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A mutation found in PHKA1 (phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Glycogen storage disease IXd
ATAGAGAAACTGAAGAAGTCAATGATAATAGTTGGGCACTCAATGGTCAGGAGTGAAACCAAAAATTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAGGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACGCGGCCGAAACCAAAATTTTTTTAAAAAGAAGAAAAAAATAATCCAGGTCTTTTTACTCTTAGTGCCCTCAACTAGTAGCCTGTAGGGAACAACTGTCTCTCCCCTATTAGGAAGACTTCCAACTGGACACAGGGTTGGTATACTATTAGCTGTAAGAAGATATAACAAAAACATTCTGCTGAAAACTCTTTCCCCAGCTTATTACCTGTTCTGCATTGCCACTGAAGACCCCATCAAGAATAAAGTATGTCCAGAACAATGGCCATTCACACTCAATGTTTTCAAATAGCTTCAGCTCAGCTGGTTCATAGTACAGACGATTGGGATCCTAGTAAAAACACAATAAAGTCTGTCATCACTCAGAGGTTAGATGTATATCTTTAGCTCAGAGGTATTATAATACGGGTTTTCATTACTGATTGTTTTAGAGAAGGTGTTCAGGAAGCAGAGCATGTACATACTCCCTTCCCTTAGCAAGTACTCTATGATGCGACTTCTAACTAGCGGAATTGGGATAGCAATGATATCACAAGAGGGTGTATGAAGAAATAAGATTGGTTTGCAATAAAGTTCAGTTTGGTTTTATATTTGTTAAGTTTTTTGTAATAATAGGACATACAAGTAGAAATGTTTAGAAGGGCAACTAGAGATGAGGGTTTGGGAATCATTTTCCTAGAGGTGACATATGAAGTACAAGTTACAGATGAGCTTTGTGAAATAGCACTAAATGAAATGAGCAAACTGCTCAAGAATGGAATCTTGGTAAACCCTCAGAGTGGGGCAAGGGAATAACAGAAAGAGAAGAATCAGGATAATCTAGTGGGAAAATTAAAATAGGAAAAGAATTTCAAGAGAATTTAGGGCTAGGTAAAAAGTGAGGTACCATAGAGAAGTCAAGGAGAATAAGGATTCAGAAAAGGCTATTGGATTGGTCATTTAAGAGCTTATGATGATGTTTCAGAACATATAATTTTAGTACACTGATAGGGGAAGAAGTCAAATTCAAGGCTAAAAAATAAAGTGGAAGAGGAAGTAGACCAGAAGAGTTTGAGCTCGATGATTTAAAAAAATCCATAATGTCTCTCAAACATCAAATCTAAGCTTTAAACAATGTTTCCATTACCAGTGAAAGTGCTTCATATTGACTGTTCAATCCCTTTAATGATACTGAATTTTTCTCATTGATATTTCCAAGGTGAACTTTTGACTAGTTGAATAAAGGGAACGTAAACTTTTCAAAATCAAGTACTGTTTAGAACTAACCAACTACAAGAGGTGGAATGTGGGGCCAGAAAGATCTACTGATGGAAAGATTTTTCCCTTTGTAATTGTTAAATATTTTGGGAGAGATACTTTGAGACAATGCAAATACTATTTCTGTATAAGCTTTCATCCACTGATTTTACCATGTATCTGTAGTTCTTTCCCGAAACTAACCAATGCAAGAGGTGGAAGGACTACACCTTCCTCTATTTTACTTAATCCAGAAAGGCCTACAAACTGAGAACTTGGCAGCTAAGCCAAGTTCAACAAATATAGCAAACATCAGTTATCATTATCCTACTTAGTGATCTCTATAAGTACCATCAGTGAGGTAAATATTTTCTCTGAATGAGGCTGCAGGTAGAAGTGGCCATTCTACCTTGGATTCATTTTGGAGAAAAGAAACCTACCTCTTTAGGAGTTTTATATCCATCTCGTAGAAAGCGACAGCAACCATAACGACCCTGGGAATACAAAGAAAAAAGGTCAGCAGCTTGTACACTGGTACGGCCATGTAATTAATCAGAAATACATCCTTGCAACATCTATATGTACCACCAACCTATCACCGATAAAGGCATAATGCTTAAAACCAAAAAACCTATAATAATATAATAATGCTTAAAACCAAAAAATCAATCCAGCAGCAGAAACAGATTTCAGCAATGTGATTTCAAGTGAAGGCAAAGTGACAGGCTCTTCACTAAAGCAGTGTTCCTAACAGTATCCTCTCCATGGCTATCCACCTAGGGTAAGTCTGACAGCATAATTACTAATCTATGTGGTCCTGTTCATAAGACACATACAGCTCATAAGTCATAAGACTCCATAAGCTTTTTAAAAAAACACATATTTTTTACATTTTGAGATAATTTTAGATTTACAGAAGAGTTGCAAAAACAGTACAGAGAATCCCAGTATTCCTGTCAACCACCATTCCGTTATAGTCACATCTTATATAACCATAGAAATCTGCCAAAACTAAAAAATTAACCTTGGTGGCTGGGTGTAGTGGCTCATGCCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGGCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATGTGGTGAAACCTTGTCTTTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACGTGACCGTAGTCCCAGTTATTCAAGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGACACAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTGGTACGATACTATTAACCAAAGCCCATAACTTATTTGGATTTCATCAGTTGTCCTTTTTTCTGTTCTAGGACCCAATTCAGGATCCCATATTGCATTCAGTCATCATGTCTCCTTAGTGTCCTCCAATCTATGACAGTTCCTCAGTCCTTCCTTGTTTTTAATGACCTTGACACTTCTGAAGAGTGTTCATCAGTTATTTTGTAGAATGCCCCTCGATTTGGTTTTGTTTGATGTTTTCTCATGATCAGAGTACGGTTATGCATATTGGGAAGGATACCACAGAAGTGATGTGCCCTTCTCAGTGCATTGTATGAGAGAGTACATGATGTCAATGTGTCCTATTACTGGTGATGTTAACCCTGATCACTTGGTTAAAGTGGTGTCTGCTGAATTTCTCCACTGTAATTTTCCATTTGTAACTATTAAATATTTTGGGGGAGATACTGTGAGACTATTCGAACACCTTCGTTATGCTTAAGCTTTTGTCTACTGGTTTTAGCATCCATCAGTAGATTTCTCCTGAAATAATTGTTATTCTTGTGTTTGTCTAATGGCAATTTTGTATTTCCTTTATTCCTTTAGCATTTATTAATTGACATTCTCCTATTAGGGAGATCTGTCTTCTTTCCTATTTATTCATTTTTCAGTTATTTATTTATATCAGTATGGACTTATGGACATTTCATTTATTCTCTGGGTTATAATCCAATACTATGATAGTTATTTTATTGTTCAAATTTTTTCTGCTTTGGCCATTAGAAGCACTTTTCAGATGGTTCCTGTGTTCCTTTGACATGTTCCATACTTTTCTGAGTACCTCTTTATTTTCTAGAACCATATGAAACTCCAGGCTCCCCTTGTATCCTCCCTGCCCCAGTCAAATCAACCACTTCTCCAAGGAGCCCTAAGTCCTTTCATTGAGAATGACATTTAGAAACCAACATTTGGACACTAGGTGTACTCATTGCCTCTGGGCCCTCTCAGTGGACAAAGTTAGGAAACACATATAGGAAGACACACATCCCTATATTAAACACACACAGACACACAGACACACACACATACACACTTCATACTGATACTACCTTCTCCAATCCAACATCACAAGGTTCATTCTAGGCTTTTCCCATTCCCTATGTGTAACAGTGAGAAACCTAGGTCTCATTACCCACTA
ATAGAGAAACTGAAGAAGTCAATGATAATAGTTGGGCACTCAATGGTCAGGAGTGAAACCAAAAATTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAGGCTCCGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACGCGGCCGAAACCAAAATTTTTTTAAAAAGAAGAAAAAAATAATCCAGGTCTTTTTACTCTTAGTGCCCTCAACTAGTAGCCTGTAGGGAACAACTGTCTCTCCCCTATTAGGAAGACTTCCAACTGGACACAGGGTTGGTATACTATTAGCTGTAAGAAGATATAACAAAAACATTCTGCTGAAAACTCTTTCCCCAGCTTATTACCTGTTCTGCATTGCCACTGAAGACCCCATCAAGAATAAAGTATGTCCAGAACAATGGCCATTCACACTCAATGTTTTCAAATAGCTTCAGCTCAGCTGGTTCATAGTACAGACGATTGGGATCCTAGTAAAAACACAATAAAGTCTGTCATCACTCAGAGGTTAGATGTATATCTTTAGCTCAGAGGTATTATAATACGGGTTTTCATTACTGATTGTTTTAGAGAAGGTGTTCAGGAAGCAGAGCATGTACATACTCCCTTCCCTTAGCAAGTACTCTATGATGCGACTTCTAACTAGCGGAATTGGGATAGCAATGATATCACAAGAGGGTGTATGAAGAAATAAGATTGGTTTGCAATAAAGTTCAGTTTGGTTTTATATTTGTTAAGTTTTTTGTAATAATAGGACATACAAGTAGAAATGTTTAGAAGGGCAACTAGAGATGAGGGTTTGGGAATCATTTTCCTAGAGGTGACATATGAAGTACAAGTTACAGATGAGCTTTGTGAAATAGCACTAAATGAAATGAGCAAACTGCTCAAGAATGGAATCTTGGTAAACCCTCAGAGTGGGGCAAGGGAATAACAGAAAGAGAAGAATCAGGATAATCTAGTGGGAAAATTAAAATAGGAAAAGAATTTCAAGAGAATTTAGGGCTAGGTAAAAAGTGAGGTACCATAGAGAAGTCAAGGAGAATAAGGATTCAGAAAAGGCTATTGGATTGGTCATTTAAGAGCTTATGATGATGTTTCAGAACATATAATTTTAGTACACTGATAGGGGAAGAAGTCAAATTCAAGGCTAAAAAATAAAGTGGAAGAGGAAGTAGACCAGAAGAGTTTGAGCTCGATGATTTAAAAAAATCCATAATGTCTCTCAAACATCAAATCTAAGCTTTAAACAATGTTTCCATTACCAGTGAAAGTGCTTCATATTGACTGTTCAATCCCTTTAATGATACTGAATTTTTCTCATTGATATTTCCAAGGTGAACTTTTGACTAGTTGAATAAAGGGAACGTAAACTTTTCAAAATCAAGTACTGTTTAGAACTAACCAACTACAAGAGGTGGAATGTGGGGCCAGAAAGATCTACTGATGGAAAGATTTTTCCCTTTGTAATTGTTAAATATTTTGGGAGAGATACTTTGAGACAATGCAAATACTATTTCTGTATAAGCTTTCATCCACTGATTTTACCATGTATCTGTAGTTCTTTCCCGAAACTAACCAATGCAAGAGGTGGAAGGACTACACCTTCCTCTATTTTACTTAATCCAGAAAGGCCTACAAACTGAGAACTTGGCAGCTAAGCCAAGTTCAACAAATATAGCAAACATCAGTTATCATTATCCTACTTAGTGATCTCTATAAGTACCATCAGTGAGGTAAATATTTTCTCTGAATGAGGCTGCAGGTAGAAGTGGCCATTCTACCTTGGATTCATTTTGGAGAAAAGAAACCTACCTCTTTAGGAGTTTTATATCCAACTCGTAGAAAGCGACAGCAACCATAACGACCCTGGGAATACAAAGAAAAAAGGTCAGCAGCTTGTACACTGGTACGGCCATGTAATTAATCAGAAATACATCCTTGCAACATCTATATGTACCACCAACCTATCACCGATAAAGGCATAATGCTTAAAACCAAAAAACCTATAATAATATAATAATGCTTAAAACCAAAAAATCAATCCAGCAGCAGAAACAGATTTCAGCAATGTGATTTCAAGTGAAGGCAAAGTGACAGGCTCTTCACTAAAGCAGTGTTCCTAACAGTATCCTCTCCATGGCTATCCACCTAGGGTAAGTCTGACAGCATAATTACTAATCTATGTGGTCCTGTTCATAAGACACATACAGCTCATAAGTCATAAGACTCCATAAGCTTTTTAAAAAAACACATATTTTTTACATTTTGAGATAATTTTAGATTTACAGAAGAGTTGCAAAAACAGTACAGAGAATCCCAGTATTCCTGTCAACCACCATTCCGTTATAGTCACATCTTATATAACCATAGAAATCTGCCAAAACTAAAAAATTAACCTTGGTGGCTGGGTGTAGTGGCTCATGCCTGTAACCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGGCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATGTGGTGAAACCTTGTCTTTACAAAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACGTGACCGTAGTCCCAGTTATTCAAGAGGCTGAGGTGGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGACACAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCCTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAAGTGAGACTTTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTGGTACGATACTATTAACCAAAGCCCATAACTTATTTGGATTTCATCAGTTGTCCTTTTTTCTGTTCTAGGACCCAATTCAGGATCCCATATTGCATTCAGTCATCATGTCTCCTTAGTGTCCTCCAATCTATGACAGTTCCTCAGTCCTTCCTTGTTTTTAATGACCTTGACACTTCTGAAGAGTGTTCATCAGTTATTTTGTAGAATGCCCCTCGATTTGGTTTTGTTTGATGTTTTCTCATGATCAGAGTACGGTTATGCATATTGGGAAGGATACCACAGAAGTGATGTGCCCTTCTCAGTGCATTGTATGAGAGAGTACATGATGTCAATGTGTCCTATTACTGGTGATGTTAACCCTGATCACTTGGTTAAAGTGGTGTCTGCTGAATTTCTCCACTGTAATTTTCCATTTGTAACTATTAAATATTTTGGGGGAGATACTGTGAGACTATTCGAACACCTTCGTTATGCTTAAGCTTTTGTCTACTGGTTTTAGCATCCATCAGTAGATTTCTCCTGAAATAATTGTTATTCTTGTGTTTGTCTAATGGCAATTTTGTATTTCCTTTATTCCTTTAGCATTTATTAATTGACATTCTCCTATTAGGGAGATCTGTCTTCTTTCCTATTTATTCATTTTTCAGTTATTTATTTATATCAGTATGGACTTATGGACATTTCATTTATTCTCTGGGTTATAATCCAATACTATGATAGTTATTTTATTGTTCAAATTTTTTCTGCTTTGGCCATTAGAAGCACTTTTCAGATGGTTCCTGTGTTCCTTTGACATGTTCCATACTTTTCTGAGTACCTCTTTATTTTCTAGAACCATATGAAACTCCAGGCTCCCCTTGTATCCTCCCTGCCCCAGTCAAATCAACCACTTCTCCAAGGAGCCCTAAGTCCTTTCATTGAGAATGACATTTAGAAACCAACATTTGGACACTAGGTGTACTCATTGCCTCTGGGCCCTCTCAGTGGACAAAGTTAGGAAACACATATAGGAAGACACACATCCCTATATTAAACACACACAGACACACAGACACACACACATACACACTTCATACTGATACTACCTTCTCCAATCCAACATCACAAGGTTCATTCTAGGCTTTTCCCATTCCCTATGTGTAACAGTGAGAAACCTAGGTCTCATTACCCACTA
Task1_train_30401
A mutation on Chromosome X affecting PHKA1 (phosphorylase kinase regulatory subunit alpha 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Glycogen storage disease IXd
TAATGGGACTGAATCAGTAATAAAATGTACTCCGATGAAGAAAAGTCCAGGAATGGATGGCTTTATTGCTGAGTTCTACCAAACTTTTAAAGAGCTAAAACCAAACTACTCCAGTAAATTGAAGGGGAGGGAATTCTTCCAAACTCACTACAAGGCCAGCAGTACCCTGAAACCAAAACTGACGAGGACACAAGAACAACAAAAAACCCATGGGCCAATATCCCTGATGAACATAGATGCAAAAATCCTCAACAAAATACTGTCAAAACAAATCCAACAGCACATCAAAAAGATTATACACCATGATTAAATCTGATCAAGTTGGTACCTTGTATCTTTTTATTGTTGAGCAGTATTCTACTGCATGAATATAGTGTAATTTGTTTATCCCTTCCTCTGTTGAAGGTTTTTTCCAGTTTTTGGCAATTATGAATAAAGCTGCTGTAAACATTTGTGTGCAGATTTTTTTGTGAGCATAAGTTTTCATTTCTGTAGGGTAGATTTCTAGGATGACATAGTTGGGTTATAAGGCAGGTGTATGATTAAATTTATAAGAAACTGCCAAACTGTTTTCTAAAGTGGGTGTACCACCCTGCATTGCTACCAGGAACGGCTGTAGAAGCTTTAACACTTTTAAAAGAAACTATAAAGACAACTCAGAAAACTTAAAGGTTTCTTGAAATCACAGACACAGGTCATACTTAAGGCCCCCAAAGGCACAATTTATCCTTAAAGTCACAGCCTTAAAGAAAACAAAGGTACATAGGGACATACCTGAAGCTTGGTGATGATTTCCTGTTTTGTGAGCTCCACCAACTGGCTATCCTCTACTGCAAAGGCAGGGAAGGAAACCACTGAGAGTAGACTAGCATCAACCTCTTTTGATGTTGAAGCACGGGGCAGTAGTGAATTTAGGATAGACTAAGAGAAAAGAAGTTAAGTTTATATAAAAGGATGTATTTCTTCTCCCTTTACCCCAATATCTTATCAACACACATGATATCACTTTTGAATATGTTTGACAAAATAGAAAAGAACATTCTTTATCTATTTTAAGTAGGTTAGTAAATACCTTAGCATTGTAAAACTAATAGCTTTAGTTTCAAAAGATTTATGTAGAAGAGGACCATTCACAAGAAAATCTAGACATTATTCAATAGTTAGAACTTAGAAAACCAGCAATTTCTGAAAATCATCCCTTGTCTTAATTCTGCTCTCAATACTTCCCTATCCTGATTCTTAACCAGTTACTCACAGATAAGGAATATTCTAACATTATTATACCACCCACAGTCCTGTTGCTCCATTAGCAACTACTTAAGAATAAAGTCAAGAGAAAACACAGCTGCTAAGAAGCAGGATAGGGAAGGCTCAGCTCCTCTACTTCTGACCCACTTTTTTCCTCTGGGAAATTTTGTGTTTTTAAAATTGGAGATGAGTTTATATTCAATAGGACCCTATGGTATCTAATCAGGGTTTGAAGGAAAGGAGAAAATTCCTCATGCCAATGAGAAAAACCTTAATCTTTCAATATGGAGAGTAATCCTAAACAAAACTGAAAATACATATTTGCCACTTAAAGTCTAATCTCCAAATATCTAAGCCTAGAGCCAACCAGGAACAAGAGAATGTTTCAGAAACACTAACAAGAATACTACAAATCCATCATCTCTGGTTTTCTTTATATATTTAGAAAAGGAGATACTCAGAAAGAGAGACCATATCCCTTTGATATGATAGTGGTGGATAATTCCACATAGTATGGTGGGATCCCTTTATAACCTTTGGCTAGAGAACAGGACTATGATCTATTTTATAGCCCATGCTATATTTGGCTTATCTCAGTATAGTATGCTTGTTAAATATATTTTTGGTACATGGTAATTAATCAGATGATGCACTGTCTCTCATTCAGCTATCCTTAATCTAAAGCTCATGCTTAAATCTGAGTCTGGGCAAGAATAAAATTTGCTATTTCCATTTTCCATAATATTTTACCTGGCAGTGCTGTACTTCATCAGCCAGGACATGGATAACTGATTGAGGCCCACCTTTCACACCAAACAGATCCAGTTCATCTAATGCTTCCAGGGCTGCCTGTGAGGAACAAGAAAGAAATGGACAAGTTTAGCATTAGAAAGATATATATTTCTTCTCCCTATATCCCAGTATCTTATCAACACACATGATGTCACTTTTGAATATGTCTGACAGAATATATAATACAAAAACATTATTTATTCCCAGGGCATTCTGAGTTTTTCTTTGTCTCCCATATTGTCTCAGAGAAAGTTAAAAAGGAGTCTGTAGCACTATCAAGTATCATACTTAACCATCATTGTACTCTCTCCTTCTATGAGTTCAACTTCTTTAGATTCCACATATAAATGAGATATTATGTTTTTTAAAATAGAATTTATTTATTTATTTCTTACTTTTCTAAATATATTTTTGATCATAAAAGTAAAACACACTCCTTATAGAATACTTTGAAAACACAGTAAAGTACAGAGAGGGCAAGAAAATCACCCAAAACAACCACTTTTAACATTTTTGACATGTTTTTTATTAGTTTTTTCTATGTCTATTTGTGTACAGTTGAGATCACATCTGGTATCCTACTTTTTACAATTAATAATATAGTGTAAGTATTTTTCCACATTACAAACACTATTTTGACATACTATTATCTCATATGGCTATAATAAAGTATATTTAGCCATTTACCAATTCTTGGAAATTTAGGTCGCCTTTAATTTTGTGCTATTAGAAATAGAACTTTGATAAACATCTCTTGCTAAATTATAAATTCCTTGAGGTCGGGGATTATGTCTTCACTAATATCTAGCACAAACCATGGCATACGGTAGGCTCTCAATAATGACTGTCAAGCTAATAAAATAACTCTTTGTATTCATTTTGAGTTATTTTGTAAGCATCAATTCCCTGAAGTAGAATCATTGGGTAAAAGAGTATGAATAATTTTTAAGACATAATGCTAAATTGCTTTTCTTGCAAGTTGTACCAACATAGCTATCACTAGCAGTATATGACAATACCTTCCTTAATGCAAACAATGTATTATCTTAAACATTTTTTCCTAATGTGATTAAAAAATGGTATATCTGTTGCATTCATATGCATTAAATTGTTAACAAGATTGAATATTATTTCTAGTATTTATTAGTTATCTGTAATTCCTCAATTAAAGGGCAGACTTGACCTAGTCTTGGGGGTAGAAGCCAGTTTTGAAAGTCTTCCCTGAAGAAATGACACCTAAACTGAGACCTATAGGGTAAGTAGAAGTTGGCCAGGCACAAAATACTCATTAATTACTGCCTTACTATTCTACTCCTTACCCTCACCAAACTCATGTCCTTCTCACATATAAATACATTCATTCTAACCCCATAGCCTCAAAGTCTTAATTCATTCCAGCACCAAGGATAAGACTCAAAAGTCCAAAATCTCATCCGTGAGTCTGAAATCAAAACAAGTTATCAACTTTCAAGATACAATGGTGGTACAGGCATAAGACAGACAGAGATATTCCCATTCTAAAAGAGAGAAACAGGCAAAAAGAAAGCAGTAACAGGCTTAAAGCAAGTCTTAAACCCAGCATAGCAGACATTAAATGTGAAAGCTGAAGAATAATCCCTTTTGACTCTGCGCGCAGGTTGGGATTGGGTCTCTAAGGCCTCAGGCAGCCCTGCCCCTGTGGCTTTGATGGGTACAGCACAGGTGGCTGCTTCTATGGGTTGCAGTCTGGTATCTGAAGCTTTCTCAGGCAGACCTTGCATGCTGCCAGTGACTCCACAGTTCTGGCATCCCAGTGGTGGTCCTGCCCTAGTGGGAACTCTCTGTGGAAGCTGCAACCCCATGTTTCTGCTTCAGTGTTGCTCTAGCGGGGGCTCTCTGTTGTGGTTCCACCCCTGTGACAAGTCTCTGCCTGGGCCCAGAAGCTGTTTTTCTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTTAATTTTATTACTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAACATGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCT
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Task1_train_30402
Here is a variant affecting SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Spastic paraplegia
CTGTCTCCTCCCAGGGAGCCTCAAATCCTAGACTCTTTTGGTGAAACACAGGGAGCATGAAGCTTCTCGTTATATGGAGACCTGCCTTGAATTCTAGCTTGTCCTTGACTTGGCCCATGATCTTAGGCTAATAAATGCCTTGACCTCGTTGAGCCTCAGTTTTCGTGCAAAAAAGCAGGTAATAATAAACCTTAGGGCAATAAGGGACGTGCTCTGTTCGGGCAATGCCTTCCCTGCTGAGTGGCGTGGCCCTGTGATTTTTGAATTTGGCTGATTCCTCTCATATGGCAGCGCAAGCCCCTCAGGACGTCTATATCCTTCCACCCAGCTCCGCCAGCCCTCAGGTGCTTAATGACTGTATTTACAGGCATCTAGCGCAGCCACGCAGCCCCGGAGCTGCATCACCTCTGGCTATGCAGTCTTTCACTTATCAGGAGGGTTAATGAGATGCAGGGTAGAAAGGTCTTGCCACTCGCCCGCCCGCTCGTGGAAGCCGAGTAGCTTGGTAACGACACCACGACTTCACGTTTAGTGCATTAGACGCGTAGACCCTTAGGGGAGGCAGAGCTTCCCGGTATCGCCGAGCGGGCCCTGAGGGCTGAGGCTGGGCACCCCTGCGCACCCCTGCTGAGTGCCCGGCCACCAGAAAGACAGATCCCCCACCTTTCCTTCTCCCTGACCCGGCGCGCTTCCTGGGGAACAAACTCTCCCTTACCCTCAGTGGGGCTGGGGCCTCAGTCTGCGACATACAGTGGGACTCCCATGTCTGCATGCCTGAGGTGGGCGGAAGGGGGCGGTGGGTGCTGGGAAGACATCCGTCCGCTTGCAGCTCCGCTGAGTCTCCAGCACCTGAAAAGCCGCGGCCGAGGCCTGAGGGACCAGCCCAGCCGAGATATCGGGGGCGGGGCAGCCCAATCCCAAACTGGCGGCTGGACCCGACTCCAACTCGTTCCTCCTAAGTCCGGGACAGATTGTCGGGAGGAGCTTGAACTGAGCTTCGGCTCCCGACTGGGCCTGGGCCCGGCCCCCACTGGTGCCACCTCCCTCCCTTCCTGGCCCGGCTCCTGGCCCACACTCGGCCCTGGCCCGGCCCTGGCCCGGCCCAGACCCGGCCCGGCCCTGGCCCGGCCCAGACCCGGCCCTCTGAGGCTCCTCCGGGCTCCAGGTTGGCGCAAACAAAGCCCTGATTGACTGCCCGGAGGGGCGGGCCTCGCTGCATGGCCGCCTCCTCCCCTCCCAGGCCGCCAGGGATTTGCCGGGAAGAGCGGGGGCAGGGGGAGACTCCCGGGGGTGCGCAGGACCGCGGGGGGCCGAGTCCTCGGGCTCGAGAAGATTGTGTCCACCCGCTGTCCGAGGCCCAGGCTGTCCCCTCAGGTCGTCCTCCTCAAGTCCAAGGAGGGACATGGGAGCTCCTGAGGGCAGGGTGGGGTTCCTCGCGGGCCAGCTGTCGTCCTAGGGTCCCCGGTGCCACCTCAGTTGCGGGCTGCTTGTGAGGAAGGAGGGTATGGGAGCAAAAAATAGGAGGGGTCTTCCCGAGGCTCGGGGTTGATCAGTGTCGGTTCTAGAGCCTGCGGGGAAAAGAGGGCAGGAGAACAGGATAGTTTGTGCTTCCTTTTTTCCATTTTAACTTTTCCTCTAACGGGCATCCGGGCAAGAACAGGGTTCAGTAGTTTGGGAAGGGAGCTGGGGGAGGCAGTGGCGGCTGGAGTAGGTAGGCGAGTAAAAGGAGGAGGAAGGGCTGGGGAGAAGAGCGAGGCTGTAGCGGCTGCCTGTTGAGGGAGGAAGAGGTGGGGGGTGTGGAGGAGGGGGAGGAGAGAGAGATGACATGGGGAGAGGAGGAGGGGGGTTGGACGTGGGAGGAGGAGGAGAGGGCTCGAGGGACCGTCTGTCGCGGGACGGGCTGGCCAGCTGGGGCGCGGAGCCTGGAGGAGGAGGCAGCGGCAGCGGCAGCAGCAGCCCTCCGAGCAGCAGCAGCTGCAGCAGCAGAAACAAGTACCAGCCACAAAGCGGCTCCTCTGGCCCAAGCAGCCACAGTCCCCCCGCCGCGATGGCGCTGCAAAGCCAGGCGAGCGAGGAAGCAAAGGGGCCCTGGCAGGAGGCAGACCAGGAACAGCAGGAGCCGGTGGGTAGCCCAGAGCCGGAGTCTGAGCCGGAGCCTGAGCCCGAGCCCGAGCCCGTGCCAGTGCCCCCGCCCGAGCCCCAGCCGGAGCCCCAGCCCCTACCGGACCCCGCACCCCTGCCGGAGCTGGAGTTCGAGTCCGAGCGGGTGCACGAACCCGAGCCCACGCCTACGGTAGAGACCCGCGGCACCGCGCGCGGCTTCCAGCCTCCCGAAGGTGGCTTCGGCTGGGTGGTGGTGTTCGCTGCCACCTGGTGCAACGGCTCCATCTTCGGCATCCATAACTCTGTCGGGATCCTCTACTCCATGCTGCTAGAGGAGGAAAAGGAAAAAAATCGCCAAGTGGAGTTCCAAGCAGGTGAGTGGCCCCGCACGCCCCACTTGGCATTTTGGGCAAGGTTGGCCGCTCCCGCTGCCACCGACCCCATACCTCCCGGTCCGAGGCGCCCCTCCAACGCGCCTCTCCGACTCCTCCCCTTACCCCTTACCCCTTGCCCCTTGCCCCTTTCCATGGCTCTCCTAGGGTGCGGGTTGCGGGGCTTTGGGCAGCTTGGACTGGGGAGACTAGGTGCAAGGCGTCCCGGGGGTACGAACTGGGACATTCATTGATCCTTGGCAAGCAATGGACTTTTTTTTGCCCTGGGACAAATCTAAATGCACCTTTCAGGTTTAAGGTACCTTTGCCCCTGTGTGCTGGGGGAAAATATTTGCAGGACTTTTTTTTTTTTTGGAGGTGGGGAGAAGTCATGAGGAGAGGAGAGAATTGAGAGGCGGGGCGGGCTCTGAGAGAAGCACTGTACCGCTGATCTCCGCAGCAGCCCCCCGGTTCCTTTGGGGAAACGGAGGTGTTTTCTGTTAAAAACACTTTAGGAATCCTGATGACTATGAGCGAAGAGTCAAACACATGGCAGGCGTGCGTGTCTGCAAGAGAGAAAGGGAGGGAGGGAGTTCGAGTCGGGGTGTGAGTGCGTCTCTGGCCGCCGCCGTTACGGCCCAGCTGGGCCCGGCAGTCCTCTGCCGCCCCGCGGGAGTGAATGGATCTCCGTGCCCTATGAGCCGAGCCCCAGAGCGGGCGGGGAGGCGGTCTCCGCAGTCTCCTGCCAGAGAGGCGTGAGGCCGCAGGCAGGCTGGGCCCTGCTGCTCACTCCGCACCGCCCCCAACTTCAGCCCTGCCTTCCCCGGCAACCCGCGCCTCTCTGCTACCGGTGGGGTGCCTCGTTCGGCCTACAGCCTGAGTGCCAGACCCGCCATTCCAGCTTTCCCCTGGAGCTGACTTGATCTCAGACAGAGTTGGGGGGCATAGCCCTCGCTTTCCAGGCCAGTGGACGCAAGACCCCAGGCGTGTGCGCTCTTCTCATTGAGGCCGCCTGTGAGCTGGGAGAAGTCAGAGGAACCATCTCGCTTTCCCAGCAAAGCCGCTGGCGAAATCCCTCAGCAGTTCTGGTGAGGGATTCAGACGAAGACGGGGGATTGGGATGCCCTCTCTGGCAAGGCTTGCTCCCTCTCGTGGCTCCTCAGGACAGCTCGACTCTTGCCACCAGCCCCAAGTTCACAACTCAGAATATGTGGCTTTTCGCAGTGTTGCCCTCGGACTGAGGAGTTCCATCCTCTCGCCAACCTCCAACCCCCACATATTTCTACTGCCATTTGAGGGGACCTGGGAATTATTAAGTGAACATAGAAACCTTGAATTCTGGAGTGTCCACCTGTGGATTCCCTGGGCCCTCTCCAGGACTTGTGGTTTTAGTTTGCAGCTTTGCTGGACTTCCCTGGCAGAAGGGGCTTTGGGGATCTTGGTGCCTCAGACCTTGTGATCCATTGGCACAGCAGCGGTGTGCAGGCCCCGATGAAGATAGTGCGTCAGTGGTTGTCAAAGGAAGTCTCTTGACTACCCAGGCCCACTGTGATGCTGGAATGGAGGGGTCCTGGGACAGTGTAGAGCAACTTCTGCGGGGAAGATGGCTGCCACAGTCACCC
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Task1_train_30403
Gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
CACGCAGCCCCGGAGCTGCATCACCTCTGGCTATGCAGTCTTTCACTTATCAGGAGGGTTAATGAGATGCAGGGTAGAAAGGTCTTGCCACTCGCCCGCCCGCTCGTGGAAGCCGAGTAGCTTGGTAACGACACCACGACTTCACGTTTAGTGCATTAGACGCGTAGACCCTTAGGGGAGGCAGAGCTTCCCGGTATCGCCGAGCGGGCCCTGAGGGCTGAGGCTGGGCACCCCTGCGCACCCCTGCTGAGTGCCCGGCCACCAGAAAGACAGATCCCCCACCTTTCCTTCTCCCTGACCCGGCGCGCTTCCTGGGGAACAAACTCTCCCTTACCCTCAGTGGGGCTGGGGCCTCAGTCTGCGACATACAGTGGGACTCCCATGTCTGCATGCCTGAGGTGGGCGGAAGGGGGCGGTGGGTGCTGGGAAGACATCCGTCCGCTTGCAGCTCCGCTGAGTCTCCAGCACCTGAAAAGCCGCGGCCGAGGCCTGAGGGACCAGCCCAGCCGAGATATCGGGGGCGGGGCAGCCCAATCCCAAACTGGCGGCTGGACCCGACTCCAACTCGTTCCTCCTAAGTCCGGGACAGATTGTCGGGAGGAGCTTGAACTGAGCTTCGGCTCCCGACTGGGCCTGGGCCCGGCCCCCACTGGTGCCACCTCCCTCCCTTCCTGGCCCGGCTCCTGGCCCACACTCGGCCCTGGCCCGGCCCTGGCCCGGCCCAGACCCGGCCCGGCCCTGGCCCGGCCCAGACCCGGCCCTCTGAGGCTCCTCCGGGCTCCAGGTTGGCGCAAACAAAGCCCTGATTGACTGCCCGGAGGGGCGGGCCTCGCTGCATGGCCGCCTCCTCCCCTCCCAGGCCGCCAGGGATTTGCCGGGAAGAGCGGGGGCAGGGGGAGACTCCCGGGGGTGCGCAGGACCGCGGGGGGCCGAGTCCTCGGGCTCGAGAAGATTGTGTCCACCCGCTGTCCGAGGCCCAGGCTGTCCCCTCAGGTCGTCCTCCTCAAGTCCAAGGAGGGACATGGGAGCTCCTGAGGGCAGGGTGGGGTTCCTCGCGGGCCAGCTGTCGTCCTAGGGTCCCCGGTGCCACCTCAGTTGCGGGCTGCTTGTGAGGAAGGAGGGTATGGGAGCAAAAAATAGGAGGGGTCTTCCCGAGGCTCGGGGTTGATCAGTGTCGGTTCTAGAGCCTGCGGGGAAAAGAGGGCAGGAGAACAGGATAGTTTGTGCTTCCTTTTTTCCATTTTAACTTTTCCTCTAACGGGCATCCGGGCAAGAACAGGGTTCAGTAGTTTGGGAAGGGAGCTGGGGGAGGCAGTGGCGGCTGGAGTAGGTAGGCGAGTAAAAGGAGGAGGAAGGGCTGGGGAGAAGAGCGAGGCTGTAGCGGCTGCCTGTTGAGGGAGGAAGAGGTGGGGGGTGTGGAGGAGGGGGAGGAGAGAGAGATGACATGGGGAGAGGAGGAGGGGGGTTGGACGTGGGAGGAGGAGGAGAGGGCTCGAGGGACCGTCTGTCGCGGGACGGGCTGGCCAGCTGGGGCGCGGAGCCTGGAGGAGGAGGCAGCGGCAGCGGCAGCAGCAGCCCTCCGAGCAGCAGCAGCTGCAGCAGCAGAAACAAGTACCAGCCACAAAGCGGCTCCTCTGGCCCAAGCAGCCACAGTCCCCCCGCCGCGATGGCGCTGCAAAGCCAGGCGAGCGAGGAAGCAAAGGGGCCCTGGCAGGAGGCAGACCAGGAACAGCAGGAGCCGGTGGGTAGCCCAGAGCCGGAGTCTGAGCCGGAGCCTGAGCCCGAGCCCGAGCCCGTGCCAGTGCCCCCGCCCGAGCCCCAGCCGGAGCCCCAGCCCCTACCGGACCCCGCACCCCTGCCGGAGCTGGAGTTCGAGTCCGAGCGGGTGCACGAACCCGAGCCCACGCCTACGGTAGAGACCCGCGGCACCGCGCGCGGCTTCCAGCCTCCCGAAGGTGGCTTCGGCTGGGTGGTGGTGTTCGCTGCCACCTGGTGCAACGGCTCCATCTTCGGCATCCATAACTCTGTCGGGATCCTCTACTCCATGCTGCTAGAGGAGGAAAAGGAAAAAAATCGCCAAGTGGAGTTCCAAGCAGGTGAGTGGCCCCGCACGCCCCACTTGGCATTTTGGGCAAGGTTGGCCGCTCCCGCTGCCACCGACCCCATACCTCCCGGTCCGAGGCGCCCCTCCAACGCGCCTCTCCGACTCCTCCCCTTACCCCTTACCCCTTGCCCCTTGCCCCTTTCCATGGCTCTCCTAGGGTGCGGGTTGCGGGGCTTTGGGCAGCTTGGACTGGGGAGACTAGGTGCAAGGCGTCCCGGGGGTACGAACTGGGACATTCATTGATCCTTGGCAAGCAATGGACTTTTTTTTGCCCTGGGACAAATCTAAATGCACCTTTCAGGTTTAAGGTACCTTTGCCCCTGTGTGCTGGGGGAAAATATTTGCAGGACTTTTTTTTTTTTTGGAGGTGGGGAGAAGTCATGAGGAGAGGAGAGAATTGAGAGGCGGGGCGGGCTCTGAGAGAAGCACTGTACCGCTGATCTCCGCAGCAGCCCCCCGGTTCCTTTGGGGAAACGGAGGTGTTTTCTGTTAAAAACACTTTAGGAATCCTGATGACTATGAGCGAAGAGTCAAACACATGGCAGGCGTGCGTGTCTGCAAGAGAGAAAGGGAGGGAGGGAGTTCGAGTCGGGGTGTGAGTGCGTCTCTGGCCGCCGCCGTTACGGCCCAGCTGGGCCCGGCAGTCCTCTGCCGCCCCGCGGGAGTGAATGGATCTCCGTGCCCTATGAGCCGAGCCCCAGAGCGGGCGGGGAGGCGGTCTCCGCAGTCTCCTGCCAGAGAGGCGTGAGGCCGCAGGCAGGCTGGGCCCTGCTGCTCACTCCGCACCGCCCCCAACTTCAGCCCTGCCTTCCCCGGCAACCCGCGCCTCTCTGCTACCGGTGGGGTGCCTCGTTCGGCCTACAGCCTGAGTGCCAGACCCGCCATTCCAGCTTTCCCCTGGAGCTGACTTGATCTCAGACAGAGTTGGGGGGCATAGCCCTCGCTTTCCAGGCCAGTGGACGCAAGACCCCAGGCGTGTGCGCTCTTCTCATTGAGGCCGCCTGTGAGCTGGGAGAAGTCAGAGGAACCATCTCGCTTTCCCAGCAAAGCCGCTGGCGAAATCCCTCAGCAGTTCTGGTGAGGGATTCAGACGAAGACGGGGGATTGGGATGCCCTCTCTGGCAAGGCTTGCTCCCTCTCGTGGCTCCTCAGGACAGCTCGACTCTTGCCACCAGCCCCAAGTTCACAACTCAGAATATGTGGCTTTTCGCAGTGTTGCCCTCGGACTGAGGAGTTCCATCCTCTCGCCAACCTCCAACCCCCACATATTTCTACTGCCATTTGAGGGGACCTGGGAATTATTAAGTGAACATAGAAACCTTGAATTCTGGAGTGTCCACCTGTGGATTCCCTGGGCCCTCTCCAGGACTTGTGGTTTTAGTTTGCAGCTTTGCTGGACTTCCCTGGCAGAAGGGGCTTTGGGGATCTTGGTGCCTCAGACCTTGTGATCCATTGGCACAGCAGCGGTGTGCAGGCCCCGATGAAGATAGTGCGTCAGTGGTTGTCAAAGGAAGTCTCTTGACTACCCAGGCCCACTGTGATGCTGGAATGGAGGGGTCCTGGGACAGTGTAGAGCAACTTCTGCGGGGAAGATGGCTGCCACAGTCACCCCTGGGACCACCTTTTTCCCTGCTTTGATGCAGTTCAGGGGCTCCTGGGAAAGCAGGCAGTGTAGGGACTCATGCTGTTGCCTAGGTTACCTCCAAGGGCACCTGCTGAGCATTGCCCTGTGGTTGAAGGCAGGCTGTTGGCCTTCAGGATCAGTGAGTGGCAAAGTCTGAGTGAAACTTGATGAGAAGCAGTAGAGGCTAGGCTGAAGCTAGGCCCTGGCATTTATATGGTGTGAGGAGGCCTAGAGCTGTGATCTTAGGAGTGTATAATAAAACTTGGAAAAACCACTATTTTACCAGGAAGAGGCTCACTGCTGGGGAACAGACTTCAAAGTAGGTGATCATAGGGGACTCAGGGGGAGGGCTGGCTGGGACTTTCCGG
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Task1_train_30404
Mutation context: Chromosome X, Gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
TCAAGTCTAATATATCAAATCTTTTCTTTTATGGATCATACGATTTGTGAATATCTGCAAAATCTTTGCCTAACCAAAGGCCAGGAAGATTTGTCTCCTATATGTTCTTCTAGAAGTTTTATAGTTTTAAGTTTTACATTAAGTCTATGATCCATTTTGCATTGATTTTTAAACATGATGTGATTATTGATATTTACAAAGTTCTCTTCTTATACATATAATTTTATCTGATTTTTTTTTTTTCTTTAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGCGCAGTGGTGAGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCGCTAGTAGCTGGAACTACAGGCGCCCGCCCCCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTGAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCCTGATCATCAGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGGCAAGATCGGGCCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAAAGCAAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAATGTTTGAGGCAGGCACAAGCAGAAATTTTAATCTCCATTTCACAGATGAGAAAACTGAGGATTAGAGAAATGCTGTGTGACTTCTCAAGATCTCACAGCTGATAGGAGATGAAATGGCAAGGTAAGAGGTGAAATTGTGATAAAAAGTTAAGGTCTCCTGCTGTCCCAGGCTAGTACTTTTGAAGCCAGGCAGAGAGGGCTCAGGGTAAGGCTCCAACAAAGTAAAGATTCCCAATGGGGAGCTGAGCAACCTATTTGGCACTGAGGTAAGAGACACAGCCAGTTGACTAGCCCCAGACTGAGCTCCTTTGGCCCATTGGGGCTCCACAATTGGAGAGAGCCAGAAGTTGGCCCAGTGCCTAGCTCATGTGTCACTCTTTGATGATGATGATGAAGAGCTGGAAGTGTTCAAAGGAGAGTTCTGAAATTAATTTCAGAGTTAGAAATTAAAGCTAAGAGGAAAAGTTAAGGAAACGAAGATTATTTGGCGGAGAAAAGAGAGGCTCAAGATGAAACTTGATAACAGCCTTCAGACGAAATAAAAAAAAAAGCTTGAACTTTCCTTCTGAGGGCTGAGCAAAGGGAAACAGTCTGGAAGAATCTAAATAAAAGGGCAAGTTCCTTCCTCCTTAGTGAGGATTGTTATAGACACTTAAGAGCCTTTAGAAACAGGATAATATCTGCTTGAGTTTGAAGTCAGGAATTTGCCAAACATGGGCTCTGATGACGGATTTCAGCATGAGGGTTACATGACTCTTGCACAGTGTCCTTAGAAATCTTTAGGTGGCCTATGAACTTGCCTTGTATCCTAGTACAATTCCAGGGGGCTTTTGTCTGTGGCCTTCTCTACTCCTTAGTCTTATCGTCTTCACAGGGTTCTTCTAATGCTGGAGACAAGCCTGACCTTAGCTCCTGAAAGCTTAACCCCAATGTTTTTTGCCCCTGAAGCCAGTGGCTTAGAACCTAAGGCTATAGATCTGGCTTAGCATCCCTGGAAAGGCCTGAAATATTGACTAGTCCAAATCTTACCGCAGTGATAGAATCCCCTGTTTTATATCTAGTCTCTTCTTGCAAAACTCTCTGAACATCAGGGACTAGCAAGCTGGCAATGCAGACCAATGCAATGCCCCCTGTGAAAGGCCAGAGAAGAAGAGCTGAGATACCAGCAGTACCACCAGGCACTACACTAAGCTAAAGTGTCTTTGCACTTGTTTTCTCTGCAGCATGGGTCGGAGCCCTCGCGATGGGTATGATCTTCTTCTGTTCTCCCATTGTGAGTATATTCACTGACCGTTTGGGCTGCCGAATCACAGCAACCGCGGGGGCTGCCGTTGCTTTCATTGGCCTCCATACCAGCTCCTTCACCAGGTAAGGCTAAGAGTTGGTGGTTATTTCCCCAAGGCTGAGGGTTGGTTTTTTTCTGGGCTTTAGCTAGGGTTACTTTTCTCACTGCAGAATCCCCTGTGGCCATGGCCCTGTAGGGCCCTCAAAGATCCTGCACCCTGGATTCAGAATCCAGTGAATTCATCTGGGTAGGGTCCCCAGGACACATTGGTAGGGAATATCCCCAGAGAGGACCTAAGAGTTCCAAAGTGGTAGGAGTACTCTAAGCCTGGTAGTTCGTAGAGCTGGGCCCAAGTCCGGTTTTGGCCACTGAATGGCAATGGAACAATTGATGAGTACCATTGTTCTCTCTGTGCCTCAATTTCTATATCTGTAACATGAGGGGATTTGACCATATGGTCTTTTTACATCTCTTTCAACTCTGCTATTTGATTCCCCTTCAGTGTGCCACACATCTCACAACCTCACTTTCCATCCCAAGATTGAGCTTCTCGAGTGAGCCCATGTGAACACCTAGCACAGGATTCCCAAAGGAATCTTATGCTGAAAAAAGAGGTCAACTGAGCCCAAGGATGTTTAGCATTTCTGACTCTTTTCCAGATAGCTCAGGCTGCTGACATATGGATGATTTGGGACAGATAATGATTTACATCATGGGCATCAGAAGGATGATTAGCAATATCCCTTACTGAGATACAAACCCAGAACCCAGCTACCCAGCTAGGCCTGGGCTAAACTGAAACCCTAGTCCCACTGGTTCCACTGGCAGAACTTGGCAGTATCAGGTGAGAAGCAGGCTCTAGGTTCATTTTCTGCTTTCTTTTCTGCCAGCCCTGCAGAAGAATGTGTGTAGGGTAAGGGAGAATAAATACCCTAACCACAGCCTGAGGAATATGGAATTCCTAAAGAACTCTGTTGACTTTCTGCCAAAGACACTTTGGAAGTTATGGTACCTCCTACTTCCAATCTGCTTGGGCCGATGTAGGGGAATGCCAGCCTGGAAACACAGAAATGAGAAATGGCCGTGGTGACATGTCTGGGATGAGGTCAGAGCTAATTTGTCAGAGACTTGCTTTCTGAGCTTAGTTACCCAGAAAAGCGTCATGGCTCTCTAGGCCTAAGGTTCCACTCACAGTAGAGAATGATAATTGTGTTTTGCCTTAACTGGGCCCTGTGAGGTAAGCCAGCTTTCTTTATGACTTGAGCATTTCCAGCTGCCCAGCCTACCCTACAGCAGAGCTTGGATTTGGCCTGCAGTCATTTCTTGGCTTCGTCCTGTCCAACTGGGACAGAGAAGGGAAAAACCGTGTCCTGCCTGGAAACTACTCAGCACTCCCAGGGCAGCAGCTCCAAACCTTTTCAGAACCCCTCTGGTGGTCAGCCTCATTCACCCCCAGCAAGCTGGTGCCTGGCTCCTTGTGGGGAGGAGCTAGGCTTCAAAAGCAGCTCCAGTCTCAGCACTATACAGCAAAGGTCTGTTTTTTAAGACCGAGCAGAGCAAAGTGTAAACGGATTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTAT
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Task1_train_30405
Given this variant in gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
TATATCAAATCTTTTCTTTTATGGATCATACGATTTGTGAATATCTGCAAAATCTTTGCCTAACCAAAGGCCAGGAAGATTTGTCTCCTATATGTTCTTCTAGAAGTTTTATAGTTTTAAGTTTTACATTAAGTCTATGATCCATTTTGCATTGATTTTTAAACATGATGTGATTATTGATATTTACAAAGTTCTCTTCTTATACATATAATTTTATCTGATTTTTTTTTTTTCTTTAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCAGCCTGGAGCGCAGTGGTGAGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCTTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCGCTAGTAGCTGGAACTACAGGCGCCCGCCCCCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTGAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCTATCTCCTGACCTCGTGATCTGCCTGCCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCTGGCCCTGATCATCAGCGGATCACAAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAACACACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGGCAAGATCGGGCCATTGCATTCCAGCCTGGGTGACAAAGCAAGACTGTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAATGTTTGAGGCAGGCACAAGCAGAAATTTTAATCTCCATTTCACAGATGAGAAAACTGAGGATTAGAGAAATGCTGTGTGACTTCTCAAGATCTCACAGCTGATAGGAGATGAAATGGCAAGGTAAGAGGTGAAATTGTGATAAAAAGTTAAGGTCTCCTGCTGTCCCAGGCTAGTACTTTTGAAGCCAGGCAGAGAGGGCTCAGGGTAAGGCTCCAACAAAGTAAAGATTCCCAATGGGGAGCTGAGCAACCTATTTGGCACTGAGGTAAGAGACACAGCCAGTTGACTAGCCCCAGACTGAGCTCCTTTGGCCCATTGGGGCTCCACAATTGGAGAGAGCCAGAAGTTGGCCCAGTGCCTAGCTCATGTGTCACTCTTTGATGATGATGATGAAGAGCTGGAAGTGTTCAAAGGAGAGTTCTGAAATTAATTTCAGAGTTAGAAATTAAAGCTAAGAGGAAAAGTTAAGGAAACGAAGATTATTTGGCGGAGAAAAGAGAGGCTCAAGATGAAACTTGATAACAGCCTTCAGACGAAATAAAAAAAAAAGCTTGAACTTTCCTTCTGAGGGCTGAGCAAAGGGAAACAGTCTGGAAGAATCTAAATAAAAGGGCAAGTTCCTTCCTCCTTAGTGAGGATTGTTATAGACACTTAAGAGCCTTTAGAAACAGGATAATATCTGCTTGAGTTTGAAGTCAGGAATTTGCCAAACATGGGCTCTGATGACGGATTTCAGCATGAGGGTTACATGACTCTTGCACAGTGTCCTTAGAAATCTTTAGGTGGCCTATGAACTTGCCTTGTATCCTAGTACAATTCCAGGGGGCTTTTGTCTGTGGCCTTCTCTACTCCTTAGTCTTATCGTCTTCACAGGGTTCTTCTAATGCTGGAGACAAGCCTGACCTTAGCTCCTGAAAGCTTAACCCCAATGTTTTTTGCCCCTGAAGCCAGTGGCTTAGAACCTAAGGCTATAGATCTGGCTTAGCATCCCTGGAAAGGCCTGAAATATTGACTAGTCCAAATCTTACCGCAGTGATAGAATCCCCTGTTTTATATCTAGTCTCTTCTTGCAAAACTCTCTGAACATCAGGGACTAGCAAGCTGGCAATGCAGACCAATGCAATGCCCCCTGTGAAAGGCCAGAGAAGAAGAGCTGAGATACCAGCAGTACCACCAGGCACTACACTAAGCTAAAGTGTCTTTGCACTTGTTTTCTCTGCAGCATGGGTCGGAGCCCTCGCGATGGGTATGATCTTCTTCTGTTCTCCCATTGTGAGTATATTCACTGACCGTTTGGGCTGCCGAATCACAGCAACCGCGGGGGCTGCCGTTGCTTTCATTGGCCTCCATACCAGCTCCTTCACCAGGTAAGGCTAAGAGTTGGTGGTTATTTCCCCAAGGCTGAGGGTTGGTTTTTTTCTGGGCTTTAGCTAGGGTTACTTTTCTCACTGCAGAATCCCCTGTGGCCATGGCCCTGTAGGGCCCTCAAAGATCCTGCACCCTGGATTCAGAATCCAGTGAATTCATCTGGGTAGGGTCCCCAGGACACATTGGTAGGGAATATCCCCAGAGAGGACCTAAGAGTTCCAAAGTGGTAGGAGTACTCTAAGCCTGGTAGTTCGTAGAGCTGGGCCCAAGTCCGGTTTTGGCCACTGAATGGCAATGGAACAATTGATGAGTACCATTGTTCTCTCTGTGCCTCAATTTCTATATCTGTAACATGAGGGGATTTGACCATATGGTCTTTTTACATCTCTTTCAACTCTGCTATTTGATTCCCCTTCAGTGTGCCACACATCTCACAACCTCACTTTCCATCCCAAGATTGAGCTTCTCGAGTGAGCCCATGTGAACACCTAGCACAGGATTCCCAAAGGAATCTTATGCTGAAAAAAGAGGTCAACTGAGCCCAAGGATGTTTAGCATTTCTGACTCTTTTCCAGATAGCTCAGGCTGCTGACATATGGATGATTTGGGACAGATAATGATTTACATCATGGGCATCAGAAGGATGATTAGCAATATCCCTTACTGAGATACAAACCCAGAACCCAGCTACCCAGCTAGGCCTGGGCTAAACTGAAACCCTAGTCCCACTGGTTCCACTGGCAGAACTTGGCAGTATCAGGTGAGAAGCAGGCTCTAGGTTCATTTTCTGCTTTCTTTTCTGCCAGCCCTGCAGAAGAATGTGTGTAGGGTAAGGGAGAATAAATACCCTAACCACAGCCTGAGGAATATGGAATTCCTAAAGAACTCTGTTGACTTTCTGCCAAAGACACTTTGGAAGTTATGGTACCTCCTACTTCCAATCTGCTTGGGCCGATGTAGGGGAATGCCAGCCTGGAAACACAGAAATGAGAAATGGCCGTGGTGACATGTCTGGGATGAGGTCAGAGCTAATTTGTCAGAGACTTGCTTTCTGAGCTTAGTTACCCAGAAAAGCGTCATGGCTCTCTAGGCCTAAGGTTCCACTCACAGTAGAGAATGATAATTGTGTTTTGCCTTAACTGGGCCCTGTGAGGTAAGCCAGCTTTCTTTATGACTTGAGCATTTCCAGCTGCCCAGCCTACCCTACAGCAGAGCTTGGATTTGGCCTGCAGTCATTTCTTGGCTTCGTCCTGTCCAACTGGGACAGAGAAGGGAAAAACCGTGTCCTGCCTGGAAACTACTCAGCACTCCCAGGGCAGCAGCTCCAAACCTTTTCAGAACCCCTCTGGTGGTCAGCCTCATTCACCCCCAGCAAGCTGGTGCCTGGCTCCTTGTGGGGAGGAGCTAGGCTTCAAAAGCAGCTCCAGTCTCAGCACTATACAGCAAAGGTCTGTTTTTTAAGACCGAGCAGAGCAAAGTGTAAACGGATTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTATGTTTTTCCCC
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Task1_train_30406
This alteration in SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
CTTCGTCCTGTCCAACTGGGACAGAGAAGGGAAAAACCGTGTCCTGCCTGGAAACTACTCAGCACTCCCAGGGCAGCAGCTCCAAACCTTTTCAGAACCCCTCTGGTGGTCAGCCTCATTCACCCCCAGCAAGCTGGTGCCTGGCTCCTTGTGGGGAGGAGCTAGGCTTCAAAAGCAGCTCCAGTCTCAGCACTATACAGCAAAGGTCTGTTTTTTAAGACCGAGCAGAGCAAAGTGTAAACGGATTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTATGTTTTTCCCCCACTGGCCCCTTCCCTGAAGGTCTAACACAAGGCCCCTTGGATAAGGCCCCCAAGCCAGGCCGATCCCATAGGGTACCTAGAATCTAATGGGCACAGGCCCAAAGGAACCTGACAGAAGAGGAACCGTTGGCTTAGCTATGTGTTCCAAGCAGAGACAACCCTTTCAAAACCAAATCCTTGCTCACGTCCAGTGAATACCAGCAGATGGAAAGCAATAGTGATGACAGCTATCTTAGAATCATGCACCATATCTTCTCTGCAGCTTAGGCCCAGTTCTTTAGTATGAGGACTGGGTCTATCTCCAGAGAAGAACTGCCTGACCAAGAAGAGTATTAGGTAATTTAGTGGCCAGATAAGAACTATTGCAAAATATATTGAGGCATCAAAAAGAAAACAAAATTCTTTACTAGGTTGTGCCAATATTATCTGGGGGCATATGGCTGGCCAAGCTGACCTTCCTATTGCCTTTCCCCTTCTGACCCTTTATGTTACAGAGGCTTATGTCCACAGCAGGGCCTATGAGTTTTAAGCCAGGACCTGTCTTACTTGGCCAGGCCCACAAATTCTTTGAGGCTCCACTTCCTGTCAAGGAGCCAGGCTACTCTAGGGAACAAATCTATACCATATCCAGAAACAAAGGCAGGACTCTAAAAGTTAAAGAGACTCCTTACCTAATGATTCCCGCTGAGATCGTCCAGGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCCATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCCGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTTGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTG
CTTCGTCCTGTCCAACTGGGACAGAGAAGGGAAAAACCGTGTCCTGCCTGGAAACTACTCAGCACTCCCAGGGCAGCAGCTCCAAACCTTTTCAGAACCCCTCTGGTGGTCAGCCTCATTCACCCCCAGCAAGCTGGTGCCTGGCTCCTTGTGGGGAGGAGCTAGGCTTCAAAAGCAGCTCCAGTCTCAGCACTATACAGCAAAGGTCTGTTTTTTAAGACCGAGCAGAGCAAAGTGTAAACGGATTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTATGTTTTTCCCCCACTGGCCCCTTCCCTGAAGGTCTAACACAAGGCCCCTTGGATAAGGCCCCCAAGCCAGGCCGATCCCATAGGGTACCTAGAATCTAATGGGCACAGGCCCAAAGGAACCTGACAGAAGAGGAACCGTTGGCTTAGCTATGTGTTCCAAGCAGAGACAACCCTTTCAAAACCAAATCCTTGCTCACGTCCAGTGAATACCAGCAGATGGAAAGCAATAGTGATGACAGCTATCTTAGAATCATGCACCATATCTTCTCTGCAGCTTAGGCCCAGTTCTTTAGTATGAGGACTGGGTCTATCTCCAGAGAAGAACTGCCTGACCAAGAAGAGTATTAGGTAATTTAGTGGCCAGATAAGAACTATTGCAAAATATATTGAGGCATCAAAAAGAAAACAAAATTCTTTACTAGGTTGTGCCAATATTATCTGGGGGCATATGGCTGGCCAAGCTGACCTTCCTATTGCCTTTCCCCTTCTGACCCTTTATGTTACAGAGGCTTATGTCCACAGCAGGGCCTATGAGTTTTAAGCCAGGACCTGTCTTACTTGGCCAGGCCCACAAATTCTTTGAGGCTCCACTTCCTGTCAAGGAGCCAGGCTACTCTAGGGAACAAATCTATACCATATCCAGAAACAAAGGCAGGACTCTAAAAGTTAAAGAGACTCCTTACCTAATGATTCCCGCTGAGATCGTCCAGGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCAATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCCGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTTGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTG
Task1_train_30407
A variant has been detected on Chromosome X in SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; not provided
TTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTATGTTTTTCCCCCACTGGCCCCTTCCCTGAAGGTCTAACACAAGGCCCCTTGGATAAGGCCCCCAAGCCAGGCCGATCCCATAGGGTACCTAGAATCTAATGGGCACAGGCCCAAAGGAACCTGACAGAAGAGGAACCGTTGGCTTAGCTATGTGTTCCAAGCAGAGACAACCCTTTCAAAACCAAATCCTTGCTCACGTCCAGTGAATACCAGCAGATGGAAAGCAATAGTGATGACAGCTATCTTAGAATCATGCACCATATCTTCTCTGCAGCTTAGGCCCAGTTCTTTAGTATGAGGACTGGGTCTATCTCCAGAGAAGAACTGCCTGACCAAGAAGAGTATTAGGTAATTTAGTGGCCAGATAAGAACTATTGCAAAATATATTGAGGCATCAAAAAGAAAACAAAATTCTTTACTAGGTTGTGCCAATATTATCTGGGGGCATATGGCTGGCCAAGCTGACCTTCCTATTGCCTTTCCCCTTCTGACCCTTTATGTTACAGAGGCTTATGTCCACAGCAGGGCCTATGAGTTTTAAGCCAGGACCTGTCTTACTTGGCCAGGCCCACAAATTCTTTGAGGCTCCACTTCCTGTCAAGGAGCCAGGCTACTCTAGGGAACAAATCTATACCATATCCAGAAACAAAGGCAGGACTCTAAAAGTTAAAGAGACTCCTTACCTAATGATTCCCGCTGAGATCGTCCAGGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCCATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCCGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTTGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTGTCTCTGATAGCCCCAAGTGCCCTCCTAAGTACCCTCAAATATCTTGGATGGAAATATGATTAACTTTTCCTTAACTTTTTTGGTGTTAGATTACAAGAGTTGGTAAATCTGCTTTGTCAGAGGCAGGGTTGCTTTTAAGGTCCATCCAATCCAACCTCATTACAGTGGTGGAGAAACAGAGGGAAAGGCTCACACAGACAGTAGTAGCAGAGCTGAACTCCTATGCAACACACTTCTCATATTCT
TTAGCAACATATGGATTCCATTTCCCTTCCAATCCACATGGGCTCAATTACAGGAGGGGAAGGAGCTCAGATGTGGTGTTTTCTTCTGGCACGCTACTGTAGGCACATTGGAGTAGGCGTTCTGTTCTCTAGCCCCTAACCTTCTTCTCTACCCGCTTTGTTCTTTCTGTAAGAGGATCTTCAGAGCCAAGAAACTTTCTGGATGGCTTCACATCCAGTGGAAAAATGGTTCTTCTCATGGCTAGAGCTCCAAATCATCCTTCCTGTTGTCTCAATCAGGGCCCTGAGTTCCTCCGAATGACATGGAATGGGGCAGGATGCAGGCAGGGCTGGTGGGGCTTTGGAAAACCCAAACAATGGGCATCCATCCCTGGGGCCCAGCTAGAAGTAGATCCACCACATGGATCTAAACCAAATCCTATGTTTTTCCCCCACTGGCCCCTTCCCTGAAGGTCTAACACAAGGCCCCTTGGATAAGGCCCCCAAGCCAGGCCGATCCCATAGGGTACCTAGAATCTAATGGGCACAGGCCCAAAGGAACCTGACAGAAGAGGAACCGTTGGCTTAGCTATGTGTTCCAAGCAGAGACAACCCTTTCAAAACCAAATCCTTGCTCACGTCCAGTGAATACCAGCAGATGGAAAGCAATAGTGATGACAGCTATCTTAGAATCATGCACCATATCTTCTCTGCAGCTTAGGCCCAGTTCTTTAGTATGAGGACTGGGTCTATCTCCAGAGAAGAACTGCCTGACCAAGAAGAGTATTAGGTAATTTAGTGGCCAGATAAGAACTATTGCAAAATATATTGAGGCATCAAAAAGAAAACAAAATTCTTTACTAGGTTGTGCCAATATTATCTGGGGGCATATGGCTGGCCAAGCTGACCTTCCTATTGCCTTTCCCCTTCTGACCCTTTATGTTACAGAGGCTTATGTCCACAGCAGGGCCTATGAGTTTTAAGCCAGGACCTGTCTTACTTGGCCAGGCCCACAAATTCTTTGAGGCTCCACTTCCTGTCAAGGAGCCAGGCTACTCTAGGGAACAAATCTATACCATATCCAGAAACAAAGGCAGGACTCTAAAAGTTAAAGAGACTCCTTACCTAATGATTCCCGCTGAGATCGTCCAGGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCCATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCAGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTTGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTGTCTCTGATAGCCCCAAGTGCCCTCCTAAGTACCCTCAAATATCTTGGATGGAAATATGATTAACTTTTCCTTAACTTTTTTGGTGTTAGATTACAAGAGTTGGTAAATCTGCTTTGTCAGAGGCAGGGTTGCTTTTAAGGTCCATCCAATCCAACCTCATTACAGTGGTGGAGAAACAGAGGGAAAGGCTCACACAGACAGTAGTAGCAGAGCTGAACTCCTATGCAACACACTTCTCATATTCT
Task1_train_30408
An alteration has been detected in SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
GGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCCATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCCGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTTGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTGTCTCTGATAGCCCCAAGTGCCCTCCTAAGTACCCTCAAATATCTTGGATGGAAATATGATTAACTTTTCCTTAACTTTTTTGGTGTTAGATTACAAGAGTTGGTAAATCTGCTTTGTCAGAGGCAGGGTTGCTTTTAAGGTCCATCCAATCCAACCTCATTACAGTGGTGGAGAAACAGAGGGAAAGGCTCACACAGACAGTAGTAGCAGAGCTGAACTCCTATGCAACACACTTCTCATATTCTACCTTGCCCTAAGTGATGGCAGAGCCAAGTCTCAGAGATGATAAGTGACTTGACCAAGGTCAAACCAAGAGATAATCTTGTGATTGAGATAAACCAATTGAGATTTTGAATTCCTGTGCAAATATCAGCAAGTGCTTTATCTGGGTGGCTATTTGCATAGGAATATGTGTGGCTTTCCCAGCCTCACCCACATGACACCCCTGTGAGTCTTCCCTGCCAGTATTAGCAGCTCCAAGATGCCAAAGAGTTCTGGAAATCAGGGTAATCTGGCATTGGGCCAGGGCTTTATCTTGAGAAGAGGCAGCAGCCCCTGCCTAGTCGTATAACTCATGTGATTCTTACTACAGTCCCTAGGAGAAAGGTAGAGTCTGAGCAGCTTTTGCTTTCTGTTATACAGTGGGAGTCCAAGGGACAGGGAGGCATTAGCCAGTTAGAGGCCAAGATAGGCTTAGGACCCAGTGCCTCTGCTGACCACCCACCCACTGCTCCTGCCCCTTTTCCTTACTCTTACTTCACCGAGTTTTACTTAGAATAATATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGC
GGGCCTAGTGTAAAGGGACTTGGGATATGTGGACCTTGGGCAGGGTTTGGGAGGGCGTATGTCTCAGAAGAACATCAGCCATTCTCTGAAATATTAATGGCCTTAGCATGGAGAAAGACACTGAAGAGTCCCATGGAAGGTTTCAATCTTCCAGGATTTTGACTTCTTGCAGACCTTTGTTGCTACCTGGGATAAAAGCTTTGCCACCACCAATAGTAAGGTGAGGCTAGTCTCTCTAAGACAATGACTCCCTGTAGCCCCTCATCCAGCTTTTACATGGGCTAGTTCTGGCTTTCCTTTGAACAGTCCTCTTTGATGGGGTGCTATGAGTCATGCTAGAGTCACACAGACCTGGATTCAAGTCCAAGTTTTGCTGATTCCCAGTTATGTTACCTTGGGCTAATTATTTTACCTCGCTGAGCCTCTGCTTCCCCATCTGCAACACAGGGATCAGAAGGCCCTCTTCTTTGTCTGTTCTGAGGGTCAGTGGCAAGTGGGGCTGTGGGTTAAGGGCGGAGGAATGGAAGTCTCAGGAAGCTGACAGGGGAGGGCAGGTAGATTGCTGGTCAGGCTGCTGAGGACAGCTCTTGGTATTTCTCCCACAGCTCCCTAAGCCTGCGCTACTTCACCTACGGGATTCTCTTTGGTTGTGGCTGTTCCTTCGCCTTTCAGCCATCCCTCGTCATCCTGGGCCACTACTTTCAACGCCGCCTGGGTCTGGCCAATGGTGTGGTGTCTGCTGGGAGTAGCATTTTCTCCATGTCCTTCCCCTTCCTCATCAGAATGCTGGGGGATAAGATCAAGCTGGCCCAAACCTTCCAGGTGCTGAGTACCTTCATGTTTGTTCTTATGCTGCTTTCACTCACCTACCGGCCCCTCCTGCCCAGCTCCCAGGACACCCCAAGCAAGAGAGGTGTCCGCACCCTGCACCAGCGCTTTCTGGCTCAGCTCAGGAAGTACTTCAACATGCGAGTGTTCCGCCAACGCACTTACCGCATCTGGGCCTTCGGAATTGCTGCTGCTGCCCTTGGCTACTTTGTTCCCTATGTACACCTGGTGAGGAATACCAGAGTGGGCCCACCCCACCTGGCCCCAAGAAGCTACCCTCAACCTGCCTAGATTCCAGAGGGTGGGGGTGGGAGACATTGAAAGGGCAGAGCTGGGACCTTTGGGAAAAGAAACAAAATATTGGTTGGAGAGATCCAGAGAGGGAAAAAGAGAGAGGTTGAGGGAAGACCTTAGTGGAAAATGGGGGCAATTCCACAGGGGGAAGCCCATGGACCATGGCTTCTCCCACAGTAAAAATTTAGATAGATTTTGAAGAGATACGCATTGCCAGGATGCAGGAGACTGGCCCGGGTGACCCAAGACAGGATTCTGTGGAATGCTGGTCTTTGTGGTCAAATGATTTTGTTTAGGAAGTAACATATACTGGATCTCTCTAGCTTTATAATGTGTAGTAATCTCTTAAAGGGACTAAAAAAAATTGTAGGAAAGAAACCCATTCAGCTTTGTTTAACTCACCATCCACCAAACTTATGCAACTACAGAACTGTTGGTTGTAGTCCAGCTGTTATCCTCCACAGGCTTCATGTTTCCTAAAACACACTTTGGAAGAGTTGCCTGGAAGTTGCTGGATTCTTCTCCCCTGGTGATTTGATGTTGCCCTAGGCTGTCAGTTTGGGGTAAGGGAATGGGGAGATTGTAGAGAAACCCTTGGATTTTCTCAATCATTTAGGCTATTTTCTGTCTTGCTGGGGCTTAGAAGGGGCGTGGAGGTACCCACCCTCCTTAGCTGTTGCTCAGAAGTCCAGAATCCAGACAGCCAAGGGATAAGCAGCCAGAGAGCTTGTCATGGAGGTAGGGCTACAGGAGAGGGGGTTTCTGTCCTGCTCCAGGAAAGTAAGCAGTAGGGGATTCTGGATATGCCTACAGTTAACCAGTCAGCTCCTCTTTCTCCTCCTGTTTCTGGGGATCCTTGTGCTATGCTTTTCAGATGAAGTATGTGGAGGAGGAGTTCTCAGAAATCAAGGAGACCTGGGTGCTCTGGGTGTGTATTGGGGCTACCTCAGGCCTTGGGCGTCTTGTGTCAGGCCACATCAGTGACTCCATCCCTGGACTTAAGAAGATCTACTTGCAGGTGAGTGTGACCACTTGTCCACTGTGGGGAGAAACAGCCTGCCACAAATGCAAGGTTATCCACAGCCTTTGGGATAGAATGGTAGCTTGTTGTGTCGCATGGGAAAGTCAATCAAATTCTCTGAGCCTCCATTTCACCTGCTTTTAAACAAAGAAAATCATCCTTGTTCTGCCTCTTTTACCAAGATTGAGTGAGGATTCTGTGAGAGCAGTGTATATGGAACCTATTAGAACACGTGTAAAGGAAGATTTTATTAATAATGGCTCTCCATGCTCCAAGACTATTTTCTGTGTGAACTAGGCTCTGGTCTGGTCTGAATACAGGCCACTGTTCAGGCTGTCAGTCTTTATCTACCTGGCAGCAGTATTGCCTTTCTTACCTGACTTATGATCCTGCAGGTGGGTTTATGAAGTGGTACCCAAGTGCAGAGCCCTGTGAAGGGGCAAAGATAGCCCCCAAAATCAAGTAGTCACAAGTAATCCATCAGGAAGGTGATTGAGTTCTGACTCATTTATCTCCTGGGAAAGCCCTAAAAGCACATGCAAGGGGCCCTAGCTACACTTACAGTGGTGATTTCTCTGTCTCTGATAGCCCCAAGTGCCCTCCTAAGTACCCTCAAATATCTTGGATGGAAATATGATTAACTTTTCCTTAACTTTTTTGGTGTTAGATTACAAGAGTTGGTAAATCTGCTTTGTCAGAGGCAGGGTTGCTTTTAAGGTCCATCCAATCCAACCTCATTACAGTGGTGGAGAAACAGAGGGAAAGGCTCACACAGACAGTAGTAGCAGAGCTGAACTCCTATGCAACACACTTCTCATATTCTACCTTGCCCTAAGTGATGGCAGAGCCAAGTCTCAGAGATGATAAGTGACTTGACCAAGGTCAAACCAAGAGATAATCTTGTGATTGAGATAAACCAATTGAGATTTTGAATTCCTGTGCAAATATCAGCAAGTGCTTTATCTGGGTGGCTATTTGCATAGGAATATGTGTGGCTTTCCCAGCCTCACCCACATGACACCCCTGTGAGTCTTCCCTGCCAGTATTAGCAGCTCCAAGATGCCAAAGAGTTCTGGAAATCAGGGTAATCTGGCATTGGGCCAGGGCTTTATCTTGAGAAGAGGCAGCAGCCCCTGCCTAGTCGTATAACTCATGTGATTCTTACTACAGTCCCTAGGAGAAAGGTAGAGTCTGAGCAGCTTTTGCTTTCTGTTATACAGTGGGAGTCCAAGGGACAGGGAGGCATTAGCCAGTTAGAGGCCAAGATAGGCTTAGGACCCAGTGCCTCTGCTGACCACCCACCCACTGCTCCTGCCCCTTTTCCTTACTCTTACTTCACCGAGTTTTACTTAGAATAATATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGC
Task1_train_30409
A variant on Chromosome X in gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Intellectual disability
CTGCTGACCACCCACCCACTGCTCCTGCCCCTTTTCCTTACTCTTACTTCACCGAGTTTTACTTAGAATAATATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGGCCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCTGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTAC
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Task1_train_30410
This variant lies on Chromosome X and affects the gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Spastic paraplegia
CTGACCACCCACCCACTGCTCCTGCCCCTTTTCCTTACTCTTACTTCACCGAGTTTTACTTAGAATAATATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGGCCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCTGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTT
CTGACCACCCACCCACTGCTCCTGCCCCTTTTCCTTACTCTTACTTCACCGAGTTTTACTTAGAATAATATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGACCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCTGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTT
Task1_train_30411
A change on Chromosome X affects gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
ATAAAATAATCTTAGAACATTATAGCTGAAACATATCTTCATCAACTAGTAGTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGGCCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCTGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTTTGGACAGTAGGGCAAAGCTGAGCTTGACTTGTCTCTCTTGACTGTTTCAGGCCTACTCCGCAACTGTTT
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Task1_train_30412
Gene SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
GTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGGCCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCTGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTTTGGACAGTAGGGCAAAGCTGAGCTTGACTTGTCTCTCTTGACTGTTTCAGGCCTACTCCGCAACTGTTTTGGGGACTACCATGTGGCCTTCTACTTTGCCGGTGTGCCCCCCATCATCGG
GTTGAACTTCCTCATTTTACAAATTGAGTGTCTTGGGCCAAGAGCACAAGACAATGGATGAACTTCTTTCTCTTGAGTTTGTTAAGATACTCCATCACAGGAATTTGCCCCCCTTTCTCCCTGCATGTAATGCAGGAGTACAGGCCTAGGGGAGGAAACGAGTGTACACACCTTCAGGTTCTGAAGAGCTATCCACTAGACTCTGTGGCTCTTAATGTTGGTAAAGACAAGCACATATCTCTGGCTTCAAGCCCCTGGACAGTCTGCTGGAAAGGAAATAGCGACAGGCTGCAGGACAGCCTCACTTTGTGCCAATTCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGGGATTTTAAATTTCTGAATCTTGAGGCCTGTTTCTCACGTCCAAGAGAGATTTTAAATTTCTGAACCTTGGCAAAGCCTCATGGAGGATGTTTAACAGACAGCTAGATACAATAGGTAATACTTAGACCTGATTAAAATCAGTTAATAGGGTCCTTTGTGTTATATAATGGTATTAACTTTTAATTTCCATAATGGGCTTTGTTGATAGGTGTGTCTGGTTTTATCCCATAGTTGTGTGTGAATCTCTTAGAGGAGAAGCTCAGGTACCGGGGTTCTTATTCCTAGCTTCTGCCTAGCTACCTCAAAACTGCCTGGGCAAAGTTCAAAGTCTCCCAACAAAAAGATGTCCTCAGATGGCATTATCCTCTCCAAAAATCAACTGATCAACCTAAAAAACTCACTGCCAGCAACAACATAGAAAATCTTTAGGGCACCAAATAACCTTGACCCCCACTCCTTCCATGTGTTCTTGGCTAAGTTGGCTTGCTTGTGTGAACTACTGGAAAATCCTTGGGCCTATTAAGGCCTTGATAGAGAGATCAGATCTTAGCCCTGACCCTGGGATGACCTGGCTCTGACCTGGCTCTACTGGCTGCAGGGGGTTGGCAGCAGCGGGATGGGGGCAGGGTTCCTTTCTCTGCCTGAAGCCCAGGTCTTCAGTCTAGCTGGCCAACACAGGTTGCAAATGAAGACCAGCTGTGTTTGCAGCAGCCCTTTTCTCTGTGGAGAAGGAAAAAAAAAACAACCTCTGGAAAGGCAGTTTCTTCATTTTGGAGTCATTTTGCTTAGCCCAGAGAAAGCCCAGTGGCTAGTCAGTGTTCCTGGGTTGGCTTCATTCTCCCTAGACATACACCTTCCCAGTGGCTTGGTTCCCCTGGAAGGCTCCTCTGTTGCCTTCTCAGGGTGTCCAGCCAAGCCCAGAGGCCCCCAGAGCCATGTGTCTGAGATGTCTGAGATAGGCAGTGCAGTCCATGTCCTAAAGCATAGGAACCTGGGTGAATGTCCCAATGGTTTCCTTTATGCCAAGGTATTTTATAAAATCAGCCCCCACAAAAATGGGCTCTGGCTCCTTCCCCATTTCAAGAAGCTGTGCCTTCCACTTACAACCCCATCTGATCATCATGCAAGCCATCCTCATGTCCTCCCTTCCCTCTTTCCATATTTTACTTGGATCTGAGAACACCGGTATGGCCTGATCCCAGACCCTGATCCCTGGGGAAGCCAAATACAGGCTCAGAAAGCAGAAACAACAATTCCTTTTATCTTAGGGTCTAGTGCAAGACAAACTTCTTGAGGCCAGGGGCCAAGTATCCCCCAACTTTCTTTTTTTAATCCCAACAGAATCACAGTTAAGTAGGGGCTTTCTTGGACTTTGAATCCCTCAGTGCAAGACTTTGAAAGGGCCTAACCATTCAGCCCAACTGCTCTCTCTGTTGACACCTTCCCCCTCCCACCACCCCATTTTATAGATGGTAGAAATGAAGACTTGAGAAAGGAGATGTGATGCTATGTGGTCTTGGCTGGCCAGCACAACCTGACCTCAGGCCCTTGTTTCTCCAGGTCCTTTCCTTCCTGCTCCTGGGCCTGATGTCCATGATGATTCCCCTGTGCCGGGACTTCGGGGGCCTTATCGTCGTCTGTCTTTTCCTGGGCCTTTGCGATGGCTTCTTCATCACCATCATGGCCCCCATTGCATTTGAGCCGGTGGGCCCAATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTTTGGACAGTAGGGCAAAGCTGAGCTTGACTTGTCTCTCTTGACTGTTTCAGGCCTACTCCGCAACTGTTTTGGGGACTACCATGTGGCCTTCTACTTTGCCGGTGTGCCCCCCATCATCGG
Task1_train_30413
A mutation on Chromosome X affecting SLC16A2 (solute carrier family 16 member 2) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Allan-Herndon-Dudley syndrome
ATGCAGGCCTCACAGGCCATTGGCTACCTCCTGGGCATGATGGCCCTGCCAATGATTGCTGGGCCCCCCATTGCAGGTGAGGCTGATATTCCAGGGAGGGCATGAATCAGGGAGTCCTTTTTTCCCTGGGTACTGGCACTCCTGAGCATCTCTCCTTGAGGCCCCTTTTCCTCTTATCGTCTATTTAAGCAGCTTTGTCAGAGTGCGTGAAACCCCTTATCACTACTGGTGGAAGAGATTAAACACAGTACACACGCATGGATCCATTCTGCGGGATGGATTTTCCATGGTGGTATATCTGTTTCAATAGGATTTTATTTCAGACAGCAGGGATCCTTCCAGCGGGGTGGAGAGAAAAATGAGTTTGGCTTTCTGACAGTTCCACTGATCTAGTATCCTCTCACTCTCTCCACAGGCAAGTGATTATTTGCAAGGTAGTTGGGTAGGAAGAGAAGAGAAAGCAGGCTCTGGTTTTATTAAAACCTAGGGACATCCTCCTCCTCCTCTGCTGGCTTCTGAACTGAGCCTGTAGAAGATATTTGATTAAAGTAATACCCCAGAATTAAGCCAGTGAGGCTCACCTTCAGCAGGAAAAGTGTTGACTTGCCATCTTTCAGCACTCCTGGTTTTCTCCCTCCATTTTCCCAGAAGGGCACTGTTGGTATCCCAGGGAACGAGGAACAGAAAACCAATGACAAGAGAACTCCAATTTCTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTATCTCAGCTCATTGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTCAAACGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCGAGTAGCTGGGAGTACAGGTGCGTGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGTCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACACCCGGCAACTCCATTTCTTTTCTGTAGGATTTATTGTAAACATTGATTCACGCATTAGCTTCTCCTAGGCTGGTCAAATGAGTTAATTCAACAAATATTCTTCGAACACAAATTATGTGCAAGGTGATATGAGGGCACTGTGTGACAGTGGCAAAAGCTTTCACTCAGGCTTCTGGGCAACAGCCACACTACCCATTGGGGGAAGGGGGCCTCTACTCACCCCCTGATCCAAACAGTGCCCCAGAATCCACATTTCTTTCCAATTTGCTTAACTCCTGAGTAAGCAAAAGGCCAAGGGCCTTTTTGCCTTTTCTGAATACTGTTTCTGGGCTCTGAGGTACTACGAGGTACCACATATTAGCTTCTGGAAGTGAGTAGGGAAGGCCTTGCATCCCATGTCAAACATATCCTTGGTTTGGCAGCTTGGAGAAACCCAGAGGGGACAACCATATATGTAACTGAAAGGAACACGTATAGCCTCTTGCTAGGACAAATGGAACTTCAGAGAAGGGTCACTTCAGAGAAAAGGAAAATAAAAACTCATCTGAAATGTACCACAGGAACCATTTGTGGGGGCAGGGGGCGGGGGTAGGAGGCTGGGAAATATCACTGTGGACCAAGACAACACTTGGCCATCTTCTGTGGATTTCTTTTAAACTAGGTTTCCTCCTAACTCCGTAACTAGGTGTGACTAGATCTTAGATTGATGAAAGTCATAAATGGAGAAACTTTAAGAGAAGCTTCATTAGCTTCTTTCATAATGAGCATTCGCTCAAGGGCCTGCAGCCCCAATGCCTTGAAGTTGAGGGAGCTCCTGAGTTAAGGCAATACACGCCAAGATTATCTGGATAGGCACTGTGATGGCCCCTAGAACGGGCTGAGAGTACCTTTGGACAGTAGGGCAAAGCTGAGCTTGACTTGTCTCTCTTGACTGTTTCAGGCCTACTCCGCAACTGTTTTGGGGACTACCATGTGGCCTTCTACTTTGCCGGTGTGCCCCCCATCATCGGGGCTGTAATCCTCTTCTTCGTCCCTCTGATGCATCAAAGGATGTTCAAGAAAGAGCAGAGAGATTCCAGCAAGGATAAGATGTTGGCCCCTGACCCAGACCCCAATGGGGAGCTACTGCCGGGCTCCCCCAACCCTGAGGAACCAATCTAATGCCTTTCTTGCCATTGTGTGCCCTTTCCCAGCTCTTCCCCTTCATCCCACCCTGCTCAGCATTTACATTTTTGCCACCAGCACACTTGTTCCCAGACCTGCGCACACAGCATTTCAGCCACCTGACAATCTCCTTGGAGTCAAAGCTCCAGGTGTTCCAAACTCATTAACTAAATTCTCCCCAGAATGCTTTTAAATTTTCCAGGGCCTTTCTCCTCCCAGGATCTGGGAAAGCTTGGGAACCACCCCTGGCCTTTGGAACCTCTCCATATACTTTCTAAGCTCTGGGGGAGGAGGAGGATGGGACCTCCTGGACCCAGCTTGTTAGTCACCCACTATAATCAACTGCCAAAGGTGCTACTGTGTCCCCAGGAGCCTAATAGGGTAGGCCCAAATCTCTGTTTGCTGAGGAGGTCATTGCCATCCATATTTGGGAGCCACTGGGTGGAGGGGCAGGGAGGCAAAATGAGACAAGTAGCCTTGGTTAGTCTTAGAGTTGCTGATGACTGTGGCTTCCCAAGAACTGGGTACAAGCAGTGCCCTTATTGTATGGTTGGTTAACAGTCTGCTCCCCTCTTCCCTTCCTTCTTTTTTTCCTCTACTGACTTCTCTCCATACTCTTTCCCCTCTATTTCTTTGTATGACTGTCATAGACACATGGGTGCTTGAAGAAAGGAGGGACCCGGAACTTGGGCCAATCAGCCTCACCTTGTCCCAGTCCACTCCTAACACTAGCATCAGTCCCACTCATCTCAGGCTGAGCCACATCTCACTTTTTCGCTCAAGCTATATAATCCTAGACTGGAAGAGTAGAATATCATATAGGGAAGAAACCTTAAACACCACAGTGTTCCATGTTCCAGTCACTGATTTTTACAAATCTTACAGTCCAAGGCATTAACCTCAAGGCCCTCCCAGCACCCCATTCTTGTATACACATGGCAAAATGTGAAGAAACTCCTTTCATCTCAGCAGGTAGAGGAGGACTGATGACACGAGCTGCCATGGCGGGAGGAGGGGCAGTAGTTATTGATATGGTGAGCCCCATCTCTCAGTTTTCATGACAGGTCTATATTTCTACCTGGGCCAGGCCAGGAAAGAGACTATTTAAGAAAAAAAAAATCAATTCCTAGCCTGGATCCCAAAAAGGTACAGGCAGCAGTTGCACATAGGGTTGGAAAATTTCTTTTGGGAAGGGGAAGCCATCCCAGCCTTTACCACCCAATGTGTCTCCCATGCTGGGCATCCTAGGCCACTTTGCTTAGAGGGCATTAAAGGTGCCATGAAAGGTAGACTCTGAACCACTTTGATCCCTCTGAAGTAGGTGACTGATGCCTCCTTATGCCCAGGCTCTGGCAACAGTCTTACTGAAGAACATTCCCAGTGCCCCTGGCTAGGGGCAGAGGGCACTGCCAGGCTGTGTTCAGTTAGCACAGCTCACCTCATTAGGAGCTCAGCCTCTCTCCTCACTCTGCCTCTTTGTGTCTCTTTTTCTCCTCTCTGAGCCTTTGTCTATTGTGTTCCTGTCACCCACCCTTTCATCATCTTTTTGCCAGGCATTCCTGGCTGTCACTTGGAGCCAACAGTAACTTGCCACCTTAAGGCAGGGTCATCCCCGGGCCAGGAGGATGAGGTTGTCCTGAGGGGCTCCAAAGAAGACAATAGTTCCCACTCATGATTTTCCGTTACAAACAGGCAGCTGGGGCATGGTTGGCCTCCAATGATTTCATTCAAGGCCAAAGTCCTGAGCCCCCTCCGCTGGTCCCAGTCCAGCTCTTATCAACTCCCCAAAGGAAAACCCACTGGTTCTTAGCTCTGTGGGTAGGAAGGGGCCCTAGAAAGGGCCTAGTTACTATCCTGTCAGTTCTAACAGTAGTGGAACAGGAGAATCTGGGCCCTAGGAGCCCT
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Task1_train_30414
A variant affecting Chromosome X, within the gene RLIM (ring finger protein, LIM domain interacting), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 61
AAGCTTTGTTTGGACATTATTTCCTTGCAAGAGCAGTACATATCCTTAGTAAACAACTACCATATTTACAAGTTAATTTCCTTGATACTTAGATAGGATTGAAAGCCAGAAGAAATCATGGAAGAGTGAGCTTTGAAATAATCTTTACAGCTAAGTTGGTAACAGTGAAGGTACCCAGACAATTCCTAAAGCAGACTTGTTTATTTTGTAGAGTATTTGACTACGTCTGGGTAGCTAGCTTGCTTTGATAAAGGCCAAGGACAAGTTCAATCCCTATTTTGGCCTGTTAAAGCTTTTCCCAGAAGAACAAATATCTGCTCCATAGTCATTCTAATCCTAACCCCAGCTAGTCTCAAAAAAGAAATTAGGCAAGAAGACTGGGGTTATCATGAAGTTACTCTTACTACTAAGAAACCAACATAAAGTGCATGTCCATAGATAGCGAGTCAGCAGTCTCATTTTCATATATGGGCAGCACAATTAAAATTTGAATTTCAAATAACCCAACATGACTTTCAACAAAGGATAAAAATCCCTTAATCTTCAACTGGTCTTTAAATTTGAGATGTTAGGACTGTGTTAGAGATAGTAATGAAATATGATCAAGTGTGCACTGGTACCTTAAATGACAAATCTCAAAAACAACACAAATTCGAGACTTTCCTATTAACACACACATGTGTACCAACTGCAATTCATATGCTAAAAGTGGTTTTATAGTCTCTTTCCTCCATTTTTTCATTTTTGAGGAGCAGACTTGTAAATTTAACTTGTGCTAGGTAGTAGTGGTTTGTTTTTCTTAAACCAAAACTCTGCCAAACTTGCTGATCTTCTGCTTCATCTACTCAGGTAGAATACCAGGTCAAGCTGCTGCTGTGGCTGCTCTCACCATATGAAACCAGTTTGTGTCTGCATTATTACTGTCTTCAGGAAAACTTTAAATTCTTCAGTTTTCTTTACTCCTCCCATATTTCACTTCCTGCCTAAATCCAAGTTAAATTATACAATTTCCACTGGTCTTCAACACGGTTTAATTCTGCACTGTCCTTTCCTTTGCATGTCACAGTAGCTGTTCACACATTAAATATTATAGATATGTTCTGCTCTTGACATCTACACACTTACAAAAGCAGCTTTGTACTTTGTTTGGTGTGTTTGTTACTATGTTGGCTCACAAAAAGCAGTTTTCTCAGTTCTAAGCATGGTACTTTACAATTTTTAATGCATTCATACAACAGTGCATTGGAAAAGTACTGAGCCTCTACAAAATAGCTTTACATTTTTAAACAAATGAATGTGATTTTTTTTCACTTACACAAGCATAGGCTTTTTAATATTTCCACAAGATAAATATCTCAATTAAACTATAAGCTCACTCTACAGTGTGCCACAGTGATGGGCTTAGGAGACAGTTATACACTTAGAAGATCCTAACCTTAGTGTTATTTACACTGACATGTCCAGTATCACCAAGTCTGAAAGGTGAACAAACAATACTCAGAATGTGGCTGAATTTGTGTTAACTAATAACTGGGAATGATATAGCTTTAATCACTTATGAAACACATACTGTAACTTAGTCTAAACTGGTAATTTCCTTTGCTCCTCTCTTATGGTGTGGGAAAATTTAAAGATCAACATGAAAAAGGAGCCATTGCTAAGGCAGATCTTTTAAGATAACAAAGGAAAAATTGACAAGTGTATATGATAAATTATCAGTAACAGTGATGCTACCAATTTAACTGGTACGGAAATCAGATTTTTAGGTCCTATAACGTGGCTTTTAAAATATTTCCTTTTATTCTGGAACAAAAACTGGAGAAAGGACAATGATTCCTTCAGAAAGCAATGACTCAATTCAGGTTGTTACTTTACATTTAAGTACCACTCAAAAAGTGGACATAAAAGCAAGTGATTCCTGTTTGCCCATCACTATATCAGCTACATAGCTGAGAGTTCAGATCTTAATTACACAACACTTTCTCTGTTACCAGAAGCTAAGACTGCTCTGCGACAAATAGGACAGGTAGAATTCTCAGATAACCAGCGATCGATGCAGTGGACATGGTACTCATGGGAACAAGGTAGTTTACGAAGTTTGTTGCCTTCTGTATATTCTGTAATGCAAACACTACAGGTTTTTAATGCATCATTTTCACCAAAACTTCTCATTGCCAAGTTGTCAATCTGTTCTTTGGTGAGTCCTCTAGGTTGGTCATCATCATCCTCATTTAAGAGGAAAAACTGAGCCAGGCTAAGGAAGGGCAAAGAGCCACTTTCATCAAATGTGACTGGGGCCCTATGTCGACCCTCTCGCCTGGCACCTGATGAGCCTGATGATGAGCTTCCTTCATTACTGCCTTCAAATAAATCTGAGCTAGTTTCTGAACTTTCACCACCGGAACTGGAACTAGGACTGGAACTGGAACTTGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACCAGAACTACTACCACCACCAGAACCTCCTCTTCCACTCCGTGACTCTGCCCTTTCCATATTTCGATTTGAGACTGAGCCAGTAGGCTCTGAGTCGCTATCACTGTACATAAAATAGCTTAACTCACCAAAACCTGTCATTATCTGCCTTAACATGGTCTGAATTGCAACAGATGTAGTCTCACTTAAACCAGTATTTAAGATTCTACGAATGGGAATTCTGATGGTACTGACATAGGTTCTCACACCTGCCCGCTCAGAACGTGAAAATGTACGCCTAAAACCTCCTCGTTCACTTTCATAGGTGACAGTGTTGTTTGGTGTCTGAGACCTAGACCGAGTTCTGCTGGCTATGCTATCTCTCTGCCGATATTCTCCAGGACGAACTCTTCTTACTTGAAGATCAAGGACTATGGTTGGAGGTCTCTGTCCTGATCCTGTAGATTCACCACTGGCAGCTGTGTCTGAAGAACCTGCTCCTTGAGAAGCATTTCTTGTTCCAGAAGCTGCAAAAAGACCTCTACTTAGCAACTCAGGCCCAGATATTTGCTGCCTCAATGTCACATGGTGCCGGGTTCTAGAACTTCCCTCCGTCTCATTTACCAAAGGATGTTCAAAAGTCTGAGATGAGATACTATGATGAGATCTTCGTGGAATTTCACTCATTGGATGCAGAGGTGACCTACTTCTTTCAGCTCTTGCTCTGGTTCTCCGATGGTCTGGGCTCCTGCTTCTTGCCCTCCTCTGACCTCTGGTAGGTGGGACCTCTGTTAACGCTTCAGTTGAATTTCGTTCTGATCTAGATGGCCTTGCAGATGTTGATTCAGATCGTGGGTTTTCCACTTGCCTTTGGCTGTTGTTTTCCACATTTTCTCCACTAGAACGTCTTGCAGATGGCTCATTTTCATTCTCTGAATTTTGGCTCCCATTATTACGGTTAACATTTATCTCTAAACTGAATCTGAAATCACCACTGTTTGGATTAGTCCGACTCACTGCTCTCCAAGATTGGTTTCCTCTTTGCCCACTTCTTGTTGTATTTCCAGTTTGTCTGACAGAGTTAAGCCAGTCTATTATAGAGTCACCATTAGACACATCATCTGAAGAGTCTCCTCCTGTTCAAAACAAAGGAGGGGGAGAGGGAGAAAAAGGAACTACTAAAATGAGGACAATCATATAAGTGCTCTGAAACTCTGCATTAAATAACTTAAAAATTCGGAACACATTTCATAATTACAGATTTTTACAAACTATACTGCATAAATTTATAAGGTAAGAAAATTCTAATTCCATTTGAAAAGAGCAAGCTACACTAGAGAAATTTAGAGAATTATTTGATTTTTAAAGGGAATCTGGAGGAAGTCTATTTTCAGTATTTTATCATATACAGAGCCAAGCATACCACTGTGGGATGGTCAGAAGACGTTTTTTCAGTCCTCTGCCAAAATACTAATGTAATCAAACTAGGTAAGGAAACAGTGTTTAACGAACAGTCACATTTAGTTCAAGCTACATTTCTGTCAAATTTTTATTAGTCTACATACTGTGCCTTTGATAACATTTGAGGTTGTTTTAAAATACAGGACTATTTATTGTAGCCATAAGAAAAATACAAACAAGA
AAGCTTTGTTTGGACATTATTTCCTTGCAAGAGCAGTACATATCCTTAGTAAACAACTACCATATTTACAAGTTAATTTCCTTGATACTTAGATAGGATTGAAAGCCAGAAGAAATCATGGAAGAGTGAGCTTTGAAATAATCTTTACAGCTAAGTTGGTAACAGTGAAGGTACCCAGACAATTCCTAAAGCAGACTTGTTTATTTTGTAGAGTATTTGACTACGTCTGGGTAGCTAGCTTGCTTTGATAAAGGCCAAGGACAAGTTCAATCCCTATTTTGGCCTGTTAAAGCTTTTCCCAGAAGAACAAATATCTGCTCCATAGTCATTCTAATCCTAACCCCAGCTAGTCTCAAAAAAGAAATTAGGCAAGAAGACTGGGGTTATCATGAAGTTACTCTTACTACTAAGAAACCAACATAAAGTGCATGTCCATAGATAGCGAGTCAGCAGTCTCATTTTCATATATGGGCAGCACAATTAAAATTTGAATTTCAAATAACCCAACATGACTTTCAACAAAGGATAAAAATCCCTTAATCTTCAACTGGTCTTTAAATTTGAGATGTTAGGACTGTGTTAGAGATAGTAATGAAATATGATCAAGTGTGCACTGGTACCTTAAATGACAAATCTCAAAAACAACACAAATTCGAGACTTTCCTATTAACACACACATGTGTACCAACTGCAATTCATATGCTAAAAGTGGTTTTATAGTCTCTTTCCTCCATTTTTTCATTTTTGAGGAGCAGACTTGTAAATTTAACTTGTGCTAGGTAGTAGTGGTTTGTTTTTCTTAAACCAAAACTCTGCCAAACTTGCTGATCTTCTGCTTCATCTACTCAGGTAGAATACCAGGTCAAGCTGCTGCTGTGGCTGCTCTCACCATATGAAACCAGTTTGTGTCTGCATTATTACTGTCTTCAGGAAAACTTTAAATTCTTCAGTTTTCTTTACTCCTCCCATATTTCACTTCCTGCCTAAATCCAAGTTAAATTATACAATTTCCACTGGTCTTCAACACGGTTTAATTCTGCACTGTCCTTTCCTTTGCATGTCACAGTAGCTGTTCACACATTAAATATTATAGATATGTTCTGCTCTTGACATCTACACACTTACAAAAGCAGCTTTGTACTTTGTTTGGTGTGTTTGTTACTATGTTGGCTCACAAAAAGCAGTTTTCTCAGTTCTAAGCATGGTACTTTACAATTTTTAATGCATTCATACAACAGTGCATTGGAAAAGTACTGAGCCTCTACAAAATAGCTTTACATTTTTAAACAAATGAATGTGATTTTTTTTCACTTACACAAGCATAGGCTTTTTAATATTTCCACAAGATAAATATCTCAATTAAACTATAAGCTCACTCTACAGTGTGCCACAGTGATGGGCTTAGGAGACAGTTATACACTTAGAAGATCCTAACCTTAGTGTTATTTACACTGACATGTCCAGTATCACCAAGTCTGAAAGGTGAACAAACAATACTCAGAATGTGGCTGAATTTGTGTTAACTAATAACTGGGAATGATATAGCTTTAATCACTTATGAAACACATACTGTAACTTAGTCTAAACTGGTAATTTCCTTTGCTCCTCTCTTATGGTGTGGGAAAATTTAAAGATCAACATGAAAAAGGAGCCATTGCTAAGGCAGATCTTTTAAGATAACAAAGGAAAAATTGACAAGTGTATATGATAAATTATCAGTAACAGTGATGCTACCAATTTAACTGGTACGGAAATCAGATTTTTAGGTCCTATAACGTGGCTTTTAAAATATTTCCTTTTATTCTGGAACAAAAACTGGAGAAAGGACAATGATTCCTTCAGAAAGCAATGACTCAATTCAGGTTGTTACTTTACATTTAAGTACCACTCAAAAAGTGGACATAAAAGCAAGTGATTCCTGTTTGCCCATCACTATATCAGCTACATAGCTGAGAGTTCAGATCTTAATTACACAACACTTTCTCTGTTACCAGAAGCTAAGACTGCTCTGCGACAAATAGGACAGGTAGAATTCTCAGATAACCAGCAATCGATGCAGTGGACATGGTACTCATGGGAACAAGGTAGTTTACGAAGTTTGTTGCCTTCTGTATATTCTGTAATGCAAACACTACAGGTTTTTAATGCATCATTTTCACCAAAACTTCTCATTGCCAAGTTGTCAATCTGTTCTTTGGTGAGTCCTCTAGGTTGGTCATCATCATCCTCATTTAAGAGGAAAAACTGAGCCAGGCTAAGGAAGGGCAAAGAGCCACTTTCATCAAATGTGACTGGGGCCCTATGTCGACCCTCTCGCCTGGCACCTGATGAGCCTGATGATGAGCTTCCTTCATTACTGCCTTCAAATAAATCTGAGCTAGTTTCTGAACTTTCACCACCGGAACTGGAACTAGGACTGGAACTGGAACTTGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACCAGAACTACTACCACCACCAGAACCTCCTCTTCCACTCCGTGACTCTGCCCTTTCCATATTTCGATTTGAGACTGAGCCAGTAGGCTCTGAGTCGCTATCACTGTACATAAAATAGCTTAACTCACCAAAACCTGTCATTATCTGCCTTAACATGGTCTGAATTGCAACAGATGTAGTCTCACTTAAACCAGTATTTAAGATTCTACGAATGGGAATTCTGATGGTACTGACATAGGTTCTCACACCTGCCCGCTCAGAACGTGAAAATGTACGCCTAAAACCTCCTCGTTCACTTTCATAGGTGACAGTGTTGTTTGGTGTCTGAGACCTAGACCGAGTTCTGCTGGCTATGCTATCTCTCTGCCGATATTCTCCAGGACGAACTCTTCTTACTTGAAGATCAAGGACTATGGTTGGAGGTCTCTGTCCTGATCCTGTAGATTCACCACTGGCAGCTGTGTCTGAAGAACCTGCTCCTTGAGAAGCATTTCTTGTTCCAGAAGCTGCAAAAAGACCTCTACTTAGCAACTCAGGCCCAGATATTTGCTGCCTCAATGTCACATGGTGCCGGGTTCTAGAACTTCCCTCCGTCTCATTTACCAAAGGATGTTCAAAAGTCTGAGATGAGATACTATGATGAGATCTTCGTGGAATTTCACTCATTGGATGCAGAGGTGACCTACTTCTTTCAGCTCTTGCTCTGGTTCTCCGATGGTCTGGGCTCCTGCTTCTTGCCCTCCTCTGACCTCTGGTAGGTGGGACCTCTGTTAACGCTTCAGTTGAATTTCGTTCTGATCTAGATGGCCTTGCAGATGTTGATTCAGATCGTGGGTTTTCCACTTGCCTTTGGCTGTTGTTTTCCACATTTTCTCCACTAGAACGTCTTGCAGATGGCTCATTTTCATTCTCTGAATTTTGGCTCCCATTATTACGGTTAACATTTATCTCTAAACTGAATCTGAAATCACCACTGTTTGGATTAGTCCGACTCACTGCTCTCCAAGATTGGTTTCCTCTTTGCCCACTTCTTGTTGTATTTCCAGTTTGTCTGACAGAGTTAAGCCAGTCTATTATAGAGTCACCATTAGACACATCATCTGAAGAGTCTCCTCCTGTTCAAAACAAAGGAGGGGGAGAGGGAGAAAAAGGAACTACTAAAATGAGGACAATCATATAAGTGCTCTGAAACTCTGCATTAAATAACTTAAAAATTCGGAACACATTTCATAATTACAGATTTTTACAAACTATACTGCATAAATTTATAAGGTAAGAAAATTCTAATTCCATTTGAAAAGAGCAAGCTACACTAGAGAAATTTAGAGAATTATTTGATTTTTAAAGGGAATCTGGAGGAAGTCTATTTTCAGTATTTTATCATATACAGAGCCAAGCATACCACTGTGGGATGGTCAGAAGACGTTTTTTCAGTCCTCTGCCAAAATACTAATGTAATCAAACTAGGTAAGGAAACAGTGTTTAACGAACAGTCACATTTAGTTCAAGCTACATTTCTGTCAAATTTTTATTAGTCTACATACTGTGCCTTTGATAACATTTGAGGTTGTTTTAAAATACAGGACTATTTATTGTAGCCATAAGAAAAATACAAACAAGA
Task1_train_30415
Given this variant in gene RLIM (ring finger protein, LIM domain interacting) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 61
GTACATATCCTTAGTAAACAACTACCATATTTACAAGTTAATTTCCTTGATACTTAGATAGGATTGAAAGCCAGAAGAAATCATGGAAGAGTGAGCTTTGAAATAATCTTTACAGCTAAGTTGGTAACAGTGAAGGTACCCAGACAATTCCTAAAGCAGACTTGTTTATTTTGTAGAGTATTTGACTACGTCTGGGTAGCTAGCTTGCTTTGATAAAGGCCAAGGACAAGTTCAATCCCTATTTTGGCCTGTTAAAGCTTTTCCCAGAAGAACAAATATCTGCTCCATAGTCATTCTAATCCTAACCCCAGCTAGTCTCAAAAAAGAAATTAGGCAAGAAGACTGGGGTTATCATGAAGTTACTCTTACTACTAAGAAACCAACATAAAGTGCATGTCCATAGATAGCGAGTCAGCAGTCTCATTTTCATATATGGGCAGCACAATTAAAATTTGAATTTCAAATAACCCAACATGACTTTCAACAAAGGATAAAAATCCCTTAATCTTCAACTGGTCTTTAAATTTGAGATGTTAGGACTGTGTTAGAGATAGTAATGAAATATGATCAAGTGTGCACTGGTACCTTAAATGACAAATCTCAAAAACAACACAAATTCGAGACTTTCCTATTAACACACACATGTGTACCAACTGCAATTCATATGCTAAAAGTGGTTTTATAGTCTCTTTCCTCCATTTTTTCATTTTTGAGGAGCAGACTTGTAAATTTAACTTGTGCTAGGTAGTAGTGGTTTGTTTTTCTTAAACCAAAACTCTGCCAAACTTGCTGATCTTCTGCTTCATCTACTCAGGTAGAATACCAGGTCAAGCTGCTGCTGTGGCTGCTCTCACCATATGAAACCAGTTTGTGTCTGCATTATTACTGTCTTCAGGAAAACTTTAAATTCTTCAGTTTTCTTTACTCCTCCCATATTTCACTTCCTGCCTAAATCCAAGTTAAATTATACAATTTCCACTGGTCTTCAACACGGTTTAATTCTGCACTGTCCTTTCCTTTGCATGTCACAGTAGCTGTTCACACATTAAATATTATAGATATGTTCTGCTCTTGACATCTACACACTTACAAAAGCAGCTTTGTACTTTGTTTGGTGTGTTTGTTACTATGTTGGCTCACAAAAAGCAGTTTTCTCAGTTCTAAGCATGGTACTTTACAATTTTTAATGCATTCATACAACAGTGCATTGGAAAAGTACTGAGCCTCTACAAAATAGCTTTACATTTTTAAACAAATGAATGTGATTTTTTTTCACTTACACAAGCATAGGCTTTTTAATATTTCCACAAGATAAATATCTCAATTAAACTATAAGCTCACTCTACAGTGTGCCACAGTGATGGGCTTAGGAGACAGTTATACACTTAGAAGATCCTAACCTTAGTGTTATTTACACTGACATGTCCAGTATCACCAAGTCTGAAAGGTGAACAAACAATACTCAGAATGTGGCTGAATTTGTGTTAACTAATAACTGGGAATGATATAGCTTTAATCACTTATGAAACACATACTGTAACTTAGTCTAAACTGGTAATTTCCTTTGCTCCTCTCTTATGGTGTGGGAAAATTTAAAGATCAACATGAAAAAGGAGCCATTGCTAAGGCAGATCTTTTAAGATAACAAAGGAAAAATTGACAAGTGTATATGATAAATTATCAGTAACAGTGATGCTACCAATTTAACTGGTACGGAAATCAGATTTTTAGGTCCTATAACGTGGCTTTTAAAATATTTCCTTTTATTCTGGAACAAAAACTGGAGAAAGGACAATGATTCCTTCAGAAAGCAATGACTCAATTCAGGTTGTTACTTTACATTTAAGTACCACTCAAAAAGTGGACATAAAAGCAAGTGATTCCTGTTTGCCCATCACTATATCAGCTACATAGCTGAGAGTTCAGATCTTAATTACACAACACTTTCTCTGTTACCAGAAGCTAAGACTGCTCTGCGACAAATAGGACAGGTAGAATTCTCAGATAACCAGCGATCGATGCAGTGGACATGGTACTCATGGGAACAAGGTAGTTTACGAAGTTTGTTGCCTTCTGTATATTCTGTAATGCAAACACTACAGGTTTTTAATGCATCATTTTCACCAAAACTTCTCATTGCCAAGTTGTCAATCTGTTCTTTGGTGAGTCCTCTAGGTTGGTCATCATCATCCTCATTTAAGAGGAAAAACTGAGCCAGGCTAAGGAAGGGCAAAGAGCCACTTTCATCAAATGTGACTGGGGCCCTATGTCGACCCTCTCGCCTGGCACCTGATGAGCCTGATGATGAGCTTCCTTCATTACTGCCTTCAAATAAATCTGAGCTAGTTTCTGAACTTTCACCACCGGAACTGGAACTAGGACTGGAACTGGAACTTGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACTGGAACTCGAACTGGAACCAGAACTACTACCACCACCAGAACCTCCTCTTCCACTCCGTGACTCTGCCCTTTCCATATTTCGATTTGAGACTGAGCCAGTAGGCTCTGAGTCGCTATCACTGTACATAAAATAGCTTAACTCACCAAAACCTGTCATTATCTGCCTTAACATGGTCTGAATTGCAACAGATGTAGTCTCACTTAAACCAGTATTTAAGATTCTACGAATGGGAATTCTGATGGTACTGACATAGGTTCTCACACCTGCCCGCTCAGAACGTGAAAATGTACGCCTAAAACCTCCTCGTTCACTTTCATAGGTGACAGTGTTGTTTGGTGTCTGAGACCTAGACCGAGTTCTGCTGGCTATGCTATCTCTCTGCCGATATTCTCCAGGACGAACTCTTCTTACTTGAAGATCAAGGACTATGGTTGGAGGTCTCTGTCCTGATCCTGTAGATTCACCACTGGCAGCTGTGTCTGAAGAACCTGCTCCTTGAGAAGCATTTCTTGTTCCAGAAGCTGCAAAAAGACCTCTACTTAGCAACTCAGGCCCAGATATTTGCTGCCTCAATGTCACATGGTGCCGGGTTCTAGAACTTCCCTCCGTCTCATTTACCAAAGGATGTTCAAAAGTCTGAGATGAGATACTATGATGAGATCTTCGTGGAATTTCACTCATTGGATGCAGAGGTGACCTACTTCTTTCAGCTCTTGCTCTGGTTCTCCGATGGTCTGGGCTCCTGCTTCTTGCCCTCCTCTGACCTCTGGTAGGTGGGACCTCTGTTAACGCTTCAGTTGAATTTCGTTCTGATCTAGATGGCCTTGCAGATGTTGATTCAGATCGTGGGTTTTCCACTTGCCTTTGGCTGTTGTTTTCCACATTTTCTCCACTAGAACGTCTTGCAGATGGCTCATTTTCATTCTCTGAATTTTGGCTCCCATTATTACGGTTAACATTTATCTCTAAACTGAATCTGAAATCACCACTGTTTGGATTAGTCCGACTCACTGCTCTCCAAGATTGGTTTCCTCTTTGCCCACTTCTTGTTGTATTTCCAGTTTGTCTGACAGAGTTAAGCCAGTCTATTATAGAGTCACCATTAGACACATCATCTGAAGAGTCTCCTCCTGTTCAAAACAAAGGAGGGGGAGAGGGAGAAAAAGGAACTACTAAAATGAGGACAATCATATAAGTGCTCTGAAACTCTGCATTAAATAACTTAAAAATTCGGAACACATTTCATAATTACAGATTTTTACAAACTATACTGCATAAATTTATAAGGTAAGAAAATTCTAATTCCATTTGAAAAGAGCAAGCTACACTAGAGAAATTTAGAGAATTATTTGATTTTTAAAGGGAATCTGGAGGAAGTCTATTTTCAGTATTTTATCATATACAGAGCCAAGCATACCACTGTGGGATGGTCAGAAGACGTTTTTTCAGTCCTCTGCCAAAATACTAATGTAATCAAACTAGGTAAGGAAACAGTGTTTAACGAACAGTCACATTTAGTTCAAGCTACATTTCTGTCAAATTTTTATTAGTCTACATACTGTGCCTTTGATAACATTTGAGGTTGTTTTAAAATACAGGACTATTTATTGTAGCCATAAGAAAAATACAAACAAGATTTATAGGTTTAAAAGCATTTGAATATTTCTTAAT
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Task1_train_30416
A sequence alteration has been identified in RLIM (ring finger protein, LIM domain interacting) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 61
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Task1_train_30417
Consider a variant on Chromosome X in gene RLIM (ring finger protein, LIM domain interacting). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Global developmental delay
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Task1_train_30418
A change on Chromosome X affects gene ABCB7 (ATP binding cassette subfamily B member 7). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked sideroblastic anemia with ataxia
TTCTTAACTTCTCAGACCTTACTTTGAATTTATTTTCCCTCCAAAGTAACACAGTAAGTGTTTATTAAATGTTTAACATGGGTTCGGCACTGTGTTTCGTACTGAGGGCAGAGTGGTTAACAAGGCATACAAAATTGAGGATGGCAGACAAGCTACTTTGTAATTATTATAAATCTACTATGTTGAAAACTGCTCCAAATTACAATAGTAGTTTCCGTTTTCTGAACAATTATGTGATAGACTCGGTATTTTATATTTATTATCTCTAATCCACAATAATTCTATCCTATAAGATAAATGGCATCCTTATTTTACAGATAAGAAAATGGAGGCCCCAGGCCACACAACTAATGACAATTAGAGATGGGGTTAGAATCCAGGTCTGTGTTCTTTGTATTCTATTATGCTATCATTCCAGGGCTTCCTATCATGCAGATTTTTCCTTCAAGTTTTTTCTTTTCCTTTTTTAAAAAATCCCTTTTGATACCAGAATTTCACTGGTAGGGTCTAATACTGACTACTTCAGTAGCATATGTTGATCCCTTGATTCAAACTGTTCTAGTTACGGATTGATCAACCCAATAAATCCTCCAAAAATTTGTTTTTTTCTGTTTTTAAATACCTGAGGTACCACTCCCACTGCCCTCCGAAGGCTTTCCAGGCTCACATCTTGTATATTTTGACCAGCAAGATAAATGCTACCCTTTTGAGGCTCATAGAAGCGAAATAATAGCCTCACTATTGTGCTTTTCCTGAAATTGGAGATGAAGAAAGGTTATTTAGCTCCTATTAATGTTAGGAAACCCCAGTTTTAAACCACAGTAATCATTTTGATAAAGAAAGAAATATTACATTGGGAATCATCAGCCTATAATACAGAATTTTACAAATAACTAAATTACCCACCCTGACCCACTACCTCCTACAATGGCCACTTTCTTTCCTGCAGGGACTTCAAAGGATATTCCACTAAGGACTTTCTGGCCCTCAATGTATTCAAAATGCACATTATCAAAGGCCACGGTAGCTGTCTGTGGTGTGATCTGAAGGGGAGATGCCATCACTTTGTCCTAGCAGGGAAGAGAAAAAAAAAGCCACTTTACGCACTGCCTAGAGTACAGCTACGAAGACAATTTTCTAATTCACAGAAAGAAAAAGGATATAATGGAAAAGAAGGAGGTTTATAAGTGGACTTAGACCACTTCCAAGCATGCATTTAAAGATTTGTTTTCTCACGCTTCATGGCTAAGGTAAAACAAACCCTGAATGTTTTGGTTTCTGAGCAACTTTTTTTTGAGGTGGGGTTGGGGAGGGAGAAGGGATAATGGGCAGGGGAGGAAAGGGGCTGAGGATGCAAGGAGAGGCAATCATATATTCCATGTCATTATTAGATAAGTAAATTCAGTGTAAGTACAAATAATTCAACTTAACAAAATTTACTTTCTAGTATAATAGTCTTCATTAACATTGTAAGATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTTCGCCCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCAGGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCATCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTTCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCTTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCATGCGTGGCCAGGTTTTTAAACACAGAAGTGAAAGCTCTAACAACCTCTTAATACAGGTGATAGCACCCCCACCCCTGACAATTCCTGCAAGTAAAATAAATTGGTTTGCTAATGTGGTGATGTAGGAATATTCCTAGAATAATCCTACTAATAGGATGATGTTCACATACTTTTGAAAAGGTACTATATAGATTACTTACTTTAATTTGGGTGTCTACCTTGAGTAGAGTAAACAAGGTGTTCATATCTATGAGTGCTTGTCTAGTCTCTCTATATACAGTTCCCAGAAAGTTCAGGGGTAATGAAAGCTGAAAAAGCAGTCCATTCACCATTACTAGATCTCCAACAGTAAGGGTACCTTAAAAGGCAGAAGAAAAAAAGGGTATTTTAGATAAATGTTACATACTTTTCCAATTTACGATAGGTTTATAGTCTATTACGACGGAACAAAATATTCTTAATCAGCAACAACTCTTATGTCAACTCAATTTCAAAGCATTAATCCACGATTTAGGTAATACAGGGAACTTAGTATACGTTAGGAATGGGAAAGACCCACCTATACACTATATATAATATATAAAAAAGAATGGTTTAAGTGAGGATAGAAATTGAAGGCTAAAAATTTTCTGTTTTTTTCCCTAAGACACTAGCAATGGTTTCTTTGTAGTGTAAAACAGGAATTTAAAAATTAGTATACATTAAAAATTGGAGAAAATAGATATCACGATTAAGGATGATAAACCATTCTGATGTACATCAAGTTGAAGGAAACAAAATGAAACAACAACAACAACAACAAAATGTTGTTGTGACCTAAATATGTTTTCCACAGATTTTCCACATATTTAGGTCACAGTGAATGAATGAATACTAACTGAGTGGGGGTGGGGAGGGTTTCCAGAAAGGAGGGACAGACATTTACTTTTGAAGTGTTTTGCAACTAAAAAAAGGAGGAGAAAGATTAAAAGGTTCCTGGTAATTCTTAAAAAAAAGAGTGCAGTTTAGTGCTTTGAACTAAACACTAAATCAATTACATTGCTTTACAGGTCTGCAAGAGAAATTAGAAAAGCTAGATACTAAAAAAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAACAGGTAGTTCCAAACAGTAATCCCAATCAGTGAGTGAGGCAGTGCTAAACAAAAGGAAGTTAAAAAACCATTATCAAACCATCAAGTAAATACATTCTGATACAGAGAAAAGTACTCCAAGGATGTGAAAGCACTTTAACATCCTTTATAATTAAGATAAGCATGCACATTCCTTTCATTAATCTTTATTTATAAAAGTTGAACAGCCTGTAAATGTGATAGCCACAGACTCATTACCTGCCACAATTCCCTGACTGGCGAGCACCATTATAGCTGTTAAACCGACACTGAAAATAGCACTTTGACCAAAGTTCAGCATAGCCAGAGTAGAGGTACTTTTCAATGAAGCAGTCTCATACGTCTTCAAAAATCCATCATATCTCTGTGCTTCATATCTTTCATTATTAAAATACTACAAAATATATAAAAATAACTATAGGCAAGTATAATTAGAATTTATTCTCTTAAGTGATTAGTATACTTTTCATCAGACTTCATGTATGAATACAATTTTGTACTGTAGATTCCATTTTAAAAATTGACTCAATATATTGGACTATGATATCCCTGCAGTTTTCCATAATGAATTGTATTTGAAAAGTCCACAAAATTCACCCAACGAATATTTACTGAATGCTTATCTAATTGCAACCCGACCTAAAACAAAATCTTCAATGACACTTCCTTCACAAAGCCTTCCCCTGAGACTCTGAATTGACAATTCCCACTACCCTCACAACATTATGCCTTCTTATTTAGTCACCTGCATACTTAAATTCTCTCGGTACAGTATAAAATTCTGGGATAGCAGGGATCAGAAAGTAATCTTTTTTTACCACCCTCCCCTGTGAAAGCACTTAGAACACATAAGAGGCATTCAGTAACTATTTGTTAAATGGAAATATGAACAAATAAATGAAAGAATTAATGAGAAGCACTATGCTAGGCACTCTGAGGGATAGAAGAGAGTCAAGAATTTATATGCCAGTTTGATTAGCTTACTGTTCATTCTGAATCAAGATGCTAACGGTACACAGTCATGCATCACTTAACAAAAGAGATATGTTCTGAGAAATGCATACTTTAGGTAATTTTGACTGTGCAATCATCATAGAGTGTACTTACACAAACCTAGATGGTATAGTCTACCACTCACCTAGACTATATGGTATAGCCTATTGCTCCTAGGCTATAAACCTGTATAGCACG
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Task1_train_30419
This mutation is located in gene ABCB7 (ATP binding cassette subfamily B member 7) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; X-linked sideroblastic anemia with ataxia
AAATGTTTAACATGGGTTCGGCACTGTGTTTCGTACTGAGGGCAGAGTGGTTAACAAGGCATACAAAATTGAGGATGGCAGACAAGCTACTTTGTAATTATTATAAATCTACTATGTTGAAAACTGCTCCAAATTACAATAGTAGTTTCCGTTTTCTGAACAATTATGTGATAGACTCGGTATTTTATATTTATTATCTCTAATCCACAATAATTCTATCCTATAAGATAAATGGCATCCTTATTTTACAGATAAGAAAATGGAGGCCCCAGGCCACACAACTAATGACAATTAGAGATGGGGTTAGAATCCAGGTCTGTGTTCTTTGTATTCTATTATGCTATCATTCCAGGGCTTCCTATCATGCAGATTTTTCCTTCAAGTTTTTTCTTTTCCTTTTTTAAAAAATCCCTTTTGATACCAGAATTTCACTGGTAGGGTCTAATACTGACTACTTCAGTAGCATATGTTGATCCCTTGATTCAAACTGTTCTAGTTACGGATTGATCAACCCAATAAATCCTCCAAAAATTTGTTTTTTTCTGTTTTTAAATACCTGAGGTACCACTCCCACTGCCCTCCGAAGGCTTTCCAGGCTCACATCTTGTATATTTTGACCAGCAAGATAAATGCTACCCTTTTGAGGCTCATAGAAGCGAAATAATAGCCTCACTATTGTGCTTTTCCTGAAATTGGAGATGAAGAAAGGTTATTTAGCTCCTATTAATGTTAGGAAACCCCAGTTTTAAACCACAGTAATCATTTTGATAAAGAAAGAAATATTACATTGGGAATCATCAGCCTATAATACAGAATTTTACAAATAACTAAATTACCCACCCTGACCCACTACCTCCTACAATGGCCACTTTCTTTCCTGCAGGGACTTCAAAGGATATTCCACTAAGGACTTTCTGGCCCTCAATGTATTCAAAATGCACATTATCAAAGGCCACGGTAGCTGTCTGTGGTGTGATCTGAAGGGGAGATGCCATCACTTTGTCCTAGCAGGGAAGAGAAAAAAAAAGCCACTTTACGCACTGCCTAGAGTACAGCTACGAAGACAATTTTCTAATTCACAGAAAGAAAAAGGATATAATGGAAAAGAAGGAGGTTTATAAGTGGACTTAGACCACTTCCAAGCATGCATTTAAAGATTTGTTTTCTCACGCTTCATGGCTAAGGTAAAACAAACCCTGAATGTTTTGGTTTCTGAGCAACTTTTTTTTGAGGTGGGGTTGGGGAGGGAGAAGGGATAATGGGCAGGGGAGGAAAGGGGCTGAGGATGCAAGGAGAGGCAATCATATATTCCATGTCATTATTAGATAAGTAAATTCAGTGTAAGTACAAATAATTCAACTTAACAAAATTTACTTTCTAGTATAATAGTCTTCATTAACATTGTAAGATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTTCGCCCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCAGGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCATCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTTCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCTTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCATGCGTGGCCAGGTTTTTAAACACAGAAGTGAAAGCTCTAACAACCTCTTAATACAGGTGATAGCACCCCCACCCCTGACAATTCCTGCAAGTAAAATAAATTGGTTTGCTAATGTGGTGATGTAGGAATATTCCTAGAATAATCCTACTAATAGGATGATGTTCACATACTTTTGAAAAGGTACTATATAGATTACTTACTTTAATTTGGGTGTCTACCTTGAGTAGAGTAAACAAGGTGTTCATATCTATGAGTGCTTGTCTAGTCTCTCTATATACAGTTCCCAGAAAGTTCAGGGGTAATGAAAGCTGAAAAAGCAGTCCATTCACCATTACTAGATCTCCAACAGTAAGGGTACCTTAAAAGGCAGAAGAAAAAAAGGGTATTTTAGATAAATGTTACATACTTTTCCAATTTACGATAGGTTTATAGTCTATTACGACGGAACAAAATATTCTTAATCAGCAACAACTCTTATGTCAACTCAATTTCAAAGCATTAATCCACGATTTAGGTAATACAGGGAACTTAGTATACGTTAGGAATGGGAAAGACCCACCTATACACTATATATAATATATAAAAAAGAATGGTTTAAGTGAGGATAGAAATTGAAGGCTAAAAATTTTCTGTTTTTTTCCCTAAGACACTAGCAATGGTTTCTTTGTAGTGTAAAACAGGAATTTAAAAATTAGTATACATTAAAAATTGGAGAAAATAGATATCACGATTAAGGATGATAAACCATTCTGATGTACATCAAGTTGAAGGAAACAAAATGAAACAACAACAACAACAACAAAATGTTGTTGTGACCTAAATATGTTTTCCACAGATTTTCCACATATTTAGGTCACAGTGAATGAATGAATACTAACTGAGTGGGGGTGGGGAGGGTTTCCAGAAAGGAGGGACAGACATTTACTTTTGAAGTGTTTTGCAACTAAAAAAAGGAGGAGAAAGATTAAAAGGTTCCTGGTAATTCTTAAAAAAAAGAGTGCAGTTTAGTGCTTTGAACTAAACACTAAATCAATTACATTGCTTTACAGGTCTGCAAGAGAAATTAGAAAAGCTAGATACTAAAAAAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAACAGGTAGTTCCAAACAGTAATCCCAATCAGTGAGTGAGGCAGTGCTAAACAAAAGGAAGTTAAAAAACCATTATCAAACCATCAAGTAAATACATTCTGATACAGAGAAAAGTACTCCAAGGATGTGAAAGCACTTTAACATCCTTTATAATTAAGATAAGCATGCACATTCCTTTCATTAATCTTTATTTATAAAAGTTGAACAGCCTGTAAATGTGATAGCCACAGACTCATTACCTGCCACAATTCCCTGACTGGCGAGCACCATTATAGCTGTTAAACCGACACTGAAAATAGCACTTTGACCAAAGTTCAGCATAGCCAGAGTAGAGGTACTTTTCAATGAAGCAGTCTCATACGTCTTCAAAAATCCATCATATCTCTGTGCTTCATATCTTTCATTATTAAAATACTACAAAATATATAAAAATAACTATAGGCAAGTATAATTAGAATTTATTCTCTTAAGTGATTAGTATACTTTTCATCAGACTTCATGTATGAATACAATTTTGTACTGTAGATTCCATTTTAAAAATTGACTCAATATATTGGACTATGATATCCCTGCAGTTTTCCATAATGAATTGTATTTGAAAAGTCCACAAAATTCACCCAACGAATATTTACTGAATGCTTATCTAATTGCAACCCGACCTAAAACAAAATCTTCAATGACACTTCCTTCACAAAGCCTTCCCCTGAGACTCTGAATTGACAATTCCCACTACCCTCACAACATTATGCCTTCTTATTTAGTCACCTGCATACTTAAATTCTCTCGGTACAGTATAAAATTCTGGGATAGCAGGGATCAGAAAGTAATCTTTTTTTACCACCCTCCCCTGTGAAAGCACTTAGAACACATAAGAGGCATTCAGTAACTATTTGTTAAATGGAAATATGAACAAATAAATGAAAGAATTAATGAGAAGCACTATGCTAGGCACTCTGAGGGATAGAAGAGAGTCAAGAATTTATATGCCAGTTTGATTAGCTTACTGTTCATTCTGAATCAAGATGCTAACGGTACACAGTCATGCATCACTTAACAAAAGAGATATGTTCTGAGAAATGCATACTTTAGGTAATTTTGACTGTGCAATCATCATAGAGTGTACTTACACAAACCTAGATGGTATAGTCTACCACTCACCTAGACTATATGGTATAGCCTATTGCTCCTAGGCTATAAACCTGTATAGCACGTTACTATATTGAATATTGTAGAAAATTGTAACACAATGGTATTTGTGTATCTAAACACAGAAAAGG
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Task1_train_30420
Here’s a variant in ABCB7 (ATP binding cassette subfamily B member 7) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; not provided
GAAAAAAAAAGCCACTTTACGCACTGCCTAGAGTACAGCTACGAAGACAATTTTCTAATTCACAGAAAGAAAAAGGATATAATGGAAAAGAAGGAGGTTTATAAGTGGACTTAGACCACTTCCAAGCATGCATTTAAAGATTTGTTTTCTCACGCTTCATGGCTAAGGTAAAACAAACCCTGAATGTTTTGGTTTCTGAGCAACTTTTTTTTGAGGTGGGGTTGGGGAGGGAGAAGGGATAATGGGCAGGGGAGGAAAGGGGCTGAGGATGCAAGGAGAGGCAATCATATATTCCATGTCATTATTAGATAAGTAAATTCAGTGTAAGTACAAATAATTCAACTTAACAAAATTTACTTTCTAGTATAATAGTCTTCATTAACATTGTAAGATTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGACGGAGTTCGCCCTTGTTGCTCAGGCTGGAGTGCAATGGCAGGATCTCGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCATCACGCCCAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTTCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCTTGATCTCAGGTGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCATGCGTGGCCAGGTTTTTAAACACAGAAGTGAAAGCTCTAACAACCTCTTAATACAGGTGATAGCACCCCCACCCCTGACAATTCCTGCAAGTAAAATAAATTGGTTTGCTAATGTGGTGATGTAGGAATATTCCTAGAATAATCCTACTAATAGGATGATGTTCACATACTTTTGAAAAGGTACTATATAGATTACTTACTTTAATTTGGGTGTCTACCTTGAGTAGAGTAAACAAGGTGTTCATATCTATGAGTGCTTGTCTAGTCTCTCTATATACAGTTCCCAGAAAGTTCAGGGGTAATGAAAGCTGAAAAAGCAGTCCATTCACCATTACTAGATCTCCAACAGTAAGGGTACCTTAAAAGGCAGAAGAAAAAAAGGGTATTTTAGATAAATGTTACATACTTTTCCAATTTACGATAGGTTTATAGTCTATTACGACGGAACAAAATATTCTTAATCAGCAACAACTCTTATGTCAACTCAATTTCAAAGCATTAATCCACGATTTAGGTAATACAGGGAACTTAGTATACGTTAGGAATGGGAAAGACCCACCTATACACTATATATAATATATAAAAAAGAATGGTTTAAGTGAGGATAGAAATTGAAGGCTAAAAATTTTCTGTTTTTTTCCCTAAGACACTAGCAATGGTTTCTTTGTAGTGTAAAACAGGAATTTAAAAATTAGTATACATTAAAAATTGGAGAAAATAGATATCACGATTAAGGATGATAAACCATTCTGATGTACATCAAGTTGAAGGAAACAAAATGAAACAACAACAACAACAACAAAATGTTGTTGTGACCTAAATATGTTTTCCACAGATTTTCCACATATTTAGGTCACAGTGAATGAATGAATACTAACTGAGTGGGGGTGGGGAGGGTTTCCAGAAAGGAGGGACAGACATTTACTTTTGAAGTGTTTTGCAACTAAAAAAAGGAGGAGAAAGATTAAAAGGTTCCTGGTAATTCTTAAAAAAAAGAGTGCAGTTTAGTGCTTTGAACTAAACACTAAATCAATTACATTGCTTTACAGGTCTGCAAGAGAAATTAGAAAAGCTAGATACTAAAAAAAAAAGTTGTTCTTAAAAGAACAGGTAGTTCCAAACAGTAATCCCAATCAGTGAGTGAGGCAGTGCTAAACAAAAGGAAGTTAAAAAACCATTATCAAACCATCAAGTAAATACATTCTGATACAGAGAAAAGTACTCCAAGGATGTGAAAGCACTTTAACATCCTTTATAATTAAGATAAGCATGCACATTCCTTTCATTAATCTTTATTTATAAAAGTTGAACAGCCTGTAAATGTGATAGCCACAGACTCATTACCTGCCACAATTCCCTGACTGGCGAGCACCATTATAGCTGTTAAACCGACACTGAAAATAGCACTTTGACCAAAGTTCAGCATAGCCAGAGTAGAGGTACTTTTCAATGAAGCAGTCTCATACGTCTTCAAAAATCCATCATATCTCTGTGCTTCATATCTTTCATTATTAAAATACTACAAAATATATAAAAATAACTATAGGCAAGTATAATTAGAATTTATTCTCTTAAGTGATTAGTATACTTTTCATCAGACTTCATGTATGAATACAATTTTGTACTGTAGATTCCATTTTAAAAATTGACTCAATATATTGGACTATGATATCCCTGCAGTTTTCCATAATGAATTGTATTTGAAAAGTCCACAAAATTCACCCAACGAATATTTACTGAATGCTTATCTAATTGCAACCCGACCTAAAACAAAATCTTCAATGACACTTCCTTCACAAAGCCTTCCCCTGAGACTCTGAATTGACAATTCCCACTACCCTCACAACATTATGCCTTCTTATTTAGTCACCTGCATACTTAAATTCTCTCGGTACAGTATAAAATTCTGGGATAGCAGGGATCAGAAAGTAATCTTTTTTTACCACCCTCCCCTGTGAAAGCACTTAGAACACATAAGAGGCATTCAGTAACTATTTGTTAAATGGAAATATGAACAAATAAATGAAAGAATTAATGAGAAGCACTATGCTAGGCACTCTGAGGGATAGAAGAGAGTCAAGAATTTATATGCCAGTTTGATTAGCTTACTGTTCATTCTGAATCAAGATGCTAACGGTACACAGTCATGCATCACTTAACAAAAGAGATATGTTCTGAGAAATGCATACTTTAGGTAATTTTGACTGTGCAATCATCATAGAGTGTACTTACACAAACCTAGATGGTATAGTCTACCACTCACCTAGACTATATGGTATAGCCTATTGCTCCTAGGCTATAAACCTGTATAGCACGTTACTATATTGAATATTGTAGAAAATTGTAACACAATGGTATTTGTGTATCTAAACACAGAAAAGGTACAGTAAAAATATAGTAAAGAAGATTTGCAGTGGTATATCTGTATAGAGCACTTATCAGCAATGGATCCTGCAGGACTGAAAATGGCTCTAGGTGAGTCAGTGAGTGAGTGGTGAGTGAATATGAAGGCCTCGGGCATTACCGTACACTACTGTAGACTTTATAAACACTGTATGCTCAGGCTACACTAAATTTATTTAATATTTTCTTTCTTCAATAACACATTAAAATTAGCTTACTGTAACTTTTTTACTTTACAAACTTAAATTTTTAAAAACTTTTTTACTCTGTAATAACTTGGCTTAAAACACACATTGTACAGCTGTATAAAAATATTTTCTTTCTTCATATCCTTATTCTATAGGCTATTTTCTATTTAATTTTTTTTTTTTTTACTTTTTAAACTTTTTTGTTAAAAACTAAGACACAATCACACACATTAGCCTAGACCTACATAGGATCAGGGTCAAATATCACTGTCTTCTACCTCCACATCTCGTTTTACTGGAAGGTCTTCAGGGGCAATAACATGCATGGAGCTGTTATCTCCCATGACAACAATGCCTTCTTCTGGAATACCTCCTGAAGGACTTACCTGAGTCTATTTTACAGTTAACTTTGTTTTTAGAAGTAGAAGGCGTACACTCTAAAATAATGATTAAACGTGTAAAAATACATATACTAGTTAACATACTAGTTTATCATTATCAAATATTAAATGATGGGTCGCGCAGCTGGTTTGTTTCCACCAGCATTACCAGAAACACATGAGTAATAGAGTAATGAATTGTGCTACAACATTACAATGGCTACAATGTCACTTGCTGACAGGAACTTTTCAGTTCCATTATTATCTTATGGGACCAACATCATAGATGCCAAAACATCATTATACAGTGCATGACTGTATTTATGATCACTTATAAATTAATTCAGAAGGTAAAAATCTGATAGTGCCAAACAAAAACTGAGAAGGAAAGAGGATAGTTTCTAAAGACAAACAATAAAATAGTATTA
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Task1_train_30421
A variant was discovered on Chromosome X, affecting ATRX (ATRX chromatin remodeler). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked
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A mutation found in ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
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Task1_train_30423
This variant affects gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked, 1
CTGGAAACCATCATCCTCAGCAAACTAACACAAGAACAGAAAACCAAACACTGCATGTTCTCACTCATAAGTGGCAGTTGAACAATGAGAACATATGGACATGGGGAGGGTTACATCACCCACTGGGGCCTGTCAGGGGGTGGGGGGAAAGGGGAGGGAGAACATTAGGACAAATACCTAATGTATGCAGGGCTTAAAACCTAGATGACGGGTTGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACATGTATACCTATGTAACAAACTGCATGTTCAGCACACGTATAACAGAACTTAAAGTAAAAAAGAAAAAAGAACAAAAAAAAGGACCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGCCAACATAGTAAAACCCCATCTCTACTAAAAATAGAAAAAAAAATTGCTGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTATAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACACAGTGAGACTGTCTCAAAAAGAGGTAGAAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGGGAAAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGGAAGAGGGAGAGAGGGGAAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGGAAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGGAAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGGAAGAGGGAGAGGGAGAGAGGGGAGGAGGGAGGTGGGGGTGGGGGAGAGAGGGGGAGGGGAGAAGAGAGAAAGAAAACTACTGGGTTCAAATTCTAGCTGTAACACTTACTGGTCATGTACCCTTGTGTAATCACAAACTCTAAATCTCAGCTTCCTGAGATAATGTATATGAGACAGGCCTTTGTAAACCTTAAAGTTTTCCATAAATTTGAGGAGTATTTAACCTTCACAAGACATAAGCTAAACTGACTATATTATACCATCTTAACAGTTATATCACACAATATTACTGACTGTGAAAGCATTCTATATTTTAAAGTCCAGATTTATTTAAACTAAAATAAAGCATCCTAAATGTCATTCAATTCTGGAAATCCCAGGTCCTCTGCTTTGCTTCTTGTATTTGAAAATAACTTTCTAATCTCCATTTGGAGGACAAAAAATTATAATGATTAAGAGTAATGCTTTTGAGTTGGTCAGATATGATTTGAAGACCAGCTTTACAATATGGTGTGTAAACTTGGGTAAGTTACCTAGCCTCTCTGAACCTCAGTTTCCTCATCTTGAAAATGAAAACAGGACTATCTGCTTTTCAGCTGCTGGATTGAGGGAGATAATCTGAACAATGTCTTGTTTTTCTTAGTATTCTCTCACAGTATACCTCTCAAAGTCAGCAAATAATACACGTTTATAAAATTAACTGGTTTCCTGCAACCCGAAATTCACCATATGAATAAATTCGAAGTAATTTCCCCTTTTCTAATTGGAAAATTTGTCTGCTACTTCTTATAAAAGTTGAAGTGTAAAGTATATTAGAAAATATGCTAATTAGATATATTATATGTGGCATAAAATATGTGTTTCAGAATATACTATCTTTTTGTGGTGCTATATGGAGAACAGATCAAGCACCCTATCATTTATAATTTTCTAGACAAAATTCATTAAATATCATTTTATTATCCTTGAAAAATTCTGAAATATAGCCTTAATCAGATGACTAAATTTGATATCAGTAGTAAAATTTCCTTAGTCCACGTTGGTTTGTTAAGCCAATAATCTAAATATGTTTACCTTTGGCAGCATGGGAGTATCCCTCTTCTTCTTCTTTTCTGAATTAGGGTCATCTAATAAGTCTGGCTCAAAAGTATAAAGTTCAGTAAGCTCATTCATAGTAAAATGACGCTCCACCTGCTGCTGATCAACAACTCGAAAAGACAGTGACTGCTTAGTTACTTGCCGATCATAAATCTTATCTTCCATGGTTCCCTTTGTAAAAAGAAGGAAGAATATACAAAAAAATAAAATTTTGTAAGCATGAAACTTAATCAAGGATAAATACGGTTACTGGTTAATATGAAATGGTAAAACTTTATGGTAGTATATTGCCATAAAGAAAAACTCATCAGCAATTTTGCTTAATTCATGAAAGATTTCATCTGTTTAGCATAGTTTACCATAATAAATAAAATTACATTACTGATAATTATTCTATATTAACTGACCAAAATGCATTCAAGTGTTGCTTTATTTATTTCTGTACTCTGTAGGAGGAGGACAGCAGGCAGATACCAGAGTAAACAGAAATAAAGGGACAGACACAAAAAACATTTAGGTAAATATTGAAGTTAGAATGCAAGAGAGCAGTTTGATTCCTTTTCAATGTAATATAATAAGCTATCAACAAACACCATAAAATGCCTTTATATCGTTTTATTTTCTATAATTTCAAGACAGAAAACAAATATAAAATACCATATCCATTACATATAAACTACATTAATTAAATGTATACATTATATTAAATGTATATTAAATATAATACAAATTATAAATGAGAATGTACAGAAGTTTTAAACTTAACAGGAAAGAAAAAAATAAAAGAAAATTGAATAAATAAACAAATAACAGGAAAGAGTTTACATAAAGTTGTCAATCAACTTATGTACTAAAGAAGATCAAATAAGCAAGGATCTACCAAAAAAAACCCAGTTTCTGGTTAAGAAGCCCAGATTTGGAGGCAGGCTGAGAGGGGTTGCATCTGCTGGGGGTAGCATCTGCTAAATGTGTTCATGCAAAACAATCTCAACCTGAGAAAGATGACATCACAGAAATGGATACACTACAAAACAGAAAATCAAGAAAAGCCAAAACTGACTTCTGCTGCTTTATGTACAGAAATGGTATTTCCAACTTTGTTTCCCTCTCTGTAATACACATATGTTCCATATCTCTAAAATATTATCAGTTTCACATAAACTTTCAATATGAAAAAGAGAATTATAAACCTACCTGAGCTAAGAACCTATATACATAAACAGGCTTAGTTTGTCCAAAGCGATAAACTCTGAATATACTCTGGATGTCATAAGATGGATTCCAAGAAGCGTCGAATATAATTACTCGATTAGCAGCTACCAGATTAATTCCTAGAGATCCTGCTTTAGTAGAAATGATAAATAATCGTCCTCTGAAAATGAAAATATAGAATAAATGCTTCAGTAATTAGTACTTTACAAATATTTTAATTACAATATGACTTTTTGATACTTAGTTTTTTTTTAACTATCAAGAGTTCAGAGAATTCATTTCTTACTTACTGAAGAAAATAATATATTATCTAAGGAGTCAGGATGATAATACATATGCCCAGGAAGAATCCTATTGTTGGAAAATAAAATCGTCTGATTTAAGAATAAAGATGAAATGAAAAATCAAATATTTACAATGTAGTCAAGGTTTTATCTACAGATTTCTGAATAAATTTAGAGAATTTATATGTAACCTGAAAGTCTATATTGTATTGGGTACAGCTAGGGGCACTAAGTACATCAAAATGAAGGAAAATGCAAAAGTAGGTGAATATGTAGGGGTGACTCAACATTTATAATACAGCATAAAGAATGTAAGGAGAGGCGTTAGACAGATGCAAGGTACTGAGGTAGATAAAACAGAAGCAAGAAGACAGACACGGGGCTCCAGGAAGGGTGTCTAAAGAAAAAAAAAAAGAAACTGATAGATTACCTGATTTGTTGGAACACAAGCATTTATAAGGTTTCTTTCTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGACTCACTCTGTCACCCAGGCGGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGAACACCACCATGCCTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACCATGTTGGCC
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Task1_train_30424
Consider this mutation in ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
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Task1_train_30425
Gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
GTCATTCAATTCTGGAAATCCCAGGTCCTCTGCTTTGCTTCTTGTATTTGAAAATAACTTTCTAATCTCCATTTGGAGGACAAAAAATTATAATGATTAAGAGTAATGCTTTTGAGTTGGTCAGATATGATTTGAAGACCAGCTTTACAATATGGTGTGTAAACTTGGGTAAGTTACCTAGCCTCTCTGAACCTCAGTTTCCTCATCTTGAAAATGAAAACAGGACTATCTGCTTTTCAGCTGCTGGATTGAGGGAGATAATCTGAACAATGTCTTGTTTTTCTTAGTATTCTCTCACAGTATACCTCTCAAAGTCAGCAAATAATACACGTTTATAAAATTAACTGGTTTCCTGCAACCCGAAATTCACCATATGAATAAATTCGAAGTAATTTCCCCTTTTCTAATTGGAAAATTTGTCTGCTACTTCTTATAAAAGTTGAAGTGTAAAGTATATTAGAAAATATGCTAATTAGATATATTATATGTGGCATAAAATATGTGTTTCAGAATATACTATCTTTTTGTGGTGCTATATGGAGAACAGATCAAGCACCCTATCATTTATAATTTTCTAGACAAAATTCATTAAATATCATTTTATTATCCTTGAAAAATTCTGAAATATAGCCTTAATCAGATGACTAAATTTGATATCAGTAGTAAAATTTCCTTAGTCCACGTTGGTTTGTTAAGCCAATAATCTAAATATGTTTACCTTTGGCAGCATGGGAGTATCCCTCTTCTTCTTCTTTTCTGAATTAGGGTCATCTAATAAGTCTGGCTCAAAAGTATAAAGTTCAGTAAGCTCATTCATAGTAAAATGACGCTCCACCTGCTGCTGATCAACAACTCGAAAAGACAGTGACTGCTTAGTTACTTGCCGATCATAAATCTTATCTTCCATGGTTCCCTTTGTAAAAAGAAGGAAGAATATACAAAAAAATAAAATTTTGTAAGCATGAAACTTAATCAAGGATAAATACGGTTACTGGTTAATATGAAATGGTAAAACTTTATGGTAGTATATTGCCATAAAGAAAAACTCATCAGCAATTTTGCTTAATTCATGAAAGATTTCATCTGTTTAGCATAGTTTACCATAATAAATAAAATTACATTACTGATAATTATTCTATATTAACTGACCAAAATGCATTCAAGTGTTGCTTTATTTATTTCTGTACTCTGTAGGAGGAGGACAGCAGGCAGATACCAGAGTAAACAGAAATAAAGGGACAGACACAAAAAACATTTAGGTAAATATTGAAGTTAGAATGCAAGAGAGCAGTTTGATTCCTTTTCAATGTAATATAATAAGCTATCAACAAACACCATAAAATGCCTTTATATCGTTTTATTTTCTATAATTTCAAGACAGAAAACAAATATAAAATACCATATCCATTACATATAAACTACATTAATTAAATGTATACATTATATTAAATGTATATTAAATATAATACAAATTATAAATGAGAATGTACAGAAGTTTTAAACTTAACAGGAAAGAAAAAAATAAAAGAAAATTGAATAAATAAACAAATAACAGGAAAGAGTTTACATAAAGTTGTCAATCAACTTATGTACTAAAGAAGATCAAATAAGCAAGGATCTACCAAAAAAAACCCAGTTTCTGGTTAAGAAGCCCAGATTTGGAGGCAGGCTGAGAGGGGTTGCATCTGCTGGGGGTAGCATCTGCTAAATGTGTTCATGCAAAACAATCTCAACCTGAGAAAGATGACATCACAGAAATGGATACACTACAAAACAGAAAATCAAGAAAAGCCAAAACTGACTTCTGCTGCTTTATGTACAGAAATGGTATTTCCAACTTTGTTTCCCTCTCTGTAATACACATATGTTCCATATCTCTAAAATATTATCAGTTTCACATAAACTTTCAATATGAAAAAGAGAATTATAAACCTACCTGAGCTAAGAACCTATATACATAAACAGGCTTAGTTTGTCCAAAGCGATAAACTCTGAATATACTCTGGATGTCATAAGATGGATTCCAAGAAGCGTCGAATATAATTACTCGATTAGCAGCTACCAGATTAATTCCTAGAGATCCTGCTTTAGTAGAAATGATAAATAATCGTCCTCTGAAAATGAAAATATAGAATAAATGCTTCAGTAATTAGTACTTTACAAATATTTTAATTACAATATGACTTTTTGATACTTAGTTTTTTTTTAACTATCAAGAGTTCAGAGAATTCATTTCTTACTTACTGAAGAAAATAATATATTATCTAAGGAGTCAGGATGATAATACATATGCCCAGGAAGAATCCTATTGTTGGAAAATAAAATCGTCTGATTTAAGAATAAAGATGAAATGAAAAATCAAATATTTACAATGTAGTCAAGGTTTTATCTACAGATTTCTGAATAAATTTAGAGAATTTATATGTAACCTGAAAGTCTATATTGTATTGGGTACAGCTAGGGGCACTAAGTACATCAAAATGAAGGAAAATGCAAAAGTAGGTGAATATGTAGGGGTGACTCAACATTTATAATACAGCATAAAGAATGTAAGGAGAGGCGTTAGACAGATGCAAGGTACTGAGGTAGATAAAACAGAAGCAAGAAGACAGACACGGGGCTCCAGGAAGGGTGTCTAAAGAAAAAAAAAAAGAAACTGATAGATTACCTGATTTGTTGGAACACAAGCATTTATAAGGTTTCTTTCTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGACTCACTCTGTCACCCAGGCGGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGACTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGATTACAGGAACACCACCATGCCTGGTTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTAAGGTAATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACATGTGCTACCATGCCTGGCCAGGATTTACAATATTTCTACAGGATAATTTAGGAATGAATTGGTGATAGGTATATAGAAAACTAAGCAAATGGTAAAAACGAATGAATACTTCAGCAAAATATAATAAACAAGTACACGAAAAAGGAAAAACAATCACAGTATTCAAGTGGCTTACAAATATTTACGTAGCCACAATAAAGAAAATACTGCAAATTAATTTAGGCAAATATTATGAAAAATTATACTGGGAAAACGAATGAGGAAAAGTGTGCCTGTGCTTGTGGTAAATTACTACCTTACACTTTAGAAAGGATGTATGTAAGTAAGTAAGAATTGCCAAGAGTTGAAATTGGTTACCTCCAGAAAGTAGAAATCACAGGTAGAAAGAGGTTTGGTCACGGGACTGGTTTTTATTTGAAGCCTTGTAAAACTATCTGTTTTTTAAAAATATGTAAATATATTACTTTGATATTAATGAAAATTTAATTTGAAAAAGATTGGATAAACACTTTTTGAAAATAAAAACAACTCTAAGGAAAAGAATTACTCAGTTCCACTCCCCAGAAACAACCTCCATTCAAATCATGATATATTTCCTACAGTTTTCTTTTTTTCTAAATATATACTTTTTAAATTTTGCAGTCAGGATAGTAACTGTATATACAATATGTATTATGAACATTTCCCCAAATTTCTTGGTAAACATCATGCTTGGTAGCTGCATAGTATTTCATTGGATGATTGTACAGTAATTTATTTAATAATTTGCTTATTGCTGGTAACTTACAGAGTGACAAAAATCCCTGGAATATAATAAGCTCTCAATAATCAACACAAAATGTTTTTCTTTTCTTTCATGAAAGAAAATTAATGACTAAAATGCCATACTAATTACATTTATAGCATTCACTATACACTAGAATGCAAAGAAACTCTAAATTTAAATGATGGGAAAAAGTTTACAATTTAGTCTACCAATCATATTATATACTAAAGAAAAATCCTGGTATAAAATAAATAGAGATACTAAATTCATGTTTTATGTCAATTTGGAGCTACCACACATCTATGAATACAGACTATAGAAATTA
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Task1_train_30426
This variant lies on Chromosome X and affects the gene ATRX (ATRX chromatin remodeler). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked, 1
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This mutation is located in gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; ATRX-related disorder
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Task1_train_30428
Consider a variant on Chromosome X in gene ATRX (ATRX chromatin remodeler). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
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Task1_train_30429
Gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
GGCAGTACTTCCTAAAATTAACTATACATTCAACACAATCCCTATTAGCATCTAAGCTGACTTCTTTGTAGAAATTTATAGGAGATTCTAAGGTTGATGTTGAATTCCAAGAGATCTGGAATAGCCACACTTTCCAATTTCAACATCACTTTCAAAGCAATGGTAATGAAATAGTGCAGTATTAGCACAGCGACTGACATATAGATCAATGGAATAGAATTGAGGGTCAGGAAACAAACATGTGTCTCCATCATCAATTCCTTTTTAATAAGAGTGACAAAAACTATTCAATAAAGAAAGAATATTCTTTTCAACAAACAGTCCTGGGACAAATGGATAACCACAGCAAAAGACTGAAGTTGAGCCTTTACCTCATATCATGCATAAAAATTAACTCAAAATGGATCAAAGACCTAAGTGCAAGGACTAAAACTATAAAACTCTTTTAAGCAAACACAGGGGTTAAAGCTTCACGACTTTTTATTTCGAAATGGTTTCTCAGCTATGACAGTAAAAGCACAAGCAACAAAAGAAAAAATAAATTGGATGTCAACAAAATAAAATATTTTTGCGCATCAGAGGACACACTCAAGAAAGCAACAGATGGCCAGGTATGGTGGCTCACACCTTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAACGAGGGAGGACTGCTTCAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTCTGGGCAAATAGAGGGAGACCTCATCTCTACGAAAAATTAAAAATAAATAAATAAAAGAAAGTGATACAGATCACCGGAACTATTTTTTTTTTAATGAAAGCAAAAGATAACCCACAGAATGAGAGAAAATATTTGCAAATCATATATATGATAGGGGCCTAGTATGTAGAATATATTTTTTAAAACACATTTCAACAACAAAAAGATAAGCAATCCAATTCAAAAATGGGCAAAGGACCTGAATAAACATTTTTTCCAAAGAAGATAAAGAAATAGTCAACAAGTACATTAAAAGATGTTCAACATTATTAGTCATTAGAGAAATGAAAATTAAAATCATAAGATACCACTTCACAACCATTAGGATGGTTATAACAAAAACAAAAATGAAAAATAACAAGTGTTGACAAGAATGTGGAGAAACTGAAATGCTTGTACATTGCTGGTAGGACTGAAATAGTACAGGCAGTGTAGAAAACAGTTTGGTATTGCCGTTTGTTTAAATAAATGAAAACCTGTGTAACAAATGTACACAACAGCACTATTCACAACAGCTGAAAGGTGAGAACAACCCTAATATCTATCAAGACCACATATTACATGTTTCCATTTATGTGACTGGTCCAGAATATATGAATCTATTAGAAACATAAAGGAGATTAGTGGTTGCTTATGTGAGGGAGTTTTGGGCTGGATAGGGGAGTAATAGTTAAAGGGTACAGAGTTTTATTTGGTAGTGATTAAAATGTTCAAAAACTGACTCTAGTGATGTTTGTACATCTCTGTGAATATATTAAAACCATTGAGTTCTACACTTTAAATGGGTGAATTGTACAGGATGTGAATTATCTCTCAATAAAACTGCTTTAGAAACCAAAAAGTTTTAATTTATCCAACAATTTCAACAACAAAGACTGCTGTATTAGGAATTTTTCTTAAGTTGATATTAGCTGCTCTTGTCACCAAAAAAAACTATGTGAGATGATAGATATGTTCATCTGCTTCACTACAGTAGCCATTTTACTATCTATATGTATCCCATAACACCATGTTGTAAACCTCAAATATAAACAATACAATTTTATTTTGAAAAAGACTATACATATATATGGATAAGGACAAATAGACATTGCAAAAAAATTTTGATATGATAGAGTTGTGAGACTGGGTAGTTTTGTTTCTTTTGTTGCTAAAATGTTTGTATGGTATGTTTAAATCAGTATTTTTAAAATTACGACACAGAAATATTTGTAGCTCACCTTTATAAATAAGGGGTTTATCTTTATCTTCTGTCTTCTCCCTACTAGCTAATTCAAGAAAATCTTCAATCAAGTCCAGAGATATGAGGGACTGGCTGAAAACAAGGCTAAAAAAACAGATTAGTGTTTATGGATTAGAAGATTCCTAGTAAAGATATCACTTCTTCCTAAATCGATCTACAAATTTAACACAATTGTAACAAAAATCCCAGCAGGATTTTTTTGTAGAAATTACAAGGTGATTGTAAAATGTATATGAGAATGCCACCTCAGAGGAGGGAAGACAATTCTGAAAAAGAAAAACAAAGTTGGAGGGCTGACTCTTCATGATTTCATTACTTACAAAGTTACAGTAACCAAGACAGTGTAGTAAAGGGACAGGCACAGATCAATAGAACAGAATAGAGTCCAGATAGAGAGCCACATAGGATAATTAATTGTAGGGCCCAGGCATTTCAATGGTAAAAGGATAGTCTTTTAACCAATGGTCTTGGTAGCCGGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGACCGAGACGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAATAAGCTGGGCACTGTGGTGGGCGCCCGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGTGGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCTTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACACAATGGTCTTAGCGAAACTGAACATCCACATGACAAAAACAATGGTCTTAGCAAAACTGAACATCCACATGAAAAAAAGTGAACTTCAACCTAAACTGCATACCTTATGCAAAAAATAACTTAAAATGGAGCATAAATCTAACTGTAAAAACTGTAAGAACAGAATGTTTAGAAGAACACAGAAGAAAATCTTCATAACATGGGTTAGGTAAAAAATTATTTACACATGACACAAAGTATCATTGTTTTAAAAGTTGATAAATTAGACTTCATCAAAATTTAAAACTTCTGCTCTATAAAAGACACTGTTTTAGAGAATGTAAAAAGTTTCCCTATTACAAGTATTTCAGTAATTTAAAATTACATGCATTCTATAACACTTTGTCATTACATTTCAAGTATGTCTGCAAATTCCTCATTCTCTGCCCTAGTAATTTTCTAACTCCTTTTTAGCCATGAAAACTATTTGGTCACATCAAGTTTTGTGTAGAGTTCAAATAAAATAAATTATAAAAGCAAGCTGTTTTAGGCATTACGGGAGAAGGAGGAAAAATGTTACTGTTCCCTTACCCTCTCCTTTCGGTCACCAATTTGCAGGGGCTCTGAGAAATAGTTCTAAAATGACTATTCTGGTCTAACCCACTGGACAGAATTTATAACATACTTACACACTAGAAAAGAAATAAAATCTAGAAAGAGAATATAAGAGGTCTTCTATTGCCCTTTATATATGCAAACAAAGTAGATCAGTATATAAGAAACAATATACCTGTGGCAAGTATGCTTTAAGTTTTATTTTTATTCTAAAAGCTATACTATAGGAGAAGAAGGTACTTATGACTCCTGAAGATCCTTCAACATTCCCTGCTACATATCTTCAGATTTAGTAGAACTGAAAACAATTGAAGCTATGAAACGGCTGTTGGAGTTAACCACTTAAGTGTTTTTTATTGTATGACTTCCTGAGCTCCACACTGTTGGAGTCTACTATCTCCCAGTTAACTACTTCTAGAATGTTGGTAAGAAAATGAATTGACTCCTGGTGCTCAGCTCAAATGACCAAGGCCTATGCTTTGACCCCTCAGTAGTTTATCTTTCCCAAAATCAAAAACATAATTGAATCAATTCTTTCTGTGCTACAAATTAAGTTCTTGAAAGTTCCCGTAAGTGAAAAAATTAAAGTCTTAGAAATACTAATTATTAAATTGGAATTAATCTGCAATCTGGGTTACTATACTGGAAAGAGGTTGATTTTAGTCAGTTAGCAATTAAGGCTGGTTCTGGGAACCACTGAACTCAGAGAAGTCTTACAGTAGAAAAGGAAAAAAGTTGTTAGGATT
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Task1_train_30430
This variant impacts the gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
TGGTAAGAAAATGAATTGACTCCTGGTGCTCAGCTCAAATGACCAAGGCCTATGCTTTGACCCCTCAGTAGTTTATCTTTCCCAAAATCAAAAACATAATTGAATCAATTCTTTCTGTGCTACAAATTAAGTTCTTGAAAGTTCCCGTAAGTGAAAAAATTAAAGTCTTAGAAATACTAATTATTAAATTGGAATTAATCTGCAATCTGGGTTACTATACTGGAAAGAGGTTGATTTTAGTCAGTTAGCAATTAAGGCTGGTTCTGGGAACCACTGAACTCAGAGAAGTCTTACAGTAGAAAAGGAAAAAAGTTGTTAGGATTAAATGTCTATACTAATGGTTCTCTCTATTAACCTTTTCCAGTTGCAGACAACATGAAGAACTCTTTTGTTTCAGACCATATTTTGAGATTTTTTTAAACATAAAAGATTATTTTATTTTAGCCTTATTTAAAATTTTTATTAAAAGCATCTCAAGCTAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCTAGGCCAACGTGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAAAACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCAAGGCTGGAGAATCACTTGAACCCAGGAAGTGGAGGTGATTTTAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCTCAGATACTTTTAAAAATCGTTTATAATCAGATGTTGGGACCTAGCAGCCTAGACAGTAAGTCTTGTTCAAAACTTTAAAAATATGTTTTTGGAGGCCGGGCGTGGTGTCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCGTGCCTGGAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCGATGAGCCGAGATCGCACCATTGCACTCCCGCCTGGGCAACAACAGCAAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAATAATGTTTTTGGAAAAGTAATTTGAAGGGGGGTGAAGATGCAAAGAAAGGAATGGTGGCAAAAATGTTAGAAGTGGAACAAAAAACAAAGAATAAATGATAAAGAAAGAATAATCAGGCCAGGTGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGCACAAATTGCTTGAGCTCAAGAGTTCGAGATCAGCCTGGGCAACACGGTGAAACCCTATCTCTGCTAAAAATAAAAACACTAGCTGGGCATGGTGGTGTGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTGGAGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACCTGAGCCTGGGAGGTCAAGACTGCAGTAAGCTGTGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACCCTGTCTCATAATGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAATAATCAAGCAGGTAAAATAAAATAAAGCCTGAGAGATGTCCACTAGATTTGAGGATTAGAAGGTCACTAGTGACTTTACAGGGGGAAATCTCAGTAAAGCAACACGGTAGAAGTCACACTACATAAACCGAAAAATGATTTTGAAGATGGAGAAACACAAATTTCAACTAAGAGCTCTACCCAAGGAAATAAGTTCAAGTTGCAATAGGTAGAAGCAGAAATTTACACTGAAGAAATAACCTGAATATGCAATCAGAACTAGTGGCTTACAAAAAAGATAGTTGCTTGTATTGGCCTAGCACTACAATGACCAAATAAATCACATCTTTAGGAAGGAAGGAAAAGCAACAGATTTGTTCAAATACATTGTTTAAGCAATAAAAACATAATCAAAAGGTTAATTTATATAATAAATATGGTAAAGCACTTACACTTTATCCCCAATTTCCTCTGCCATTCGAAGAATTTCAAAGAGAAGTACCATTTTCCCAGAATGCTCTAAAACCTCAGCATCAGCATCTGTAACAAAATCTTTGTACCAGTCTGGAGCTGGGCTGCTTGGATTAGAAGAAGAAGTAGCTTTACCTAAATAAGACAAATGGAACATAAGTAGGTAAATTAGAAAAGAAATGGAAAGAGAGCAAGAGAGACAGAAAAAGACCTACCCATGGGGAGAGTAAGAAAGAAACTGATGGGGACTTGGGAGAGGGGAGGGAAAAAAGAGAAAGGCAGGCACACGCACATACAGCACAGAAGGACAGAGACTATCCCAGAAGAGTGAGCTCTAGATAGAAAAAGAGAAAGGAAGGAGATGCCAAATAAGAGAACAAGCAAGAGATTGACTCTGAGAGAGTGCAAGTGTAAGAGACAAACCCTCGGGGTAGGAGTGGAGCTCAGAAAGACAGAGACCCAAAGAGAAGAGAAACCATCCCCTTCCCACCAGGCCCTAAGAGAGTAAAATGCCCCCAAACATACTCCATGAGACAGGAATCAACAGAGATGGAAAGGCTCAGTTACCACGAGAGAAAAGACCTTGGGGGTAGAAAACATTTCACTGTGCTACTAGGATCTGGAAACCGCCAACAAGAATTGACCCCAGAATCAGCATATCATATTAAATGATTTCGTTCTTATATATTTTCCCCACAAACTTTGACTATGAAAGGTGGAAGGAGAAAGTAGCATAAAATAATTTATTAAAAGATTTAAACATAGTTTGATTCAAAATAAGAAATATGCAGGTTTAGCATGTTTATACACTTTCTCAATTGCTTTTTAATGCAAAGTATTTTAAAATATATTTTTGTTACAAAAATTTAAATGCTCAGAAAAGTATATAAGATATAAGAAACAAATGTGCTTCCACATTCCATCTTCATCAAATTTTAACACTGTTAAAACTTCGGATGAAGCTGAAGCCTAATATATGATCCTACATGATCCCATTCTCTTTCCTTCCTTCCTTTCCAATAGGTAACTAAACCCCTAAATTATATATTTACCATTTTTTGCAGTGTTTTATGTTTTTTACTGCATGTGTATCACTAAACTGTACAAATGGCTATACTGTTTGTAAAATCCTACAAATTACTTTTTCACTCAAAGCGAGATTTACTCATGCTTGACATGGAGCTCCCGTTCAATCATTCTAACTACCATGTAGTATTCCACTGCATGAATACACTATCATTTATTAGTTCTCCTCATAGACATCTAGATTGTTTCTTGTTTTTGGCTAATATGAAATAACTGCAACGAATGCTCATTGCTGAGTATATTTTTCTTAAATATTGTGTATTTTAAGTTTTAAATTTTCTGGCATAAAGTTATGATTAGGAATTTTAAAAATATCATTTTAGACATACTTATAGTCTTTATCAAATACTTCTATTATCAGAAGTTCTTGAGAATCTAATCATGCCATTTATTTTGTATGCTAACTTTCCTCAGGTTGACTACTAATACTTTCTGTTCCTAGCTTTTCCTAAGGTTATTTTCTCAGGTGTAGCTACAATCTGTGAAATTTCTGGGTAGCCTTGGTTAAGGTCATATATCTCCAGAGTGATTCTACATTTGCTTCTACCAGGTCTCCAGGGAATCACCAACTCAGAATTACTTGTGAAGTTAATATTTCAGTTTCGGATCTTTTAGACTATATGAGTAATATAAATTCAAACCATAAAGTATGTGAGGTGAAGGCCATGACCGTAAATTCAATGTAACTATTTTTCCCAACCAAGAGCCCTGGCTGAAATAGATAAGCTTCCTTGTCAACTCCCTGGATTGTCGATGGGATTGTAAACTTTAAAGGGATTCAGCTTTGAGAAGGGGTCACAGAACTCTCCAACTTATAGAGGGCTCGAAGTCTCAAATCCTGTCCCTGGATAAATGAAAATCAAAGCTGCTAGTCTCAAGACTAGCATCTCCCTAGGATTTCCATAGCATACCTTCTTCAATTTACCATTTAGGCTTATCAGTTCCCTCC
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Task1_train_30431
Here’s a variant in ATRX (ATRX chromatin remodeler) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
GCTCCTCTCTTAATTCATACTGGCCTCTCCTATAACCATTTCAAAAAAGTGAGATTTATAATACTGTACTACAGAATTAGGGTGAGCATAGGAACTTCATCATAGTAGCTATGTTCCTCTTAAGGAACTCCCTATCTTAAGGATGAAAAATCTAAACATTAACATAATAAGATATGAGGCTTTACACCTGGCAAATGAATCAACTATGTTTTAAACTCAGCGGAACTTCTTTTTTAAAAGTTGAATGCAGCAGAAATTTTTTAAGACAACGCAAGGAGATATAACTGTAAAACTATCTACTGAAAGAGCGGGAAAGAAAACACAAAATTATTAAACTTTAAGCTCAGAAAATATGTTGGGATTGTTATATAAAAAAGTAAGAATATTTTATTACTATGGAACATATTTGTACCTGAACACATCCAGCTAACATCTCATAGAGAATGTGAGCACGTTTTTTCATCACTCTGACATCTACCATGGTAGAATCTGCACACTGACCATTTTGAATTGGATTTATAAATCTATTCCTGAACTCCTTAATGGATCCAAGTAAATTTTCCTTGATAAAATTAACCATACAATGATCTAAGAGAGAAGACATTATTCATTAACAACATTAACAATCGTTAAAAAGACTTAGAAAAATTCCCCAATGAAATGCTCATGTCAAAAACACATGCATTAGAATTAAGCTATAAAGAAAGAATATCAAGCTAAGTATAGAATAAACATGGTTATAAGTCTGATCTACAAGTGAATTACCAAAACGAGAGAGAAAATTGAAGTAAAAACCATCCCTAAATACTAGACATGAACGTTTTTTAAAAATACCTAAGGACAGTTTATTCAAACTCACTATTATTCTTTATAAGAGATATGAAGTATAAAACAAGTGGTCCATTAATCTAACCATGATTTTATGGTCAGTGAGGCTATCTTGTGAAGAAAGGAGATACTAAGTCAAAACAATAAATAGGAGGTAATAAGCTACTAAGCAAGTTAATTTATATTAACTGATTCATTTCCAGAATAACCAAATAATATTTGAGAGATCAAATAATAACAACTGTTATTCAGTATTCAGTTGGGGCTACACAAATAGTAAAAAAAAAAAATTAATTACTAATGTATTTTGTAAGACTAACCCATTTTGTAAAAATTAACAGAGCCATCACTTGTCCCATACTATATAGGACCACAATATGAAACAGCATTTCTATAAATAGGGTAACAGAATAGAAAAGAGGAAAACTGGAACAGATAAAAACAAACATAAAGTATAGGCTAAAGTGAAATGACTAGTATTACAAATAATAAAATAGCAAAAAGTTACCATAAATACACTAAAGGAATGTAACACAGAGAAAAATAACAAAAAGCCATTACAGTGGGAAAAAGAAAAAAAGTGAGAGATTATAACAGGAAATTTCAATTAGTTACTTGCTGAATAATCTCATGTTCCCTTCTTTAGTGTCACCACAGACATACGAAAATGAGGGTAATTCACAAGTCATTTCCCTAGGTTCACATCAACTACCTTTAGCCTCAGCAAACTGTCCTGCCATGGATTCAGCAAACCTCTCCTTCTCCCATCTCCACTTTACTAAAATGTTCACAGTTCCCATTTCTTTCTGATTTCTTGACAGTACATGCCCCAAAACTGGAATATCCCCTTAAAATTATCTGGAGTAATCACATATGCTTATGTACTTTCTAAAGCAATCATTAAGACTTCTGATACTCTTGCAATAATTCACATTCCATATTTATATATGAACATTCACAATAGCGTATCTCTTAACTGTATTTTACCACTCATTTATAAAGCATCTCATTTGAAAAGTATGTTATTCTTTCACAGCAGACTAAGATGAACCTATGTAGATCATGGTCTAGGACTATACTAGAATAAGTAGAAGAAAGGTAAATGGTAACGTTACAAAAATATATCTGAGGAAATACCAATATTCTACTGCATAATCAGAGATATTAACTCACACTCAATTAGGTTATTTTGAAGTGGTGTTCCTGTTAAAATAATCCTCCTCCTTGATCGTATAGAATTCATAGCTTTAGAAACAGCAGATGCTTCATTTTTTAGAATATGGCCTTCATCACAAACAACAAAATCAGGGCCTACAAAAATAAACAGAAAAATAACACAATTAATATATAATAAAACTGAAAATGTGATCCATTTAAGTAAATAAAGTTAATCCCTTTAAAGTGCTGATCTTACAGGAAGATAAAATGACATCGTTGTAAGTATAAACATATTTTATCTGCTCCCGTATTTGGTTAATACAGCACTAACTATATTAATTATATCCAAATGGTAGAGCATTGAAATACCACTATAAATGGTAGTCAGGGTCCTCTGAGTTTACAAAAATAAGCAAAAATAAAAACAACAAGAGGGAAAAAGTTCCCCCAACAGACATAGCCTATTTTTAAAAATGTCTTTTAAAATTGAAAAGTCTTTAAAGCTATTTCAGCATTAGTATATCAACTTAAACTATCAGCAAAGACTAAGAGCAATGTATATATACATGAAAAGACAAATTTCAAAAGTTACACTTTAAGAATAATATATGTCACAACAGACCATATAATACTTCCCACTTAGTCCAAATAACTAACATTCATTGCTGGGGAAAAATTTTAACTGATAAAAGAAAGTGAAACTGGTTGTTACATGGGTATGGAGGGTAGGGAGAACAGCTTTTAAGCTATAAAAGATCTTAAAAGCTTAAACTCAGAAAATATTTGGGATTGCAATATAAAAAATAACAACATTTTATTACTATGGAATGCATTTGTACCTGAACAAATATGTTCCACAGCATCTGTGGACTCTTTTAGAAGAAATACTAAAGGCTTATTTGTTAAAATAACATACATATTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTATTTGAGATGGAGTCTCCCTCTGTCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACAATCTTGGGTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAGGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTATCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTTGCATTTTTAGTAAAGACGAGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACCGGCATAAGCCACCACGCCCAGCTGATATATATTTTTTCCAGGGCATAATACATACTCTATTTGCTTGCTGGTTAACATATACACACATATTACTTAATTGCTGATTTCAACAAAGCAGCTGTCAAACTATCTCCCATCTGGTAAGCATTAGAGAAAATGCAACTTTTACATGACTTCAAAAGTAACAGCTTCAGTATGACAGATCAAATAATAACAACTGTTATTCAGTATTCAGTTGGGGCTACACAAATAGTAAAAAAAAACAACAACAACAACAACAAAAAAAAACTAATATTTTGTAAAACTAAAATCTCTAGCTTTGTATTTAAAAATTATGCATCCCTTACTTTGAATCTGAAAACATTTTCTACAGAGAAAAAAATGCCTTTTACAGCAGTGATTTAAATGGTTTTACCACTTAATATTCGGTATCCATGAGGATGCGTTGAAATGGGTACTCTCATACACTCTGTGGGAGTCTAAATTAGTATCAAAAATTTTGGAAGTCAATTTTACAATAATTATCAAAATGCAAAATGTGTAAACCCTTTGACCCATATTTCAATTTCTAGGAATTGGTCCCAAAGATACTCTTCCACAGGCACCCAAAGATACATAAAAGAATGTTCTCTGCAGCACGGTTTGTTACGGAGGAAAATTGAAAACAACCTAAAAATTTGTCAGAGGGGATCTGGTAAATGGGGCTTAAACCATGGGATAATGGAATAAGTCACAGAGTTAAAATTAATGAGGTAGACACACCCCCACTGGAGAAGCTGAAGGTCTGTTTGCTGGAGAAATTCCTGACTTTAGCTGGAGTTGAGTCAAGTTAGAAAGCCAAGCCGAGCGAAATACAGGGGTAGAGGAAGTAGCAGAAAGGCACTGGGAGCTTGCTGGATCCC
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Task1_train_30432
This variant impacts the gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked
TAAAAAAAGCTCCCAATGGTCAAAGTGAAACAATTTGAGCAAAAAAAAAAAAAAAATGCAGTAATGGTTTATAGTCCAATGCACGAACTAAAAATAGATGAGTATATAATTATATAAATCAAAGGCTAAATAAATGGGTAAGAAAAGATAATTTTTTCTTTAAAAAAATCCAAATTTTATGTGTAGATATTACCCACTATAGGAGATACAGCTTAATTTCCACCATCCTCCCATTCAGGTGGGCTAGATTGAGTGACTGGATTCCAATGAACAGATGAGGGACAGGTAAAAGTAGCAGCTCTACAGGAGAGAAACCTGACAAACTCTACCCTAGCCAAGTGATGAAAGTTAACATCATCAGTAACAGCAAGTGCTTATCATGTACCCCCGATATGAGATATGATGTGACAAAAAGGGTATGTCACCTCTGGTATATTCTTTCAAAACCTCAGTCTAATCTCAGTCTAATCACAAGAAAAACTATAAATTCAGATCAGAGAACACTCTACAGGATATCTACCTGGACGGTCCTCCTTAAGACTGATGAGATAATGAAAAAATAAAGATTGAGAAACCGTCATAGACCAGAAGACTGTTAGAGACATGACAGCTAAATACAATGTAGAACCCTGGATAGAAAAACTGGTGCAATACAAATGCAGTTTGAAGTTATTAATAATAATGTGTCAATTTCTTAGTTTTGACAAATCTACCATGGCAATGTAAGATGTTAACAATTGAGGAACCAGATGTAGGGTATATGGGAACTCTCTGCACTACCTTTTCAACTTTCATGTAAACAGAAAATTATTCCAAAATGAAAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGATGGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGGAACCTCCAGCTCCCAGGTTTGAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGAGTGCACCACCATGCCCGGCCAAAAATTTTTTTTAAATGTCACTAAATGATAAAATATGGCAATGACAAATGTTACCCTTCATGTTAGAAGCTTTAATTTTTTTTTTCTTCATTTTTTTCATGAACAAATAAGTACACTAAGCACCTGAAACTGTTGTATTAAACAGTTTCAAGGAAATCTTGTGGAAAAAATCTGCTACAATGATACTAGACACTAGCTTATAATTTTTCAACAATAAACCAGCCACAAGATTTATAAACACCTATTTAATCGTGGGAAAGAGATAAACTTATTATTAGGCCTTAGATTTGTGATGGCAGTTATTTTGCTATGTATTAACTACCTCATTATCTTTAAAAAAGAGGCAAAGCCAAGGATTCTAAAGATTACTATCACTTTGACAATGACAATTACCCAGACTTTCTCAACAAAAATAAAACCTCAATAGTGTCTTAAATATGATATGACAAGATAAACATATGAAGAAAAAGTTGCACAAATTAATAATCGTAGATTAAAAAATAATTTTAGTTTTGCAGACAGTACAACGTGTTGCTTTTCCAAGTGGCAAATATATCAACATCTGGCTCTCACATCAGATTACTATCACATAAGGATCAACAGTATTGAAAATATTAACCTTTCATACTGATGGCCCCTTAAAAGGAGATAAGCAAGCAGCAATTCTTCTAATGACATGAAGTTTGGAAAGACACAAACTGTTTTCAGGATATGGAGAGAGCTCTTGTTATCACCTAATATTTGGATAGCTGGAAGAATCTTTGATTGCAACACAGGCATTTGATGCATTTTTAAGTGTTTACAAGGTATCCCCTAAAACCCTAAACACTTTCAGACTCAGCAAATAAATTCTGAACAGCTGGCGACATTAAGGGTGATTTTATTCTATTGAAATACTAAGAATTTTCTAAAAGGCAAAAACCTGAAGGATAACCACAACAAAGACCAGATACTTAGTAGCTGTGCAATTACTATTTGTTAAAATATAAACACATTTTTTATTCAACTTGCTTCTTTATGTCACTGTCTATTAATACCTTACCTGGATCAACCAAAGCTTTGTTAAATATTTCTTTAAGTTTCCGACTCTTCACATTCCTTCCTTGAGCAAGATTTCTATACATCTCATAGCCTATGATCATAACACCACCATCTTCTTGCCACCTCTGCAGCATGTAGCTTCTCTCCTGAGGACGTTTCACAGTTGCTAATTCAGAAACCTTTTGTGGGGAAATAAAGATTTTTTTAAGTAGCTACTAAAAACATGTGAATATTAAATATTCCCACTGAAATATGCATCACTGGTTAAAAAACATTAAAAATTAAAAAAAATTAAAAATAGTTTACTATATGAATTTCATGTGACTATTTTAATAATAGAAAACATTTAAAATAAGTTACCTCAAGCTTCTCATCATCTTTTAATCCCTCTTGCCACTTCTCAAATTCATTCATCCAATTCAAAGCAGTATTAAGAGGACAAACCACTAACGCCGTGCTGAAATCCAGTTTGTCACACAAAAGAACTGTATGAAGAAAACTTACCACCTATAAGAAAACAGATTGTCACCTTCGTTTAAATATCCACAAAAAAATTTAATAAATTAAGCAATCTTACAATATTATAGCTTTGTTTTGCTTAAACAATAAACGGCCAGAATTTCCAAACCAGGCAAGGCACAGGGAAAGAGATAGTAAAATGCCAAAGTTCAACTAGATGATGTATCAGGCTCTTCCAACTCTAAAGCTCCATGATTCTATGATCAATGTGAATAGTATAAAATGATCCCATACCAATACTAAGTCCTAGGTCTCCACAGAATGTCCCTATAGTCTTTCAAAAAATACCATCGCTCATTTAGAAGAGAATCATGTTACATAATATTTTTCCACTTTAATGTGTTCTGACCCATTAAATCTATAATTACTTTATGGTTTAAAAGTACAAATACATTCACCAATTTTACATCTCTGCTACAACTCCTGCCATTTAGAAATGCAGCAATTTTAATAGTAAAAGATACTTTACTTTGTCATTACTTTAACATCATAAACCGTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTCTACCTTAGAATCTTTGCAGTTGTTGTTGGCCATACCTGAAACCCCACAGCCTCGCTTCATTAGGACCTCTGCTCAAACATTACCTCCTAAAAGATGCCTTTCCTAACTCAATATCCTCCCTTAACATTCATTTTCTGAAAGTACATATTTCTTATTTGATTAGCAGCTCTCTCCTCCACTAGAATATAAGCTCCTTGGAGACAGATCTTGTTATTCTTGTTCACTGCTTTATCTTCAGCCCCTACGACTGTGCCTGAAACATAATAGAATCCAATATATATTAATGAATCCACAAAAACAGGATACCTTCATATTCTTCAGCTCTTACCTGTAAAGTCTTACCAAGGCCCATACAGTGGGCAAGAATGCATCCTGAACCTGGAGATTTCTTTGTTTTTTTCACAGACTCACAGCAGCAATCCCACATAAACTGAACACCTAAAAATAACAGCTTCATTAAGTTAAATTTAAAGGTCCAAGTTAAAAACTTCCTTTACATAAACACATCAAAAACATAACCAAAACTTCTAAGAAACAGCATTAAAAAAACACTTAGCTAAATAATTTCTTACATCTAAATGGGATTTTTTCCCACCAAACTAAAGCAGAAACAAGTTAACACAAACATAGAACAGGGGGACTTTCCTTCATCTTCTCTAAGCTATCCACAGTAGATGTTCTGTATTCCCTGAGATGGTTCAAAGAAACATAAGAATACTCTAAAAGAGAAACGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGTTGGGAGAATCACTTGAGGCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGTTATAGCACCACTGTACTCCAGC
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Task1_train_30433
The gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) is located on Chromosome X, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
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Task1_train_30434
Gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
AACAGCAAGTGCTTATCATGTACCCCCGATATGAGATATGATGTGACAAAAAGGGTATGTCACCTCTGGTATATTCTTTCAAAACCTCAGTCTAATCTCAGTCTAATCACAAGAAAAACTATAAATTCAGATCAGAGAACACTCTACAGGATATCTACCTGGACGGTCCTCCTTAAGACTGATGAGATAATGAAAAAATAAAGATTGAGAAACCGTCATAGACCAGAAGACTGTTAGAGACATGACAGCTAAATACAATGTAGAACCCTGGATAGAAAAACTGGTGCAATACAAATGCAGTTTGAAGTTATTAATAATAATGTGTCAATTTCTTAGTTTTGACAAATCTACCATGGCAATGTAAGATGTTAACAATTGAGGAACCAGATGTAGGGTATATGGGAACTCTCTGCACTACCTTTTCAACTTTCATGTAAACAGAAAATTATTCCAAAATGAAAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGATGGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGGAACCTCCAGCTCCCAGGTTTGAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGAGTGCACCACCATGCCCGGCCAAAAATTTTTTTTAAATGTCACTAAATGATAAAATATGGCAATGACAAATGTTACCCTTCATGTTAGAAGCTTTAATTTTTTTTTTCTTCATTTTTTTCATGAACAAATAAGTACACTAAGCACCTGAAACTGTTGTATTAAACAGTTTCAAGGAAATCTTGTGGAAAAAATCTGCTACAATGATACTAGACACTAGCTTATAATTTTTCAACAATAAACCAGCCACAAGATTTATAAACACCTATTTAATCGTGGGAAAGAGATAAACTTATTATTAGGCCTTAGATTTGTGATGGCAGTTATTTTGCTATGTATTAACTACCTCATTATCTTTAAAAAAGAGGCAAAGCCAAGGATTCTAAAGATTACTATCACTTTGACAATGACAATTACCCAGACTTTCTCAACAAAAATAAAACCTCAATAGTGTCTTAAATATGATATGACAAGATAAACATATGAAGAAAAAGTTGCACAAATTAATAATCGTAGATTAAAAAATAATTTTAGTTTTGCAGACAGTACAACGTGTTGCTTTTCCAAGTGGCAAATATATCAACATCTGGCTCTCACATCAGATTACTATCACATAAGGATCAACAGTATTGAAAATATTAACCTTTCATACTGATGGCCCCTTAAAAGGAGATAAGCAAGCAGCAATTCTTCTAATGACATGAAGTTTGGAAAGACACAAACTGTTTTCAGGATATGGAGAGAGCTCTTGTTATCACCTAATATTTGGATAGCTGGAAGAATCTTTGATTGCAACACAGGCATTTGATGCATTTTTAAGTGTTTACAAGGTATCCCCTAAAACCCTAAACACTTTCAGACTCAGCAAATAAATTCTGAACAGCTGGCGACATTAAGGGTGATTTTATTCTATTGAAATACTAAGAATTTTCTAAAAGGCAAAAACCTGAAGGATAACCACAACAAAGACCAGATACTTAGTAGCTGTGCAATTACTATTTGTTAAAATATAAACACATTTTTTATTCAACTTGCTTCTTTATGTCACTGTCTATTAATACCTTACCTGGATCAACCAAAGCTTTGTTAAATATTTCTTTAAGTTTCCGACTCTTCACATTCCTTCCTTGAGCAAGATTTCTATACATCTCATAGCCTATGATCATAACACCACCATCTTCTTGCCACCTCTGCAGCATGTAGCTTCTCTCCTGAGGACGTTTCACAGTTGCTAATTCAGAAACCTTTTGTGGGGAAATAAAGATTTTTTTAAGTAGCTACTAAAAACATGTGAATATTAAATATTCCCACTGAAATATGCATCACTGGTTAAAAAACATTAAAAATTAAAAAAAATTAAAAATAGTTTACTATATGAATTTCATGTGACTATTTTAATAATAGAAAACATTTAAAATAAGTTACCTCAAGCTTCTCATCATCTTTTAATCCCTCTTGCCACTTCTCAAATTCATTCATCCAATTCAAAGCAGTATTAAGAGGACAAACCACTAACGCCGTGCTGAAATCCAGTTTGTCACACAAAAGAACTGTATGAAGAAAACTTACCACCTATAAGAAAACAGATTGTCACCTTCGTTTAAATATCCACAAAAAAATTTAATAAATTAAGCAATCTTACAATATTATAGCTTTGTTTTGCTTAAACAATAAACGGCCAGAATTTCCAAACCAGGCAAGGCACAGGGAAAGAGATAGTAAAATGCCAAAGTTCAACTAGATGATGTATCAGGCTCTTCCAACTCTAAAGCTCCATGATTCTATGATCAATGTGAATAGTATAAAATGATCCCATACCAATACTAAGTCCTAGGTCTCCACAGAATGTCCCTATAGTCTTTCAAAAAATACCATCGCTCATTTAGAAGAGAATCATGTTACATAATATTTTTCCACTTTAATGTGTTCTGACCCATTAAATCTATAATTACTTTATGGTTTAAAAGTACAAATACATTCACCAATTTTACATCTCTGCTACAACTCCTGCCATTTAGAAATGCAGCAATTTTAATAGTAAAAGATACTTTACTTTGTCATTACTTTAACATCATAAACCGTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTCTACCTTAGAATCTTTGCAGTTGTTGTTGGCCATACCTGAAACCCCACAGCCTCGCTTCATTAGGACCTCTGCTCAAACATTACCTCCTAAAAGATGCCTTTCCTAACTCAATATCCTCCCTTAACATTCATTTTCTGAAAGTACATATTTCTTATTTGATTAGCAGCTCTCTCCTCCACTAGAATATAAGCTCCTTGGAGACAGATCTTGTTATTCTTGTTCACTGCTTTATCTTCAGCCCCTACGACTGTGCCTGAAACATAATAGAATCCAATATATATTAATGAATCCACAAAAACAGGATACCTTCATATTCTTCAGCTCTTACCTGTAAAGTCTTACCAAGGCCCATACAGTGGGCAAGAATGCATCCTGAACCTGGAGATTTCTTTGTTTTTTTCACAGACTCACAGCAGCAATCCCACATAAACTGAACACCTAAAAATAACAGCTTCATTAAGTTAAATTTAAAGGTCCAAGTTAAAAACTTCCTTTACATAAACACATCAAAAACATAACCAAAACTTCTAAGAAACAGCATTAAAAAAACACTTAGCTAAATAATTTCTTACATCTAAATGGGATTTTTTCCCACCAAACTAAAGCAGAAACAAGTTAACACAAACATAGAACAGGGGGACTTTCCTTCATCTTCTCTAAGCTATCCACAGTAGATGTTCTGTATTCCCTGAGATGGTTCAAAGAAACATAAGAATACTCTAAAAGAGAAACGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGTTGGGAGAATCACTTGAGGCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGTTATAGCACCACTGTACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAATAATAATAATAATTTTTGTAAAAAGAGAGCAACTTTATCCAAAAAGAGAATGGCTTCCTATCAAAAATACCTTTGAGTTTATTGAGTCAATCAGGAAAAAAAAACCCATGAGATAATTTCATCATCTTTTCCTTTATTCGATAGTAAACACTGAGCAAGAAAGGGGACTAGCAACTCAAAAGGTAGGAACTACAGAACCTCCCTTATGATTAATTCACATAAACACTCAAAACTGACTTACTGATTCAACTCTAATAAAGAAAACATACCTAAAAATGCTGAAATAGCATTTTCTGAAAAAGGCTTTTAGCTAGCTACAGCTCTTCCCA
AACAGCAAGTGCTTATCATGTACCCCCGATATGAGATATGATGTGACAAAAAGGGTATGTCACCTCTGGTATATTCTTTCAAAACCTCAGTCTAATCTCAGTCTAATCACAAGAAAAACTATAAATTCAGATCAGAGAACACTCTACAGGATATCTACCTGGACGGTCCTCCTTAAGACTGATGAGATAATGAAAAAATAAAGATTGAGAAACCGTCATAGACCAGAAGACTGTTAGAGACATGACAGCTAAATACAATGTAGAACCCTGGATAGAAAAACTGGTGCAATACAAATGCAGTTTGAAGTTATTAATAATAATGTGTCAATTTCTTAGTTTTGACAAATCTACCATGGCAATGTAAGATGTTAACAATTGAGGAACCAGATGTAGGGTATATGGGAACTCTCTGCACTACCTTTTCAACTTTCATGTAAACAGAAAATTATTCCAAAATGAAAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGATGGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGGAACCTCCAGCTCCCAGGTTTGAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGAGTGCACCACCATGCCCGGCCAAAAATTTTTTTTAAATGTCACTAAATGATAAAATATGGCAATGACAAATGTTACCCTTCATGTTAGAAGCTTTAATTTTTTTTTTCTTCATTTTTTTCATGAACAAATAAGTACACTAAGCACCTGAAACTGTTGTATTAAACAGTTTCAAGGAAATCTTGTGGAAAAAATCTGCTACAATGATACTAGACACTAGCTTATAATTTTTCAACAATAAACCAGCCACAAGATTTATAAACACCTATTTAATCGTGGGAAAGAGATAAACTTATTATTAGGCCTTAGATTTGTGATGGCAGTTATTTTGCTATGTATTAACTACCTCATTATCTTTAAAAAAGAGGCAAAGCCAAGGATTCTAAAGATTACTATCACTTTGACAATGACAATTACCCAGACTTTCTCAACAAAAATAAAACCTCAATAGTGTCTTAAATATGATATGACAAGATAAACATATGAAGAAAAAGTTGCACAAATTAATAATCGTAGATTAAAAAATAATTTTAGTTTTGCAGACAGTACAACGTGTTGCTTTTCCAAGTGGCAAATATATCAACATCTGGCTCTCACATCAGATTACTATCACATAAGGATCAACAGTATTGAAAATATTAACCTTTCATACTGATGGCCCCTTAAAAGGAGATAAGCAAGCAGCAATTCTTCTAATGACATGAAGTTTGGAAAGACACAAACTGTTTTCAGGATATGGAGAGAGCTCTTGTTATCACCTAATATTTGGATAGCTGGAAGAATCTTTGATTGCAACACAGGCATTTGATGCATTTTTAAGTGTTTACAAGGTATCCCCTAAAACCCTAAACACTTTCAGACTCAGCAAATAAATTCTGAACAGCTGGCGACATTAAGGGTGATTTTATTCTATTGAAATACTAAGAATTTTCTAAAAGGCAAAAACCTGAAGGATAACCACAACAAAGACCAGATACTTAGTAGCTGTGCAATTACTATTTGTTAAAATATAAACACATTTTTTATTCAACTTGCTTCTTTATGTCACTGTCTATTAATACCTTACCTGGATCAACCAAAGCTTTGTTAAATATTTCTTTAAGTTTCCGACTCTTCACATTCCTTCCTTGAGCAAGATTTCTATACATCTCATAGCCTATGATCATAACACCACCATCTTCTTGCCACCTCTGCAGCATGTAGCTTCTCTCCTGAGGACGTTTCACAGTTGCTAATTCAGAAACCTTTTGTGGGGAAATAAAGATTTTTTTAAGTAGCTACTAAAAACATGTGAATATTAAATATTCCCACTGAAATATGCATCACTGGTTAAAAAACATTAAAAATTAAAAAAAATTAAAAATAGTTTACTATATGAATTTCATGTGACTATTTTAATAATAGAAAACATTTAAAATAAGTTACCTCAAGATTCTCATCATCTTTTAATCCCTCTTGCCACTTCTCAAATTCATTCATCCAATTCAAAGCAGTATTAAGAGGACAAACCACTAACGCCGTGCTGAAATCCAGTTTGTCACACAAAAGAACTGTATGAAGAAAACTTACCACCTATAAGAAAACAGATTGTCACCTTCGTTTAAATATCCACAAAAAAATTTAATAAATTAAGCAATCTTACAATATTATAGCTTTGTTTTGCTTAAACAATAAACGGCCAGAATTTCCAAACCAGGCAAGGCACAGGGAAAGAGATAGTAAAATGCCAAAGTTCAACTAGATGATGTATCAGGCTCTTCCAACTCTAAAGCTCCATGATTCTATGATCAATGTGAATAGTATAAAATGATCCCATACCAATACTAAGTCCTAGGTCTCCACAGAATGTCCCTATAGTCTTTCAAAAAATACCATCGCTCATTTAGAAGAGAATCATGTTACATAATATTTTTCCACTTTAATGTGTTCTGACCCATTAAATCTATAATTACTTTATGGTTTAAAAGTACAAATACATTCACCAATTTTACATCTCTGCTACAACTCCTGCCATTTAGAAATGCAGCAATTTTAATAGTAAAAGATACTTTACTTTGTCATTACTTTAACATCATAAACCGTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTCTACCTTAGAATCTTTGCAGTTGTTGTTGGCCATACCTGAAACCCCACAGCCTCGCTTCATTAGGACCTCTGCTCAAACATTACCTCCTAAAAGATGCCTTTCCTAACTCAATATCCTCCCTTAACATTCATTTTCTGAAAGTACATATTTCTTATTTGATTAGCAGCTCTCTCCTCCACTAGAATATAAGCTCCTTGGAGACAGATCTTGTTATTCTTGTTCACTGCTTTATCTTCAGCCCCTACGACTGTGCCTGAAACATAATAGAATCCAATATATATTAATGAATCCACAAAAACAGGATACCTTCATATTCTTCAGCTCTTACCTGTAAAGTCTTACCAAGGCCCATACAGTGGGCAAGAATGCATCCTGAACCTGGAGATTTCTTTGTTTTTTTCACAGACTCACAGCAGCAATCCCACATAAACTGAACACCTAAAAATAACAGCTTCATTAAGTTAAATTTAAAGGTCCAAGTTAAAAACTTCCTTTACATAAACACATCAAAAACATAACCAAAACTTCTAAGAAACAGCATTAAAAAAACACTTAGCTAAATAATTTCTTACATCTAAATGGGATTTTTTCCCACCAAACTAAAGCAGAAACAAGTTAACACAAACATAGAACAGGGGGACTTTCCTTCATCTTCTCTAAGCTATCCACAGTAGATGTTCTGTATTCCCTGAGATGGTTCAAAGAAACATAAGAATACTCTAAAAGAGAAACGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGTTGGGAGAATCACTTGAGGCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGTTATAGCACCACTGTACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAATAATAATAATAATTTTTGTAAAAAGAGAGCAACTTTATCCAAAAAGAGAATGGCTTCCTATCAAAAATACCTTTGAGTTTATTGAGTCAATCAGGAAAAAAAAACCCATGAGATAATTTCATCATCTTTTCCTTTATTCGATAGTAAACACTGAGCAAGAAAGGGGACTAGCAACTCAAAAGGTAGGAACTACAGAACCTCCCTTATGATTAATTCACATAAACACTCAAAACTGACTTACTGATTCAACTCTAATAAAGAAAACATACCTAAAAATGCTGAAATAGCATTTTCTGAAAAAGGCTTTTAGCTAGCTACAGCTCTTCCCA
Task1_train_30435
Here is a genetic alteration in ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
CTCAGTCTAATCTCAGTCTAATCACAAGAAAAACTATAAATTCAGATCAGAGAACACTCTACAGGATATCTACCTGGACGGTCCTCCTTAAGACTGATGAGATAATGAAAAAATAAAGATTGAGAAACCGTCATAGACCAGAAGACTGTTAGAGACATGACAGCTAAATACAATGTAGAACCCTGGATAGAAAAACTGGTGCAATACAAATGCAGTTTGAAGTTATTAATAATAATGTGTCAATTTCTTAGTTTTGACAAATCTACCATGGCAATGTAAGATGTTAACAATTGAGGAACCAGATGTAGGGTATATGGGAACTCTCTGCACTACCTTTTCAACTTTCATGTAAACAGAAAATTATTCCAAAATGAAAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGATGGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGGAACCTCCAGCTCCCAGGTTTGAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGAGTGCACCACCATGCCCGGCCAAAAATTTTTTTTAAATGTCACTAAATGATAAAATATGGCAATGACAAATGTTACCCTTCATGTTAGAAGCTTTAATTTTTTTTTTCTTCATTTTTTTCATGAACAAATAAGTACACTAAGCACCTGAAACTGTTGTATTAAACAGTTTCAAGGAAATCTTGTGGAAAAAATCTGCTACAATGATACTAGACACTAGCTTATAATTTTTCAACAATAAACCAGCCACAAGATTTATAAACACCTATTTAATCGTGGGAAAGAGATAAACTTATTATTAGGCCTTAGATTTGTGATGGCAGTTATTTTGCTATGTATTAACTACCTCATTATCTTTAAAAAAGAGGCAAAGCCAAGGATTCTAAAGATTACTATCACTTTGACAATGACAATTACCCAGACTTTCTCAACAAAAATAAAACCTCAATAGTGTCTTAAATATGATATGACAAGATAAACATATGAAGAAAAAGTTGCACAAATTAATAATCGTAGATTAAAAAATAATTTTAGTTTTGCAGACAGTACAACGTGTTGCTTTTCCAAGTGGCAAATATATCAACATCTGGCTCTCACATCAGATTACTATCACATAAGGATCAACAGTATTGAAAATATTAACCTTTCATACTGATGGCCCCTTAAAAGGAGATAAGCAAGCAGCAATTCTTCTAATGACATGAAGTTTGGAAAGACACAAACTGTTTTCAGGATATGGAGAGAGCTCTTGTTATCACCTAATATTTGGATAGCTGGAAGAATCTTTGATTGCAACACAGGCATTTGATGCATTTTTAAGTGTTTACAAGGTATCCCCTAAAACCCTAAACACTTTCAGACTCAGCAAATAAATTCTGAACAGCTGGCGACATTAAGGGTGATTTTATTCTATTGAAATACTAAGAATTTTCTAAAAGGCAAAAACCTGAAGGATAACCACAACAAAGACCAGATACTTAGTAGCTGTGCAATTACTATTTGTTAAAATATAAACACATTTTTTATTCAACTTGCTTCTTTATGTCACTGTCTATTAATACCTTACCTGGATCAACCAAAGCTTTGTTAAATATTTCTTTAAGTTTCCGACTCTTCACATTCCTTCCTTGAGCAAGATTTCTATACATCTCATAGCCTATGATCATAACACCACCATCTTCTTGCCACCTCTGCAGCATGTAGCTTCTCTCCTGAGGACGTTTCACAGTTGCTAATTCAGAAACCTTTTGTGGGGAAATAAAGATTTTTTTAAGTAGCTACTAAAAACATGTGAATATTAAATATTCCCACTGAAATATGCATCACTGGTTAAAAAACATTAAAAATTAAAAAAAATTAAAAATAGTTTACTATATGAATTTCATGTGACTATTTTAATAATAGAAAACATTTAAAATAAGTTACCTCAAGCTTCTCATCATCTTTTAATCCCTCTTGCCACTTCTCAAATTCATTCATCCAATTCAAAGCAGTATTAAGAGGACAAACCACTAACGCCGTGCTGAAATCCAGTTTGTCACACAAAAGAACTGTATGAAGAAAACTTACCACCTATAAGAAAACAGATTGTCACCTTCGTTTAAATATCCACAAAAAAATTTAATAAATTAAGCAATCTTACAATATTATAGCTTTGTTTTGCTTAAACAATAAACGGCCAGAATTTCCAAACCAGGCAAGGCACAGGGAAAGAGATAGTAAAATGCCAAAGTTCAACTAGATGATGTATCAGGCTCTTCCAACTCTAAAGCTCCATGATTCTATGATCAATGTGAATAGTATAAAATGATCCCATACCAATACTAAGTCCTAGGTCTCCACAGAATGTCCCTATAGTCTTTCAAAAAATACCATCGCTCATTTAGAAGAGAATCATGTTACATAATATTTTTCCACTTTAATGTGTTCTGACCCATTAAATCTATAATTACTTTATGGTTTAAAAGTACAAATACATTCACCAATTTTACATCTCTGCTACAACTCCTGCCATTTAGAAATGCAGCAATTTTAATAGTAAAAGATACTTTACTTTGTCATTACTTTAACATCATAAACCGTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTCTACCTTAGAATCTTTGCAGTTGTTGTTGGCCATACCTGAAACCCCACAGCCTCGCTTCATTAGGACCTCTGCTCAAACATTACCTCCTAAAAGATGCCTTTCCTAACTCAATATCCTCCCTTAACATTCATTTTCTGAAAGTACATATTTCTTATTTGATTAGCAGCTCTCTCCTCCACTAGAATATAAGCTCCTTGGAGACAGATCTTGTTATTCTTGTTCACTGCTTTATCTTCAGCCCCTACGACTGTGCCTGAAACATAATAGAATCCAATATATATTAATGAATCCACAAAAACAGGATACCTTCATATTCTTCAGCTCTTACCTGTAAAGTCTTACCAAGGCCCATACAGTGGGCAAGAATGCATCCTGAACCTGGAGATTTCTTTGTTTTTTTCACAGACTCACAGCAGCAATCCCACATAAACTGAACACCTAAAAATAACAGCTTCATTAAGTTAAATTTAAAGGTCCAAGTTAAAAACTTCCTTTACATAAACACATCAAAAACATAACCAAAACTTCTAAGAAACAGCATTAAAAAAACACTTAGCTAAATAATTTCTTACATCTAAATGGGATTTTTTCCCACCAAACTAAAGCAGAAACAAGTTAACACAAACATAGAACAGGGGGACTTTCCTTCATCTTCTCTAAGCTATCCACAGTAGATGTTCTGTATTCCCTGAGATGGTTCAAAGAAACATAAGAATACTCTAAAAGAGAAACGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGTTGGGAGAATCACTTGAGGCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGTTATAGCACCACTGTACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAATAATAATAATAATTTTTGTAAAAAGAGAGCAACTTTATCCAAAAAGAGAATGGCTTCCTATCAAAAATACCTTTGAGTTTATTGAGTCAATCAGGAAAAAAAAACCCATGAGATAATTTCATCATCTTTTCCTTTATTCGATAGTAAACACTGAGCAAGAAAGGGGACTAGCAACTCAAAAGGTAGGAACTACAGAACCTCCCTTATGATTAATTCACATAAACACTCAAAACTGACTTACTGATTCAACTCTAATAAAGAAAACATACCTAAAAATGCTGAAATAGCATTTTCTGAAAAAGGCTTTTAGCTAGCTACAGCTCTTCCCAACCCCTAGCTGCCCTTAGGCCAGTCTTTGCTAATTAGGTGAAACCTACTTGCTATATCTACCCATTTGTAAGTAGCACTTCTTTC
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Task1_train_30436
The variant affects gene ATRX (ATRX chromatin remodeler), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
AAGAAAAACTATAAATTCAGATCAGAGAACACTCTACAGGATATCTACCTGGACGGTCCTCCTTAAGACTGATGAGATAATGAAAAAATAAAGATTGAGAAACCGTCATAGACCAGAAGACTGTTAGAGACATGACAGCTAAATACAATGTAGAACCCTGGATAGAAAAACTGGTGCAATACAAATGCAGTTTGAAGTTATTAATAATAATGTGTCAATTTCTTAGTTTTGACAAATCTACCATGGCAATGTAAGATGTTAACAATTGAGGAACCAGATGTAGGGTATATGGGAACTCTCTGCACTACCTTTTCAACTTTCATGTAAACAGAAAATTATTCCAAAATGAAAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGATGGGAGTGCAGTGGCACAATCTTGGCTCACTGGAACCTCCAGCTCCCAGGTTTGAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGAGTGCACCACCATGCCCGGCCAAAAATTTTTTTTAAATGTCACTAAATGATAAAATATGGCAATGACAAATGTTACCCTTCATGTTAGAAGCTTTAATTTTTTTTTTCTTCATTTTTTTCATGAACAAATAAGTACACTAAGCACCTGAAACTGTTGTATTAAACAGTTTCAAGGAAATCTTGTGGAAAAAATCTGCTACAATGATACTAGACACTAGCTTATAATTTTTCAACAATAAACCAGCCACAAGATTTATAAACACCTATTTAATCGTGGGAAAGAGATAAACTTATTATTAGGCCTTAGATTTGTGATGGCAGTTATTTTGCTATGTATTAACTACCTCATTATCTTTAAAAAAGAGGCAAAGCCAAGGATTCTAAAGATTACTATCACTTTGACAATGACAATTACCCAGACTTTCTCAACAAAAATAAAACCTCAATAGTGTCTTAAATATGATATGACAAGATAAACATATGAAGAAAAAGTTGCACAAATTAATAATCGTAGATTAAAAAATAATTTTAGTTTTGCAGACAGTACAACGTGTTGCTTTTCCAAGTGGCAAATATATCAACATCTGGCTCTCACATCAGATTACTATCACATAAGGATCAACAGTATTGAAAATATTAACCTTTCATACTGATGGCCCCTTAAAAGGAGATAAGCAAGCAGCAATTCTTCTAATGACATGAAGTTTGGAAAGACACAAACTGTTTTCAGGATATGGAGAGAGCTCTTGTTATCACCTAATATTTGGATAGCTGGAAGAATCTTTGATTGCAACACAGGCATTTGATGCATTTTTAAGTGTTTACAAGGTATCCCCTAAAACCCTAAACACTTTCAGACTCAGCAAATAAATTCTGAACAGCTGGCGACATTAAGGGTGATTTTATTCTATTGAAATACTAAGAATTTTCTAAAAGGCAAAAACCTGAAGGATAACCACAACAAAGACCAGATACTTAGTAGCTGTGCAATTACTATTTGTTAAAATATAAACACATTTTTTATTCAACTTGCTTCTTTATGTCACTGTCTATTAATACCTTACCTGGATCAACCAAAGCTTTGTTAAATATTTCTTTAAGTTTCCGACTCTTCACATTCCTTCCTTGAGCAAGATTTCTATACATCTCATAGCCTATGATCATAACACCACCATCTTCTTGCCACCTCTGCAGCATGTAGCTTCTCTCCTGAGGACGTTTCACAGTTGCTAATTCAGAAACCTTTTGTGGGGAAATAAAGATTTTTTTAAGTAGCTACTAAAAACATGTGAATATTAAATATTCCCACTGAAATATGCATCACTGGTTAAAAAACATTAAAAATTAAAAAAAATTAAAAATAGTTTACTATATGAATTTCATGTGACTATTTTAATAATAGAAAACATTTAAAATAAGTTACCTCAAGCTTCTCATCATCTTTTAATCCCTCTTGCCACTTCTCAAATTCATTCATCCAATTCAAAGCAGTATTAAGAGGACAAACCACTAACGCCGTGCTGAAATCCAGTTTGTCACACAAAAGAACTGTATGAAGAAAACTTACCACCTATAAGAAAACAGATTGTCACCTTCGTTTAAATATCCACAAAAAAATTTAATAAATTAAGCAATCTTACAATATTATAGCTTTGTTTTGCTTAAACAATAAACGGCCAGAATTTCCAAACCAGGCAAGGCACAGGGAAAGAGATAGTAAAATGCCAAAGTTCAACTAGATGATGTATCAGGCTCTTCCAACTCTAAAGCTCCATGATTCTATGATCAATGTGAATAGTATAAAATGATCCCATACCAATACTAAGTCCTAGGTCTCCACAGAATGTCCCTATAGTCTTTCAAAAAATACCATCGCTCATTTAGAAGAGAATCATGTTACATAATATTTTTCCACTTTAATGTGTTCTGACCCATTAAATCTATAATTACTTTATGGTTTAAAAGTACAAATACATTCACCAATTTTACATCTCTGCTACAACTCCTGCCATTTAGAAATGCAGCAATTTTAATAGTAAAAGATACTTTACTTTGTCATTACTTTAACATCATAAACCGTTAAAAGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTAATTTCTACCTTAGAATCTTTGCAGTTGTTGTTGGCCATACCTGAAACCCCACAGCCTCGCTTCATTAGGACCTCTGCTCAAACATTACCTCCTAAAAGATGCCTTTCCTAACTCAATATCCTCCCTTAACATTCATTTTCTGAAAGTACATATTTCTTATTTGATTAGCAGCTCTCTCCTCCACTAGAATATAAGCTCCTTGGAGACAGATCTTGTTATTCTTGTTCACTGCTTTATCTTCAGCCCCTACGACTGTGCCTGAAACATAATAGAATCCAATATATATTAATGAATCCACAAAAACAGGATACCTTCATATTCTTCAGCTCTTACCTGTAAAGTCTTACCAAGGCCCATACAGTGGGCAAGAATGCATCCTGAACCTGGAGATTTCTTTGTTTTTTTCACAGACTCACAGCAGCAATCCCACATAAACTGAACACCTAAAAATAACAGCTTCATTAAGTTAAATTTAAAGGTCCAAGTTAAAAACTTCCTTTACATAAACACATCAAAAACATAACCAAAACTTCTAAGAAACAGCATTAAAAAAACACTTAGCTAAATAATTTCTTACATCTAAATGGGATTTTTTCCCACCAAACTAAAGCAGAAACAAGTTAACACAAACATAGAACAGGGGGACTTTCCTTCATCTTCTCTAAGCTATCCACAGTAGATGTTCTGTATTCCCTGAGATGGTTCAAAGAAACATAAGAATACTCTAAAAGAGAAACGTGGCCGGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCAAGCACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCCAGATACTCAGGAGGCTGAGTTGGGAGAATCACTTGAGGCCAGGAGGCAGAGATTGCAGTGAGCTGTTATAGCACCACTGTACTCCAGCCTGAGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAATAATAATAATAATTTTTGTAAAAAGAGAGCAACTTTATCCAAAAAGAGAATGGCTTCCTATCAAAAATACCTTTGAGTTTATTGAGTCAATCAGGAAAAAAAAACCCATGAGATAATTTCATCATCTTTTCCTTTATTCGATAGTAAACACTGAGCAAGAAAGGGGACTAGCAACTCAAAAGGTAGGAACTACAGAACCTCCCTTATGATTAATTCACATAAACACTCAAAACTGACTTACTGATTCAACTCTAATAAAGAAAACATACCTAAAAATGCTGAAATAGCATTTTCTGAAAAAGGCTTTTAGCTAGCTACAGCTCTTCCCAACCCCTAGCTGCCCTTAGGCCAGTCTTTGCTAATTAGGTGAAACCTACTTGCTATATCTACCCATTTGTAAGTAGCACTTCTTTCTCTTTTTATAACGCTCATTGTGTTT
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Task1_train_30437
A sequence alteration has been identified in ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked
TCTTCTCTCTACCATATGCTCCATTCTTACTCTTTTTATCCTCTGAAGAGTCACAACTATCTCCTTTCCCTGTTGACTTCTCAGCATAATCAGATAATTCATCCTTCTTTTTAGAAGTTTTATCTCTTATTTTTTTACTTTTCTTTTCTCCATCAGTTGTTCCATTCTTAATTTGTTTTATGCCCTTAGGAAAATGACAAATTTCTTCTCGCTCAGGTAACTTTTCAGTGCCATCAGATGAAGATTCATACTGTTGTTCCATTTTAATTACTTTTTTCTTAAAGTCTGAAGGTTTCTTTTTTTCTTCAGTTCCCTTTTTGCTCTGCTTTTTATCATCTTCAGAAGTTTCATCGCTCTGGTCTTTCTTTAGGAATTTCTCTGCAATATCAGATAAGCCATCCTGTACTTTTTTACATGTTTTGGTTTTGAGATGCTTGCTCTTTTCTTTAGTTTCAGCAACTTTTCTAACTTCCAAAGAAGTAAAACTCTCCTCTTTCCCAGAAAGCTTATCGACACCATCAGTGGAAGCACTTGCTTGCTGCTTCTTAGGAAGTCGATCTCTTAATTCCATGATGGTCGTGTCTTTATCAACTGTGCCTTCTGCTGAAGAGAAAGTCTCTCTCTCTTGTTTTCTTTCAGCATCATCAGATGATCCTTCTTGTGAGGTCTTCAAATTTTTGTGCCCTTGATTATCCATTCCTTTTTTGCTGTGTTTCTCATCTTCAGAAGAGTCAAAATCTTTTGTATTTGGAATTCTTTTTTTGGTGGTTCTGGCAGCACCAATTTTACTCATGCTCTTTATCTCTTTTTCTAATTCTGAGTCATAATTAGAAGACTCAGACTGGGTTTGTCGTTTCTTTTTAGAAATTATAGAGCTCTTAGCTGATTTGCCCTTTTTAGTATCAAAATCTGAGCCAGATGTAGAACTTTTTCGTTTCCTTTTTCCTTTATCATCTTTCCCCGCCTGAGTCTTTAAATCATACAAAGTCTTATGGTTTGTATGAATTTCATTAATATCAGTATCTGAAGAAGAACTGTGACTCATCCTGCTCACCTCTTTGAGGATTGCTAGCATTTCATCAGAATCTGAATTTTGATCCACAGTCTCTGATTGCTTAGATTTTGGCAATTTATTAGGCTTAGGATTATCTATAGCACTGTCAGAAGAATTACGCTTATCCTTTTTTCTCACTGGAACTGATAGTTTTTGTTTCTCCTTAACTGTTTCATTACATTCTTCATCTGAATTAGATGTTACAGGGTTAGTTTCTGTCGGTCGCCTCAAGGGTGTAGTCTTTACACGTGGGGATCTTCGAAGATCAGATTCCTCTAAAAGTAATGAAACTTCATTTTCAACCAAATGCTCATTATCACTGTTTTCCTGTCCAAGTCCACATTTCTCTAACTTGGGGTTCAGACCACAACTTTTATAGCCATCTTTATCTTGTGGAACTTCCTGACAATCAGCACCTTTAATTGGGGAATTAGAAAGGGAAACAGGAGTGAGTTTAACATATAATTCTTTTGTTACTTTAGCTGTAGTTTTTGATTTAATACCTCCTCTGTTGTCTTTTGAAGAAATATTTAATTTTACAGATGAACTCTCCACTTCTTGTTCAGTTCCACTGCTGCCATCCCCTTGATGATCAACTGAACTCTGAACTTCCATAGCAGTCTCAAGATTCTCAAAAATGTCTTCTGGAACTGAGGAAGGAACAGACACAATATCCATGTCTAAATCTTCAGAAGTGTTGGCAGGTTCATATTGAGGTTCTTCTTTTCTATCAGATTTCTTATGTTCACCACCGGTACTTTTATTTGTTCTTTGTTCCTCTGTTGGAACATTCTGATGCATGTGCTCACTATCTACCTGTTTTCTTGAAAGTTTAGCTTCTGACTTTGAAATATCCTTCTTTTCCAAAGCACAAGGTTTTTCTCCTTTTCGTGCTTTTGTTTCAAACTTAGCATCTATGACTTTATGCTCTTTGGTATTTTTCTCTTTGTTTACAGCATCCATCGCTCGAAACTCGGAATTTAAGTCTTCTTCCAATGCAAGATGAGCCTTCTTAATATCAGCCAACACAGACTTAAAAGCCTTAAGCTGACGTAATTTTGTAGCAGAACTGATTTCTGAATTATCTGTTGCCTGCTTTAAAAATTTAACATAACTGGAGTTCATGTTGGCTGTGGTCTCAATCAGTTTTTTTGCCTTCTTAATCATCTCTTTGGGCACAATTAGTGCGGAATAAGAGTAGGTTACAGAGCCAGAACAGGAATCATCTAATTTCTTTTCTTCTCCATTACAATTTGAACTAGTCTTCTTTGGAGAAAATCTGGATGTATGTTCATATACTTTATTACTCTTTTCACTGTCAACTTTTATCTTCTTCTTATTTTGCTGCAACAACTGTTCTAAATTCTCAAATACGCTGTTACATGCAGTGACCAAGTCCAACAAAGGCTCTGGGTGACAAATGTAGCAATACCATTGGTTGTTTTCATCCATTATTGTGGACAACTCCTTTCGACCAAGGTTGCGTAGAATGCATTTCTTGCAGAAAGCATTATGGCAAAAGTCACAACAAATCAAGTTTCCACCTTCCGCACACCACCTGAAATGTTTTAAAGATTAAAACATTATTCCCTTCTTTCAGGAAACTGAAAAGATATGTAAAAAAATAAAAATAAACATTATTCCCAACAAAACTCATTTTAATCTCTTTGTTATAATGCAATTTAAATTTTACTGCCAGTAATTTTAGTGGTAATTTAGGTCATCTGCTTACTCTTTATTAGAAACTTAAACTAGACATAAATCCAGGGTTTTATGGAAAAGAACAACCTTTCATTAAAGACATCAATGACGATACTATGAAAGACAAACCTCATAAATGATTATGTAACAATTCCTCCCAAAAGTAGGAAACACTGAATGTTAGCTCATCTATATTACCTACCTACATTGTTCATCCATTCCATCTGAGTCACGGCTAATATCATCACTCATGTAATACTTAAAGCAATTCTATTAAAAGAAAAGAGGAAGGGGAAATTTAATTCGAAATTGATAACATTCATAAAGGACAAAAACTTTATTTTTTTAAGTAATTAAAAACACTGGGGAAAATCTCCAGGACACTGGTGTGGGCAAAGATTTATTGAGCATATTACACAAGCTCAGGCAACCAAAGCAAAAATTGGCAAATGAGATCACATCAAGTTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAGGATACAATCAACAAAATGAAAAGACAACCCACAGAATGGGAGAACATTTTGCAAAGTGCCCATCTGACAATGGATTAATAACCACAATATATAAAGAGCTCCAACAATTCTATAGGAAAAAATCAAATAATCCAATCAAAAAATGGGCAAAAGATTAGACTGGACATTTCTCCAAAGAAGACATACAAATGACAAACAGGCATATGAAAAGCTGCTCACCATCATTGATTATCAGAGAAATGTTAATCAAAACTATAATAAGATATCATCTCACCCCAGTTAAAATGGCTTATATCCAAAAGACAGGCAATAACAAATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCCTTGTATACTGTTGGTAGGAATGTAAATGAGTACAATCACTATAGAAAACAGTTGGGAGATTCCTCAAAAAAACTAAAAATTGAGATACCGTATGATCCAGCAATCCACCTGCTGAGTATATACACAAAAGAAAGGAAATGAGTATATCAAAGAGATACTGGCACTCCTATGATTGTTGGGCCACTGTTTACAATAGCAAAGATTTGGAAGCAACCTAAGTGCCCATCAACAGATAAGTAAATAAATAAAATGCGGTACATATACACAATGGAGTACTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAGATCCTGTCATTTGCAACAACATGGAAGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAAATAAGCCAGGCACAGAAAGACAAACACTGCATGTTGTCACTTATAAGTGGGATCTAAAAATCAAAACAATTGAACTCATGGATGAACTAATGAAGGATGTCATGAAGGACAGTTACAAGAAGCTGGGAAAGGTAGTGAGGGGATAGGGAG
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Task1_train_30438
A genomic change on Chromosome X affects ATRX (ATRX chromatin remodeler). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Intellectual disability-hypotonic facies syndrome, X-linked, 1
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Task1_train_30439
Gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Alpha thalassemia-X-linked intellectual disability syndrome
AGAAGTAAAACTCTCCTCTTTCCCAGAAAGCTTATCGACACCATCAGTGGAAGCACTTGCTTGCTGCTTCTTAGGAAGTCGATCTCTTAATTCCATGATGGTCGTGTCTTTATCAACTGTGCCTTCTGCTGAAGAGAAAGTCTCTCTCTCTTGTTTTCTTTCAGCATCATCAGATGATCCTTCTTGTGAGGTCTTCAAATTTTTGTGCCCTTGATTATCCATTCCTTTTTTGCTGTGTTTCTCATCTTCAGAAGAGTCAAAATCTTTTGTATTTGGAATTCTTTTTTTGGTGGTTCTGGCAGCACCAATTTTACTCATGCTCTTTATCTCTTTTTCTAATTCTGAGTCATAATTAGAAGACTCAGACTGGGTTTGTCGTTTCTTTTTAGAAATTATAGAGCTCTTAGCTGATTTGCCCTTTTTAGTATCAAAATCTGAGCCAGATGTAGAACTTTTTCGTTTCCTTTTTCCTTTATCATCTTTCCCCGCCTGAGTCTTTAAATCATACAAAGTCTTATGGTTTGTATGAATTTCATTAATATCAGTATCTGAAGAAGAACTGTGACTCATCCTGCTCACCTCTTTGAGGATTGCTAGCATTTCATCAGAATCTGAATTTTGATCCACAGTCTCTGATTGCTTAGATTTTGGCAATTTATTAGGCTTAGGATTATCTATAGCACTGTCAGAAGAATTACGCTTATCCTTTTTTCTCACTGGAACTGATAGTTTTTGTTTCTCCTTAACTGTTTCATTACATTCTTCATCTGAATTAGATGTTACAGGGTTAGTTTCTGTCGGTCGCCTCAAGGGTGTAGTCTTTACACGTGGGGATCTTCGAAGATCAGATTCCTCTAAAAGTAATGAAACTTCATTTTCAACCAAATGCTCATTATCACTGTTTTCCTGTCCAAGTCCACATTTCTCTAACTTGGGGTTCAGACCACAACTTTTATAGCCATCTTTATCTTGTGGAACTTCCTGACAATCAGCACCTTTAATTGGGGAATTAGAAAGGGAAACAGGAGTGAGTTTAACATATAATTCTTTTGTTACTTTAGCTGTAGTTTTTGATTTAATACCTCCTCTGTTGTCTTTTGAAGAAATATTTAATTTTACAGATGAACTCTCCACTTCTTGTTCAGTTCCACTGCTGCCATCCCCTTGATGATCAACTGAACTCTGAACTTCCATAGCAGTCTCAAGATTCTCAAAAATGTCTTCTGGAACTGAGGAAGGAACAGACACAATATCCATGTCTAAATCTTCAGAAGTGTTGGCAGGTTCATATTGAGGTTCTTCTTTTCTATCAGATTTCTTATGTTCACCACCGGTACTTTTATTTGTTCTTTGTTCCTCTGTTGGAACATTCTGATGCATGTGCTCACTATCTACCTGTTTTCTTGAAAGTTTAGCTTCTGACTTTGAAATATCCTTCTTTTCCAAAGCACAAGGTTTTTCTCCTTTTCGTGCTTTTGTTTCAAACTTAGCATCTATGACTTTATGCTCTTTGGTATTTTTCTCTTTGTTTACAGCATCCATCGCTCGAAACTCGGAATTTAAGTCTTCTTCCAATGCAAGATGAGCCTTCTTAATATCAGCCAACACAGACTTAAAAGCCTTAAGCTGACGTAATTTTGTAGCAGAACTGATTTCTGAATTATCTGTTGCCTGCTTTAAAAATTTAACATAACTGGAGTTCATGTTGGCTGTGGTCTCAATCAGTTTTTTTGCCTTCTTAATCATCTCTTTGGGCACAATTAGTGCGGAATAAGAGTAGGTTACAGAGCCAGAACAGGAATCATCTAATTTCTTTTCTTCTCCATTACAATTTGAACTAGTCTTCTTTGGAGAAAATCTGGATGTATGTTCATATACTTTATTACTCTTTTCACTGTCAACTTTTATCTTCTTCTTATTTTGCTGCAACAACTGTTCTAAATTCTCAAATACGCTGTTACATGCAGTGACCAAGTCCAACAAAGGCTCTGGGTGACAAATGTAGCAATACCATTGGTTGTTTTCATCCATTATTGTGGACAACTCCTTTCGACCAAGGTTGCGTAGAATGCATTTCTTGCAGAAAGCATTATGGCAAAAGTCACAACAAATCAAGTTTCCACCTTCCGCACACCACCTGAAATGTTTTAAAGATTAAAACATTATTCCCTTCTTTCAGGAAACTGAAAAGATATGTAAAAAAATAAAAATAAACATTATTCCCAACAAAACTCATTTTAATCTCTTTGTTATAATGCAATTTAAATTTTACTGCCAGTAATTTTAGTGGTAATTTAGGTCATCTGCTTACTCTTTATTAGAAACTTAAACTAGACATAAATCCAGGGTTTTATGGAAAAGAACAACCTTTCATTAAAGACATCAATGACGATACTATGAAAGACAAACCTCATAAATGATTATGTAACAATTCCTCCCAAAAGTAGGAAACACTGAATGTTAGCTCATCTATATTACCTACCTACATTGTTCATCCATTCCATCTGAGTCACGGCTAATATCATCACTCATGTAATACTTAAAGCAATTCTATTAAAAGAAAAGAGGAAGGGGAAATTTAATTCGAAATTGATAACATTCATAAAGGACAAAAACTTTATTTTTTTAAGTAATTAAAAACACTGGGGAAAATCTCCAGGACACTGGTGTGGGCAAAGATTTATTGAGCATATTACACAAGCTCAGGCAACCAAAGCAAAAATTGGCAAATGAGATCACATCAAGTTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAGGATACAATCAACAAAATGAAAAGACAACCCACAGAATGGGAGAACATTTTGCAAAGTGCCCATCTGACAATGGATTAATAACCACAATATATAAAGAGCTCCAACAATTCTATAGGAAAAAATCAAATAATCCAATCAAAAAATGGGCAAAAGATTAGACTGGACATTTCTCCAAAGAAGACATACAAATGACAAACAGGCATATGAAAAGCTGCTCACCATCATTGATTATCAGAGAAATGTTAATCAAAACTATAATAAGATATCATCTCACCCCAGTTAAAATGGCTTATATCCAAAAGACAGGCAATAACAAATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCCTTGTATACTGTTGGTAGGAATGTAAATGAGTACAATCACTATAGAAAACAGTTGGGAGATTCCTCAAAAAAACTAAAAATTGAGATACCGTATGATCCAGCAATCCACCTGCTGAGTATATACACAAAAGAAAGGAAATGAGTATATCAAAGAGATACTGGCACTCCTATGATTGTTGGGCCACTGTTTACAATAGCAAAGATTTGGAAGCAACCTAAGTGCCCATCAACAGATAAGTAAATAAATAAAATGCGGTACATATACACAATGGAGTACTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAGATCCTGTCATTTGCAACAACATGGAAGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAAATAAGCCAGGCACAGAAAGACAAACACTGCATGTTGTCACTTATAAGTGGGATCTAAAAATCAAAACAATTGAACTCATGGATGAACTAATGAAGGATGTCATGAAGGACAGTTACAAGAAGCTGGGAAAGGTAGTGAGGGGATAGGGAGGAGGTGGGGATGGTTAATGAGTACAAAAAAATACAAAGAATAAGACCTACTATTTAATAGCACAATAGGGTGACTACAGTCAATAGCAACTTAATTGTACATTTTTAAATAACTTAAAGAATGTAATTAGATTGCTTGTAACTCAAAGGATAAATGCTTGAGGGGATGGATACCCCATTTTCCACAATGTGCTTATTTTACATTGCACGCCAGTATTAAAACATCTCATGTATGCCATAAATATATACACCTACCATGAACCCACAAAAATTTTAAAAATACAAACAATTTTTTTTTAAAAAAGGGAGTATGTGTGCATGTTTCAGAGACTCAAAGCAAAAACACTGCACTACTGCAGCCGGGTACAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTCTGGGAGGACGAGGAGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAC
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Task1_train_30440
The gene ATRX (ATRX chromatin remodeler) on Chromosome X carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; not provided
TTAAATCATACAAAGTCTTATGGTTTGTATGAATTTCATTAATATCAGTATCTGAAGAAGAACTGTGACTCATCCTGCTCACCTCTTTGAGGATTGCTAGCATTTCATCAGAATCTGAATTTTGATCCACAGTCTCTGATTGCTTAGATTTTGGCAATTTATTAGGCTTAGGATTATCTATAGCACTGTCAGAAGAATTACGCTTATCCTTTTTTCTCACTGGAACTGATAGTTTTTGTTTCTCCTTAACTGTTTCATTACATTCTTCATCTGAATTAGATGTTACAGGGTTAGTTTCTGTCGGTCGCCTCAAGGGTGTAGTCTTTACACGTGGGGATCTTCGAAGATCAGATTCCTCTAAAAGTAATGAAACTTCATTTTCAACCAAATGCTCATTATCACTGTTTTCCTGTCCAAGTCCACATTTCTCTAACTTGGGGTTCAGACCACAACTTTTATAGCCATCTTTATCTTGTGGAACTTCCTGACAATCAGCACCTTTAATTGGGGAATTAGAAAGGGAAACAGGAGTGAGTTTAACATATAATTCTTTTGTTACTTTAGCTGTAGTTTTTGATTTAATACCTCCTCTGTTGTCTTTTGAAGAAATATTTAATTTTACAGATGAACTCTCCACTTCTTGTTCAGTTCCACTGCTGCCATCCCCTTGATGATCAACTGAACTCTGAACTTCCATAGCAGTCTCAAGATTCTCAAAAATGTCTTCTGGAACTGAGGAAGGAACAGACACAATATCCATGTCTAAATCTTCAGAAGTGTTGGCAGGTTCATATTGAGGTTCTTCTTTTCTATCAGATTTCTTATGTTCACCACCGGTACTTTTATTTGTTCTTTGTTCCTCTGTTGGAACATTCTGATGCATGTGCTCACTATCTACCTGTTTTCTTGAAAGTTTAGCTTCTGACTTTGAAATATCCTTCTTTTCCAAAGCACAAGGTTTTTCTCCTTTTCGTGCTTTTGTTTCAAACTTAGCATCTATGACTTTATGCTCTTTGGTATTTTTCTCTTTGTTTACAGCATCCATCGCTCGAAACTCGGAATTTAAGTCTTCTTCCAATGCAAGATGAGCCTTCTTAATATCAGCCAACACAGACTTAAAAGCCTTAAGCTGACGTAATTTTGTAGCAGAACTGATTTCTGAATTATCTGTTGCCTGCTTTAAAAATTTAACATAACTGGAGTTCATGTTGGCTGTGGTCTCAATCAGTTTTTTTGCCTTCTTAATCATCTCTTTGGGCACAATTAGTGCGGAATAAGAGTAGGTTACAGAGCCAGAACAGGAATCATCTAATTTCTTTTCTTCTCCATTACAATTTGAACTAGTCTTCTTTGGAGAAAATCTGGATGTATGTTCATATACTTTATTACTCTTTTCACTGTCAACTTTTATCTTCTTCTTATTTTGCTGCAACAACTGTTCTAAATTCTCAAATACGCTGTTACATGCAGTGACCAAGTCCAACAAAGGCTCTGGGTGACAAATGTAGCAATACCATTGGTTGTTTTCATCCATTATTGTGGACAACTCCTTTCGACCAAGGTTGCGTAGAATGCATTTCTTGCAGAAAGCATTATGGCAAAAGTCACAACAAATCAAGTTTCCACCTTCCGCACACCACCTGAAATGTTTTAAAGATTAAAACATTATTCCCTTCTTTCAGGAAACTGAAAAGATATGTAAAAAAATAAAAATAAACATTATTCCCAACAAAACTCATTTTAATCTCTTTGTTATAATGCAATTTAAATTTTACTGCCAGTAATTTTAGTGGTAATTTAGGTCATCTGCTTACTCTTTATTAGAAACTTAAACTAGACATAAATCCAGGGTTTTATGGAAAAGAACAACCTTTCATTAAAGACATCAATGACGATACTATGAAAGACAAACCTCATAAATGATTATGTAACAATTCCTCCCAAAAGTAGGAAACACTGAATGTTAGCTCATCTATATTACCTACCTACATTGTTCATCCATTCCATCTGAGTCACGGCTAATATCATCACTCATGTAATACTTAAAGCAATTCTATTAAAAGAAAAGAGGAAGGGGAAATTTAATTCGAAATTGATAACATTCATAAAGGACAAAAACTTTATTTTTTTAAGTAATTAAAAACACTGGGGAAAATCTCCAGGACACTGGTGTGGGCAAAGATTTATTGAGCATATTACACAAGCTCAGGCAACCAAAGCAAAAATTGGCAAATGAGATCACATCAAGTTAAAAAGCTTCTGCACAGCAAAGGATACAATCAACAAAATGAAAAGACAACCCACAGAATGGGAGAACATTTTGCAAAGTGCCCATCTGACAATGGATTAATAACCACAATATATAAAGAGCTCCAACAATTCTATAGGAAAAAATCAAATAATCCAATCAAAAAATGGGCAAAAGATTAGACTGGACATTTCTCCAAAGAAGACATACAAATGACAAACAGGCATATGAAAAGCTGCTCACCATCATTGATTATCAGAGAAATGTTAATCAAAACTATAATAAGATATCATCTCACCCCAGTTAAAATGGCTTATATCCAAAAGACAGGCAATAACAAATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAAGGGAACCCTTGTATACTGTTGGTAGGAATGTAAATGAGTACAATCACTATAGAAAACAGTTGGGAGATTCCTCAAAAAAACTAAAAATTGAGATACCGTATGATCCAGCAATCCACCTGCTGAGTATATACACAAAAGAAAGGAAATGAGTATATCAAAGAGATACTGGCACTCCTATGATTGTTGGGCCACTGTTTACAATAGCAAAGATTTGGAAGCAACCTAAGTGCCCATCAACAGATAAGTAAATAAATAAAATGCGGTACATATACACAATGGAGTACTATTCAGCCATAAAAAAGAATGAGATCCTGTCATTTGCAACAACATGGAAGGAACTGGAGATCATTATGTTAAGTGAAATAAGCCAGGCACAGAAAGACAAACACTGCATGTTGTCACTTATAAGTGGGATCTAAAAATCAAAACAATTGAACTCATGGATGAACTAATGAAGGATGTCATGAAGGACAGTTACAAGAAGCTGGGAAAGGTAGTGAGGGGATAGGGAGGAGGTGGGGATGGTTAATGAGTACAAAAAAATACAAAGAATAAGACCTACTATTTAATAGCACAATAGGGTGACTACAGTCAATAGCAACTTAATTGTACATTTTTAAATAACTTAAAGAATGTAATTAGATTGCTTGTAACTCAAAGGATAAATGCTTGAGGGGATGGATACCCCATTTTCCACAATGTGCTTATTTTACATTGCACGCCAGTATTAAAACATCTCATGTATGCCATAAATATATACACCTACCATGAACCCACAAAAATTTTAAAAATACAAACAATTTTTTTTTAAAAAAGGGAGTATGTGTGCATGTTTCAGAGACTCAAAGCAAAAACACTGCACTACTGCAGCCGGGTACAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTCTGGGAGGACGAGGAGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTATTCTAAAGGTTGAGGCAGGAGACTCACTTGAACCCTGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGACACTCCGCCTCAAAAATAAATAAATAAATAAAATAAACACTGCTACCCACTACCCAATGTCTGTATTTTCCAGACATCTAACTATCTCAAGAATTAATGCCTTGAAACAGATTTCCATACACTCAAGTACCACTATTCCTTATTTAAAAGTGTATAAAAGATTTTTGGCTGGGTGTTTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACAGGGTAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTAGTGGACACCTGTAATCCCAGCTACTCGAG
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Task1_train_30441
The gene ATRX (ATRX chromatin remodeler), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; not provided
TTAAAAGTGTATAAAAGATTTTTGGCTGGGTGTTTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACAGGGTAAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGTGTGGTAGTGGACACCTGTAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGACCCAGGAGGTGGACGTTGTCGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTACAAAAGATTTTAGTAAAGCTAATTTCTGGTCTCATACATCTAGCTACTAAAGCTCTACATAAAAATGTATTAGATTTGGGTACTTAACAATTTTAATAGCCACCATATACAAACAGCTACTATGTATACAGCTAAACAATTAATCTATATTATCTTTAAATACCAAATACCTACCATGCAAGGTAGGACATATTATGAGAGAAAAGGCTAACTTTCATTAATATGTAAATAAATCTAAAGTCATACAACTAGTAAGAGGCAAAGCTGTTATTCAAATCCAAGTTTGACTGACTTCAAAGTCTTTCCAGTGGGACTGCAGAAAGGGAAAAGGTGCTCACTGATACAAACTACCGATTAGTGAAATGGCCTAGGCTCAACAGACTGGTTCTTGAAAAAAGACAATCACATAGATAAGAAAACAGAAAGGCAAATACATGTCACAAATCCAGCAATATTAGATTCTACTGTCACAATTTAAAATGAAACTCTCTAATACATACCCTAGATAGGCCCCTGGCTGAACTGAATTCAAGGAAAGGAGGGATACAAATTGCTAAAGAACAAAGTACAGTTCATTTAAGCATGTCTGAATCTATCAAAAATTCATGCAAGAAAAGATCTAGAGCTAGAATTCCAAGGAAAACATGGCCTGCCACTGCATTTCAAAGGCAGCTTTTTATTGGGAAACAAACTAACATAGGATTAATCTTAGCAGGAATATGAGTTAAGAAAACCATAACCTTGACATTTATAGGTAGGTAGGTAGTTACTGAGACGAAATTTCCCTCTTGTTGTCCAGGCTGGAGTACAATGGCGCGATCTCGACTCGCTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGGACCCGCCACCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGACACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGAGATCCACCTGCCTCAGCATCCCAAAGTGCTAGGATTACAAGCATGAGCCACCATGCCAGGCCCACATTTATAGATATTTAAAATTAACTCCAAGGTATTACTAACAAAAAAGTGGCACAGACTGTTAAAATTATAATCAACACATAAAAAACATTTTTAATTCTATCATCTCCAAGTTATGTCAAAACCCTGCTCCACATAGATAGTTTACATTTGGGGAAGTAGGATATATAAGGGGAAAGATTATAAAACACAAACATTACACACATCCACTCTTGAGATTTTCAAACACACCAAGCTCTCCCTCAACTACCAGTATCTGAATACTATGTTGCCTCTTCCCAGAACATGATGAACCAATCTCACTTACCAGGCTGATTCTTATTCATATTTCACATACAGCTTTCCACTAGAAAGCCATCCAAATCCTATTTACACAGGCTTCCGGTGTGCTCCCATAATCACAGTATCTCCCCTATCATGACACTTAGGCTTTGTACGTCTATTTTCCCCACTATAGTAGAAGTCTTCCAAGGGCAGATACCATTTTCATCTTTCTTCAAGACTGTGCCCTCAAAGGCCTGGTATATGGTAAGCATTCAAATATTTACGGTATGAAATATCAACAGATCATTACATACCTTACAAATAAGAACTTGCAATGAAGGGTGTCTATAAATGGAATCTTTTTGAAAATGATTGACCTGTTGTCCACAAGCAGTGCAGCTCACAATCCCATGAAGCCCATCTTCTAGGAGAAAGGAGTGGCTATTATTCACACATTTATACACAGAAAAAGATACTTACTTTAGTCAGCATTTTGTAACTTTTGTATTAGACATGAAATACCTCATAATCCTTAGAAAAATGGCATATTGGACACAAGTAAAAAAGGTTAATATTTTATCGACTTACTAAGCACATGACAACCTTGGCAAATTCCAAGTTACAAATCCTAATTGTTTCCTTTTACAGATGCAAATGCCATTTTTTACAACTTGAAATAACATTAAGAGAACCCATAAAAAGTTCTAAAACTAGGGGCCAAGAGCTCTTATTTTGTTATTGCTTTGCAAATAAATTCAGTATCAGTCCTTAAAGAATGGGGAAGTAAGTAACATATACGGAACAGATTCTTTTGCAATCCTACACTTAAGTATGCCATAAAGGTTTTTATTCTCATTGGAATTGTCTGCACAGATCCTATCAATATGGTATGTAAAAACTTGGTAATTTTATGATATTACCAATTTCCTTGCTAATATTTACTTCAACACTATACATAAATTGTCATTAAACTGCCTTTTTTCTATGTGTACTCCACTATCCACTCCATATCAATACTGTCTACTATTTCCAAATAAAGACAAACAAGACATTGCAGGTATATCTATTTTGGCAGCAAAACATCAGAACGACTGGGGGAAAAAGGCAGAGTCCCATTCTGTACTGTCTCCTGATAAACAGACTGAAGAAAACCTACAGAAACCTCTCCAGCCTCCCTCTTGTCCCTAGTTCTGCTAAGGCAGTGTTTCACACCCTGAGCTAAACATTAGAGTCATCTGAAGAATCTTTTTAAAAACAGCCATTCCCACCCCTAAACCACTGAATTAAAATCTCTCAGGCATTTTCTTAAAGTTTCAAAGATGATCCTGATGTGCAACCAAGACCTTGATCAAAATAAGATGGTAGATTATAATTCAGAAGTCACTCAAAATGCTTACATTCACAAATAAAAAGGAGACAACTAAAAAACAAATTGGCTCCATCCTTAAATAAAAAACAAAACATCACATATATTTTTCACCCTTTTAATTTTCTCTTTTGGGTTTCTGTTAGGTTTAAGGTCCAAAGCGCCATGGACCCAAATATTATCATGAATATTTTTATTTGTAGAAACTTTAAAAAAATTTTTAAGAGCTAGAGTCTCACTCTGTCACCTAGGCTGGAATGCAATGGTGCAAATTCAGCTCACTGCAGCCTCTACCTCCCAGGCTCAAGCAATCCTCCTACCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTATAGGCATACACCACTACACCCAGCTAATTCTTTTTAAAGACTGGGTCTCACTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGGGCTCAAGCAATCTTCTGGCATCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTAGCCAGAAGCTAAAAACGTTAATGTATAAGAACACCATCATACTTTTTTAGAAAAGTAAACTTGAAGGTTTACTATTTATGTTGCTAATATTTTTATTTATTTATTTTTTTAATTTTAAAGATGGGGTCTCAATCCATCACCCAGACTGGAGTACAATGGCACAATTATAAATCACTGTAGCCTCAAACGCCTGAGTTCAAGCAATCCTCCTATCTCAACCTACCTAATAGCAGGCATTACAAGCCTAATGTATTATAATCACATTATTTACAAACACCAGTTTGATCTTGGGTATTCATATATTCTGTATTTGTTTTAACAGAAACAAATACACCACACCATACTTTTTCATTTCAAACAATGATTTCATTCAGATAAACTAACAAGATAAATAAAATGTAGAATCTGAATGTTCATCCAGTGTTAAGTAATACTTACTAAGTATCTTCTATGTGCTTTGGTGCATACATCGCTCAAGAATTAAACAAAACTAGGTAATTCTTTGGAGATTTTCTCCCACATGTGCACAAGGAATCAAATATAAGGATATTCACCACAGCACTAATTAGAAAATTAGA
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Task1_train_30442
A variant has been detected on Chromosome X in MAGT1 (magnesium transporter 1). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Congenital disorder of glycosylation
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Task1_train_30443
An alteration has been detected in ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30444
Mutation context: Chromosome X, Gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30445
Here is a mutation in ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Cutis laxa, X-linked
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Task1_train_30446
This mutation is located in gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_30447
This sequence change occurs on Chromosome X, altering ATP7A (ATPase copper transporting alpha). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTGGTGCTAGCTTTTATGGCCTATTAATGAGAACCTCTACTGAGGACAGTTGTACTTGAGTTAAACTCTTATATATAGGATACATATTAACTAGCATTAAGGAAATATTTATTTGTTTGATGAAAGATTGGAAACAAATGCAATCAAGAGCAGGAAGCACATCTTCATCTTTGTATTCCCCAGAGTGACTTGCCCTCAGTAATTGAACTGTTCTTAATGACAATACCATGGCTTAGAATTTCTCTATACAATATTTATATGTTCAGTGAAATAATTTTTTTCTCATGAATTTCCTTAGAGCTTAGGTTTTGAAGCTTCTTTGGTCAAGAAGGATCGGTCAGCAAGTCACTTAGATCATAAACGAGAAATAAGACAGTAAGTACTTTGGAGTGTCAGTAAAAAACAGATTTTGACTCCTTATTACAAATTTTTTTTTGCATGTCAGTTTTTATAATATCATCCTTATACTGGATGAAATGGTCACAATGTATATCTCTCTGTAGTATGTAGAATCTTTACCCATTAGCTATTTATGACCATGATTTTTCTTTTTTTATTTTTTCCATATAAGATGGAGACGGTCTTTTCTTGTGAGTCTGTTTTTCTGTATTCCTGTAATGGGGCTGATGATATATATGATGGTTATGGACCACCACTTTGCAACTCTTCACCATAATCAAAACATGAGTAAAGAAGAAATGATCAACCTTCATTCTTCTATGTTCCTGGAGCGCCAGATTCTTCCAGGATTGTCTGTTATGAATTTGCTGTCCTTTTTATTGTGTGTACCTGTACAGGCAAGTGAATTGTTAGCAAATATATTTGTTAATAATAAAAAATAAGCAAAATTTGGCAGGCAAGGTTTATTTTCAGCTACAAAACTGATGTTAGCTAGAAGTCTGATCATTTTATGCCATATGCTTTACAAAAATAATCTTCAACTGGGTAGTTATTTAAGTTGATAATAGATGCCATTTAACCCCTAAGAAAGAGTTCAAGTTTTTTGGGTTTGGTATTTATATCTGCTACTGTATATAACTTTATTTTATTTTTAAATTTTTATTTATCTATTTTTTTTTTTTTAGAGATGGGGTTTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGTAAGCACAGCTCACTGTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCATTCCTTCTGCCTCAGCATTCTGAGTAGCTGGGACTTCCAGGCACTAGCCACTGCACCCAGCTCAATGACTTTATTTTTGTTATTTCTTCCTGGCACTTCAGTTCATTACTTTCTGTATGTTTTAAACTCTTTTTTCGAGATAAACTTTTACTTTGGAATAGAATACTTCTATCAAATAAATCTTTTCCTTTATCTGATCCTTATAAAAGGCAATAATGATTTTAAAAAACATCTTAGTTTCTCTGTTTTAATGAAATAAGCTTTCCAGTTATATTTACCAACAAAAACGGCCAACAGATTTCGTAGCTTGTGATATACCAGTTAGTTTGAGTTTTGGAAAGATGGGTGAGTTTTATACAAAAAAATCCTTGAGAAAATGTAATTCCTTTCTTAGTTCTTGTTTTTGCTAGCCTCAGAAAGAAAAATCTGCTTGGTGTGATGGCTCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATATCAAGACTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAATATCTGATTTTCCTTGTATTATGGAATATCCATTGGATCATAGATGATAGCCCCACAGGCTTGTGCAGCAATTTGAATACCTCCCTCTGCATGTACATCTATTGAAATACAAACACGATTGTTTTGGCTTAATCTCCCTTTAGTGTTTATGGATTAGCTAAAAGCCAAAGAAAGTGACTATTGATACTTTAAGTTATTGAGATATATATGTGAATTTCAGCATTTTTTAAAATTCAATGATTATCATTCCTATATTGCAGTTTTTCGGAGGCTGGTACTTCTACATTCAGGCTTATAAAGCACTGAAGCATAAGACAGCAAATATGGACGTACTGATTGTGCTGGCAACCACCATTGCATTTGCCTACTCTTTGATTATTCTTCTAGTTGCAATGTATGAGAGAGCCAAAGTGAACCCTATTACTTTCTTTGACACACCCCCTATGCTGTTTGTGTTTATTGCACTAGGCCGATGGCTGGAACATATAGCAAAGGTAAAGTAAGAAAGGGTGACATTTGTTAAAATGTTGGGTGGATAAATGACCTTAGTATTTTTTAGGCCAATCATTGGAAATACATGCTTTTATGTAGTTAACCATTTACTGAAAGACGTATTTTCATTTTGGCAATATTTTAAGTTAAATATCAGTTTAGAAGATTTACCAAATATGGAATTAATACTGTAGATAGTACAGTATGTCTGTTTATTTTAAGAGAGACAAATGAGAAATACTTATCACTTATTTACTTACATTATTAATTGAAAAATTGACATGACCACATGGTTTAAAATAATGATAGAAAAAATTCACCCATATTCCCTTGCTATAATGTAAATCATTTTCTAATTCCATTCTACATACCTTTCTACTTAACAGAGTTGCAAATGTAGTATTCATACTACTTTGTACCCTTAACACTATAAAGTTTTTCACCATTTTTGCAGTCTAGATTATTATCTAATATTTCTGACTAAGTCTGTCACATCAGTTTGCTTTAATTTAATAAACCATTCAGGTGTTTTTCACCATTAGATTGTTTCTAATTTTTTATTTTTAGATAATCCTGCATTGAACATACTCATGTCTAATAGTCATTTCCATTGAGCTAATATCTTAGAAGACATTACAAAGGATGTGTTTACTGGGTTAAAGGGCATAAATATTTCTCTGGTTCATGGTACAAGTTGTAACAGTTTTTGCCAGCAGGGGTATGTCAGTGAAGTATTTTTACTACAACTTCACCAGCATTGCATCCCCCCCACAAATTCTTTCTAAGTTAATAGACATTAAATGGTATTACAGGGTAACTTTAGTTTGTGTTTCTTCCATTAATGGTGGGGATAAACATTTTTTCATCATCGGATGTTTATATTTCCTTTTGAATGATTTGCTTATATATGTCCTTTGCCTGTGTGTTTATTGGGTTCATGTTTTTCTTATTAATTTATATAATTTCTTCATAAATTATACCTAATAATACTTTTAAAATATTTTGTGTACTTTTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCCAACATGGTGAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCGCGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGGGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAATATTTTGTGTACTTCGTCTTTCTGAAGTGAAACATTTTCTAGTGAAACATTTTGAAGTGAAACATTCAAACATTTTGAAGTGAAACATTTTCATATTAATTTTTAAACAAATTAATATTCCTAAAGCTGTCTTTTGGGTAAATGCTAAAGATTGTATTTTTATTTTAGTTAAGACCTGAACTTTTTCTTCCTTAGCATTTTCAATGTGTTTGTTTTAATTTATAGGGCAAAACATCAGAGGCTCTTGCAAAGTTAATTTCACTACAAGCTACAGAAGCAACTATTGTAACTCTTGATTCTGATAATATCCTCCTCAGGTATTTATCTTCACTCTTCCCTCTTCTCTTTTTTTAACTTCTTAAGAAAAATTTCAAATATATACAGAAGTAGAAAAAGGACTATCATGAATTCACATAATCTGTCTCCCAGATATAAAAATTATCCACATTTTGCCATACTTCATCTATCCATTTTGTCTGTCTTTCTTGTTGCAGTA
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Task1_train_30448
Located on Chromosome X, this mutation impacts ATP7A (ATPase copper transporting alpha). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Cutis laxa, X-linked
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Task1_train_30449
Chromosome X houses a mutation in gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; X-linked distal spinal muscular atrophy type 3
CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCGGCCTGGTGCTAGCTTTTATGGCCTATTAATGAGAACCTCTACTGAGGACAGTTGTACTTGAGTTAAACTCTTATATATAGGATACATATTAACTAGCATTAAGGAAATATTTATTTGTTTGATGAAAGATTGGAAACAAATGCAATCAAGAGCAGGAAGCACATCTTCATCTTTGTATTCCCCAGAGTGACTTGCCCTCAGTAATTGAACTGTTCTTAATGACAATACCATGGCTTAGAATTTCTCTATACAATATTTATATGTTCAGTGAAATAATTTTTTTCTCATGAATTTCCTTAGAGCTTAGGTTTTGAAGCTTCTTTGGTCAAGAAGGATCGGTCAGCAAGTCACTTAGATCATAAACGAGAAATAAGACAGTAAGTACTTTGGAGTGTCAGTAAAAAACAGATTTTGACTCCTTATTACAAATTTTTTTTTGCATGTCAGTTTTTATAATATCATCCTTATACTGGATGAAATGGTCACAATGTATATCTCTCTGTAGTATGTAGAATCTTTACCCATTAGCTATTTATGACCATGATTTTTCTTTTTTTATTTTTTCCATATAAGATGGAGACGGTCTTTTCTTGTGAGTCTGTTTTTCTGTATTCCTGTAATGGGGCTGATGATATATATGATGGTTATGGACCACCACTTTGCAACTCTTCACCATAATCAAAACATGAGTAAAGAAGAAATGATCAACCTTCATTCTTCTATGTTCCTGGAGCGCCAGATTCTTCCAGGATTGTCTGTTATGAATTTGCTGTCCTTTTTATTGTGTGTACCTGTACAGGCAAGTGAATTGTTAGCAAATATATTTGTTAATAATAAAAAATAAGCAAAATTTGGCAGGCAAGGTTTATTTTCAGCTACAAAACTGATGTTAGCTAGAAGTCTGATCATTTTATGCCATATGCTTTACAAAAATAATCTTCAACTGGGTAGTTATTTAAGTTGATAATAGATGCCATTTAACCCCTAAGAAAGAGTTCAAGTTTTTTGGGTTTGGTATTTATATCTGCTACTGTATATAACTTTATTTTATTTTTAAATTTTTATTTATCTATTTTTTTTTTTTTAGAGATGGGGTTTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGTAAGCACAGCTCACTGTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCATTCCTTCTGCCTCAGCATTCTGAGTAGCTGGGACTTCCAGGCACTAGCCACTGCACCCAGCTCAATGACTTTATTTTTGTTATTTCTTCCTGGCACTTCAGTTCATTACTTTCTGTATGTTTTAAACTCTTTTTTCGAGATAAACTTTTACTTTGGAATAGAATACTTCTATCAAATAAATCTTTTCCTTTATCTGATCCTTATAAAAGGCAATAATGATTTTAAAAAACATCTTAGTTTCTCTGTTTTAATGAAATAAGCTTTCCAGTTATATTTACCAACAAAAACGGCCAACAGATTTCGTAGCTTGTGATATACCAGTTAGTTTGAGTTTTGGAAAGATGGGTGAGTTTTATACAAAAAAATCCTTGAGAAAATGTAATTCCTTTCTTAGTTCTTGTTTTTGCTAGCCTCAGAAAGAAAAATCTGCTTGGTGTGATGGCTCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATATCAAGACTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAATATCTGATTTTCCTTGTATTATGGAATATCCATTGGATCATAGATGATAGCCCCACAGGCTTGTGCAGCAATTTGAATACCTCCCTCTGCATGTACATCTATTGAAATACAAACACGATTGTTTTGGCTTAATCTCCCTTTAGTGTTTATGGATTAGCTAAAAGCCAAAGAAAGTGACTATTGATACTTTAAGTTATTGAGATATATATGTGAATTTCAGCATTTTTTAAAATTCAATGATTATCATTCCTATATTGCAGTTTTTCGGAGGCTGGTACTTCTACATTCAGGCTTATAAAGCACTGAAGCATAAGACAGCAAATATGGACGTACTGATTGTGCTGGCAACCACCATTGCATTTGCCTACTCTTTGATTATTCTTCTAGTTGCAATGTATGAGAGAGCCAAAGTGAACCCTATTACTTTCTTTGACACACCCCCTATGCTGTTTGTGTTTATTGCACTAGGCCGATGGCTGGAACATATAGCAAAGGTAAAGTAAGAAAGGGTGACATTTGTTAAAATGTTGGGTGGATAAATGACCTTAGTATTTTTTAGGCCAATCATTGGAAATACATGCTTTTATGTAGTTAACCATTTACTGAAAGACGTATTTTCATTTTGGCAATATTTTAAGTTAAATATCAGTTTAGAAGATTTACCAAATATGGAATTAATACTGTAGATAGTACAGTATGTCTGTTTATTTTAAGAGAGACAAATGAGAAATACTTATCACTTATTTACTTACATTATTAATTGAAAAATTGACATGACCACATGGTTTAAAATAATGATAGAAAAAATTCACCCATATTCCCTTGCTATAATGTAAATCATTTTCTAATTCCATTCTACATACCTTTCTACTTAACAGAGTTGCAAATGTAGTATTCATACTACTTTGTACCCTTAACACTATAAAGTTTTTCACCATTTTTGCAGTCTAGATTATTATCTAATATTTCTGACTAAGTCTGTCACATCAGTTTGCTTTAATTTAATAAACCATTCAGGTGTTTTTCACCATTAGATTGTTTCTAATTTTTTATTTTTAGATAATCCTGCATTGAACATACTCATGTCTAATAGTCATTTCCATTGAGCTAATATCTTAGAAGACATTACAAAGGATGTGTTTACTGGGTTAAAGGGCATAAATATTTCTCTGGTTCATGGTACAAGTTGTAACAGTTTTTGCCAGCAGGGGTATGTCAGTGAAGTATTTTTACTACAACTTCACCAGCATTGCATCCCCCCCACAAATTCTTTCTAAGTTAATAGACATTAAATGGTATTACAGGGTAACTTTAGTTTGTGTTTCTTCCATTAATGGTGGGGATAAACATTTTTTCATCATCGGATGTTTATATTTCCTTTTGAATGATTTGCTTATATATGTCCTTTGCCTGTGTGTTTATTGGGTTCATGTTTTTCTTATTAATTTATATAATTTCTTCATAAATTATACCTAATAATACTTTTAAAATATTTTGTGTACTTTTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCCAACATGGTGAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCGCGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGGGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAATATTTTGTGTACTTCGTCTTTCTGAAGTGAAACATTTTCTAGTGAAACATTTTGAAGTGAAACATTCAAACATTTTGAAGTGAAACATTTTCATATTAATTTTTAAACAAATTAATATTCCTAAAGCTGTCTTTTGGGTAAATGCTAAAGATTGTATTTTTATTTTAGTTAAGACCTGAACTTTTTCTTCCTTAGCATTTTCAATGTGTTTGTTTTAATTTATAGGGCAAAACATCAGAGGCTCTTGCAAAGTTAATTTCACTACAAGCTACAGAAGCAACTATTGTAACTCTTGATTCTGATAATATCCTCCTCAGGTATTTATCTTCACTCTTCCCTCTTCTCTTTTTTTAACTTCTTAAGAAAAATTTCAAATATATACAGAAGTAGAAAAAGGACTATCATGAATTCACATAATCTGTCTCCCAGATATAAAAATTATCCACATTTTGCCATACTTCATCTATCCATTTTGTCTGTCTTTCTTGTTGCAGTA
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Task1_train_30450
This mutation occurs in ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30451
A variant was discovered in gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
ATGCAATCAAGAGCAGGAAGCACATCTTCATCTTTGTATTCCCCAGAGTGACTTGCCCTCAGTAATTGAACTGTTCTTAATGACAATACCATGGCTTAGAATTTCTCTATACAATATTTATATGTTCAGTGAAATAATTTTTTTCTCATGAATTTCCTTAGAGCTTAGGTTTTGAAGCTTCTTTGGTCAAGAAGGATCGGTCAGCAAGTCACTTAGATCATAAACGAGAAATAAGACAGTAAGTACTTTGGAGTGTCAGTAAAAAACAGATTTTGACTCCTTATTACAAATTTTTTTTTGCATGTCAGTTTTTATAATATCATCCTTATACTGGATGAAATGGTCACAATGTATATCTCTCTGTAGTATGTAGAATCTTTACCCATTAGCTATTTATGACCATGATTTTTCTTTTTTTATTTTTTCCATATAAGATGGAGACGGTCTTTTCTTGTGAGTCTGTTTTTCTGTATTCCTGTAATGGGGCTGATGATATATATGATGGTTATGGACCACCACTTTGCAACTCTTCACCATAATCAAAACATGAGTAAAGAAGAAATGATCAACCTTCATTCTTCTATGTTCCTGGAGCGCCAGATTCTTCCAGGATTGTCTGTTATGAATTTGCTGTCCTTTTTATTGTGTGTACCTGTACAGGCAAGTGAATTGTTAGCAAATATATTTGTTAATAATAAAAAATAAGCAAAATTTGGCAGGCAAGGTTTATTTTCAGCTACAAAACTGATGTTAGCTAGAAGTCTGATCATTTTATGCCATATGCTTTACAAAAATAATCTTCAACTGGGTAGTTATTTAAGTTGATAATAGATGCCATTTAACCCCTAAGAAAGAGTTCAAGTTTTTTGGGTTTGGTATTTATATCTGCTACTGTATATAACTTTATTTTATTTTTAAATTTTTATTTATCTATTTTTTTTTTTTTAGAGATGGGGTTTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCAGTGGTGTAAGCACAGCTCACTGTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCATTCCTTCTGCCTCAGCATTCTGAGTAGCTGGGACTTCCAGGCACTAGCCACTGCACCCAGCTCAATGACTTTATTTTTGTTATTTCTTCCTGGCACTTCAGTTCATTACTTTCTGTATGTTTTAAACTCTTTTTTCGAGATAAACTTTTACTTTGGAATAGAATACTTCTATCAAATAAATCTTTTCCTTTATCTGATCCTTATAAAAGGCAATAATGATTTTAAAAAACATCTTAGTTTCTCTGTTTTAATGAAATAAGCTTTCCAGTTATATTTACCAACAAAAACGGCCAACAGATTTCGTAGCTTGTGATATACCAGTTAGTTTGAGTTTTGGAAAGATGGGTGAGTTTTATACAAAAAAATCCTTGAGAAAATGTAATTCCTTTCTTAGTTCTTGTTTTTGCTAGCCTCAGAAAGAAAAATCTGCTTGGTGTGATGGCTCATGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATATCAAGACTGTCTCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAATATCTGATTTTCCTTGTATTATGGAATATCCATTGGATCATAGATGATAGCCCCACAGGCTTGTGCAGCAATTTGAATACCTCCCTCTGCATGTACATCTATTGAAATACAAACACGATTGTTTTGGCTTAATCTCCCTTTAGTGTTTATGGATTAGCTAAAAGCCAAAGAAAGTGACTATTGATACTTTAAGTTATTGAGATATATATGTGAATTTCAGCATTTTTTAAAATTCAATGATTATCATTCCTATATTGCAGTTTTTCGGAGGCTGGTACTTCTACATTCAGGCTTATAAAGCACTGAAGCATAAGACAGCAAATATGGACGTACTGATTGTGCTGGCAACCACCATTGCATTTGCCTACTCTTTGATTATTCTTCTAGTTGCAATGTATGAGAGAGCCAAAGTGAACCCTATTACTTTCTTTGACACACCCCCTATGCTGTTTGTGTTTATTGCACTAGGCCGATGGCTGGAACATATAGCAAAGGTAAAGTAAGAAAGGGTGACATTTGTTAAAATGTTGGGTGGATAAATGACCTTAGTATTTTTTAGGCCAATCATTGGAAATACATGCTTTTATGTAGTTAACCATTTACTGAAAGACGTATTTTCATTTTGGCAATATTTTAAGTTAAATATCAGTTTAGAAGATTTACCAAATATGGAATTAATACTGTAGATAGTACAGTATGTCTGTTTATTTTAAGAGAGACAAATGAGAAATACTTATCACTTATTTACTTACATTATTAATTGAAAAATTGACATGACCACATGGTTTAAAATAATGATAGAAAAAATTCACCCATATTCCCTTGCTATAATGTAAATCATTTTCTAATTCCATTCTACATACCTTTCTACTTAACAGAGTTGCAAATGTAGTATTCATACTACTTTGTACCCTTAACACTATAAAGTTTTTCACCATTTTTGCAGTCTAGATTATTATCTAATATTTCTGACTAAGTCTGTCACATCAGTTTGCTTTAATTTAATAAACCATTCAGGTGTTTTTCACCATTAGATTGTTTCTAATTTTTTATTTTTAGATAATCCTGCATTGAACATACTCATGTCTAATAGTCATTTCCATTGAGCTAATATCTTAGAAGACATTACAAAGGATGTGTTTACTGGGTTAAAGGGCATAAATATTTCTCTGGTTCATGGTACAAGTTGTAACAGTTTTTGCCAGCAGGGGTATGTCAGTGAAGTATTTTTACTACAACTTCACCAGCATTGCATCCCCCCCACAAATTCTTTCTAAGTTAATAGACATTAAATGGTATTACAGGGTAACTTTAGTTTGTGTTTCTTCCATTAATGGTGGGGATAAACATTTTTTCATCATCGGATGTTTATATTTCCTTTTGAATGATTTGCTTATATATGTCCTTTGCCTGTGTGTTTATTGGGTTCATGTTTTTCTTATTAATTTATATAATTTCTTCATAAATTATACCTAATAATACTTTTAAAATATTTTGTGTACTTTTAGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCGGCCTGGCCAACATGGTGAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGCGCGTCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGGGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCTACTGCACTCCAGCCTGGGTAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAATATTTTGTGTACTTCGTCTTTCTGAAGTGAAACATTTTCTAGTGAAACATTTTGAAGTGAAACATTCAAACATTTTGAAGTGAAACATTTTCATATTAATTTTTAAACAAATTAATATTCCTAAAGCTGTCTTTTGGGTAAATGCTAAAGATTGTATTTTTATTTTAGTTAAGACCTGAACTTTTTCTTCCTTAGCATTTTCAATGTGTTTGTTTTAATTTATAGGGCAAAACATCAGAGGCTCTTGCAAAGTTAATTTCACTACAAGCTACAGAAGCAACTATTGTAACTCTTGATTCTGATAATATCCTCCTCAGGTATTTATCTTCACTCTTCCCTCTTCTCTTTTTTTAACTTCTTAAGAAAAATTTCAAATATATACAGAAGTAGAAAAAGGACTATCATGAATTCACATAATCTGTCTCCCAGATATAAAAATTATCCACATTTTGCCATACTTCATCTATCCATTTTGTCTGTCTTTCTTGTTGCAGTAGTATTAAACCAAATTTCAGTCATATTGTTTTACGGCTAAATATTCTGTGTTATCTCTAAAAAAGGATATATTCTGATATAACTATACTACCGTACTGTACCTAACAAAATGAACATTAATTCCTTAATGTCACCTAAGACCCAATTCATATTCACATTTCTCCTGTTGTCTCCAAAAT
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Task1_train_30452
A variant found in Chromosome X affects ATP7A (ATPase copper transporting alpha). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30453
Gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Cutis laxa, X-linked
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Task1_train_30454
A variant affecting Chromosome X, within the gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; X-linked distal spinal muscular atrophy type 3
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Task1_train_30455
This gene mutation involves ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
CAATCCCATTTACAATAATCACACACAAAACATACCTAGGAATACATTTAACCAAGGAGGTGAAAGATCTCTACAGAGAGAAGCATAAAACACTGATGAAAGAAACTGAAGAAGACACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCCCATGGATTGGAAGCATTAATATTAAAACTACCATACTGTCCAAAGCAATCTATAGATTCAACACAATTCCTATAAAACTAATGTCCTCTGTCACAGAATTAAAAAAGCAATCCTAAAATTCATATGGAAAAAGAACCTAAATAGCCAAAGCCATCCTAAGCAAAAAGAATAAAACTAGAGGCATCACATTACCTGACTTCAAATTATACTGCAAGGCTATAGTAATCAAAAGCATGGTATTGATACAAAAATAGACATGTAGATCAATTGAACAAAATAGAGAACCCAGAAATAAAACCACACACCTACAACCAACTGATCTTCAACAAAGTTGACCAAAACAAGCAATGGGGAAAGGACACCCTATTCAATATATGATATTATTATATGGGATTACAGACATGAGCCACTGTGTCCAGCCCACTACTGTAATATTAAAAAGTTTCTTTAAGTGATTCATGTCTGTTTAGTACACACTGAACAAAAGGATTGTTGGGAAGTTTTTTTGGTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCAGGAATGCAGTGGTGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTCAAACTTCTGGGCTTAAGCGATTCTCTTACCTTAGCCTCCCGAGTAGCTGCAACTGCAGGCATGCACCACCATCCCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGACCGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTCTTGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGCATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCGGACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCATACCTGGCTAATTTTTCACAAATTTTTTTTGTAGAGATGAGGTCTTACCATGTTGCCCAGGGTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAATGATCCTCCTGCCTTAGCCTCCAAAAGTACTGGGATTACAGATGTGAGCCCGTGCACAGACCAGCAAGTAGCTTGGAATGTGTTTCCTTCAGGAATTTTTCTCATGAGTTCAGGATGTCTTAGATTTCTTCTAAAACTACCAATTATATTTTTCCCACATGAGCAAACACTGAACGTCACTAAGAGCTTAATTAGCAGATATACTTGGTTCACATTGTTATGTCCAAAAGGATTTTGTTGAAATATGACTAAGGTCCCTTTGCATGCCATGTGATTCTTTTTCATTGTCTTTCAAGAATAGTGTGAAAGGCAGAATTATGGTTTTACTCTACAGAGATTGAGAATTCTGTTTATTCAGTATCAAATTTTTTGAAAATTATGTCTCACATTTGCAGCTATTTCTGAAAATTTCTAATAAAAACATTCATTCTCAATATGGAGCACTTATATTCAGTCCATAGTTTGTAATTCTGGAATCTCAGTATGTCCCAATTTCTTATATTCATAAAAGAAAGAAAGTGTTTTCTTACCTGTAACTAAAAAATATATGTAGGTAGCTAGGTAGGATATGTCACTTTTTAAATTGTGGTTTTATTTAAATAGTGTTAAGTTTTGTGTCTTTTGTTTTGTACAGCTCTAAATCAATAACCAAAATTTATGCCTTTCTTCTAAAGGGCTACAATAGAAGTATCTCCCGAACAGAAACGATAATACGATTTGCTTTCCAAGCCTCTATCACAGTTCTGTGTATTGCATGTCCCTGTTCACTGGGACTGGCCACTCCAACTGCTGTGATGGTGGGTACAGGAGTAGGTGCTCAAAATGGCATACTAATAAAAGGTGGAGAGCCATTGGAGATGGCTCATAAGGTAAGACAGTCCCCAGAACTAAAACCTGTACCACCAAACTATCAATAGCACCCCTCACATGTGAGAAACACATACTCCTAAATTATTTCTCTGTGGTCCATGAGCTGAGCTGCTTCTAGGACTATCCAGAGATTTGAGGTAGGAAAGGTGTTATTTTGGTTCTGCTTCAGATTGGCCTTTGTTACCTAAGATTCCTAAAACTACTCCAGGCCTATTTATTAGAGCAGACCCTAATGTGGAAAACCTGGACTCCTATCCTAGCTCAGACTAGACTAGTCTTTGTGGCAGAAAGACAGAATAGGTGTTTGCCCAGGAAAATTTGCCAAACTCCAGCAGCCTTCTAACCTATTTGTGTGTGACTTGTTTTCTTCACTGGGACCTTCAATTGCAGTGCCGTTTCTTTGCCTTTGCTGCCACCAGCCGACAGTTTGCAGCTATGACTTTAGGAATATAATCCTATCTCTGATCTCATATTAGGATTTCCATAATCATCTCAAAGCTACTTGACTTCAACTAAAACCATGTTTCTACTAGTATGTTCTTATTATGAGGATGTAAGCTATGTACAGAGGTATATAGTAAACATAGAACATATCTTAGAACAAATCTGGAAACTCACCTCGCCAGAGAATACAGGCTAGTAATTTTTATAGACATTTTAAACTTTGATATAATTTCAAACTTAAAAGTCGCAAGACTAGCCTGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGACCACGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGAGTTGGCACACCTGTAATCCCAACTACTCAGGAGACTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAGCCCGGAGGGCAGGGGTTGCAGTGAGCTGGGATCGCGCCACTGCACTCCAGCTTGGGCGACTGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAATGTTGCAAGACTAGTACAAAGAACTCCTATATGCCCTTTACTGCAGTCGTTGGGCTCTTTTCCTAAGAATAAGGACATTCTCTTATGTAAACTGTAGTACAACTATCAAAATCAATAAATTAATATTGATATGTTGTTATCTGATCTGTAGTCCATGTTCCAGTTTCCTCAGTTGTCTCAATAATGTGCTTTATAGCTATTTTTCCCCTGTCCAGAATCATACTTTGTTGGTTTATTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGAAGTCTCGCTCTATGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCCACCAAGTTCCAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAACTTTTTATTATTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGATCTCCTGACCTCAGGTGATCCATACACCTCAGTCTCTGAAAGTGCTGGGATTATAGGCTTGAGCCACCGCACCTGGCCATTTACCTTTATTCTTATAATCATTTCCCTACTGCTTAGATTTCCTCATCAGATCTATAATTCATTATATTGAAAGCCTTTCTTTTTTACCTTGAGGCACTAGAGGCGTCTCTTAATTACCTATTAACAGTCAACCCTTAAAAATTAGCTCTAGTTGTTTAACATATATTCACAGTTATTTAGCATGAACAAACAGTTCAGCATTGGCAGAGGAGAGCTGTTGTGTATAACTAAGAGTATTTCTTCTTTTATTTTCCCGAAGACCATCAGTTTTTTAAGTCAAATTAAGTCAAAGGTCAGTTTACTAAGAAACTAAATAGTCATCTCTTTGTCAAAACAGACCTTTTTCTTATTTCTGGAAAGGTGATGTGGAGGATCATCAAGTCATTGTATCTTAATTTTTTTACAGGTAAAGGTAGTGGTATTTGATAAGACTGGAACCATTA
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Task1_train_30456
A variant was discovered in gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30457
A mutation found in ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
TGCAAAGGCCCAGAGGCATGGAAGAACAGAGTATGTTCTTAGAAAATTTGAACATCACTGTTGGAGGCTATGTTCTAGGAGCAATACAATGTAGTGACTGTGCAAGGTTAGACAGGAAGAACTTGCTTCATGGGGTTTTATAAAGATTAATTGAACTTACTAAATGTTATTTCTGTGCCTACTTTCAGATGCTCTTAATGCTCAGCAGTATAAAGTCCTCATTGGTAACCGGGAGTGGATGATTAGAAATGGTCTTGTCATTAATAACGATGTAAATGATTTCATGACTGAACATGAGAGAAAAGGTCGGACTGCTGTATTAGTAGCAGTTGATGGTAAGGTTTTCCATAAGTATGCTATAACTCAATGTTTTGTTATTGTTTTATTAATTTATTTATTTTTGAGAGACCTCTGAACTATGAGGGTTATTCAAAAGCATCTTGAATGCAAAATGAAAATGTCAACAACACATGATTATTACTGATTAATTTAAAATTCTCTCGCATTTGCCTGCCTTTGTTACTTTCTTCCCTAGCCTATGTTTTAAATGAAGGCTAATCAAGGATTTTTTAAAACCTAAAAATAGCAACAGTAAAATAATAGCAAAGTAAAATAATATTCGTAATCCCATCATCCTAACACAATGTCAGGTTTTTTTTGTTTGTTTCTTTGTTTTGTTTTTGTTCTTGTTTTTGTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCTCTCTTGTTGCCCAAACTGGAGTGCAATGATGTGATTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCGCACCACCATGCCCGGCTAATTGTTTGTATTTTTAGTGGAAATGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACTTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCAGCCCACAACGTCAGTTTTAATTTTGTATATTCCATTCCTAGTTTTCTTGAAATGTGTGTGTGTTTGCAGAATTACAGTATTAGTACATATACCATTTTTTACTGGGTACATTTTATCGTAAGTAAATTTTACCTCAATAAAGTTAAAATCACTTGTACACATACTATTTTATTATGCTTTATTTTACTTAATGCTTTCTAATGTTGCTATATAATTTTACTATAATACTGCATAATTTATCAATCTTACACACTATAATCATTCCCCTCTTGTTGGAAATTTAGGCTATTCCTAATATTTCACTATTGTAAATGACACTACAATAAATATCTTTGAGGTTGTATGTGCTTTATTTTGTTATTTCTTAGGGTAAATTTCTAGTTGTGAGATTAATTCCACTCTACATTTATAATGTCTGCTAAGTATGAAGGCAGTCTTTTACTATGGCCTTTTTAGGTCTGGGAAGAAGCAGAGAATACCATTTTACTTTTGTTTTGTAAATAGAATAAAATAATAAGATTTATGGTAATATTTTTCCCACTATAAAGTGCCCATTTTGTCTCTCTCTGCCCCCCCCCCCTTACCTTAAAAAGAAAAAAAGTATTAATCTTCAGTTTCATTTGCCTATAAATTAGATAAAGTGTTTGAGGCTGTTGGCAAATACCTTTCTGAGGAACAAAAAGGGTCTTCTAATATCCAGTAAGGTCTCTCTTTTTATTTTCCTGTGATTACTTTATTAGTAACCCCTACCTCACTCTGAAATTTTCATAACCAAATATGGAGGCTTGTTACAGAGTTTGTAGTATAAAGTCTGTGTGGGCTTAGAGATATTTTAAGTTAAGCCATGCCCTGAACAACTTTACTTGAGAAAATTCATTTCATTCTGAAATTTCAAGTCAAAATGTTATTCTCCTTTCACTATATTCCAAGTTCTTTTATTTTGTGCTGCCCCTATATTAGATGAGCTGTGTGGCTTGATAGCCATTGCAGACACAGTGAAGCCTGAAGCAGAACTGGCTATCCATATTCTGAAATCTATGGGCTTAGAAGTAGTTCTGATGACTGGAGACAACAGTAAAACAGCTAGATCTATTGCTTCTCAGGTAATTGATAGGGGTATGTGATAACTTCTAATTATTGATATACATTTTATATCTTGCCTTCAAATGCTAAGAAATTTACATTACCTACTATTTTCATTATCACTGAGTAGTCCTATCTGGTTCCTTCAAGAAAATTTACCATGCTTTGCTGGAAAGACTTTGGGCTTTGTGTGTTGCTGTTATACGTAAAAAGGTATTTGCTTAGTTCATGGGATGCTTGCGTGACACTGTACACCAATTTCTGTTGATGTGCCCTTTGAAATGTTGCTCATATTCTTTACCAGTGCTGCCAACCTAAGCTGGGCTCTCCTGATCTCATGCCTGAAACACAGCAATAGCTCCACACACATCCCTCTCTAGTCCATCCTAAATACCACCACCAATGGAACTATTTTCCTAATGCACCACTTTGACATACCATTTTTCTGCTCCTGACTCCCACATCTGCCTTATCTCTAAAATTTTTCAATCTTTTTAACTTTGGAATGCCTTCTCCCCTCTTCTAATAAATAATGCAAGTAATCTTTTAATACATTCTTTTGTTTCTTTTTTTTTTCTTGGGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCATCGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACATGCATACACCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCGTGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAACACCTTCTTATGTAAAAAATACAGAAGGATATAAAGTAAAAATGTCCTCTTTTCCCCATGCTCCCCATTCAGTCCTACTGCCCCTCACACTGCCACTTTTTCATATGCATATATGTGCATATACAGAGTACATATACAGTATAATTCTGGTCTTTTCAACATCAGATCATTTTGAACAGATTGTTCAGTAGTTTGCTTTTTTTACGTAACAGTATACTTTGGAGCTTCATCCATATCTGAACATAAAGTTATTTTGGCCGGGTTTGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCACATGAGGTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAAAGTTACTTTATTCTTTCTATACTGAATTCCATGGTATGGATGTATCATAATTTATTTAACCATTTCCCTAATGATGGACATTTGGGTGGTTTTGAAAATTTTCTTTTTGCAAACAAGGCAATAATAAACATCTTTGGACATGTATCTTTCTGTACATGTGCAAGCCTGTCCAAGATAGAGCTAGACATGGAATTGCTAGACCAAATGATGCTCACATTTTGATAGATGCTGCCAGATGCCCTCCAAAAAGAGTTACAATTTACACACCAGCCACTGGTGTATAAGAGAGCTCATTTCTCCACATCCTTGCTATCACTAGATATTATCAGTCTTTTAAAATGTGGACATCTTGTGGGTGAAAACTGATGGCTTGTTATTGCTCAGTTATGTTTCACGTACTCATTATTTTTTAAATGAATTGAGTTTATTTTCATCACATAGGTTGGCATTACTAAGGTGTTTGCTGAAGTTCTACCTTCTCACAAGGTTGCTAAAGTGAAGCAACTTCAAGAGGAGGGGAAACGGGTAGCAATGGTGGGAGATGGAATCAATGACTCCCCAGCTCTGGCAATGGCTAATGTGGGAATTGCTATTGGCACA
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Task1_train_30458
Consider this mutation in ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
GGCTATCCATATTCTGAAATCTATGGGCTTAGAAGTAGTTCTGATGACTGGAGACAACAGTAAAACAGCTAGATCTATTGCTTCTCAGGTAATTGATAGGGGTATGTGATAACTTCTAATTATTGATATACATTTTATATCTTGCCTTCAAATGCTAAGAAATTTACATTACCTACTATTTTCATTATCACTGAGTAGTCCTATCTGGTTCCTTCAAGAAAATTTACCATGCTTTGCTGGAAAGACTTTGGGCTTTGTGTGTTGCTGTTATACGTAAAAAGGTATTTGCTTAGTTCATGGGATGCTTGCGTGACACTGTACACCAATTTCTGTTGATGTGCCCTTTGAAATGTTGCTCATATTCTTTACCAGTGCTGCCAACCTAAGCTGGGCTCTCCTGATCTCATGCCTGAAACACAGCAATAGCTCCACACACATCCCTCTCTAGTCCATCCTAAATACCACCACCAATGGAACTATTTTCCTAATGCACCACTTTGACATACCATTTTTCTGCTCCTGACTCCCACATCTGCCTTATCTCTAAAATTTTTCAATCTTTTTAACTTTGGAATGCCTTCTCCCCTCTTCTAATAAATAATGCAAGTAATCTTTTAATACATTCTTTTGTTTCTTTTTTTTTTCTTGGGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCATCGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACATGCATACACCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCGTGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAACACCTTCTTATGTAAAAAATACAGAAGGATATAAAGTAAAAATGTCCTCTTTTCCCCATGCTCCCCATTCAGTCCTACTGCCCCTCACACTGCCACTTTTTCATATGCATATATGTGCATATACAGAGTACATATACAGTATAATTCTGGTCTTTTCAACATCAGATCATTTTGAACAGATTGTTCAGTAGTTTGCTTTTTTTACGTAACAGTATACTTTGGAGCTTCATCCATATCTGAACATAAAGTTATTTTGGCCGGGTTTGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCACATGAGGTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAAAGTTACTTTATTCTTTCTATACTGAATTCCATGGTATGGATGTATCATAATTTATTTAACCATTTCCCTAATGATGGACATTTGGGTGGTTTTGAAAATTTTCTTTTTGCAAACAAGGCAATAATAAACATCTTTGGACATGTATCTTTCTGTACATGTGCAAGCCTGTCCAAGATAGAGCTAGACATGGAATTGCTAGACCAAATGATGCTCACATTTTGATAGATGCTGCCAGATGCCCTCCAAAAAGAGTTACAATTTACACACCAGCCACTGGTGTATAAGAGAGCTCATTTCTCCACATCCTTGCTATCACTAGATATTATCAGTCTTTTAAAATGTGGACATCTTGTGGGTGAAAACTGATGGCTTGTTATTGCTCAGTTATGTTTCACGTACTCATTATTTTTTAAATGAATTGAGTTTATTTTCATCACATAGGTTGGCATTACTAAGGTGTTTGCTGAAGTTCTACCTTCTCACAAGGTTGCTAAAGTGAAGCAACTTCAAGAGGAGGGGAAACGGGTAGCAATGGTGGGAGATGGAATCAATGACTCCCCAGCTCTGGCAATGGCTAATGTGGGAATTGCTATTGGCACAGGCACAGATGTAGCCATTGAAGCAGCTGATGTGGTTTTGATAAGGGTAAGTGCCATGGCTTGACCTTTGAGGAGTATGAGACTGCCCTATGTGGTCAATGATAATGTCATAAAGTATATTGAGCATAACAATTCTGTCTTAAGTTCCATGCTATCAGCCATTAAGAGTTTAAGAATATGGAGTGGGATTATGGGAAGTCATGCTAATTTACCCCCTGACTTTCTCAACCCAGCTCATAAGCAAGTGAGAATTATAAGTTTCTGAAGTGAAGAAGAAGATTTAAGAATGGATTCGGAATAAAATGATCTTCAACAAATAGTTGCTGAGATTATTTTAAGTAGATTTAATCATAGTACCAGCATACACCCCTAAAAGTGTTTTCAGAACCCTGAGGAAAATTTTTGAAAAACACCTTCGGAAGCTGAGTCTAAGTTTTAGCATTATCTGAGATTTGTAATTAATTCACATATTACCCTAAGGTAGACGTAATCTTCAACATACACAGTATCAAATGTAAAAGTTACTGGTTAAGTTAGAGTCTCTTACTAATATCACAAATATTTCTGTTCTTAGAATGATCTTCTGGATGTAGTGGCAAGTATTGACTTATCAAGAAAGACAGTCAAGAGGATTCGGATAAATTTTGTCTTTGCTCTAATTTATAATCTGGTTGGAATTCCCATAGCTGCTGGTATGTGACTCTTAACTAGTACTGCTTTTTCCACTAAAGTTATTAGAGACCTAACATATTGGAAGCCTGTCTTCTTACTATTAGTTTTGAGCTTAGTTTTTGTTTGTAGCCTACTGGTATGGTGAGAGGTAATGTTAAAATCAATCATTTTAATTTTCAGTAATGTTTGTTATAGCTTAAGAATATATAAGCATTCTGACAGATTTATTTTTTTCCCTCCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTCATACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACTATAGGTGCCCGCCACAACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTATAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGCTGTGAGCCACCACTCCCAGCCTTCAACTTTGTATTTTGAAAAATTTCAAACTTGACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCATGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACGGAGGCAGTAGACTCGCTTGAACCCAAGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCGCCATCGCACTTCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCATACCTCCAAAAACATTGAAAAAAATGGTACAATAAAAATCTGTATGCCTTTCACCTAAACTCACCAACTGATGGTATTTTGCCACATTGCTTCATCTCTTTCTGCATATATTTGCACAGAGATATGTATTTGTTTGCTTATTAATTTTTTTCTAAATAGATTTACCTTTAATCTGACTACCCAAACCCAACACTGTTTGCAAGATTAATTCATGGAGCAAATGATTTTTAAAGAATTATACAAGTATTTTCCTCTAGTCTTTTTTTTACTCTACATCAGTTTTTGTCTTGTTACATAGTTGTGATTGTAGCTTATGGAGAATTTTCTGCTCTTCACTTAATATTCTATTATAGTCAGCTGGTATTTTTTTTAGGTTGAGAGACCAGATGACAGAGAGAGTGAACAAAGCAATATAACTGAGAAAAAAGAATTTAGAGTTATTTAATAAGCATCTGAGAATCT
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Task1_train_30459
The gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
TATTCTGAAATCTATGGGCTTAGAAGTAGTTCTGATGACTGGAGACAACAGTAAAACAGCTAGATCTATTGCTTCTCAGGTAATTGATAGGGGTATGTGATAACTTCTAATTATTGATATACATTTTATATCTTGCCTTCAAATGCTAAGAAATTTACATTACCTACTATTTTCATTATCACTGAGTAGTCCTATCTGGTTCCTTCAAGAAAATTTACCATGCTTTGCTGGAAAGACTTTGGGCTTTGTGTGTTGCTGTTATACGTAAAAAGGTATTTGCTTAGTTCATGGGATGCTTGCGTGACACTGTACACCAATTTCTGTTGATGTGCCCTTTGAAATGTTGCTCATATTCTTTACCAGTGCTGCCAACCTAAGCTGGGCTCTCCTGATCTCATGCCTGAAACACAGCAATAGCTCCACACACATCCCTCTCTAGTCCATCCTAAATACCACCACCAATGGAACTATTTTCCTAATGCACCACTTTGACATACCATTTTTCTGCTCCTGACTCCCACATCTGCCTTATCTCTAAAATTTTTCAATCTTTTTAACTTTGGAATGCCTTCTCCCCTCTTCTAATAAATAATGCAAGTAATCTTTTAATACATTCTTTTGTTTCTTTTTTTTTTCTTGGGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCATCGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACATGCATACACCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCGTGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAACACCTTCTTATGTAAAAAATACAGAAGGATATAAAGTAAAAATGTCCTCTTTTCCCCATGCTCCCCATTCAGTCCTACTGCCCCTCACACTGCCACTTTTTCATATGCATATATGTGCATATACAGAGTACATATACAGTATAATTCTGGTCTTTTCAACATCAGATCATTTTGAACAGATTGTTCAGTAGTTTGCTTTTTTTACGTAACAGTATACTTTGGAGCTTCATCCATATCTGAACATAAAGTTATTTTGGCCGGGTTTGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCACATGAGGTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAAAGTTACTTTATTCTTTCTATACTGAATTCCATGGTATGGATGTATCATAATTTATTTAACCATTTCCCTAATGATGGACATTTGGGTGGTTTTGAAAATTTTCTTTTTGCAAACAAGGCAATAATAAACATCTTTGGACATGTATCTTTCTGTACATGTGCAAGCCTGTCCAAGATAGAGCTAGACATGGAATTGCTAGACCAAATGATGCTCACATTTTGATAGATGCTGCCAGATGCCCTCCAAAAAGAGTTACAATTTACACACCAGCCACTGGTGTATAAGAGAGCTCATTTCTCCACATCCTTGCTATCACTAGATATTATCAGTCTTTTAAAATGTGGACATCTTGTGGGTGAAAACTGATGGCTTGTTATTGCTCAGTTATGTTTCACGTACTCATTATTTTTTAAATGAATTGAGTTTATTTTCATCACATAGGTTGGCATTACTAAGGTGTTTGCTGAAGTTCTACCTTCTCACAAGGTTGCTAAAGTGAAGCAACTTCAAGAGGAGGGGAAACGGGTAGCAATGGTGGGAGATGGAATCAATGACTCCCCAGCTCTGGCAATGGCTAATGTGGGAATTGCTATTGGCACAGGCACAGATGTAGCCATTGAAGCAGCTGATGTGGTTTTGATAAGGGTAAGTGCCATGGCTTGACCTTTGAGGAGTATGAGACTGCCCTATGTGGTCAATGATAATGTCATAAAGTATATTGAGCATAACAATTCTGTCTTAAGTTCCATGCTATCAGCCATTAAGAGTTTAAGAATATGGAGTGGGATTATGGGAAGTCATGCTAATTTACCCCCTGACTTTCTCAACCCAGCTCATAAGCAAGTGAGAATTATAAGTTTCTGAAGTGAAGAAGAAGATTTAAGAATGGATTCGGAATAAAATGATCTTCAACAAATAGTTGCTGAGATTATTTTAAGTAGATTTAATCATAGTACCAGCATACACCCCTAAAAGTGTTTTCAGAACCCTGAGGAAAATTTTTGAAAAACACCTTCGGAAGCTGAGTCTAAGTTTTAGCATTATCTGAGATTTGTAATTAATTCACATATTACCCTAAGGTAGACGTAATCTTCAACATACACAGTATCAAATGTAAAAGTTACTGGTTAAGTTAGAGTCTCTTACTAATATCACAAATATTTCTGTTCTTAGAATGATCTTCTGGATGTAGTGGCAAGTATTGACTTATCAAGAAAGACAGTCAAGAGGATTCGGATAAATTTTGTCTTTGCTCTAATTTATAATCTGGTTGGAATTCCCATAGCTGCTGGTATGTGACTCTTAACTAGTACTGCTTTTTCCACTAAAGTTATTAGAGACCTAACATATTGGAAGCCTGTCTTCTTACTATTAGTTTTGAGCTTAGTTTTTGTTTGTAGCCTACTGGTATGGTGAGAGGTAATGTTAAAATCAATCATTTTAATTTTCAGTAATGTTTGTTATAGCTTAAGAATATATAAGCATTCTGACAGATTTATTTTTTTCCCTCCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTCATACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACTATAGGTGCCCGCCACAACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTATAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGCTGTGAGCCACCACTCCCAGCCTTCAACTTTGTATTTTGAAAAATTTCAAACTTGACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCATGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACGGAGGCAGTAGACTCGCTTGAACCCAAGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCGCCATCGCACTTCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCATACCTCCAAAAACATTGAAAAAAATGGTACAATAAAAATCTGTATGCCTTTCACCTAAACTCACCAACTGATGGTATTTTGCCACATTGCTTCATCTCTTTCTGCATATATTTGCACAGAGATATGTATTTGTTTGCTTATTAATTTTTTTCTAAATAGATTTACCTTTAATCTGACTACCCAAACCCAACACTGTTTGCAAGATTAATTCATGGAGCAAATGATTTTTAAAGAATTATACAAGTATTTTCCTCTAGTCTTTTTTTTACTCTACATCAGTTTTTGTCTTGTTACATAGTTGTGATTGTAGCTTATGGAGAATTTTCTGCTCTTCACTTAATATTCTATTATAGTCAGCTGGTATTTTTTTTAGGTTGAGAGACCAGATGACAGAGAGAGTGAACAAAGCAATATAACTGAGAAAAAAGAATTTAGAGTTATTTAATAAGCATCTGAGAATCTCCTAAACTT
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Task1_train_30460
The gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
AAGTAGTTCTGATGACTGGAGACAACAGTAAAACAGCTAGATCTATTGCTTCTCAGGTAATTGATAGGGGTATGTGATAACTTCTAATTATTGATATACATTTTATATCTTGCCTTCAAATGCTAAGAAATTTACATTACCTACTATTTTCATTATCACTGAGTAGTCCTATCTGGTTCCTTCAAGAAAATTTACCATGCTTTGCTGGAAAGACTTTGGGCTTTGTGTGTTGCTGTTATACGTAAAAAGGTATTTGCTTAGTTCATGGGATGCTTGCGTGACACTGTACACCAATTTCTGTTGATGTGCCCTTTGAAATGTTGCTCATATTCTTTACCAGTGCTGCCAACCTAAGCTGGGCTCTCCTGATCTCATGCCTGAAACACAGCAATAGCTCCACACACATCCCTCTCTAGTCCATCCTAAATACCACCACCAATGGAACTATTTTCCTAATGCACCACTTTGACATACCATTTTTCTGCTCCTGACTCCCACATCTGCCTTATCTCTAAAATTTTTCAATCTTTTTAACTTTGGAATGCCTTCTCCCCTCTTCTAATAAATAATGCAAGTAATCTTTTAATACATTCTTTTGTTTCTTTTTTTTTTCTTGGGACGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCATCGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACATGCATACACCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCGTGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAACACCTTCTTATGTAAAAAATACAGAAGGATATAAAGTAAAAATGTCCTCTTTTCCCCATGCTCCCCATTCAGTCCTACTGCCCCTCACACTGCCACTTTTTCATATGCATATATGTGCATATACAGAGTACATATACAGTATAATTCTGGTCTTTTCAACATCAGATCATTTTGAACAGATTGTTCAGTAGTTTGCTTTTTTTACGTAACAGTATACTTTGGAGCTTCATCCATATCTGAACATAAAGTTATTTTGGCCGGGTTTGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCACATGAGGTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAAAGTTACTTTATTCTTTCTATACTGAATTCCATGGTATGGATGTATCATAATTTATTTAACCATTTCCCTAATGATGGACATTTGGGTGGTTTTGAAAATTTTCTTTTTGCAAACAAGGCAATAATAAACATCTTTGGACATGTATCTTTCTGTACATGTGCAAGCCTGTCCAAGATAGAGCTAGACATGGAATTGCTAGACCAAATGATGCTCACATTTTGATAGATGCTGCCAGATGCCCTCCAAAAAGAGTTACAATTTACACACCAGCCACTGGTGTATAAGAGAGCTCATTTCTCCACATCCTTGCTATCACTAGATATTATCAGTCTTTTAAAATGTGGACATCTTGTGGGTGAAAACTGATGGCTTGTTATTGCTCAGTTATGTTTCACGTACTCATTATTTTTTAAATGAATTGAGTTTATTTTCATCACATAGGTTGGCATTACTAAGGTGTTTGCTGAAGTTCTACCTTCTCACAAGGTTGCTAAAGTGAAGCAACTTCAAGAGGAGGGGAAACGGGTAGCAATGGTGGGAGATGGAATCAATGACTCCCCAGCTCTGGCAATGGCTAATGTGGGAATTGCTATTGGCACAGGCACAGATGTAGCCATTGAAGCAGCTGATGTGGTTTTGATAAGGGTAAGTGCCATGGCTTGACCTTTGAGGAGTATGAGACTGCCCTATGTGGTCAATGATAATGTCATAAAGTATATTGAGCATAACAATTCTGTCTTAAGTTCCATGCTATCAGCCATTAAGAGTTTAAGAATATGGAGTGGGATTATGGGAAGTCATGCTAATTTACCCCCTGACTTTCTCAACCCAGCTCATAAGCAAGTGAGAATTATAAGTTTCTGAAGTGAAGAAGAAGATTTAAGAATGGATTCGGAATAAAATGATCTTCAACAAATAGTTGCTGAGATTATTTTAAGTAGATTTAATCATAGTACCAGCATACACCCCTAAAAGTGTTTTCAGAACCCTGAGGAAAATTTTTGAAAAACACCTTCGGAAGCTGAGTCTAAGTTTTAGCATTATCTGAGATTTGTAATTAATTCACATATTACCCTAAGGTAGACGTAATCTTCAACATACACAGTATCAAATGTAAAAGTTACTGGTTAAGTTAGAGTCTCTTACTAATATCACAAATATTTCTGTTCTTAGAATGATCTTCTGGATGTAGTGGCAAGTATTGACTTATCAAGAAAGACAGTCAAGAGGATTCGGATAAATTTTGTCTTTGCTCTAATTTATAATCTGGTTGGAATTCCCATAGCTGCTGGTATGTGACTCTTAACTAGTACTGCTTTTTCCACTAAAGTTATTAGAGACCTAACATATTGGAAGCCTGTCTTCTTACTATTAGTTTTGAGCTTAGTTTTTGTTTGTAGCCTACTGGTATGGTGAGAGGTAATGTTAAAATCAATCATTTTAATTTTCAGTAATGTTTGTTATAGCTTAAGAATATATAAGCATTCTGACAGATTTATTTTTTTCCCTCCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTCATACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACTATAGGTGCCCGCCACAACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTATAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGCTGTGAGCCACCACTCCCAGCCTTCAACTTTGTATTTTGAAAAATTTCAAACTTGACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCATGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACGGAGGCAGTAGACTCGCTTGAACCCAAGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCGCCATCGCACTTCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCATACCTCCAAAAACATTGAAAAAAATGGTACAATAAAAATCTGTATGCCTTTCACCTAAACTCACCAACTGATGGTATTTTGCCACATTGCTTCATCTCTTTCTGCATATATTTGCACAGAGATATGTATTTGTTTGCTTATTAATTTTTTTCTAAATAGATTTACCTTTAATCTGACTACCCAAACCCAACACTGTTTGCAAGATTAATTCATGGAGCAAATGATTTTTAAAGAATTATACAAGTATTTTCCTCTAGTCTTTTTTTTACTCTACATCAGTTTTTGTCTTGTTACATAGTTGTGATTGTAGCTTATGGAGAATTTTCTGCTCTTCACTTAATATTCTATTATAGTCAGCTGGTATTTTTTTTAGGTTGAGAGACCAGATGACAGAGAGAGTGAACAAAGCAATATAACTGAGAAAAAAGAATTTAGAGTTATTTAATAAGCATCTGAGAATCTCCTAAACTTAGGGACCTGGTAGGAGTTAGTAA
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Task1_train_30461
Given this context: Chromosome X, gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
TCATCGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTACATGCATACACCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCGTGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACACGTGTGAGCCACCGCACCCGGCCTATTAACACCTTCTTATGTAAAAAATACAGAAGGATATAAAGTAAAAATGTCCTCTTTTCCCCATGCTCCCCATTCAGTCCTACTGCCCCTCACACTGCCACTTTTTCATATGCATATATGTGCATATACAGAGTACATATACAGTATAATTCTGGTCTTTTCAACATCAGATCATTTTGAACAGATTGTTCAGTAGTTTGCTTTTTTTACGTAACAGTATACTTTGGAGCTTCATCCATATCTGAACATAAAGTTATTTTGGCCGGGTTTGTTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGTGGGCAGATCACATGAGGTCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAGCATGGTGAAACCTTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTACAAAGTTACTTTATTCTTTCTATACTGAATTCCATGGTATGGATGTATCATAATTTATTTAACCATTTCCCTAATGATGGACATTTGGGTGGTTTTGAAAATTTTCTTTTTGCAAACAAGGCAATAATAAACATCTTTGGACATGTATCTTTCTGTACATGTGCAAGCCTGTCCAAGATAGAGCTAGACATGGAATTGCTAGACCAAATGATGCTCACATTTTGATAGATGCTGCCAGATGCCCTCCAAAAAGAGTTACAATTTACACACCAGCCACTGGTGTATAAGAGAGCTCATTTCTCCACATCCTTGCTATCACTAGATATTATCAGTCTTTTAAAATGTGGACATCTTGTGGGTGAAAACTGATGGCTTGTTATTGCTCAGTTATGTTTCACGTACTCATTATTTTTTAAATGAATTGAGTTTATTTTCATCACATAGGTTGGCATTACTAAGGTGTTTGCTGAAGTTCTACCTTCTCACAAGGTTGCTAAAGTGAAGCAACTTCAAGAGGAGGGGAAACGGGTAGCAATGGTGGGAGATGGAATCAATGACTCCCCAGCTCTGGCAATGGCTAATGTGGGAATTGCTATTGGCACAGGCACAGATGTAGCCATTGAAGCAGCTGATGTGGTTTTGATAAGGGTAAGTGCCATGGCTTGACCTTTGAGGAGTATGAGACTGCCCTATGTGGTCAATGATAATGTCATAAAGTATATTGAGCATAACAATTCTGTCTTAAGTTCCATGCTATCAGCCATTAAGAGTTTAAGAATATGGAGTGGGATTATGGGAAGTCATGCTAATTTACCCCCTGACTTTCTCAACCCAGCTCATAAGCAAGTGAGAATTATAAGTTTCTGAAGTGAAGAAGAAGATTTAAGAATGGATTCGGAATAAAATGATCTTCAACAAATAGTTGCTGAGATTATTTTAAGTAGATTTAATCATAGTACCAGCATACACCCCTAAAAGTGTTTTCAGAACCCTGAGGAAAATTTTTGAAAAACACCTTCGGAAGCTGAGTCTAAGTTTTAGCATTATCTGAGATTTGTAATTAATTCACATATTACCCTAAGGTAGACGTAATCTTCAACATACACAGTATCAAATGTAAAAGTTACTGGTTAAGTTAGAGTCTCTTACTAATATCACAAATATTTCTGTTCTTAGAATGATCTTCTGGATGTAGTGGCAAGTATTGACTTATCAAGAAAGACAGTCAAGAGGATTCGGATAAATTTTGTCTTTGCTCTAATTTATAATCTGGTTGGAATTCCCATAGCTGCTGGTATGTGACTCTTAACTAGTACTGCTTTTTCCACTAAAGTTATTAGAGACCTAACATATTGGAAGCCTGTCTTCTTACTATTAGTTTTGAGCTTAGTTTTTGTTTGTAGCCTACTGGTATGGTGAGAGGTAATGTTAAAATCAATCATTTTAATTTTCAGTAATGTTTGTTATAGCTTAAGAATATATAAGCATTCTGACAGATTTATTTTTTTCCCTCCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTCATACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACTATAGGTGCCCGCCACAACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTATAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGCTGTGAGCCACCACTCCCAGCCTTCAACTTTGTATTTTGAAAAATTTCAAACTTGACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCATGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACGGAGGCAGTAGACTCGCTTGAACCCAAGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCGCCATCGCACTTCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCATACCTCCAAAAACATTGAAAAAAATGGTACAATAAAAATCTGTATGCCTTTCACCTAAACTCACCAACTGATGGTATTTTGCCACATTGCTTCATCTCTTTCTGCATATATTTGCACAGAGATATGTATTTGTTTGCTTATTAATTTTTTTCTAAATAGATTTACCTTTAATCTGACTACCCAAACCCAACACTGTTTGCAAGATTAATTCATGGAGCAAATGATTTTTAAAGAATTATACAAGTATTTTCCTCTAGTCTTTTTTTTACTCTACATCAGTTTTTGTCTTGTTACATAGTTGTGATTGTAGCTTATGGAGAATTTTCTGCTCTTCACTTAATATTCTATTATAGTCAGCTGGTATTTTTTTTAGGTTGAGAGACCAGATGACAGAGAGAGTGAACAAAGCAATATAACTGAGAAAAAAGAATTTAGAGTTATTTAATAAGCATCTGAGAATCTCCTAAACTTAGGGACCTGGTAGGAGTTAGTAATGATGACATAAAAGAAATAAGTATTGTTTTCTTCTTGTTCTCTCTGGTTTGAGGGCCAAGGAAAGACAAGAAATGACATGAGAACAATTACAAAACTGTTTATCAGCAAGGACACACAAATACTGAGAGAACAAAGAACAAAAGAACAATCTAAGTCCAGTAAGATTAATTCATGGAGCAAGTGATTTTTAAATAATTATACAAGTAATATATGATCACCATAGAAAAAGTAGAAAAATATAAAGAAGCACATAAAAAGTTAAAAGTATGAGTCTATTTCATCCTCATCATGTGAGCAAACATTCTTATGTCTGTGAAAACCAAGTGTGGATGAGTTTGTAGAACATGAACTCCCATACGCTATTGGTTGGATTTTGAATCACTACAGCCACTTTGGAGAACAGCTGAGGAATATCCACGTAAAGTTGAAGATGTGCCCATGTTATGACCCAGTAGTTTCACCCCTAGGTATATACCCCACAGAAACTCTCAAACATGGACACGGGGAGACATGTACAAGAATGTTAACAGCAACACTCTGTTAGTGAAAAAAATGGCAACAACAAAAATCTCTACCACCAAGAGGATAAATGCTGAAGAAGTATCAAACAAAGAAATGATTTGTATGTATGTTAGAAACACATTAATAATCTGTTTAGTATTATCTACT
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Task1_train_30462
Gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Menkes kinky-hair syndrome
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Task1_train_30463
Here is a variant affecting ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Cutis laxa, X-linked
TACTGCTTTTTCCACTAAAGTTATTAGAGACCTAACATATTGGAAGCCTGTCTTCTTACTATTAGTTTTGAGCTTAGTTTTTGTTTGTAGCCTACTGGTATGGTGAGAGGTAATGTTAAAATCAATCATTTTAATTTTCAGTAATGTTTGTTATAGCTTAAGAATATATAAGCATTCTGACAGATTTATTTTTTTCCCTCCAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTCATACAATCTCGGCTCACTGCAGCCTCCATCTCCTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACTATAGGTGCCCGCCACAACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTATAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTAATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGCTGTGAGCCACCACTCCCAGCCTTCAACTTTGTATTTTGAAAAATTTCAAACTTGACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCATGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACGGAGGCAGTAGACTCGCTTGAACCCAAGAGGTGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCGCGCCATCGCACTTCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCATACCTCCAAAAACATTGAAAAAAATGGTACAATAAAAATCTGTATGCCTTTCACCTAAACTCACCAACTGATGGTATTTTGCCACATTGCTTCATCTCTTTCTGCATATATTTGCACAGAGATATGTATTTGTTTGCTTATTAATTTTTTTCTAAATAGATTTACCTTTAATCTGACTACCCAAACCCAACACTGTTTGCAAGATTAATTCATGGAGCAAATGATTTTTAAAGAATTATACAAGTATTTTCCTCTAGTCTTTTTTTTACTCTACATCAGTTTTTGTCTTGTTACATAGTTGTGATTGTAGCTTATGGAGAATTTTCTGCTCTTCACTTAATATTCTATTATAGTCAGCTGGTATTTTTTTTAGGTTGAGAGACCAGATGACAGAGAGAGTGAACAAAGCAATATAACTGAGAAAAAAGAATTTAGAGTTATTTAATAAGCATCTGAGAATCTCCTAAACTTAGGGACCTGGTAGGAGTTAGTAATGATGACATAAAAGAAATAAGTATTGTTTTCTTCTTGTTCTCTCTGGTTTGAGGGCCAAGGAAAGACAAGAAATGACATGAGAACAATTACAAAACTGTTTATCAGCAAGGACACACAAATACTGAGAGAACAAAGAACAAAAGAACAATCTAAGTCCAGTAAGATTAATTCATGGAGCAAGTGATTTTTAAATAATTATACAAGTAATATATGATCACCATAGAAAAAGTAGAAAAATATAAAGAAGCACATAAAAAGTTAAAAGTATGAGTCTATTTCATCCTCATCATGTGAGCAAACATTCTTATGTCTGTGAAAACCAAGTGTGGATGAGTTTGTAGAACATGAACTCCCATACGCTATTGGTTGGATTTTGAATCACTACAGCCACTTTGGAGAACAGCTGAGGAATATCCACGTAAAGTTGAAGATGTGCCCATGTTATGACCCAGTAGTTTCACCCCTAGGTATATACCCCACAGAAACTCTCAAACATGGACACGGGGAGACATGTACAAGAATGTTAACAGCAACACTCTGTTAGTGAAAAAAATGGCAACAACAAAAATCTCTACCACCAAGAGGATAAATGCTGAAGAAGTATCAAACAAAGAAATGATTTGTATGTATGTTAGAAACACATTAATAATCTGTTTAGTATTATCTACTCTAACTAATCCATACTTGTTTCTTAGGAGTTTTTATGCCCATTGGTTTGGTTTTGCAGCCCTGGATGGGATCTGCAGCAATGGCTGCTTCATCTGTTTCTGTAGTACTTTCTTCTCTCTTCCTTAAACTGTAAGTATGATAGCTTGCTCACATTTGTATTTTGTATTCCTGTTATCATCTAGTCATTCTTGGTAGGTTTTATTCTTGTATTGATCAATGATAAGCCCAAACCATTCTTAATGAGAATTATTATTAGCGGCCGGGCGTGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGTAATTTGAGACCAGTCTGGCCAATATGGTGAAACCCTATGTCTACTAGAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTAGACACCTGTAATCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCAACAGAGTGAGATTCCATCTCAAAAAAAGAAAAGAATTATTATTAGCTAACAGTAATAATTAGCTATGTAATTGTTACTTCGTGTACTTTATGCATAGCAACCACAAGCACTGAGTGGGATAAAATATAGTGCACTAATTCTGAGAAGTAGGGTTTCTGATGATATAACTCCACACAATTCGTTTCAAGCTATTTTCCTACCAGTGATCACCTTTATACATTTCATACCAAAACTAAGTGTGGATGAGCAAATCTTCTTTCTTTTCTGCATGTAGCGAGCATCTCATTTACTTTTGGTTATTTGAAACTAGCATACTTTTGCATATGTCCAGTTACAGGAAACCAACTTACGAGAGTTATGAACTGCCTGCCCGGAGCCAGATAGGACAGAAGAGTCCTTCAGAAATCAGCGTTCATGTTGGAATAGATGATACCTCAAGGAATTCTCCTAAACTGGGTTTGCTGGACCGGATTGTTAATTATAGCAGAGCCTCTATAAACTCACTACTGTCTGATAAACGCTCCCTAAACAGTGTTGTTACCAGTGAACCTGACAAGCACTCACTCCTGGTGGGAGACTTCAGGGAAGATGATGACACTGCATTATAAAAGGCCATGGAGAGTGCTGCCAGTTTAACTTGTCATGCACTGACACAGCATTCATGATGTTACCTTCACTTTTCAAAATATTGTAGAAGGATTTTTCTCATGCTCTTATATTAGGGATTCTATTTGAGTTGCGTTTATCTGTTGGCAAAAATATCTTTTTCAAGGCATCAGCTCTGAACCTAGCTTTATTTAAACTGAATTTCCAGTATATTTTTGTTTTCACTAACAACAGATAAGGTAGAGCAGTGAGGTTTACAACAAGCCCTACAATTAGAGATTGCTGAACTGCTGCTAAAGTGATTTTTTTTTTATTTGACCAAAAAAAAAAAGGCCCAAGAAGAAGAAAATGAAAAATTTGAAGATTTGAGAGCATGAAGATATTCATGCTTTTGAACTCAAAATATTGAAGATACTCTCAAGCCTGTATCCCTGCCCCACTGGGGAGCAATGACTTTCAAAGCACTGTGTATAAAACATCTAGTTTTAGAAGGGAAACAGTTGAAACTGTTTAAAAATAGATGTGCCTTATTTATTGCAGGCTTTCTTTCCCCCATTCTCCCTGCATCCTTGTCCTTGCAGGTGCTTTTTTAGATGCTCCAATATGTCTTCTTTTGTTATTTTCTTTCGAGCTAACCAAGTTTAGGTGGTTTTTCATTGATTAAAAATAACTGACAACTGTTCTAATATTTTGCTCCTTTTTAAATTTTGTAGCTCAAAAGACCTTAAAGGTCTGTAGGGTTCCCTGCCTCCCATCTTTCCACTGTTGTAAAAAGTATATCAAATTATTCCTTCAAGTTTCCTAGCTCTGTGCTCAGTTTCAGTTCACTCCTGCCAAGTTGGACTCTAAGTTATTCTTCATGTAGTCTGCTGATCTCAGTCTGGAAACTTAACATTATGAGCCTTTTCTGCTCAAAAAATTTTCAAAGATTAAAACTATTATACATATACAGGTCATATAAAATTACCTGGATTCACTAAA
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Task1_train_30464
The gene ATP7A (ATPase copper transporting alpha) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked distal spinal muscular atrophy type 3
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Task1_train_30465
A mutation on Chromosome X affecting PGK1 (phosphoglycerate kinase 1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
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Task1_train_30466
This sequence change occurs on Chromosome X, altering PGK1 (phosphoglycerate kinase 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
CATTTCCGGAAATCCATGGAGTTGATTAACAAAATGAAGCATTAGAAATAATAAAACTTGCTGATAAGGGATAGTCCTGAAAACTAATTGGTTCCATTGCACAAACTTTGTACCTGATACAGATTTTTAAATTTGATATAAAGGAGTTCTTATATCTGCTAAATATTAATAACATAAGATATTTTAAAAGTATAACTTTTTTAATCATTCCATTCTTTGCTCAGATGTCATCATATCAGACTTTCCCTGGCCATCCTGTCTAAAAATCTCCTCTACCATTGTTCCCCGGTCATTTTTGTCCTCAAAAGTAGGGGAACAAAAATGGGGAACAATGGTTTGTTTTTTTTCTGTATCTCACCATCTGATATATTACATGTACGCACACACACATACATGTTTATTGTCTCTCTCCATTAGAATTTCACTTCCATGAGAACAGAGAGTTTTTAAAAAAGTTTTCTGTTTCATTCTCAGAACCTGGAATGATGCCTGGCACAAAAGAAGCATTCAATAAATATTTGATGAATAAATAAATGCTTTTCTTGATCAATTTTAATTTCTTATAAACTGGCAAAATGGCAAGTTAGTAGCAGGTTTATAACAAAACTTTTAAATGTTTAAAGGGAGTTAATTTTTTGATTAATTTATAATGTAATGAATGTGATACATTATGGAAACCAAGCTCTAGACAGTGCAATTATTTTTTCCTACATAAAAAAGTGACTTAGGATCTATTAATAGGTGCAGAAAAGTTACTACATGTTTTTTATTTTTCCCCAAATTTCCTTTGATGGTTTCAAGATTTGAGAATTTTATGTATTTTCCATAGTCATATAAGAAGTGTTTTCAGGGGTCCCCAAGATCACCCACATATCTCATGATGATTTGCTAGGACTCAGAGTTGTTCTCATGGCTAAAGTTTATTACAGTGAAAGAATGCATGACAAGATTAGGAAGAGGAAAAGACATGGGGGAGTCTAGAGAAATCCATGGGCTTCCAGTTTCCTGTGAGGGGACACATCAAGTGTTTTCCTTTCTTCAGCAGTGAAAAATGCAGTAATTGTCTGCAGTGTTTCTGCCTGGAGAAGCATGCTAGAGACTCAGATCCCAAGATTTTTGTTGGGAACTGGTAACATAGGGATCCTCTGCCTAGCAACTACCAAAATTACAAACTTCTGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTATTCCCAGCAGTTTGGGAGGCTGAGGCCTGCAGATAACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACAACATGGTAAAACCCCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAGTTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAGGAAGATGACCTAAGCCCCTGGGGAGGTTGAAGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCTCTCCACTCCAGCCTGTTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAACAAAAAAAGGAAAAGAAAAAAAAAATTCTAGACTTCTAGAGTGGGGCAGGTGTTCAGCATAAATCACCATGTTTGTATAGACGGTCTAGGAAGAGTGAATAGCCCTTGTTGGTCTTGTCAGTTAACTTTGAAAGCCAAGTTCCCAGATACCAGCCAGGATCTAATCTTGCAGACAGGTCCTTCTGTAGATAGTAGCCTCAGGCCTGCTGTGTTAACTCTTGTCTGTGAAAGGGGCAGATACATAATGAGATTGTACAATCCTAGGTGGAGGGTTGGCATTGCATTTAACTTCTTAAGGACCACCATTGAATTACTGATAGTAGATTTGAAGGAACTTGGAGAAGAAAAGGAGCTTTATGCTTTATGAGGTTATCAATAAGCTAGTTCCCACTAATTTCTAGGAGTAACTTCATTCTGTTTGTTGTCTCTCTTTGGTTGCAGGATTAAGGCTGCTGTCCCAAGCATCAAATTCTGCTTGGACAATGGAGCCAAGTCGGTAGTCCTTATGAGCCACCTAGGCCGGCCTGATGGTGTGCCCATGCCTGACAAGTACTCCTTAGAGCCAGTTGCTGTAGAACTCAAATCTCTGCTGGGCAAGTAAGTGCCAGGCTCTGGTGCTGGTAGACTTTGTGGCGGGGGAAGTTGTCAAGCACGTTGTTACTGGTTTTTAACTTTCATACTGCTCAAGTGTCTTCATCTCTTCCTCTTCTCAGGGATGTTCTGTTCTTGAAGGACTGTGTAGGCCCAGAAGTGGAGAAAGCCTGTGCCAACCCAGCTGCTGGGTCTGTCATCCTGCTGGAGAACCTCCGCTTTCATGTGGAGGAAGAAGGGAAGGGAAAAGATGCTTCTGGGAACAAGGTAGGACCTGTGATTTTGACATTATTGGGGGTGAGGGCCTGAGTCTGTAAGAGACTGTGGTTGAAGAATAGAGAAAGCTCATTTATTTTAACTTAGACACCTTTTATTGAAGCATACAATGCCGACACAGCTTGATGGGTTATCTCAAAGTAAACACACTTGTGTAACCACCACCCAGGTCAAGGAATAGAATATTACCAGCATCCCAGAAGCCCTCCTTCATGTTCAGGTGGTGTTTAAATATGTTTGAAAAATATGTGAACACCTTTGAGGTGAAAGAGTATTCAGTGAATATGATGGTCATGATGATGTCACCTTGGATTTAAGGCATTTTCTTAAGATGTGTAAAGTATGTTCCTTTAAATCTCTCTTTAAGATAGAGGTACAGGTATCGACTTATTTCATAAAGAAACTAAGTCTCAAAAAAAAAAAAACTTAAGTTTCTGAAAGGCAGTCATACGATTAAAGTTAGAGGCAGTGGTGCTGTTGGTCTTTAGAGCTCAGCCCATTCAATCAGCAAACTTTTTCTATAAATGGCCAGATAGTTAATATTTTAGGCTTTCTGTGTTGTGCAGTCACTTCCATCTGCATATAGTCTCTGTTGGAACTACTCACCTCTGCCGATGTTGTGCAAAAGCAGCCATAGATAACTCACCAAACAGATTACTGTGAACTGACAACCAGAATTCAAATATTCAATGATAAAACTGGCTCTTTGCAGATGATTTTGAATTTGCCCATTGACTAGAAAGGAAGCTGAAGGCATTTTTTAGTACTTTCCACTATTCTGGTCTTTAGTATCTCGGAGAACAAGATGCTCTGAGTCTAGTGTCTCAGTCTCCTTTGGCTTCTCACATTTATTAAGGTCATTGGGAGTGCCTGCTTTCAAGCAGTTTCTTTTTTTAGCACCAAAGATGCTGGTCTTGCCTTATCCTGCTTTTGGCATGGTCTTGCTGCAGTATTAGGAGTCAAATGCTGACCTAAAATTTGGTGTCCTTTTAATCTGGAACTCATGATGCATGAACTCTAGGGCTTAGAAGTGGCAGGAGGCAAAGGGCATATTGAAGCAAAACTTTTTATTTAGGAAATGATGAGCTGACTATGTAGTCTATGACTTTTTTAGTAAACTGACTTGACATTCACTATCTAATGGCTTTTAATACCTGAAATTTCAGGAGTCAGTCCCAAGTTCAAAATGGATTAAAAAAACAGTGAGGCTGGGTGCGGTGCCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCTGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTTTCTACTAAAAATACAAAAAAGTCGGGCATGGTGGCAAGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGTTTGCAGCACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAACCACAAAAACAAAGTGAGGATATGAGGACATAAACATTTTCCCTTTATCCAAAGTGCCCACATTGATCTTTTAAGGGCCTTCTCTTTCTTCTAGTTATTTGCAGATCAGTAAATGAGAAATGGGTTCTGATTGATATTATTTCCATGGCACCTTTTTTCATGAAGAGCTTTCAATTTACCCTGTTTTTCCTTAAATATCTTTTTAAAGAGACAGGGTCTTGTTCTGTTGCCCATGGTGGAGTGCAGTGGCATGACATTAATTATTGCAGCCTCAAAC
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Task1_train_30467
This gene mutation involves PGK1 (phosphoglycerate kinase 1) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
AATACCTGAAATTTCAGGAGTCAGTCCCAAGTTCAAAATGGATTAAAAAAACAGTGAGGCTGGGTGCGGTGCCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCTGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTTTCTACTAAAAATACAAAAAAGTCGGGCATGGTGGCAAGTGCCTGTAATTCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGATGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGTTTGCAGCACTGCATTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAACCACAAAAACAAAGTGAGGATATGAGGACATAAACATTTTCCCTTTATCCAAAGTGCCCACATTGATCTTTTAAGGGCCTTCTCTTTCTTCTAGTTATTTGCAGATCAGTAAATGAGAAATGGGTTCTGATTGATATTATTTCCATGGCACCTTTTTTCATGAAGAGCTTTCAATTTACCCTGTTTTTCCTTAAATATCTTTTTAAAGAGACAGGGTCTTGTTCTGTTGCCCATGGTGGAGTGCAGTGGCATGACATTAATTATTGCAGCCTCAAACTTGAGGGCTGAAGTGATCCTCCTGCCTCATCCTTGTAGGGAGCTAGGACTACAGGCACATACCACCATGTCCAACTGACCTTTACTTTTTTTTTTTTTTCCTGGTAGAGACGGGGTCTTGCTATGTTGCCCAGGCTCATCTCGAACTCCTGGGCTTAAGTGATCCTCCCATATTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGAGCTACTGCCCCTGGCCTCCTTAAATAGTTCGTAAATGGAGGGGTTATTATGCCTTTTTGATAGAAGGGAAAATTTCAGAGCAACTTCCCAAAGGTGACACAATGAATTAGTGTCAGAGCTGGACATAGAACTCAGGTCTCCTTACATTTGAGCATTGTTATCATTACTACATGTGTCATCTTCCAATCACTAGTGGCAGATGTTATTGTAGTCTACAGAGCTTATGGGAGTGCCACAATCTTCAATTTTAGCATTAGTGCCTCTGCAATTCTTTGGATCTTTAGGGAAAAGCCCCATTTTTTATGGCAGTCCCCTTCACCTCCTTGATACATAGGAGCATAGGAGTGGGCAGTGACTTAAAATGAACATCTGCTTTGTGCTATGTACTCTTCTGTGTCCTGTCCCCTTTCATCTGGCTTGCTTCCTGTGCCTCTTTGCTTAATCTCCTGCCAGAGACTCTCTGGTTTGCTTATCCTCCCATCTTGCTTTCTGTCCCCTTTGGGGTATGCCTTGATGGCAAGCTGACATTTTAAAGCTCTATGTTTAACTTCTACATTTTCTTCCTCTCTTTTTGTAGAAGTATATTTCTTGTTTTCTCAGATGCCTAGCTTCCAGAGAAGGTCATAAAATACCTTTTTGTCAATGTGAAGTGTTTCTGAGGTTCTTTTCTGTTGTCATGTTTCCATCTGCCTTCTCTGTCCCAGCTTGCCCTTGTTGCTTTTATGAGGAATATGTGTGAGAGCCCCTTGCACTTCGCAGAAAGGCCTTGGTAGCCAGCAGCTTGAGTCAAGTATGATACTATCACAAGGAGAATGTTTAAAATGAGGAACTAAGTCAAGGAGAGGGAAGGATAATCAGAACCTTGAGCTGAAGGCTGGGGAGAGGCTAGTGGGGTGTGGTTAACTTCATGTGATTAGAGGTAAAGCCATCGTTCAGGAATATTAGGTTTGCAATTTGAGGGAAGTTAAGGGAGAGCAGAAACATGCAGAAATGACCAAAGTATCTGGAATATTTGGAAGAAAGAACACATCCTACTGCTGGTTGTAAAAAATCGCTGTCCCACCTACTCAGGGTCTTTAGAGATGTTCAAGAGGACTCTTGGTGTATGAAATGCTTTTATAGTTGTCTTTGGAGCCATCACATTTTCTGTTTTTGTTTTTCTCTATAGGTTAAAGCCGAGCCAGCCAAAATAGAAGCTTTCCGAGCTTCACTTTCCAAGCTAGGGGATGTCTATGTCAATGATGCTTTTGGCACTGCTCACAGAGCCCACAGGTACCAAGAACCTTGTAGACTACCACACTGAGAACAGTATTCCTATTTACTTGAGTAGCCCAAGCTCTGGGTTGTTTTTGGAGAGTTTTGTATTATACTGTAATCCTTTCAGCTTCTCTAATTGGAACTGCCACTATGGCTCTTGTTGAGTAGCTCTCATCCAAAGAGGAAATAAAGGTAAAAAAATGTTGGTAATTGTAGGGCTTTTTGTGGAGTTTCAGGAAGAGGTTGCTCTTTCTCACCTTAGATATTTTGTACAGAGTTATCCTTTTATGAACGTTATAAGATCAGACTCTCATGCTGTCAGTAGGAAGCAAATTGAGGAATCCTCTTCTGCTATCATCAACCGGCCAATTACTTACTGTGATTTGCCCTTTGGCCTGCCTGAAGAGTGTTAACTGGGTATCTTAAATTCTACCTAAGTTCATTACTTTTTTACTCTTTCCCTTTGACCTTGCACTATTAGTTAAAAATCTTATCTTGTACCTAAGTGTTTTTTGTTGCAATGTAGGGATGAAAACCATGATTTCTTGCAGTCCAGAAGTAGAAATATTTTAGTGATAAGGAGCTGGCCTCTAGGACTAGGAGGAATGATAGGGATTGACTAGAATCTGAATGTCTTTGATCTTTTCTAGCTCCATGGTAGGAGTCAATCTGCCACAGAAGGCTGGTGGGTTTTTGATGAAGAAGGAGCTGAACTACTTTGCAAAGGCCTTGGAGAGCCCAGAGCGACCCTTCCTGGCCATCCTGGGCGGGTATGAAGAACTCTTTAAGATCATGCTTTAAGTATTGTTTGCCTGGTAGTAGGCCATAACTTGGGTGGTTTATTGTCATATAGCTCAGTCACACTGGGTAACTGAGGAGAATTTAATAAAGGAACTACAGGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGGCCCAGGCAGGAAGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGATGGGCCCAGACAACAAAGTGAGATCTCATGTCTACAAAAAAAAATTAGCTGGGCGGTGGTGGTATGCACCTGTGGTCCCAGTTACCAGAGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTAGAGGCTGCAGTGCACTGTGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCGTTTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAACAAACAAACGAACGAACTACATACAGAGGTGTGGGTAGGGTTCAGGGAAACCACAAAGGGACAGTACAGTAATTTGGGGCTACCAACAGGCATCACCATTTCTATGCCTGAAGGGACAAAGGGAGGGGAATGGTTATCAGAATTCAGAGAGGAAAGTTGGTGTGGAGAGAGCTATCTGATGGGAACTGTAGCCTTTGGTCAAAGGACACAAGATCTGGTAGGGAGGGGGAGCCAGGGCAATAAATATTCTGATCTCCTTTCAGTCTCCTGCTGCTGCACCCCCTCCCACCCTCAATTTGGCTGAAACCCAAATGGAAGCCAGAGCGCAAGAAAGCTCCTTGATGTAGTCCATGCAGGTCCTCCTCCTGTGATGCAACAGGGTAGAGAAGGATAGAAGATGGCTCTGCAGGGAAGAATGGGAAAGATCCACCATAGGTGCTCATTTAGCAATTTTGAAGTGCTTGAGCCTTATAACCTGGCAGGGTATAACTATATAACCTGGCAGGGTATAACCATATAATCTGGCAGGGTATAACCATATAATCTGGCAGGGTATAACCATATAACCTGGCAGGGTATAACTATGAAAACCTCTTCATATGTGTTTAATATATAATTTAGACCTCATTTCTCCAGATTACATACCTATTTTATCTTTTCTCCTATAGGGAAAGGCAGCAAGTAGATAATGATTTTCCAATGGGTTAGTTAAAAATAGAAATTTCAGAATTGAGGGTTGAGAGGAGGATAAATTTTAGGTGAGAGAGCTAGCACTGCTTGGATAAGACAATTTCCTGTGACTTGGTGTGG
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Task1_train_30468
This gene mutation involves PGK1 (phosphoglycerate kinase 1) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_30469
Assess the clinical impact of this variant on gene PGK1 (phosphoglycerate kinase 1), found on Chromosome X. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
GATCCTCCCATATTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGTGTGAGCTACTGCCCCTGGCCTCCTTAAATAGTTCGTAAATGGAGGGGTTATTATGCCTTTTTGATAGAAGGGAAAATTTCAGAGCAACTTCCCAAAGGTGACACAATGAATTAGTGTCAGAGCTGGACATAGAACTCAGGTCTCCTTACATTTGAGCATTGTTATCATTACTACATGTGTCATCTTCCAATCACTAGTGGCAGATGTTATTGTAGTCTACAGAGCTTATGGGAGTGCCACAATCTTCAATTTTAGCATTAGTGCCTCTGCAATTCTTTGGATCTTTAGGGAAAAGCCCCATTTTTTATGGCAGTCCCCTTCACCTCCTTGATACATAGGAGCATAGGAGTGGGCAGTGACTTAAAATGAACATCTGCTTTGTGCTATGTACTCTTCTGTGTCCTGTCCCCTTTCATCTGGCTTGCTTCCTGTGCCTCTTTGCTTAATCTCCTGCCAGAGACTCTCTGGTTTGCTTATCCTCCCATCTTGCTTTCTGTCCCCTTTGGGGTATGCCTTGATGGCAAGCTGACATTTTAAAGCTCTATGTTTAACTTCTACATTTTCTTCCTCTCTTTTTGTAGAAGTATATTTCTTGTTTTCTCAGATGCCTAGCTTCCAGAGAAGGTCATAAAATACCTTTTTGTCAATGTGAAGTGTTTCTGAGGTTCTTTTCTGTTGTCATGTTTCCATCTGCCTTCTCTGTCCCAGCTTGCCCTTGTTGCTTTTATGAGGAATATGTGTGAGAGCCCCTTGCACTTCGCAGAAAGGCCTTGGTAGCCAGCAGCTTGAGTCAAGTATGATACTATCACAAGGAGAATGTTTAAAATGAGGAACTAAGTCAAGGAGAGGGAAGGATAATCAGAACCTTGAGCTGAAGGCTGGGGAGAGGCTAGTGGGGTGTGGTTAACTTCATGTGATTAGAGGTAAAGCCATCGTTCAGGAATATTAGGTTTGCAATTTGAGGGAAGTTAAGGGAGAGCAGAAACATGCAGAAATGACCAAAGTATCTGGAATATTTGGAAGAAAGAACACATCCTACTGCTGGTTGTAAAAAATCGCTGTCCCACCTACTCAGGGTCTTTAGAGATGTTCAAGAGGACTCTTGGTGTATGAAATGCTTTTATAGTTGTCTTTGGAGCCATCACATTTTCTGTTTTTGTTTTTCTCTATAGGTTAAAGCCGAGCCAGCCAAAATAGAAGCTTTCCGAGCTTCACTTTCCAAGCTAGGGGATGTCTATGTCAATGATGCTTTTGGCACTGCTCACAGAGCCCACAGGTACCAAGAACCTTGTAGACTACCACACTGAGAACAGTATTCCTATTTACTTGAGTAGCCCAAGCTCTGGGTTGTTTTTGGAGAGTTTTGTATTATACTGTAATCCTTTCAGCTTCTCTAATTGGAACTGCCACTATGGCTCTTGTTGAGTAGCTCTCATCCAAAGAGGAAATAAAGGTAAAAAAATGTTGGTAATTGTAGGGCTTTTTGTGGAGTTTCAGGAAGAGGTTGCTCTTTCTCACCTTAGATATTTTGTACAGAGTTATCCTTTTATGAACGTTATAAGATCAGACTCTCATGCTGTCAGTAGGAAGCAAATTGAGGAATCCTCTTCTGCTATCATCAACCGGCCAATTACTTACTGTGATTTGCCCTTTGGCCTGCCTGAAGAGTGTTAACTGGGTATCTTAAATTCTACCTAAGTTCATTACTTTTTTACTCTTTCCCTTTGACCTTGCACTATTAGTTAAAAATCTTATCTTGTACCTAAGTGTTTTTTGTTGCAATGTAGGGATGAAAACCATGATTTCTTGCAGTCCAGAAGTAGAAATATTTTAGTGATAAGGAGCTGGCCTCTAGGACTAGGAGGAATGATAGGGATTGACTAGAATCTGAATGTCTTTGATCTTTTCTAGCTCCATGGTAGGAGTCAATCTGCCACAGAAGGCTGGTGGGTTTTTGATGAAGAAGGAGCTGAACTACTTTGCAAAGGCCTTGGAGAGCCCAGAGCGACCCTTCCTGGCCATCCTGGGCGGGTATGAAGAACTCTTTAAGATCATGCTTTAAGTATTGTTTGCCTGGTAGTAGGCCATAACTTGGGTGGTTTATTGTCATATAGCTCAGTCACACTGGGTAACTGAGGAGAATTTAATAAAGGAACTACAGGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGGCCCAGGCAGGAAGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGATGGGCCCAGACAACAAAGTGAGATCTCATGTCTACAAAAAAAAATTAGCTGGGCGGTGGTGGTATGCACCTGTGGTCCCAGTTACCAGAGAGGCTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTAGAGGCTGCAGTGCACTGTGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCGTTTCTAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAACAAACAAACGAACGAACTACATACAGAGGTGTGGGTAGGGTTCAGGGAAACCACAAAGGGACAGTACAGTAATTTGGGGCTACCAACAGGCATCACCATTTCTATGCCTGAAGGGACAAAGGGAGGGGAATGGTTATCAGAATTCAGAGAGGAAAGTTGGTGTGGAGAGAGCTATCTGATGGGAACTGTAGCCTTTGGTCAAAGGACACAAGATCTGGTAGGGAGGGGGAGCCAGGGCAATAAATATTCTGATCTCCTTTCAGTCTCCTGCTGCTGCACCCCCTCCCACCCTCAATTTGGCTGAAACCCAAATGGAAGCCAGAGCGCAAGAAAGCTCCTTGATGTAGTCCATGCAGGTCCTCCTCCTGTGATGCAACAGGGTAGAGAAGGATAGAAGATGGCTCTGCAGGGAAGAATGGGAAAGATCCACCATAGGTGCTCATTTAGCAATTTTGAAGTGCTTGAGCCTTATAACCTGGCAGGGTATAACTATATAACCTGGCAGGGTATAACCATATAATCTGGCAGGGTATAACCATATAATCTGGCAGGGTATAACCATATAACCTGGCAGGGTATAACTATGAAAACCTCTTCATATGTGTTTAATATATAATTTAGACCTCATTTCTCCAGATTACATACCTATTTTATCTTTTCTCCTATAGGGAAAGGCAGCAAGTAGATAATGATTTTCCAATGGGTTAGTTAAAAATAGAAATTTCAGAATTGAGGGTTGAGAGGAGGATAAATTTTAGGTGAGAGAGCTAGCACTGCTTGGATAAGACAATTTCCTGTGACTTGGTGTGGTGATCTAGGTAGCAGTCTCTTTATGGCTGGAGGCCCATTACCCTTCTATGAGCAGGGTTTTTTCCCCCAGGGGAGTGAACATACTATCTCCTGATGAAAATTGACTCTGGAGTTGGGTGTCAATTTCAGGTAGCATAGTTGCTTATACTGTTTGGCTCTGTGTCTCCACCCAAATCTCATCTCGAATTATCCCCACGTGTTGTGGGAGGGACCTGGTGATTGGATCAAGGGGGCGGTTCACCCCATACTGTTCTTGTGATAGTGTTGTTTGGCAGTTCCACCCTCGCTCGCCTCTCTCTTGCCACCATGTAAGATGTGACTTGCTTCCCCTTTGCCTTCCGCCACGATTGTAAATTTCCTGAGGCCTCTCCAGCCATGCGGAACTGTGAGTCAATTTAACCTTTCTTTATAAATTACCAAGTCTCAGGTAGTCCTTTATAGCATTGTGAAAATGGGCTAATACAGTTGCTTTCTAGGCTTTATGAGCCCAGTTTCAGAGTCTTAAAAATAACTCAGGTAGATACAGGTTGTTGTGTCTTGTTCTTGGAAAAAGGTATCTATTCCTGGGCTTTGTTCTTCAACTTTCTGTAGACCTGGAATATGGGAGTGAGTGCCACCTAGTGCTACCTTATGGTTAGGTTTTTAGGTTCAGACTGAAATAGCTGTTACGGGGAATTGGATGTGAGATTTTTTTGCCACCTTTCTTGTAGTGTAGTTTCCCTAGGCCATTAACAGTTTTTGGGAAAACTTTTATATTTTATTAAACAAACTTTATTGTA
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The variant affects gene PGK1 (phosphoglycerate kinase 1), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
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Task1_train_30471
With a mutation on Chromosome X in gene PGK1 (phosphoglycerate kinase 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
CCATGCATTGCCTTTGGCTGTTAGGTATCTCTTGTAATAATCTCCTATTTATTACTTTCATTCTGTTGATTTGTTGAAGAAACAGGCATTTGAGCTGTAAGCTATTCTTTAGAAGAAATTGAACTCCTTTCTAACTGCTTTCTTCCCTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTAAAACAATCTATCTTTACCCTTGGTGGTAACCAATCTTTACAACTGAAATAAATAGTAAATAGTTTCTTGCCATCTGTTCACCCACATCACTGTTGTTTCATACCTCCTTTTCACAAATCCTAGCATAGGGTTTCTCACTGGATAGGCATTATCTTGTTTATTGAATGAAGAAGGAAACAGACACAAGGTGGTTTGTCCACGTAAGTGGGATTTAGTTATATGGGAATGTTTATGGAAGGCAGGCTATTACTTTGTTTCTCTTTAGTTTGGATCTTTTTTGTCTCATAGGGAGATGCAAGATACATGTGTATTTATCTTATTTCCATGTACTAGAAAATAAGATCCCAAAGGGTAGGGATCTTTCTGTTGCCTTTGCCCTGTGATGTTTCTCAAAGACCTAGAATAGTGCTTGGCACAGAGTAGGTGCCCAGTAAATGTGTTGAATTGGGTGACCCAATAAAAATAAATGCCATAAAGAAAATGTCCCAGGCTGGGCATGGTGGCTTAGGCATGTAACCCTAGTGCTTTGGAAGGCCAAGGCAGGAGGATCACTTGAGCTTAGGAGTTTGAAACTAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAAAAATTTAAAAAGAAAAATTATCCAGGGGTAGTGTTGTACGCCTGTGGTCGCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAAGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGTTCCAGGTTACAGTGAGCTATGATTGTACCACTGCACTCCAGCCTCGGCAACAGAGTGAGACTTTGTGTTGAAAAGAGAGAGAGAAAAAAATGTCCCAGCAACTGAGCATAGGGTATGACTTTAGGAATATATATTTTTGTTCAGTATATATTTATTTAGTATACAGTCCAGTCAATCCCTGCTCTAAGGTTAGGATAATTCTGAGTGGCTCTGGGATCCCACAATTAGCAATCGTGCTTAGATACAATTAGCAATCTTGATGCTCTGAATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGGAATGTGCAAAATAGATGTGGAACCCATAGTTTCCTTAGACAAGAGTAGGTCTTCTGAGCCCTGCTTAAAAAAAGAATATGGATTTAAATCTGTTGTCCATCAGCTTCTAGGTAGAATTAAAAAAAAATGTATTGATGGTAAGTGGGGTGAGGAATTTTTAAAAAGATACACTGATGTCTGGAGCCATACCTTAAAAGGATTTCTTAGAAATGGATTGAGTTTTTGGGTTGGAGAAACATAGGGCAAAGTTAGGCAGTACTTTTGTCACTTTGAGACTTTCTCTGTTCCTGTGCCTTGAAATAGAAACTCAGTTTCTATGTAATACCACTTCTCTAGTCCATTCTTCTTTAAGTGATGATTCTTGCTTTCTCTTGTAGAGCTAAAGTTGCAGACAAGATCCAGCTCATCAATAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGGTAGGAAACAAATGCCAAGTGGATGTGAAATAGCTCTCCATGATAATAGCAGGTTGTATAAATGTAAAAAGAAAACAGTCTTTTGACATGAGCCCTGAAAATTCCCATTTTTATTTATTTTGGCAAGTCTTTCGTCTTTGCATTGTTCCTTTATATTGTATTGTGTCTGGTTCCTGTCTGCTTTGTGAGGCAGTCTTGTTCTTAGTATAGATGCTGACCTCCATCATTTTGGCTCCCCTGTGTAGATTGGCACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTAATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTCACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCCACTGTGGCTTCTGGCATACCTGCTGGCTGGATGGTGAGTCACTTGAGTGGGTTGGTAGTGTGAGTGAACAGAAACTCTGTGGTGTCATTTATTCATTGATTCAGCCAATCAACAAGCATTTTAAAACAATCTCTATAGGAGATCTGTCAGAGAGGGCTCTGCATGTTGCAGTGAGTCCCTCATGGAAGAATCCATGGGAGAAAAGCAGTGCTATTGGATTACTGGCCTTCAGTAATGCAGTAATGTGTTGCAAAACTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTAACCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTCATAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGATCTCAATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCTGCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCATTTTTAGTTTTATCTGTTTTTTCTTCATCTGTTTAATGTGTATTAAGTACTTACTGCGTACTGGAGATAGTGTCATGTACTTTCATGGTTTGGGTTGTTTTGGATTATGTTGCTATCTAGAAAGCTATATAAGAAAACTTTCTCATATGAAAAAATTAAGTATACTGATTACAAGCAGGGAGAAATGTAAGTGTATATTAAAGACTAATATAGTTGATTTTAGGGTGCTCCAAATATCATTTTGATTGCTGTATAAAATTGTATCATGTTTTTACATGCTAGTTTGCTTATTTTTCTTTTCAGGCATTCACGTATTATTTAGTTCAGTGTTTCTCAAAGTATGTTCCTAAGACCAGCAGTATCAGTATCATTTTTGGAACTTGTTAAAAATGCAAGTTCTTGGGTCCCACCCCAGACCTACCGAATCAGGAACTGAGGGTGGGGCCAAACAGTCTGTTTGAATAAGCCCTCCTGGTGATTCTCATGCATGGCAAAGTTTGAGTACTACTGATCTAGTTTACTGTCATTCCCAACACTATTGACATCTGTTGTTTTGTGGGGGACTGTTGAATTGTAAGGTTGTTTAAAGCATCCTTGGCCACTAGATGCCAGTAGCACCCTCCCAAGTTGCAACAACAATATTTCTAGACATTGCCACATGCCTATCTATTATGAAGGGGCAGAACTGACCTGGTTGAGAACCATTGATCTAGTTTTCACTAACATAAATAGTGTGGCTAAGAATGTCTTTATTAAATAACTTTTGAGGTTTTCCGTTAGACTTGATCTTCCATACAGTAGAATTTTTGAGTATAAAGGGCATGAACAGGTTTATAAAGACTGAAGGGTACTATTTGTTTCTAGAAGAAACTTTGGTGTGCAGCCCTGAGTTCTGGTCTTGGTGGAGGTGGTGTTTAAGTAGCTTTTCTTGATAGCTCATCTTCTCTTTCACCTCTACCCCTCAGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAAAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCACTCGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGTCCTGTGGGGGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGGGGAACCAAAGCTCTCATGGATGAGGTGGTGAAAGCCACTTCTAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTAAGCGGTCCTATACAAAGCTAATACCCATATAAGCTGGCAGAATTCTGATCAGAGGAAGGTGGAATGGAGAACTTCTTCTATGTCTCTTTATTCTGGGTAAATGTTAAGAGGTAAACAGGTAGGTAATTTACAGAGGAGCCTCTTGGTAAGATAGAGTTGGGGGTTTATCAGCTACCTTTTGGGTTGGGGAGCACACTGCCTTACAGTTTTGGTGCCAATCCCTTTTTTTTCTTTTCTCTCTTTTCCCTTTTTACCTGGCTTTCATTCAACAGGTGGTGGAGACAC
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Task1_train_30472
This mutation occurs in PGK1 (phosphoglycerate kinase 1) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
AGCTAAAGTTGCAGACAAGATCCAGCTCATCAATAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGGTAGGAAACAAATGCCAAGTGGATGTGAAATAGCTCTCCATGATAATAGCAGGTTGTATAAATGTAAAAAGAAAACAGTCTTTTGACATGAGCCCTGAAAATTCCCATTTTTATTTATTTTGGCAAGTCTTTCGTCTTTGCATTGTTCCTTTATATTGTATTGTGTCTGGTTCCTGTCTGCTTTGTGAGGCAGTCTTGTTCTTAGTATAGATGCTGACCTCCATCATTTTGGCTCCCCTGTGTAGATTGGCACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTAATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTCACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCCACTGTGGCTTCTGGCATACCTGCTGGCTGGATGGTGAGTCACTTGAGTGGGTTGGTAGTGTGAGTGAACAGAAACTCTGTGGTGTCATTTATTCATTGATTCAGCCAATCAACAAGCATTTTAAAACAATCTCTATAGGAGATCTGTCAGAGAGGGCTCTGCATGTTGCAGTGAGTCCCTCATGGAAGAATCCATGGGAGAAAAGCAGTGCTATTGGATTACTGGCCTTCAGTAATGCAGTAATGTGTTGCAAAACTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTAACCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTCATAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGATCTCAATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCTGCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCATTTTTAGTTTTATCTGTTTTTTCTTCATCTGTTTAATGTGTATTAAGTACTTACTGCGTACTGGAGATAGTGTCATGTACTTTCATGGTTTGGGTTGTTTTGGATTATGTTGCTATCTAGAAAGCTATATAAGAAAACTTTCTCATATGAAAAAATTAAGTATACTGATTACAAGCAGGGAGAAATGTAAGTGTATATTAAAGACTAATATAGTTGATTTTAGGGTGCTCCAAATATCATTTTGATTGCTGTATAAAATTGTATCATGTTTTTACATGCTAGTTTGCTTATTTTTCTTTTCAGGCATTCACGTATTATTTAGTTCAGTGTTTCTCAAAGTATGTTCCTAAGACCAGCAGTATCAGTATCATTTTTGGAACTTGTTAAAAATGCAAGTTCTTGGGTCCCACCCCAGACCTACCGAATCAGGAACTGAGGGTGGGGCCAAACAGTCTGTTTGAATAAGCCCTCCTGGTGATTCTCATGCATGGCAAAGTTTGAGTACTACTGATCTAGTTTACTGTCATTCCCAACACTATTGACATCTGTTGTTTTGTGGGGGACTGTTGAATTGTAAGGTTGTTTAAAGCATCCTTGGCCACTAGATGCCAGTAGCACCCTCCCAAGTTGCAACAACAATATTTCTAGACATTGCCACATGCCTATCTATTATGAAGGGGCAGAACTGACCTGGTTGAGAACCATTGATCTAGTTTTCACTAACATAAATAGTGTGGCTAAGAATGTCTTTATTAAATAACTTTTGAGGTTTTCCGTTAGACTTGATCTTCCATACAGTAGAATTTTTGAGTATAAAGGGCATGAACAGGTTTATAAAGACTGAAGGGTACTATTTGTTTCTAGAAGAAACTTTGGTGTGCAGCCCTGAGTTCTGGTCTTGGTGGAGGTGGTGTTTAAGTAGCTTTTCTTGATAGCTCATCTTCTCTTTCACCTCTACCCCTCAGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAAAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCACTCGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGTCCTGTGGGGGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGGGGAACCAAAGCTCTCATGGATGAGGTGGTGAAAGCCACTTCTAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTAAGCGGTCCTATACAAAGCTAATACCCATATAAGCTGGCAGAATTCTGATCAGAGGAAGGTGGAATGGAGAACTTCTTCTATGTCTCTTTATTCTGGGTAAATGTTAAGAGGTAAACAGGTAGGTAATTTACAGAGGAGCCTCTTGGTAAGATAGAGTTGGGGGTTTATCAGCTACCTTTTGGGTTGGGGAGCACACTGCCTTACAGTTTTGGTGCCAATCCCTTTTTTTTCTTTTCTCTCTTTTCCCTTTTTACCTGGCTTTCATTCAACAGGTGGTGGAGACACTGCCACTTGCTGTGCCAAATGGAACACGGAGGATAAAGTCAGCCATGTGAGCACTGGGGGTGGTGCCAGTTTGGAGCTCCTGGAAGGTGAGGGTCTTCTGTTTTTTGGCTTGTTTGGGATAAGGGTGGACTGTGCAGTGAGAGGTGGGTAGAATGGAGTGGAGAAAGTTAGAAGGTAGTGTTGTCATTAGCAGTCATTACTACCTGGGCAGTACAGAGGAACTTCAGATAAAGCTCCTGGCATCCACTGAGGCGGGGAGGGACAGATAGAAACTTGGTCTGAGAGTTATGGTCTAGTAGACCTGGAATCCACAATGTAAAAGTTGGCCAGCTCCTGGCCATATATCCTAAAAAAGAGCTGGCATGTTATTGGGAAGATAAAGTGGGGGAAATCTGGCTTACTGGGCCCTATAGTAATGCTGTCTATGTATGTGTGCTCTCTCAAAAACAGGTAAAGTCCTTCCTGGGGTGGATGCTCTCAGCAATATTTAGTACTTTCCTGCCTTTTAGTTCCTGTGCACAGCCCCTAAGTCAACTTAGCATTTTCTGCATCTCCACTTGGCATTAGCTAAAACCTTCCATGTCAAGATTCAGCTAGTGGCCAAGAGATGCAGTGCCAGGAACCCTTAAACAGTTGCACAGCATCTCAGCTCATCTTCACTGCACCCTGGATTTGCATACATTCTTCAAGATCCCATTTGAATTTTTTAGTGACTAAACCATTGTGCATTCTAGAGTGCATATATTTATATTTTGCCTGTTAAAAAGAAAGTGAGCAGTGTTAGCTTAGTTCTCTTTTGATGTAGGTTATTATGATTAGCTTTGTCACTGTTTCACTACTCAGCATGGAAACAAGATGAAATTCCATTTGTAGGTAGTGAGACAAAATTGATGATCCATTAAGTAAACAATAAAAGTGTCCATTGAAACCGTGATTTTTTTTTTTTTCCTGTCATACTTTGTTAGGAAGGGTGAGAATAGAATCTTGAGGAACGGATCAGATGTCTATATTGCTGAATGCAAGAAGTGGGGCAGCAGCAGTGGAGAGATGGGACAATTAGATAAATGTCCATTCTTTATCAAGGGCCTACTTTATGGCAGACATTGTGCTAGTGCTTTTATTCTAACTTTTATTTTTATCAGTTACACATGATCATAATTTAAAAAGTCAAGGCTTATAACAAAAAAGCCCCAGCCCATTCCTCCCATTCAAGATTCCCACTCCCCAGAGGTGACCACTTTCAACTCTTGAGTTTTTCAGGTATATACCTCCATGTTTCTAAGTAATATGCTTATATTGTTCACTTCTTTTTTTTTTATTTTTTAAAGAAATCTATTTCATACCATGGAGGAAGGCTCTGTTCCACATATATTTCCACTTCTTCATTCTCTCGGTATAGTTTTGTCACAATTATAGATTAGATCAAAAGTCTACATAACTAATACAGCTGAGCTATGTAGTATGCTATGATTAAATTTACTTATGTAACTTTTATTGTCTTTGGCATTAACAGTGTTTCAAAAAATTTTCTGTGTATACCCATCAGTGATTCATTCCCAAATCTTCTAGAAGCATAAGTGTCTCAATATAT
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Task1_train_30473
The gene PGK1 (phosphoglycerate kinase 1), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
GACAAGATCCAGCTCATCAATAATATGCTGGACAAAGTCAATGAGATGATTATTGGTGGTGGAATGGCTTTTACCTTCCTTAAGGTGCTCAACAACATGGAGGTAGGAAACAAATGCCAAGTGGATGTGAAATAGCTCTCCATGATAATAGCAGGTTGTATAAATGTAAAAAGAAAACAGTCTTTTGACATGAGCCCTGAAAATTCCCATTTTTATTTATTTTGGCAAGTCTTTCGTCTTTGCATTGTTCCTTTATATTGTATTGTGTCTGGTTCCTGTCTGCTTTGTGAGGCAGTCTTGTTCTTAGTATAGATGCTGACCTCCATCATTTTGGCTCCCCTGTGTAGATTGGCACTTCTCTGTTTGATGAAGAGGGAGCCAAGATTGTCAAAGACCTAATGTCCAAAGCTGAGAAGAATGGTGTGAAGATTACCTTGCCTGTTGACTTTGTCACTGCTGACAAGTTTGATGAGAATGCCAAGACTGGCCAAGCCACTGTGGCTTCTGGCATACCTGCTGGCTGGATGGTGAGTCACTTGAGTGGGTTGGTAGTGTGAGTGAACAGAAACTCTGTGGTGTCATTTATTCATTGATTCAGCCAATCAACAAGCATTTTAAAACAATCTCTATAGGAGATCTGTCAGAGAGGGCTCTGCATGTTGCAGTGAGTCCCTCATGGAAGAATCCATGGGAGAAAAGCAGTGCTATTGGATTACTGGCCTTCAGTAATGCAGTAATGTGTTGCAAAACTTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTAACCCTCCCCAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTCATAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGATGATCTCAATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCTGCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCCCATTTTTAGTTTTATCTGTTTTTTCTTCATCTGTTTAATGTGTATTAAGTACTTACTGCGTACTGGAGATAGTGTCATGTACTTTCATGGTTTGGGTTGTTTTGGATTATGTTGCTATCTAGAAAGCTATATAAGAAAACTTTCTCATATGAAAAAATTAAGTATACTGATTACAAGCAGGGAGAAATGTAAGTGTATATTAAAGACTAATATAGTTGATTTTAGGGTGCTCCAAATATCATTTTGATTGCTGTATAAAATTGTATCATGTTTTTACATGCTAGTTTGCTTATTTTTCTTTTCAGGCATTCACGTATTATTTAGTTCAGTGTTTCTCAAAGTATGTTCCTAAGACCAGCAGTATCAGTATCATTTTTGGAACTTGTTAAAAATGCAAGTTCTTGGGTCCCACCCCAGACCTACCGAATCAGGAACTGAGGGTGGGGCCAAACAGTCTGTTTGAATAAGCCCTCCTGGTGATTCTCATGCATGGCAAAGTTTGAGTACTACTGATCTAGTTTACTGTCATTCCCAACACTATTGACATCTGTTGTTTTGTGGGGGACTGTTGAATTGTAAGGTTGTTTAAAGCATCCTTGGCCACTAGATGCCAGTAGCACCCTCCCAAGTTGCAACAACAATATTTCTAGACATTGCCACATGCCTATCTATTATGAAGGGGCAGAACTGACCTGGTTGAGAACCATTGATCTAGTTTTCACTAACATAAATAGTGTGGCTAAGAATGTCTTTATTAAATAACTTTTGAGGTTTTCCGTTAGACTTGATCTTCCATACAGTAGAATTTTTGAGTATAAAGGGCATGAACAGGTTTATAAAGACTGAAGGGTACTATTTGTTTCTAGAAGAAACTTTGGTGTGCAGCCCTGAGTTCTGGTCTTGGTGGAGGTGGTGTTTAAGTAGCTTTTCTTGATAGCTCATCTTCTCTTTCACCTCTACCCCTCAGGGCTTGGACTGTGGTCCTGAAAGCAGCAAGAAGTATGCTGAGGCTGTCACTCGGGCTAAGCAGATTGTGTGGAATGGTCCTGTGGGGGTATTTGAATGGGAAGCTTTTGCCCGGGGAACCAAAGCTCTCATGGATGAGGTGGTGAAAGCCACTTCTAGGGGCTGCATCACCATCATAGGTAAGCGGTCCTATACAAAGCTAATACCCATATAAGCTGGCAGAATTCTGATCAGAGGAAGGTGGAATGGAGAACTTCTTCTATGTCTCTTTATTCTGGGTAAATGTTAAGAGGTAAACAGGTAGGTAATTTACAGAGGAGCCTCTTGGTAAGATAGAGTTGGGGGTTTATCAGCTACCTTTTGGGTTGGGGAGCACACTGCCTTACAGTTTTGGTGCCAATCCCTTTTTTTTCTTTTCTCTCTTTTCCCTTTTTACCTGGCTTTCATTCAACAGGTGGTGGAGACACTGCCACTTGCTGTGCCAAATGGAACACGGAGGATAAAGTCAGCCATGTGAGCACTGGGGGTGGTGCCAGTTTGGAGCTCCTGGAAGGTGAGGGTCTTCTGTTTTTTGGCTTGTTTGGGATAAGGGTGGACTGTGCAGTGAGAGGTGGGTAGAATGGAGTGGAGAAAGTTAGAAGGTAGTGTTGTCATTAGCAGTCATTACTACCTGGGCAGTACAGAGGAACTTCAGATAAAGCTCCTGGCATCCACTGAGGCGGGGAGGGACAGATAGAAACTTGGTCTGAGAGTTATGGTCTAGTAGACCTGGAATCCACAATGTAAAAGTTGGCCAGCTCCTGGCCATATATCCTAAAAAAGAGCTGGCATGTTATTGGGAAGATAAAGTGGGGGAAATCTGGCTTACTGGGCCCTATAGTAATGCTGTCTATGTATGTGTGCTCTCTCAAAAACAGGTAAAGTCCTTCCTGGGGTGGATGCTCTCAGCAATATTTAGTACTTTCCTGCCTTTTAGTTCCTGTGCACAGCCCCTAAGTCAACTTAGCATTTTCTGCATCTCCACTTGGCATTAGCTAAAACCTTCCATGTCAAGATTCAGCTAGTGGCCAAGAGATGCAGTGCCAGGAACCCTTAAACAGTTGCACAGCATCTCAGCTCATCTTCACTGCACCCTGGATTTGCATACATTCTTCAAGATCCCATTTGAATTTTTTAGTGACTAAACCATTGTGCATTCTAGAGTGCATATATTTATATTTTGCCTGTTAAAAAGAAAGTGAGCAGTGTTAGCTTAGTTCTCTTTTGATGTAGGTTATTATGATTAGCTTTGTCACTGTTTCACTACTCAGCATGGAAACAAGATGAAATTCCATTTGTAGGTAGTGAGACAAAATTGATGATCCATTAAGTAAACAATAAAAGTGTCCATTGAAACCGTGATTTTTTTTTTTTTCCTGTCATACTTTGTTAGGAAGGGTGAGAATAGAATCTTGAGGAACGGATCAGATGTCTATATTGCTGAATGCAAGAAGTGGGGCAGCAGCAGTGGAGAGATGGGACAATTAGATAAATGTCCATTCTTTATCAAGGGCCTACTTTATGGCAGACATTGTGCTAGTGCTTTTATTCTAACTTTTATTTTTATCAGTTACACATGATCATAATTTAAAAAGTCAAGGCTTATAACAAAAAAGCCCCAGCCCATTCCTCCCATTCAAGATTCCCACTCCCCAGAGGTGACCACTTTCAACTCTTGAGTTTTTCAGGTATATACCTCCATGTTTCTAAGTAATATGCTTATATTGTTCACTTCTTTTTTTTTTATTTTTTAAAGAAATCTATTTCATACCATGGAGGAAGGCTCTGTTCCACATATATTTCCACTTCTTCATTCTCTCGGTATAGTTTTGTCACAATTATAGATTAGATCAAAAGTCTACATAACTAATACAGCTGAGCTATGTAGTATGCTATGATTAAATTTACTTATGTAACTTTTATTGTCTTTGGCATTAACAGTGTTTCAAAAAATTTTCTGTGTATACCCATCAGTGATTCATTCCCAAATCTTCTAGAAGCATAAGTGTCTCAATATATTAAAACATATTGA
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Task1_train_30474
This sequence change occurs on Chromosome X, altering PGK1 (phosphoglycerate kinase 1). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Glycogen storage disease due to phosphoglycerate kinase 1 deficiency
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Task1_train_30475
With a mutation on Chromosome X in gene TBX22 (T-box transcription factor 22), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Cleft palate with ankyloglossia
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Task1_train_30476
A sequence alteration has been identified in TBX22 (T-box transcription factor 22) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Cleft palate with ankyloglossia
TAGGCCTGTCTTTTCGTCCATCTTTAACCTTTCCCCTGAAGTAATGTCTGGGTCTTAGAGGGTACAAGTATCATTTTCCCTTTATTTAAGCCCTCAACCTACAGCAGGCTGAAAGTGGCCCAACTGTTTTAAAGCCAAAAAGCCCTTCTGGGATACACCCCAGACACACCAGCTTGCCAACACTTTGACTCAGGGGCTTGGGGTCCAGTTCAGGGTTGGAGGGGTTGGGGAGGTGACAGCTGTTTACACTAGGGCTGTGAGCATTTGACCCAGAGGTGGGTCCCTGGTCCTCCAAGGAGACAGCCCACCTCAAAACCAGAGCTAGCTTTGAAAGCAAGGAGAAGGCTCTGCTCAGAGGACTGCTGGGGCTGCAGTATGGAAACAGCAGAAAAAGCTGTTTGCTTCTCAAATTGCAGCTGGCTTGGGAATAAGAGCAAAACTGGGAAGTTGAGATTGGAAATAGTGTGAAAATCGGCCAGAGGCTGCGCAGGGCTGTGTTCCTAAGAGTTTTCTTGATGTGAAGCCTTATTGACAAAAGGGCTTCCACAAAGAGTGGTGACAGTGGCCTAGACAAGACATCCTTGTCAGCCCTCCACTTCTTCCCAGACTCTTCACACCCAAAGCTAGTGGATTTTTCCATTATCTCTGTGAGATAAAATTTGTTAGATCAATTTCTGTGGTGGTTTCTGTGAGAAAATACAAATCAGACTTAGAAATCTCATGACATTTTACTTTCCCTGCACTTCATTGCATTTTGATGACATATGCTTATTTACAGTTTATTTTTTGCCCCGAATGCTTGTTAGAAATTAAGTTGAGTCTTCTCCTTACTTGCCCTTGGGATCACTGGGCTAATCTGGAGTGAAGTCCTCAGGAACAGAACACAACAGCTCCCAGCTTTGGCCTGCTGCACCTAATGCCACAGCATGTGTTTTTTCAGGTACGTCTATCACAGCTCACAGTGGATGGTAGCTGGGAATACAGACCATTTGTGCATCATTCCTAGATTCTATGTTCACCCGGACTCACCCTGCTCGGGAGAGACCTGGATGCGGCAGATCATCAGCTTTGATCGCATGAAACTCACCAACAATGAGATGGATGACAAAGGCCACGTACGTGAGCACAATCCTTTACCCCGAGGAGGGAGGTGCCAAGGCTCCTGCCCACTGGTCACCCTGGAGAGGCCAGGGAGGCTTTTTGCAGATGCACATGTTGTGTTTTTTAGGAACTGTTCAAGCCCTGCACCTGTAAGTAAAGTAGCTAACCTAGGGCTCCTGAAACGTTTGTTTAGCATCTGAGATGCTGGCGACTGGGGATGGTGAATATAGGGAGTTTGAGGACAGAAGGAGACCTGTTTAAGCCAGAATGCCTGGTCTGGGAGAGTAGGAGGGAACCATTCAGGGAGTTCTCAGGCACCTTAGCCTCCTTGGCAATCACTATGATCTCTGATTGCCTTCCTGTAGTCCACGCAGTTGGATGGGCACCCAGTGTATGGTATGTGTGATGGAAGGATACAAGTGGGGGAATCTCAGACTGCATCCTGGAAATCTCCCAAACAACCTACCCTCATAGGTCCTATTGATCTTGCACATTCTCACTAGGTGCACCCCAGCTTCTGTCCTCCCCAGTCTGGCACTGTGCCAGCTACAAAAGGAAAGAGGGAAGCTCCCAAGATTAGGAGGTAGGGTATGTCAGGTTACCCACCATATCCAAGCCTATCAGTTACTGCCATGGGAACTTGTAGCAGGCTAGCAGATCCCAGTGCCACTTCTACACCAGATGGTCGCCAGTGTTTGAAGCAGGAAAAGGCCCCAATCTGGAAATGGAATCACTGCTGACTGGTGCCGCTGAGGTGTCTTTCTCTGGAAATGTTTTTAGCTCGGAGCGCCTCTGTTGGAGGCCAAATGGCACAACAAAGTAGTTACCTAAGCTTCATCATTGCCTTTTTGTGTGCACATGGTGGAGGTGGTCAGGAGAGGGAACTAGGGTTTGGGACTGAAGCCAGTTTTTCTAACAGCATTGATCATTTCTCCTCCAGATCATTCTGCAATCCATGCATAAGTACAAACCCCGAGTGCACGTGATAGAGCAAGGCAGCAGTGTTGACCTGTCCCAGATTCAGTCCTTGCCCACTGAAGGTGTTAAAACATTCTCCTTTAAAGAAACTGAGTTCACCACAGTAACGGCTTACCAAAACCAACAGGTAAACTTGGTCATGTCTCAGGCGAATGGAAATGGCTCCAGAGGGACCTTGGATTAGAGGCATAGAGGCTAACTGCCATCAATTGCATTTTCCACAATTCTAAATAAAAATCATAGTTTTATTGTATTGTCATCCATGCAAGTTTGATAATGAATTGTATAAATCTTATGGGAGAAGGCAACTCCAGAAGGTAATTTATAAAAGTAATGATTTATAAATAGGAGCTAACCATTCTAAATATGACTTGCAATATGGTTACATTTATTTAAATTGTCATATTAACGTGTTTCAACATCTCTTCTGGTGGTTGTAACCACTATAAGCAATGGCAACAGTGTTCTTACTGAAAGCAATGACTTTATCTTTCTCTCTCTATTGAATCCATAGATTACGAAACTAAAAATAGAAAGAAATCCTTTTGCTAAAGGATTTAGAGATACTGGAAGAAACAGGTAAGCAGCATAGCAATGACATCTAATATTGATGTAGCTAGCTATTTTCACAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACTTTCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCAACAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCCTGAACACCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGTCCCCCACAAGTTTTAAGGATAAGAAAACTGACTCAGAGACTCAAAAGCTCTAAGTTTTGTAATTAGTAGGTGGTAAGAAAGGAACCCAGATGTTTTGTGTTGAAAACATTACTTCCTCCCACTCCTTTGCTACTCACTATTAAGACCTTGCTTATTTTAGAATTCTAGGTTTGACTGAATTTTATTCAGAAGTCTAGCTATATAAAAGAGAAATATTTAAAATAGTTACATCTGAAAGATATAGCAAAATAACTCAAAATCATTATTTTCAGAAATTGCATTCTGGGGATGCTGAAAGTTGACTCTCTTTTTTAGGGGTGTATTGGATGGGCTTTTAGAGACCTACCCATGGAGGCCTTCTTTCACTCTCGATTTTAAAACCTTTGGCGCAGACACACAAAGTAAGAAAACTTGGAACGTTTGTTTTATTTTTACATATCAATTAAATAACAACATCCGGAACCCTTGTACCAAATACTACACAAGGGGATATGTACATGCAAGAAAATGTGTACTTATGGGTAACTGCGTGTACATTTGCCTGAATGACGAGGTAAGAGGCATAAAGGGAGAGAAGCTGGCATGAAGGAAGAGAATAGAAATGTGATAATTGTAGACTTATTGACATATGTTAATAAGTTATCTTACACCCTGTGATTTTCAGATTTCATCTGGATTTTTCAGCCTCTCACTGTTTCACATTCTTTAGGATATGCCTGTGGTGCATTTGCAGCCTGATTTGCAAATATGTTACTATTGAAATGAATAGTTTATCTTTTATGAGGACCTTTCAGTACATGTTAAAATGACTTTCATTAAATTCATCACTGAGCTCTAATTTTCCTCTTTTTTGTTCATGGGGAAAGTAAATGTTAAAAATAATACTAAGTCTTCACAATTTAATTGCCACAAGCATTTAAAAATATTTGCAAGATATTTATCCTCAGATGGTACATTACATGACAAAATAATAATAATTAAATAATGCAGGCTTTCTGGTGGAAGGATACCTTAATTTGCTCTGATAGTTAATAATAAATAGAATAATTTTTATTTGAAAATGACATGGATTTTTTTTATCCC
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Task1_train_30477
This variant affects gene TBX22 (T-box transcription factor 22) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Cleft palate with ankyloglossia
AAAGCCCTTCTGGGATACACCCCAGACACACCAGCTTGCCAACACTTTGACTCAGGGGCTTGGGGTCCAGTTCAGGGTTGGAGGGGTTGGGGAGGTGACAGCTGTTTACACTAGGGCTGTGAGCATTTGACCCAGAGGTGGGTCCCTGGTCCTCCAAGGAGACAGCCCACCTCAAAACCAGAGCTAGCTTTGAAAGCAAGGAGAAGGCTCTGCTCAGAGGACTGCTGGGGCTGCAGTATGGAAACAGCAGAAAAAGCTGTTTGCTTCTCAAATTGCAGCTGGCTTGGGAATAAGAGCAAAACTGGGAAGTTGAGATTGGAAATAGTGTGAAAATCGGCCAGAGGCTGCGCAGGGCTGTGTTCCTAAGAGTTTTCTTGATGTGAAGCCTTATTGACAAAAGGGCTTCCACAAAGAGTGGTGACAGTGGCCTAGACAAGACATCCTTGTCAGCCCTCCACTTCTTCCCAGACTCTTCACACCCAAAGCTAGTGGATTTTTCCATTATCTCTGTGAGATAAAATTTGTTAGATCAATTTCTGTGGTGGTTTCTGTGAGAAAATACAAATCAGACTTAGAAATCTCATGACATTTTACTTTCCCTGCACTTCATTGCATTTTGATGACATATGCTTATTTACAGTTTATTTTTTGCCCCGAATGCTTGTTAGAAATTAAGTTGAGTCTTCTCCTTACTTGCCCTTGGGATCACTGGGCTAATCTGGAGTGAAGTCCTCAGGAACAGAACACAACAGCTCCCAGCTTTGGCCTGCTGCACCTAATGCCACAGCATGTGTTTTTTCAGGTACGTCTATCACAGCTCACAGTGGATGGTAGCTGGGAATACAGACCATTTGTGCATCATTCCTAGATTCTATGTTCACCCGGACTCACCCTGCTCGGGAGAGACCTGGATGCGGCAGATCATCAGCTTTGATCGCATGAAACTCACCAACAATGAGATGGATGACAAAGGCCACGTACGTGAGCACAATCCTTTACCCCGAGGAGGGAGGTGCCAAGGCTCCTGCCCACTGGTCACCCTGGAGAGGCCAGGGAGGCTTTTTGCAGATGCACATGTTGTGTTTTTTAGGAACTGTTCAAGCCCTGCACCTGTAAGTAAAGTAGCTAACCTAGGGCTCCTGAAACGTTTGTTTAGCATCTGAGATGCTGGCGACTGGGGATGGTGAATATAGGGAGTTTGAGGACAGAAGGAGACCTGTTTAAGCCAGAATGCCTGGTCTGGGAGAGTAGGAGGGAACCATTCAGGGAGTTCTCAGGCACCTTAGCCTCCTTGGCAATCACTATGATCTCTGATTGCCTTCCTGTAGTCCACGCAGTTGGATGGGCACCCAGTGTATGGTATGTGTGATGGAAGGATACAAGTGGGGGAATCTCAGACTGCATCCTGGAAATCTCCCAAACAACCTACCCTCATAGGTCCTATTGATCTTGCACATTCTCACTAGGTGCACCCCAGCTTCTGTCCTCCCCAGTCTGGCACTGTGCCAGCTACAAAAGGAAAGAGGGAAGCTCCCAAGATTAGGAGGTAGGGTATGTCAGGTTACCCACCATATCCAAGCCTATCAGTTACTGCCATGGGAACTTGTAGCAGGCTAGCAGATCCCAGTGCCACTTCTACACCAGATGGTCGCCAGTGTTTGAAGCAGGAAAAGGCCCCAATCTGGAAATGGAATCACTGCTGACTGGTGCCGCTGAGGTGTCTTTCTCTGGAAATGTTTTTAGCTCGGAGCGCCTCTGTTGGAGGCCAAATGGCACAACAAAGTAGTTACCTAAGCTTCATCATTGCCTTTTTGTGTGCACATGGTGGAGGTGGTCAGGAGAGGGAACTAGGGTTTGGGACTGAAGCCAGTTTTTCTAACAGCATTGATCATTTCTCCTCCAGATCATTCTGCAATCCATGCATAAGTACAAACCCCGAGTGCACGTGATAGAGCAAGGCAGCAGTGTTGACCTGTCCCAGATTCAGTCCTTGCCCACTGAAGGTGTTAAAACATTCTCCTTTAAAGAAACTGAGTTCACCACAGTAACGGCTTACCAAAACCAACAGGTAAACTTGGTCATGTCTCAGGCGAATGGAAATGGCTCCAGAGGGACCTTGGATTAGAGGCATAGAGGCTAACTGCCATCAATTGCATTTTCCACAATTCTAAATAAAAATCATAGTTTTATTGTATTGTCATCCATGCAAGTTTGATAATGAATTGTATAAATCTTATGGGAGAAGGCAACTCCAGAAGGTAATTTATAAAAGTAATGATTTATAAATAGGAGCTAACCATTCTAAATATGACTTGCAATATGGTTACATTTATTTAAATTGTCATATTAACGTGTTTCAACATCTCTTCTGGTGGTTGTAACCACTATAAGCAATGGCAACAGTGTTCTTACTGAAAGCAATGACTTTATCTTTCTCTCTCTATTGAATCCATAGATTACGAAACTAAAAATAGAAAGAAATCCTTTTGCTAAAGGATTTAGAGATACTGGAAGAAACAGGTAAGCAGCATAGCAATGACATCTAATATTGATGTAGCTAGCTATTTTCACAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACTTTCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCAACAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCCTGAACACCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGTCCCCCACAAGTTTTAAGGATAAGAAAACTGACTCAGAGACTCAAAAGCTCTAAGTTTTGTAATTAGTAGGTGGTAAGAAAGGAACCCAGATGTTTTGTGTTGAAAACATTACTTCCTCCCACTCCTTTGCTACTCACTATTAAGACCTTGCTTATTTTAGAATTCTAGGTTTGACTGAATTTTATTCAGAAGTCTAGCTATATAAAAGAGAAATATTTAAAATAGTTACATCTGAAAGATATAGCAAAATAACTCAAAATCATTATTTTCAGAAATTGCATTCTGGGGATGCTGAAAGTTGACTCTCTTTTTTAGGGGTGTATTGGATGGGCTTTTAGAGACCTACCCATGGAGGCCTTCTTTCACTCTCGATTTTAAAACCTTTGGCGCAGACACACAAAGTAAGAAAACTTGGAACGTTTGTTTTATTTTTACATATCAATTAAATAACAACATCCGGAACCCTTGTACCAAATACTACACAAGGGGATATGTACATGCAAGAAAATGTGTACTTATGGGTAACTGCGTGTACATTTGCCTGAATGACGAGGTAAGAGGCATAAAGGGAGAGAAGCTGGCATGAAGGAAGAGAATAGAAATGTGATAATTGTAGACTTATTGACATATGTTAATAAGTTATCTTACACCCTGTGATTTTCAGATTTCATCTGGATTTTTCAGCCTCTCACTGTTTCACATTCTTTAGGATATGCCTGTGGTGCATTTGCAGCCTGATTTGCAAATATGTTACTATTGAAATGAATAGTTTATCTTTTATGAGGACCTTTCAGTACATGTTAAAATGACTTTCATTAAATTCATCACTGAGCTCTAATTTTCCTCTTTTTTGTTCATGGGGAAAGTAAATGTTAAAAATAATACTAAGTCTTCACAATTTAATTGCCACAAGCATTTAAAAATATTTGCAAGATATTTATCCTCAGATGGTACATTACATGACAAAATAATAATAATTAAATAATGCAGGCTTTCTGGTGGAAGGATACCTTAATTTGCTCTGATAGTTAATAATAAATAGAATAATTTTTATTTGAAAATGACATGGATTTTTTTTATCCCTTTGTCTTTACTCCATCGAAGTTGCTTGTCTTTGACCATTAATTCAAGGTTACAATTGCCAAGCAAAACCAACATTATAGTTAGGTTGAGTTTTACATGATGCCATAACAACTAACTGAAAAGGGAAGAAGTGAAGTC
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Task1_train_30478
Here is a variant affecting TBX22 (T-box transcription factor 22) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Cleft palate with ankyloglossia
GGGATACACCCCAGACACACCAGCTTGCCAACACTTTGACTCAGGGGCTTGGGGTCCAGTTCAGGGTTGGAGGGGTTGGGGAGGTGACAGCTGTTTACACTAGGGCTGTGAGCATTTGACCCAGAGGTGGGTCCCTGGTCCTCCAAGGAGACAGCCCACCTCAAAACCAGAGCTAGCTTTGAAAGCAAGGAGAAGGCTCTGCTCAGAGGACTGCTGGGGCTGCAGTATGGAAACAGCAGAAAAAGCTGTTTGCTTCTCAAATTGCAGCTGGCTTGGGAATAAGAGCAAAACTGGGAAGTTGAGATTGGAAATAGTGTGAAAATCGGCCAGAGGCTGCGCAGGGCTGTGTTCCTAAGAGTTTTCTTGATGTGAAGCCTTATTGACAAAAGGGCTTCCACAAAGAGTGGTGACAGTGGCCTAGACAAGACATCCTTGTCAGCCCTCCACTTCTTCCCAGACTCTTCACACCCAAAGCTAGTGGATTTTTCCATTATCTCTGTGAGATAAAATTTGTTAGATCAATTTCTGTGGTGGTTTCTGTGAGAAAATACAAATCAGACTTAGAAATCTCATGACATTTTACTTTCCCTGCACTTCATTGCATTTTGATGACATATGCTTATTTACAGTTTATTTTTTGCCCCGAATGCTTGTTAGAAATTAAGTTGAGTCTTCTCCTTACTTGCCCTTGGGATCACTGGGCTAATCTGGAGTGAAGTCCTCAGGAACAGAACACAACAGCTCCCAGCTTTGGCCTGCTGCACCTAATGCCACAGCATGTGTTTTTTCAGGTACGTCTATCACAGCTCACAGTGGATGGTAGCTGGGAATACAGACCATTTGTGCATCATTCCTAGATTCTATGTTCACCCGGACTCACCCTGCTCGGGAGAGACCTGGATGCGGCAGATCATCAGCTTTGATCGCATGAAACTCACCAACAATGAGATGGATGACAAAGGCCACGTACGTGAGCACAATCCTTTACCCCGAGGAGGGAGGTGCCAAGGCTCCTGCCCACTGGTCACCCTGGAGAGGCCAGGGAGGCTTTTTGCAGATGCACATGTTGTGTTTTTTAGGAACTGTTCAAGCCCTGCACCTGTAAGTAAAGTAGCTAACCTAGGGCTCCTGAAACGTTTGTTTAGCATCTGAGATGCTGGCGACTGGGGATGGTGAATATAGGGAGTTTGAGGACAGAAGGAGACCTGTTTAAGCCAGAATGCCTGGTCTGGGAGAGTAGGAGGGAACCATTCAGGGAGTTCTCAGGCACCTTAGCCTCCTTGGCAATCACTATGATCTCTGATTGCCTTCCTGTAGTCCACGCAGTTGGATGGGCACCCAGTGTATGGTATGTGTGATGGAAGGATACAAGTGGGGGAATCTCAGACTGCATCCTGGAAATCTCCCAAACAACCTACCCTCATAGGTCCTATTGATCTTGCACATTCTCACTAGGTGCACCCCAGCTTCTGTCCTCCCCAGTCTGGCACTGTGCCAGCTACAAAAGGAAAGAGGGAAGCTCCCAAGATTAGGAGGTAGGGTATGTCAGGTTACCCACCATATCCAAGCCTATCAGTTACTGCCATGGGAACTTGTAGCAGGCTAGCAGATCCCAGTGCCACTTCTACACCAGATGGTCGCCAGTGTTTGAAGCAGGAAAAGGCCCCAATCTGGAAATGGAATCACTGCTGACTGGTGCCGCTGAGGTGTCTTTCTCTGGAAATGTTTTTAGCTCGGAGCGCCTCTGTTGGAGGCCAAATGGCACAACAAAGTAGTTACCTAAGCTTCATCATTGCCTTTTTGTGTGCACATGGTGGAGGTGGTCAGGAGAGGGAACTAGGGTTTGGGACTGAAGCCAGTTTTTCTAACAGCATTGATCATTTCTCCTCCAGATCATTCTGCAATCCATGCATAAGTACAAACCCCGAGTGCACGTGATAGAGCAAGGCAGCAGTGTTGACCTGTCCCAGATTCAGTCCTTGCCCACTGAAGGTGTTAAAACATTCTCCTTTAAAGAAACTGAGTTCACCACAGTAACGGCTTACCAAAACCAACAGGTAAACTTGGTCATGTCTCAGGCGAATGGAAATGGCTCCAGAGGGACCTTGGATTAGAGGCATAGAGGCTAACTGCCATCAATTGCATTTTCCACAATTCTAAATAAAAATCATAGTTTTATTGTATTGTCATCCATGCAAGTTTGATAATGAATTGTATAAATCTTATGGGAGAAGGCAACTCCAGAAGGTAATTTATAAAAGTAATGATTTATAAATAGGAGCTAACCATTCTAAATATGACTTGCAATATGGTTACATTTATTTAAATTGTCATATTAACGTGTTTCAACATCTCTTCTGGTGGTTGTAACCACTATAAGCAATGGCAACAGTGTTCTTACTGAAAGCAATGACTTTATCTTTCTCTCTCTATTGAATCCATAGATTACGAAACTAAAAATAGAAAGAAATCCTTTTGCTAAAGGATTTAGAGATACTGGAAGAAACAGGTAAGCAGCATAGCAATGACATCTAATATTGATGTAGCTAGCTATTTTCACAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACTTTCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCAACAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCCTGAACACCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGTCCCCCACAAGTTTTAAGGATAAGAAAACTGACTCAGAGACTCAAAAGCTCTAAGTTTTGTAATTAGTAGGTGGTAAGAAAGGAACCCAGATGTTTTGTGTTGAAAACATTACTTCCTCCCACTCCTTTGCTACTCACTATTAAGACCTTGCTTATTTTAGAATTCTAGGTTTGACTGAATTTTATTCAGAAGTCTAGCTATATAAAAGAGAAATATTTAAAATAGTTACATCTGAAAGATATAGCAAAATAACTCAAAATCATTATTTTCAGAAATTGCATTCTGGGGATGCTGAAAGTTGACTCTCTTTTTTAGGGGTGTATTGGATGGGCTTTTAGAGACCTACCCATGGAGGCCTTCTTTCACTCTCGATTTTAAAACCTTTGGCGCAGACACACAAAGTAAGAAAACTTGGAACGTTTGTTTTATTTTTACATATCAATTAAATAACAACATCCGGAACCCTTGTACCAAATACTACACAAGGGGATATGTACATGCAAGAAAATGTGTACTTATGGGTAACTGCGTGTACATTTGCCTGAATGACGAGGTAAGAGGCATAAAGGGAGAGAAGCTGGCATGAAGGAAGAGAATAGAAATGTGATAATTGTAGACTTATTGACATATGTTAATAAGTTATCTTACACCCTGTGATTTTCAGATTTCATCTGGATTTTTCAGCCTCTCACTGTTTCACATTCTTTAGGATATGCCTGTGGTGCATTTGCAGCCTGATTTGCAAATATGTTACTATTGAAATGAATAGTTTATCTTTTATGAGGACCTTTCAGTACATGTTAAAATGACTTTCATTAAATTCATCACTGAGCTCTAATTTTCCTCTTTTTTGTTCATGGGGAAAGTAAATGTTAAAAATAATACTAAGTCTTCACAATTTAATTGCCACAAGCATTTAAAAATATTTGCAAGATATTTATCCTCAGATGGTACATTACATGACAAAATAATAATAATTAAATAATGCAGGCTTTCTGGTGGAAGGATACCTTAATTTGCTCTGATAGTTAATAATAAATAGAATAATTTTTATTTGAAAATGACATGGATTTTTTTTATCCCTTTGTCTTTACTCCATCGAAGTTGCTTGTCTTTGACCATTAATTCAAGGTTACAATTGCCAAGCAAAACCAACATTATAGTTAGGTTGAGTTTTACATGATGCCATAACAACTAACTGAAAAGGGAAGAAGTGAAGTCTAATCATTTGG
GGGATACACCCCAGACACACCAGCTTGCCAACACTTTGACTCAGGGGCTTGGGGTCCAGTTCAGGGTTGGAGGGGTTGGGGAGGTGACAGCTGTTTACACTAGGGCTGTGAGCATTTGACCCAGAGGTGGGTCCCTGGTCCTCCAAGGAGACAGCCCACCTCAAAACCAGAGCTAGCTTTGAAAGCAAGGAGAAGGCTCTGCTCAGAGGACTGCTGGGGCTGCAGTATGGAAACAGCAGAAAAAGCTGTTTGCTTCTCAAATTGCAGCTGGCTTGGGAATAAGAGCAAAACTGGGAAGTTGAGATTGGAAATAGTGTGAAAATCGGCCAGAGGCTGCGCAGGGCTGTGTTCCTAAGAGTTTTCTTGATGTGAAGCCTTATTGACAAAAGGGCTTCCACAAAGAGTGGTGACAGTGGCCTAGACAAGACATCCTTGTCAGCCCTCCACTTCTTCCCAGACTCTTCACACCCAAAGCTAGTGGATTTTTCCATTATCTCTGTGAGATAAAATTTGTTAGATCAATTTCTGTGGTGGTTTCTGTGAGAAAATACAAATCAGACTTAGAAATCTCATGACATTTTACTTTCCCTGCACTTCATTGCATTTTGATGACATATGCTTATTTACAGTTTATTTTTTGCCCCGAATGCTTGTTAGAAATTAAGTTGAGTCTTCTCCTTACTTGCCCTTGGGATCACTGGGCTAATCTGGAGTGAAGTCCTCAGGAACAGAACACAACAGCTCCCAGCTTTGGCCTGCTGCACCTAATGCCACAGCATGTGTTTTTTCAGGTACGTCTATCACAGCTCACAGTGGATGGTAGCTGGGAATACAGACCATTTGTGCATCATTCCTAGATTCTATGTTCACCCGGACTCACCCTGCTCGGGAGAGACCTGGATGCGGCAGATCATCAGCTTTGATCGCATGAAACTCACCAACAATGAGATGGATGACAAAGGCCACGTACGTGAGCACAATCCTTTACCCCGAGGAGGGAGGTGCCAAGGCTCCTGCCCACTGGTCACCCTGGAGAGGCCAGGGAGGCTTTTTGCAGATGCACATGTTGTGTTTTTTAGGAACTGTTCAAGCCCTGCACCTGTAAGTAAAGTAGCTAACCTAGGGCTCCTGAAACGTTTGTTTAGCATCTGAGATGCTGGCGACTGGGGATGGTGAATATAGGGAGTTTGAGGACAGAAGGAGACCTGTTTAAGCCAGAATGCCTGGTCTGGGAGAGTAGGAGGGAACCATTCAGGGAGTTCTCAGGCACCTTAGCCTCCTTGGCAATCACTATGATCTCTGATTGCCTTCCTGTAGTCCACGCAGTTGGATGGGCACCCAGTGTATGGTATGTGTGATGGAAGGATACAAGTGGGGGAATCTCAGACTGCATCCTGGAAATCTCCCAAACAACCTACCCTCATAGGTCCTATTGATCTTGCACATTCTCACTAGGTGCACCCCAGCTTCTGTCCTCCCCAGTCTGGCACTGTGCCAGCTACAAAAGGAAAGAGGGAAGCTCCCAAGATTAGGAGGTAGGGTATGTCAGGTTACCCACCATATCCAAGCCTATCAGTTACTGCCATGGGAACTTGTAGCAGGCTAGCAGATCCCAGTGCCACTTCTACACCAGATGGTCGCCAGTGTTTGAAGCAGGAAAAGGCCCCAATCTGGAAATGGAATCACTGCTGACTGGTGCCGCTGAGGTGTCTTTCTCTGGAAATGTTTTTAGCTCGGAGCGCCTCTGTTGGAGGCCAAATGGCACAACAAAGTAGTTACCTAAGCTTCATCATTGCCTTTTTGTGTGCACATGGTGGAGGTGGTCAGGAGAGGGAACTAGGGTTTGGGACTGAAGCCAGTTTTTCTAACAGCATTGATCATTTCTCCTCCAGATCATTCTGCAATCCATGCATAAGTACAAACCCCGAGTGCACGTGATAGAGCAAGGCAGCAGTGTTGACCTGTCCCAGATTCAGTCCTTGCCCACTGAAGGTGTTAAAACATTCTCCTTTAAAGAAACTGAGTTCACCACAGTAACGGCTTACCAATACCAACAGGTAAACTTGGTCATGTCTCAGGCGAATGGAAATGGCTCCAGAGGGACCTTGGATTAGAGGCATAGAGGCTAACTGCCATCAATTGCATTTTCCACAATTCTAAATAAAAATCATAGTTTTATTGTATTGTCATCCATGCAAGTTTGATAATGAATTGTATAAATCTTATGGGAGAAGGCAACTCCAGAAGGTAATTTATAAAAGTAATGATTTATAAATAGGAGCTAACCATTCTAAATATGACTTGCAATATGGTTACATTTATTTAAATTGTCATATTAACGTGTTTCAACATCTCTTCTGGTGGTTGTAACCACTATAAGCAATGGCAACAGTGTTCTTACTGAAAGCAATGACTTTATCTTTCTCTCTCTATTGAATCCATAGATTACGAAACTAAAAATAGAAAGAAATCCTTTTGCTAAAGGATTTAGAGATACTGGAAGAAACAGGTAAGCAGCATAGCAATGACATCTAATATTGATGTAGCTAGCTATTTTCACAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGCTCACTGCAACTTTCACCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTAGGATTACAGGCATGTGCCAACAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATATTGGTCAGGCTGGTCCTGAACACCTGACCTCGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGTCCCCCACAAGTTTTAAGGATAAGAAAACTGACTCAGAGACTCAAAAGCTCTAAGTTTTGTAATTAGTAGGTGGTAAGAAAGGAACCCAGATGTTTTGTGTTGAAAACATTACTTCCTCCCACTCCTTTGCTACTCACTATTAAGACCTTGCTTATTTTAGAATTCTAGGTTTGACTGAATTTTATTCAGAAGTCTAGCTATATAAAAGAGAAATATTTAAAATAGTTACATCTGAAAGATATAGCAAAATAACTCAAAATCATTATTTTCAGAAATTGCATTCTGGGGATGCTGAAAGTTGACTCTCTTTTTTAGGGGTGTATTGGATGGGCTTTTAGAGACCTACCCATGGAGGCCTTCTTTCACTCTCGATTTTAAAACCTTTGGCGCAGACACACAAAGTAAGAAAACTTGGAACGTTTGTTTTATTTTTACATATCAATTAAATAACAACATCCGGAACCCTTGTACCAAATACTACACAAGGGGATATGTACATGCAAGAAAATGTGTACTTATGGGTAACTGCGTGTACATTTGCCTGAATGACGAGGTAAGAGGCATAAAGGGAGAGAAGCTGGCATGAAGGAAGAGAATAGAAATGTGATAATTGTAGACTTATTGACATATGTTAATAAGTTATCTTACACCCTGTGATTTTCAGATTTCATCTGGATTTTTCAGCCTCTCACTGTTTCACATTCTTTAGGATATGCCTGTGGTGCATTTGCAGCCTGATTTGCAAATATGTTACTATTGAAATGAATAGTTTATCTTTTATGAGGACCTTTCAGTACATGTTAAAATGACTTTCATTAAATTCATCACTGAGCTCTAATTTTCCTCTTTTTTGTTCATGGGGAAAGTAAATGTTAAAAATAATACTAAGTCTTCACAATTTAATTGCCACAAGCATTTAAAAATATTTGCAAGATATTTATCCTCAGATGGTACATTACATGACAAAATAATAATAATTAAATAATGCAGGCTTTCTGGTGGAAGGATACCTTAATTTGCTCTGATAGTTAATAATAAATAGAATAATTTTTATTTGAAAATGACATGGATTTTTTTTATCCCTTTGTCTTTACTCCATCGAAGTTGCTTGTCTTTGACCATTAATTCAAGGTTACAATTGCCAAGCAAAACCAACATTATAGTTAGGTTGAGTTTTACATGATGCCATAACAACTAACTGAAAAGGGAAGAAGTGAAGTCTAATCATTTGG
Task1_train_30479
With a mutation on Chromosome X in gene BRWD3 (bromodomain and WD repeat domain containing 3), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 93
GACAATAAGGGTTTTTAAAGATGTTTTTTATCTATAAAATAATGATTCACAACATGAGTGTGCAGTGCAATAAGGTTCTTTCCTGAAAGACTAGAACAGAAGAACCCTTTGGAATGATATGAGCAGAATCTATAAGTTGATTCATAATACTAGCTAGCCAAAACATTCCAAATCAAACCAGGTGCTTTGTTAAATTTTAAGATTCAAATGAAAACCAGCAACTCACAGCTGTTAAATGGTAAGTGGAGCAGAAATATATAAGCAGTAGCCCAAGTCTACTTACACAAATATGTTCTAAGAAAGCCTAAGGTGGTAGAGCATACTATATTTATGAAACTTTGTTAATTACAATTATTAATTTGAGAGCCAATACAATTATTAACAACCTCTCAGCTTATAACTTATGGGGTATTCATTCCTACTAAGCTTGTTCTATTTCTCCTTAGTCAGTAAGGAATAACAGCATCTATTTTCCTTAATGTTTCCAGTAGTTGTAGTTAAGAGGTAGCTGAGCTACTGTTCAAAGAAGTTGTTCTTTGTGGATGAGGATTTTTCAAATGTTTAAGTTATTTAAGCTACACAAATTCTATTAATGCAATAAAATGTGATAGGAAAAAAATTGATGCGGGAAACTTTTGCATTTGGCACCTTGTCTAGATTGATACCTCAAGTATTCTTTTTTAATAAAGTTAATGCACACATCAGAACACACCACGAAGATCTGCTACATATTTACAAGGCACCAACCCTTTCTCACCTTTAACGTGAATTATGCAAATCAATGAAAAGCATATCAAGATCCCCCCACCCCCCAAAAAACTGTAGTATAAATATATACTTCAGTTCAGTACAAGTCATGAAAGTTTGGCCTGGGAAGAGTAAAATAATCCAGATCGCTCTTACAATATAGAAACTGTAAACATTTAATAGCTGCCTTTAGGATTGGTGTATTGTGCAAAAGTTATTATTACTGGGTATAGGAATCAAAATGGCAAAAACAAACTATATAAAACTCTGTAAGAAGGTGCTATACTTCTGTGATACAAAAGCAAAAGAGGGCTATTCTATTGAGATAAAAATGTCATGCTACTCTTAAGAAGCTGAATGCTCCTTTAATGTAGTAAATCTGTAGTGTCTGTGTTGTGTTTCGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTCTTTTAATTTAAGGCCTAATGAGTAAGGCTTATTTGAACAAATGAAGTGTGGAGATCAAAAGTCTTGAAACAAATGTATACTGGCATAAATGGAAAAGCACCAATGTGAAAGGAAGCAGAAGTCCCCACACAACTTGCTTTGTAGATTTCCTGGTAAATTCCCTGCAGTAGAAGGCCATTGAATTTTTTAAGTTATTCTAAATTTATTAACTGTTAATAATTCCATCCCATGAGATGGCTAACCCTGGCTTTTTCTGTCATTTTACGCACTCTGCCTGATCTGGATGTACCAAGATTCAGAGGATCCTCAGTGGACACAAAATTGTCATTATCAGAATCATCATTATATAAAACAGTCCTCCTGCCTTGGTTTCTTGTTTTAATTCGAGGCAGTCTACTGAAACGTCCTGAAAACATGGTATCAAATTCATCATCTGCAATACGTGCTCGTTTGGCTCTGGTAGCTCCTCTAGAAGCACCTCTTCCTCCTCTCCCTCTTCCCCTCCCCCTAGTGCCACCTCCACCTCTTCCTCGACTCCCTCGTCCCCTGCCTCCTCTTCCTCTGCCTCCTCTACTCCATCTACCCCATCTTCCCCATCTGCCTCTTCCTCCTGTGCCTCTGGTCTTCCAATTTCTTTTTCCATTGCCATGTTGCTTTCTGAGTTTTCTTTTAGGTCTGGTTTGTATGAATTTGCTATAATCATGGTCTCCATCTACGTAATCTTGATCTGTTCTGGAAGTTGATTCAGAGTCAGAGTCAGAACCACAGGTACTTTCAGAACTTAAACTGGATCCTAACTCTCCACTCTCTGAGGTGGATAAATGAGATTTCTCTTTTGTTTCTTTTTTCTCTTTATCTTCTCCTCCCATGTTTTCATCTTCTTCTGATGCACTAAGTAGTTTTCTCTTGATTCCTGTCCGGGGCTCTCTGCCATCACCATTTGTAAGGGGTCCATCAAGGGAGTGATCTAAATTAAAATGAATGATTTTTAATAGTTAAGCTTTGACATTGACAAAATGGTTATTTAGGTTCAAAAACAGTCTACAGTTCCCAAAAATATGTGGAATACAATCATGGAGGGTGTCAGACTAAGAACTTAAATTTCTTCAAAATAGAAGATATTAAAGTGTTTATTTTTGTCTGCTTTTTTGGGAGAGGGAGGAGAATATGGGGGTGGAATGATGGCCATGAGGTTTAGGCAGAAGTTTTAAGGGCCTACTTCAGGAAGAATTACCTGAGAACACTAATTAGTATAGTTTCATTCATTCGGTTGATAAATTCTTATTCATTATCTACTATTAGCAAGGCATTGCTAGAAGCTTTGAATACGGCAATGAAAGGGACAGTCCTTGCTGTTGGAATTTATATTTTAGTGGGAATACCTTGAAAGATAACAAAGTGAATAAATTAATAATAAAATTTCACACAGACATGTTATAAAGAGGATTAAAAAAAGAGTGTATATGTGTAGAAGGGAATGTATTTTAGATAGGGAAGACTTCTCTACAGAGGTAGTATTAGAAGAAATAACTGAATGAAGTCAGATGTAGGGAAAGAACATTCCAGAGGAGGGAACAGAAAGCAAGCCAGTATAACCAGAGTGGAATAGAAAAACAGTGAGTAGTAGGAGATGAGTGCCAGTGGAGAGTTTTAAGCTGGAGAAAGAATCTGATTTACACTTTTAAAATAGTATGGTTGCTGTATATAAAAAAGATCACAGGGGAGGCAAGACTGAAAGTGGAAGGAGAGACCAGTTGGGCATCCACTGCAGTATTCTAGGTAAGACATGACAAAGGATATGTCAATAGATGTGATGATAAGTGATTATATTTGGAATATTTCCTTCTAGAGAAACCTTTAATTTCAAAGGTTGAACTGATGGGACTTGCTGACAGACTATATGTCAAGTGTCAAGCACAGAATGAAGACTGACTCCTAGGTTTTATGGCCAAAGCAACTGGGTGAATGGTAGAGATATTTTGCCAAGGTAGAGAACACTGAAGGAGCAACAGGTTTGAGCAGGGCTCAAGATTCCATTTTAGATGTTGACAGAGATCCAAGACAAGACATTTTTTTAAAAAAAAGAAATAAAGAGCAGGTAGATATACCAGTCTGGAGCTCAGGGGAGAGGGTAGAGCTGGAGATATAATTGCGGAAATTTTCAGTAAAGAGATAATATTTAGGGTAATGAGAACTAGGAGAGCTCACTGAGTGAGTAAGTAAAGAGAGACAACGTGGCTGAAGACTGAGACTTGAGATGTTCAAACATTTAAAGATAAAGAAGAACCAACAAAGAAAATGGAGGACCAGCCAGTGGGGTCGGTAGGAAACAAGAGAGCAGACTGGAAGAATTGAAAAGAAGACTAGGGCTGTAGATAATTACAAGATTAACCTAATAAGTCTGGGTGTTATGGACTGAATTGTGTCCCTTCAAAATTCATATGTGGAAGCCCTAATCCCCGAAGTGACTGCAGTTGGAGATTAGGGCATTTAGGGAGGTAATTAAGGTTAAATGAGGTTATATGGGTGGGACTATAACTCAACAGGACTGATGTTCTTAAAGGAAAAGGAAGAGATACTAGAGGTATTTCCCTCTGTCTCTCTGTAGAGGCAAGGCCACGTGAGGACAAAGCAAGAAGGTGGACATATAGAAGCCAGGGAAAAAGCCCTTATCAGATACCCACCCATATGGCACTTTCACAATGGACTGAGCCTCCAGCTCTGTGAGAAGATGAATGTCTGCTGTTTAAGCCACCCAGTCTGTGGTATCTTGTTATGGAAACCCAAGCTGACTAATACTTCAGGCTGGAGACTAAGGTGATAGCAGTAGAAACTATATAGAAGATTTAAGTGGTATTAAAGAGTTGTGGAATCCACAAAACT
GACAATAAGGGTTTTTAAAGATGTTTTTTATCTATAAAATAATGATTCACAACATGAGTGTGCAGTGCAATAAGGTTCTTTCCTGAAAGACTAGAACAGAAGAACCCTTTGGAATGATATGAGCAGAATCTATAAGTTGATTCATAATACTAGCTAGCCAAAACATTCCAAATCAAACCAGGTGCTTTGTTAAATTTTAAGATTCAAATGAAAACCAGCAACTCACAGCTGTTAAATGGTAAGTGGAGCAGAAATATATAAGCAGTAGCCCAAGTCTACTTACACAAATATGTTCTAAGAAAGCCTAAGGTGGTAGAGCATACTATATTTATGAAACTTTGTTAATTACAATTATTAATTTGAGAGCCAATACAATTATTAACAACCTCTCAGCTTATAACTTATGGGGTATTCATTCCTACTAAGCTTGTTCTATTTCTCCTTAGTCAGTAAGGAATAACAGCATCTATTTTCCTTAATGTTTCCAGTAGTTGTAGTTAAGAGGTAGCTGAGCTACTGTTCAAAGAAGTTGTTCTTTGTGGATGAGGATTTTTCAAATGTTTAAGTTATTTAAGCTACACAAATTCTATTAATGCAATAAAATGTGATAGGAAAAAAATTGATGCGGGAAACTTTTGCATTTGGCACCTTGTCTAGATTGATACCTCAAGTATTCTTTTTTAATAAAGTTAATGCACACATCAGAACACACCACGAAGATCTGCTACATATTTACAAGGCACCAACCCTTTCTCACCTTTAACGTGAATTATGCAAATCAATGAAAAGCATATCAAGATCCCCCCACCCCCCAAAAAACTGTAGTATAAATATATACTTCAGTTCAGTACAAGTCATGAAAGTTTGGCCTGGGAAGAGTAAAATAATCCAGATCGCTCTTACAATATAGAAACTGTAAACATTTAATAGCTGCCTTTAGGATTGGTGTATTGTGCAAAAGTTATTATTACTGGGTATAGGAATCAAAATGGCAAAAACAAACTATATAAAACTCTGTAAGAAGGTGCTATACTTCTGTGATACAAAAGCAAAAGAGGGCTATTCTATTGAGATAAAAATGTCATGCTACTCTTAAGAAGCTGAATGCTCCTTTAATGTAGTAAATCTGTAGTGTCTGTGTTGTGTTTCGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTTTGTGTGTGTGTGGGCAGAATTTCTTTTAATTTAAGGCCTAATGAGTAAGGCTTATTTGAACAAATGAAGTGTGGAGATCAAAAGTCTTGAAACAAATGTATACTGGCATAAATGGAAAAGCACCAATGTGAAAGGAAGCAGAAGTCCCCACACAACTTGCTTTGTAGATTTCCTGGTAAATTCCCTGCAGTAGAAGGCCATTGAATTTTTTAAGTTATTCTAAATTTATTAACTGTTAATAATTCCATCCCATGAGATGGCTAACCCTGGCTTTTTCTGTCATTTTACGCACTCTGCCTGATCTGGATGTACCAAGATTCAGAGGATCCTCAGTGGACACAAAATTGTCATTATCAGAATCATCATTATATAAAACAGTCCTCCTGCCTTGGTTTCTTGTTTTAATTCGAGGCAGTCTACTGAAACGTCCTGAAAACATGGTATCAAATTCATCATCTGCAATACGTGCTCGTTTGGCTCTGGTAGCTCCTCTAGAAGCACCTCTTCCTCCTCTCCCTCTTCCCCTCCCCCTAGTGCCACCTCCACCTCTTCCTCGACTCCCTCGTCCCCTGCCTCCTCTTCCTCTGCCTCCTCTACTCCATCTACCCCATCTTCCCCATCTGCCTCTTCCTCCTGTGCCTCTGGTCTTCCAATTTCTTTTTCCATTGCCATGTTGCTTTCTGAGTTTTCTTTTAGGTCTGGTTTGTATGAATTTGCTATAATCATGGTCTCCATCTACGTAATCTTGATCTGTTCTGGAAGTTGATTCAGAGTCAGAGTCAGAACCACAGGTACTTTCAGAACTTAAACTGGATCCTAACTCTCCACTCTCTGAGGTGGATAAATGAGATTTCTCTTCTGTTTCTTTTTTCTCTTTATCTTCTCCTCCCATGTTTTCATCTTCTTCTGATGCACTAAGTAGTTTTCTCTTGATTCCTGTCCGGGGCTCTCTGCCATCACCATTTGTAAGGGGTCCATCAAGGGAGTGATCTAAATTAAAATGAATGATTTTTAATAGTTAAGCTTTGACATTGACAAAATGGTTATTTAGGTTCAAAAACAGTCTACAGTTCCCAAAAATATGTGGAATACAATCATGGAGGGTGTCAGACTAAGAACTTAAATTTCTTCAAAATAGAAGATATTAAAGTGTTTATTTTTGTCTGCTTTTTTGGGAGAGGGAGGAGAATATGGGGGTGGAATGATGGCCATGAGGTTTAGGCAGAAGTTTTAAGGGCCTACTTCAGGAAGAATTACCTGAGAACACTAATTAGTATAGTTTCATTCATTCGGTTGATAAATTCTTATTCATTATCTACTATTAGCAAGGCATTGCTAGAAGCTTTGAATACGGCAATGAAAGGGACAGTCCTTGCTGTTGGAATTTATATTTTAGTGGGAATACCTTGAAAGATAACAAAGTGAATAAATTAATAATAAAATTTCACACAGACATGTTATAAAGAGGATTAAAAAAAGAGTGTATATGTGTAGAAGGGAATGTATTTTAGATAGGGAAGACTTCTCTACAGAGGTAGTATTAGAAGAAATAACTGAATGAAGTCAGATGTAGGGAAAGAACATTCCAGAGGAGGGAACAGAAAGCAAGCCAGTATAACCAGAGTGGAATAGAAAAACAGTGAGTAGTAGGAGATGAGTGCCAGTGGAGAGTTTTAAGCTGGAGAAAGAATCTGATTTACACTTTTAAAATAGTATGGTTGCTGTATATAAAAAAGATCACAGGGGAGGCAAGACTGAAAGTGGAAGGAGAGACCAGTTGGGCATCCACTGCAGTATTCTAGGTAAGACATGACAAAGGATATGTCAATAGATGTGATGATAAGTGATTATATTTGGAATATTTCCTTCTAGAGAAACCTTTAATTTCAAAGGTTGAACTGATGGGACTTGCTGACAGACTATATGTCAAGTGTCAAGCACAGAATGAAGACTGACTCCTAGGTTTTATGGCCAAAGCAACTGGGTGAATGGTAGAGATATTTTGCCAAGGTAGAGAACACTGAAGGAGCAACAGGTTTGAGCAGGGCTCAAGATTCCATTTTAGATGTTGACAGAGATCCAAGACAAGACATTTTTTTAAAAAAAAGAAATAAAGAGCAGGTAGATATACCAGTCTGGAGCTCAGGGGAGAGGGTAGAGCTGGAGATATAATTGCGGAAATTTTCAGTAAAGAGATAATATTTAGGGTAATGAGAACTAGGAGAGCTCACTGAGTGAGTAAGTAAAGAGAGACAACGTGGCTGAAGACTGAGACTTGAGATGTTCAAACATTTAAAGATAAAGAAGAACCAACAAAGAAAATGGAGGACCAGCCAGTGGGGTCGGTAGGAAACAAGAGAGCAGACTGGAAGAATTGAAAAGAAGACTAGGGCTGTAGATAATTACAAGATTAACCTAATAAGTCTGGGTGTTATGGACTGAATTGTGTCCCTTCAAAATTCATATGTGGAAGCCCTAATCCCCGAAGTGACTGCAGTTGGAGATTAGGGCATTTAGGGAGGTAATTAAGGTTAAATGAGGTTATATGGGTGGGACTATAACTCAACAGGACTGATGTTCTTAAAGGAAAAGGAAGAGATACTAGAGGTATTTCCCTCTGTCTCTCTGTAGAGGCAAGGCCACGTGAGGACAAAGCAAGAAGGTGGACATATAGAAGCCAGGGAAAAAGCCCTTATCAGATACCCACCCATATGGCACTTTCACAATGGACTGAGCCTCCAGCTCTGTGAGAAGATGAATGTCTGCTGTTTAAGCCACCCAGTCTGTGGTATCTTGTTATGGAAACCCAAGCTGACTAATACTTCAGGCTGGAGACTAAGGTGATAGCAGTAGAAACTATATAGAAGATTTAAGTGGTATTAAAGAGTTGTGGAATCCACAAAACT
Task1_train_30480
A sequence alteration has been identified in BRWD3 (bromodomain and WD repeat domain containing 3) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 93
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Task1_train_30481
This alteration occurs within gene BRWD3 (bromodomain and WD repeat domain containing 3) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Intellectual disability, X-linked 93
TTTAATAATACCCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTTGTGGCTTTGATTTGCATTTCCCTAATGATTAGTGATGTTTTAGCATTTTTTCATATGTTTGTTGGTCGCTTATACATTTTCTTTTAAGAAGTGTCTGTTCATGTCCTTTGCCATTTTTAAATGAGATTGTTTGTTTTTTTGCTTGTTGATTGAAGTTCCTTATAGATTCTGGATATGATCTTACAATAATCATACACATTTACTGATTATTAATCACATTTAACAGATGGCAAAACTGATCTTCATAGGTATAGGGTCCTGCTTAAAGTTATATATTAGCATATAGCAAAGCTAGAATTGAAATCCAGGTCTTATTCCAAAGCCCAAGCTCTTTTACCACATATAAGCTGCTCCTACAATTTCCTAGGACAACAAGGTTAGGATAAAAAGTAAGAACTTGGCCGGGTGAGGTAGCTCATTCCTGTAATCCCAGCACTTTTGGAGGCCAAGTCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAAGGCAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGTGCATGTAATCCCAGTTACTCGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATTTCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCTCTACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTTAAAAAAAAAAAAAGAGTAAGAAATCACATGTTTTATTGAATCCTCTGATTCTAAAAAAGATTCAACTTTTACTTGATGACGAATAGATGGGAGCTGTCCCTATCTTCCAGAAGATAATTATGTAAAGCTCACTTGATAAGCTACTTTAGCACCTGATGACATTAATAAAAAGTTTTACAAACATCTAAATCAAATCTTTATCTTAATAAATATACATATTCTCAGCTGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCCTGAGGTCAGGACTTCGAGACTAGCCTGGTCAATGTGGCAAAATCCTGTCTCCAATAAAAATACGAAAAATTAGCTAGGCATGGTGGCGTGTACCTGCGATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATAGGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTTGCAAAATAAATAAAAAATAAATAAATAAATATACATATTCTCTCTTATATCCTTCCTGTCAAGAATCATCACACAACTCTTCATTTACCTGGAAAACTATCATAAAATGGCCCTTTAGTCTCTTATTCAGAAAACCAAAATGAAACACACATAAACCTAGGTAGAAATGGTGGTGTATGTATACCTATGTCTGTCTGTATGTGCATGTGTGCATATATATATACACATATATAGGTACAAATGAATGAAATATTTATTGACAAAATCATTCTCCATAAAATATGGAGCCACATGGGTATTATATATGTAGCTACAAGGGTAATATATCAAAACAGCTATTTTACAAAACACCAAAAGTTTCTGGGCTTCTTGTGATTTATCATATTTAAAATATACCAAAGCTGTCAGAACCTTGAGAGTGTTTATAGTCTACACACTCAGCTTATGGAGGCTCCAGAAGGTAAAAAGTTGCTGATTACGGAAAATATCCACAAAGGGGAACTCCTGCTTTGCTCTAATTATGGACTAGTATAGACTAGACAATAGAAAATAGCATACAAATTTTGAGAAACGTATAAAATGTGATCCATAATATTCAGTTCTACAAGAGTATAGATCATCATCTTATCTTGGATACACAATCAACAGTGAAATATGCATAAAACTGAGGGGAAAAAACCATGGGTAAGCAATTTAATTCCAAAGCTACTTCCATTGCATAGCTTATGAATTTGGCAAACTTACCCTGAGATCCATTTTGTTCCATGGCTGTTTTTGTAAATTAACACTGTATATTTTCGATTTCCTTACAGCCCGAACATAAGCTTCATGTCCTTGCCTAAAATAGATAAGCTAAAACAGAAAACATAAGGTATTAAACAGCAGCATCCTATATAACTCTGTATGTCCAATATACATTCCTACAAACATCCTCTTCTGTTTGCAGAAAGAAATAATTATAATATTGAAAGACTTTATACAATAAAGGTTTCAAATGATGTTAATTCAGTATTCATGCCTACGTAGCCCTGTGCTCAGTACCACATCATATAAACACAGTAAACACAGTCCTTTCCCTTCAATCAGCTTCATAAGTGTGCTGAAGAAGCAGATTCATGGAAAATGTACACAAAACTGGTCATATTTTAAAGTATATGTGCCCCTCCATATCCACAGCTTCTGCATCAACAAATCCAATCAACTGCAGATTGAAAATATTTGATATATATAACAATACAATTAGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTTTAATCCCAGCACTTTGGGAGGTTGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAATGTGGCAAAACCCCATCTCTAATAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGACACATGCCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGACGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAAGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCAACATTGCACTCCAGCCTGGGCAATAAGAGCAAAACTCCCTGTCAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGATAATACAGATAAAAAACCAATATCATATAACAACAATTAATATAGCATTTACATTGTATTAGGTATCATAAGTAATATAGAGATAATTTAAAGTATATAGGAGGATGTACATAGGTTATATGCAAATACTATGCCTTTTATATAATGTCCTTGTAGATTCTGTTATTTGCAAGGGGTCCTAGAGCCAATTCTGTGTGGATACCGAAGGACAACTGTACTATACTTCAAATTATAACTGACACTCTAACTATCAAAATTCTAATATTCAGTCTACACATTCCATATAAACAGTATAAATCACAGGTTACTAAATGGAGTAATTTCAAGACAAATTAAAAGTTGCCTGTTACAAGAGTTCATGTCAGAACTGGCATATTATGGAAGGAAAATGAATTCAATTACTTAATTCTTCAGCTCTTTAAGTCACCATTTACTATCATTTTCTATATTTATTACAAAAAGTTTCTTTTCCTCAAGTTTAAAAGCAGTGATAGAGGCTAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGTACTTTGGGAGGCCGAGATTGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTCACCGGGCGTGGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGACTGAGGCAGGAGGATCGCTTTGAACCCAGGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATAGCCCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGTGATAGAGATAAGTAAATAGAAGAAAGTAACAAAAAATACCATATTATGAGATTTCTAAAATACATTAACATACTCTACCAATCAATACTAGGTCAGAATTTCTAATAGCTAAAAATTTGAGCAGAAAATAAAAAAGGTTTAAAATTAGTAAATAAAATAATTGTAAGGGTTAAAAACCAATAATACACGTCATTAAGATATCCTTTATTATATATTCATTCCTGAATTCCACAAATACTGATCATTGAACATCTATGTGTAGGCACTAGATGCTGTGATAAGGCATAAAACCATTTCCTCTAGGATATGGAAACTCATGTAGATATATAACTATAATGCAAGGTAGAATATATTATATATCAGAAGAGAAAAATAATTTAGGTAGAAAAGCCATGAGCACAGAGGGACTGGCCAATGAAAAACAAGGATAACATCCTGGAAAAGTTAGTATTTGAATTAGACCTTGAAAATGATAATTTTAAGAAGCAATGATCTGTATGTAGGGA
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Task1_train_30482
Given this context: Chromosome X, gene POU3F4 (POU class 3 homeobox 4) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; X-linked mixed hearing loss with perilymphatic gusher
CTTTTCAAGCTGAAAGCAAATTCAAGCTTGATGGGGACTGGGGAAGTGGGGGCGGTACTTGATGCCAAACATCCCGCCATTTCTCTCTCTCTGAATTTCCTGGGCACATTAAATGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCA
CTTTTCAAGCTGAAAGCAAATTCAAGCTTGATGGGGACTGGGGAAGTGGGGGCGGTACTTGATGCCAAACATCCCGCCATTTCTCTCTCTCTGAATTTCCTGGGCACATTAAATGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTAGTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCA
Task1_train_30483
A variant was discovered on Chromosome X, affecting POU3F4 (POU class 3 homeobox 4). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; X-linked mixed hearing loss with perilymphatic gusher
TTGATGCCAAACATCCCGCCATTTCTCTCTCTCTGAATTTCCTGGGCACATTAAATGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCAGTTGCTGTGGCTTTATTGCTAGCTAGTATCCACACACCAGGTCCACAGGCGAACCTCA
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Task1_train_30484
A genomic change on Chromosome X affects POU3F4 (POU class 3 homeobox 4). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked mixed hearing loss with perilymphatic gusher
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Task1_train_30485
The gene POU3F4 (POU class 3 homeobox 4) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked mixed hearing loss with perilymphatic gusher
CTGAATTTCCTGGGCACATTAAATGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCAGTTGCTGTGGCTTTATTGCTAGCTAGTATCCACACACCAGGTCCACAGGCGAACCTCATTCCCAAGGAGCACACACGTGTGAGGCCGGCC
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Task1_train_30486
A change on Chromosome X affects gene POU3F4 (POU class 3 homeobox 4). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; X-linked mixed hearing loss with perilymphatic gusher
TGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGACAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCAGTTGCTGTGGCTTTATTGCTAGCTAGTATCCACACACCAGGTCCACAGGCGAACCTCATTCCCAAGGAGCACACACGTGTGAGGCCGGCCAAGCACCCAACACCCAGCCGCCG
TGCAGGGCGGGTGAGGAGGGTGGGGGAGCGGTGAAGGTTAAAAACAATTTTCCTAGGGGATGGCATCGGGGCGCGGGGTCACGAACGTTTTCCTGTATACCTATTCGTAGTGGGTCTGCAGAGTGTTTTGGGTGAGTGTGAGGGCTGCCCGCTTCAGCAAGCAGAACCTTTGACAGAAGTTGTGGGATCTGTGATGGGAACTGATATGGAGCAGTGAGAAAGCAAGGTTTCCAATTGACCAGCTAGATTGGGAAGCAAACTTCGAAATAACTGAATATTGTCAGTATCACATTAGATTTTACTTTCCCAGAATAATTCAGTTCTTCGTGACCTAAAAAATTTTTCAGAAAAATTGAAAGAACAGGATATCTCTTAGAAGCTTTCAGACCTTGATATCGAGGTTCTTAATACAATGAAATAAACTGAAATGTTCTTATTGGAATCATTGGTTTCAACTTTATTGGTTTAGGGTCCAATCGAAGACGTTACTTTGCTCAAAGTTTGTAGCGACGTTTTGTTTTGCAGTCCTAGGCACACAACTAGCCCGCCCAGACAGCCGAGTGAGTCTGAAAAATCCCTATTCACTGAGATCAAAATGACATTTAAACTTGCTTTACTTTTTCTTTATTTAGATTAATCTAAATAATCAAAAAGGAGTTCTACAACCTTAATTTTCCACCTCACTCCCTGACTGCCCCCCAACAACACATCCCTCACATCTTTTCCCCATCAACATAAACCCCGCGGTGGGGGGGGTAGTAATCAAATGTACGGCCGCCACTCTGCGCTAGGCAGCCAATGGAGCTGAAAGATTGATTCACTTCCTGCTTGGGTCTCATTGAAACTCCGGAGCTTCACCAGCCTAATTTGGAAAGCGAGCCCGACCTCCCGCACCGCTATTGGCCGGGCTTACTCCTGGCCAGGCGGAGACGCGCTGCGATTGGCCGTGGTGGGTGCCGGTAACCCGTGCTAGCGTCTTTGGCTCCCCGCACCGTAGATGTCAAAGGCTGAAGCTGCTCCCTTTGCCACATTATAACTAGTAGGGGATCCTCACCGACCATGGCCACAGCTGCCTCGAATCCCTACAGCATTCTCAGTTCCACCTCCCTAGTCCATGCGGACTCTGCGGGCATGCAGCAGGGGAGTCCTTTCCGCAACCCTCAGAAACTTCTCCAAAGTGATTACTTGCAGGGAGTTCCCAGCAATGGGCATCCCCTCGGGCATCACTGGGTGACCAGTCTGAGCGACGGGGGCCCATGGTCCTCCACACTGGCCACCAGCCCCCTGGACCAGCAGGACGTGAAGCCCGGGCGCGAAGACCTGCAACTGGGTGCGATCATCCATCACCGCTCGCCACACGTAGCCCACCACTCACCGCACACTAACCACCCCAACGCCTGGGGGGCCAGCCCGGCACCGAACCCGTCTATCACGTCAAGCGGCCAACCCCTCAACGTGTACTCGCAGCCTGGCTTCACCGTGAGCGGCATGCTGGAACACGGGGGACTCACCCCACCTCCAGCTGCCGCCTCTGCACAGAGCCTGCACCCGGTGCTCCGAGAGCCCCCGGATCACGGCGAACTGGGCTCGCACCATTGCCAGGATCACTCCGACGAGGAGACGCCAACCTCTGATGAGTTGGAACAGTTCGCCAAACAATTCAAACAAAGAAGAATCAAGTTGGGCTTCACGCAGGCCGACGTGGGGTTGGCGCTGGGCACACTGTATGGTAACGTGTTCTCGCAGACCACCATCTGCAGGTTCGAGGCCTTGCAGCTGAGCTTCAAAAATATGTGCAAGCTGAAGCCCCTGCTGAACAAGTGGCTGGAGGAGGCGGATTCGTCCACAGGGAGCCCGACCAGCATTGACAAGATCGCTGCACAGGGCCGCAAGCGCAAGAAGCGGACCTCCATCGAGGTGAGTGTCAAGGGCGTACTGGAGACGCATTTCCTCAAGTGTCCCAAGCCTGCCGCGCAGGAGATCTCCTCGCTGGCAGACAGCCTCCAGTTGGAGAAGGAAGTGGTGCGTGTCTGGTTCTGTAATCGAAGTCAAAAAGAGAAAAGAATGACTCCGCCAGGGGATCAGCAGCCGCATGAGGTTTATTCGCACACCGTGAAAACAGACACATCTTGCCATGATCTCTGACTGGAGGAAGCGAGGAGGCGGCCGGCCGCACTGGGAGCAGCGCGGATTTCTCTTTCTCTCTCACTCTCTTCCTTTCATTCTAGTATTCTTTATTATTTTTCTCTCTCTCTCGTTCGCTCGCTCTCTCGTACTCTCTCTCTTTTCCCTCCTTTCCTTTTTCTTTCCTTTCCCCTTTTTCTTTCCCTTCTTTTTCCCTTTCCTTTCCTTTCATTTTCTTTCCTTTCCCCTTCCCTTCCCTTCCCTTCCATCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTTTTCTTTTGCTTTCCTTTCCTTTTTTTCCCTTTTCTTTCCTTTTCATAAGAGGTTCTAACTTCTGTTGACAAAGGAAACACATACTCTCTCATTCAGGCTTCTCAATGCTGATACACAGTTACATTAAGCAGTCCAAGCTGGGATCTCATATTCCTGGCTCCCCGGGCAACAGTTCCCTTTAGCCTTTTCTGCTGATCAATACATATTGTTTACTCAGAGTAAGGTTTGTTTGGTCGCTCCTCTCTAGGAAGAACAAGGAGTGGGATAACGTGGGGGCGGGGTGGGGCGGGGGAGGGATTGGGAAGACAGATGTGTGCCTCTGAATAACCTTTCAGCGCCTTGGTTATAGCAGCTGTATTTCAGGTGAAATTTGTTTTACAATAGACTAGTTTTGCATTTTTAAAAACTTCTATAGCGTTTCTAAATGTCTGCGGTGTTTTACTACAATCTGTACACAATATTTGTGAGATAATTTGTATCTAATCGACCACTCCATGTTATTATTGCTATTATTATTACTACTTCGTTGAGCTGATGGCTTTTTAATTGCTTAGAAAAGGGAGGAGATGAATGGGAATAGGCGGGGAGAGAGATGCCTATCTACTCACCGCCCCCCCCCTTCCCAAATCTCTATGAGGAGGAGAGGATACAACGAAGAGAGTTATTGATGATGATATTGGTTATATTTTTTTTCCGGGGTGGAGTGCCTAGGAAGGGCAGAATAGGGAAGCCTATTAGGTTTGCAAACTAGTGCGAAGTAGCAGCGGCGATTTCGCAGCTTTCTGCCCTCCCTCCTGGAAGTGTGGAGCCCGCGCAGGCTACCGCAGCATAGATCGAGGTATCTGAGAAGGATTCGGCGGCAACTCTGGGCCAAAGAGGTGGCCTGACAGTCTGGGAGGGCTCCGCACTCACCGGACTCCAGGATTCCTGCGCGCAGAAATCCAGGCCCCCAGCCTCGCTAGGGCGACCTTCCGCGCGACCTCACTTCGGCCCTCCTAGAGGAAAGACTTTGCCTTCACACGCGATTACTTTCACTGGAGATCACGACCCGGAGACGCTGGCGACTGGGCCAGCGCCTCCCATTTCGGTTCACCTCCAGTTCACCGCCCCCTCTGAGTAAGAAACCCTTGGGGAGGGGTGGCGAGGGAGTGGGGGATAGGCATTCTCTGCTCAGTGCAGAACGGCAATGAAATGATTGGCAAAGGTCACAGGGATTCTGGTCCATCCGCGTACCACCTCTCCCCCCATGTATATACCGCTGTCTGTGTGTGGGCTCGTGGGGAGCTGTCTCGGCGTTTCTGATAAGCACAGCTGGTGGAAGCCCACAGCGACGATCCAGCGAGCTAGCGAGCGCCCGGGAGGCTGGGTTCCTGCTTTTTAAAATATAAATATATATATATTTTTAAATCTCTGTGTGTATGTGTCTCTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGTGCAAACGTGTGTGTGTAGATAGCTGTGTGTATCGCGTTACTATGTACAAAAACAAAAAGTACAAAAAAAAAAAAAAACCTGGCTAGGCTGTGTAGAGATCCCAAAAATATGCAGTTGCTGTGGCTTTATTGCTAGCTAGTATCCACACACCAGGTCCACAGGCGAACCTCATTCCCAAGGAGCACACACGTGTGAGGCCGGCCAAGCACCCAACACCCAGCCGCCG
Task1_train_30487
Here is a variant affecting CHM (CHM Rab escort protein) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Choroideremia
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Task1_train_30488
A sequence alteration has been identified in CHM (CHM Rab escort protein) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_30489
This variant lies on Chromosome X and affects the gene PCDH19 (protocadherin 19). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
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Task1_train_30490
This variant impacts the gene PCDH19 (protocadherin 19) on Chromosome X. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
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TCTCCTATAAAAATCGCCACTAGCAGTCACAGGTTTGAAAGCTAAGAGCAATATTAATTTACATTTCTCCCATCTGAAATGACTTGGTGCTGAAGGAAAGAAAAGTCATGGCCATTTCACTAGTAACAGGATTAAAGCATTTATGAGGCATTGCAGCTGCTCTTTTATGGCACCTGATTGATATTCATGTGTGGTTAGCATTTGTCTACTAACTTGTGTAACGCAGAGAATAGTAAAAGGGAAACAATAATTGCATGGCTGTTACATATTCAGGGGGCTCTGATTCACAGAAGTGTGCATTTCAGACGGTGTCAAATACAAACTGAACCTACAGGAACATATTTTGACTGATTAACATGCAGACACAAATGGCACAAAAGACACACTGATGTGTAGGTGTGTTGAAAGCACACACACACCTTGGTTGTAAATAGCAGCATCATTCATTTTCAGCAAACTAAAGAAACAACTTTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCAGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGC
Task1_train_30491
A change on Chromosome X affects gene PCDH19 (protocadherin 19). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
CTCCTATAAAAATCGCCACTAGCAGTCACAGGTTTGAAAGCTAAGAGCAATATTAATTTACATTTCTCCCATCTGAAATGACTTGGTGCTGAAGGAAAGAAAAGTCATGGCCATTTCACTAGTAACAGGATTAAAGCATTTATGAGGCATTGCAGCTGCTCTTTTATGGCACCTGATTGATATTCATGTGTGGTTAGCATTTGTCTACTAACTTGTGTAACGCAGAGAATAGTAAAAGGGAAACAATAATTGCATGGCTGTTACATATTCAGGGGGCTCTGATTCACAGAAGTGTGCATTTCAGACGGTGTCAAATACAAACTGAACCTACAGGAACATATTTTGACTGATTAACATGCAGACACAAATGGCACAAAAGACACACTGATGTGTAGGTGTGTTGAAAGCACACACACACCTTGGTTGTAAATAGCAGCATCATTCATTTTCAGCAAACTAAAGAAACAACTTTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCG
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Task1_train_30492
A variant affecting Chromosome X, within the gene PCDH19 (protocadherin 19), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
TTGACTGATTAACATGCAGACACAAATGGCACAAAAGACACACTGATGTGTAGGTGTGTTGAAAGCACACACACACCTTGGTTGTAAATAGCAGCATCATTCATTTTCAGCAAACTAAAGAAACAACTTTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCC
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Task1_train_30493
This is a variant in PCDH19 (protocadherin 19), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
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Task1_train_30494
A mutation found in PCDH19 (protocadherin 19) on Chromosome X may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
CTGATGTGTAGGTGTGTTGAAAGCACACACACACCTTGGTTGTAAATAGCAGCATCATTCATTTTCAGCAAACTAAAGAAACAACTTTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGA
CTGATGTGTAGGTGTGTTGAAAGCACACACACACCTTGGTTGTAAATAGCAGCATCATTCATTTTCAGCAAACTAAAGAAACAACTTTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCATCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGA
Task1_train_30495
This variant affects gene PCDH19 (protocadherin 19) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
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Task1_train_30496
The gene PCDH19 (protocadherin 19), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
TTTTTCAACTGTTTCGATGAGACACTGCTGGAAAAAAAATGTCATGTATTATCCTAAATTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGAGCTTGAGCGCGCTCCCTCGCGCTAAGGCTGGCTTCGAAGGGCTTGGGGGCGCGTCTGTCCAGGATCCGAGGTGGGAGCGGAGTTCC
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Task1_train_30497
This gene mutation involves PCDH19 (protocadherin 19) on Chromosome X. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
TTGGATTCTAGGATTCTAGAAATGCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGAGCTTGAGCGCGCTCCCTCGCGCTAAGGCTGGCTTCGAAGGGCTTGGGGGCGCGTCTGTCCAGGATCCGAGGTGGGAGCGGAGTTCCCCCCACAGAGCAGTTGAGGGTCTGCGGGCGTTTTCGTCTAGGAAATCAAAGTTAACAA
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Task1_train_30498
Mutation context: Chromosome X, Gene PCDH19 (protocadherin 19). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
GCTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGAGCTTGAGCGCGCTCCCTCGCGCTAAGGCTGGCTTCGAAGGGCTTGGGGGCGCGTCTGTCCAGGATCCGAGGTGGGAGCGGAGTTCCCCCCACAGAGCAGTTGAGGGTCTGCGGGCGTTTTCGTCTAGGAAATCAAAGTTAACAACGCAGTCCGACCCTCCACGTCAA
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Task1_train_30499
Mutation context: Chromosome X, Gene PCDH19 (protocadherin 19). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 9
CTTAGACTTATGTGCTCTATCCAAATGTAAGAAAGGGCTTCAGTAAGACCTTCTAATGTGCTTATCAGGAAATCTTTTTAAAAAATACTGTGTTTCTTCTTTTCTCCCTTTTCCTCCCCCTTCTATCCCTCTCTCTCTCCCTCCCCCCCCCATACACACACAGACACACACACATCCTTCACACACTTCAAGAGAAACTGTAACACAATAGCCCACAGTGACATCCACTGGTAGGAACCAGATCTTAATGCCACAACACAGTCTCACATTAGAGGAAAGCATCATCAACTCTAGAAGATTGCTATTTTTACTGAAACATCTGGATGCAAAGTCTTGTTCCTCATTGGGATGTTTGGTCTCCACACTACCAACCAACCAGATATTTGAAAACATACAGATGCCTGATAGAATTTCACTTTATATAGCCAGATGTTTGGGGACTAGATAAAAAACAAGCCAAGAATAAACTAAAAACCACTAATCACCTGCATCTCCACACACTCCTGTTCTCTCCTCCCCCTCATCTCCCTTTCCCATCTTACACTCCCACTCCCAGTCTCTCTCCAGAGTTCATCACTGCAACAAGACAGGGTAGCTGCCAACACTCCCTCTCCTTTCATTCAGTACCTGTCCCAAAAACACTGTGCCCCAGACACCAAGTTGTGGTAGTTGGTGGTTTTCCTAAAAATATGATCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTGTTTTTCCTACCATAACTTCATGGAGACAGCTATGCAAATTTTAAAATGATAATTGCGTTTCTGCTCACCATCATTATGTGACAGAATCCATTCAAACACTAAATGATTGTCTTCCAGCAAATTGTCAGATCAAAAGAATTGATCAACTTGGACTGTCACAAACTTTTCACCCTACAAAAAGAAGCACTGCAAGTATGCTGCATGCATTTAAGTAGGAAACAAAAGCACCAGGATTTTCACACAGAGACACAGATAAACACACCTTATTCATCCAAGACAAAGAAAGAAAACTTGGCTTTACCTGCAGTTGTAGGTCCGGATCTCTTTGTTGTCTCGCTTGCACTTGATTGCCACGAAGATCATAGTTACAAAGAGGATGCCCGCAATGGAGCCCAGGGCAATAATGAAAATCAAGGACAAGTTCACAGAGCCCATTGACTCTTGGGCATCGAGAGCAGGGGACAAGTAGATTAGGACGAGAGCAGAGGCAGAGAGAGATGTCTTGCCGTGGTCGTGAGCCACCACGATAAGCTCATAGGAGGACTTGGAGCTCTCCCCGAAGGTGCGGGTGGTTCTGACTTCGCCATTGACCTGGTCTATTTCAAAGAAGCCGCGGTCGCCCTCGGTCATGTCGTAGGTGACTCGGCCATTTTCGCCCTCATCGTAGTCTTCTGCCTTGACAACAGTCACCAGGTAGCCTATGCCAGAGTTGCGGGGTATGTAGACCTCGGCAGTGCCGTTAATCAGAGGTGGGGCTGTGATGACCGGGGTGTTGTCGTTGACGTCGAGGATGATGACCCGCACCGTAGCGTTGCTTTGCAGTGAGGGAAGGCCGCCGTCCTTGGCCAGCACCTTGAATTCGAACGCCTTGGTCTGCTCGTGGTTAAAGGATCGCAGCGCGTAGATGTCGCCTGAGTTGGGATTGATGGAGACATAGGTGAAGACAGGCATGTCCCGCACCTGCGACGGCACGATCTGGTAGGAGACACTGCCGTTGAGACCCAGGTCGGGGTCGCGAGCAGACACAGAGAGCAGATAGGCGCCAGGCGTGTTGTTCTCCTGCACAATGACCTGGTAGTAGGGCTTGGAAAAGTGCGGGTGGTTGTCATTTTCGTCAGTGATGAGCACGGTAAAGGACTTGGCACTCTGCAGCATGGGCACGCCGCCGTCGCGTGCCTGAATTGTGAGGTTGTATTGGTCGTGCTGCTCGCGGTCCAGCCGTCCGTCCACCAGAATAGTGGAGAAGCTCTCATATTCCTGCAGTCGAAAGGGCACATTGCCCAGCAAACGGCACTGCACACGTCCATTGAGGCCTGAGTCGCGATCAGACACCCGCACCAAGGCGATCACGTAGCCCGGGGGGGCGCTCTCGCTGACCTCCACAAGCTCACTGTTGACTGACAGCAGGTTGATGACCGGCGGATTGTCATTGGTGTCCAGCACGCTGACGGTGACCTTGCAGTGTGCCGGGATGGAATTGGGCCCCAAGTCCTTAGCCTGCACGTCCAGTTCGTACACGTGCCCCTCTTCGTAGTCTAAAGCGCCAGTGACAGTGACCAGGCCACTGTGCGGGTCGATCTGAAAGAGCTCGCGCGTGCGGTCGTTGACGTAGCCATAGAAGGAGTAGACCACCTGGCCGTTGGTGCCCTCGTCTGGATCGCTGGCGTTGAGGCGGATGACGGGTGTGTTGGGAGGCGAGTTTTCTGGCACGCTCACCGCGTAGGTGGACTCGCTAAACACCGGGTTGTTGTCATTGGAGTCGGTCACCTTGATACTAAGGCCAACGGTGCCCAGGCGCGGCGGGTCGCCACCGTCTAGCGCAGTGATTCGGAAGCTGTAGTGCGACTGCGTCTCGCGGTCCAGGCTCTTTTCCACCACGAGTTCGGCAAAGCGGGAGCCGTCGCCGCGCGTCTTGATCTCCAGGCCGAACAGCTCGTTGGGCGTGAGCTCGTAAGTCTGCACGCCAAAGCTTCCTGAGTCTGGATCGTAAGCGCTGTCCAGCGGGATGCGCGTGCCAGGGCTGGCTGCCTCCGAGATCTCCAGCTCGATCTGTGCTGCCGGGAAACTGGGCGCATTGTCGTTCAGGTCCTTGATCTCCACCTTTATCACGCAGATTTCCATTGAGCTGGACATGACCTCGAGCGAGATGATGCACTTGGGGCTCTGGCGGCACAGCAGATCACGGTCAATCTTCTGCTTGGTGACCAGCAGGCCAGAGCTGGGATTGATGTCCACTAGGTGTGGAGCCGAGTTGGACACCACGCGAAAGGCTGAAGCCTGCCGGGGGTCCAGCGCGAAGCCCGCCTCTCGCGCGTCTTTGGCCACGTTGGCAATCACCGTCCCGGCGCGCTGCTCCTCTTCTACCGAGTACTTGAGATTAATGAGGGCGGCAGCCTGCGTCCACAGTATGGCCAGCAGCAGCAGCACCGGCAGCAGGAGCGACTCCATGGCTGCACGGGGCTCTGCCTGGCCTCGCCTCTCCACACCCCTCCGAGACCGACGCCGTCGGCGCTCCAGCTTCCCGCCGGCTCGGGCCGCCTGTTGCGCGCGCCCCGTGGCCCCGGAGGCCGCGGGAGAAGTCCCGCCCAGGGCGGCCCGGCGGCGCGCGGGGGACACCCGCGGCGGCTCCAATGCTGAGGTTGCGGCGGACGCGGCGGGGGCTCGCGGGGGCCCCGGGGGCTCCGAGGGGCCAAGGGAGCGCCGCGCGGCCCCGAGCCCCCTCCCTCCAGCCCGGCTACTCAGTTTTACCCCTTCAAAGTTAGCCGGGCGCGACTGTCGGCAGCCGCCCAGGGCTGCGGGTCGGGCGGCGTCTGCGCGGCCTGGAGGACGCACCGCTGAGTCCGGACAGTACTTGAGGCGAAGGTAAAGAGGGCGGAGGAGGCGCAGCCTTTCAGGCACTGCCCGGCCCGCCGCGGTGCACCGGCACTGAGGCTGGCGAACTCGCTGTCTGTGCACCTGGCATGCGCAAAGACCTCCCCCCAGCGCTCCCAGTTCACTGCGGAGAGAGTACCCGCTTGGAATGCGCCCTCCGGGGTCTGGGGGGGCCACACTGGCCTCTTCGAGGCCTGTTCGGGAGAAAGGGGGTGTCGCAGACGGGAGTCAGTTACTGGCAAGCGCCGCGGGCACCCGGTTATAGGGTTGAGTCGGATGGCGGTCCCGGGGCCAGCAGAGGAAGGGGGAGGGGAGAGAGGCTGCCAGAGCTTGAGCGCGCTCCCTCGCGCTAAGGCTGGCTTCGAAGGGCTTGGGGGCGCGTCTGTCCAGGATCCGAGGTGGGAGCGGAGTTCCCCCCACAGAGCAGTTGAGGGTCTGCGGGCGTTTTCGTCTAGGAAATCAAAGTTAACAACGCAGTCCGACCCTCCACGTCAAG
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