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Task1_train_30700
A sequence alteration has been identified in HNRNPH2, RPL36A-HNRNPH2 (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2| RPL36A-HNRNPH2 readthrough) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; HNRNPH2-related disorder
GCAGATTCCACTTTTTTTGGTATGTGTAGATACATCTTTTCTCCATTTTACTCCTGTTGCCTTAGGCGATTCCTTTAACATATATTTATGAGACAAGTTCTAACTAATCTCCCTAGTTCCACGTCGACCCCCTTCTGTTTGAGTGCCACGCTGTTGCCAGGGTGATCTGTCTGAAAGAGTTTTGGTGAAGTCACCCTACATACTCCCCGGTTTAAAAGTCTTAAAAGGCGCTTAGTGTTTGTATATCAAAGTCTTTGGGATCTGATCTATGCCTTGCCAGTCTTTTCACTTGCTTTTCCCTCTCCTATTTGTGCTTCATCATAATTAAGAAAAAAAAATGTTTATGGATCCCTGGGCAGATTAGTCTGTTTCATTTAACCATTTGGCCTCCAACCAATAGAACTGATCAACTAGTCCCTCTTTGATACTATGCTTACACTCCACTCAGAGGGTCATGGCAAGTATAATGTATATTTGCATTTACATCTTTAATAATGACATTCGGTGCTCCTGTAGGACCATAAGCCCATTCTGGGCTTATTGATTCTTGTATGCCAGAGCCGAATATTGGACATGGCAACTAAAAAATGTTTCTAAAATGAATGTGTGAATTCCCAATAATGTCTTTTTTTCATTTATCTCTGGAGCCCAAATATTTCCCTGATTTTATTGATTTGCATACATTTTTATATAATGAAGATATTATATAAAGAACTTACATAACCTGTGTTTTGTTTGTGTTTTAATTGTTGTTTAATCTTTTGATCTAGTGAAGTTTTTTATGTTTATATATTCAGATATAGCCATCTTTTATTTGTTGACATCTCCCACTGATTTGTTGCTGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGGTCGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACCTCCACCTCCTGGGTACATAAAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATACACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCGATTGCTGTTAATTTTTAATGGTATCTAACACGTAATAGGCATTGAATAAATAACTGCTAAAAAATGAATGAGTTAAAAATTTGGTGAACTCTCTGTTTATACAGACGTCTTACAGAAAAGCTGTCAGCATAATTGAATTTTCTATTAATAGTTTGCTTTTTTCTCTTACTATATCACGAGCATTTTTCCATGACAGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTCAGCTACACCAAAATTGCATTGAGCCAAACTTGCCACCAAGAGCCCAACAATCACCATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATTGCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGTGAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTGAAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACAGGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGGACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGAAGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAAGGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCTTCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAGCTCATGGCTATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAGAGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTGGTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAATGATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCCAGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCCACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGTACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTGAATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCTAATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAACAAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTACAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATGGGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATGACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCTTAGGTAGAGAAGGAGCACTAAATAGCTACTCCAGATATAAAAGCTGTACATTTGTGGGAGTTGAATAGAATGGGAGGGATGTTTAGTATATCCAGTATGATTGGTAAATGGGAAATATAATTGATTCTGATCACTCTTGGTCAGCTTCTCTTTCTTTATCTTTCTTTCTCCTTTTTTAAGAAAACGAGTTAAGTTTAACAGTTTTGCATTACAGGCTTGTGATTCATGCTTACTGTAAAGTGGAAGTTGAGATTATTTTAAAACTTCAAGCTCAGTAATTTTGAACACTGAAACATTCATCTAGGACATAATAACAAAGTTCAGTATTGACCATAACTGTTAAAACAATTTTTAGCTTTCCTCAAGTTAGTTATGTTGTAGGAGTGTACCTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTTAATGCAGTTTCACTTATGTTAAATGTTGCTCTTATACCACAAATACATTGAAAACTTCGGATGCATGTTGAGAAACATGCCTTTCTGTAAAACTCAAATATAGGAGCTGTGTCTACGATTCAAAGTGAAAACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGCTTTTTGGTTTAATATCCTGTAAGGCACGTGAGTGTACACTTTTTTTTTTTTTAAGGATACGGGACAATTTTAAGATGTAATACCAATACTTTAGAAGTTTGGTCGTGTCGTTTGTATGAAAATCTGAGGCTTTGGTTTAAATCTTTCCTTGTATTGTGATTTCCATTTAGATGTATTGTACTAAGTGAAACTTGTTAAATAAATCTTCCTTTTAAAAACTGGAAAAAATCTTGAACTGATTGATTTTTATTATGTTCTGTCATATGGGCACACTGATTGACTTTACAATTCCCTCAAAGTTAAGATTTTTAATTTTAAAATTATAAATGATATTTAGCATCTTTATATGTTCATTGTTGCATATATCATTAATTATTTCTAAGATATATCCCTAGAAATGGGATTGCTGAGTCAAAGATATACTCATTTTTAAGGCTTCTGATTTGTGTTACCAGAAAGATTCTGGTACTTTATCTTTCTACTTGGAGTGTGTGTTTTATTTTCCCCCTTATACCCTCCTTATTGATGCACATTATTCTTTTTGAACTTTGCCAGTTTTTTAGTTGAGAAATGATATCTCATTGCTATTTTAATTTGTATTTTTTTGATTAATATTAAAGTTGTACATTCTTTTTTAAAAAAAACTTACCATGTCTACAGGACTATTGAGCTACTTTTGGAGACTGTACTTACCAAGATAGTATTCTCTAAAATCCAAAGAAGTGAAAGCAAATAAATAATCCTTTT
GCAGATTCCACTTTTTTTGGTATGTGTAGATACATCTTTTCTCCATTTTACTCCTGTTGCCTTAGGCGATTCCTTTAACATATATTTATGAGACAAGTTCTAACTAATCTCCCTAGTTCCACGTCGACCCCCTTCTGTTTGAGTGCCACGCTGTTGCCAGGGTGATCTGTCTGAAAGAGTTTTGGTGAAGTCACCCTACATACTCCCCGGTTTAAAAGTCTTAAAAGGCGCTTAGTGTTTGTATATCAAAGTCTTTGGGATCTGATCTATGCCTTGCCAGTCTTTTCACTTGCTTTTCCCTCTCCTATTTGTGCTTCATCATAATTAAGAAAAAAAAATGTTTATGGATCCCTGGGCAGATTAGTCTGTTTCATTTAACCATTTGGCCTCCAACCAATAGAACTGATCAACTAGTCCCTCTTTGATACTATGCTTACACTCCACTCAGAGGGTCATGGCAAGTATAATGTATATTTGCATTTACATCTTTAATAATGACATTCGGTGCTCCTGTAGGACCATAAGCCCATTCTGGGCTTATTGATTCTTGTATGCCAGAGCCGAATATTGGACATGGCAACTAAAAAATGTTTCTAAAATGAATGTGTGAATTCCCAATAATGTCTTTTTTTCATTTATCTCTGGAGCCCAAATATTTCCCTGATTTTATTGATTTGCATACATTTTTATATAATGAAGATATTATATAAAGAACTTACATAACCTGTGTTTTGTTTGTGTTTTAATTGTTGTTTAATCTTTTGATCTAGTGAAGTTTTTTATGTTTATATATTCAGATATAGCCATCTTTTATTTGTTGACATCTCCCACTGATTTGTTGCTGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGGTCGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACCTCCACCTCCTGGGTACATAAAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATACACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCGATTGCTGTTAATTTTTAATGGTATCTAACACGTAATAGGCATTGAATAAATAACTGCTAAAAAATGAATGAGTTAAAAATTTGGTGAACTCTCTGTTTATACAGACGTCTTACAGAAAAGCTGTCAGCATAATTGAATTTTCTATTAATAGTTTGCTTTTTTCTCTTACTATATCACGAGCATTTTTCCATGACAGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTCAGCTACACCAAAATTGCATTGAGCCAAACTTGCCACCAAGAGCCCAACAATCACCATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATTGCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGTGAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTGAAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACAGGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGGACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGAAGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAAGGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCTTCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAGCTCATGGCTATGCAGCAGCCAGGTCCCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAGAGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTGGTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAATGATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCCAGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCCACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGTACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTGAATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCTAATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAACAAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTACAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATGGGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATGACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCTTAGGTAGAGAAGGAGCACTAAATAGCTACTCCAGATATAAAAGCTGTACATTTGTGGGAGTTGAATAGAATGGGAGGGATGTTTAGTATATCCAGTATGATTGGTAAATGGGAAATATAATTGATTCTGATCACTCTTGGTCAGCTTCTCTTTCTTTATCTTTCTTTCTCCTTTTTTAAGAAAACGAGTTAAGTTTAACAGTTTTGCATTACAGGCTTGTGATTCATGCTTACTGTAAAGTGGAAGTTGAGATTATTTTAAAACTTCAAGCTCAGTAATTTTGAACACTGAAACATTCATCTAGGACATAATAACAAAGTTCAGTATTGACCATAACTGTTAAAACAATTTTTAGCTTTCCTCAAGTTAGTTATGTTGTAGGAGTGTACCTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTTAATGCAGTTTCACTTATGTTAAATGTTGCTCTTATACCACAAATACATTGAAAACTTCGGATGCATGTTGAGAAACATGCCTTTCTGTAAAACTCAAATATAGGAGCTGTGTCTACGATTCAAAGTGAAAACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGCTTTTTGGTTTAATATCCTGTAAGGCACGTGAGTGTACACTTTTTTTTTTTTTAAGGATACGGGACAATTTTAAGATGTAATACCAATACTTTAGAAGTTTGGTCGTGTCGTTTGTATGAAAATCTGAGGCTTTGGTTTAAATCTTTCCTTGTATTGTGATTTCCATTTAGATGTATTGTACTAAGTGAAACTTGTTAAATAAATCTTCCTTTTAAAAACTGGAAAAAATCTTGAACTGATTGATTTTTATTATGTTCTGTCATATGGGCACACTGATTGACTTTACAATTCCCTCAAAGTTAAGATTTTTAATTTTAAAATTATAAATGATATTTAGCATCTTTATATGTTCATTGTTGCATATATCATTAATTATTTCTAAGATATATCCCTAGAAATGGGATTGCTGAGTCAAAGATATACTCATTTTTAAGGCTTCTGATTTGTGTTACCAGAAAGATTCTGGTACTTTATCTTTCTACTTGGAGTGTGTGTTTTATTTTCCCCCTTATACCCTCCTTATTGATGCACATTATTCTTTTTGAACTTTGCCAGTTTTTTAGTTGAGAAATGATATCTCATTGCTATTTTAATTTGTATTTTTTTGATTAATATTAAAGTTGTACATTCTTTTTTAAAAAAAACTTACCATGTCTACAGGACTATTGAGCTACTTTTGGAGACTGTACTTACCAAGATAGTATTCTCTAAAATCCAAAGAAGTGAAAGCAAATAAATAATCCTTTT
Task1_train_30701
Here is a mutation in HNRNPH2, RPL36A-HNRNPH2 (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2| RPL36A-HNRNPH2 readthrough) on Chromosome X. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
ACTTTTTTTGGTATGTGTAGATACATCTTTTCTCCATTTTACTCCTGTTGCCTTAGGCGATTCCTTTAACATATATTTATGAGACAAGTTCTAACTAATCTCCCTAGTTCCACGTCGACCCCCTTCTGTTTGAGTGCCACGCTGTTGCCAGGGTGATCTGTCTGAAAGAGTTTTGGTGAAGTCACCCTACATACTCCCCGGTTTAAAAGTCTTAAAAGGCGCTTAGTGTTTGTATATCAAAGTCTTTGGGATCTGATCTATGCCTTGCCAGTCTTTTCACTTGCTTTTCCCTCTCCTATTTGTGCTTCATCATAATTAAGAAAAAAAAATGTTTATGGATCCCTGGGCAGATTAGTCTGTTTCATTTAACCATTTGGCCTCCAACCAATAGAACTGATCAACTAGTCCCTCTTTGATACTATGCTTACACTCCACTCAGAGGGTCATGGCAAGTATAATGTATATTTGCATTTACATCTTTAATAATGACATTCGGTGCTCCTGTAGGACCATAAGCCCATTCTGGGCTTATTGATTCTTGTATGCCAGAGCCGAATATTGGACATGGCAACTAAAAAATGTTTCTAAAATGAATGTGTGAATTCCCAATAATGTCTTTTTTTCATTTATCTCTGGAGCCCAAATATTTCCCTGATTTTATTGATTTGCATACATTTTTATATAATGAAGATATTATATAAAGAACTTACATAACCTGTGTTTTGTTTGTGTTTTAATTGTTGTTTAATCTTTTGATCTAGTGAAGTTTTTTATGTTTATATATTCAGATATAGCCATCTTTTATTTGTTGACATCTCCCACTGATTTGTTGCTGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGGTCGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACCTCCACCTCCTGGGTACATAAAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATACACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCGATTGCTGTTAATTTTTAATGGTATCTAACACGTAATAGGCATTGAATAAATAACTGCTAAAAAATGAATGAGTTAAAAATTTGGTGAACTCTCTGTTTATACAGACGTCTTACAGAAAAGCTGTCAGCATAATTGAATTTTCTATTAATAGTTTGCTTTTTTCTCTTACTATATCACGAGCATTTTTCCATGACAGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTCAGCTACACCAAAATTGCATTGAGCCAAACTTGCCACCAAGAGCCCAACAATCACCATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATTGCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGTGAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTGAAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACAGGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGGACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGAAGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAAGGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCTTCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAGCTCATGGCTATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAGAGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTGGTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAATGATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCCAGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCCACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGTACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTGAATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCTAATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAACAAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTACAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATGGGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATGACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCTTAGGTAGAGAAGGAGCACTAAATAGCTACTCCAGATATAAAAGCTGTACATTTGTGGGAGTTGAATAGAATGGGAGGGATGTTTAGTATATCCAGTATGATTGGTAAATGGGAAATATAATTGATTCTGATCACTCTTGGTCAGCTTCTCTTTCTTTATCTTTCTTTCTCCTTTTTTAAGAAAACGAGTTAAGTTTAACAGTTTTGCATTACAGGCTTGTGATTCATGCTTACTGTAAAGTGGAAGTTGAGATTATTTTAAAACTTCAAGCTCAGTAATTTTGAACACTGAAACATTCATCTAGGACATAATAACAAAGTTCAGTATTGACCATAACTGTTAAAACAATTTTTAGCTTTCCTCAAGTTAGTTATGTTGTAGGAGTGTACCTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTTAATGCAGTTTCACTTATGTTAAATGTTGCTCTTATACCACAAATACATTGAAAACTTCGGATGCATGTTGAGAAACATGCCTTTCTGTAAAACTCAAATATAGGAGCTGTGTCTACGATTCAAAGTGAAAACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGCTTTTTGGTTTAATATCCTGTAAGGCACGTGAGTGTACACTTTTTTTTTTTTTAAGGATACGGGACAATTTTAAGATGTAATACCAATACTTTAGAAGTTTGGTCGTGTCGTTTGTATGAAAATCTGAGGCTTTGGTTTAAATCTTTCCTTGTATTGTGATTTCCATTTAGATGTATTGTACTAAGTGAAACTTGTTAAATAAATCTTCCTTTTAAAAACTGGAAAAAATCTTGAACTGATTGATTTTTATTATGTTCTGTCATATGGGCACACTGATTGACTTTACAATTCCCTCAAAGTTAAGATTTTTAATTTTAAAATTATAAATGATATTTAGCATCTTTATATGTTCATTGTTGCATATATCATTAATTATTTCTAAGATATATCCCTAGAAATGGGATTGCTGAGTCAAAGATATACTCATTTTTAAGGCTTCTGATTTGTGTTACCAGAAAGATTCTGGTACTTTATCTTTCTACTTGGAGTGTGTGTTTTATTTTCCCCCTTATACCCTCCTTATTGATGCACATTATTCTTTTTGAACTTTGCCAGTTTTTTAGTTGAGAAATGATATCTCATTGCTATTTTAATTTGTATTTTTTTGATTAATATTAAAGTTGTACATTCTTTTTTAAAAAAAACTTACCATGTCTACAGGACTATTGAGCTACTTTTGGAGACTGTACTTACCAAGATAGTATTCTCTAAAATCCAAAGAAGTGAAAGCAAATAAATAATCCTTTTTATTTCACC
ACTTTTTTTGGTATGTGTAGATACATCTTTTCTCCATTTTACTCCTGTTGCCTTAGGCGATTCCTTTAACATATATTTATGAGACAAGTTCTAACTAATCTCCCTAGTTCCACGTCGACCCCCTTCTGTTTGAGTGCCACGCTGTTGCCAGGGTGATCTGTCTGAAAGAGTTTTGGTGAAGTCACCCTACATACTCCCCGGTTTAAAAGTCTTAAAAGGCGCTTAGTGTTTGTATATCAAAGTCTTTGGGATCTGATCTATGCCTTGCCAGTCTTTTCACTTGCTTTTCCCTCTCCTATTTGTGCTTCATCATAATTAAGAAAAAAAAATGTTTATGGATCCCTGGGCAGATTAGTCTGTTTCATTTAACCATTTGGCCTCCAACCAATAGAACTGATCAACTAGTCCCTCTTTGATACTATGCTTACACTCCACTCAGAGGGTCATGGCAAGTATAATGTATATTTGCATTTACATCTTTAATAATGACATTCGGTGCTCCTGTAGGACCATAAGCCCATTCTGGGCTTATTGATTCTTGTATGCCAGAGCCGAATATTGGACATGGCAACTAAAAAATGTTTCTAAAATGAATGTGTGAATTCCCAATAATGTCTTTTTTTCATTTATCTCTGGAGCCCAAATATTTCCCTGATTTTATTGATTTGCATACATTTTTATATAATGAAGATATTATATAAAGAACTTACATAACCTGTGTTTTGTTTGTGTTTTAATTGTTGTTTAATCTTTTGATCTAGTGAAGTTTTTTATGTTTATATATTCAGATATAGCCATCTTTTATTTGTTGACATCTCCCACTGATTTGTTGCTGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTGGTCGCTGAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACCTCCACCTCCTGGGTACATAAAAGCGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTGCTGACCTCAGGTGATACACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCGATTGCTGTTAATTTTTAATGGTATCTAACACGTAATAGGCATTGAATAAATAACTGCTAAAAAATGAATGAGTTAAAAATTTGGTGAACTCTCTGTTTATACAGACGTCTTACAGAAAAGCTGTCAGCATAATTGAATTTTCTATTAATAGTTTGCTTTTTTCTCTTACTATATCACGAGCATTTTTCCATGACAGTAGTCTTCTTTTTTTTTTTTTCAGCTACACCAAAATTGCATTGAGCCAAACTTGCCACCAAGAGCCCAACAATCACCATGATGCTGAGCACGGAAGGCAGGGAGGGGTTCGTGGTGAAGGTCAGGGGCCTACCCTGGTCCTGCTCAGCCGATGAAGTGATGCGCTTCTTCTCTGATTGCAAGATCCAAAATGGCACATCAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGTGAAGCATTTGTTGAACTTGAATCTGAAGAGGAAGTGAAATTGGCTTTGAAGAAGGACAGAGAAACCATGGGACACAGATACGTTGAAGTATTCAAGTCTAACAGTGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACAGGTCCGAATAGCCCTGATACTGCCAACGATGGCTTCGTCCGGCTTAGAGGACTCCCATTTGGCTGTAGCAAGGAAGAGATTGTTCAGTTCTTTTCAGGGTTGGAAATTGTGCCAAATGGGATGACACTGCCAGTGGACTTTCAGGGGCGAAGCACAGGGGAAGCCTTTGTGCAGTTTGCTTCACAGGAGATAGCTGAGAAGGCCTTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTACATTGAGATCTTCAAGAGTAGCCGAGCTGAAGTTCGAACCCACTATGATCCCCCTCGAAAGCTCATGGCTATGCAGCGGCCAGGTCTCTATGATAGGCCGGGGGCTGGCAGAGGGTATAATAGCATTGGCAGAGGAGCTGGGTTTGAAAGGATGAGGCGTGGTGCCTATGGTGGAGGGTATGGAGGCTATGATGACTATGGTGGCTATAATGATGGATATGGCTTTGGGTCTGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCATAGATACGGAGATGGTGGGTCCAGTTTCCAGAGCACCACAGGGCACTGTGTACACATGAGGGGGTTACCTTACAGAGCCACTGAGAATGATATTTATAATTTCTTCTCACCTCTTAATCCCATGAGAGTACATATTGAAATTGGACCCGATGGCAGAGTTACCGGTGAGGCAGATGTTGAATTTGCTACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGGCAAAAGACAAAGCTAATATGCAACACAGATATGTGGAGCTCTTCTTAAATTCTACTGCAGGAACAAGTGGGGGTGCTTACGATCACAGCTATGTAGAACTTTTTTTGAATTCTACAGCAGGGGCAAGTGGTGGCGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGGATGGGCTTATCCAACCAGTCTAGTTATGGAGGTCCTGCTAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTATGGTGGTCAGAGCAGTATGAGTGGATATGACCAAGTTCTGCAGGAAAACTCCAGTGACTATCAGTCAAACCTTGCTTAGGTAGAGAAGGAGCACTAAATAGCTACTCCAGATATAAAAGCTGTACATTTGTGGGAGTTGAATAGAATGGGAGGGATGTTTAGTATATCCAGTATGATTGGTAAATGGGAAATATAATTGATTCTGATCACTCTTGGTCAGCTTCTCTTTCTTTATCTTTCTTTCTCCTTTTTTAAGAAAACGAGTTAAGTTTAACAGTTTTGCATTACAGGCTTGTGATTCATGCTTACTGTAAAGTGGAAGTTGAGATTATTTTAAAACTTCAAGCTCAGTAATTTTGAACACTGAAACATTCATCTAGGACATAATAACAAAGTTCAGTATTGACCATAACTGTTAAAACAATTTTTAGCTTTCCTCAAGTTAGTTATGTTGTAGGAGTGTACCTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTTAATGCAGTTTCACTTATGTTAAATGTTGCTCTTATACCACAAATACATTGAAAACTTCGGATGCATGTTGAGAAACATGCCTTTCTGTAAAACTCAAATATAGGAGCTGTGTCTACGATTCAAAGTGAAAACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGCTTTTTGGTTTAATATCCTGTAAGGCACGTGAGTGTACACTTTTTTTTTTTTTAAGGATACGGGACAATTTTAAGATGTAATACCAATACTTTAGAAGTTTGGTCGTGTCGTTTGTATGAAAATCTGAGGCTTTGGTTTAAATCTTTCCTTGTATTGTGATTTCCATTTAGATGTATTGTACTAAGTGAAACTTGTTAAATAAATCTTCCTTTTAAAAACTGGAAAAAATCTTGAACTGATTGATTTTTATTATGTTCTGTCATATGGGCACACTGATTGACTTTACAATTCCCTCAAAGTTAAGATTTTTAATTTTAAAATTATAAATGATATTTAGCATCTTTATATGTTCATTGTTGCATATATCATTAATTATTTCTAAGATATATCCCTAGAAATGGGATTGCTGAGTCAAAGATATACTCATTTTTAAGGCTTCTGATTTGTGTTACCAGAAAGATTCTGGTACTTTATCTTTCTACTTGGAGTGTGTGTTTTATTTTCCCCCTTATACCCTCCTTATTGATGCACATTATTCTTTTTGAACTTTGCCAGTTTTTTAGTTGAGAAATGATATCTCATTGCTATTTTAATTTGTATTTTTTTGATTAATATTAAAGTTGTACATTCTTTTTTAAAAAAAACTTACCATGTCTACAGGACTATTGAGCTACTTTTGGAGACTGTACTTACCAAGATAGTATTCTCTAAAATCCAAAGAAGTGAAAGCAAATAAATAATCCTTTTTATTTCACC
Task1_train_30702
Here is a genetic alteration in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
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Task1_train_30703
An alteration has been detected in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
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Task1_train_30704
This alteration occurs within gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_30705
With a mutation on Chromosome X in gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
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Task1_train_30706
The gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) is located on Chromosome X, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
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Task1_train_30707
A variant affecting Chromosome X, within the gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
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Here’s a variant in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
AAGGATCATTTGCCTCATCCTCTAAATCTGAACTCCCAAAGTTTGGGCTCACTCCTGCCATCTGATGAGCTGAGGAGACACATTTGGCGATTTCTTGCTCTTGGTCCTCCCCCTTCTCCAGGGCCATTCCGACAGTGACCATCCAGAAGTTTATTGCTGGCTCAATCCTACAGTTGAGCTTCCAAAGCAGGCATAGTCTGTGGCTGGCGAGCAGGGCTGGGGAGGGCGAGGGGCTCTAGGACCCTTTTCCATCAGTCACATGGCCTTAGTCTCGTCTGCTCTGGAAAGCTACTATTATACCGTTTTGCAAGGGGCAGCATTTCCAGAGATCCTTTTTTCTTGGGGCTGATACAAGAGCAAAGGATCTAGAGTTCTAGTACTCTAAGCAAGCCTCAAACGGTGCAGGATTTGGCCCCAGTGGGCCCACAGGGGCATCTGCCAAAGACTCGTCCATTTCCTAACAGCAGAGCCCAAGCCAGTAACATGTCCAAAGTCACAGCCCAAAGAGAAAACTGTAAGACACAATCTTGCCTTTCTCCCACCCCAGGAAGGTACTAGTCTCTGCTCAGTATCTCCCTCCTCTTCTCTCCTCTCCCAAGGCAAAATCACAGGAAAAGTTCCAGGAGACCATACCTTCCTTCTCCGGAGTCTTCCAACAGGTGCCCCTCTTATTATATGCCAGCCAGTTGTTTTAAAGGCCATCCATGGGAGGACACCGGCCTCTAGGTCAAGGGAGCTGTGAAGGGAGACAGGACTGACAAGGAGCCCAGACAGACACTGTTTAAGATTCACCTGTTCTAGAAAACCTTCCCAGGCTGATCCCATCTAGCAGTGGGCATTTAAATACCTTCACAGTCTTTAGAAATAGCTTATTGCTAAGGCAGGTTTTATATAGTATTTCCCTGTTTTTGCTGCTTAGCCATTTTTGTCTTACCGCTTCTTTCTCTGTGGCAAGGACTATATTTCGTTTCTTCTCTCCACCCTCACTGCCACCTGCTGCTTCACTCTAACCCACTCCCTGCCTCTTGTCTGCCTGGCTTAAGCTCTCTGATGAAGATATTACACTCTCAGGATAGAATACTGACTACCTGATTCCCAGATCGTGTTCTTGACTTGTCTCGAAGTCGATTATCCTTCTTGGAAATCACCCACATCTTCAACGCTGGCCTTTTCTTTAACCTAGTCTGTGAACTTGCATAGGTCTTGCCCACTTCTGGGTCTTTATTATTGTAGCTATAAAATTATTACAATTCTAGCCTCCCCCAGCCTAATCACAATCTGTTCATCGAATTGACAGCCTGCATTTTGTCTTCATGCAGTTGAAACTGAGAAGGATTTGGAGGAAATTATCTTAAAAGACAATTTTTTCTTCTCTATTGTGTTCGTAGAGCTGGGGGTGGGGGTGGGGGAGGAACGCTTATTTTCCAAGGAATCGGGAGGGGAAAGGTGGAGAGGGCCAAGGGCAGCTAGGAGTGATGTGGGGAGCTGGAGCAGATTCGGAAGGACTTTGGGAGCTAATATCTAGGTTTTTGACTCTGAGCCCCTGTTGGGGCTCTCACTTCATGGCTTCTCACGCTTGTGCTGCATATCCCACACCAATTAGACCCAAGGATCAGTTGGAAGTTTCCAGGACATCTTCATTTTATTTCCACCCTCAATCCACATTTCCAGATGTCTCTGCAGCAAAGCGAAATTCCAGGCAAGCCTTAGGGAAAAAAGGAAAAACAAAGAAAATGAAACAATTGGCAGTGAAAGGCAGAAAGAGAAGATGGAGCCCTTAGAGAAGGGAGTATCCCTGAGTAGGTGGGGAAAAGGGGAGGAGAAGGGAGGAGGAGAGGAGGAGGAAAGCAGGCCTGTCCCTTTAAGGGGGTTGGCTGTCAATCAGAAAGCCCTTTTCATTGCAGGAGAAGAGGACAAAGATACTCAGAGAGAAAAAGTAAAAGACCGAAGAAGGAGGCTGGAGAGACCAGGATCCTTCCAGCTGAACAAAGTCAGCCACAAAGCAGACTAGCCAGCCGGCTACAATTGGAGTCAGAGTCCCAAAGACATGGGTAAGTTTCAAAAACTTTAGCATTGAAGATTCAAGAGGACACAGGAATTCACAAGAGAATTTCCAACTTTGGGGTTCGGGGGTTCCATGGTTTAAATGAGTCGTGTTTTGGCACTTGTTTTCTTTTTAAATTCCTTAACATTCAGTTAGATTAACTCCTTCTCCGCTGTACTAAGCATGATGCTTTATTACCAAAGAATTCCAGCAGCACGTGGAGAGTCCCACAGATCTCTGGAGAGAGTGCCCAGCTGGATGGATGTGGTCATGTGTCCTCCTACCCCCTCACTTCCCTCTATCTTCTCTTTTCCCTTGGTTCCAAGGCCCTGGCAACGGTTGGGTCAGCTTGCCCTCCTGGTTCTGCTGGAGGCCACTGAGCACTGTCTAGCCCTCAGATGTACAAAATAACTGCTTGCTTGATGCAAACTTTGAACCATGTTTGGCATTAATAGGAAGCTGGGGATCGGGCAAGCTGGACTCAGGCTTGGCTATGGCTGAGGAGGCCATTCTCAGGTTCAGGAAATGAAAGTAAAGTCCTCAATGGCTTGACCATGGGAAACAGATATGGGTAGGAGTGTGTGTGTGTATGTGCATATGTGCATGTGTGTGCACATATAGGGTTGATCATTTCTAGCAAATATCACAGACACAGCTTTCCTGAAGGCTCTTTGCTGTGACAAGGAGGATGCTGGGACATTAGGGCTCTTGCTAAGTTGGCTGAGTATTGAGGGCTTTTCTAGGTTCCGTGAACAAAGACAGAAGCTATGAAGTTCTGGTGGTAGTTTCTACTCAGAGTAATGTGTGCAGAGCACAAGGGTCTTTGTCCCTATTGGACTCCACAGAGTCCTGTAGACATTGCTAACATTTGGCAAAACAAAGATAGCAGCTTAAACACATCCTAAATGAAATGAGACTCAGTTGCCCCATGTATTCCCTATCAAATGTAGCATCCAGTAGACAACATCCACAGAGATCAATTTGCAATTATACTGAGCTGGTTCAGCCTTTAGGTTGTTTCATCATGAAACACAGAGAGAACACTTTGAAGCATGTGTTCAGGTAAAACAGGAGGGAGAGCACTGGACAGGGAGTCGGAAAAATCAGATTCAAATCCCAGATCTGCTACTTATGAACTATGTGACCTTGGACAGGTCACTGAATCACCACTTCCTCATCTGGAAAATGGGGACAGCAATAACTACTTTGTCTACTTTCAGGGTTGTGAGAATCAAGTAACAATAATGTCAAAGTCCTTTGAAAATGGGCAAGATCTATAACAACTGTAAATCATGATAATACCTACTATTAGACAATAATGTGTATACAGGCGAACTCTTCCTCTTTCCAGGGTGGTTGGGTTTTCTTTGCGTGCTTGGGTCAGAATCATTTGACCAATTATGTGTGACCAGATGAGAGGTGAATGTTGGAGGAACTCAATTCCTGCCCTGGGTAACATCAGGAATCCTATCTAATGTCAGCCGAGCTGACTGGATAGGTTGTGCATTAAAAACAGAGAGGGAGTAAAGAAGGATGTTGAATATTACTTCCTCAGGGGATGAAATCCCTGAGGAAAGGCAGGAACAAATAAAGTGACCACAGGGACAATTGCCTGTTATGGAGGCTGGGTGGTTTCCTCCAGAGGAAGAGTGCCACAGATAAGGGCACGATTGAGGATGCACATTGGGTCCCAGGTCCTAAGGGTGGACGATACTTGGGCCAGGTACATATGATGGAGCAGCCACTGAGTTTTCATTTATTCAATAACAGAGTATCTAAAGTACTTTGAATTATAGATCATCTCTAACAAGGTACTGGACTGCCACTACTTCTGATGTGGAGTGCACTGCTGTTCAACAATTGCAGTAAACACATTGTATCATGGAATCCGGGATTGGAAGGAACTTTAGAAGTTGTCTGAGCCAACCTTCAATGCGGGATTCATTTTTACAACAACCAATTAAATGTTCGTACAGCCTCTGCTTAATCACCTCCAGGAACAGGGAACTTACTACTTCAACCATATAGAATCCCTTAGGATTGGAAGCAAGG
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Task1_train_30709
A mutation in RAB9B, PLP1 (RAB9B, member RAS oncogene family| proteolipid protein 1), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
AGGATCATTTGCCTCATCCTCTAAATCTGAACTCCCAAAGTTTGGGCTCACTCCTGCCATCTGATGAGCTGAGGAGACACATTTGGCGATTTCTTGCTCTTGGTCCTCCCCCTTCTCCAGGGCCATTCCGACAGTGACCATCCAGAAGTTTATTGCTGGCTCAATCCTACAGTTGAGCTTCCAAAGCAGGCATAGTCTGTGGCTGGCGAGCAGGGCTGGGGAGGGCGAGGGGCTCTAGGACCCTTTTCCATCAGTCACATGGCCTTAGTCTCGTCTGCTCTGGAAAGCTACTATTATACCGTTTTGCAAGGGGCAGCATTTCCAGAGATCCTTTTTTCTTGGGGCTGATACAAGAGCAAAGGATCTAGAGTTCTAGTACTCTAAGCAAGCCTCAAACGGTGCAGGATTTGGCCCCAGTGGGCCCACAGGGGCATCTGCCAAAGACTCGTCCATTTCCTAACAGCAGAGCCCAAGCCAGTAACATGTCCAAAGTCACAGCCCAAAGAGAAAACTGTAAGACACAATCTTGCCTTTCTCCCACCCCAGGAAGGTACTAGTCTCTGCTCAGTATCTCCCTCCTCTTCTCTCCTCTCCCAAGGCAAAATCACAGGAAAAGTTCCAGGAGACCATACCTTCCTTCTCCGGAGTCTTCCAACAGGTGCCCCTCTTATTATATGCCAGCCAGTTGTTTTAAAGGCCATCCATGGGAGGACACCGGCCTCTAGGTCAAGGGAGCTGTGAAGGGAGACAGGACTGACAAGGAGCCCAGACAGACACTGTTTAAGATTCACCTGTTCTAGAAAACCTTCCCAGGCTGATCCCATCTAGCAGTGGGCATTTAAATACCTTCACAGTCTTTAGAAATAGCTTATTGCTAAGGCAGGTTTTATATAGTATTTCCCTGTTTTTGCTGCTTAGCCATTTTTGTCTTACCGCTTCTTTCTCTGTGGCAAGGACTATATTTCGTTTCTTCTCTCCACCCTCACTGCCACCTGCTGCTTCACTCTAACCCACTCCCTGCCTCTTGTCTGCCTGGCTTAAGCTCTCTGATGAAGATATTACACTCTCAGGATAGAATACTGACTACCTGATTCCCAGATCGTGTTCTTGACTTGTCTCGAAGTCGATTATCCTTCTTGGAAATCACCCACATCTTCAACGCTGGCCTTTTCTTTAACCTAGTCTGTGAACTTGCATAGGTCTTGCCCACTTCTGGGTCTTTATTATTGTAGCTATAAAATTATTACAATTCTAGCCTCCCCCAGCCTAATCACAATCTGTTCATCGAATTGACAGCCTGCATTTTGTCTTCATGCAGTTGAAACTGAGAAGGATTTGGAGGAAATTATCTTAAAAGACAATTTTTTCTTCTCTATTGTGTTCGTAGAGCTGGGGGTGGGGGTGGGGGAGGAACGCTTATTTTCCAAGGAATCGGGAGGGGAAAGGTGGAGAGGGCCAAGGGCAGCTAGGAGTGATGTGGGGAGCTGGAGCAGATTCGGAAGGACTTTGGGAGCTAATATCTAGGTTTTTGACTCTGAGCCCCTGTTGGGGCTCTCACTTCATGGCTTCTCACGCTTGTGCTGCATATCCCACACCAATTAGACCCAAGGATCAGTTGGAAGTTTCCAGGACATCTTCATTTTATTTCCACCCTCAATCCACATTTCCAGATGTCTCTGCAGCAAAGCGAAATTCCAGGCAAGCCTTAGGGAAAAAAGGAAAAACAAAGAAAATGAAACAATTGGCAGTGAAAGGCAGAAAGAGAAGATGGAGCCCTTAGAGAAGGGAGTATCCCTGAGTAGGTGGGGAAAAGGGGAGGAGAAGGGAGGAGGAGAGGAGGAGGAAAGCAGGCCTGTCCCTTTAAGGGGGTTGGCTGTCAATCAGAAAGCCCTTTTCATTGCAGGAGAAGAGGACAAAGATACTCAGAGAGAAAAAGTAAAAGACCGAAGAAGGAGGCTGGAGAGACCAGGATCCTTCCAGCTGAACAAAGTCAGCCACAAAGCAGACTAGCCAGCCGGCTACAATTGGAGTCAGAGTCCCAAAGACATGGGTAAGTTTCAAAAACTTTAGCATTGAAGATTCAAGAGGACACAGGAATTCACAAGAGAATTTCCAACTTTGGGGTTCGGGGGTTCCATGGTTTAAATGAGTCGTGTTTTGGCACTTGTTTTCTTTTTAAATTCCTTAACATTCAGTTAGATTAACTCCTTCTCCGCTGTACTAAGCATGATGCTTTATTACCAAAGAATTCCAGCAGCACGTGGAGAGTCCCACAGATCTCTGGAGAGAGTGCCCAGCTGGATGGATGTGGTCATGTGTCCTCCTACCCCCTCACTTCCCTCTATCTTCTCTTTTCCCTTGGTTCCAAGGCCCTGGCAACGGTTGGGTCAGCTTGCCCTCCTGGTTCTGCTGGAGGCCACTGAGCACTGTCTAGCCCTCAGATGTACAAAATAACTGCTTGCTTGATGCAAACTTTGAACCATGTTTGGCATTAATAGGAAGCTGGGGATCGGGCAAGCTGGACTCAGGCTTGGCTATGGCTGAGGAGGCCATTCTCAGGTTCAGGAAATGAAAGTAAAGTCCTCAATGGCTTGACCATGGGAAACAGATATGGGTAGGAGTGTGTGTGTGTATGTGCATATGTGCATGTGTGTGCACATATAGGGTTGATCATTTCTAGCAAATATCACAGACACAGCTTTCCTGAAGGCTCTTTGCTGTGACAAGGAGGATGCTGGGACATTAGGGCTCTTGCTAAGTTGGCTGAGTATTGAGGGCTTTTCTAGGTTCCGTGAACAAAGACAGAAGCTATGAAGTTCTGGTGGTAGTTTCTACTCAGAGTAATGTGTGCAGAGCACAAGGGTCTTTGTCCCTATTGGACTCCACAGAGTCCTGTAGACATTGCTAACATTTGGCAAAACAAAGATAGCAGCTTAAACACATCCTAAATGAAATGAGACTCAGTTGCCCCATGTATTCCCTATCAAATGTAGCATCCAGTAGACAACATCCACAGAGATCAATTTGCAATTATACTGAGCTGGTTCAGCCTTTAGGTTGTTTCATCATGAAACACAGAGAGAACACTTTGAAGCATGTGTTCAGGTAAAACAGGAGGGAGAGCACTGGACAGGGAGTCGGAAAAATCAGATTCAAATCCCAGATCTGCTACTTATGAACTATGTGACCTTGGACAGGTCACTGAATCACCACTTCCTCATCTGGAAAATGGGGACAGCAATAACTACTTTGTCTACTTTCAGGGTTGTGAGAATCAAGTAACAATAATGTCAAAGTCCTTTGAAAATGGGCAAGATCTATAACAACTGTAAATCATGATAATACCTACTATTAGACAATAATGTGTATACAGGCGAACTCTTCCTCTTTCCAGGGTGGTTGGGTTTTCTTTGCGTGCTTGGGTCAGAATCATTTGACCAATTATGTGTGACCAGATGAGAGGTGAATGTTGGAGGAACTCAATTCCTGCCCTGGGTAACATCAGGAATCCTATCTAATGTCAGCCGAGCTGACTGGATAGGTTGTGCATTAAAAACAGAGAGGGAGTAAAGAAGGATGTTGAATATTACTTCCTCAGGGGATGAAATCCCTGAGGAAAGGCAGGAACAAATAAAGTGACCACAGGGACAATTGCCTGTTATGGAGGCTGGGTGGTTTCCTCCAGAGGAAGAGTGCCACAGATAAGGGCACGATTGAGGATGCACATTGGGTCCCAGGTCCTAAGGGTGGACGATACTTGGGCCAGGTACATATGATGGAGCAGCCACTGAGTTTTCATTTATTCAATAACAGAGTATCTAAAGTACTTTGAATTATAGATCATCTCTAACAAGGTACTGGACTGCCACTACTTCTGATGTGGAGTGCACTGCTGTTCAACAATTGCAGTAAACACATTGTATCATGGAATCCGGGATTGGAAGGAACTTTAGAAGTTGTCTGAGCCAACCTTCAATGCGGGATTCATTTTTACAACAACCAATTAAATGTTCGTACAGCCTCTGCTTAATCACCTCCAGGAACAGGGAACTTACTACTTCAACCATATAGAATCCCTTAGGATTGGAAGCAAGGA
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Task1_train_30710
The following genetic variant occurs in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
TCTACCTCGATTTTCCCATGACAGAGATAATTTGATCTTTCCAAATCTGTTCACACTGATGCAATTCAGCCATGTAAATCACTAGGTATTCATGCTCTCTGGGCTAAAAACAAACTGTAACTAATGTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAAT
TCTACCTCGATTTTCCCATGACAGAGATAATTTGATCTTTCCAAATCTGTTCACACTGATGCAATTCAGCCATGTAAATCACTAGGTATTCATGCTCTCTGGGCTAAAAACAAACTGTAACTAATGTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCTCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAAT
Task1_train_30711
A genetic alteration is present in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
TCTACCTCGATTTTCCCATGACAGAGATAATTTGATCTTTCCAAATCTGTTCACACTGATGCAATTCAGCCATGTAAATCACTAGGTATTCATGCTCTCTGGGCTAAAAACAAACTGTAACTAATGTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAAT
TCTACCTCGATTTTCCCATGACAGAGATAATTTGATCTTTCCAAATCTGTTCACACTGATGCAATTCAGCCATGTAAATCACTAGGTATTCATGCTCTCTGGGCTAAAAACAAACTGTAACTAATGTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCTCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAAT
Task1_train_30712
This variant impacts the gene RAB9B, PLP1 (RAB9B, member RAS oncogene family| proteolipid protein 1) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
GGTATTCATGCTCTCTGGGCTAAAAACAAACTGTAACTAATGTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCT
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Task1_train_30713
This alteration occurs within gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
GTTAACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATT
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Task1_train_30714
This sequence change occurs on Chromosome X, altering PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
ACAGAATCAGGAAAAGGAGTCCCCTTTCCCTGGTACCCTATAGAAAAGTGAGTGTGGCTTGGAGAAATGCTTGAATACAAAAATCCAAGCCTAAGTAATTAATACAATTTATTTTTATTGTACAAGCTGTCACAACCTGCTTATTCAAAAATAGCAGCTTCCCAGTACATTTGCTGAGTATTTGTGTGTGTGCATGTGTATACTGTGTTTATAGATATATAAAATCAGTGGGTATATATACATATATTTATATATATACATACATATGAATTAAGACATTTTTTCTGAAGAGCTTAACATTCTCATTTCTTCTACATTTTAGGGATCTGGCCGAGAGGCCAGAGGAAGCCATTCTTTTCCTCATCTAGTCAGTCATCTACTTGGCATTTGCTAAGGTTCACTCCATATGACATCTTAGAGCATGGGACTAGTACTTGGAACACAGCTGCTTTCAGAGCCTGTGACTTCTTGTGTGCCTCTCCTGTTTCTCAGCAACACTGGCATAGGGCCTGGGATACCAGGTCTGGGGATCTCAGGGACTCTTAGCACTTTAAGACACATGTGTTCCCAGGCCCTGGTGTGTTCCTCTAGTGCCAGAAAGATGTTTCATGCTTTGCTGACTTTGTATAAAGTCTGTTTGTAGCTGTTTTGACAGAATCTCAGCGTATAACTGAGGGTGGGGACATTAGCCAAGCTGCATTATAGGAGGACAAAACTGCCATACAAAGTGTCCAAAATCATTAAGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAG
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Task1_train_30715
The following genetic variant occurs in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
AGCCTGCATTTTTATTATTGGGAGTAATATCAAACCTCCTATTTTCCAATTTTCATTTCTTGTCCTGTGCTAGCTCCATCCTGTTTGGACTGCTCCTCCCATATGTAAACTAAGAAGAATCAAGCATTCTTTGCAACAAATACACACGATGCTCAAAAATGTCCAGGAGCATCCAATTTCCAAAGTTTCCTCCACCTGGAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAG
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Task1_train_30716
This sequence variant lies in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
GAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCT
GAATGCTCTTCATGCTAAAATCCTGTCTGACAATACCAGCATCTCTGGCCTGCACTCATCCCTTCCTGGAACTCCAAGTGCATTTACCCTCTGTTACCACTTACTTGGCTGCCTGAATTGTTAGTTGAAAATATTAGGTCTACTTAGCTAATTCTTCCTCAGGAAATTAAAGACTCCCATATGGCAGAGTCTGTGTCTTTTCTCTCTTCATATCCCGTATAACACCCAGCATAATGCTGGGCATATAGTGAGTATTCCATAAATAGTTGATGAATGACTAAAATAAGCAAGCAAACAAACAGACTAGAACAATAAGAAAGAAGGGACTGATTTCATAATCTCTCTGGCTTGCTATTTGAATTGCTGAATTATTATTATTTATTAAATATTTTTTAAATTCTGGCAATAAAAGGTAAGGATTTATTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTCTTGAGACAGAGTCTCGCTCTTACTGCCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCAATCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCTCCTGGGTTTAACAGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACGCCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCATGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCAAAGATTTATTTTCAAGAATGAAACAAAGTAAGGATTCTGGGTCAATCTCACATGCTGAAAGCCAAAACCTCTAGCCGCTCCTGCTTTTTGACTTCGGAGTGCCCACTATCTCCGAGCCTGTGAGCACAGGGCCTGGCAGAGGGGTTTGAGTGGCATGAGCTACCTACTGGATGTGCCTGACTGTTTCCCCTTCTTCTTCCCCAGGCTTGTTAGAGTGCTGTGCAAGATGTCTGGTAGGGGCCCCCTTTGCTTCCCTGGTGGCCACTGGATTGTGTTTCTTTGGGGTGGCACTGTTCTGTGGCTGTGGACATGAAGCCCTCACTGGCACAGAAAAGCTAATTGAGACCTATTTCTCCAAAAACTACCAAGACTATGAGTATCTCATCAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTTATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCT
Task1_train_30717
Here is a mutation in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
CAATGTGTAAGTACCTGCCCTCCCACACAGACCCATCTTTTTTTTCCCTCTCTCCATCCTGGAGATAGAGAACTCTTCAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGG
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Task1_train_30718
Here is a genetic alteration in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
CAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACA
CAGTACCTTAGTAACTAGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGCCCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACA
Task1_train_30719
The gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
AGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTA
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Task1_train_30720
The following genetic variant occurs in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
AGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTA
AGCAGGGGACTGGGGTGGAGCCAGACCGGATTCCCGAGTCTTCCCTCTGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTACTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTA
Task1_train_30721
A variant has been detected on Chromosome X in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
TGTGCAGATCTCTCCTGCTCCACATTCGAAGCCCATTCAGAAAGGAGGGGTCTGCCTGCCTGCCTGTCAGCCCCTCCCACCCCCGCCCCCTTGTTTTCTTACACGTGTTCTGACTTCTGCTAGGTGTGGTTCATATTGCCCAAGTTGGAGCCTCCAGCGTAGTAGGTATGGAGAAGCCAAGGGAGGCACTAAGCCTCTCCTGTTCCTAGAACAAGTTAGGCTCCTGTTCCTTCACCCACCTTTCTTCTTGTCTAGCTCCCTACTCCTGTGAGTTAGCATGTCTGAAGGGTGGGGCAGGGAGAGTAGGTCCCTGGTTCTCCAGGTCCCAGGGTAAGCAAGGTGTGGCGGGAGGGGCATATGTTTCTGGTCACATACACCCTGTCTTCACTTATTTCAACAAAGATAAGGTGAAAGCATGCAGGAGGAACCTGGTGATTCCTCTAGAAAATCCCTAGCCTTGTTAAGGTGCTCGCTCTGGTGTATACCTCACTTATGTCGGGAAAGAAGCCAGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAG
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Task1_train_30722
Given a variant located on Chromosome X and affecting RAB9B, PLP1 (RAB9B, member RAS oncogene family| proteolipid protein 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
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Task1_train_30723
The variant affects gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; not provided
AGGTCTTCAATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTC
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Task1_train_30724
This variant impacts the gene RAB9B, PLP1 (RAB9B, member RAS oncogene family| proteolipid protein 1) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
ATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTG
ATTAATAAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGTTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTG
Task1_train_30725
This variant affects gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease, connatal
AAGATTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCT
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Task1_train_30726
This sequence variant lies in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
TTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAG
TTCCCTGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTGCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAG
Task1_train_30727
This is a variant in PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
TGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCAC
TGGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACTTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCAC
Task1_train_30728
Given a variant located on Chromosome X and affecting PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Hereditary spastic paraplegia 2
GGTCTCGTTTGTCTACCTGTTAATGCAGGATCCATGCCTTCCAGTATGTCATCTATGGAACTGCCTCTTTCTTCTTCCTTTATGGGGCCCTCCTGCTGGCTGAGGGCTTCTACACCACCGGCGCAGTCAGGCAGATCTTTGGCGACTACAAGACCACCATCTGCGGCAAGGGCCTGAGCGCAACGGTAACAGGGGGCCAGAAGGGGAGGGGTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTCATTCTTTGGAGCGGGTGTGTCATTGTTTGGGAAAATGGCTAGGACATCCCGACAAGGTGATCATCCTCAGGATTTTGTGGCAATAACAAGGGGTGGGGGAAAATTGGGCGCGAGTCTGTGGCCTCGTCCCCACCCAAGGCTGGGTCCTCTCTAGGGGCCTGGCATTTGAGTGAGGAAGCGATGGCTGCAGCCGAACGAGAAGGTCAGGAAGAACGTGGTGCCCAGCTGGCTTAGCCTCACCTTTCAAAGGTTCCCTAAGCAAATTTCTTCTCAAAACAGAAAGCATGAGTTTTGTGGGATGCTTTGTACAATCAGACCATTTCTAAGCCATCTGTTGGTATCCCTTTGTTCCCTTCCTAGTAGGTACCACAAGAGTGGATCTAACTGGACAAGAGTCTAAAATGCTGCTCATGTGATTGAGACTTGGGCACCTGATCTGAGAGGGAGGATGGATAATAAAAATTAAATAATTAACTCCAAGGTGAAATTTACAATGTTCTGGGATCCTGCACAGTTCGAGGTCCCAGAGGGAATTGGAGTAGATCTGCATGTTGAATGTTTTATTGCCTGAGGGTTATCCATGCTTTGAGTGAGGTGCACATTTGTTTTCAGTCTCTGGAGTTAAAGATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCACC
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Task1_train_30729
Assess the clinical impact of this variant on gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family), found on Chromosome X. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease
ATCCTTTGGCGGCTGAACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCACCTTCATGATTGCTGCCACTTACAACTTTGCCGTCCTTAAACTCATGGGCCGAGGCACCAAGTTCTGATCCCCCGTAGAAATCCCCCTTTCTCTAATAGCGAGGCTCTAACCACACAGCCTACAATGCTGCGTCTCCCATCTTAACTCTTTGCCTTTGCCACCAACTGGCCCTCTTCTTACTTGATGAGTGTAACAAGAAAGGAGAGTCTTGCAGTGATTAAGGTCTCTCTTTGGACTCTCCCCTCTTATGTACCTCTTTTAGTCATTTTGCTTCATAGCTGGTTCCTGCTAGAAATGGGAAATGCCTAAGAAGATGACTTCCCAACTGCAAGTCACAAAGGAATGGAGGCTCTAATTGAATTTTCAAGCATCTCCTGAGGATCAGAAAGTAATTTCTTCTCAAAGGGTACTTCCACTGATGGAAACAAAGTGGAAGGAAAGATGCTCAGGTACAGAGAAGGAATGTCTTTGGTCCTCTTGCCATCTATAGGGGCCAAATATATTCTCTTTGGTGTACAAAATGGAATTCATTCTGGTCTCTCTATTACCACTGAAGATAGAAGAAAAAAGAATGTCAGAAAAACAATAAGAGCGTTTGCCCAAATCTGCCTATTGCAGCTGGGAGAAGGGGGTCAAAGCAAGGATCTTTCACCCACAGAAAGAGAGCACTGACCCCGATGGCGATGGACTACTGAAGCCCTAACTCAGCCAACCTTACTTACAGCATAAGGGAGCGTAGAATCTGTGTAGACGAAGGGGGCATCTGGCCTTACACCTCGTTAGGGAAGAGAAACAGGGTGTTGTCAGCATCTTCTCACTCCCTTCTCCTTGATAACAGCTACCATGACAACCCTGTGGTTTC
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Task1_train_30730
This variant impacts the gene PLP1, RAB9B (proteolipid protein 1| RAB9B, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Pelizaeus-Merzbacher disease, connatal
AACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGCTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCACCTTCATGATTGCTGCCACTTACAACTTTGCCGTCCTTAAACTCATGGGCCGAGGCACCAAGTTCTGATCCCCCGTAGAAATCCCCCTTTCTCTAATAGCGAGGCTCTAACCACACAGCCTACAATGCTGCGTCTCCCATCTTAACTCTTTGCCTTTGCCACCAACTGGCCCTCTTCTTACTTGATGAGTGTAACAAGAAAGGAGAGTCTTGCAGTGATTAAGGTCTCTCTTTGGACTCTCCCCTCTTATGTACCTCTTTTAGTCATTTTGCTTCATAGCTGGTTCCTGCTAGAAATGGGAAATGCCTAAGAAGATGACTTCCCAACTGCAAGTCACAAAGGAATGGAGGCTCTAATTGAATTTTCAAGCATCTCCTGAGGATCAGAAAGTAATTTCTTCTCAAAGGGTACTTCCACTGATGGAAACAAAGTGGAAGGAAAGATGCTCAGGTACAGAGAAGGAATGTCTTTGGTCCTCTTGCCATCTATAGGGGCCAAATATATTCTCTTTGGTGTACAAAATGGAATTCATTCTGGTCTCTCTATTACCACTGAAGATAGAAGAAAAAAGAATGTCAGAAAAACAATAAGAGCGTTTGCCCAAATCTGCCTATTGCAGCTGGGAGAAGGGGGTCAAAGCAAGGATCTTTCACCCACAGAAAGAGAGCACTGACCCCGATGGCGATGGACTACTGAAGCCCTAACTCAGCCAACCTTACTTACAGCATAAGGGAGCGTAGAATCTGTGTAGACGAAGGGGGCATCTGGCCTTACACCTCGTTAGGGAAGAGAAACAGGGTGTTGTCAGCATCTTCTCACTCCCTTCTCCTTGATAACAGCTACCATGACAACCCTGTGGTTTCCAAGGAGCTGAGAAT
AACATGTGTGGGTTCCAGCAATGTCTTTTTGTGGCCAGCAGTTAGCTTAGAAAGGTTTTGTATCTGAAATTTTAATCTCCTATTGGCTTTGTTCAATGGCTAGGGAACAAAAATGTTCCTATGGCAAGGAACATGTTCTAAGCTCAGCCTAAGGCACAAAATGGCACGACTTTCTTTCAAGATCTGTTTTGATTTCTTTACACCTTATCTGCCCAAAAACATCCTCTGAAGCCTCTCTAACCCAGGGATCCTCCTCACTCTTCCCCTACCCATTCCCCCCACCCTCCGTTATACTGGGGCCAGTTATCTAGTAGATACTGCCAATTACCCTTGGCAGAGGTGCCCTGCTCACTAATTTCATTTGAAGGAGAGCCCTGGAACCTGGTTTTAATGTCTGGCACACGCCACTCCAGGATCTCCCAGTTTGTGTTTCTACATCTGCAGGCTGATGCTGATTTCTAACCACCCCATGTCAATCATTTTAGTTTGTGGGCATCACCTATGCCCTGACCGTTGTGTGGCTCCTGGTGTTTGCCTGCTCTGCTGTGCCTGTGTACATTTACTTCAACACCTGGACCACCTGCCAGTCTATTGCCTTCCCCAGCAAGACCTCTGCCAGTATAGGCAGTCTCTGTGCTGATGCCAGAATGTATGGTGAGTTAGGGTACGGGTGCTTTGGCTCTCCTACCCACTATGGAAGCACTATATATTTGGTTATTTTCTTAGTGTAAGGAGGGTGGTGATTATGAGAAAAATATAAGATGATGAATGATTGGGTCTTAGTTTATTAATCCTTCCCTACTGAAACCAGAGAGGTTTCTTCCCCGGGAAGGGAACTTGGAAGTGGTGGGAGTTTTCTTGGCCATTCACATTGGCCTACTCTAGTTGACTGCTGTTCACAACCCCAAAGCAGCACATTTCAATAACAAACACAAGGTTTCACCACTGTTCAATACCACCTTCTCTTTTTTGTAAACCTGTAGAAAAGAGGATCCTGATTGTTGGTAGAATCCAACTTTACAGCCAGGATAATTAGAGATGGAAGAAGGGCTCTGGGGGAAAGTCTCCATGTGGCCCCGTAACTCCATAAAGCTTACCCTGCTTGCTTTTTGTGTCTTACTTAGGTGTTCTCCCATGGAATGCTTTCCCTGGCAAGGTTTGTGGCTCCAACCTTCTGTCCATCTGCAAAACAGCTGAGGTGAGTGGGTTATTTGGGTTATTTTACAAGGGAGTAGCTAATACCATACAAATTACACCCATGGCCTTCAATTTTAAGGACTGAAAGTTTCCCTTTGCTGGATTTTGAATTAGCCGATTGCCTTCTACAACATGTTGGCTAAGTGTGCCTGAGCCAATGAGCATAGAAGGTAAAACACCTGTTTTCTCTAGAGTTGCATAGAAAGACTTCCTTTCCAACCCTTCCCCTCTTAAAAGAGAAGTTTGTAGCTTTAGGTAAAGATAGAGCCTAATGGCAAAATCCCCCACATGAAAATTTTCATTCCTTTAGTTAAAAACCATATCAAGAAAATGGGCTGTGCACAGAGGCATTCATAGGTTTTATGAAAACATTTTCAATTTGGAACTTCTTTATCTCAAATGAGAGGTAAAATAAGTACATTTGAAAGGGAAAGCACTGTATTGAGAACAGATATTATATACAAATGAGGCAGGGGAATAAAAGTAAATCCGGGGGAGACAGGCAGTAAATTATTTCTTTGACAGCAAAATGTTGACTTTAAATTTTGGGCCCCTGGGCACAACTGTAGGGAACCAGTTAATTATTTTGGAGTACTGTACTATTTCATGACTATTCTGTGATCTGGGTGTTAATGGGCCAGGTGCTATGGTGTACACTGAAGACTGGGAGGCCCACATTTAGGGAAGTGAAAACTTAGTTAGAGATGTGGAATTAGCACACAAGAAAGATATCAACACATTCAGAAAGCTGTATTCATGATTTACAGTGGAGCATATTACTGCTGTTGCAAGAAACAGTTCTTCCTCTTTCATTTTCCTGCAGTTCCAAATGACCTTCCACCTGTTTATTGTTGCATTTGTGGGGGCTGCAGCTACACTGGTTTCCCTGGTGAGTTGACTTTGAATGATCTTGGCAAGTAAATAGGCCTGAGATAGTGTGGGTACAGCTATTCTGAAAGGCAAGAAGGTAGACTGCTTCCATCCTTGAAATGCTGGAGGGAAGCTTCTGGGAAGATAGCAAAGGGTGGAGGCTCCGTACTTCTACTTGCATTGGCAAGGCAGAAAGACATCACAAATTAGATGGGAACAAGAAAAGTGGTATGAGGAAAGAGGTAAGAGATTCATAGACACGAATGATAATATTTAGTATTTATAGAACATGTAATGTTGCCAAGTACTTTGCAGTCATAAATTACGGTTAATTCTCAATACATTTTGATCAGATCAGTGACAAAACACTGAAACATCACGAAACATGACTTGCTATAGCCTGGAATTCTATATACTATCAATATGAATCCACTTTGGATACTCTCCAGTGGATTTAGTTACTCATATGGAAATACTGGGAGGACCTCCTAACATTATTAGAATTGTTATGATTATAATACAATGCTATGTCCCAGGTCTTGCTGATAGTGCTACAGTGCCCTGTGAATGTAGTGTGCTCATTGTGCAGATTAAAAACCTAAGGCACTGAAGGGTGAAGTGATTTATCTGAAGTTATTTTATAAGCAGTGATCAGACAAGATGAGCTCACAGAACTCCTGGCCCCTACTGCTGAGGTTTCCATACAGAGTCAAGTAATTTCTCACCTTGTAAAACGAATTGATTCATTAACCAGGGGAGAGCTCTACTGCATGATGTGGCTGTGTGTCTACAGCAAGCACCCTATGACTCTAAGTCACTCGGACATATTGATGTGGCAAAGCCCAAATATTGTTCACTTCCCTGAGGAAAACTCAGTGCTAGATCAAACAGAGGTGTGGAATAAATCTTTATGATTTGATTCTCTGGGCCTGGGCCATGAGACCCATGATGCCTCAGAGACATCGGACTTCCAGTCAAGTGTATATGGAGAAAGCCAAGCCTGGGATGTACTGCTTTTTGCAGAGCATGGGTTTTTCCCTTATTTAGTTATGATTTTATTTCTACCCTTCCTCATTCCCAAAGGGATTTGAGGAGGGAGTGCTTTCTTTTCTACTCTCATTCACATTCTCTCTTCTGTTCCCTACAGCTCACCTTCATGATTGCTGCCACTTACAACTTTGCCGTCCTTAAACTCATGGGCCGAGGCACCAAGTTCTGATCCCCCGTAGAAATCCCCCTTTCTCTAATAGCGAGGCTCTAACCACACAGCCTACAATGCTGCGTCTCCCATCTTAACTCTTTGCCTTTGCCACCAACTGGCCCTCTTCTTACTTGATGAGTGTAACAAGAAAGGAGAGTCTTGCAGTGATTAAGGTCTCTCTTTGGACTCTCCCCTCTTATGTACCTCTTTTAGTCATTTTGCTTCATAGCTGGTTCCTGCTAGAAATGGGAAATGCCTAAGAAGATGACTTCCCAACTGCAAGTCACAAAGGAATGGAGGCTCTAATTGAATTTTCAAGCATCTCCTGAGGATCAGAAAGTAATTTCTTCTCAAAGGGTACTTCCACTGATGGAAACAAAGTGGAAGGAAAGATGCTCAGGTACAGAGAAGGAATGTCTTTGGTCCTCTTGCCATCTATAGGGGCCAAATATATTCTCTTTGGTGTACAAAATGGAATTCATTCTGGTCTCTCTATTACCACTGAAGATAGAAGAAAAAAGAATGTCAGAAAAACAATAAGAGCGTTTGCCCAAATCTGCCTATTGCAGCTGGGAGAAGGGGGTCAAAGCAAGGATCTTTCACCCACAGAAAGAGAGCACTGACCCCGATGGCGATGGACTACTGAAGCCCTAACTCAGCCAACCTTACTTACAGCATAAGGGAGCGTAGAATCTGTGTAGACGAAGGGGGCATCTGGCCTTACACCTCGTTAGGGAAGAGAAACAGGGTGTTGTCAGCATCTTCTCACTCCCTTCTCCTTGATAACAGCTACCATGACAACCCTGTGGTTTCCAAGGAGCTGAGAAT
Task1_train_30731
Here’s a variant in SERPINA7 (serpin family A member 7) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Thyroxine-binding globulin, Chicago
CAGGGCCAGGATTGTAATGTAACTTTAGTGAAACACAACTCCATGTTAACAATGAATTTTTGTACCAGAGATTCTGCTCTGGGCTTCAAAAATTGCTTACACAAAAGCAAAGTGTGAACTATACCAGGAATAAACAAACTTCCATGCAAATGGGTCTAATCAGAAAAAATTAGAATGTTTGTAATACACATGCTTTTCTAAACATAAATATTTATTTCAATATGGAAGTACAACATCTGCAACAGTACTTATGCATTTTTTTTACTATTTTCCTGTCACTGAAGTGTTTTACCTCAGGGCTAGAATTTCAGATACTACATCATTACCACTCACTGTGCCATTTATACTCAAGCTTTAAATACATAGTGTCTGAAATAAAATCTAGTTTGGTAGGTGGTAATGAGTTGGCATGTACAGGTAGAGGGAAGGTTGTTGAAGGATCTGGGGATACAAAAGTACCAATATTCAGTGAAATTAGAGCCAAAAAGGAGATTCCTACTTAAACAAGTGGGACAGGGGTGCTATATATGGAAAGGAGTCTGATTGGGATACAGAAAAAGAGGGTCTATGAGATATGACATGAATGAATTACTTTCTTTCTCCACTCCCAGCTTATACATTGGCAAGGTGGAAGTATGTTTTCTTGGGGGGAAGGTGGGGTTGGACAGGCAAGTTTATCTCTTGCTGTATTGTCCCATGCTTGTTCAGTAACTTGTTCAGTTGTCTCAGTCTGTAACTCATCCCCATAGTGGGAGTTCCTTTATTCAACCTACCAGTGTCAGATCTGGCAAGAACTCAGAGAATCCTACTAATGGGACAGTGGGAAGGGGGTTGAGAAGTTCACATATAAGACAATGCATCTGCATTGTTTTATGTCCATTGATCTTATTGGAGTACTGGGATACGAAGACCTGACCTGCTTTTTAGCTATTCCCCAGAAGACAGAAAAGGGAAAATTTTTCAACCCAGTCAAATTTATTAGAGCAAATGAGTTGAGGGGTATTCTGACAAAGAGAAATATACAAACATAGAGCCTTCCTATGCTTTGGATAATAATGAATTACTCATTGACATTCTGAATGCTCTGCCATAGGATTGGCCTCTTCCACAGCCAACAAAGTTCAGCCAGGGTTCAATCTTCATCCCATCATAAGGGAATGCAAGTCCAAGCTCACATCAATCACACCAGGCTATATTATTTATTTATTTCCCATTGCAATACACACGTGCAATTAGCCAATGGCCTTTTTCCCAACTACGCTTCCGTTGGGTTCACAACTTTCCCTAGAAAGAGAATACTCCTTGTGCTTCTCTCCAAAATCAACAACATGAAAGATCTATCAATTTGGATAATAGGGTGTAGGAAAGTGTTTTCAGGCTGATCCGAAAGTTCAACTTCAGGGACAGCTGCAGCTTCAGTTCCCTTTTCACCAATGTGCAGCACAGCCTTATGGGCAGCCTGTGTGGGGAGAACAAATCCTGCGGGTCTCTGAAGAAACAGGAACAGTCTTTGGGAAGGTCTAGAAGTAAGAAAGGGAAAGGAAAGGTGGGGCCGCCCCTTTGCTATACTATGTTGATGGTGCTAGAATATGAAGTTTCCTCTGCTAAATGTAGTCAATCATTCTCTGGCGATTCTACGGCTAGCCATTGGGAAACACCTCATTCACTATGGCCTGCTGCCGCCAGGAGTCACCTCTTAAGCATTCCCTCCTCACACCTCCTTCAGAACTGCATCTCACCAGAGTCACTTCTGATCATTAAGCTGTTCTATCAGAGTAATTCTGGGACATAAAGGTCAAGGATGGAAGAAACTGATACAATTACTTATTTGGAGTAATGGGAATGACTCTGGAGTGATTCTAGCTTAGGAGGAGTCACACCGCCTCTCTAGGCATCAGATTGCTAATTGGTAAAATAAGAAAGTTGAATCAATTGACTCCTAATTGCTCTTCCAGTTCATACATTTAAGAACTCTAGTTTATCAACTTACATTGGAAAGTTTCAGACCATTGTCCTCTGTGAGTCCAGAAAAATCAGCATTTTCAGAATAGGCATGCTGAATGCCCATCTTCAAAAGTGTGGCTCCAAGGTCATATGTGGCAGAAATGGAAAACTTTGGAACAAACAAGTCAACCCATCTGTGGGAAAAGAGGAAGGGAACACATGGCAATCACCATATCAAGCTTATGATTCTCTCCTTCTCTCTCTCATGATGGTATTATATTGGACTCTGCTTCTTCCCTGAGTATTGATAACCATTACTATGTAAGTCAATACATGGCACCAAACTCACAGAAGTTATTCTGAAAGGAATGCACTCAGGTACAGCCAATGTTGGACTGAAGCACTGGGAGTAGGGAGATGTAACTCCTTTATAATCAAGAGAAAATATCCCTGAGGTGACGACCAAGGTTGGGGAGCTAGTGGCATGAAGGTTAATGGGTAGCACCCAGGAGCTTCACAGTTTTCTGCCTTGCACTTCCAGTACAGAGTGGCTGCCCAATCACCTTTCAACATCAAAATCCAACCTGTTCTTTGAGCTCTAGTTGGTCTACAGGAAGCCATCAATTTACTAATAGGCTGACTTTGGGGAGCTCATCTTATCTTTCAAGACCAGACTTCCTAATTTGAAAAATGCCAATTATACTGCCTCCTTTGTAGGTTTGTTGATGTGCTTGGATGATATGAAGTATGTAGAATGCCCAGCCAAGGGCCTGGTAGACAGTATTTTCTTGGCATATTCTAGTGATCATACATAGCTGTTGGGTAGTTCAGGGTGATTCTTCTGCCTCTGGGTTTCTGCTGAACTCTGTCTCACCTGCACTTTTATGCCCACCTTCCACCCACACATCCTCTAAGGCATTTACCCCTTCTGTAGTAAGCGGTTCCACTTCTTCAGTGTTTTAGATGACATGGCAGCTTCCACTGACTCCATCTGTCCCTCCTTGGGAAGAACAAAGAGTGCCAGAGCATTCTTGCTGTAGTCCATTTGCAGAACTGTGCAGTTCAATTCCATATCCACTAGGTGATAGTATTGTTCCATCTGGTGCATCATGGGCACTTGAACAGTGGTGGTCTTGTCTATTAAGAAGCTGGAACTGTCTTCTGTCTTGGATGGATCAAAAGGATTTGCCCACTGGGCTTAAAATACAAAGAAAAGAGAGGTGTTTATTTTAAACCGGTATCAGTACCAACAAGACCTTTTCCATTAGTGATTTCATTTAGAAATTAAGATCACCACAGAGTTAGGTACCTACAGTCAACCAGTTTTACAAGTGACTGAGGATCAGGCAGAGAAAGTCATTTGTCATGGTCTCCCAGTTAACAGGTGGCAGAGCCAGGAATCATACCCAGGGCTGTTGGGCTCCACAGTCTGTATTCAAAACTACTATACCACACTAAGCCCATCAGAGCCATAGTTTCCTCTTCCATAAAAAGGTATAACGACATCCAACACACTAGGGAGAAGTGAGAAAACAGATCTGTTCTGCAATTTTAGCCAATCTATCTATGTGTGGTTTGTGGCCGACAATTGATTACTCCTCCAAGAAATGTGGCTGACATATACTATAGAACCAGGAGAAATCATTTGAGCACAGTACCTTTAGGAAATAGTCACATGATTCTTGTTTCTACAAGCACCAGCTTTAGACTCACACAGACCTTGTTGGTAATATCAGTTCTAAAACTTATTAACTGTGTAAACTTGGACACTTATGAGTATTGATTGAGACAGTGTGTGTATACCACACATGTCAGATGGTGTTTAGTACACAGTGAGTGCATAATACATGGTAAAATTATGTATGTAACATGCCTAAGTATGTACAGCAAGTGAGAATCACAGTAGGCTTTACATACAAATATGTCTACTTGACAAGTGCAAGCTTGTCCCACCTCACCAAATCTTTTGGAAACCATGAATCTTTAGCCAATTATGAGCAAGATGTTCATACCATTGTCACCCACCTCTCTGAAAGGGCGCTCTCCCTAGAAATTTCCTGGACTCATTCACAGAGCTGTGTGTCCATCTTGGAAGATCCAATACTATTCACAGCTATGTCCAGTGGAGCAGATCACTGTGGTATGAGGGACA
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This variant impacts the gene SERPINA7 (serpin family A member 7) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Thyroxine-binding globulin, slow
TCCTTCTCTCTCTCATGATGGTATTATATTGGACTCTGCTTCTTCCCTGAGTATTGATAACCATTACTATGTAAGTCAATACATGGCACCAAACTCACAGAAGTTATTCTGAAAGGAATGCACTCAGGTACAGCCAATGTTGGACTGAAGCACTGGGAGTAGGGAGATGTAACTCCTTTATAATCAAGAGAAAATATCCCTGAGGTGACGACCAAGGTTGGGGAGCTAGTGGCATGAAGGTTAATGGGTAGCACCCAGGAGCTTCACAGTTTTCTGCCTTGCACTTCCAGTACAGAGTGGCTGCCCAATCACCTTTCAACATCAAAATCCAACCTGTTCTTTGAGCTCTAGTTGGTCTACAGGAAGCCATCAATTTACTAATAGGCTGACTTTGGGGAGCTCATCTTATCTTTCAAGACCAGACTTCCTAATTTGAAAAATGCCAATTATACTGCCTCCTTTGTAGGTTTGTTGATGTGCTTGGATGATATGAAGTATGTAGAATGCCCAGCCAAGGGCCTGGTAGACAGTATTTTCTTGGCATATTCTAGTGATCATACATAGCTGTTGGGTAGTTCAGGGTGATTCTTCTGCCTCTGGGTTTCTGCTGAACTCTGTCTCACCTGCACTTTTATGCCCACCTTCCACCCACACATCCTCTAAGGCATTTACCCCTTCTGTAGTAAGCGGTTCCACTTCTTCAGTGTTTTAGATGACATGGCAGCTTCCACTGACTCCATCTGTCCCTCCTTGGGAAGAACAAAGAGTGCCAGAGCATTCTTGCTGTAGTCCATTTGCAGAACTGTGCAGTTCAATTCCATATCCACTAGGTGATAGTATTGTTCCATCTGGTGCATCATGGGCACTTGAACAGTGGTGGTCTTGTCTATTAAGAAGCTGGAACTGTCTTCTGTCTTGGATGGATCAAAAGGATTTGCCCACTGGGCTTAAAATACAAAGAAAAGAGAGGTGTTTATTTTAAACCGGTATCAGTACCAACAAGACCTTTTCCATTAGTGATTTCATTTAGAAATTAAGATCACCACAGAGTTAGGTACCTACAGTCAACCAGTTTTACAAGTGACTGAGGATCAGGCAGAGAAAGTCATTTGTCATGGTCTCCCAGTTAACAGGTGGCAGAGCCAGGAATCATACCCAGGGCTGTTGGGCTCCACAGTCTGTATTCAAAACTACTATACCACACTAAGCCCATCAGAGCCATAGTTTCCTCTTCCATAAAAAGGTATAACGACATCCAACACACTAGGGAGAAGTGAGAAAACAGATCTGTTCTGCAATTTTAGCCAATCTATCTATGTGTGGTTTGTGGCCGACAATTGATTACTCCTCCAAGAAATGTGGCTGACATATACTATAGAACCAGGAGAAATCATTTGAGCACAGTACCTTTAGGAAATAGTCACATGATTCTTGTTTCTACAAGCACCAGCTTTAGACTCACACAGACCTTGTTGGTAATATCAGTTCTAAAACTTATTAACTGTGTAAACTTGGACACTTATGAGTATTGATTGAGACAGTGTGTGTATACCACACATGTCAGATGGTGTTTAGTACACAGTGAGTGCATAATACATGGTAAAATTATGTATGTAACATGCCTAAGTATGTACAGCAAGTGAGAATCACAGTAGGCTTTACATACAAATATGTCTACTTGACAAGTGCAAGCTTGTCCCACCTCACCAAATCTTTTGGAAACCATGAATCTTTAGCCAATTATGAGCAAGATGTTCATACCATTGTCACCCACCTCTCTGAAAGGGCGCTCTCCCTAGAAATTTCCTGGACTCATTCACAGAGCTGTGTGTCCATCTTGGAAGATCCAATACTATTCACAGCTATGTCCAGTGGAGCAGATCACTGTGGTATGAGGGACACCTACTGATGCCAGTAATAAGAGACCATGAGCTCCCCTCAGCACTCCACCCAAGTATCTGAGCCCTAGACTGAAAATTGACATCTGAAAGTCTTACCTTTAAAGTGAATATAGTTCACTAAGACCATGATGGTGTTTGGCTTGAGGTCTTGAATTAGACCCACAACTTTCCCTTTGGTTTGCATCTCCACATGACTGTTAATCTCCTGCTTGGCTGCAGAAATGTTGGAGAAGTCGGTAGAAAAGACTTCAGTCTCATAGAGGGTCTTGACATCATTCAAGAACTTTGCCAGTGGTTTCAGATGCTTGCCAATGAAGAGGGCATTTCCTATCTGCAATTCCAGTTCCTTCTTTGGAAAATTCAGTGAACAGATCAGATGCTGGAAGCCATGCTGGATCTCTACCATTGGAGTGTCTGTGAGGTTGAACCCCAAGGTCTCCACAATCTCAGTTTGGGTGCTGCAGCAGGCCCCAAAGGAAAGCATAACCAAAGCTGCAGAAATGCTCACAGGGGAAAAGAAGATGTTCTTATCTGGGGTCTCCACAGTGAACCTCCGGTACAGATTGAATGCAAAGTCAGCATTAATGGATGACATCTTGTAGAGAGTGGCATTTGGTTGGGATGAATGGCAGGCTGTTACTTTGCCTTCAGGTGATGCACAGTGGATTGTAGCATGAAGCCCAAGTACCAAGAGAACCAGATACAGGAATGGTGACATTTTGGAAGGAAGTTAATCTATAAGAGATGAAGTGAGACAACCACTGAGGGAGCTTAGTTGGATGAAACACTCCCTGAGCCAGAGACACATAATAACCACCCACATTGATTAATAAAACAATAGTAAATATTTGATGATGTGCTCATCAGGGGCTGAGCAGGGGTTTCTCTCCCTTGAAAAACAGGAGATGCATCTAATATGGACAGGGAGTAGGAGAAGTGGCTTGCTGCAACCACGGAAATAATGCCATGGACTGTCATTCAGATGTTATAGCAACATTATGAAAACGCTGTGAGTAAATTAAATTTATGGAAATTGAATCACTTTTTTTCTGAACTAGAGGCAGCCTTTTGGAGAGAGGGGATATTCTTAGGTTAAACTAGTACTCCCTCTGTATACATTATTCATTGTAGATTAGAATTTTAGATTTTTTTTTTCATCTGGCATTTTCTTAAGATAAAATCTATGAGATGAGAGAACACTCGCATCTTATTTGGCTAAAAGACAAAATGAAAGTAATTTGTACAATATATGATTAGTTGGAATGGATGGGTGGTGGTTTATGGAGCCACGTACAAGGTCATGAGCTGAAATTCATGCATTTTGCAATGCATGGAAGCCATAGAGGTATTTTCGAACAACCAGAAAATGAAAGAATAATTTTCTAAATTTTACATTTCTTTCACCATTAATCTTAGTAACATCTAAACAGTCATTTCTAAGTTGTAAGACATCTTAACACTATTATTCTTACACCTATGCATGTTACTTTTAATTATTATAAAGAAAGCCAGAAAGATAAGGTGTAAGGTTCTCTGATCCTGAAAGAGTGCAAAGAAATGGAGTAAAGAAGTCAGGTGTGGAAATCCAATGAAAGTGGACATGTGTGCTTAGAAGGAAGAGGTCTATGAACTCAGAAAAAGGATCCTTCCTCCACCCTCCATCTTCTTCCTGAGTGATCTTACCCTCCGCACTCAATTGCTAGAAACTGTATCTCTCTCAGATTGCTCTCCTGAGCTCCTAGCCATTTATCCAGCTTTCTTTTGGATATAACCACCAGGATGGTCCACACAGACCTCAGTCTCAATAAGAAAATCTCAAAGTTGCCAGATGTAAACATATCATCTCCCTACACCTTAAGCTTGCTCCCTCATCTTCATTCCACATCTCAGTTTATCACATCACTGTCTATAGAGACACCTAAGCCAGATACCTGGGAATAATCATAGCCTCCTTTTATTCTCATTCCCCATATCTAATGAAGCATGATGTCTTATGAATACTAACTCTTAAATAACTCTCAAAACTTCTCCCTTCTCTTCATTCCTGCTGCCTCTGCCTCTCAGTTCATGGCCTGAGCTACTATATCAGCTCCTAACAGATCACACCATCTCCTATATCCTCCATACCAACCCCCTTTGTTCACCACTCTATCCAATCTCCATATCATCATCAGAGTCCTCTTTCTTTAAAAGTC
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Task1_train_30733
Chromosome X houses a mutation in gene SERPINA7 (serpin family A member 7). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Thyroxine-binding globulin deficiency, partial
GCTAGTGGCATGAAGGTTAATGGGTAGCACCCAGGAGCTTCACAGTTTTCTGCCTTGCACTTCCAGTACAGAGTGGCTGCCCAATCACCTTTCAACATCAAAATCCAACCTGTTCTTTGAGCTCTAGTTGGTCTACAGGAAGCCATCAATTTACTAATAGGCTGACTTTGGGGAGCTCATCTTATCTTTCAAGACCAGACTTCCTAATTTGAAAAATGCCAATTATACTGCCTCCTTTGTAGGTTTGTTGATGTGCTTGGATGATATGAAGTATGTAGAATGCCCAGCCAAGGGCCTGGTAGACAGTATTTTCTTGGCATATTCTAGTGATCATACATAGCTGTTGGGTAGTTCAGGGTGATTCTTCTGCCTCTGGGTTTCTGCTGAACTCTGTCTCACCTGCACTTTTATGCCCACCTTCCACCCACACATCCTCTAAGGCATTTACCCCTTCTGTAGTAAGCGGTTCCACTTCTTCAGTGTTTTAGATGACATGGCAGCTTCCACTGACTCCATCTGTCCCTCCTTGGGAAGAACAAAGAGTGCCAGAGCATTCTTGCTGTAGTCCATTTGCAGAACTGTGCAGTTCAATTCCATATCCACTAGGTGATAGTATTGTTCCATCTGGTGCATCATGGGCACTTGAACAGTGGTGGTCTTGTCTATTAAGAAGCTGGAACTGTCTTCTGTCTTGGATGGATCAAAAGGATTTGCCCACTGGGCTTAAAATACAAAGAAAAGAGAGGTGTTTATTTTAAACCGGTATCAGTACCAACAAGACCTTTTCCATTAGTGATTTCATTTAGAAATTAAGATCACCACAGAGTTAGGTACCTACAGTCAACCAGTTTTACAAGTGACTGAGGATCAGGCAGAGAAAGTCATTTGTCATGGTCTCCCAGTTAACAGGTGGCAGAGCCAGGAATCATACCCAGGGCTGTTGGGCTCCACAGTCTGTATTCAAAACTACTATACCACACTAAGCCCATCAGAGCCATAGTTTCCTCTTCCATAAAAAGGTATAACGACATCCAACACACTAGGGAGAAGTGAGAAAACAGATCTGTTCTGCAATTTTAGCCAATCTATCTATGTGTGGTTTGTGGCCGACAATTGATTACTCCTCCAAGAAATGTGGCTGACATATACTATAGAACCAGGAGAAATCATTTGAGCACAGTACCTTTAGGAAATAGTCACATGATTCTTGTTTCTACAAGCACCAGCTTTAGACTCACACAGACCTTGTTGGTAATATCAGTTCTAAAACTTATTAACTGTGTAAACTTGGACACTTATGAGTATTGATTGAGACAGTGTGTGTATACCACACATGTCAGATGGTGTTTAGTACACAGTGAGTGCATAATACATGGTAAAATTATGTATGTAACATGCCTAAGTATGTACAGCAAGTGAGAATCACAGTAGGCTTTACATACAAATATGTCTACTTGACAAGTGCAAGCTTGTCCCACCTCACCAAATCTTTTGGAAACCATGAATCTTTAGCCAATTATGAGCAAGATGTTCATACCATTGTCACCCACCTCTCTGAAAGGGCGCTCTCCCTAGAAATTTCCTGGACTCATTCACAGAGCTGTGTGTCCATCTTGGAAGATCCAATACTATTCACAGCTATGTCCAGTGGAGCAGATCACTGTGGTATGAGGGACACCTACTGATGCCAGTAATAAGAGACCATGAGCTCCCCTCAGCACTCCACCCAAGTATCTGAGCCCTAGACTGAAAATTGACATCTGAAAGTCTTACCTTTAAAGTGAATATAGTTCACTAAGACCATGATGGTGTTTGGCTTGAGGTCTTGAATTAGACCCACAACTTTCCCTTTGGTTTGCATCTCCACATGACTGTTAATCTCCTGCTTGGCTGCAGAAATGTTGGAGAAGTCGGTAGAAAAGACTTCAGTCTCATAGAGGGTCTTGACATCATTCAAGAACTTTGCCAGTGGTTTCAGATGCTTGCCAATGAAGAGGGCATTTCCTATCTGCAATTCCAGTTCCTTCTTTGGAAAATTCAGTGAACAGATCAGATGCTGGAAGCCATGCTGGATCTCTACCATTGGAGTGTCTGTGAGGTTGAACCCCAAGGTCTCCACAATCTCAGTTTGGGTGCTGCAGCAGGCCCCAAAGGAAAGCATAACCAAAGCTGCAGAAATGCTCACAGGGGAAAAGAAGATGTTCTTATCTGGGGTCTCCACAGTGAACCTCCGGTACAGATTGAATGCAAAGTCAGCATTAATGGATGACATCTTGTAGAGAGTGGCATTTGGTTGGGATGAATGGCAGGCTGTTACTTTGCCTTCAGGTGATGCACAGTGGATTGTAGCATGAAGCCCAAGTACCAAGAGAACCAGATACAGGAATGGTGACATTTTGGAAGGAAGTTAATCTATAAGAGATGAAGTGAGACAACCACTGAGGGAGCTTAGTTGGATGAAACACTCCCTGAGCCAGAGACACATAATAACCACCCACATTGATTAATAAAACAATAGTAAATATTTGATGATGTGCTCATCAGGGGCTGAGCAGGGGTTTCTCTCCCTTGAAAAACAGGAGATGCATCTAATATGGACAGGGAGTAGGAGAAGTGGCTTGCTGCAACCACGGAAATAATGCCATGGACTGTCATTCAGATGTTATAGCAACATTATGAAAACGCTGTGAGTAAATTAAATTTATGGAAATTGAATCACTTTTTTTCTGAACTAGAGGCAGCCTTTTGGAGAGAGGGGATATTCTTAGGTTAAACTAGTACTCCCTCTGTATACATTATTCATTGTAGATTAGAATTTTAGATTTTTTTTTTCATCTGGCATTTTCTTAAGATAAAATCTATGAGATGAGAGAACACTCGCATCTTATTTGGCTAAAAGACAAAATGAAAGTAATTTGTACAATATATGATTAGTTGGAATGGATGGGTGGTGGTTTATGGAGCCACGTACAAGGTCATGAGCTGAAATTCATGCATTTTGCAATGCATGGAAGCCATAGAGGTATTTTCGAACAACCAGAAAATGAAAGAATAATTTTCTAAATTTTACATTTCTTTCACCATTAATCTTAGTAACATCTAAACAGTCATTTCTAAGTTGTAAGACATCTTAACACTATTATTCTTACACCTATGCATGTTACTTTTAATTATTATAAAGAAAGCCAGAAAGATAAGGTGTAAGGTTCTCTGATCCTGAAAGAGTGCAAAGAAATGGAGTAAAGAAGTCAGGTGTGGAAATCCAATGAAAGTGGACATGTGTGCTTAGAAGGAAGAGGTCTATGAACTCAGAAAAAGGATCCTTCCTCCACCCTCCATCTTCTTCCTGAGTGATCTTACCCTCCGCACTCAATTGCTAGAAACTGTATCTCTCTCAGATTGCTCTCCTGAGCTCCTAGCCATTTATCCAGCTTTCTTTTGGATATAACCACCAGGATGGTCCACACAGACCTCAGTCTCAATAAGAAAATCTCAAAGTTGCCAGATGTAAACATATCATCTCCCTACACCTTAAGCTTGCTCCCTCATCTTCATTCCACATCTCAGTTTATCACATCACTGTCTATAGAGACACCTAAGCCAGATACCTGGGAATAATCATAGCCTCCTTTTATTCTCATTCCCCATATCTAATGAAGCATGATGTCTTATGAATACTAACTCTTAAATAACTCTCAAAACTTCTCCCTTCTCTTCATTCCTGCTGCCTCTGCCTCTCAGTTCATGGCCTGAGCTACTATATCAGCTCCTAACAGATCACACCATCTCCTATATCCTCCATACCAACCCCCTTTGTTCACCACTCTATCCAATCTCCATATCATCATCAGAGTCCTCTTTCTTTAAAAGTCACTGAGGCTGGTAGAAAGTCAATTATTAGATGACCACACTTAGACCTTCACCCCTAGAGCCAGGAATTTGGTTTGGGACTCTGACTTGCCAACTTGGTTATTTGGGACTCTGACTTGCTGATAGAGATGTTCAAAGTTTCCAAAGAGAAAAAAAGTACTTACAGCAAATGCCCAAGAATCCACCTGCATCTCTCAGAAAGCAACATCTTTCCATTTTTATAGCA
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Task1_train_30734
This mutation is located in gene TBC1D8B (TBC1 domain family member 8B) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 20
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Task1_train_30735
This mutation is located in gene TBC1D8B (TBC1 domain family member 8B) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Nephrotic syndrome, type 20
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Task1_train_30736
A mutation found in CLDN2 (claudin 2) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Azoospermia, obstructive, with nephrolithiasis
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AAGACCAGTGTGGGCAACATGGCAAAACCTGGTCTCTACAAAAAATACACACACACACACACAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAATGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGCCAAAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAGAAAGAAAGAAAAATTAGTGGATCAGAGGGTCTTGTAGAGAATGGGGAGGTGTGCCCTTGACCCTTAGTGTCCTGAATCTTGGCAACACCGAGGGCTCCTTGAACACGGCAAAATCTTATATGGCTCTGAGATTCCAAAGCATTGACTCAGATACCTGCCTCATGCAAAGCCCTATATTCTAGAGCAGTTTCCCTTTCCTCTGTGGCAGACTCTTGTCCCCCCTAACAGATGGCCCAGGGAATTTCAGGGCCCCCTCTCAGTCCTGGAACCCTTGTTCCAGAGTGCTCCCTCATCATCCAAGAGGCTGATGATGGGAGCATCTATTAGGAGACTGGACAGGAAATGTCTGGGCATGTTATACATGCAGGAGGCCTTAGACTAGGCTGCAGAGGGGGATTTGGGCATGGCTGGGAGGATCTGAACTCTCAGAGTATGGACAGAAGGCTTTGCTGCCCACCCCCATCTACCCTGGAGTAGATTTTCACCATGGGCAGAATGATCCAGGGCTAGGCCACTACTCTCTAGGCCCCTGGAGATTCAAGAGGCCTCTAACAAACTGGAGTCCAAGACTACATTCTAGGATCTGTTCCTCCTGATGTAGTCTGCAGTTTGGCCTCAGTCTGCAATTGAGGGGCCCTATGGCACTGTTGCTTGGCAATGTATTAAACAGCAGGCCTTGGAGACTAGCACTTGAGTTAACACAGCCACCACAACCACCACTGCCATCATCACCTTCCCGGAAAGCAGCCACCTGTCTGGCTCCTGGCTTTGTCCAGCTGCCAACCTAAGGCATGTGCCTACGCAGGAGGCGATGACATTTTGGCTCCACGTTCAAAGTTGTTTTTTTTTTCCTTTCTCATGTGTTATTTCTAAAGATAACAAAGGTCAAAAGGCATCCAGCGTTTTCTGGTTTCTCATAAGCTTCTGGTCAATATTTAATCTGGTTTATGGATTTTTTTTAGGTCTTCTAGATGCCTTCTTGAGGCTGCTTGTGGCCACCCACAGACACTTGTAAGGAGGAGAGAAGTCAGCCTGGCAGAGAGACTCTGAAATGAGGGATTAGAGGTGTTCAAGGAGCAAGAGCTTCAGCCTGAAGACAAGGGAGCAGTCCCTGAAGACGCTTCTACTGAGAGGTCTGCCATGGCCTCTCTTGGCCTCCAACTTGTGGGCTACATCCTAGGCCTTCTGGGGCTTTTGGGCACACTGGTTGCCATGCTGCTCCCCAGCTGGAAAACAAGTTCTTATGTCGGTGCCAGCATTGTGACAGCAGTTGGCTTCTCCAAGGGCCTCTGGATGGAATGTGCCACACACAGCACAGGCATCACCCAGTGTGACATCTATAGCACCCTTCTGGGCCTGCCCGCTGACATCCAGGCTGCCCAGGCCATGATGGTGACATCCAGTGCAATCTCCTCCCTGGCCTGCATTATCTCTGTGGTGGGCATGAGATGCACAGTCTTCTGCCAGGAATCCCGAGCCAAAGACAGAGTGGCGGTAGCAGGTGGAGTCTTTTTCATCCTTGGAGGCCTCCTGGGATTCATTCCTGTTGCCTGGAATCTTCATGGGATCCTACGGGACTTCTACTCACCACTGGTGCCTGACAGCATGAAATTTGAGATTCGAGAGGCTCTTTACTTGGGCATTATTTCTTCCCTGTTCTCCCTGATAGCTGGAATCATCCTCTGCTTTTCCTGCTCATCCCAGAGAAATCGCTCCAACTACTACGATGCCTACCAAGCCCAACCTCTTGCCACAAGGAGCTCTCCAAGGCCTGGTCAACCTCCCAAAGTCAAGAGTGAGTTCAATTCCTACAGCCTGACAGGGTATGTGTGAAGAACCAGGGGCCAGAGCTGGGGGGTGGCTGGGTCTGTGAAAAACAGTGGACAGCACCCCGAGGGCCACAGGTGAGGGACACTACCACTGGATCGTGTCAGAAGGTGCTGCTGAGGATAGACTGACTTTGGCCATTGGATTGAGCAAAGGCAGAAATGGGGGCTAGTGTAACAGCATGCAGGTTGAATTGCCAAGGATGCTCGCCATGCCAGCCTTTCTGTTTTCCTCACCTTGCTGCTCCCCTGCCCTAAGTCCCCAACCCTCAACTTGAAACCCCATTCCCTTAAGCCAGGACTCAGAGGATCCCTTTGCCCTCTGGTTTACCTGGGACTCCATCCCCAAACCCACTAATCACATCCCACTGACTGACCCTCTGTGATCAAAGACCCTCTCTCTGGCTGAGGTTGGCTCTTAGCTCATTGCTGGGGATGGGAAGGAGAAGCAGTGGCTTTTGTGGGCATTGCTCTAACCTACTTCTCAAGCTTCCCTCCAAAGAAACTGATTGGCCCTGGAACCTCCATCCCACTCTTGTTATGACTCCACAGTGTCCAGACTAATTTGTGCATGAACTGAAATAAAACCATCCTACGGTATCCAGGGAACAGAAAGCAGGATGCAGGATGGGAGGACAGGAAGGCAGCCTGGGACATTTAAAAAAATAAAAATGAAAAAAAAACCCAGAACCCATTTCTCAGGGCACTTTCCAGAATTCTCTCATATTTGTGGGCTGGGATCAAGCCTGCAGCTTGAGGAAAGCACAAGGAAAGGAAAGAAGATCTGGTGGAAAGCTCAGGTGGCAGCGGACTCTGACTCCACTGAGGAACTGCCTCAGAAGCTGCGATCACAACTTTGGCTGAAGCCCCTGCCTCACTCTAGGGCACCTGACCTGGCCTCTTGCCTAAACCACAAGGCTAAGGGCTATAGACAATGGTTTCCTTAGGAACAGTAAACCAGTTTTTCTAGGGATGGCCCTTGGCTGGGGGATGACAGTGTGGGAGCTGTGGGGTACTGAGGAAGACACCATTCCTTGACGGTGTCTAAGAAGCCAGGTGGATGTGTGTGGTGGCTCCAGTGGGTGTTTCTACTCTGCCAGTGAGAGGCAGCCCCCTAGAAACTCTTCAGGCGTAATGGAAAATCAGCTCAAATGAGATCAGGCCCCCCCAGGGTCCACCCACAGAGCACTACAGAGCCTCTGAAAGACCATAGCACCAAGCGAGCCCCTTCAGATTCCCCCACTGTCCATCGGAAGATGCTCCAGAGTGGCTAGAGGGCATCTAAGGGCTCCAGCATGGCATATCCATGCCCACGGTGCTGTGTCCATGATCTGAGTGATAGCTGCACTGCTGCCTGGGATTGCAGCTGAGGTGGGAGTGGAGAATGGTTCCCAGGAAGACAGTTCCACCTCTAAGGTCCGAAAATGTTCCCTTTACCCTGGAGTGGGAGTGAGGGGTCATACACCAAAGGTATTTTCCCTCACCAGTCTAGGCATGACTGGCTTCTGAAAAATTCCAGCACACCTCCTCGAACCTCATTGTCAGCAGAGAGGGCCCATCTGTTGTCTGTAACATGCCTTTCACATGTCCACCTTCTTGCCATGTTCCAGCTGCTCTCCCAACCTGGAAGGCCGTCTCCCCTTAGCCAAGTCCTCCTCAGGCTTGGAGAACTTCCTCAGCGTCACCTCCTTCATTGAGCCTTCTCTGATCACTCCATCCCTCTCCTACCCCTCCCTCCCCCAACCCTCAATGTATAAATTGCTTCTTGATGCTTAGCATTCACAATTTTTGATTGATCGTTATTTGTGTGTGTGTGTCCGATCTCACAAGTATATTGTAAAC
Task1_train_30737
The gene CLDN2 (claudin 2) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Male infertility
AAGACCAGTGTGGGCAACATGGCAAAACCTGGTCTCTACAAAAAATACACACACACACACACAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAACTAGCCAGGTGTGGTGATGCGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTTGTGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAATGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGCCAAAGTGAGAACCTGTCTCAAAAAGAAAGAAAGAAAAATTAGTGGATCAGAGGGTCTTGTAGAGAATGGGGAGGTGTGCCCTTGACCCTTAGTGTCCTGAATCTTGGCAACACCGAGGGCTCCTTGAACACGGCAAAATCTTATATGGCTCTGAGATTCCAAAGCATTGACTCAGATACCTGCCTCATGCAAAGCCCTATATTCTAGAGCAGTTTCCCTTTCCTCTGTGGCAGACTCTTGTCCCCCCTAACAGATGGCCCAGGGAATTTCAGGGCCCCCTCTCAGTCCTGGAACCCTTGTTCCAGAGTGCTCCCTCATCATCCAAGAGGCTGATGATGGGAGCATCTATTAGGAGACTGGACAGGAAATGTCTGGGCATGTTATACATGCAGGAGGCCTTAGACTAGGCTGCAGAGGGGGATTTGGGCATGGCTGGGAGGATCTGAACTCTCAGAGTATGGACAGAAGGCTTTGCTGCCCACCCCCATCTACCCTGGAGTAGATTTTCACCATGGGCAGAATGATCCAGGGCTAGGCCACTACTCTCTAGGCCCCTGGAGATTCAAGAGGCCTCTAACAAACTGGAGTCCAAGACTACATTCTAGGATCTGTTCCTCCTGATGTAGTCTGCAGTTTGGCCTCAGTCTGCAATTGAGGGGCCCTATGGCACTGTTGCTTGGCAATGTATTAAACAGCAGGCCTTGGAGACTAGCACTTGAGTTAACACAGCCACCACAACCACCACTGCCATCATCACCTTCCCGGAAAGCAGCCACCTGTCTGGCTCCTGGCTTTGTCCAGCTGCCAACCTAAGGCATGTGCCTACGCAGGAGGCGATGACATTTTGGCTCCACGTTCAAAGTTGTTTTTTTTTTCCTTTCTCATGTGTTATTTCTAAAGATAACAAAGGTCAAAAGGCATCCAGCGTTTTCTGGTTTCTCATAAGCTTCTGGTCAATATTTAATCTGGTTTATGGATTTTTTTTAGGTCTTCTAGATGCCTTCTTGAGGCTGCTTGTGGCCACCCACAGACACTTGTAAGGAGGAGAGAAGTCAGCCTGGCAGAGAGACTCTGAAATGAGGGATTAGAGGTGTTCAAGGAGCAAGAGCTTCAGCCTGAAGACAAGGGAGCAGTCCCTGAAGACGCTTCTACTGAGAGGTCTGCCATGGCCTCTCTTGGCCTCCAACTTGTGGGCTACATCCTAGGCCTTCTGGGGCTTTTGGGCACACTGGTTGCCATGCTGCTCCCCAGCTGGAAAACAAGTTCTTATGTCGGTGCCAGCATTGTGACAGCAGTTGGCTTCTCCAAGGGCCTCTGGATGGAATGTGCCACACACAGCACAGGCATCACCCAGTGTGACATCTATAGCACCCTTCTGGGCCTGCCCGCTGACATCCAGGCTGCCCAGGCCATGATGGTGACATCCAGTGCAATCTCCTCCCTGGCCTGCATTATCTCTGTGGTGGGCATGAGATGCACAGTCTTCTGCCAGGAATCCCGAGCCAAAGACAGAGTGGCGGTAGCAGGTGGAGTCTTTTTCATCCTTGGAGGCCTCCTGGGATTCATTCCTGTTGCCTGGAATCTTCATGGGATCCTACGGGACTTCTACTCACCACTGGTGCCTGACAGCATGAAATTTGAGATTGGAGAGGCTCTTTACTTGGGCATTATTTCTTCCCTGTTCTCCCTGATAGCTGGAATCATCCTCTGCTTTTCCTGCTCATCCCAGAGAAATCGCTCCAACTACTACGATGCCTACCAAGCCCAACCTCTTGCCACAAGGAGCTCTCCAAGGCCTGGTCAACCTCCCAAAGTCAAGAGTGAGTTCAATTCCTACAGCCTGACAGGGTATGTGTGAAGAACCAGGGGCCAGAGCTGGGGGGTGGCTGGGTCTGTGAAAAACAGTGGACAGCACCCCGAGGGCCACAGGTGAGGGACACTACCACTGGATCGTGTCAGAAGGTGCTGCTGAGGATAGACTGACTTTGGCCATTGGATTGAGCAAAGGCAGAAATGGGGGCTAGTGTAACAGCATGCAGGTTGAATTGCCAAGGATGCTCGCCATGCCAGCCTTTCTGTTTTCCTCACCTTGCTGCTCCCCTGCCCTAAGTCCCCAACCCTCAACTTGAAACCCCATTCCCTTAAGCCAGGACTCAGAGGATCCCTTTGCCCTCTGGTTTACCTGGGACTCCATCCCCAAACCCACTAATCACATCCCACTGACTGACCCTCTGTGATCAAAGACCCTCTCTCTGGCTGAGGTTGGCTCTTAGCTCATTGCTGGGGATGGGAAGGAGAAGCAGTGGCTTTTGTGGGCATTGCTCTAACCTACTTCTCAAGCTTCCCTCCAAAGAAACTGATTGGCCCTGGAACCTCCATCCCACTCTTGTTATGACTCCACAGTGTCCAGACTAATTTGTGCATGAACTGAAATAAAACCATCCTACGGTATCCAGGGAACAGAAAGCAGGATGCAGGATGGGAGGACAGGAAGGCAGCCTGGGACATTTAAAAAAATAAAAATGAAAAAAAAACCCAGAACCCATTTCTCAGGGCACTTTCCAGAATTCTCTCATATTTGTGGGCTGGGATCAAGCCTGCAGCTTGAGGAAAGCACAAGGAAAGGAAAGAAGATCTGGTGGAAAGCTCAGGTGGCAGCGGACTCTGACTCCACTGAGGAACTGCCTCAGAAGCTGCGATCACAACTTTGGCTGAAGCCCCTGCCTCACTCTAGGGCACCTGACCTGGCCTCTTGCCTAAACCACAAGGCTAAGGGCTATAGACAATGGTTTCCTTAGGAACAGTAAACCAGTTTTTCTAGGGATGGCCCTTGGCTGGGGGATGACAGTGTGGGAGCTGTGGGGTACTGAGGAAGACACCATTCCTTGACGGTGTCTAAGAAGCCAGGTGGATGTGTGTGGTGGCTCCAGTGGGTGTTTCTACTCTGCCAGTGAGAGGCAGCCCCCTAGAAACTCTTCAGGCGTAATGGAAAATCAGCTCAAATGAGATCAGGCCCCCCCAGGGTCCACCCACAGAGCACTACAGAGCCTCTGAAAGACCATAGCACCAAGCGAGCCCCTTCAGATTCCCCCACTGTCCATCGGAAGATGCTCCAGAGTGGCTAGAGGGCATCTAAGGGCTCCAGCATGGCATATCCATGCCCACGGTGCTGTGTCCATGATCTGAGTGATAGCTGCACTGCTGCCTGGGATTGCAGCTGAGGTGGGAGTGGAGAATGGTTCCCAGGAAGACAGTTCCACCTCTAAGGTCCGAAAATGTTCCCTTTACCCTGGAGTGGGAGTGAGGGGTCATACACCAAAGGTATTTTCCCTCACCAGTCTAGGCATGACTGGCTTCTGAAAAATTCCAGCACACCTCCTCGAACCTCATTGTCAGCAGAGAGGGCCCATCTGTTGTCTGTAACATGCCTTTCACATGTCCACCTTCTTGCCATGTTCCAGCTGCTCTCCCAACCTGGAAGGCCGTCTCCCCTTAGCCAAGTCCTCCTCAGGCTTGGAGAACTTCCTCAGCGTCACCTCCTTCATTGAGCCTTCTCTGATCACTCCATCCCTCTCCTACCCCTCCCTCCCCCAACCCTCAATGTATAAATTGCTTCTTGATGCTTAGCATTCACAATTTTTGATTGATCGTTATTTGTGTGTGTGTGTCCGATCTCACAAGTATATTGTAAAC
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Task1_train_30738
Consider a variant on Chromosome X in gene DNAAF6 (dynein axonemal assembly factor 6). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Ciliary dyskinesia, primary, 36, X-linked
GCTAAGATAGTAGATTTTAAGTATTCTCATCACAAGTAAATGATAAGTAGGTGAGGTAATCCATATGTTAATCAGCTTGAGTTAGTCATCCACTGTGTATACATATTTCAGAACATCATATGGTATATCATAAATATATACAATTTTTATTTGTTCATTAAAAATGGAGAAATGAATAAATAATTTTTAAATAGAAAAAAGATGAACTAAAATAATCATGGAAATGATGAATAGCCATTTACATATAAAGATGCTGTTTTTACTCTACCACTGCAGGTAAATAGTTTTTCTAATAATGGAAATATATTTGCCTTGAATTATCCACATTCCTTGCATATTTTCTGAGATAGAAGACCAAGAAAGTCACGTGTGGTTAGATCATTTTTTATTTTTTAAGGTCTATTTACCAAGATGCTTAGCTTCTTTACCTTCTACCTTCCTATATTCTAGCAATTTCATGGAATTCATTCATTGAATTGTTTAATAAATATTTATTGAGAACCTATTGTATCAGGCAGTATGACCATCTCTGATACTACAATGCAGATCAAAACAGAAAAAGTCCCTGTTCTGATTGAGCTAATAGACTTTTGGAGAAGACAATAAAACAAATAACTACACAATTTTATCTTACATTAAGAGGCTTATACATTAACATCTTTGAGTTTACTTATAAAAAAAAGTCCAATAAATAAGGCTAAATAATATTTTTACATTTCCCCAGCATTTTGAGCTATACATTTTTACAGAGTTGAACATTTTACAAATCTTTAAAAATATAAAAGGCTCTAATTCTGTTGGTCATGATCACCATTAACCAGAGGATAGGAAGGGAGAGGAAGTGAATTTCATTCATCAATTTAGTTAATTGCAAAAGATTAATCTGGACAAATGTTTAAAATAATGGCTAAAATGAGGTCTAAGGATGGTTTTAAAATTTCAGTTATTATTGCTATACATACTCAAGAGGCTATTTGCCTTACCCAAGAGATATTCGCTCCATGGCAGTCTAATTCACATTTCATGTATTTCTGTGCTGCCTGTATTTCTGATAATGTAGGTCTAATAATCTTTAAATTCTGAAGGCAATGATTCATATGTAAAATGTTATATATAAATCTGTAGTTAGGCTTTACAAAGCCCGTGCTAGATAGAAGCTGATCATTTCAAAAGAATTGCCAGAATTGAAAACCTAACAATCGGGTGCATTTCTGGGAATGCTTAAAATGACTCAAAGCAGTGCTCTGCACCTAATGCAGGTCTCCACCGGATGCTACAATAGTTAAAACAAATGTGAGCTGGGTTTTTGCATGCCTACTGGAGCCTATCCATTTTTAAACATTTAAAGATGACATGCAGAAACCCAACCTCATGCTCAGCTCTGCATGAGGAAAATGCTGGACTAAAAAATGATCATTGTATCCACTGCTTTCAGTTTCTTTAATTGATATTATTGAGAATTATGTCATGCTTGCATGGAAAAGATATCAAAGCGTTTTTATATAGTAAAAACAATGCAAGATAAGACATTTCTCTCCACATCAGATTGATTGTAGTTGTAATTTTTTCTTTTATATAAAAATATTTTTAAATATAATCCTATTTATGTTTCTGGAAAAATGTGTAATATTTCTTTGCATATGTATATGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTGGAATGATACACAACAGAATACTAACATTGATTATCTCCAGGCAGTTGGATTGTAGATTATTTTCTTCTTTTTGTTTATGTTTTTGCCAAATTCTCTACAGTTGTTATTAAAATTCTACAATGTATTGGTTCTGTATTGATAGAAACATTTAGTCAGTAGTTACTAATTTAGTTTGTTTTGATCAAAAAAAAAAGCTAGCGATTACAAATAATGTTTTATTTCAATGAACCCAAACTGAGTGTGAAGAAGAACAGGAGCAATTTAGAGAAGGAAAAAAGCATGAGCTTCAGCTTTATCTTCCCTTTCTTCACAGTCATCCCTGAAACCAGCGAGGAAAATAATGAGGACATCTGGAATTCAGAAGAGATTCCAGAAGGAGCAGAATATGATGATATGTGGGATGTTAGAGAAATCCCAGAGTAAGTCAAATGAAGCCAGGAATGTCTTTAGGAGTTTAAGTTAGCTGTGTCATCTGATAACATTTTACTTTTTACAAGATTCATAAAGTAACATACCACATAAAAGATAAAACTACAGTGACACACGGAAGGCATGTGTAATTGATTATTTTTTTCCTTCTAGAGCAGAAACAAATAATAAAGCATAACACCTTCCTTTCAGTTACTATCTAGCAAAAATGAAAAATATAGTCATTTCCATTATAAATTTATATTTAATGTCAATTTGTTGTATAATGTGGAACTAGCAGTTGGAGAAAGCCAGCCCATTAAATTGCAAGCATTCATACAAACTAAATTACAATGCCATGTTTATTTGTCAAGCACTTGCTTTTAATTACTCAATGTTCCACAATTTCGGTAAAAGGCTATGTTCTCTCTCCAATTATCAATTATTACCCAGACTTGTTTACTAGATATTCTAAGATTATATTTAGTGTTCAGTGTATTTTGCAAGCAGGGTTCAAGACTTGCTTTGTAGCCTTTTCAATACAATCAAGTTGTAAATATGAAATTTAGAATTATTATAAAAAGCCTTTTATTCTGATTTTAAAAGCACTCATACTTTTAAGAACCTTAAAATATATTTATATACATAGATTAAATTATTGGTCAAATAGACTAAGCTTTACATATGTGTATTTTGAAATAAAATTTGGATTGACTATTTAGAATAGCAGGAAAAATAAAGCCAACACTTACTAAATTATAATGTACTATATAAATTCTTAAAGACTTCTATGGCAAGTGATCTGACAACTTTTCTAATACTGAATACAAAACTATCCAGTATTTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCTGCTCACTGCAACCTGCGCCCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCATGTAGCTGGAACTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGCAATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAAGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCAAAATTGTCCAGTATAAAACAAGCAAATAAACAAAAACTCCATGCTTCTGCCTTCTACATAAGTTCTGAAAACAGAAGCAGTGGGAGACTGCAGACAATTAACTAGAAAGAAGTATCCAGCTTTCAAATAAACAATGTCAAGACCATAAACCTCATAAAAAATCAAAGGAGATTTTAAAACATTTCTTAGAGAACGAAGAGAGTAAATTTGAAGTTATGTTTATATAGTGTCCACGTATCATATGAAAAGTAATAATTAAGTCACTTATTTGTCATATTGTCTAACAAATGTCAAATATCCATATGCAGCAAACTTCAAATTTGAGTAATTTTTCCCTTTTCATCCTGATGTTTGATGTTAGGTAGATAGAACATCCATGAAAGCTTTAAATGAATAATAACTTCAGGTTATTATGAGGAAAATTGCTTTATAAGATTTTAAAAATCTTCATCTTCTACCTTATGAAAATACATTTCAACATTTCTCAGTGGATGCAGAGGAAAATAGGTAAAGAACATGAACAGGCAGTTCAAAAAAGAAGAATCACAAGTGGCCAAGTAAAAGAATAACAAGGAGCTGAGCTAAGGCACTGGCCTTGGGGAGAAGTATGAGGGTCTTTATTTGAGTGAGTTTTGGATGAAGAGTTGGTATTTGGTTAGATAAAATGGATGAGAGGAGAGCGTCAAAGATGATGCTGAAGTTATTAGCTTGGGTGACTGAGGAAATGATAATGCCATTAACTTTGATAGGAATTATAGGTTAAGAAGAAGCAGTGAGTTTGTTTTTGTTTTCTTTCTTTCTCCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTTTCT
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Task1_train_30739
Given this variant in gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 5
TCACTCTTATCTCATTGACCTCACTTTCCTCCTTTTCTCTTATAGATACATTCCACCTCCACCACACAACACTCGTCCCGCATTGGTATTCCTCAAACAAGCGAGATACATCTGCCTTAGGGTATTTGCCCTTTCTGTTCTCTTTGCTTATCGAGATATCAACATGGCTCATTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTCCTTCAGGTCTTTGCCCAAATGTTACCTTCCAAGACAGGTCTTCTCTGACCACCCTACTTAAAATTGTACTCCTCTCCTCTACACTCTGGCACATTATCCCACTTTCCTTGCCTGATTTTTTTTTCCACAACACTTATTGCCATTTGACATACTATGCATTTTGCTTATTTACATGTTTATTGTTTGAGAATGTAAACTCCATGACAGCAGGGTATTTTTAATTGTTTACTAATGTATTCTTGTGCCAATACACAGGGCCTAGCACATAAAGAATGTTCACTAAATATTTATTGAATGAACGAATCCCTTGGGGCAAATACTTTGTAGTCCCCTCAACGCCTTGCACACTGCCTTGCATGCAATAGAACACTCAGTAAATATTTGATGAATGGCCTATGATGGAAGACTACTAATATTCTGCCTTGCAGTTTACTTCCTTCTCCAAGTATTCCTATATACATGGGCCTACATTAAATTTCTGAGCTTGTAAAAGTGCAAAAAAGGTCAGAAGGAGAAGTCCTCCATGGACACTGCTGAAAATAGCAGTAAGACAAAGACAGGATGCTGCTTTGAGTATTTTCTGCCTTTGCCACTTAGATAAATCCCTCTCCCACCTCCATCTCAGTTTTATCATATGTAAAACGACTATATGATCTCTGAGGTCCCTTCTATTTTTACATTTGGTAGTTATGAGCACTATGGTCACTTTTGATTCCAGAATTGTATGATTTTTATCTTCTCCTAACCCATGCTTAAAATATGCTTAATGGAAACATGGTGCAAGAATAAAGGCTCACTTAGGTCCAATTAACAAGTATCGCTATAAAAATAATAAAACATGGTGTAAAAGGCCACATTAGCAACATGTAGCTGATGACATTGAGGCTTACATGAGGCAGACAGGACTAAAACCCAGGTTTTTTCAAATCCCTTCAGGGCTCTTTATCTGAAGTCCCATAGAACACTATACTTTCTTTCCTTTCCGAGGGCTATAAAAGTTAGATCTTTATTGTCCAGATAGTTTGGAAAATCCATCTTCCTTCACTTGTTTCAACATACTTGGTTCCAGCACTAGAAACAAAACAACTTTCTCTTGCAGTGTCTCTTGGATGATTCAGGTGGCATGCCTTCAGTCACTTCCCCCATGTAAACTGTCTTGCAGGCAAAGGCGACACTGCAATTACAATGGGCAAGCAAACTCCTTGCATGCACGTCTGTGATGTAAAAGTGTTTTAATTCAGCCCCATCCTTATAAAGAGATAAAAAATGTGTTCAGAAACATGCAAACTCGTGGCTGTCATCCTGATAAACAGATTTTCTTAAAGGAAACTGTAAACCAGAGCCAGACTTACTTTCCTGCGCTGAGGGAGGGGAAATAAAAAAGCAGGCATGGTTGATTTCCCGCTAGCGGGAACGATCTGGCCTCAGACGTCACCAGCATCCCTCCACCCCCAGTCCAACGTCTCCTGTCCCCAACAGCCTAGCTACAGGGGGCCGGGCTATGGGTTAGTCTCGCCCCCGTTCATGCTCTTCACCCAATACCTGAGAGAATCGGAAGGAGGCAGAGCTACACCGAGGACCAAACCCCGCCCTTCGCTCCCTCTTAGCTAATCGTTGCCAGCGGGGTGTGGACTTCGCCGCTGACCCCACCTCCGCCGCTTTGGGTAATTTAGAGCCGCGCGCCGGGCGGGAATGTAAGATGGCGGAGTAGCAACGCAAAGCGCTTGGTATTGAGTCTGTGGCCGACTTCGGTTCCGGTCTCTGCAGCAGCCGTGATCGCTTAGTGGAGTGCTTAGGGTAGTTGGCCAGGATGCCGAATATCAAAATCTTCAGCGGCAGCTCCCACCAGGACTTATCTCAGAAAATTGCTGACCGCCTGGGCCTGGAGCTAGGCAAGGTGGTGACTAAGAAATTCAGCAACCAGGAGACCTGGTAAGGACCAAGTTGGGACCCTGACTAGACCTCACCTGCCCAGGCGGCAGAGTATAGGAGGGATGGGGTCGCCGCTTGAGCTCAAACAGACTGGGGGTTGGGGGGAGAGGGTGCAGCTCTGTGACTAGCCTACCCCACGGGCTGTTTCCGTTATTTTACCTCTCGCGGGAGGGTCACGTTCATTCTTACCGTGCGGTGGGGTGGAGTCAAAAGATGGAGTGTGAGGCGAAGCTTCTGCGTTTGAGGGCAAGGGCTGGGGGACCCAATAGATAGTGGCTGCATAGAGCGACGAGAGGGGACCGACGCTTAGCCAGGGCGGTAGGGACACGTGGCTTGGCTTTGCTGTTGAGCCACCCAGGCTGGACTGGGTTGCTTCAGCTCTTAGACTAGCTTGCATTTAGAGAGCCTACCTGCGTACTGAGCTCTCCTGGTCTTTCTTTTCCTAGAGTCCAATAAGCAGCTTTTTGATTCGAAATGGTGTTGGTCCGTTCGGCTTGGTGTTGAGGGAAACTGACATTATATACTGCAGGCGCCAAAATTATTACGACTTCCCTTAGATCAGCAAGCGTTGGCTTTTCTCATCTTATGAATCATCTACCTGAGTAATTGGAGCCATAAATCTAGTTGATTTGTTAAAGTGATGCGTTGACTCTGCATCCTTGATAGCCAGCATCTCAGCTTGAGCCATCCAAAAAATCTTGGAAATCTCAATTCTGGAATGTTTGACCTTCCCCAGTGCAGCTAGTGGTACAGATAATGCAAAAGCGTATTTTTCAGTAACCGAGTCCATCCTGGACTTGGCTCCTTCTTTAAGCTCTGTGTAGGGAATTTAGGAAACAATTTTATACCTGAATGTTAAAGATAATTGAGGACAGGCAATGTAGTGGAAGACTAGGATTGGACAGTGCATTGCAACTTGCGTTTTTTCCATTGCCTTGCCAGTAAAACTTGCTTCCTCGACTCCGACTTACACCCTCTACCGGCACCATGGGACTGTTTTAGAGATGACTTGGTTACCTGATTATTTCAGTGCCCCTTCCACCTAAGTGTGGGATCTTTAGTTTCTGATAGGTGTAATTTGTATTTTATTGTTACCCTATCGATTAAATCAGAGCCCTGCCCACAATCTTACAGATTTGTTAAGGGGAAAGTTTTCACCTAATAATCAGATAAGAATATTTCGAATATTTTTTCCTAAATGTTTTTGCTTACTTTTTTGCTTTCTTTGGACTGATTTCCAAGTTTAACTCGCCTTATCTCTTTTAGACCCAGCTGATAAAGTAATGTCACCGATAATGGACAGCTTCTTCCCGAATTATTGTGCTACTGATTGTGATGCAAATGATAGTGTAAACATTGCCATCTGTAACCAGGCAATACCTTAGTTAAAAGAGGCTTACAAACTGCTGTCTTTAGATTTTTCCAAACCATTATGGCTCATGGGCCTTAATAAAGAATACAAAACAGGACTAGACTTTGTGATTGGCAATATAGTTAGGGGACAAGAATGTTTTTCATTTAGAGGTTTTCTTTGGCCCCTGTGGATATTTAATCCTTTTCCTATGCGTCTAGGAAAAATGTGAAGGCATGAAAGCTTTATTTTCTCCTTGTGTTAATCCTTCTGCCCTCTGCATAATGCAGCACCCCAGAACCTGAGGCTATATTGGGAGAGGAGAGGGGGAGGACAACTTAGTTTTCTACTGATTGATTTCTATTAAGTCCAACATGGATAATTGCTGACTGGTTAGATTTTCTTGTTTCTGGCTTAATCATTAGCTTCTTGTTTCCTAGATATTCTGAAATCTTCATTGAACATAATCACATTTTTTTTTATGGAGTTCCCCCTATCTTTGTTTTTCCTATACTGAAGAAATGGTAACTGCTCCCTATAACTGCTCCCCCAGGTGACTCTTGGTTGATGCTCTCTTGAGCAGAGTAGCTTTTCTTCTAACATAAGGATCATCCTTGGCT
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Task1_train_30740
This alteration in PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 5
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Task1_train_30741
The variant affects gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Phosphoribosylpyrophosphate synthetase superactivity
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Task1_train_30742
Gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
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Task1_train_30743
This variant affects the gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth Neuropathy X
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Task1_train_30744
A variant affecting Chromosome X, within the gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
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Task1_train_30745
A genetic alteration is present in PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
GCCCTTCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATACATGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCCTGCCATATACTTTAAATCATCTCTAGATTACTTATAATACTTAATACAATATAAATACTACGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTAGAAAATAATGACAAAGAAAAAAATCTGTACATGTTCAATACAGGTGCAATTTTTTCTCCAAATATTTTCAATCCACACTTGGTTGAATCCATAGATGTGGAACCTATGGATATGGAGGGCTGACAGTACAGTGGTTTAAAATCTATTTCATGTTCTTTCTTTCCTCATTGTAGTGTGGAAATTGGTGAAAGTGTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAATGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAGGATAAGAAAGATAAGGTAGGAGCAGAATTTTATTTTTTGAGCAGAGGAAGCAGGAGCACTTGCCCCAAATCACAAATAAATTCCAAAATTATCAAATATATATTTAGGGGGAATTTTAAAAATCACCTTTTCTTAGGTATTACCCTATCTTCAAAACAATAGAAATATAATTGGTTTGTATAAAGCAACACATTTGTAGTCTGTATTTTATTACAGTGATACATATATAACTTTCAGTTAGCTCACTGGTATTTTTAATTGTATCAGTAAGACTAAGCACCAACTCCTCTGGAGTACTGGAGTATATTTTTAAAATTACGGTAGATCCTCTCAAACTGTAAGATTGGGATCCTAGTTGTGACCTCTTCATAAAACTTGAAGTCTGTTATATGAATACTTGATCTGATAGATACATAGATAGATAGATAGATAGATAAACTATATATATCTCTCACCTTATCCTGGTATATTAGAGGATAAGGCATATACATAAAACTTTGCAAGTCTATTGTAATTAATGCCCAATTTTACACACAATGCCTCGAAGAAGGTCAGATATTTTTATTCCAACAGAGTATAAAGTAAAGGGCATGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGGCAACGCTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAATACAAAAGAAATTATCCAGGCGTGGCGCTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATGCATGGACTTTGCTATTTTACAGTGCAGCAAGTATGTTTTATTTGAGGAGTTCATAGTTGTTGGAAAGTTGACCTCCAGATGAGTAAGTAGTGATGTGATTTACAAAGGAAACTATAATATCTATTCTGTGATGTATCTTCAAACCTTGACATGTTAGGTGTTAAAGGTTTACATATGTATGTGTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTATTTTTTAAAGTCTGCCTAGTTTGAATAATTGAGCATTGGAAACACTTGAATAGGATTGAAAATGTGTACATTAAGAAAACAAAAGTTAGGAAAGCATTTTCTTTATTGATAAGTGTATCCTGATTTGGAAAAGTGATGTTCCACTTAATATTTGTTCTGAATTATGATCCACTTAAAGTCAATGGACATGTCTCCTTCTATGAATTTCTGGGTACCATAGTGCCTTTAACATAGTAGGTACACAATAAATAGTTTCTTGAGTAAATGAATTGTTTTTCAAATTGGCTTTTTGGTTTTTCTTTTCTTTCCTCCCCTCCATTTAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTATCAGTGGAAGCTAAATATTGGTGTTTGAAAGGTGGGAGGAAAGGACTGATGATGCTGAAGACTGCAGAGAAGCCAAAAATTATGCCCAAGTACATCTGAAATAAACTAGATATCAACAACATTTTAAATGTGTTCACCTTAAGCATACTTCATGATCTTAGTCATTTCAGGTGGTTAGATAGGGAGGCAGTCTAGTTTTATGGGAAGAGCACTACTTTGAATAAAGGCTCTGGTATTTACTAGCTTTGTAAGCTTGGGAAGGTTACTTAATTTCTCTGAACATATACTTTTTCATTATTGTGAGTATAAAACATTAAATTCATATTATAATGCCTGGCCCATGACAGGTACTCATAGATAGGAGCTGTTATTATCATTCTTATTCTCCTTGAATATTCATGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTCAGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGACACCAGGCCCAGCTAACTTTTTTGTACTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCTGCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAAGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCATGGTCTTAAATTTAGAGCCACAGATATTGGAGCCTACTTTCCAACATAAACCCAAAGTAAGGGGGGTGGAATACCACCTTTATTTTATATTTTTTCAAAGAGATTTTTCAAATCATTACATTTCAAGCTTGTGGGAATTCAATGAAGTACATTGGACAGGGACTGTACTCCTTTTATGGAAAGGAATGACTTAATTGAGAAATACAACTAATTTGTATCAACTAGAATTAGAACACAGATCTCCTGATTTCTAATTATTCACTGTGACTATTTATCATAAGTAGCTTCCATTAAGTTTATATGCCATAGCATCTCTAACTGGTTTATCCATTAGCTTTTACTCCTTAACAAATCAGTCCAACACTTAGTGGCATAAAGCAGTATTTACAAACTCACTGAGTCTGCATGTTGACTGGGCAGTTCTTAATGGTTTTGTCTGAACTTAGCCATTCTTTACAAGGGCTCACTTATGTTCCTATGTTCAGTTGTGGGTTGACTGAGGGCTGGCTTTGCTGATCTTGGCTGGGCTCTCTCACATAGCCCAGATTCAAGGAGGCTTTTATAATCTACCACACTGGGCCTGCCTTCCCATCAGTTTGAATGTTGCAGTAAGACATTCTCTGAGCAAGTTACTACTTTGTGTTTGCCATTTATAAATGGAAGAGAAGGAAAGTGAAGCAAAACTGATCCAGCTTCTTTCTACAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAATATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAGCTAAGAGGTATGGTTGAAATTAGTATTGTTCCCAATGTACTGGGAAAATCTTTCAGATGGTTGTGTCACAAAGTGAAGTTTTTCTATCCAAGTGGCAGTTTTTAAGTATTTTTGAATGGATGTAAGTAGCTAGCACATGGGTTGAATATAGTTTTACCCTTTCCTCTTTTACTGTCCTCAGTTACTACTCGGAAGACAAGACAGAAAAGGGGTCCTAAATCATCATATTATGGATTTGACTATAACTTATGAGTAACTTGGTGCTACAGAGCTAGCAATACAGCTATAAACCTTTTGGGAAGGGTAGAAAATGTGGTTTTCTAATGAATAGCAGCTGCTATTGAACCACATATTGGTGGACAAATTCGCTTTTACACTCCTCTTACAATGCTGTTGGTTAGATCATTTTGATCCTTGGGATTAAAATATTAAGCAGGAAGGAAAGTAAAGTGTGACATTTTTATTTAAAGCCAAGATCTTAACATTTTAAACAAACTGATTG
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Task1_train_30746
This sequence change occurs on Chromosome X, altering PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 5
GCCCTTCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATACATGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCCTGCCATATACTTTAAATCATCTCTAGATTACTTATAATACTTAATACAATATAAATACTACGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTAGAAAATAATGACAAAGAAAAAAATCTGTACATGTTCAATACAGGTGCAATTTTTTCTCCAAATATTTTCAATCCACACTTGGTTGAATCCATAGATGTGGAACCTATGGATATGGAGGGCTGACAGTACAGTGGTTTAAAATCTATTTCATGTTCTTTCTTTCCTCATTGTAGTGTGGAAATTGGTGAAAGTGTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAATGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAGGATAAGAAAGATAAGGTAGGAGCAGAATTTTATTTTTTGAGCAGAGGAAGCAGGAGCACTTGCCCCAAATCACAAATAAATTCCAAAATTATCAAATATATATTTAGGGGGAATTTTAAAAATCACCTTTTCTTAGGTATTACCCTATCTTCAAAACAATAGAAATATAATTGGTTTGTATAAAGCAACACATTTGTAGTCTGTATTTTATTACAGTGATACATATATAACTTTCAGTTAGCTCACTGGTATTTTTAATTGTATCAGTAAGACTAAGCACCAACTCCTCTGGAGTACTGGAGTATATTTTTAAAATTACGGTAGATCCTCTCAAACTGTAAGATTGGGATCCTAGTTGTGACCTCTTCATAAAACTTGAAGTCTGTTATATGAATACTTGATCTGATAGATACATAGATAGATAGATAGATAGATAAACTATATATATCTCTCACCTTATCCTGGTATATTAGAGGATAAGGCATATACATAAAACTTTGCAAGTCTATTGTAATTAATGCCCAATTTTACACACAATGCCTCGAAGAAGGTCAGATATTTTTATTCCAACAGAGTATAAAGTAAAGGGCATGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGGCAACGCTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAATACAAAAGAAATTATCCAGGCGTGGCGCTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATGCATGGACTTTGCTATTTTACAGTGCAGCAAGTATGTTTTATTTGAGGAGTTCATAGTTGTTGGAAAGTTGACCTCCAGATGAGTAAGTAGTGATGTGATTTACAAAGGAAACTATAATATCTATTCTGTGATGTATCTTCAAACCTTGACATGTTAGGTGTTAAAGGTTTACATATGTATGTGTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTATTTTTTAAAGTCTGCCTAGTTTGAATAATTGAGCATTGGAAACACTTGAATAGGATTGAAAATGTGTACATTAAGAAAACAAAAGTTAGGAAAGCATTTTCTTTATTGATAAGTGTATCCTGATTTGGAAAAGTGATGTTCCACTTAATATTTGTTCTGAATTATGATCCACTTAAAGTCAATGGACATGTCTCCTTCTATGAATTTCTGGGTACCATAGTGCCTTTAACATAGTAGGTACACAATAAATAGTTTCTTGAGTAAATGAATTGTTTTTCAAATTGGCTTTTTGGTTTTTCTTTTCTTTCCTCCCCTCCATTTAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTATCAGTGGAAGCTAAATATTGGTGTTTGAAAGGTGGGAGGAAAGGACTGATGATGCTGAAGACTGCAGAGAAGCCAAAAATTATGCCCAAGTACATCTGAAATAAACTAGATATCAACAACATTTTAAATGTGTTCACCTTAAGCATACTTCATGATCTTAGTCATTTCAGGTGGTTAGATAGGGAGGCAGTCTAGTTTTATGGGAAGAGCACTACTTTGAATAAAGGCTCTGGTATTTACTAGCTTTGTAAGCTTGGGAAGGTTACTTAATTTCTCTGAACATATACTTTTTCATTATTGTGAGTATAAAACATTAAATTCATATTATAATGCCTGGCCCATGACAGGTACTCATAGATAGGAGCTGTTATTATCATTCTTATTCTCCTTGAATATTCATGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTCAGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGACACCAGGCCCAGCTAACTTTTTTGTACTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCTGCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAAGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCATGGTCTTAAATTTAGAGCCACAGATATTGGAGCCTACTTTCCAACATAAACCCAAAGTAAGGGGGGTGGAATACCACCTTTATTTTATATTTTTTCAAAGAGATTTTTCAAATCATTACATTTCAAGCTTGTGGGAATTCAATGAAGTACATTGGACAGGGACTGTACTCCTTTTATGGAAAGGAATGACTTAATTGAGAAATACAACTAATTTGTATCAACTAGAATTAGAACACAGATCTCCTGATTTCTAATTATTCACTGTGACTATTTATCATAAGTAGCTTCCATTAAGTTTATATGCCATAGCATCTCTAACTGGTTTATCCATTAGCTTTTACTCCTTAACAAATCAGTCCAACACTTAGTGGCATAAAGCAGTATTTACAAACTCACTGAGTCTGCATGTTGACTGGGCAGTTCTTAATGGTTTTGTCTGAACTTAGCCATTCTTTACAAGGGCTCACTTATGTTCCTATGTTCAGTTGTGGGTTGACTGAGGGCTGGCTTTGCTGATCTTGGCTGGGCTCTCTCACATAGCCCAGATTCAAGGAGGCTTTTATAATCTACCACACTGGGCCTGCCTTCCCATCAGTTTGAATGTTGCAGTAAGACATTCTCTGAGCAAGTTACTACTTTGTGTTTGCCATTTATAAATGGAAGAGAAGGAAAGTGAAGCAAAACTGATCCAGCTTCTTTCTACAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAATATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAGCTAAGAGGTATGGTTGAAATTAGTATTGTTCCCAATGTACTGGGAAAATCTTTCAGATGGTTGTGTCACAAAGTGAAGTTTTTCTATCCAAGTGGCAGTTTTTAAGTATTTTTGAATGGATGTAAGTAGCTAGCACATGGGTTGAATATAGTTTTACCCTTTCCTCTTTTACTGTCCTCAGTTACTACTCGGAAGACAAGACAGAAAAGGGGTCCTAAATCATCATATTATGGATTTGACTATAACTTATGAGTAACTTGGTGCTACAGAGCTAGCAATACAGCTATAAACCTTTTGGGAAGGGTAGAAAATGTGGTTTTCTAATGAATAGCAGCTGCTATTGAACCACATATTGGTGGACAAATTCGCTTTTACACTCCTCTTACAATGCTGTTGGTTAGATCATTTTGATCCTTGGGATTAAAATATTAAGCAGGAAGGAAAGTAAAGTGTGACATTTTTATTTAAAGCCAAGATCTTAACATTTTAAACAAACTGATTG
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Task1_train_30747
The variant affects gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 5
TTTTAGTAGAGATACATGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCCTGCCATATACTTTAAATCATCTCTAGATTACTTATAATACTTAATACAATATAAATACTACGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTAGAAAATAATGACAAAGAAAAAAATCTGTACATGTTCAATACAGGTGCAATTTTTTCTCCAAATATTTTCAATCCACACTTGGTTGAATCCATAGATGTGGAACCTATGGATATGGAGGGCTGACAGTACAGTGGTTTAAAATCTATTTCATGTTCTTTCTTTCCTCATTGTAGTGTGGAAATTGGTGAAAGTGTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAATGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAGGATAAGAAAGATAAGGTAGGAGCAGAATTTTATTTTTTGAGCAGAGGAAGCAGGAGCACTTGCCCCAAATCACAAATAAATTCCAAAATTATCAAATATATATTTAGGGGGAATTTTAAAAATCACCTTTTCTTAGGTATTACCCTATCTTCAAAACAATAGAAATATAATTGGTTTGTATAAAGCAACACATTTGTAGTCTGTATTTTATTACAGTGATACATATATAACTTTCAGTTAGCTCACTGGTATTTTTAATTGTATCAGTAAGACTAAGCACCAACTCCTCTGGAGTACTGGAGTATATTTTTAAAATTACGGTAGATCCTCTCAAACTGTAAGATTGGGATCCTAGTTGTGACCTCTTCATAAAACTTGAAGTCTGTTATATGAATACTTGATCTGATAGATACATAGATAGATAGATAGATAGATAAACTATATATATCTCTCACCTTATCCTGGTATATTAGAGGATAAGGCATATACATAAAACTTTGCAAGTCTATTGTAATTAATGCCCAATTTTACACACAATGCCTCGAAGAAGGTCAGATATTTTTATTCCAACAGAGTATAAAGTAAAGGGCATGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGGCAACGCTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAATACAAAAGAAATTATCCAGGCGTGGCGCTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATGCATGGACTTTGCTATTTTACAGTGCAGCAAGTATGTTTTATTTGAGGAGTTCATAGTTGTTGGAAAGTTGACCTCCAGATGAGTAAGTAGTGATGTGATTTACAAAGGAAACTATAATATCTATTCTGTGATGTATCTTCAAACCTTGACATGTTAGGTGTTAAAGGTTTACATATGTATGTGTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTATTTTTTAAAGTCTGCCTAGTTTGAATAATTGAGCATTGGAAACACTTGAATAGGATTGAAAATGTGTACATTAAGAAAACAAAAGTTAGGAAAGCATTTTCTTTATTGATAAGTGTATCCTGATTTGGAAAAGTGATGTTCCACTTAATATTTGTTCTGAATTATGATCCACTTAAAGTCAATGGACATGTCTCCTTCTATGAATTTCTGGGTACCATAGTGCCTTTAACATAGTAGGTACACAATAAATAGTTTCTTGAGTAAATGAATTGTTTTTCAAATTGGCTTTTTGGTTTTTCTTTTCTTTCCTCCCCTCCATTTAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTATCAGTGGAAGCTAAATATTGGTGTTTGAAAGGTGGGAGGAAAGGACTGATGATGCTGAAGACTGCAGAGAAGCCAAAAATTATGCCCAAGTACATCTGAAATAAACTAGATATCAACAACATTTTAAATGTGTTCACCTTAAGCATACTTCATGATCTTAGTCATTTCAGGTGGTTAGATAGGGAGGCAGTCTAGTTTTATGGGAAGAGCACTACTTTGAATAAAGGCTCTGGTATTTACTAGCTTTGTAAGCTTGGGAAGGTTACTTAATTTCTCTGAACATATACTTTTTCATTATTGTGAGTATAAAACATTAAATTCATATTATAATGCCTGGCCCATGACAGGTACTCATAGATAGGAGCTGTTATTATCATTCTTATTCTCCTTGAATATTCATGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTCAGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGACACCAGGCCCAGCTAACTTTTTTGTACTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCTGCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAAGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCATGGTCTTAAATTTAGAGCCACAGATATTGGAGCCTACTTTCCAACATAAACCCAAAGTAAGGGGGGTGGAATACCACCTTTATTTTATATTTTTTCAAAGAGATTTTTCAAATCATTACATTTCAAGCTTGTGGGAATTCAATGAAGTACATTGGACAGGGACTGTACTCCTTTTATGGAAAGGAATGACTTAATTGAGAAATACAACTAATTTGTATCAACTAGAATTAGAACACAGATCTCCTGATTTCTAATTATTCACTGTGACTATTTATCATAAGTAGCTTCCATTAAGTTTATATGCCATAGCATCTCTAACTGGTTTATCCATTAGCTTTTACTCCTTAACAAATCAGTCCAACACTTAGTGGCATAAAGCAGTATTTACAAACTCACTGAGTCTGCATGTTGACTGGGCAGTTCTTAATGGTTTTGTCTGAACTTAGCCATTCTTTACAAGGGCTCACTTATGTTCCTATGTTCAGTTGTGGGTTGACTGAGGGCTGGCTTTGCTGATCTTGGCTGGGCTCTCTCACATAGCCCAGATTCAAGGAGGCTTTTATAATCTACCACACTGGGCCTGCCTTCCCATCAGTTTGAATGTTGCAGTAAGACATTCTCTGAGCAAGTTACTACTTTGTGTTTGCCATTTATAAATGGAAGAGAAGGAAAGTGAAGCAAAACTGATCCAGCTTCTTTCTACAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAATATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAGCTAAGAGGTATGGTTGAAATTAGTATTGTTCCCAATGTACTGGGAAAATCTTTCAGATGGTTGTGTCACAAAGTGAAGTTTTTCTATCCAAGTGGCAGTTTTTAAGTATTTTTGAATGGATGTAAGTAGCTAGCACATGGGTTGAATATAGTTTTACCCTTTCCTCTTTTACTGTCCTCAGTTACTACTCGGAAGACAAGACAGAAAAGGGGTCCTAAATCATCATATTATGGATTTGACTATAACTTATGAGTAACTTGGTGCTACAGAGCTAGCAATACAGCTATAAACCTTTTGGGAAGGGTAGAAAATGTGGTTTTCTAATGAATAGCAGCTGCTATTGAACCACATATTGGTGGACAAATTCGCTTTTACACTCCTCTTACAATGCTGTTGGTTAGATCATTTTGATCCTTGGGATTAAAATATTAAGCAGGAAGGAAAGTAAAGTGTGACATTTTTATTTAAAGCCAAGATCTTAACATTTTAAACAAACTGATTGCCAGGGATTGCCAGTTAAC
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Task1_train_30748
Given this variant in gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Phosphoribosylpyrophosphate synthetase superactivity
GCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCCTGCCATATACTTTAAATCATCTCTAGATTACTTATAATACTTAATACAATATAAATACTACGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTAGAAAATAATGACAAAGAAAAAAATCTGTACATGTTCAATACAGGTGCAATTTTTTCTCCAAATATTTTCAATCCACACTTGGTTGAATCCATAGATGTGGAACCTATGGATATGGAGGGCTGACAGTACAGTGGTTTAAAATCTATTTCATGTTCTTTCTTTCCTCATTGTAGTGTGGAAATTGGTGAAAGTGTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAATGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAGGATAAGAAAGATAAGGTAGGAGCAGAATTTTATTTTTTGAGCAGAGGAAGCAGGAGCACTTGCCCCAAATCACAAATAAATTCCAAAATTATCAAATATATATTTAGGGGGAATTTTAAAAATCACCTTTTCTTAGGTATTACCCTATCTTCAAAACAATAGAAATATAATTGGTTTGTATAAAGCAACACATTTGTAGTCTGTATTTTATTACAGTGATACATATATAACTTTCAGTTAGCTCACTGGTATTTTTAATTGTATCAGTAAGACTAAGCACCAACTCCTCTGGAGTACTGGAGTATATTTTTAAAATTACGGTAGATCCTCTCAAACTGTAAGATTGGGATCCTAGTTGTGACCTCTTCATAAAACTTGAAGTCTGTTATATGAATACTTGATCTGATAGATACATAGATAGATAGATAGATAGATAAACTATATATATCTCTCACCTTATCCTGGTATATTAGAGGATAAGGCATATACATAAAACTTTGCAAGTCTATTGTAATTAATGCCCAATTTTACACACAATGCCTCGAAGAAGGTCAGATATTTTTATTCCAACAGAGTATAAAGTAAAGGGCATGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGGCAACGCTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAATACAAAAGAAATTATCCAGGCGTGGCGCTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATGCATGGACTTTGCTATTTTACAGTGCAGCAAGTATGTTTTATTTGAGGAGTTCATAGTTGTTGGAAAGTTGACCTCCAGATGAGTAAGTAGTGATGTGATTTACAAAGGAAACTATAATATCTATTCTGTGATGTATCTTCAAACCTTGACATGTTAGGTGTTAAAGGTTTACATATGTATGTGTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTATTTTTTAAAGTCTGCCTAGTTTGAATAATTGAGCATTGGAAACACTTGAATAGGATTGAAAATGTGTACATTAAGAAAACAAAAGTTAGGAAAGCATTTTCTTTATTGATAAGTGTATCCTGATTTGGAAAAGTGATGTTCCACTTAATATTTGTTCTGAATTATGATCCACTTAAAGTCAATGGACATGTCTCCTTCTATGAATTTCTGGGTACCATAGTGCCTTTAACATAGTAGGTACACAATAAATAGTTTCTTGAGTAAATGAATTGTTTTTCAAATTGGCTTTTTGGTTTTTCTTTTCTTTCCTCCCCTCCATTTAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTATCAGTGGAAGCTAAATATTGGTGTTTGAAAGGTGGGAGGAAAGGACTGATGATGCTGAAGACTGCAGAGAAGCCAAAAATTATGCCCAAGTACATCTGAAATAAACTAGATATCAACAACATTTTAAATGTGTTCACCTTAAGCATACTTCATGATCTTAGTCATTTCAGGTGGTTAGATAGGGAGGCAGTCTAGTTTTATGGGAAGAGCACTACTTTGAATAAAGGCTCTGGTATTTACTAGCTTTGTAAGCTTGGGAAGGTTACTTAATTTCTCTGAACATATACTTTTTCATTATTGTGAGTATAAAACATTAAATTCATATTATAATGCCTGGCCCATGACAGGTACTCATAGATAGGAGCTGTTATTATCATTCTTATTCTCCTTGAATATTCATGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTCAGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGACACCAGGCCCAGCTAACTTTTTTGTACTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCTGCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAAGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCATGGTCTTAAATTTAGAGCCACAGATATTGGAGCCTACTTTCCAACATAAACCCAAAGTAAGGGGGGTGGAATACCACCTTTATTTTATATTTTTTCAAAGAGATTTTTCAAATCATTACATTTCAAGCTTGTGGGAATTCAATGAAGTACATTGGACAGGGACTGTACTCCTTTTATGGAAAGGAATGACTTAATTGAGAAATACAACTAATTTGTATCAACTAGAATTAGAACACAGATCTCCTGATTTCTAATTATTCACTGTGACTATTTATCATAAGTAGCTTCCATTAAGTTTATATGCCATAGCATCTCTAACTGGTTTATCCATTAGCTTTTACTCCTTAACAAATCAGTCCAACACTTAGTGGCATAAAGCAGTATTTACAAACTCACTGAGTCTGCATGTTGACTGGGCAGTTCTTAATGGTTTTGTCTGAACTTAGCCATTCTTTACAAGGGCTCACTTATGTTCCTATGTTCAGTTGTGGGTTGACTGAGGGCTGGCTTTGCTGATCTTGGCTGGGCTCTCTCACATAGCCCAGATTCAAGGAGGCTTTTATAATCTACCACACTGGGCCTGCCTTCCCATCAGTTTGAATGTTGCAGTAAGACATTCTCTGAGCAAGTTACTACTTTGTGTTTGCCATTTATAAATGGAAGAGAAGGAAAGTGAAGCAAAACTGATCCAGCTTCTTTCTACAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAATATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAGCTAAGAGGTATGGTTGAAATTAGTATTGTTCCCAATGTACTGGGAAAATCTTTCAGATGGTTGTGTCACAAAGTGAAGTTTTTCTATCCAAGTGGCAGTTTTTAAGTATTTTTGAATGGATGTAAGTAGCTAGCACATGGGTTGAATATAGTTTTACCCTTTCCTCTTTTACTGTCCTCAGTTACTACTCGGAAGACAAGACAGAAAAGGGGTCCTAAATCATCATATTATGGATTTGACTATAACTTATGAGTAACTTGGTGCTACAGAGCTAGCAATACAGCTATAAACCTTTTGGGAAGGGTAGAAAATGTGGTTTTCTAATGAATAGCAGCTGCTATTGAACCACATATTGGTGGACAAATTCGCTTTTACACTCCTCTTACAATGCTGTTGGTTAGATCATTTTGATCCTTGGGATTAAAATATTAAGCAGGAAGGAAAGTAAAGTGTGACATTTTTATTTAAAGCCAAGATCTTAACATTTTAAACAAACTGATTGCCAGGGATTGCCAGTTAACAGTGCTTTGCAGCTCACATGGTG
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Task1_train_30749
With a mutation on Chromosome X in gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Arts syndrome
GGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTGCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCCTGCCATATACTTTAAATCATCTCTAGATTACTTATAATACTTAATACAATATAAATACTACGTAAATAGTTGTTATACTGTATTTAGAAAATAATGACAAAGAAAAAAATCTGTACATGTTCAATACAGGTGCAATTTTTTCTCCAAATATTTTCAATCCACACTTGGTTGAATCCATAGATGTGGAACCTATGGATATGGAGGGCTGACAGTACAGTGGTTTAAAATCTATTTCATGTTCTTTCTTTCCTCATTGTAGTGTGGAAATTGGTGAAAGTGTACGTGGAGAGGATGTCTACATTGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAATGACAATTTAATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCCAGCCGGGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGGCAGGATAAGAAAGATAAGGTAGGAGCAGAATTTTATTTTTTGAGCAGAGGAAGCAGGAGCACTTGCCCCAAATCACAAATAAATTCCAAAATTATCAAATATATATTTAGGGGGAATTTTAAAAATCACCTTTTCTTAGGTATTACCCTATCTTCAAAACAATAGAAATATAATTGGTTTGTATAAAGCAACACATTTGTAGTCTGTATTTTATTACAGTGATACATATATAACTTTCAGTTAGCTCACTGGTATTTTTAATTGTATCAGTAAGACTAAGCACCAACTCCTCTGGAGTACTGGAGTATATTTTTAAAATTACGGTAGATCCTCTCAAACTGTAAGATTGGGATCCTAGTTGTGACCTCTTCATAAAACTTGAAGTCTGTTATATGAATACTTGATCTGATAGATACATAGATAGATAGATAGATAGATAAACTATATATATCTCTCACCTTATCCTGGTATATTAGAGGATAAGGCATATACATAAAACTTTGCAAGTCTATTGTAATTAATGCCCAATTTTACACACAATGCCTCGAAGAAGGTCAGATATTTTTATTCCAACAGAGTATAAAGTAAAGGGCATGGGCCGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGAGGATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTTGAGACCAGCCTGGGCAACGCTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAATACAAAAGAAATTATCCAGGCGTGGCGCTGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCATGCATGGACTTTGCTATTTTACAGTGCAGCAAGTATGTTTTATTTGAGGAGTTCATAGTTGTTGGAAAGTTGACCTCCAGATGAGTAAGTAGTGATGTGATTTACAAAGGAAACTATAATATCTATTCTGTGATGTATCTTCAAACCTTGACATGTTAGGTGTTAAAGGTTTACATATGTATGTGTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTATTTTTTAAAGTCTGCCTAGTTTGAATAATTGAGCATTGGAAACACTTGAATAGGATTGAAAATGTGTACATTAAGAAAACAAAAGTTAGGAAAGCATTTTCTTTATTGATAAGTGTATCCTGATTTGGAAAAGTGATGTTCCACTTAATATTTGTTCTGAATTATGATCCACTTAAAGTCAATGGACATGTCTCCTTCTATGAATTTCTGGGTACCATAGTGCCTTTAACATAGTAGGTACACAATAAATAGTTTCTTGAGTAAATGAATTGTTTTTCAAATTGGCTTTTTGGTTTTTCTTTTCTTTCCTCCCCTCCATTTAGAGCCGGGCGCCAATCTCAGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTATCTGTAGCAGGTGCAGATCATATTATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAATTCAGGTATCAGTGGAAGCTAAATATTGGTGTTTGAAAGGTGGGAGGAAAGGACTGATGATGCTGAAGACTGCAGAGAAGCCAAAAATTATGCCCAAGTACATCTGAAATAAACTAGATATCAACAACATTTTAAATGTGTTCACCTTAAGCATACTTCATGATCTTAGTCATTTCAGGTGGTTAGATAGGGAGGCAGTCTAGTTTTATGGGAAGAGCACTACTTTGAATAAAGGCTCTGGTATTTACTAGCTTTGTAAGCTTGGGAAGGTTACTTAATTTCTCTGAACATATACTTTTTCATTATTGTGAGTATAAAACATTAAATTCATATTATAATGCCTGGCCCATGACAGGTACTCATAGATAGGAGCTGTTATTATCATTCTTATTCTCCTTGAATATTCATGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTCAGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGACACCAGGCCCAGCTAACTTTTTTGTACTTTTAGTTGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCTGCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAAGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCTCATGGTCTTAAATTTAGAGCCACAGATATTGGAGCCTACTTTCCAACATAAACCCAAAGTAAGGGGGGTGGAATACCACCTTTATTTTATATTTTTTCAAAGAGATTTTTCAAATCATTACATTTCAAGCTTGTGGGAATTCAATGAAGTACATTGGACAGGGACTGTACTCCTTTTATGGAAAGGAATGACTTAATTGAGAAATACAACTAATTTGTATCAACTAGAATTAGAACACAGATCTCCTGATTTCTAATTATTCACTGTGACTATTTATCATAAGTAGCTTCCATTAAGTTTATATGCCATAGCATCTCTAACTGGTTTATCCATTAGCTTTTACTCCTTAACAAATCAGTCCAACACTTAGTGGCATAAAGCAGTATTTACAAACTCACTGAGTCTGCATGTTGACTGGGCAGTTCTTAATGGTTTTGTCTGAACTTAGCCATTCTTTACAAGGGCTCACTTATGTTCCTATGTTCAGTTGTGGGTTGACTGAGGGCTGGCTTTGCTGATCTTGGCTGGGCTCTCTCACATAGCCCAGATTCAAGGAGGCTTTTATAATCTACCACACTGGGCCTGCCTTCCCATCAGTTTGAATGTTGCAGTAAGACATTCTCTGAGCAAGTTACTACTTTGTGTTTGCCATTTATAAATGGAAGAGAAGGAAAGTGAAGCAAAACTGATCCAGCTTCTTTCTACAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAATTTGTATGCAGAGCCGGCTGTCCTAAAGTGGATAAGGGAGAATATCTCTGAGTGGAGGAACTGCACTATTGTCTCACCTGATGCTGGTGGAGCTAAGAGGTATGGTTGAAATTAGTATTGTTCCCAATGTACTGGGAAAATCTTTCAGATGGTTGTGTCACAAAGTGAAGTTTTTCTATCCAAGTGGCAGTTTTTAAGTATTTTTGAATGGATGTAAGTAGCTAGCACATGGGTTGAATATAGTTTTACCCTTTCCTCTTTTACTGTCCTCAGTTACTACTCGGAAGACAAGACAGAAAAGGGGTCCTAAATCATCATATTATGGATTTGACTATAACTTATGAGTAACTTGGTGCTACAGAGCTAGCAATACAGCTATAAACCTTTTGGGAAGGGTAGAAAATGTGGTTTTCTAATGAATAGCAGCTGCTATTGAACCACATATTGGTGGACAAATTCGCTTTTACACTCCTCTTACAATGCTGTTGGTTAGATCATTTTGATCCTTGGGATTAAAATATTAAGCAGGAAGGAAAGTAAAGTGTGACATTTTTATTTAAAGCCAAGATCTTAACATTTTAAACAAACTGATTGCCAGGGATTGCCAGTTAACAGTGCTTTGCAGCTCACATGGTGCAGACTAAGAGCT
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Task1_train_30750
The gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Arts syndrome
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Task1_train_30751
Gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Phosphoribosylpyrophosphate synthetase superactivity
TCTAAAAGCCATTCAAATCTTCAATGACTGTTTCTCAACAACCTCTTTTATTTCAGTAACTTCAACAGAACTGATAAGCTGAGAACTTGAGTTATGTTATCCAGCCAGATATATGGGTTGGTGAGTCCCATGTAATTGCTAGTTACCATCTGTAATGCTAGAGACAGCCTAAGAAACATCCCCCCAACTAGTAGTTGTCATATTTAATTTGTCGGTCATTATTTTAATATCTTTCTGTGGGACTTAGAAAATAGTCACATTTGAAATAGGCAGGATTTTCTTTCCAAAGGTGGGTATAGGAAAACTGCCTTTAGTAGACAACTTATTGCTACCTGATTTTTTTTTCATTATCATTGTCTTATAGTGATGGAGTATTTTACAATTGAGTGTCTATCACTTCTGTGTTGGCAGGGTTTGGGGAGTAGGTAGAGATCCCTGTGTGATATTCATTTGTACAGTAGTTCTCTCCTCAAAAGGTGTAGAGAGTTACTTTTTCTAGCCCTTTTTATGCTTTGTTGGTCACTGAATTTGTTGGCCTTTGAGTATGGTTGGTTTGGGATACTTGAACTAATTGATCATGCATTTGCCTTGGGTAAGTAATCATTCCAAGCGAATTGGTTACCACTGATGTTATGTGCTTATGCAGTAGTAGTAATGGAGAGTACAGGGTATGGTTGGTTTAGATCAAGGTACAAATGTTACCTAGATTATGGTTCAAACCTTATTATGTGGTCACAGGTTCTCACTTATCCAGCAAAAACTCATGTGACCATAGTCACAAGAGAAACAGGACAAAATGCTATAGTTTGTTCAGTTCTACATTAAAAAACAGGACAAATCCCCAAGCACGGGCTGCTTCACACATGACGGAGATGGCACAGCGGAGCATGGACAGACGTGCCACTGGGGCAGCTCACTGTCATTTACACTGAATAGATTTTTGTTTGAATTATGTGGTACTTTGTCAAAAGACAAATTTGTCTTCTATCCTACCTTCTAGTCTGGTTTATTTTCTCTTGTAATAAGAAAAATAAGAATTCTCTTTGATTGGAAGATACTTTGGACCGAATGGTGAGATGCCTAGCTTGTCTGGGTAATTGATATAACTTTCTGTCTAGCAATTGTGAAAAAAACTCCCAAGCTTGGTGTCCAGGTACAGTTGACAGTGACAGTTGATGGATGTTTTGCCAACAGCACTGAGGGAAGTGATGAGGACACAGGCATTGGAACAGGCTGGATGCTGCTCCTCTCCTGCCAGTCAGGTTCTCTTCTCACCACATCCCCATTCACGGGTCTTCCATGATGGGAATTGGGACAGTCTGTGTACTCCTGGCATTAGTTAATTCTTTCCTCATTCCTTCTGCTGCCAATCCATTAAATAAACTTGCGTGTCTTAGCGTTATACTGCTTCCCAGTACTGGTGAGGGTGTCTGTCCTCTACCCAGAATGAATACTCATCTAAGTTTGATCAGTACGTTCATAAGCTTCTGTTGAGCTATGGAGGCACTGGTTTATAAAACCCAGTTTGTGATATTTGCCTTTGAGAAGTCAATGATAGTTGCTTTCATTCTTCCAGCCCTGGGAACTATTGGTTTCAAGGAGTATTCTCCTCCCCAAAACAAGCCCATTCTTTAGTCCATTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCAGCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCCCCCGGCCTCTTTAGTCCATTTCTTTTGTCTTAGAAGCCACACATACATATGAACACGCTCTGTTTTGCAGAGTGACCTCCATTGCAGACAGGCTGAATGTGGACTTTGCCTTGATTCACAAAGAACGGAAGAAGGCCAATGAAGTGGACCGCATGGTGCTTGTGGGAGATGTGAAGGATCGGGTGGCCATCCTTGTGGATGACATGGCTGACACTTGTGGCACAATCTGCCATGCAGCTGACAAGTAAGTGTGGATTGATGGGGCTGGTAGTTAGAAGGAAAAAGCTAGCAATTGCTGTCTGAATGTCTTCAGCCTGCTGATTCCTTTTGGAACCAAATTGAGGGGATAAGTAACTTTGTGAGATTTTTATCACCCAAGGCTTAAATTATAATACATAGAAATTGTTGAGTACTCTTATTTTTTTTTCAGATTTTCTTATTTTTTAAATTTATATTGTACTAAGCTACATATAACACAATTTGCCATTTTAACTATTTTAAGTGTATAATTCCATGACATTAACTATATTCACAATGTTAGACAACCATCGCCTGATCATCAAAGTTTTTTGATCACCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCA
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Task1_train_30752
This genomic variant is located on Chromosome X, within the PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Phosphoribosylpyrophosphate synthetase superactivity
ATTCAAATCTTCAATGACTGTTTCTCAACAACCTCTTTTATTTCAGTAACTTCAACAGAACTGATAAGCTGAGAACTTGAGTTATGTTATCCAGCCAGATATATGGGTTGGTGAGTCCCATGTAATTGCTAGTTACCATCTGTAATGCTAGAGACAGCCTAAGAAACATCCCCCCAACTAGTAGTTGTCATATTTAATTTGTCGGTCATTATTTTAATATCTTTCTGTGGGACTTAGAAAATAGTCACATTTGAAATAGGCAGGATTTTCTTTCCAAAGGTGGGTATAGGAAAACTGCCTTTAGTAGACAACTTATTGCTACCTGATTTTTTTTTCATTATCATTGTCTTATAGTGATGGAGTATTTTACAATTGAGTGTCTATCACTTCTGTGTTGGCAGGGTTTGGGGAGTAGGTAGAGATCCCTGTGTGATATTCATTTGTACAGTAGTTCTCTCCTCAAAAGGTGTAGAGAGTTACTTTTTCTAGCCCTTTTTATGCTTTGTTGGTCACTGAATTTGTTGGCCTTTGAGTATGGTTGGTTTGGGATACTTGAACTAATTGATCATGCATTTGCCTTGGGTAAGTAATCATTCCAAGCGAATTGGTTACCACTGATGTTATGTGCTTATGCAGTAGTAGTAATGGAGAGTACAGGGTATGGTTGGTTTAGATCAAGGTACAAATGTTACCTAGATTATGGTTCAAACCTTATTATGTGGTCACAGGTTCTCACTTATCCAGCAAAAACTCATGTGACCATAGTCACAAGAGAAACAGGACAAAATGCTATAGTTTGTTCAGTTCTACATTAAAAAACAGGACAAATCCCCAAGCACGGGCTGCTTCACACATGACGGAGATGGCACAGCGGAGCATGGACAGACGTGCCACTGGGGCAGCTCACTGTCATTTACACTGAATAGATTTTTGTTTGAATTATGTGGTACTTTGTCAAAAGACAAATTTGTCTTCTATCCTACCTTCTAGTCTGGTTTATTTTCTCTTGTAATAAGAAAAATAAGAATTCTCTTTGATTGGAAGATACTTTGGACCGAATGGTGAGATGCCTAGCTTGTCTGGGTAATTGATATAACTTTCTGTCTAGCAATTGTGAAAAAAACTCCCAAGCTTGGTGTCCAGGTACAGTTGACAGTGACAGTTGATGGATGTTTTGCCAACAGCACTGAGGGAAGTGATGAGGACACAGGCATTGGAACAGGCTGGATGCTGCTCCTCTCCTGCCAGTCAGGTTCTCTTCTCACCACATCCCCATTCACGGGTCTTCCATGATGGGAATTGGGACAGTCTGTGTACTCCTGGCATTAGTTAATTCTTTCCTCATTCCTTCTGCTGCCAATCCATTAAATAAACTTGCGTGTCTTAGCGTTATACTGCTTCCCAGTACTGGTGAGGGTGTCTGTCCTCTACCCAGAATGAATACTCATCTAAGTTTGATCAGTACGTTCATAAGCTTCTGTTGAGCTATGGAGGCACTGGTTTATAAAACCCAGTTTGTGATATTTGCCTTTGAGAAGTCAATGATAGTTGCTTTCATTCTTCCAGCCCTGGGAACTATTGGTTTCAAGGAGTATTCTCCTCCCCAAAACAAGCCCATTCTTTAGTCCATTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCAGCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCCCCCGGCCTCTTTAGTCCATTTCTTTTGTCTTAGAAGCCACACATACATATGAACACGCTCTGTTTTGCAGAGTGACCTCCATTGCAGACAGGCTGAATGTGGACTTTGCCTTGATTCACAAAGAACGGAAGAAGGCCAATGAAGTGGACCGCATGGTGCTTGTGGGAGATGTGAAGGATCGGGTGGCCATCCTTGTGGATGACATGGCTGACACTTGTGGCACAATCTGCCATGCAGCTGACAAGTAAGTGTGGATTGATGGGGCTGGTAGTTAGAAGGAAAAAGCTAGCAATTGCTGTCTGAATGTCTTCAGCCTGCTGATTCCTTTTGGAACCAAATTGAGGGGATAAGTAACTTTGTGAGATTTTTATCACCCAAGGCTTAAATTATAATACATAGAAATTGTTGAGTACTCTTATTTTTTTTTCAGATTTTCTTATTTTTTAAATTTATATTGTACTAAGCTACATATAACACAATTTGCCATTTTAACTATTTTAAGTGTATAATTCCATGACATTAACTATATTCACAATGTTAGACAACCATCGCCTGATCATCAAAGTTTTTTGATCACCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGA
ATTCAAATCTTCAATGACTGTTTCTCAACAACCTCTTTTATTTCAGTAACTTCAACAGAACTGATAAGCTGAGAACTTGAGTTATGTTATCCAGCCAGATATATGGGTTGGTGAGTCCCATGTAATTGCTAGTTACCATCTGTAATGCTAGAGACAGCCTAAGAAACATCCCCCCAACTAGTAGTTGTCATATTTAATTTGTCGGTCATTATTTTAATATCTTTCTGTGGGACTTAGAAAATAGTCACATTTGAAATAGGCAGGATTTTCTTTCCAAAGGTGGGTATAGGAAAACTGCCTTTAGTAGACAACTTATTGCTACCTGATTTTTTTTTCATTATCATTGTCTTATAGTGATGGAGTATTTTACAATTGAGTGTCTATCACTTCTGTGTTGGCAGGGTTTGGGGAGTAGGTAGAGATCCCTGTGTGATATTCATTTGTACAGTAGTTCTCTCCTCAAAAGGTGTAGAGAGTTACTTTTTCTAGCCCTTTTTATGCTTTGTTGGTCACTGAATTTGTTGGCCTTTGAGTATGGTTGGTTTGGGATACTTGAACTAATTGATCATGCATTTGCCTTGGGTAAGTAATCATTCCAAGCGAATTGGTTACCACTGATGTTATGTGCTTATGCAGTAGTAGTAATGGAGAGTACAGGGTATGGTTGGTTTAGATCAAGGTACAAATGTTACCTAGATTATGGTTCAAACCTTATTATGTGGTCACAGGTTCTCACTTATCCAGCAAAAACTCATGTGACCATAGTCACAAGAGAAACAGGACAAAATGCTATAGTTTGTTCAGTTCTACATTAAAAAACAGGACAAATCCCCAAGCACGGGCTGCTTCACACATGACGGAGATGGCACAGCGGAGCATGGACAGACGTGCCACTGGGGCAGCTCACTGTCATTTACACTGAATAGATTTTTGTTTGAATTATGTGGTACTTTGTCAAAAGACAAATTTGTCTTCTATCCTACCTTCTAGTCTGGTTTATTTTCTCTTGTAATAAGAAAAATAAGAATTCTCTTTGATTGGAAGATACTTTGGACCGAATGGTGAGATGCCTAGCTTGTCTGGGTAATTGATATAACTTTCTGTCTAGCAATTGTGAAAAAAACTCCCAAGCTTGGTGTCCAGGTACAGTTGACAGTGACAGTTGATGGATGTTTTGCCAACAGCACTGAGGGAAGTGATGAGGACACAGGCATTGGAACAGGCTGGATGCTGCTCCTCTCCTGCCAGTCAGGTTCTCTTCTCACCACATCCCCATTCACGGGTCTTCCATGATGGGAATTGGGACAGTCTGTGTACTCCTGGCATTAGTTAATTCTTTCCTCATTCCTTCTGCTGCCAATCCATTAAATAAACTTGCGTGTCTTAGCGTTATACTGCTTCCCAGTACTGGTGAGGGTGTCTGTCCTCTACCCAGAATGAATACTCATCTAAGTTTGATCAGTACGTTCATAAGCTTCTGTTGAGCTATGGAGGCACTGGTTTATAAAACCCAGTTTGTGATATTTGCCTTTGAGAAGTCAATGATAGTTGCTTTCATTCTTCCAGCCCTGGGAACTATTGGTTTCAAGGAGTATTCTCCTCCCCAAAACAAGCCCATTCTTTAGTCCATTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCAGCTCCTGGGTTCACGCCATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCCCCCGGCCTCTTTAGTCCATTTCTTTTGTCTTAGAAGCCACACATACATATGAACACGCTCTGTTTTGCAGAGTGACCTCCATTGCAGACAGGCTGAATGTGGACTTTGCCTTGATTCAGAAAGAACGGAAGAAGGCCAATGAAGTGGACCGCATGGTGCTTGTGGGAGATGTGAAGGATCGGGTGGCCATCCTTGTGGATGACATGGCTGACACTTGTGGCACAATCTGCCATGCAGCTGACAAGTAAGTGTGGATTGATGGGGCTGGTAGTTAGAAGGAAAAAGCTAGCAATTGCTGTCTGAATGTCTTCAGCCTGCTGATTCCTTTTGGAACCAAATTGAGGGGATAAGTAACTTTGTGAGATTTTTATCACCCAAGGCTTAAATTATAATACATAGAAATTGTTGAGTACTCTTATTTTTTTTTCAGATTTTCTTATTTTTTAAATTTATATTGTACTAAGCTACATATAACACAATTTGCCATTTTAACTATTTTAAGTGTATAATTCCATGACATTAACTATATTCACAATGTTAGACAACCATCGCCTGATCATCAAAGTTTTTTGATCACCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGA
Task1_train_30753
This mutation occurs in PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Arts syndrome
CCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGAGGTCATCTGAGCACACAGCAAAGTGGTGGCCACCTACAAGAGAAGAGGCCTCAGCATGACACCTACTTTGTCTGCACCTTGATCTTGGACTTTAAGCCTCCAGAACTGTGAAAAATTTGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCATTCTATGGTATTTTCTTTTCCTTAAAAAAATTTTTCCCCTAACCCACTGTGCCTTATAATATTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTCATATGATATTTTGTTGTGGAAGCCTAAGCAGGCTAATATACTCCTCCCTGACTAAAATTCTGCAATGACAAGTAAGATGAATCCAAATCAACATTTTTTCCCTCTAGACTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAATCTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAGTAGTAGTCACCAATACCATACCTCAGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCCAAAATACAGGTGAGGATGAGATTTGTGCAAAACAAGACTTTTCTAAGTGTTTAGGAGGTGGTTACTTACGTTGAATTAGGTCTCTGGATTCTGAAGATATCTTTCTTTGGTCTGAAGGATTTAGTCTTGTCATCAGAATTTGTGATCCAAAAGTTAACAATCACCTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAAT
CCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGAGGTCATCTGAGCACACAGCAAAGTGGTGGCCACCTACAAGAGAAGAGGCCTCAGCATGACACCTACTTTGTCTGCACCTTGATCTTGGACTTTAAGCCTCCAGAACTGTGAAAAATTTGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCATTCTATGGTATTTTCTTTTCCTTAAAAAAATTTTTCCCCTAACCCACTGTGCCTTATAATATTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTCATATGATATTTTGTTGTGGAAGCCTAAGCAGGCTAATATACTCCTCCCTGACTAAAATTCTGCAATGACAAGTAAGATGAATCCAAATCAACATTTTTTCCCTCTAGACTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAATCTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAGTAGTAGTCACCAATACCATACCTCCGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCCAAAATACAGGTGAGGATGAGATTTGTGCAAAACAAGACTTTTCTAAGTGTTTAGGAGGTGGTTACTTACGTTGAATTAGGTCTCTGGATTCTGAAGATATCTTTCTTTGGTCTGAAGGATTTAGTCTTGTCATCAGAATTTGTGATCCAAAAGTTAACAATCACCTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAAT
Task1_train_30754
A sequence alteration has been identified in PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
CCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGAGGTCATCTGAGCACACAGCAAAGTGGTGGCCACCTACAAGAGAAGAGGCCTCAGCATGACACCTACTTTGTCTGCACCTTGATCTTGGACTTTAAGCCTCCAGAACTGTGAAAAATTTGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCATTCTATGGTATTTTCTTTTCCTTAAAAAAATTTTTCCCCTAACCCACTGTGCCTTATAATATTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTCATATGATATTTTGTTGTGGAAGCCTAAGCAGGCTAATATACTCCTCCCTGACTAAAATTCTGCAATGACAAGTAAGATGAATCCAAATCAACATTTTTTCCCTCTAGACTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAATCTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAGTAGTAGTCACCAATACCATACCTCAGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCCAAAATACAGGTGAGGATGAGATTTGTGCAAAACAAGACTTTTCTAAGTGTTTAGGAGGTGGTTACTTACGTTGAATTAGGTCTCTGGATTCTGAAGATATCTTTCTTTGGTCTGAAGGATTTAGTCTTGTCATCAGAATTTGTGATCCAAAAGTTAACAATCACCTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAAT
CCCTGAGTATGCTACATGCGATTGTTTTTTGTTTTAATGAGTTAAAATAAAAATCCTGAGCAGACAGGTGTGTGTGCTCATATTTTTATTTTACCTAAGCCGGAACCCTTGGTCTTACTTCTCGACTGTTTTACCGGCTGCTACTTTTGTTCATTATTACTTCTTTTTTTCACTCTAATCCTGTGATAGGTTAATGTTTATATTACTTGTCATCTCTTGCCTGCAGTGTTCTAAATTGCCTCCCCACTCTGTTCTCCATTGCCAGTCACCGTTCTCTCACCTCCCCACTCCATCTCTCCATGCTTGCTAATCTTCCTGCAACTGAGGCTCGATCCCATCACTCTTTAAGATTTTAAGTGGCCCCTCATTACTAACAATCCAAGCCACTATGAGCAGCATTGTTTCTTAGAATGGTATTTTTACTTTTATTTTTATTTTGAGACATGGTCTCACTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGTAGTAGTACAATTACGGCTCACTGCAGTCTTGAAATCTTGGGCTCAAGAAATCCTCCTGTCTCAGACTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAAGTGCCACCACACTTGGGTAATTATTTATTATTATTATTATTATTTTTGTAGAGAAGGAGTCCCACTATGTTGCCCAGGCTGTCCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCAATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGCTGTGAGCCACAGCACCCAGCCCTGAGAATGGTTTTTTTAAACTTTCTTGTGTCTGTGCCTTGCACAGTGCCTGGCACATAATAGGTGCTAAAAAAAAATTGGGGTGAATGATTCTTGGTTTGGGATCCTGGAGTAAACATTCATAAAACCCATTTCATCCTTGTACAAGTACGGGAATACTAGTCGCTATAACAGATCAACTCCCTAACATGATAGTTTCCTTCTTGTCCATGGCACACTCCAATGCAAGTGTTCTTGTTGGACTCATTTTTTCTAAGCAATAGTTAGGAGCTCAGATTCTTTCAATCTTTGGTGCTATATCTTTAACATGGGGTTTCCAAGATTACCTTGGAAGACATTTCAATTTTGGCCAGCCAGAAAAGGAAAAGAACACAGAGGATCACCCCTGGAAGATTTTTGTTAAGTCCAACCAAAAACTGATGTACATTGTGTCTGCCCACATTTTAATAGCCAGAATTAAGCCACATGGCCACACTGAACTATGTGAGGGAGGCTGGGAAATGTAGTTCAGCTATGTGCCCAGAAAGAAGAGGAAGTGGATTTTGTTAAGTGCAACAGTCTATGCCAGAGTCCTTTGACACTAATTCAGACCTATTCAGATAAGTTCTTAGTGCAGTTCTTTCTCGATATGGACTGAATTGTGTCCTCCCCAAATTCATATATGTTGAGGCCTAACCCCAATGTGATGGTATTTGGAGTTACCTTGAGGGGCACGTATTTAGGATTAGATGAGGTCACTAGGGCAGAGCCCTTACAATGGGATGAATGCCCTTATAAGAAGAGAATGCTGGAGAACTGGCCAGCATTTCCCCATGCGCACGCATGCGTGCACACACACTCACACTCACACACAAAGAGGTCATCTGAGCACACAGCAAAGTGGTGGCCACCTACAAGAGAAGAGGCCTCAGCATGACACCTACTTTGTCTGCACCTTGATCTTGGACTTTAAGCCTCCAGAACTGTGAAAAATTTGTTTCTGTTATTTAAGCCACCCATTCTATGGTATTTTCTTTTCCTTAAAAAAATTTTTCCCCTAACCCACTGTGCCTTATAATATTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTCATATGATATTTTGTTGTGGAAGCCTAAGCAGGCTAATATACTCCTCCCTGACTAAAATTCTGCAATGACAAGTAAGATGAATCCAAATCAACATTTTTTCCCTCTAGACTTCTCTCAGCTGGCGCCACCAGAGTTTATGCCATCTTGACTCATGGAATCTTCTCCGGTCCTGCTATTTCTCGCATCAACAACGCATGCTTTGAGGCAGTAGTAGTCACCAATACCATACCTCCGGAGGACAAGATGAAGCATTGCTCCAAAATACAGGTGAGGATGAGATTTGTGCAAAACAAGACTTTTCTAAGTGTTTAGGAGGTGGTTACTTACGTTGAATTAGGTCTCTGGATTCTGAAGATATCTTTCTTTGGTCTGAAGGATTTAGTCTTGTCATCAGAATTTGTGATCCAAAAGTTAACAATCACCTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAAT
Task1_train_30755
Here’s a variant in PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
TTGTGATCCAAAAGTTAACAATCACCTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAATGTTATGAAGAATAGCTGAGTGCAGCCTCATGACAGGGAAACAGCACAGTGTTGCAGTTTTAAGAGGAAGGGCACTTGCCTGGCTGCTCATCAGTGTCTGCAAATTGGCCAGTCATCTCTGACCATATGATAGTAACCTGATTTCCTTTCTTGCCTTTCTAGGTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGCCATCAGGAGAACTCACAATGGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATGTCCCTTTATAATAGAGTAACTTCTGAGGCTTTTTGAGAATAAAATCCACCCCACCCTTGTTTCCCCTTGGTATTTGATGACAAATTCAGCAGAAGACCCGGCTTGCTCCAGTGTAGCTTTCTACATCCCACATCAGGTATATTAGAGCTTATCCGAACTGGGGAAAGACGGATTGAGATTAACTGCTGGGACCTCCTACCTGCATTATCTCATTCTGGCTTCCTTGATAATTCTGTGGGCCTTGCAGCTTTAACTATAGCTCAGCTGCTGCAAGATTTCAGACTTTTGAGGATGTTGTGTGAGGGTGTTTGACTGTGACTGGGGAAGCTCAGACTACTTTGTATGTGAATGCTTCAGGGTTTTCTTTGTTGAGAACAACTAGCAACAAAGGCAACCCATGTGTGACCAGTTCTCCCCAAGGTCTATGCTAAATTATAGCAAGAGCCCTGGGCAACCCCAAACCTAGTCCTGGTAGCTGAGCACCCTGTAAGGCAGGAGCAGGCAGCTCAGCTTGAGCAGACATTGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGTTGAGGGGGGAGGCAGCACAGTGCAGCAAATGTTTCTTGGGAGGAAGAAGCCTGATCCATCACCATCTGCTTGACTATGTAGCTTGGATTCTCCTTTGTACCTATCCCTTTCGATTTGGCTTTACCTTCATCTATCTTGATCCTTTCCTGGCCAAATATCCTCTTGGGCCCAAATGAACATTGTACCATAGTCTTCTGGAAAGCAAACATGCTTCCTGCTATGTAATTGCTAACATTCATATTAGATGATGTGCTGTAGCTTGATCTTCCTTAGCCTACTGCCACTGAGGCAGTAGGTTTTAGGTGGTATCGTAGTGCCTTTTGATTAATTTAAGTATTTAATTTTCATCTTCCTTCTTTGGATCTATTTGGCCTCTCAAATGAACTGAGATTCCTGTTAAAAAAGATTGATGTTATTGTCTCTTGTAGAGGAAACTAATAAAGTGTGTGTACCTGTGTGATTTGGGGTCTGTATCATACATAATCTGTACTGATCTCTCTGCTAAAGGTTTGGTTTAGATAGATGTCTTGCTGTCCATTGATAGCTCTTATTTGTTTCCAAACTACGTTAGCTTCATTGTTAAACCAAGAGAAGACATTGGCAGCAGTTTTATTCAACTGTAAGACTAAGATGTCTGGAGTTTACTGAGAATGTGATAAGAGTGTAATTCTGTGCAGTATACCTAAATTATAGCATGTATAATGTCTGGTGGATCTCTGGTTCTTACTCCTGAAGATCCAAATTAGGTATTTTCTTATGGGAGGAGAATTTCTGTGATTTATTCATTTTGAACTAATTTTGCCAAATGTGATAATTTCCTTCCATTCATCAGTAATTGACATACGTTTGGCATTTACTTTCTTTGTTTTTTTTGATTTTTTGGTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGAATTTATAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTATATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGTGCCCGGCTGGGCATTTACTTTCATCCCTGCTAAATAAGAACTATTTTGAGAAGGTAAATGTGCAAAATTTAAGGATGAATTATTATGCATTCCAAAATTTTAAGTTTCCTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTCTCTTTCTTTCTTTCCCTTTAGCTCTCTCTTTCTTCATTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTCTCTTTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTTTCTGTCTTTCATCTTTCTCTTGCTCTGTCACCC
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Task1_train_30756
This gene mutation involves PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; PRPS1-related disorder
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TTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAATGTTATGAAGAATAGCTGAGTGCAGCCTCATGACAGGGAAACAGCACAGTGTTGCAGTTTTAAGAGGAAGGGCACTTGCCTGGCTGCTCATCAGTGTCTGCAAATTGGCCAGTCATCTCTGACCATATGATAGTAACCTGATTTCCTTTCTTGCCTTTCTAGGTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGCCATCAGGAGAACTCACAATAGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATGTCCCTTTATAATAGAGTAACTTCTGAGGCTTTTTGAGAATAAAATCCACCCCACCCTTGTTTCCCCTTGGTATTTGATGACAAATTCAGCAGAAGACCCGGCTTGCTCCAGTGTAGCTTTCTACATCCCACATCAGGTATATTAGAGCTTATCCGAACTGGGGAAAGACGGATTGAGATTAACTGCTGGGACCTCCTACCTGCATTATCTCATTCTGGCTTCCTTGATAATTCTGTGGGCCTTGCAGCTTTAACTATAGCTCAGCTGCTGCAAGATTTCAGACTTTTGAGGATGTTGTGTGAGGGTGTTTGACTGTGACTGGGGAAGCTCAGACTACTTTGTATGTGAATGCTTCAGGGTTTTCTTTGTTGAGAACAACTAGCAACAAAGGCAACCCATGTGTGACCAGTTCTCCCCAAGGTCTATGCTAAATTATAGCAAGAGCCCTGGGCAACCCCAAACCTAGTCCTGGTAGCTGAGCACCCTGTAAGGCAGGAGCAGGCAGCTCAGCTTGAGCAGACATTGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGTTGAGGGGGGAGGCAGCACAGTGCAGCAAATGTTTCTTGGGAGGAAGAAGCCTGATCCATCACCATCTGCTTGACTATGTAGCTTGGATTCTCCTTTGTACCTATCCCTTTCGATTTGGCTTTACCTTCATCTATCTTGATCCTTTCCTGGCCAAATATCCTCTTGGGCCCAAATGAACATTGTACCATAGTCTTCTGGAAAGCAAACATGCTTCCTGCTATGTAATTGCTAACATTCATATTAGATGATGTGCTGTAGCTTGATCTTCCTTAGCCTACTGCCACTGAGGCAGTAGGTTTTAGGTGGTATCGTAGTGCCTTTTGATTAATTTAAGTATTTAATTTTCATCTTCCTTCTTTGGATCTATTTGGCCTCTCAAATGAACTGAGATTCCTGTTAAAAAAGATTGATGTTATTGTCTCTTGTAGAGGAAACTAATAAAGTGTGTGTACCTGTGTGATTTGGGGTCTGTATCATACATAATCTGTACTGATCTCTCTGCTAAAGGTTTGGTTTAGATAGATGTCTTGCTGTCCATTGATAGCTCTTATTTGTTTCCAAACTACGTTAGCTTCATTGTTAAACCAAGAGAAGACATTGGCAGCAGTTTTATTCAACTGTAAGACTAAGATGTCTGGAGTTTACTGAGAATGTGATAAGAGTGTAATTCTGTGCAGTATACCTAAATTATAGCATGTATAATGTCTGGTGGATCTCTGGTTCTTACTCCTGAAGATCCAAATTAGGTATTTTCTTATGGGAGGAGAATTTCTGTGATTTATTCATTTTGAACTAATTTTGCCAAATGTGATAATTTCCTTCCATTCATCAGTAATTGACATACGTTTGGCATTTACTTTCTTTGTTTTTTTTGATTTTTTGGTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGAATTTATAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTATATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGTGCCCGGCTGGGCATTTACTTTCATCCCTGCTAAATAAGAACTATTTTGAGAAGGTAAATGTGCAAAATTTAAGGATGAATTATTATGCATTCCAAAATTTTAAGTTTCCTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTCTCTTTCTTTCTTTCCCTTTAGCTCTCTCTTTCTTCATTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTCTCTTTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTTTCTGTCTTTCATCTTTCTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT
Task1_train_30757
With a mutation on Chromosome X in gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 1
TTCTTTTCAAACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAATGTTATGAAGAATAGCTGAGTGCAGCCTCATGACAGGGAAACAGCACAGTGTTGCAGTTTTAAGAGGAAGGGCACTTGCCTGGCTGCTCATCAGTGTCTGCAAATTGGCCAGTCATCTCTGACCATATGATAGTAACCTGATTTCCTTTCTTGCCTTTCTAGGTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGCCATCAGGAGAACTCACAATGGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATGTCCCTTTATAATAGAGTAACTTCTGAGGCTTTTTGAGAATAAAATCCACCCCACCCTTGTTTCCCCTTGGTATTTGATGACAAATTCAGCAGAAGACCCGGCTTGCTCCAGTGTAGCTTTCTACATCCCACATCAGGTATATTAGAGCTTATCCGAACTGGGGAAAGACGGATTGAGATTAACTGCTGGGACCTCCTACCTGCATTATCTCATTCTGGCTTCCTTGATAATTCTGTGGGCCTTGCAGCTTTAACTATAGCTCAGCTGCTGCAAGATTTCAGACTTTTGAGGATGTTGTGTGAGGGTGTTTGACTGTGACTGGGGAAGCTCAGACTACTTTGTATGTGAATGCTTCAGGGTTTTCTTTGTTGAGAACAACTAGCAACAAAGGCAACCCATGTGTGACCAGTTCTCCCCAAGGTCTATGCTAAATTATAGCAAGAGCCCTGGGCAACCCCAAACCTAGTCCTGGTAGCTGAGCACCCTGTAAGGCAGGAGCAGGCAGCTCAGCTTGAGCAGACATTGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGTTGAGGGGGGAGGCAGCACAGTGCAGCAAATGTTTCTTGGGAGGAAGAAGCCTGATCCATCACCATCTGCTTGACTATGTAGCTTGGATTCTCCTTTGTACCTATCCCTTTCGATTTGGCTTTACCTTCATCTATCTTGATCCTTTCCTGGCCAAATATCCTCTTGGGCCCAAATGAACATTGTACCATAGTCTTCTGGAAAGCAAACATGCTTCCTGCTATGTAATTGCTAACATTCATATTAGATGATGTGCTGTAGCTTGATCTTCCTTAGCCTACTGCCACTGAGGCAGTAGGTTTTAGGTGGTATCGTAGTGCCTTTTGATTAATTTAAGTATTTAATTTTCATCTTCCTTCTTTGGATCTATTTGGCCTCTCAAATGAACTGAGATTCCTGTTAAAAAAGATTGATGTTATTGTCTCTTGTAGAGGAAACTAATAAAGTGTGTGTACCTGTGTGATTTGGGGTCTGTATCATACATAATCTGTACTGATCTCTCTGCTAAAGGTTTGGTTTAGATAGATGTCTTGCTGTCCATTGATAGCTCTTATTTGTTTCCAAACTACGTTAGCTTCATTGTTAAACCAAGAGAAGACATTGGCAGCAGTTTTATTCAACTGTAAGACTAAGATGTCTGGAGTTTACTGAGAATGTGATAAGAGTGTAATTCTGTGCAGTATACCTAAATTATAGCATGTATAATGTCTGGTGGATCTCTGGTTCTTACTCCTGAAGATCCAAATTAGGTATTTTCTTATGGGAGGAGAATTTCTGTGATTTATTCATTTTGAACTAATTTTGCCAAATGTGATAATTTCCTTCCATTCATCAGTAATTGACATACGTTTGGCATTTACTTTCTTTGTTTTTTTTGATTTTTTGGTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGAATTTATAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTATATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGTGCCCGGCTGGGCATTTACTTTCATCCCTGCTAAATAAGAACTATTTTGAGAAGGTAAATGTGCAAAATTTAAGGATGAATTATTATGCATTCCAAAATTTTAAGTTTCCTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTCTCTTTCTTTCTTTCCCTTTAGCTCTCTCTTTCTTCATTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTCTCTTTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTTTCTGTCTTTCATCTTTCTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCT
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Task1_train_30758
This variant affects the gene PRPS1 (phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 5
AACTGCCAAGCCTTGGGAAAATCACCTGTTTAAAAGTTTAAATTGCTACACCTCAGAATCTCTGGAAGATGGAGCCTAAGATTCTACATTTTAACAGGTTCTCCCAGTGATTCTGATGCAAATTAAAGTTTTCAAGTCCATACTTTACAGTATGTGTTTGTCTGTTAACTATCGGCCCCTGTAGATATAATGTGAAACCTTTAAACTGATTGTACACTTCTACCAACTTTAGTGTTTCTCAGTGTGCTCTGGACCTAAGGTTCTTATTAAAATGTAGATTCCTTTGCTCCATCTAAGACCTATAAAACCAGAGGTCCTGGAACCAGTATTTTAAAGTAATTCCCCAAGTAATTGTTAGAAACTAAAGTTTGAGTGCTCTTGCACTAAAAGAACAAGGCCTTGCTTAATTAAAAATGTTCACATTAATCTATGAGCTTTTTGAAATTAATATGTGTAATTGGAGGATTATCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGGATCTTGCTCTGTTGCCCCAGCCGGAGTGCGCAATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACTTTGAAGGCTCAGGCAATCATCCTGTCTCAGCCTCCCAAGTGGCTGGCGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGATATTATGTGTAGAGACGGGGTCTCCCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGCTATCCTCCTGTGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGATGTCATTCTTAAGGATTTTTTTTCAACTTAGTCTTTTTTTTTTCCTTCATAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCTAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACCGCAACCTCAGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGACTAATTTTTTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGCTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGTCCACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTATTCAGAAGGATTTTTAAATGCGAACCTACCACCATTTTTTTTTAGACAGGGTCTCACTCTGTTGCCTAAGCTGGAGTGCAGTGGCCTGATCTTGACTCACTGCAGCCTCAAACTCCCAGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTAGCCTCACAAGTAGCTGGGACTACAGGCATACACCACAACCACGCCTGGCTAATTTTTGTTTTATTGTAGAGACAGAGTTTCACCATATTGCCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACAGTGCCCAGCCATTTTGATGAACCAAAGTCAGCGTTTTTTCTCAGTTAGCATTTTGACTCTTTCCTAAGTGGCTGTTTTGTTTTGTTTTGTTGTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACCGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCACACCATGCTTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGCCTGGTCTCCAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCAGGGATTAACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCGTAAGTGGCTATCTTAAAAATGTTATGAAGAATAGCTGAGTGCAGCCTCATGACAGGGAAACAGCACAGTGTTGCAGTTTTAAGAGGAAGGGCACTTGCCTGGCTGCTCATCAGTGTCTGCAAATTGGCCAGTCATCTCTGACCATATGATAGTAACCTGATTTCCTTTCTTGCCTTTCTAGGTGATTGACATCTCTATGATCCTTGCAGAAGCCATCAGGAGAACTCACAATGGAGAATCCGTTTCTTACCTATTCAGCCATGTCCCTTTATAATAGAGTAACTTCTGAGGCTTTTTGAGAATAAAATCCACCCCACCCTTGTTTCCCCTTGGTATTTGATGACAAATTCAGCAGAAGACCCGGCTTGCTCCAGTGTAGCTTTCTACATCCCACATCAGGTATATTAGAGCTTATCCGAACTGGGGAAAGACGGATTGAGATTAACTGCTGGGACCTCCTACCTGCATTATCTCATTCTGGCTTCCTTGATAATTCTGTGGGCCTTGCAGCTTTAACTATAGCTCAGCTGCTGCAAGATTTCAGACTTTTGAGGATGTTGTGTGAGGGTGTTTGACTGTGACTGGGGAAGCTCAGACTACTTTGTATGTGAATGCTTCAGGGTTTTCTTTGTTGAGAACAACTAGCAACAAAGGCAACCCATGTGTGACCAGTTCTCCCCAAGGTCTATGCTAAATTATAGCAAGAGCCCTGGGCAACCCCAAACCTAGTCCTGGTAGCTGAGCACCCTGTAAGGCAGGAGCAGGCAGCTCAGCTTGAGCAGACATTGGGTGGGGGGTGGGGGGTGGTTGAGGGGGGAGGCAGCACAGTGCAGCAAATGTTTCTTGGGAGGAAGAAGCCTGATCCATCACCATCTGCTTGACTATGTAGCTTGGATTCTCCTTTGTACCTATCCCTTTCGATTTGGCTTTACCTTCATCTATCTTGATCCTTTCCTGGCCAAATATCCTCTTGGGCCCAAATGAACATTGTACCATAGTCTTCTGGAAAGCAAACATGCTTCCTGCTATGTAATTGCTAACATTCATATTAGATGATGTGCTGTAGCTTGATCTTCCTTAGCCTACTGCCACTGAGGCAGTAGGTTTTAGGTGGTATCGTAGTGCCTTTTGATTAATTTAAGTATTTAATTTTCATCTTCCTTCTTTGGATCTATTTGGCCTCTCAAATGAACTGAGATTCCTGTTAAAAAAGATTGATGTTATTGTCTCTTGTAGAGGAAACTAATAAAGTGTGTGTACCTGTGTGATTTGGGGTCTGTATCATACATAATCTGTACTGATCTCTCTGCTAAAGGTTTGGTTTAGATAGATGTCTTGCTGTCCATTGATAGCTCTTATTTGTTTCCAAACTACGTTAGCTTCATTGTTAAACCAAGAGAAGACATTGGCAGCAGTTTTATTCAACTGTAAGACTAAGATGTCTGGAGTTTACTGAGAATGTGATAAGAGTGTAATTCTGTGCAGTATACCTAAATTATAGCATGTATAATGTCTGGTGGATCTCTGGTTCTTACTCCTGAAGATCCAAATTAGGTATTTTCTTATGGGAGGAGAATTTCTGTGATTTATTCATTTTGAACTAATTTTGCCAAATGTGATAATTTCCTTCCATTCATCAGTAATTGACATACGTTTGGCATTTACTTTCTTTGTTTTTTTTGATTTTTTGGTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGAATTTATAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTATATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGTGCCCGGCTGGGCATTTACTTTCATCCCTGCTAAATAAGAACTATTTTGAGAAGGTAAATGTGCAAAATTTAAGGATGAATTATTATGCATTCCAAAATTTTAAGTTTCCTTCTTTCTTTCCTTTTTTTTCTCTTTCTTTCTTTCCCTTTAGCTCTCTCTTTCTTCATTTCTTTCTTTTCTTTCCTTCCTTCTCTTTCTCTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTCTTTCTGTCTTTCATCTTTCTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCTCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTC
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Task1_train_30759
A mutation in LOC101928335, MID2 (uncharacterized LOC101928335| midline 2), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 101
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Task1_train_30760
Here is a genetic alteration in COL4A6 (collagen type IV alpha 6 chain) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Hearing loss, X-linked 6
AAAATTCGAAAATTATCCAGGTGTGGTGGAGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTACAGCCTGGGTGAGAGTAAGACTTCATTTCAGAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATGTCCTTACAACCTTCACAATAATTTGTGAAATGATATATTGACTCGGTTTAAAGAATCTTGAATTATCAAGTTTTAACCTGTACCATCTACCATCAACCTTATTACACCGATTCACAAAAATAGATTTGGAAATAAATAAAATTTTGCAAGACCTGGTATCCTGTCTTCTTTTATTGTAATTCTTCAAGATGATAAGGTGGAAACAGGAGAAATATGTTTAAGAAATAGCCCCTTGGTTATTGGGAAGGCTCTTTCTTCTGCAAACAAATATTAGTCTCCTATGGAACACTGCACTATGCTAGGCATGTAAAGAAACTCTAAGAAGTATTACCATCCCTAGTATCAAGAGACTTACAATGCAGTTGGGGAAAGTAAAAGCAGTAATAGAAGGAGATATATAATTTAAGTAGCAATGACATACTGTGGAGGTCAAGGGAAAGCTTAATGGAAGAAGTGGGGTTTATCTTGAACCCTGAAAGAGGAATATGATATGACTACACAAAGAGGAAGAGCACTCCAGGAAAAGGCAACATGGTAAAATTTTGGAGCTGGAAGTGAACATATTGTGTTTGGGTATAGTGAAGAAGACTGGTGTCTTAGTTTTTTTGTTTCAATTAAGAGCATGATATAAGGTTGAAAAAGTTGGTTGTATCCATGTTTGGAGACTTTTGAATTCCAAGTTGAGGAGTTTGGACATTATATGATCTCTGTTCAATTGGTACCATATGTGGCTTTGAACTAGGGGAGTTACATGATATTGGCACTTTACAGATATTAAATTGGCTGCAGTGTTCTTAATAGAATTGAATGTAAAAACTACTTAGGAAGTTGTTGTCATTCACTCACTCATCTATCCATCCATCCAACCATCCACTTACTCCAACAAGCATATAGGTATTTGAAAAACTAGGCATGAGATAATGAGAGTTTAGTAGCAATAAGAGAAGGAAAGAATATAAGAGGAATTGCAAAGGAAATAAGAGATAATCTCAAAATTTTAAACTTCAGATTATTATAAGTGTGGTGTCACTAATGGAAGCATAGAAGTTGTGGAAACCCAAAAGTTGGGATGAACAGCTGTTCTGGCTGTATTGAAGAAGATTAGTTATTAGCATAGCACCTTCATAAACTATAAGCAGGACTGTTACACATAATTTCTAAAATTCAAGTAGAAAAAGAAGTTATATAAAGAGGAAGGAGTTAAGGGATAAAATGGGGGATTAGACTATAAGCAACTAGATTTCTGCCCAATCTGAGATTCCATGAGTTGAGGAAAGGTTTTTCCCAGCTGATGATATTACCACACAATTTAGAGGGCACCTTGTCCAATCTCCCACTCATTGCTTTGATGACATTTGCAACAAGTGGTCATCCATCTTCTTCTTGAACTCTCCCAGGGATTATGAGCTCATAACCTCCCTCAGTAGCTCTGTTACATTTTCAGACTGCTCTGGTAGGAAGTTCTTCACGAAGTAGGGTGGAAATCTATGTTATTCTGCCCCCTAAGCTTACCACAATACAATTATAATACTTTTTTTCACATGCAAATCCTTCAGGGGGTTGAAAGTAGTGATTATGGTCAGACAAGTCTCTTCTTATGATACATTTCATGCACCTGAGTCATAACCACTCTACAAGGGGTCAAATTTCCAAGTCCAAAGCCATCTGATTCTATGACTCACCCTTAGATCCGGGAAGGCCTTGTTGTCCCGGTAATCCATCCTTGCCTTTATCTCCAGGAAGCCCACGGGGTCCAGGAAGTCCTGGTAACCCATTTCCTGGGAGGCCAGGTGGACCAGGATGGCCTTTTTCACCAGGAAGTCCAGGTAACCCCTTTTCACCTGGGAAGCCCTGTCCACCATCACCCTAGACAACATATAAAACAAAGAATGAAAATTCAACTCAGAGATTTATCTGGACAGTCCTCTGACTACAGGAAAGAGGTAGCCAGTGTGACCAATGCTTTGTGTTTTGTTAAAATTATCTATCATCACCATAGTTTATCTATCAGTCTCCTCTGACTTTAGTTAGTGGATATGAATCTTGTCTACTCTGGGTGATCTAACAACACAAAAGTTTCTGGATAGGGGTGAGGAGACAGGGCAAGAAATGAGCAGGATAATAACAACCCCAGAGATCACAGAAAGTGGCTAGATTACTTGAGGAGAAAAGTCACTGAGAAGCTGAAGTATTTTTAAGTCATATGGTCAGGTGTTACTAGCATTTATCAAATGAGACAATGATCCATTCTGAGAAAATGATTCCCACTTTACATAAAGGAAAAGCAAAAAGCAAAAAGTTTCAGTGGCAGAGGCAGGGCAAGGTCCTCTAGACTCTGTTCTTCCCTGTTTCATGGTCCAGTGGCCATCAGACCCCCCAACAAAGTCAGGTGTGAAGATCTGTAGAGCTAATCACCTAGGAACGATCAACTTACCGGAAGGCCTGGCAGACCTGGTAAACCTGGTACTCCGTCCTTGCCTGGTTCTCCTATTACACCACGGAAGCCCTGGGAGCCAGAATCACCCCGATCTCCTGGCATTCCTTGGATTGTACTGAGAATTGGTTCCCCCTTCTTTCCTTTGGGTCCTGAAGGACCCAGAGGCCCAACTAAGCCCTGACAAAGAAAAGAGAGAAGAGGGAGTAGTCAGAAGATGTAGACTTCATAGAATTCCGGCACCTAGCATTATGACTTAGAGCAGAACCTTGGGTACATATTGGCACTGTTCTAGACACTGATTATGTTGTAATCTTGAATAATAGTTGCCCATTTATTTCTGCACCTTTTGTAAATTTTGAAATCTTTGAAGATGTAAACCTCACCTTAATTCCTATTTTATCTTCATGGGCCAGCACATTGCTAGGCAAAGGTAAACAATGTTGTGGAAGGAAGAAATTGTGGAAAGAGAAAAGGGAAAATAGGTAGGTTAAAGCAGAAAGGACTTTAAGAGACTCTATAGTCAGATTTCATGTTGTAGATCAAAACCCCAAAACTTTGTTTTAATCCCATCTCTCTTGTATGTGCTTTAGAAAAGTAACTGGGGGGATTGAAGGGCACTTGAAAGATTCCATTGCTTCCTCAGGGTCAAAGTTTGGCAAGACTTACTGGAGCCCCTGCTGGGCCCTGTGCACCCCCAGAGCCTCGATCTCCTCTGGCTCCTTTAAGGCCTGGAAGGCCTATGAGACCCCATGGACCAGGTGGGCCTGGTTCCCCGGGTGGTCCAGTGTTGGGAACACCACCGTCACAAGCACAGAAACCTGAGTCTCCTGGGAGAAAAAGACAACATAGAACGAAGTGGGTCATTTTTTTCCAAGAAGAATAAAGAATTGATCATGGTTATTTGTGACTTGAACAACTCCATAGAGGGAATCTGAAGGCTTGCAGAGAACACACTCAAATGAACTTGGTTCACTCTCCAGCAGAGTATGTCTGTGTTAGTGGTTCAGATTTTGTTAGTCAGGGATGAGGCTCAGCCATCAGTGAGTCTAAAGTATAGCCATAGTTGAGAACCACTGACCTCTACTAACCAGCTGAGAGTCTGGAATTCAAGCCGCTCAAAGATTTTCTTTACCAAAATGTCTTTTCCCCTGACTTTTGTACATATGACACAAATGTGTACATATTTTTGTAAATGTTGAGACAAATGCCAAATAAATAATGATAGGGATTTCAGCAAAGCACCTTTGAAGAGGTATCAAGGAGTCACTAGCACTATGTTCTAACTCCCTATATCTTCCATGCTTATTGTCTGGAAAATAAGAATTGGTGCCAACATAGGTGACCCTGAGTTTCCCTAAGATTCTGAAGGGCCCCTTCTTACTTTAAGAAAATTGATGATTCCTAAAACTCTAAGAGAATAGTCTGTTCTTCAGATTAGTGTTTCTTGAGTGTGATCCTGCATGAATCATCTGTGAT
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Task1_train_30761
Here is a genetic alteration in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
GCCTGCTCCCAATTTCTCTGCAGTGACAGAAGTACCAGTATAGTCCCGGCCTGGCAAAGTAACCCGAAGTAAGAAAGAGGAGGGGAGCTCGGGGCAGCAACAGCTCACCCAGGGTGCATGCTTGCGGCTCCTCCGGAGCTGGGTCCCGGGAGACTGCTAAGCGGCTCCGCGGCCCGTGCTCATCTGGGCTCTGCTGATGCTTGGAGGCTGTTTCCTTACTCAGAACAGAGTAGGTGGACGAAGTGGCCCAGTTTGGAAGAAACTAAACACTGCTTCTAGATAAGAAGTGCTCCAAAGGGAAACAGGCTCAGCGGTGCCCGTTACAACTTGCAGCACTCAGGAGATAGTTCCATGCAGCAGGAGAGGAAAGAATGGAGGGGAAAGGGGCGGGGCTGTCTGCTGTCAATCATCCCCCCTACCTTGGGCAGCCGGTAGTCTTTCTCACTTTCAGGCACCTTTCCACACAACAGCCCTAAGTATCTCCACAGCTTCACACACAGCCCCTTAGAGACCTATACGCTAAGACCTAAGCAACTGTGCATCATATACTTTCAACTTTACTGTTAGGTTACACATAAAGAGACATAGGCATACTATTCCCACATAAGACAGATGGGCCCGAAAGTGCCCTTGCACACATGCCCAAATGCATACAACACTGATTCAAATTGATAGTACACTAGGCTATTGGGAAGGGGAGACAGTTTCTGGAGTTGTAAATCCACTCTGAGCTAAGCAGAACCTAAGGATGAGTGGGCCCTCGTGAAATAGATCCAAAACCTTGAAAGACTCTAAAGTGGTTAATTCTAGGAAGATAGAAATGTTGTGAAGAATTCTTCATCAAATTCTTGAAGATTCTCCAAGGAGTCCGCAGAAAGTATTTTCTAGTTCTTTTGTTACTTTAAAAAAAATCTATATATCAGAATTATCAAAGGAACATTCAAGTCTTTATATGGGAGATATCGATTCAGCTGCCATCAACTCTATTTAAATATTTCCAATTAAGTGTTTATATTAATTCTAAGAAACACTGCACTAAATTTATTTAATTCCCTGCCCTAAATCTTTCTGAAACACAACTACAATGAGAGTCAATACCTTTTACATTAGCTCAATATAGGAGGCATTAATTATAGGATTCAATGCAGCTAAACAGAGATATAGCTGTATTATAATAACATAATACCATAGAATAATTACCAATACCTGCTGAATGCTCCCAGATCTTATACGTATATAACACACATAAAGTATTCACGCACATATACTTATTTTCTTACTTGTTTATAAGCATATACTTTATTTATTCCCAATATTTTCACATCTTCTGCTTGTATGTAGAAACTCTCTGTTCTGTGAGCAGCTGGAAGGTAAAGAAGACCAGCAGCCCAGGGAGCACCGACCAAAATTTGTTTCTAATGAGTAACAATAAAAAGCACGGCCCCTCTGAGATCCATCCGCTAAAAAAATAGTCCCAGTTTAGATCTATTTGTAATTGGCTTTGGTACGCACACCAATGAGATTGGAACTGAGCCTAGAAAAGTAGTATCAACGGAAGGTGCAAATGAACGAATAGAAAAGCTTCCCGGTTGGACTCATGGTGCTCAGTCAACTAGTCTGGAAGTTTCCCTCCCCCAAATAACTGAGCGTCACTCCCTCGCAGGTTGCCGGTGCAGTCTAAAACTGTGGCGGAGTGATACTCAAATTCCCTTGTGCTGGTGAGGAGGGGGGCCTTGCACGGGGAAGAGAGGGAGGAAAGTAGATCTGTAGGAATTGAGTGAAGAAAAAGTTTGCAAGTCTGGACAGAAGGGAAAAGTTCTCCTGAGAGACCGGCTTTGGGGAGGGGAGGGGGGAAGGAAGAGTAGCTCCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCTTCCACTCTTAAAAAGCTTCTTTCTCTTCACCCAAGCCTCACTGTCCCTCTCCGGCTCTAGCTCTCTCCATATAAACCCTCAAGATTATGTCAATTGGTTAGAGCCAGCCGGGAATTTCGTGCGGGTGCTGAAGGAGCTGCGGGAGCCGGAGAAGAATGAAACTGCGTGGAGTCAGCCTGGCTGCCGGCTTGTTCTTACTGGCCCTGAGTCTTTGGGGGCAGCCTGCAGAGGCTGCGGTAAGTCCTTCCTCCCCTCCCCCGCGCCCATCACCGCTCTTTCACGCTGAAATTACCTTTTTTTTGGGGGGGGGGTCCCTTTATCTTCCTTTTGGCGTTGACTAGGGAATTCAAATTTGCTTTCTCATGTTTAGGAAGAAACGTTATTTGCAACACCGGTAACTCAAGCCTTCTGAAGTCCAACGGAGAGGTTTAAGTGCTTAAAAATAGGGCTGCTTGCTTCCCTGCAGCTAGCTCCTCCGGGGGCAAGAGCAAAGTCAGAAGTGGGGGACGCTAATTAAAGGCTCACTAGGCTGTGGTGGGTATTTAAAACTTTTCCTCCCCTCCCTCCACCGTCGGGTGTTTCCCTGCCTGGCGACTAACCTTTTCACTACTTGTACCCAGCCCACTCTTTGAATTTTGTCTGTAGTTTAATATTTTGGCTCTTCGAAAATCCAGCTTCCATCAAAGTGTTTTTAGCGCCTCAGTGAAGTTCGTCCCCTTTGCTCTTTCCTTAAGCAACAGGAACCTACCCCCACCTCAGGTCATTCAAGCCACTGACCTCCTTTTCCCTTTTGACATCCTTGTTACAAATGAAATGCTAAGGCAACATACCAAGAAGAGTGAGGTAAAGTCTCAGGCTTCAGGTCTTTTGCGTCTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTCTAAATTATGGGTTTTTTTGTTTGTTTACTTTTTTTTAAACCTACCAAGGCATCTGAACAAATTGAGAATTTGCCCATCACCTATTCAAAGGAAAATACTCCTTTTTCAAAGGAGAATCAGTGTTCCAGTTTAAAGGAAAGTGGGGGAGGAGGTACATGTGAAATAGCAGCAAAAAGCTCCATTCAGTTTTAGGAATGTAGAATTCAAACCTCAGTATATCTCTTAGAAGGGTATCTGGGTAGTCCCACCCACTGTCCTATTGGGGATGAGGGCCAGATGTTAAAAAAATGAATGGCTTTGTGAGAGAAAATGTTCTCCAGCCTGAAGCCCATCATCTTTAATTTCATATAACCTCTGAAGAATAAGTGTGTGACAAATTATTTAAATTTATTTGAGTGATCATTATGGATAGTTTTAAAAACTGTTTAATATGAGATCATGGCTTAGGCCTTCACATGGTTGAGTGACCGTCAATTCTTTGTAAGCAGCTGCTATGTTACAGCTCATCTGGGTCCACTTTTAAGTTAGCTGTCTAGCTTCCCTATAGCACTTAGCATGCCTCAAATCACATGTCCTCTTTCTATCCTTCTGAAGGTGTGTACCCGGTGTATGAAAACTAACTTTCATATTACTCTGAGCACAACATAATTATAATAGCAAATTTGCTGAAAAACCATGCATATCAAATATTTTTACTATGCATGCCATAATTTTCTTCCATCAAAGTAGACAAATGATTTAAAAATGCTTTTTTGATGCAGAGCATCTTAATGGGGGTAAGGTTTAGCCAGTCAATAGGGCTACAGACTTGGATAAAACTGCAATTGTGCTGTTGAAAATAGTTCATTTTAAAAACATCTTCTTGGTGCCCTCTGTTTCTGGCATTTGGCCCAGGGACAAAGATTTTGTAGATGTTTGATTAAATATATATATGTTTTTTGATGTTACTTTTAACAAATTTGCACCAGATGACAACTATACAGGTATGTATAGCAACACTACACATCAATTAATATTAAATCAATTTATGTTAACAATGAGGTTTCTTTTTATTGACAAAACTTGAGAGCAAGCTTGTTTTCTTGGATTCTTAAACTAATGAGTATTCATGAAGTCATTACAGCTCTTTCCCTTTTCCTCCTATATAATTTTTAAAGAACATTTTATATCCCCTTTTCCTATCATTAGGATATTGTGCCTCTATTAAAACCAAGGGTTTGTTTTTCCTGGTTCATACATAAATATTTTAATAGGCTCAAAAATATGAATGATATCGGCTCTGCATACTTGTGCTGGAGATATCGGTG
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Task1_train_30762
Located on Chromosome X, this mutation impacts COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
CCTGCTCCCAATTTCTCTGCAGTGACAGAAGTACCAGTATAGTCCCGGCCTGGCAAAGTAACCCGAAGTAAGAAAGAGGAGGGGAGCTCGGGGCAGCAACAGCTCACCCAGGGTGCATGCTTGCGGCTCCTCCGGAGCTGGGTCCCGGGAGACTGCTAAGCGGCTCCGCGGCCCGTGCTCATCTGGGCTCTGCTGATGCTTGGAGGCTGTTTCCTTACTCAGAACAGAGTAGGTGGACGAAGTGGCCCAGTTTGGAAGAAACTAAACACTGCTTCTAGATAAGAAGTGCTCCAAAGGGAAACAGGCTCAGCGGTGCCCGTTACAACTTGCAGCACTCAGGAGATAGTTCCATGCAGCAGGAGAGGAAAGAATGGAGGGGAAAGGGGCGGGGCTGTCTGCTGTCAATCATCCCCCCTACCTTGGGCAGCCGGTAGTCTTTCTCACTTTCAGGCACCTTTCCACACAACAGCCCTAAGTATCTCCACAGCTTCACACACAGCCCCTTAGAGACCTATACGCTAAGACCTAAGCAACTGTGCATCATATACTTTCAACTTTACTGTTAGGTTACACATAAAGAGACATAGGCATACTATTCCCACATAAGACAGATGGGCCCGAAAGTGCCCTTGCACACATGCCCAAATGCATACAACACTGATTCAAATTGATAGTACACTAGGCTATTGGGAAGGGGAGACAGTTTCTGGAGTTGTAAATCCACTCTGAGCTAAGCAGAACCTAAGGATGAGTGGGCCCTCGTGAAATAGATCCAAAACCTTGAAAGACTCTAAAGTGGTTAATTCTAGGAAGATAGAAATGTTGTGAAGAATTCTTCATCAAATTCTTGAAGATTCTCCAAGGAGTCCGCAGAAAGTATTTTCTAGTTCTTTTGTTACTTTAAAAAAAATCTATATATCAGAATTATCAAAGGAACATTCAAGTCTTTATATGGGAGATATCGATTCAGCTGCCATCAACTCTATTTAAATATTTCCAATTAAGTGTTTATATTAATTCTAAGAAACACTGCACTAAATTTATTTAATTCCCTGCCCTAAATCTTTCTGAAACACAACTACAATGAGAGTCAATACCTTTTACATTAGCTCAATATAGGAGGCATTAATTATAGGATTCAATGCAGCTAAACAGAGATATAGCTGTATTATAATAACATAATACCATAGAATAATTACCAATACCTGCTGAATGCTCCCAGATCTTATACGTATATAACACACATAAAGTATTCACGCACATATACTTATTTTCTTACTTGTTTATAAGCATATACTTTATTTATTCCCAATATTTTCACATCTTCTGCTTGTATGTAGAAACTCTCTGTTCTGTGAGCAGCTGGAAGGTAAAGAAGACCAGCAGCCCAGGGAGCACCGACCAAAATTTGTTTCTAATGAGTAACAATAAAAAGCACGGCCCCTCTGAGATCCATCCGCTAAAAAAATAGTCCCAGTTTAGATCTATTTGTAATTGGCTTTGGTACGCACACCAATGAGATTGGAACTGAGCCTAGAAAAGTAGTATCAACGGAAGGTGCAAATGAACGAATAGAAAAGCTTCCCGGTTGGACTCATGGTGCTCAGTCAACTAGTCTGGAAGTTTCCCTCCCCCAAATAACTGAGCGTCACTCCCTCGCAGGTTGCCGGTGCAGTCTAAAACTGTGGCGGAGTGATACTCAAATTCCCTTGTGCTGGTGAGGAGGGGGGCCTTGCACGGGGAAGAGAGGGAGGAAAGTAGATCTGTAGGAATTGAGTGAAGAAAAAGTTTGCAAGTCTGGACAGAAGGGAAAAGTTCTCCTGAGAGACCGGCTTTGGGGAGGGGAGGGGGGAAGGAAGAGTAGCTCCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTCTTCCACTCTTAAAAAGCTTCTTTCTCTTCACCCAAGCCTCACTGTCCCTCTCCGGCTCTAGCTCTCTCCATATAAACCCTCAAGATTATGTCAATTGGTTAGAGCCAGCCGGGAATTTCGTGCGGGTGCTGAAGGAGCTGCGGGAGCCGGAGAAGAATGAAACTGCGTGGAGTCAGCCTGGCTGCCGGCTTGTTCTTACTGGCCCTGAGTCTTTGGGGGCAGCCTGCAGAGGCTGCGGTAAGTCCTTCCTCCCCTCCCCCGCGCCCATCACCGCTCTTTCACGCTGAAATTACCTTTTTTTTGGGGGGGGGGTCCCTTTATCTTCCTTTTGGCGTTGACTAGGGAATTCAAATTTGCTTTCTCATGTTTAGGAAGAAACGTTATTTGCAACACCGGTAACTCAAGCCTTCTGAAGTCCAACGGAGAGGTTTAAGTGCTTAAAAATAGGGCTGCTTGCTTCCCTGCAGCTAGCTCCTCCGGGGGCAAGAGCAAAGTCAGAAGTGGGGGACGCTAATTAAAGGCTCACTAGGCTGTGGTGGGTATTTAAAACTTTTCCTCCCCTCCCTCCACCGTCGGGTGTTTCCCTGCCTGGCGACTAACCTTTTCACTACTTGTACCCAGCCCACTCTTTGAATTTTGTCTGTAGTTTAATATTTTGGCTCTTCGAAAATCCAGCTTCCATCAAAGTGTTTTTAGCGCCTCAGTGAAGTTCGTCCCCTTTGCTCTTTCCTTAAGCAACAGGAACCTACCCCCACCTCAGGTCATTCAAGCCACTGACCTCCTTTTCCCTTTTGACATCCTTGTTACAAATGAAATGCTAAGGCAACATACCAAGAAGAGTGAGGTAAAGTCTCAGGCTTCAGGTCTTTTGCGTCTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTCTAAATTATGGGTTTTTTTGTTTGTTTACTTTTTTTTAAACCTACCAAGGCATCTGAACAAATTGAGAATTTGCCCATCACCTATTCAAAGGAAAATACTCCTTTTTCAAAGGAGAATCAGTGTTCCAGTTTAAAGGAAAGTGGGGGAGGAGGTACATGTGAAATAGCAGCAAAAAGCTCCATTCAGTTTTAGGAATGTAGAATTCAAACCTCAGTATATCTCTTAGAAGGGTATCTGGGTAGTCCCACCCACTGTCCTATTGGGGATGAGGGCCAGATGTTAAAAAAATGAATGGCTTTGTGAGAGAAAATGTTCTCCAGCCTGAAGCCCATCATCTTTAATTTCATATAACCTCTGAAGAATAAGTGTGTGACAAATTATTTAAATTTATTTGAGTGATCATTATGGATAGTTTTAAAAACTGTTTAATATGAGATCATGGCTTAGGCCTTCACATGGTTGAGTGACCGTCAATTCTTTGTAAGCAGCTGCTATGTTACAGCTCATCTGGGTCCACTTTTAAGTTAGCTGTCTAGCTTCCCTATAGCACTTAGCATGCCTCAAATCACATGTCCTCTTTCTATCCTTCTGAAGGTGTGTACCCGGTGTATGAAAACTAACTTTCATATTACTCTGAGCACAACATAATTATAATAGCAAATTTGCTGAAAAACCATGCATATCAAATATTTTTACTATGCATGCCATAATTTTCTTCCATCAAAGTAGACAAATGATTTAAAAATGCTTTTTTGATGCAGAGCATCTTAATGGGGGTAAGGTTTAGCCAGTCAATAGGGCTACAGACTTGGATAAAACTGCAATTGTGCTGTTGAAAATAGTTCATTTTAAAAACATCTTCTTGGTGCCCTCTGTTTCTGGCATTTGGCCCAGGGACAAAGATTTTGTAGATGTTTGATTAAATATATATATGTTTTTTGATGTTACTTTTAACAAATTTGCACCAGATGACAACTATACAGGTATGTATAGCAACACTACACATCAATTAATATTAAATCAATTTATGTTAACAATGAGGTTTCTTTTTATTGACAAAACTTGAGAGCAAGCTTGTTTTCTTGGATTCTTAAACTAATGAGTATTCATGAAGTCATTACAGCTCTTTCCCTTTTCCTCCTATATAATTTTTAAAGAACATTTTATATCCCCTTTTCCTATCATTAGGATATTGTGCCTCTATTAAAACCAAGGGTTTGTTTTTCCTGGTTCATACATAAATATTTTAATAGGCTCAAAAATATGAATGATATCGGCTCTGCATACTTGTGCTGGAGATATCGGTGA
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Task1_train_30763
A variant found in Chromosome X affects COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
AAACCCATGCACATATATTCACATATAAAGTTCAGACATGCATTTCAGTGTCAAATGTTAATTATTCTTACATTAACAGCCATTTGGGGTTATCACTACTCTTTACCTCTCCATTAATGCATGAGTGTTGACAATATGCACAATTTAATTCAGGGACTACGACTGTTGACAGTTACTGTCTTGTGAACTTGTGAATCAGTATCTTCTTGTGAAACGGTATCTTCTAAATTTTATAAAATCCATAGTCTGGAACTTAAAATTTATGTTTGCAGAAAAATATTATATATTTTTAATTAACCTCTGTTTCCTGCACATTGTAATATAATTTTTTGTAGATGGGTTCATCCTTCCCATTAGAGAGCAATGATGTACTTTGTACTTCTACTTGCACCTAACATAACATAGTGGCTGTCACATAACAGGTGATCAATAAGTATTTCTTGAATTAGTTACACATGTTGGAGGGAGCTGTGTGTTACTCATCTTAGAAGTCTAGTGCCTAACAATTTTTCTGTCCTCTAGTAATATTCAATTCATATTTGATGAATGAGTAAGTCTGAATAAGCCTATTTAATCTGTAGTGTAGTTAGCGTAAAATACTAAAATCAGTATATAACCCCCAAACATCTATGAATAATAAATAATAGCGGCATAGCAGACTTTCTGTTTGACGTGTCAGGAGCACAGCTTTCACTGGAGCAGCCTCTTGTAGTGTGAGTGAGAGATTACTGCAACATCAAGCCATTGTAGTTTGCTCTTATAATCAGGAAAAGAGGTTTCAGTATGAAGGTGACTTTTAGTTGCAGCTGAGTGAGTTAGGAGTTCTGACCAGAAGGATAAGGTCAGTACTTTCAAAAGGGTTGAGGAGGGTACTTTGGTAGTGACTAGAGTAAAGGAAATCATGGAATGTTGAGCAGCAGGCTAAGGTATTTTATATCAAAGGCCCTCAAGATTGATGGGCATTATTTGGTATTTATGTCACATGAAGGTTTCAGTAACTCAGTCTGGTATCTATCTGATGAAAAGAATGCCACCTCCTTGTAAGTAAACACTGAGCTATCCATGTATATTAAACTAACTTGTTTTTCTAAGCAGTTCATTTTCTAAGAGTAAAGGATAGTACTGAATGGCAGAAGTCACATACTGTATTCTTTTCCTCTATAGGTTTTCTATTTTGGAGGAGGATATTTTTCTGGCTTGAGGACCTCAATTCCTAATATGATTGAATGCCTGTTTAGAACATCTAGACTGTGGGAGCAGCATTTATGGTAAAGCTGTTAGAGACTGAGCTATTATTAGTGATGAAGGAGTAGGAGCAAAGAAAAGAAAGAAAGGTGGTAAAAGATAGTGTTATATATTTTATGCTCCATGATTGCTCATGAATGGAGAGAAACAAGTGACTTGAAGTGGTAGGCATTGTTGTCTAGTTGCCAAGGTCATTGCTAATACAGAGTGAGAGGTAATTTTTTACAAGCAATGTTAGAAGAAAAAAAGGAGAGTTCCTGAGAGTTTGGACATGTGGCAAATCATATTACAGGGAAGTTGTATGAATTTCTTTTCCATTTTTAACATATTTTAGATTGTGCATACTGTCAACACTCATGCATTAATGAAGAGGTAAAGGGTAGTGATAACCCCAAATGGCTGTTAATGTAAGAATAATTAACTTTGAAATGTATGTCTGTACTTTATATGTGAATATATGTGCATGGGTTTTTGTTGTTGTAAGTAGAAGATGGTGTAGCTTTCCATCTTTAGCCTTTATTGAGAGATATCTCATTTTTAATGTCTTGTAAAATGATATTTTTCACTTTAAAATTATAAAAATTATGTTTGCTCATTTTGAAAAGTTAAGACAGAAGTGTATATAATAAAAGGTGCAAGCTTCCTGAGAGGTAACTGTTATTTGCAATTTCGTATATCTTTTCAGATATTTTTCTGGTATCTATCTTTCAAGTTTGGATTGTTGATTTCAGTTGAGCTGTAAGTCAGAGTCTGATTTTTGGGTTCATATTTAATGATTTTTTCCCTCTTTCTCTTCCTTATAGGCTTGCTATGGGTGTTCTCCAGGATCAAAGTGTGACTGCAGTGGCATAAAAGGGGAAAAGGTGAGGTCTTAGATTGGCATTTGAAAATTTAGTAAAGCCAGTAAACTAATGGTTTTAATAAATATTTTTTTAAAAACAGAGCTTCTATCTCAGTACTTAAGTAAGTGAAATGAATCCTATTGCATTGCTTATTTTAGAGAGCTTATAAGGATTAGATTATATCTTAAGGTCAGCAAAGATTTTCTGTAAAAGGCCATATAGCAAACATTTTAGGATTTATGGGACACATCAGTTTCTGTCACATATTCTTATTTATATAAATAGAACTTTAAAAGTGACTAAAAAATATTCTTAGCTCTTGGATCATAGAACATGAGCCTCTTGGGATCTGGATCAGGACCTCTTTCCCGTAACATATTTCTGGCGACCACAGAAGGGACTATAGTGCAGAAACCCTAGCTTAATGGCTACCTTTGGGTAAGTGTTGGGGTCCTTTAATATCTGCATTTGGCCTGAGAGCTATAATCTGCCAAACTCTGATTGGTCTTGTTGAAGGCACTGACTTACTTAATAGGCAAAGACAGGGGAAAAACACTTAAGAAGGAAACTAAACATTTATCAAGCTACTAATCTCTGCCAGATACCAGGCAATATCATGTATTTTTATCTAGTCTATGCAGTTTAATAATAGATGAAAGTCTTTTTTTTTGTTTTTTCGTTTTTGAGACACGGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGTCACAATCAAGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCGTGCCTCAGCCTGCCAAGTAGCTGGGATTGTAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTTATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGCCTTGTTGGCTAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCCACCTTGGCAGGGGATTCCAGGAGTGAGCCACCATGCCCAGCTGAATGTTTATTTCTATCTTACTTTTTCCACAGCAGCATCTCCTATTGTACAGATATTATGATTACAAAGTAAGTATTGGTGAAGATTATATAGCATAAGCCTAATCACTATCAGTGAATGACATTAATATTATCAAATATAAAAGGGATAGTAAATTATAGCCTAAAGAGAGTTATACTAGGAGATGGGATCATACTCTTGTCTCCACTCTTTGGGGCTCAGTATTTTTGAATGAATGAGTGAATGCTGCTAATTATATATGAAGCAGTTTAGGACAGTATGTCTAGGGCATAATCTACTTAGAGGTATAGAAGGTACGTTAGCATATTAGACATTCTTAAAAGTTCTGGAGCAAAGAAACCTATTTGTTTGTTTTGTAATGCTACATTTCCAAGCCCCATTTGACCATGTTATAGACTTTCCCCTTAACAGAGCAGCTATTAATATTAATTGGATAGTCTTCTGCAGAACACTTATTTGAGTAACATTAGTTTGATGGGAGTAGTTTCGCAGTAAGGGTGCTTTCTGTAGTGGAGAAAATACCAAGAGGGATTAACTTCATATAATAGTAGAGTGATGTTTATCAGATTAACTTTTGAGATAAGAATGGAATACTCTGGACAAAATATAACAGCTACTTGATAGTACAAGAGAATAACCAAAGGAAAAAGAGGAGAGGCATCTGCACTTGAAAGAAAGGAAATACACTGGGCATATTTGCATTTATATGGCTTTTCCCCTGAGTACAGCCCTTAGTCTGCATGGCAAAGGAAGGCTAAAACCCAGACAAAAACCCATGGTCTTACTGGCTTGAGTCAGCAGAGTTGAGGATGCCAGAATGGCTGAAAAGTGAAGAGGGATATACTGGAATGTAGGGAAACACATTGGAAAGAGCTCAAAAAATTGCTTATAGATTCCATCCAAATTCTTGCTTGAATCCTGAAGTTTATAACTATAGAGGAAGGTTCATACAACCCAGCAAAAAGGAACAGCTGGAAGTCTGCAATAACTGAGCATAGATTTAACCGTTGTCCGTTGAAAGGAGAATGGAGTT
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Task1_train_30764
This genomic variant is located on Chromosome X, within the COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TTATTCCTCTCTTATCTGTAGGCGAGATAGCAGTTTTGCTTCTGAGAAAATATGGCTTTCTTCAAGTATTATCCTCCAGTTTTGGCAGAGATATGCTGTAAATACCAGCTGAGATCCCAAAATGTACCTGTTTTCCCCTCATGAAAATCTACTGTAACTAGATTTTTTTTCCTTTGTGCTTTCTTTCTGACTGAAACTTGTGATCAGATTTCTACTACTAGCTCTGCCAGTAATAATTTGAGGGAATCTAGCTCTAAAAATTTTAAAACTTTTAATTTCTTCCTCTTGTTTTATTTCCTCAAAAACAATTGTGTTGAGGTTGATGAATACTAAATTATCATAATTTAAACACTAATTAAAACAACAAGGGGATATATGTCTAGAAAATAAGAAGTGTAGTAATATGTCAGTAATAATTATTGTCAAAACTACAGGAATGTTGCCATCTATCATTAATTGACTAAAATTAGCTTCATTAACTTTGAAATGAAAAGTGGAAACTGACCAGTAGTCTTTTCAAAGTACTTATATTTATTATAGGATGTTTGTTGAATTATTCAGCATAAAATCATCTAAGCTTTTTAGACTAAACTTAGTACTTACAAAACACACACACACACACACTTTCAGAGTAGAAATAAAAGTGTGCTGTACCTTAACCTCTAGAGATATGTGTCTTCAATGGCCCCTTAGTCAGCCACCTAGTAGATATGGATGCTTTCTCTTTCTCACGTGCTGTCCAGGCTGTCACTGTGGGTAGGATCTGTTAAGAGGGTTCCCAGAATGAGGTCTGACCAGAGGCAGCCTTCGAGCCTTAGAAAAGTGGAGGAACTACTTGTAACCCTGTAGTTGGGAGCACGTGCCATGAAGCTGTCCTTCGGGGTTCTTTTATATATATATATATTTTGTACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGGCCCCGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTAAAGTTGGAAACCATCATTCTGAGCCTTCGGGGTTCTTAAACTTCATAGTGATGAATTATCTTTGTGTAACTGGATCCCCTAGTTTTGGAGTTTACACCCTTACTAGGATTGGCTATATGCAGATTAACTAACCCTAATATGTTAATCCAAATAGCATTAGTACACATGCTGGCTCTGCTTCCCCACCTTTCTGACTGTACAGATATTCACATCAGGCAACCCTACTGTAAAGGTGCTGATAAGATATGATGGGTCCTCACTGGTAGATAGGCAGTCTTCCTGTCCTGGTGATGATAAAGGCTGCGGTTAGAACTGAGACCTGAGTCACAATTCAAGTAATTATTCTGAGTAAAGGAATTAATGGTGGTATTTTCTTTATACTTTTGTTTTCTACATTGAATATGTATTCATTTTTAGTATTAATTTTACAATTAGAAAAAGTAATAAAAGTTTTGATGTTTTGAAGGTTTTTTTCTGGTTAATTTCAAGTCTGGGAGCTTCTCTGATGGTTTCCTTTTACCCTTCCCTGCTCCATACTTATTTAATGTAACCCTTACAGATCTGGTTTCCTGGATTTATTGCTATCTTCCCTATTAAACTCTTGATGTCAGTATGTTTAAATCTCATTTCATCTCTGATATGCTTTTTACTTTTACAAGAAAGAAAGAGATTACCACATATGATATAACTTCCAGACGGTTTGTGTTTTCTCCCCCCACATCTTAACAGGTTTTCCCATGTTAGTAGATACTGTGAATTTACATAATTAAATTAAGTTAGTTTTGTCTAGATAGTCATGTGATCTTTTTGAATCTCAACCATGCCTGTGCTTGAAAATTCACAAATGACCTTACCTTTCATTCTCATTTAATTGCAGGGAGAGAGAGGGTTTCCAGGTTTGGAAGGACACCCAGGATTGCCTGGATTTCCAGGTCCAGAAGGGCCTCCGGGGCCTCGGGGACAAAAGGTATGTATCATGTTGCCAACCAGTAATGCCAGATGAATTAAGTCATCTTAAATGTGGGACTAGGTGTCACATCAACTAAAAAGTTACTGAATTATAGCAAGAAACTAATATGTAAATGAAACAATGGAATGACGGGGAGTCTGTACTTTATTGTATTTTGTTAAAAAACTAAATATTACTGCCATATTCAGATGCTTTTGGAAGATGCTGTTGATTGTTTGTAGTTATTGGCTGCCTTCACAAAAATTAAGTTCTGTCAAGAGCTTAGCTGAGCTGGAGAGAGCTGAATTACCAGTTGTTAGAGTAGCTGATTAAGAGAAGAAGCCAAAATGAAAGTAACAGTCAAACCTTTACTCACTTACTGCAATATTATAAGCAGAAAGTTAAACTGGAGAAAGTGCTGACTCCCCCACTGTTCTATTTGTCCCCATGGTGCAGCATCAGCAAAGGTCAGATGGATCAGCACAGATGTTGGAAATCATTTGACTGCTGAGGGAGCTCAGAACGAAAAGCTCCTGCAGTTGTATGGACCCAGGGGCAGGGTGGGAGAAGGAGAAGAGCTAGGATGGAAACGTACTGAATCAGAGTGCAGAAAAAGTATTTTTATGGTTTCTTTCTCCTCTCATAAGAAGGTCTCCACCAAAAGAGGCCTTTAAATGCAGAAATGCAGTTGAGCACAGCCAGCCATGGTAGCCTGAATCTTTGACTGATACTTCAGAGATTGCAGTGCATTAGCTGTGCACCAAGTTTGCTGTGTGGAGGGTAGCTGTCCCTTATGAGGCCTACCAAGAGGACTTTGGTTGGACCCGAACAGTCATAGGTGTTTAGACAAGAGCCATATTCTCAATTCCATACCTTGATTTTTCAGGACCTGAGTGAGAAACATAAGCTGCCCCATCATGGACCTGAATGGGTTGGACTTTAAAGGGCTCTGTCAAAAAACAGGATAATATCTGAGGCCACAGTAGATTATGGTCATGATCAATCATGTTCTAAGCAGGATGAACAGGCCTGCTTGGAGAACTGAATGTAAGCATGAGCCCCAGCTATTGCCAAGCCAGTAATAGATGTCCCATAGCCCACTTGATCTACGTTAGAGAGCCAGGAGGCTTTTTTCTTAAGTCTTATGATGGATTGTTCTACTTTGCCAGTTTTCATTGATCTAGGTGCAATATGAGGTGCTGGCAATTCCAGAGACCCCTCACAGTTGGCCAGCAGGCAGCTAAGGGCTATATGGTTAGCTAACACTATGTGGGCCAAGGAGTTGAGGCTAGTCTGTTTTGTTTCCAAAGCTGAAGTAATGTCATTAATGACCTCAGCAAGGGTCAAAGACAGGTTGCGGACAACCTTTTCTAATTGAGCGATGCTCACAGTGAGAAAAGTTGTCTGGAGTATTCCCATGAGTAGACAGTAGGTAATGCCAGCTGGCAATTCTCCTGAATAACCGGAGTCTATCTAGTTTTGGAGTTCTCATTTTGTTTTATGTAATGTTATATGCTTAATGGGAGGGACTGTTTTGAATATTTGAGTATCTCTTATCAATGTCCTATTATGTATGTTACATTGGTAGGAATGTTGAAAGCCTGATTTTTATAAAAGAAATAATACCCCAAGAAGAGTGCACACAGTTCTGGGAATGTAAGAGTCATTGGTTACCATGGAGATCAACCAGCCAGAAGTCCCTCCTGGTGAGCAGAGTACTTGAGTGGAATTGAAAAATTTGTGTAAGGTGGAGGCAGAAATAGAGAAATAAATTGCCACCACCATCGAGGCCAAAATGGCTCCAATGGCAGATCATATGTCCCTTTTCCCAGATAATTCAATTGCTTCCATATGGGACAGGAGTGAGCTGACATCCCAGGAGGTATTTTCTTCCTGTGGTATCAGAGTCAATTGTTGCAATCTGTCAGATCCAGTGTAATAAAGTTAGGGTACATGAAGTACTAAAATGGTCCATGTTTAGAGAAACGTCCATTC
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Task1_train_30765
This alteration occurs within gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; not provided
CCAGGCTGGAGAGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGGCTACAGGCGTCCACCACAACGCCCGGCTAATTTTTTGTGATTTTTATTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAACCATGATGGTCTGGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGAGCGGTTTTTATTGCTACTCGATTTGTCACTGTTTCAATGTCTTCTCAGTGGAAATATGTATTTTTAAGAGAAAAATTAACATGAGTTCATATTATTGCTTCCAATTGCAATTTAAAATTAAGAAAGGTTTTGTATACTTATTATCTCTTCCCCTCATCTCTCTCTCTATTGAGGTGAAAATGTTCATTCCTAATATCATAAATGTAATTTCTTATTTGCTTTTTCCTACAATATGCCTATTTCCTACAATATGCTTTAAAATAACAATGTATAACTTAACAAAATAAAAATTTAAATTTTAATAGTGATGATAGGATAATAGGATTCTTGAAAACCATTAATTATTTCTTTGTTGAGTTTTCCCCCTTTGAATTGACCAGTTTTGCTAAAGAATTAGAGTTAAGATACCATGTTTGATGAAAGGCACTTGAAGTAATTCTTTTCTCTGTATGGTTTTGTCAACAACTTGAAACAGACGTACACTGGATCCAATTTATTTTTCATTTTTAATGATTTCCTTTTTACCTTTTTTAAAATTTTAAATTATTTAAAACATCTACGTGGTTTTATAAGACAAGGTGTAGTCAGAGATGCTTCTCTTTCATTCTTGCCATTTCCCTAGTGTTTTAATCTTCCTCTGAGAGGTAATCATTAGTTTTTACATAGTAATCATAGTTTTACATTATGTGAATGTGCCATAATTTATTTAGTCATGTTCCTATTGGTGGTCATTTGAGTTGTGTATTAGTCTGTTCTCACACTGCTTATAAAGACATACCCAAGACTAGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATGGAGTCACAGTTCCACATGGCTCCGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAGATGAAGGAAGAGCAAAGGGACATCATACATGGCAGCAGACAAGAGAAAATGAGAGCCAAGCGAAAGGGGAAACACCTTATAAAACCATCAGATTTCGTGAGACTTACTATCACAAGAACAGTATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTATCTCCCACCGGGTCCCTCCCACAACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTCAAGATAAGATTTGGGTGAGGACACAGCAAAACCATATCAAGTTGTTTCTAATTTTAACTATAACTGGTTACATGGTTGTTTCTAAACTTTAGCTATAATAATGCTGCAATTGTTAACTTTGTTTCTCATATTTTGTTTCATAATTTCTAGGGTATCTTCAGGACAGATTCTTAGAAGTGAAATGCTAGGTCAAAGGGCAAATGCATGGGTAATTTTGCTAGATATTTTCAAATTTCTCTCCATAGAGTTTGAATCTTCATTAGCAGTATATGAGAATACTTTTTCACCATAGTCTCACCTACAGAGAATATTGTCAAACTTGTATTTTTGCCAATCATGACAGAGAAATTTAAGAATTTTGGGGGTGATCACTATTAATGTCTTCAGTGGAAATATATTTGCCACTCCCCCATCCCCTGCTGAATTAATTTTTCATCACAAACCTGGGAGATCCTTATCCATTAGAAGAGACATTTCATCCACGAATTTGCCTGCTCCTAATAAGTGCAATGAAGACAATGCTCCCTCAAATTGAAGTTTCTTTTATAGTTTTCAATAAAAGAGACTTTTAAACACATGTAAGAGATTTTTCTCTAATGTTTCAAAGAACAATGAGTAGTAATAAATAGTGAGACACAATTTTTCCAAATCTATTCTAAAATAATTTTCATAATATCCTTAGGTAGGATATTATTTTATTTTTATGGGTTGTCATTTAGTTTAAGGATTTTATTTCTTCTTATAGGGTCCTCCTGGACTTCCTGGATTTCCAGGGACACCAGGTCTTCCTGTAAGTAGCATTTCACTTTTTACTTTGAAATCTCTTGAAAAGTAATCTAAGACATATTATACATGTGTTATGTCGCTTTTCAAAGGGAATGCCAGGCCACGATGGGGCCCCAGGACCTCAAGGTATTCCCGGATGCAATGGAACCAAGGTGAGATCCATCCATTTAATCTTGGGTAGTATACTTGACAATAATTAACTTAAAAACCTAAAGAAATCAATATGAAGAATGTAGAAGAAGGGATATAGTGTCTTCAGGTCTTGGCTATTACATAAAGTATGCTCTGACTATAATTTTCTATATATTGAACTATCAATAATTTCATTAAACATGTATAATTAGCTGGGATATTGCATTGGGTTAAAGATTACTTACCAAACCCTTTTTTGACTTTAGCATAAAGTAGGATGAGAATTAAAACGAAATTAGGATATATATGTTTCAAATATTATATCAATTGTTGAAAGTAATACTTCTGAATGTCATTCATTTGCTTTGCCATTATTAAAAAACTAGGTACAATTTATGTTTTCAAATATTTCATGTTTTTAAGATTTTTTAACACGCCGAATAACTTCCTTAAGAAAAATCTTAAAAAATTATATGTAATACAGCACATCCGTTTTTACTATAAACTGTCAGTATGAAACCTGAAACTTCTTCATCAGCAAAGATGATACATTTAACAATTTTAAATAACCCTAACTTTAGATATAGCAAACATTTTTTTTTCTGATCCAATGTTTCTTCTCTTTAGTCAACTGTTGGATTGAATATAAAGTAATAGATAATAAGAAAAAATGAGGAAAATTTGCTCTGCTTGTAAGCTTACAATATTATAGCCAATTCTTATTCCCTCCCCTTTCTCCTTTTCCTTTAGGTTAATGCAATATATTGTTATTCTCTGTATTTTCTTTTGGTATTTTCTGTTTTTCACATAATATTCTGTAAAACTATTCATAAAATACCTTAGGTCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCATGCTGGAGTGCAATGTCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGCACCACAATGCCCAGCTAATTGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCTTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCACCGCGCCCGGCCAGATCTTTCTAACTAATGGCATATGTCAGATTTTATATAGGGCATATTTTTAAAATAACTTGAACAACTATTTTGCATTACAGTGGCCATATTTTGTGATAATTACTGTACTCTATACTTGAGGCAGTACAGTTCTTTTCATCTCCAGTATTTCTTCAGGTCAATGTAACCCTTGTCAATAATAATAATTTTTAAAAAAAATTTTGGATTCATGAGGACTAATCGTGTTCTTCATTTTAGCTAGGGCAACCTTAAAGTGATAAGACCAATGTGGAGTTGGTTTGCCTGATACATTTCATGTTAAATTGGACTAAATTTTTGTGCCTCTTCTGGTTATTTGTTTATTTTTATTTACTTATTTATTTTTGCCAGTGTGCTTTAAGAAACAAACAGACCACTAACCAAAGTTTCAAATTTGAAGGGCCAATGTATCTATAATCAGTACAGTGTGCTATATGATTAAAGGGAGCATTGATTAACTTGTGTTTCAGGCTTCCAATTATGTGAGTAACAAATTTTAAACAAATTAAATTGATTTATTATGCATATTTTTAAAGTCTGAATGCTTTTCTTATATTTCTTACTATGTAAGTAAAAGAATGAACTTTAAAGTTGGAGCCACAATGTATAGGTTTTTTTCTTTTTCTGTCTTTTAAACTTGATGTCTAGGCCACTTCCTTTCTCTCGGGACCTACTTTTTCCATGT
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Task1_train_30766
Given this variant in gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
AACCATGATGGTCTGGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGAGCGGTTTTTATTGCTACTCGATTTGTCACTGTTTCAATGTCTTCTCAGTGGAAATATGTATTTTTAAGAGAAAAATTAACATGAGTTCATATTATTGCTTCCAATTGCAATTTAAAATTAAGAAAGGTTTTGTATACTTATTATCTCTTCCCCTCATCTCTCTCTCTATTGAGGTGAAAATGTTCATTCCTAATATCATAAATGTAATTTCTTATTTGCTTTTTCCTACAATATGCCTATTTCCTACAATATGCTTTAAAATAACAATGTATAACTTAACAAAATAAAAATTTAAATTTTAATAGTGATGATAGGATAATAGGATTCTTGAAAACCATTAATTATTTCTTTGTTGAGTTTTCCCCCTTTGAATTGACCAGTTTTGCTAAAGAATTAGAGTTAAGATACCATGTTTGATGAAAGGCACTTGAAGTAATTCTTTTCTCTGTATGGTTTTGTCAACAACTTGAAACAGACGTACACTGGATCCAATTTATTTTTCATTTTTAATGATTTCCTTTTTACCTTTTTTAAAATTTTAAATTATTTAAAACATCTACGTGGTTTTATAAGACAAGGTGTAGTCAGAGATGCTTCTCTTTCATTCTTGCCATTTCCCTAGTGTTTTAATCTTCCTCTGAGAGGTAATCATTAGTTTTTACATAGTAATCATAGTTTTACATTATGTGAATGTGCCATAATTTATTTAGTCATGTTCCTATTGGTGGTCATTTGAGTTGTGTATTAGTCTGTTCTCACACTGCTTATAAAGACATACCCAAGACTAGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATGGAGTCACAGTTCCACATGGCTCCGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAGATGAAGGAAGAGCAAAGGGACATCATACATGGCAGCAGACAAGAGAAAATGAGAGCCAAGCGAAAGGGGAAACACCTTATAAAACCATCAGATTTCGTGAGACTTACTATCACAAGAACAGTATGGGGGAAACCACCCCCATGATTCAATTATCTCCCACCGGGTCCCTCCCACAACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTCAAGATAAGATTTGGGTGAGGACACAGCAAAACCATATCAAGTTGTTTCTAATTTTAACTATAACTGGTTACATGGTTGTTTCTAAACTTTAGCTATAATAATGCTGCAATTGTTAACTTTGTTTCTCATATTTTGTTTCATAATTTCTAGGGTATCTTCAGGACAGATTCTTAGAAGTGAAATGCTAGGTCAAAGGGCAAATGCATGGGTAATTTTGCTAGATATTTTCAAATTTCTCTCCATAGAGTTTGAATCTTCATTAGCAGTATATGAGAATACTTTTTCACCATAGTCTCACCTACAGAGAATATTGTCAAACTTGTATTTTTGCCAATCATGACAGAGAAATTTAAGAATTTTGGGGGTGATCACTATTAATGTCTTCAGTGGAAATATATTTGCCACTCCCCCATCCCCTGCTGAATTAATTTTTCATCACAAACCTGGGAGATCCTTATCCATTAGAAGAGACATTTCATCCACGAATTTGCCTGCTCCTAATAAGTGCAATGAAGACAATGCTCCCTCAAATTGAAGTTTCTTTTATAGTTTTCAATAAAAGAGACTTTTAAACACATGTAAGAGATTTTTCTCTAATGTTTCAAAGAACAATGAGTAGTAATAAATAGTGAGACACAATTTTTCCAAATCTATTCTAAAATAATTTTCATAATATCCTTAGGTAGGATATTATTTTATTTTTATGGGTTGTCATTTAGTTTAAGGATTTTATTTCTTCTTATAGGGTCCTCCTGGACTTCCTGGATTTCCAGGGACACCAGGTCTTCCTGTAAGTAGCATTTCACTTTTTACTTTGAAATCTCTTGAAAAGTAATCTAAGACATATTATACATGTGTTATGTCGCTTTTCAAAGGGAATGCCAGGCCACGATGGGGCCCCAGGACCTCAAGGTATTCCCGGATGCAATGGAACCAAGGTGAGATCCATCCATTTAATCTTGGGTAGTATACTTGACAATAATTAACTTAAAAACCTAAAGAAATCAATATGAAGAATGTAGAAGAAGGGATATAGTGTCTTCAGGTCTTGGCTATTACATAAAGTATGCTCTGACTATAATTTTCTATATATTGAACTATCAATAATTTCATTAAACATGTATAATTAGCTGGGATATTGCATTGGGTTAAAGATTACTTACCAAACCCTTTTTTGACTTTAGCATAAAGTAGGATGAGAATTAAAACGAAATTAGGATATATATGTTTCAAATATTATATCAATTGTTGAAAGTAATACTTCTGAATGTCATTCATTTGCTTTGCCATTATTAAAAAACTAGGTACAATTTATGTTTTCAAATATTTCATGTTTTTAAGATTTTTTAACACGCCGAATAACTTCCTTAAGAAAAATCTTAAAAAATTATATGTAATACAGCACATCCGTTTTTACTATAAACTGTCAGTATGAAACCTGAAACTTCTTCATCAGCAAAGATGATACATTTAACAATTTTAAATAACCCTAACTTTAGATATAGCAAACATTTTTTTTTCTGATCCAATGTTTCTTCTCTTTAGTCAACTGTTGGATTGAATATAAAGTAATAGATAATAAGAAAAAATGAGGAAAATTTGCTCTGCTTGTAAGCTTACAATATTATAGCCAATTCTTATTCCCTCCCCTTTCTCCTTTTCCTTTAGGTTAATGCAATATATTGTTATTCTCTGTATTTTCTTTTGGTATTTTCTGTTTTTCACATAATATTCTGTAAAACTATTCATAAAATACCTTAGGTCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCATGCTGGAGTGCAATGTCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGCACCACAATGCCCAGCTAATTGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCTTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCACCGCGCCCGGCCAGATCTTTCTAACTAATGGCATATGTCAGATTTTATATAGGGCATATTTTTAAAATAACTTGAACAACTATTTTGCATTACAGTGGCCATATTTTGTGATAATTACTGTACTCTATACTTGAGGCAGTACAGTTCTTTTCATCTCCAGTATTTCTTCAGGTCAATGTAACCCTTGTCAATAATAATAATTTTTAAAAAAAATTTTGGATTCATGAGGACTAATCGTGTTCTTCATTTTAGCTAGGGCAACCTTAAAGTGATAAGACCAATGTGGAGTTGGTTTGCCTGATACATTTCATGTTAAATTGGACTAAATTTTTGTGCCTCTTCTGGTTATTTGTTTATTTTTATTTACTTATTTATTTTTGCCAGTGTGCTTTAAGAAACAAACAGACCACTAACCAAAGTTTCAAATTTGAAGGGCCAATGTATCTATAATCAGTACAGTGTGCTATATGATTAAAGGGAGCATTGATTAACTTGTGTTTCAGGCTTCCAATTATGTGAGTAACAAATTTTAAACAAATTAAATTGATTTATTATGCATATTTTTAAAGTCTGAATGCTTTTCTTATATTTCTTACTATGTAAGTAAAAGAATGAACTTTAAAGTTGGAGCCACAATGTATAGGTTTTTTTCTTTTTCTGTCTTTTAAACTTGATGTCTAGGCCACTTCCTTTCTCTCGGGACCTACTTTTTCCATGTGTAACAAGGTGGAGAGAAGGGTATTGGACTCACAAAGACACACAACAGTAGTAATTTTATTCTTTCAAACCTTCTGATGAAGTTGTTTCTAGGATTACCGTGGCATACAGGTATTTGAAAGGAGGTTGCTTTGGTGTTCTTCTACAGCAATTTCAGCTTTTGTTTT
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Task1_train_30767
Here’s a variant in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
AAATAACCCTAACTTTAGATATAGCAAACATTTTTTTTTCTGATCCAATGTTTCTTCTCTTTAGTCAACTGTTGGATTGAATATAAAGTAATAGATAATAAGAAAAAATGAGGAAAATTTGCTCTGCTTGTAAGCTTACAATATTATAGCCAATTCTTATTCCCTCCCCTTTCTCCTTTTCCTTTAGGTTAATGCAATATATTGTTATTCTCTGTATTTTCTTTTGGTATTTTCTGTTTTTCACATAATATTCTGTAAAACTATTCATAAAATACCTTAGGTCCTTCTTTCTTTCTTTCTTTGTTTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCATGCTGGAGTGCAATGTCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGCACGCACCACAATGCCCAGCTAATTGTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCTTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCGAGCCACCGCGCCCGGCCAGATCTTTCTAACTAATGGCATATGTCAGATTTTATATAGGGCATATTTTTAAAATAACTTGAACAACTATTTTGCATTACAGTGGCCATATTTTGTGATAATTACTGTACTCTATACTTGAGGCAGTACAGTTCTTTTCATCTCCAGTATTTCTTCAGGTCAATGTAACCCTTGTCAATAATAATAATTTTTAAAAAAAATTTTGGATTCATGAGGACTAATCGTGTTCTTCATTTTAGCTAGGGCAACCTTAAAGTGATAAGACCAATGTGGAGTTGGTTTGCCTGATACATTTCATGTTAAATTGGACTAAATTTTTGTGCCTCTTCTGGTTATTTGTTTATTTTTATTTACTTATTTATTTTTGCCAGTGTGCTTTAAGAAACAAACAGACCACTAACCAAAGTTTCAAATTTGAAGGGCCAATGTATCTATAATCAGTACAGTGTGCTATATGATTAAAGGGAGCATTGATTAACTTGTGTTTCAGGCTTCCAATTATGTGAGTAACAAATTTTAAACAAATTAAATTGATTTATTATGCATATTTTTAAAGTCTGAATGCTTTTCTTATATTTCTTACTATGTAAGTAAAAGAATGAACTTTAAAGTTGGAGCCACAATGTATAGGTTTTTTTCTTTTTCTGTCTTTTAAACTTGATGTCTAGGCCACTTCCTTTCTCTCGGGACCTACTTTTTCCATGTGTAACAAGGTGGAGAGAAGGGTATTGGACTCACAAAGACACACAACAGTAGTAATTTTATTCTTTCAAACCTTCTGATGAAGTTGTTTCTAGGATTACCGTGGCATACAGGTATTTGAAAGGAGGTTGCTTTGGTGTTCTTCTACAGCAATTTCAGCTTTTGTTTTCTAAACCAAGTGTCCATATTAGTACTTTACAGTAGTGAGTGAGAAAAGCTGGGTGCCTAGAAAACATAATGACCTGCAATTGCTAGAACTATTGCTATTATTGTCCTCTTGGTGATATTAATGGCCTTCTTTCTTACCATCTTTTCCCCTTTACAAAAATAATTTGAAATAGTTTACAATAAAAGAAAAATGCAACAGAGCAGTTAAAATAAGAATCTATATAACACATGGGCAGGAAATGGGGCAGATCATTAACTATTAAATGTGATGATAGAATTTATGGCGTGATCGTCTCAAAATGTCTTTGTTGGAAGAAAAGAACTGAGGTAGATAATTTTTTTTCTTTACTTCTAATTGGGATAGATGAATTGGGATAAAAGTTGAATTGATATGGATAGTTGATATTGAAGTAATTGGAAAGTGAAGGCTAATGAACTTTTTGGCAATCTGGCATGTTTCAAAATGGCTTTTATAGAAATCTTTTCAAGAAGTCATATCTTGATGGTATAGTTATTCTTTGTTTCTTGTTCCTCCATGCTCTTTATTTTTAACTCCTTCTAGGGAGAACGTGGATTTCCAGGCAGTCCCGGTTTTCCTGGTTTACAGGGTCCTCCAGTAAGTTATAAAATTTGGGATTATGATGAACACAGGAATTAACAAAAGAAGCAGAAATGTAGTGAGAGAGCCCAATGCATTCATGTGGAACAAAGTAATACATTTTAAAGTAATAAACTAGAGGAAAATGTTTCAAAAAGAAGTTGGTAATATAGCTTTCTCCTGGGCAAAAGCAAGGATTTTGTATGTATATAAATGTCACCTCTAAGTATCCTAAGGTATATCCTATTCAGAAATGACGCTACAGCAGTCTACTCATTTTATACTCTATTTAGAAAGCATTCTGTAATTGGCGTGTTTCTCTCTCATACATATAAAATAATCCCTTTTCTTTTTAATAATAGGGACCCCCTGGGATCCCAGGTATGAAGGTAAGCATCTCATTCTGGGGAACAAATGTTTTGAATAAAATATTAGGAAAGCTGGCAACTTCAATAGGATAATGACTCAAACTTCTGTCTTAAAATCGATGTTTCTAGAAGTTGTGCAGGTGTAAACTTACAAGCTCTCCTTAAGTAGTCTCCTGTGTTCCCATGGCTTTAAGTACCTTGTATGTGCTGATACACTTGAAAATGTGTATATCAGACTTGAGTTTCTTTGCTGACACTTTAAGTCTTCATCTTCTTACACTTTGATACAGTTAACCACTTACTCTCTGTAGAATTACTTTTTTCCCTGGCCTCTGTGACACTATCCTTTCCTGATTTTTCTTCTACACCTCTGGTTAATTTGCAGTCTTCTATGTAAGGTCATTATTTTATGTCCATCAAGCATCAGGTCACAGTCTGTACTCCTTCCCTGCAATGCCCAGAAATATTACTAATGCCCATATTATTGATTACTATCTAGTTACTAAATACCAAATGAGACTTTTCTTCTGAGTTAGCTATGTGTATTCATCAGCCTCTCTGACATCTCCACATGTTCCAAGTTAATCCACCCACAAAATAAACCCGCTCCTCCCTGTGGCTCCTCATATCTCAAATTTGCATCTTTATATGTTATGTACACTTTTACACGATCTCAAAACCTGGGAGTTAATATTTATATCTTCCATTCCTTCACCCACCACCTCATTCAATTCCATCACTAAACACTAAGTGTGCCTGTAAAAGGCACCTTAAATTCATCCACTTTTCTTCATTCCCACTGTTACCACGTTAATCATAATGTCTCATCTGGATTACTGCAATAACCTCTTACGTAGTCTCTAGTCTCTTTTTTTCACCACTACTCCGCCCTTACCTCCCATCCTGTTTTATTCTTTACAAAGCAACCAAGAATGACATTTTAAAAGTGTTCATTGATAATTTAATATGCTTATAAACCTTCAAGGGCTTTCTACTGTGTATCTAAGGTAAAGTCCATAGTTTGTTTGTAAGAACTGCATGCTCTGGTCCTTGCCTACATTGACAGCCTTATCTTAAACCACTAAACTTATCCCTTAGCTCACTGACCACATCAGTCTGCATTTAGTTATTGGGATGTGCCAAACGTTTTGCTTTTAGGGTCTTTTGTATATATGGTTTACTTTGCCTAATATTCTTCCTCCTATCTTTGCCTGGATGACTCCTTATTATCCTTCAGGTCTTAACCTGAATGTTACCTTCACAGATTGCCCTTCTTTGACTACCCAAGCTAATTTTCTCCACTAGTTTTTTTTTTTCAATTATTGTACCATGTTATTTTTCTTCATAGCCCTTAATATTCACAGCCCTTGATATTGTCATCTTATATTTTTACATATTAGGGTCTGTATTTTCCCATTATATTGTTAGCTTTATGAGAACAGAGGCCTTGTTTATCTTCTCCATTACTGATTACCCAGAACCTACCACAATTGTTGGCAAATACTTAATATTTACTACATATTTTTTAATGAGTAACTGAAGGTACTACACTCTTAATAAATCTACTGTTCTTCAGTGTACTCTGGCCACTTCCTCATTTTCCTTTAAAAGGTAAACTTATCATTTTTATTACTGAGATGGCCT
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Task1_train_30768
This gene mutation involves COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_30769
This is a variant in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; not provided
GGAAAATGTTTCAAAAAGAAGTTGGTAATATAGCTTTCTCCTGGGCAAAAGCAAGGATTTTGTATGTATATAAATGTCACCTCTAAGTATCCTAAGGTATATCCTATTCAGAAATGACGCTACAGCAGTCTACTCATTTTATACTCTATTTAGAAAGCATTCTGTAATTGGCGTGTTTCTCTCTCATACATATAAAATAATCCCTTTTCTTTTTAATAATAGGGACCCCCTGGGATCCCAGGTATGAAGGTAAGCATCTCATTCTGGGGAACAAATGTTTTGAATAAAATATTAGGAAAGCTGGCAACTTCAATAGGATAATGACTCAAACTTCTGTCTTAAAATCGATGTTTCTAGAAGTTGTGCAGGTGTAAACTTACAAGCTCTCCTTAAGTAGTCTCCTGTGTTCCCATGGCTTTAAGTACCTTGTATGTGCTGATACACTTGAAAATGTGTATATCAGACTTGAGTTTCTTTGCTGACACTTTAAGTCTTCATCTTCTTACACTTTGATACAGTTAACCACTTACTCTCTGTAGAATTACTTTTTTCCCTGGCCTCTGTGACACTATCCTTTCCTGATTTTTCTTCTACACCTCTGGTTAATTTGCAGTCTTCTATGTAAGGTCATTATTTTATGTCCATCAAGCATCAGGTCACAGTCTGTACTCCTTCCCTGCAATGCCCAGAAATATTACTAATGCCCATATTATTGATTACTATCTAGTTACTAAATACCAAATGAGACTTTTCTTCTGAGTTAGCTATGTGTATTCATCAGCCTCTCTGACATCTCCACATGTTCCAAGTTAATCCACCCACAAAATAAACCCGCTCCTCCCTGTGGCTCCTCATATCTCAAATTTGCATCTTTATATGTTATGTACACTTTTACACGATCTCAAAACCTGGGAGTTAATATTTATATCTTCCATTCCTTCACCCACCACCTCATTCAATTCCATCACTAAACACTAAGTGTGCCTGTAAAAGGCACCTTAAATTCATCCACTTTTCTTCATTCCCACTGTTACCACGTTAATCATAATGTCTCATCTGGATTACTGCAATAACCTCTTACGTAGTCTCTAGTCTCTTTTTTTCACCACTACTCCGCCCTTACCTCCCATCCTGTTTTATTCTTTACAAAGCAACCAAGAATGACATTTTAAAAGTGTTCATTGATAATTTAATATGCTTATAAACCTTCAAGGGCTTTCTACTGTGTATCTAAGGTAAAGTCCATAGTTTGTTTGTAAGAACTGCATGCTCTGGTCCTTGCCTACATTGACAGCCTTATCTTAAACCACTAAACTTATCCCTTAGCTCACTGACCACATCAGTCTGCATTTAGTTATTGGGATGTGCCAAACGTTTTGCTTTTAGGGTCTTTTGTATATATGGTTTACTTTGCCTAATATTCTTCCTCCTATCTTTGCCTGGATGACTCCTTATTATCCTTCAGGTCTTAACCTGAATGTTACCTTCACAGATTGCCCTTCTTTGACTACCCAAGCTAATTTTCTCCACTAGTTTTTTTTTTTCAATTATTGTACCATGTTATTTTTCTTCATAGCCCTTAATATTCACAGCCCTTGATATTGTCATCTTATATTTTTACATATTAGGGTCTGTATTTTCCCATTATATTGTTAGCTTTATGAGAACAGAGGCCTTGTTTATCTTCTCCATTACTGATTACCCAGAACCTACCACAATTGTTGGCAAATACTTAATATTTACTACATATTTTTTAATGAGTAACTGAAGGTACTACACTCTTAATAAATCTACTGTTCTTCAGTGTACTCTGGCCACTTCCTCATTTTCCTTTAAAAGGTAAACTTATCATTTTTATTACTGAGATGGCCTAATCTTTTAGTACATCTCTGTTACAAATTGAATCTTCAGATCATTTTTCTGGTTTTGCTGGTTTTCATGTATAATAACTGTGTCTTAGAACTTCCATTGATGGCTTCTTTTAGGGTGAACCAGGTAGTATAATTATGTCATCACTGCCAGGACCAAAGGGTAATCCAGGATATCCAGGTCCTCCTGGAATACAAGTAAGTATCCAGTGATTTTCTTTTTTTGCTATATTGATTAAACCAGAAGATTACAACAATCCCTCAACCTTTAGTACTCTCTGTTTTTGTCATAAAAATTATCATCAGATGTTTACTAGACATTACATGTACTTTCTACCTGAAAATAAAAGCAATCTGGACCAGGGAGAATTTTAACAACATCGGCTTCATTCTTTTGCCTTTCTATCCAGTGTTTTGGGGATTGGCAGCAGAAATAGGGTTCTATATTCTTATTCTTGTACTGTGGAGAGCAGTAGGGTCTTTTGTACATTTACAAAAGACCTAATTAAAAATAAAAATTATGGAAGTCCCATTGAATATATTAAGATATATCATTTGTAACACTATCAGTTATGCATAATATATGAACATATTTTGAAGGCTGAAGGAATACAGTTTATGCATGGTGAACATCAAATGTAATCTTAAGAAAAAAATTTTAGCCTACAGAAAACATGCATAGAGAGAGCAGTAACTTTTGAGTATAGATTAGGAGGTCAATTTCTTAGGGTTTATATTTCATGATAATCGAATCCTTTGCCAAAAATGAAAAATCAAAACTTCCTGGTAGTTTATCACTAAGATACAAGATTGGGGACTTTTTTCATTAGCTACCTTGTCATTCCTTACTTGATATCACCCATCCATAGTTTTTAAAATTCACTCAATCTTGCCCTTTATATTTTATAAATTGTTATGAAGTAATATTTGAAAATACAACAGAATACATGCAAAATATATGTATGTTATGAAGCATAACTATAAAGTGAACAACATTTAAGAGCTAGAAAATTACAAATAATTTTGAATCAACCTGTGTCCCCCTTGGTAATCAAATCCTTCTGCATTCCCCCAAGACATAGCTACCATCTGTGCCTTAAAAATAGCTTTATTATATATGCATATATTTCTAAGCAATAGAATATTTAGCTTTGCTTTATAAAATAATGTAATATTTATGTAGTTTTCTGCAACTTACTTTTTCTACTTGATATGCTAAGATTCATCCATATTATTGGATATGGCTTTAGTTCACTCTGTTTCACTTTCATATAACTTTCCATTTGTGGACATACTACCATTTGGTGTTTTTTGTTTTATGTGGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATAGCATCTTGCACTCTTGCCCAGACCGGAGTGCAGTGGCATGATCATGGCTCACTGCAGTCTTAACCTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCATAGGTGCACATCACCACACCTGGCTACTTTTTGAAAATTTTCGTGGAGACAAGTTCTCACCATGTTGCCAAGGCTGGTCTCAAACATCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCTTAGGCCTCCAAAAGTATGAGGATTACAGGTGTAAGCCTCTGTGCCCAGCCTACAATTTTTTCATTACAAAAAAAAATCCATGATTTATATCTAAGTATAGAATTGCTAGATTGTAGGCCAAATTTTCAGTTTTTAACATGCCAAATTATTCCATAACACTTGTATCATTCTCTTATAATTTATCCCAGTTCCTCTCATTTCCCTCTGTCTTTAATCTTATCTATTTTAAAATTAGAGAAGCTATCTTGAAAGTAGTAGCCTTTCCCTTCTCATTGGTAGCATAAAAGCCCTAACTAAATGCATACCTTTATCACTTTGTTTTGTAAATTTTCCTTATTATTTGTCTTATGTTTATTTACCACTTTAAACCACAAGTTTTCTTATAATTACTTAATCCTTTTATCCCTTTGCATTTTAAAATTTCACTTATAATATTGCTGAATGATAAAATTGTAGAGCAGAATTCCAATGACGACTGAAGTTTAAATGAAGTCTAAATTTCATCCATTTAGTTCTTTGTAAGATACAATTAGGGGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTGGCACTTTGGGAGGCCAAGTCATGAGATCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACGA
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Task1_train_30770
A variant affecting Chromosome X, within the gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
GAAAATGTTTCAAAAAGAAGTTGGTAATATAGCTTTCTCCTGGGCAAAAGCAAGGATTTTGTATGTATATAAATGTCACCTCTAAGTATCCTAAGGTATATCCTATTCAGAAATGACGCTACAGCAGTCTACTCATTTTATACTCTATTTAGAAAGCATTCTGTAATTGGCGTGTTTCTCTCTCATACATATAAAATAATCCCTTTTCTTTTTAATAATAGGGACCCCCTGGGATCCCAGGTATGAAGGTAAGCATCTCATTCTGGGGAACAAATGTTTTGAATAAAATATTAGGAAAGCTGGCAACTTCAATAGGATAATGACTCAAACTTCTGTCTTAAAATCGATGTTTCTAGAAGTTGTGCAGGTGTAAACTTACAAGCTCTCCTTAAGTAGTCTCCTGTGTTCCCATGGCTTTAAGTACCTTGTATGTGCTGATACACTTGAAAATGTGTATATCAGACTTGAGTTTCTTTGCTGACACTTTAAGTCTTCATCTTCTTACACTTTGATACAGTTAACCACTTACTCTCTGTAGAATTACTTTTTTCCCTGGCCTCTGTGACACTATCCTTTCCTGATTTTTCTTCTACACCTCTGGTTAATTTGCAGTCTTCTATGTAAGGTCATTATTTTATGTCCATCAAGCATCAGGTCACAGTCTGTACTCCTTCCCTGCAATGCCCAGAAATATTACTAATGCCCATATTATTGATTACTATCTAGTTACTAAATACCAAATGAGACTTTTCTTCTGAGTTAGCTATGTGTATTCATCAGCCTCTCTGACATCTCCACATGTTCCAAGTTAATCCACCCACAAAATAAACCCGCTCCTCCCTGTGGCTCCTCATATCTCAAATTTGCATCTTTATATGTTATGTACACTTTTACACGATCTCAAAACCTGGGAGTTAATATTTATATCTTCCATTCCTTCACCCACCACCTCATTCAATTCCATCACTAAACACTAAGTGTGCCTGTAAAAGGCACCTTAAATTCATCCACTTTTCTTCATTCCCACTGTTACCACGTTAATCATAATGTCTCATCTGGATTACTGCAATAACCTCTTACGTAGTCTCTAGTCTCTTTTTTTCACCACTACTCCGCCCTTACCTCCCATCCTGTTTTATTCTTTACAAAGCAACCAAGAATGACATTTTAAAAGTGTTCATTGATAATTTAATATGCTTATAAACCTTCAAGGGCTTTCTACTGTGTATCTAAGGTAAAGTCCATAGTTTGTTTGTAAGAACTGCATGCTCTGGTCCTTGCCTACATTGACAGCCTTATCTTAAACCACTAAACTTATCCCTTAGCTCACTGACCACATCAGTCTGCATTTAGTTATTGGGATGTGCCAAACGTTTTGCTTTTAGGGTCTTTTGTATATATGGTTTACTTTGCCTAATATTCTTCCTCCTATCTTTGCCTGGATGACTCCTTATTATCCTTCAGGTCTTAACCTGAATGTTACCTTCACAGATTGCCCTTCTTTGACTACCCAAGCTAATTTTCTCCACTAGTTTTTTTTTTTCAATTATTGTACCATGTTATTTTTCTTCATAGCCCTTAATATTCACAGCCCTTGATATTGTCATCTTATATTTTTACATATTAGGGTCTGTATTTTCCCATTATATTGTTAGCTTTATGAGAACAGAGGCCTTGTTTATCTTCTCCATTACTGATTACCCAGAACCTACCACAATTGTTGGCAAATACTTAATATTTACTACATATTTTTTAATGAGTAACTGAAGGTACTACACTCTTAATAAATCTACTGTTCTTCAGTGTACTCTGGCCACTTCCTCATTTTCCTTTAAAAGGTAAACTTATCATTTTTATTACTGAGATGGCCTAATCTTTTAGTACATCTCTGTTACAAATTGAATCTTCAGATCATTTTTCTGGTTTTGCTGGTTTTCATGTATAATAACTGTGTCTTAGAACTTCCATTGATGGCTTCTTTTAGGGTGAACCAGGTAGTATAATTATGTCATCACTGCCAGGACCAAAGGGTAATCCAGGATATCCAGGTCCTCCTGGAATACAAGTAAGTATCCAGTGATTTTCTTTTTTTGCTATATTGATTAAACCAGAAGATTACAACAATCCCTCAACCTTTAGTACTCTCTGTTTTTGTCATAAAAATTATCATCAGATGTTTACTAGACATTACATGTACTTTCTACCTGAAAATAAAAGCAATCTGGACCAGGGAGAATTTTAACAACATCGGCTTCATTCTTTTGCCTTTCTATCCAGTGTTTTGGGGATTGGCAGCAGAAATAGGGTTCTATATTCTTATTCTTGTACTGTGGAGAGCAGTAGGGTCTTTTGTACATTTACAAAAGACCTAATTAAAAATAAAAATTATGGAAGTCCCATTGAATATATTAAGATATATCATTTGTAACACTATCAGTTATGCATAATATATGAACATATTTTGAAGGCTGAAGGAATACAGTTTATGCATGGTGAACATCAAATGTAATCTTAAGAAAAAAATTTTAGCCTACAGAAAACATGCATAGAGAGAGCAGTAACTTTTGAGTATAGATTAGGAGGTCAATTTCTTAGGGTTTATATTTCATGATAATCGAATCCTTTGCCAAAAATGAAAAATCAAAACTTCCTGGTAGTTTATCACTAAGATACAAGATTGGGGACTTTTTTCATTAGCTACCTTGTCATTCCTTACTTGATATCACCCATCCATAGTTTTTAAAATTCACTCAATCTTGCCCTTTATATTTTATAAATTGTTATGAAGTAATATTTGAAAATACAACAGAATACATGCAAAATATATGTATGTTATGAAGCATAACTATAAAGTGAACAACATTTAAGAGCTAGAAAATTACAAATAATTTTGAATCAACCTGTGTCCCCCTTGGTAATCAAATCCTTCTGCATTCCCCCAAGACATAGCTACCATCTGTGCCTTAAAAATAGCTTTATTATATATGCATATATTTCTAAGCAATAGAATATTTAGCTTTGCTTTATAAAATAATGTAATATTTATGTAGTTTTCTGCAACTTACTTTTTCTACTTGATATGCTAAGATTCATCCATATTATTGGATATGGCTTTAGTTCACTCTGTTTCACTTTCATATAACTTTCCATTTGTGGACATACTACCATTTGGTGTTTTTTGTTTTATGTGGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATAGCATCTTGCACTCTTGCCCAGACCGGAGTGCAGTGGCATGATCATGGCTCACTGCAGTCTTAACCTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCATAGGTGCACATCACCACACCTGGCTACTTTTTGAAAATTTTCGTGGAGACAAGTTCTCACCATGTTGCCAAGGCTGGTCTCAAACATCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCTTAGGCCTCCAAAAGTATGAGGATTACAGGTGTAAGCCTCTGTGCCCAGCCTACAATTTTTTCATTACAAAAAAAAATCCATGATTTATATCTAAGTATAGAATTGCTAGATTGTAGGCCAAATTTTCAGTTTTTAACATGCCAAATTATTCCATAACACTTGTATCATTCTCTTATAATTTATCCCAGTTCCTCTCATTTCCCTCTGTCTTTAATCTTATCTATTTTAAAATTAGAGAAGCTATCTTGAAAGTAGTAGCCTTTCCCTTCTCATTGGTAGCATAAAAGCCCTAACTAAATGCATACCTTTATCACTTTGTTTTGTAAATTTTCCTTATTATTTGTCTTATGTTTATTTACCACTTTAAACCACAAGTTTTCTTATAATTACTTAATCCTTTTATCCCTTTGCATTTTAAAATTTCACTTATAATATTGCTGAATGATAAAATTGTAGAGCAGAATTCCAATGACGACTGAAGTTTAAATGAAGTCTAAATTTCATCCATTTAGTTCTTTGTAAGATACAATTAGGGGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTGGCACTTTGGGAGGCCAAGTCATGAGATCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACGAT
GAAAATGTTTCAAAAAGAAGTTGGTAATATAGCTTTCTCCTGGGCAAAAGCAAGGATTTTGTATGTATATAAATGTCACCTCTAAGTATCCTAAGGTATATCCTATTCAGAAATGACGCTACAGCAGTCTACTCATTTTATACTCTATTTAGAAAGCATTCTGTAATTGGCGTGTTTCTCTCTCATACATATAAAATAATCCCTTTTCTTTTTAATAATAGGGACCCCCTGGGATCCCAGGTATGAAGGTAAGCATCTCATTCTGGGGAACAAATGTTTTGAATAAAATATTAGGAAAGCTGGCAACTTCAATAGGATAATGACTCAAACTTCTGTCTTAAAATCGATGTTTCTAGAAGTTGTGCAGGTGTAAACTTACAAGCTCTCCTTAAGTAGTCTCCTGTGTTCCCATGGCTTTAAGTACCTTGTATGTGCTGATACACTTGAAAATGTGTATATCAGACTTGAGTTTCTTTGCTGACACTTTAAGTCTTCATCTTCTTACACTTTGATACAGTTAACCACTTACTCTCTGTAGAATTACTTTTTTCCCTGGCCTCTGTGACACTATCCTTTCCTGATTTTTCTTCTACACCTCTGGTTAATTTGCAGTCTTCTATGTAAGGTCATTATTTTATGTCCATCAAGCATCAGGTCACAGTCTGTACTCCTTCCCTGCAATGCCCAGAAATATTACTAATGCCCATATTATTGATTACTATCTAGTTACTAAATACCAAATGAGACTTTTCTTCTGAGTTAGCTATGTGTATTCATCAGCCTCTCTGACATCTCCACATGTTCCAAGTTAATCCACCCACAAAATAAACCCGCTCCTCCCTGTGGCTCCTCATATCTCAAATTTGCATCTTTATATGTTATGTACACTTTTACACGATCTCAAAACCTGGGAGTTAATATTTATATCTTCCATTCCTTCACCCACCACCTCATTCAATTCCATCACTAAACACTAAGTGTGCCTGTAAAAGGCACCTTAAATTCATCCACTTTTCTTCATTCCCACTGTTACCACGTTAATCATAATGTCTCATCTGGATTACTGCAATAACCTCTTACGTAGTCTCTAGTCTCTTTTTTTCACCACTACTCCGCCCTTACCTCCCATCCTGTTTTATTCTTTACAAAGCAACCAAGAATGACATTTTAAAAGTGTTCATTGATAATTTAATATGCTTATAAACCTTCAAGGGCTTTCTACTGTGTATCTAAGGTAAAGTCCATAGTTTGTTTGTAAGAACTGCATGCTCTGGTCCTTGCCTACATTGACAGCCTTATCTTAAACCACTAAACTTATCCCTTAGCTCACTGACCACATCAGTCTGCATTTAGTTATTGGGATGTGCCAAACGTTTTGCTTTTAGGGTCTTTTGTATATATGGTTTACTTTGCCTAATATTCTTCCTCCTATCTTTGCCTGGATGACTCCTTATTATCCTTCAGGTCTTAACCTGAATGTTACCTTCACAGATTGCCCTTCTTTGACTACCCAAGCTAATTTTCTCCACTAGTTTTTTTTTTTCAATTATTGTACCATGTTATTTTTCTTCATAGCCCTTAATATTCACAGCCCTTGATATTGTCATCTTATATTTTTACATATTAGGGTCTGTATTTTCCCATTATATTGTTAGCTTTATGAGAACAGAGGCCTTGTTTATCTTCTCCATTACTGATTACCCAGAACCTACCACAATTGTTGGCAAATACTTAATATTTACTACATATTTTTTAATGAGTAACTGAAGGTACTACACTCTTAATAAATCTACTGTTCTTCAGTGTACTCTGGCCACTTCCTCATTTTCCTTTAAAAGGTAAACTTATCATTTTTATTACTGAGATGGCCTAATCTTTTAGTACATCTCTGTTACAAATTGAATCTTCAGATCATTTTTCTGGTTTTGCTGGTTTTCATGTATAATAACTGTGTCTTAGAACTTCCATTGATGGCTTCTTTTAGGGTGAACCAGGTAGTATAATTATGTCATCACTGCCAGGACCAAAGGGTAATCCAGGATATCCAGATCCTCCTGGAATACAAGTAAGTATCCAGTGATTTTCTTTTTTTGCTATATTGATTAAACCAGAAGATTACAACAATCCCTCAACCTTTAGTACTCTCTGTTTTTGTCATAAAAATTATCATCAGATGTTTACTAGACATTACATGTACTTTCTACCTGAAAATAAAAGCAATCTGGACCAGGGAGAATTTTAACAACATCGGCTTCATTCTTTTGCCTTTCTATCCAGTGTTTTGGGGATTGGCAGCAGAAATAGGGTTCTATATTCTTATTCTTGTACTGTGGAGAGCAGTAGGGTCTTTTGTACATTTACAAAAGACCTAATTAAAAATAAAAATTATGGAAGTCCCATTGAATATATTAAGATATATCATTTGTAACACTATCAGTTATGCATAATATATGAACATATTTTGAAGGCTGAAGGAATACAGTTTATGCATGGTGAACATCAAATGTAATCTTAAGAAAAAAATTTTAGCCTACAGAAAACATGCATAGAGAGAGCAGTAACTTTTGAGTATAGATTAGGAGGTCAATTTCTTAGGGTTTATATTTCATGATAATCGAATCCTTTGCCAAAAATGAAAAATCAAAACTTCCTGGTAGTTTATCACTAAGATACAAGATTGGGGACTTTTTTCATTAGCTACCTTGTCATTCCTTACTTGATATCACCCATCCATAGTTTTTAAAATTCACTCAATCTTGCCCTTTATATTTTATAAATTGTTATGAAGTAATATTTGAAAATACAACAGAATACATGCAAAATATATGTATGTTATGAAGCATAACTATAAAGTGAACAACATTTAAGAGCTAGAAAATTACAAATAATTTTGAATCAACCTGTGTCCCCCTTGGTAATCAAATCCTTCTGCATTCCCCCAAGACATAGCTACCATCTGTGCCTTAAAAATAGCTTTATTATATATGCATATATTTCTAAGCAATAGAATATTTAGCTTTGCTTTATAAAATAATGTAATATTTATGTAGTTTTCTGCAACTTACTTTTTCTACTTGATATGCTAAGATTCATCCATATTATTGGATATGGCTTTAGTTCACTCTGTTTCACTTTCATATAACTTTCCATTTGTGGACATACTACCATTTGGTGTTTTTTGTTTTATGTGGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATAGCATCTTGCACTCTTGCCCAGACCGGAGTGCAGTGGCATGATCATGGCTCACTGCAGTCTTAACCTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCATAGGTGCACATCACCACACCTGGCTACTTTTTGAAAATTTTCGTGGAGACAAGTTCTCACCATGTTGCCAAGGCTGGTCTCAAACATCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCTTAGGCCTCCAAAAGTATGAGGATTACAGGTGTAAGCCTCTGTGCCCAGCCTACAATTTTTTCATTACAAAAAAAAATCCATGATTTATATCTAAGTATAGAATTGCTAGATTGTAGGCCAAATTTTCAGTTTTTAACATGCCAAATTATTCCATAACACTTGTATCATTCTCTTATAATTTATCCCAGTTCCTCTCATTTCCCTCTGTCTTTAATCTTATCTATTTTAAAATTAGAGAAGCTATCTTGAAAGTAGTAGCCTTTCCCTTCTCATTGGTAGCATAAAAGCCCTAACTAAATGCATACCTTTATCACTTTGTTTTGTAAATTTTCCTTATTATTTGTCTTATGTTTATTTACCACTTTAAACCACAAGTTTTCTTATAATTACTTAATCCTTTTATCCCTTTGCATTTTAAAATTTCACTTATAATATTGCTGAATGATAAAATTGTAGAGCAGAATTCCAATGACGACTGAAGTTTAAATGAAGTCTAAATTTCATCCATTTAGTTCTTTGTAAGATACAATTAGGGGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTGGCACTTTGGGAGGCCAAGTCATGAGATCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACGAT
Task1_train_30771
This variant affects gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
AATAGGGTTCTATATTCTTATTCTTGTACTGTGGAGAGCAGTAGGGTCTTTTGTACATTTACAAAAGACCTAATTAAAAATAAAAATTATGGAAGTCCCATTGAATATATTAAGATATATCATTTGTAACACTATCAGTTATGCATAATATATGAACATATTTTGAAGGCTGAAGGAATACAGTTTATGCATGGTGAACATCAAATGTAATCTTAAGAAAAAAATTTTAGCCTACAGAAAACATGCATAGAGAGAGCAGTAACTTTTGAGTATAGATTAGGAGGTCAATTTCTTAGGGTTTATATTTCATGATAATCGAATCCTTTGCCAAAAATGAAAAATCAAAACTTCCTGGTAGTTTATCACTAAGATACAAGATTGGGGACTTTTTTCATTAGCTACCTTGTCATTCCTTACTTGATATCACCCATCCATAGTTTTTAAAATTCACTCAATCTTGCCCTTTATATTTTATAAATTGTTATGAAGTAATATTTGAAAATACAACAGAATACATGCAAAATATATGTATGTTATGAAGCATAACTATAAAGTGAACAACATTTAAGAGCTAGAAAATTACAAATAATTTTGAATCAACCTGTGTCCCCCTTGGTAATCAAATCCTTCTGCATTCCCCCAAGACATAGCTACCATCTGTGCCTTAAAAATAGCTTTATTATATATGCATATATTTCTAAGCAATAGAATATTTAGCTTTGCTTTATAAAATAATGTAATATTTATGTAGTTTTCTGCAACTTACTTTTTCTACTTGATATGCTAAGATTCATCCATATTATTGGATATGGCTTTAGTTCACTCTGTTTCACTTTCATATAACTTTCCATTTGTGGACATACTACCATTTGGTGTTTTTTGTTTTATGTGGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATAGCATCTTGCACTCTTGCCCAGACCGGAGTGCAGTGGCATGATCATGGCTCACTGCAGTCTTAACCTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCATAGGTGCACATCACCACACCTGGCTACTTTTTGAAAATTTTCGTGGAGACAAGTTCTCACCATGTTGCCAAGGCTGGTCTCAAACATCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCTTAGGCCTCCAAAAGTATGAGGATTACAGGTGTAAGCCTCTGTGCCCAGCCTACAATTTTTTCATTACAAAAAAAAATCCATGATTTATATCTAAGTATAGAATTGCTAGATTGTAGGCCAAATTTTCAGTTTTTAACATGCCAAATTATTCCATAACACTTGTATCATTCTCTTATAATTTATCCCAGTTCCTCTCATTTCCCTCTGTCTTTAATCTTATCTATTTTAAAATTAGAGAAGCTATCTTGAAAGTAGTAGCCTTTCCCTTCTCATTGGTAGCATAAAAGCCCTAACTAAATGCATACCTTTATCACTTTGTTTTGTAAATTTTCCTTATTATTTGTCTTATGTTTATTTACCACTTTAAACCACAAGTTTTCTTATAATTACTTAATCCTTTTATCCCTTTGCATTTTAAAATTTCACTTATAATATTGCTGAATGATAAAATTGTAGAGCAGAATTCCAATGACGACTGAAGTTTAAATGAAGTCTAAATTTCATCCATTTAGTTCTTTGTAAGATACAATTAGGGGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTGGCACTTTGGGAGGCCAAGTCATGAGATCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACGATAATTAGCCGGACCTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGTTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACACAAGTGAGACTTTGTGTAAAAAAAGAAAAAATACAATAAGGGGCTTGTTTTTCTTTTTTTTCATCATTTTCTTTACTCACTTTATAACAGGGCCTACCTGGTCCCACTGGTATACCAGGGCCAATTGGTCCCCCAGGACCACCAGGTTTGATGGTAAGCTCTCTTCTTTAATTTAATTTCCCCCCCTTTCCTTTCTGACTTCTTTCAGGAATATTAATATTATTTATAATACTTGAAAACATAATGCATTCTCAACATTCATAATTTATAATTTTCTTATGTAAAGGTGACTTTACAATGATATGGTGAATAATATGCATTCTAAGTAATGGCTCCATTTTATAGATGGAAAAATGAGGTATATAAAAGGAAAGATTTACAATGAAATATTTTGTTGGTTGCTCTTGATGTATCAGTGTTGAAGTCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCT
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Task1_train_30772
The gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
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Task1_train_30773
Here is a genetic alteration in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; not provided
TATATTCTTATTCTTGTACTGTGGAGAGCAGTAGGGTCTTTTGTACATTTACAAAAGACCTAATTAAAAATAAAAATTATGGAAGTCCCATTGAATATATTAAGATATATCATTTGTAACACTATCAGTTATGCATAATATATGAACATATTTTGAAGGCTGAAGGAATACAGTTTATGCATGGTGAACATCAAATGTAATCTTAAGAAAAAAATTTTAGCCTACAGAAAACATGCATAGAGAGAGCAGTAACTTTTGAGTATAGATTAGGAGGTCAATTTCTTAGGGTTTATATTTCATGATAATCGAATCCTTTGCCAAAAATGAAAAATCAAAACTTCCTGGTAGTTTATCACTAAGATACAAGATTGGGGACTTTTTTCATTAGCTACCTTGTCATTCCTTACTTGATATCACCCATCCATAGTTTTTAAAATTCACTCAATCTTGCCCTTTATATTTTATAAATTGTTATGAAGTAATATTTGAAAATACAACAGAATACATGCAAAATATATGTATGTTATGAAGCATAACTATAAAGTGAACAACATTTAAGAGCTAGAAAATTACAAATAATTTTGAATCAACCTGTGTCCCCCTTGGTAATCAAATCCTTCTGCATTCCCCCAAGACATAGCTACCATCTGTGCCTTAAAAATAGCTTTATTATATATGCATATATTTCTAAGCAATAGAATATTTAGCTTTGCTTTATAAAATAATGTAATATTTATGTAGTTTTCTGCAACTTACTTTTTCTACTTGATATGCTAAGATTCATCCATATTATTGGATATGGCTTTAGTTCACTCTGTTTCACTTTCATATAACTTTCCATTTGTGGACATACTACCATTTGGTGTTTTTTGTTTTATGTGGTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGAGATAGCATCTTGCACTCTTGCCCAGACCGGAGTGCAGTGGCATGATCATGGCTCACTGCAGTCTTAACCTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGGACCATAGGTGCACATCACCACACCTGGCTACTTTTTGAAAATTTTCGTGGAGACAAGTTCTCACCATGTTGCCAAGGCTGGTCTCAAACATCTGAGCTCAAGTGATCCTCCTGCTTAGGCCTCCAAAAGTATGAGGATTACAGGTGTAAGCCTCTGTGCCCAGCCTACAATTTTTTCATTACAAAAAAAAATCCATGATTTATATCTAAGTATAGAATTGCTAGATTGTAGGCCAAATTTTCAGTTTTTAACATGCCAAATTATTCCATAACACTTGTATCATTCTCTTATAATTTATCCCAGTTCCTCTCATTTCCCTCTGTCTTTAATCTTATCTATTTTAAAATTAGAGAAGCTATCTTGAAAGTAGTAGCCTTTCCCTTCTCATTGGTAGCATAAAAGCCCTAACTAAATGCATACCTTTATCACTTTGTTTTGTAAATTTTCCTTATTATTTGTCTTATGTTTATTTACCACTTTAAACCACAAGTTTTCTTATAATTACTTAATCCTTTTATCCCTTTGCATTTTAAAATTTCACTTATAATATTGCTGAATGATAAAATTGTAGAGCAGAATTCCAATGACGACTGAAGTTTAAATGAAGTCTAAATTTCATCCATTTAGTTCTTTGTAAGATACAATTAGGGGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTGGCACTTTGGGAGGCCAAGTCATGAGATCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACGATAATTAGCCGGACCTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTCGCAGTGAGTTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACACAAGTGAGACTTTGTGTAAAAAAAGAAAAAATACAATAAGGGGCTTGTTTTTCTTTTTTTTCATCATTTTCTTTACTCACTTTATAACAGGGCCTACCTGGTCCCACTGGTATACCAGGGCCAATTGGTCCCCCAGGACCACCAGGTTTGATGGTAAGCTCTCTTCTTTAATTTAATTTCCCCCCCTTTCCTTTCTGACTTCTTTCAGGAATATTAATATTATTTATAATACTTGAAAACATAATGCATTCTCAACATTCATAATTTATAATTTTCTTATGTAAAGGTGACTTTACAATGATATGGTGAATAATATGCATTCTAAGTAATGGCTCCATTTTATAGATGGAAAAATGAGGTATATAAAAGGAAAGATTTACAATGAAATATTTTGTTGGTTGCTCTTGATGTATCAGTGTTGAAGTCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCTAAGGTAATTT
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Task1_train_30774
Given this variant in gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_30775
Here is a genetic alteration in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TACTTGAAAACATAATGCATTCTCAACATTCATAATTTATAATTTTCTTATGTAAAGGTGACTTTACAATGATATGGTGAATAATATGCATTCTAAGTAATGGCTCCATTTTATAGATGGAAAAATGAGGTATATAAAAGGAAAGATTTACAATGAAATATTTTGTTGGTTGCTCTTGATGTATCAGTGTTGAAGTCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCTAAGGTAATTTTCTTTTTCTTTATATCTTTTATTTGGTGTGGATTCCTTTTCTTACTGTCAGTGAGATTTTTAAATGGAAACTTCTCTCTCCAGGGGAATATGGGCTTAAATTTCCAGGGACCCAAAGGTGAAAAAGTGAGTAAAGAAAGAGAGCTGGTTATTCAGCCCTCAGCTTTCTCTTTTTGTAGTCATTTGAACTGTCTTTTTCTTTCTCTTGCTTCTTGAAGTTATCTTATCTTACATGTTATATTACTGTCTGTGGAGATTATGAAGTATCACCACTGTCTTATTTTATCTTGCAAACAGGGTGAGCAAGGTCTTCAGGGCCCACCTGGGCCACCTGGGCAGATCAGTGAACAGAAAAGACCAATTGATGTAGAGTTTCAGAAAGGAGATCAGGTGAGTAAGTAGGGAGGAAGTCAATGAAAATCTTGCTATGGATATGTTAATTAGTTTGATGGTGGTAATCACATCACAATGTATATGTATATCAAAACATCACATTGTTTACACCTTAGATATATACAGTTTTTAATTTGTCAGTTATACCTCAATAAAGCTGAAAAAAATAAAATGATAAAAAGTTAAAAATAATATTTCTATGTAAGTGGAATTCCATTAAAATGCATTATAAGCTGAAATGTGGTTATATATAAGGGTATTTTTTTTTAAATAACAAGGATTTGAGATTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGT
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Task1_train_30776
Mutation context: Chromosome X, Gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
ATGCATTCTCAACATTCATAATTTATAATTTTCTTATGTAAAGGTGACTTTACAATGATATGGTGAATAATATGCATTCTAAGTAATGGCTCCATTTTATAGATGGAAAAATGAGGTATATAAAAGGAAAGATTTACAATGAAATATTTTGTTGGTTGCTCTTGATGTATCAGTGTTGAAGTCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCTAAGGTAATTTTCTTTTTCTTTATATCTTTTATTTGGTGTGGATTCCTTTTCTTACTGTCAGTGAGATTTTTAAATGGAAACTTCTCTCTCCAGGGGAATATGGGCTTAAATTTCCAGGGACCCAAAGGTGAAAAAGTGAGTAAAGAAAGAGAGCTGGTTATTCAGCCCTCAGCTTTCTCTTTTTGTAGTCATTTGAACTGTCTTTTTCTTTCTCTTGCTTCTTGAAGTTATCTTATCTTACATGTTATATTACTGTCTGTGGAGATTATGAAGTATCACCACTGTCTTATTTTATCTTGCAAACAGGGTGAGCAAGGTCTTCAGGGCCCACCTGGGCCACCTGGGCAGATCAGTGAACAGAAAAGACCAATTGATGTAGAGTTTCAGAAAGGAGATCAGGTGAGTAAGTAGGGAGGAAGTCAATGAAAATCTTGCTATGGATATGTTAATTAGTTTGATGGTGGTAATCACATCACAATGTATATGTATATCAAAACATCACATTGTTTACACCTTAGATATATACAGTTTTTAATTTGTCAGTTATACCTCAATAAAGCTGAAAAAAATAAAATGATAAAAAGTTAAAAATAATATTTCTATGTAAGTGGAATTCCATTAAAATGCATTATAAGCTGAAATGTGGTTATATATAAGGGTATTTTTTTTTAAATAACAAGGATTTGAGATTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTA
ATGCATTCTCAACATTCATAATTTATAATTTTCTTATGTAAAGGTGACTTTACAATGATATGGTGAATAATATGCATTCTAAGTAATGGCTCCATTTTATAGATGGAAAAATGAGGTATATAAAAGGAAAGATTTACAATGAAATATTTTGTTGGTTGCTCTTGATGTATCAGTGTTGAAGTCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCTAAGGTAATTTTCTTTTTCTTTATATCTTTTATTTGGTGTGGATTCCTTTTCTTACTGTCAGTGAGATTTTTAAATGGAAACTTCTCTCTCCAGGGGAATATGGGCTTAAATTTCCAGGGACCCAAAAGTGAAAAAGTGAGTAAAGAAAGAGAGCTGGTTATTCAGCCCTCAGCTTTCTCTTTTTGTAGTCATTTGAACTGTCTTTTTCTTTCTCTTGCTTCTTGAAGTTATCTTATCTTACATGTTATATTACTGTCTGTGGAGATTATGAAGTATCACCACTGTCTTATTTTATCTTGCAAACAGGGTGAGCAAGGTCTTCAGGGCCCACCTGGGCCACCTGGGCAGATCAGTGAACAGAAAAGACCAATTGATGTAGAGTTTCAGAAAGGAGATCAGGTGAGTAAGTAGGGAGGAAGTCAATGAAAATCTTGCTATGGATATGTTAATTAGTTTGATGGTGGTAATCACATCACAATGTATATGTATATCAAAACATCACATTGTTTACACCTTAGATATATACAGTTTTTAATTTGTCAGTTATACCTCAATAAAGCTGAAAAAAATAAAATGATAAAAAGTTAAAAATAATATTTCTATGTAAGTGGAATTCCATTAAAATGCATTATAAGCTGAAATGTGGTTATATATAAGGGTATTTTTTTTTAAATAACAAGGATTTGAGATTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTA
Task1_train_30777
Given a variant located on Chromosome X and affecting COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TCAATTCTGGCCATTTCAGAAAGTCTTTTAAGGCAGTTTTCTAATCACTTGATGAAACATGTTTCTTCAAACTGCAATTGTTTGTTTAAGAAGAGCAAAAGCAGGGCTTCATAAAAAATATTGGCTCTCATTTCCTAGGCGCCTGGGACAAAACAGTAGAATTGGTGAGGGGAGTGATCACTATGCAATTGGTCACAGGTTTTTGTACCCCAAAAACTTCTACAGATCCTGAATGTGCAACCGGTTCTCTTACTTTACTAGCTCTGTAGTCACTCTTATTTTCTATCCTAGTAAATTCTAAGTATTTTTACTTCTGCAATACTTAGATTTCATTCAAGTCATGTTTTGGACTTACAGCTTTGCTGTTGCCCTCTTAAAAGGGCAAGAAAATTGTATTTCAGTAGAAGTAATTTCTCATGTGCCACTCTATCTCTCATCTACCATATATTTAAGTGACAGTTTTCATTATACCTTTATAGGTTGTACATTTTTGTTTGTGACAATTGGTCCTGCACTTTTGAGTGAAGGAAATAATGTTTGATAACTGCTAGAAGAATCTACCAGAAAAGATTGTGATTTCTGCTTTCCTGTAACTTTTTGGGGGAAGATGAGAAAACCCTTTTGTTTGTTTTAGTTGTAGACTTCATGCAAAGCATGAAACTATGGACTTTCGCACTTTTTCCTAATTCTGCTGTTGGAACATTGGTGCCCCTTGAGTATATTGTTACACCTTGAATTTCCTCAACCATTGTGGCCACTTAACCGATTCACTTTACGTTTCTGGATATTCCTTGAATTAACGCTAATTCAACAGGTGAAGCCAAATCTTAGAAATGCCACCAAGAGGCCAGGTGCTGTGGCTCATGCCTGTAATCCCGGCACTTTGGGAGGCTAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTTGAGATCAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCATGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAGGAAAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTTCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGGGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAATGCCACCAAGATACAATATATAAATAAATAGGCCCATTGAGGTTAAGAGGCAACATACTTGAGCAGAAAGGTGCCTATTTAATTTTTTAAACCTTGAAACATTCTCAGATACACAAAGTCATATTGTATAAAAATCAAACTGGATTTTAAAAAATAAACACATGCTTTTTAGAACTTGAGAGTTAATTAGAGTTAATTGCTTTATGGTACCTAAGTTTACCTATAATTCTGATGTGAAAAATTTGATGGGTCTGTTGAGATTAACTTTTGAATTGATTTTTGACAATGGGGCTACCTCTCTACCTCTGCCCATCCCAGCTTTTTTCTCTTGCCCATTTCTATTTTGTCATCAGAGGTACTCACATTCATCTAGCTCATTTTAATCAATTAAAATGTGTGTCTCTGACTAAAATGAAAACAAACAAGAAAATACTATTTTGATGGGCTTTTTCACACCTTACTCTTTCTGAAACTAAATAACTTTTAAAATTAACTTATTAATATAACATTTTATTTTCTCTTTTGTCTTCTCTTCTTAGGGCCCTCCTGGTCCACCAGGACTTCCAGGACCTAAGGTAATTTTCTTTTTCTTTATATCTTTTATTTGGTGTGGATTCCTTTTCTTACTGTCAGTGAGATTTTTAAATGGAAACTTCTCTCTCCAGGGGAATATGGGCTTAAATTTCCAGGGACCCAAAGGTGAAAAAGTGAGTAAAGAAAGAGAGCTGGTTATTCAGCCCTCAGCTTTCTCTTTTTGTAGTCATTTGAACTGTCTTTTTCTTTCTCTTGCTTCTTGAAGTTATCTTATCTTACATGTTATATTACTGTCTGTGGAGATTATGAAGTATCACCACTGTCTTATTTTATCTTGCAAACAGGGTGAGCAAGGTCTTCAGGGCCCACCTGGGCCACCTGGGCAGATCAGTGAACAGAAAAGACCAATTGATGTAGAGTTTCAGAAAGGAGATCAGGTGAGTAAGTAGGGAGGAAGTCAATGAAAATCTTGCTATGGATATGTTAATTAGTTTGATGGTGGTAATCACATCACAATGTATATGTATATCAAAACATCACATTGTTTACACCTTAGATATATACAGTTTTTAATTTGTCAGTTATACCTCAATAAAGCTGAAAAAAATAAAATGATAAAAAGTTAAAAATAATATTTCTATGTAAGTGGAATTCCATTAAAATGCATTATAAGCTGAAATGTGGTTATATATAAGGGTATTTTTTTTTAAATAACAAGGATTTGAGATTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTGGGGTACAGATCCCATCAGCCAGGTAGTGAACATAGTACTCAGAAGTTAGTTTTACAAGTATTACCTGCCTCCCTCTACTCTTAGTAGTCCCCAGTGTCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCTTGTGTCCCCAATGTTTAGTTCTCAGTTATAAGTGAGAA
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Task1_train_30778
This gene mutation involves COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
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Task1_train_30779
This sequence variant lies in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
ATTATTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTGGGGTACAGATCCCATCAGCCAGGTAGTGAACATAGTACTCAGAAGTTAGTTTTACAAGTATTACCTGCCTCCCTCTACTCTTAGTAGTCCCCAGTGTCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCTTGTGTCCCCAATGTTTAGTTCTCAGTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTGATTTTTTGTTCATGCATTAATTCACTTAGGATTATAGCCTCCAGCTCTAACCATGTTGCTCCAACATAGATGTAGCTGTGGTTCAGTTTATTAAAAATGCTCCTAGCTAGCTCTAGTGCTTAGAATGAAAATGCATGTTCCAGTATTAACATTGATTTCCTTTCCCCTACTACTGCATAGGGACTTCCTGGTGACCGAGGGCCTCCTGGACCTCCAGGGATACGTGGTCCTCCAGTAAGTACCTAAAGTGCTTTAGCATCATTTAATGTAAATTGGTATTGGTACACAGTATCCCATGAACCATTGTGAAACTATTTTTATGTGTACAGGGTCCCCCAGGTGGTGAGAAAGGTGAGAAGGGTGAGCAAGGAGAGCCAGGCAAAAGAGTAAGTGATGTAACTGCTAATATTCTTTGCAAAAAAATTCTAAATGTGTGTGTGTGTGATTTTATTCTTTCTTCCTACATCTTCCATTGTTTCAAAATATCACTACTGACATTATAATGTTGATGTCTAAAAAGTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAA
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Task1_train_30780
Here is a genetic alteration in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TTTTTTTTTTTTTTGAGACTAAGTCTTGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCTGCTAATTATTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTGGGGTACAGATCCCATCAGCCAGGTAGTGAACATAGTACTCAGAAGTTAGTTTTACAAGTATTACCTGCCTCCCTCTACTCTTAGTAGTCCCCAGTGTCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCTTGTGTCCCCAATGTTTAGTTCTCAGTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTGATTTTTTGTTCATGCATTAATTCACTTAGGATTATAGCCTCCAGCTCTAACCATGTTGCTCCAACATAGATGTAGCTGTGGTTCAGTTTATTAAAAATGCTCCTAGCTAGCTCTAGTGCTTAGAATGAAAATGCATGTTCCAGTATTAACATTGATTTCCTTTCCCCTACTACTGCATAGGGACTTCCTGGTGACCGAGGGCCTCCTGGACCTCCAGGGATACGTGGTCCTCCAGTAAGTACCTAAAGTGCTTTAGCATCATTTAATGTAAATTGGTATTGGTACACAGTATCCCATGAACCATTGTGAAACTATTTTTATGTGTACAGGGTCCCCCAGGTGGTGAGAAAGGTGAGAAGGGTGAGCAAGGAGAGCCAGGCAAAAGAGTAAGTGATGTAACTGCTAATATTCTTTGCAAAAAAATTCTAAATGTGTGTGTGTGTGATTTTATTCTTTCTTCCTACATCTTCCATTGTTTCAAAATATCACTACTGACATTATAATGTTGATGTCTAAAAAGTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGA
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Task1_train_30781
This alteration occurs within gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; not provided
CCAAAGTGTTGGGATTTCAGGCATAAGCCACCATGCCTGGCCAAGATCATTAAATTTTCAAAATAACTTTATCAAGATACAGTCTACATACATATAATCCACCCATTTAAAGTGTACAATTCAATTTTTTTTTTAGTGCATTCACAGGGTAGTGAAACTATCAGTGCAATCTAACTTTAGAAAATTCTGAGGCTTCCTCAAAAAAATCTCCATACCTATGTTAGTTGTACTCCTTATTTCTCCCCAAATTGACCAGCCCTAGGTAATCACTAATCTACTTCTTGGCTCTGTAAATTTTTCTATTCTGAATATTTCATATAAATGGAATCATACAATATGTGGTCTTCTGTGTCTGGCTTCTTTTACTTAGCATAGTGTTTTCATGTTAAATCACTTTGCAGCACATATCAGTGCTTCATTCCTTTTTATGGCTGAATAATATTTCATTGTGTAAATAGTCTACATTTTGTTTATCCATTTATTCATCAGTTGATGGGCATTTGGGTTATTTCCATTTTTGGCTATTTGAAGAATCCATTCATGTATAAAATTAGGTTATGGTAAGTCAGAATGATGACAGTGTTCCCTACATTTCACTGATATGCAAGGAGAAAGATAATGTTACTCTATAAACCTTTGTTGTGTTTAGAAATAATTATCTGATACCCTGCTTTTGCTAGAGTAGATGAGGGAAATTAGATATATTTTTAAAGCATACTGGCCCACACTTTAACAAACAGAATGTGTGCATTTTTGTTTCACTTAAATGTGAATAAGAAAGTTAAGAATAAAGGAAAAGTTGTATTGAAACTCTATCATCAATATGAATTTGGCCATTTAATTATCTCCCAAAATATATGTATGCCGTGTGACCCCAAAATCTCTTTGTTTTAGGTATTCTTGCTTTTTATAAAATATTTTATAAGAATAAAAAATTGTCATTATTTTCATTTTAAGTGTTGCCTTGTTATTTACCTCAAATCTTGGCTTGTATATAGACAAAAAATTAACTGAAATGAGCAAAGATAGCTCTAGTTAATTTTGCCTAGAAGATTTCAACTTTAAGTTAGAAACACCCTATTATCTTTGGTTGTACTACATGAGTATTCAGTTCAGTTTAATTTTTTTAGGGGGAGATTTATTTTTATTTTATTTTATTATTTAAAAAAGTCAACCTTTATTTTAGATACAGGGGGTACATGTACAGGTTTGTCACATAGGTATATTGTGTGATGCTGAGGTTTGGGGTACAGATCCCATCAGCCAGGTAGTGAACATAGTACTCAGAAGTTAGTTTTACAAGTATTACCTGCCTCCCTCTACTCTTAGTAGTCCCCAGTGTCTATTGTTGCCATCTTTATGTCCTTGTGTCCCCAATGTTTAGTTCTCAGTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTGATTTTTTGTTCATGCATTAATTCACTTAGGATTATAGCCTCCAGCTCTAACCATGTTGCTCCAACATAGATGTAGCTGTGGTTCAGTTTATTAAAAATGCTCCTAGCTAGCTCTAGTGCTTAGAATGAAAATGCATGTTCCAGTATTAACATTGATTTCCTTTCCCCTACTACTGCATAGGGACTTCCTGGTGACCGAGGGCCTCCTGGACCTCCAGGGATACGTGGTCCTCCAGTAAGTACCTAAAGTGCTTTAGCATCATTTAATGTAAATTGGTATTGGTACACAGTATCCCATGAACCATTGTGAAACTATTTTTATGTGTACAGGGTCCCCCAGGTGGTGAGAAAGGTGAGAAGGGTGAGCAAGGAGAGCCAGGCAAAAGAGTAAGTGATGTAACTGCTAATATTCTTTGCAAAAAAATTCTAAATGTGTGTGTGTGTGATTTTATTCTTTCTTCCTACATCTTCCATTGTTTCAAAATATCACTACTGACATTATAATGTTGATGTCTAAAAAGTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTAC
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Task1_train_30782
This variant affects the gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
GTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATT
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Task1_train_30783
A genomic change on Chromosome X affects COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
GTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATT
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Task1_train_30784
Mutation context: Chromosome X, Gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
GTCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATT
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Task1_train_30785
This alteration occurs within gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TCTACTTAATATAGTCCAAGCCAGGAATAAAGCTTGTTATATTCTTTAACTTTATGCTTCCTAACTAACAAATGTATGTTGTTGCCCTATCATTTCTTTGTATCCTATAGGGTAAACCAGGCAAAGATGGAGAAAATGGCCAACCAGGAATTCCTGTAAGTAGCTAAGGTTCTTTCCCCCTGCAAAACTGGAGACATTTATGTGTTGGTATAACATAAGGTGGCAGAGAAGCAGTATGACAAAAATTGTGGGGTCTGGAAATAGTTTAAATGAATTGAAATTATCCAGTCTTTGTCTTTTGAATATAATTTTCAATTTTTAAAAAATTTTGTGAGTACATAGTAGGTGTATATATTTATTTATGAGGTACATGAGATGTTTTGATACATGTATGTAATGTGAAATAAGGACATCACAGAGAATGGGGTATTCATCCCCTCAAGCATTTATCCTTTGCATTACAAACAATCCAGTTACACCAAATATAAATTTGAGGTTCCTCTATTTTTTAAAGTCAGATTTATTGAGATATAATTTACATAAAGTAAAAGGAACTATTTTTAGTTTACAGTTCTGTGTTTGACAAACACATACAGTTGTGTCACCACCACCATAATCAAGAACACTTCCATCACCTTCAAAAGTTCCCTCATGCTCTTTTTTAGTTATCCCCTCCCTATTCCCCTATCCCAACCCCCTTATAACGACTGATCTTTTGTCAATCTCTTTAATTTTGCCTATTCCCAAATGTCAGATACATTGGATCATATTGTATGTAGCCTTTCGAATCAGGATCCTTTCACATAACATAATACATTGAATTGTGTATCAGTTCATTTTTTTATTGCTGAGTAGTATTTGATAGTTTGAATATACCATGGTTTGTTTGTCCATTTACACATTGAAGGATATTTTGGTTATTTCTGTGTTTTGGCCATTATGAATAAAACTTTTATATTCATATAAAAATATTTATATGAATATAAATATTCCCATACAGTTTTTTTGTGTGTGTGTGAACATGTTTTTTCAGTAAAAGTTTTGACAGGTAATTCTTCTACTTACTACCAAAAAGGGGCATGGGAAATAAAATATGTAAGTCCAAGAACATTATTTCAAGCAGCTTCAGTATCAAGAGTATCCGCAGTAGGCAAGAGTTTTTCAAAGACAGAGAGAATATTTGATGAAATTTGTAAGTTATTCTAAGGGAAAAGGATAATTCTTAACAAGACAGGTTAGAATTACTAAATTCAGATAAATTGGTTTCAGGATATTTTACTAAACAGGCAATCCTCAACTTACAATCTCTAGTTCAAAAATATTTTATATTATAAAATATCAAGAGGTAAATTCAGGGCCTCAGTTCCTGGCTTCTTTTGGAACAATTGGTCTTTGTCTTGATTCAGGCAGCTGTGATATTCAACAATTGCCTCTTAGTGTTTTCAACAAATTGGGGTTGCGGGGTGGGGAGGCTGTTCTCTTGTTCTCTGTTTGCACTGGGAGAACCCAAGTTGGGTCAAATAAAGGCAGCCTTGCAAATAGCCTTCTTTTGAACCAGCAGACAGATCAAATAATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTG
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Task1_train_30786
Here is a variant affecting COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
ATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCT
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Task1_train_30787
The variant affects gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; not provided
ATGATAATTCTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGGCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCT
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Task1_train_30788
A mutation in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
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CTCTGGATATGGGGCTTTGAAGGAGCTCCAACCCTGTTCTTTCCTCTCCAATTGCTGCTAGGCTGCTGGTTTTCACCTTGATTGTGAGGAGAGGTGGTGTGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGAGGTGGTGGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCATAAATCTCTGAGAGGTGGTAGGAATAGAGCAAGTTAAAATGCCACAAAGCTCTGAGTTCTCACCAAGATTCAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAAAACACTCCTTGAATTGCTGCAAGCTTTGGTTAAGTTCTGAAAGTTAATTCTGACTGACCATTTTTGCCAGTATTCTCATTGCTTCTATGGAGAAGACAATCTTTGGAGATTTCCTAACACCATCATTTGTGCTGATGTCACCCTATCCTCTATGTTTTAAAGGGTTTGCCTGGTGATCCTGGTTACCCTGGTGAACCCGGAAGGGATGGTGAAAAGGTAAGAATTTTAATACTTTGAAGTGACTGGTTTAGTCTAGCTAAAATAATCCTTTTCTTCTCCCAGGCTTGAGTTATAAATGGAAAAAGTCTACATAACTAGCTTTTATATTCAAAATATGCCTTCTTTATTCATCTTTTGCTCATTTTTCTTTTATACCACACTTGCTAAATTTTATTCCATTGCCATAAATCACAGTCCATGTTGCAGAAATACATTAAGCATTGTTTAACTTTAGCATTTCCACTGTGAAAAGTCATTGCCTTTACTTTGAGCATGTATCGGCAAAACTTCTTTTTTTCCACAAAGAGAATTCAGCACTATTTTAGTGAGGTCCTCTTACTAAAAAGGCTTATAACTGTGAATGTAGAACGTCGCCACTAAACATTTCCATTCTGTATGCAATTATTGTCTGTAAGTCTGTGGCTAATTCTTTGTTGTTTTTTCCCCCCTACTGGGCCAATGCAGTCTGACTGAGGTCATTTATTTAGTTACCTATTTTTCAAGTGACTTTGAAAGATTGTATGAAGCATACAATTACCAGATTTTTAGCAGGGCACAAAATAACCAGTCCTCCAATCCCTCTTGTTTTTAATTGCTTCGTATCAAAAACTGAAAGCTTTTTGGTTTTTCAGGCAAGGAAGGAAAGGCGTTACAAACTTGAATGTACCCAGAAGGCACATATTTTAATGGTGGTTTATTTTTAAATTAGGTCCAAGTTCTAGCATGGCTTAAAAGGCACAATTAGAATAGATGGAGGTAGGAAATACTCCGATAAAATGATTTTTTGTCAAATAGTATTTGTATATAGATGGATGGCTTCTATGAACAAGTTTAGAGTCAGAATAGAAGTATGAAAAAGACCATCCTTGTGTCTTGGCCAGTAGTAGAGTAACACTTGAATATTGAATATTGTGGTTTTTTTCATGCTGTTGTAGCTACTAATCAAGGATAAAAGTTTTATCTGAACTTGTCTTTCATTAGCTTCTAAGAGCAAGCTCATGAAAGCAATTCAGATTTACTAGCTATTATTGATGATAGTTAAGTCCATCACATCTAAAATGTCTGTCACTAATAGAAATGGCACTACATTTATGTCCTTGACTAGTTTTATGAGAAGAAACATGGCTAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAATTTTTTCACTGATTCTAGTGCTACCATTTTTTTTCTATTATCTTCTTTATAGAGTATTTGTAGTTGGCTAGAAATAGGAATCTTAAAAATCAAAGAATATTACAACTAGAAATACCTTAAAACTCTGGTCCAAAAATCTTTATTCTTTCTATATAAACCAGAGAAGTTAATTAACTTGGTGAAGATTACATAGCTAGTAAATCTGAGACACCATCACAGGTTAGGCTTAGCTCAGAATTGTTTCATTACTTCATGTTGCATTTCTCATTTGAGGTATTTTATGATTGATTTCTGGGTCTTTTTGGAAAGTTTCTCTTATATTCTTGAGGAAATTGATGTTTTCATGTGAATTTTACTAACCTATTTTACAATTGCATTGAACAGGGCCAAAAAGGTGACACTGTCCCACCTGGACCTCCTGGACTTGTAAGTTTTTTTTTTTTAGTCTTCGTTTATCAAATTTATTAATGCATTATCATTTTTGTGCCTTAATCGCATACTCCCTACTTTTTCTTGATAGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCTCCCATAATG
Task1_train_30789
This is a variant in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; not provided
AGAACACAAAATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCTCCCATAATGTTTTCAGGAGAACAAGGCTTTTCTTCTTTGCATTTCTTTATTTTTTTTTTCTTTGGTAATAAAGGTAATTCCTAGACCTGGGACTGGTATAACTATAGGAGAAAAAGGAAACATTGGGTTGCCTGGGTTGCCTGGAGAAAAAGGAGAGCGAGGATTTCCTGGAATACAGGGTCCACCTGGCCTTCCTGGACCTCCAGGTAAATGAGATTGCATTTATGGCCTTGTTCTTATAGCATCCTTACTAATCCATGTATACTTTTTATCACATTAGTTCCATGGTCAGCATGGAAGTAGGAGACACAAGTCCTTTTTAATTGACAGATACTTCCCAACTCTTACTATACCTTCTCTCACCATATTACTCACTTGTACTTTAAAAAAGCCCAAGTGAATAGTGTCCTTTAATCCTAAGATTCCTATTTCTACATTTTATTTTTTATTGATACATAATTGTACATATTTATGGGATACATGTGATATTTTAATACATGAGTCCAATGTATAATGATTAAATCAAGGTAACTAGAATATCCATTACCTCAAGTATTTATCTTTTCTTTATGTTGGGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTGTTTTGAAATATACAGTAAGTTGTTGTTAACTGCTGTGAATCTACTGTGCTACCAAACACTGAAACTTATTGCTTCTATCTAACTGTATGTTTGTACCCATTAACCAACCTTTCTTCATTTCCCCCGACCCTTCCCAGCCCCTGGTAACCATCATTCTACTCTCCACCTCCATGAGATCAACTTTTTTTTTTTAACCTCCTACGTAAGAATGAGAACATGCATTTGTATTTGCCTTTCTGTGCCTGGTTTATTTCACTTAACGTAATGTCCTTCAGGCTCATCCATGTTGCTGCAAATGATAGAACTCCGTTCTTTTATGGCCAAATAATATTCCATTGTGTATTTATACCACATTTCCTTTATCTGTTCATCCACTGATGAACATTCAGGTTGATTTCATATCTTGGCTATTGTGAATATTGCTACAATAAACATGGAAGTGCAGATATCTCTTTGAATTACTAATTTATTTTCTTTTGAATATATACCCAGACGTGAGATTGTTGGAACATATGGTAGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAAGAACCTCCATACTTTTTTTCATAATGGTTGCATTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTGTGAGAGTTCCCTCTTCTCTGCATCCTTGCAGCATCTGTTATTTTTTGTCTTTTTGATGATAGCCATATTAACTGGGGTATATTTTATTATTAATAAATTACACCAAACAATTCTTAATTTAGTAGGCAAATCATCACACTTTTCATGCTAATAGGGAAGGATATTCTCCCCAAGTAATGCCTAGTTTTGCAAGATTTCCTGTATAAAAATGGCAAGCAGCGTTATCCACCTAAAATTTCAGAAATACCTAACTAGAAATCCCCATGGTGATTTTGTTATACAATAAAATCTTAGAGCTCAATACTGAGTTTTATATTATTCCCTTTGAAAACACACAGTATAGTGGAACATTTCTAATTTGGCCACAAATTGAGTACTGCCCTTATCTAGAATGTTTATTTGAATGTTCTCTGAAATAGGGTAATAATAGTGATTTCCGTAAGATTTCTAGATGCATGTGGTACAGTGCCTGGCACACATACATATTCAATAAATTATTATTCCTTTTCCTTCAAAAATACGTGGCTAATGAAATACTAAAATGATGAGATGAGTGATATTCAGTGATCTTTCCCAAGAGAAAGAAAATAAATATAGGTTCCATTATGCTCTAAATGCAAACTTCAGATTCCTAAATGTGAACTTCAGATTCCTAACCTCAAGATAGTGAATTAAATACAGACTGTATCTGGAAAATTGAAATAAAGAATTATCTCAGGATGCAGTAAAAGAGATAAGGAGTTGGGAAGTATGAATGAAAAGTTAAGAGGTATGAAAGATAAACCTAGAAGCTCCAAAATTATCTCATGAGGGAGGTCAAGGAGGAGAGAATGGGACAAGAGGCAGCATTTGAAAAAAAATAATGGCTGAGAACTTCCATCTATTAAAAAACACATGCATCACTATGAAAAAGCTCATGAAGCACTAAGCAATAGTAAAATAATAGTAATGCAAAGGTCCATAACTAGA
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Task1_train_30790
This sequence variant lies in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; not provided
AATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCTCCCATAATGTTTTCAGGAGAACAAGGCTTTTCTTCTTTGCATTTCTTTATTTTTTTTTTCTTTGGTAATAAAGGTAATTCCTAGACCTGGGACTGGTATAACTATAGGAGAAAAAGGAAACATTGGGTTGCCTGGGTTGCCTGGAGAAAAAGGAGAGCGAGGATTTCCTGGAATACAGGGTCCACCTGGCCTTCCTGGACCTCCAGGTAAATGAGATTGCATTTATGGCCTTGTTCTTATAGCATCCTTACTAATCCATGTATACTTTTTATCACATTAGTTCCATGGTCAGCATGGAAGTAGGAGACACAAGTCCTTTTTAATTGACAGATACTTCCCAACTCTTACTATACCTTCTCTCACCATATTACTCACTTGTACTTTAAAAAAGCCCAAGTGAATAGTGTCCTTTAATCCTAAGATTCCTATTTCTACATTTTATTTTTTATTGATACATAATTGTACATATTTATGGGATACATGTGATATTTTAATACATGAGTCCAATGTATAATGATTAAATCAAGGTAACTAGAATATCCATTACCTCAAGTATTTATCTTTTCTTTATGTTGGGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTGTTTTGAAATATACAGTAAGTTGTTGTTAACTGCTGTGAATCTACTGTGCTACCAAACACTGAAACTTATTGCTTCTATCTAACTGTATGTTTGTACCCATTAACCAACCTTTCTTCATTTCCCCCGACCCTTCCCAGCCCCTGGTAACCATCATTCTACTCTCCACCTCCATGAGATCAACTTTTTTTTTTTAACCTCCTACGTAAGAATGAGAACATGCATTTGTATTTGCCTTTCTGTGCCTGGTTTATTTCACTTAACGTAATGTCCTTCAGGCTCATCCATGTTGCTGCAAATGATAGAACTCCGTTCTTTTATGGCCAAATAATATTCCATTGTGTATTTATACCACATTTCCTTTATCTGTTCATCCACTGATGAACATTCAGGTTGATTTCATATCTTGGCTATTGTGAATATTGCTACAATAAACATGGAAGTGCAGATATCTCTTTGAATTACTAATTTATTTTCTTTTGAATATATACCCAGACGTGAGATTGTTGGAACATATGGTAGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAAGAACCTCCATACTTTTTTTCATAATGGTTGCATTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTGTGAGAGTTCCCTCTTCTCTGCATCCTTGCAGCATCTGTTATTTTTTGTCTTTTTGATGATAGCCATATTAACTGGGGTATATTTTATTATTAATAAATTACACCAAACAATTCTTAATTTAGTAGGCAAATCATCACACTTTTCATGCTAATAGGGAAGGATATTCTCCCCAAGTAATGCCTAGTTTTGCAAGATTTCCTGTATAAAAATGGCAAGCAGCGTTATCCACCTAAAATTTCAGAAATACCTAACTAGAAATCCCCATGGTGATTTTGTTATACAATAAAATCTTAGAGCTCAATACTGAGTTTTATATTATTCCCTTTGAAAACACACAGTATAGTGGAACATTTCTAATTTGGCCACAAATTGAGTACTGCCCTTATCTAGAATGTTTATTTGAATGTTCTCTGAAATAGGGTAATAATAGTGATTTCCGTAAGATTTCTAGATGCATGTGGTACAGTGCCTGGCACACATACATATTCAATAAATTATTATTCCTTTTCCTTCAAAAATACGTGGCTAATGAAATACTAAAATGATGAGATGAGTGATATTCAGTGATCTTTCCCAAGAGAAAGAAAATAAATATAGGTTCCATTATGCTCTAAATGCAAACTTCAGATTCCTAAATGTGAACTTCAGATTCCTAACCTCAAGATAGTGAATTAAATACAGACTGTATCTGGAAAATTGAAATAAAGAATTATCTCAGGATGCAGTAAAAGAGATAAGGAGTTGGGAAGTATGAATGAAAAGTTAAGAGGTATGAAAGATAAACCTAGAAGCTCCAAAATTATCTCATGAGGGAGGTCAAGGAGGAGAGAATGGGACAAGAGGCAGCATTTGAAAAAAAATAATGGCTGAGAACTTCCATCTATTAAAAAACACATGCATCACTATGAAAAAGCTCATGAAGCACTAAGCAATAGTAAAATAATAGTAATGCAAAGGTCCATAACTAGACACATTGTA
AATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCTCCCATAATGTTTTCAGGAGAACAAGGCTTTTCTTCTTTGCATTTCTTTATTTTTTTTTTCTTTGGTAATAAAGGTAATTCCTAGACCTGGGACTGGTATAACTATAGGAGAAAAAGGAAACATTGGGTTGCCTAGGTTGCCTGGAGAAAAAGGAGAGCGAGGATTTCCTGGAATACAGGGTCCACCTGGCCTTCCTGGACCTCCAGGTAAATGAGATTGCATTTATGGCCTTGTTCTTATAGCATCCTTACTAATCCATGTATACTTTTTATCACATTAGTTCCATGGTCAGCATGGAAGTAGGAGACACAAGTCCTTTTTAATTGACAGATACTTCCCAACTCTTACTATACCTTCTCTCACCATATTACTCACTTGTACTTTAAAAAAGCCCAAGTGAATAGTGTCCTTTAATCCTAAGATTCCTATTTCTACATTTTATTTTTTATTGATACATAATTGTACATATTTATGGGATACATGTGATATTTTAATACATGAGTCCAATGTATAATGATTAAATCAAGGTAACTAGAATATCCATTACCTCAAGTATTTATCTTTTCTTTATGTTGGGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTGTTTTGAAATATACAGTAAGTTGTTGTTAACTGCTGTGAATCTACTGTGCTACCAAACACTGAAACTTATTGCTTCTATCTAACTGTATGTTTGTACCCATTAACCAACCTTTCTTCATTTCCCCCGACCCTTCCCAGCCCCTGGTAACCATCATTCTACTCTCCACCTCCATGAGATCAACTTTTTTTTTTTAACCTCCTACGTAAGAATGAGAACATGCATTTGTATTTGCCTTTCTGTGCCTGGTTTATTTCACTTAACGTAATGTCCTTCAGGCTCATCCATGTTGCTGCAAATGATAGAACTCCGTTCTTTTATGGCCAAATAATATTCCATTGTGTATTTATACCACATTTCCTTTATCTGTTCATCCACTGATGAACATTCAGGTTGATTTCATATCTTGGCTATTGTGAATATTGCTACAATAAACATGGAAGTGCAGATATCTCTTTGAATTACTAATTTATTTTCTTTTGAATATATACCCAGACGTGAGATTGTTGGAACATATGGTAGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAAGAACCTCCATACTTTTTTTCATAATGGTTGCATTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTGTGAGAGTTCCCTCTTCTCTGCATCCTTGCAGCATCTGTTATTTTTTGTCTTTTTGATGATAGCCATATTAACTGGGGTATATTTTATTATTAATAAATTACACCAAACAATTCTTAATTTAGTAGGCAAATCATCACACTTTTCATGCTAATAGGGAAGGATATTCTCCCCAAGTAATGCCTAGTTTTGCAAGATTTCCTGTATAAAAATGGCAAGCAGCGTTATCCACCTAAAATTTCAGAAATACCTAACTAGAAATCCCCATGGTGATTTTGTTATACAATAAAATCTTAGAGCTCAATACTGAGTTTTATATTATTCCCTTTGAAAACACACAGTATAGTGGAACATTTCTAATTTGGCCACAAATTGAGTACTGCCCTTATCTAGAATGTTTATTTGAATGTTCTCTGAAATAGGGTAATAATAGTGATTTCCGTAAGATTTCTAGATGCATGTGGTACAGTGCCTGGCACACATACATATTCAATAAATTATTATTCCTTTTCCTTCAAAAATACGTGGCTAATGAAATACTAAAATGATGAGATGAGTGATATTCAGTGATCTTTCCCAAGAGAAAGAAAATAAATATAGGTTCCATTATGCTCTAAATGCAAACTTCAGATTCCTAAATGTGAACTTCAGATTCCTAACCTCAAGATAGTGAATTAAATACAGACTGTATCTGGAAAATTGAAATAAAGAATTATCTCAGGATGCAGTAAAAGAGATAAGGAGTTGGGAAGTATGAATGAAAAGTTAAGAGGTATGAAAGATAAACCTAGAAGCTCCAAAATTATCTCATGAGGGAGGTCAAGGAGGAGAGAATGGGACAAGAGGCAGCATTTGAAAAAAAATAATGGCTGAGAACTTCCATCTATTAAAAAACACATGCATCACTATGAAAAAGCTCATGAAGCACTAAGCAATAGTAAAATAATAGTAATGCAAAGGTCCATAACTAGACACATTGTA
Task1_train_30791
Located on Chromosome X, this mutation impacts COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
ATTTCAAGTCATTATCAATTTCTACTGGCTTAAAAGTCTTTACATCTAAAATCTTCAGTAATGTTGACCTCAAGGTCTTTGTATTGTTCTGCCTATGCATTACTTCTGCATGGTAAAGGTCTAAAATTATGGCATTGGGTTGTTTTGCCTCATGATTGCCAGATCATTTCTCAAGCAACCAGCAGGTGGTGCAAGTGTTGCTTACAAAGGTTCAATGAAAACAACAACAACAAAACAAAACTTGGGGAAGTTGGGGTGGGGGTGGGGGATTGGTCCTTTCCCCTGCAGAGCTCAGGAGAAAGATAGATTTGGTCTTAATAGGTTTTCTCAATTTGTAATTGTCTGATTCACACTTCTTTCTTTCCTGAGTGTGTGCTTTCTAGGGACTTTTAATAACGCATGTAGGAAGCTGCTTTATGAAAGAATAATTGAGGGTGGCGGAGCTACAGATTTTCTGTCATGTTTGTGTTCACTATGAAATTTAAGTCAAATATACTTCCAGTCTTATTAGGAATAAAATATCATTGCTGAGGTTTAACATATTGGTTTTTCTTTGGTTGAAATTTAGTAAGACTCTTGACTTCAAACTGCATTGAAGCCGCAACAGTGCGAATGTTGGAAAACTTATGTGTCCAGACATGTTAGTAACATTAACTTAATTCGTATTATCCATAATGAGTCTCAGTTATTAATACTTAGGACTGTACTAAATCTAATGAGGATATACTTAAAGAAGATCTTAGATATTTTTTATTCACTTTCATTTTAAAATCAGCTTCAGTCCTCTAGGAAATAATCTCTTTATAAAATGAGAAGATAAAATTTTAATAAGTATCAGAAGAAATGGAAATTTTGAGAGTACAGTCCTATTTAGCAGCCTAGTTTCCCTTTTGAATCACTATTCCAATCTTAGGTCCCACAACTTTTTGTCTTCTTTTGTGTGAATATTTCTTATATCCATCCAATAGAGACAGGATGAAATATCACACTGCTATTAGGTGTTGATTTGTACATCAGACTGGCAGTCTCTTAAATCTGAAGTTCATTTACCTTTATAGGTCTATAAGAAGAATTTGTTAATATTTAATTTATTTAATATTAAGTTTTTTAAGAAAATACTTAATGAGTTACAAGAATACAGAGTAAAAAGAAATGATTAGTTAGTTGGGTTTAATCAATAAAGAACATGGGTTTTATTTTTAAATTTTTTTGGTATATAGTAGGTATATATATTTATGGGGGAGTTTTCTTTTTTAAAGGAAGAAATAAATGTGGGTTAATAAAGAGAAAGATTGGGGAAAGGCATTACACATGTTTGGAATGAAATATGCAAAGACATAGACAAGAACGTGCAAGTTGAATGAAATGGTTAGAATCAGACAGACTTCACTATAATAAAAATTTATTGTAAGACGTAGTAGGAGATTAAATAGGTGAGAGAAGTATTGGAAGTGAGAGGTGACTTACAGTTCAGGATTAAAAGTAGCAGCACTTATAGTAAAAAGTAGTGAGCAATTTTGAGTCCTTAAGCAGAATAGTTAACACACACACACAAATGGTTTTTGAGGAAGCATATCCTAACAATAGATTGGAATTCAAGGGACAAGATCAGAGGTGCTTCTATTACTCTAAGTGTGAGTTGATAATATAGCTGTGGCAGCAGAAATCAAGGGAGCAAATTGGAGAGACGTTTTCTGTAAAGAATTGTCAGGCTTAGGAGATTGGAATGAATTGAATGTGAATTATAGGAGAAGAGACATCAAAAATACTTTTAGTTTTATATGCTTCGGGCTCAGGAACATGGTAATGTTGTTACTTGTATTGGACATTTTCTAATCAGTTGGAGGATGGGAGTGATACAAAATGTGACTCATAAACTATGTGAAAATGATGACATTGTAATCATATGTAGCTCCCATAATGTTTTCAGGAGAACAAGGCTTTTCTTCTTTGCATTTCTTTATTTTTTTTTTCTTTGGTAATAAAGGTAATTCCTAGACCTGGGACTGGTATAACTATAGGAGAAAAAGGAAACATTGGGTTGCCTGGGTTGCCTGGAGAAAAAGGAGAGCGAGGATTTCCTGGAATACAGGGTCCACCTGGCCTTCCTGGACCTCCAGGTAAATGAGATTGCATTTATGGCCTTGTTCTTATAGCATCCTTACTAATCCATGTATACTTTTTATCACATTAGTTCCATGGTCAGCATGGAAGTAGGAGACACAAGTCCTTTTTAATTGACAGATACTTCCCAACTCTTACTATACCTTCTCTCACCATATTACTCACTTGTACTTTAAAAAAGCCCAAGTGAATAGTGTCCTTTAATCCTAAGATTCCTATTTCTACATTTTATTTTTTATTGATACATAATTGTACATATTTATGGGATACATGTGATATTTTAATACATGAGTCCAATGTATAATGATTAAATCAAGGTAACTAGAATATCCATTACCTCAAGTATTTATCTTTTCTTTATGTTGGGAACATTCAAAATCTTCTCTTCTAGCTGTTTTGAAATATACAGTAAGTTGTTGTTAACTGCTGTGAATCTACTGTGCTACCAAACACTGAAACTTATTGCTTCTATCTAACTGTATGTTTGTACCCATTAACCAACCTTTCTTCATTTCCCCCGACCCTTCCCAGCCCCTGGTAACCATCATTCTACTCTCCACCTCCATGAGATCAACTTTTTTTTTTTAACCTCCTACGTAAGAATGAGAACATGCATTTGTATTTGCCTTTCTGTGCCTGGTTTATTTCACTTAACGTAATGTCCTTCAGGCTCATCCATGTTGCTGCAAATGATAGAACTCCGTTCTTTTATGGCCAAATAATATTCCATTGTGTATTTATACCACATTTCCTTTATCTGTTCATCCACTGATGAACATTCAGGTTGATTTCATATCTTGGCTATTGTGAATATTGCTACAATAAACATGGAAGTGCAGATATCTCTTTGAATTACTAATTTATTTTCTTTTGAATATATACCCAGACGTGAGATTGTTGGAACATATGGTAGTTCTATTTTTAGTTTTTTGAAGAACCTCCATACTTTTTTTCATAATGGTTGCATTAATTTACATTCCCACCAACAGTGTGTGAGAGTTCCCTCTTCTCTGCATCCTTGCAGCATCTGTTATTTTTTGTCTTTTTGATGATAGCCATATTAACTGGGGTATATTTTATTATTAATAAATTACACCAAACAATTCTTAATTTAGTAGGCAAATCATCACACTTTTCATGCTAATAGGGAAGGATATTCTCCCCAAGTAATGCCTAGTTTTGCAAGATTTCCTGTATAAAAATGGCAAGCAGCGTTATCCACCTAAAATTTCAGAAATACCTAACTAGAAATCCCCATGGTGATTTTGTTATACAATAAAATCTTAGAGCTCAATACTGAGTTTTATATTATTCCCTTTGAAAACACACAGTATAGTGGAACATTTCTAATTTGGCCACAAATTGAGTACTGCCCTTATCTAGAATGTTTATTTGAATGTTCTCTGAAATAGGGTAATAATAGTGATTTCCGTAAGATTTCTAGATGCATGTGGTACAGTGCCTGGCACACATACATATTCAATAAATTATTATTCCTTTTCCTTCAAAAATACGTGGCTAATGAAATACTAAAATGATGAGATGAGTGATATTCAGTGATCTTTCCCAAGAGAAAGAAAATAAATATAGGTTCCATTATGCTCTAAATGCAAACTTCAGATTCCTAAATGTGAACTTCAGATTCCTAACCTCAAGATAGTGAATTAAATACAGACTGTATCTGGAAAATTGAAATAAAGAATTATCTCAGGATGCAGTAAAAGAGATAAGGAGTTGGGAAGTATGAATGAAAAGTTAAGAGGTATGAAAGATAAACCTAGAAGCTCCAAAATTATCTCATGAGGGAGGTCAAGGAGGAGAGAATGGGACAAGAGGCAGCATTTGAAAAAAAATAATGGCTGAGAACTTCCATCTATTAAAAAACACATGCATCACTATGAAAAAGCTCATGAAGCACTAAGCAATAGTAAAATAATAGTAATGCAAAGGTCCATAACTAGACACATTGTAG
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Task1_train_30792
Mutation context: Chromosome X, Gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
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Task1_train_30793
Here’s a variant in COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; not provided
GAAAATATATTAGTAAAGCATATTAAGTCTAAATCAGTACTGGTTATTTTTTAAAAAGGTGTTTTAAGTAACAACTTGGAGCTATAATTGTAAACATTATTAACGTGATGTGTAGATGCAGAGAGAATAAGGATAAGAGTTTTTGTCTTGTTAGGGAAAGATAATATAAATCTTGTTAACTGTATAAATTTTTAGAAATGTATACATGTTTAAGTACATAGGTTAAAATGTTAATAGTAGCCACTAGAGAAGAATAGAAATAAAATGTATAACATACACACCAATTGAAGAAAGAAAATGACTAAAAGTCTCATATATAGTATAAGTTAAGATGGGGGCAAAATAAAGACAAATCTGGGTAAATAGAAAATAAAATATAAGGTGACAAGAAGAAATTAAAAATAAGTCAGTAACTCCAACAAATTTGAAAGGACTAAACACTGATTAAAAGACAGTGACTAAAATAAAATTGAAATTAAAAATACCTATATATAGTGCACAGTAGACATATCTAAAGCAAAGTGACAGATACAATCTGAAAATAATGCAGTATATATTGGGCAAATGCTATACATAAAAAAGCTGGTTTAGCAATTCTAATATAGTATGAAATATAATTAAATTCAAAACTTGAAACTATAAAAATTCTAGAAGAAAATGCAGGAAAAACTTTTCTGGACATTGACCTAGGTAAAGATTTATGACTAAGACTTCAAAAGTAAATGTAACCAAAACAACAATAGACAATTGGGACTTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAATCAGTGGAGTAAATAGCCTACAGAATGGGTGAAAATAATTGTAAACTGTGCATCTGGCAAAGGACTAATATCCAGAATCTATTAATATAAGGAACTTAGACAAATCAATAAGAGAAAAAAATAACCCCATTAAAAACTGGGCAAAAGACATGAACAGAACACTTCTTAAAATAAGACATATATGTGGCCAACAAACATGAAAAAATGCTTAACATCACTAATCAGCAAATAAATGCAAAGTAAAACCACAATGAGATACTAACACATTAGAATGGCTATTATTAAAAAGTCATAAAATAACAGATTTGGGCAAGAAATAATTTCAGTTATTCAGAGACCATCTGATTATCTACCAGAAAGCTTTAAAAAATCCATTGACAAATTCCCAGAACTTAAAGAGAATATGTGTGCAAGATGGCCAGATCTGAGTAGCATACTTAATTTGCCTTCCTCTTCACCAGCAAACGTACAAGAGAAAAAAATACACTTCACAATAGTAATAGTATTAAAATTCACAGTAGAATAACCCCAACAATACATGTGTAAGACTTCTTTGCAGAATTTTGTAAATTATTATTAAATAATATAAAATTACTAAATAGAGAAATAAATTTAATTATTACTTGATGTGAAAAACCAATATAATAAACAGTTGATTCTACCAAAAAATAATCTTTAACTTCAAATTAATCCCATTCAGAATCCCAACCAGTTTTTGAAAATGAAACTGAAAAATTTATTTAGAAAAGTAAATTTGTAGATGGTTTTAAAAATGAACAAAGATGAGCGTATTTTCCTTAGCAGTTTTGAAAACATTATAAAGTCATAGTAACTAAAAAGTGTGTTAATGGTGCATGAATCACCAGTGTAACAGAAGAATGTCCGGAAACAGAGCCATGTTTATATGGTAACTTTGAAATACCTTTTTATCTTGCTAATGACTTTCCGGTATTTTTGAGATTATAAGAACAGATTGTCAAAGGATGGGGTTACTAGTAATTTCCAAAAGTAGTAAACCTACTTTAAATTATTATTTCCTACCCTCAAACTGTTACTTACATTCTTTGAAACTTTTCAACCTTTTTTTCAGACTTTTGAGTCTCATAGAAAAAAAATAACATAACCAGAATTATATGTTAAAGGAAGATCTTATCATTATCTAATGTCTCAATGAGAACTAAAGTAACATCTCTAAGATGAAATCATTTTGATCACTTTTTTGAATCTTAGGGGCTGCAGTTATGGGTCCTCCTGGCCCTCCTGGATTTCCTGGAGAAAGGGGTCAGAAAGGTGATGAAGGACCACCTGGAATTTCCATTCCTGGACCTCCTGGACTTGACGGACAGCCTGGGGCTCCTGGGCTTCCAGGGCCTCCTGGCCCTGCTGGCCCTCACATTCCTCCTAGTAAGCTATATTTTTCTCCTATTAAGTTCTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATAAGTAACTCTAGCTAAAGGTTGGCCTCATTTGTTGCGTTTCTGATATCTAAGAAATTCTACCACTGCTTCTGCTTTTTGGGTTTTGGTAGTTCTTGGATGTTTACATTTGCTCTTCATATAGTATTTATCAGCAATGTTATATTTTCCTTTTGCTTATAGGTACTTTTATTTCTTCAGAGAATAGGTCTTTTTCTGGCTTGTCAGGCTTTCTTTTGTTTAATCTTCTGGATATTTCACAATTAGCTTGCTATCCTTTCTTTATCTTACTCAGGTGATGAGATATGTGAACCAGGCCCTCCAGGCCCCCCAGGATCTCCAGGTGATAAAGGACTCCAAGGAGAACAAGGAGTGAAAGGTTTGATCTCCAAACATATTCATTCCTTCATTTTCTTCATTCTTTCAAATCATCAGCAAAATCCCCTGTATCCTCCATCACACCTTAGCCACTGACTCCCATGGTCATACCCCAAGACCATCTCATTACCAATAGTGTTATACTTACATGACCTTGGTTTCATGCATCCCATTTTTTGGATCGCTCTCTTCTTTCTAGCTTACTACCTCTAGTAACCTGACTCCAGCAATACTCCAACCCCACTGAGACCTAGCAACTTTGACTAATGCTTAACTTTTTGATGTCCTTTCTTCCCTCTTAACCTTGCTTAAGTTCCATTATCAATCACTGTAATCAATTCCATTCATAAATCCATGATTCCTTTGCCCTTCTCTCACTTCATTGCACTCACTTGGAACAAAAGCATAATCCAAATTTTCATGTTTTCTGAGCCTACACTTTCTCTTCTCTTTTCAAGTTTTAACAGTTCCTCCCCTATTCTTACCTTGCTTCCTACTTCACTGACCAATTAAAGCAATAACAAGAGAACTTTCACTGATTGCTACCACCATATTTACTTACCTACTTGCACCTGTGCCCATATAGTCTCCCTTCTTGCATATTACTGTTACTGCTCCTATCTAAAGCCAGTTCTTCTATTTATACAATAGATTCCATTTCCTCTTATTTCCCCAAGGATTTTTTTTCCAGCAATTTTTGCCTCTCCGACATCACCAATTTTTCCCTCTCTATTCAGTCATTCCAAGGAGCATACAAATATGCTTTTTTCACCTATCTAAAAAAATGTAATCCTACATTCCCTGCCAGCTGTTTCTCTATTTTTCTATTCTCATTTGCAACAAAACTTCCTAAGAATTTTCTCCTCATTACCTCTAGATACTCTCCTCTTGTTTTCTCTTAAACATACTCCAATCAAGATTTCATCCCCTCTTCCCCCAACTCCCCACTGCCTACCACTCCACAAATGCTGGTCAGTCACCAGCAGTCTATATCCTACTAATCCAAATGTCAGGTCTGTCCTTTTTTTGCTTGCTTTTTGCCTTCTTTAAACATTTGCATCCCTTAGCTTTCAGTACATTTCCTGTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTGTGGTGTACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCCATGTAATTACCATCTAAACCAAAATATAGAACATTTTCAGGACCCTGGAAGACTCTTGTGCTCCCTACTCAGTATCCCCCAAAGGTAATCACTATTTTATCCTCTGGCATATATTAATTTGCCTAATCTTGAACTTTGTGTACATGGAATTATACTGTATGAGCTCTTTTGTGCCTGGTTTCTTTAGCTAAATATATGTGAGATATATCTATGTTCTTGTTTGTTGCAGTATTTTTCCACCATTCTTTGTTTTCCACTGCACATTACCTCAATATTCTAATGTTGATGGACATTTGGTCTGGAGCTATTGTGAATAAAGCTGTCATAAATATTCTTGTA
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Gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
TCTAAATCAGTACTGGTTATTTTTTAAAAAGGTGTTTTAAGTAACAACTTGGAGCTATAATTGTAAACATTATTAACGTGATGTGTAGATGCAGAGAGAATAAGGATAAGAGTTTTTGTCTTGTTAGGGAAAGATAATATAAATCTTGTTAACTGTATAAATTTTTAGAAATGTATACATGTTTAAGTACATAGGTTAAAATGTTAATAGTAGCCACTAGAGAAGAATAGAAATAAAATGTATAACATACACACCAATTGAAGAAAGAAAATGACTAAAAGTCTCATATATAGTATAAGTTAAGATGGGGGCAAAATAAAGACAAATCTGGGTAAATAGAAAATAAAATATAAGGTGACAAGAAGAAATTAAAAATAAGTCAGTAACTCCAACAAATTTGAAAGGACTAAACACTGATTAAAAGACAGTGACTAAAATAAAATTGAAATTAAAAATACCTATATATAGTGCACAGTAGACATATCTAAAGCAAAGTGACAGATACAATCTGAAAATAATGCAGTATATATTGGGCAAATGCTATACATAAAAAAGCTGGTTTAGCAATTCTAATATAGTATGAAATATAATTAAATTCAAAACTTGAAACTATAAAAATTCTAGAAGAAAATGCAGGAAAAACTTTTCTGGACATTGACCTAGGTAAAGATTTATGACTAAGACTTCAAAAGTAAATGTAACCAAAACAACAATAGACAATTGGGACTTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAATCAGTGGAGTAAATAGCCTACAGAATGGGTGAAAATAATTGTAAACTGTGCATCTGGCAAAGGACTAATATCCAGAATCTATTAATATAAGGAACTTAGACAAATCAATAAGAGAAAAAAATAACCCCATTAAAAACTGGGCAAAAGACATGAACAGAACACTTCTTAAAATAAGACATATATGTGGCCAACAAACATGAAAAAATGCTTAACATCACTAATCAGCAAATAAATGCAAAGTAAAACCACAATGAGATACTAACACATTAGAATGGCTATTATTAAAAAGTCATAAAATAACAGATTTGGGCAAGAAATAATTTCAGTTATTCAGAGACCATCTGATTATCTACCAGAAAGCTTTAAAAAATCCATTGACAAATTCCCAGAACTTAAAGAGAATATGTGTGCAAGATGGCCAGATCTGAGTAGCATACTTAATTTGCCTTCCTCTTCACCAGCAAACGTACAAGAGAAAAAAATACACTTCACAATAGTAATAGTATTAAAATTCACAGTAGAATAACCCCAACAATACATGTGTAAGACTTCTTTGCAGAATTTTGTAAATTATTATTAAATAATATAAAATTACTAAATAGAGAAATAAATTTAATTATTACTTGATGTGAAAAACCAATATAATAAACAGTTGATTCTACCAAAAAATAATCTTTAACTTCAAATTAATCCCATTCAGAATCCCAACCAGTTTTTGAAAATGAAACTGAAAAATTTATTTAGAAAAGTAAATTTGTAGATGGTTTTAAAAATGAACAAAGATGAGCGTATTTTCCTTAGCAGTTTTGAAAACATTATAAAGTCATAGTAACTAAAAAGTGTGTTAATGGTGCATGAATCACCAGTGTAACAGAAGAATGTCCGGAAACAGAGCCATGTTTATATGGTAACTTTGAAATACCTTTTTATCTTGCTAATGACTTTCCGGTATTTTTGAGATTATAAGAACAGATTGTCAAAGGATGGGGTTACTAGTAATTTCCAAAAGTAGTAAACCTACTTTAAATTATTATTTCCTACCCTCAAACTGTTACTTACATTCTTTGAAACTTTTCAACCTTTTTTTCAGACTTTTGAGTCTCATAGAAAAAAAATAACATAACCAGAATTATATGTTAAAGGAAGATCTTATCATTATCTAATGTCTCAATGAGAACTAAAGTAACATCTCTAAGATGAAATCATTTTGATCACTTTTTTGAATCTTAGGGGCTGCAGTTATGGGTCCTCCTGGCCCTCCTGGATTTCCTGGAGAAAGGGGTCAGAAAGGTGATGAAGGACCACCTGGAATTTCCATTCCTGGACCTCCTGGACTTGACGGACAGCCTGGGGCTCCTGGGCTTCCAGGGCCTCCTGGCCCTGCTGGCCCTCACATTCCTCCTAGTAAGCTATATTTTTCTCCTATTAAGTTCTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATAAGTAACTCTAGCTAAAGGTTGGCCTCATTTGTTGCGTTTCTGATATCTAAGAAATTCTACCACTGCTTCTGCTTTTTGGGTTTTGGTAGTTCTTGGATGTTTACATTTGCTCTTCATATAGTATTTATCAGCAATGTTATATTTTCCTTTTGCTTATAGGTACTTTTATTTCTTCAGAGAATAGGTCTTTTTCTGGCTTGTCAGGCTTTCTTTTGTTTAATCTTCTGGATATTTCACAATTAGCTTGCTATCCTTTCTTTATCTTACTCAGGTGATGAGATATGTGAACCAGGCCCTCCAGGCCCCCCAGGATCTCCAGGTGATAAAGGACTCCAAGGAGAACAAGGAGTGAAAGGTTTGATCTCCAAACATATTCATTCCTTCATTTTCTTCATTCTTTCAAATCATCAGCAAAATCCCCTGTATCCTCCATCACACCTTAGCCACTGACTCCCATGGTCATACCCCAAGACCATCTCATTACCAATAGTGTTATACTTACATGACCTTGGTTTCATGCATCCCATTTTTTGGATCGCTCTCTTCTTTCTAGCTTACTACCTCTAGTAACCTGACTCCAGCAATACTCCAACCCCACTGAGACCTAGCAACTTTGACTAATGCTTAACTTTTTGATGTCCTTTCTTCCCTCTTAACCTTGCTTAAGTTCCATTATCAATCACTGTAATCAATTCCATTCATAAATCCATGATTCCTTTGCCCTTCTCTCACTTCATTGCACTCACTTGGAACAAAAGCATAATCCAAATTTTCATGTTTTCTGAGCCTACACTTTCTCTTCTCTTTTCAAGTTTTAACAGTTCCTCCCCTATTCTTACCTTGCTTCCTACTTCACTGACCAATTAAAGCAATAACAAGAGAACTTTCACTGATTGCTACCACCATATTTACTTACCTACTTGCACCTGTGCCCATATAGTCTCCCTTCTTGCATATTACTGTTACTGCTCCTATCTAAAGCCAGTTCTTCTATTTATACAATAGATTCCATTTCCTCTTATTTCCCCAAGGATTTTTTTTCCAGCAATTTTTGCCTCTCCGACATCACCAATTTTTCCCTCTCTATTCAGTCATTCCAAGGAGCATACAAATATGCTTTTTTCACCTATCTAAAAAAATGTAATCCTACATTCCCTGCCAGCTGTTTCTCTATTTTTCTATTCTCATTTGCAACAAAACTTCCTAAGAATTTTCTCCTCATTACCTCTAGATACTCTCCTCTTGTTTTCTCTTAAACATACTCCAATCAAGATTTCATCCCCTCTTCCCCCAACTCCCCACTGCCTACCACTCCACAAATGCTGGTCAGTCACCAGCAGTCTATATCCTACTAATCCAAATGTCAGGTCTGTCCTTTTTTTGCTTGCTTTTTGCCTTCTTTAAACATTTGCATCCCTTAGCTTTCAGTACATTTCCTGTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTGTGGTGTACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCCATGTAATTACCATCTAAACCAAAATATAGAACATTTTCAGGACCCTGGAAGACTCTTGTGCTCCCTACTCAGTATCCCCCAAAGGTAATCACTATTTTATCCTCTGGCATATATTAATTTGCCTAATCTTGAACTTTGTGTACATGGAATTATACTGTATGAGCTCTTTTGTGCCTGGTTTCTTTAGCTAAATATATGTGAGATATATCTATGTTCTTGTTTGTTGCAGTATTTTTCCACCATTCTTTGTTTTCCACTGCACATTACCTCAATATTCTAATGTTGATGGACATTTGGTCTGGAGCTATTGTGAATAAAGCTGTCATAAATATTCTTGTACGTGTATTTTTTTTGTAGGACATAAAC
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Task1_train_30795
Here is a variant affecting COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
TCTAAATCAGTACTGGTTATTTTTTAAAAAGGTGTTTTAAGTAACAACTTGGAGCTATAATTGTAAACATTATTAACGTGATGTGTAGATGCAGAGAGAATAAGGATAAGAGTTTTTGTCTTGTTAGGGAAAGATAATATAAATCTTGTTAACTGTATAAATTTTTAGAAATGTATACATGTTTAAGTACATAGGTTAAAATGTTAATAGTAGCCACTAGAGAAGAATAGAAATAAAATGTATAACATACACACCAATTGAAGAAAGAAAATGACTAAAAGTCTCATATATAGTATAAGTTAAGATGGGGGCAAAATAAAGACAAATCTGGGTAAATAGAAAATAAAATATAAGGTGACAAGAAGAAATTAAAAATAAGTCAGTAACTCCAACAAATTTGAAAGGACTAAACACTGATTAAAAGACAGTGACTAAAATAAAATTGAAATTAAAAATACCTATATATAGTGCACAGTAGACATATCTAAAGCAAAGTGACAGATACAATCTGAAAATAATGCAGTATATATTGGGCAAATGCTATACATAAAAAAGCTGGTTTAGCAATTCTAATATAGTATGAAATATAATTAAATTCAAAACTTGAAACTATAAAAATTCTAGAAGAAAATGCAGGAAAAACTTTTCTGGACATTGACCTAGGTAAAGATTTATGACTAAGACTTCAAAAGTAAATGTAACCAAAACAACAATAGACAATTGGGACTTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAATCAGTGGAGTAAATAGCCTACAGAATGGGTGAAAATAATTGTAAACTGTGCATCTGGCAAAGGACTAATATCCAGAATCTATTAATATAAGGAACTTAGACAAATCAATAAGAGAAAAAAATAACCCCATTAAAAACTGGGCAAAAGACATGAACAGAACACTTCTTAAAATAAGACATATATGTGGCCAACAAACATGAAAAAATGCTTAACATCACTAATCAGCAAATAAATGCAAAGTAAAACCACAATGAGATACTAACACATTAGAATGGCTATTATTAAAAAGTCATAAAATAACAGATTTGGGCAAGAAATAATTTCAGTTATTCAGAGACCATCTGATTATCTACCAGAAAGCTTTAAAAAATCCATTGACAAATTCCCAGAACTTAAAGAGAATATGTGTGCAAGATGGCCAGATCTGAGTAGCATACTTAATTTGCCTTCCTCTTCACCAGCAAACGTACAAGAGAAAAAAATACACTTCACAATAGTAATAGTATTAAAATTCACAGTAGAATAACCCCAACAATACATGTGTAAGACTTCTTTGCAGAATTTTGTAAATTATTATTAAATAATATAAAATTACTAAATAGAGAAATAAATTTAATTATTACTTGATGTGAAAAACCAATATAATAAACAGTTGATTCTACCAAAAAATAATCTTTAACTTCAAATTAATCCCATTCAGAATCCCAACCAGTTTTTGAAAATGAAACTGAAAAATTTATTTAGAAAAGTAAATTTGTAGATGGTTTTAAAAATGAACAAAGATGAGCGTATTTTCCTTAGCAGTTTTGAAAACATTATAAAGTCATAGTAACTAAAAAGTGTGTTAATGGTGCATGAATCACCAGTGTAACAGAAGAATGTCCGGAAACAGAGCCATGTTTATATGGTAACTTTGAAATACCTTTTTATCTTGCTAATGACTTTCCGGTATTTTTGAGATTATAAGAACAGATTGTCAAAGGATGGGGTTACTAGTAATTTCCAAAAGTAGTAAACCTACTTTAAATTATTATTTCCTACCCTCAAACTGTTACTTACATTCTTTGAAACTTTTCAACCTTTTTTTCAGACTTTTGAGTCTCATAGAAAAAAAATAACATAACCAGAATTATATGTTAAAGGAAGATCTTATCATTATCTAATGTCTCAATGAGAACTAAAGTAACATCTCTAAGATGAAATCATTTTGATCACTTTTTTGAATCTTAGGGGCTGCAGTTATGGGTCCTCCTGGCCCTCCTGGATTTCCTGGAGAAAGGGGTCAGAAAGGTGATGAAGGACCACCTGGAATTTCCATTCCTGGACCTCCTGGACTTGACGGACAGCCTGGGGCTCCTGGGCTTCCAGGGCCTCCTGGCCCTGCTGGCCCTCACATTCCTCCTAGTAAGCTATATTTTTCTCCTATTAAGTTCTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATAAGTAACTCTAGCTAAAGGTTGGCCTCATTTGTTGCGTTTCTGATATCTAAGAAATTCTACCACTGCTTCTGCTTTTTGGGTTTTGGTAGTTCTTGGATGTTTACATTTGCTCTTCATATAGTATTTATCAGCAATGTTATATTTTCCTTTTGCTTATAGGTACTTTTATTTCTTCAGAGAATAGGTCTTTTTCTGGCTTGTCAGGCTTTCTTTTGTTTAATCTTCTGGATATTTCACAATTAGCTTGCTATCCTTTCTTTATCTTACTCAGGTGATGAGATATGTGAACCAGGCCCTCCAGGCCCCCCAGGATCTCCAGGTGATAAAGGACTCCAAGGAGAACAAGGAGTGAAAGGTTTGATCTCCAAACATATTCATTCCTTCATTTTCTTCATTCTTTCAAATCATCAGCAAAATCCCCTGTATCCTCCATCACACCTTAGCCACTGACTCCCATGGTCATACCCCAAGACCATCTCATTACCAATAGTGTTATACTTACATGACCTTGGTTTCATGCATCCCATTTTTTGGATCGCTCTCTTCTTTCTAGCTTACTACCTCTAGTAACCTGACTCCAGCAATACTCCAACCCCACTGAGACCTAGCAACTTTGACTAATGCTTAACTTTTTGATGTCCTTTCTTCCCTCTTAACCTTGCTTAAGTTCCATTATCAATCACTGTAATCAATTCCATTCATAAATCCATGATTCCTTTGCCCTTCTCTCACTTCATTGCACTCACTTGGAACAAAAGCATAATCCAAATTTTCATGTTTTCTGAGCCTACACTTTCTCTTCTCTTTTCAAGTTTTAACAGTTCCTCCCCTATTCTTACCTTGCTTCCTACTTCACTGACCAATTAAAGCAATAACAAGAGAACTTTCACTGATTGCTACCACCATATTTACTTACCTACTTGCACCTGTGCCCATATAGTCTCCCTTCTTGCATATTACTGTTACTGCTCCTATCTAAAGCCAGTTCTTCTATTTATACAATAGATTCCATTTCCTCTTATTTCCCCAAGGATTTTTTTTCCAGCAATTTTTGCCTCTCCGACATCACCAATTTTTCCCTCTCTATTCAGTCATTCCAAGGAGCATACAAATATGCTTTTTTCACCTATCTAAAAAAATGTAATCCTACATTCCCTGCCAGCTGTTTCTCTATTTTTCTATTCTCATTTGCAACAAAACTTCCTAAGAATTTTCTCCTCATTACCTCTAGATACTCTCCTCTTGTTTTCTCTTAAACATACTCCAATCAAGATTTCATCCCCTCTTCCCCCAACTCCCCACTGCCTACCACTCCACAAATGCTGGTCAGTCACCAGCAGTCTATATCCTACTAATCCAAATGTCAGGTCTGTCCTTTTTTTGCTTGCTTTTTGCCTTCTTTAAACATTTGCATCCCTTAGCTTTCAGTACATTTCCTGTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTGTGGTGTACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCCATGTAATTACCATCTAAACCAAAATATAGAACATTTTCAGGACCCTGGAAGACTCTTGTGCTCCCTACTCAGTATCCCCCAAAGGTAATCACTATTTTATCCTCTGGCATATATTAATTTGCCTAATCTTGAACTTTGTGTACATGGAATTATACTGTATGAGCTCTTTTGTGCCTGGTTTCTTTAGCTAAATATATGTGAGATATATCTATGTTCTTGTTTGTTGCAGTATTTTTCCACCATTCTTTGTTTTCCACTGCACATTACCTCAATATTCTAATGTTGATGGACATTTGGTCTGGAGCTATTGTGAATAAAGCTGTCATAAATATTCTTGTACGTGTATTTTTTTTGTAGGACATAAAC
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Task1_train_30796
A change on Chromosome X affects gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
GTACTGGTTATTTTTTAAAAAGGTGTTTTAAGTAACAACTTGGAGCTATAATTGTAAACATTATTAACGTGATGTGTAGATGCAGAGAGAATAAGGATAAGAGTTTTTGTCTTGTTAGGGAAAGATAATATAAATCTTGTTAACTGTATAAATTTTTAGAAATGTATACATGTTTAAGTACATAGGTTAAAATGTTAATAGTAGCCACTAGAGAAGAATAGAAATAAAATGTATAACATACACACCAATTGAAGAAAGAAAATGACTAAAAGTCTCATATATAGTATAAGTTAAGATGGGGGCAAAATAAAGACAAATCTGGGTAAATAGAAAATAAAATATAAGGTGACAAGAAGAAATTAAAAATAAGTCAGTAACTCCAACAAATTTGAAAGGACTAAACACTGATTAAAAGACAGTGACTAAAATAAAATTGAAATTAAAAATACCTATATATAGTGCACAGTAGACATATCTAAAGCAAAGTGACAGATACAATCTGAAAATAATGCAGTATATATTGGGCAAATGCTATACATAAAAAAGCTGGTTTAGCAATTCTAATATAGTATGAAATATAATTAAATTCAAAACTTGAAACTATAAAAATTCTAGAAGAAAATGCAGGAAAAACTTTTCTGGACATTGACCTAGGTAAAGATTTATGACTAAGACTTCAAAAGTAAATGTAACCAAAACAACAATAGACAATTGGGACTTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAATCAGTGGAGTAAATAGCCTACAGAATGGGTGAAAATAATTGTAAACTGTGCATCTGGCAAAGGACTAATATCCAGAATCTATTAATATAAGGAACTTAGACAAATCAATAAGAGAAAAAAATAACCCCATTAAAAACTGGGCAAAAGACATGAACAGAACACTTCTTAAAATAAGACATATATGTGGCCAACAAACATGAAAAAATGCTTAACATCACTAATCAGCAAATAAATGCAAAGTAAAACCACAATGAGATACTAACACATTAGAATGGCTATTATTAAAAAGTCATAAAATAACAGATTTGGGCAAGAAATAATTTCAGTTATTCAGAGACCATCTGATTATCTACCAGAAAGCTTTAAAAAATCCATTGACAAATTCCCAGAACTTAAAGAGAATATGTGTGCAAGATGGCCAGATCTGAGTAGCATACTTAATTTGCCTTCCTCTTCACCAGCAAACGTACAAGAGAAAAAAATACACTTCACAATAGTAATAGTATTAAAATTCACAGTAGAATAACCCCAACAATACATGTGTAAGACTTCTTTGCAGAATTTTGTAAATTATTATTAAATAATATAAAATTACTAAATAGAGAAATAAATTTAATTATTACTTGATGTGAAAAACCAATATAATAAACAGTTGATTCTACCAAAAAATAATCTTTAACTTCAAATTAATCCCATTCAGAATCCCAACCAGTTTTTGAAAATGAAACTGAAAAATTTATTTAGAAAAGTAAATTTGTAGATGGTTTTAAAAATGAACAAAGATGAGCGTATTTTCCTTAGCAGTTTTGAAAACATTATAAAGTCATAGTAACTAAAAAGTGTGTTAATGGTGCATGAATCACCAGTGTAACAGAAGAATGTCCGGAAACAGAGCCATGTTTATATGGTAACTTTGAAATACCTTTTTATCTTGCTAATGACTTTCCGGTATTTTTGAGATTATAAGAACAGATTGTCAAAGGATGGGGTTACTAGTAATTTCCAAAAGTAGTAAACCTACTTTAAATTATTATTTCCTACCCTCAAACTGTTACTTACATTCTTTGAAACTTTTCAACCTTTTTTTCAGACTTTTGAGTCTCATAGAAAAAAAATAACATAACCAGAATTATATGTTAAAGGAAGATCTTATCATTATCTAATGTCTCAATGAGAACTAAAGTAACATCTCTAAGATGAAATCATTTTGATCACTTTTTTGAATCTTAGGGGCTGCAGTTATGGGTCCTCCTGGCCCTCCTGGATTTCCTGGAGAAAGGGGTCAGAAAGGTGATGAAGGACCACCTGGAATTTCCATTCCTGGACCTCCTGGACTTGACGGACAGCCTGGGGCTCCTGGGCTTCCAGGGCCTCCTGGCCCTGCTGGCCCTCACATTCCTCCTAGTAAGCTATATTTTTCTCCTATTAAGTTCTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATAAGTAACTCTAGCTAAAGGTTGGCCTCATTTGTTGCGTTTCTGATATCTAAGAAATTCTACCACTGCTTCTGCTTTTTGGGTTTTGGTAGTTCTTGGATGTTTACATTTGCTCTTCATATAGTATTTATCAGCAATGTTATATTTTCCTTTTGCTTATAGGTACTTTTATTTCTTCAGAGAATAGGTCTTTTTCTGGCTTGTCAGGCTTTCTTTTGTTTAATCTTCTGGATATTTCACAATTAGCTTGCTATCCTTTCTTTATCTTACTCAGGTGATGAGATATGTGAACCAGGCCCTCCAGGCCCCCCAGGATCTCCAGGTGATAAAGGACTCCAAGGAGAACAAGGAGTGAAAGGTTTGATCTCCAAACATATTCATTCCTTCATTTTCTTCATTCTTTCAAATCATCAGCAAAATCCCCTGTATCCTCCATCACACCTTAGCCACTGACTCCCATGGTCATACCCCAAGACCATCTCATTACCAATAGTGTTATACTTACATGACCTTGGTTTCATGCATCCCATTTTTTGGATCGCTCTCTTCTTTCTAGCTTACTACCTCTAGTAACCTGACTCCAGCAATACTCCAACCCCACTGAGACCTAGCAACTTTGACTAATGCTTAACTTTTTGATGTCCTTTCTTCCCTCTTAACCTTGCTTAAGTTCCATTATCAATCACTGTAATCAATTCCATTCATAAATCCATGATTCCTTTGCCCTTCTCTCACTTCATTGCACTCACTTGGAACAAAAGCATAATCCAAATTTTCATGTTTTCTGAGCCTACACTTTCTCTTCTCTTTTCAAGTTTTAACAGTTCCTCCCCTATTCTTACCTTGCTTCCTACTTCACTGACCAATTAAAGCAATAACAAGAGAACTTTCACTGATTGCTACCACCATATTTACTTACCTACTTGCACCTGTGCCCATATAGTCTCCCTTCTTGCATATTACTGTTACTGCTCCTATCTAAAGCCAGTTCTTCTATTTATACAATAGATTCCATTTCCTCTTATTTCCCCAAGGATTTTTTTTCCAGCAATTTTTGCCTCTCCGACATCACCAATTTTTCCCTCTCTATTCAGTCATTCCAAGGAGCATACAAATATGCTTTTTTCACCTATCTAAAAAAATGTAATCCTACATTCCCTGCCAGCTGTTTCTCTATTTTTCTATTCTCATTTGCAACAAAACTTCCTAAGAATTTTCTCCTCATTACCTCTAGATACTCTCCTCTTGTTTTCTCTTAAACATACTCCAATCAAGATTTCATCCCCTCTTCCCCCAACTCCCCACTGCCTACCACTCCACAAATGCTGGTCAGTCACCAGCAGTCTATATCCTACTAATCCAAATGTCAGGTCTGTCCTTTTTTTGCTTGCTTTTTGCCTTCTTTAAACATTTGCATCCCTTAGCTTTCAGTACATTTCCTGTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTGTGGTGTACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCCATGTAATTACCATCTAAACCAAAATATAGAACATTTTCAGGACCCTGGAAGACTCTTGTGCTCCCTACTCAGTATCCCCCAAAGGTAATCACTATTTTATCCTCTGGCATATATTAATTTGCCTAATCTTGAACTTTGTGTACATGGAATTATACTGTATGAGCTCTTTTGTGCCTGGTTTCTTTAGCTAAATATATGTGAGATATATCTATGTTCTTGTTTGTTGCAGTATTTTTCCACCATTCTTTGTTTTCCACTGCACATTACCTCAATATTCTAATGTTGATGGACATTTGGTCTGGAGCTATTGTGAATAAAGCTGTCATAAATATTCTTGTACGTGTATTTTTTTTGTAGGACATAAACACTAATTTT
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Task1_train_30797
A variant on Chromosome X in gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
GTACTGGTTATTTTTTAAAAAGGTGTTTTAAGTAACAACTTGGAGCTATAATTGTAAACATTATTAACGTGATGTGTAGATGCAGAGAGAATAAGGATAAGAGTTTTTGTCTTGTTAGGGAAAGATAATATAAATCTTGTTAACTGTATAAATTTTTAGAAATGTATACATGTTTAAGTACATAGGTTAAAATGTTAATAGTAGCCACTAGAGAAGAATAGAAATAAAATGTATAACATACACACCAATTGAAGAAAGAAAATGACTAAAAGTCTCATATATAGTATAAGTTAAGATGGGGGCAAAATAAAGACAAATCTGGGTAAATAGAAAATAAAATATAAGGTGACAAGAAGAAATTAAAAATAAGTCAGTAACTCCAACAAATTTGAAAGGACTAAACACTGATTAAAAGACAGTGACTAAAATAAAATTGAAATTAAAAATACCTATATATAGTGCACAGTAGACATATCTAAAGCAAAGTGACAGATACAATCTGAAAATAATGCAGTATATATTGGGCAAATGCTATACATAAAAAAGCTGGTTTAGCAATTCTAATATAGTATGAAATATAATTAAATTCAAAACTTGAAACTATAAAAATTCTAGAAGAAAATGCAGGAAAAACTTTTCTGGACATTGACCTAGGTAAAGATTTATGACTAAGACTTCAAAAGTAAATGTAACCAAAACAACAATAGACAATTGGGACTTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACAATCAGTGGAGTAAATAGCCTACAGAATGGGTGAAAATAATTGTAAACTGTGCATCTGGCAAAGGACTAATATCCAGAATCTATTAATATAAGGAACTTAGACAAATCAATAAGAGAAAAAAATAACCCCATTAAAAACTGGGCAAAAGACATGAACAGAACACTTCTTAAAATAAGACATATATGTGGCCAACAAACATGAAAAAATGCTTAACATCACTAATCAGCAAATAAATGCAAAGTAAAACCACAATGAGATACTAACACATTAGAATGGCTATTATTAAAAAGTCATAAAATAACAGATTTGGGCAAGAAATAATTTCAGTTATTCAGAGACCATCTGATTATCTACCAGAAAGCTTTAAAAAATCCATTGACAAATTCCCAGAACTTAAAGAGAATATGTGTGCAAGATGGCCAGATCTGAGTAGCATACTTAATTTGCCTTCCTCTTCACCAGCAAACGTACAAGAGAAAAAAATACACTTCACAATAGTAATAGTATTAAAATTCACAGTAGAATAACCCCAACAATACATGTGTAAGACTTCTTTGCAGAATTTTGTAAATTATTATTAAATAATATAAAATTACTAAATAGAGAAATAAATTTAATTATTACTTGATGTGAAAAACCAATATAATAAACAGTTGATTCTACCAAAAAATAATCTTTAACTTCAAATTAATCCCATTCAGAATCCCAACCAGTTTTTGAAAATGAAACTGAAAAATTTATTTAGAAAAGTAAATTTGTAGATGGTTTTAAAAATGAACAAAGATGAGCGTATTTTCCTTAGCAGTTTTGAAAACATTATAAAGTCATAGTAACTAAAAAGTGTGTTAATGGTGCATGAATCACCAGTGTAACAGAAGAATGTCCGGAAACAGAGCCATGTTTATATGGTAACTTTGAAATACCTTTTTATCTTGCTAATGACTTTCCGGTATTTTTGAGATTATAAGAACAGATTGTCAAAGGATGGGGTTACTAGTAATTTCCAAAAGTAGTAAACCTACTTTAAATTATTATTTCCTACCCTCAAACTGTTACTTACATTCTTTGAAACTTTTCAACCTTTTTTTCAGACTTTTGAGTCTCATAGAAAAAAAATAACATAACCAGAATTATATGTTAAAGGAAGATCTTATCATTATCTAATGTCTCAATGAGAACTAAAGTAACATCTCTAAGATGAAATCATTTTGATCACTTTTTTGAATCTTAGGGGCTGCAGTTATGGGTCCTCCTGGCCCTCCTGGATTTCCTGGAGAAAGGGGTCAGAAAGGTGATGAAGGACCACCTGGAATTTCCATTCCTGGACCTCCTGGACTTGACGGACAGCCTGGGGCTCCTGGGCTTCCAGGGCCTCCTGGCCCTGCTGGCCCTCACATTCCTCCTAGTAAGCTATATTTTTCTCCTATTAAGTTCTATTTTTGTTTTTGTTTATTTTGTTTATAAGTAACTCTAGCTAAAGGTTGGCCTCATTTGTTGCGTTTCTGATATCTAAGAAATTCTACCACTGCTTCTGCTTTTTGGGTTTTGGTAGTTCTTGGATGTTTACATTTGCTCTTCATATAGTATTTATCAGCAATGTTATATTTTCCTTTTGCTTATAGGTACTTTTATTTCTTCAGAGAATAGGTCTTTTTCTGGCTTGTCAGGCTTTCTTTTGTTTAATCTTCTGGATATTTCACAATTAGCTTGCTATCCTTTCTTTATCTTACTCAGGTGATGAGATATGTGAACCAGGCCCTCCAGGCCCCCCAGGATCTCCAGGTGATAAAGGACTCCAAGGAGAACAAGGAGTGAAAGGTTTGATCTCCAAACATATTCATTCCTTCATTTTCTTCATTCTTTCAAATCATCAGCAAAATCCCCTGTATCCTCCATCACACCTTAGCCACTGACTCCCATGGTCATACCCCAAGACCATCTCATTACCAATAGTGTTATACTTACATGACCTTGGTTTCATGCATCCCATTTTTTGGATCGCTCTCTTCTTTCTAGCTTACTACCTCTAGTAACCTGACTCCAGCAATACTCCAACCCCACTGAGACCTAGCAACTTTGACTAATGCTTAACTTTTTGATGTCCTTTCTTCCCTCTTAACCTTGCTTAAGTTCCATTATCAATCACTGTAATCAATTCCATTCATAAATCCATGATTCCTTTGCCCTTCTCTCACTTCATTGCACTCACTTGGAACAAAAGCATAATCCAAATTTTCATGTTTTCTGAGCCTACACTTTCTCTTCTCTTTTCAAGTTTTAACAGTTCCTCCCCTATTCTTACCTTGCTTCCTACTTCACTGACCAATTAAAGCAATAACAAGAGAACTTTCACTGATTGCTACCACCATATTTACTTACCTACTTGCACCTGTGCCCATATAGTCTCCCTTCTTGCATATTACTGTTACTGCTCCTATCTAAAGCCAGTTCTTCTATTTATACAATAGATTCCATTTCCTCTTATTTCCCCAAGGATTTTTTTTCCAGCAATTTTTGCCTCTCCGACATCACCAATTTTTCCCTCTCTATTCAGTCATTCCAAGGAGCATACAAATATGCTTTTTTCACCTATCTAAAAAAATGTAATCCTACATTCCCTGCCAGCTGTTTCTCTATTTTTCTATTCTCATTTGCAACAAAACTTCCTAAGAATTTTCTCCTCATTACCTCTAGATACTCTCCTCTTGTTTTCTCTTAAACATACTCCAATCAAGATTTCATCCCCTCTTCCCCCAACTCCCCACTGCCTACCACTCCACAAATGCTGGTCAGTCACCAGCAGTCTATATCCTACTAATCCAAATGTCAGGTCTGTCCTTTTTTTGCTTGCTTTTTGCCTTCTTTAAACATTTGCATCCCTTAGCTTTCAGTACATTTCCTGTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTGTGGTGTACATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATCCATGTAATTACCATCTAAACCAAAATATAGAACATTTTCAGGACCCTGGAAGACTCTTGTGCTCCCTACTCAGTATCCCCCAAAGGTAATCACTATTTTATCCTCTGGCATATATTAATTTGCCTAATCTTGAACTTTGTGTACATGGAATTATACTGTATGAGCTCTTTTGTGCCTGGTTTCTTTAGCTAAATATATGTGAGATATATCTATGTTCTTGTTTGTTGCAGTATTTTTCCACCATTCTTTGTTTTCCACTGCACATTACCTCAATATTCTAATGTTGATGGACATTTGGTCTGGAGCTATTGTGAATAAAGCTGTCATAAATATTCTTGTACGTGTATTTTTTTTGTAGGACATAAACACTAATTTT
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Task1_train_30798
A variant affecting Chromosome X, within the gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; X-linked Alport syndrome
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Task1_train_30799
Mutation context: Chromosome X, Gene COL4A5 (collagen type IV alpha 5 chain). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
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