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Task1_train_29100
A variant on Chromosome X in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
GAGAAAAACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGTTGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACAC
GAGAAAAACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGATGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACAC
Task1_train_29101
Given a variant located on Chromosome X and affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GAGAAAAACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGTTGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACAC
GAGAAAAACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGATGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACAC
Task1_train_29102
A variant found in Chromosome X affects CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29103
With a mutation on Chromosome X in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
AAACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGTTGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACGCACA
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Task1_train_29104
A variant on Chromosome X in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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Task1_train_29105
This is a variant in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; CDKL5 disorder
AACTGCAAAAATAGTGCAAAGAATTTCCTACTTCCTATACCCTTGACCTAGATTTTCCAAGTGTGTTAATATTTTATCATATTTGCTTTATCATTCTTTCTGTCTTTTTTCTCTTCCCTCATACACACATATAATTTTTCTCAGTGGTTTAAGTTGTAAACATGATGCCCCTTTAAAAACTTTAGTGCTGTTTCTTAAAAATGAGAGCATTGTTTTATATAACCGAAGTACTAATATGAAAATTAGAAAACTACTGACAACAGTACTATAATCTGTGAACATTTGAATTGTATCAATTGTTCTTCATAGCGAAAAAAGAACAAAAGCTTTTTCTTGTCCAGGATGTAATCCAGGATCATGCAATGTATTTCATTGTCATATCTCTTAATCTTCTTTAATCTGGAATAGTCGCTTCTTGTTACTCAGTTGTTTCTTGTCTTTCATGACCTTGACATTTTAAAAGAATATGGGCCAATTATTTAGTAAAATGTCCCTCAGCTTGGGCTTGTCTCTTGCTTCTTGTGATTAGATTCAGGTTTTGCATTTCTGGCAGGAATGCCACAGAAGTGGTGATGTGATACATCCTATCAGGGGGCATATAATGTTGGTTTGTCCCCTTATTGATGACGTTAACTTGATCATTTAATTAAGGTGGTGTCTGGCAGGATTCTTCAGTGTAAAATTACTATTTTTCTTCTTGTAATTAATAGGTATCTTGTGGATACTTTGAGATTAGATAATATCCTGTTTTCCATCAAATTTTCAACCACTAGTTTTAGCATGTATTGATCATACTTGCTTGAAATAATTATTACCAGAGTGATTGCCAAATGGCGATCTTCTAATTTTATCACTACATTTATTATTTGGAATTATACTTCGCAAAAGAGCTTTCTCTTCTCCCCCATTTATTTATTTATGTCAGTAAGGACTTTTAAAAAAATTATATGGGTTATAATCTGTTACTGTGCTTATTTACTTTGTTGCTCAAATATTCCCGATTAGGCCAGTGGGAGTCACATCAGTCTGACTCCTGTGTCCTTTTGAGGTACCCCTATCATTCTTTGAGCATTTCCTTACTTTCTGGCACCACAAAAATATGCCCTAGGCTCCTATGGTCCTTCTCCTGCCCCACCCTTGGAATCAGCCATTTCTTCAAGGAACCCTAGTTCCTTTTATCAGAGCACCAGCTGTGTTCATAGCTATAGGGGTATCATTGCTTCTAGGCCTTCTCAGCAGACAGAGCTAGGAAATATATGTATGTGAGTGCACATTTACACAAACACCTTTATATCTGTCTATACTCCTATATATTAAAAACTGAGCTTATATTGTTAACTCCAACTCCAAGCCTTCTCCCTTTTTATATTTGTTACTCCCTTTTATGAGAATAAGAAACCAAGGTCAGTATATTCACAGAATATTTACCTATTTGCCCAATCTTAGAACACACACAAACAAGTTTCATGTCATTGTATAAAAGCAGGTAGCTAAGTAGAATATAGTATTTGTTTATAATTCTTTTTATTTTTAGCTTTAGGAGAGTAGATAGTGAAAATGCTGTTTTTAAAAGTTAGCTGTGGTTAATTCATTTGTCCTTGTCCCCAAAAGTGTGGTTATATTATTCATTTCAAATACAGAGAGGTTCATTTGTTTGTATTCATTCCATTTTGGGTTCTTCGCTCCTATTACTGTTGGTTTCTTCTTCATTTTAAGTGTATAAAACATTAAAATGGATTGAAAAATAACTCTACAAAAAGGTAAGATTGGTTACTAGAGTACTGCAAATATAAAACTTACAGCTTTTAATTGTGTTTGTTTTTTTCAGGGAGTCATTTAATACTTCATGATTAGAACAAATATGTGAAAGTTCCCACCAACCAGTGAGAATTTCTTCCTTCAGACGGTTTTGGATCTTACTGCACAGCTTTCTGAGAAGTTCTTTTGGTGCCATGTTTTGTGGCTTGCATCAAAAGAGGAGTTTGTCTTCATGAAGATTCCTAACATTGGTAATGTGATGAATAAATTTGAGATCCTTGGGGTTGTAGGTGAAGGTAAGTTGGAATTTTTGCGTTCCTTGAGTTTTGAGCAATGAACAGTTAGTTATTCCTACCACCAAAAAGTTACTAATTAGATCCTGTTAATTTAACCTATATCAATTCACATGTGTGTCTAAGAGTAAAATATTAAAAATAAAATTACTCTTAAACAATTTGGGTCTCACTCTCCAATAAAAAATTAATAACTTTTTAAAACCCTTTAAAGTTTAATAAATCAAAGATTTTTTTCCCTTTTCTTTTAAAAAGAGCCCCAGTGTTACAACAGTCTTTGCCTTCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAATCATGAGTTCCTTAGTCTGCATTTTTTTTCTTGGTTCCATTTTATTTTTATATCAGCTAGGCTTATTTTGAATAACTTAAATTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAAGACAGAGTCTCACTGTTACCCAGACTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCATGTTGGTGAAATTTTACTTAATACCTGGTAAATAAACAAATAAGTAAATTCTGTTTCTTTGAAAATGGGAGACTATGTTTTGTAAATTCTGAGGCATACAATTTTATCTCTGAAATCAGGGTGTATCTTATAATCAGTATCATGTCACAGTTTAATTGGCAGCATTCTCCCTTTCCTAATAGTACATAAAATAATGCTCATGACCAATGATATACCATTGATTTGATGAAATATGATGTCATTTTGTATAAACTGACTCCTAAAAAAAAATCATTTCTTCTGATTTTTCCTGCTTAGTGATTTTTGCTCTAGACTTAAAGATAACTTTGGAAATTTTGATAAATGATTCTGTTAACAGAAGATAAGTGATTATAATTATGGTTTCTTAGCATTTATATCTTTAAAGCATATGTTACAAAAATTTCATATTTCAGAATTTTCAAATAAACTCTGAATTCCTAAAGGACTAAAAAAGTTCACCTATGTGAACAGCAAAGCTGTTATTAAGTTTTAAAGTTGGCAAATCCTTTCAAATACATAGAAACAATTAAAATAAAGAGTTTAATCATTGGATGCTTGTTTCAAGGTCTGAAATTCAAACCATACAAAACAAATAGGTCTTTGTTCCTTCACTAGTCAACTCCTCTTCCATTTCTTCATCGATGTTATGTAAAAATTTCATTTTCAGTGTCTTGCTTACCATCTGTTCTGGAATAGCCTATTTTATTTTTCAAAAGTATTAGAATTAGAGACCAATGCAATAAAGCTGCTGACTGGAGAAGGCTAGCACATACGGTGTAACAAGGTTAGAATGCTCCAGATTCTGGGCCTAAGTTTTTCTGGATCATAACTAGTTTTTCTCATTATAGCCATAGGTGATCATCTTCTTTGGGATTGGCTCAAAATTACCAGACTGTTATATATATATATATATATCAGAATATGTTACTTTGTTATCAGAACTACCATTGCTGTATGTTTCTTTCTTTGGAAAGCACCTCACATGTATTTTTGGCTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACGCACAC
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Task1_train_29106
A variant has been detected on Chromosome X in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; not provided
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CTAGGATATACATATAAAGTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCTGTCAAGCAAACTCTGCATTCTTGTAGTTTAGACAGTGTATTTTTTACCCCATAGAATAACTGGCATAGGCAGTTAGAATTGGACAATTGCCTGGCAATTGTGGAGTTAAGTTAGATGGTTATAATGGCTGGTTCTATGCTAACTGTGATAATAGGATTCATCCATCTCTACCAAAGTGAGGGAGACTTGTTCAGGTCCCATAGACTGTGTTGGAGACACATTTCCCAATTTTGTATCCGTGAAGCCCCCTTCTCATAGATGAATGCAGGCTTGCCAGTCTGCTAATGTTAATGTTCTTGATGTTTCTGCAAAGCTCAGCTATCATTCATTACATTTTGATTCTCTTAATTAGATTTTTCACATTATAATTTTAACCTCAGTTTCCTGAGTACTTTGCTGTCAACTCTGTCCTACTTCTAAGGAAGAAGTCTATTGCCTAGATAATAGGATAAGTAACCCCAAAGGTAGTTACTTGTTGAAATACACCAAAGACAGTGGGAGTGCTTGTCGCCTTTGTGCATGAACTGAGTCTTTATTTATGGCAAAAGGTAGCAAATCCTACTAGCTATTAATTGGAATACTGAGGCCTGGACTACTTTGCCAGTCAGGAGAGACATTCAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCATGTCTCTACAAAAAAAACTTAAAAAACAAAACAAAACAGAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGGCATTTCAGTATCCTAGAGGAAGATTTTAATGTCTTCTAGAACAGATAATGTATTTGGTGGGCTCTGTGCTTGAGCTTACTACTGGGATGTCATTAGCTCTTAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTCGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTGGACTACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCAACTATACCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTAGCTCTTAAGTTTTAAGTTCCACAGAATCTTCTGAGTTAATTTTCCTTTATTCTCAAAGTTCTTGAGACCAAATCTTGTCTCCATAAATGTGTAACCCTACATTTAAACGTATCGCCAGTGAAATTTTCTTTAAAAAGAAACATTTAAAAATACTTGTTGGAAGAAATGACTTGTCTATACTCTTGATTTATAATAAATGTATAATAAAGTATGTTCCATTTGTATGTGGCTCATTATTGCATTATCACTATAGAATCTTGTCACTTTAGTAGTCATTATTATAACACTGAGAAGCAATGTCAGTATAGCAGAGCTTTGTAGTTTGTATGCGTGCCCTTGATTGTTTACTTCTTTTTATTATAGGAGCCTATAGAGTTGTACTTAAATGCAGACACAAGGCAAGTACATTATTTTTAAAAAGAAATATCTGTATATGTTTAACTGTTTTGAAACTAATGTAGTGGTCTTTGCGTGTGGGCATGTACAGGTTGAGCATTCCTTATCTGAAATGCTTGAGACCAGAAATGTTTTGGATTTTTTTGGATTTTGGAATATTTCCATATATGTAATGAGATACCTTGGGGATGGGACCCAAGGCTAGACACAAAATTCATTTATGTTTCATATATACTTAATACATATAGCTTGAAGGTAATTTTATGCAATATTTTAAGTTTTTGCCTAAAACAAAGTTTAAATACTTATATGTGGAATTTTCCACTTGTGGCATCATATCAGTACTCAAAGTTTTGGATTTTGGAGCATTTTGGATTTTTGAATTAGGGATGCTCAACCTGTAATTAAAACTCTGGTTATGAGGATGTTGTTTAATGAAGTGGAATTAATATGTGAATGCTGCCAGAAAGAGACTACTTTTAGATAAGCTTGATCATGGTTGGGTAGTCCTTAGTTCTTAGCAATCACGTGCTATTTTTTTTTTTCAACTGACCTATGCCGTGCACCTCATAATGACATTTAGATCAACAGTGGACAGCATGTATGATGGTGGTCCCGTAAGATTATGATATGGTATTTTTTGTTTAGATAAAAAACATTTTCAGATACACAAATACTTATCATTGACTATGGTACTCAGTAAGGTAACATGCTATACAGGTTTGTAGCCTTGAAACAATAGGCTATACCATGTAGCCTAGATGTGTAGTAGGCTATACCATCTAGGTTTGTGTAAGTACACTCTATGATGTTTGCACAGTGATAAAAATCACCTAATGACATATTTTTCAGAATGTATTCTTGTCATTAAGTGATGCATGACTGTATAAGTGAAAAGCTGCCTAATGGGAAAAGAGAAAAGGTGGTGGGACAGGAATAAGAAGGCAGGGCAGTGACAGATTTAATTTATGTTCAAGTACTTATGAGCAAAGAGTTTTTTTAAAAATTATTTTTCATGTAGACCCATTAACTTAGATTGCTTGATGCATTTGAATCCAGATTTTGAAGGGTAATAAGGTAGGTGTTTGGATATGAGCTAGAACTTGGGATAATAGTGTAGATTATGATTACTGGCTATAGTTGATTACCCTTGAACAGCTGTGAAATGAACCTTACTAGAAATTATTTTACTATGGTAATAATCACAAATTATTCAGAGAAGTTATTTGAAGTTTCCATAGCTGTTATTCAGTTGTAAGCATGTTTTACTGGGAGAGTAACTTTCAGATGGCAAGTGTTGAAACTGTAACAAACATTAGTTTAAATATTTTTCTATTATGGCATACCTAGTCTGAGTATTTGGCTTCATTTGCATATAATTTGTTAAGACCAAGGTTTTAAGTTTTTTCGTGATGTTTCAGAATGATATAATTTATGTCTGTGGTGATTTTAGCAATTTAACCCAAAACATTTAAACTCTTGAATCTGTCGTCTATTGAAAATAATGTATGTGTGTGTATGTATGTAAATATGCACACACATAAATAAAGATGATACTCTTATATTTGCTTTTTCTTTCCTATTGTACAAAATACTACCTGCCTTTTGAATTTAAGCCTTCGTGACACTTAATATATTTTTGTGTTTAGATCACAGATCTCTTACTTCCATGCAATGGCTTTTGTATTCTTCTTGAAATTGGGTGATTGAACTATTTTATGTTAATAATAGTTATCTGAAGATCTCTTTGCCATTAAATTTTCAAAAATGGTTCGAATACTATTGGTTCTTGATTAAGGATGATTAAGAATTTAAAATAATAAATATAATAAAAATAAATTTAGCACCTTGAACACCTTGTTAAGAAATATTACTGTAGTTTGAAATTAAACAAATGAAAAGCTCCCTAATAAAATGCTAAATGCTATACTTTTAATGACTTGCCTTTAGTTATAAGTTTCTGAAGCTTAAAAAAAATTCCTGGGTGGATATTACTTGGGAGAAATAGGTTATTAGTTTCTAA
Task1_train_29107
The gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; CDKL5 disorder
GTATATAACAATCTGTCACCAGGAACGGTGACTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATCCAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGTTGCAGTGAGTGAGCTTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGATGAGAGAGCGAGACTGTCTCAAAACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCCCTGTCAAGCAAACTCTGCATTCTTGTAGTTTAGACAGTGTATTTTTTACCCCATAGAATAACTGGCATAGGCAGTTAGAATTGGACAATTGCCTGGCAATTGTGGAGTTAAGTTAGATGGTTATAATGGCTGGTTCTATGCTAACTGTGATAATAGGATTCATCCATCTCTACCAAAGTGAGGGAGACTTGTTCAGGTCCCATAGACTGTGTTGGAGACACATTTCCCAATTTTGTATCCGTGAAGCCCCCTTCTCATAGATGAATGCAGGCTTGCCAGTCTGCTAATGTTAATGTTCTTGATGTTTCTGCAAAGCTCAGCTATCATTCATTACATTTTGATTCTCTTAATTAGATTTTTCACATTATAATTTTAACCTCAGTTTCCTGAGTACTTTGCTGTCAACTCTGTCCTACTTCTAAGGAAGAAGTCTATTGCCTAGATAATAGGATAAGTAACCCCAAAGGTAGTTACTTGTTGAAATACACCAAAGACAGTGGGAGTGCTTGTCGCCTTTGTGCATGAACTGAGTCTTTATTTATGGCAAAAGGTAGCAAATCCTACTAGCTATTAATTGGAATACTGAGGCCTGGACTACTTTGCCAGTCAGGAGAGACATTCAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCATGTCTCTACAAAAAAAACTTAAAAAACAAAACAAAACAGAAAAAAAAAAAAAAAGAGGGGCATTTCAGTATCCTAGAGGAAGATTTTAATGTCTTCTAGAACAGATAATGTATTTGGTGGGCTCTGTGCTTGAGCTTACTACTGGGATGTCATTAGCTCTTAAGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTCGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTGGACTACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCAACTATACCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGTTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCCTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCTGGCCTAGCTCTTAAGTTTTAAGTTCCACAGAATCTTCTGAGTTAATTTTCCTTTATTCTCAAAGTTCTTGAGACCAAATCTTGTCTCCATAAATGTGTAACCCTACATTTAAACGTATCGCCAGTGAAATTTTCTTTAAAAAGAAACATTTAAAAATACTTGTTGGAAGAAATGACTTGTCTATACTCTTGATTTATAATAAATGTATAATAAAGTATGTTCCATTTGTATGTGGCTCATTATTGCATTATCACTATAGAATCTTGTCACTTTAGTAGTCATTATTATAACACTGAGAAGCAATGTCAGTATAGCAGAGCTTTGTAGTTTGTATGCGTGCCCTTGATTGTTTACTTCTTTTTATTATAGGAGCCTATGGAGTTGTACTTAAATGCAGACACAAGGCAAGTACATTATTTTTAAAAAGAAATATCTGTATATGTTTAACTGTTTTGAAACTAATGTAGTGGTCTTTGCGTGTGGGCATGTACAGGTTGAGCATTCCTTATCTGAAATGCTTGAGACCAGAAATGTTTTGGATTTTTTTGGATTTTGGAATATTTCCATATATGTAATGAGATACCTTGGGGATGGGACCCAAGGCTAGACACAAAATTCATTTATGTTTCATATATACTTAATACATATAGCTTGAAGGTAATTTTATGCAATATTTTAAGTTTTTGCCTAAAACAAAGTTTAAATACTTATATGTGGAATTTTCCACTTGTGGCATCATATCAGTACTCAAAGTTTTGGATTTTGGAGCATTTTGGATTTTTGAATTAGGGATGCTCAACCTGTAATTAAAACTCTGGTTATGAGGATGTTGTTTAATGAAGTGGAATTAATATGTGAATGCTGCCAGAAAGAGACTACTTTTAGATAAGCTTGATCATGGTTGGGTAGTCCTTAGTTCTTAGCAATCACGTGCTATTTTTTTTTTTCAACTGACCTATGCCGTGCACCTCATAATGACATTTAGATCAACAGTGGACAGCATGTATGATGGTGGTCCCGTAAGATTATGATATGGTATTTTTTGTTTAGATAAAAAACATTTTCAGATACACAAATACTTATCATTGACTATGGTACTCAGTAAGGTAACATGCTATACAGGTTTGTAGCCTTGAAACAATAGGCTATACCATGTAGCCTAGATGTGTAGTAGGCTATACCATCTAGGTTTGTGTAAGTACACTCTATGATGTTTGCACAGTGATAAAAATCACCTAATGACATATTTTTCAGAATGTATTCTTGTCATTAAGTGATGCATGACTGTATAAGTGAAAAGCTGCCTAATGGGAAAAGAGAAAAGGTGGTGGGACAGGAATAAGAAGGCAGGGCAGTGACAGATTTAATTTATGTTCAAGTACTTATGAGCAAAGAGTTTTTTTAAAAATTATTTTTCATGTAGACCCATTAACTTAGATTGCTTGATGCATTTGAATCCAGATTTTGAAGGGTAATAAGGTAGGTGTTTGGATATGAGCTAGAACTTGGGATAATAGTGTAGATTATGATTACTGGCTATAGTTGATTACCCTTGAACAGCTGTGAAATGAACCTTACTAGAAATTATTTTACTATGGTAATAATCACAAATTATTCAGAGAAGTTATTTGAAGTTTCCATAGCTGTTATTCAGTTGTAAGCATGTTTTACTGGGAGAGTAACTTTCAGATGGCAAGTGTTGAAACTGTAACAAACATTAGTTTAAATATTTTTCTATTATGGCATACCTAGTCTGAGTATTTGGCTTCATTTGCATATAATTTGTTAAGACCAAGGTTTTAAGTTTTTTCGTGATGTTTCAGAATGATATAATTTATGTCTGTGGTGATTTTAGCAATTTAACCCAAAACATTTAAACTCTTGAATCTGTCGTCTATTGAAAATAATGTATGTGTGTGTATGTATGTAAATATGCACACACATAAATAAAGATGATACTCTTATATTTGCTTTTTCTTTCCTATTGTACAAAATACTACCTGCCTTTTGAATTTAAGCCTTCGTGACACTTAATATATTTTTGTGTTTAGATCACAGATCTCTTACTTCCATGCAATGGCTTTTGTATTCTTCTTGAAATTGGGTGATTGAACTATTTTATGTTAATAATAGTTATCTGAAGATCTCTTTGCCATTAAATTTTCAAAAATGGTTCGAATACTATTGGTTCTTGATTAAGGATGATTAAGAATTTAAAATAATAAATATAATAAAAATAAATTTAGCACCTTGAACACCTTGTTAAGAAATATTACTGTAGTTTGAAATTAAACAAATGAAAAGCTCCCTAATAAAATGCTAAATGCTATACTTTTAATGACTTGCCTTTAGTTATAAGTTTCTGAAGCTTAAAAAAAATTCCTGGGTGGATATTACTTGGGAGAAATAGGTTATTAGTTTCTAAGTTAAATTTGACTTTTTC
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Task1_train_29108
Given this context: Chromosome X, gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; CDKL5 disorder
CAACATACAATAAGATGTCCAATATTACTACTACCATTTGAGAAAAATTTACTGGAAGAAAATATACCAAAATATTAACAAGGGTTAATTTTGTAAATGTCTTCTCTATATCCTTTTTGTACCCTTTGTATTCTTTTTGTGTTTTCTGTAATGAGTTTATATTATTTTTATAAGCAGTTTGAATACATGTGAAATGTTAAATTCTTTCCAGTATCTTCTCTTAATTGCATGTGTTTTTCACTAAACACTGAATTGGTTTAATGTAGAAAACTTCATCTGTTCGATTTCATTCTTTAAGTAAATACATAAACCATATCGGGGGAGGCAGAGAAAGTGAGTTTTGAGGAGAGAGGATTTTCATGGTATTCTTGAAAGGATAAATAAAAGAATACACATTTTATTTGACCCCCATTAGCCATCTGCTTTATACAGTAAATTGTGTTTATGAGATGCCAGAGAAAAATAACTAATGAATTTATTCAAGGTGGTATAAATGTGCCAGTTACAAATTTAAATTTGTAGTCATATCAGTGGACAGTTTTGAACTGAGTAAGATCTTTTATAAAATCAGACAAAGTTTTAACGCTTAGGATGCAATGAAAGAAATGTATGTGGGAGTCTTTCAGTTAGAATAGAATATAAGATGGAACACTACCTGGAACAATATTCATTTGAGATGTGCGCAGTTTTTCTCTATTCCTGGAAGCTACATCTTTGTTCTGTGAGAAAAGCAAGAGGAGGTTCCTGATATGGTCTGTCCTTTCAGTTATGCTGTAGGTAGATTGCTAGCTAGAGCCATTTGAAAAGGAGCAGGGTAAGAACATGATATCAATGTATTATGGGAGAGTAGCATACATGAAAGAGTCACCTTTGTACTACGTGGGATAATATTCCAGCTGATAATCTCCTGCATTACTTAAAATTGGCAGTTCTTCCTTCCCAATAATAAAATACCTGGAAGAAGGAGTTTCTTTAAGTCAGAAGATCCATTAATGTACAAATAAGTTGTACCCTATACATACAAGTAAGTTGTCTCTACCCTACAATCCTGTTCCTTCATTAAAAACAAAAACACAGTACCTTTAAGAAGTATCTTTTTCCTCCATAATTTATAGCACTTGCCTGGTATTGTGTTTAATTTTAAAGTTTTTGTTTTGATGCAGGGACAACGTTTTATTAAATATTAAAAGATTTGATCTGAAAGTGTCCCCACTTAAAGTAAAAAAGAACAGGCCTGAGTCATTCAGAAGGCTTTTATATGACATGTTGGCTTTGAAGAATTTGTATTAATTATTTTGCCAAAAGCTTTTTTATTCCTTTTATAGACCAGAATTGAATAAAAATTGTTTAGTTTAGTGGTACTTAGTTCTTAGCATTTCCATTTCCTTTCCAGCCCTTGTTTTCTTTCCTCCCAACCAAAAACAACAAAAAAGATTTTCATATTTTCTTTTAAAGCAGAATTCTGTTATTTCTTCTGTTCAGAAGAGATAAGGGCAGGACGAAGGTGATGATTGGTATTTGGTGATGGAATGTTTATCTCACTTTGGATTTGCAGTGGCCATCAATAGGGGCGAGCTGGTGAAAATTAGATATGCTTGTTAGCATTCTGCTACCAGCAACTACTGTGTATTGGAGAGGCCCTTTCTTGGTCTTAGAAGGCCAATTAAAATGTGTCTCTGGACTTCAGAGGGCAGTACAGATGACAGTCTGACACTCATCCTGGCACTTTTGAGTATCCTCAAGACATTGACACTAATGATTTATGAGTTACGCATATTCTGTCACCATATCTGCTCTTTGCTCCACACCCTCTCCCTTTCTCCTTTCCCTTCCTTGACAATGTTTGTGGGGTGATAAGAAAGAGATTTTGGAACCAAGAAATGAGAGGTGGCGGGGGAGAGGAAGATGATATATTTTTAACACTCTGGCTTCTTGCTACTCTGTCCCAGAATATACCCCCAGGCAACTGGAATCCCCAGTCGGAAAAACACTGGAGAATGACTTTCCTTCTGCTTCTTTTCCCTTGCAGGAAACACATGAAATTGTGGCGATCAAGAAATTCAAGGACAGTGAAGGTAGATATATATATATATATATATATATCTGTATATATGTATTTTTCCTTCTGTATAAAGTTTTTATACATAGAGTGTGGAAGAAGTGGGATCTAGCTGGTCAGACACTGTCTATTCCTGATATTTTGAAGTCACAATCTCAGAAAGTGAATATAGCTTATTTCTTATGCTTTGCTTTCAAACATTTAGTTCCTTTTATGTGAATCTTTTCAAATCTCATGATATTAGAAAATTCATCTTTTTATTTTAAGGTTGCAAGCAGCATTGGAAATCTTGCTCCAAAGGCTGGTTAGAAGGCATGTTGTTTATGCTGTTTCTAAATATTATTAAAATAAAAAAACTGGCTTCAAGTAAATACTTCTGTGGGTCCACATAAATAGCAAGTACTACATGAAAGATTTCAGTATTGGTTACGGTGATCTCCAGCTCCTAGTCAGAGTTAGAAATACAAGGATATATTGAGGGATTGATTTTATATTTAGAATAATGCATTGAGAGAATAAAAGCTTTTTAAGAAGAAATACTATGCTTAGGGGCCTTCATCACATCCAGACCATTTCAGACAGAGTTGTAAAATTACCCCATGCTGGGCAAGAAAGTTTAAAATAATGCATTTCAGTAGTTCATTAGTTTTAAAATCTAGACTGTTGGCCATCCAAAGATAGCCAAATAGAGAAACTGATAACAAAAATAGGTATGGCCTTTAAGGTGCTCTAGACAACATTTTTTTCAGACTTTTTGGACTGAGACCCACAGTAGAAATATATTTCATATCCTAACCCAGTGTCCGCACACATATGTAACACTATATGTAAATGAAGCAAAAATGTCACGAACTTCATCTTATGAATGTGAAGCTCTCTACTTTCTGTTCTTTCCTGTTCATGTAAATGCCTATTGTGACATCAAATGGATTGATTTCACTACTAGTAAGTCAGAGCCTGCTATTTGAAAAACTATGGTCTAAGAGTAAGAAGTACCAACACAGCATCAATCTTCATATCTAATTAGAAGTGTGGAAATAGCAGTCATAGCTTACCTTCATCAGCACACATCCCCTAAGTGATGTAAGACACCAGCCTCTATATTTATGAACAGTTTCATCACCCTCACCTCAAAGACTTAGCAAACATTAAATAACAAAAAGGGACTTGCTCCAGGATAGATGTAGTAGTATTTGATGTAATCCATCTCTGATGTGCTAGTTATATGAAACACATGCATATCAGCTGGGAACTTTAGCAGTCATTGTATGGGCAGGCTTAAAGGGAAGGTAAAAAGTGGAAGGTAAAAAAGAACTTTTTGCTTGTTCTGGGGGGACAAAAAAATCTTGCTTCAAATGGGATATTTGTGGTCTAGCAGGAAGCAGTAGCTCCAGGCTATCCCACTGTGATACCATTGGAAATGAGCTCTTTGAGCAGTGACTTTGGGTCAGCAGGTGGCTGAGAGACAAATGGTGATTTCCTAAAAAGAATGGTTGCAACAGTAGATCAAAGCACAACCTTCGCATGCATGTAAAGGCTTCTGGCTGTGCATTCATCTTTCAGGGCATATTGGCAAGCATCAGTTACCACCAAAAATAATAACTGTCATCAAATTTTGTAAAAAGTACAATCTAGGCCATGTATGCCACCTTTTTTTGTTTATGAGACAGGGTCTCACACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTCCCCGGGCTCAAGTGATTCTACAGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTATTTGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTGCTGAGCTCAAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCTTGTCCAGCCCCATTACTTTCTTTTTAAGTAAATACCATGTTCTTTATAATCTCTGTCTTGTGCATACCAATTCTTAGCTTCAATTATATATTTTTAC
CAACATACAATAAGATGTCCAATATTACTACTACCATTTGAGAAAAATTTACTGGAAGAAAATATACCAAAATATTAACAAGGGTTAATTTTGTAAATGTCTTCTCTATATCCTTTTTGTACCCTTTGTATTCTTTTTGTGTTTTCTGTAATGAGTTTATATTATTTTTATAAGCAGTTTGAATACATGTGAAATGTTAAATTCTTTCCAGTATCTTCTCTTAATTGCATGTGTTTTTCACTAAACACTGAATTGGTTTAATGTAGAAAACTTCATCTGTTCGATTTCATTCTTTAAGTAAATACATAAACCATATCGGGGGAGGCAGAGAAAGTGAGTTTTGAGGAGAGAGGATTTTCATGGTATTCTTGAAAGGATAAATAAAAGAATACACATTTTATTTGACCCCCATTAGCCATCTGCTTTATACAGTAAATTGTGTTTATGAGATGCCAGAGAAAAATAACTAATGAATTTATTCAAGGTGGTATAAATGTGCCAGTTACAAATTTAAATTTGTAGTCATATCAGTGGACAGTTTTGAACTGAGTAAGATCTTTTATAAAATCAGACAAAGTTTTAACGCTTAGGATGCAATGAAAGAAATGTATGTGGGAGTCTTTCAGTTAGAATAGAATATAAGATGGAACACTACCTGGAACAATATTCATTTGAGATGTGCGCAGTTTTTCTCTATTCCTGGAAGCTACATCTTTGTTCTGTGAGAAAAGCAAGAGGAGGTTCCTGATATGGTCTGTCCTTTCAGTTATGCTGTAGGTAGATTGCTAGCTAGAGCCATTTGAAAAGGAGCAGGGTAAGAACATGATATCAATGTATTATGGGAGAGTAGCATACATGAAAGAGTCACCTTTGTACTACGTGGGATAATATTCCAGCTGATAATCTCCTGCATTACTTAAAATTGGCAGTTCTTCCTTCCCAATAATAAAATACCTGGAAGAAGGAGTTTCTTTAAGTCAGAAGATCCATTAATGTACAAATAAGTTGTACCCTATACATACAAGTAAGTTGTCTCTACCCTACAATCCTGTTCCTTCATTAAAAACAAAAACACAGTACCTTTAAGAAGTATCTTTTTCCTCCATAATTTATAGCACTTGCCTGGTATTGTGTTTAATTTTAAAGTTTTTGTTTTGATGCAGGGACAACGTTTTATTAAATATTAAAAGATTTGATCTGAAAGTGTCCCCACTTAAAGTAAAAAAGAACAGGCCTGAGTCATTCAGAAGGCTTTTATATGACATGTTGGCTTTGAAGAATTTGTATTAATTATTTTGCCAAAAGCTTTTTTATTCCTTTTATAGACCAGAATTGAATAAAAATTGTTTAGTTTAGTGGTACTTAGTTCTTAGCATTTCCATTTCCTTTCCAGCCCTTGTTTTCTTTCCTCCCAACCAAAAACAACAAAAAAGATTTTCATATTTTCTTTTAAAGCAGAATTCTGTTATTTCTTCTGTTCAGAAGAGATAAGGGCAGGACGAAGGTGATGATTGGTATTTGGTGATGGAATGTTTATCTCACTTTGGATTTGCAGTGGCCATCAATAGGGGCGAGCTGGTGAAAATTAGATATGCTTGTTAGCATTCTGCTACCAGCAACTACTGTGTATTGGAGAGGCCCTTTCTTGGTCTTAGAAGGCCAATTAAAATGTGTCTCTGGACTTCAGAGGGCAGTACAGATGACAGTCTGACACTCATCCTGGCACTTTTGAGTATCCTCAAGACATTGACACTAATGATTTATGAGTTACGCATATTCTGTCACCATATCTGCTCTTTGCTCCACACCCTCTCCCTTTCTCCTTTCCCTTCCTTGACAATGTTTGTGGGGTGATAAGAAAGAGATTTTGGAACCAAGAAATGAGAGGTGGCGGGGGAGAGGAAGATGATATATTTTTAACACTCTGGCTTCTTGCTACTCTGTCCCAGAATATACCCCCAGGCAACTGGAATCCCCAGTCGGAAAAACACTGGAGAATGACTTTCCTTCTGCTTCTTTTCCCTTGCAGGAAACACATGAAATTGTGGTGATCAAGAAATTCAAGGACAGTGAAGGTAGATATATATATATATATATATATATCTGTATATATGTATTTTTCCTTCTGTATAAAGTTTTTATACATAGAGTGTGGAAGAAGTGGGATCTAGCTGGTCAGACACTGTCTATTCCTGATATTTTGAAGTCACAATCTCAGAAAGTGAATATAGCTTATTTCTTATGCTTTGCTTTCAAACATTTAGTTCCTTTTATGTGAATCTTTTCAAATCTCATGATATTAGAAAATTCATCTTTTTATTTTAAGGTTGCAAGCAGCATTGGAAATCTTGCTCCAAAGGCTGGTTAGAAGGCATGTTGTTTATGCTGTTTCTAAATATTATTAAAATAAAAAAACTGGCTTCAAGTAAATACTTCTGTGGGTCCACATAAATAGCAAGTACTACATGAAAGATTTCAGTATTGGTTACGGTGATCTCCAGCTCCTAGTCAGAGTTAGAAATACAAGGATATATTGAGGGATTGATTTTATATTTAGAATAATGCATTGAGAGAATAAAAGCTTTTTAAGAAGAAATACTATGCTTAGGGGCCTTCATCACATCCAGACCATTTCAGACAGAGTTGTAAAATTACCCCATGCTGGGCAAGAAAGTTTAAAATAATGCATTTCAGTAGTTCATTAGTTTTAAAATCTAGACTGTTGGCCATCCAAAGATAGCCAAATAGAGAAACTGATAACAAAAATAGGTATGGCCTTTAAGGTGCTCTAGACAACATTTTTTTCAGACTTTTTGGACTGAGACCCACAGTAGAAATATATTTCATATCCTAACCCAGTGTCCGCACACATATGTAACACTATATGTAAATGAAGCAAAAATGTCACGAACTTCATCTTATGAATGTGAAGCTCTCTACTTTCTGTTCTTTCCTGTTCATGTAAATGCCTATTGTGACATCAAATGGATTGATTTCACTACTAGTAAGTCAGAGCCTGCTATTTGAAAAACTATGGTCTAAGAGTAAGAAGTACCAACACAGCATCAATCTTCATATCTAATTAGAAGTGTGGAAATAGCAGTCATAGCTTACCTTCATCAGCACACATCCCCTAAGTGATGTAAGACACCAGCCTCTATATTTATGAACAGTTTCATCACCCTCACCTCAAAGACTTAGCAAACATTAAATAACAAAAAGGGACTTGCTCCAGGATAGATGTAGTAGTATTTGATGTAATCCATCTCTGATGTGCTAGTTATATGAAACACATGCATATCAGCTGGGAACTTTAGCAGTCATTGTATGGGCAGGCTTAAAGGGAAGGTAAAAAGTGGAAGGTAAAAAAGAACTTTTTGCTTGTTCTGGGGGGACAAAAAAATCTTGCTTCAAATGGGATATTTGTGGTCTAGCAGGAAGCAGTAGCTCCAGGCTATCCCACTGTGATACCATTGGAAATGAGCTCTTTGAGCAGTGACTTTGGGTCAGCAGGTGGCTGAGAGACAAATGGTGATTTCCTAAAAAGAATGGTTGCAACAGTAGATCAAAGCACAACCTTCGCATGCATGTAAAGGCTTCTGGCTGTGCATTCATCTTTCAGGGCATATTGGCAAGCATCAGTTACCACCAAAAATAATAACTGTCATCAAATTTTGTAAAAAGTACAATCTAGGCCATGTATGCCACCTTTTTTTGTTTATGAGACAGGGTCTCACACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTCCCCGGGCTCAAGTGATTCTACAGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTATTTGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTGCTGAGCTCAAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCTTGTCCAGCCCCATTACTTTCTTTTTAAGTAAATACCATGTTCTTTATAATCTCTGTCTTGTGCATACCAATTCTTAGCTTCAATTATATATTTTTAC
Task1_train_29109
An alteration has been detected in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
ACAATAAGATGTCCAATATTACTACTACCATTTGAGAAAAATTTACTGGAAGAAAATATACCAAAATATTAACAAGGGTTAATTTTGTAAATGTCTTCTCTATATCCTTTTTGTACCCTTTGTATTCTTTTTGTGTTTTCTGTAATGAGTTTATATTATTTTTATAAGCAGTTTGAATACATGTGAAATGTTAAATTCTTTCCAGTATCTTCTCTTAATTGCATGTGTTTTTCACTAAACACTGAATTGGTTTAATGTAGAAAACTTCATCTGTTCGATTTCATTCTTTAAGTAAATACATAAACCATATCGGGGGAGGCAGAGAAAGTGAGTTTTGAGGAGAGAGGATTTTCATGGTATTCTTGAAAGGATAAATAAAAGAATACACATTTTATTTGACCCCCATTAGCCATCTGCTTTATACAGTAAATTGTGTTTATGAGATGCCAGAGAAAAATAACTAATGAATTTATTCAAGGTGGTATAAATGTGCCAGTTACAAATTTAAATTTGTAGTCATATCAGTGGACAGTTTTGAACTGAGTAAGATCTTTTATAAAATCAGACAAAGTTTTAACGCTTAGGATGCAATGAAAGAAATGTATGTGGGAGTCTTTCAGTTAGAATAGAATATAAGATGGAACACTACCTGGAACAATATTCATTTGAGATGTGCGCAGTTTTTCTCTATTCCTGGAAGCTACATCTTTGTTCTGTGAGAAAAGCAAGAGGAGGTTCCTGATATGGTCTGTCCTTTCAGTTATGCTGTAGGTAGATTGCTAGCTAGAGCCATTTGAAAAGGAGCAGGGTAAGAACATGATATCAATGTATTATGGGAGAGTAGCATACATGAAAGAGTCACCTTTGTACTACGTGGGATAATATTCCAGCTGATAATCTCCTGCATTACTTAAAATTGGCAGTTCTTCCTTCCCAATAATAAAATACCTGGAAGAAGGAGTTTCTTTAAGTCAGAAGATCCATTAATGTACAAATAAGTTGTACCCTATACATACAAGTAAGTTGTCTCTACCCTACAATCCTGTTCCTTCATTAAAAACAAAAACACAGTACCTTTAAGAAGTATCTTTTTCCTCCATAATTTATAGCACTTGCCTGGTATTGTGTTTAATTTTAAAGTTTTTGTTTTGATGCAGGGACAACGTTTTATTAAATATTAAAAGATTTGATCTGAAAGTGTCCCCACTTAAAGTAAAAAAGAACAGGCCTGAGTCATTCAGAAGGCTTTTATATGACATGTTGGCTTTGAAGAATTTGTATTAATTATTTTGCCAAAAGCTTTTTTATTCCTTTTATAGACCAGAATTGAATAAAAATTGTTTAGTTTAGTGGTACTTAGTTCTTAGCATTTCCATTTCCTTTCCAGCCCTTGTTTTCTTTCCTCCCAACCAAAAACAACAAAAAAGATTTTCATATTTTCTTTTAAAGCAGAATTCTGTTATTTCTTCTGTTCAGAAGAGATAAGGGCAGGACGAAGGTGATGATTGGTATTTGGTGATGGAATGTTTATCTCACTTTGGATTTGCAGTGGCCATCAATAGGGGCGAGCTGGTGAAAATTAGATATGCTTGTTAGCATTCTGCTACCAGCAACTACTGTGTATTGGAGAGGCCCTTTCTTGGTCTTAGAAGGCCAATTAAAATGTGTCTCTGGACTTCAGAGGGCAGTACAGATGACAGTCTGACACTCATCCTGGCACTTTTGAGTATCCTCAAGACATTGACACTAATGATTTATGAGTTACGCATATTCTGTCACCATATCTGCTCTTTGCTCCACACCCTCTCCCTTTCTCCTTTCCCTTCCTTGACAATGTTTGTGGGGTGATAAGAAAGAGATTTTGGAACCAAGAAATGAGAGGTGGCGGGGGAGAGGAAGATGATATATTTTTAACACTCTGGCTTCTTGCTACTCTGTCCCAGAATATACCCCCAGGCAACTGGAATCCCCAGTCGGAAAAACACTGGAGAATGACTTTCCTTCTGCTTCTTTTCCCTTGCAGGAAACACATGAAATTGTGGCGATCAAGAAATTCAAGGACAGTGAAGGTAGATATATATATATATATATATATATCTGTATATATGTATTTTTCCTTCTGTATAAAGTTTTTATACATAGAGTGTGGAAGAAGTGGGATCTAGCTGGTCAGACACTGTCTATTCCTGATATTTTGAAGTCACAATCTCAGAAAGTGAATATAGCTTATTTCTTATGCTTTGCTTTCAAACATTTAGTTCCTTTTATGTGAATCTTTTCAAATCTCATGATATTAGAAAATTCATCTTTTTATTTTAAGGTTGCAAGCAGCATTGGAAATCTTGCTCCAAAGGCTGGTTAGAAGGCATGTTGTTTATGCTGTTTCTAAATATTATTAAAATAAAAAAACTGGCTTCAAGTAAATACTTCTGTGGGTCCACATAAATAGCAAGTACTACATGAAAGATTTCAGTATTGGTTACGGTGATCTCCAGCTCCTAGTCAGAGTTAGAAATACAAGGATATATTGAGGGATTGATTTTATATTTAGAATAATGCATTGAGAGAATAAAAGCTTTTTAAGAAGAAATACTATGCTTAGGGGCCTTCATCACATCCAGACCATTTCAGACAGAGTTGTAAAATTACCCCATGCTGGGCAAGAAAGTTTAAAATAATGCATTTCAGTAGTTCATTAGTTTTAAAATCTAGACTGTTGGCCATCCAAAGATAGCCAAATAGAGAAACTGATAACAAAAATAGGTATGGCCTTTAAGGTGCTCTAGACAACATTTTTTTCAGACTTTTTGGACTGAGACCCACAGTAGAAATATATTTCATATCCTAACCCAGTGTCCGCACACATATGTAACACTATATGTAAATGAAGCAAAAATGTCACGAACTTCATCTTATGAATGTGAAGCTCTCTACTTTCTGTTCTTTCCTGTTCATGTAAATGCCTATTGTGACATCAAATGGATTGATTTCACTACTAGTAAGTCAGAGCCTGCTATTTGAAAAACTATGGTCTAAGAGTAAGAAGTACCAACACAGCATCAATCTTCATATCTAATTAGAAGTGTGGAAATAGCAGTCATAGCTTACCTTCATCAGCACACATCCCCTAAGTGATGTAAGACACCAGCCTCTATATTTATGAACAGTTTCATCACCCTCACCTCAAAGACTTAGCAAACATTAAATAACAAAAAGGGACTTGCTCCAGGATAGATGTAGTAGTATTTGATGTAATCCATCTCTGATGTGCTAGTTATATGAAACACATGCATATCAGCTGGGAACTTTAGCAGTCATTGTATGGGCAGGCTTAAAGGGAAGGTAAAAAGTGGAAGGTAAAAAAGAACTTTTTGCTTGTTCTGGGGGGACAAAAAAATCTTGCTTCAAATGGGATATTTGTGGTCTAGCAGGAAGCAGTAGCTCCAGGCTATCCCACTGTGATACCATTGGAAATGAGCTCTTTGAGCAGTGACTTTGGGTCAGCAGGTGGCTGAGAGACAAATGGTGATTTCCTAAAAAGAATGGTTGCAACAGTAGATCAAAGCACAACCTTCGCATGCATGTAAAGGCTTCTGGCTGTGCATTCATCTTTCAGGGCATATTGGCAAGCATCAGTTACCACCAAAAATAATAACTGTCATCAAATTTTGTAAAAAGTACAATCTAGGCCATGTATGCCACCTTTTTTTGTTTATGAGACAGGGTCTCACACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTCCCCGGGCTCAAGTGATTCTACAGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTATTTGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTGCTGAGCTCAAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCTTGTCCAGCCCCATTACTTTCTTTTTAAGTAAATACCATGTTCTTTATAATCTCTGTCTTGTGCATACCAATTCTTAGCTTCAATTATATATTTTTACCTGTGT
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Given this context: Chromosome X, gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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ACAATAAGATGTCCAATATTACTACTACCATTTGAGAAAAATTTACTGGAAGAAAATATACCAAAATATTAACAAGGGTTAATTTTGTAAATGTCTTCTCTATATCCTTTTTGTACCCTTTGTATTCTTTTTGTGTTTTCTGTAATGAGTTTATATTATTTTTATAAGCAGTTTGAATACATGTGAAATGTTAAATTCTTTCCAGTATCTTCTCTTAATTGCATGTGTTTTTCACTAAACACTGAATTGGTTTAATGTAGAAAACTTCATCTGTTCGATTTCATTCTTTAAGTAAATACATAAACCATATCGGGGGAGGCAGAGAAAGTGAGTTTTGAGGAGAGAGGATTTTCATGGTATTCTTGAAAGGATAAATAAAAGAATACACATTTTATTTGACCCCCATTAGCCATCTGCTTTATACAGTAAATTGTGTTTATGAGATGCCAGAGAAAAATAACTAATGAATTTATTCAAGGTGGTATAAATGTGCCAGTTACAAATTTAAATTTGTAGTCATATCAGTGGACAGTTTTGAACTGAGTAAGATCTTTTATAAAATCAGACAAAGTTTTAACGCTTAGGATGCAATGAAAGAAATGTATGTGGGAGTCTTTCAGTTAGAATAGAATATAAGATGGAACACTACCTGGAACAATATTCATTTGAGATGTGCGCAGTTTTTCTCTATTCCTGGAAGCTACATCTTTGTTCTGTGAGAAAAGCAAGAGGAGGTTCCTGATATGGTCTGTCCTTTCAGTTATGCTGTAGGTAGATTGCTAGCTAGAGCCATTTGAAAAGGAGCAGGGTAAGAACATGATATCAATGTATTATGGGAGAGTAGCATACATGAAAGAGTCACCTTTGTACTACGTGGGATAATATTCCAGCTGATAATCTCCTGCATTACTTAAAATTGGCAGTTCTTCCTTCCCAATAATAAAATACCTGGAAGAAGGAGTTTCTTTAAGTCAGAAGATCCATTAATGTACAAATAAGTTGTACCCTATACATACAAGTAAGTTGTCTCTACCCTACAATCCTGTTCCTTCATTAAAAACAAAAACACAGTACCTTTAAGAAGTATCTTTTTCCTCCATAATTTATAGCACTTGCCTGGTATTGTGTTTAATTTTAAAGTTTTTGTTTTGATGCAGGGACAACGTTTTATTAAATATTAAAAGATTTGATCTGAAAGTGTCCCCACTTAAAGTAAAAAAGAACAGGCCTGAGTCATTCAGAAGGCTTTTATATGACATGTTGGCTTTGAAGAATTTGTATTAATTATTTTGCCAAAAGCTTTTTTATTCCTTTTATAGACCAGAATTGAATAAAAATTGTTTAGTTTAGTGGTACTTAGTTCTTAGCATTTCCATTTCCTTTCCAGCCCTTGTTTTCTTTCCTCCCAACCAAAAACAACAAAAAAGATTTTCATATTTTCTTTTAAAGCAGAATTCTGTTATTTCTTCTGTTCAGAAGAGATAAGGGCAGGACGAAGGTGATGATTGGTATTTGGTGATGGAATGTTTATCTCACTTTGGATTTGCAGTGGCCATCAATAGGGGCGAGCTGGTGAAAATTAGATATGCTTGTTAGCATTCTGCTACCAGCAACTACTGTGTATTGGAGAGGCCCTTTCTTGGTCTTAGAAGGCCAATTAAAATGTGTCTCTGGACTTCAGAGGGCAGTACAGATGACAGTCTGACACTCATCCTGGCACTTTTGAGTATCCTCAAGACATTGACACTAATGATTTATGAGTTACGCATATTCTGTCACCATATCTGCTCTTTGCTCCACACCCTCTCCCTTTCTCCTTTCCCTTCCTTGACAATGTTTGTGGGGTGATAAGAAAGAGATTTTGGAACCAAGAAATGAGAGGTGGCGGGGGAGAGGAAGATGATATATTTTTAACACTCTGGCTTCTTGCTACTCTGTCCCAGAATATACCCCCAGGCAACTGGAATCCCCAGTCGGAAAAACACTGGAGAATGACTTTCCTTCTGCTTCTTTTCCCTTGCAGGAAACACATGAAATTGTGGCGATCAGGAAATTCAAGGACAGTGAAGGTAGATATATATATATATATATATATATCTGTATATATGTATTTTTCCTTCTGTATAAAGTTTTTATACATAGAGTGTGGAAGAAGTGGGATCTAGCTGGTCAGACACTGTCTATTCCTGATATTTTGAAGTCACAATCTCAGAAAGTGAATATAGCTTATTTCTTATGCTTTGCTTTCAAACATTTAGTTCCTTTTATGTGAATCTTTTCAAATCTCATGATATTAGAAAATTCATCTTTTTATTTTAAGGTTGCAAGCAGCATTGGAAATCTTGCTCCAAAGGCTGGTTAGAAGGCATGTTGTTTATGCTGTTTCTAAATATTATTAAAATAAAAAAACTGGCTTCAAGTAAATACTTCTGTGGGTCCACATAAATAGCAAGTACTACATGAAAGATTTCAGTATTGGTTACGGTGATCTCCAGCTCCTAGTCAGAGTTAGAAATACAAGGATATATTGAGGGATTGATTTTATATTTAGAATAATGCATTGAGAGAATAAAAGCTTTTTAAGAAGAAATACTATGCTTAGGGGCCTTCATCACATCCAGACCATTTCAGACAGAGTTGTAAAATTACCCCATGCTGGGCAAGAAAGTTTAAAATAATGCATTTCAGTAGTTCATTAGTTTTAAAATCTAGACTGTTGGCCATCCAAAGATAGCCAAATAGAGAAACTGATAACAAAAATAGGTATGGCCTTTAAGGTGCTCTAGACAACATTTTTTTCAGACTTTTTGGACTGAGACCCACAGTAGAAATATATTTCATATCCTAACCCAGTGTCCGCACACATATGTAACACTATATGTAAATGAAGCAAAAATGTCACGAACTTCATCTTATGAATGTGAAGCTCTCTACTTTCTGTTCTTTCCTGTTCATGTAAATGCCTATTGTGACATCAAATGGATTGATTTCACTACTAGTAAGTCAGAGCCTGCTATTTGAAAAACTATGGTCTAAGAGTAAGAAGTACCAACACAGCATCAATCTTCATATCTAATTAGAAGTGTGGAAATAGCAGTCATAGCTTACCTTCATCAGCACACATCCCCTAAGTGATGTAAGACACCAGCCTCTATATTTATGAACAGTTTCATCACCCTCACCTCAAAGACTTAGCAAACATTAAATAACAAAAAGGGACTTGCTCCAGGATAGATGTAGTAGTATTTGATGTAATCCATCTCTGATGTGCTAGTTATATGAAACACATGCATATCAGCTGGGAACTTTAGCAGTCATTGTATGGGCAGGCTTAAAGGGAAGGTAAAAAGTGGAAGGTAAAAAAGAACTTTTTGCTTGTTCTGGGGGGACAAAAAAATCTTGCTTCAAATGGGATATTTGTGGTCTAGCAGGAAGCAGTAGCTCCAGGCTATCCCACTGTGATACCATTGGAAATGAGCTCTTTGAGCAGTGACTTTGGGTCAGCAGGTGGCTGAGAGACAAATGGTGATTTCCTAAAAAGAATGGTTGCAACAGTAGATCAAAGCACAACCTTCGCATGCATGTAAAGGCTTCTGGCTGTGCATTCATCTTTCAGGGCATATTGGCAAGCATCAGTTACCACCAAAAATAATAACTGTCATCAAATTTTGTAAAAAGTACAATCTAGGCCATGTATGCCACCTTTTTTTGTTTATGAGACAGGGTCTCACACTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACTCCCCGGGCTCAAGTGATTCTACAGCCACAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTATTTGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTGCTGAGCTCAAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTACTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCTTGTCCAGCCCCATTACTTTCTTTTTAAGTAAATACCATGTTCTTTATAATCTCTGTCTTGTGCATACCAATTCTTAGCTTCAATTATATATTTTTACCTGTGT
Task1_train_29111
The variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GGATATTAGAGAAGCATGTTCTCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTC
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A change on Chromosome X affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
GGATATTAGAGAAGCATGTTCTCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTC
GGATATTAGAGAAGCATGTTCTCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCCGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTC
Task1_train_29113
This variant impacts the gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; CDKL5 disorder
GTTCTCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTCTCTAAGGGATAAGGGAC
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Task1_train_29114
The variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; CDKL5 disorder
TCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTCTCTAAGGGATAAGGGACTGGT
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Task1_train_29115
This alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; CDKL5 disorder
TCGATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTCTCTAAGGGATAAGGGACTGGT
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This alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
GATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTCTCTAAGGGATAAGGGACTGGTAA
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Task1_train_29117
A variant found in Chromosome X affects CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GATCTTGCTTCTTTAGGAAACTGCCGGTGTTCCTGTGCTTCAGCAGCTGCAGCTACCTTAGCATTCTAACAGTCACAGAACACCACTGTTCTGGCTCACCCCCAACTTGCAGAACACCTGGACCTTTGTCCCCTCCCAATGCTCTAAGCTACTTTGGGATGTCCCCGATTGCATCTCAGACATTCCCCCACTGCCAGGTGACATCCACTGTCATGCTCTTTTCCCTGTAAGTACCCAGTTCCCTGTTGACTGCCTTGGTGTGATCCAGGTAATTCGCTGCTTATGCCACAGTTGGCCTTTCCTACTGCTGGTTCTTGTCTTCTCATAGGCAGTATCTCTCTTGGTCCTAATCTGTGTTCCAGTGTTCTCCAACAGCTTTCTGGCTAAAGTAGAATACTTCATTTATGTAACCAGTTCACAAGGGAGTGTTGACTCCGTGTTCCCAGTTTGTTATGGATACTCGGGTGCTACAAAGCCCTTGCTTTTATGTCATTCCCTTTTCTTTAAACTCAGTTTGAGTTGGGGGTTGGGAAAGGGGGCTGGGATAGAAAATAATCTGAGGAAACATTCCTGGGTCTGCATTTAGAATCTTCCCTCTCCCTTTGGAATCCATTCAGCCTTTTTCCTCCTGCGTGCCTTGGTTAGAGAGCCTTTCTTCTAGAGGGCATATCAAGTAGGCTTCCGTGCCCCTATCTCCACACTCCATTTTCCTCCTTCTCACACTGAAAGATGTGTCTAATCCTGAGGGTCACACAGCTCTCAAGCTAGGATTCTGGCCCTTACCCAAAAGCTTGTGGCTACATGTGTTTTAGACTTCATAATTTTTGGATTTTAGAATGGACGTGTGGCATGTTATAATGCACAGCACTCAGTAATCAAGTAGTATTTCTATAGCACAACATATGAATGTTCATATTAGATTGGATAAACAAAGACTTTATGTAGTCTCCTGTCAGTTCAGGTGTTACCTCTCAGTGAATTTGCCCCAAACTTAGAAAAAGCTTTCAGTTTTTAGACTGTGTTTTGGATTTTGGACTTGCAGATGAGGGATTATGAACCTGTATCCTGGTACATACATGCAAAAACATGGTAGTTAGGATTTCCCGGGTAAATCTAAAGGTATAATAAAAACTAATTTAAATAGAAATATTATTTTCATCACTCCCCTGCCAATTAATCTATTAGAGTTAATATGACTTCTGTCCTTCCTCCATAACCACGGAGATTATCATGAATGAAGTTGATGGTATGGAAGAGGGTCTATTGGTTCAGCATAAGTTCTCCATCCCAGAACAGCTACACCATCTGGGATGGACAGATGGACATGCCACAGGGAGGACAGCAGGAACCTACAGCAGCTGCTGTTCAGAGAGAAGATTAGACACTCTCAGAATTCCCTGCAACTTGGCTGTGACTTGAATTGTGGATGCTTGGCGCATGACCTCTGCTCCCTGAGGTGACTCATGCAGCCTGAGGAATAAAATGTTTTTTTAGGCCAAAGTTTCAGGCCATCCTTAAAAACATCAGCTACTACAGATGCCGGCTGCATAGAGGTTCTTCTGCACACTGACAGTTTTGATTCCTTATGGCCCTTTTAATCTCTTTCCTTCCTTGTATAGAGTGTTATAGTTCAGATGACAATGGAGGCATATGTTGTATCTATAAGTGTGTTTTTATACATACACGTAGTAAAAGAAGTATAAGAAAATTTTTATACATACACATAGTAAAAGGAGTATAAGAAAATATAAGCAGGAAGTCAAGTTTGTGCTGATCAAGTAAACCCTTTCTTCGATTTTCTTATTCTTGATCCTTTCAACAAGAAAACGTGTTATTTAATATTCCATTCTTGTACTTCTTATGCAGAAGTACTCAAAGCAGAAGGTGAAATTGGGATGTTTTCAGTGTTCTTGGAATTCTTTGAATAGTAGCTTGAAAGTTTTCATTTTAGTCTCTTCACCATTGTTTACATTCTAGAAAATGAAGAAGTCAAAGAAACGACTTTACGAGAGCTTAAAATGCTTCGGACTCTCAAGCAGGAAAACATTGTGGAGTTGAAGGAAGCATTTCGTCGGAGGGGAAAGTTGTACTTGGTGTTTGAGTATGTTGAAAAAGTAAGTCATTAATTGCCAATGTGCACATTTGCCCGATTCTTTTATTTAAGGCTGTTTCTGACATTATTTAAGAAAGTACTGTTATCTAATATGGCTTATCAATGTACTCATAATCTGAGGACTTTAAAAATGAAAGTGTTGTTAATAATCATTAGAAATTCTGAAATATATTTAAGAATTTTGTACAATTAAACTGTATAGAGATAATCGTAAGTTTAAACAATATACTGATTTGGCTTCTGAAGTCTTAAACTCTATGTTCAACAAGTAATTTTTAGACTTGACTTAACTAAGCCTAAACTGAGGGAGAAACTGGTAAACTGACAGTGATGGTACAGGCTGGAAGAGGCTGTATAAGATACCACACTGAATCAGACCTAGGCTGGGGAATGAGTGGGCCCAGGAAGCAGCTTATGTGAACTGCCAATGCTTTGGCTTTATTTGAGGGAAGGAGCTGTGCCAGGAGGCCTAAGGTGAGGCTTGAGGTGGTAGATGAGACCGTAAAAGAAAAGCATGCATTGTTTGAGCTGTCTACACTTGCCTTAGCTTGTATTAAAAAATGTTCAACTTGTTGGAGACAATTTTAATAACATGACCTAAGGGCAAATGTATGTTACAGTAATCAATAATGTGTGCCTAGAAATTTCTTGGAGAGGGGCCTGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCGCTTGAGCCTCAGGAGTTTGAGAATAGCCTGAGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAATTTCTTGGAGAGCAGCTGACCTACAGCAGTTGTTATGGTCAAAAACTTAAACAGATAAACACTTTAACAGTAGTAGAAGAAACTGGAGTGGGGCAAACCTTTAAGCAAGTTTTCTTGATGAGTAAATAGGTGGCTCCTGCCGATTCCTATGCTGTTGTCCAAAGAAGGTTGAAGTGGGAGAAGTTTATGTTTGCTGCAGGTCTATACCCAGGTGCTTGCTATACCATAAATGACAGAGTATCAACATTGTCATAACCAAATGGAAAGCAGTATTGCCAGGGTAACTGACCAGTAATGTGGCTTTGAATGCATTCAGCCTTTACAAATTGTTTTTTGAAATAAAAAAAAAAAATACATGTAATAATTTCCTTACTAGAAAAACTGGAACGGTACTAGCAGGTTGTTTGTAATCTTAAACCACTGCTTTATGTTCCTTTTCCAGAATCTGTTTTAAGTTTCTTTTTCTGTGTCAACTTATACATTCCTCTAAGGTACCTTCCACACCAAAATAAAACTAAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTATTAAAAAAAAAGGATTGCTGTATTAGGATTCCAGGGGAAACCAGATGCTCTTTATTTTTTAAAAACTTTTTAGAGATGGTGTCTCACTATGTTGCCTAGGCTGGAGTGTAGTGGCTATTCACAGGTATGATTATAGCACACTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCTTTCACATCAGCCTCCTGAGTCGCTAGGACTACAGGTGCGCGCCACCATGCCTGGCTGCTTTTTATTTTTTCATTATCATAAATAATCATGCAGTTTGTAGTTTTCACTACCAAATAAGAAAATTTTGACATCTCTTAGTTTATCCTTTTTATTTTTGTTCTATTCATGGTGGTTGTTCATTATTAATAATAATTTAATATAACAAATGGAGAAGTCACTTCTGTGTATCTGTTTCCTCACTGGGAGAGGCAATTTTGTGTGTCTGAGATCTCCCTGCTGGTAAATGGCTGAGCTGCTACTAGAACTCCAGTCTTCTGACAGTCAGGCCTGAGATTCTTCCCCCGATCCTGTGGTTCTTAGGTAGAATGTGACTGTCACACCTGCCACATTAGTGGCAGTGCGTCATAATTGACAGTGAGTCTCAGGAGAGCAAGGAGAAAGTTCTCTAAGGGATAAGGGACTGGTAA
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Task1_train_29118
The variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29119
With a mutation on Chromosome X in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29120
The following genetic variant occurs in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; CDKL5 disorder
TTGAAAAAGAGAATTCAAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTG
TTGAAAAAGAGAATTCAAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGACTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTG
Task1_train_29121
This variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
TTGAAAAAGAGAATTCAAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTG
TTGAAAAAGAGAATTCAAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGACTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTG
Task1_train_29122
The gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) is located on Chromosome X, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29123
Gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
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Task1_train_29124
Here is a variant affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; CDKL5 disorder
AAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAA
AAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCGTAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAA
Task1_train_29125
The following genetic variant occurs in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; CDKL5-related disorder
AAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAA
AAATGGAGAATCAAAAAATGATGCATACATACTTAAAATGTTTATTTTAATTGGAAACATAAATACTGTATGTATTCATTTACCACGCTATAAAGGTAGGGTCAAGGCCTTTTGCCTATCGCTCTTCTGAAGTTCTGATTGGTCTTTTTTACATACATCATACTCGTAATGCATCTTTAAGGTAAAGCAAATGTGCAAAAACATCTGCAAAGGAATCTCAGTGCAGAATCCTTCAATTGGACATGCTTATCCCCACTAGCACCCATTCCTTGCCAGTGTTTTGTAGTTGTCTCACATTTGATTAGATGGCAATAAGTTTAGTGGCTTTTCATTTATTAAGCCTTTCTAAAGTATTCAACTTTGTTTTCTTATAAACAACAACTCTTTTTTTAAAAAAACATTATTTCATTTGTTTATATGGTATTTAATTATATTAAAATAACAAGTGCATCTTTTATAAATAGGCATGGGAGTAAATACAACTGATTCTTGATAGGTATACAACTTGACTGGTGGGAACAAAACTGTGAGGCCAAATTAGAGCAGTGATTTTCTGACTGGTCTTATGGCCCCTTCACACTCTGAAAATTATTGGGAACCCTAAGAACTTTTTATTTATGTGTATTTTATCTATTAGTGTTTCTCATATTAGTCATGACTGAGCAATATAAAAATATTAGTTCATTTTAAAATAACAATAAACGTATTGCATGTTAACATAGATAAGTTTGTATGTCAGTTATTCTTTCAAGTGAAAAATGGCATTCCACATAAAAAGCAGCTCATTCAGCTTGCATCTCAATCCTCTAAGTGCTTTTCCTCAGGACAACCATTGGACAGATGGTGCATGTGCAGCAGAAGGGCTTTATGTGCAGTCTGCCATTTTATCATGCAGATTCCAAAAAAGACATGTACTCAAGAATTGAAATTTAGTCAAAGTAATATTTTGTACTGCTTCATCAAAGATGTCCTTAACTAAAACGTCTGTTTTCTTTTTTAAAGGCAAGGTTTAATTGGATTAAAGAATCCAATGCCTTGATTCATGCTGAGGTGCCAGCAGTTTACCCATTGTTGCTTTGTACCATTAGTGTAAATGCCAACACAGTGAAAAAGGCAAACATCACAGTCTTATTATGAATATAGTTTTGACTTCATGGGCCCTCCGCAAGATCTGAGACCCCACAGATCCACATGTTACACTTTGAGAACTGCTGTCCTAGATGGTTGCTTACAAACAATAAGCTGTGATTGTACCACGGGCCTTGTACTTTACAGTGAGAAAGGAGAATGGTTAATCTGGAAATTCAGTAGAGACCGGCTAAGTGGAATTTCTACATAATAAAAAATTTTGCATGAATTTTAGTTATAATGGTCTCTGACTCCAAATTAAGGTTTTTGAATATTGAATTGTAGGGGGTCTGTGACTCTTTATTTCAATAGTATTTTCTGGCCTGTTTGAATTTTTGTACTAAATGTATTGATCATTTTTAATTTTGGACATTTTTTTTTCTACTAAGAATATTTCGTGGATCTTCCAGGTGTATTTTCAAGGCTTGATTTTTATCACAAGATTCTGTTGCAGAGATACAGCACACTGTGTTTAAAAAGGCTCTTTCCCCCCTTTATACATTACAGTGTCATATTTCTACTTTGTATTGCTTTTCTCTTCTAATTATTCTAAAATAATGCCTGAAAACCTTTAGGGAGAGTGAAAAGTATACAGGGTTATTATTTGGGGTAGCATTAGGGAATAGTAAAAATGGAATTCCTCATAAAAGAAAGCCCCAATTTTAATGCTGATTCAGCATGAGAAAGTTGTAGATAGAAAGCAAAACAATTAAAAAAAAAAGCTCTGTATTGGATGAATTATTCTAGATGCTTTGTAAAATTGTTAATACATAATTTACGGGCCTACCTAATTTGGGAAATAATGACTCTATTTAATTTTTAGAATATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCGTAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAA
Task1_train_29126
This genomic variant is located on Chromosome X, within the CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
ATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTG
ATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAAGCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTG
Task1_train_29127
This variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
ATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTG
ATGCTCGAATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAAGCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTG
Task1_train_29128
A change on Chromosome X affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29129
Gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
AATTGCTGGAAGAAATGCCAAATGGAGTTCCACCTGAGAAAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTAT
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Task1_train_29130
A mutation on Chromosome X affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29131
A mutation on Chromosome X affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; CDKL5 disorder
AAGTAAAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATA
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Task1_train_29132
A mutation in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
AAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGC
AAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTAGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGC
Task1_train_29133
This alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
AAAAGCTACATCTATCAGCTAATCAAGGCTATTCACTGGTGCCATAAGAATGATATTGTCCATCGAGGTGAGTATGAGATTTTTAAAATGGAAAATATTAAAACATCAAATAAAGTTAAGAGTATTTCACATGTTACTGTCTTTAAGAATATTTTCATAAGCATTGGCATTGCCATTTAAATTAAATATATTTTGAAAGTGCAAGACATGAGAAATATTTGCTCTCCATATCTCCTTTTCTATCACCAAAAGGATGGATTACAAATTTATTTGGATATTGTGGTGAGATCTTTACATTTGTATAACTATTATAGATCCACTCCCAATTGTAGAAATGCCTAGTGATATAAGAGAACTCAACAAATGTGAACTTTGAAACTTACTTGGGGATAGGAGAAGAGCAAAATGTTGATCTCTATAGCCTTGGTCCTGCAGGTAGACCAGGTAATGTGAAACAACTCTGAATCAGGCTTTATATAGGTGGTTCCTAAGTCACTGGCCCCTATTGGCACTCATGTCTCATTCCTTCTTACACCAACAATCTCCAGTATGTATCTTCACCTCCTAATTTTCTCTACCCCTTAGTGAAAAGTGCCCGTTGTCTGCAGTTGCAGGCATGATCAACCTTGCATAAAGGTCATAATTATACTCCCATAAACTGTTTTGTCCTTTACTGCCATGAAGTGGGTGGTTTATAGCAATGAAAGGGAAATTACTTGCTCAGCATCAACTTTGTCTCTTCTCCTGATAATCTTTCTTGCACTGGAGAGTTTTACAGTAGTGGGACACAAATTGATACAACAATGACCCTAAATATTTATTTAAAAAATTGCAGTATTTACTTTTTGTCTTTAGATTAGCAGATAAAAGAATGCTACATTTTAATTTACCTATACACAAATGCACAAGGATATCACTTTAAAAATATTCTCACTTGTGAGAATAGTTTAAAGGTCATATGAAGAATGCCATCGTCTTTTATTCCTAGAAACAGTTTATATTTCTCTTGCATTTGACTCTCATAGCAGTTACCTTATCAAGATTGTTGGTAGCATGGGTAGATCTCCACGTCAACTGGACATCCAGTGTCTAGGGTAATGATTCTAGTAACAGTCTATACTGTAGTTTGGGGATATTAATGAGGAGCCGAGTTAGGTGCATTTCCATCATGATACTGTGATTTGATTATGTGCATAGTGAATCATTGGTTGCAAATTAATGGTAGAAACCATGATTTGAAATCTACAGATTTCACTACCTCTGCCCTTTCTCCATTTGCATCTCTACCATATGATATAGATCATGGGTATTCTACTCTAAAAATACAATTGCGAGATGCCTCCCAAGGAGAGAATTCAACTGCATTTTCTGTGAATTTCTACTTAACTCCCACCACATCTTCATAACATCCATGGAAAAAATTAGAAATCTTAATTTGACTCATCCAGTATGGCTTCAGCATTAGACATTGATAATTGTGAACCATGCAGAAAAGCTAAAGAGACGTAAATATAGAAATTATGTAGAAGAATGTAACAGAAAGCATGTCTTGTATGTCTTCTCCAGTAAATATAATGCTAGCTACTTATTCTCATGTATTTTTAAAGTATCTTGTGGGTGTAAACATTTTATATTTCTATCTCCAAAAATTTGTATTACTAGTATTTTATGAAGTAATAATAGGTTTTTGAAATGTGTTGGCCTATATTTAATTATTCTTAAAATTCTTTCAGAGATCCAACTAATCCTTTTAATACTTAAAGAGGAAAAAAATATTTTTGAAGTTGTGGTCTGCATGTTTCTGAGAAAGAAATTCATTGAAACTTTTATGTACCAGCATAAAATGTGTTACTTTATTTTTGCTGCCACAGTTTTCTATTCAAATTACTCTAGATATTTCTAATTAGATGCTATTACAGTGATCTAACAGTGTCAATCAGGAGAACATAGAACATTTTTACTAATTTTTTTTTTATCTTGACACTCCAGATATAAAACCAGAAAATCTCTTAATCAGCCACAATGATGTCCTAAAACTGTGTGACTTTGGTAAGTTAAAAAGAAATTAAGTCCTGGTACTTACAGAATTAATTTATTGTAACACATAGGTAGCTTTTAAAGGAATATTAAAAGTAATTGTTATGTTTTGACTTAAATTGGTAGAGGAACATTCTTTTGAGTCACATGTTGAAAAATTGATTGCTGGAGGAGTACTGCTCTCTTCAGAGTATTGTCTATTTTTAAAATTTTATCATGGTTTTTGTTTAATCAGAACTAATTCAAAGCAAATACACCCATATGCCCAATATCTAATGACTTCACAAAAATTTTTTTTGAATGTTGATAGTTGTTCCAGGTTTAATCATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGC
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Task1_train_29134
This mutation is located in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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Task1_train_29135
A genetic alteration is present in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CATGAACACTAAAATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACC
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Task1_train_29136
This gene mutation involves CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_29137
This variant affects the gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; CDKL5 disorder
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Task1_train_29138
This mutation is located in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29139
A variant found in Chromosome X affects CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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This sequence variant lies in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; CDKL5 disorder
AATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGAC
AATATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGAGGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGAC
Task1_train_29141
A variant was discovered in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; CDKL5 disorder
TATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTC
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Task1_train_29142
The gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
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Task1_train_29143
Gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
TATCCCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTC
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Task1_train_29144
Consider this mutation in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATGGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
Task1_train_29145
A mutation found in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
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Task1_train_29146
The gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) is located on Chromosome X, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Intellectual disability
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CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATTGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
Task1_train_29147
Gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Atypical Rett syndrome
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
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Task1_train_29148
This mutation occurs in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATTGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
Task1_train_29149
This variant affects the gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
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Task1_train_29150
Chromosome X houses a mutation in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATTGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
Task1_train_29151
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; CDKL5 disorder
CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
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Task1_train_29152
A mutation found in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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CCTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATTGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGT
Task1_train_29153
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; CDKL5 disorder
CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
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Task1_train_29154
A sequence alteration has been identified in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
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CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCCGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
Task1_train_29155
This gene mutation involves CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
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Task1_train_29156
A variant has been detected on Chromosome X in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; CDKL5 disorder
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CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCCGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
Task1_train_29157
This is a variant in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
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Task1_train_29158
A variant was discovered on Chromosome X, affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
CTCTGTAAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTG
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Task1_train_29159
This genomic variant is located on Chromosome X, within the CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; CDKL5 disorder
AAATACACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAG
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Task1_train_29160
This variant affects the gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29161
A variant has been detected on Chromosome X in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; CDKL5 disorder
ACATAAGTATTTTGTATATGCAATTGTTATATATCTATAAAGTCAAAAGACATTTTTAGAACATTTTCATTTGTTCCCTCTAAATGTTCAATGAATGGGGTTAGTCATGTATAATATTACAGCTTTTGATTGAATGTATAGGGAAATTTTTTTAGTTGTACTCTCTCCTAGTAGAAAATTGTCTGTGTCTCCCATGTAGATAACTCTGTATTAAGCTCTATTAAACATTTAAATTAAAATAATTCAGAAAAAATTTTAGATTGTATGTTAGGGTCATGGGTCACTTTTTAAAATAATAGTTTTGCCTAACCTGTATGCTGAAAAATGAACACTTGATTTTTTAAATGTCTTTTTTCATATATTTAAATATAATCACAAATACAATGTAAACCTCCACATATAACTAAGAATCCATCTCCTTATAAGGAAAAATTAGATTAGATTAGTGCATAGGAGATGAATTACACAAGCAAGAAATAGAGGCATTGTCAAAATTTGCTTCGTAGAATGACCCATTTTGTCCAGTGTAGCAAATGGAAGCATGTGTAGCTCTTGTCACTCAGTATTTTCAAAGATTTTGAATATTATTAACCTGTTTGTCTGAGAAAAAATGTTTTACAGGACTTAATTTTCTTCATATTTTATGATAAGGAATGATATGTAAAAGAGTCTGTGTCCTAAATTTATAAAGAATGTACTTAGGAAAAAGGAAATATTGAATACTGGATCTGAAAGATTTTAATTGTGGCATTTTTAGCATTTTGTTAGCATTATGATTTTCAGGAACAACATCTGTTTCTGATTTCCTGTCCGTGATTGTGATTACTACCCAAAACAGAGACTTAAGTTACTGAAAATATAAAGCAAGTTATAAATATAAAAGAATGCCCATAGAATGGTTAGTAGTAGGAAGAGTACTCCTGGTCTGGCATTTCTCAGAGAAAAGACTGTTGTAAATGGTCAGGAAGTTCCTCCTGGCAGCACCACATGCGGTATCCTGTGTCCTGTGTATCCCTAGCAAGGACTTCCTAATTGCTTCCCCTCCCAGAGTACGCACTCCTTGGTCTGACTTGAAGAACCCCATTCAAAAATACAAATATTTCTTCAAAGCGTGTCTTATGAAGAAACATTGATTATCTGAAGTTAGGGGTTTTGTTTTACGCTGGGATTGTTTTTATTTTTTACCGTTTCATTTTAAGAAACAGTATTTTCCATGTCTCAAAACTGACGTACACCTTGATTTTTACTCTTAATTTTAATGTTCTGATTCTCTATAACTATTCACAGTGAACCTATGTTGTGTTTGGTGAGTTAGATGGGTGATTAACTTATCCTCCTGCCTTATTTTGTGGCTATGCAGTAGCCCTAAAACCTTTTCAAAGGGTGGGGGTAAAAGTAGTGGTAGAGTCTGTAATTGGTAACTAAGATACCCCTAATATTCTCAGTCATTAGGAGATGATAGTAATTTTGGCCTGCTTTGTTTCCATCACTGTTTATGTAAAGGCTAGAATTGCTCAGCAACAGTACATATGCAAATACTGTGTAAGTGCCACATAGCAAAATTAATGACCGTCTACAATATGCTAGTTTGACTTTGATTTTGATTTCTAGCTTTTGTGGGGACTTTATTTCATTTTTTTCCTAAGGTTTGCATTTATTGGGAGAGCTGATTTAAAAGTATGCTCTGAATAATTATAAAAGCATGGGATGACTTCGAAAACCCGGTTTTCTTTAGCATAGTGAAGAGACTGGTTTTGTAGTGAATACATTGTATGTCTTTCAATTGACATGGAACACTCTACTAACTTTTTAAGATAACAAGGATATTATTAATAAATAGCCCATGCGAGAACAGTCATTACATTCTTTTGATGTTGTTTAAAGTATTACTAGCGCTGAAATATTTTGCCCACATGAATTATTATTTCTTTTTCAAAGTTACAACTTTGGACTTTGCTATCTTTCAGGTTTTGCTCGTAATCTGTCAGAAGGCAATAATGCTAATTACACAGAGTACGTTGCCACCAGATGGTATCGGTCCCCAGAACTCTTACTTGGGTGAGTTACCGTCCCAAAATAGAATGACATTTCCACATCTGCTGATTCTATTGTCATTTGCTTTGAGTTCATCTATGGAAAATAAGAACTTCAGTTAATTAAATGTGTCAGTTACATATTGCAGTATAACAAACTACCTAAAACTTAATGGTATGAAACAAGCACCTTTTTGTTTGCTCAGAATTCTGGGTGTGGGGGAATCACCAGTTTGAGTTCAGCTGGATGGTTCTTCTACTGGTCTCTCTTGGAGTCACTCACGAAGTTATAGTCAGCTGGTAGGTCTTCTGGGAGCTGGTTAGTTTAGGGGTCTCAGCTGGATCAGACCATCTCTGATCCCTGGAAACTTATCCTCCAGTAAGCTATTCCAAGTTTCTAAGTGTGATAGTTGGAGAATTCTGTGCTATTAAGAGGGTAAGCCCCAAAGCAACAGCAGCTTTCAAGCCTTTTTTTGTATGGCTTTTGCCTCGTTGGCCAAAGCATGTTACATGACCAACCCCTGATTCATGGTATGGAGAAATAAATTCCATCTCTTGATGGGGCAAGTGGCAGAGCCATATTATAAAATGGTATATGTATGGAAATGGAAGAAATTAATTGTAGCCATCTTTGCTAATAAACTTCCACATTAAGAATGTGAATATCCACACAGTTTGACATTCTGGCTTATCTATTTGTTCATTTATTAATTCTTCAAGTACTTATCAAGTATCTCTTATGTCCAACCACTTTGCCAGGCACATAGAGTAAATATTGAACCAGACTGAGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAAGCCAGCAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGATACCTGCCTGTAGTCCCATCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGGAGAGTCACTTGAGTCCAGGAGGCAGAGGTCGCAGTGGGCTGATATCCCACCACTGCACTCCAACCTGGGCGTCAGAGCAAGACTCCATCACACACACACAAAAAAACCCCAAAAAACAAAAAAATGGACCAATTGCCATTTTTGTTCTGAACAGTGTAAATCCTGTTTGATGATAAATGGCTATTCAAACTAGCACTGCATTGATGATTTTCTCAGTAACATCTCTACATTGATCTACTTTGTGGCCACCCTTTAACTTTCAATGCTCTTTCATTCATCTGTTAACACCAGAAAAAGGTCTTCTGATAAGGTTCTTTTCTTTTTAGTACATTTTAACTTTAAAGCCTAAGAAGGAGCCTGTAGTTCTCATTAATAATTCTCTACCTACCCTAGTTGTAGGATTATTTTCCTTAGATTGTATTTCCTTCTTTGGGACCACCCAAAAACAGATAATTTATACTCCACAAATAAAATTAGATATAGTGATAATGATGACAAGTGCGCAAATTGTAGGTCTCATTTCTTTAATTTAGCATGCCATACGTGTATCTGGGGGACATGAGGAATTTAATTTTTAAAAATGTTTTTTATATAATAGCAATATAAGTTTCTGGATTTTTTTTCTGAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGC
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Task1_train_29162
A change on Chromosome X affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29163
The variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
GAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGA
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Task1_train_29164
Mutation context: Chromosome X, Gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGA
GAAGAGCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGCCATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGA
Task1_train_29165
A variant was discovered in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
GCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTG
GCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGGGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTG
Task1_train_29166
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTG
GCATGATGACGACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGGGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTG
Task1_train_29167
A mutation found in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
GACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCC
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Task1_train_29168
This variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29169
Here is a mutation in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; CDKL5 disorder
GACATGTTTAAGTTACTCACTGAGGGTTTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCC
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Task1_train_29170
A genetic alteration is present in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29171
This genomic variant is located on Chromosome X, within the CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
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Task1_train_29172
Given this variant in gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
TTATTTTGATATTAACTACTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAA
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Task1_train_29173
A variant found in Chromosome X affects CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
CTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAG
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Task1_train_29174
The gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) is located on Chromosome X, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
CTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAG
CTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGAAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAG
Task1_train_29175
This variant affects gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; CDKL5 disorder
CTTATTTTCCAGTGTCTACCAACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAG
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Task1_train_29176
Here is a variant affecting CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
ACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGG
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Task1_train_29177
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
ACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACTTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGG
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Task1_train_29178
This variant impacts the gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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ACCGTCTAGTAGTAATTCTTGATTCATTGCTGACCTAAAGCCTGTAAGAATCATTGACATTAGTTTTTGAAAGCTTTACTATTTTTTTTAAATCAAAAGCTTGCTTTATCCTGAAAAACAAAGATGCTTAGTCACTTTATTATCTCTTCCATTGTGTAGGCAGAGTTTAGAGTTTTTATGCTAATTTTTAATCTTAGAATTAGGATTGATTTTCTTTGTGTTTGTCTATATTTCTTCCGTGTACCTTTTGGACTCATTGGGATGCATAGTCCATTTTCTTTTGGGAGAATTGAATTTACTGGACACTTTACCAATGGAGAAATGAGTATGAAGTAGATCATTCTTAGAACCCCATCTGAGGACTCAAGTGTAGTAGAAGGGCTTGTTATAATATGGTGGTGTCTGTAACATGGCCCCAAAAAGTTTATTTTGAGGACAGCCTTATTGTGAATCTTCAGAGAGTATCTGCTGCTTAATAATACCTGTAGAAAAACTGGAGTTATGTTTAGAGATGTGTGCTAGCTGCTAAAAGTATGGGGACAATGTAACTAAATTAGTGCTGAAATGAATATTGCTAATTAAGTGATTGTCAAGTACTAGTTGAAGAGCCATATTTGTAAAAATCCTTTTGAAATCAGGTATTTGGTTATACATTAAGAATTTAAGTTTTATATATTCTCAAGGCTTTGTCCTTGACATTCAGAATCATTCCAGCTGCATAAATTATTCAAATCAGATGACAGAAGAAAAATAGCTTGTAGTGAGTATGTGAAAATTTTCCATAAGTTTCTCCATCTAGCACTATGGAACAAATTTTCTCTTTCTCAAACAGATACGAAAGAAAGATCAGTATCTTGCCCTGCCCAACAAACTTACCAAAAAGATCTAAATGAAGTTTCCTTGTGTAGTTCTTAGGTTGATATGGGAAGGAAATGAGATAAATGAAATATTGACTTATTATTGCAATGATTTGTTATCCTAGAAATTTGTTCTGTATAATGTTAACAGTCCTTTGATTTAAAAGTTTTGTTTCACTACTGTATCATTTTAGCATTCCAAAATTTCTTTCCATATTCTTTTTCAGATATTTTCTTTTGGCTTTCCCTTCTTAAAGCTTGGATTATTTATGTTGGAAATGTGTGTGAGCGTGCACGCGTGTGTGTGTGGTTTCTTAATTTGCTGTAAATTTAACACTCTAGATATAAAGCTGTTTTGAGGATACCTAGATTTTCATATACAACCTCCATTTATTAATAACAGCAACACTCCTAAAGCCCTCTGGTAAACTCACACCCTAGAAGAAGCTATAAACCCCTAAATAAACTGGAAAATGTTTTGAGGGAAATAGCTACCATAAAGCTCTATATACATAGGTTACATATATTATATTCAAATAAATAATATAGTAGATCTTAGCACAATCTTAGTCATCAGAAACTGTGATGCTGAGCGATGGAAGGTTAAATAATATTCAGTGTTAAGGAAACACATAAATCAGTACATAGTAAATTTTAATAGACTGAACTCATAAAATGGATAAGATGTATCTTTTTGACATTTAGAGAGCTAAAGGATAATTATTTGTCTTAGAAAATACAATTATTTGGAAGCATTTCATTCCCCAAGTGAGGTGTTACTTGCCAGATATGTATACTGTATTAGGGTTTATTAAGCCGTTCACATTTAAGATACATATCTATTTATGTGAATAAATTTCAAATTAGTGTATACTAACTAAATTGTTATTAAATTGATGGCTTTATTAGCATAGGTTTATTCACTTGTGTTCTGATGATTTGCTTTTCAGCCTTCTTTTCACATGGAACTTTTTAATTTCATAAATATACAAGTGTGCTGCACATAAATTTGTTCACAATAATTTGGAAATTATCAAAACATTATATTTTTTCAGTTGCCAAAATAATCTCTTCCTTTATTTTTCAGCGCTCCCTATGGAAAGTCCGTGGACATGTGGTCGGTGGGCTGTATTCTTGGGGAGCTTAGCGATGGACAGCCTTTATTTCCTGGAGAAAGTGAAATTGACCAACCTTTTACTATTCAGAAGGTGCTAGGACCACTTCCATCTGAGCAGATGAAGCTTTTCTACAGTAATCCTCGCTTCCATGGGCTCCGGGTAAGAGGTTTTGCTGAAACCCAAAATGGAATCAATACTGCAGTATTTGAGTCATTGTTCATTGCACAATGGAATGCTAAACTATCCTTTGAATACTATTTCTTTTCCCATTACAGTGTTTATAATCCCTATTATAATATTTTATTTCCGAATTTTTTAATAGTACTTGTGGATTTAAAAAGTGGTTAGAATTCAAATTCTAATCTTTTTTCTAATTTTTAAGTTCCAGTTTTTCAAAATCTTTTTTAGTGTATACATTTTTACACACTAAACTTTGGTTATCTTATATTGTTTCTTTATCCAAAATATTAAGCATCCCCCAAATATACCAAATGTATGAATGTTGAACAAACATATTTGTAGTGATTTGAGGAAAGCCCTGAAAACTTGGATTCCCCAGATTTGAAGGTTCTTGTTTTAGTAGATGTTTCTGGTCCACTGACGGTGAAACATCAAATCTTCTTTTCAAATTAGTGTATTGTCTTGGGTCCGTGCATGGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCCAAGTTGGGCAGAACACTTAAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACTTTGTGAAACCCCATCTCTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGAGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCAGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAAACAACAACTAGTGTATTGTCTTGGGCAGCCTTTCCTAGACTTGACAACTTTGTACAAAACTTTTCTGAGAATATGTGAAATAGCGTCTTAGAAAGTATAAACTTTCCCCAAATGAGGAGGAGTCACCTTATTAGAGTGCCCAGTGAGTTATAGGCTACTTCTTCCACCTACCCCAAAAACAACTTTTTAAGTTTTCAGCCAGTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTCTAGGGTACATGTGCACAACATGCAAGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTTGTCATTTACATTAGGTATATCTCCTAATGCTATTTTCCCCCCTCCCCCAACCCCATGACAGGCCCCAGTGTGTGATGTTCCCCATCCTGTGTCCAAGTGTTCTCATTGTTCATTTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCAGTATTTGGTTTTCTGTCCTTGGGATAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCAGCTTTATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTTTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGGTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAGTAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATCCTTTATATACCTGGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCTTGAGGAATCACCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCACATCCTCTCCAGCACCTGTTGTTTCCTGACTTTTTAATGATCACCATTCTAACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTCCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTTTTCATGTGTCTGTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTTCATATCCTTCACCCACTTTTTGATGGAGTAGTTTGATTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCTTTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCAAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGATGG
Task1_train_29179
This is a variant in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
AGCATTAATTTTCTTATCAATGAAATTTCACTCCTAGAAAAAATAAGGGGGTATCTGGTAGCATAAGATAGACCTCATACACAAAATATTAACATGTACTGGTATAGGGTCTTTTATCACAGCATGGTAGGTGTCTTTCTATTTGGGCTGATATTTAATGCTCCAGTAACATCGAAGGGAGCCTCTGTACTTCCCTTAGGAGAGGCACCTAGGTTTAGAAAGAGTGTGGGTTTGGATCACAAGACTGGGTGCAAATACTAGTTCTACTGCTGTTTAATTATGTAACTTGCCTTGAACCAGTTATTTGAACTTTCTGATTGTCACCTTCTTCATCTCTAAAATAAGAATAATATATCCAAAATGCCTCGCATAACATCACTTCCCTCAGAAATCAGTTTTAGGTTATTGCCTGTGCATCTGTATTGAGTTCATGTTATTCCTTCTACTCCTCTATCTGGAAGGTGCTGTCCTACTTTTCTCTGTCTTCACATTTTTCATATTTTTCAAAACCCAATTCAGATATTACCTATGGGTTCTTTCTTCCACAGCCATAAACCATCTTGGTCTTTCCTTTCTCTGAGCTTCAATTAGAATTTATGGTTGCACAGTTTAACATTGATTGCTTTCCCAACCAGACAGCAGATTCCTCAAGAGCAGGGTTTGGGTCTTACCTGTATTTTTTGTCTCCTGCTATCCAGAGCATGGTGTGGAGATGATGTCATAATCACTCCTTAAATATCTTGTTTGAAATTTTACTGTATAATTAGTCCTCCCATTTACTTATTTAGCATGTTTAGGGATTTCGGTACTTAGAAATGCTTGTATGTTGGTATAGAGGAAATAATGTATGGAAGCAGACTAGCCCTGACATTTGGAAGGGAGTACATGGCATTGGGCTCTGCCAGTCATATTACCCAATACTTTAACATCCACTAGATATTGCAGAATGTGAGTTGGCAGAGGAAAGAACAAAAAGCACATCTAAATAAACTTGACCCCTTCCCCTCATTTTATTTAAAAATGCATTTGTTAATCTAGGAACCTGTTTGTCTTCGGTTCCAACTTTAAAAAAGGAAGAATTTGAAAACAGGTCATTGTAAGAGCATATTAAAAGCGATGACAGAATGTGTGTCTGAATTCACTCTCTACTTCTGTGACCTTTTAGGTACTGGCCACTTACTTTCTCTCTATTTTTACTTCTATGTTTTCAAAAGTAAATGGTATGTTGTTGTTAAAAAGCTATAAGGATTCTATCTAATGTCTTATCATATCCTTTCTGCTAGACCCTCAATTACTATCAGTAATTAAGAATCATGTGTATAAGCAGACAAATTATGTATACACTGTATTAAAACTGAATTGTTTATAATCAGATGATATTCTATTTTACTGCATAATTAGTTCAAATTTTTATATTTTAGTTTGTTTCACATGCCTTAGTATTGTCTGCCTAGATTTAAGTATCATCTTTCACCTGTGAGTTTTCCTATTATTTGACACCCAGTCGTAGTAATCCATATAAAAATACATAGACGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGATGCCAGCCTGGCCAATGTAGTGAAACCCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCATGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGCATGAAACTCTGTCTCAAAAACAAACAAAAAAAAATACATAGACAACAAAAGTAATATACAAGTATGAATTTGACTGGGATTGGCATTTTTGCTTATCTGCTCCCTTCTGCAACACTCACAAGCACGTGCACACACATGTCCTTCCCCAAATGTTAACATTCCCTTTGTGTATGTCTCACAGTTTCCAGCTGTTAACCATCCTCAGTCCTTGGAAAGAAGATACCTTGGAATTTTGAATAGTGTTCTACTTGACCTAATGAAGGTAAGGCCAATTGATATTATCTCTATAAAATGTCTTTTGGTTTGTGGATTCTTTTGTGTCTACATGTGACCATAGCCTGCTTTTATGAATGAAATTTTAGGAGATGTGGAATGGCAAATAATGGGGAACTATGTCATATTAAAAGGCATGTAACTTATTTAAAATTACAATGGGATCTGGTATTGTCACAGTCCATCTAGACAGAATCATGAGACCCCTAAATGACATTCTTAAAATGGACAGAATAATAAAAATCTGTTAGCATGCAAGAGCTGTTCAAGCATAAGGTTTTAAAACAAATCTTAAAATCAATGTTGAAAGAAGAAATTCAACAATTTTTTCTGACATGGTATTTGAAGCCTCCCATCGCCTACACAGATTTGATCAGTGAATCTAATTTTTCTCTTTTTCTAACTTGGTCTCTTCTCTCCCAGACTCTTTCTGGCTCTACTTTAGACGTATCAGGATCATTGCTAATGCTGTGGCCTGAGTGTTCTTCCTTATGCTACCCTCCCTGTCCAGAAGTCTTCCTGCTCTATACTCTAAAAGCATTCTCAAATTTCTTTATTCAAGTTTATTTTTTTTTCTCCAGTAGACAGTCGGCTCCTTGAGTGGGAACTGTTTTTCATATTTCTCCAGCTTTCACTGCAGCCAGAAGTGCATAAGCAAGTGTTGGTTGTTTGATAGTAGACCTTCAAAGAACACTTATTAATGGATCAATTTTATTTTATGCCCAGTCAGTCAACTGTCAAAATCAGTAGAGGTTACACTGTGCATAGAGCCTTTAAAAGGCATACTTAGCACAGTCGGAAATTTCTGAGTGGCATTCTCAGAACTTTGCCGTGCTTTAAACTATGTTAATCTGTGTTCCAGGGAACATAGTGTACATAGGTGTGGGGGTGGAGGTGGGGGAGGAGGGTGTGACGTTTCGGAAAGGCCACATACCATACAACCTTTTGTAGAGATGCACAATATTCATTAATCCATAAAGGCTTTCAGAAATATCACAATAAAGAGGCATTTCTGTCTTACCCAATATTTTCCAAATTTAATTAAATACTGAATACTGTTTTTTATAAAACTCTAAAGCTCTAGTGTTCTTCTGAATACAGATTGAGAAATGCTACTGGCAAAAAAGAACCCTTAAAGCCTTTTGTTTAATTAGTCATAAATTATCACTTAAATCAGGTAGGTTTTGTCAATACACTTTTTCACACAGTCAGTCCTCATGGATTGGGACCTCAATAATTTGGTAACTTCTAAAATGTGAATAGAATAAAGTAGGAACATGGAATTAAATACAATTTCATGTTTTCTGCCTTTCATCTTTCTTTAGTTAAAAATAATTGAATGTTTTTGTTAAATCATTACCAAATATAATTGCCAAGCATCAGTGTGGTACCAGATTAAAAGCTAGCACAAATAAAAGTAGAAAGATTACCCGAATCATCCTGTGCTTCTGCCAGTTTAGAAGTTAAACATTCAAATTCCTATTTATTTAATATCTTTACCATCAGATTTCTTTAAGTAAATATTTTTATTGACATGTCCTTTCAGAAGGTGCGCAAATTGTATCTATATGTCAGTTACTTTTTATAATGTAAACATATTAGTGTAACTCTACCCAGATGTAGATAGAGAAAATTACTAACACCCTGGAAGCCTTCTTATGCCCCCTTCCAGGCTTTATGCCACCCCACCCCCCTCAGAAACCAGTTCCGACTTCTGTCACCAAAGATTAGTATTGCCTTATTATCAAATGTTATATAAATAGAATCATTCCTTTTGTTTTTTAGCTTTTTTTGAAAATGAATTTGAAAAATGAAAAATACCAATTATCCCTTCTTTGAATATTTCAAAGAGAAATATTCTCTTTGCCATTCTCTAAAGCTGCCGTGTTAATTTTGTCCACATCTAAGTACCTAAAATGGCCATCTCATCCTGTCAGCCAATTTAGTGGGGGTACAGGTCACCAAAATTAATTCAAGCCCCTAATAACCTTAAGACTAGCTGTAGTAATTATATTGGCTCTAT
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Task1_train_29180
This genomic variant is located on Chromosome X, within the CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
AGCATTAATTTTCTTATCAATGAAATTTCACTCCTAGAAAAAATAAGGGGGTATCTGGTAGCATAAGATAGACCTCATACACAAAATATTAACATGTACTGGTATAGGGTCTTTTATCACAGCATGGTAGGTGTCTTTCTATTTGGGCTGATATTTAATGCTCCAGTAACATCGAAGGGAGCCTCTGTACTTCCCTTAGGAGAGGCACCTAGGTTTAGAAAGAGTGTGGGTTTGGATCACAAGACTGGGTGCAAATACTAGTTCTACTGCTGTTTAATTATGTAACTTGCCTTGAACCAGTTATTTGAACTTTCTGATTGTCACCTTCTTCATCTCTAAAATAAGAATAATATATCCAAAATGCCTCGCATAACATCACTTCCCTCAGAAATCAGTTTTAGGTTATTGCCTGTGCATCTGTATTGAGTTCATGTTATTCCTTCTACTCCTCTATCTGGAAGGTGCTGTCCTACTTTTCTCTGTCTTCACATTTTTCATATTTTTCAAAACCCAATTCAGATATTACCTATGGGTTCTTTCTTCCACAGCCATAAACCATCTTGGTCTTTCCTTTCTCTGAGCTTCAATTAGAATTTATGGTTGCACAGTTTAACATTGATTGCTTTCCCAACCAGACAGCAGATTCCTCAAGAGCAGGGTTTGGGTCTTACCTGTATTTTTTGTCTCCTGCTATCCAGAGCATGGTGTGGAGATGATGTCATAATCACTCCTTAAATATCTTGTTTGAAATTTTACTGTATAATTAGTCCTCCCATTTACTTATTTAGCATGTTTAGGGATTTCGGTACTTAGAAATGCTTGTATGTTGGTATAGAGGAAATAATGTATGGAAGCAGACTAGCCCTGACATTTGGAAGGGAGTACATGGCATTGGGCTCTGCCAGTCATATTACCCAATACTTTAACATCCACTAGATATTGCAGAATGTGAGTTGGCAGAGGAAAGAACAAAAAGCACATCTAAATAAACTTGACCCCTTCCCCTCATTTTATTTAAAAATGCATTTGTTAATCTAGGAACCTGTTTGTCTTCGGTTCCAACTTTAAAAAAGGAAGAATTTGAAAACAGGTCATTGTAAGAGCATATTAAAAGCGATGACAGAATGTGTGTCTGAATTCACTCTCTACTTCTGTGACCTTTTAGGTACTGGCCACTTACTTTCTCTCTATTTTTACTTCTATGTTTTCAAAAGTAAATGGTATGTTGTTGTTAAAAAGCTATAAGGATTCTATCTAATGTCTTATCATATCCTTTCTGCTAGACCCTCAATTACTATCAGTAATTAAGAATCATGTGTATAAGCAGACAAATTATGTATACACTGTATTAAAACTGAATTGTTTATAATCAGATGATATTCTATTTTACTGCATAATTAGTTCAAATTTTTATATTTTAGTTTGTTTCACATGCCTTAGTATTGTCTGCCTAGATTTAAGTATCATCTTTCACCTGTGAGTTTTCCTATTATTTGACACCCAGTCGTAGTAATCCATATAAAAATACATAGACGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGATGCCAGCCTGGCCAATGTAGTGAAACCCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCATGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGCATGAAACTCTGTCTCAAAAACAAACAAAAAAAAATACATAGACAACAAAAGTAATATACAAGTATGAATTTGACTGGGATTGGCATTTTTGCTTATCTGCTCCCTTCTGCAACACTCACAAGCACGTGCACACACATGTCCTTCCCCAAATGTTAACATTCCCTTTGTGTATGTCTCACAGTTTCCAGCTGTTAACCATCCTCAGTCCTTGGAAAGAAGATACCTTGGAATTTTGAATAGTGTTCTACTTGACCTAATGAAGGTAAGGCCAATTGATATTATCTCTATAAAATGTCTTTTGGTTTGTGGATTCTTTTGTGTCTACATGTGACCATAGCCTGCTTTTATGAATGAAATTTTAGGAGATGTGGAATGGCAAATAATGGGGAACTATGTCATATTAAAAGGCATGTAACTTATTTAAAATTACAATGGGATCTGGTATTGTCACAGTCCATCTAGACAGAATCATGAGACCCCTAAATGACATTCTTAAAATGGACAGAATAATAAAAATCTGTTAGCATGCAAGAGCTGTTCAAGCATAAGGTTTTAAAACAAATCTTAAAATCAATGTTGAAAGAAGAAATTCAACAATTTTTTCTGACATGGTATTTGAAGCCTCCCATCGCCTACACAGATTTGATCAGTGAATCTAATTTTTCTCTTTTTCTAACTTGGTCTCTTCTCTCCCAGACTCTTTCTGGCTCTACTTTAGACGTATCAGGATCATTGCTAATGCTGTGGCCTGAGTGTTCTTCCTTATGCTACCCTCCCTGTCCAGAAGTCTTCCTGCTCTATACTCTAAAAGCATTCTCAAATTTCTTTATTCAAGTTTATTTTTTTTTCTCCAGTAGACAGTCGGCTCCTTGAGTGGGAACTGTTTTTCATATTTCTCCAGCTTTCACTGCAGCCAGAAGTGCATAAGCAAGTGTTGGTTGTTTGATAGTAGACCTTCAAAGAACACTTATTAATGGATCAATTTTATTTTATGCCCAGTCAGTCAACTGTCAAAATCAGTAGAGGTTACACTGTGCATAGAGCCTTTAAAAGGCATACTTAGCACAGTCGGAAATTTCTGAGTGGCATTCTCAGAACTTTGCCGTGCTTTAAACTATGTTAATCTGTGTTCCAGGGAACATAGTGTACATAGGTGTGGGGGTGGAGGTGGGGGAGGAGGGTGTGACGTTTCGGAAAGGCCACATACCATACAACCTTTTGTAGAGATGCACAATATTCATTAATCCATAAAGGCTTTCAGAAATATCACAATAAAGAGGCATTTCTGTCTTACCCAATATTTTCCAAATTTAATTAAATACTGAATACTGTTTTTTATAAAACTCTAAAGCTCTAGTGTTCTTCTGAATACAGATTGAGAAATGCTACTGGCAAAAAAGAACCCTTAAAGCCTTTTGTTTAATTAGTCATAAATTATCACTTAAATCAGGTAGGTTTTGTCAATACACTTTTTCACACAGTCAGTCCTCATGGATTGGGACCTCAATAATTTGGTAACTTCTAAAATGTGAATAGAATAAAGTAGGAACATGGAATTAAATACAATTTCATGTTTTCTGCCTTTCATCTTTCTTTAGTTAAAAATAATTGAATGTTTTTGTTAAATCATTACCAAATATAATTGCCAAGCATCAGTGTGGTACCAGATTAAAAGCTAGCACAAATAAAAGTAGAAAGATTACCCGAATCATCCTGTGCTTCTGCCAGTTTAGAAGTTAAACATTCAAATTCCTATTTATTTAATATCTTTACCATCAGATTTCTTTAAGTAAATATTTTTATTGACATGTCCTTTCAGAAGGTGCGCAAATTGTATCTATATGTCAGTTACTTTTTATAATGTAAACATATTAGTGTAACTCTACCCAGATGTAGATAGAGAAAATTACTAACACCCTGGAAGCCTTCTTATGCCCCCTTCCAGGCTTTATGCCACCCCACCCCCCTCAGAAACCAGTTCCGACTTCTGTCACCAAAGATTAGTATTGCCTTATTATCAAATGTTATATAAATAGAATCATTCCTTTTGTTTTTTAGCTTTTTTTGAAAATGAATTTGAAAAATGAAAAATACCAATTATCCCTTCTTTGAATATTTCAAAGAGAAATATTCTCTTTGCCATTCTCTAAAGCTGCCGTGTTAATTTTGTCCACATCTAAGTACCTAAAATGGCCATCTCATCCTGTCAGCCAATTTAGTGGGGGTACAGGTCACCAAAATTAATTCAAGCCCCTAATAACCTTAAGACTAGCTGTAGTAATTATATTGGCTCTAT
AGCATTAATTTTCTTATCAATGAAATTTCACTCCTAGAAAAAATAAGGGGGTATCTGGTAGCATAAGATAGACCTCATACACAAAATATTAACATGTACTGGTATAGGGTCTTTTATCACAGCATGGTAGGTGTCTTTCTATTTGGGCTGATATTTAATGCTCCAGTAACATCGAAGGGAGCCTCTGTACTTCCCTTAGGAGAGGCACCTAGGTTTAGAAAGAGTGTGGGTTTGGATCACAAGACTGGGTGCAAATACTAGTTCTACTGCTGTTTAATTATGTAACTTGCCTTGAACCAGTTATTTGAACTTTCTGATTGTCACCTTCTTCATCTCTAAAATAAGAATAATATATCCAAAATGCCTCGCATAACATCACTTCCCTCAGAAATCAGTTTTAGGTTATTGCCTGTGCATCTGTATTGAGTTCATGTTATTCCTTCTACTCCTCTATCTGGAAGGTGCTGTCCTACTTTTCTCTGTCTTCACATTTTTCATATTTTTCAAAACCCAATTCAGATATTACCTATGGGTTCTTTCTTCCACAGCCATAAACCATCTTGGTCTTTCCTTTCTCTGAGCTTCAATTAGAATTTATGGTTGCACAGTTTAACATTGATTGCTTTCCCAACCAGACAGCAGATTCCTCAAGAGCAGGGTTTGGGTCTTACCTGTATTTTTTGTCTCCTGCTATCCAGAGCATGGTGTGGAGATGATGTCATAATCACTCCTTAAATATCTTGTTTGAAATTTTACTGTATAATTAGTCCTCCCATTTACTTATTTAGCATGTTTAGGGATTTCGGTACTTAGAAATGCTTGTATGTTGGTATAGAGGAAATAATGTATGGAAGCAGACTAGCCCTGACATTTGGAAGGGAGTACATGGCATTGGGCTCTGCCAGTCATATTACCCAATACTTTAACATCCACTAGATATTGCAGAATGTGAGTTGGCAGAGGAAAGAACAAAAAGCACATCTAAATAAACTTGACCCCTTCCCCTCATTTTATTTAAAAATGCATTTGTTAATCTAGGAACCTGTTTGTCTTCGGTTCCAACTTTAAAAAAGGAAGAATTTGAAAACAGGTCATTGTAAGAGCATATTAAAAGCGATGACAGAATGTGTGTCTGAATTCACTCTCTACTTCTGTGACCTTTTAGGTACTGGCCACTTACTTTCTCTCTATTTTTACTTCTATGTTTTCAAAAGTAAATGGTATGTTGTTGTTAAAAAGCTATAAGGATTCTATCTAATGTCTTATCATATCCTTTCTGCTAGACCCTCAATTACTATCAGTAATTAAGAATCATGTGTATAAGCAGACAAATTATGTATACACTGTATTAAAACTGAATTGTTTATAATCAGATGATATTCTATTTTACTGCATAATTAGTTCAAATTTTTATATTTTAGTTTGTTTCACATGCCTTAGTATTGTCTGCCTAGATTTAAGTATCATCTTTCACCTGTGAGTTTTCCTATTATTTGACACCCAGTCGTAGTAATCCATATAAAAATACATAGACGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGATGCCAGCCTGGCCAATGTAGTGAAACCCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCATGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGCATGAAACTCTGTCTCAAAAACAAACAAAAAAAAATACATAGACAACAAAAGTAATATACAAGTATGAATTTGACTGGGATTGGCATTTTTGCTTATCTGCTCCCTTCTGCAACACTCACAAGCACGTGCACACACATGTCCTTCCCCAAATGTTAACATTCCCTTTGTGTATGTCTCACAGTTTCCAGCTGTTAACCATCCTCAGTCCTTGGAAAGAAGATACCTTGGAATTTTGAATAGTGTTCTACCTGACCTAATGAAGGTAAGGCCAATTGATATTATCTCTATAAAATGTCTTTTGGTTTGTGGATTCTTTTGTGTCTACATGTGACCATAGCCTGCTTTTATGAATGAAATTTTAGGAGATGTGGAATGGCAAATAATGGGGAACTATGTCATATTAAAAGGCATGTAACTTATTTAAAATTACAATGGGATCTGGTATTGTCACAGTCCATCTAGACAGAATCATGAGACCCCTAAATGACATTCTTAAAATGGACAGAATAATAAAAATCTGTTAGCATGCAAGAGCTGTTCAAGCATAAGGTTTTAAAACAAATCTTAAAATCAATGTTGAAAGAAGAAATTCAACAATTTTTTCTGACATGGTATTTGAAGCCTCCCATCGCCTACACAGATTTGATCAGTGAATCTAATTTTTCTCTTTTTCTAACTTGGTCTCTTCTCTCCCAGACTCTTTCTGGCTCTACTTTAGACGTATCAGGATCATTGCTAATGCTGTGGCCTGAGTGTTCTTCCTTATGCTACCCTCCCTGTCCAGAAGTCTTCCTGCTCTATACTCTAAAAGCATTCTCAAATTTCTTTATTCAAGTTTATTTTTTTTTCTCCAGTAGACAGTCGGCTCCTTGAGTGGGAACTGTTTTTCATATTTCTCCAGCTTTCACTGCAGCCAGAAGTGCATAAGCAAGTGTTGGTTGTTTGATAGTAGACCTTCAAAGAACACTTATTAATGGATCAATTTTATTTTATGCCCAGTCAGTCAACTGTCAAAATCAGTAGAGGTTACACTGTGCATAGAGCCTTTAAAAGGCATACTTAGCACAGTCGGAAATTTCTGAGTGGCATTCTCAGAACTTTGCCGTGCTTTAAACTATGTTAATCTGTGTTCCAGGGAACATAGTGTACATAGGTGTGGGGGTGGAGGTGGGGGAGGAGGGTGTGACGTTTCGGAAAGGCCACATACCATACAACCTTTTGTAGAGATGCACAATATTCATTAATCCATAAAGGCTTTCAGAAATATCACAATAAAGAGGCATTTCTGTCTTACCCAATATTTTCCAAATTTAATTAAATACTGAATACTGTTTTTTATAAAACTCTAAAGCTCTAGTGTTCTTCTGAATACAGATTGAGAAATGCTACTGGCAAAAAAGAACCCTTAAAGCCTTTTGTTTAATTAGTCATAAATTATCACTTAAATCAGGTAGGTTTTGTCAATACACTTTTTCACACAGTCAGTCCTCATGGATTGGGACCTCAATAATTTGGTAACTTCTAAAATGTGAATAGAATAAAGTAGGAACATGGAATTAAATACAATTTCATGTTTTCTGCCTTTCATCTTTCTTTAGTTAAAAATAATTGAATGTTTTTGTTAAATCATTACCAAATATAATTGCCAAGCATCAGTGTGGTACCAGATTAAAAGCTAGCACAAATAAAAGTAGAAAGATTACCCGAATCATCCTGTGCTTCTGCCAGTTTAGAAGTTAAACATTCAAATTCCTATTTATTTAATATCTTTACCATCAGATTTCTTTAAGTAAATATTTTTATTGACATGTCCTTTCAGAAGGTGCGCAAATTGTATCTATATGTCAGTTACTTTTTATAATGTAAACATATTAGTGTAACTCTACCCAGATGTAGATAGAGAAAATTACTAACACCCTGGAAGCCTTCTTATGCCCCCTTCCAGGCTTTATGCCACCCCACCCCCCTCAGAAACCAGTTCCGACTTCTGTCACCAAAGATTAGTATTGCCTTATTATCAAATGTTATATAAATAGAATCATTCCTTTTGTTTTTTAGCTTTTTTTGAAAATGAATTTGAAAAATGAAAAATACCAATTATCCCTTCTTTGAATATTTCAAAGAGAAATATTCTCTTTGCCATTCTCTAAAGCTGCCGTGTTAATTTTGTCCACATCTAAGTACCTAAAATGGCCATCTCATCCTGTCAGCCAATTTAGTGGGGGTACAGGTCACCAAAATTAATTCAAGCCCCTAATAACCTTAAGACTAGCTGTAGTAATTATATTGGCTCTAT
Task1_train_29181
A genomic change on Chromosome X affects CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; CDKL5 disorder
AGCATTAATTTTCTTATCAATGAAATTTCACTCCTAGAAAAAATAAGGGGGTATCTGGTAGCATAAGATAGACCTCATACACAAAATATTAACATGTACTGGTATAGGGTCTTTTATCACAGCATGGTAGGTGTCTTTCTATTTGGGCTGATATTTAATGCTCCAGTAACATCGAAGGGAGCCTCTGTACTTCCCTTAGGAGAGGCACCTAGGTTTAGAAAGAGTGTGGGTTTGGATCACAAGACTGGGTGCAAATACTAGTTCTACTGCTGTTTAATTATGTAACTTGCCTTGAACCAGTTATTTGAACTTTCTGATTGTCACCTTCTTCATCTCTAAAATAAGAATAATATATCCAAAATGCCTCGCATAACATCACTTCCCTCAGAAATCAGTTTTAGGTTATTGCCTGTGCATCTGTATTGAGTTCATGTTATTCCTTCTACTCCTCTATCTGGAAGGTGCTGTCCTACTTTTCTCTGTCTTCACATTTTTCATATTTTTCAAAACCCAATTCAGATATTACCTATGGGTTCTTTCTTCCACAGCCATAAACCATCTTGGTCTTTCCTTTCTCTGAGCTTCAATTAGAATTTATGGTTGCACAGTTTAACATTGATTGCTTTCCCAACCAGACAGCAGATTCCTCAAGAGCAGGGTTTGGGTCTTACCTGTATTTTTTGTCTCCTGCTATCCAGAGCATGGTGTGGAGATGATGTCATAATCACTCCTTAAATATCTTGTTTGAAATTTTACTGTATAATTAGTCCTCCCATTTACTTATTTAGCATGTTTAGGGATTTCGGTACTTAGAAATGCTTGTATGTTGGTATAGAGGAAATAATGTATGGAAGCAGACTAGCCCTGACATTTGGAAGGGAGTACATGGCATTGGGCTCTGCCAGTCATATTACCCAATACTTTAACATCCACTAGATATTGCAGAATGTGAGTTGGCAGAGGAAAGAACAAAAAGCACATCTAAATAAACTTGACCCCTTCCCCTCATTTTATTTAAAAATGCATTTGTTAATCTAGGAACCTGTTTGTCTTCGGTTCCAACTTTAAAAAAGGAAGAATTTGAAAACAGGTCATTGTAAGAGCATATTAAAAGCGATGACAGAATGTGTGTCTGAATTCACTCTCTACTTCTGTGACCTTTTAGGTACTGGCCACTTACTTTCTCTCTATTTTTACTTCTATGTTTTCAAAAGTAAATGGTATGTTGTTGTTAAAAAGCTATAAGGATTCTATCTAATGTCTTATCATATCCTTTCTGCTAGACCCTCAATTACTATCAGTAATTAAGAATCATGTGTATAAGCAGACAAATTATGTATACACTGTATTAAAACTGAATTGTTTATAATCAGATGATATTCTATTTTACTGCATAATTAGTTCAAATTTTTATATTTTAGTTTGTTTCACATGCCTTAGTATTGTCTGCCTAGATTTAAGTATCATCTTTCACCTGTGAGTTTTCCTATTATTTGACACCCAGTCGTAGTAATCCATATAAAAATACATAGACGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGATGCCAGCCTGGCCAATGTAGTGAAACCCCAGCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAAGCAGGAGAATCGCATGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCGCACCATTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGCATGAAACTCTGTCTCAAAAACAAACAAAAAAAAATACATAGACAACAAAAGTAATATACAAGTATGAATTTGACTGGGATTGGCATTTTTGCTTATCTGCTCCCTTCTGCAACACTCACAAGCACGTGCACACACATGTCCTTCCCCAAATGTTAACATTCCCTTTGTGTATGTCTCACAGTTTCCAGCTGTTAACCATCCTCAGTCCTTGGAAAGAAGATACCTTGGAATTTTGAATAGTGTTCTACTTGACCTAATGAAGGTAAGGCCAATTGATATTATCTCTATAAAATGTCTTTTGGTTTGTGGATTCTTTTGTGTCTACATGTGACCATAGCCTGCTTTTATGAATGAAATTTTAGGAGATGTGGAATGGCAAATAATGGGGAACTATGTCATATTAAAAGGCATGTAACTTATTTAAAATTACAATGGGATCTGGTATTGTCACAGTCCATCTAGACAGAATCATGAGACCCCTAAATGACATTCTTAAAATGGACAGAATAATAAAAATCTGTTAGCATGCAAGAGCTGTTCAAGCATAAGGTTTTAAAACAAATCTTAAAATCAATGTTGAAAGAAGAAATTCAACAATTTTTTCTGACATGGTATTTGAAGCCTCCCATCGCCTACACAGATTTGATCAGTGAATCTAATTTTTCTCTTTTTCTAACTTGGTCTCTTCTCTCCCAGACTCTTTCTGGCTCTACTTTAGACGTATCAGGATCATTGCTAATGCTGTGGCCTGAGTGTTCTTCCTTATGCTACCCTCCCTGTCCAGAAGTCTTCCTGCTCTATACTCTAAAAGCATTCTCAAATTTCTTTATTCAAGTTTATTTTTTTTTCTCCAGTAGACAGTCGGCTCCTTGAGTGGGAACTGTTTTTCATATTTCTCCAGCTTTCACTGCAGCCAGAAGTGCATAAGCAAGTGTTGGTTGTTTGATAGTAGACCTTCAAAGAACACTTATTAATGGATCAATTTTATTTTATGCCCAGTCAGTCAACTGTCAAAATCAGTAGAGGTTACACTGTGCATAGAGCCTTTAAAAGGCATACTTAGCACAGTCGGAAATTTCTGAGTGGCATTCTCAGAACTTTGCCGTGCTTTAAACTATGTTAATCTGTGTTCCAGGGAACATAGTGTACATAGGTGTGGGGGTGGAGGTGGGGGAGGAGGGTGTGACGTTTCGGAAAGGCCACATACCATACAACCTTTTGTAGAGATGCACAATATTCATTAATCCATAAAGGCTTTCAGAAATATCACAATAAAGAGGCATTTCTGTCTTACCCAATATTTTCCAAATTTAATTAAATACTGAATACTGTTTTTTATAAAACTCTAAAGCTCTAGTGTTCTTCTGAATACAGATTGAGAAATGCTACTGGCAAAAAAGAACCCTTAAAGCCTTTTGTTTAATTAGTCATAAATTATCACTTAAATCAGGTAGGTTTTGTCAATACACTTTTTCACACAGTCAGTCCTCATGGATTGGGACCTCAATAATTTGGTAACTTCTAAAATGTGAATAGAATAAAGTAGGAACATGGAATTAAATACAATTTCATGTTTTCTGCCTTTCATCTTTCTTTAGTTAAAAATAATTGAATGTTTTTGTTAAATCATTACCAAATATAATTGCCAAGCATCAGTGTGGTACCAGATTAAAAGCTAGCACAAATAAAAGTAGAAAGATTACCCGAATCATCCTGTGCTTCTGCCAGTTTAGAAGTTAAACATTCAAATTCCTATTTATTTAATATCTTTACCATCAGATTTCTTTAAGTAAATATTTTTATTGACATGTCCTTTCAGAAGGTGCGCAAATTGTATCTATATGTCAGTTACTTTTTATAATGTAAACATATTAGTGTAACTCTACCCAGATGTAGATAGAGAAAATTACTAACACCCTGGAAGCCTTCTTATGCCCCCTTCCAGGCTTTATGCCACCCCACCCCCCTCAGAAACCAGTTCCGACTTCTGTCACCAAAGATTAGTATTGCCTTATTATCAAATGTTATATAAATAGAATCATTCCTTTTGTTTTTTAGCTTTTTTTGAAAATGAATTTGAAAAATGAAAAATACCAATTATCCCTTCTTTGAATATTTCAAAGAGAAATATTCTCTTTGCCATTCTCTAAAGCTGCCGTGTTAATTTTGTCCACATCTAAGTACCTAAAATGGCCATCTCATCCTGTCAGCCAATTTAGTGGGGGTACAGGTCACCAAAATTAATTCAAGCCCCTAATAACCTTAAGACTAGCTGTAGTAATTATATTGGCTCTAT
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Task1_train_29182
Assess the clinical impact of this variant on gene CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5), found on Chromosome X. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
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Task1_train_29183
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Angelman syndrome-like
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Task1_train_29184
A genetic alteration is present in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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Task1_train_29185
Here is a genetic alteration in CDKL5 (cyclin dependent kinase like 5) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; CDKL5 disorder
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Task1_train_29186
Here is a variant affecting CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29187
This variant impacts the gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Juvenile retinoschisis
GAGACAGTCGATTCGTGGTTGCAGAGGGCTTGGGGTGGCCGATGGGTTGGGGAGTGTTGGCTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATAT
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Task1_train_29188
A variant on Chromosome X in gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Retinal dystrophy
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GCAGAGGGCTTGGGGTGGCCGATGGGTTGGGGAGTGTTGGCTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCGGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCC
Task1_train_29189
Gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
GAGGGCTTGGGGTGGCCGATGGGTTGGGGAGTGTTGGCTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACA
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Task1_train_29190
A change on Chromosome X affects gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Juvenile retinoschisis
TGGGGTGGCCGATGGGTTGGGGAGTGTTGGCTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAA
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Task1_train_29191
Gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Retinal dystrophy
TGGGGTGGCCGATGGGTTGGGGAGTGTTGGCTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAA
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Task1_train_29192
An alteration has been detected in CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Retinoschisis
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Task1_train_29193
A variant was discovered on Chromosome X, affecting CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Retinal dystrophy
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Task1_train_29194
A genomic change on Chromosome X affects CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29195
Here’s a variant in CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_29196
This variant lies on Chromosome X and affects the gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
CTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAACATCAGACCATACCCGTGAAGCAAAGTGCA
CTGATGGGTGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGTGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAACATCAGACCATACCCGTGAAGCAAAGTGCA
Task1_train_29197
The following genetic variant occurs in CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Retinal dystrophy
TGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGCGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAACATCAGACCATACCCGTGAAGCAAAGTGCATTCAATGA
TGCAGGATTTCTCTTTGGGGTGATAAACTTTCTAAAATTGATCTAGTGATAATGGTTGCACAACTCTGAATATACCAAAAGTCATCAAATTGTACACTTTAAATGGATACAAATTGTATGTGAACTTAATCTCAATAAAGCCGTGACAAAAGTTTCCAACATGAACTCTTATTTGGAAAGCCTTTCTCCCTGCCTCACTGTTTCCTCCTCTCCTTTTTCCCTGAACTGCACTCTCTCGACTCCTGTGTTTGATGTGCCTTAACTCTTAGGATACTGCCATTTTGTCTGACAGTCCATGTCGTGACCAAAGTTAATTCACCTTTCCAAATAAGGGTCTCTGTTCAGGCATTTCTATCCAAAATAGATTTGTCCTGTGTCCTAAGGCCAGGGATAAGTCCCCCCACCCCCCCCCCCCACCCCCAACACCCTGTGTGATGTGTTTATATTTGAGAGAAGATTGGGCGGGGAAAAGCATTTTCCGAAGTTCAAGCATACAGCATAGGGACTAGAAAGATGCTGGGTTGGATATAAAATAATTGAGCCCCCAAAGCATCAAGAAGGATGTTTGGGGCTTTTAGAAGGCTGCCTGTTCACAGAAAAGGTGAATGTGTTGTCCAGCACTGTATTAGCGCGAGTCTAGTCACTTGCCTTGGCATTTGAAAATGAAAAGTAACTCGGAAATGAGCTGCTAGCAAAGACTACCCTGTGTCTGGGGCCAGAACAGTCTTTAGAGCAGCCTCGTCCTCTGATTCCACCACCTGCTCTCCATATCCCTCTCCTGCCCCTCCCCCGTGTTAACAGCCTCTCCCAGGAAGGGGCCTGGAAACTCAGGCTGCGCTCTAAGTGGCCAATGAGGCCTCCCAATCTAAGGCGCCGCCTCCAGGAACGGAAAGCCAGGCCCATTCCTTCCCAGAGAGCTTTTCAGGAGCAGGCGCAGTTTGCGTATTGCAAGGCAGAGGGTGGAGGGTGAGAAGCTTTCAGGGAAAAAGCTACATGGTCCTTTTTATGATGTGAGTCCTTCCCACTTCCTGCGAAGCATGTAGCCAGCTAATGAGCCTCCTCTGAGTAGCCAGTGGTAGCTCCTGGGCCAGCTGTTCTCGAACTATGTTTGGTTTGCTAGGAAATGGTAGCCCTAGGTAAAGGGCAATTGTACTGTGTTGTGGTCATTTGGGGTCCCTACATATACTGAGATGTGCAGCCTGTCCTGTATGATCACCTAAATGGTGACCACAGACACGGGGAATTTGCTGGAATGGATTGCATAATGGAGCTGTGTGTATTGGGCGCTCTGGTCCCTCCCCAATCCCTGTGTTCATGAGGGTGGAAGCCCAGATCCGCCTTGAAGGTAAGAACTGTGAGCAGAGGAAACTCCCCTACCTTGGGCTTTTGGTCATTTGTCACGTATAGCCTCTCAGGGCACCGGGATTCTCACCCACCGCACTCATCCCTGCCACCCAGTCACCCTTGAGACCCTCAGCTGCCTCCCCAGGGCTCTGAAGTCCTCTTTGGCGATGATTTAGTGGAAACTTAACTAGGAGGAGCTGCTCCCTTCTGCATTCAAAGCCAGGCTTTAGGAAACTGTATGTTTCTGTCTTGAATGTGGTAAAGCAAATGAATTTTCAAATTATCAGGGCTGCTTTGTGTTCCCCTGAGACTGCACCTTTCACAGTATCACTGAGACAAAAAATGAGCAGAAAATTACCCCTGCTACTTAGGCTTTTGTAAGAAAATTCGTTTCGGGGACATTTTCTTTGTTCTGACTTTCTCTGGCCCTGAGTGGGGAATAAGTTCATTTTTATTTCATTGAAATCAGAAAGCTATATCTTAAAAAAAAAAAAATTATCTACCCAGCACTGCAGTTACAATTGCTTTGCGAAATATAGCCCTGTCCATCTCGGTGGTGTGTGAGGGGGTCCCCTACGGCCCGCTCTGTGCCAGTCACCCCCTGGCAGGCGCCGAGCTGAGGCAGGCATCAGGCACACTTGCTGACGCACTCCAGCAGCTCCATCCGGATGGCAATGCGGACGTGCCAGCCCAGCGGGATGAGGTGGATGAAGCGGGAGATGATGGGGGGCCGCAGCAGGTTCTGAACCGTGGAGGTGCGGTCCGAGTTGCCATAGAAGACCTAGAGAGATAGAGGAAATCCTGTCACCATCACATCGGGGAGGGAAAAGGAAGAAGGGTTCCTTTCTGGAGCTAGCCCCAACTTTTAACTATAGAAATGATTAGGAAGTAGTTAAAGCAGTTTGCGGGTGCCCCCCAAAATCTGACCTTGAGTGATTGTCATCACACCTACATGCTTGGGACATCTGGAACTGCACCATCCAATAGGGTGGCCACTAGCCAATATGTCTGTTTACACTTCAATTAATTAAAATTAGATAAAAATTCAGTTCCTCAGTCACATGAGCCACATTTCAAGTGGCCGCCATATTGGACAGTGCAGATGTGAACATTTCCATCACAGAAAGTTCTATTGGAGGGTGCTGCTAGAAAATGCCACTTGACTCATCGCTTTTGAGTTTTTATCCTTTGCATTTTGACATTTTGAAAAGGCCCACATCACACTTACATGTTCCAAAGGTATCCAAAGTAGGGCTCAAGTGAAAACCCGTGCTTGGCTCAGGAGTTGTAAGCCAAAACTTAAATGTGTATTCCTACTTTGATACAAGTGATGAGTACCTTTCCAACTTGGAAAATGTTTTTTTAAAAAGACATAAAAACTTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCGGATCGTTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACACACAGTGAGACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCAGGTGCCTGTAAATCCCAGCTACTCTGGAGGCGGAGGCAGGAGAATTACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTACAGTGAGCTGAGATCACACCGTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAAAGACATAAAAACTCGAAGGAAGATTCTGGAAAGGGGAGGGTGGTGCCAGAGTAAAGAGAAAGGGGGTTTGCTTAGTGTTTTTAAGGATGTAACATAAAAACATGCTGTGGGTGTTTGACGCCATTTCCAAAGAAATCATTCTTTGCCCTCTTACCAAAGTCATGGTGCTCTGCCTGATGCCACTAGGACATTTCATCTCCTTCTGGGATTATCTCCTGAAAATATCTGGCTGTTGCATTTGGCCCCATCCATCCACAAAACGGGAAGGGCCTGGTCTGCCATGTTCTTGCCTTTCTCCGCAGTGGCACCGCCCCACACCACCCTCTCTATTGCAGTTTGTCTTTGAGCCTATTCAAGTCAGGAGCCAGGTGAAGAGAGGGGAGGGTGGAACAGGCTCCACCAGATTGCACAAGTGCAGGGGTGAAGTGCCTCTTTGCAAAGAACCTTCAAGGCCTTCAGAAGCACAGGGCTTGAAAAACTTCTCATGTCTTTTGAAGAGGCCAGCTAATAAGAATAAAAATGAAATTAAATGTCCAAGTATCAAGATGGTTTTTCCTCTTGTGTTCAAACTCCTTGGAACAACCCATGAACGTCTTGGCCGTACAAATTGTCATCAGAGACTTACAAAGCCTTCTGAATCTCAGCTGTACATGTCTACTTAACCTGATTAAATGTTGAAATTAGCCTGGGGAACTCCTTACTCTTAGGCAAAAGGATGTTTACCATTTCCAAAGAGCTAGGGAGTTTTTAATTCATTTTTATTCATAGCAAATATATATATATATATATAGTCAGGAGTCTACTGCGTTTAGTCAATGGTGAAGAAGACTTCTGTCTCAATCCACAAAGATTAATAGGATGTAGAGTTGCCCAAAGGTTTAAGTTCGTCTGTGTTTGTGCTGGTGAAGTCCTTTTAACCATTTGGCTAATGGGTAACTTGCTAGGTTCTCAAAAGGCTCCCCTCTGTCAGTCTCAAACAATAGGAGAGGCCACATCTATATAAATGGATGATTCTCTACCCACATCAATAACATCAGACCATACCCGTGAAGCAAAGTGCATTCAATGA
Task1_train_29198
This alteration occurs within gene CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Retinal dystrophy
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Task1_train_29199
A variant was discovered on Chromosome X, affecting CDKL5, RS1 (cyclin dependent kinase like 5| retinoschisin 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Retinal dystrophy
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