_id
stringlengths 2
7
| title
stringclasses 1
value | partition
stringclasses 3
values | language
stringclasses 1
value | meta_information
dict | text
stringlengths 5
1.76k
|
|---|---|---|---|---|---|
c244060
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавить данные Mutex в объект Batch.
Аргументы:
mutex (str): Значение для этой индикаторной метки.
confidence (str, kwargs): Уровень угрозы для этого индикатора.
date_added (str, kwargs): Дата и время создания индикаторной метки.
last_modified (str, kwargs): Дата и время последнего изменения индикаторной метки.
rating (str, kwargs): Уровень угрозы для этой индикаторной метки.
xid (str, kwargs): Внешний идентификатор для этой индикаторной метки.
Возвращает:
obj: Экземпляр Mutex.
|
||
c244080
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выведите результат команды пакета.
|
||
c244100
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Метод операции CRUD для работы с базой данных KeyValue.
Этот метод автоматически проверяет, передана ли одна переменная или переданы «смешанные» данные, и возвращает результаты из базы данных. Он также автоматически определяет тип переменной для чтения.
Аргументы:
ключ (строка): Переменная для чтения из базы данных.
массив (логическое): Преобразовать строку/словарь в массив/список перед возвратом.
встроенный (логическое): Разрешить встроенные переменные.
Возвращает:
(любой): Результаты, извлеченные из базы данных.
|
||
c244120
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Постройте TCEntityArray из ответа ThreatConnect в формате JSON.
.. Внимание :: Этот метод часто изменяется.
Аргументы:
tc_data (словарь): Массив данных, возвращенных от вызова API TC.
value_fields (список): Имена полей, которые содержат данные "value".
resource_type (строка): Тип ресурса данных tc_data, предоставленных.
resource_type_parent (строка): Родительский тип ресурса данных tc_data, предоставленных.
Возвращает:
(список): Список, представляющий TCEntityArray.
|
||
c244140
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть имена в layout.json.
|
||
c244160
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создать объект TI url.
Аргументы:
owner:
url:
**kwargs:
Возвращается:
|
||
c244180
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Метод внутреннего окружения для динамического создания классов пользовательских индикаторов.
|
||
c244200
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Точка признака на метках безопасности для этого ресурса.
Этот метод вернет все *ресурсы* (группа, индикаторы, задача, жертвы и т.д.) для этого ресурса, которым применена указанная метка безопасности.
**Примеры конечных точек URI**
+--------------+----------------------------------------------------------------------+
| HTTP Метод | API-конечные точки URI |
+==============+======================================================================+
| GET | /v2/securityLabels/{resourceId}/groups/{resourceType} |
+--------------+----------------------------------------------------------------------+
| GET | /v2/securityLabels/{resourceId}/groups/{resourceType}/{uniqueId} |
+--------------+----------------------------------------------------------------------+
| GET | /v2/securityLabels/{resourceId}/indicators/{resourceType} |
+--------------+----------------------------------------------------------------------+
| GET | /v2/securityLabels/{resourceId}/indicators/{resourceType}/{uniqueId} |
+--------------+----------------------------------------------------------------------+
Аргументы:
resource_id (string): ID ресурса источника (имя метки безопасности).
|
||
c244220
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавить escalatee к задаче
GET: /v2/tasks/{uniqueId}/escalatees
GET: /v2/tasks/{uniqueId}/escalatees/{escalateeId}
POST: /v2/tasks/{uniqueId}/escalatees/{escalateeId}
DELETE: /v2/tasks/{uniqueId}/escalatees/{escalateeId}
Аргументы:
escalatee (по желанию [строка]): Имя escalatee.
resource_id (по желанию [строка]): Идентификатор задачи.
|
||
c244240
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Преобразовать дату и время в секунды эпохи.
|
||
c244260
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Коды ошибок ThreatConnect.
|
||
c244280
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получает делегированных для ускорения задач
|
||
c244300
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращать конфигурационные данные.
Загружать при первом доступе, иначе возвращать существующие данные.
.. code-block:: python
self.profiles = {
<имя профиля>: {
'data': {},
'ij_filename': <имя файла>,
'fqfn': 'tcex.json'
}
}
|
||
c244320
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверить, что поле начинается с указанного значения.
Аргументы:
filter_value (строка): Строка или список значений.
Возвращает:
(boolean): Результат проверки
|
||
c244340
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Резервное копирование всего JSS в XML-файл.
Для каждого типа объекта получите все объекты, а затем заархивируйте всё сэндвич. Это, почти наверняка, займет много времени!
Архивация — это метод Python для сериализации/десериализации Python-объектов. Это позволяет сохранить объект JSSObject на диск и затем загрузить его позже без необходимости извлечения из JSS.
Аргументы:
path: строковый путь к файлу, который вы хотите перезаписать. Путь будет раскрыт до открытия.
|
||
c244360
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте SubElements у корня с помощью kwargs.
Аргументы:
root: Элемент, к которому добавляются SubElements.
item: Ключ/значение в виде кортежа из self.data_keys, которое добавляется.
kwargs:
Для каждого элемента в self.data_keys, если он имеет соответствующий kwargs, создайте SubElement у корня со значением kwargs.
Значения int и bool будут приведены к строкам. (Int 10, bool False становятся строковыми значениями "10" и "false").
Словари будут рекурсивно добавлены к элементу их ключа.
|
||
c244380
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Удалить файл из всех репозиториев, которые поддерживают это.
Одиночные репозитории определят, откуда следует его удалять (скрипты или пакеты).
Это не удалит соответствующий объект пакета или скрипта из базы данных JSS!
Аргументы:
filename: Имя файла, которое вы хотите удалить (не указывайте путь).
|
||
c244400
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть кортеж потенциальных строк подключения.
Casper Admin кажется, что может подключаться несколькими способами:
- hostname/share
- fqdn/share
Кроме того, есть возможность:
- IPAddress/share
Затем учитывайте возможность того, что порт может быть включен!
Это дает нам до шести действительных адресов для подключения для отчета.
|
||
c244420
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создать новый пакет с нуля.
Аргументы:
name: Строка с именем файла пакета, используемого для
отображения имени объекта Package (здесь "name").
Оно также будет использоваться как значение "filename". Casper
позволит указать разные значения, но это не рекомендуется.
kwargs:
Приемлемые ключевые слова включают все верхнеуровневые ключи.
Значения будут приведены к строке. Значения (например, Int 10, bool False)
станут строками ("10" и "false").
|
||
c244440
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Оцените начальный шаг
|
||
c244460
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Для обратной совместимости
|
||
c244480
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вычислите плотность в зависимости от параллельного угла с использованием сплайнового представления и приближений.
|
||
c244500
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Метод readrows просто 'объединяет' строки из множества файлов ИЛИ разархивирует файл и затем читает строки.
|
||
c244520
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Записать JSON на диск.
Аргументы:
path (str): путь, куда надо записать
contents (dict): содержимое JSON-блоба
message (str): сообщение для лога
|
||
c244540
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Чтение из `path`.
Маленькая вспомогательная функция для чтения из `файла`.
Аргументы:
- `path` (str): путь для чтения.
- `file_type` (str, опционально): тип файла. Текущая реализация принимает
`text` или `binary`. По умолчанию `text`.
- `exception` (Exception, опционально): исключение, которое будет выброшено,
если чтение из файла не удалось. По умолчанию `ScriptWorkerException`.
Возвращает:
- `None`, если чтение из `path` не удалось и `exception` равно `None`
- `str` или `bytes`: содержимое `path`
Поднимает:
- `Exception`, если `exception` установлено.
|
||
c244560
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получите номер запроса на вытягивание, который создал график.
Аргументы:
obj (ChainOfTrust или LinkOfTrust): объект доверия, который нужно проверить.
source_env_prefix (str): Префикс переменной окружения, используемый для получения информации о репозитории.
Возвращает:
int: номер запроса на вытягивание.
None: если номер запроса не определен для этой задачи.
|
||
c244580
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Определяет, отмечено ли артефакт как необязательный или нет.
Аргументы:
chain (ChainOfTrust): объект цепочки доверия
task_id (str): идентификатор упомянной задачи
Возвращает:
bool: True, если артефакт необязателен
|
||
c244600
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить исходный URL объекта Trust.
Аргументы:
obj (ChainOfTrust или LinkOfTrust): объект доверия, который нужно проверить
Возникает:
CoTError: если репозиторий и источник определены и не совпадают
Возвращает:
str: исходный URL
|
||
c244620
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Обновите настройки логирования Python из конфигурации.
По умолчанию эта функция настраивает логирование в `scriptworker`, но это изменится, если какой-либо другой модуль вызовет эту функцию или задаст параметр `log_name`.
* Используйте форматирование из настроек конфигурации.
* Логируйте на экран, если включен `verbose`.
* Добавьте вращающийся лог-файл на основе настроек конфигурации.
Аргументы:
`context` (scriptworker.context.Context): контекст scriptworker.
`log_name` (str, опционально): имя Выхода, которое нужно изменить.
Если None, используйте верхний уровень модуля ('scriptworker').
По умолчанию None.
|
||
c244640
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Начинает сеанс с кластером NATS Streaming.
:param cluster: Имя кластера, к которому будет установлена связь.
:param nats: Подключение NATS, которое будет использоваться для NATS Streaming.
|
||
c244660
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавьте примеры из наборов.
|
||
c244700
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Для получения дополнительной информации см. cloudvolume.lib.save_images.
|
||
c244720
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Существует множество различных типов исключений, которые могут быть вызваны этим методом. Мы хотим убедиться, что возвращаем только None, если файл не существует.
|
||
c244740
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверяет, находится ли точка на или внутри определяющей области.
Возвращает: булево
|
||
c244760
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Устанавливает `matching_method` для этого `SearchQuery`.
Метод, с помощью которого выполняется поиск по совпадениям. По умолчанию: CONTAINS # noqa: E501
:param matching_method: `matching_method` для этого `SearchQuery`. # noqa: E501
:type: str
|
||
c244780
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Верните короткое сообщение для кода статуса CIM.
|
||
c244800
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Тестирует все профили в server.profiles, чтобы определить, присутствует ли профиль в
всей словаре all_profiles_dict.
Возвращает список профилей в profile_dict и определённом сервере. Если add_error_list равно True, также добавляет профили, не найденные в
PROFILES_WITH_NO_DEFINITIONS.
|
||
c244820
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Это метод низкого уровня, вызываемый pywbem в конце операции. Он завершает измерение для указанной операции, захватывая необходимые данные и обновляя данные статистики, если статистика включена для соединения.
Параметры:
request_len (:term:`integer`)
Размер тела HTTP-запроса с сообщением CIM-XML, в байтах.
reply_len (:term:`integer`)
Размер тела HTTP-ответа с сообщением CIM-XML, в байтах.
exception (:class:`py:bool`)
Логический параметр, указывающий, произошла ли ошибка при обработке операции.
server_time (:class:`py:bool`)
Время в секундах, которое сервер, по желанию, отправляет клиенту в теле HTTP-ответа, определяющее время от получения запроса сервером до начала отправки ответа. Если `None`, время от сервера отсутствует.
Возвращает:
float: Прошедшее время для только что завершившейся операции, или `None`, если контейнер с статистикой, содержащий этот объект, не включен.
|
||
c244840
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Анализируйте элемент CLASSNAME и возвращайте путь к классу, который он представляет, в виде объекта CIMClassName.
Атрибуты:
<!ELEMENT CLASSNAME EMPTY>
<!ATTLIST CLASSNAME
%CIMName;>
Возвращает:
Объект CIMClassName (без namespace или хоста)
|
||
c244860
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Парсинг ожидаемого элемента IPARAMVALUE. То есть,
::
<!ELEMENT IPARAMVALUE (VALUE | VALUE.ARRAY | VALUE.REFERENCE |
INSTANCENAME | CLASSNAME |
QUALIFIER.DECLARATION |
CLASS | INSTANCE | VALUE.NAMEDINSTANCE)?>
<!ATTLIST IPARAMVALUE
%CIMName;>
Возвращает пару NAME, VALUE.
|
||
c244900
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить класс из репозитория. Получает класс, определенный classname, из репозитория, создает копию, расширяет копированный класс для включения свойств суперкласса, если не localonly, и фильтрует класс на основе propertylist и includeClassOrigin.
Здесь также устанавливается атрибут propagated.
Параметры:
classname (:term:`string`):
Имя класса для извлечения.
namespace (:term:`string`):
Пространство имен, из которого извлекается класс.
local_only (:class:`py:bool`):
Если `True`, возвращаются только свойства и методы этого конкретного класса. В противном случае возвращаются свойства и методы из суперклассов.
include_qualifiers (:class:`py:bool`):
Если `True`, включаются квалификаторы. В противном случае удаляются все квалификаторы.
include_classorigin (:class:`py:bool`):
Если `True`, возвращаются атрибуты class_origin свойств и методов.
property_list ():
Свойства, которые должны быть включены в возвращаемый класс. Если равно None, возвращаются все свойства. Если пусто, возвращаются никакие свойства.
Возвращает:
Копию класса, если найден, с установленными свойствами суперкласса, фильтрованными на основе ключевых слов в параметрах.
Возбуждает:
CIMError: (CIM_ERR_NOT_FOUND), если класс не найден в репозитории.
CIMError: (CIM_ERR_INVALID_NAMESPACE), если пространство имен не существует.
|
||
c244920
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Отправьте ответное сообщение CIM-XML обратно на WBEM сервер, указывающее на ошибку.
|
||
c244940
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть строку MOF с описанием этого экземпляра CIM.
Возвращенная строка MOF соответствует правилу ``instanceDeclaration``
ABNF, определенному в :term:`DSP0004`, но с некоторыми ограничениями:
* Pywbem не поддерживает псевдонимы экземпляров, поэтому возвращенная MOF-строка не определяет псевдонимный имя для экземпляра.
* Хотя pywbem поддерживает квалификаторы для объектов :class:`~pywbem.CIMInstance` и объектов :class:`~pywbem.CIMProperty`,
используемых как значения свойств внутри экземпляра, возвращенная строка MOF не содержит
квалификаторов для экземпляра или его значений свойств.
Порядок свойств и квалификаторов сохраняется.
Параметры:
indent (:term:`integer`): Этот параметр устарел в pywbem 0.12.
Любое значение, отличное от 0, вызывает уведомление об устаревании.
В противном случае параметр игнорируется и возвращенное описание экземпляра в MOF не отформатировано с отступами.
Возвращает:
:term:`unicode string`: Строка MOF.
|
||
c244960
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Определите пространство имен на основе строки пространства имен или `None`. Если это необходимо, используется пространство имен по умолчанию объекта соединения.
Возвращает определенное именно пространство имен для использования в качестве аргумента для `imethodcall()`.
|
||
c244980
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сгенерируйте XML подтягивание для метода-вызова с встроенной функцией.
|
||
c245000
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлечение класса CIM из локального репозитория этого класса.
Для описания параметров см.
:meth:`pywbem.WBEMConnection.GetClass`.
|
||
c245020
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Статическая функция вспомогательного назначения, которая правильно выполняет открытие файла записи репликатора для различных версий Python.
*Новая функция в pywbem 0.10.*
Это решает вопрос, где файл должен быть открыт в текстовом режиме, но это выполняется по-разному в Python 2 и Python 3.
Возвращаемый объект, подобный файлу, должен быть закрыт вызывающей стороной.
Параметры:
filename (:term:`string`):
Имя файла, в который будет записан вывод репликатора
file_mode (:term:`string`):
Опциональный режим файла. По умолчанию 'w', который перезаписывает любой существующий файл. Если используется 'a', данные добавляются в любой существующий файл.
Возвращает:
Объект, подобный файлу.
Пример::
recorder = TestClientRecorder(...)
recorder_file = recorder.open_file('recorder.log')
. . . # Выполнение операций WBEM с использованием репликатора
recorder_file.close()
|
||
c245060
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Показать использование с описанием для команд
|
||
c245080
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Угадай тип медиа для предоставленного содержимого манифеста
:param content: JSON-контент манифеста (байты)
:return: тип медиа (строка), или None, если не удается угадать
|
||
c245100
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Генератор фильтрует компоненты из компонентов_листа по имени
|
||
c245120
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Ожидайте завершения запроса составления:
:param compose_id: int, ID запроса составления, который нужно дождаться
:param burst_retry: int, количество секунд ожидания между повторными попытками до превышения длительности серии
:param burst_length: int, количество секунд, после которых переходят к более медленному интервалу повторных попыток
:param slow_retry: int, количество секунд ожидания между повторными попытками после превышения длительности серии
:param timeout: int, время ожидания окончания запроса составления
:return: dict, обновленный статус запроса составления.
:raise RuntimeError: если состояние state_name становится 'failed'
|
||
c245140
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте образ из указанного URL и добавьте тег.
Операция выполняется асинхронно, и вы должны использовать возвращённый генератор, чтобы дождаться завершения сборки.
:параметр url: str
:параметр image: ImageName, имя результирующего образа
:параметр git_path: str, путь к Dockerfile внутри Git-репозитория
:параметр copy_dockerfile_to: str, скопируйте Dockerfile в указанный путь
:параметр stream: bool, True возвращает генератор, False возвращает str
:параметр use_cache: bool, True, если вы хотите использовать кэш
:возвращает: генератор
|
||
c245160
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сформировать и вернуть адресат и текст письма для отправки.
|
||
c245180
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть количество секунд, оставшихся до истечения срока действия этого токена.
|
||
c245200
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлекает соответствующие правила для твита с уточнением полей в формате gnip.
Аргументы:
tweet (Tweet): твит
Возвращает:
list: возможные пары вида ``[{"tag": "user_tag", "value": "rule_value"}]``
из стандартных наборов правил или None, если нет правил или не найдено поле matching_rules. \n
Больше информации о данном значении см. по адресу:
http://support.gnip.com/enrichments/matching_rules.html
|
||
c245220
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть первый найденный отображаемый элемент ненулевого размера или None, если ничего не найдено.
|
||
c245240
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вернуть набор машин на основе `имен хостов`.
Любое имя хоста, которое не найдено, приведет к ошибке.
|
||
c245260
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Подключитесь к MAAS по адресу `url`, используя ранее полученный ключ API.
:param url: УРЛ MAAS, например, http://maas.example.com:5240/MAAS/
:param apikey: Ключ API, который необходимо использовать, например:
SkTvsyHhzkREvvdtNk:Ywn5FvXVupVPvNUhrN:cm3Q2f5naXYPYsrPDPfQy9Q9cUFaEgbM
:param insecure: Нужно ли игнорировать проверки TLS сертификатов при использовании HTTPS.
:return: Объект клиента.
|
||
c245280
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создать Bcache на узле.
:param node: Узел, на котором создается интерфейс.
:type node: `Node` или `str`
:param name: Имя Bcache.
:type name: `str`
:param backing_device: Устройство целевой записи или раздел, на основе которого создается Bcache.
:type backing_device: `BlockDevice` или `Partition`
:param cache_set: Кэш-набор Bcache, используемый перед устройством хранения.
:type cache_set: `BcacheCacheSet` или `int`
:param cache_mode: Режим кэширования для этого устройства.
:type cache_mode: `CacheMode`
:type backing_device: `BlockDevice` или `Partition`
:param uuid: UUID для Bcache (необязательно).
:type uuid: `str`
|
||
c245300
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте `Space` в MAAS.
:param name: Название `Space` (опционально, по умолчанию будет присвоено значение, если не указано).
:type name: `str`
:param description: Описание `Space` (опционально).
:type description: `str`
:returns: Созданный Space
:rtype: `Space`
|
||
c245320
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Установите значение конфигурации в системе MAAS.
Обратитесь к вашему серверу MAAS за признанными настройками. В качестве альтернативы используйте предварительно скомпилированные функции, также определенные на этом объекте.
|
||
c245340
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сохраните это устройство (блок-устройство).
|
||
c245360
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить родителя и отправить ему в обработчик.
|
||
c245380
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте настраиваемый `ObjectSet`, который управляется связанным `Object.`
:param manager: Управляющий `ObjectSet`. Это `Object`, который управляет этой группой объектов.
:param field: Поле на `manager`, которое создало этот управляемый `ObjectSet`.
:param items: Объекты в `ObjectSet`.
|
||
c245400
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Подпишите URI и заголовки.
Предполагается метод запроса `GET` без тела.
:param credentials: Кортеж из ключа потребителя, ключа токена и секрета токена.
|
||
c245440
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращает настройку формата, соответствующую типу этого узла, или None, если узел не имеет настройки формата.
|
||
c245460
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Поиск вблизи определенного списка номеров остатков и их цепей для любого указанного имени остатка.
Аргументы:
resname (str): Имя остатка, ищущееся вблизи заданных цепей и номеров остатков.
model: Объект модели Biopython
chains (str, list): ID цепи или их ID для проверки
resnums (int, list): Номера остатков в цепи для проверки
threshold (float): Отсечка в ангстремах для возвращения True, если RESNAME находится поблизости
Возвращает:
bool: True, если RESNAME находится в пределах отсечки
|
||
c245480
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Разделить список на списки размером n.
Аргументы:
l: Список элементов.
n: Размер новых списков.
Возвращает:
list: Список списков, где каждый из них размером n, полученный из l.
|
||
c245500
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Извлечение пометок для аминокислоты или диапазона аминокислот.
Аргументы:
start_resnum (int): Номер аминокислоты
end_resnum (int): Опциональный номер аминокислоты, укажите, если требуется диапазон
Возвращает:
dict: Пометки букв для этой аминокислоты или аминокислот
|
||
c245520
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Вычисляет процент остатков, которые находятся на поверхности или зарыты, а также, являются ли они полярными или неполярными. Возвращает словарь, содержащий эту информацию.
|
||
c245540
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Изолировать рецептор, удалив все, кроме белка и указанных лигандов.
Аргументы:
- keep_ligands (str, list): Лиганд(ы), которые нужно оставить в файле PDB
- force_rerun (bool): Если метод должен быть перезапущен, даже если существует выходной файл
|
||
c245560
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте файл FoldX под названием 'individual_list.txt', но случайно переставьте номера мутаций или аминокислоты, которые были введены.
Перестановки случайных сочетаний могут быть немного запутанными - это то, что может произойти:
- randomize_resnums=False, randomize_resids=False: нет изменений, оригинальные мутации выполняются.
- randomize_resnums=True, randomize_resids=False: мутации аминокислоты X в аминокислоту Y будут выполняться, но на другом номере аминокислоты, где найдена аминокислота X.
- randomize_resnums=False, randomize_resids=True: мутации аминокислоты X# в случайную аминокислоту будут выполняться.
- randomize_resnums=True, randomize_resids=True: оригинальные мутации игнорируются, случайные мутации любой аминокислоты выполняются.
Аргументы:
list_of_tuples (list): Список кортежей, указывающих группы мутаций, которые необходимо случайно переставить.
original_sequence (str, Seq, SeqRecord): Оригинальная аминокислотная последовательность
randomize_resnums (bool): Требуется ли случайным образом переставлять номера аминокислот
randomize_resids (bool): Требуется ли случайно переставлять сами аминокислоты
skip_resnums (list):
|
||
c245580
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возврат DictList, содержащего только указанные типы в атрибуте последовательности.
Аргументы:
seq_type (SeqProp): Тип объекта
Возвращает:
DictList: Фильтрованный DictList соответствующих только указанному типу объекта
|
||
c245600
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить все аннотации на уровне остатков, хранящиеся в поле ``letter_annotations`` объекта SeqProp для заданного номера остатка.
Используются представительская последовательность, структура и идентификатор цепи, хранящиеся по умолчанию. Если нужны другие свойства из других структур, укажите соответствующие идентификаторы. Алайнмент для данной последовательности по отношению к структуре должен присутствовать в списке sequence_alignments.
Аргументы:
seq_resnum (int): Номер остатка в последовательности
seqprop (SeqProp): Объект SeqProp
structprop (StructProp): Объект StructProp
chain_id (str): Идентификатор цепи в структуре для получения аннотации
use_representatives (bool): Если следует использовать представительские идентификаторы последовательности/структуры/цепи
Возвращает:
dict: Все доступные letter_annotations для указанного номера остатка
|
||
c245620
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Сопоставьте идентификаторы UniProt представительских последовательностей с ID PDB с помощью API "Лучших структур" PDBe. Сохраните файл JSON результатов в каталоге ``sequences`` каждого белка.
API "Лучшие структуры" доступен по адресу https://www.ebi.ac.uk/pdbe/api/doc/sifts.html. Список структур PDB, сопоставленных с идентификатором UniProt, отсортированный по покрытию белка, а при одинаковом покрытии — по разрешению.
Аргументы:
seq_ident_cutoff (float): Порог идентичности последовательностей в десятичной форме.
outdir (str): Каталог, в который будут сохранены результаты поиска в виде JSON-файлов.
force_rerun (bool): Повторное получение JSON-файлов, если они уже существуют.
Возвращает:
list: Сортированный список объектов PDBProp, соответствующих идентификатору UniProt.
|
||
c245640
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получи числа и нормализуй по количеству белков, представляя в виде процентов.
|
||
c245660
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Запускаем функцию search_ss_bonds из Biopython, чтобы найти потенциальные дисульфидные мостики для каждой цепочки и сохраняем результат в ChainProp.
Будем добавлять список кортежей пар в поле аннотаций. Он выглядит примерно так:
[ ((' ', 79, ' '), (' ', 110, ' ')),
((' ', 174, ' '), (' ', 180, ' ')),
((' ', 369, ' '), (' ', 377, ' '))]
Где каждая пара — это пара цистеиновых остатков, находящихся достаточно близко друг к другу в пространстве.
|
||
c245680
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Анализируйте KEGG flatfile и возвращайте словарь метаданных.
Ключи словаря:
refseq
uniprot
pdbs
taxonomy
Аргументы:
infile: Путь к KEGG flatfile
Возвращаемое значение:
dict: Словарь метаданных
|
||
c245700
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Оболочка для _store_disorder
|
||
c245720
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Объедините гауссовское видеопредставление с оригиналом и сохраните в файл.
|
||
c245740
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить номер текущего активного раунда.
Аргументы:
tournament (int): ID турнира (опционально, по умолчанию 1)
Возвращает:
int: номер текущего активного раунда
Пример:
>>> NumerAPI().get_current_round()
104
|
||
c245760
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить название спутника, используемого в rsr-reader, из платформы и номера.
|
||
c245780
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Конвертировать из длины волны в числовую плотность волн.
Единицы:
Длина волны: микрометры (1e-6 м)
Числовая плотность волн: см⁻¹
|
||
c245820
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создать абсолютный URL из относительного.
>>> url_formatter = URLFormatter("example.com", 80)
>>> url_formatter.get_abs_url("kml_master.kml")
'http://example.com:80/kml_master.kml'
|
||
c245840
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создать объект MapSource из xml-файла MOBAC MapSource.
Аргументы:
xml_path: путь к файлу xml MapSource MOBAC.
mapsource_prefix: корневой путь папки mapsource.
Используется для определения относительного пути внутри директории карт.
Примечания:
Мета-информация читается из xml-тегов <id>, <folder>, <name>. Если <id> недоступен, он по умолчанию принимает имя базового файла xml. Если тег <folder> не доступен, он по умолчанию принимает папку файла xml с удаленным `mapsource_prefix`.
Сначала функция пытается получить <url>, <minZoom>, <maxZoom> из тегов <customMapSource> внутри тега <layers>. Если тег <layers> недоступен, функция пытается найти <url>, <minZoom> и <maxZoom> на уровне верхнего уровня. Если ни одна из этой информации не найдена, выбрасывается исключение MapSourceException.
Возвращает:
MapSource:
Поднимает:
MapSourceException: когда файл xml не может быть правильно проанализирован.
|
||
c245860
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверьте переменную servers и преобразуйте ее в корректную форму кортежа.
|
||
c245880
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте объект-заглушку для манипуляций
|
||
c245900
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Существенно, противоположность отложенной загрузки. Только поля, передаваемые в этот метод и которые не указаны как отложенные, загружаются немедленно при оценке queryset.
|
||
c245920
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Добавьте фильтр или список фильтров в запрос.
Если предоставлен последовательность фильтров, все они будут добавлены и комбинированы с помощью ANDFilter.
Если предоставлен последовательность запросов, все они будут добавлены и комбинированы с помощью BooleanQuery(must).
|
||
c245940
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить все закрытые индексы.
|
||
c245960
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Проверяет запросы, сделанные Plivo на ваши сервера.
:param uri: URL ваших серверов
:param nonce: X-Plivo-Signature-V2-Nonce
:param signature: заголовок X-Plivo-Signature-V2
:param auth_token: токен авторизации Plivo
:return: True, если запрос соответствует подписи, False в противном случае
|
||
c245980
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Построй граф BEL на основе рёбер.
|
||
c246000
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Обработайте наследственный фьюжн.
|
||
c246020
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Выбрось исключение, если пространство имен не описано или если оно не подтверждает заданное имя.
|
||
c246040
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Обрабатывайте транспозиции, которые не имеют записей «fromLoc» и «toLoc».
|
||
c246060
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Создайте узел-предикат, который является обратным для данного узлового предиката.
|
||
c246080
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Постройте гистограмму для всех отношений в графе.
:param pybel.BELGraph graph: BEL-граф
:return: Счетчик из {тип отношения: частота}
|
||
c246100
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Возвращайте true, если узел содержит хотя бы один out_edge, который является причинным.
|
||
c246120
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Получить объединение всех подграфов (направленных) первого уровня из бабеля графа для указанного набора нод.
:param pybel.BELGraph graph: BEL граф
:param nbunch: BEL нода или список BEL нод
:return: Подграф исходного BEL графа
:rtype: pybel.BELGraph
|
||
c246140
|
train
|
{
"resource": ""
}
|
Удалите сеть, а также очистите любые рёбра, которые больше не являются частью какой-либо сети.
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.