_id
stringlengths 2
7
| title
stringclasses 1
value | partition
stringclasses 3
values | language
stringclasses 1
value | meta_information
dict | text
stringlengths 5
1.76k
|
|---|---|---|---|---|---|
c219220
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получите локальный файл FASTA, соответствующий указанному региону.
|
||
c219240
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Формирует команду для запуска EricScript с использованием функции `do.run`.
:param tx_output_dir: расположение, куда все выходные данные EricScript будут записаны во время выполнения.
:param input_files: итерируемый набор с путями к двум fastq файлам с входными данными.
:return: список
|
||
c219260
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Преобразовать выровненный файл SAM в формат BAM.
|
||
c219280
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Отфильтровать VCF по предварительно рассчитанным меньшим регионам.
|
||
c219300
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Удалите ненужную информацию из примера данных, уменьшив размер для передачи сообщения.
|
||
c219320
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Обработка индексов и очистка объединенных BAM файлов и входных файлов.
|
||
c219340
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Преобразуйте пример выходных данных во входные данные для конфигурационных файлов CWL с типами.
|
||
c219360
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Рассчитать статистики для VCF в целях фильтрации, сохраняя их в файл для быстрого повторного запуска.
|
||
c219380
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Подключиться к SeqCluster для выполнения кластеризации напрямую с использованием Python
|
||
c219400
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Подготавливает базы данных Gemini параллельно, обрабатывая популяции, вызванные совместно.
|
||
c219420
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возврат DeepVariant вызова на гемизиготные образцы.
Возможный участок может быть единым участком или списком нескольких участков для вызова с несколькими ядрами.
|
||
c219440
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Адаптируйте использование многопроцессорности для предотвращения излишнего использования памяти на основе информации о системе.
|
||
c219460
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
работайте с Cutadapt в режиме парного окончания
|
||
c219480
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выберите хромосомы для обработки, избегая лишних пропусков через хромосомы.
|
||
c219500
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлечь вызовы зародышевых клеток для указанного образца, если это только опухоль.
|
||
c219520
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выполняйте интросомные вызовы с помощью Octopus, обрабатывая и парные, и только опухолевые случаи.
Подробности по улучшению для низкой частоты, только опухолевых случаев и вызовов UMI указаны в:
https://github.com/luntergroup/octopus/blob/develop/configs/UMI.config
|
||
c219540
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлеки строку для использования индель-коллера, или пустую строку, если не указано.
|
||
c219560
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
bgzip и tabix индексируют входной файл, обрабатывая форматы данных VCF и BED.
|
||
c219580
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлечение статистики по разрешению неоднозначностей из указанного файла.
|
||
c219600
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получите необходимые команды для запуска THetA с использованием локального bcbio Python.
|
||
c219620
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Организуйте результаты контрольных работ в основной файл и вспомогательные выходные данные.
Обеспечивает совместимость с выходными данными CWL. Возвращает None, если во время обработки не созданы файлы.
|
||
c219640
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вызов копий номеров из нормализованного и сегментированного входного файла.
|
||
c219660
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Используйте sambamba для выборки региона из BAM файла
|
||
c219680
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Организуется информация события из переданного файла YAML или API Галактики.
Создается высокоуровневая структура, используемая для последующей обработки.
sample_names — это список образцов для включения из общего файла, в случаях, когда мы запускаем несколько пайплайнов из одного конфигурационного файла.
|
||
c219700
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверьте, является ли формат_качество равным "стандартному" и формат_fastq не является "сэнджер".
|
||
c219720
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Преобразуйте флоу-кель в таблицу проб для демультиплексирования.
|
||
c219740
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть подмножество BED-файла по определенному региону хромосомы.
variant_regions - это файл в формате BED, region - это имя хромосомы или кортеж (name, start, end) для геномного региона.
|
||
c219760
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вызвать системную команду в фоновом режиме, отключиться от неё и скрыть её вывод.
|
||
c219780
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Импортировать палитру из файла с расширением JSON.
|
||
c219800
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Использовать для переопределения метода pprint format для устранения префиксов Unicode.
Например, использовать 'John' вместо u'John'.
|
||
c219820
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Составьте часть текста Аргументы для справки по использованию.
Параметры
---------
options : list[sacred.commandline_options.CommandLineOption]
Список всех поддерживаемых параметров командной строки.
Возвращает
---------
str
Текст, отформатированный как описание поддерживаемых аргументов командной строки, основанный на указанных параметрах.
|
||
c219840
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Конвертируйте путь к файлу Python в список названий модулей.
|
||
c219860
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Требуется и используется функция для сбора функций с помощью декоратора `gather_from_ingredients` в `Ingredient`. Не используйте эту функцию саму по себе вне декоратора!
Переопределив эту функцию, вы сможете фильтровать, что видно при сборе (например, команды). См. пример в `Experiment._gather`.
|
||
c219940
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Функция утилиты, используемая для создания парных гауссовских потенциалов. Она работает для всех размерностей изображений. В случае 2D она выполняет те же действия, что и `DenseCRF2D.addPairwiseGaussian`.
Параметры
----------
sdims: список или кортеж
Масштабирующие факторы по каждой дименсии. Они обозначаются как `sxy` в `DenseCRF2D.addPairwiseGaussian`.
shape: список или кортеж
Размер CRF.
|
||
c219960
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить сырые строки файла жанра.
|
||
c219980
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Определяет избыточный коэффициент Шарпа стратегии.
Параметры
----------
returns : pd.Series или np.ndarray
Ежедневные накопленные доходности стратегии, неаккумулированные.
- См. подробное объяснение в :func:`~empyrical.stats.cum_returns`.
factor_returns : float / series
Бенчмарковая доходность для сравнения с доходностью результата.
out : array-like, optional
Массив, чтобы использовать как буфер вывода.
Если не передан, будет создан новый массив.
Возвращает
-------
excess_sharpe : float
Примечание
-------
Избыточный коэффициент Шарпа - упрощенный коэффициент информации, который использует отклонение в качестве знаменателя, а не «активный риск».
|
||
c220000
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Удалить узел из планировщика.
Это следует вызывать или после сбоя узла, или во время завершения работы.
В первом случае все назначенные на узел ожидающие элементы будут перепланированы.
Вызывается хуками:
- ``DSession.worker_workerfinished``.
- ``DSession.worker_errordown``.
Возвращает элемент, выполнявшийся на узле в момент сбоя, или None, если у узла нет больше ожидающих элементов.
|
||
c220020
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращаем новый узел на основе существующего.
Это обычно для случая, когда узел погибает, это скопирует спецификацию существующего узла и создаст новый узел с новым идентификатором. Новый узел будет настроен так, что вскоре начнет вызывать фукнции с префиксом "worker_*" и выполнять работу.
|
||
c220040
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Взять команду из сообщения
:возврат:
|
||
c220060
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверка токена аутентификации
:param data:
:param token:
:return:
|
||
c220080
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выберите целевое сообщение.
:param сообщение:
:return:
|
||
c220100
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Используйте этот метод для создания нового пригласительного адреса для чата; любой ранее созданный адрес аннулируется.
Бот должен быть администратором в чате для того, чтобы это работало, и у него должны быть соответствующие административные права.
Источник: https://core.telegram.org/bots/api#exportchatinvitelink
:param chat_id: Уникальный идентификатор целевого чата или имя пользователя целевого канала
:type chat_id: :obj:`typing.Union[base.Integer, base.String]`
:return: Возвращает экспортированный пригласительный адрес в виде строки в случае успеха
:rtype: :obj:`base.String`
|
||
c220120
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Зарегистрировать обратный вызов для процесса завершения работы
:param callback:
:param polling: использовать с опросом
:param webhook: использовать с вебхуком
|
||
c220140
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавить префикс к метке
:param prefix:
:param iterable:
:return:
|
||
c220160
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Декоратор для обработчика запросов обратных вызовов
Пример:
.. code-block:: python3
@dp.callback_query_handler(lambda callback_query: True)
async def some_callback_handler(callback_query: types.CallbackQuery)
:param state:
:param custom_filters:
:param run_task: запуск обработки в задаче (без ожидания результатов)
:param kwargs:
|
||
c220180
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить запись из хранилища
:param chat:
:param user:
:return:
|
||
c220200
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Остановите анализ как можно скорее.
|
||
c220220
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращает зеркальную копию доски.
Доска зеркально отражается по вертикали, и цвета фигур меняются местами, так что позиция эквивалентна модуло цвета.
|
||
c220240
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получает UCI нотацию хода.
*chess960* по умолчанию использует режим доски. Передайте ``True``, чтобы принудительно задать режим Chess960.
|
||
c220260
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выбирает случайную запись для указанной позиции, распределённую в соответствии с весами записей.
:raises: :exc:`IndexError` если ни одна запись не найдена.
|
||
c220280
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверить статус загрузки
Параметры
----------
upload: str
Идентификатор загрузки или словарь со строковым ключом 'id'.
username : str
Имя пользователя аккаунта, по умолчанию имя пользователя сервиса.
account : str, **устарело**
Подстановка для username. Будет удалено в версии 1.0.
Возвращает
----------
requests.Response
|
||
c220300
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращает изображение одного маркера без любой
картографической основы.
Параметры
---------
marker_name : str
Форма и размер маркера.
label : str, необязательный
Алфавитно-цифровой метка маркера.
Возможности - буква от a до z, число от 0 до 99 или
имя действительного иконок Maki.
color : str, необязательный
Цвет маркера.
Возможности включают цветовые коды в шести- или трехзначном
шестнадцатеричном формате.
retina : bool, необязательный
Масштаб маркера, где True указывает на масштаб с
поддержкой Retina (двойной масштаб), а False
указывает на стандартный масштаб.
Значение по умолчанию - false.
Возвращает
----------
request.Response
Объект ответа, содержащий указанный маркер.
|
||
c220320
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Определите, нужно ли пропускать данный объект.
Если это экземпляр модели является родителем единственного инстанса подкласса, пропустите его.
Подклассный инстанс создаст для нас экземпляр родителя.
TODO: Дать пользователю возможность принудительно создать его?
|
||
c220340
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Разделите запрос на недействительность на группы по 1000 объектов
|
||
c220360
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Верните длину этой ломаной линии в метрах.
|
||
c220380
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверьте даты начала и истечения срока действия файла.
Выдайте предупреждение, если он начинается только в будущем, или если истекает срок действия менее чем через 60 дней.
Аргументы:
problems: Объект объект объект, репортер проблем
first_date: Объект даты, представляющий первый день, когда файл активен
last_date: Объект даты, представляющий последний день активности файла
today: Объект даты, представляющий дату проведения проверки службы
Возвращает:
None
|
||
c220400
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создай метод для определения, в какую KML-папку должен попасть останов.
Аргументы:
stop_folder: родительская папка для всех остановок.
Возвращает:
Функцию, которая должна принимать аргумент Stop и возвращать кортежи (KML-папка для остановки, KML-папка для путей).
Дан факт, что у нас есть остановка, нам нужно определить, в какую папку она должна попасть. В самом простом случае, это корневая папка Стопов. Однако, если показать иерархию остановок включен, мы помещаем остановку в отдельную подпапку в зависимости от того, является ли она станцией, платформой, входном пунктом, или просто остановкой. Этот метод возвращает функцию, которая используется для выбора той папки, в которую должна попасть остановка. Он также опционально возвращает папку, в которую должны быть добавлены все линейные связи, связанные с остановкой (например, чтобы показать путь между входом и станцией).
|
||
c220420
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть кортеж значений calendar.txt, или None, если этот период обслуживания не должен находиться в calendar.txt.
|
||
c220440
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Опционально закодируйте текст и верните его. Результат должен быть безопасен для печати.
|
||
c220460
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавьте поездку в этот маршрут.
Аргументы:
- schedule: объект Schedule, который будет содержать новую поездку, либо None для использования расписания этого маршрута.
- headsign: headsign поездки в виде строки
- service_period: объект ServicePeriod или None для использования schedule.GetDefaultServicePeriod()
- trip_id: необязательный trip_id для новой поездки
Возвращает:
- новый объект Trip.
|
||
c220500
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сила делает старый и новый календари не пересекающимися начиная с даты-граничной точки.
Это обрезает периоды обслуживания старого графика настолько, что обслуживание останавливается на один день раньше указанной даты-граничной точки и обрезает новый график настолько, что обслуживание начинается только с даты-граничной точки.
Аргументы:
cutoff: Дата-граничная точка в виде строки в формате YYYYMMDD. Часовой пояс тот же, что используется в файле calendar.txt.
|
||
c220520
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Дано остановочный пункт с идентификатором stop_id и время в секундах с полуночи. Вернуть следующие поезда, которые должны посетить остановочный пункт.
|
||
c220540
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Верните отсортированный список объектов StopTime для этого рейса.
|
||
c220560
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить структурные свойства и метаданные опроса
Создать объект описания, который при передаче в `segyio.create()` создаст новый файл с такой же структурой, размерами и метаданными, как и ``f``.
Принимает открытый SEGY-файл (созданный с использованием `segyio.open`) или имя файла.
Параметры
---------
``f`` : str или ``segyio.SegyFile``
Возвращает
----------
``spec`` : ``segyio.spec``
Примечания
----------
.. versionadded:: 1.4
|
||
c220580
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Предложения для определительно положительной матрицы с использованием отклонений случайного обхода на Чолескском факторе текущего значения.
|
||
c220600
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Одно выполнение алгоритма t-walk
|
||
c220620
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Пусть следы обрезаются на заданном индексе.
|
||
c220640
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Генерирует итерационные выборки из априорного распределения.
|
||
c220660
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Внутренний метод для определения минимального интервала заданной ширины
Предполагается, что массив x — отсортированный массив numpy.
|
||
c220680
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавить значения Пуассона
|
||
c220700
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Построение гистограммы с воспроизведенными данными, показывающей местоположение наблюдаемых данных
:Аргументы:
simdata: массив или объект PyMC
История симулированных данных или объект стохастической переменной PyMC, содержащий историю.
trueval: числовой
Истинное (наблюдаемое) значение данных.
bins: int или string
Количество ячеек или предпочтительный метод бининга. Доступные методы включают 'doanes', 'sturges' и 'sqrt' (по умолчанию 'doanes').
format (опционально): string
Формат графического вывода (по умолчанию png).
suffix (опционально): string
Суффикс имени файла.
path (опционально): string
Указывает расположение для сохранения графиков (по умолчанию локальный каталог).
fontmap (опционально): dict
Словарь шрифтов для графики.
|
||
c220720
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Логарифмическая функция правдоподобия категориального распределения. Самое общее дискретное распределение.
.. math:: f(x=i \mid p) = p_i
для :math:`i \in 0 \ldots k-1`.
:Параметры:
- `x` : [int] :math:`x \in 0\ldots k-1`
- `p` : [float] :math:`p > 0`, :math:`\sum p = 1`
|
||
c220740
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Ожидаемое значение мультиномиально-гипергеометрического распределения.
Параметры:
- `n` : Количество вытягиваний.
- `m` : Количество элементов в каждой категории.
|
||
c220760
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Нелицентральное распределение Стьюдента логарифмический правдоподобия.
Описывает нормальную случайную величину, точность которой распределена по гамма-закону.
.. math::
f(x|\mu,\lambda,\nu) = \frac{\Gamma(\frac{\nu + 1}{2})}{\Gamma(\frac{\nu}{2})}
\left(\frac{\lambda}{\pi\nu}\right)^{\frac{1}{2}}
\left[1+\frac{\lambda(x-\mu)^2}{\nu}\right]^{-\frac{\nu+1}{2}}
:Параметры:
- `x` : Входные данные.
- `mu` : Параметр локализации.
- `lambda` : Параметр масштаба.
- `nu` : Степени свободы.
|
||
c220780
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сделайте синхронный запрос с использованием поставщика
|
||
c220800
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращает кортеж, содержащий все имена пакетов, доступные в текущем реестре.
|
||
c220820
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Преобразование из имени, например 'ethfinex.eth', в метку, например 'ethfinex'.
Если имя уже является меткой, выполнение этой операции не должно вызывать изменений, кроме преобразования в строку и проверки синтаксиса имени.
|
||
c220840
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
```plaintext
Создайте класс WordVectors на основе текстового файла word2vec
Параметры
----------
fname : путь к файлу
vocabUnicodeSize: максимальная длина строки (78, по умолчанию)
desired_vocab: если установлено, это будет игнорировать любое слово и вектор,
которые не попадают в desired_vocab.
Возвращает
-------
Инстанс класса WordVectors
|
||
c220860
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Используется crispy_forms_tags для получения атрибутов помощника
|
||
c220880
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Передавайте события позиции курсора мыши на пример.
|
||
c220900
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Обновите содержимое текстуры.
Аргументы:
face (int): Сторона для обновления.
data (bytes): Данные пикселей.
viewport (tuple): Видимая область.
Ключевые аргументы:
alignment (int): Выравнивание байтов пикселей.
|
||
c220920
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проблема мультиномиальной логистической регрессии
|
||
c220940
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
производная функции связи по mu
Параметры
----------
mu : массив длиной n
dist : экземпляр распределения
Возвращает
-------
grad : np.array длиной n
|
||
c220960
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
оцените p-значения для всех признаков
|
||
c220980
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Построить экземпляр Term из словаря
Параметры
----------
cls : класс
info : словарь
содержит всю информацию, необходимую для построения термина
Возвращает
------
экземпляр Term
|
||
c221000
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Для Python 2.x.
# Возвращает
Следующую порцию.
|
||
c221020
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Загрузить настройки из диска.
Считать данные настроек в формате JSON из указанного пути, или из стандартного местоположения в ``/var/lib/sos/presets``.
:param presets_path: каталог, содержащий JSON-настройки.
|
||
c221040
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Определите, работает ли на платформе узел, запускающий etcd
|
||
c221060
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Отправь запрос на выполнение внешней команды и верни её вывод или пустую строку в случае ошибки.
|
||
c221080
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Запустите программу или список программ и получите вывод
|
||
c221100
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Верни список предметов, которые находятся в `a` или `b`.
|
||
c221120
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Напишите всю метаданные скрипта, включая постоянный скрипт Набор.
Инстанс Набора может содержать произвольные пользовательские данные, например, объекты функций, контексты OpenCL или любые другие
несериализуемые объекты, как ключи или значения.
Попробуйте сериализовать данные, и если это не удается, используйте резервный вариант: проверьте хранилище и удалите все
несериализуемые данные.
|
||
c221140
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Это называется, когда пользователь успешно завершает запись комбинации клавиш.
|
||
c221160
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Захватите все горячие клавиши, относящиеся к окну
Используется при создании нового окна
|
||
c221180
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Рисует 2D каркас в 3D, определяемый 2D-массивами x, y, z в порядке.
См. также: ipyvolume.pylab.plot_mesh
:param x: {x2d}
:param y: {y2d}
:param z: {z2d}
:param color: {color2d}
:param bool wrapx: когда True, ось x считается замкнутой, и многоугольники рисуются между начальной и конечной точками
:param bool wrapy: аналогично для оси y
:return: Mesh
|
||
c221200
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Метод для трейсера установить ID клиента темперировщика.
|
||
c221220
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Загружает все компоненты по указанным путям. Каждый путь должен быть пакетом или модулем. Все компоненты внутри пути загружаются.
Аргументы:
paths (str): Пакет или модуль, который нужно загрузить.
Ключевые аргументы:
include (str): Регулярное выражение для включения в список загрузки пакетов и модулей. По умолчанию соответствует '.*'
exclude (str): Регулярное выражение для исключения из списка загружаемых пакетов и модулей. По умолчанию соответствует 'test'
continue_on_error (bool): Если True, продолжать загрузку даже если возникает ImportError. Если False, выбросить первый возникший ImportError.
Возвращает:
int: Общее количество загруженных модулей.
Поднимает:
ImportError
|
||
c221240
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Собирать информацию из журнала для отладки
|
||
c221260
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Доводит предикаты, которые принимают аргумент, в DSL.
|
||
c221280
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Свяжитесь с API учета инвентаря, чтобы проверить, существует ли машина.
Возвращает
True система существует в инвентаре
False система не существует в инвентаре
None ошибка соединения или обработки ответа
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.