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Here is a variant affecting PRNP (prion protein (Kanno blood group)) on Chromosome 20. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Gerstmann-Straussler-Scheinker syndrome
AGGGAGGCTGGTTGGGAGGCTGTTGAAGAAATCAGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTT
AGGGAGGCTGGTTGGGAGGCTGTTGAAGAAATCAGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCAAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTT
Task1_train_27701
An alteration has been detected in PRNP (prion protein (Kanno blood group)) on Chromosome 20. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Fatal familial insomnia
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AGGGAGGCTGGTTGGGAGGCTGTTGAAGAAATCAGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCAAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTT
Task1_train_27702
Mutation context: Chromosome 20, Gene PRNP (prion protein (Kanno blood group)). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Inherited Creutzfeldt-Jakob disease
AGGGAGGCTGGTTGGGAGGCTGTTGAAGAAATCAGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTT
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Task1_train_27703
A variant found in Chromosome 20 affects PRNP (prion protein (Kanno blood group)). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Kuru, susceptibility to
AGGGAGGCTGGTTGGGAGGCTGTTGAAGAAATCAGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTT
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Task1_train_27704
A variant was discovered in gene PRNP (prion protein (Kanno blood group)), Chromosome 20. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Inherited Creutzfeldt-Jakob disease
AGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTGAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTTTTCAGTCCTGGATTTAGAAATAGATTTTCTTGA
AGGTGAGAAGTGATGGAAGCACCGAATAAGATGGTCATGTTGGAAAAATTGAGAAGCTGAGGTGCTTAGCATTGATTTTCAAGGTAGAGCTACTGAGATTTGCTGATAGATCCAATGTATGCTGGGAGAGAAAATTCAGTCACTCTAGAGCATTGGCTGGATTTGTCACCCATTGCAGCGAATGGAGAAGGTGCTGACATAAAAGCCCTTTAGACTGAAAGCTACTGACTGAGGGGATGGTGCCCTAGTTTGATTTCCTGGGGTGTATGAGTAGCAGGGAGGCCAAGAGCTGGGCCTCACGAGATTGTGGGGACTACATCAGGGAAGCAGGCCTGCAAAGAACCTGCACCACAGACCCCCACCTAAAAGAGCCTCCAAAAACCCTAACTGGCATGACCTGAGTACTTTAACTCTGCTTGTAACTTTCAAATATATTTTGATTTGCTTATGACCACCAAGGCAAAACTTCCCATTTCAATAATGTTAGTAGAAACATAAACAGGATGTTAATTTATTTATTTGGTAATTCTTTTTATGAATATTATCCAGTTTAATCATTAGCTCTGAAGGAGATGAAAAATAATTTTCTAATTTTTAGAAAAATTTGCAGCTAATTGGGTGATAAAGGTAAGGGGTTTCTGAGTTCACAAAAATGTTCTAAAATTGGCAACAGTTTCGGTTGCACGTTTCATTAAATGTACTAAAAACCATTGAACTGTACATGGTATATGGTGAATTATATGGTATGTGAATTATATCTCAACAAGCTGGGTATTGTTTTTTTAAAAAATAAAAATAAAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAAAAACAATTGCAGATCATCCCAGCACTGAGGACAAGACTAACTTCAGTGTTCCAGTATATGCCATTATAGGTTTTACGGCACACAGTGATGATTTGGAGCCTATGATTTGACCTAGGGTACAGCAGGTACTGTTTAGCAATCATTTTACTATTGTCATAGGTCTCTGCTCTTGGAGCTAAGTGCCCAGGGTAAATGAGATCTTTAATTTGAAAAGAGATTTTTGATTTGATGAATGTACATTCTCCAAAGGGTCATAAATTGTCATTCTGGATGTTTGATCTGTTTGTTGTTTTGGTACAAAAATTAGAAGAAAATAATTCACTCATAAAATGTTAAATAATGAACTAAAAGTCATTCATCAAGTCCATAACTTAGGGTCACATTTGTCCTTGGAGCAGGAGAAAGAGTTGTGTTCACCCTTTTCTTACTTTTGCTTTTGTCCTAAGTGCTTCAGAGAAGTACAGGGTGGCAACAGTGTTTCTACTGAGCAGCTGATACCATTGCTATGCACTCATTCATTATGCAGGAAACATTTAGTAATTTCAACATAAATATGGGACTCTGACGTTCTCCTCTTCATTTTGCAGAGCAGTCATTATGGCGAACCTTGGCTGCTGGATGCTGGTTCTCTTTGTGGCCACATGGAGTGACCTGGGCCTCTGCAAGAAGCGCCCGAAGCCTGGAGGATGGAACACTGGGGGCAGCCGATACCCGGGGCAGGGCAGCCCTGGAGGCAACCGCTACCCACCTCAGGGCGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGGCAGCCCCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCTCATGGTGGTGGCTGGGGTCAAGGAGGTGGCACCCACAGTCAGTGGAACAAGCCGAGTAAGCCAAAAACCAACATGAAGCACATGGCTGGTGCTGCAGCAGCTGGGGCAGTGGTGGGGGGCCTTGGCGGCTACATGCTGGGAAGTGCCATGAGCAGGCCCATCATACATTTCGGCAGTGACTATGAGGACCGTTACTATCGTGAAAACATGCACCGTTACCCCAACCAAGTGTACTACAGGCCCATGGATGAGTACAGCAACCAGAACAACTTTGTGCACGACTGCGTCAATATCACAATCAAGCAGCACACGGTCACCACAACCACCAAGGGGGAGAACTTCACCGAGACCGACGTTAAGATGATGGAGCGCGTGGTTCAGCAGATGTGTATCACCCAGTACGAGAGGGAATCTCAGGCCTATTACCAGAGAGGATCGAGCATGGTCCTCTTCTCCTCTCCACCTGTGATCCTCCTGATCTCTTTCCTCATCTTCCTGATAGTGGGATGAGGAAGGTCTTCCTGTTTTCACCATCTTTCTAATCTTTTTCCAGCTTGAGGGAGGCGGTATCCACCTGCAGCCCTTTTAGTGGTGGTGTCTCACTCTTTCTTCTCTCTTTGTCCCGGATAGGCTAATCAATACCCTTGGCACTGATGGGCACTGGAAAACATAGAGTAGACCTGAGATGCTGGTCAAGCCCCCTTTGATTGAGTTCATCATGAGCCGTTGCTAATGCCAGGCCAGTAAAAGTATAACAGCAAATAACCATTGGTTAATCTGGACTTATTTTTGGACTTAGTGCAACAGGTTGAGGCTAAAACAAATCTCAGAACAGTCTGAAATACCTTTGCCTGGATACCTCTGGCTCCTTCAGCAGCTAGAGCTCAGTATACTAATGCCCTATCTTAGTAGAGATTTCATAGCTATTTAGAGATATTTTCCATTTTAAGAAAACCCGACAACATTTCTGCCAGGTTTGTTAGGAGGCCACATGATACTTATTCAAAAAAATCCTAGAGATTCTTAGCTCTTGGGATGCAGGCTCAGCCCGCTGGAGCATGAGCTCTGTGTGTACCGAGAACTGGGGTGATGTTTTACTTTTCACAGTATGGGCTACACAGCAGCTGTTCAACAAGAGTAAATATTGTCACAACACTGAACCTCTGGCTAGAGGACATATTCACAGTGAACATAACTGTAACATATATGAAAGGCTTCTGGGACTTGAAATCAAATGTTTGGGAATGGTGCCCTTGGAGGCAACCTCCCATTTTAGATGTTTAAAGGACCCTATATGTGGCATTCCTTTCTTTAAACTATAGGTAATTAAGGCAGCTGAAAAGTAAATTGCCTTCTAGACACTGAAGGCAAATCTCCTTTGTCCATTTACCTGGAAACCAGAATGATTTTGACATACAGGAGAGCTGCAGTTGTGAAAGCACCATCATCATAGAGGATGATGTAATTAAAAAATGGTCAGTGTGCAAAGAAAAGAACTGCTTGCATTTCTTTATTTCTGTCTCATAATTGTCAAAAACCAGAATTAGGTCAAGTTCATAGTTTCTGTAATTGGCTTTTGAATCAAAGAATAGGGAGACAATCTAAAAAATATCTTAGGTTGGAGATGACAGAAATATGATTGATTTGAAGTGGAAAAAGAAATTCTGTTAATGTTAATTAAAGTAAAATTATTCCCTGAATTGTTTGATATTGTCACCTAGCAGATATGTATTACTTTTCTGCAATGTTATTATTGGCTTGCACTTTGTGAGTATTCTATGTAAAAATATATATGTATATAAAATATATATTGCATAGGACAGACTTAGGAGTTTTGTTTAGAGCAGTTAACATCTGAAGTGTCTAATGCATTAACTTTTGTAAGGTACTGAATACTTAATATGTGGGAAACCCTTTTGCGTGGTCCTTAGGCTTACAATGTGCACTGAATCGTTTCATGTAAGAATCCAAAGTGGACACCATTAACAGGTCTTTGAAATATGCATGTACTTTATATTTTCTATATTTGTAACTTTGCATGTTCTTGTTTTGTTATATAAAAAAATTGTAAATGTTTAATATCTGACTGAAATTAAACGAGCGAAGATGAGCACCACCTCCCGTGTCTGCAGTTGTATTTCCTGGTGCTTGCCCTGTGTTGGGGACTGTTTTGGGGGTTAATCTGAGCCAAGTGGCGCTTTCTGTCCTCCCTTCTCAAGTGATGGCCGATGGTTCACGCACTTCCCCCTGTTCCTGCCCTTGTCCTCACTTCCCAGTCACCCACTAGTTCATCTCTGCGGCTTTTGCATTTTCTCCACAAGCATCTAAGTGGGCTTAGCACTGGTAAACTGCAAAGGCACTATTGCAGCAGGAGGAACAGTCTGGGAGCTTTTTTCAGTCCTGGATTTAGAAATAGATTTTCTTGA
Task1_train_27705
A genetic alteration is present in PROKR2 (prokineticin receptor 2) on Chromosome 20. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Hypogonadotropic hypogonadism 3 with or without anosmia
CAGTTACCACAAATGTATAATACAAACAGATTCAGAAGTGATATTTATGCAGCACTAGGGTGCTATTTTGCAACATGCAGGGAGGACTGTCAACACTTCTAAGACCGCAGGGATGCTGAGAGTCTTGGGGTCACTGAGAATCTGAGGTTAAATTTCCCAGATTATAACCAAGAACAGGGATCCCTTTTTGGCCCACTGTAGACAAGGTACACTGTGAAGTCTTCAGGAGTCTTTCATCCAAAGAACAGGGATGAAAAAGTGTGGGTATTTCTCTAATAAATCACAGTGGATGGGGTTTCCAAATAAACTCCCTCCAAATAAACTGTTCAATATCACTTCTCCATTCTTATCGTGTGCACAGTTGAAAAGCACATTCACAAACCATGGCCTCAATGGGCTCTCCCAACAGTCTTGCAAGGTATGAAGAGCGGATATTTTCATCATCGCCATTTCATTAAAGCAAAACTGAGACACAGAGAGAAAACATCATGAATTTAGGACTTGAGTCTTAGAGTTAGGACCTGAACCCAGGTCTTTGGATTCTAGGTAGAGTTCCTTTTGTAAAAGAGGGAGTGTTCTAGAAAGTGGTCCAGTCCTTAGCAAAATGCCCACAGAGATTATGTTCATTGCCAGTGGCAACCTCCACTTTTTTCTCTGTCCTCTTTCCCCCTGACCCCAGAGCCACTGAAATCCTTTGCACTGAGGAGGCAAAAATTGACACCTCAGGATTACCCATCTCCACCCAAATAAAATGATAAGCTTTCAAGCATCAGTGGGAAAGTGATTTTTAGGTTCTTTCCTTTGAAATTACACCATTGTGGATAACCACATAAGGCTGGGCTGACTATAAGAATTTTTTTTTTCTTGAAGCCAAAATCCTAGAGAATGCCCTGGGAGGCAGTAGGAGGTGGGTGGGAAAGTTCAGTATGATGGCTGTAACACACCTCCCATGATGCTGTAAACCACGCACTGACAAACTTATCGTTACATTTCCATTGTGTCTAAGAGTCTTCTTCTATAGCCGTTGGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTCCTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACTCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGCAATCTCAGCTCACTGCAAACTCCAACTCCCAGGTTCAAGCTATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTAGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGCCTGGGTTGAACTCCTGACCTCAAGTGTTCCACGTGCCTCAGCCTCCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCATGCCTGGCCTATAGCCTTTTGATATTCCTGCACTGGTAAGATACAGAATTAGGGAAGATGGAGGGTGAACTATCTATATATCTGGAGATAGCTTGGAAACTCCAATAGCTTCTGCTACTTTGTTATGTTTTTTATATGTTTTTGATTGTAATCAAATCAAGTGTTTTTTATTACAGTAGGTGAAGAGTAAATGTCAGCTCCTGCTGTCCCTGTCTAATCTCATTGGTGTGGTTTGCACACAGTACATGTTCAGTCCATGTCAGTTGCTGCTCCTTGTGTCTAATCTCCTTGTTGGGATTGTGGACACAGTAGGTGTCGAGCGGATATCAGTAAATGTCAGCTGATTTGGTTCATGTCTAGTCTCATTGTATGTTACGACTTTGCAGCATTCAGCTTCTTGAGGGCACGGGGGAGGCATGAACACAGATGTCATTTCCCATGCAGCCTATGAACTTGGTTGATGGTGGGTGATGCTCTGAGTACTGGACTGGGGTTTTCAATTGTGTGACACCAGTGGGTCACTTCAGCCTGATACAGTCCACCTCTTCTGTGGTGGGCACCCCGTTGGTTCTGAGGTCAAGGTCAGCACTGGACTTGCTCCCCCGCTGGGAGGGACGCCAGTGCAGCAGCATCATCTTCTTGAAGTACTTCATGGTGTTGTTCTTGACCGTCACGAAGCACACGGTGTTGATCATGCTGTTGCTCATGGCGATGCACTCGACCACGTAGAAGGCAGTGAGGTAGTGCTTTTCCTTCACGAACACAGTGGGGAAGAAGTCACGAACGATGGTGAAACCGTAGAAGGGTGCCCAGCACAGCACATAGGCCGTGAGAATGCACATGAGCACCAGGACCGTCTTCCTGCGGCAGCGCAGCCGCTTGCGAATCTGCTCCGTCTGGAACCCAGGGACTGCCTTGAACCAGAGCTCCCGGGAGATCCTGGCATAGCACAGGGTCATGGTGACCACAGGGCCCACGAACTCGACACCAAAGATGAAGAGGAAGTAGGACTTGTAGTAGAGCTGCTGATCCACAGGCCAGATCTGGCCACAGAAGATCTTCTCCTGGCTCTTGACAATAAAGAGGACCGTTTCTGTTGCAAAGTAAGCCGATGGGATGGCAATGAGAATGGACACCATCCAGACCAAGGCGATCAGGAAGGAGGCCGTTTGATAATTCATCCGTGGTTTCAAGGGGTGAACGATGGCGAGATATCTGGTGGGGGAGGGAAGCCAACAGTAGTAATGATGAATACGTGGAAACGTTAGTTTGTAACTAACCCCAAACATACACTAAAGCAGTGGCACAGTGAATCCTCATGTACTTGTTATCCAGCTTTAACAAGCTTCATCTTATTTTAGCAACATCATTTGGCATAGTGAAGTGTTTTAGTGAAAACAGCACAGGCTTTGGGTCAAACAGGCTGAATAAATCCTGGGTTTTCCCTGGATTGGCTTTGGGGTCTGAGATGAATTATTCAATCTCCCTGAGATTTATTTCCTCAAATGCAACCTGGAATAAGATGATACTTACTTTGCAGGGCTACTGTGAACACTAAATATGGCAATTTTTGTAAAATGCTTTGTGTATAGTAGGCGTTCAATAAATACTTGTGTCCTGTTATTATTCTTAAGCATCCTATTATACCACCTTGGGTTTCCATCTTGTCATTCTGCCCAAGAACATACAATACTCTCAGAGCTCTTCATTCCAAATAGCTCACGGTTTAGGTGAAGGAAGGGCTTATGGCCCCCAGACAGAGGTGGGAGCCTTTCTCAGGGCAGTTGGCAAGAATTTGCTTCCCCTCCCATGAGCTGTCATCCTGCATTTCAGAGGCAGGAGAGTCAAGGTAAGCTTGTAGTGAAATCTAAGGACTCTAATGAAAAGTAAATGCCTTGCCCAAGCTCACATCATGCAGGGACCAGAATCCAGGCTCTTGATACAAAGCTTATGCTCCCACCTCCCTGGGCCATCTTGTGCTCAAATGAGAAGGTGTGTGAAGTCTTTATCCTTGCCCTTTCCAATGAGCCACACTGTCTTGGAGACAGATTGGAGCCCTTTGTGGGAAATGAGCTCATTTGTGTGGATTGAATACTTTCTTTCCAGAGAGACCTAATGACACCTATTTAGACACCTGGTGCCCTGGCATCATTTCTATGCATCTTATGGTTGGGGTAGGGGGTAGGGGAGGAATGCTTTGGGATATGGTAGATGAAGATAAGAGGCATGAAGGACAGGGAGGAAACAAATCAACCCTGGAAATGAACGTGTACTTCATACCTGGAGCTTGAGTCAGGTGAGAACAAGAGCAGGATGCCGCCTGCTGGTAAACAGGCCCCCCAAAACCTGGCCATAAACTGGCGTCAGCGTAACAATGGGACAAGTGTGGGCTCTGGTTCGTTCCACCTTGGAACTTTTTCACACTGATGATGAGGAGGAAGGAGAGTATAACGAAGTAACAGAAGAGGTTACAGAGCAGGTTTATTTGCCAGCTAAAGCTAAAGCGGCAAAGGAGGGAGAGGTTCATCCCTACTCTTCTGCACCCCCTCCTTATTATTTTGAAGAAAAAGACCCTCCAGATCTTTCTTTTCTGGAGGACACTGGGTGAAAAGTAGTTGCCCCAGTGACTATTCGAGCAGCACTTCAAGCGACTGCTCTTAGTTCTATTCAGGCAGGAATTCAGCAACCTAGATGAGAGGGTGATTTAGAGGCTTGGCAGTTCCCTGTTAGAATACACCGCCCCAGATCAACA
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Task1_train_27706
A mutation in PROKR2 (prokineticin receptor 2), located on Chromosome 20, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Hypogonadotropic hypogonadism 3 with or without anosmia
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Task1_train_27707
This alteration occurs within gene PROKR2 (prokineticin receptor 2) located on Chromosome 20. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Hypogonadotropic hypogonadism 3 with or without anosmia
GAACCCTGACTAATATACTCTCACTTTAGTGAGCATCAGAATCACTCAAGGAATTAGATAAAAATGCAGATTCCTGGGACCTTGCCCAAGGGATTCCCACTCAAGAGGGTGGGGTGGAGCCCAGGAATCTGACTTTGTATCTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCAGTCTTGGCTCACGGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCACGCCCAACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCATGCTGGCCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCGTCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACCGCACCCGGGCTGACTTTGTGTCTTTCCATCAAATGATACTTTGCACCATTTTCCCTGGAGAATTGTGTGCAGTTGGTTGATAGGTACACATTTCATAAGGGATGGTTTCAGGGCTGGTGAGCCTGAGTTGTAGCAAAATCGTTTTTCCTGCAGAAATTATGTTATACAAAGGAAGGAGGATGCTTCCTACACCCGTCTGTGTATTTTATTACTAAAATGAAAAATATTAAACTGGCTGAATAAAGAGAAAAAATCTAAGCAGCACTGAGAACAGGGGAAAAATTTAAGAGTTGAAAAGATGAAAGGAAAAAAGATGACTAAGCAGATCATCCTAATGAGCACAGCTTACAATGGTGGACAGCAACCAAGAGAAGGTGACCACTGCCCCCTCGAACAGAGCCAGTGATGGCCCGATGCTGGCCTGCAACTGTTCACATAAACAAAATGTGTGTAAGATTTGTCATAAACTGCTATTATACATTTTACTTTATAAATTTAAAATAGAGCAAGGGCTGGTGACGAGGAATAAGTTCTAGTGTTCTACAGGTCTATAGGGTGAATATAATTACCACAATTTATTATATAATTTCCAAATAGCCAGAAGAGTGGATTTTGAATGTTTCCAACACAAAGAAATGATAAACATTTGAGGTGATGGATATGCTAATTACCTTGGTTGATCATTACACATTGTATACATACATGCATAGAAATATCACTCTGTATGCCATTAAGTATTTACAATTATTATGTGTCAATTAAAAATAATAAAAGCAAAAAATAAAATAATAAATACATAAAGGAAAGGAAAAAATAAAATAGAGCAAGGACTTCTGGAAATATCTCATGCAAATGTATGCAAATGAGCACACCAACATATGCAGAAAAGCAAAAGCAAGCGTGTCCTTTCCTCTTTTGCACAAACAAACCCTGTTATCTTATTTTAAAATGAGCTCTGCAACAAAGTCTATCAGAAACAACAGCACATACGTTATGTTTTTTTATGACATTAAAGAACAGGTGAAACTGAACTGTAATGATAGAAATCAGATTGGTGGTTGCCTGGTGGGGGAGGATTGACTGGTGAGGAGCACAGAAGGTTCTCTAGCTGATGGAAATGTTTCACATCTCCACCTGGAGGGTGGCTACAGGAAAAGCCTAGTACATGTTTTCCTGACTGGAAGCTGCCCTAGTTAACTCTCATGTGGCTTCTAGGTAGTAGCTGCCTGCCCTTTCTGCTTTCCCTTTGTGTTGGTGCCACATACTGTCATGTGGCATGCCTGTATCTGAAGCACATGTGGTATCTGGGGGCATGGCCCAGAGATGGGCCACTCAGCAGCCCCAGTCTTGCTCACATCTGGGGGAACAGAACTCAACTGGAGAAACAAGACCTCCTCTTGCCCTCCAAAGATTGGTGAGCATTCCTATCTGGAGCAATGTCAGCCTGTCAGAGCCTAAATGAGGAAAGAGACAGCCTGGCCCAGCCCCACCACTCACCCCACCCACCATCCTCACCTGTCAATGGCAATGGCCAGCAAGGCATTGGTGGAGACGTAGAGGGAGACGGTGCGCAGGTAGTTGACGGAGGCACAGAGCACGTGGCCATGCTCCCAGGAGAGCTGCCGTACCACGTAGTAGTCCATCTCGAAGGGGCAGCAGATGATGGCCACCAGGAAGTCGGAGATGGCCAGGTTGGCAATGAGCAGATTGGTGAGGTTGCGCAACTTCTTATAGCGGGTGAGGGCAGCGATAAAGACAAAGTTACCGATGCCGCAGACCAGCATGATGCCTGCCAGTGCAATGCCAATGACGATCTTGGCTGCGAAGAAGGTCCGGGTCTTGGTCATGTCCTCATCCTCATCCATAGGGAGGTCATAATCACCATAACTGAAGTTAAAGGAGAGGGAGGAGGCATGGTCTTGGGGTGGATTAAAGTTGGGTGTGAAACTGGTGTTTCCATTCTGGGCTGCCATGGTGATGTCTGCAAGAAAAGTGGTGTGAGGGAGGTGCGAGGGGTGAGGGTCCAGACCTTCTGCTCTTTCAGGGTCAGTGAGCCTAGCACCCTGCCCACATCCTTGGGGAGAGTTGACTCACCGTCCTGGATCCTGGAAGGAGGCACAACCAGTGGGCAACATGCAGGAGAACATCTGGTCACATTCCCTGAGTTCCCCAAGTATAGGCCAACCAGACCCACTGCCTAACCAGATGGAACTACCCGGGATGCGGGGAGAGGAGACCTGAGATCTGTAAGTTGGGAAACCCTCCGTGGCTGCCCAGCTGTCAGGAAGGACAGCATAGGATGGATCAGACTGTCCAGAACTCTCAAGAAGAATGTGCACCTTTGCCCTTTGCCCAGGGGCCAGGGCCTCTTTGTCTGCCCAGTCACATCCTCCAGCCCCCAACACATCAGCTCCCACAGGGGCTTCTGGAACATTTCCAAGGATGCTCCCATGAGCTGGCCAGGCTCCTACAGCTGTCACAACGTTGTGGCACCTGTTGGCCAGGGACAATGAAGCAGGAGGGCCAGGATGCTGCGGGGTCTTCTCTCCAAAGCAGGACACCACTCCTTCTGTACTGACCAAGCCATAGACTTGGAAATCACCAAGTTCACTTTCACATGGACAGACTGAGTCACCCTGGGCCAGTGATTTATGCTCTCTGAGTCCTAATCTTCCTGTAAACCAAATTCCTGCTGCCCAGTCCAGTGCCTGGTGCATAGTGGGGGCTAGACAGACATCTGTTGAGTGCATGACCAGGGCGCTGTAGGTGGAGGAGGTGGTGGTGGGGTGGGGGAGGGGAATTCCCCTGCTGCTCCCCGTTCTGTGGGAACCAGCTCCAGAAAGAAATCCTCTGCCGCCCTTCCCACCCTACTCCAACTTTGGATCTGCTCTCTGACCTCCTTCACTTGGCCCTAGTTCTCCACCCAGAGTCAACCCTGCCTGAAAGGCACCATGTCCTGTCACCAAGGTCTCAAAATAGGGAAAATAGTCTCTGAAGCCCTCAGCCCGCAGGAGATAGGGCACCCCAGGGTACAAGGCTTCACCGAGGGGCTGGAAAAAGAGCCCAGATCCCAACACCTATAGAAAGGGGCCCTGGCTGTCCAGCTGTGAGTGGCCTTCCCCTCGCCTCTCAGCACACCTGGAAACGACTCCACATGTGGGCGCCGCGGGATGCTGGGTAGCAAGGAGATGACCCAGCTGAACAATGCATTTGGTCCACTCCTGCGAGGGGAGGAGAACGCCGAGGGACAGGAACTGCGCGCCAGCAAAAGACACCCTAACCTGGGGTGCGCCCGCCAGCTGCTTTCCCAAGGTGAAAACCTCCAAGAGGCGAGATGCAAATCCCAGTGGCGTCCACACCCGGAGGTGTCTTCTCTCCAGGTCGCCCCTCCGTCTCATGCGACACCCCAATCCCCGCAGCCTCTGCTCAGCGTGGGACCAAGAATGGGGAGTCCTACCCCTCCTCGGCTTTCCAGCCCCCTAACCCAAGACAAGAGGGCGCGCGCCCGGGCTGGGACAGGTCCCAGCCGCATTTTCGTAGATTGCACTCCCCGCCCGGGAGCGACCCGTTCCAGCAGCCCCCTTCCCGCCCCATCAACGCGGCCGCACTGTCGGCGTCTAGAGGCGACATCCTGGCAAAGACAGGAATCAAGTCAGAAATTCAGGCTCTAGAAGCAAA
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Task1_train_27708
Mutation context: Chromosome 20, Gene MCM8 (minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Premature ovarian failure 10
TTCCCGTCTCTAAAGTGCCTTCAATTGGCAGAATTTAAAGAGAATCTGAGACATGTAGGGTACAGATCTGAATTATAGCATCGCAGAGCAGGAAGTAGAACAGTGGGCCTGAAATCAAGGGACAATAACAAATACAGCTTTGTGTAGAAACACAGGTAAGGAATCTCCCTTTGATAATTAGGAATACCAATTAACCTACATCAGTCTGTATAGGTGCAGGGAACTGTCTTTTTTGTGCTGTTAAAATACCCATTTGTTTCTTATGTCTCATGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACTTTTTATTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTCTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCTAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTTATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTCCAGACGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCATACTTTTTTTTTTTAGGAAAACTAGACGTTTGAGGTCCAGGACCCTCCCTGCCCCATACCAGGCATGCAGTAGTCATTTTGTGAATGAATAGAGTACTTTACAAATGTTTTCTTTATTGGAAATCTGTTCGTTTTTTTCCATCAATAGAATCTGTTTCATGAATGATCTTTTGTTCCTTTAGGATGTATTAGCCACCAGCACTCCCATTGCTCCCCTAGCAGATAGCTCAGAACACTATAAGTGATCTTTGGACAGTCCTAAAGATGGAGTTCAAGAGGTGCCTTAGCCTTCACCATCTGTGCTTCCAAACTACTTTATTGTACTGTTCTTCTGTGAGAGACATATTTGAAAATGTAGAACTTTAGAGTGTTAAAAAAAAAAAGGCTTTTCAGTTTTGCCACCAGGGTCAAGTGTTGGTCTGTCTCCTGATCTCAGGAAAGACTGTGATTGTGATTGTCTTCAGCTCTGTCAGAGTAAGAGCTTAGTTTATGTGTCTGGCTTTGGCTTTATTATAATTTTTAGTTTAAGCTTATTGTCTAAATTATCTGAACTAACATGTCCTATTAGGTGTCAAAGATGCAAAACAAAGTTTCCCAGATAGTGGGGCTTTTAGAGAGAGAGAGTTTCTGTCTGCATTTCACATTATGCAAACCTAAATTTGTTTTAGAATCTTAAGTTTACATTCTATACTAGTTCTTATATGAATGTAATCAAAATACAAAGCAATTAGAAAAAAATCATCTACCATGTATATAGTGCTGCTTTTGTCTCATGAAAAATGTGCATGTACCTGTGTGATTATTTGTGCTAATGCCATATTTGTTGGATTAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATTTGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGTAAGATTCCTCTACAGCAAAGCTACCAGTCATGTGCCATCTTACCAATGTATTCGAGGTACTTGTGATTATGATCGTAGGCACTGGAGTCAGACTTCCTTGGTTCAGACCTCAGTTCTGCCACTTACCTGCAGTATGGACTTTGATTAATTACTTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTTCATTTGGAGATAGAGGTATAAATACCTACCTCAAAGGATTGTTAAGAGGCAGTAATACATTAATATATTTAAAATATCAGAACCATGCTTGGCACAAAGCTTATACTTATGTCATACTTACCATTATCACATATAAACATTGTATGCTTTCTCAAAGTCTATAATAGAATGCTCAGTTAATGGTAATTGACTACAGAAAAGCAATTATTGTTTTCATACTTTTATATTTTATAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAGATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCACCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTAACTATTTGTCTTATGCATACTTTTGTCTAAACTTTTTTAATGTTTGCACACACATGCACACCTTGTCTAAGTTTAAAGGAAGATTTTACAGTGACTGTACTTTCTATAAGAGATACTTAGCTTTTACGAAAAGATGTTGGCTAGAACTGAGAGGTTGCAGTTCCGTTCTGAAAGATACCATTCATTCTATATACAACAGCTTATCTAAATGAAATATTTACCTCCAACTTATTTGGATTTGCTTAATCTTGCTAAAGATTGTGCAGAAATTAAACTTTGCTTTCAAGAAGTTATACAATCTCATAGGGAAGATAAAACAAGGAATCATGGTGTTATCGGTTATGAACTTAGAGCAAAAAAGAGCAACCTTAGATTTAGGTTCTGTGGCATGAAGCAAACCACTGAGTGTCCCTGTATATCAAATGTAAATAACAGTTTGTACTGTGCTTGCCTGAGTTTTTTTTCAGGGTCAGGTAATACAACATATATGAAAACATTTTTAACTTTTTAAATTTTTTAAATTTATTTTTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTTTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGTCATGATCTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGTGCACCACCATGCCCAGCTAAGTTTTGGAGTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGATCTTGTGATCCGCCTGCCTTGGCTTCCTAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCCGGCCAAAAACATTTTTTAGGCTAGCAAACAGATACATGCTTCAAGGTAATGAATAGCAAATCTCAGGACAGGCATACACAAAGTGCTGGGGCATTCAGAGGGGCATTCTTCTACCTCTTGCCTGTGCTGTCCATTCAACATAGAATCCCCTTCCCTTCACATGGACAGATTATTTGGGCCTAGCTCAGTTGTCTGTCTGTAAAACCTTTCTCATGACCACTTTTCGAAACTTGCATGGTATTTTGTCTGTACATCTTTATGGTCCTTATGACAATTACAGCTGTATATATGCATCTTATTTTGCCTCTTAGGTTGCCAGCAAACTGCTGTGTACAAGTGGTATTAAATGTTTGTTTGTTGTTTATTTATTTATTTATTTTGAAATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTTGCCTCATTGCAGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGCACTGCCACACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCGGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGGGATCCACCCACTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCAGCGTGTTTATATTATTTAATGTTAAATGCCAAGGGAGTGAGTATTAGGTATTTTAAAGGTCATTTTTATTTTCTGTGTCTTGATTGGTCAGTGAATATAGAGAAATAGGAATGCATTTTTTTTTTTTTAATTAGTATCAAGAGGTGATGGTTTTGGGGACTAATGTAAGGGCTTTTAATGTTAGGTTTAGTTGGGACAGAAAGTAGCAGACTGGGATGCTGGAGTTTTTCAGCACAGGGACAGCAAAATCCAATGTAAAACATCCACTATAAAGTAAGTAGTCATAATTAAATATTAGATATTTAAAGGGCTGTTAAAGTTTTCTGTTTTTATTCTGTTTCTGTCCATAAACTTTATATTCTCTATAAAAATAGAGTTCTGTATAAAGAGGATGTTTTGTTTTCCAACTTCAGAGTAAATGTCTGTCCTGTTTAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGCTGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGTGAGGAATTTGATGTATTAAAGTATTAC
TTCCCGTCTCTAAAGTGCCTTCAATTGGCAGAATTTAAAGAGAATCTGAGACATGTAGGGTACAGATCTGAATTATAGCATCGCAGAGCAGGAAGTAGAACAGTGGGCCTGAAATCAAGGGACAATAACAAATACAGCTTTGTGTAGAAACACAGGTAAGGAATCTCCCTTTGATAATTAGGAATACCAATTAACCTACATCAGTCTGTATAGGTGCAGGGAACTGTCTTTTTTGTGCTGTTAAAATACCCATTTGTTTCTTATGTCTCATGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACTTTTTATTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTCTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCTAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTTATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTCCAGACGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCATACTTTTTTTTTTTAGGAAAACTAGACGTTTGAGGTCCAGGACCCTCCCTGCCCCATACCAGGCATGCAGTAGTCATTTTGTGAATGAATAGAGTACTTTACAAATGTTTTCTTTATTGGAAATCTGTTCGTTTTTTTCCATCAATAGAATCTGTTTCATGAATGATCTTTTGTTCCTTTAGGATGTATTAGCCACCAGCACTCCCATTGCTCCCCTAGCAGATAGCTCAGAACACTATAAGTGATCTTTGGACAGTCCTAAAGATGGAGTTCAAGAGGTGCCTTAGCCTTCACCATCTGTGCTTCCAAACTACTTTATTGTACTGTTCTTCTGTGAGAGACATATTTGAAAATGTAGAACTTTAGAGTGTTAAAAAAAAAAAGGCTTTTCAGTTTTGCCACCAGGGTCAAGTGTTGGTCTGTCTCCTGATCTCAGGAAAGACTGTGATTGTGATTGTCTTCAGCTCTGTCAGAGTAAGAGCTTAGTTTATGTGTCTGGCTTTGGCTTTATTATAATTTTTAGTTTAAGCTTATTGTCTAAATTATCTGAACTAACATGTCCTATTAGGTGTCAAAGATGCAAAACAAAGTTTCCCAGATAGTGGGGCTTTTAGAGAGAGAGAGTTTCTGTCTGCATTTCACATTATGCAAACCTAAATTTGTTTTAGAATCTTAAGTTTACATTCTATACTAGTTCTTATATGAATGTAATCAAAATACAAAGCAATTAGAAAAAAATCATCTACCATGTATATAGTGCTGCTTTTGTCTCATGAAAAATGTGCATGTACCTGTGTGATTATTTGTGCTAATGCCATATTTGTTGGATTAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATTTGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGTAAGATTCCTCTACAGCAAAGCTACCAGTCATGTGCCATCTTACCAATGTATTCGAGGTACTTGTGATTATGATCGTAGGCACTGGAGTCAGACTTCCTTGGTTCAGACCTCAGTTCTGCCACTTACCTGCAGTATGGACTTTGATTAATTACTTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTTCATTTGGAGATAGAGGTATAAATACCTACCTCAAAGGATTGTTAAGAGGCAGTAATACATTAATATATTTAAAATATCAGAACCATGCTTGGCACAAAGCTTATACTTATGTCATACTTACCATTATCACATATAAACATTGTATGCTTTCTCAAAGTCTATAATAGAATGCTCAGTTAATGGTAATTGACTACAGAAAAGCAATTATTGTTTTCATACTTTTATATTTTATAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAGATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCACGTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTAACTATTTGTCTTATGCATACTTTTGTCTAAACTTTTTTAATGTTTGCACACACATGCACACCTTGTCTAAGTTTAAAGGAAGATTTTACAGTGACTGTACTTTCTATAAGAGATACTTAGCTTTTACGAAAAGATGTTGGCTAGAACTGAGAGGTTGCAGTTCCGTTCTGAAAGATACCATTCATTCTATATACAACAGCTTATCTAAATGAAATATTTACCTCCAACTTATTTGGATTTGCTTAATCTTGCTAAAGATTGTGCAGAAATTAAACTTTGCTTTCAAGAAGTTATACAATCTCATAGGGAAGATAAAACAAGGAATCATGGTGTTATCGGTTATGAACTTAGAGCAAAAAAGAGCAACCTTAGATTTAGGTTCTGTGGCATGAAGCAAACCACTGAGTGTCCCTGTATATCAAATGTAAATAACAGTTTGTACTGTGCTTGCCTGAGTTTTTTTTCAGGGTCAGGTAATACAACATATATGAAAACATTTTTAACTTTTTAAATTTTTTAAATTTATTTTTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTTTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGTCATGATCTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGTGCACCACCATGCCCAGCTAAGTTTTGGAGTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGATCTTGTGATCCGCCTGCCTTGGCTTCCTAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCCGGCCAAAAACATTTTTTAGGCTAGCAAACAGATACATGCTTCAAGGTAATGAATAGCAAATCTCAGGACAGGCATACACAAAGTGCTGGGGCATTCAGAGGGGCATTCTTCTACCTCTTGCCTGTGCTGTCCATTCAACATAGAATCCCCTTCCCTTCACATGGACAGATTATTTGGGCCTAGCTCAGTTGTCTGTCTGTAAAACCTTTCTCATGACCACTTTTCGAAACTTGCATGGTATTTTGTCTGTACATCTTTATGGTCCTTATGACAATTACAGCTGTATATATGCATCTTATTTTGCCTCTTAGGTTGCCAGCAAACTGCTGTGTACAAGTGGTATTAAATGTTTGTTTGTTGTTTATTTATTTATTTATTTTGAAATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTTGCCTCATTGCAGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGCACTGCCACACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCGGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGGGATCCACCCACTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCAGCGTGTTTATATTATTTAATGTTAAATGCCAAGGGAGTGAGTATTAGGTATTTTAAAGGTCATTTTTATTTTCTGTGTCTTGATTGGTCAGTGAATATAGAGAAATAGGAATGCATTTTTTTTTTTTTAATTAGTATCAAGAGGTGATGGTTTTGGGGACTAATGTAAGGGCTTTTAATGTTAGGTTTAGTTGGGACAGAAAGTAGCAGACTGGGATGCTGGAGTTTTTCAGCACAGGGACAGCAAAATCCAATGTAAAACATCCACTATAAAGTAAGTAGTCATAATTAAATATTAGATATTTAAAGGGCTGTTAAAGTTTTCTGTTTTTATTCTGTTTCTGTCCATAAACTTTATATTCTCTATAAAAATAGAGTTCTGTATAAAGAGGATGTTTTGTTTTCCAACTTCAGAGTAAATGTCTGTCCTGTTTAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGCTGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGTGAGGAATTTGATGTATTAAAGTATTAC
Task1_train_27709
The gene MCM8 (minichromosome maintenance 8 homologous recombination repair factor) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Premature ovarian failure 10
AAAGAGAATCTGAGACATGTAGGGTACAGATCTGAATTATAGCATCGCAGAGCAGGAAGTAGAACAGTGGGCCTGAAATCAAGGGACAATAACAAATACAGCTTTGTGTAGAAACACAGGTAAGGAATCTCCCTTTGATAATTAGGAATACCAATTAACCTACATCAGTCTGTATAGGTGCAGGGAACTGTCTTTTTTGTGCTGTTAAAATACCCATTTGTTTCTTATGTCTCATGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACTTTTTATTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTCTGTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCTAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTTATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTCCAGACGTGAGCCACCGCACCCAGCCGCATACTTTTTTTTTTTAGGAAAACTAGACGTTTGAGGTCCAGGACCCTCCCTGCCCCATACCAGGCATGCAGTAGTCATTTTGTGAATGAATAGAGTACTTTACAAATGTTTTCTTTATTGGAAATCTGTTCGTTTTTTTCCATCAATAGAATCTGTTTCATGAATGATCTTTTGTTCCTTTAGGATGTATTAGCCACCAGCACTCCCATTGCTCCCCTAGCAGATAGCTCAGAACACTATAAGTGATCTTTGGACAGTCCTAAAGATGGAGTTCAAGAGGTGCCTTAGCCTTCACCATCTGTGCTTCCAAACTACTTTATTGTACTGTTCTTCTGTGAGAGACATATTTGAAAATGTAGAACTTTAGAGTGTTAAAAAAAAAAAGGCTTTTCAGTTTTGCCACCAGGGTCAAGTGTTGGTCTGTCTCCTGATCTCAGGAAAGACTGTGATTGTGATTGTCTTCAGCTCTGTCAGAGTAAGAGCTTAGTTTATGTGTCTGGCTTTGGCTTTATTATAATTTTTAGTTTAAGCTTATTGTCTAAATTATCTGAACTAACATGTCCTATTAGGTGTCAAAGATGCAAAACAAAGTTTCCCAGATAGTGGGGCTTTTAGAGAGAGAGAGTTTCTGTCTGCATTTCACATTATGCAAACCTAAATTTGTTTTAGAATCTTAAGTTTACATTCTATACTAGTTCTTATATGAATGTAATCAAAATACAAAGCAATTAGAAAAAAATCATCTACCATGTATATAGTGCTGCTTTTGTCTCATGAAAAATGTGCATGTACCTGTGTGATTATTTGTGCTAATGCCATATTTGTTGGATTAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATTTGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGTAAGATTCCTCTACAGCAAAGCTACCAGTCATGTGCCATCTTACCAATGTATTCGAGGTACTTGTGATTATGATCGTAGGCACTGGAGTCAGACTTCCTTGGTTCAGACCTCAGTTCTGCCACTTACCTGCAGTATGGACTTTGATTAATTACTTCTCTGTGCCTCAGTTTTCTTTCATTTGGAGATAGAGGTATAAATACCTACCTCAAAGGATTGTTAAGAGGCAGTAATACATTAATATATTTAAAATATCAGAACCATGCTTGGCACAAAGCTTATACTTATGTCATACTTACCATTATCACATATAAACATTGTATGCTTTCTCAAAGTCTATAATAGAATGCTCAGTTAATGGTAATTGACTACAGAAAAGCAATTATTGTTTTCATACTTTTATATTTTATAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAGATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCACCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTAACTATTTGTCTTATGCATACTTTTGTCTAAACTTTTTTAATGTTTGCACACACATGCACACCTTGTCTAAGTTTAAAGGAAGATTTTACAGTGACTGTACTTTCTATAAGAGATACTTAGCTTTTACGAAAAGATGTTGGCTAGAACTGAGAGGTTGCAGTTCCGTTCTGAAAGATACCATTCATTCTATATACAACAGCTTATCTAAATGAAATATTTACCTCCAACTTATTTGGATTTGCTTAATCTTGCTAAAGATTGTGCAGAAATTAAACTTTGCTTTCAAGAAGTTATACAATCTCATAGGGAAGATAAAACAAGGAATCATGGTGTTATCGGTTATGAACTTAGAGCAAAAAAGAGCAACCTTAGATTTAGGTTCTGTGGCATGAAGCAAACCACTGAGTGTCCCTGTATATCAAATGTAAATAACAGTTTGTACTGTGCTTGCCTGAGTTTTTTTTCAGGGTCAGGTAATACAACATATATGAAAACATTTTTAACTTTTTAAATTTTTTAAATTTATTTTTTATTTATTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTTTGTTGCCAGGCTGGAGTGCAGTGTCATGATCTCCGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGTGCACCACCATGCCCAGCTAAGTTTTGGAGTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACGATGTTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCTTGATCTTGTGATCCGCCTGCCTTGGCTTCCTAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCTTGCCCGGCCAAAAACATTTTTTAGGCTAGCAAACAGATACATGCTTCAAGGTAATGAATAGCAAATCTCAGGACAGGCATACACAAAGTGCTGGGGCATTCAGAGGGGCATTCTTCTACCTCTTGCCTGTGCTGTCCATTCAACATAGAATCCCCTTCCCTTCACATGGACAGATTATTTGGGCCTAGCTCAGTTGTCTGTCTGTAAAACCTTTCTCATGACCACTTTTCGAAACTTGCATGGTATTTTGTCTGTACATCTTTATGGTCCTTATGACAATTACAGCTGTATATATGCATCTTATTTTGCCTCTTAGGTTGCCAGCAAACTGCTGTGTACAAGTGGTATTAAATGTTTGTTTGTTGTTTATTTATTTATTTATTTTGAAATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTTGCCTCATTGCAGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTATAGGCATGCACTGCCACACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGTCGGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGGGATCCACCCACTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATAACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCAGCGTGTTTATATTATTTAATGTTAAATGCCAAGGGAGTGAGTATTAGGTATTTTAAAGGTCATTTTTATTTTCTGTGTCTTGATTGGTCAGTGAATATAGAGAAATAGGAATGCATTTTTTTTTTTTTAATTAGTATCAAGAGGTGATGGTTTTGGGGACTAATGTAAGGGCTTTTAATGTTAGGTTTAGTTGGGACAGAAAGTAGCAGACTGGGATGCTGGAGTTTTTCAGCACAGGGACAGCAAAATCCAATGTAAAACATCCACTATAAAGTAAGTAGTCATAATTAAATATTAGATATTTAAAGGGCTGTTAAAGTTTTCTGTTTTTATTCTGTTTCTGTCCATAAACTTTATATTCTCTATAAAAATAGAGTTCTGTATAAAGAGGATGTTTTGTTTTCCAACTTCAGAGTAAATGTCTGTCCTGTTTAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGCTGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGTGAGGAATTTGATGTATTAAAGTATTACTTAGAATGGGACATTGAAGGCCATTTAAGAATGAAA
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Task1_train_27710
A variant affecting Chromosome 20, within the gene CRLS1 (cardiolipin synthase 1), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 57
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Task1_train_27711
A variant was discovered in gene CRLS1 (cardiolipin synthase 1), Chromosome 20. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 57
GATCAGGTAGAAAGATTAAATGAAAGGGAGAGATGGATGATGCAAGGGGAGATGGGGAAGAAGGGAGGCAGGTCACAGAAGGTGAGAGGGCATGGGAACGGATGAAGGAAGGCAGAGAGAATGAATGGATGCAGGTAGGTGGGGGATTTGATGATGGGAATATGAGGATGGGCTGACTACGGTTTTCTTTTTCCTTAAGGAAAATACAGACATGACCATGAGCGAGAGGGATGGAGTTAGGTCTGAGGTGAGAGCAGAGACAGTGTGGAAGAGACAGTGTGAAAAGAGAGGGTAAATATGGTAAACAAGTGTGGGATTGCTAGGCAGTATTGGGTGCCCATGGGAGATTTGTGGTCATCAGTTTGAAGTGAGACCAGTCTTCCCATTTGTGTGTTTTCCTTAAGCACTATTCAGCTCTTAGGTGCAGGCCCAGAGTACATGGAGAGTTGCTTTTAAGCAGTGTTGAAGGAGAGTGGAGTGAAGGGGAGTTACAGATGTTTATAAAGGAATGATGTTGATGACCTTGGAATCTAGTGTGGATTAGAGGAATAGTGAAGATGAGAGGGTGATGATGGCGAAAAAGTGAAAGGTTAAGTTCCCTGAGGTCAGAAACTGAACTAAACCTGATCTTCCAAGGTCCCAGCTCCCCAGGCTAGGTACTTTTCTGTTCGTATGCTTAAGAAGGAAATAGATTTTTTCAGTTGCAATAGCAATAGCTAGTAACTGCTTTTTTTGAGGATTTACTAAGTGCTGAGTGCTGAACAAGTATTAATCACATTGTGTGCTGAAGACAACCACCCCTTTGAGGTAGGTAATTTATCTCTGTTTTACAGATGAGGAAACTAAGGCTTAGTCAGGCCAAATAACTTATCCAAGATCACACAGCTACTAAGTGGCAGAGCCAGGACTTGAACAGCTTCTGTTCTGCTACAAAGACCACATTTTTTTTTACCACGGTCCTGGACTACCGCTGTCTCCTCTAACTCATTGGAATACTTGAGATATGGACAACTTACTTGTTCTTTAAAATGAACCATGATTAATTGCGTCTAAATTAATCTTTTTTCCCCTTAGAAATAGTATTAGAGAACTCAAACATTTGTTGAAACTTGAAGTTAAATGAGTAAAAGCCAGGAAGGGACTTGGATAAACCAGAAAATATCTGCCTTGTTTAATGTGAATAGACAGTACTTGATTTCAGTCCATTTTGTGGCCCCAGAGTGGCCAGACCGCTCCCTTCTCAAGTTAGGATGGAGACCTGGGTTTTTATGGGAAGAATTGAATACTTACATGTTGATAACTAATTACAGTTTTTAAAAGCTCTGATAGGTCAAACAGAACCAGCTTACAGGCTCCATTTGGCCCACTAGCAACTAGATGTGACTTATGCTTTAAATGGTTTATTTTTAATCACAATAATATAAAAATAAATAATTTAAGTATCAGAATTTTAACTAGGCCAGGTAGAGAGGATTGAGTTTTCTATTCAAATGTAGGTAATGCAGATACAGTCAGAGTATGGAATAAACAGTGGTATTGAGCAAAATGAGTTGAAAAACAGAAAAATGGTAAGTTTTAACAGAGTTGGATTATATTATCCTAGTCCAGGCTCTGCCGTTCATGCTTTCTTTGAGTTTTCTTTGGGTTCTTTATAGCTGTAAATACATCACTAACCGTATCTCTAAATGTGTATTTGGGTTCATCCCACAAAGGGGCCTTGTGAAAATACCGAGAAATAACCAGAAGGACTTGAGGGGGAAAGAAAATAAATGTGCATTTATTTTAAGACCAGTTGCTAATTTAAAAGCGAAATGTATACCAGCAAAAGAATGAGAATGTTTGGGGGTAAGAAACAGAAGACATTTTGTTAACATTTTATGAGAGTATAATTGTTATTCTGGTATATCTTAAGCTTCAGAATATCTGCTTTGTTCCTGTTATGACATTTATATATATAAAAAAAAACTTCTATTTTCAGTTGGATGGATTTATTGCTCGAAACTGGGCCAATCAAAGATCAGCTTTGGGAAGTGCTCTTGATCCACTTGCTGATAAAATACTTATCAGTATCTTATATGTTAGCTTGACCTATGCAGATCTTATTCCAGGTAAGAACGCGTCATGCGTACTTTTGAATAGCACAGGGAAGAATGACATTAGTCAGCTTAGGATTTCTCTTGAGAGACAAATAATTTTTGTTCCAAAAATATAGTTTTCAACTTTAAACTGTTTCCCTAATTTTAAACTGTTGAACTGTTTTGTCAAACTACTTGTGGATTTTAGAATTTATGTCCTTGTTTTACTAGTAAAATCAGTTGCTTTCCTAGTAAGATTGTTTAAAATTAAAATTGAATAAATATTTCACAGTGCCAATTCATATTACTCTGAAATTTTTTGGTGATACATTATGTATTTTTAGTGCCTAGCTTTTCAAAAGCAATTTAGTTTTCCTACGTTTATTATCTTTATTAATATCGTTTAATCATAAGTGAGAACTCTGAAATTCTGAAGATGTCTATAAAATTTCACATTATGTAGACCCTATTATGCAATTTTTAAATCATATATATAGTTTGTACATTATATGAATACTTTTTCTGATAAGATTTCATGATTTTTTTGCTTTGTATTTTGCATGTGCTTTTCTGATTGTTCATTTTCTTCTTCAGTCGTATTTCTCAGTTTTTCTCCCTCAGACCAAGTTAAACTGTTTTTTTCCCAAGAGCTAGGAATCATATCTGATCACACTGGGACTTCCCTTCACTGTCAGTCTAAGAGTTTGCATTTTTGAGGTTTAGGAAAAGGGAAAAAAAAGGAAGAAAGAAAGAAATTGTATCTGAGAACAAAGAAGCTGCCACATGGTCCCTCGGTATCATGTTATTATTGACACTTGGTAGAAAGAAGTATAGTGGCATTTCAGTCTAGTCTCCCCCAACTGGAAATTATTTTTCTTTCTGATTTTTAGTCTTTTAAGTTCTCGTACCAAAATAAAAAATAAATTGGACTAATGTTTACTTTTATGTGCTTCTTTGAAAGTTAGAATTGAGGTGTGTATGTGATTGGGGAATGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTCTTGCCTAGGCTGGTCTCGAACTTCTGGGATCAAGTGATCCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGATGGGACTATTGGCTTGAATCACCTTGCTTGGCCCCTGCCATTTTTTCAAAGTTACATTGTATTTTGATGTAGTATTTTACAAAGGTTGGCCAGTCATTTTGCTATTGAACATAGAAATTGTTTCCAGGTTTTTTGGAATTATGGGTAATGTTGCTGTGAGTTTTACTTATATGATTGGTGTAGGTTGCTTTCCAAGCTGAGACTTCCCTTCACTGGCAATCTTAGAGTTTCCATTTTCTTTCTTCTGTGTTGAGTCTGTTTTTCCAGGCTCCCATGTCTTCCTTTGCTTTAAGTTACTCCTTTTCTCCAGTTGTTTTCTGTAGAAGGATGGAGTGTGGCAGCCAGATTTTTAGAGGTCTTAGACATCTCAGTGTCTCTATTTTGTCTTCCATACATGATTGACAGTTGAAGTAGGCATCACTTTTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTGAGACAGGGTCTCACTCTGTGACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCATTGCAGCCTTAACCTCCCAGCTCAAGCAGTCCTCTGACCTCAGCCTCCCAAGAACCTACCACCATGTGCATCACCACGCCTGGCTAATATTTGTACTTTTTGTAGATATAGGGTTTTACCACGTTGCCCAGGCTGGAGGCATAATTTTTAAACTGCAGATGATTTTAATTCAGAATTGTGAAGACCCTCTTCCATAGACTTGGAGATTCCAACTTGCTACGGAACAGTCTCTTATCATTTGGATACCTTTTCCTTTACATGGGATTGTGTTTAGTATTGGAAAGCTTTTAGGATTTTAAGAAAATGTGATTCCTAATTGATGTTTTCTTTAAAAAGTTATCTCTCTTAATTCATTTTCTAATGCTTATATGGCTACCCAGTTATCCTAGCACTTTTTATAGAAAAATTTGTA
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Task1_train_27712
Assess the clinical impact of this variant on gene CRLS1 (cardiolipin synthase 1), found on Chromosome 20. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 57
TTCCATGCATACTATACATAGATTTTAATTTGCATGGATTTGCTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTTGCTGCAGCCTCTGCCTCCTGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATTACAGGCATGCCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCTCCGTGTTGGTCAGGCTGATCTCGAACTCCTGACCTCCGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCAGGTTTGCTGCATTTTAAAAGTGTGATTGTTGTTAGATTTTGCCAGCTAATGATTGCTACAGAAAAGTTTGTTTACCGGTACAAAAATGTTCCTAAAAATTATGACTCACTGTTTTCATGCTTGGCTCATATAGCCACATCTTGTTTGCTCCAAATGCCGTGACTTGAGTGGATAAGCATTTTTTCTTTGGAATAGTATTATCCATCAAGGACTAGGCCAAGGATCAATATGTACATCATAGCTATAACAGCAGAGATTTAAATTTTAAATCTGTAATTAGAGATTTTCTTCAGATTGCAGAGCCAATTGAATGTCAAAACTGGAGAGGACCATAAGTATAGCCTCCAATAATTCATAAAAGATTTGTTTGAAAGTATTTTGGAAGGGATGTTCATGATCCTTTTTATTTTTATCTTTATTTATTTGAAATAGTTTGGATGCTGTTGGAACCGAGTGTTTGAACTCAGGCTTTTTTTTTTCCCCCCTTTTTAAAAATAATAATTTTTTTTTCTTATAAAAGATATGTTCACAGTTAAAAACTTTCTATGGTGCAGAAGGATATAAAGTGAAGCAAGTTCTCTGCCATCTCATTCCCATTCAGTAAGGAAATAGGGGTTCCTTGGGTATTTATTTTAAAATATCCTTCTATTGGCTATGGCTCTGGGACCATGGTGTAAAATCTGAGGAATGATGACAAAAATATTGACAAGTTGCATTCATTGAATGGGCAGGGAGAAAAACAGCAATCCCTGGGAAGGAACTGGCTGGATAAGTATACAATATTTCACGCTGGGCACAATGGCTCATGCATGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTTTAGACCAGCCAGGACAACATGGTGAAATCCCTTCTCTACAAAAATACAAAAATTAGGCATGGTGGCGTGCATCTGTGCTCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATTGCATTGAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGATACCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTCTGTTTCTCTACTAGTTGCACATAACAGCAAATTTTACTCTTCAGAGAATAGTCTAAAATGCAGAACAAGCAATCAAAGCTCCTGAGATTTCAGAAGAGTTTGAGGCCTCCCACATCCTTCTCCACCTCTTTATAATCTCTTTTCATGTAATTCTGAGTATGGTGATCTTTTTTCAAATGTGCAGAGCTTAGAAGTAGCAAAGGAGGAGATAGCGCTGAGTAGAGCTGATGCTGATAACTGCGGACTAATAGCTTAAAAACATGCAAGAAAAAAACACAAACAGATGAGAAGATCAGCATACTGAAAGGCAGATACAGACTTCAAAGCCATAGTCTGTACTTCACTTTGTTTTGAGGGCGGGTTAAAGAAGAATATAAAAATCAGTAGTTTGCTATAGGGGACCCTAAACCATCGATAGGTGTTCATTATAAAATTTCTATTTGTGAAAACAGCAGTTTGTGGTAAGGCTGAATGACATATTATTGTATTCATAATGCATATTAGTACTCTTCAGAATCCCAGTTAAAATTATTTTATGTTTGATTTTCAGTTCCACTTACTTACATGATCATTTCGAGAGATGTAATGTTGATTGCTGCTGTTTTTTATGTCAGATACCGAACTCTTCCAACACCAGTGAGTTTGTTTCCAAAAAGTATTCTTTTAGCATTATATATGATTTAAGGAAAAAGCAAAAAGACATATTTTTGCGTCAACATCTTTTCAATTGATGGCACGTGAAACCCAGACTAGCCAGCCCCTATCCCTAGAAGCAAATTCTTTAAAGGTGTTTCATATAGGTCCAGGCCATATTGTCTAATTTAACCTCTACCATGGATAGTCTAGAATTGGTTTTAAAAATCACAGTTGTATGAACATGGGATGGTTTGTTTGCATATTTATTCACAGGCTCTATAAATACTTGAACACATACGCATAGCATATTAACCTCTTTTGGCTCCCAATGTACTGAAAATAGAGCAGTAGAGCAGTATTTTGTTCATTTTATTTTTTAATTCAAAAAAGAAAATAGTGAATAAGGGAATTTTGAGTTTAGTAAAATTTTATAAAGCAAACTATATGATAGGTATTGTGTTCGAATTTTACAGCAATTGAAAAATCTATACATTTTTTAAAATCAATATTCAGTATATATTGAATGTATGATTTATAAAGTTATGTTGTTACCTAAGTATAATAACAAAATGTCTATTTTAAATAAAAATGTTATTTTAAACAATAAGTTAATTACTTTATCTTTTTTGGTCCTCTGCCAGCGAACACTTGCCAAGTATTTCAATCCTTGCTATGCCACTGCTAGGTTAAAACCAACATTCATCAGCAAGGTAAGAGAATGCAATGTTCTTTGAAGTTATTCCTTTGTAAATTTTTATTATACAGGATATAAACCTTAGTCAAGAACAGCTGAAAATGAGACAAATTTAAATGCATTGAGTATAGAGGCTAGAGAGTAGCGTTGGGCAGGCAGTTTTAACCTAGTTTGTCCTCCGTGTTTTTTGGATCATCCTTATACATGTTGTGCCTTGAGTTGGTGGTCTGAGAGTTTAAGCTCTGAATGAGGTAATCGGGCCACTGTTTAGGGAAAGGGAATTGAAATGTAATTGTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTTACTTTGTTGCCCAGGCTGGTATGGAACTCCTGGCTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTGGGTTCCCAAATTATTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCAAGCTTGGCTGTAACTGCTTCTTAATTCAGTTTCACAGATTATGAAGAGTCCCTGGTGGTTTCACTCCCTCCTTCCCTGTGGTGAAAATACCAAATGGCTGTTCATTTTCAGGATTGATAGTTAAGTGGAAAGGGATAGGAAAATAGGAAAAAGTTTTGTTCACTAATAAACAACTGCTACTCTTAGTTGTCCATTCTGTTTTCCCGAGCATTCAGGGCAATAAGTATATGCCAGTCTACCTCTCAAGCCATATTTGTTTTTCTAGTAGCTTTGATAAGTTTTCTCAGTTCATTCTTTTGTCCCATCTTTAATGTCAAGGATTTAACAGGTTAAGAATGCCCATCATTTTTGGGAGAGAAGGGTAGTTGCTTCTATACAGAACTCCCTGGGGTGGACTTTCATCTACATGCATAGGGTTTGGGGTTTTTTTGTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGCTTCAAGTGACTTGTGTTTATATTGTATGGCAATTTGAGTGTAGCGTTACATGGAAAGTGCTTAAAGAGGTACGGGGACAAGTGCCTTAAACCCTTATAGGAAGCCCTTAGGATAAAATTTACATTTTATTTTATTTTATATTTTATATTTTATTTTATTTTAATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTATTATTTTTTATAGATGAATTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG
TTCCATGCATACTATACATAGATTTTAATTTGCATGGATTTGCTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCTTGCTGCAGCCTCTGCCTCCTGGCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGATTACAGGCATGCCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGCTTCTCCGTGTTGGTCAGGCTGATCTCGAACTCCTGACCTCCGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCAGGTTTGCTGCATTTTAAAAGTGTGATTGTTGTTAGATTTTGCCAGCTAATGATTGCTACAGAAAAGTTTGTTTACCGGTACAAAAATGTTCCTAAAAATTATGACTCACTGTTTTCATGCTTGGCTCATATAGCCACATCTTGTTTGCTCCAAATGCCGTGACTTGAGTGGATAAGCATTTTTTCTTTGGAATAGTATTATCCATCAAGGACTAGGCCAAGGATCAATATGTACATCATAGCTATAACAGCAGAGATTTAAATTTTAAATCTGTAATTAGAGATTTTCTTCAGATTGCAGAGCCAATTGAATGTCAAAACTGGAGAGGACCATAAGTATAGCCTCCAATAATTCATAAAAGATTTGTTTGAAAGTATTTTGGAAGGGATGTTCATGATCCTTTTTATTTTTATCTTTATTTATTTGAAATAGTTTGGATGCTGTTGGAACCGAGTGTTTGAACTCAGGCTTTTTTTTTTCCCCCCTTTTTAAAAATAATAATTTTTTTTTCTTATAAAAGATATGTTCACAGTTAAAAACTTTCTATGGTGCAGAAGGATATAAAGTGAAGCAAGTTCTCTGCCATCTCATTCCCATTCAGTAAGGAAATAGGGGTTCCTTGGGTATTTATTTTAAAATATCCTTCTATTGGCTATGGCTCTGGGACCATGGTGTAAAATCTGAGGAATGATGACAAAAATATTGACAAGTTGCATTCATTGAATGGGCAGGGAGAAAAACAGCAATCCCTGGGAAGGAACTGGCTGGATAAGTATACAATATTTCACGCTGGGCACAATGGCTCATGCATGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTTTAGACCAGCCAGGACAACATGGTGAAATCCCTTCTCTACAAAAATACAAAAATTAGGCATGGTGGCGTGCATCTGTGCTCCCAGCTACTTGGGAGGGTGAGGTGGGAGGATTGCATTGAGCCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGATACCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATTCTGTTTCTCTACTAGTTGCACATAACAGCAAATTTTACTCTTCAGAGAATAGTCTAAAATGCAGAACAAGCAATCAAAGCTCCTGAGATTTCAGAAGAGTTTGAGGCCTCCCACATCCTTCTCCACCTCTTTATAATCTCTTTTCATGTAATTCTGAGTATGGTGATCTTTTTTCAAATGTGCAGAGCTTAGAAGTAGCAAAGGAGGAGATAGCGCTGAGTAGAGCTGATGCTGATAACTGCGGACTAATAGCTTAAAAACATGCAAGAAAAAAACACAAACAGATGAGAAGATCAGCATACTGAAAGGCAGATACAGACTTCAAAGCCATAGTCTGTACTTCACTTTGTTTTGAGGGCGGGTTAAAGAAGAATATAAAAATCAGTAGTTTGCTATAGGGGACCCTAAACCATCGATAGGTGTTCATTATAAAATTTCTATTTGTGAAAACAGCAGTTTGTGGTAAGGCTGAATGACATATTATTGTATTCATAATGCATATTAGTACTCTTCAGAATCCCAGTTAAAATTATTTTATGTTTGATTTTCAGTTCCACTTACTTACATGATCATTTCGAGAGATGTAATGTTGATTGCTGCTGTTTTTTATGTCAGATACCGAACTTTTCCAACACCAGTGAGTTTGTTTCCAAAAAGTATTCTTTTAGCATTATATATGATTTAAGGAAAAAGCAAAAAGACATATTTTTGCGTCAACATCTTTTCAATTGATGGCACGTGAAACCCAGACTAGCCAGCCCCTATCCCTAGAAGCAAATTCTTTAAAGGTGTTTCATATAGGTCCAGGCCATATTGTCTAATTTAACCTCTACCATGGATAGTCTAGAATTGGTTTTAAAAATCACAGTTGTATGAACATGGGATGGTTTGTTTGCATATTTATTCACAGGCTCTATAAATACTTGAACACATACGCATAGCATATTAACCTCTTTTGGCTCCCAATGTACTGAAAATAGAGCAGTAGAGCAGTATTTTGTTCATTTTATTTTTTAATTCAAAAAAGAAAATAGTGAATAAGGGAATTTTGAGTTTAGTAAAATTTTATAAAGCAAACTATATGATAGGTATTGTGTTCGAATTTTACAGCAATTGAAAAATCTATACATTTTTTAAAATCAATATTCAGTATATATTGAATGTATGATTTATAAAGTTATGTTGTTACCTAAGTATAATAACAAAATGTCTATTTTAAATAAAAATGTTATTTTAAACAATAAGTTAATTACTTTATCTTTTTTGGTCCTCTGCCAGCGAACACTTGCCAAGTATTTCAATCCTTGCTATGCCACTGCTAGGTTAAAACCAACATTCATCAGCAAGGTAAGAGAATGCAATGTTCTTTGAAGTTATTCCTTTGTAAATTTTTATTATACAGGATATAAACCTTAGTCAAGAACAGCTGAAAATGAGACAAATTTAAATGCATTGAGTATAGAGGCTAGAGAGTAGCGTTGGGCAGGCAGTTTTAACCTAGTTTGTCCTCCGTGTTTTTTGGATCATCCTTATACATGTTGTGCCTTGAGTTGGTGGTCTGAGAGTTTAAGCTCTGAATGAGGTAATCGGGCCACTGTTTAGGGAAAGGGAATTGAAATGTAATTGTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTTACTTTGTTGCCCAGGCTGGTATGGAACTCCTGGCTTCAAGCAATTCTCCTGCCTTGGGTTCCCAAATTATTGGGATTACAGGAGTGAGCCACCAAGCTTGGCTGTAACTGCTTCTTAATTCAGTTTCACAGATTATGAAGAGTCCCTGGTGGTTTCACTCCCTCCTTCCCTGTGGTGAAAATACCAAATGGCTGTTCATTTTCAGGATTGATAGTTAAGTGGAAAGGGATAGGAAAATAGGAAAAAGTTTTGTTCACTAATAAACAACTGCTACTCTTAGTTGTCCATTCTGTTTTCCCGAGCATTCAGGGCAATAAGTATATGCCAGTCTACCTCTCAAGCCATATTTGTTTTTCTAGTAGCTTTGATAAGTTTTCTCAGTTCATTCTTTTGTCCCATCTTTAATGTCAAGGATTTAACAGGTTAAGAATGCCCATCATTTTTGGGAGAGAAGGGTAGTTGCTTCTATACAGAACTCCCTGGGGTGGACTTTCATCTACATGCATAGGGTTTGGGGTTTTTTTGTTGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGGCTTCAAGTGACTTGTGTTTATATTGTATGGCAATTTGAGTGTAGCGTTACATGGAAAGTGCTTAAAGAGGTACGGGGACAAGTGCCTTAAACCCTTATAGGAAGCCCTTAGGATAAAATTTACATTTTATTTTATTTTATATTTTATATTTTATTTTATTTTAATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTATTATTTTTTATAGATGAATTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGACGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGTCAGACTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCATCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGG
Task1_train_27713
Given this variant in gene FERMT1 (FERM domain containing kindlin 1) on Chromosome 20, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Kindler syndrome
CCAGGGAGGAATTCCCATCCCTTGACTGCAGGCTCAGTCATGTCTTCTGCTTTGGCCAATGGAATGTGGGTGGAAGTGACAGTGTGCCAACTTCATGCCTAAGCTTTAGGAGGTGCATGTGTTGCTACGTGCCCTCTCACACTTCTGCCCTCACCAAGAGGAGACCTTCCCTAGGCAGCCTGGGACCCAGAATAAATAAAATCAGCTCAACCAGAGGCACAGTCCCACCAAACCTGTGTCTCCAAACCCATATGACCAGCTGACACCATCCTGGATCATCCAATCCCCAGCCTACCTTTCAGCACATCTTTCAGAAAACAATGTTTATTGTTTTTCTTTTTCTGGGGGAACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCGGTGGTGCCATCTTGGCTCACTGCAAACTCTGCATCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCCAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGAGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCATGGCAAATGTTTATTGTTAGAATGTCATTGTGATTTTGTTACACTGTGATTGTTTGTTACAAAGCAATAGCTGAGTGACACAATAGTGCTCTAAATTTGTGAAAACATTTTTGGGTTTTGCTCTTAGGCTTAGTGGAGGTGAAGTGACTTAATATTTTTGGGGTTTTACTCACATGGTCACATCTCAAATACATTTCATTCATACCATCGGCAACAGGGATTAGTAACTTGATTCCAAATTTTCTTCCTGCTACATTTACATCGGGCACAACTTCGCAGCCTGAAGGACAAAGATCAGAGACAAAACTGAGTTCTGAGGCATCTGTTAGATAAACATCAGGTGTGTATCTGAAATAAAGACTTTGAATACAAGCCCCTCAGATTTGCTTTGGTTTTGAAAAATGGAGGAGCAAGCTGATAACATTAATTAATGGATAATTAGATAAATCTTATGAACAATTAACATAGATAAAGAAAAATGCTTTTCTTTTACAGTTTTCTTAAAAAGTCAATTTAGTTCATTTTCAGGTTAATGCTGGCTCTCCAAACTCATAGAAAAAATTGTGGATATGAACTTTAAAATAAATCAAAGCAGAAGGAATTCTCTGATTGTCACAATAATGTGAGTTGAGTGTACTGGTTAATTAAATATTTCAATTAATAGATGGTTATCAGGACGCTCACAGTGACCTTCAGAAATTAGAATAGGCATTAAAGTGACACTGAATTAAATATAACTGTTCTGGAATACAGAAAACTTTTCAGGATCTTACAGCACCTCATGTGCTATACTCTTGGACATGAATTACCACCACATCATAAACTCTGGACACACTGAGAAAGATGGAACAGCAGAATGCAAATAATCATGTTTACTAGACTGCATTCAAGGCTCATGCTTGGAAGAGCAGCTGCAGCCAGGCTGTCATTTGGAAAACAGTGACACTGGTTCTGGTGGTTCCTCTAGAAGTAAGTAAACCGTGCCTCATGGTGTCGAAACCCTGACTTTAATCTGCTCACCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCACTCTATCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATCATCTCGGCTCACTGCAACCTTCACCTCTTCAAGTGGTCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTGGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATCTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTTTGAGCCACCGCGTCTGCCCTGACTTACGATGAGCCACAGCAAGATATAGGGTACTCTTACCTCTAAGATTTAGTTTTTCTAGTGGTTCTCCTTGTTCAAGTTCCTTATTTTTAAAGTATGCTATGGATGTGTCTTTAAAGATAAACCAATATTGTTTGAAAGCTTTTGGTAGTAACTTCTTGGGCCTGCAAATTCAAAGATAGTGAATGTTTAAACCACCACCCAGAAATGTGGAACACGCTGCAGATTTCAAGCAGATCAGATCAGATGTTTGTGTCAAAGAAAACACACTTTGTTTTTTCAAAAATAATTTCAAATTGCTAATTTCCAAGCGCTGGAAATGAAATGCTGATATGTGATGTAGATTTTAACACTAAGCCTCCACCTGGGGCCACACCTGGCTCTGCTACTGTCTACACGTGTGTCCTGGGAAAGATCCTGCACTTACCTGGGCTGCGTGCACTGCCTCTGTGTGATGGGGACCGTCGTAGTCTGGGAACCCAGGGCTTTTGTGAGGACAGAATGAGTTCATCTACATGAAGAGCTTATCACAACACCTGATGCAACTGAAGTGTTAACTGTGATGGTGTATGTGAGGAACCGACATGAATCTGGTGACATTTGGAATCTCGGCATACTTTTTGCATTTGAAAAAGCTGTCGATATGGACAGCCCAAGCTTCAGGTTACCATACATACAAGTCAGATATAAACATGAGCAGCATTTTCTGTAGTTTCCTCTTCACCCTTAAGAGAAACTATGGGAGAATTCTCAGTGAACCATGGAAATCAGCGATATCTACAGCTAGTCAATATAGACTCTACTGTTATTAAAAACTATTTTGGGGAAAGGTATCCAGCTGTGGTATTGGTATCTGTTGGGGCCAGAAAACTTTATACAGTGGACTAGACAAGGTTGGTGGTGCCAGTGGCAGGCCTAAAGGTTGGGTCATTCAAAATAGGAAACGTGAGAATGAGCTAGGGGGAGGACAGGGGTTGGAGATAGGCAGAGAAAAGAAATTATTAGTATGCGGTTTGTGGAAGAAACCTGGCCGTGGGGGCAGATCAGGGTATCTCATGCCAGAGGGGCGGACTTCTGCATCAAGAATGGGAGAAGAAAGGAACCTTGGTGTTCCTCTTGGAGAAGAGAGGAACCATTCATATGTAATTTGGGGCAATTTTTTTTTTTGGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCAGGCTAGAGTGCTGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCAACTCCCTGGTTCAAGGGGTTCTCCTGCCTCCGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCAGCTGGGACAATTTTTTTAAACATGTCAGTACTAGTCTTTCCTTAGCTAAACATATGTTATCCTTAACACAAAGATAGGAAAGAAGTTGCACATTAAAAAAAAAAAGTATATGCTGGGTGCCAGTGCCATCATCTCAGCACTTTGGGGAGCTGAAGTGAGAGAATTGCCTGAGGCCAGGAGTTTAGGACCAGCCTGGGCAACACAGGAAGATCACATCTCTACAAAAAAAGAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGTGTCTATAGTCCCAGCTATGTGGGAGGATTGGTTAAGCCTGGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCTATGATCACCCTGGGTGACAGAGTAAGGACTTGTTTCTAAAAAATAAATAAATAAAATTTAAAAACCCAGCAAAACCCCCTCAGTGTATTACAGAAGAATATTACATATAATTTATAAAATAAATTTGAAAAACATTATATGAACTTAACATTTCCAGGATTAAGAAAAAACACTGTATTAAAATAGTATTTATTTGCTGGGTGCGGTGGCTCGTGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCTGATCACTTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGGCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGCCGTGGTGGCGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACCCGGAGGCTGAGGCACAAGGATTG
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Task1_train_27714
A variant affecting Chromosome 20, within the gene BMP2 (bone morphogenetic protein 2), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Transposition of the great arteries, dextro-looped
TTGAGTGAGTGATCTGACATGATTCTCCTTTGCTAAGGCATCTAGATTCAGTGCACAACTTACAGCTGTTTGTCTTTAGGGGAAATACAACTGTAAAATTAATAAAAACATAGTCTCTTCTTATGATAACATGGAACGATGGCAAAATAGATTTTGTTAGCACTTGGGTAGGAATTCTGAATGAAGCAGGCAAATTCTGTTGGCAGTGAAATGATAGGATGTGGTAAAGTTAGAATAAAATAAACTTAAATGTCTCAAACTCTCATGGTATATACTACCAGTTTAATAATAATGTTGTACCTTTGATGATTTGCAGACTACAAGCATTCAAGGTGCTGTGTTATATATTACTTGCTTGGAGAATAATACTTCTTAAAAATTGAAATTCAGAAATTTTAAATCAGACAAAGCTTTTGTGCATGGCCCACTTAAATGGCTATTTTGAAATAATGATAGTGGATATAGAAGGATTATTCTGTAATAGGATGAGACTGTTCCTTTTGTCATGGAGATCATAATCATATTTTTGTAAATTTTTATTATTTTTTTGGTTTTGTGTCCATCCTGCACACTATTACTGGGTAGGTACATGGTTTTTTAACATGGTTTATCTTTCAAAACTATAAAGGCATTGCAAACAGAAGACAGGTCATTTATTTTTCTTCCAAAAGCATCTAAAATGAGATTTTGATATTTGAGGTCATAAAGAGGTGAGAGAACAGACAACAGTTGGGAAAGCTATTTCTCTTGAAATTGTTTGGCCTTAATTACTACAGTGTCCTAGTACCACCCATACGTTTCCAAAGAAGTAGATCCCTGTAAATGCCTTTGTCTCTGGACTTTTGAGTAAAATAGTAGGGTGTGCTTTGCAAAATGTCATCGTTGATGTTGAGTTTCAGAGTCTTTAATTAGGAAGCTGAAATCTGTATATCGAGATTTGTAAATCATCTAAATTGCAGAGTAATGTTTTAGAATACTGCTTAAGGGATTGGCATTAAAGCCTTTTTTAAAAAAGAAATGCAATAATTTCCTCAAATCCTCACTCATTAGACCTCTACTAACTATAGTGCTGACTTTTTTTTTTTTTTACCCTAAAGTCTGGAATTCCAAAGAAATGCTTCACCATTTCCCCCATTATTATAGCCACCTGGAAGCAGTATTCATGTATTAGATCAAAAACACAACAAAGAATTATGAAAGGTTGTTTCCTGGTATGCAATGCATGATGACATGAACTTACAGAACAGAGAGAAGGGAGGCTCCATGTTTATTTAAAGAGGAAATTTTTATTTTCTGGTTACCTACTTTTACATGGGTTACATCAAATCCCACGATGAGGTTTAAAAATTCTCATAGATAATCAAACGTCATTACTTGGCTTACTGAAATTCAGACTTTTCTTTTTTCTTCCCTGTTTTTCTCTATCAAATTAGAATCTTTGGAAGAACTACCAGAAACGAGTGGGAAAACAACCCGGAGATTCTTCTTTAATTTAAGTTCTATCCCCACGGAGGAGTTTATCACCTCAGCAGAGCTTCAGGTTTTCCGAGAACAGATGCAAGATGCTTTAGGAAACAATAGCAGTTTCCATCACCGAATTAATATTTATGAAATCATAAAACCTGCAACAGCCAACTCGAAATTCCCCGTGACCAGACTTTTGGACACCAGGTTGGTGAATCAGAATGCAAGCAGGTGGGAAAGTTTTGATGTCACCCCCGCTGTGATGCGGTGGACTGCACAGGGACACGCCAACCATGGATTCGTGGTGGAAGTGGCCCACTTGGAGGAGAAACAAGGTGTCTCCAAGAGACATGTTAGGATAAGCAGGTCTTTGCACCAAGATGAACACAGCTGGTCACAGATAAGGCCATTGCTAGTAACTTTTGGCCATGATGGAAAAGGGCATCCTCTCCACAAAAGAGAAAAACGTCAAGCCAAACACAAACAGCGGAAACGCCTTAAGTCCAGCTGTAAGAGACACCCTTTGTACGTGGACTTCAGTGACGTGGGGTGGAATGACTGGATTGTGGCTCCCCCGGGGTATCACGCCTTTTACTGCCACGGAGAATGCCCTTTTCCTCTGGCTGATCATCTGAACTCCACTAATCATGCCATTGTTCAGACGTTGGTCAACTCTGTTAACTCTAAGATTCCTAAGGCATGCTGTGTCCCGACAGAACTCAGTGCTATCTCGATGCTGTACCTTGACGAGAATGAAAAGGTTGTATTAAAGAACTATCAGGACATGGTTGTGGAGGGTTGTGGGTGTCGCTAGTACAGCAAAATTAAATACATAAATATATATATATATATATATTTTAGAAAAAAGAAAAAAACAAACAAACAAAAAAACCCCACCCCAGTTGACACTTTAATATTTCCCAATGAAGACTTTATTTATGGAATGGAATGGAAAAAAAAACAGCTATTTTGAAAATATATTTATATCTACGAAAAGAAGTTGGGAAAACAAATATTTTAATCAGAGAATTATTCCTTAAAGATTTAAAATGTATTTAGTTGTACATTTTATATGGGTTCAACCCCAGCACATGAAGTATAATGGTCAGATTTATTTTGTATTTATTTACTATTATAACCACTTTTTAGGAAAAAAATAGCTAATTTGTATTTATATGTAATCAAAAGAAGTATCGGGTTTGTACATAATTTTCCAAAAATTGTAGTTGTTTTCAGTTGTGTGTATTTAAGATGAAAAGTCTACATGGAAGGTTACTCTGGCAAAGTGCTTAGCACGTTTGCTTTTTTGCAGTGCTACTGTTGAGTTCACAAGTTCAAGTCCAGAAAAAAAAAGTGGATAATCCACTCTGCTGACTTTCAAGATTATTATATTATTCAATTCTCAGGAATGTTGCAGAGTGATTGTCCAATCCATGAGAATTTACATCCTTATTAGGTGGAATATTTGGATAAGAACCAGACATTGCTGATCTATTATAGAAACTCTCCTCCTGCCCCTTAATTTACAGAAAGAATAAAGCAGGATCCATAGAAATAATTAGGAAAACGATGAACCTGCAGGAAAGTGAATGATGGTTTGTTGTTCTTCTTTCCTAAATTAGTGATCCCTTCAAAGGGGCTGATCTGGCCAAAGTATTCAATAAAACGTAAGATTTCTTCATTATTGATATTGTGGTCATATATATTTAAAATTGATATCTCGTGGCCCTCATCAAGGGTTGGAAATTTATTTGTGTTTTACCTTTACCTCATCTGAGAGCTCTTTATTCTCCAAAGAACCCAGTTTTCTAACTTTTTGCCCAACACGCAGCAAAATTATGCACATCGTGTTTTCTGCCCACCCTCTGTTCTCTGACCTATCAGCTTGCTTTTCTTTCCAAGGTTGTGTGTTTGAACACATTTCTCCAAATGTTAAACCTATTTCAGATAATAAATATCAAATCTCTGGCATTTCATTCTATAAAGTCCAACCTGTAAGAGAAAATGGTGCATTTGTATAGCGCTTACAATGATGACCTTGTGTTTGCATTTTTGTTTCTGAAGTTATATATTTTAGAGGGGGTGGGGGAAAGGTAATGAATGGCTGGAAAATTGCAGGCAAGTTATTTGATAAGTCATATTTGCACTAAAGGTGTTACCAGTGATTTAGTATTTTTCAAATGAACTTCTTTGGGGCAGAAAGATTTAAGGGAAAACTAAAGCCTACAAAACAAGCAAAACCTGGATAACCCGAGATAAAGTTTCAGAGATAATAGCCCATGCAACAGAGGCAACGGTGCCAGAAAATTAGAAAGGGAAAGTGTCGGAGATCAGCTTCTATAAGAACATCTGCCAGTTGGACTGACGCCCAAACAGAATGAAGTCAAATTAGGCTGCTCAGATTGAACACTTACCAGAGTGTCAGGGCTTCTGTACCCTGGGTTAGAATCAGACCAAGGAAGGGTTCAGCAGATGTTCATAAGAGCAGGGCACCCACAACTACCCACTATTTTACTGGCAGTATTTTAGGTCAGTTTCCAGGACTTTGCATCCCCTCTGATCCTGCCATGCATGATTGGTGAAACCTACCTCTAATCTCCTTGGAATTGGCTAAAAAACAGTGTGTTTATAA
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Task1_train_27715
Gene BMP2 (bone morphogenetic protein 2) on Chromosome 20 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Atrial septal defect 1
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Task1_train_27716
Given this variant in gene PLCB1 (phospholipase C beta 1) on Chromosome 20, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Self-limited epilepsy with centrotemporal spikes
CACTGAGCTGGGCTATAATAACTGCCACAACAATCTAATGAATTCTGTTTAATTAAAAAGAGATAATAAGAAGAATTTCATATTAAAACCCATAAGCCTAGATAATATGATGGTTCTAAATTGTCCTCATTGCCAATGTTAGATGTCTGACAACTTTAACTATTGTGAAACATCCATCACAGATATTCTAACTATAGATTCTGTTGTTTGAGGGAGGTGGGAAGGAAGCTCTGTTTGCAATCATTTGAAATAGCAAACTGACATTTTCTTTTTCCAGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAGAAATCTGTGAGAAGTAAGCCCTCATTCCCATTACAATTGACATGTGCATCTGAATTTATTCAACACAAATTCCCATCTGATTTGCCTCTTTTTTCTCTTTTACTTCCATTGTGACTTCAGAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCTAAATCCAAAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGTAAGTCAAAAGTGTCCCCTCTCCCAAACAGTTCATCTGGGAATTATTTTATTTTGTACGTCAGAGTCACAGGTTCATAACCAGTCAAAGACTCCTTCGTGAAGTTTCTCCTCTAGTCAGCCTTTCAAAAGATTCTTTTGGTAAGGTTTTTAACAGGGAAGGCTCAAGCAAAGACTGGTTCAATAAAGGAGTGAGGCACACCCAGGGCCTTTTAGATAAAGAGTAAGCAAAGAGCTTCCCTCAGGGAAAGGCTAAATCCTCACTTCCTACCCATAATCTTCCTGGCATTTAGTGAAAACAGAGCCTGTGCCTTGGGAGGAACCTGACCTTTGTCCAAAGGCTGGCAGATTATACCTTCCTTGTAGCAGTAATAAGAATGTTGCTATGGCTCACACTTGTAATCTCAGCACTTTGAAAGGCCTAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATAGGGGCCTGGGCAACACAGGGAGACTCTGTCTCTACAAAAAAATTTTAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCACACCTATATTTCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCTGGAGGATGGCTTCAGCATGGGAGGTCAAGGCTTCAGTGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCTACCATGGGCAACAGAGCGAAACCTTGTCTCCAATAAATAAATAGATAAAAATAAGGAAAAAAGAAAAAGAATGTTGAGAGTTCTGTAACCTTTTATCTAGAAGTCTGAGATTACCATTTGTCAATTCTGGATGAATTGGTATAATGATGTATTCATCATTTGCTTTTAGGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCAGTATATCAAGAGGGTATGTGGGCTCATCACGCTCTCTCCTTTGCAAAACATGTGTGAACATTTGGTGAGCTCGCTGTGAGCTTCTGGAAGGAAATGTCATGCCTTGCCATAACTTTTTATCACTAGCACCTAGCAGAGCTGTTTCACAGGGTGGGCACTCCTTAATCAACATTTCTGCAAGTTGAATTGCAAACCACTTTGTAAAAGGATTCATCTAAAAATAGAGTCAAGTCATTTCCAAAGTCAAGAGCCCAGAAACATATTGTAAATGATAGTGTTCCCAAAAGAACCTTTAATTGTCATCAATGATAGAGATGATGGCAACCTCGAAGGGCTGTCCTTTTTTTTTCCAATTTAATGTCATAGAAATGTTTACATATTTATAAAAAGGTAAGAACAGTGCAGTCCATTGATCACCACCTCCCACCCTTATGTTTCTGTCACCTAGCTTCAACACTTACTACAGTTTCCTATACTTGTAAGTGTAGTTCTTGATCAGGAGATCAAATAATCAAATGTAAGCCATAGATCTGAAAAGCTTTCGGTATTTTCTGAAAACGTGCACTTTTAAATGTTTAGATGAAAGTAATGTTTCTTGTAACTTTCTTATAGCTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAACACAAGGAAATACGTCAGCAGATCCTGGATGAAAAGCCCAAGGTAAACGGAACTGAATTAAAATGAACAATTATTTTATTTGATTTCCATTTAGTAAGAGTAAAACCTTCCTGGTTTACATAAGTACCTTGTACACAGTCTCAGATCAGTTCTTGCATATGAAACTCATGTATCTTTCTCAATGAAGGAAAAAATATAGCAATATTCAGTAAGCATTTATCATCACCTGGTGAGCTTTTAAAAACTGCAAATATGCAGAACCCAGCCCCAGAGATTTGGCTTTAACTAATCTGGGGTATGGCTCAGACAAAGGTATTTTTATAGTCCGTTTCCCCTGGAGAATCAGAGACTAACCAAACCTTCAGTTTGGGTACTACTAAGTAAACGTCAGTTCTAAATAGCTGATGTAATGTTGTAATGCCACCCTCTGTCCAGCAGAGGATGCCCTGCACCAAAATCACTTTGGTTTTTATCTAGCAAAATAGTCTCATAAATCAGAGAAAAGCAAATCTTTTGTTTCCCATAGTAACAGTTGATTGGGGCTCTGCTTTAAAATTATCTTATGTTCATTGTTTGGTTAAAATTAATTGTCTTATGAATATTAACTTTGAATGAACTGAGTATCTGTAGATCAAATACTTTGAGGTTACCAAATGGCATCTCAGTTTTAGAACATTCCTTCCATTTTGATTCATCACTGAATAGTTTTCTGTTTGTGGAAATTGTGTTTTTCAATTTTCCTGCGCTTCTATTTTCAATTTAAAATATCTACTCTAAAAAGTACTGCCATTCCACACAAGCATTTCTCGAGTCCTAAAAGTTAAAAAACGTTAGTTTTATTTAATTGTATGTTTCATTCACCAGTTTACTTCTTATAGATTTCTTATGGATAATTCTAAATATATTTTCATGGTTCTTTGTGCTCTTATGCTTTCATATTTATTATATAAGACATTTATTTAATATTTTTAATTTCTAAGTTTTTAGGGTTGGCAATATAGATTCTCAAGCAAGAATTAATAATTACTTAGATATGGTGCTAATTCTTACGTTTCTCCTATAAACATATAATGTAGATCTTCTCAGCCACCCTCTCAGGTTGATTATGCACTAATAAAGTGGAATAAATTTTAACATAATTTCAGAAATTGCTATACTTTCCAATCAGAATTGATCTTTTTAAAATGCTCAAATTATTTAGAGCAAAAGATCCAGTTTGACTGAAATTTAAGAAACACTTTAATAATAATCAGTCTCAGGTGATATATTCAGATACATACATTTCTAATCTATGCTGTCTGGTTTTAAATTTGTCATTACTTTGTACACTGACATAATAGAATTTGCTTATGGTTGATGGCTCAGCTAGTTTTTGTATTTCAAAAAAATTTAGGTAATATGGTTCTTTTCAGAGTTTCATTTTGCTTTTTTTTTTCATGCGTGTTTTGGTTCAACAATGTTAACTATTTTACTTACAGATAAAATGTGAATGTAAAATCATTAATGTGTTTAAATTATATAACTCTCAGTATCAGTAACCCATACAAAGATTTTCTTGTTACTGCTCTAGGTCATCATGATTAAAATCAACCTCAGTAAATGTGGAAGCACCCTTAAACTTCTTCCCTGGATATAACTGGACATGAAAAGAACTAATAACTTTTGGCTGATTTATTAACAGTCAGGGTGCATTCAGCTGCAATTTTACAATAAGCCCAATTAAAACTGGCTTCAACAGTTATAGTATTTAGTAAGCCACGTTACTGGAAATTCAGAGGTACTACAGTTGTAACAGTGATTAATTTAGTGGCTTAACAATTTCATCTCCAGGTATTTTTAGAATTTCCACTGTTGTTGCCTTCTAGATCCAGACCGTGAACTCAGTCATGAGATGGCTGCCCTAGCTCCACACATCATAACCTTACATGAAACCACTCAAAGGACGTGCAGCAAATGTCTTCATTTTGTAACCCTTTCTAGGATTGAGAAAAACCTTCCTACATCCCCTCTAGCTGGTGTTTCCTCATTGGGTACAATGGCCTCATATT
CACTGAGCTGGGCTATAATAACTGCCACAACAATCTAATGAATTCTGTTTAATTAAAAAGAGATAATAAGAAGAATTTCATATTAAAACCCATAAGCCTAGATAATATGATGGTTCTAAATTGTCCTCATTGCCAATGTTAGATGTCTGACAACTTTAACTATTGTGAAACATCCATCACAGATATTCTAACTATAGATTCTGTTGTTTGAGGGAGGTGGGAAGGAAGCTCTGTTTGCAATCATTTGAAATAGCAAACTGACATTTTCTTTTTCCAGCTTATTCAAAAGTTGACGGATGTCGCAGAAGAGTGTCAGAACAATCAGTTAAAGAAGCTCAAAGAAATCTGTGAGAAGTAAGCCCTCATTCCCATTACAATTGACATGTGCATCTGAATTTATTCAACACAAATTCCCATCTGATTTGCCTCTTTTTTCTCTTTTACTTCCATTGTGACTTCAGAGAAAAGAAAGAATTAAAGAAGAAAATGGATAAAAAGAGGCAGGAGAAGATAACAGAAGCTAAATCCAAAGACAAAAGTCAGATGGAAGAGTAAGTCAAAAGTGTCCCCTCTCCCAAACAGTTCATCTGGGAATTATTTTATTTTGTACGTCAGAGTCACAGGTTCATAACCAGTCAAAGACTCCTTCGTGAAGTTTCTCCTCTAGTCAGCCTTTCAAAAGATTCTTTTGGTAAGGTTTTTAACAGGGAAGGCTCAAGCAAAGACTGGTTCAATAAAGGAGTGAGGCACACCCAGGGCCTTTTAGATAAAGAGTAAGCAAAGAGCTTCCCTCAGGGAAAGGCTAAATCCTCACTTCCTACCCATAATCTTCCTGGCATTTAGTGAAAACAGAGCCTGTGCCTTGGGAGGAACCTGACCTTTGTCCAAAGGCTGGCAGATTATACCTTCCTTGTAGCAGTAATAAGAATGTTGCTATGGCTCACACTTGTAATCTCAGCACTTTGAAAGGCCTAGGTGGGAGGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAATAGGGGCCTGGGCAACACAGGGAGACTCTGTCTCTACAAAAAAATTTTAAGATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCACACCTATATTTCCAGCTACTCAGAAGGCTGAGGCTGGAGGATGGCTTCAGCATGGGAGGTCAAGGCTTCAGTGAGCCATGATGGTGCCACTGCACTCTACCATGGGCAACAGAGCGAAACCTTGTCTCCAATAAATAAATAGATAAAAATAAGGAAAAAAGAAAAAGAATGTTGAGAGTTCTGTAACCTTTTATCTAGAAGTCTGAGATTACCATTTGTCAATTCTGGATGAATTGGTATAATGATGTATTCATCATTTGCTTTTAGGGAGAAGACAGAGATGATCCGGTCATATATCCAGGAAGTGGTGCAGTATATCAAGAGGGTATGTGGGCTCATCACGCTCTCTCCTTTGCAAAACATGTGTGAACATTTGGTGAGCTCGCTGTGAGCTTCTGGAAGGAAATGTCATGCCTTGCCATAACTTTTTATCACTAGCACCTAGCAGAGCTGTTTCACAGGGTGGGCACTCCTTAATCAACATTTCTGCAAGTTGAATTGCAAACCACTTTGTAAAAGGATTCATCTAAAAATAGAGTCAAGTCATTTCCAAAGTCAAGAGCCCAGAAACATATTGTAAATGATAGTGTTCCCAAAAGAACCTTTAATTGTCATCAATGATAGAGATGATGGCAACCTCGAAGGGCTGTCCTTTTTTTTTCCAATTTAATGTCATAGAAATGTTTACATATTTATAAAAAGGTAAGAACAGTGCAGTCCATTGATCACCACCTCCCACCCTTATGTTTCTGTCACCTAGCTTCAACACTTACTACAGTTTCCTATACTTGTAAGTGTAGTTCTTGATCAGGAGATCAAATAATCAAATGTAAGCCATAGATCTGAAAAGCTTTCGGTATTTTCTGAAAACGTGCACTTTTAAATGTTTAGATGAAAGTAATGTTTCTTGTAACTTTCTTATAGCTAGAAGAAGCGCAAAGTAAACGGCAAGAAAAACTCGTAGAGAAATACAAGGAAATACGTCAGCAGATCCTGGATGAAAAGCCCAAGGTAAACGGAACTGAATTAAAATGAACAATTATTTTATTTGATTTCCATTTAGTAAGAGTAAAACCTTCCTGGTTTACATAAGTACCTTGTACACAGTCTCAGATCAGTTCTTGCATATGAAACTCATGTATCTTTCTCAATGAAGGAAAAAATATAGCAATATTCAGTAAGCATTTATCATCACCTGGTGAGCTTTTAAAAACTGCAAATATGCAGAACCCAGCCCCAGAGATTTGGCTTTAACTAATCTGGGGTATGGCTCAGACAAAGGTATTTTTATAGTCCGTTTCCCCTGGAGAATCAGAGACTAACCAAACCTTCAGTTTGGGTACTACTAAGTAAACGTCAGTTCTAAATAGCTGATGTAATGTTGTAATGCCACCCTCTGTCCAGCAGAGGATGCCCTGCACCAAAATCACTTTGGTTTTTATCTAGCAAAATAGTCTCATAAATCAGAGAAAAGCAAATCTTTTGTTTCCCATAGTAACAGTTGATTGGGGCTCTGCTTTAAAATTATCTTATGTTCATTGTTTGGTTAAAATTAATTGTCTTATGAATATTAACTTTGAATGAACTGAGTATCTGTAGATCAAATACTTTGAGGTTACCAAATGGCATCTCAGTTTTAGAACATTCCTTCCATTTTGATTCATCACTGAATAGTTTTCTGTTTGTGGAAATTGTGTTTTTCAATTTTCCTGCGCTTCTATTTTCAATTTAAAATATCTACTCTAAAAAGTACTGCCATTCCACACAAGCATTTCTCGAGTCCTAAAAGTTAAAAAACGTTAGTTTTATTTAATTGTATGTTTCATTCACCAGTTTACTTCTTATAGATTTCTTATGGATAATTCTAAATATATTTTCATGGTTCTTTGTGCTCTTATGCTTTCATATTTATTATATAAGACATTTATTTAATATTTTTAATTTCTAAGTTTTTAGGGTTGGCAATATAGATTCTCAAGCAAGAATTAATAATTACTTAGATATGGTGCTAATTCTTACGTTTCTCCTATAAACATATAATGTAGATCTTCTCAGCCACCCTCTCAGGTTGATTATGCACTAATAAAGTGGAATAAATTTTAACATAATTTCAGAAATTGCTATACTTTCCAATCAGAATTGATCTTTTTAAAATGCTCAAATTATTTAGAGCAAAAGATCCAGTTTGACTGAAATTTAAGAAACACTTTAATAATAATCAGTCTCAGGTGATATATTCAGATACATACATTTCTAATCTATGCTGTCTGGTTTTAAATTTGTCATTACTTTGTACACTGACATAATAGAATTTGCTTATGGTTGATGGCTCAGCTAGTTTTTGTATTTCAAAAAAATTTAGGTAATATGGTTCTTTTCAGAGTTTCATTTTGCTTTTTTTTTTCATGCGTGTTTTGGTTCAACAATGTTAACTATTTTACTTACAGATAAAATGTGAATGTAAAATCATTAATGTGTTTAAATTATATAACTCTCAGTATCAGTAACCCATACAAAGATTTTCTTGTTACTGCTCTAGGTCATCATGATTAAAATCAACCTCAGTAAATGTGGAAGCACCCTTAAACTTCTTCCCTGGATATAACTGGACATGAAAAGAACTAATAACTTTTGGCTGATTTATTAACAGTCAGGGTGCATTCAGCTGCAATTTTACAATAAGCCCAATTAAAACTGGCTTCAACAGTTATAGTATTTAGTAAGCCACGTTACTGGAAATTCAGAGGTACTACAGTTGTAACAGTGATTAATTTAGTGGCTTAACAATTTCATCTCCAGGTATTTTTAGAATTTCCACTGTTGTTGCCTTCTAGATCCAGACCGTGAACTCAGTCATGAGATGGCTGCCCTAGCTCCACACATCATAACCTTACATGAAACCACTCAAAGGACGTGCAGCAAATGTCTTCATTTTGTAACCCTTTCTAGGATTGAGAAAAACCTTCCTACATCCCCTCTAGCTGGTGTTTCCTCATTGGGTACAATGGCCTCATATT
Task1_train_27717
This genomic variant is located on Chromosome 20, within the PLCB4 (phospholipase C beta 4) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 1
CCCTCTCCAGGCAATGCCTTCTCCTTCCTACTCAGTGCCCTACAATTTATGGTCCACACAGCAGCCAGAGTAAACCTTTTAAAACCAAATCTAATCATGTTATTCCACCCTTTGAAACCCTCCAAAGGCTTCCCAACACATTTAGAATAAAATCTAAAATACTTAGTGAGGACTAAAGCCCAAGTGATGTAGCCTTTGGCTCCATCTCCAATCTCACTTCAAGCTACCTTTTTCCTTGGTCACTTGCTCTGTCTTGCTGTCATTGAATGATGTTGGCACGCATACATCTGCATCAAGGTCTTTGCACTTGATGATCCTTCTGCCTGGACTGGTGTTTCCTGGGTGTGCACGTGGCTTGCTCCTCACACATGTACGTGACCTCAGAAGGGCTTTCACTGGCCCATATTTAACACAGCATCCTGCCATGCTTCATCACCTTCCTCCCTGCTTTCTCTGTCCTTCTAGTACCTCTTTGACATTATATTTATTTGTTTACTTATTTGTTTCTGTCACTCATAATATGAGAGTTTCATGAAGGCAGGGCTTACCTGTTTCTTCTATCACTGCATCTATCCTGGTGCCTCTAAAAGTACTTGCTCTTTAGAATGAATGAAGGTGCCCAAGGAAAGAGGTATACAAATTTCTACTTTCATTTATAATTAGAAATGACCTAACTATCCATCAACCAAATAATGGATAATAAATTATGATATATTCATATATGGACTTCTGTACCTTCAGTGAAAAATAAATGAACAAGATCTACCTACATAGCTGGTATATAAAGATAAAAATAGCAAGTTGCAAATGCACACAGTGGGATAGTTTTTACATAAAATTAAAAACAGCCCAAACTACCCGTTGTTTGGATAAATGCATATGTAGTAAGGTTGCAGAACCATTTTGGAGGTAAACACCAAAACTAGGATACTAGTTATCTATCTGGTATGGAATGGAATTGAGGTGGGGTATACAGGATGCTGCAGTGGCATCAGAAATTATGTATTCTTTTACATGTAAGTCAAATAATCAAAAATGTAAATCAAATAAGGCAAAATGTTGAGATCTGACCACACTGGTGTAGGCCCGTGGCTATTCATTATGCTATCATCTGAACACTTCTGTATTAGCTTGAAATCAGTTCATAACTTGCAAGTTCTTAAATAAAACAAAAACTTGAAGCTGTCGATGCATCAACCATTTATAAGTTGCATAAATACTGATTGTTGCTCCTGTAGTTACCACGTGGGCTCTACCCCATGTCAGAAAGGTGTGATCGAAATGAAGGGTGGCTTTTGGGGCCACGTTTCAATGACCACTGTATACTCTTCTCACCAGTCCCATAACCTGACTTTTAGATAAAATTGAAAACTGAATTGTTTAAACTCAGAAGCACCATCATCTCCAAGAAAAATCCCTTTTCCAATTCAGTGAGAACAATGTCTTATAATTAATACATTTTCCATTTTTAAAGAGCACCTCTCGTATCTATTCTCATTTCCCATTATGAAGATCTTGGAAGTCAGATAGGTCCAGTCTTTTTCCCCAATTGACAGAAGAAGAAGCTGAGATCTAGGAGCCAAAGGAGTGAGTAGCAAGAGCAGAACTTGATACAGGCCCCCTGGACCCCTGGTCACCATAACTCCCAGTGCTGTGTTTCTGAACTTGGGGGACCATGTACATCTGCCATCATGGATGTAAAAGCAGAATACCACCTGTTTGTGGAATTCATTATGTTACTTATAATGTGCAACTCTCTTATTTCATTCAAGTTCTGACAGATGAAAGTTCTTGGGAAAGAGACTGTGAAGACGTTTTTACTCTTATAATTTAAGCTGCCTCAGCTTCCATGAATAAAACATGAGATATGCATCTTCAGAGCTACAAGTGCTACTAAGATGTTCTTTTTCCCCTAGGCCTTATATCAAGTGATGGGTTTTGCAGATATCTGATGTCAGATGAAAACGCCCCAGTCTTCCTAGATCGTTTAGAACTTTACCAAGAAATGGACCATCCTCTGGCTCACTACTTCATCAGTTCTTCCCATAACACTTATCTCACTGGCAGACAGTTCGGCGGGAAGTCTTCGGTAGAAATGTACAGACAGGTTCTCCTGGCTGGTTGCAGGTGAGGAACTCAAGATGGCAATTTGTTTTTTGTGTGTGATGCCCTTCAGTTTAATTTACTTTTCTCTGAAAAACAGGAAATAGTAATCAGGATGAAAAGGAAATTTGTTTATTCCCTTTAATGGATTATCATGGTCATTTAACGTTGAGAAAAGAAGGACAGTATCTCTTTCGGAAAAATCTTCAGTCATCCAAAAGACTTTACTGTGAAAAGACTTTTCTTTACTGTAAATTTAAAATATGCCTCCAAAACCACAAAAAAGAAAACATGCATATTGTAAGAAGGCGTGTTGAGTTTTTTGTTGATTATAGGTACTTGTTACTAGCACCATGCTCTAACCAATTGAGCTAACTGGCCATTGATTATAGGCACTTGTAAATTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTCTCAGTTTCTCAGAGAGGGGGATGTGGCAGGGTCATAGGATAATAGTGGAGAGAAGGTCAGCAGATAAACACGTGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGTCCCTGCCGCCTTCGGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTGAGATTAGGGAGTGGTGATGACTCTTAACTAGCATGCTGCCTTCTAGCATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGTACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTTGACACACCACATGTTTCAGAGAGCACGGGGTTGGGGGTAAGATTATAGATTAACAGCATCCCAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGGTGTCTCCTATGTCAACTTCTTACTACACAGACACAGTAACAATCTGATCTCTCTTTCTTTTCCCCACATTTCCCCCTTTTCTTTTCGACAAAACCGCCATCGTCATCATGGCCCGTTCTCGATGGTCACTGTCTCTTTGGAGCTGTTGGGTACACTTCCCAGATGGGGCGGCCTGGCAGAGGTGCTCCTCACCTCCCAGATGATGGGCGGCCAGGCAGAGGTGCTCCCCACCTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAA
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Task1_train_27718
The gene PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
CCCTCTCCAGGCAATGCCTTCTCCTTCCTACTCAGTGCCCTACAATTTATGGTCCACACAGCAGCCAGAGTAAACCTTTTAAAACCAAATCTAATCATGTTATTCCACCCTTTGAAACCCTCCAAAGGCTTCCCAACACATTTAGAATAAAATCTAAAATACTTAGTGAGGACTAAAGCCCAAGTGATGTAGCCTTTGGCTCCATCTCCAATCTCACTTCAAGCTACCTTTTTCCTTGGTCACTTGCTCTGTCTTGCTGTCATTGAATGATGTTGGCACGCATACATCTGCATCAAGGTCTTTGCACTTGATGATCCTTCTGCCTGGACTGGTGTTTCCTGGGTGTGCACGTGGCTTGCTCCTCACACATGTACGTGACCTCAGAAGGGCTTTCACTGGCCCATATTTAACACAGCATCCTGCCATGCTTCATCACCTTCCTCCCTGCTTTCTCTGTCCTTCTAGTACCTCTTTGACATTATATTTATTTGTTTACTTATTTGTTTCTGTCACTCATAATATGAGAGTTTCATGAAGGCAGGGCTTACCTGTTTCTTCTATCACTGCATCTATCCTGGTGCCTCTAAAAGTACTTGCTCTTTAGAATGAATGAAGGTGCCCAAGGAAAGAGGTATACAAATTTCTACTTTCATTTATAATTAGAAATGACCTAACTATCCATCAACCAAATAATGGATAATAAATTATGATATATTCATATATGGACTTCTGTACCTTCAGTGAAAAATAAATGAACAAGATCTACCTACATAGCTGGTATATAAAGATAAAAATAGCAAGTTGCAAATGCACACAGTGGGATAGTTTTTACATAAAATTAAAAACAGCCCAAACTACCCGTTGTTTGGATAAATGCATATGTAGTAAGGTTGCAGAACCATTTTGGAGGTAAACACCAAAACTAGGATACTAGTTATCTATCTGGTATGGAATGGAATTGAGGTGGGGTATACAGGATGCTGCAGTGGCATCAGAAATTATGTATTCTTTTACATGTAAGTCAAATAATCAAAAATGTAAATCAAATAAGGCAAAATGTTGAGATCTGACCACACTGGTGTAGGCCCGTGGCTATTCATTATGCTATCATCTGAACACTTCTGTATTAGCTTGAAATCAGTTCATAACTTGCAAGTTCTTAAATAAAACAAAAACTTGAAGCTGTCGATGCATCAACCATTTATAAGTTGCATAAATACTGATTGTTGCTCCTGTAGTTACCACGTGGGCTCTACCCCATGTCAGAAAGGTGTGATCGAAATGAAGGGTGGCTTTTGGGGCCACGTTTCAATGACCACTGTATACTCTTCTCACCAGTCCCATAACCTGACTTTTAGATAAAATTGAAAACTGAATTGTTTAAACTCAGAAGCACCATCATCTCCAAGAAAAATCCCTTTTCCAATTCAGTGAGAACAATGTCTTATAATTAATACATTTTCCATTTTTAAAGAGCACCTCTCGTATCTATTCTCATTTCCCATTATGAAGATCTTGGAAGTCAGATAGGTCCAGTCTTTTTCCCCAATTGACAGAAGAAGAAGCTGAGATCTAGGAGCCAAAGGAGTGAGTAGCAAGAGCAGAACTTGATACAGGCCCCCTGGACCCCTGGTCACCATAACTCCCAGTGCTGTGTTTCTGAACTTGGGGGACCATGTACATCTGCCATCATGGATGTAAAAGCAGAATACCACCTGTTTGTGGAATTCATTATGTTACTTATAATGTGCAACTCTCTTATTTCATTCAAGTTCTGACAGATGAAAGTTCTTGGGAAAGAGACTGTGAAGACGTTTTTACTCTTATAATTTAAGCTGCCTCAGCTTCCATGAATAAAACATGAGATATGCATCTTCAGAGCTACAAGTGCTACTAAGATGTTCTTTTTCCCCTAGGCCTTATATCAAGTGATGGGTTTTGCAGATATCTGATGTCAGATGAAAACGCCCCAGTCTTCCTAGATCGTTTAGAACTTTACCAAGAAATGGACCATCCTCTGGCTCACTACTTCATCAGTTCTTCCCATAACACTTATCTCACTGGCAGACAGTTCGGCGGGAAGTCTTCGGTAGAAATGTACAGACAGGTTCTCCTGGCTGGTTGCAGGTGAGGAACTCAAGATGGCAATTTGTTTTTTGTGTGTGATGCCCTTCAGTTTAATTTACTTTTCTCTGAAAAACAGGAAATAGTAATCAGGATGAAAAGGAAATTTGTTTATTCCCTTTAATGGATTATCATGGTCATTTAACGTTGAGAAAAGAAGGACAGTATCTCTTTCGGAAAAATCTTCAGTCATCCAAAAGACTTTACTGTGAAAAGACTTTTCTTTACTGTAAATTTAAAATATGCCTCCAAAACCACAAAAAAGAAAACATGCATATTGTAAGAAGGCGTGTTGAGTTTTTTGTTGATTATAGGTACTTGTTACTAGCACCATGCTCTAACCAATTGAGCTAACTGGCCATTGATTATAGGCACTTGTAAATTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTCTCAGTTTCTCAGAGAGGGGGATGTGGCAGGGTCATAGGATAATAGTGGAGAGAAGGTCAGCAGATAAACACGTGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGTCCCTGCCGCCTTCGGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTGAGATTAGGGAGTGGTGATGACTCTTAACTAGCATGCTGCCTTCTAGCATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGTACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTTGACACACCACATGTTTCAGAGAGCACGGGGTTGGGGGTAAGATTATAGATTAACAGCATCCCAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGGTGTCTCCTATGTCAACTTCTTACTACACAGACACAGTAACAATCTGATCTCTCTTTCTTTTCCCCACATTTCCCCCTTTTCTTTTCGACAAAACCGCCATCGTCATCATGGCCCGTTCTCGATGGTCACTGTCTCTTTGGAGCTGTTGGGTACACTTCCCAGATGGGGCGGCCTGGCAGAGGTGCTCCTCACCTCCCAGATGATGGGCGGCCAGGCAGAGGTGCTCCCCACCTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAA
CCCTCTCCAGGCAATGCCTTCTCCTTCCTACTCAGTGCCCTACAATTTATGGTCCACACAGCAGCCAGAGTAAACCTTTTAAAACCAAATCTAATCATGTTATTCCACCCTTTGAAACCCTCCAAAGGCTTCCCAACACATTTAGAATAAAATCTAAAATACTTAGTGAGGACTAAAGCCCAAGTGATGTAGCCTTTGGCTCCATCTCCAATCTCACTTCAAGCTACCTTTTTCCTTGGTCACTTGCTCTGTCTTGCTGTCATTGAATGATGTTGGCACGCATACATCTGCATCAAGGTCTTTGCACTTGATGATCCTTCTGCCTGGACTGGTGTTTCCTGGGTGTGCACGTGGCTTGCTCCTCACACATGTACGTGACCTCAGAAGGGCTTTCACTGGCCCATATTTAACACAGCATCCTGCCATGCTTCATCACCTTCCTCCCTGCTTTCTCTGTCCTTCTAGTACCTCTTTGACATTATATTTATTTGTTTACTTATTTGTTTCTGTCACTCATAATATGAGAGTTTCATGAAGGCAGGGCTTACCTGTTTCTTCTATCACTGCATCTATCCTGGTGCCTCTAAAAGTACTTGCTCTTTAGAATGAATGAAGGTGCCCAAGGAAAGAGGTATACAAATTTCTACTTTCATTTATAATTAGAAATGACCTAACTATCCATCAACCAAATAATGGATAATAAATTATGATATATTCATATATGGACTTCTGTACCTTCAGTGAAAAATAAATGAACAAGATCTACCTACATAGCTGGTATATAAAGATAAAAATAGCAAGTTGCAAATGCACACAGTGGGATAGTTTTTACATAAAATTAAAAACAGCCCAAACTACCCGTTGTTTGGATAAATGCATATGTAGTAAGGTTGCAGAACCATTTTGGAGGTAAACACCAAAACTAGGATACTAGTTATCTATCTGGTATGGAATGGAATTGAGGTGGGGTATACAGGATGCTGCAGTGGCATCAGAAATTATGTATTCTTTTACATGTAAGTCAAATAATCAAAAATGTAAATCAAATAAGGCAAAATGTTGAGATCTGACCACACTGGTGTAGGCCCGTGGCTATTCATTATGCTATCATCTGAACACTTCTGTATTAGCTTGAAATCAGTTCATAACTTGCAAGTTCTTAAATAAAACAAAAACTTGAAGCTGTCGATGCATCAACCATTTATAAGTTGCATAAATACTGATTGTTGCTCCTGTAGTTACCACGTGGGCTCTACCCCATGTCAGAAAGGTGTGATCGAAATGAAGGGTGGCTTTTGGGGCCACGTTTCAATGACCACTGTATACTCTTCTCACCAGTCCCATAACCTGACTTTTAGATAAAATTGAAAACTGAATTGTTTAAACTCAGAAGCACCATCATCTCCAAGAAAAATCCCTTTTCCAATTCAGTGAGAACAATGTCTTATAATTAATACATTTTCCATTTTTAAAGAGCACCTCTCGTATCTATTCTCATTTCCCATTATGAAGATCTTGGAAGTCAGATAGGTCCAGTCTTTTTCCCCAATTGACAGAAGAAGAAGCTGAGATCTAGGAGCCAAAGGAGTGAGTAGCAAGAGCAGAACTTGATACAGGCCCCCTGGACCCCTGGTCACCATAACTCCCAGTGCTGTGTTTCTGAACTTGGGGGACCATGTACATCTGCCATCATGGATGTAAAAGCAGAATACCACCTGTTTGTGGAATTCATTATGTTACTTATAATGTGCAACTCTCTTATTTCATTCAAGTTCTGACAGATGAAAGTTCTTGGGAAAGAGACTGTGAAGACGTTTTTACTCTTATAATTTAAGCTGCCTCAGCTTCCATGAATAAAACATGAGATATGCATCTTCAGAGCTACAAGTGCTACTAAGATGTTCTTTTTCCCCTAGGCCTTATATCAAGTGATGGGTTTTGCAGATATCTGATGTCAGATGAAAACGCCCCAGTCTTCCTAGATCGTTTAGAACTTTACCAAGAAATGGACCATCCTCTGGCTCACTACTTCATCAGTTCTTCCCATAGCACTTATCTCACTGGCAGACAGTTCGGCGGGAAGTCTTCGGTAGAAATGTACAGACAGGTTCTCCTGGCTGGTTGCAGGTGAGGAACTCAAGATGGCAATTTGTTTTTTGTGTGTGATGCCCTTCAGTTTAATTTACTTTTCTCTGAAAAACAGGAAATAGTAATCAGGATGAAAAGGAAATTTGTTTATTCCCTTTAATGGATTATCATGGTCATTTAACGTTGAGAAAAGAAGGACAGTATCTCTTTCGGAAAAATCTTCAGTCATCCAAAAGACTTTACTGTGAAAAGACTTTTCTTTACTGTAAATTTAAAATATGCCTCCAAAACCACAAAAAAGAAAACATGCATATTGTAAGAAGGCGTGTTGAGTTTTTTGTTGATTATAGGTACTTGTTACTAGCACCATGCTCTAACCAATTGAGCTAACTGGCCATTGATTATAGGCACTTGTAAATTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTATTTATTGATCATTCTTGGGTGTTTCTCAGTTTCTCAGAGAGGGGGATGTGGCAGGGTCATAGGATAATAGTGGAGAGAAGGTCAGCAGATAAACACGTGAACAAAGGTCTCTGGTTTTCCTAGGCAGAGGTCCCTGCCGCCTTCGGCAGTGTTTGTGTCCCTGGGTACTTGAGATTAGGGAGTGGTGATGACTCTTAACTAGCATGCTGCCTTCTAGCATCTGTTTAACAAAGCACATCTTGTACCGCCCTTAATCCATTTAACCCTGAGTTGACACACCACATGTTTCAGAGAGCACGGGGTTGGGGGTAAGATTATAGATTAACAGCATCCCAAGGCAGAAGAATTTTTCTTAGTACAGAACAAAATGGTGTCTCCTATGTCAACTTCTTACTACACAGACACAGTAACAATCTGATCTCTCTTTCTTTTCCCCACATTTCCCCCTTTTCTTTTCGACAAAACCGCCATCGTCATCATGGCCCGTTCTCGATGGTCACTGTCTCTTTGGAGCTGTTGGGTACACTTCCCAGATGGGGCGGCCTGGCAGAGGTGCTCCTCACCTCCCAGATGATGGGCGGCCAGGCAGAGGTGCTCCCCACCTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAA
Task1_train_27719
A sequence alteration has been identified in PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
CAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAAATATTTGAGATTTAAAATATGGCAAAAATGATGAAAGTGAAAAATAAGAAATGTAGTTACATTATGTTTTTTTCTTGGTTATAAATTAAACAATACTTTATTTTTTTAATTCATTTTTTTTTGGATATGGAAATATGTTAAAAGAAATTAACTGTCTTACTACTTCCATTTGCAAACTTCCTCTGAATACCTGAGTATGAATCACTAAACATTTTCTGAAATGGCCAAAGTAACATTATCCAGCCTATCAAAATTAAAAGTAATTTTTTTAATTTATTTTATTTTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACGTGCAGGTTTGTTATATATGTATACATGCGCCATGTTGGTGTCCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCATGTCATCTAAAACCCAGCCCACATTCATATTTCCCCAGTTGTCCCCAACCAAATTGTCCTTTTTTTTTTTTTTAATTGGGACAGAGTCTTACTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATGTCAGCTCACTGGAACCTCCCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTTAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATTACAGCCTCCCAAGTAGCCATCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCTTCCTAGGACACACCACGCCCGGCCCCCAAATTGTCCTTTATTGCGTTTTGTCACAAGTAGGATTTCATCCAGAACCATGATGCTTGTTATATTTCTTAAGTCTCTTAATCTCACTCAGACAATCCCCTTTTGATAATACCAACCAGATGAGGAATATAATGTGGTTTTAACCTGTATATGCCATGAAATAATCAGGTTACTTAATTTATTCAATTTTCTGTTCTGGAAGAAAACAACTTATTTTGATGTCTTTCTTTTAATTTGTATGAACACTATTTCATTGTAAAGTTTCAATATTGTAACTTCACTATATCCCTAGATGTGTTGAACTTGACTGCTGGGATGGAAAAGGTGAAGACCAAGAACCAATAATAACTCATGGAAAAGCAATGTGTACAGATATCCTTTTTAAGGTAACTTTAAAAATAATTACACAGACTTTTCCAAACTCTGTGAAAATGCAGGAAATAGGGAGATGGAGAAGAGAAAACAAATGATTCATTTTCTCAAGCATTATGCCTTCATATTCCCTTCTTCCAGTCTTGAGGAAAAAGTCAAGACAAAGATCTTTTCCACTGAACGTCCCCTTCATGATACTGTTCTTGCTTTCAAATGGTGACTGTGTTACATAACAAGGTTTCTCTGGCAGAGTTTACCTAGTTTTACTTACCTTAGAAACAGTGTCTCCTTTTGTTATCTACTTATTTGCTTATTTACTTTACATTATTCCTAAAGGACTTCAAGGTGGCATAAAAAGATAAATAGAATACAGGAATAAAATAGATTGTAAATAGGGCCTACAAGAATAAGAAAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCAGGGAGATCACCTGAGATCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTACACTGTTGCATTCTAGCCTGGACAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAATAAATAAATAAGTAAATAATAAGATAATGAGGTTAGACAAATCAAAAGAATGAAATTCTGTGGTTTGCAAATGTCAGCTGCAGCTGTCTGTCGGTTTGGTATAACTCAGGATAGATATTACAACACCAGGAGCAGCGGTTCTCAACTCCACCTACATGTGAAACATCACCATGGGTATTTTCAAAAACATAGGTGCTGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGTGGAGGCAGGTGGATCACTTGACGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGAGGCAGAGTCAGGAGAATTGCTTGAACACAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAAACCAGATCATGCCATTGCTCTCCAGCCTCAGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACACACATACACACACACGCAGATGTCTAGATGCTATGCATAGTATTTCTCTTAGCCAAGATATTGGAGAGTTTTGACCAGCAATGAATTCAAGATAATACTTCTTGATATGTACCAAGAGTATATTCAAGTGGGAAGCCATGAATTTGCATAGCCAGGAAGAATAACTAAATGACTACCTCAGCCACAAGGAATGCCTCAATAAAATATTTCAAGATTATCTAACCTTGGGCTTTATCATGTCAAATGGATTTGCCTAGATAACTATTGTGAAATATTTTTCTGATTAACTGAATGATGAGATTTGCCCTGTGATTAGCTACAAACCAGTAAGAATTTGGGGATTTTTACCAAATATGATGCTCCGGTTGTAGAAGTGCTGGTTTGAAGCCTTTCTTTCTAAAGCTAAGCAGAGACGGGGCCAACCATCTCTTAAAGCCTCTCCTATTTCATGGAGAATAGTGAAAGGGAAGATTATGTTTAGCTCCTTCAAATGTTGTTTTCTGTAATTAAGTTCTGTGTTACAGATGGGGGGTCAAGAACACTTCTATGTTTCACTTACATGTTGCTTGACCAACGAGAACCCCTTCCCCCGGCCTTGTAACCAGGCTAATAGGAAACAAGGGATACTGCAAATGTCACTTTAGTACACAGAGGTCTACATCAAGTTAATGAAGTATAGCCCAAGACTGATTTCCAAACACAGAGGAAAGTCAGTGAAAGCCTCCAGCAGTCCTGAGGTTACTACCCACACTTTTCTGCATGAGGTGGGGAGGAGTCATACAGTGGTCGGGAGTGAA
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Task1_train_27720
Assess the clinical impact of this variant on gene PLCB4 (phospholipase C beta 4), found on Chromosome 20. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
GGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAAATATTTGAGATTTAAAATATGGCAAAAATGATGAAAGTGAAAAATAAGAAATGTAGTTACATTATGTTTTTTTCTTGGTTATAAATTAAACAATACTTTATTTTTTTAATTCATTTTTTTTTGGATATGGAAATATGTTAAAAGAAATTAACTGTCTTACTACTTCCATTTGCAAACTTCCTCTGAATACCTGAGTATGAATCACTAAACATTTTCTGAAATGGCCAAAGTAACATTATCCAGCCTATCAAAATTAAAAGTAATTTTTTTAATTTATTTTATTTTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACGTGCAGGTTTGTTATATATGTATACATGCGCCATGTTGGTGTCCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCATGTCATCTAAAACCCAGCCCACATTCATATTTCCCCAGTTGTCCCCAACCAAATTGTCCTTTTTTTTTTTTTTAATTGGGACAGAGTCTTACTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATGTCAGCTCACTGGAACCTCCCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTTAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATTACAGCCTCCCAAGTAGCCATCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCTTCCTAGGACACACCACGCCCGGCCCCCAAATTGTCCTTTATTGCGTTTTGTCACAAGTAGGATTTCATCCAGAACCATGATGCTTGTTATATTTCTTAAGTCTCTTAATCTCACTCAGACAATCCCCTTTTGATAATACCAACCAGATGAGGAATATAATGTGGTTTTAACCTGTATATGCCATGAAATAATCAGGTTACTTAATTTATTCAATTTTCTGTTCTGGAAGAAAACAACTTATTTTGATGTCTTTCTTTTAATTTGTATGAACACTATTTCATTGTAAAGTTTCAATATTGTAACTTCACTATATCCCTAGATGTGTTGAACTTGACTGCTGGGATGGAAAAGGTGAAGACCAAGAACCAATAATAACTCATGGAAAAGCAATGTGTACAGATATCCTTTTTAAGGTAACTTTAAAAATAATTACACAGACTTTTCCAAACTCTGTGAAAATGCAGGAAATAGGGAGATGGAGAAGAGAAAACAAATGATTCATTTTCTCAAGCATTATGCCTTCATATTCCCTTCTTCCAGTCTTGAGGAAAAAGTCAAGACAAAGATCTTTTCCACTGAACGTCCCCTTCATGATACTGTTCTTGCTTTCAAATGGTGACTGTGTTACATAACAAGGTTTCTCTGGCAGAGTTTACCTAGTTTTACTTACCTTAGAAACAGTGTCTCCTTTTGTTATCTACTTATTTGCTTATTTACTTTACATTATTCCTAAAGGACTTCAAGGTGGCATAAAAAGATAAATAGAATACAGGAATAAAATAGATTGTAAATAGGGCCTACAAGAATAAGAAAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCAGGGAGATCACCTGAGATCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTACACTGTTGCATTCTAGCCTGGACAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAATAAATAAATAAGTAAATAATAAGATAATGAGGTTAGACAAATCAAAAGAATGAAATTCTGTGGTTTGCAAATGTCAGCTGCAGCTGTCTGTCGGTTTGGTATAACTCAGGATAGATATTACAACACCAGGAGCAGCGGTTCTCAACTCCACCTACATGTGAAACATCACCATGGGTATTTTCAAAAACATAGGTGCTGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGTGGAGGCAGGTGGATCACTTGACGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGAGGCAGAGTCAGGAGAATTGCTTGAACACAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAAACCAGATCATGCCATTGCTCTCCAGCCTCAGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACACACATACACACACACGCAGATGTCTAGATGCTATGCATAGTATTTCTCTTAGCCAAGATATTGGAGAGTTTTGACCAGCAATGAATTCAAGATAATACTTCTTGATATGTACCAAGAGTATATTCAAGTGGGAAGCCATGAATTTGCATAGCCAGGAAGAATAACTAAATGACTACCTCAGCCACAAGGAATGCCTCAATAAAATATTTCAAGATTATCTAACCTTGGGCTTTATCATGTCAAATGGATTTGCCTAGATAACTATTGTGAAATATTTTTCTGATTAACTGAATGATGAGATTTGCCCTGTGATTAGCTACAAACCAGTAAGAATTTGGGGATTTTTACCAAATATGATGCTCCGGTTGTAGAAGTGCTGGTTTGAAGCCTTTCTTTCTAAAGCTAAGCAGAGACGGGGCCAACCATCTCTTAAAGCCTCTCCTATTTCATGGAGAATAGTGAAAGGGAAGATTATGTTTAGCTCCTTCAAATGTTGTTTTCTGTAATTAAGTTCTGTGTTACAGATGGGGGGTCAAGAACACTTCTATGTTTCACTTACATGTTGCTTGACCAACGAGAACCCCTTCCCCCGGCCTTGTAACCAGGCTAATAGGAAACAAGGGATACTGCAAATGTCACTTTAGTACACAGAGGTCTACATCAAGTTAATGAAGTATAGCCCAAGACTGATTTCCAAACACAGAGGAAAGTCAGTGAAAGCCTCCAGCAGTCCTGAGGTTACTACCCACACTTTTCTGCATGAGGTGGGGAGGAGTCATACAGTGGTCGGGAGTGAAAACCT
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Task1_train_27721
A variant was discovered on Chromosome 20, affecting PLCB4 (phospholipase C beta 4). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
GGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGCGGCTGGGCAGAGGCGCTCCTCACTTCCCAGTCGTGGCGGCTGGGCAAAGGCGCTTCTCACATCCCAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAAAGGCTCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGGCAGAGGCGCTCCTCACATCCCAGATGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGATGGGGTGGTGGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCACCTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGCGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCGGCCGGGCAGAGGTGCTCCTCGCTTCCCAGACGGGGCAGCCGGGCAGAGGGGCTCCCCACATCCCAGACGATGGGCAGCCAGGCAGAGATGCTCCCCACTTCCTAGACGGGGTGGCGGCCGGGCAGAGGCTGTAATCTTAGCACTTCGGGAGGCCAAGGCAGGCGGCTGGAAGGTGGAGGTTGTGGCGAGCCGAGATCACGCCACTACACTCCAGCCTGGGCAACACTGAGCATTGAGTGAGCGAGACTCCGTCTGCAATCCCAGCACCCCGGGAGGCCGAGGCTGGCAGACCACTCGAGGTCAGGAGCCGGAGACCAGCCCCGTCAACAGGGCGATACCCCATCTCCTCCAAAAATAGAAAAACCAGTCAGGCGTGGTGGCGCACACCCGCAATCCCAGGCACTTGGCAGGCCGAGGCAGGAGAACCACGGAAGTCCGGGGCAGGGAGGCTGCAGCGAGCCGAGACCACGGCAGTATAGTCCAGCCTCGGCAACGGAGGGAGACCGAAGAAAGGAGGGAGGGGGAGGGGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGTAAATTAGCTTTATTTGATGTAAAAGTTCAAAAATTTAGTTCTCTGAGAGTAGAAATTATTAAAATCGTTTTTGTTTTATAGAAACTGGCAAATATTTGAGATTTAAAATATGGCAAAAATGATGAAAGTGAAAAATAAGAAATGTAGTTACATTATGTTTTTTTCTTGGTTATAAATTAAACAATACTTTATTTTTTTAATTCATTTTTTTTTGGATATGGAAATATGTTAAAAGAAATTAACTGTCTTACTACTTCCATTTGCAAACTTCCTCTGAATACCTGAGTATGAATCACTAAACATTTTCTGAAATGGCCAAAGTAACATTATCCAGCCTATCAAAATTAAAAGTAATTTTTTTAATTTATTTTATTTTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACGTGCAGGTTTGTTATATATGTATACATGCGCCATGTTGGTGTCCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAGCATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGTCCCATGTCATCTAAAACCCAGCCCACATTCATATTTCCCCAGTTGTCCCCAACCAAATTGTCCTTTTTTTTTTTTTTAATTGGGACAGAGTCTTACTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATGTCAGCTCACTGGAACCTCCCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTTAGCCTCCCAGGTAGCTGGGATTACAGCCTCCCAAGTAGCCATCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCTTCCTAGGACACACCACGCCCGGCCCCCAAATTGTCCTTTATTGCGTTTTGTCACAAGTAGGATTTCATCCAGAACCATGATGCTTGTTATATTTCTTAAGTCTCTTAATCTCACTCAGACAATCCCCTTTTGATAATACCAACCAGATGAGGAATATAATGTGGTTTTAACCTGTATATGCCATGAAATAATCAGGTTACTTAATTTATTCAATTTTCTGTTCTGGAAGAAAACAACTTATTTTGATGTCTTTCTTTTAATTTGTATGAACACTATTTCATTGTAAAGTTTCAATATTGTAACTTCACTATATCCCTAGATGTGTTGAACTTGACTGCTGGGATGGAAAAGGTGAAGACCAAGAACCAATAATAACTCATGGAAAAGCAATGTGTACAGATATCCTTTTTAAGGTAACTTTAAAAATAATTACACAGACTTTTCCAAACTCTGTGAAAATGCAGGAAATAGGGAGATGGAGAAGAGAAAACAAATGATTCATTTTCTCAAGCATTATGCCTTCATATTCCCTTCTTCCAGTCTTGAGGAAAAAGTCAAGACAAAGATCTTTTCCACTGAACGTCCCCTTCATGATACTGTTCTTGCTTTCAAATGGTGACTGTGTTACATAACAAGGTTTCTCTGGCAGAGTTTACCTAGTTTTACTTACCTTAGAAACAGTGTCTCCTTTTGTTATCTACTTATTTGCTTATTTACTTTACATTATTCCTAAAGGACTTCAAGGTGGCATAAAAAGATAAATAGAATACAGGAATAAAATAGATTGTAAATAGGGCCTACAAGAATAAGAAAGGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCAGGGAGATCACCTGAGATCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATGCAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTACACTGTTGCATTCTAGCCTGGACAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAATAAATAAATAAGTAAATAATAAGATAATGAGGTTAGACAAATCAAAAGAATGAAATTCTGTGGTTTGCAAATGTCAGCTGCAGCTGTCTGTCGGTTTGGTATAACTCAGGATAGATATTACAACACCAGGAGCAGCGGTTCTCAACTCCACCTACATGTGAAACATCACCATGGGTATTTTCAAAAACATAGGTGCTGCTGGGCGTGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGGTGGAGGCAGGTGGATCACTTGACGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGCTGAGGCAGAGTCAGGAGAATTGCTTGAACACAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAAACCAGATCATGCCATTGCTCTCCAGCCTCAGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAACACACATACACACACACGCAGATGTCTAGATGCTATGCATAGTATTTCTCTTAGCCAAGATATTGGAGAGTTTTGACCAGCAATGAATTCAAGATAATACTTCTTGATATGTACCAAGAGTATATTCAAGTGGGAAGCCATGAATTTGCATAGCCAGGAAGAATAACTAAATGACTACCTCAGCCACAAGGAATGCCTCAATAAAATATTTCAAGATTATCTAACCTTGGGCTTTATCATGTCAAATGGATTTGCCTAGATAACTATTGTGAAATATTTTTCTGATTAACTGAATGATGAGATTTGCCCTGTGATTAGCTACAAACCAGTAAGAATTTGGGGATTTTTACCAAATATGATGCTCCGGTTGTAGAAGTGCTGGTTTGAAGCCTTTCTTTCTAAAGCTAAGCAGAGACGGGGCCAACCATCTCTTAAAGCCTCTCCTATTTCATGGAGAATAGTGAAAGGGAAGATTATGTTTAGCTCCTTCAAATGTTGTTTTCTGTAATTAAGTTCTGTGTTACAGATGGGGGGTCAAGAACACTTCTATGTTTCACTTACATGTTGCTTGACCAACGAGAACCCCTTCCCCCGGCCTTGTAACCAGGCTAATAGGAAACAAGGGATACTGCAAATGTCACTTTAGTACACAGAGGTCTACATCAAGTTAATGAAGTATAGCCCAAGACTGATTTCCAAACACAGAGGAAAGTCAGTGAAAGCCTCCAGCAGTCCTGAGGTTACTACCCACACTTTTCTGCATGAGGTGGGGAGGAGTCATACAGTGGTCGGGAGTGAAAACCTC
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Here is a mutation in PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 1
ATTAGGTTACTTTTAAGATTAAGTGCTTTTTAAATACTATAAACCACGTATGTATGTTGCTTACATTCTAGAGTGCTACAGTGAAACATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCGCATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGA
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Task1_train_27723
Given a variant located on Chromosome 20 and affecting PLCB4 (phospholipase C beta 4), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 1
TTAGGTTACTTTTAAGATTAAGTGCTTTTTAAATACTATAAACCACGTATGTATGTTGCTTACATTCTAGAGTGCTACAGTGAAACATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCGCATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGAG
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Task1_train_27724
A variant on Chromosome 20 in gene PLCB4 (phospholipase C beta 4) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
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Task1_train_27725
A change on Chromosome 20 affects gene PLCB4 (phospholipase C beta 4). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
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Task1_train_27726
The following genetic variant occurs in PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome
TTAGGTTACTTTTAAGATTAAGTGCTTTTTAAATACTATAAACCACGTATGTATGTTGCTTACATTCTAGAGTGCTACAGTGAAACATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCGCATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGAG
TTAGGTTACTTTTAAGATTAAGTGCTTTTTAAATACTATAAACCACGTATGTATGTTGCTTACATTCTAGAGTGCTACAGTGAAACATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCACATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGAG
Task1_train_27727
Located on Chromosome 20, this mutation impacts PLCB4 (phospholipase C beta 4). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 2
TTAGGTTACTTTTAAGATTAAGTGCTTTTTAAATACTATAAACCACGTATGTATGTTGCTTACATTCTAGAGTGCTACAGTGAAACATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCGCATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGAG
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This variant impacts the gene PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 1
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Task1_train_27729
A sequence alteration has been identified in PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Ocular melanocytosis
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Task1_train_27730
Consider this mutation in PLCB4 (phospholipase C beta 4) on Chromosome 20. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Uveal melanoma
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Task1_train_27731
A genomic change on Chromosome 20 affects PLCB4 (phospholipase C beta 4). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Auriculocondylar syndrome 1
ATAGTCCCCAAAGAGGCAGCATCATTAGCACCTGGGAACTAGTTACAGCAATGACTGGCCTCACTGCAGACTCACTTCAACAGAAACTCTGAGTGTGGGGCCCAGGAATCTGTTCTAGTTTAAAAAGTCTTCCAGGTGATTCTGATGCACGCTAATGTTCGAGAGTCACTATTTTTGATGTTGTGCCTCAATTTGTAAAAATATGATGCTATATCTATTTCATAGCATTGCTGTGAGGTCCAATATAGTAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCTGGTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACCTCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAATTACAGGCTCACGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGGCATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTTGCCATGTTCGCCAAGTTTGTCTTGAACTCCTGGCCTCCCAAAGTGCTGGATTAAAGGCATGAGCCACCGTTCCCGGCCAGTAATTTCTTGAATAAAGTCCCTTAAAAATCTAAAAATGTCCTACAAATGTAAGATAAGCTTAATATTTTATGATTACCTCCTTTTGCATTATTCAGAGCTACAACAGACACTAACTTCTTAAAGTATCCTTTAGCATAATTGAGGAAGAAAAAGCCTTTACCTTTCAATTTGTGTGTGTGCAATTATCTTTATTAAGGAAATCTGCAGCACGTATCCGTGGGTCCTACTGAAGTCATCAACTTATATGTTTTCTTCCTTGTGCTTGTAGGGCCTGGTCACTGTAGAAGATGAGCAGGCGTGGATGGCATCTTATAAATATGTAGGTGCTACCACTAATATCCATCCATATTTGTCCACAATGATCAACTACGCCCAGCCTGTAAAGTTTCAAGGTTTCCATGTGGCAGAAGGTAACACCAAAGGTTAAATGCAGTCGCCTTTTTTGCTTGATTTTCTTTTATGGTGCTGATGAGCTTTTATCTAATTTGTTGCCATTTTTCTTTGTGGGCATGGGGGCTGTTCCACCTCACCTTATTTTTGTTTCACAGACCATAGAAGCCACCTTGGTATGTGGTGACATTACATTGTCATTCACGACTTCAACCACAAGGTGGCGATGAGAGACTATGGATTTGTTAGTGCTGGGCATGTAGCTTCTTCTGTTCCCAAGTGCATTCACAAGACTCCTTTTAATCAAAAGCTGGTTTTCAAAAAAACATAAGAAGTATTTAAAAACTTCATTTCTGGGCTAGAGAAGCCATCGTAATCATCATTATCATCAAAAATTCATATTTCGGTGGTGGCTGAAAAGACAGATGTCTCCATCCACAGGATGTCAATGAAAGTAGGAGCTACTGACATGATAATGTAGCATTAGCCTCCAAGGCCTCATGATTCAGGGTGTAATTGCATTTATTTATTGCTGTTTTTCGGTGAGGGTTTGATGGCAGAGTTCCTGAATCCATCTTTGCTTTTCTTTTACAGAACGCAATATTCATTATAACATGTCTTCTTTTAATGAATCAGTCGGTCTTGGCTACTTGAAGACACATGCAATTGAATTTGTCAAGTATCCTTATGTATCAAGTGGAATGAGTGGTTGACTCACGTTGGTTTGGCAAGAGCCTCTGAAATAGATAAATGGCTAATATCTCATTCTGGTGGTGGAGTTCATAAAATGATATGTGGGAAAGACCATGGCAGCTGTGACAATCTGCCCAAATGAAAATTGTTTTTATAATCCACACAGTGAACTGTGATCTTAAGCATCATTTGTAAATGTGAAATCTGCTCTGTGCTGTCTACTTGTTTGTCATTGTTGGCCTAGACCTTTGTTGTTTTAGCTCTTTGTTGTTTATTTTTCTCTGCTGTAGGACTCTTTTTTTCTGTTTTCCTTAATAAGTTACAGTTATAACAAACGGCAAATGAGTCGCATTTACCCCAAGGGAGGCCGAGTCGATTCCAGTAATTACATGCCTCAGATTTTCTGGAACGCTGGCTGCCAGATGGTTTCACTGAACTATCAAACCCCAGGTAGGAGCTGATGTCCAGTGACCCCAAATTCCATGAGAACACTTTGACAGGATGGTGCCAGCACTTCCCATCAGTTGGCTGTGGGCATTTTTTAAAGGAAGCAGACATATGGCAAAGCAATGTGTTATTGGATTTATATAATGGTGAGAAATAAAAAAAAAAAAACCAAAATAGAGCAAACAATGGTAGAAGATAATGTGTTGTGATTGGAATTTAATTCCTTTCATAAATGCCATGACTATTCCTGCTAACCATTATCCCATATTCCAAAATATTTCTCATTTTTCTTCCTTTTGGATCAAAGTTGTTATCTTTGTTTCCAGAGGCAGAATTAAGTGAAAAGAATTTGAGTATCTTTGTACAGTAACAGCGACTCATTTCTCCTTTGGCAAACACCCTGACCACTGTGAACATTCAGCAAATATGACTGATGCAGGGGCACTTCACTAAACAAATACAGAATATTTTGAAGTAAATGCCACTAAAATGGTATATAAGGAGTTACATATTTGAAGAGGTACTAATCTATAACTTGGTCCTCCAAAGTGTACTCAAAGTCAGGTTTCCAATATATAATGACTTTTTTTTTCTGGAAGGAAAAGAGTAAATTTTTATAATTGATAAACACATTTTTAAAATTTTTGAGGTTTGCTTAAGAGCCTAGGATCACAGTATCAAGACTAGAGGTAGCAAAATAGAAATAGAATAGATAGAAATATGCCACAAACCCTCTTCACTGTAGATGGTCAATTCTACAGCATGGTTCTTACAACTGGTAAAATAAAACAAAACCAGAAAGCTCTTTTTTCCTTCAACTCTTTGCTATTAAGAGAACTGCCCATGCTTCCCAATTTGAGGATTTTTTAAAATCTATTTTGTATTTTAAGAATCCCTGTCACTTCGTTCCCTGCTATGTGGATTGAGTGGAAGATCCTTTGACTTTCATTCCTTTGGCATGAGTGTGAGCTGACTGTGCTTCTCATGCCTTGAAGGAGCCTCCCCAGTGACCAGAAGCTCCTCCTACTGGAGTCACCATTCTGCATGGGGTCCCCACAGTGCTTGCTAGGTTAGACTGTGACGTGATAGCTACCAATACAATCCTGAGTGTTTCTAGCTGGGGCCCAGTAACAAGGCTCTGATGACTTCACTTACTTAAAAAAGCCCAACTTGTGTTCTCAGTTGTCAGTGAGTCCATAATATGGATTAAATGGCTAACCCAGCTTATGTTTTATTCTATAATATTAGGTTTAAACACAACATTTTGAAGAGGAAAAAATATCCATCAGTTTACCCATTTCTTTTGCGGATGGGAAGAAAGAAAAAATGTTATTCACTTGCAAGACAGAAGTCAAAAGCCATGTGCTGCCAGTGTAGACCCCACTAGAGTAATTCCCCCTGCCTCCCATCCTGGAAGCATGCCACCAAGTTTTATGCGATACTTACCTAGTTCATTTTCCAGTCTTTTAAATCAAGTTTCATATTCACCCTCCCGGGTATCTCCAGGGTTCCTCTGCCCAGGGATCCTGAGACCCATCCTCTCCCACTGTAGCAGGTTGGATATCTCTACTCTCAATACTCATCAAACAATGGTGTGACTCCTATATTGAATCCAGTTTTAAAAGTGACCTTTAGCATGATCTTTATGAAAACACATTTTATGTTTAATTTAAATGAAACATGAGGTCAATTCAACATGGAAGAGAGTATGCCTTAAATAGACCAAGCAGAACCTTGTAGTATTAAAGAGGGACCTGTGGGCCTAGGAGCAATCTGATACCTATTGTTTCAAATCACCCCGTCAGGGTCTTTTTTGTCTAGGAAGACAAGATGCTAAATTATTTTTGTCTCTTGACAGATTTAGCGATGCAATTGAATCAGGGAAAATTTGAGTATAATGGATCGTGCGGGTGAGTAATATGATTTAAACTGTTTTCACCTAGATTGAGAACTCCATACTACAGCTCTAATGAAGCCATGTCATTTTCAATTAGGGGCTACAGAATTTAAGCTGGGTTTGAGGGATGGAATAGAA
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Task1_train_27732
The gene SNAP25 (synaptosome associated protein 25), on Chromosome 20, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Early infantile epileptic encephalopathy with suppression bursts
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CTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCAGAAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACATGGTTTTACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTGGACCTCTGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCTAAGTGCTGGGATCACAGGCATGAGCCACCACACCCAGCTATATTTGCGGATTTTTTTTTTTAAGCCATCACTGTGCCTGTATTTATTCGGCAAAAGTTCTCCTGCACTACCTTATTATCTCCTCCAGGTATTCAATGCTGGATAAACAATGAAATTTTGTTTTCACCTGTCATTTCAAAAGCATAAGAGAAATAGCAGATTCCTCATGAACTGAATTCTGTTCTTTAGCCTCACGAAAGAAAACACAGTAGGCTTTTATTTTCCAAATTCACAGTCTGGCAGTTTGGGTCACTAGTGAATGTATCTTAGTTTTTTTGGAAGCACAATTTCCACTGTATAACTTAATGTGAAATTGTGTTTAAGTGATAATGTATGCCCTTAGGCTGGAAATGTACTTATCAGTTGTATTCTAGGCATGCCTTTATTCCAGGAGGCACAGGCATGCATGCATGAAAATACAGATGAAAAGAGGAATGGAAATGTAATTAGGTTTTGTAATTAGCCAGCGAAGACATCCATTGCTGCCTTCCTTTAATGGTCTTTTAAAGCTGTTTTAAAAATCCTTTCATTGAACTTGTAGTTATCTCAATTTGGTGATACAATTCAAAAAAATTAATCAAGTTGGTGTATGTAACCTTGGCAACCTAGAAGTATGATTCATTTTTATGACTATTGATCTATGTACTTAGATACACTAAGGTCAGCTATGCTGGCAGCAGTGACACCATATTGTCCTATGTTCCAATTCATAATCCTACTTCCAAAGAGACATTCATTCTCCCTGCTCTCTGCCTGGGCTTGGAGCATGACCCCCATTATAGACTTGGAAATCAGGGGGCAGAGAAGTGAAATGCCTTCCAAAACATTCATAGCAATTAAGTCATAGGATGATAGAGGAATTGCAATGTTCCAGGACTTACAATGTTGCTGTGTGGATGTTACTCTTTTTTTAAAAAACAGCTTTTACGAATTACATATGCACAATCAAGTGCAGACCATGGCTACCTCTGGCTAGACTGCCACTGCTAGGGGAAGAAAAGACATCCATACCCATTGCTTATGATTGCTGCTGCTGCTGTTGTCTCCAAAGAAGAAAATGGATTCTATTTTCTACCCTTATCTGGTTGAGGATGCTTAAAAACCAAAAGATGGAGATATTTTAAAGTTGAAGCAGATCCTTTCCTTAGTAGCGTTAAACTGGAATGCCTAAAACATAAACTAACACCCTGTTTTTTTTTCTCCTGGATTTCACTGGTGCCTGAGTAAGCGAATATGCTGTGCTGTTTTCCTGGACACTCAGAATCAAACAGGCCTTCCACCCCATCCCATCATGTTGAATTACAAAGTATTTTGAGCATCGTTTGGTTTGTTTCTTTCCACCCATACCTGTGTAGGGCAGCGGTAGCAGTCTTCAACAATGCATCCTCTTGGACAATGCATTGTAATATCTCTCTTTCAAATTCTGTTTCACATAGTCATTTCTCATGTTCTGTTGGAGACCCCCAAAAAATTCATTCCACACTGTCATCCCTTTGTCCTAACCAGAACAACTCGATCGTGTCGAAGAAGGCATGAACCATATCAACCAAGACATGAAGGAGGCTGAGAAAAATTTAAAAGATTTAGGGAAATGCTGTGGCCTTTTCATATGTCCTTGTAACAAGTAGGTACTGGGTACCAGCTCTAATCTGTGGCGTCCAGTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAATGTCAAAGTGAATGTCTGAAGTTTTGTCTTTTTTTCTTTGTCCTTTTCCATCTGCTTCATTCTGTGGGGATAAAATACTTGTGTTTAATCAGAACAACTGGAACGCATTGAGGAAGGGATGGACCAAAACAATAAGGACATGAAAGAAGCAGAAAAGAATTTGACGGACCTAGGAAAATTCTGCGGGCTTTGTGTGTGTCCCTGTAACAAGTAGGTGCTGCCTGCCTGCCTGAAGCTTTGATTTCCCAAGGCCCATCTCCAAGCCTTGACAAGCTCATTCCTGCCAAGCTCATAGGCAGGATGAGCATGTGGCATGCAGAACAGATCAATACCGTCTCCAATGCATTCATCTCATAGCATAGATGATATTAGCAGGAGTTACTGTTGATGCATTAAAAATCAGGCATACTACAGTGAAAGCTTCACTGTCAGCAACTTTTATTGATGAACGTTTCAACATTTTCCAGAAAGTGTACCTTGAGACAGAGGCTAGCCTCAAGAAAGAGGCACCCAGGGAACTTCCTTTTCCCCAACCCCAAGAGTCAAAATTACAGATTTAGAAAAGGCTGCGGGTAAGTTTGGAAGATGAGAAACACATATGCGAAGGTTTGATTTTTTCCAAAATAAAAGAGACAGGTAATTTGGCCCAGGGAAGGATTCTATAAATTAGAGAATATGACAGAGATTCTCCCTTTCTACTGCCCACCAGTTGCCAAATTTTGTCAATAGATGCTGCCACTGCACCCAACACAGAGGCAATGAGCTCTTCAGCAAGAAGTGCTCAAGCCTTACTCAAATTGGACCCATCCCTCCCAAATTTTTCTCCTTGGAAGATCTACCCGTACACTGGCTGAAATGTTGAAATGTGTAGATTTTGCATGCACAACATCACAAAACATTCAACTGTTCTCAAGGTTCTGCAACGCTTTTTTGGAATGTAGCAGAAATGTGACATGTGGTTATAAAGGTTTGCAATGGAAGGAACCTAAAACTGAGGGTTCTGGAAGATTGTCTCATTTGACTAGTGGTGGAAAAAGAAATGCATGAGTGGATTGCCCAACATGCATTTGGAAAATTAAACTCCTTATCCAATCTCCCTCACCCCTCCCACTTCCCCCTTCTAAAAGAAGACTTTTTCCTAAAAGCTCTCCTGATCCTAGCTTTTAGAATAGAAATTGACGTCATTTTTAGCAGATTATATGACCATTCACATCCTTTAAACTTTGAGGCTGATTTAAAATATCCCACTTCCTGTTTAGGAGGGGGAGGGGCTCATATTGCAAAAAAATTAAAAAATTCTGCTTTTTAAAGAGTGATCTACAGTAAAGCCTGATTAACTGGAATCTAGCTAACTGGAAACCTCAGCTGCATGCTCTTGCTCCCTTCCATTTTTAGCAAAAAAGAAACAAAGAAAAAAAATCACATCAGAAATGTAAAATGGTTTTTCTTCCAGGGTAGTTTGCATTGTCTCACTTAGTCTCCATCCTCCTGCAACTTCCACATCTATGAGGACCAAACAATAAGAGTTGATCTTCACAGAAAAGGCCATCAAGCAATCAGTATAAATGATAACCAAGGAAAGATTCAATCAGGTCTTCTACCTTAAGACTTTCAGGCAGGAAAGTGGCTCAGGAGTCTAGCAAAGATATTCACTCATCATCCATGAAACAAAACTTTCCTCCATGGCCCCACTGTTCATTAAGAAAGTCATATAATTCATCAGAAAAAAAAAAAAAAAGCCTCATTACCAAGCATTCCAGTTAGTCAAGATTTGACTGTATATTCCTTTCAGTGGCAACTTGCCCCCAGGTGAGATTTCCATCCATTTCATGATAAATTCCAACAGATACATTTTCCCCCCTTCATCAACTGTGTGTGAAGAAAGGGTGAAGGCAGGGTCCCCTGGGATGGATTCTGATGTTCTAATGAAATGATGGCTCCTACGAATTCCACTTTTGAGTGGTCACTAATTTCCTTAATGCACAAGAGACCCTAAACTAAGCTTCAAAGCTTGACTGAGGTGTTCCCTATTGTGTGTAAATAATGCTTTAAAAACCATGTGTCACAACGCAGTGGCTGGTGGTGCCCTGGACTCTCTGAGGGCTTCGCCCTGTCTCGGCATGTTTCAAGGGACGATGGTAGATGTACGGCAGTGATGTGAGTCTATGTGCAGCAT
Task1_train_27733
A variant was discovered on Chromosome 20, affecting SNAP25 (synaptosome associated protein 25). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
CTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCAGAAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACATGGTTTTACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTGGACCTCTGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCTAAGTGCTGGGATCACAGGCATGAGCCACCACACCCAGCTATATTTGCGGATTTTTTTTTTTAAGCCATCACTGTGCCTGTATTTATTCGGCAAAAGTTCTCCTGCACTACCTTATTATCTCCTCCAGGTATTCAATGCTGGATAAACAATGAAATTTTGTTTTCACCTGTCATTTCAAAAGCATAAGAGAAATAGCAGATTCCTCATGAACTGAATTCTGTTCTTTAGCCTCACGAAAGAAAACACAGTAGGCTTTTATTTTCCAAATTCACAGTCTGGCAGTTTGGGTCACTAGTGAATGTATCTTAGTTTTTTTGGAAGCACAATTTCCACTGTATAACTTAATGTGAAATTGTGTTTAAGTGATAATGTATGCCCTTAGGCTGGAAATGTACTTATCAGTTGTATTCTAGGCATGCCTTTATTCCAGGAGGCACAGGCATGCATGCATGAAAATACAGATGAAAAGAGGAATGGAAATGTAATTAGGTTTTGTAATTAGCCAGCGAAGACATCCATTGCTGCCTTCCTTTAATGGTCTTTTAAAGCTGTTTTAAAAATCCTTTCATTGAACTTGTAGTTATCTCAATTTGGTGATACAATTCAAAAAAATTAATCAAGTTGGTGTATGTAACCTTGGCAACCTAGAAGTATGATTCATTTTTATGACTATTGATCTATGTACTTAGATACACTAAGGTCAGCTATGCTGGCAGCAGTGACACCATATTGTCCTATGTTCCAATTCATAATCCTACTTCCAAAGAGACATTCATTCTCCCTGCTCTCTGCCTGGGCTTGGAGCATGACCCCCATTATAGACTTGGAAATCAGGGGGCAGAGAAGTGAAATGCCTTCCAAAACATTCATAGCAATTAAGTCATAGGATGATAGAGGAATTGCAATGTTCCAGGACTTACAATGTTGCTGTGTGGATGTTACTCTTTTTTTAAAAAACAGCTTTTACGAATTACATATGCACAATCAAGTGCAGACCATGGCTACCTCTGGCTAGACTGCCACTGCTAGGGGAAGAAAAGACATCCATACCCATTGCTTATGATTGCTGCTGCTGCTGTTGTCTCCAAAGAAGAAAATGGATTCTATTTTCTACCCTTATCTGGTTGAGGATGCTTAAAAACCAAAAGATGGAGATATTTTAAAGTTGAAGCAGATCCTTTCCTTAGTAGCGTTAAACTGGAATGCCTAAAACATAAACTAACACCCTGTTTTTTTTTCTCCTGGATTTCACTGGTGCCTGAGTAAGCGAATATGCTGTGCTGTTTTCCTGGACACTCAGAATCAAACAGGCCTTCCACCCCATCCCATCATGTTGAATTACAAAGTATTTTGAGCATCGTTTGGTTTGTTTCTTTCCACCCATACCTGTGTAGGGCAGCGGTAGCAGTCTTCAACAATGCATCCTCTTGGACAATGCATTGTAATATCTCTCTTTCAAATTCTGTTTCACATAGTCATTTCTCATGTTCTGTTGGAGACCCCCAAAAAATTCATTCCACACTGTCATCCCTTTGTCCTAACCAGAACAACTCGATCGTGTCGAAGAAGGCATGAACCATATCAACCAAGACATGAAGGAGGCTGAGAAAAATTTAAAAGATTTAGGGAAATGCTGTGGCCTTTTCATATGTCCTTGTAACAAGTAGGTACTGGGTACCAGCTCTAATCTGTGGCGTCCAGTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAATGTCAAAGTGAATGTCTGAAGTTTTGTCTTTTTTTCTTTGTCCTTTTCCATCTGCTTCATTCTGTGGGGATAAAATACTTGTGTTTAATCAGAACAACTGGAACGCATTGAGGAAGGGATGGACCAAATCAATAAGGACATGAAAGAAGCAGAAAAGAATTTGACGGACCTAGGAAAATTCTGCGGGCTTTGTGTGTGTCCCTGTAACAAGTAGGTGCTGCCTGCCTGCCTGAAGCTTTGATTTCCCAAGGCCCATCTCCAAGCCTTGACAAGCTCATTCCTGCCAAGCTCATAGGCAGGATGAGCATGTGGCATGCAGAACAGATCAATACCGTCTCCAATGCATTCATCTCATAGCATAGATGATATTAGCAGGAGTTACTGTTGATGCATTAAAAATCAGGCATACTACAGTGAAAGCTTCACTGTCAGCAACTTTTATTGATGAACGTTTCAACATTTTCCAGAAAGTGTACCTTGAGACAGAGGCTAGCCTCAAGAAAGAGGCACCCAGGGAACTTCCTTTTCCCCAACCCCAAGAGTCAAAATTACAGATTTAGAAAAGGCTGCGGGTAAGTTTGGAAGATGAGAAACACATATGCGAAGGTTTGATTTTTTCCAAAATAAAAGAGACAGGTAATTTGGCCCAGGGAAGGATTCTATAAATTAGAGAATATGACAGAGATTCTCCCTTTCTACTGCCCACCAGTTGCCAAATTTTGTCAATAGATGCTGCCACTGCACCCAACACAGAGGCAATGAGCTCTTCAGCAAGAAGTGCTCAAGCCTTACTCAAATTGGACCCATCCCTCCCAAATTTTTCTCCTTGGAAGATCTACCCGTACACTGGCTGAAATGTTGAAATGTGTAGATTTTGCATGCACAACATCACAAAACATTCAACTGTTCTCAAGGTTCTGCAACGCTTTTTTGGAATGTAGCAGAAATGTGACATGTGGTTATAAAGGTTTGCAATGGAAGGAACCTAAAACTGAGGGTTCTGGAAGATTGTCTCATTTGACTAGTGGTGGAAAAAGAAATGCATGAGTGGATTGCCCAACATGCATTTGGAAAATTAAACTCCTTATCCAATCTCCCTCACCCCTCCCACTTCCCCCTTCTAAAAGAAGACTTTTTCCTAAAAGCTCTCCTGATCCTAGCTTTTAGAATAGAAATTGACGTCATTTTTAGCAGATTATATGACCATTCACATCCTTTAAACTTTGAGGCTGATTTAAAATATCCCACTTCCTGTTTAGGAGGGGGAGGGGCTCATATTGCAAAAAAATTAAAAAATTCTGCTTTTTAAAGAGTGATCTACAGTAAAGCCTGATTAACTGGAATCTAGCTAACTGGAAACCTCAGCTGCATGCTCTTGCTCCCTTCCATTTTTAGCAAAAAAGAAACAAAGAAAAAAAATCACATCAGAAATGTAAAATGGTTTTTCTTCCAGGGTAGTTTGCATTGTCTCACTTAGTCTCCATCCTCCTGCAACTTCCACATCTATGAGGACCAAACAATAAGAGTTGATCTTCACAGAAAAGGCCATCAAGCAATCAGTATAAATGATAACCAAGGAAAGATTCAATCAGGTCTTCTACCTTAAGACTTTCAGGCAGGAAAGTGGCTCAGGAGTCTAGCAAAGATATTCACTCATCATCCATGAAACAAAACTTTCCTCCATGGCCCCACTGTTCATTAAGAAAGTCATATAATTCATCAGAAAAAAAAAAAAAAAGCCTCATTACCAAGCATTCCAGTTAGTCAAGATTTGACTGTATATTCCTTTCAGTGGCAACTTGCCCCCAGGTGAGATTTCCATCCATTTCATGATAAATTCCAACAGATACATTTTCCCCCCTTCATCAACTGTGTGTGAAGAAAGGGTGAAGGCAGGGTCCCCTGGGATGGATTCTGATGTTCTAATGAAATGATGGCTCCTACGAATTCCACTTTTGAGTGGTCACTAATTTCCTTAATGCACAAGAGACCCTAAACTAAGCTTCAAAGCTTGACTGAGGTGTTCCCTATTGTGTGTAAATAATGCTTTAAAAACCATGTGTCACAACGCAGTGGCTGGTGGTGCCCTGGACTCTCTGAGGGCTTCGCCCTGTCTCGGCATGTTTCAAGGGACGATGGTAGATGTACGGCAGTGATGTGAGTCTATGTGCAGCAT
CTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCATGCCACCACGCCCAGAAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACATGGTTTTACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCTGGACCTCTGGTGATCTGCCTGCCTTGGCCTCCCTAAGTGCTGGGATCACAGGCATGAGCCACCACACCCAGCTATATTTGCGGATTTTTTTTTTTAAGCCATCACTGTGCCTGTATTTATTCGGCAAAAGTTCTCCTGCACTACCTTATTATCTCCTCCAGGTATTCAATGCTGGATAAACAATGAAATTTTGTTTTCACCTGTCATTTCAAAAGCATAAGAGAAATAGCAGATTCCTCATGAACTGAATTCTGTTCTTTAGCCTCACGAAAGAAAACACAGTAGGCTTTTATTTTCCAAATTCACAGTCTGGCAGTTTGGGTCACTAGTGAATGTATCTTAGTTTTTTTGGAAGCACAATTTCCACTGTATAACTTAATGTGAAATTGTGTTTAAGTGATAATGTATGCCCTTAGGCTGGAAATGTACTTATCAGTTGTATTCTAGGCATGCCTTTATTCCAGGAGGCACAGGCATGCATGCATGAAAATACAGATGAAAAGAGGAATGGAAATGTAATTAGGTTTTGTAATTAGCCAGCGAAGACATCCATTGCTGCCTTCCTTTAATGGTCTTTTAAAGCTGTTTTAAAAATCCTTTCATTGAACTTGTAGTTATCTCAATTTGGTGATACAATTCAAAAAAATTAATCAAGTTGGTGTATGTAACCTTGGCAACCTAGAAGTATGATTCATTTTTATGACTATTGATCTATGTACTTAGATACACTAAGGTCAGCTATGCTGGCAGCAGTGACACCATATTGTCCTATGTTCCAATTCATAATCCTACTTCCAAAGAGACATTCATTCTCCCTGCTCTCTGCCTGGGCTTGGAGCATGACCCCCATTATAGACTTGGAAATCAGGGGGCAGAGAAGTGAAATGCCTTCCAAAACATTCATAGCAATTAAGTCATAGGATGATAGAGGAATTGCAATGTTCCAGGACTTACAATGTTGCTGTGTGGATGTTACTCTTTTTTTAAAAAACAGCTTTTACGAATTACATATGCACAATCAAGTGCAGACCATGGCTACCTCTGGCTAGACTGCCACTGCTAGGGGAAGAAAAGACATCCATACCCATTGCTTATGATTGCTGCTGCTGCTGTTGTCTCCAAAGAAGAAAATGGATTCTATTTTCTACCCTTATCTGGTTGAGGATGCTTAAAAACCAAAAGATGGAGATATTTTAAAGTTGAAGCAGATCCTTTCCTTAGTAGCGTTAAACTGGAATGCCTAAAACATAAACTAACACCCTGTTTTTTTTTCTCCTGGATTTCACTGGTGCCTGAGTAAGCGAATATGCTGTGCTGTTTTCCTGGACACTCAGAATCAAACAGGCCTTCCACCCCATCCCATCATGTTGAATTACAAAGTATTTTGAGCATCGTTTGGTTTGTTTCTTTCCACCCATACCTGTGTAGGGCAGCGGTAGCAGTCTTCAACAATGCATCCTCTTGGACAATGCATTGTAATATCTCTCTTTCAAATTCTGTTTCACATAGTCATTTCTCATGTTCTGTTGGAGACCCCCAAAAAATTCATTCCACACTGTCATCCCTTTGTCCTAACCAGAACAACTCGATCGTGTCGAAGAAGGCATGAACCATATCAACCAAGACATGAAGGAGGCTGAGAAAAATTTAAAAGATTTAGGGAAATGCTGTGGCCTTTTCATATGTCCTTGTAACAAGTAGGTACTGGGTACCAGCTCTAATCTGTGGCGTCCAGTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAATGTCAAAGTGAATGTCTGAAGTTTTGTCTTTTTTTCTTTGTCCTTTTCCATCTGCTTCATTCTGTGGGGATAAAATACTTGTGTTTAATCAGAACAACTGGAACGCATTGAGGAAGGGATGGACCAAAACAATAAGGACATGAAAGAAGCAGAAAAGAATTTGACGGACCTAGGAAAATTCTGCGGGCTTTGTGTGTGTCCCTGTAACAAGTAGGTGCTGCCTGCCTGCCTGAAGCTTTGATTTCCCAAGGCCCATCTCCAAGCCTTGACAAGCTCATTCCTGCCAAGCTCATAGGCAGGATGAGCATGTGGCATGCAGAACAGATCAATACCGTCTCCAATGCATTCATCTCATAGCATAGATGATATTAGCAGGAGTTACTGTTGATGCATTAAAAATCAGGCATACTACAGTGAAAGCTTCACTGTCAGCAACTTTTATTGATGAACGTTTCAACATTTTCCAGAAAGTGTACCTTGAGACAGAGGCTAGCCTCAAGAAAGAGGCACCCAGGGAACTTCCTTTTCCCCAACCCCAAGAGTCAAAATTACAGATTTAGAAAAGGCTGCGGGTAAGTTTGGAAGATGAGAAACACATATGCGAAGGTTTGATTTTTTCCAAAATAAAAGAGACAGGTAATTTGGCCCAGGGAAGGATTCTATAAATTAGAGAATATGACAGAGATTCTCCCTTTCTACTGCCCACCAGTTGCCAAATTTTGTCAATAGATGCTGCCACTGCACCCAACACAGAGGCAATGAGCTCTTCAGCAAGAAGTGCTCAAGCCTTACTCAAATTGGACCCATCCCTCCCAAATTTTTCTCCTTGGAAGATCTACCCGTACACTGGCTGAAATGTTGAAATGTGTAGATTTTGCATGCACAACATCACAAAACATTCAACTGTTCTCAAGGTTCTGCAACGCTTTTTTGGAATGTAGCAGAAATGTGACATGTGGTTATAAAGGTTTGCAATGGAAGGAACCTAAAACTGAGGGTTCTGGAAGATTGTCTCATTTGACTAGTGGTGGAAAAAGAAATGCATGAGTGGATTGCCCAACATGCATTTGGAAAATTAAACTCCTTATCCAATCTCCCTCACCCCTCCCACTTCCCCCTTCTAAAAGAAGACTTTTTCCTAAAAGCTCTCCTGATCCTAGCTTTTAGAATAGAAATTGACGTCATTTTTAGCAGATTATATGACCATTCACATCCTTTAAACTTTGAGGCTGATTTAAAATATCCCACTTCCTGTTTAGGAGGGGGAGGGGCTCATATTGCAAAAAAATTAAAAAATTCTGCTTTTTAAAGAGTGATCTACAGTAAAGCCTGATTAACTGGAATCTAGCTAACTGGAAACCTCAGCTGCATGCTCTTGCTCCCTTCCATTTTTAGCAAAAAAGAAACAAAGAAAAAAAATCACATCAGAAATGTAAAATGGTTTTTCTTCCAGGGTAGTTTGCATTGTCTCACTTAGTCTCCATCCTCCTGCAACTTCCACATCTATGAGGACCAAACAATAAGAGTTGATCTTCACAGAAAAGGCCATCAAGCAATCAGTATAAATGATAACCAAGGAAAGATTCAATCAGGTCTTCTACCTTAAGACTTTCAGGCAGGAAAGTGGCTCAGGAGTCTAGCAAAGATATTCACTCATCATCCATGAAACAAAACTTTCCTCCATGGCCCCACTGTTCATTAAGAAAGTCATATAATTCATCAGAAAAAAAAAAAAAAAGCCTCATTACCAAGCATTCCAGTTAGTCAAGATTTGACTGTATATTCCTTTCAGTGGCAACTTGCCCCCAGGTGAGATTTCCATCCATTTCATGATAAATTCCAACAGATACATTTTCCCCCCTTCATCAACTGTGTGTGAAGAAAGGGTGAAGGCAGGGTCCCCTGGGATGGATTCTGATGTTCTAATGAAATGATGGCTCCTACGAATTCCACTTTTGAGTGGTCACTAATTTCCTTAATGCACAAGAGACCCTAAACTAAGCTTCAAAGCTTGACTGAGGTGTTCCCTATTGTGTGTAAATAATGCTTTAAAAACCATGTGTCACAACGCAGTGGCTGGTGGTGCCCTGGACTCTCTGAGGGCTTCGCCCTGTCTCGGCATGTTTCAAGGGACGATGGTAGATGTACGGCAGTGATGTGAGTCTATGTGCAGCAT
Task1_train_27734
This sequence variant lies in SNAP25 (synaptosome associated protein 25) on Chromosome 20. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Developmental and epileptic encephalopathy, 2
AGTGTGGACTCTGACTCCAGGTTGCTAGCATTCAGACTCTGGTTTCTCCATTTATTAGTACTAAGACTTCAGACAAATTCCCCAGATCGTTTCTGACTGCTTTTCTCATTTGGAAAAGTGAGCTAATAATAGTACACACTTTATAGTTGATATTGTTAATCTTGATGTTGTCAAAGTTTAATGAGTGGAACAAAGTACAGTTGACCCTTGAACAACATGGAGATTTAGGGTGTCAACCCCCATGCAGCTGAAAATTTTTTGACTCCCCCAAAATTTAACTACTAGTAGCCTACTGTTGACTGGAAGCCTTAATGACATAAAAAGTCCATTAACATCTATGTTTTATGTATTATTTACTGTATTCGTATGATAAAGTAAGCTGGAGAAAAGAAAATGTTATTAAGAAAATCATAAGGAAGATAAAATACATTTATAATACTATGCTGTATTTATTGATACCATCAGTTTATATCATTTGTTTACAAGATGAATCATCAGTCTGAAATCTTCAGTACACATTAAGCAATTCAACTTTTTCTTGAAATGTCGTGACTTTTTTTTGCTTTTTGGGAGCACTGCTAGCATCACTGGTGGCACTTTGTATGGGTGCATGATGTTATTCAAGGTTTACAGTATTGCACTAAACATGATTTTTTTTAAATGTGAAACTGCAAGAGATCACTTTTTACTGCACTATGCAATTTACTGGAGAGATGGTGAGGATGATTAGTATCACAGAGCATTTTAAACGGATGCTCACAACACTTGAGTTCACCACAATAATAGGAGGTGGCTATGAAATTATTAGAGTAGTACAGTATGGACTACAGTTAATTTTATACAATTATGATTTAATACTTCACCTTTACATTTCTCTCAACTGCAAATAGGCCCATGTATGGTCTATATTTGTTTAAGTCTCATCAATTTTAACTTTTCATAGTAGATTTATATGTATTTTATGATAGTAAATAATAGACTAGACTAGTATCTACATATATTTTATCCATTCATGACATGCCTAATTTTTTCTAAATTTTCTCAATATTTCTAAGTAACACATTCATCTGCAAGTTTGTCTTAATTGTTGCAAATCTCCAAAGCATTTTCCAGTGTATTTATTGAAAAAAAATCCTGGCCAGGTACAATGGCACATGCCTGTAATCTCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGAGGGAGGACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGATCTCATCTATACAAAAAATAGAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCATGCACCTGTGGTCTTAGCTATTTAGGAGGCTGAGATGGGAGGCTCAGTTGAGCCCAGGCAGTCAAGGGTGCAATGAGCTATGATCACACCGCTGTTCCCCAGCCTGGGCATCAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAGGAAGAAAGAAATTCACACAAAAGTGGATCCACACCATTCAAACCCATGATGTCCAAGGGTCCACTGTACATGCTCATGCTCATTAGCAATATTTTTTATCATCCAGGTTGGAGAAGAGAAAGCTGAGCCCCCAAGATGTAATTTGTTCAAAGGGACACTGCTAATAAATTAGCCATGGTTTCAATCCTACAGTATAAGAAGTGTAATTCAACTTGGTCCAACAGATGTGAATGCCTACCACAGAAGTCATTGAGTGTCTTTCTAGGATAGAAAGATAAATCATATATAAGCCTACGCTCTCTGGTAGGGAAAATTATTAAAAATGAAAATTAAAAAAGCAATGATTCTGAAAAAATATATTCGTTCATTAAAAAAAAAAAATGAAAATTAAGCTTCTACGGTCACATTCAAATAGAGCCATAGCCGTCATTCTGGGAAGACAAAAGAAAGGATGGCCCATGCTGACCAAGGAGGTTTTAAGTGGTTTCACCCAAGAGGAAGCATTGGACCCGGACCCAGAAGGGTGAATGGATTTTTAAGGGGTAACCTGAGTTCTGTTTCTTTTCCCCCTTTTCTAGGCTGATTCCAACAAAACCAGAATTGATGAGGCCAACCAACGTGCAACAAAGATGCTGGGAAGTGGTTAAGTGTGCCCACCCGTGTTCTCCTCCAAATGCTGTCGGGCAAGATAGCTCCTTCATGCTTTTCTCATGGTATTATCTAGTAGGTCTGCACACATAACACACATCAGTCCACCCCCATTGTGAATGTTGTCCTGTGTCATCTGTCAGCTTCCCAACAATACTTTGTGTCTTTTGTTCTCTCTTGGTCTCTTTCTTTCCAAAGGTTGTACATAGTGGTCATTTGGTGGCTCTAACTCCTTGAGGTCTTGAGTTTCATTTTTCATTTTCTCTCCTCGGTGGCATTTGCTGAATAACAACAATTTAGGAATGCTCAATGTGCTGTTGATTCTTTCAATCCACAGTATTGTTCTTGTAAAACTGTGACATTCCACAGAGTTACTGCCACGGTCCTTTGAGTGTCAGGCTCTGAATCTCTCAAAATGTGCCGTCTTTGGTTCCTCATGGCTGTTATCTGTCTTTATGATTTCATGATTAGACAATGTGGAATTACATAACAGGCATTGCACTAAAAGTGATGTGATTTATGCATTTATGCATGAGAACTAAATAGATTTTTAGATTCCTACTTAAACAAAAACTTTCCATGACAGTAGCATACTGATGAGACAACACACACACACACAAAACAACAGCAACAACAACAGAACAACAACAAAGCATGCTCAGTATTGAGACACTGTCAAGATTAAGTTATACCAGCAAAAGTGCAGTAGTGTCACTTTTTTCCTGTCAATATATAGAGACTTCTAAATCATAATCATCCTTTTTTAAAAAAAAGAATTTTAAAAAAGATGGATTTGACACACTCACCATTTAATCATTTCCAGCAAAATATATGTTTGGCTGAAATTATGTCAAATGGATGTAATATAGGGTTTGTTTGCTGCTTTTGATGGCTATGTTTTGGAGAGAGCAATCTTGCTGTGAAACAGTGTGGATGTAAATTTTATAAGGCTGACTCTTACTAACCACCATTTCCCCTGTGGTTTGTTATCAGTACAATTCTTTGTTGCTTAATCTAGAGCTATGCACACCAAATTGCTGAGATGTTTAGTAGCTGATAAAGAAACCTTTTAAAAAAATAATATAAATGAATGAAATATAAACTGTGAGATAAATATCATTATAGCATGTAATATTAAATTCCTCCTGTCTCCTCTGTCAGTTTGTGAAGTGATTGACATTTTGTAGCTAGTTTAAAATTATTAAAAATTATAGACTCCAGATGATCTGCTTTAATTTCTTCATGGACTCGTCTGATTTTGCACTCACACGAGAAGAGAAAGCCTGGCTACCCTATCCCAGCTACTAAAAGCCAGTTCTGTGCACCGAGGACAGTGTGGGGGAAAATAGAAGATTTAAGCATGATTCCAGTGGCAACTGACAACTTGGCTTGATTCTCATAACCTGCTCCAGAATTACTTTGTGAATTCAGTGTTGACTAAGGGAGAAAATGTAGTTATCCAGAACACATAGAAAGAAAAATTTATAGGAAAAAAATCTATGGTACCCAGGCATGGCCCTACATAGATTCAGGTATATCTGGTGTCTGTCAACTCCAATCTTCCTTCCTTTCCACAAAATCCCCACCATCTAAAATTGAGGGCTTCACTACCACACCACCACTGACTCCATGTTTTTTTAAACAGCTTTACTGACTCACTATAAAATTCATCCATTTAAATATATAATTAATTTCTTTTGTATATTCACTGAGGTAGCAATCTAATTTTAGAACATCTTTATCACTGCCGCCAAAATACCCCATACCTATTAGCAATCACTCCCATCTCACTTCTCCCAGCCCTAGGGAATTACTGGTTTACTAGTTATCTCTATAGATTTGCCTATACATTTCATATAAATGGCATCATACAATGTGTGGTCTTCGGGAACTGGCTTCTTTCACTTAATATAATGTTTTCAAGGTTCCTCCATGTTGTATCACAGATCAGTACTTCATTCTTTTTTAAGGCCAAATAATATTCTATTGTATGCATAGATACTATTTTGTTTATCCATGTA
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Task1_train_27735
A sequence alteration has been identified in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; BARDET-BIEDL SYNDROME 2/6, DIGENIC
AAAGTTTCACTTTTGCATTACAACATCAGCTCAAAGTTCAGAATCTCATAATTGGAATCAAGTCAGGGTGATATCATAACTGGAATCACCCCAGGCTTCCTCAGGAGGTAGTTCTTTAAGTACAGTTCCTGGAACACAGTTGCTTTCCATCTGTAGACCCATGAAACTAGAGAAAAGTTATCTGCCTTCTACTCACAGCATAAAATTATGGATAAGGCATAACCATAACCATCACCATAACATTCTGTCCACAAAGCTGGGAAATGGGAGACATAAAGGAGTCACTAAGTCTAGCCCATGCTCAAGGGGAGGAAATTATGCAAGGTCTGAAACTAGGAGGTGGGGCCACCTTAGAGGCTGCCTACCACACTGCCCTTCTATTTGATTGTAATAATAAAAGGAGTAAAACTTTTGATAAATATTTTATGAGACTTCAGGTGGGGCTGATACCTAACATATATGGATGGCATTGCTGCTTGTATTGCTAGTTTTTTCCTTTGGCTCAGAGTAAAAATTCTTTTTGATTACAAGAATATCAGAGGAAATTGTTTAACAATTCTATTTCTCTTTATCATGGCTATAGATCTGATCATTGACTATTAGGTTGGTTTGTTTCCCAAAAATTTCCAAAATATTTTCCTAAAGTTTAATACAACATTTGTTATAGCTCCATGCTTATTCATGTGGCTGCCTTCTATATTTCTTCTTCAATTTATCAATACATCTTATATTTGCATAAAATTCAAACTACATCCCTTGGTGAAACATAATGTCTCTACTTTGAACATGGGAGATTTTCTACTTTCTTTTTCATACTATTGACTAGAGAAATAACTTCCCCTTCCCTTTATGCTGCTTTCTGAAGTCCTGCTAGAATACTCCTTATTGTCCTTCCTTTTTCTATCAGTCTATGGTTCTCAACCAACAACAGTTTTGCTCTTCGGGGGACATTTGGCAATGTCTGGAAACATTTTTGGTTGTCACAACAGGAGGGTGCTACTGGCATCTAGTGTGCAGAGGCCAGGGATGCTGCTCAGTAAGCTGTAATGCACAGGGCAGCCTCCGTACAACAAAGAATTATGGGGCTCAGAATGTCAATAATGCCAAAGTTGAGAAACCCCAGTGTAAAACAAACCAGTCCTTCTTCCCACTTTAAAAATGAAGACATTACAATGTTGCTTTAGCCTTGGTTACTATATAAATCTACTTTTTCCCCCCAAAAGCAAACATTTCCCCAAAATAACAAAAATGTGGAGTTGTGATATAAACTACAAATTGCAGGCAAACCAGGTTCTACTCAATTACCTAACCACTGAAGAATATAGCTTGAGATAAAGGGCATGGAGAAAAGTGAAATTTTACTAAATGTGCAGTTTGAATACTTCTTTTGATTGAGCAATATATACTGAATGTTTTGTGACACTTTGAGATCTAGTTTTATACTTTAAGCATATGTAATTACTGCTAACTGGAAAATATCTAAAATATGTATATCCAAACTAGAGCATGGATTAGGAGTCTTTTTTATTTGTTTGCTCTCAAAATGATGCCAACATAACAAAAATTTAGAACAATGTACAGCAGCCAGTATAGAATCCCTAAGATAACTATAATATTTTTAAATAAATAATGCTTCATATTTTTATTGTTTCATGGCATTTCCATTCACGAATCACCTTTTTTCCTAAATAAGTGTATCTATAATTTTATGAGTCATTTGTCCAAATATGTAGAACAGGGCTTTGGGAGAAAACAAATACACTCACAATTTTTCTCAATTGCCAACAGACTAGTTTATTTGTTTCTCTTGTAATACGAACATGCTATTCTCTTAGTTTTTATCTTCAATAACATATGAAAGATCCAAAATCAAATTGGCTGTCTCTACAGCCACCTGTAGGCCACTAAGCTTTGCAGTCAAACAGTCCAAGGTCAGGTTGCTGGCTGAGCCCACAGCTTCATGTGGAAGGCAGCTTTGTGGCACAAATGGACGACGTGTGCTTCTTAAGAAAGACCAGTTGAGTTCTTCCTGGCTATTGTATAATCCACAGCCACACTGTGAAAGCAAATCTGGCCAGTTAGCAACACAGGGAGAATCTGCCTGAACTGACCAAAGGTGTCCATACTTCATGTCAGTGAGAATTTCACCTCCATCATGTTCTAAAGAGCCAACAACAGATTCTAGGGCACTGCAAAATGCTTCAGCAATTAATTGAAGTTCTGTTTGAGTACATTCATCATCTTTGAGAATGCTTTCTGGGTCGTTGTGAGTCTAAAGAGTAATAAAAACATTGAAAACACATACAAAGCAATTAATATAAAATGTTTCAGAAAAATAAGATACTGAAATCAAAATCTTATTCCTAAAGTAATTACTTACTTTCATTTAATTTGGGGTCTGGCACAATGCTAACGGGCTTGTATGGGTCAGCCGGCCGGGTTGCAAACCCTTAACTAGGTTGGTTATAGTAAAAATGTATTAAAAATGTATATACTACCAGTCATGTTACCAGAATGAGTGAATCAGAATAACCCCACCATCAGCTTATTCTGAATGAGGCTTGGTAGTGCCTCCTTAATACATGAAGGACTAGGCATAATACATGTATTACAGGTTTTTCTGCACACAGGAGGAAGTTCCTGAAGACTGATGTCCCAAATGGAGTACTTATTTATCTCTGCAAAATGTTTGAGATTTGCTTAAAATGGGAATGCACATATTTTTATTTGGAAATCATGATGTAAATTTTCATATCAATGTTTTAAAAATGAATATTCTTCTCTTTAAATTAATGAAAAGGTAATAAGACCTTAAACAGTCTTCTGGTTCCACTATTTAAAAATGTTTATCCTAGAAATTCCATGATAAAAAGAAAAATTAATATATAGCCATGCACCACATACCAACACTTCAGTCAATGATAGACTGCATATACAACAGTGGTCCCATAAGATTATAAGGCCATATTTTTACTAACCTTTTCTGTGTGTTGATATGTTTAGATACATAAATACCATTGTGTTACAATTACCTACAGTATTCAGTACAGTAATATGCTGTAAGGGTTTGTAGCCTAGGAGCAATAGGCTATACCACATAGCTTAGGAGTGTGGTAGGCTCTACCATGTAGGTTTGTGCAAGTACACTCTATATTGTTTGCACAACAATATTGTCTAATGATGCATTTCTCAGAATATATCTTTGTTAAGCAACATGTCTGTATTAGCAAACTAATAACTGAATGATGGGTTAAAAAATCCATATCTTAACTGCTTAAAAACAGTGACTACTTTCCTACTCAAGACACCTCCTTCCTCTAAAAAACTTTCTCTAGTTTATCAATTCCATTTCAGAATACATTATTGTCCATTCAGCACCAATAGATTGGCACAAATTTTGTTTTCCATAATGTATATTCTGATAACTTTTCATGAATGTGCTTTATCTTCAAAGAGATTCTAAGTTATTTGGGGAAGGACAGGGCATGTTTACCCAATGAATCGATTGCTAATATCTGGAAAACACCTATACCTTTTTCTATCCATTTTCAAATAAAGTAGGCCAGTACTTATGAAATAATCAGAACAACAATGCACTAAACTTATCTGAGAGCTGTCAGGAAATGGAGTTTCCTAGACCAATCAAAAAATTCTATTTAGTATAATTAATAAATAACATACATAAATACCAATTTTAAAATTATAATAGAATCTAATATGTGAATTGCTTAAATAAATGAAACTTTTCTTGATGCTCTAGAAGATACTGAAGTATTCTGTAGAAACTTGGCCCTTTTGTTTGTGAACATCAATTATTACTGTATTGCAGCAGTTGAGATCTCTAAGAGAACTCCCAATAACAGAATGCTAGCTTCAACATGCAGAACATGTAGACAATACTCAAAGAACGTGATCGCTTGCTTAAATATTTTTATAATAATCATTGTAATAAGGATATTACCTTATATTTACCTTGTTATTTCCCTCAAGTGTTTTTGATTATCTACTTTATTTAGACTACTGAAAAATTCAGTGTTAAAGGCTACAAGTTTACCTGTATAACAAACCTATACATGCACCCCTGAACCTAAAAGTT
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Consider this mutation in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
ACCTTGTGATCCGCTCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCCCAGCCCTTTCTGTTTTTTTAGATGTAGTCCTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTTGGCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCC
ACCTTGTGATCCGCTCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCCCAGCCCTTTCTGTTTTTTTAGATGTAGTCCTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTTGGCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATAATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCC
Task1_train_27737
Here is a variant affecting MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; McKusick-Kaufman syndrome
ACCTTGTGATCCGCTCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCCCAGCCCTTTCTGTTTTTTTAGATGTAGTCCTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTTGGCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCC
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A sequence alteration has been identified in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome 6
ACCTTGTGATCCGCTCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCCCAGCCCTTTCTGTTTTTTTAGATGTAGTCCTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTTGGCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCC
ACCTTGTGATCCGCTCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCCCAGCCCTTTCTGTTTTTTTAGATGTAGTCCTGCTTTGTTGCCCAGGCTGGACTTGAACTCCTTGGCTCAAGTAATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATAATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCC
Task1_train_27739
This is a variant in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), located on Chromosome 20. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; McKusick-Kaufman syndrome
AATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTG
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Task1_train_27740
This mutation is located in gene MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; MKKS-related disorder
AATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTG
AATCCTCCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGAGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTG
Task1_train_27741
A mutation in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), located on Chromosome 20, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
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Task1_train_27742
A variant found in Chromosome 20 affects MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome 6
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCACAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
Task1_train_27743
Here’s a variant in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) located on Chromosome 20. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; McKusick-Kaufman syndrome
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCACAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
Task1_train_27744
The gene MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), on Chromosome 20, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome 6
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCACAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
Task1_train_27745
A variant affecting Chromosome 20, within the gene MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; McKusick-Kaufman syndrome
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCACAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
Task1_train_27746
A mutation in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), located on Chromosome 20, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
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Task1_train_27747
Gene MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein), found on Chromosome 20, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Retinal dystrophy
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
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A mutation found in MKKS (MKKS centrosomal shuttling protein) on Chromosome 20 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Bardet-Biedl syndrome
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCATAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
CCTGCCTCAACTTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCATGTACCACACCCAGCTAAAGTGTCCCATATTTTAAAAATGAGTCTGGAAGACCCAGTATTCACAAACTGGAAATTGCCAGATTCATGCAAAGCTAGTAGATATTTAAGGCTATCAGTCTGACTTACCATACCAACAACGAGTTCCAAGGAATTATTTCCATTATTAAGAAACTCTACTTTTGACAGTCATTTGAGTCTTACCAAGGTAGGGCAATAACCCAGAGATATTATGTATTCAACACTTGGCATACATATGGCTCCTTTTTGATAATTTATACTAAGACTTTTATTAAATAAACTTTAACAATGGTTTAAGTCTAGTAACTTAAAAATTGGAAACAATGCAGACTAAATGATCATCTTTCTGATAGATTGTCAAAGCAGTTAAAGGATACTGAAAAGTAGCTCACATCAGGAACTCTTCAGCTTGTCATTTTTCTTTGGCTCTAACAGTACTTATATCTGCTTTTAATTTGCTGAGTTTGTAAAATACAGTGAATTTTTTGCCTATTTTAGTTCTGTATATTACCAAATATATTTCGGTCAATTCAACAAACACTTTAGAACACCCACAGTGGGCCAGGCCTGTAATAGGTGCTGAAAGTAAAAGATGATCTTGGTTCTCAAGGTCAGGTGGGAACAGTTTTGATATAGGTAAAACATAGGTGCATGTACATCCCCCTCCCATTAGAAACAACTACTTAAGGAGAAGTACAGAAGTTTGCTGGAATTATGACAAAGTGAAGAAAAAGGGTCATTCTAGTTACAAAATTACTTTCTAAATATAACATGATTTAAAAGTTTTGTCAATTGAGGCTGAAGAATTTTGTGTAAAGTATGAAAGACCTTAGGATTATGGGGATGTTAGACTTCTCAATAACCTGTAAAATATTTGGGGGTTAGATGATATAGTACATTAGGGGGCTGAAAATACATAGAAAATGGCTATAATCACTGCATTTTTAGTATGTGAACAATACAGGATCTTTTCCAGAAACCTTTGCTGCCAGAAATGATACTGACACATGCTGGGTCAATTTTTCAAGATGTTAACAGTGACACAAACCAAAAATATCTCTGCTCAAAAAAGTGTGATTTATTAACTGTAAGAGGCAAAAGCAAAGAGTGATTTTTACCTGTCATTTTAGTCAGGGGTTCCATCAGAGTCACTCCAATTCTGTCTATGGCAATAATACGATGCATATTGAGAAACTGCTTCAAAGATGGATGTATAACTTTTTGGCACAGGACAAGATCTACGTGGTCACTGATTAGCTGCCTTCCTAGGTTAAGCAGCTGGTCCAAGACTGCATTTTCAAGAGAAACCCCATAACTGACCACCACAGTTCCTTCTCCAGTGTCAGAAGTGTCTCCGGATAAAGTTGTACAAAAGAGTGCCACCTTGAGGGCAGTTGATTTTTTGATAGGTAATAGCCTCATTAATTGAACTTCTGACATTTCAATGAGTATCCCAGGTAATACAGTGGAATCTATAACTCTTTGACCTTTTAAAGGTACAATTAAACTCTTTCCTAAAATGATGTGGCCTTCAGCATTTTCTGGAATTGTAAGCAAAAAGGCTCTCAGGATCAAAGCACTGACATGCTCTGTTTCCTTTCTGGTGAGCATACAGGCAGGTTTACTTGTTAATATACTACGCACCAAACAAAGGAGGATCTGAGTACTACTAAAGTCCACTGGGATTCGACAACCACAGGTCTCAGACTTGAGATAACTGATGCAAAGACTCAAAAGATGTTTATTTAATCTAATGACAGTGGTGGGTGTCAAGCCTAATCTCTGAACATTTTCAATCAGGTTGCAGCAAAGAATAGCTGTGAATAAGCCACAATCACTGAAGCTTGACACATGATTCTGTATGGAGGCTGTCAGGATCTTTAAAATGGGATGTGTGACCAAAAGGTGACTGAGCAGAGCTGAGGACTGTGAGGTTGTACACACGTAACCTCCAAAGCCATTGTGCAGCTGCTTCAGCCTACCTGAGGGGCCACAGCATGATGTTACAATTCTTTTCAAGACAGAAAGTGTGGTCCTGACTCTCTCAGTTGTCAGTGGTTCACTCTTACACAATGATGGCTTCTTAGCTTCCAAACGAGACATCTTACTTCAGGTGGTAACTAGTGAAGACCGTTTTTATTTTGTAAACCACATTTTTCTATTTATTGCATTATCACGTTTTAACATTAAAAATTATTCTTTAGGAATTAAAGTATGAATATGCAGCATTGTGGCTATAAAATCAAAAAGTTCAATGTTTATGAAGCTAATCAGCATAGAATGATTTAATGACAAATTAGTAATTCCAAATATTTATTTTACTTCACTCTTCAATACTCTTTTGTTTGCTTTGAGACTGAAATTTTACAGACTGCTTTGCAGACCTCTGCAAAAAGTATGTTCCAAGATGGACACCTATGAAAGATATCCCAGCTACAAGAAGCCAGTTCTTTCTAATCCAACTGGTATTTTTCATCTCTTCTTTCGATATGAAGCTCAGATTCAAAGCTGCTTCTTTACCTAATAAATAATAAAAAAAACATTTTAGAGAAATACTTCCCAAGCAGTTTGTAGACTGCAGTTTAATAATTTATTCTAATGCTCTGCTGCCTTTTTAGAAAAAGGAACTACTAACTGGCACAAACGTCCAGAAAATGAGAAAGGTAGACCAACTTTGACTTAAAATTCCTTTATTCTTCAATAAATCCCCTCTACAAGAAAAAGTGCTTGTATTTCAGTGATTCTGTAAGGCACAACAACATGGCTAGAAAGCTTACAGCACAGTTATTTGAATATGGCATGCTTCTAGGAGAGAAATGCTACGATATAAAACAGAGAATTAGGTCTCTGAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATCTTGGCTCACCACAACCTCAGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCACCCTCCTCAGTGGCAGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTTGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCCATCTCTGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACTGTGCCCGGCAAGTCTCTGAGTCTTAAAAGAAGTCCCAAATATCTTTATTCTCCAACATGAAGATTTAATATTATGTTTTTATCTATAATTGTGGTTTGCTTGGAAACTTTAGGTTTGAACAGAAGTGCATTTATATCAAGTCATGTTTGTAAATAATTATAAAAACAAGATAGCTGTTGGCATGTCTACTGCAGGAACTCACTAATGTATAGTCTATATTTAGCTGAATAATTCTGCACAACACATTGTACCAAAAAACAAACCATGTTTTAAACACCTGGCTAAAGTCAGAGCTAATTTTCTATCATTTTACGTTATCAATCAATGATTTTCAGTTTTGGAAATCCTAGTCAACGAATCCTCCCCAAAGCACTGGTTAATGACAGTACATGCAAAAACCAAGGGATATGCTGGATAACAACAACAATAAAAATAGGATCTGAGTTGCAATTCAATTTCAAAGTCTAAATACCATAAAATGTTATATATCAAAAGGACATGTAGAAATACAATTCTAGTTTCCTTAACAAGGTAGTGTCCTTGCTAAAAAAAAGTGTGCCTTGAGGCATAAATTCCTGACACATTAATAATAATGTGTGAAAAGAATAAAAACGTTAGATCATAGATCTTATCTGTTGAGGCCGGGTGTTTTAAAGGTATATTATTCGTTAGTATTTCCAGGAATATGCTGAGTATGGTAGTGTCCAGGAGAGCATTTAGCATAAATGAAACAAATCTATTTAGCCTAAAGTACTTCCTAAAAGTAGGCTACAGCATAGTATGGTGATCAGACCAAAACCTTGATTTGAAGATGTGCAAAGAGGTGGGCAGAACAAGGGAATGTTATGCAAATGTTATTTTGGTTACCATTCCCAATTTAGCTAAAGGGCTGTAACCA
Task1_train_27749
The gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; not provided
ATTTCTCCAGGGCCTGATCAGACCCAGCACAGACAAGCCTCTGGAAGCCACAGTCGTCCTCCCTTCCGTTTGTATTAGCTTTATCCTATACCAGTGTAGCTGTGGTTAACATCTGCTTGCCCATAATTTCATGTTAGTCATGGGGAAATGCACATACTTTCTTCAGGACCCCACTGTAGATTAATCATCAGATTCTGTGACTGGCACTCTCTCCCCAAGAACAAGGAGGGCTACACCACCCAGGGAACTACCAGCAGGTACCTGGGAGGATCCAGCCTGGCATATCTTAATCCCAGCTGGAGGAGAGAGATCCTTTGCTCTATGAGAGCTACTTAAAGGGAATGGTGGCTTTGTTTTTAAAGATGAAAGTCTTGGGGTGAGGCATGGAATGAAGCGGTAAAGCCATTGGGAAAACCAGACGGAGACAGTCCTTACTTATTCTGCAGTCGGGCCCAGCAAAACCCGGGGCACATTCGCACCGGTACCAGTTGTCTCCATCCACACAGGTGCCGCTGTTGTAACTAAGAAAGCAAAGACCACCTTGGTTACCAACCTCCCAGTCCATTACTCTGGCTGCCAATCACTCACATGTCACCACACCAGTTACAGTCAGTGGCTCTCACCCCATGGCCGTTGCCTGGGGAATTTTAAAAGAATACTGATGCCTGGGTCCCACCCCCAGAAAGTCTAATTTCACAGGTCTTGGTTGCAGCCCAGGCAGCGGGATTTTTAAAAGCTCCCAGGTGATTCTGGTGTGCAGCCAAGGTTGAAAAATCACTGCTCTAAATGAGGACACAACCTGGCTAATTAAAGTGTGGTCCATGGGGCAGCAGGATCGCTTCACCTGGGAGCTTGTTAGAAAAGCAGTCTGAGGCCCCACCCCAGACCTCCTGACTCAGAACTTGCATTTTAAACACAATCCCTGGGTGATTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATAGTGGATGAGTGCTGGCTTAAAAGGATGTCACACTTACCAGGGATGAGGGCTGCAGTCATTGGTATCTGCAAAGAAAAGACAACTTAATAGTGAGGACTTCAACAGGGAAAGCGGTCTTAGCCCTAAGTAAAACCACCACTTATTTTCCTAATACCCAAATGATAAAGTCGTAGTTAACACCAGCAAAATACCTTTGCTAAATTGGAACCAGGCCCGCACCACACTTAGTTTCATTTGCTGTGGGACACATGTACACAGGAAGAGGCCCTGGTAGGGGATAGGGGTGGGGGTGAGAATGGAAGGAGACAGGCTGCTGGTCAGACCCAGAGCTGGGAACTGAGACGCCATCTGTCTCCACTTATCTTATTGGCGACTTTCTCATGCCCAGGTCAGGGCTGTATCCCATCAAGTCATTAATGCAGACCCAGGTGATACAAAAGCAGACATCAAACAGCTCTGCTTCTGGTTTCCATTGCAAGTCCCCAAGGGTGTCAGGATCTGCTCCGACAGCCCTGGGAGAGTTCAAGGGGGGAGGACACTCACTCTGAGCACAGATGGGCCCCTCCCAGCCTTCCTTGCAGACGCACGTAAAGGACTCGCCGTTGACCACACATGTGCCCCCATTATGGCAGGGGTTGGGCAGGCAGCTACTGTTTCGGGCTATAAAAGAAGAGCAGACACGACCACCCTCCCTGAGTATCCAGAAACAGTCTGGAGGGGCAAGAACCAGGCCCAGAGAAATATCATAAGCTCCAGGGGCCAACCAGCAGACACGCCCAGGTGGCCATGCCCACTGCAGATCCCACGTGGGGCATAAAGTTACCTATGTTACAGGTTGTTCCTTCCCAGCCGCCAGGACACATGCACTTAAAAGCATCCCCCTCATCATAGCAGGTGCCACCGTTGTTGCACGTGGCCTCATCACACTGACTGTCACCTGGAGGAAAATATTTCAGTGTGAGTCCCAGTGGCCCCCTCCCACAGAAGACAGAGGGAAGGGTCCCAGAGATAGCATCCAAGGCCAACTACCACTTACGTGAGTGGCAGGTCTTTCCTTTCCACCCATTTTTACAGTCACAGTAGAAGTCATTGACCAGGTCGCGACACGTGCCCCCATTGTGGCAGGGGTTCTGGCTGCAGTCATTAATATCTAGAATCAAAGGGGAGACAATCGGCTGAAGACGAGATCCAGGACCATTCACGACAGGCGAGAGCCAAGCCTTTCCTACTGCTTACATCCAACATCCTATTCTGAGAACAGCCACAGTCGTAGTACTTTAACACAATCAGGCTTTTCCAGGAATAAAGGAGCTCCCAACTGGGTTACTTTGAATGCCACAAGTTAGGCAAGATGTGGGGTGGGCCTCTGGAAGTCCCATGGAAATGAAAGTAGAAATATGACTTTCCTTGCAAGCAGGAATATTTATTACACAGTCTAATTCTATAGGTCCTCAGCAGAAGCTCCTCCCCATAAGCTATCATCAGGACTCATAAATGCAAATGAGACACAAGTGATACTGTCCCAGTGCAGAAATCACTGCGGTCTTGCTTCCAGAGATTTCCAGTACAAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGA
ATTTCTCCAGGGCCTGATCAGACCCAGCACAGACAAGCCTCTGGAAGCCACAGTCGTCCTCCCTTCCGTTTGTATTAGCTTTATCCTATACCAGTGTAGCTGTGGTTAACATCTGCTTGCCCATAATTTCATGTTAGTCATGGGGAAATGCACATACTTTCTTCAGGACCCCACTGTAGATTAATCATCAGATTCTGTGACTGGCACTCTCTCCCCAAGAACAAGGAGGGCTACACCACCCAGGGAACTACCAGCAGGTACCTGGGAGGATCCAGCCTGGCATATCTTAATCCCAGCTGGAGGAGAGAGATCCTTTGCTCTATGAGAGCTACTTAAAGGGAATGGTGGCTTTGTTTTTAAAGATGAAAGTCTTGGGGTGAGGCATGGAATGAAGCGGTAAAGCCATTGGGAAAACCAGACGGAGACAGTCCTTACTTATTCTGCAGTCGGGCCCAGCAAAACCCGGGGCACATTCGCACCGGTACCAGTTGTCTCCATCCACACAGGTGCCGCTGTTGTAACTAAGAAAGCAAAGACCACCTTGGTTACCAACCTCCCAGTCCATTACTCTGGCTGCCAATCACTCACATGTCACCACACCAGTTACAGTCAGTGGCTCTCACCCCATGGCCGTTGCCTGGGGAATTTTAAAAGAATACTGATGCCTGGGTCCCACCCCCAGAAAGTCTAATTTCACAGGTCTTGGTTGCAGCCCAGGCAGCGGGATTTTTAAAAGCTCCCAGGTGATTCTGGTGTGCAGCCAAGGTTGAAAAATCACTGCTCTAAATGAGGACACAACCTGGCTAATTAAAGTGTGGTCCATGGGGCAGCAGGATCGCTTCACCTGGGAGCTTGTTAGAAAAGCAGTCTGAGGCCCCACCCCAGACCTCCTGACTCAGAACTTGCATTTTAAACACAATCCCTGGGTGATTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATAGTGGATGAGTGCTGGCTTAAAAGGATGTCACACTTACCAGGGATGAGGGCTGCAGTCATTGGTATCTGCAAAGAAAAGACAACTTAATAGTGAGGACTTCAACAGGGAAAGCGGTCTTAGCCCTAAGTAAAACCACCACTTATTTTCCTAATACCCAAATGATAAAGTCGTAGTTAACACCAGCAAAATACCTTTGCTAAATTGGAACCAGGCCCGCACCACACTTAGTTTCATTTGCTGTGGGACACATGTACACAGGAAGAGGCCCTGGTAGGGGATAGGGGTGGGGGTGAGAATGGAAGGAGACAGGCTGCTGGTCAGACCCAGAGCTGGGAACTGAGACGCCATCTGTCTCCACTTATCTTATTGGCGACTTTCTCATGCCCAGGTCAGGGCTGTATCCCATCAAGTCATTAATGCAGACCCAGGTGATACAAAAGCAGACATCAAACAGCTCTGCTTCTGGTTTCCATTGCAAGTCCCCAAGGGTGTCAGGATCTGCTCCGACAGCCCTGGGAGAGTTCAAGGGGGGAGGACACTCACTCTGAGCACAGATGGGCCCCTCCCAGCCTTCCTTGCAGACGCACGTAAAGGACTCGCCGTTGACCACACATGTGCCCCCATTATGGCAGGGGTTGGGCAGGCAGCTACTGTTTCGGGCTATAAAAGAAGAGCAGACACGACCACCCTCCCTGAGTATCCAGAAACAGTCTGGAGGGGCAAGAACCAGGCCCAGAGAAATATCATAAGCTCCAGGGGCCAACCAGCAGACACGCCCAGGTGGCCATGCCCACTGCAGATCCCACGTGGGGCATAAAGTTACCTATGTTACAGGTTGTTCCTTCCCAGCCGCCAGGACACATGCACTTAAAAGCATCCCCCTCATCATAGCAGGTGCCACCGTTGTTGCACGTGGCCTCATCACACTGACTGTCACCTGGAGGAAAATATTTCAGTGTGAGTCCCAGTGGCCCCCTCCCACAGAAGACAGAGGGAAGGGTCCCAGAGATAGCATCCAAGGCCAACTACCACTTACGTGAGTGGCAGGTCTTTCCTTTCCACCCATTTTTATAGTCACAGTAGAAGTCATTGACCAGGTCGCGACACGTGCCCCCATTGTGGCAGGGGTTCTGGCTGCAGTCATTAATATCTAGAATCAAAGGGGAGACAATCGGCTGAAGACGAGATCCAGGACCATTCACGACAGGCGAGAGCCAAGCCTTTCCTACTGCTTACATCCAACATCCTATTCTGAGAACAGCCACAGTCGTAGTACTTTAACACAATCAGGCTTTTCCAGGAATAAAGGAGCTCCCAACTGGGTTACTTTGAATGCCACAAGTTAGGCAAGATGTGGGGTGGGCCTCTGGAAGTCCCATGGAAATGAAAGTAGAAATATGACTTTCCTTGCAAGCAGGAATATTTATTACACAGTCTAATTCTATAGGTCCTCAGCAGAAGCTCCTCCCCATAAGCTATCATCAGGACTCATAAATGCAAATGAGACACAAGTGATACTGTCCCAGTGCAGAAATCACTGCGGTCTTGCTTCCAGAGATTTCCAGTACAAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGA
Task1_train_27750
Here’s a variant in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) located on Chromosome 20. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, Type 2HH
CGTTGCCTGGGGAATTTTAAAAGAATACTGATGCCTGGGTCCCACCCCCAGAAAGTCTAATTTCACAGGTCTTGGTTGCAGCCCAGGCAGCGGGATTTTTAAAAGCTCCCAGGTGATTCTGGTGTGCAGCCAAGGTTGAAAAATCACTGCTCTAAATGAGGACACAACCTGGCTAATTAAAGTGTGGTCCATGGGGCAGCAGGATCGCTTCACCTGGGAGCTTGTTAGAAAAGCAGTCTGAGGCCCCACCCCAGACCTCCTGACTCAGAACTTGCATTTTAAACACAATCCCTGGGTGATTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATAGTGGATGAGTGCTGGCTTAAAAGGATGTCACACTTACCAGGGATGAGGGCTGCAGTCATTGGTATCTGCAAAGAAAAGACAACTTAATAGTGAGGACTTCAACAGGGAAAGCGGTCTTAGCCCTAAGTAAAACCACCACTTATTTTCCTAATACCCAAATGATAAAGTCGTAGTTAACACCAGCAAAATACCTTTGCTAAATTGGAACCAGGCCCGCACCACACTTAGTTTCATTTGCTGTGGGACACATGTACACAGGAAGAGGCCCTGGTAGGGGATAGGGGTGGGGGTGAGAATGGAAGGAGACAGGCTGCTGGTCAGACCCAGAGCTGGGAACTGAGACGCCATCTGTCTCCACTTATCTTATTGGCGACTTTCTCATGCCCAGGTCAGGGCTGTATCCCATCAAGTCATTAATGCAGACCCAGGTGATACAAAAGCAGACATCAAACAGCTCTGCTTCTGGTTTCCATTGCAAGTCCCCAAGGGTGTCAGGATCTGCTCCGACAGCCCTGGGAGAGTTCAAGGGGGGAGGACACTCACTCTGAGCACAGATGGGCCCCTCCCAGCCTTCCTTGCAGACGCACGTAAAGGACTCGCCGTTGACCACACATGTGCCCCCATTATGGCAGGGGTTGGGCAGGCAGCTACTGTTTCGGGCTATAAAAGAAGAGCAGACACGACCACCCTCCCTGAGTATCCAGAAACAGTCTGGAGGGGCAAGAACCAGGCCCAGAGAAATATCATAAGCTCCAGGGGCCAACCAGCAGACACGCCCAGGTGGCCATGCCCACTGCAGATCCCACGTGGGGCATAAAGTTACCTATGTTACAGGTTGTTCCTTCCCAGCCGCCAGGACACATGCACTTAAAAGCATCCCCCTCATCATAGCAGGTGCCACCGTTGTTGCACGTGGCCTCATCACACTGACTGTCACCTGGAGGAAAATATTTCAGTGTGAGTCCCAGTGGCCCCCTCCCACAGAAGACAGAGGGAAGGGTCCCAGAGATAGCATCCAAGGCCAACTACCACTTACGTGAGTGGCAGGTCTTTCCTTTCCACCCATTTTTACAGTCACAGTAGAAGTCATTGACCAGGTCGCGACACGTGCCCCCATTGTGGCAGGGGTTCTGGCTGCAGTCATTAATATCTAGAATCAAAGGGGAGACAATCGGCTGAAGACGAGATCCAGGACCATTCACGACAGGCGAGAGCCAAGCCTTTCCTACTGCTTACATCCAACATCCTATTCTGAGAACAGCCACAGTCGTAGTACTTTAACACAATCAGGCTTTTCCAGGAATAAAGGAGCTCCCAACTGGGTTACTTTGAATGCCACAAGTTAGGCAAGATGTGGGGTGGGCCTCTGGAAGTCCCATGGAAATGAAAGTAGAAATATGACTTTCCTTGCAAGCAGGAATATTTATTACACAGTCTAATTCTATAGGTCCTCAGCAGAAGCTCCTCCCCATAAGCTATCATCAGGACTCATAAATGCAAATGAGACACAAGTGATACTGTCCCAGTGCAGAAATCACTGCGGTCTTGCTTCCAGAGATTTCCAGTACAAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACCTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCA
CGTTGCCTGGGGAATTTTAAAAGAATACTGATGCCTGGGTCCCACCCCCAGAAAGTCTAATTTCACAGGTCTTGGTTGCAGCCCAGGCAGCGGGATTTTTAAAAGCTCCCAGGTGATTCTGGTGTGCAGCCAAGGTTGAAAAATCACTGCTCTAAATGAGGACACAACCTGGCTAATTAAAGTGTGGTCCATGGGGCAGCAGGATCGCTTCACCTGGGAGCTTGTTAGAAAAGCAGTCTGAGGCCCCACCCCAGACCTCCTGACTCAGAACTTGCATTTTAAACACAATCCCTGGGTGATTCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGATAGTGGATGAGTGCTGGCTTAAAAGGATGTCACACTTACCAGGGATGAGGGCTGCAGTCATTGGTATCTGCAAAGAAAAGACAACTTAATAGTGAGGACTTCAACAGGGAAAGCGGTCTTAGCCCTAAGTAAAACCACCACTTATTTTCCTAATACCCAAATGATAAAGTCGTAGTTAACACCAGCAAAATACCTTTGCTAAATTGGAACCAGGCCCGCACCACACTTAGTTTCATTTGCTGTGGGACACATGTACACAGGAAGAGGCCCTGGTAGGGGATAGGGGTGGGGGTGAGAATGGAAGGAGACAGGCTGCTGGTCAGACCCAGAGCTGGGAACTGAGACGCCATCTGTCTCCACTTATCTTATTGGCGACTTTCTCATGCCCAGGTCAGGGCTGTATCCCATCAAGTCATTAATGCAGACCCAGGTGATACAAAAGCAGACATCAAACAGCTCTGCTTCTGGTTTCCATTGCAAGTCCCCAAGGGTGTCAGGATCTGCTCCGACAGCCCTGGGAGAGTTCAAGGGGGGAGGACACTCACTCTGAGCACAGATGGGCCCCTCCCAGCCTTCCTTGCAGACGCACGTAAAGGACTCGCCGTTGACCACACATGTGCCCCCATTATGGCAGGGGTTGGGCAGGCAGCTACTGTTTCGGGCTATAAAAGAAGAGCAGACACGACCACCCTCCCTGAGTATCCAGAAACAGTCTGGAGGGGCAAGAACCAGGCCCAGAGAAATATCATAAGCTCCAGGGGCCAACCAGCAGACACGCCCAGGTGGCCATGCCCACTGCAGATCCCACGTGGGGCATAAAGTTACCTATGTTACAGGTTGTTCCTTCCCAGCCGCCAGGACACATGCACTTAAAAGCATCCCCCTCATCATAGCAGGTGCCACCGTTGTTGCACGTGGCCTCATCACACTGACTGTCACCTGGAGGAAAATATTTCAGTGTGAGTCCCAGTGGCCCCCTCCCACAGAAGACAGAGGGAAGGGTCCCAGAGATAGCATCCAAGGCCAACTACCACTTACGTGAGTGGCAGGTCTTTCCTTTCCACCCATTTTTACAGTCACAGTAGAAGTCATTGACCAGGTCGCGACACGTGCCCCCATTGTGGCAGGGGTTCTGGCTGCAGTCATTAATATCTAGAATCAAAGGGGAGACAATCGGCTGAAGACGAGATCCAGGACCATTCACGACAGGCGAGAGCCAAGCCTTTCCTACTGCTTACATCCAACATCCTATTCTGAGAACAGCCACAGTCGTAGTACTTTAACACAATCAGGCTTTTCCAGGAATAAAGGAGCTCCCAACTGGGTTACTTTGAATGCCACAAGTTAGGCAAGATGTGGGGTGGGCCTCTGGAAGTCCCATGGAAATGAAAGTAGAAATATGACTTTCCTTGCAAGCAGGAATATTTATTACACAGTCTAATTCTATAGGTCCTCAGCAGAAGCTCCTCCCCATAAGCTATCATCAGGACTCATAAATGCAAATGAGACACAAGTGATACTGTCCCAGTGCAGAAATCACTGCGGTCTTGCTTCCAGAGATTTCCAGTACAAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGGGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACCTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCA
Task1_train_27751
A variant was discovered on Chromosome 20, affecting JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, Type 2HH
ACCAGGCCCAGAGAAATATCATAAGCTCCAGGGGCCAACCAGCAGACACGCCCAGGTGGCCATGCCCACTGCAGATCCCACGTGGGGCATAAAGTTACCTATGTTACAGGTTGTTCCTTCCCAGCCGCCAGGACACATGCACTTAAAAGCATCCCCCTCATCATAGCAGGTGCCACCGTTGTTGCACGTGGCCTCATCACACTGACTGTCACCTGGAGGAAAATATTTCAGTGTGAGTCCCAGTGGCCCCCTCCCACAGAAGACAGAGGGAAGGGTCCCAGAGATAGCATCCAAGGCCAACTACCACTTACGTGAGTGGCAGGTCTTTCCTTTCCACCCATTTTTACAGTCACAGTAGAAGTCATTGACCAGGTCGCGACACGTGCCCCCATTGTGGCAGGGGTTCTGGCTGCAGTCATTAATATCTAGAATCAAAGGGGAGACAATCGGCTGAAGACGAGATCCAGGACCATTCACGACAGGCGAGAGCCAAGCCTTTCCTACTGCTTACATCCAACATCCTATTCTGAGAACAGCCACAGTCGTAGTACTTTAACACAATCAGGCTTTTCCAGGAATAAAGGAGCTCCCAACTGGGTTACTTTGAATGCCACAAGTTAGGCAAGATGTGGGGTGGGCCTCTGGAAGTCCCATGGAAATGAAAGTAGAAATATGACTTTCCTTGCAAGCAGGAATATTTATTACACAGTCTAATTCTATAGGTCCTCAGCAGAAGCTCCTCCCCATAAGCTATCATCAGGACTCATAAATGCAAATGAGACACAAGTGATACTGTCCCAGTGCAGAAATCACTGCGGTCTTGCTTCCAGAGATTTCCAGTACAAAGAAAGTTTTCCCACGTTGAAGTGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACCTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCACCGTTCTGGCAGGGATTAGGCTCACAATAATCGATGTCCAGCTGCAAATATCAGGAACAGCGAAAAGGGGGAGGGATCAGAGTAAAACAAAGGTGTCACGATAACTTCTCTGGGGCAGCAGGCACTGGAATCTGACAGTTCCTTCGGTTTCTATTAGGAGACACCCTGTAAGATACATCTCTATGCTGTAGGGACTGCCAATGTCCAGTATTTGAAACAACGGGGCAGAGTGGGAGAGGGAGCACAAGAGGGGGTGGAGGGAACCAAAAAGAACACAAAGACGAAGACACTAAGAAGAAAATAATTCGTCAGTATCTCCTTCCACCAGCATTTGTCTAGCAGAGACTCTCTCATCAATAGGATGTTAATAGATGTTAGGAAATTCCAGACACAAGAGCTGAGGGAAAAGTAAAGGGAAGCGGAGGAGGCAGCGGCTCTGCTCTAAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTGCCACCACTCACCTGACAGAGGTTTCCAGAGAAACCAGTGGGACACAGACACTGGAATCTGTTGATTTCATTCTGACAGTGACCCCCATTCAAACAGGGGTTGCTGGCACATTCATCGATGTCTCTCTCACAGTGATCGCCTGCATAGCCAGGTGGACAGATACAGCGATAACCATTAACCAAATCCTAGAAGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGACACATGCTTTTTTTCTATGTATTCCACAAACACAGGGCTTCAGCGGTTTAGCATGACTGTTGCGGTTTAGCTGGTTCACTGAAATAGCCAAATGCTAAACCTCTGAAAGTGGTTAGAGGAATTTCTATGTGCATGCCTTCAAAATGACTCCCACGAGGCTGGGGTAACATAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAGAGACTCTTTTTTCACCCAAATTTTTAAATCTCACAGGGACAGAGCTCTCCTAGTGTCGCACAAATCTAAAGATTTGTTGTCAATTGTCAAAGTTTTGATTTAAGCAAAGATTTACATACCCGACAGGAGGCGTCATTCTGACACTGGCCAAGGCAGTCATTAATATCTAAAAAATAAATAAGTCATCATTTTAAAGAGG
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Task1_train_27752
Here is a genetic alteration in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
TGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACCTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCACCGTTCTGGCAGGGATTAGGCTCACAATAATCGATGTCCAGCTGCAAATATCAGGAACAGCGAAAAGGGGGAGGGATCAGAGTAAAACAAAGGTGTCACGATAACTTCTCTGGGGCAGCAGGCACTGGAATCTGACAGTTCCTTCGGTTTCTATTAGGAGACACCCTGTAAGATACATCTCTATGCTGTAGGGACTGCCAATGTCCAGTATTTGAAACAACGGGGCAGAGTGGGAGAGGGAGCACAAGAGGGGGTGGAGGGAACCAAAAAGAACACAAAGACGAAGACACTAAGAAGAAAATAATTCGTCAGTATCTCCTTCCACCAGCATTTGTCTAGCAGAGACTCTCTCATCAATAGGATGTTAATAGATGTTAGGAAATTCCAGACACAAGAGCTGAGGGAAAAGTAAAGGGAAGCGGAGGAGGCAGCGGCTCTGCTCTAAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTGCCACCACTCACCTGACAGAGGTTTCCAGAGAAACCAGTGGGACACAGACACTGGAATCTGTTGATTTCATTCTGACAGTGACCCCCATTCAAACAGGGGTTGCTGGCACATTCATCGATGTCTCTCTCACAGTGATCGCCTGCATAGCCAGGTGGACAGATACAGCGATAACCATTAACCAAATCCTAGAAGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGACACATGCTTTTTTTCTATGTATTCCACAAACACAGGGCTTCAGCGGTTTAGCATGACTGTTGCGGTTTAGCTGGTTCACTGAAATAGCCAAATGCTAAACCTCTGAAAGTGGTTAGAGGAATTTCTATGTGCATGCCTTCAAAATGACTCCCACGAGGCTGGGGTAACATAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAGAGACTCTTTTTTCACCCAAATTTTTAAATCTCACAGGGACAGAGCTCTCCTAGTGTCGCACAAATCTAAAGATTTGTTGTCAATTGTCAAAGTTTTGATTTAAGCAAAGATTTACATACCCGACAGGAGGCGTCATTCTGACACTGGCCAAGGCAGTCATTAATATCTAAAAAATAAATAAGTCATCATTTTAAAGAGGTAATTTACAGTGAAATTGGGCTTAATTGAAAAGCCTTCTCAGCTCAGGATAGATAAGTTTCAAATCAGATTTCCTGTGTGCTTTCCGTGAGATAAGGTTATTACGCTGGGTGGGGACCCTCCCTAATTCTTCCAGAATGAGGGAGTGAAACTTCACATCATTGTTTCAGCCACATTATCAGAATATGGCTGGTTTTCGCAGCTAATGAGCCTGATAAAGTGTATGTTTTCACTGCTGCCCTGACCACTCCCTCTCAAAAAACCATTCCCACTCTAAGGTTTTCCTTCTACTGCTCAAGTCCTAGGACTGGAGCCCCAGTACGGACCAGCAAGTCGGCTACCCAAGTTTCATGAAAATCAAAATGGAAACAAAGTCACTCACTTATGTCACAATTCTGACCCATCCAGCCGGGAAGACAGTCGCAGTAGTAGCTGGCAATGAGATTCTTACAGGATTTGGCGTTTACACAAGGTTTGGCCTCACATTCATTTGCATCTGAAAGGAGATGGGGATGAGCATGAGAAATGAAGTTCAACCCCCATCTCCCCCACCTTGGAAAAAAAAAGAACAGGCCAGAGTTTGTCTGAGACATGAGACATTTTAATAAGCTAGCTAAATAAAAGATACTAGAGGTTCCCTCTATTTTAAGCATCTGATCCCTCTCCCTAGCTATTATCCAATAAGAACCCTAATTGATAACTTTCCAGCTGCTAGTTAACCAGCCCCCAACAAAACAGCAGAAAGCCACCAGGCATTTCTGTGCAAAACCCAGGCAGCCTAGTTGCTGGGATTTAAATGTGGCAAAAAGAATGCAGACAGCTCATTCCTCATGAGATCATCCCCTTTTGGAACCCAGCTGAACACTCC
TGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACATTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCACCGTTCTGGCAGGGATTAGGCTCACAATAATCGATGTCCAGCTGCAAATATCAGGAACAGCGAAAAGGGGGAGGGATCAGAGTAAAACAAAGGTGTCACGATAACTTCTCTGGGGCAGCAGGCACTGGAATCTGACAGTTCCTTCGGTTTCTATTAGGAGACACCCTGTAAGATACATCTCTATGCTGTAGGGACTGCCAATGTCCAGTATTTGAAACAACGGGGCAGAGTGGGAGAGGGAGCACAAGAGGGGGTGGAGGGAACCAAAAAGAACACAAAGACGAAGACACTAAGAAGAAAATAATTCGTCAGTATCTCCTTCCACCAGCATTTGTCTAGCAGAGACTCTCTCATCAATAGGATGTTAATAGATGTTAGGAAATTCCAGACACAAGAGCTGAGGGAAAAGTAAAGGGAAGCGGAGGAGGCAGCGGCTCTGCTCTAAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTGCCACCACTCACCTGACAGAGGTTTCCAGAGAAACCAGTGGGACACAGACACTGGAATCTGTTGATTTCATTCTGACAGTGACCCCCATTCAAACAGGGGTTGCTGGCACATTCATCGATGTCTCTCTCACAGTGATCGCCTGCATAGCCAGGTGGACAGATACAGCGATAACCATTAACCAAATCCTAGAAGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGACACATGCTTTTTTTCTATGTATTCCACAAACACAGGGCTTCAGCGGTTTAGCATGACTGTTGCGGTTTAGCTGGTTCACTGAAATAGCCAAATGCTAAACCTCTGAAAGTGGTTAGAGGAATTTCTATGTGCATGCCTTCAAAATGACTCCCACGAGGCTGGGGTAACATAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAGAGACTCTTTTTTCACCCAAATTTTTAAATCTCACAGGGACAGAGCTCTCCTAGTGTCGCACAAATCTAAAGATTTGTTGTCAATTGTCAAAGTTTTGATTTAAGCAAAGATTTACATACCCGACAGGAGGCGTCATTCTGACACTGGCCAAGGCAGTCATTAATATCTAAAAAATAAATAAGTCATCATTTTAAAGAGGTAATTTACAGTGAAATTGGGCTTAATTGAAAAGCCTTCTCAGCTCAGGATAGATAAGTTTCAAATCAGATTTCCTGTGTGCTTTCCGTGAGATAAGGTTATTACGCTGGGTGGGGACCCTCCCTAATTCTTCCAGAATGAGGGAGTGAAACTTCACATCATTGTTTCAGCCACATTATCAGAATATGGCTGGTTTTCGCAGCTAATGAGCCTGATAAAGTGTATGTTTTCACTGCTGCCCTGACCACTCCCTCTCAAAAAACCATTCCCACTCTAAGGTTTTCCTTCTACTGCTCAAGTCCTAGGACTGGAGCCCCAGTACGGACCAGCAAGTCGGCTACCCAAGTTTCATGAAAATCAAAATGGAAACAAAGTCACTCACTTATGTCACAATTCTGACCCATCCAGCCGGGAAGACAGTCGCAGTAGTAGCTGGCAATGAGATTCTTACAGGATTTGGCGTTTACACAAGGTTTGGCCTCACATTCATTTGCATCTGAAAGGAGATGGGGATGAGCATGAGAAATGAAGTTCAACCCCCATCTCCCCCACCTTGGAAAAAAAAAGAACAGGCCAGAGTTTGTCTGAGACATGAGACATTTTAATAAGCTAGCTAAATAAAAGATACTAGAGGTTCCCTCTATTTTAAGCATCTGATCCCTCTCCCTAGCTATTATCCAATAAGAACCCTAATTGATAACTTTCCAGCTGCTAGTTAACCAGCCCCCAACAAAACAGCAGAAAGCCACCAGGCATTTCTGTGCAAAACCCAGGCAGCCTAGTTGCTGGGATTTAAATGTGGCAAAAAGAATGCAGACAGCTCATTCCTCATGAGATCATCCCCTTTTGGAACCCAGCTGAACACTCC
Task1_train_27753
Assess the clinical impact of this variant on gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1), found on Chromosome 20. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
TGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACCTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCACCGTTCTGGCAGGGATTAGGCTCACAATAATCGATGTCCAGCTGCAAATATCAGGAACAGCGAAAAGGGGGAGGGATCAGAGTAAAACAAAGGTGTCACGATAACTTCTCTGGGGCAGCAGGCACTGGAATCTGACAGTTCCTTCGGTTTCTATTAGGAGACACCCTGTAAGATACATCTCTATGCTGTAGGGACTGCCAATGTCCAGTATTTGAAACAACGGGGCAGAGTGGGAGAGGGAGCACAAGAGGGGGTGGAGGGAACCAAAAAGAACACAAAGACGAAGACACTAAGAAGAAAATAATTCGTCAGTATCTCCTTCCACCAGCATTTGTCTAGCAGAGACTCTCTCATCAATAGGATGTTAATAGATGTTAGGAAATTCCAGACACAAGAGCTGAGGGAAAAGTAAAGGGAAGCGGAGGAGGCAGCGGCTCTGCTCTAAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTGCCACCACTCACCTGACAGAGGTTTCCAGAGAAACCAGTGGGACACAGACACTGGAATCTGTTGATTTCATTCTGACAGTGACCCCCATTCAAACAGGGGTTGCTGGCACATTCATCGATGTCTCTCTCACAGTGATCGCCTGCATAGCCAGGTGGACAGATACAGCGATAACCATTAACCAAATCCTAGAAGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGACACATGCTTTTTTTCTATGTATTCCACAAACACAGGGCTTCAGCGGTTTAGCATGACTGTTGCGGTTTAGCTGGTTCACTGAAATAGCCAAATGCTAAACCTCTGAAAGTGGTTAGAGGAATTTCTATGTGCATGCCTTCAAAATGACTCCCACGAGGCTGGGGTAACATAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAGAGACTCTTTTTTCACCCAAATTTTTAAATCTCACAGGGACAGAGCTCTCCTAGTGTCGCACAAATCTAAAGATTTGTTGTCAATTGTCAAAGTTTTGATTTAAGCAAAGATTTACATACCCGACAGGAGGCGTCATTCTGACACTGGCCAAGGCAGTCATTAATATCTAAAAAATAAATAAGTCATCATTTTAAAGAGGTAATTTACAGTGAAATTGGGCTTAATTGAAAAGCCTTCTCAGCTCAGGATAGATAAGTTTCAAATCAGATTTCCTGTGTGCTTTCCGTGAGATAAGGTTATTACGCTGGGTGGGGACCCTCCCTAATTCTTCCAGAATGAGGGAGTGAAACTTCACATCATTGTTTCAGCCACATTATCAGAATATGGCTGGTTTTCGCAGCTAATGAGCCTGATAAAGTGTATGTTTTCACTGCTGCCCTGACCACTCCCTCTCAAAAAACCATTCCCACTCTAAGGTTTTCCTTCTACTGCTCAAGTCCTAGGACTGGAGCCCCAGTACGGACCAGCAAGTCGGCTACCCAAGTTTCATGAAAATCAAAATGGAAACAAAGTCACTCACTTATGTCACAATTCTGACCCATCCAGCCGGGAAGACAGTCGCAGTAGTAGCTGGCAATGAGATTCTTACAGGATTTGGCGTTTACACAAGGTTTGGCCTCACATTCATTTGCATCTGAAAGGAGATGGGGATGAGCATGAGAAATGAAGTTCAACCCCCATCTCCCCCACCTTGGAAAAAAAAAGAACAGGCCAGAGTTTGTCTGAGACATGAGACATTTTAATAAGCTAGCTAAATAAAAGATACTAGAGGTTCCCTCTATTTTAAGCATCTGATCCCTCTCCCTAGCTATTATCCAATAAGAACCCTAATTGATAACTTTCCAGCTGCTAGTTAACCAGCCCCCAACAAAACAGCAGAAAGCCACCAGGCATTTCTGTGCAAAACCCAGGCAGCCTAGTTGCTGGGATTTAAATGTGGCAAAAAGAATGCAGACAGCTCATTCCTCATGAGATCATCCCCTTTTGGAACCCAGCTGAACACTCC
TGGGATCCCTCCAACATGACCCATACATCCCAGAGCTCCCCAAAGAGTGGCAGACTCACTGGTTTCACAGTAGGCCCCCTCCCAGCCGTCACTACAGATGCACTTGTAGGAGTTGACACCATCGATGCAAGTGCCACCGTTTCTACAAGGGTTGCTCTCACAGTCATTAATATCTATGAAACAAAGTAAAGCAAAAAAAGAACTGAAGGACTTGTGAAGCCATAGACAAGCACTGTTCAGCAGTTTTCATGGCTCCCTCCTGACACAATGCACCTGGCACCTCCACCTGCTACCCTCCATCAGGGCTGTTTCTCAAATTAGACAGGCGGCTTATCAAGCAGAAGCTTCCAGAGAGTGCCTTACCCACTTAATGCCCTCACATGGGCATTTAGTCACCGGTACTAGGTGAAAGTGGGGAAGAAACTCCTACAGAAAAGAGGAATCACCCAACCTAGCAACATTCCAGAATGTTCCAACATAGATATGGAGGCTCCGAGGCAGAGTGATCTGGTAAATTGAACACGACCTCAGTCTTAGATCCCAGATGTAAGGATAAGTCTCAACCAGTCTCCCCAGCCTTACTGTTTCTGATTAAAACAATTTCAACACTGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGTTGGGGGTCGGGGGGTGGATCATCTGAGGCTGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGGCGTGGTGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAAGGCTGAGGCAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCCGAGGTTGTGGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCTAGCCTGGGCAACAACAGCGAAATTCGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTTCAACACCAATGATCCCAGGGTGGGCCAGGGGCAGAGGCAGGGGCAGGGGCAGGCTGGGGAGCACTGGTCCATTCCCGGATGAGGGAGTCTTACTTTCATGGCAGTATGTTCCCGTGAAGCCTTTGTTACAGTCACAGGTGAATTTGCCTCCCGACTGACTCTTGCACTTCCCGTGAGGACCACAGACGTTGGAGGAAATATACCGCACCCCTTCAGGTGTGTCGTTGGAAGCCATGGCCACTGTGCAGCTGTCAATCACTAGAAGATAGGCTTGGGATCAGATCACAGCCATGCACCCACAGATGCGGCATTCCTAAGCCAAGGGCCTGGGCCAAGCCCACTTTCCTGGAGACAGGGACCCTCTGGCTAATGAGACACACCCCAGGGAAGCCAAGATACTGGCAACGTGCCACATCACATTATGACAGGCAAAGTTGAGACTCCAGGCAAAGAGTTTTAAAGCATTTTCTCCCTCCACACAACCAGGAAAACCCACATGCTTGTGGATCCCCTTCATCCTACCTTTGACATCTACCCAATTTGGTAAACACTTGCTAAGGCAAAAGGACCTGCTTTATTTACTTCCTTTTTGATCTTAAGCAAGGCTCAAGGACAATCTTATAGAAGCTTTAAATGTTGTGCTGCCTAATACAGCAGCCACCGGCCACATGTGGCTATTTACATTTAAATGAACTAAAATGAAATAAAATCAGTTTCTAGTTACACTAGTCACAGTCCACATGGCCTGGGGCTCCCATACCTGACCGTGCAGATACAGAACATCCCCCTCTGTCTGCCGTTGCAGGAAGTTCTGTTGACAGTGTTGTTCTCAGGCATTTGCCTCAGCGTTGCACATCAGCCCACCCCAGAACAGGAATGCTAAATGGATTTCACATTCTCTCCCCTGGGCTACTTGTAGACACGGCTCTCCCACTGGCAGGCCGGAATAGATTGTTTCCACGTGTTGCGGCCCGCTACACAGGCAGGATCATTTCACTATAGAGGTCCTCCTCACCAATACATTACTTCTCAAGTGTAACAAGGGGCAGTGGTAGTAAGTGGGGACAAAAGGAGCAAGTCTGGAGACAGCCAGGTCCCGGGAGAAGGGAGGTACGTTCACAGGGGGTCGTGCGGCAGTGGTCTTTCAGGTGTGAGCAGTTCTTGCCCTCATAGTCCTCGGGGCACTTGCAGAAATAGTCACTGGCACGGTTGTAGCACTGGGCACCGTTCTGGCAGGGATTAGGCTCACAATAATCGATGTCCAGCTGCAAATATCAGGAACAGCGAAAAGGGGGAGGGATCAGAGTAAAACAAAGGTGTCACGATAACTTCTCTGGGGCAGCAGGCACTGGAATCTGACAGTTCCTTCGGTTTCTATTAGGAGACACCCTGTAAGATACATCTCTATGCTGTAGGGACTGCCAATGTCCAGTATTTGAAACAACGGGGCAGAGTGGGAGAGGGAGCACAAGAGGGGGTGGAGGGAACCAAAAAGAACACAAAGACGAAGACACTAAGAAGAAAATAATTCGTCAGTATCTCCTTCCACCAGCATTTGTCTAGCAGAGACTCTCTCATCAATAGGATGTTAATAGATGTTAGGAAATTCCAGACACAAGAGCTGAGGGAAAAGTAAAGGGAAGCGGAGGAGGCAGCGGCTCTGCTCTAAAAACTTGGCCATCTGAGGTTTTGCCACCACTCACCTGACAGAGGTTTCCAGAGAAACCAGTGGGACACAGACACTGGAATCTGTTGATTTCATTCTGACAGTGACCCCCATTCAAACAGGGGTTGCTGGCACATTCATCGATGTCTCTCTCACAGTGATCGCCTGCATAGCCAGGTGGACAGATACAGCGATAACCATTAACCAAATCCTAGAAGAGGAGAAGGGGAGAGAGAGACACATGCTTTTTTTCTATGTATTCCACAAACACAGGGCTTCAGCGGTTTAGCATGACTGTTGCGGTTTAGCTGGTTCACTGAAATAGCCAAATGCTAAACCTCTGAAAGTGGTTAGAGGAATTTCTATGTGCATGCCTTCAAAATGACTCCCACGAGGCTGGGGTAACATAAGCCCTAGCGAAACTTCCAAGAGACTCTTTTTTCACCCAAATTTTTAAATCTCACAGGGACAGAGCTCTCCTAGTGTCGCACAAATCTAAAGATTTGTTGTCAATTGTCAAAGTTTTGATTTAAGCAAAGATTTACATACCCGACAGGAGGCGTCATTCTGACACTGGCCAAGGCAGTCATTAATATCTAAAAAATAAATAAGTCATCATTTTAAAGAGGTAATTTACAGTGAAATTGGGCTTAATTGAAAAGCCTTCTCAGCTCAGGATAGATAAGTTTCAAATCAGATTTCCTGTGTGCTTTCCGTGAGATAAGGTTATTACGCTGGGTGGGGACCCTCCCTAATTCTTCCAGAATGAGGGAGTGAAACTTCACATCATTGTTTCAGCCACATTATCAGAATATGGCTGGTTTTCGCAGCTAATGAGCCTGATAAAGTGTATGTTTTCACTGCTGCCCTGACCACTCCCTCTCAAAAAACCATTCCCACTCTAAGGTTTTCCTTCTACTGCTCAAGTCCTAGGACTGGAGCCCCAGTACGGACCAGCAAGTCGGCTACCCAAGTTTCATGAAAATCAAAATGGAAACAAAGTCACTCACTTATGTCACAATTCTGACCCATCCAGCCGGGAAGACAGTCGCAGTAGTAGCTGGCAATGAGATTCTTACAGGATTTGGCGTTTACACAAGGTTTGGCCTCACATTCATTTGCATCTGAAAGGAGATGGGGATGAGCATGAGAAATGAAGTTCAACCCCCATCTCCCCCACCTTGGAAAAAAAAAGAACAGGCCAGAGTTTGTCTGAGACATGAGACATTTTAATAAGCTAGCTAAATAAAAGATACTAGAGGTTCCCTCTATTTTAAGCATCTGATCCCTCTCCCTAGCTATTATCCAATAAGAACCCTAATTGATAACTTTCCAGCTGCTAGTTAACCAGCCCCCAACAAAACAGCAGAAAGCCACCAGGCATTTCTGTGCAAAACCCAGGCAGCCTAGTTGCTGGGATTTAAATGTGGCAAAAAGAATGCAGACAGCTCATTCCTCATGAGATCATCCCCTTTTGGAACCCAGCTGAACACTCC
Task1_train_27754
Here is a mutation in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
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Task1_train_27755
This variant affects the gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) found on Chromosome 20. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
ATAGCTGTAAAAAACAGAGAAGGGCGTGTCAGCACACTGCCTGTTCCTTGCATCGCCCCGGTCATGAGAATGGCCCATTGCATTAAAGTCTGCAAATTCCACGATTTTAACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCC
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Task1_train_27756
With a mutation on Chromosome 20 in gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Deafness, congenital heart defects, and posterior embryotoxon
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGTGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
Task1_train_27757
Given this variant in gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Tetralogy of Fallot
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
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Task1_train_27758
The following genetic variant occurs in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGTGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
Task1_train_27759
This alteration occurs within gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) located on Chromosome 20. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, Type 2HH
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
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Task1_train_27760
A genomic change on Chromosome 20 affects JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
AACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGT
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Task1_train_27761
A genetic alteration is present in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
ACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGTG
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Task1_train_27762
Gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Tetralogy of Fallot
ACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGTG
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Task1_train_27763
Gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20 is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Deafness, congenital heart defects, and posterior embryotoxon
ACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGTG
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Task1_train_27764
Here is a variant affecting JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
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Task1_train_27765
With a mutation on Chromosome 20 in gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease, axonal, Type 2HH
ACAGGTCTCATATCAAGTCCCTTGTAAGGAGAGGAAGATGGGAGGGGCCCAAATAACAAAACCAGCTTTAAACTTCAAGGCCTTGTTAGCAGATTCTGAAAACATGATATTGTTTGGGGACAAAATGCAGACAAGTTGACGAGGGAAGGGGGACCTTCGTCCAGCCTCTCTAAACCACAGCTACCCTGGCTCCTTGAGCAGAGCTTGGTCAGTTTCCATTCTGCCCACACCCTTTTCATTAGAAGAAAAAAAGGTATAGATAATCCTTCCCCATCCCACCAGGACACATTCAGATGAGCCTCAGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCCATACCAAATGCCTGGTTTGAAAATTCCATGGGACTAACAGAGCCAGCCAGGCTGGACTCATTGGGCAGGCTAATCTGGTGGCCAGATCTGGTGAGACTTTTATAAAGTATCCTTGCAGAGCAATTCTCTACTTCGTTTAAAAAAAAGAAAAAAGTAACTTCTAAAAAATGTCAGTTTCTAAGACCAGGCAACAGTGGCCCATGCCTATAATCCCAACACTTTGGGAGATTGAGGCAGAAGGATAGCTTGAGGCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCAACAACATAGCAAGACTATGTCTACACAAAATAAAAAAGCTGGGTGTGGTGGCATGTGCCTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAACCCAGGAGTTCAAGGCTCCAGTGAGCCATGATTGTGCCATCATGGGTGACAAAGTGAGCACCTTATCTTAAAAAAAAAAAAAAACACCAAACAAAAAACCCACACTAAGTGTTAGGTCGTTTAATTTTTAAAACACACTAAAATATGTTAATGAATTCCCCTTTTCATTTGAATTCCAGAAATGCCATCCTTTTTAAACTCTTCTCTCCAATTATTTAAGAAAGCAGTAGTACTACCCGGGAGAGCTGTAAATTCCTTCCCCCATGACCCACCCCTCTCTCATGGTTGAAAAACTCACTTTGAAATTGAGTCTATCAAAACAATTTACCTAATTATCATGTAAAATAAGCAGAGTACATTATTGCTCATGAGGGGATATTATACAGTTAACAGAATTACCCATCAAGTTGCTATGAATTGGAATCACTGAATTCTATAAAGGGACTGGGACAGTAGACAGCACAGAGACTAAAAGTGGGCCCACTCCTACACCAATAGGAAAGCTTGAGCTAACCACATACCTCTCCCCATCAAAGCCATGCCCCCAAAGACACCTAGTGAAAACTTGCTGCAAGGCTACCCTGAATGCAGGGGCTATCATTTCCTATAGGATAGCCTGTTCAGACAACAACTGGGCTGACCTAGTCCTGTCTGGATCTATTTTGGGTCAAGTTCCTTAGAAGCAGAGTCTGAGAAGGGGATCTGGACATAGGTAGAAGGAATTGAGGGAAGCAGATGGGGTAGGGGAAAGAGCTGAGCAAGAACATGGTCTCAACTGGAGTCTGATTTCAGCCTAATCCCAGGGTAAGCTCTAGAGTGCAAATTGTACTACTGTTTTAAGGCAAAGGAAGCTGGGCTTTGTAGCCCTATGTCTGTCAATCACTGACTGTGAGCTGGAGGAATGGGGCATGCACTGGTTTGGCCAAGGACGAGTCTCCTGAGAAGGAGCAGCTGTGAGCTGTTGGCAGCCAACACAGCACCTGGGGGATGGGGATGCCAGTAAAGGGGATCTGGATGGGGCACCAACAGCATCTTCTACACTCCGCATCTTCATACTGCAGGCCCAGAATAACAGCCAAAATCCCACCCCACCTGAGATAGCCGCATGCCACCTGCCTGCTGGTGGGGTGATAAATGGACACTAAAAGCAACAGGCACACGTGCACATGCACACACACACACATACCTCTGTTACATTCGGGGCCCATCCAGCCTTCCATGCAAGTTTTGTTGCCATTCTGGTCACAGGCATAGTGTCCAAAGAAGTCATCTCTGGGGCGGCAGAACTTATTGCAGCCAAAGCCATAGTAGTAGTCATCACAGGTCACGCGGATCTGATACTCAAAGTGGGCAACGCCCGTGTTCTGCTTCAGCGTCTGCCACTGCCGGCTGGGGTTGATCATGCCCGAGTGAGAAGCCTTTTCAATAATACTGTCAGGTTCTAGAGACAAAGTGATGAATCATGTTAATATTCACATTGCAGCCTTCTTCCCTGACCATTTTGGCTTTTTAAAATAAAAACATATGCACCTGCTACAAAATTCTATCTGTTGTAAAAAAGGCAAAGAAATGAAAAGTTTATGCCCCTACCCAGAGACAACCTGTTACCACTTGTTTACCTTCTTTAATGGGTACACAGTATTTCATTGTCTGGAAACACCAATAAATAATTTACCTAGTCCCTGACATGTGTGCATGTGAGTCGTTTGGGCTTCTTACTATTAAACAAAGCCACAGTGAGCATTCCTTGAACGTATCTGCCTGTGTATGGTTCCCACAATGAGATACTCTAGAAATGGAAGTGCTGAATCAGAGTCCGTGCACAACAAATCAACCTCTGTCCACAGTCTCAAACTACCAGTCTGTCCTCCCACCACCCAGGAAGCTGTGTTTCCCAATAACACTGCCAACGTTGTACATTATCAAACCTTCTAATCTATGCCTGATAGGTAAAGAGGTATCTCATTTAATTAGCATTTAACTAAGTGATGGCAAGAGCCCTTTCTGGTAGTTACAAAACCATTTATATTTGTTCCTGTGAACAGCAACAGCTTCTCTTCTCTGCCAACTTTTCTATTACATTGCCATACTGACTTGCAAGTGCTCTTTACATATGAGAGACAGTAGCTCCCTATGGAATGTTGCTCTTGAAGAAATTTCATTATTCCAGATAAAGGTCAGCAATCATTTCTGGTTTTAGGGTTTTATGTCTTGCTCAGAAAAGCTTTTTGTCCATTTCAAAACTCTTAACTGGAAGCCAAGGAGACGATTAAGTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAATTGTTAACATGGCAACCTTTAAAGCCAGCTCTTAAATACCAAGACCTTGAACTTGATGCATTCCACCTTTCTCCTCTGCCCAGAAGGCAGATGGGAGAATAATTCACCAAAGTTTAGACACAGGTAAATTGAGGGGAGGGTTTCTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTGAGCCAAGTCATGCTCCTGAAAAAAAATGCTTACTGAGGATAATAAACACCTCGAGCTCAAGCAGCTCTCAGGAGTATGTAGTCCCTGCCCTGAGGCCACTTATCATCTAGTTTGAGAAGAGACAGGTACAAAAATAGCTCAAACATCAGGTGCCAGCAGTTCAGGGGAGGGATCTGAAAAGGCAGCAAGGCACTAAATCAGCACCCCAACCTGGTTTTGTGTTTGTTTTCTTAAACCTGCCAGCACCAACTCTTCATCACCTTGTCAAATTCAAGACCATCTTGGAGAGACAGTTAGGACTGACTTGCAATGTCTTTGTGATTCTTACCCACCCACATGGCTGTTTTTCTAGGCCTCGGGCCAGTGCTCCTTTAAAAAGTGATGCAAGCCCTATAAGTGACCAGGAGAGAAGGGACTCCTGGGTGGCTTCATCCACACACCGCTTCCAACAGGGCCCCAGCGTTCGCCCTCTAGGGCTCTCAAACTGCTGCGTGGGCAAGACAAGCCTTGAACAAGCTCACATACCTGCAGCCTGACACCCCGGCACGCACTGAACCACTTGCAGGCAGGTAACACTTTACTCGTTTTTGCAAATAAACAGAGGCCAAGGAATGACAAAAATGTCTCTCCATTAACTATGTTTGCTCTGCTGGTTCAGTTAAAAAGCATAGTGGGCTATTACCACGCGCTTACAAGATCTTCATAAAAGGGATCGGTTAAACACACTAGCCATGGCTTAAAGGCATCCAGCTTCTGAGGCTGGTATCAACAACAAACAGTTTAGACAAGAGTCCAGGGCAATCCTAGGGGTGCAGGACTGATATGTACTTTTCAGTCATGCAGTAAGCTTTCCACTTATTTCCGGGAAGTGTCGTGCAGAGGATCACTTCAGAATCCTCAGTG
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Task1_train_27766
This variant impacts the gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) on Chromosome 20. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
GGCTTATGGCAATGAGTGTTCAAATATCGGTGCCAGACACCCAGAAGGGGCCCTGGGAAGGGACTGCTTTTGGCAAGAGAAGATCCTGAGTTTGGTTTTGACTGTGCTGAATTCAAGATTCCTTGGAAGCATCATAAAAGAGGCCAAATAGGCAAGTGGAGAAACCATTTCCACCAAACCCATCTCCCTCTTCAGGGTTCACCAAGTGAGTTTTGATAACCTGCAATGGGCACCCTTGAGGTTTAAAAGAACTTTATTCCTACCTCAGTCTTTCTTGTCCTCTTCCAGGGATTTGATTACCCCCCCAGGAGATGAAACATCCTAGAACCCCAAAATCGGGCTACCTGGAAATGCAGACAACTGTGGGTAGCTCTGGACAAGCCCTGGGTTCCCAGGGGACATAACTCCCTGACCTGCGAGGTGACAGGAGGTCCAGGAAAGGTGCTGTGAATGCTGCAGTGTGGCGGGGAGGTCTCTCACATGTCCCTAACAAGTATACTGACCTGGCTCTTATCACAGGCCAGGATCAACCTCAAGCTGTTCACTCTACCGGGTGGATTGTTTCAATAGCTAAAAGGGAGGGGAAAGAACACCATGTCGACACCATACTATTACAGAAGAGCCTATGTCTCCCCCCTCCTCAACCCCTTCTGCCTAACGCTTAGTTACCATTGTAAGCAGGTCACAGTGACATAATGTTCACAGTCCTCAACGTTTGTGGCAGGGAGGGGAGAACAAACAGGTGTCTATGACCCTGACTGGCATCAGCCATAGCCAAGGCTGACAGAGCTTCCCTGCCACCCCCACACACACCCCCCCACGGCATTACAGGGTAGCCCTCTGGGGAGGAAGACTCGAACCTTGGACTTTCATGAGCTCCCCCTCCAGGGAGGATGACATCCAAAAAGCTGGACTTAAGATTCCCAAGCTAGAAGAGTGACCCAAATGGCCTGGGACTCTCTGGCACATCGGAGCTCAGCAATGATTCTGTGGCTCCAAGTAGCCCAATAAGCCAGCCACAGGTGGAAGCTGCCCACGTAGCAGGCACCAAGCCCTCACTGCACCCACGGTGTGCATTCACCATTTTCTGTCAGCAAAAAAAAGCAAGGCAAGGAAAGATGAAAATATATTATTCACAGTGAAAGCAAACAAAAAAAAATGGTAAGATAGAAAAGCAAAAAGTACAAGGCATTCAGAGAACAGAGAGCCAAGACAAGAAGCTGGATCCACTCTTCCTCATGCACAGACCAAGAGATTTCAGTGAGCATCAAGTTTTCCAGCGACCGCAACCCAAACTCTGCTGGCAAAAAGGGAACTTGAAGTTTCGGCTCGTGAGCGAAAACACTGTAAAGTTACAATTAAAGAGCAAGACTACTTTGTAAGCCAGACTATGTCATTTCAATCACATCCTCCATGGCTTATCCACCAAAACCAACCCCTCAGTCCTGAAAGGCAACCTGCACTGAAAACAGAGCCATCTTTCAGAAAGGGACAAGGCAGGTAATGGCTGTGAAGCTCTGGAATTGCGCTTCAATGAAAGGTTTGTGGAGCAGTGTGGGAAACCCGGAGAGACTAGAAGCTCACCTGCCCACCAAGTGAAATTCAAGGTCGGTCTCTAGAGCCCAGCACCACCTTTATGGCTTTATCTTTCTGATGAGAGATTAAACACTCACTTAAAGTTTAAATGGACTTTTAAAAAGTCACTACTTTGATCCTTTAGCAGACTACAAGGTTTTAAAGTTGTAAAACCATTAAGATCTCTATCCCGAAGATAATCTAGGTTTCATAATCAGGGAATGAGTTAACTGGGATTCTGTTCTGGCCACTTAATATTCCAAGCAAAAATCCTAGAAAAGTTAAGGAATACATTCCACTGAAGGTTCACCCTGGGGTACAGGGGAGAACAGAAGGCAAGAGGTGGCAGAAATGCTAAGTACTAAGGAGACAGATCCAGCTCCAACTGGTTGGCCAAGCCCCACACTTCCACGTGTGTTTAGAGAAAAGTCCACAGAAGCGATACTTACGAACGGTGTCATTACTGGAATCCCACGCCTCCACAAGCAACGTATAGGACCTCTGCAAGACAAACAAACAATTTAGCAATTCAGAAACAGGGTCGACTTTCCAAAATCTCGTACATTCTTGGCCTCCCAGAATACCCCACCAAACAAAACCATAATGCCAAAATAAAAATTCTGTTGGTTGTTGCATTGAGTTCCTGGATGTTTAAATCCAAACCAACTCCCCTTCCTTTGTCAGCACTCTTCCCAGGTTGACAAATGACTCCTTTCACCTGGCAGGGACGCACTGGAGTCAACATGCATGCAGGCAGCTCAAAGTTGAGATCAGGAAATGCCACCTCACTATATGATATGAGAGTATTTAGCATATAGTTTCCCAAAACTTTCCAGACCCTGACCCTAGTGCATGAGGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAGAATTTATTCTAAGCTAACCTAACCAGGTATTTGTACCGAGGGGGTATTGCTAAGGTTACACTTTGGGCCCTGGTGAGGCAGTCTCTAGGGAGGCCCCCTTTTCCTTTTTAGAACCCCTTTGAAAACTCTGTCTATGTGAGACCATCCTGGCTCCCACAAGTATCGGGTAACTCTAGGAAACAGGAGGGGGTAGATGCAAAGTGACTCTGCAAGACAAAGAAGTCAACCTCACTTGGGCGGTGGAGTTGGGGGCAGATCCCAGGGAAGAAAGTACAAAGGGAGAAACAACCGCACACCCATGGGTTATATTTATTGATGAACTTATCTGTTAATAAGATCTAACATTCCAAGAATAATCAGAGTCTACTAACTAAACAAATTCCCTGGATACTGGCAAGATGCCAGCTGTTAAACTGAAGGCACCTTTTATCTTCCAAGCTTATCTCAGAATTCCACCTCCCCACCCCCAGCCAAACCTAAGCTATTAGCAAATTCCCTCCTTTTCTAAAATTTTCCTTCGTAATTTACAGTAAGGTCAGTCTCACAAAACACCAGCGTTTAAATGAAGCTTCTGCTATCTTGGCACTGAAGAAATGTACTCAAGGCAGGTGGGGTAGACAAGGAACATGAACTAGGTTATGAATCCCTGCTTTGCTGTGTCAGAAACCAAGCCATAGGAAATAGAAGCGTGTATAGATTAAATAATACCGTGCTGTGCCACCAGAAGCACACTGCTGCCAAGAGAAGAGAAAGCACCTATAAGATAAAGGAAAAAGAGAAAAAGGGAGGGTAAAAGGGAGTTTCATTCATAACTCAAGGCCAGCTTAGCGCTCTCAGAGTGACACAGCAGGTCATCTCTGAATATAAAAATATCTTGTGATAGACCCTGCCTTGGAATTCAGCCGAAATATGTTTCATACTCAAAGCAGAGTAGGATTCCATTTCGTTCACTGATAACTGTGGGAAAATGCTCAGAAAAGCAAGCAAAACCGGGCAAGCCAGGGCACATACCCAGCCCTCTCCTGTTAGTGGCCACAGGTCCAAATTCATTGCTGTTGTTACTATTTTATTAGCGAAAGTTATACCTTATTTACTGCCTCTTTAAGTTTCTTAGGACTTCCTGCAAATTACAGGACTCTTCCCTAAGAGCAGCAAGAAATTATATTTCTCTACTGATTTGAGGTAAGAGCACAGTCAAAATGAGGCCAGATGTGTGGCTGATTCTGTATAATTAAGCCCTTCATTTGCTGGTCACGTTGAGGCCCACGTCCTCCACTTCAACAGTATTGTTGTAATTAATCCTCTGATTAAATGCATTGATACCAGGAGTTTTGACAGACTTGCACAAGCGCTAAACACATAATACCCACAAACCCCACTGCAAGGGAAGGTGCCGGGACTGAGCTGGCATGGCAGTACTAACTCAGTTTAATACTCAAAGAGGAAAGCATCCTTAGGTCTTGCACAAGAACTTGGACGACCAAGCAGTCTACCAGGCTCATCCTCGCCAGAACTGGGAAAACCTCAGAAGTTGCTGACCGACATCACCCCACCTGGAGAGAAAAGAATTGCACACAGCCCTACGTGCCTGGCTCTGTGATTTTCCATGAACTGCCCTT
GGCTTATGGCAATGAGTGTTCAAATATCGGTGCCAGACACCCAGAAGGGGCCCTGGGAAGGGACTGCTTTTGGCAAGAGAAGATCCTGAGTTTGGTTTTGACTGTGCTGAATTCAAGATTCCTTGGAAGCATCATAAAAGAGGCCAAATAGGCAAGTGGAGAAACCATTTCCACCAAACCCATCTCCCTCTTCAGGGTTCACCAAGTGAGTTTTGATAACCTGCAATGGGCACCCTTGAGGTTTAAAAGAACTTTATTCCTACCTCAGTCTTTCTTGTCCTCTTCCAGGGATTTGATTACCCCCCCAGGAGATGAAACATCCTAGAACCCCAAAATCGGGCTACCTGGAAATGCAGACAACTGTGGGTAGCTCTGGACAAGCCCTGGGTTCCCAGGGGACATAACTCCCTGACCTGCGAGGTGACAGGAGGTCCAGGAAAGGTGCTGTGAATGCTGCAGTGTGGCGGGGAGGTCTCTCACATGTCCCTAACAAGTATACTGACCTGGCTCTTATCACAGGCCAGGATCAACCTCAAGCTGTTCACTCTACCGGGTGGATTGTTTCAATAGCTAAAAGGGAGGGGAAAGAACACCATGTCGACACCATACTATTACAGAAGAGCCTATGTCTCCCCCCTCCTCAACCCCTTCTGCCTAACGCTTAGTTACCATTGTAAGCAGGTCACAGTGACATAATGTTCACAGTCCTCAACGTTTGTGGCAGGGAGGGGAGAACAAACAGGTGTCTATGACCCTGACTGGCATCAGCCATAGCCAAGGCTGACAGAGCTTCCCTGCCACCCCCACACACACCCCCCCACGGCATTACAGGGTAGCCCTCTGGGGAGGAAGACTCGAACCTTGGACTTTCATGAGCTCCCCCTCCAGGGAGGATGACATCCAAAAAGCTGGACTTAAGATTCCCAAGCTAGAAGAGTGACCCAAATGGCCTGGGACTCTCTGGCACATCGGAGCTCAGCAATGATTCTGTGGCTCCAAGTAGCCCAATAAGCCAGCCACAGGTGGAAGCTGCCCACGTAGCAGGCACCAAGCCCTCACTGCACCCACGGTGTGCATTCACCATTTTCTGTCAGCAAAAAAAAGCAAGGCAAGGAAAGATGAAAATATATTATTCACAGTGAAAGCAAACAAAAAAAAATGGTAAGATAGAAAAGCAAAAAGTACAAGGCATTCAGAGAACAGAGAGCCAAGACAAGAAGCTGGATCCACTCTTCCTCATGCACAGACCAAGAGATTTCAGTGAGCATCAAGTTTTCCAGCGACCGCAACCCAAACTCTGCTGGCAAAAAGGGAACTTGAAGTTTCGGCTCGTGAGCGAAAACACTGTAAAGTTACAATTAAAGAGCAAGACTACTTTGTAAGCCAGACTATGTCATTTCAATCACATCCTCCATGGCTTATCCACCAAAACCAACCCCTCAGTCCTGAAAGGCAACCTGCACTGAAAACAGAGCCATCTTTCAGAAAGGGACAAGGCAGGTAATGGCTGTGAAGCTCTGGAATTGCGCTTCAATGAAAGGTTTGTGGAGCAGTGTGGGAAACCCGGAGAGACTAGAAGCTCACCTGCCCACCAAGTGAAATTCAAGGTCGGTCTCTAGAGCCCAGCACCACCTTTATGGCTTTATCTTTCTGATGAGAGATTAAACACTCACTTAAAGTTTAAATGGACTTTTAAAAAGTCACTACTTTGATCCTTTAGCAGACTACAAGGTTTTAAAGTTGTAAAACCATTAAGATCTCTATCCCGAAGATAATCTAGGTTTCATAATCAGGGAATGAGTTAACTGGGATTCTGTTCTGGCCACTTAATATTCCAAGCAAAAATCCTAGAAAAGTTAAGGAATACATTCCACTGAAGGTTCACCCTGGGGTACAGGGGAGAACAGAAGGCAAGAGGTGGCAGAAATGCTAAGTACTAAGGAGACAGATCCAGCTCCAACTGGTTGGCCAAGCCCCACACTTCCACGTGTGTTTAGAGAAAAGTCCACAGAAGCGATACTTACGAACGGTGTCATTACTGGAATCCCCCGCCTCCACAAGCAACGTATAGGACCTCTGCAAGACAAACAAACAATTTAGCAATTCAGAAACAGGGTCGACTTTCCAAAATCTCGTACATTCTTGGCCTCCCAGAATACCCCACCAAACAAAACCATAATGCCAAAATAAAAATTCTGTTGGTTGTTGCATTGAGTTCCTGGATGTTTAAATCCAAACCAACTCCCCTTCCTTTGTCAGCACTCTTCCCAGGTTGACAAATGACTCCTTTCACCTGGCAGGGACGCACTGGAGTCAACATGCATGCAGGCAGCTCAAAGTTGAGATCAGGAAATGCCACCTCACTATATGATATGAGAGTATTTAGCATATAGTTTCCCAAAACTTTCCAGACCCTGACCCTAGTGCATGAGGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAAAGAATTTATTCTAAGCTAACCTAACCAGGTATTTGTACCGAGGGGGTATTGCTAAGGTTACACTTTGGGCCCTGGTGAGGCAGTCTCTAGGGAGGCCCCCTTTTCCTTTTTAGAACCCCTTTGAAAACTCTGTCTATGTGAGACCATCCTGGCTCCCACAAGTATCGGGTAACTCTAGGAAACAGGAGGGGGTAGATGCAAAGTGACTCTGCAAGACAAAGAAGTCAACCTCACTTGGGCGGTGGAGTTGGGGGCAGATCCCAGGGAAGAAAGTACAAAGGGAGAAACAACCGCACACCCATGGGTTATATTTATTGATGAACTTATCTGTTAATAAGATCTAACATTCCAAGAATAATCAGAGTCTACTAACTAAACAAATTCCCTGGATACTGGCAAGATGCCAGCTGTTAAACTGAAGGCACCTTTTATCTTCCAAGCTTATCTCAGAATTCCACCTCCCCACCCCCAGCCAAACCTAAGCTATTAGCAAATTCCCTCCTTTTCTAAAATTTTCCTTCGTAATTTACAGTAAGGTCAGTCTCACAAAACACCAGCGTTTAAATGAAGCTTCTGCTATCTTGGCACTGAAGAAATGTACTCAAGGCAGGTGGGGTAGACAAGGAACATGAACTAGGTTATGAATCCCTGCTTTGCTGTGTCAGAAACCAAGCCATAGGAAATAGAAGCGTGTATAGATTAAATAATACCGTGCTGTGCCACCAGAAGCACACTGCTGCCAAGAGAAGAGAAAGCACCTATAAGATAAAGGAAAAAGAGAAAAAGGGAGGGTAAAAGGGAGTTTCATTCATAACTCAAGGCCAGCTTAGCGCTCTCAGAGTGACACAGCAGGTCATCTCTGAATATAAAAATATCTTGTGATAGACCCTGCCTTGGAATTCAGCCGAAATATGTTTCATACTCAAAGCAGAGTAGGATTCCATTTCGTTCACTGATAACTGTGGGAAAATGCTCAGAAAAGCAAGCAAAACCGGGCAAGCCAGGGCACATACCCAGCCCTCTCCTGTTAGTGGCCACAGGTCCAAATTCATTGCTGTTGTTACTATTTTATTAGCGAAAGTTATACCTTATTTACTGCCTCTTTAAGTTTCTTAGGACTTCCTGCAAATTACAGGACTCTTCCCTAAGAGCAGCAAGAAATTATATTTCTCTACTGATTTGAGGTAAGAGCACAGTCAAAATGAGGCCAGATGTGTGGCTGATTCTGTATAATTAAGCCCTTCATTTGCTGGTCACGTTGAGGCCCACGTCCTCCACTTCAACAGTATTGTTGTAATTAATCCTCTGATTAAATGCATTGATACCAGGAGTTTTGACAGACTTGCACAAGCGCTAAACACATAATACCCACAAACCCCACTGCAAGGGAAGGTGCCGGGACTGAGCTGGCATGGCAGTACTAACTCAGTTTAATACTCAAAGAGGAAAGCATCCTTAGGTCTTGCACAAGAACTTGGACGACCAAGCAGTCTACCAGGCTCATCCTCGCCAGAACTGGGAAAACCTCAGAAGTTGCTGACCGACATCACCCCACCTGGAGAGAAAAGAATTGCACACAGCCCTACGTGCCTGGCTCTGTGATTTTCCATGAACTGCCCTT
Task1_train_27767
Gene JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1), found on Chromosome 20, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
CAGACGCACTTTTCTAGGTCACTTTTCCTTGGCCAGCGAGGGAGCAAGCCTCCTTGTTTTCATGTTAGCCATCCCTCTGACCCTACTCTCCAAAATGAGCCTCAGCCAGGCTGCTGCTTTTCCACATCACTAATAAGATTCCTTTTATGGTCTTGTGAAAAGCGAGGGGCTCCAGACAGATCCTCCGGCAGGAGGGTGGAACCACCTGCAGGCCCCTTCCCCCTAAACTCCAAACACACGTTCAAGGGCAGTTTGAGTATTCACAGTCAGCTTGGGCCAGCCAGATTTAAACGCAGCCAGACTCTTTAGCTTAAAGTTCTCCCTAATAGGGGATTAACAAACAAGATAAATACTCTTGGTAAAAATGAAATCCCACAACAGAAACAGCCCTTGGACCTCAAGAGAGCTTCACAGACAGCGTTGGTTTTAATTTTTCTTTTTATAAACCCCTTTTCATGGCAGTTTTTGATAACTGTCTTATCTCACCCACAGCAGAGGGCACTTTATAATGCCAGCTCCTGTAATCGTGGATTTTAAGAGCCACCCCAAGCTTCATACACAGACACAGCCAGATAGTCTCCCCTCTGTCTCCTCCCAGAATCACAACCTAAGCCGGCGGACAGGAGGCAGCAGAGTGCACCCCATTAGAGCACGTGGTGGAAAGCAATGCTCTGGGGCACCGAGCTCCCCCTCTCACCACCCACCCTCCCAGCACAGGCTAGGCCAAGCCCCAGTCTTGGCAATGAGTCATGCCTCCTGGACAGCAGGAGCCAGGCAGAGGGCACACCCCCAACATTTCCCTTTCCTCCCCTTCTGCAATCGCACCCATCTTCCTTCCACCCATTTTGGGATGTTGCAAGGGCCTCGCTGCAGGATCTGCCAGCTGGGCCCGGGCCTCGAGCTCCTTTGGGGGCGGAATGGGGCGGGGGGATGAGGGCCTATCACTTACACCCTCAGGCACTACCTCCAGAAGACCACCCCTTCCAAGCCTTGGCACGGCCCCCGAAGGCTTGCGGGGGCCGTGCACCCGCCCTTCCCGGGGAAGTCTGCAAACACAGCTGTTCCAGAGCCCGGGAACCGCTGGAAGTGAGGCCACAAGAGCTACACCACTCGGGGGCGGGGGCAGGAAGGGGCCAGCAGCGGGCGGGGGTTCCCAGGTCTACAGCTCCTGTGAGGGCCCCAAGAACCTCCTCCTGCGGCGGCCGCCCCCGGCCCTTAAGCCGAACCTGGAGAGCGCCCCCGCACACACTAAAATCTCCCGGGGAGCAGCGGGAAACGGACTCCCCCACACCCTCCAGGAAGGACACACCCGCCCTCCCGGCCGTTCACGGGAAAGGGGAGGTTGCCAATTTGGACGGCGTTCGCAGGCCAGAACTGCGCCGAGTCGCCTTCCACGGCGCACCAGGTTTAATTAGTTAAGCAAAGAGATCAGCTACAACGATCTCTTGGCTTGGGGCCGGGAGAGTTACTCTGGGAACTTCAAGTTGCAAGTTTACACCGGCCTTCCTAGGAGCCTGGTCCCATAAACCCTCTGGGATCCCCACTTTTGTGCACTAAGCAAATAGCAGCAGGAATGGGACCCACCTCGACTACCCCAGCCGAGATCTAACTATAGTGTCCCGGCTCCCTCACCCGCCACCCCTAGAGATTTCCCCAGTTAGCGCCTAGTTTCAAGCCAAAGCCCTTTAAATCCCTCTCGCAAGGGATAACAGGGCTCGGCCAGGCGCGGGTGTGAGGCTCCGCCCGGCCTCCTTCCCGAGTAGTCACTCACCGGCCAGGCGAAACTGAAAGGCAGCACGATGCGGTTGCGGTCGTTGCCGCGGCTGGCCTTGAGGTTGAAGGTGTTGCCCCCGATGACAGGCGTGGACCCTGAGCCGAAGCTGCAGGGCCCCCCGGCCGTGACGCGGGACTGATACTCCTTGAGGCACACTTTGAAGTATGTGTCACACTCGTCGCGGGTGCACTTGCGGTCTCCCGGGTTCCGGGCGCCGCCGCAGCAGTTCCCGTTCTGCAGCTCCCCGTTCACGTTCTGCATGGACAGGATCTCCAACTCGAACTGACCCGAGGCCCCACACACCTGCCGGCGAGGGAAGGAGGTAGGTCAGCGCGGGAGAAAGCTGTTTTCTTCGAGTATAGAGGTGGCGACTCCCTCCCACTCCCCGCCCCGACGAGCCCTCCTCGCCGAGTGAAAATAATTTTGCGAAACTACGTTCAAGGACTCAACATGATTCCGGGGCAAAAAAAAAAAAAAATGCACGAGTGCGGAAGAAATCCGACGACTTCCCGGGGGGCAACAGCGGAGCGAACGCGCCCCTGTCCGGCCTGGAGGGGTCACCCTCAGGAGGCAGGGGCTCCCGTGGGGGAGTTGGCGCGCTCAGCCCAGGTGCAGCCGCTCGGGCGCAGGGGCGAGGAGTCGGGCGCTCGAGGGCTGCCGAGCCTGCTCGCGGGGCTCAACCGCCCAGGGCGCCGCGAGGGGAGGGAGAGGACGGCTGGGAGGGAGGCCCGGAGAAGGGCTCCTACCTTGGCTCGCAGGGCACAGAGCAGGGCGAGCAGGAGGCTTAGGGGGCGCCCGGACCGGCCGCGCGTCCGTGGGGAACGCATCGCTGCGCCGCGCGCCGCGGGCACTCGGGACGCCGCCGCTGCTGTTCGCGCTGGTGCTGCCGCCGGTGCTGCCGTCGCCGCTGCCCCTGCGGCCGCCGCGTCCCGGCTCTAATATACTCCGCCGATTGGAGCATGCACGACTGGAAAACAACACCACTTTTCAAAAGCCCTTTCAAGAGCGGCCCGTTCCAGAAGGCAAAGAGCCCGGCCTCCTTTTATTATTCTGATCGCTTCTTTGAGACGCTCCCCCTCCTCTTCCACCTCCCGGCTTTCTTTCCTTCTCTCGCGCTCCCCTTCTTTTATTATTATGATTATGCGCAGCCTTTTATTCCCTTTTAGATCAGCTGCATGGAAAAAGGGGGGAGGGAGGGGAGAAAAAAAAAAACCAGCCTAGCTCGCGGGCCGGCCGCAGGTAACACAATGACGCGTGCCCGCCCGGCTCTCGGAGAAGGACCCGGAGAGCCCGTCTGGCAGCAGCGGCCGGGGCTGGCCACCTCTACCCAGCACGCCGGGCAGGGCGCATGCGCGCTTATTAATATTCATGAGAGGGCGTGCTCACCCTGGGCACGCCCCTCCCCTTCACGTTGCTGGGGAGGGGGTAGTGCGAGGAGGAACTTGGAAGGGGTTGGGGGCAGCGGGATGCTCAGGGCGGCGTAGAAGAACCAGGGCCCCACACCAACCCCCGCCCTCGGGAGCTTCGGGCCAGGAGGGAAGGGAGAGTGCGGGGAGGTACTTGGAAGGGATCGTTGCTCAGGGACGCCTGGAGGCCCCCAGCGGGGACCGCCCCCTCGGGCGCCCCGGGCCGTGCGCCTTTGCCCGCGCGTCGGGGCCCCAGGTGTAGGCGCCGCGGCGCTGACTGAGCGGTCGGAGCGGGGCAGCTTCCGCCTTCCGAACCGCCTGCGTCAGCTGCGGCTTTCGCCCCGGGAGGAGGGCCTGCCTGCCCGCCGGGAGTTCGGCCCGCTTCCCGCGAGCGAGCCGCCCAGAGCGCTCTGCTGGCGGCAGAGGCGGCGGCGAGGCTGGCGCGCTTGCCGCCGTCTGCTCGCCCCGCGGAGGCGACCTGGGCAGACGCTGCTGGGAACTTTGAAAAACTTTCCTGGAGCCAGGCTTGCCGCAGATTCGAGGGGAAGCCTCGGCCGCGTCCCACCCCCTCCCAAATCCGAGTCTGCGGAGCCTGGGAGGGCTCCCAGCTTCCTATCCAAACCGCGCCGGGGCAGAGGCGCGGGGAAACCGGGGGTAGAAGGCGGCGGGCACGCCGGGGCCCTGTTCAGGCTTTGGGAAGGGCCGGCGGAGATGCTGGTGGGCTTGGACGCCCTCCCCGGCCCGACGCCCCGGCCGCAGTGCCGGGATTGCACCTGTAGGCGGCCTCCGAGCAGCTCTCTGGGTGGCAAGAGATGGGCCTGGGAGGGACCGTGTCCCCAGCACCGCCAGCCGCGGAACTTGCCTTCTCTGGGGTGGCAGTGGAAACCGATACTGTTTTCCACCTTGAGGCAAGCCT
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This is a variant in JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1), located on Chromosome 20. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
TCTAGGTCACTTTTCCTTGGCCAGCGAGGGAGCAAGCCTCCTTGTTTTCATGTTAGCCATCCCTCTGACCCTACTCTCCAAAATGAGCCTCAGCCAGGCTGCTGCTTTTCCACATCACTAATAAGATTCCTTTTATGGTCTTGTGAAAAGCGAGGGGCTCCAGACAGATCCTCCGGCAGGAGGGTGGAACCACCTGCAGGCCCCTTCCCCCTAAACTCCAAACACACGTTCAAGGGCAGTTTGAGTATTCACAGTCAGCTTGGGCCAGCCAGATTTAAACGCAGCCAGACTCTTTAGCTTAAAGTTCTCCCTAATAGGGGATTAACAAACAAGATAAATACTCTTGGTAAAAATGAAATCCCACAACAGAAACAGCCCTTGGACCTCAAGAGAGCTTCACAGACAGCGTTGGTTTTAATTTTTCTTTTTATAAACCCCTTTTCATGGCAGTTTTTGATAACTGTCTTATCTCACCCACAGCAGAGGGCACTTTATAATGCCAGCTCCTGTAATCGTGGATTTTAAGAGCCACCCCAAGCTTCATACACAGACACAGCCAGATAGTCTCCCCTCTGTCTCCTCCCAGAATCACAACCTAAGCCGGCGGACAGGAGGCAGCAGAGTGCACCCCATTAGAGCACGTGGTGGAAAGCAATGCTCTGGGGCACCGAGCTCCCCCTCTCACCACCCACCCTCCCAGCACAGGCTAGGCCAAGCCCCAGTCTTGGCAATGAGTCATGCCTCCTGGACAGCAGGAGCCAGGCAGAGGGCACACCCCCAACATTTCCCTTTCCTCCCCTTCTGCAATCGCACCCATCTTCCTTCCACCCATTTTGGGATGTTGCAAGGGCCTCGCTGCAGGATCTGCCAGCTGGGCCCGGGCCTCGAGCTCCTTTGGGGGCGGAATGGGGCGGGGGGATGAGGGCCTATCACTTACACCCTCAGGCACTACCTCCAGAAGACCACCCCTTCCAAGCCTTGGCACGGCCCCCGAAGGCTTGCGGGGGCCGTGCACCCGCCCTTCCCGGGGAAGTCTGCAAACACAGCTGTTCCAGAGCCCGGGAACCGCTGGAAGTGAGGCCACAAGAGCTACACCACTCGGGGGCGGGGGCAGGAAGGGGCCAGCAGCGGGCGGGGGTTCCCAGGTCTACAGCTCCTGTGAGGGCCCCAAGAACCTCCTCCTGCGGCGGCCGCCCCCGGCCCTTAAGCCGAACCTGGAGAGCGCCCCCGCACACACTAAAATCTCCCGGGGAGCAGCGGGAAACGGACTCCCCCACACCCTCCAGGAAGGACACACCCGCCCTCCCGGCCGTTCACGGGAAAGGGGAGGTTGCCAATTTGGACGGCGTTCGCAGGCCAGAACTGCGCCGAGTCGCCTTCCACGGCGCACCAGGTTTAATTAGTTAAGCAAAGAGATCAGCTACAACGATCTCTTGGCTTGGGGCCGGGAGAGTTACTCTGGGAACTTCAAGTTGCAAGTTTACACCGGCCTTCCTAGGAGCCTGGTCCCATAAACCCTCTGGGATCCCCACTTTTGTGCACTAAGCAAATAGCAGCAGGAATGGGACCCACCTCGACTACCCCAGCCGAGATCTAACTATAGTGTCCCGGCTCCCTCACCCGCCACCCCTAGAGATTTCCCCAGTTAGCGCCTAGTTTCAAGCCAAAGCCCTTTAAATCCCTCTCGCAAGGGATAACAGGGCTCGGCCAGGCGCGGGTGTGAGGCTCCGCCCGGCCTCCTTCCCGAGTAGTCACTCACCGGCCAGGCGAAACTGAAAGGCAGCACGATGCGGTTGCGGTCGTTGCCGCGGCTGGCCTTGAGGTTGAAGGTGTTGCCCCCGATGACAGGCGTGGACCCTGAGCCGAAGCTGCAGGGCCCCCCGGCCGTGACGCGGGACTGATACTCCTTGAGGCACACTTTGAAGTATGTGTCACACTCGTCGCGGGTGCACTTGCGGTCTCCCGGGTTCCGGGCGCCGCCGCAGCAGTTCCCGTTCTGCAGCTCCCCGTTCACGTTCTGCATGGACAGGATCTCCAACTCGAACTGACCCGAGGCCCCACACACCTGCCGGCGAGGGAAGGAGGTAGGTCAGCGCGGGAGAAAGCTGTTTTCTTCGAGTATAGAGGTGGCGACTCCCTCCCACTCCCCGCCCCGACGAGCCCTCCTCGCCGAGTGAAAATAATTTTGCGAAACTACGTTCAAGGACTCAACATGATTCCGGGGCAAAAAAAAAAAAAAATGCACGAGTGCGGAAGAAATCCGACGACTTCCCGGGGGGCAACAGCGGAGCGAACGCGCCCCTGTCCGGCCTGGAGGGGTCACCCTCAGGAGGCAGGGGCTCCCGTGGGGGAGTTGGCGCGCTCAGCCCAGGTGCAGCCGCTCGGGCGCAGGGGCGAGGAGTCGGGCGCTCGAGGGCTGCCGAGCCTGCTCGCGGGGCTCAACCGCCCAGGGCGCCGCGAGGGGAGGGAGAGGACGGCTGGGAGGGAGGCCCGGAGAAGGGCTCCTACCTTGGCTCGCAGGGCACAGAGCAGGGCGAGCAGGAGGCTTAGGGGGCGCCCGGACCGGCCGCGCGTCCGTGGGGAACGCATCGCTGCGCCGCGCGCCGCGGGCACTCGGGACGCCGCCGCTGCTGTTCGCGCTGGTGCTGCCGCCGGTGCTGCCGTCGCCGCTGCCCCTGCGGCCGCCGCGTCCCGGCTCTAATATACTCCGCCGATTGGAGCATGCACGACTGGAAAACAACACCACTTTTCAAAAGCCCTTTCAAGAGCGGCCCGTTCCAGAAGGCAAAGAGCCCGGCCTCCTTTTATTATTCTGATCGCTTCTTTGAGACGCTCCCCCTCCTCTTCCACCTCCCGGCTTTCTTTCCTTCTCTCGCGCTCCCCTTCTTTTATTATTATGATTATGCGCAGCCTTTTATTCCCTTTTAGATCAGCTGCATGGAAAAAGGGGGGAGGGAGGGGAGAAAAAAAAAAACCAGCCTAGCTCGCGGGCCGGCCGCAGGTAACACAATGACGCGTGCCCGCCCGGCTCTCGGAGAAGGACCCGGAGAGCCCGTCTGGCAGCAGCGGCCGGGGCTGGCCACCTCTACCCAGCACGCCGGGCAGGGCGCATGCGCGCTTATTAATATTCATGAGAGGGCGTGCTCACCCTGGGCACGCCCCTCCCCTTCACGTTGCTGGGGAGGGGGTAGTGCGAGGAGGAACTTGGAAGGGGTTGGGGGCAGCGGGATGCTCAGGGCGGCGTAGAAGAACCAGGGCCCCACACCAACCCCCGCCCTCGGGAGCTTCGGGCCAGGAGGGAAGGGAGAGTGCGGGGAGGTACTTGGAAGGGATCGTTGCTCAGGGACGCCTGGAGGCCCCCAGCGGGGACCGCCCCCTCGGGCGCCCCGGGCCGTGCGCCTTTGCCCGCGCGTCGGGGCCCCAGGTGTAGGCGCCGCGGCGCTGACTGAGCGGTCGGAGCGGGGCAGCTTCCGCCTTCCGAACCGCCTGCGTCAGCTGCGGCTTTCGCCCCGGGAGGAGGGCCTGCCTGCCCGCCGGGAGTTCGGCCCGCTTCCCGCGAGCGAGCCGCCCAGAGCGCTCTGCTGGCGGCAGAGGCGGCGGCGAGGCTGGCGCGCTTGCCGCCGTCTGCTCGCCCCGCGGAGGCGACCTGGGCAGACGCTGCTGGGAACTTTGAAAAACTTTCCTGGAGCCAGGCTTGCCGCAGATTCGAGGGGAAGCCTCGGCCGCGTCCCACCCCCTCCCAAATCCGAGTCTGCGGAGCCTGGGAGGGCTCCCAGCTTCCTATCCAAACCGCGCCGGGGCAGAGGCGCGGGGAAACCGGGGGTAGAAGGCGGCGGGCACGCCGGGGCCCTGTTCAGGCTTTGGGAAGGGCCGGCGGAGATGCTGGTGGGCTTGGACGCCCTCCCCGGCCCGACGCCCCGGCCGCAGTGCCGGGATTGCACCTGTAGGCGGCCTCCGAGCAGCTCTCTGGGTGGCAAGAGATGGGCCTGGGAGGGACCGTGTCCCCAGCACCGCCAGCCGCGGAACTTGCCTTCTCTGGGGTGGCAGTGGAAACCGATACTGTTTTCCACCTTGAGGCAAGCCTCGCAATTAACAG
TCTAGGTCACTTTTCCTTGGCCAGCGAGGGAGCAAGCCTCCTTGTTTTCATGTTAGCCATCCCTCTGACCCTACTCTCCAAAATGAGCCTCAGCCAGGCTGCTGCTTTTCCACATCACTAATAAGATTCCTTTTATGGTCTTGTGAAAAGCGAGGGGCTCCAGACAGATCCTCCGGCAGGAGGGTGGAACCACCTGCAGGCCCCTTCCCCCTAAACTCCAAACACACGTTCAAGGGCAGTTTGAGTATTCACAGTCAGCTTGGGCCAGCCAGATTTAAACGCAGCCAGACTCTTTAGCTTAAAGTTCTCCCTAATAGGGGATTAACAAACAAGATAAATACTCTTGGTAAAAATGAAATCCCACAACAGAAACAGCCCTTGGACCTCAAGAGAGCTTCACAGACAGCGTTGGTTTTAATTTTTCTTTTTATAAACCCCTTTTCATGGCAGTTTTTGATAACTGTCTTATCTCACCCACAGCAGAGGGCACTTTATAATGCCAGCTCCTGTAATCGTGGATTTTAAGAGCCACCCCAAGCTTCATACACAGACACAGCCAGATAGTCTCCCCTCTGTCTCCTCCCAGAATCACAACCTAAGCCGGCGGACAGGAGGCAGCAGAGTGCACCCCATTAGAGCACGTGGTGGAAAGCAATGCTCTGGGGCACCGAGCTCCCCCTCTCACCACCCACCCTCCCAGCACAGGCTAGGCCAAGCCCCAGTCTTGGCAATGAGTCATGCCTCCTGGACAGCAGGAGCCAGGCAGAGGGCACACCCCCAACATTTCCCTTTCCTCCCCTTCTGCAATCGCACCCATCTTCCTTCCACCCATTTTGGGATGTTGCAAGGGCCTCGCTGCAGGATCTGCCAGCTGGGCCCGGGCCTCGAGCTCCTTTGGGGGCGGAATGGGGCGGGGGGATGAGGGCCTATCACTTACACCCTCAGGCACTACCTCCAGAAGACCACCCCTTCCAAGCCTTGGCACGGCCCCCGAAGGCTTGCGGGGGCCGTGCACCCGCCCTTCCCGGGGAAGTCTGCAAACACAGCTGTTCCAGAGCCCGGGAACCGCTGGAAGTGAGGCCACAAGAGCTACACCACTCGGGGGCGGGGGCAGGAAGGGGCCAGCAGCGGGCGGGGGTTCCCAGGTCTACAGCTCCTGTGAGGGCCCCAAGAACCTCCTCCTGCGGCGGCCGCCCCCGGCCCTTAAGCCGAACCTGGAGAGCGCCCCCGCACACACTAAAATCTCCCGGGGAGCAGCGGGAAACGGACTCCCCCACACCCTCCAGGAAGGACACACCCGCCCTCCCGGCCGTTCACGGGAAAGGGGAGGTTGCCAATTTGGACGGCGTTCGCAGGCCAGAACTGCGCCGAGTCGCCTTCCACGGCGCACCAGGTTTAATTAGTTAAGCAAAGAGATCAGCTACAACGATCTCTTGGCTTGGGGCCGGGAGAGTTACTCTGGGAACTTCAAGTTGCAAGTTTACACCGGCCTTCCTAGGAGCCTGGTCCCATAAACCCTCTGGGATCCCCACTTTTGTGCACTAAGCAAATAGCAGCAGGAATGGGACCCACCTCGACTACCCCAGCCGAGATCTAACTATAGTGTCCCGGCTCCCTCACCCGCCACCCCTAGAGATTTCCCCAGTTAGCGCCTAGTTTCAAGCCAAAGCCCTTTAAATCCCTCTCGCAAGGGATAACAGGGCTCGGCCAGGCGCGGGTGTGAGGCTCCGCCCGGCCTCCTTCCCGAGTAGTCACTCACCGGCCAGGCGAAACTGAAAGGCAGCACGATGCGGTTGCGGTCGTTGCCGCGGCTGGCCTTGAGGTTGAAGGTGTTGCCCCCGATGACAGGCGTGGACCCTGAGCCGAAGCTGCAGGGCCCCCCGGCCGTGACGCGGGACTGATACTCCTTGAGGCACACTTTGAAGTATGTGTCACACTCGTCGCGGGTGCACTTGCGGTCTCCCGGGTTCCGGGCGCCGCCGCAGCAGTTCCCGTTCTGCAGCTCCCCGTTCACGTTCTGCATGGACAGGATCTCCAACTCGAACTGAACCGAGGCCCCACACACCTGCCGGCGAGGGAAGGAGGTAGGTCAGCGCGGGAGAAAGCTGTTTTCTTCGAGTATAGAGGTGGCGACTCCCTCCCACTCCCCGCCCCGACGAGCCCTCCTCGCCGAGTGAAAATAATTTTGCGAAACTACGTTCAAGGACTCAACATGATTCCGGGGCAAAAAAAAAAAAAAATGCACGAGTGCGGAAGAAATCCGACGACTTCCCGGGGGGCAACAGCGGAGCGAACGCGCCCCTGTCCGGCCTGGAGGGGTCACCCTCAGGAGGCAGGGGCTCCCGTGGGGGAGTTGGCGCGCTCAGCCCAGGTGCAGCCGCTCGGGCGCAGGGGCGAGGAGTCGGGCGCTCGAGGGCTGCCGAGCCTGCTCGCGGGGCTCAACCGCCCAGGGCGCCGCGAGGGGAGGGAGAGGACGGCTGGGAGGGAGGCCCGGAGAAGGGCTCCTACCTTGGCTCGCAGGGCACAGAGCAGGGCGAGCAGGAGGCTTAGGGGGCGCCCGGACCGGCCGCGCGTCCGTGGGGAACGCATCGCTGCGCCGCGCGCCGCGGGCACTCGGGACGCCGCCGCTGCTGTTCGCGCTGGTGCTGCCGCCGGTGCTGCCGTCGCCGCTGCCCCTGCGGCCGCCGCGTCCCGGCTCTAATATACTCCGCCGATTGGAGCATGCACGACTGGAAAACAACACCACTTTTCAAAAGCCCTTTCAAGAGCGGCCCGTTCCAGAAGGCAAAGAGCCCGGCCTCCTTTTATTATTCTGATCGCTTCTTTGAGACGCTCCCCCTCCTCTTCCACCTCCCGGCTTTCTTTCCTTCTCTCGCGCTCCCCTTCTTTTATTATTATGATTATGCGCAGCCTTTTATTCCCTTTTAGATCAGCTGCATGGAAAAAGGGGGGAGGGAGGGGAGAAAAAAAAAAACCAGCCTAGCTCGCGGGCCGGCCGCAGGTAACACAATGACGCGTGCCCGCCCGGCTCTCGGAGAAGGACCCGGAGAGCCCGTCTGGCAGCAGCGGCCGGGGCTGGCCACCTCTACCCAGCACGCCGGGCAGGGCGCATGCGCGCTTATTAATATTCATGAGAGGGCGTGCTCACCCTGGGCACGCCCCTCCCCTTCACGTTGCTGGGGAGGGGGTAGTGCGAGGAGGAACTTGGAAGGGGTTGGGGGCAGCGGGATGCTCAGGGCGGCGTAGAAGAACCAGGGCCCCACACCAACCCCCGCCCTCGGGAGCTTCGGGCCAGGAGGGAAGGGAGAGTGCGGGGAGGTACTTGGAAGGGATCGTTGCTCAGGGACGCCTGGAGGCCCCCAGCGGGGACCGCCCCCTCGGGCGCCCCGGGCCGTGCGCCTTTGCCCGCGCGTCGGGGCCCCAGGTGTAGGCGCCGCGGCGCTGACTGAGCGGTCGGAGCGGGGCAGCTTCCGCCTTCCGAACCGCCTGCGTCAGCTGCGGCTTTCGCCCCGGGAGGAGGGCCTGCCTGCCCGCCGGGAGTTCGGCCCGCTTCCCGCGAGCGAGCCGCCCAGAGCGCTCTGCTGGCGGCAGAGGCGGCGGCGAGGCTGGCGCGCTTGCCGCCGTCTGCTCGCCCCGCGGAGGCGACCTGGGCAGACGCTGCTGGGAACTTTGAAAAACTTTCCTGGAGCCAGGCTTGCCGCAGATTCGAGGGGAAGCCTCGGCCGCGTCCCACCCCCTCCCAAATCCGAGTCTGCGGAGCCTGGGAGGGCTCCCAGCTTCCTATCCAAACCGCGCCGGGGCAGAGGCGCGGGGAAACCGGGGGTAGAAGGCGGCGGGCACGCCGGGGCCCTGTTCAGGCTTTGGGAAGGGCCGGCGGAGATGCTGGTGGGCTTGGACGCCCTCCCCGGCCCGACGCCCCGGCCGCAGTGCCGGGATTGCACCTGTAGGCGGCCTCCGAGCAGCTCTCTGGGTGGCAAGAGATGGGCCTGGGAGGGACCGTGTCCCCAGCACCGCCAGCCGCGGAACTTGCCTTCTCTGGGGTGGCAGTGGAAACCGATACTGTTTTCCACCTTGAGGCAAGCCTCGCAATTAACAG
Task1_train_27769
This genomic variant is located on Chromosome 20, within the JAG1 (jagged canonical Notch ligand 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Alagille syndrome due to a JAG1 point mutation
CTTCATACACAGACACAGCCAGATAGTCTCCCCTCTGTCTCCTCCCAGAATCACAACCTAAGCCGGCGGACAGGAGGCAGCAGAGTGCACCCCATTAGAGCACGTGGTGGAAAGCAATGCTCTGGGGCACCGAGCTCCCCCTCTCACCACCCACCCTCCCAGCACAGGCTAGGCCAAGCCCCAGTCTTGGCAATGAGTCATGCCTCCTGGACAGCAGGAGCCAGGCAGAGGGCACACCCCCAACATTTCCCTTTCCTCCCCTTCTGCAATCGCACCCATCTTCCTTCCACCCATTTTGGGATGTTGCAAGGGCCTCGCTGCAGGATCTGCCAGCTGGGCCCGGGCCTCGAGCTCCTTTGGGGGCGGAATGGGGCGGGGGGATGAGGGCCTATCACTTACACCCTCAGGCACTACCTCCAGAAGACCACCCCTTCCAAGCCTTGGCACGGCCCCCGAAGGCTTGCGGGGGCCGTGCACCCGCCCTTCCCGGGGAAGTCTGCAAACACAGCTGTTCCAGAGCCCGGGAACCGCTGGAAGTGAGGCCACAAGAGCTACACCACTCGGGGGCGGGGGCAGGAAGGGGCCAGCAGCGGGCGGGGGTTCCCAGGTCTACAGCTCCTGTGAGGGCCCCAAGAACCTCCTCCTGCGGCGGCCGCCCCCGGCCCTTAAGCCGAACCTGGAGAGCGCCCCCGCACACACTAAAATCTCCCGGGGAGCAGCGGGAAACGGACTCCCCCACACCCTCCAGGAAGGACACACCCGCCCTCCCGGCCGTTCACGGGAAAGGGGAGGTTGCCAATTTGGACGGCGTTCGCAGGCCAGAACTGCGCCGAGTCGCCTTCCACGGCGCACCAGGTTTAATTAGTTAAGCAAAGAGATCAGCTACAACGATCTCTTGGCTTGGGGCCGGGAGAGTTACTCTGGGAACTTCAAGTTGCAAGTTTACACCGGCCTTCCTAGGAGCCTGGTCCCATAAACCCTCTGGGATCCCCACTTTTGTGCACTAAGCAAATAGCAGCAGGAATGGGACCCACCTCGACTACCCCAGCCGAGATCTAACTATAGTGTCCCGGCTCCCTCACCCGCCACCCCTAGAGATTTCCCCAGTTAGCGCCTAGTTTCAAGCCAAAGCCCTTTAAATCCCTCTCGCAAGGGATAACAGGGCTCGGCCAGGCGCGGGTGTGAGGCTCCGCCCGGCCTCCTTCCCGAGTAGTCACTCACCGGCCAGGCGAAACTGAAAGGCAGCACGATGCGGTTGCGGTCGTTGCCGCGGCTGGCCTTGAGGTTGAAGGTGTTGCCCCCGATGACAGGCGTGGACCCTGAGCCGAAGCTGCAGGGCCCCCCGGCCGTGACGCGGGACTGATACTCCTTGAGGCACACTTTGAAGTATGTGTCACACTCGTCGCGGGTGCACTTGCGGTCTCCCGGGTTCCGGGCGCCGCCGCAGCAGTTCCCGTTCTGCAGCTCCCCGTTCACGTTCTGCATGGACAGGATCTCCAACTCGAACTGACCCGAGGCCCCACACACCTGCCGGCGAGGGAAGGAGGTAGGTCAGCGCGGGAGAAAGCTGTTTTCTTCGAGTATAGAGGTGGCGACTCCCTCCCACTCCCCGCCCCGACGAGCCCTCCTCGCCGAGTGAAAATAATTTTGCGAAACTACGTTCAAGGACTCAACATGATTCCGGGGCAAAAAAAAAAAAAAATGCACGAGTGCGGAAGAAATCCGACGACTTCCCGGGGGGCAACAGCGGAGCGAACGCGCCCCTGTCCGGCCTGGAGGGGTCACCCTCAGGAGGCAGGGGCTCCCGTGGGGGAGTTGGCGCGCTCAGCCCAGGTGCAGCCGCTCGGGCGCAGGGGCGAGGAGTCGGGCGCTCGAGGGCTGCCGAGCCTGCTCGCGGGGCTCAACCGCCCAGGGCGCCGCGAGGGGAGGGAGAGGACGGCTGGGAGGGAGGCCCGGAGAAGGGCTCCTACCTTGGCTCGCAGGGCACAGAGCAGGGCGAGCAGGAGGCTTAGGGGGCGCCCGGACCGGCCGCGCGTCCGTGGGGAACGCATCGCTGCGCCGCGCGCCGCGGGCACTCGGGACGCCGCCGCTGCTGTTCGCGCTGGTGCTGCCGCCGGTGCTGCCGTCGCCGCTGCCCCTGCGGCCGCCGCGTCCCGGCTCTAATATACTCCGCCGATTGGAGCATGCACGACTGGAAAACAACACCACTTTTCAAAAGCCCTTTCAAGAGCGGCCCGTTCCAGAAGGCAAAGAGCCCGGCCTCCTTTTATTATTCTGATCGCTTCTTTGAGACGCTCCCCCTCCTCTTCCACCTCCCGGCTTTCTTTCCTTCTCTCGCGCTCCCCTTCTTTTATTATTATGATTATGCGCAGCCTTTTATTCCCTTTTAGATCAGCTGCATGGAAAAAGGGGGGAGGGAGGGGAGAAAAAAAAAAACCAGCCTAGCTCGCGGGCCGGCCGCAGGTAACACAATGACGCGTGCCCGCCCGGCTCTCGGAGAAGGACCCGGAGAGCCCGTCTGGCAGCAGCGGCCGGGGCTGGCCACCTCTACCCAGCACGCCGGGCAGGGCGCATGCGCGCTTATTAATATTCATGAGAGGGCGTGCTCACCCTGGGCACGCCCCTCCCCTTCACGTTGCTGGGGAGGGGGTAGTGCGAGGAGGAACTTGGAAGGGGTTGGGGGCAGCGGGATGCTCAGGGCGGCGTAGAAGAACCAGGGCCCCACACCAACCCCCGCCCTCGGGAGCTTCGGGCCAGGAGGGAAGGGAGAGTGCGGGGAGGTACTTGGAAGGGATCGTTGCTCAGGGACGCCTGGAGGCCCCCAGCGGGGACCGCCCCCTCGGGCGCCCCGGGCCGTGCGCCTTTGCCCGCGCGTCGGGGCCCCAGGTGTAGGCGCCGCGGCGCTGACTGAGCGGTCGGAGCGGGGCAGCTTCCGCCTTCCGAACCGCCTGCGTCAGCTGCGGCTTTCGCCCCGGGAGGAGGGCCTGCCTGCCCGCCGGGAGTTCGGCCCGCTTCCCGCGAGCGAGCCGCCCAGAGCGCTCTGCTGGCGGCAGAGGCGGCGGCGAGGCTGGCGCGCTTGCCGCCGTCTGCTCGCCCCGCGGAGGCGACCTGGGCAGACGCTGCTGGGAACTTTGAAAAACTTTCCTGGAGCCAGGCTTGCCGCAGATTCGAGGGGAAGCCTCGGCCGCGTCCCACCCCCTCCCAAATCCGAGTCTGCGGAGCCTGGGAGGGCTCCCAGCTTCCTATCCAAACCGCGCCGGGGCAGAGGCGCGGGGAAACCGGGGGTAGAAGGCGGCGGGCACGCCGGGGCCCTGTTCAGGCTTTGGGAAGGGCCGGCGGAGATGCTGGTGGGCTTGGACGCCCTCCCCGGCCCGACGCCCCGGCCGCAGTGCCGGGATTGCACCTGTAGGCGGCCTCCGAGCAGCTCTCTGGGTGGCAAGAGATGGGCCTGGGAGGGACCGTGTCCCCAGCACCGCCAGCCGCGGAACTTGCCTTCTCTGGGGTGGCAGTGGAAACCGATACTGTTTTCCACCTTGAGGCAAGCCTCGCAATTAACAGCTACACTCCTGGTCATAATCAAGGTCGAAGAAAGCCCGTGGGCTGGCCGTAGCCTCTGCTAACCCCTCTCCCACGGGCTTGCTGTTGCATTTGAGGGGACCTTTATATGGAAACATCGACTTCCTTTGAAGGGTGGACAAAGTTTTGGCCCTAATAGTAGGTATGTCCTGCAGAAAAGCGTGACTATTCAGCGGCCGGTTTGGGGCTTGAGTTCTCCTGGGTGTGGGGCGTGATGGGCTGGCAATAGGTCAAGGGAAAATAGTTTCCAACATGCTGAGTTATGAGCATAAAAGGGTGGGTATTTGTGGTTATCTACTTATTGCATTTGATGGGAGGCTCAGTATGAACAATATTTTCAGTGCCAAATCTCATCATTCTGAGGAATAAACTAGGGCAGCTAACTGACCTCTTTACATAGGTTCAAAGCTACCAAGGATGGTTAGGAGTCTTGGCATTTTAACAGCCTAAGAAATGCTCCTAAGAAAAGTGCTTACTTAGTGGTAATGTGTCCCATCTTGAGCACTGGCGGGAGAATCCA
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Task1_train_27770
Given this context: Chromosome 20, gene TASP1 (taspase 1) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Suleiman-El-Hattab syndrome
TGGCTTCTCTCACCTTCTCTACTTCTCTATGGGGTTTTACCATGTTGGCCCGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAACTGATCTGCCCACCTTGGCCTTCCATGCTGGGATTACAGGAGTGAGCCACTGCGCCTGGCCTCAAATTACCATTCACCATCTGCACTGCTATCACATATCTACAGCAGGGTAATATGCTAAAATTTTTAAGTAGTTAATTGTGCATTTAAAATACATTAAAAGTATCTAGTTTCAGCACACTTTAAAAAATAATTAGCCTTTGATATAACTTGCTTTTGTATTTTGTTTCATTTGGGCTTGTCAAAAAGAACTGTTCTTTACCTCTCATCTGATACTTACATAGTTTCAAGTTTATTACATCTCCTCTATCCAAGCATTATAATCCAATTAAGCAACTGCATTTTCATATAAGCCCTTTTACTCCTTTCTTCCACACTCTTTCCTGATTTTCTAACTCTCAGAAGCTGTGTATTCACAAACTAGCCAAGTGAGGCAAACCAACACATAAATTTTACGGAAGTATTTCTTTTGCTCAGGACAGTTCTAAGTGCAGTGGCAGAATAGCTTCTAGATTGTTAGACGTAATATCCTGCTAACATAGTCCAGAACTATCCTTAGTTCTGTTGTTGCCATTTTGCTAACCAAAACAAACAGAAAACAGTGAGAAAGTCATGGGGACTATAATGCATCAAAGGTGACTCTGCTGGCTTTTCTCTCACCTTCTCTACTAGCGTATCCAAATCTGATATGCCAAGCTTGACTTTCCTATTGCAAACTTGACAAATACACAGGACTTTATAATGTAGAAAAATACCATGACCAGACAAAGGCTTTTACAATGAGTTAAAGCATTGTACATACGTTGAGTAATCATTCCCTATACAGCCCCTTGCACACTAGGCAGAGTAGCACAAAACTAGTTATTCTTCCCTTCCCCTTTTTCCTAGTCTAGGAATGTAAGCAGCTTAGAGCAGATCAAACAACACCACTTTGGGGTGTGCAGTGATATTCTCCATGAATTGGATCTCTCTGCTTCAAATAGTCACTAACCATCATGAAAAAAGTAACTGTGACACTGACTCTTCTTCAAATGTGACAAAGTACACAAAGCATAACAAGACACATTCCATCTATAAGATGCCACCCAAATACTGAGTTTAAATGAACCCTTGCAACTACTCCGTGAGAATATCCAATTCATCTGTTCACTCAACAAACATTTATTAAGCCCACAAGTAATGTGCCAAAATTGATTTATCCTCAGAAAGCTTCCTAGATCAAATAGATTGTTAAATTTCATTCTCAGTATAAAACTAAAAATGAGAGACGGGGGAAAGGGGCAAAGTGAAGAAGATGTGCAAGTGAACTGGGGACAAGCAAATTTTACATAAATTAGACCATCTCCATTTCTAGATTTGTTAAGTGGTATCATGTGTTGGTGACCTGAAATACTGGTTATTTTCTAAAATGGCTGAAATGCTGGATCAGAGGAGGGATGTAAAGGGCCAAATGTCACAATACATGGAACAGAGGAAATAAAAAATGTAACTCTAAAATCATTTCTCCAACTAAAAAGCAAGCAGTATAGTCAAGTAGAGCTTGTTCCTAAAGAGAGTGACATTTACAGAGAGAAAATGGAAACTGGCACACATTTATTAAATGTCTACTAAATACCCAGGCCAGTGCCCAGCCTGCTGAAAGGAGAAAAACTAGGATCAACGATTGTAAAGATGAGAAACAAACCAATTACTATGAGATAGGTTTTCTTAAAAAGAATTTTAAAAAGGTATTTGGTTGATGATTTATACTACATGTTAAAAAACAATGACATTCATTTTTTCTAAAGAAAAAATGTTCCCACTGGTTAAAAAATTGTGAGCTAAAAATTCCATGCTTTACTTTGAAAGGCTAGTTTAAAAAACCCATAATTACTTACCTGCCCAACTCTCCCCGGATGTTTCAAGGCCAAGCCTCCACTGGAGACAGCAGCAGCAACATTCCCTTCGTGGTCCACAACCACAGCGCCTACCGTGTCCAAAGTGCCTGAGTCATTTTCCTGCAGAGCAAAAGTGGCACAAGTATTCACTAGGCATGGAGTGGGACAATCTGATATGACTACATAGCACTTTTCCATACAATCATGACAGAACAAAATCTAAACTAATCCCTAAGTGGAACATTGAGCAATCTCCTAAAATTATCTATTATCAAGTTGCCATTTAAATCCTATTTAAGTCAAAATGTATTTTCCACCGAGAAATCCCAAACAAAAGGTATCCTGTTGCTTTTCTCTAATAATAAGGCTATAGTGTCTTTTTAATGGAGGAAATGTCACAATTTAATATAAATTACAGTATACAGCAGTATCTCTTCATTCTCAAGAATTAAGTTCATGTTTGAGAATGTGTAGAGGAAACCATCGGTGGCATAAATGAGCTAATAATAAATACTCTTGTTGGTATTTCTTTAAGTATTATATACAAACATCTAATAGAAATACATTCCACACAATAAATTAAGAAAATGGCATTTACAATCTTAAAGTATACCACACTATCATTTTTCTCTTAGAGTTCCTTGTTTGTGAGAAAATTTATGGCAAGCTCCCTTCTCTCCTATAACAGTAACATGCTTGCCAATTGTATGGCAGAAAAGTGTACGTTCTTGGAAGGTTTGTGTTTCAATGTTTTGTCCCAGGTCCCACATGTTTAAGGCACATAGTGATATTTACTGACTATGAGCCGCTGTCTCCTACCTCCAAAGTTTATGGGTCACCTGTGCAAGAGAGACAAACACTACACTACTGGATAGAAACAATGATTAAGGGAGGCAAGAAAAAAATTCATGGAAAAAGAAGTCTCATATATTAAAAAGGGGGGTTACGGTAGGTTTTTAGGTTAATAGTAGTCATGGTGGTGTTCTTATGCTAGGGCATTGGTTTTCAAACCTTGCCCTACAACCCTAGACCCCACCCTTACCCCCACCACCAGTATGCATGTAAGAGCCAGGCCCAACGCCGGGTTCAACATGAACAGCTCCTCATCCTGTGTGATTTATTGCTCACATTACTGAGCAGGACTTGGTTGGTACTGAGAGATCCCTAAGAAGCAAAATGACACACTAAAGCCATCACCAGAAAAGTCAATGAGCTCCCGGGCCCATCTCAGAAGTTTAGCAACATTGAAGAGTTTCTAAATAGTGGAAGCAGAATTCAAACAAGAGATGTTTCCCTAAAGCAAACTGGAAAACTCAGAAGTAGAGTGTGCCACAACAAAATTTTACATCAAGTCTGTTAGGAAAAGGTACTTACATCTAGAATTTATATTTCTTGCTCTAAATTCTAACTTCCCTTAAATATACTGATACACTATGACAGTACTTAGTTTGATAGGAAATGCTGAACTGGCTGAAATGAATGCTATATTCCTAATCCCTCTTTTAACCACAGCTAGGGAAAGTCTAGCCAATGGATCCACATGGTCATATCTCAGAATGACATAGTTCTGCTCAAGGCATGTGCCCTTCAAGAATACTTCCTGGCCTGAACTCCCTAAGGAAAGGTTTGATCCACTCCACATCACACTGAATGCAACAGACACTCAGGACATATTTATTTTTTAATTAGGATGCAGGATGTCTGTATCCCTGGTGGTACAAAACATGCCCAATAGTGAGTAACATGCAATGCCATCCCAATGTCAGGGCCAGTTTTCTACCTCTGTTTCGCAAGATTTGACTTCACGCAAATCCAGATGCTGCCGCTATCTTAGGGAAGACTTAACAATAACCAGACTTGCTCATTCAGGTTGGACAAAGCAAAGTCTGTCTTCTCTGGTAGGTAAGATTAAGAACAGCAGTACGGAAATGCATTAAAAACATTTTATTCCAGAAAAGATGGATAATCTTAAAGAGAAATATACTTTTAAGAGGAATATTTGTTTTATAATGCTAATAAATAATTTTATATCTTTGCAATCTTGGGTAGAGAAGTGTTAGTTCCCCAGATGCCAAGTTTGATGTCACCTTTAAGAAGGCTTCTCAAATTTTAATGTGCACACACATCATCAGGAGAATTTGT
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Task1_train_27771
Chromosome 20 houses a mutation in gene NDUFAF5 (NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 5). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Mitochondrial complex 1 deficiency, nuclear type 16
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Task1_train_27772
Gene FLRT3, MACROD2 (fibronectin leucine rich transmembrane protein 3| mono-ADP ribosylhydrolase 2) on Chromosome 20 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Hypogonadotropic hypogonadism 21 with or without anosmia
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Task1_train_27773
Here’s a variant in BFSP1 (beaded filament structural protein 1) located on Chromosome 20. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Cataract 33
CAAACCTTTTAATGGTGCATCTTCCAGAGCTCCGTTGGTTTTGTCTTTTGTTATAATCTCTTTTCTCCTTGGAACATTCTTGGGGAGGGCTTTTTGTCTTGGTTTTGCTGCTGTTATATCCTGCAGAGCTCTGGTAAGATCTGGAAAAACACACAGGCAGAAATTCAAGTATAATTGTCACTGAGAGAGAAAGAAAATACGCTGGTTGGAAAATAGGCTAACTCTCTCGGAAACAAACGCCTATAGTACTAGGGTGGGGCTTCCTTCATCTGGAGCAGAAGCAATGGAAGAAAGGCCCTGGCTTTGTTGCTCCATGGCCCAGGCTGAGGTCCAGCTGGGCGACTCTGGACAAGTCACTGGATGCCTTTGGGCTTCCAGAGGGAAGGTGCTCCCTGTTCTGACACCCACAGTTCACCACCACACCAGGCAGAACCTACCAAGGTATGCAAGGCCATTGTCCTGACACTCAATGGGAGCCCTAGCCCCTGTTCCCACTGCAGCCCCACTGAGCTCACAGCAGACACTTGGATCCACAGAAGCCCATTCCTCAAAGTTATTCTCTCCTCTGACTTCCTCAAAGGAGAGACGACAGAGCTACCTGGGGGCTTCTGACATGCTCAGATGGCCTTGGGCCTGGAGATGGAACCCGTTCACGGTGGATCTACCTCATTCCATAATTAGCTCAAGCTAGATAAATGCCACCCGGCTGTGATCAGCCTCCCCTTCCTCCCAGGCCAAGAGAAGAAGCGATGCTATGAAATTCAGAAATGACAGGAATCCCCTGCCCCAAGTCCACCCTCCTGCTTCCAGACTAGCTGAAAGGAAAAACTAAAAGTTGAAGAAAACACATAAAATTCTCACCTGGTATAATCTATGAGGCTTCCCGGCTCCACCCACATAGTGAATTTTGAACTTTTTCAGCCCAAAAGTCATCCCCTGCATCCCTTCCCACTGGTAACCACAGGGCAAGACCGATCAAGCACCGGCATCAAGCACGGCTGATTCACAATAAAAAGAGAGCCAGGTGAGCCGGCAACAGCAGACATGGGTCACAAAGCCACAGGTGCAAGGGATGCAGAGAGGGACAGGGCACAGGAAAACTGCTGGGAACTGGTATGCGAGGAGGAGGTGCTTACAGGACTGCACAGAATCTCAGGGCCCAGTGCCAAAAAAACCCACAAGACCCCTTGTTCCAAATTATTAAGAACTTCAGAACAGCATTAGCAGAGCATTCAGCCAAGCTGGGACCGTTCTGAGAGCAAGCCCCTGCAGGGCCGCTCGTCTGCAGACCTGGCCCTGGGCGTCCAGCTGCAAGGCTGTTCCCTTTCCAACCATGTTGACTCTGGAACACCATTTCCACAAAGCCCTCTGAGCTATCTGGAAATAAGGATTTCAAGGCCCTATATGCATGAGCATCCATATTACCACCTTCTCTTTTCTCCCCAAATGCTGCGCTTGTTCAGAACTGGGAGATTTCGATGTGAGGTGAGGTCTTACAGACCAAATGTTGAAGGCAGATGCCACATTTACCAGCCAAGCTGTTTCTGCCTGGTTTGAGGGAGGGGAGAATGAGAGATGACTGAGCAGCCACTCTGCACTGGACACCATGTTACACGCGTTGGCACAAACCCTTTGATTCAATGTGGGGAGGCGGTGGGATGTGATCCAGTGTTCACTTACTGCCGAGCGGAGGGAGCAAGAAGTGAATATTGAGTTGTACTTTTTGCCCAATTAAATGCCTTGTGTTGCAAAAGTTATTGCTGTCAAACCATAAAACAAATATAAAAATACAAAATAAATGCCTCACATTAGGGATGGCATGCCCAAGGTAGCCTAGCCCCCTAGTCGATTTTTCTCCTTATAAACTTCTCAGCTCAGTCACTTAGCAAGCCAGAGAGGGCAGAGGGTGGGAAGGAGTCCTCCTTCACATAAAAGCATTTAATTTCCAGATGGATCTGAAGCAAGCATGAATGTTAAAGTCAGGAAGAGAGCCGCTTGGTTTTTTTCAAGACAGAAAAAAACAGAAGTCCAGTGTTGGGGAGCGTTACCTTTCCCACCGGATCCAGTGCTGAGAGAGACTCCATGGCTCTGGGTGAACAGGGGAATGGGAGTTTCAATGAAGGCAGAGGTCAGCCTGGCAGAAAGAACCAGAAAGAACAAGCCAAACAGAGGTCAGGGGCAAGAGCGACTCTCGTTAATGTTGAGCAAAAATGAAAAAAAAGCTTTCTCTAGACCAAATTGCTCACGAATTAGATATCATTTTAAACAGACAGCCATACACACATTTACATACTGGATGAGGACATAAAGGAAGTGATCATTTCTTTGAGCTCAAGAGTCATAAACTGTGAAACATACCTATAAAAAATTGTAAAGTGGGGATTGCTTATAACCTAAAAATGCCACTTCTCCATGAGACAGTGCCTTTTTTATTTTTTTGCCTTTTGTTTTTTTGCCTTTTTGATTTTTTTAGTTAGAGTAGTCAACCCAGGCTGAAGTATTTAGGGCAAACAGAGTATGATATCTCCAACTTAAGATATATGTATATATACGTGTATGTATATATATATACACACACACACGTATATATACGTGTGTATATATATATACACGTATATATACGTATATATATACACACACGTATGTATATATGTGTGTATATATGTATATGTGTGTGTATATGTATATATACGTATATATATACGTGTATATATATACGTATATATACATATACACACACATATATACATATATACATATATCTACTCATATATACGTATATACATATATACATATACATGTACACACACACATCATATATAAATAGAGAAAAAATGATAAAGCAATTGAGATAAAATATAAACAACTGGTGAATCTGGAGTATTCAGGAGTTCCTTGTTCTATTCTTGCAACATTTCTATCAATTTAAAATTAGACCAAAATCAGAACTTATAGATAAATAAAAGAGGTATCCAGTCACCTTTCTGTGAAGCCCTGTCCCAAAACAAAAATGTTTACAAAGTCACCGAAATGCCAGCTCCAGACTTATTCTTGCAGATGTGTGCATAGTGTTCACTGTGACATAAATATAATGTGGAATCATGCCAGATACACCGACCAGCACTGGAGAAAGAAAAATAAAATCCTGCTTCTCCTGCCAAGCATTCGAGTGCTCACAGCCAAGAGAGAGCACCCAGCGCGAAGGGAAGAGCTGCTCCTGGTGGGGACCTCAGTTGTGGGGGGCTTCTCTTTTCATTCAGTCGAAACCCAGGAATTTAGCAAGACTGAAGTGAAGAATCACAAATTAATTCCCAACCCGTTCTCTGGAAATCACCGTAGCTATGAATACCAGCATAGCTGGAGAGAAAGAGAGAATTTCCCAGCTTTCTTAAAGTGAGTAGGGATCGACTCACAGCTCCATTATGGAGAAGACCAGACAGCCACATAGTCACAGCCACAGACTGACTCAGCAAGGTGCTAAGAATTGTGAGGATGGCAGCAGGAGCATCACCAACACCTCTGAGTGCCCTCAAGTGCCAGGCTCCGTGCCACGTAGCTCACCTGCAGCACCTCATTAAATACTCCTGGGCATCCCACCTGCTGGGACACTTATGTCCCCAGAGGCCTATGAGCAAAACACAGGCTTCTCAGTGAGGCCTTTTCTGACCACCCTACTTAAAACTGCAAGCATTCCCCCATCACCCCTATTGCCACCACCCTCCTCCCTGCGGGAACTTCCTCCTCAGCACTGGTCGTACCTTCATCCTCTGTCTCCCCTACTAGTTATCCAACACCCATGGGGTCAGGAATTGTTCTGTTTCCTTCCCTGACACATGCCCACTGCCTATAACTGTGCCTGGCACACAATAGGCACTCAATAAAGAGTTGTGGAAGGAATAAGTGGCCTGGATGGGGAGGGCACACGCTCACCTGTTGCCTTCAATCTCGATGATACGATGATACCGGTCCAGCTCATTCTTCAGGGTTTGCTGGGCGACCGCCAGCTGCCGGCAGTCGTAAGAAGACTTCTCCAGGACCCGCTCTGTCTCCTCAATCTCCTTGCGCAGTGTCTCAATCTGCTCGTTATAAAGCTGAA
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Task1_train_27774
Given a variant located on Chromosome 20 and affecting MGME1 (mitochondrial genome maintenance exonuclease 1), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Mitochondrial DNA depletion syndrome 11
CTGCCTGTCCAGCTTTTTGCTTTGGGGCAAATTAACAGCACTGCCTGGTGGGATAGGGCCTCATTCATTAAAATGGGGGTAACTTACAATCCCTATTTTGCTGGGTTGTTGGGTTTGAAAATTAAATAATGTTTTGAAAGCTCCAAGGCCATTGCTTAGCATAACAGTCCCCCCTCTTTCTCTCCTCTTACTAAGAAACAAGTGAATATATTTCTTGTGTTTGTTGAGTCTCTTTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTGAGTAGAGACTGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTAATCCGCCTGCCTTGGCTGCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCATGTTCCCTTTTTTAAAATGTGTATGAGGAGGGGGCTTACTATGCAAGCGCTTGGAGGCCAACGAGCACTGAAAATGAGGAGAGAGTTCAAAAATCAAGTTAGATCCTGGGATACGCCAACAAATCCAGACACTACAGTTCTTTCGGAGAAACCTGGGGACGAAAAGTAAGGCTTTGACCTCAGAAAATGAACATACAGGAAAAATAATGTGTCCTAATGTGTCCTAATGAAATTTCTCTAGTATTCACATGTTATAAAATGTTAGGAAGAAAGAAGATGTGTCCTCCTACAAGCCATAAATCAGAATTCTAATAATCTAAAGCTAATTAGAAAAATATTACATGTTAAATATTAAATATTAGAATAGAAAAATGTATGAGGGAAAAAAATTGAGACACAGCTGAATTTTTCAGGCTGTTCCAGCACTAAAAAAAAAATACAGGAGAAGAATGTCACATATTTTCCTCTTCCTCCCCCTCCAGATTCCATAATATCAAATTCATAACTTTTCATTTGCGCATGCCTTATTTTCCATTCCTTGTTTGTCACTAATCCTGTTAGTAAAAGGATTCCCCCACCTATGTTCATAATTAAGTTTTGGTCTAAAAAGAACTACAAACAGAAGCACAGTTCCCTAGATTTCTAATTTTTTTTTATTTTATCACAGCCAGTTAACTTATTACATTGGATACTTAAACACATAGTACCATAAACTGGATGTGGTCTTGTAGCCGCCAGATCTTCAGTTTTGACTTTGGCCCAATTCTCCTAGAAGTACTTAATTTTAATTCATTTTATTACCTAACGTCCTATTAATAATCCCGTTGGTTTCAAAGTATATTCTTAGGTTTCACAAGAGGCTGAAATTTGGTCTTAGGGGTTGTCACTTAAAAATAACTAATGTAATTTTTGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAGTCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCACCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAGTAGAAAAATTAGCCAGGCACGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGACCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAATATCGCCCACTACACTCCAGCCTGGGCGACAGAGGGAGACTCCATCCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATGTCATTTTTAATTGTATTGTTTCAGGGCGTTTTAGAGTATTTGTTTTTCAGTGTTAGCTTTGTTTGTGTTTCCCCCCTCCCCTTTTCCCTGATTTTCTTTTCAGACGTCTTTTTACAAGGGAAACGGTTCCACGAAGCCTTGGAAAGCATACTTTCACCCCAGGAAACCTTAAAAGAGAGAGATGAAAATCTCCTCAAGTCTGGTTACATTGAAAGTGTCCAGCATATTCTGAAAGATGTCAGTGGAGTGCGAGCTCTTGAAAGTGCTGTTCAACATGAAACCTTAAACTATATAGGTCTGCTGGACTGTGTGGCTGAGTATCAGTAAGTATGAGATTGGAGGTGAATTAATACAGCGTAGGACAGATGGTGCCTGTCAAAGGTGTGCCTGTAGGTACTGTAGCCTCTGTCTGTTTAATGTCCAGACCTTTGTGCTAGGTAAAAGAATTGGGTGGGGCGGGGTTGAGAACAGGTACAAGGAGAAGAGCCACGTAACCTTTGTCATCCAGTACTCCAAAATCAAATTGTTTGCTGGAGAAAGGTATATTCTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTGTCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCCAGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCGCACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAAGTGATCCATCCACCTTGGTTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGCCGAGATTTTTCAATCTCCCTAACATGGCCTGTTTGCCAGCCTGTCCTTCCCCTCCCCCAAAGCAAGGTACCTGCCATAAGATCCAATTTCATTCCTGCGTTTTCTTTCCTGTTTTTCTAAAGATAGCACCATGATCTGTTGGTTCTGAAAATCAACTCTTCCTGGCTTCCAGGCAGTGCTTGACATGGATCAGAGATCTGAACTTACTAAAGCTTCCCATGGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTCGTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTAGGTTCAAGCTATTATCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGTGTGGCTGATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGTAGGCATGAGCCACCACGCCCGGTCCCCATGGTTTTTATATCGTAGCTGTCTTACTGTTTTACTCAGGTACTTCAGAGTCCAAGTGTTACAGGAAAGGGGTCCTGATCCAGACCCCGAGAGGGTTCTTCGATCTCGGGCAAGAAAGAATTTAGGTTGAAGGCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTAGCCAACATGGCAAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGTGTGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAGGCAGGAGAATCACTTTAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAACCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGCATTCAGGATGAGTCTGCAGTGCAAAGTAAAAGCAGGTTTATTAATAAAGTAAAGTAGTGGAAGTATAGCTACTCCATAGACAGAGCAGGGCGTTCCTGAAAGTAAGAGGAGGAACACTTCCACCCTAAGTACAGTGCTCATATATATAAGATAAAAAAAGAGATCTTGGGGAGATGTGCTCTACTGCAAGGGTTTGTGATAAAGGATTAATTTTCTTAATTATTATATTTTGCAAGAATCGATACTATCTTTAAAGCAAAATTAGGAATGCCTTCGTTCTCCAGATATCAGGGTATCTGGACACTCCCAAGTCTGGGTCTGTTTAGTAAACATTATTAATTTGTTCCCTTAACCTTAAACATCTAGAGGCTATGAATGCCTGACTTTCTGGGAATGCAGCCCAGCAAGGCCCAGCCTCACTTTCCTAGCCCTCACTCAAGATGGAGTTGCTCTCGTTCGAACGCCTCTGATACAAAGGTGGCTACAACCTGCAGGTACCCCTAATCCA
CTGCCTGTCCAGCTTTTTGCTTTGGGGCAAATTAACAGCACTGCCTGGTGGGATAGGGCCTCATTCATTAAAATGGGGGTAACTTACAATCCCTATTTTGCTGGGTTGTTGGGTTTGAAAATTAAATAATGTTTTGAAAGCTCCAAGGCCATTGCTTAGCATAACAGTCCCCCCTCTTTCTCTCCTCTTACTAAGAAACAAGTGAATATATTTCTTGTGTTTGTTGAGTCTCTTTGTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGAATTACAGGCATGCGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTGAGTAGAGACTGGGTTTTACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTAATCCGCCTGCCTTGGCTGCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATAAGCCACCATGCCCGGCCATGTTCCCTTTTTTAAAATGTGTATGAGGAGGGGGCTTACTATGCAAGCGCTTGGAGGCCAACGAGCACTGAAAATGAGGAGAGAGTTCAAAAATCAAGTTAGATCCTGGGATACGCCAACAAATCCAGACACTACAGTTCTTTCGGAGAAACCTGGGGACGAAAAGTAAGGCTTTGACCTCAGAAAATGAACATACAGGAAAAATAATGTGTCCTAATGTGTCCTAATGAAATTTCTCTAGTATTCACATGTTATAAAATGTTAGGAAGAAAGAAGATGTGTCCTCCTACAAGCCATAAATCAGAATTCTAATAATCTAAAGCTAATTAGAAAAATATTACATGTTAAATATTAAATATTAGAATAGAAAAATGTATGAGGGAAAAAAATTGAGACACAGCTGAATTTTTCAGGCTGTTCCAGCACTAAAAAAAAAATACAGGAGAAGAATGTCACATATTTTCCTCTTCCTCCCCCTCCAGATTCCATAATATCAAATTCATAACTTTTCATTTGCGCATGCCTTATTTTCCATTCCTTGTTTGTCACTAATCCTGTTAGTAAAAGGATTCCCCCACCTATGTTCATAATTAAGTTTTGGTCTAAAAAGAACTACAAACAGAAGCACAGTTCCCTAGATTTCTAATTTTTTTTTATTTTATCACAGCCAGTTAACTTATTACATTGGATACTTAAACACATAGTACCATAAACTGGATGTGGTCTTGTAGCCGCCAGATCTTCAGTTTTGACTTTGGCCCAATTCTCCTAGAAGTACTTAATTTTAATTCATTTTATTACCTAACGTCCTATTAATAATCCCGTTGGTTTCAAAGTATATTCTTAGGTTTCACAAGAGGCTGAAATTTGGTCTTAGGGGTTGTCACTTAAAAATAACTAATGTAATTTTTGGCCGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAGTCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGCAGATCACGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCACCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAGTAGAAAAATTAGCCAGGCACGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGACCCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAATATCGCCCACTACACTCCAGCCTGGGCGACAGAGGGAGACTCCATCCAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATGTCATTTTTAATTGTATTGTTTCAGGGCGTTTTAGAGTATTTGTTTTTCAGTGTTAGCTTTGTTTGTGTTTCCCCCCTCCCCTTTTCCCTGATTTTCTTTTCAGACGTCTTTTTACAAGGGAAACGGTTCCACGAAGCCTTGGAAAGCATACTTTCACCCCAGGAAACCTTAAAAGAGAGAGATGAAAATCTCCTCAAGTCTGGTTACATTGAAAGTGTCCAGCATATTCTGAAAGATGTCAGTGGAGTGCGAGCTCTTGAAAGTGCTGTTCAACATGAAACCTTAAACTGTATAGGTCTGCTGGACTGTGTGGCTGAGTATCAGTAAGTATGAGATTGGAGGTGAATTAATACAGCGTAGGACAGATGGTGCCTGTCAAAGGTGTGCCTGTAGGTACTGTAGCCTCTGTCTGTTTAATGTCCAGACCTTTGTGCTAGGTAAAAGAATTGGGTGGGGCGGGGTTGAGAACAGGTACAAGGAGAAGAGCCACGTAACCTTTGTCATCCAGTACTCCAAAATCAAATTGTTTGCTGGAGAAAGGTATATTCTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTGTCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCCAGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGCACCACCGCACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAAGTGATCCATCCACCTTGGTTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGCCGAGATTTTTCAATCTCCCTAACATGGCCTGTTTGCCAGCCTGTCCTTCCCCTCCCCCAAAGCAAGGTACCTGCCATAAGATCCAATTTCATTCCTGCGTTTTCTTTCCTGTTTTTCTAAAGATAGCACCATGATCTGTTGGTTCTGAAAATCAACTCTTCCTGGCTTCCAGGCAGTGCTTGACATGGATCAGAGATCTGAACTTACTAAAGCTTCCCATGGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTCGTTTTGTTTTTTGAGACGGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATTTCAGCTCACTGCAACCTCCATCTCCTAGGTTCAAGCTATTATCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGTGTGGCTGATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTTCGGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTGTAGGCATGAGCCACCACGCCCGGTCCCCATGGTTTTTATATCGTAGCTGTCTTACTGTTTTACTCAGGTACTTCAGAGTCCAAGTGTTACAGGAAAGGGGTCCTGATCCAGACCCCGAGAGGGTTCTTCGATCTCGGGCAAGAAAGAATTTAGGTTGAAGGCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTAGCCAACATGGCAAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGTGTGTGCCTATAGTCCCAGCTACTCGGGAGTCTGAGGCAGGAGAATCACTTTAACCCGGGAGGCAGAAGTTGCAGTGAACCGAGATGGTGCCACTGCACTCCAGCCTGAGCAACAGGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAATAAAAGAAAGAAAAGAAAAAGCATTCAGGATGAGTCTGCAGTGCAAAGTAAAAGCAGGTTTATTAATAAAGTAAAGTAGTGGAAGTATAGCTACTCCATAGACAGAGCAGGGCGTTCCTGAAAGTAAGAGGAGGAACACTTCCACCCTAAGTACAGTGCTCATATATATAAGATAAAAAAAGAGATCTTGGGGAGATGTGCTCTACTGCAAGGGTTTGTGATAAAGGATTAATTTTCTTAATTATTATATTTTGCAAGAATCGATACTATCTTTAAAGCAAAATTAGGAATGCCTTCGTTCTCCAGATATCAGGGTATCTGGACACTCCCAAGTCTGGGTCTGTTTAGTAAACATTATTAATTTGTTCCCTTAACCTTAAACATCTAGAGGCTATGAATGCCTGACTTTCTGGGAATGCAGCCCAGCAAGGCCCAGCCTCACTTTCCTAGCCCTCACTCAAGATGGAGTTGCTCTCGTTCGAACGCCTCTGATACAAAGGTGGCTACAACCTGCAGGTACCCCTAATCCA
Task1_train_27775
A variant on Chromosome 20 in gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
CTCCCTGCCGCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTCATCCACCGGCCTCGGTCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAGTGCCTTTTAATAAAGAACGTTTTGAGAGAGAGACGGTTATTTAATGAAATCTGCTGACATACTTGCTGAGAGTTGTGATAGAACTTGCTTTCATTCCGACTTTAGTTATCCCTTTGCTTCCCATGAAGCTCCAGAGTGCTTCCTGTGCACACAGTGCTTCAGGTTCTTGCCGTTGCCAGAAATAAACAGATTTCTTAGAGTTTCAGTTGGAGCAAACATTGGAATTCTTGTGTTCTGGGCTTTATGTAGTAGAGTAATTCATTTGCTTTTCTAGCCATGCAATATTATTGCCTTAATCAAAATTATTTACAGTATGGTACTTCCCAAAATAACAGACAGTTGTTATCCATATTCAGGAAGTGGGCGCGAGAGGCCACTTTAATTTGATAGACTCTTTAATTTGCCTTTTTACTACTTTTCTTGAGGGGCTTGTTCCCTTGAACCCCAATAGCTGAGTTGTGTGTTACCCTAGATTTTAGGATATGAACAGGATGTATAAATACTCAATGAAGTTGGGATCATCTGGGTTTGAGAGTTTAGCCTGTAGGACAGTTTTACTGACCACAGTCTTCATTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGTGCAATGGCATTGTCTCGCCTCACTGCAATCTCTGCCTCCCGAGTTCAGACGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGAGTATAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTTGACCACAGCCTGTCAAGGCATGAACATAAGCAACCGTGGTGAGGAAAGAGGTTCTGGTGAGACTCAGCATAATAGTAATTTTGGTAATACCAAGTAGAAATAATTTAGCTCAAAACTGGTTCCCATTATGAACCAAACTTGAAGATCAGTATCCAGCTCTTTTCTCCAAAGTTAACAAAGTGCGGAAGGGAATGAGCACCCCCCCGCTACTGAAAAAAAAATCACTTGGAATGTAAAATTTAATAGAGGAAGAAAGGAAGGAGATTAGAGAGGAAGATAGTTGGATGCCGAAACAGGGTTCAAGACTTACCCTTGAGCAAGGGGCTGAAATTGGCTTGACTGATAGGACGTGTGATCTGTGAGGAGGTTTGAAGTAGTAGTGTTTAACTACATGTAGTTTGGAGATGATCAGGTGATTGTAAACCTCCCACTCCTTTGATTTATTTTTAAGTGCTTGAAAGGAGAGGTGAGAAAGGAGCAGTGATCAATGATAACTGTGCGGTTAACTGACTTTTGGGTATCAGATGGAAAAGAAATACTGTCATTCTACAGCAACAGGTTCTTCCCAAGTATTTAAGAAACACTGTGTTAGTTGGGCCGGGTACAGTGGGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCACAGGCTTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATGGGAAAAAAAGAGAAACACTGTGTTACATGACCCATCTTCTTTTTTTGACATTTAGTTCAGAATTTCACATACCATTAAGGTAATTAAAGTTTTATCTTCAGTTCCCTTTTAGACTATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAACGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCCTTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAGACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGGTATGGATTCTTTTGAAACTGGTAAAAATGATAAATACAATATATTATGAATTTTATGTGATGCTCATAAAAGTCATTAAATTTGGGCAGGTCATCAAATTTGTGATAAGTAGTAGATGATGAGACTCCTAAACGATTCTTGTGGTGAGTAGTAAGTGGTGAATATTTGTAGAAATCTCCCTGGCCTGATAATTCCAGATAAAATTGGAATCTTACAGGAATGAGGTAGAGGTAGAGGGAGAGGATTTGTAATTCACTTTTTTTTTGGCTGATAATCAGTTTGCTTTTGGCTTAACTGTAGACTTTATTGATTCCTCTTAAAGTAATTTCCCAGAAGAATTCGAAAGCTTAGACCGTCTTCTCATGCTTCCCGGGTACAGTGATGCTATATGGCAAGGAGAAGTAGCAGGCAGAAGAAATTTTAACTGTTAACAATTTGTTAAGTGTAATTTTTTTTTTTTTTGTGCCTGAGATAGTGACCTATTTCTTTTAAATGTGGGCATTATTTGAAATGATTTTTAAACAGGTAGAGAGTGTCATAAAATTTTTATATGAGGGAACATTTTTTACTTCATTCTCATTGCTTTTATTTAATGTGCCCATATGTGAATGCATAGCCACTGGTTATTAATTTTCTAAATGTAGAAAATAAGGGAAAAGTAACTGAAGCATTATCTTGAACCAATTTGAGGAAGTGAAATGTGCTTGCCCAACTTTTCTTAAAATGGGCTAAGTCAGGTTAAAAATCTAGAAGCATTTTCCTGTGTGTGAAATATGCTTTTAATGTTGGAATTTAGTAGTTTCACATAGCCGGACAATAAAGATGTTAGAAAAAAATCATGAAGAGTATGTTAAGATAAAAGGCAAGAGAGAAATAATGTATAATTTATATAAATCATGACATTTAAAAAATTAGGAAATTGGAAAAGAGAAAAAGATTTAGTATTTCTTCACTGTGGCTGTTTGATGGAAATTGTGGTGTACTTAGCCAGAATTCTAACTGCGGTGAACGTTTTGCATACTCATACTTATGCATACACATAGAAACACTTACTTGTGTGATTTACTGAACTTGAAATTTACAAATGAACGCTTTCTACCTTAAAAATAAAAATTTTATTTTAAAAATAAAAGTGGTACCTACTTATAATATTTATCTTTCTCACAGTCAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGGTATGTGAATTATTTTTAAAAAATGTTATATGTTTTATTTTAGTTGTATTATGAAAAAAATTAAGTTAGGTTGAATTTGTGTTTACACTGGCAGTGAGCAGTTTCTGCTGAACTCAGGGTGATAACTTTTGTTAAGCACAATATTGAATTTGAACATTTGTGGTTTATTCTGTTGAGTGGTTTTCTTGAGTCCTTGTCATTTGCTTGGGGCTGGGGAGGGGGTGTTCATTGAATTCCCTTTTCTTACACATTTTCTGTAGGCAGTGAATCTGTGACCCAAAGAAAGCACCTGTTTTTCATATTTCTCTTGACTTCAGTATATTCTGATTGGATAGTGTATATTACTGAATTTTCATTTTCTGATCTTTCTAACTTTTAGAGTCCAGGTATCAGTGTTGAGCTTCTTTTGATTTAAAAATTTTAAAAGTACCAAACTAGAAGGAGCTCACAAATCACAAGAGAGACTTCTCTATAAAAGTAACTGTGCGGCCAGGCCTAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAAATCGAGACCATTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCCGGGCGCGGTGACTTA
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Here is a genetic alteration in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Cowden syndrome 7
CTCCCTGCCGCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTCATCCACCGGCCTCGGTCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAGTGCCTTTTAATAAAGAACGTTTTGAGAGAGAGACGGTTATTTAATGAAATCTGCTGACATACTTGCTGAGAGTTGTGATAGAACTTGCTTTCATTCCGACTTTAGTTATCCCTTTGCTTCCCATGAAGCTCCAGAGTGCTTCCTGTGCACACAGTGCTTCAGGTTCTTGCCGTTGCCAGAAATAAACAGATTTCTTAGAGTTTCAGTTGGAGCAAACATTGGAATTCTTGTGTTCTGGGCTTTATGTAGTAGAGTAATTCATTTGCTTTTCTAGCCATGCAATATTATTGCCTTAATCAAAATTATTTACAGTATGGTACTTCCCAAAATAACAGACAGTTGTTATCCATATTCAGGAAGTGGGCGCGAGAGGCCACTTTAATTTGATAGACTCTTTAATTTGCCTTTTTACTACTTTTCTTGAGGGGCTTGTTCCCTTGAACCCCAATAGCTGAGTTGTGTGTTACCCTAGATTTTAGGATATGAACAGGATGTATAAATACTCAATGAAGTTGGGATCATCTGGGTTTGAGAGTTTAGCCTGTAGGACAGTTTTACTGACCACAGTCTTCATTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGTGCAATGGCATTGTCTCGCCTCACTGCAATCTCTGCCTCCCGAGTTCAGACGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGAGTATAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTTGACCACAGCCTGTCAAGGCATGAACATAAGCAACCGTGGTGAGGAAAGAGGTTCTGGTGAGACTCAGCATAATAGTAATTTTGGTAATACCAAGTAGAAATAATTTAGCTCAAAACTGGTTCCCATTATGAACCAAACTTGAAGATCAGTATCCAGCTCTTTTCTCCAAAGTTAACAAAGTGCGGAAGGGAATGAGCACCCCCCCGCTACTGAAAAAAAAATCACTTGGAATGTAAAATTTAATAGAGGAAGAAAGGAAGGAGATTAGAGAGGAAGATAGTTGGATGCCGAAACAGGGTTCAAGACTTACCCTTGAGCAAGGGGCTGAAATTGGCTTGACTGATAGGACGTGTGATCTGTGAGGAGGTTTGAAGTAGTAGTGTTTAACTACATGTAGTTTGGAGATGATCAGGTGATTGTAAACCTCCCACTCCTTTGATTTATTTTTAAGTGCTTGAAAGGAGAGGTGAGAAAGGAGCAGTGATCAATGATAACTGTGCGGTTAACTGACTTTTGGGTATCAGATGGAAAAGAAATACTGTCATTCTACAGCAACAGGTTCTTCCCAAGTATTTAAGAAACACTGTGTTAGTTGGGCCGGGTACAGTGGGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCACAGGCTTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATGGGAAAAAAAGAGAAACACTGTGTTACATGACCCATCTTCTTTTTTTGACATTTAGTTCAGAATTTCACATACCATTAAGGTAATTAAAGTTTTATCTTCAGTTCCCTTTTAGACTATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAACGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCCTTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAGACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGGTATGGATTCTTTTGAAACTGGTAAAAATGATAAATACAATATATTATGAATTTTATGTGATGCTCATAAAAGTCATTAAATTTGGGCAGGTCATCAAATTTGTGATAAGTAGTAGATGATGAGACTCCTAAACGATTCTTGTGGTGAGTAGTAAGTGGTGAATATTTGTAGAAATCTCCCTGGCCTGATAATTCCAGATAAAATTGGAATCTTACAGGAATGAGGTAGAGGTAGAGGGAGAGGATTTGTAATTCACTTTTTTTTTGGCTGATAATCAGTTTGCTTTTGGCTTAACTGTAGACTTTATTGATTCCTCTTAAAGTAATTTCCCAGAAGAATTCGAAAGCTTAGACCGTCTTCTCATGCTTCCCGGGTACAGTGATGCTATATGGCAAGGAGAAGTAGCAGGCAGAAGAAATTTTAACTGTTAACAATTTGTTAAGTGTAATTTTTTTTTTTTTTGTGCCTGAGATAGTGACCTATTTCTTTTAAATGTGGGCATTATTTGAAATGATTTTTAAACAGGTAGAGAGTGTCATAAAATTTTTATATGAGGGAACATTTTTTACTTCATTCTCATTGCTTTTATTTAATGTGCCCATATGTGAATGCATAGCCACTGGTTATTAATTTTCTAAATGTAGAAAATAAGGGAAAAGTAACTGAAGCATTATCTTGAACCAATTTGAGGAAGTGAAATGTGCTTGCCCAACTTTTCTTAAAATGGGCTAAGTCAGGTTAAAAATCTAGAAGCATTTTCCTGTGTGTGAAATATGCTTTTAATGTTGGAATTTAGTAGTTTCACATAGCCGGACAATAAAGATGTTAGAAAAAAATCATGAAGAGTATGTTAAGATAAAAGGCAAGAGAGAAATAATGTATAATTTATATAAATCATGACATTTAAAAAATTAGGAAATTGGAAAAGAGAAAAAGATTTAGTATTTCTTCACTGTGGCTGTTTGATGGAAATTGTGGTGTACTTAGCCAGAATTCTAACTGCGGTGAACGTTTTGCATACTCATACTTATGCATACACATAGAAACACTTACTTGTGTGATTTACTGAACTTGAAATTTACAAATGAACGCTTTCTACCTTAAAAATAAAAATTTTATTTTAAAAATAAAAGTGGTACCTACTTATAATATTTATCTTTCTCACAGTCAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGGTATGTGAATTATTTTTAAAAAATGTTATATGTTTTATTTTAGTTGTATTATGAAAAAAATTAAGTTAGGTTGAATTTGTGTTTACACTGGCAGTGAGCAGTTTCTGCTGAACTCAGGGTGATAACTTTTGTTAAGCACAATATTGAATTTGAACATTTGTGGTTTATTCTGTTGAGTGGTTTTCTTGAGTCCTTGTCATTTGCTTGGGGCTGGGGAGGGGGTGTTCATTGAATTCCCTTTTCTTACACATTTTCTGTAGGCAGTGAATCTGTGACCCAAAGAAAGCACCTGTTTTTCATATTTCTCTTGACTTCAGTATATTCTGATTGGATAGTGTATATTACTGAATTTTCATTTTCTGATCTTTCTAACTTTTAGAGTCCAGGTATCAGTGTTGAGCTTCTTTTGATTTAAAAATTTTAAAAGTACCAAACTAGAAGGAGCTCACAAATCACAAGAGAGACTTCTCTATAAAAGTAACTGTGCGGCCAGGCCTAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAAATCGAGACCATTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCCGGGCGCGGTGACTTA
CTCCCTGCCGCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTCATCCACCGGCCTCGGTCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAGTGCCTTTTAATAAAGAACGTTTTGAGAGAGAGACGGTTATTTAATGAAATCTGCTGACATACTTGCTGAGAGTTGTGATAGAACTTGCTTTCATTCCGACTTTAGTTATCCCTTTGCTTCCCATGAAGCTCCAGAGTGCTTCCTGTGCACACAGTGCTTCAGGTTCTTGCCGTTGCCAGAAATAAACAGATTTCTTAGAGTTTCAGTTGGAGCAAACATTGGAATTCTTGTGTTCTGGGCTTTATGTAGTAGAGTAATTCATTTGCTTTTCTAGCCATGCAATATTATTGCCTTAATCAAAATTATTTACAGTATGGTACTTCCCAAAATAACAGACAGTTGTTATCCATATTCAGGAAGTGGGCGCGAGAGGCCACTTTAATTTGATAGACTCTTTAATTTGCCTTTTTACTACTTTTCTTGAGGGGCTTGTTCCCTTGAACCCCAATAGCTGAGTTGTGTGTTACCCTAGATTTTAGGATATGAACAGGATGTATAAATACTCAATGAAGTTGGGATCATCTGGGTTTGAGAGTTTAGCCTGTAGGACAGTTTTACTGACCACAGTCTTCATTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGTGCAATGGCATTGTCTCGCCTCACTGCAATCTCTGCCTCCCGAGTTCAGACGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGAGTATAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTTGACCACAGCCTGTCAAGGCATGAACATAAGCAACCGTGGTGAGGAAAGAGGTTCTGGTGAGACTCAGCATAATAGTAATTTTGGTAATACCAAGTAGAAATAATTTAGCTCAAAACTGGTTCCCATTATGAACCAAACTTGAAGATCAGTATCCAGCTCTTTTCTCCAAAGTTAACAAAGTGCGGAAGGGAATGAGCACCCCCCCGCTACTGAAAAAAAAATCACTTGGAATGTAAAATTTAATAGAGGAAGAAAGGAAGGAGATTAGAGAGGAAGATAGTTGGATGCCGAAACAGGGTTCAAGACTTACCCTTGAGCAAGGGGCTGAAATTGGCTTGACTGATAGGACGTGTGATCTGTGAGGAGGTTTGAAGTAGTAGTGTTTAACTACATGTAGTTTGGAGATGATCAGGTGATTGTAAACCTCCCACTCCTTTGATTTATTTTTAAGTGCTTGAAAGGAGAGGTGAGAAAGGAGCAGTGATCAATGATAACTGTGCGGTTAACTGACTTTTGGGTATCAGATGGAAAAGAAATACTGTCATTCTACAGCAACAGGTTCTTCCCAAGTATTTAAGAAACACTGTGTTAGTTGGGCCGGGTACAGTGGGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCACAGGCTTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATGGGAAAAAAAGAGAAACACTGTGTTACATGACCCATCTTCTTTTTTTGACATTTAGTTCAGAATTTCACATACCATTAAGGTAATTAAAGTTTTATCTTCAGTTCCCTTTTAGACTATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAATGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCCTTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAGACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGGTATGGATTCTTTTGAAACTGGTAAAAATGATAAATACAATATATTATGAATTTTATGTGATGCTCATAAAAGTCATTAAATTTGGGCAGGTCATCAAATTTGTGATAAGTAGTAGATGATGAGACTCCTAAACGATTCTTGTGGTGAGTAGTAAGTGGTGAATATTTGTAGAAATCTCCCTGGCCTGATAATTCCAGATAAAATTGGAATCTTACAGGAATGAGGTAGAGGTAGAGGGAGAGGATTTGTAATTCACTTTTTTTTTGGCTGATAATCAGTTTGCTTTTGGCTTAACTGTAGACTTTATTGATTCCTCTTAAAGTAATTTCCCAGAAGAATTCGAAAGCTTAGACCGTCTTCTCATGCTTCCCGGGTACAGTGATGCTATATGGCAAGGAGAAGTAGCAGGCAGAAGAAATTTTAACTGTTAACAATTTGTTAAGTGTAATTTTTTTTTTTTTTGTGCCTGAGATAGTGACCTATTTCTTTTAAATGTGGGCATTATTTGAAATGATTTTTAAACAGGTAGAGAGTGTCATAAAATTTTTATATGAGGGAACATTTTTTACTTCATTCTCATTGCTTTTATTTAATGTGCCCATATGTGAATGCATAGCCACTGGTTATTAATTTTCTAAATGTAGAAAATAAGGGAAAAGTAACTGAAGCATTATCTTGAACCAATTTGAGGAAGTGAAATGTGCTTGCCCAACTTTTCTTAAAATGGGCTAAGTCAGGTTAAAAATCTAGAAGCATTTTCCTGTGTGTGAAATATGCTTTTAATGTTGGAATTTAGTAGTTTCACATAGCCGGACAATAAAGATGTTAGAAAAAAATCATGAAGAGTATGTTAAGATAAAAGGCAAGAGAGAAATAATGTATAATTTATATAAATCATGACATTTAAAAAATTAGGAAATTGGAAAAGAGAAAAAGATTTAGTATTTCTTCACTGTGGCTGTTTGATGGAAATTGTGGTGTACTTAGCCAGAATTCTAACTGCGGTGAACGTTTTGCATACTCATACTTATGCATACACATAGAAACACTTACTTGTGTGATTTACTGAACTTGAAATTTACAAATGAACGCTTTCTACCTTAAAAATAAAAATTTTATTTTAAAAATAAAAGTGGTACCTACTTATAATATTTATCTTTCTCACAGTCAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGGTATGTGAATTATTTTTAAAAAATGTTATATGTTTTATTTTAGTTGTATTATGAAAAAAATTAAGTTAGGTTGAATTTGTGTTTACACTGGCAGTGAGCAGTTTCTGCTGAACTCAGGGTGATAACTTTTGTTAAGCACAATATTGAATTTGAACATTTGTGGTTTATTCTGTTGAGTGGTTTTCTTGAGTCCTTGTCATTTGCTTGGGGCTGGGGAGGGGGTGTTCATTGAATTCCCTTTTCTTACACATTTTCTGTAGGCAGTGAATCTGTGACCCAAAGAAAGCACCTGTTTTTCATATTTCTCTTGACTTCAGTATATTCTGATTGGATAGTGTATATTACTGAATTTTCATTTTCTGATCTTTCTAACTTTTAGAGTCCAGGTATCAGTGTTGAGCTTCTTTTGATTTAAAAATTTTAAAAGTACCAAACTAGAAGGAGCTCACAAATCACAAGAGAGACTTCTCTATAAAAGTAACTGTGCGGCCAGGCCTAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAAATCGAGACCATTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCCGGGCGCGGTGACTTA
Task1_train_27777
This alteration occurs within gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) located on Chromosome 20. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
CTCCCTGCCGCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTCATCCACCGGCCTCGGTCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAGTGCCTTTTAATAAAGAACGTTTTGAGAGAGAGACGGTTATTTAATGAAATCTGCTGACATACTTGCTGAGAGTTGTGATAGAACTTGCTTTCATTCCGACTTTAGTTATCCCTTTGCTTCCCATGAAGCTCCAGAGTGCTTCCTGTGCACACAGTGCTTCAGGTTCTTGCCGTTGCCAGAAATAAACAGATTTCTTAGAGTTTCAGTTGGAGCAAACATTGGAATTCTTGTGTTCTGGGCTTTATGTAGTAGAGTAATTCATTTGCTTTTCTAGCCATGCAATATTATTGCCTTAATCAAAATTATTTACAGTATGGTACTTCCCAAAATAACAGACAGTTGTTATCCATATTCAGGAAGTGGGCGCGAGAGGCCACTTTAATTTGATAGACTCTTTAATTTGCCTTTTTACTACTTTTCTTGAGGGGCTTGTTCCCTTGAACCCCAATAGCTGAGTTGTGTGTTACCCTAGATTTTAGGATATGAACAGGATGTATAAATACTCAATGAAGTTGGGATCATCTGGGTTTGAGAGTTTAGCCTGTAGGACAGTTTTACTGACCACAGTCTTCATTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGTGCAATGGCATTGTCTCGCCTCACTGCAATCTCTGCCTCCCGAGTTCAGACGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGAGTATAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTTGACCACAGCCTGTCAAGGCATGAACATAAGCAACCGTGGTGAGGAAAGAGGTTCTGGTGAGACTCAGCATAATAGTAATTTTGGTAATACCAAGTAGAAATAATTTAGCTCAAAACTGGTTCCCATTATGAACCAAACTTGAAGATCAGTATCCAGCTCTTTTCTCCAAAGTTAACAAAGTGCGGAAGGGAATGAGCACCCCCCCGCTACTGAAAAAAAAATCACTTGGAATGTAAAATTTAATAGAGGAAGAAAGGAAGGAGATTAGAGAGGAAGATAGTTGGATGCCGAAACAGGGTTCAAGACTTACCCTTGAGCAAGGGGCTGAAATTGGCTTGACTGATAGGACGTGTGATCTGTGAGGAGGTTTGAAGTAGTAGTGTTTAACTACATGTAGTTTGGAGATGATCAGGTGATTGTAAACCTCCCACTCCTTTGATTTATTTTTAAGTGCTTGAAAGGAGAGGTGAGAAAGGAGCAGTGATCAATGATAACTGTGCGGTTAACTGACTTTTGGGTATCAGATGGAAAAGAAATACTGTCATTCTACAGCAACAGGTTCTTCCCAAGTATTTAAGAAACACTGTGTTAGTTGGGCCGGGTACAGTGGGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCACAGGCTTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATGGGAAAAAAAGAGAAACACTGTGTTACATGACCCATCTTCTTTTTTTGACATTTAGTTCAGAATTTCACATACCATTAAGGTAATTAAAGTTTTATCTTCAGTTCCCTTTTAGACTATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAACGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCCTTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAGACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGGTATGGATTCTTTTGAAACTGGTAAAAATGATAAATACAATATATTATGAATTTTATGTGATGCTCATAAAAGTCATTAAATTTGGGCAGGTCATCAAATTTGTGATAAGTAGTAGATGATGAGACTCCTAAACGATTCTTGTGGTGAGTAGTAAGTGGTGAATATTTGTAGAAATCTCCCTGGCCTGATAATTCCAGATAAAATTGGAATCTTACAGGAATGAGGTAGAGGTAGAGGGAGAGGATTTGTAATTCACTTTTTTTTTGGCTGATAATCAGTTTGCTTTTGGCTTAACTGTAGACTTTATTGATTCCTCTTAAAGTAATTTCCCAGAAGAATTCGAAAGCTTAGACCGTCTTCTCATGCTTCCCGGGTACAGTGATGCTATATGGCAAGGAGAAGTAGCAGGCAGAAGAAATTTTAACTGTTAACAATTTGTTAAGTGTAATTTTTTTTTTTTTTGTGCCTGAGATAGTGACCTATTTCTTTTAAATGTGGGCATTATTTGAAATGATTTTTAAACAGGTAGAGAGTGTCATAAAATTTTTATATGAGGGAACATTTTTTACTTCATTCTCATTGCTTTTATTTAATGTGCCCATATGTGAATGCATAGCCACTGGTTATTAATTTTCTAAATGTAGAAAATAAGGGAAAAGTAACTGAAGCATTATCTTGAACCAATTTGAGGAAGTGAAATGTGCTTGCCCAACTTTTCTTAAAATGGGCTAAGTCAGGTTAAAAATCTAGAAGCATTTTCCTGTGTGTGAAATATGCTTTTAATGTTGGAATTTAGTAGTTTCACATAGCCGGACAATAAAGATGTTAGAAAAAAATCATGAAGAGTATGTTAAGATAAAAGGCAAGAGAGAAATAATGTATAATTTATATAAATCATGACATTTAAAAAATTAGGAAATTGGAAAAGAGAAAAAGATTTAGTATTTCTTCACTGTGGCTGTTTGATGGAAATTGTGGTGTACTTAGCCAGAATTCTAACTGCGGTGAACGTTTTGCATACTCATACTTATGCATACACATAGAAACACTTACTTGTGTGATTTACTGAACTTGAAATTTACAAATGAACGCTTTCTACCTTAAAAATAAAAATTTTATTTTAAAAATAAAAGTGGTACCTACTTATAATATTTATCTTTCTCACAGTCAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGGTATGTGAATTATTTTTAAAAAATGTTATATGTTTTATTTTAGTTGTATTATGAAAAAAATTAAGTTAGGTTGAATTTGTGTTTACACTGGCAGTGAGCAGTTTCTGCTGAACTCAGGGTGATAACTTTTGTTAAGCACAATATTGAATTTGAACATTTGTGGTTTATTCTGTTGAGTGGTTTTCTTGAGTCCTTGTCATTTGCTTGGGGCTGGGGAGGGGGTGTTCATTGAATTCCCTTTTCTTACACATTTTCTGTAGGCAGTGAATCTGTGACCCAAAGAAAGCACCTGTTTTTCATATTTCTCTTGACTTCAGTATATTCTGATTGGATAGTGTATATTACTGAATTTTCATTTTCTGATCTTTCTAACTTTTAGAGTCCAGGTATCAGTGTTGAGCTTCTTTTGATTTAAAAATTTTAAAAGTACCAAACTAGAAGGAGCTCACAAATCACAAGAGAGACTTCTCTATAAAAGTAACTGTGCGGCCAGGCCTAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAAATCGAGACCATTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCCGGGCGCGGTGACTTA
CTCCCTGCCGCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAATTCCTGACCTCAGGTCATCCACCGGCCTCGGTCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCGCCAGTGCCTTTTAATAAAGAACGTTTTGAGAGAGAGACGGTTATTTAATGAAATCTGCTGACATACTTGCTGAGAGTTGTGATAGAACTTGCTTTCATTCCGACTTTAGTTATCCCTTTGCTTCCCATGAAGCTCCAGAGTGCTTCCTGTGCACACAGTGCTTCAGGTTCTTGCCGTTGCCAGAAATAAACAGATTTCTTAGAGTTTCAGTTGGAGCAAACATTGGAATTCTTGTGTTCTGGGCTTTATGTAGTAGAGTAATTCATTTGCTTTTCTAGCCATGCAATATTATTGCCTTAATCAAAATTATTTACAGTATGGTACTTCCCAAAATAACAGACAGTTGTTATCCATATTCAGGAAGTGGGCGCGAGAGGCCACTTTAATTTGATAGACTCTTTAATTTGCCTTTTTACTACTTTTCTTGAGGGGCTTGTTCCCTTGAACCCCAATAGCTGAGTTGTGTGTTACCCTAGATTTTAGGATATGAACAGGATGTATAAATACTCAATGAAGTTGGGATCATCTGGGTTTGAGAGTTTAGCCTGTAGGACAGTTTTACTGACCACAGTCTTCATTTTTTTTTTGAAACAGAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGTGCAATGGCATTGTCTCGCCTCACTGCAATCTCTGCCTCCCGAGTTCAGACGATTCTCCTGCCTCAACCTCCTGAGTAGCTGGGACTATGGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCACTGTGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGAGTATAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTTGACCACAGCCTGTCAAGGCATGAACATAAGCAACCGTGGTGAGGAAAGAGGTTCTGGTGAGACTCAGCATAATAGTAATTTTGGTAATACCAAGTAGAAATAATTTAGCTCAAAACTGGTTCCCATTATGAACCAAACTTGAAGATCAGTATCCAGCTCTTTTCTCCAAAGTTAACAAAGTGCGGAAGGGAATGAGCACCCCCCCGCTACTGAAAAAAAAATCACTTGGAATGTAAAATTTAATAGAGGAAGAAAGGAAGGAGATTAGAGAGGAAGATAGTTGGATGCCGAAACAGGGTTCAAGACTTACCCTTGAGCAAGGGGCTGAAATTGGCTTGACTGATAGGACGTGTGATCTGTGAGGAGGTTTGAAGTAGTAGTGTTTAACTACATGTAGTTTGGAGATGATCAGGTGATTGTAAACCTCCCACTCCTTTGATTTATTTTTAAGTGCTTGAAAGGAGAGGTGAGAAAGGAGCAGTGATCAATGATAACTGTGCGGTTAACTGACTTTTGGGTATCAGATGGAAAAGAAATACTGTCATTCTACAGCAACAGGTTCTTCCCAAGTATTTAAGAAACACTGTGTTAGTTGGGCCGGGTACAGTGGGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCTTGGTGGCACAGGCTTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGTGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATGGGAAAAAAAGAGAAACACTGTGTTACATGACCCATCTTCTTTTTTTGACATTTAGTTCAGAATTTCACATACCATTAAGGTAATTAAAGTTTTATCTTCAGTTCCCTTTTAGACTATGGCGACATACCTGGAGTTCATCCAGCAGAATGAAGAATGGGATGGTGTGCGTTTTAGTTGGAACGTGTGGCCTTCCAGCCGGCTGGAGGCTACAAGAATGGTTGTACCCCTGGCTTGTCTCCTTACTCCTTTGAAAGAACGTCCAGACCTACCTCCTGTACAATATGAACCTGTGCTTTGCAGCAGGCCAACTTGTAAAGCTGTTCTCAACCCACTTTGGTATGGATTCTTTTGAAACTGGTAAAAATGATAAATACAATATATTATGAATTTTATGTGATGCTCATAAAAGTCATTAAATTTGGGCAGGTCATCAAATTTGTGATAAGTAGTAGATGATGAGACTCCTAAACGATTCTTGTGGTGAGTAGTAAGTGGTGAATATTTGTAGAAATCTCCCTGGCCTGATAATTCCAGATAAAATTGGAATCTTACAGGAATGAGGTAGAGGTAGAGGGAGAGGATTTGTAATTCACTTTTTTTTTGGCTGATAATCAGTTTGCTTTTGGCTTAACTGTAGACTTTATTGATTCCTCTTAAAGTAATTTCCCAGAAGAATTCGAAAGCTTAGACCGTCTTCTCATGCTTCCCGGGTACAGTGATGCTATATGGCAAGGAGAAGTAGCAGGCAGAAGAAATTTTAACTGTTAACAATTTGTTAAGTGTAATTTTTTTTTTTTTTGTGCCTGAGATAGTGACCTATTTCTTTTAAATGTGGGCATTATTTGAAATGATTTTTAAACAGGTAGAGAGTGTCATAAAATTTTTATATGAGGGAACATTTTTTACTTCATTCTCATTGCTTTTATTTAATGTGCCCATATGTGAATGCATAGCCACTGGTTATTAATTTTCTAAATGTAGAAAATAAGGGAAAAGTAACTGAAGCATTATCTTGAACCAATTTGAGGAAGTGAAATGTGCTTGCCCAACTTTTCTTAAAATGGGCTAAGTCAGGTTAAAAATCTAGAAGCATTTTCCTGTGTGTGAAATATGCTTTTAATGTTGGAATTTAGTAGTTTCACATAGCCGGACAATAAAGATGTTAGAAAAAAATCATGAAGAGTATGTTAAGATAAAAGGCAAGAGAGAAATAATGTATAATTTATATAAATCATGACATTTAAAAAATTAGGAAATTGGAAAAGAGAAAAAGATTTAGTATTTCTTCACTGTGGCTGTTTGATGGAAATTGTGGTGTACTTAGCCAGAATTCTAACTGCGGTGAACGTTTTGCATACTCATACTTATGCATACACATAGAAACACTTACTTGTGTGATTTACTGAACTTGAAATTTACAAATGAACGCTTTCTACCTTAAAAATAAAAATTTTATTTTAAAAATAAAAGTGGTACCTACTTATAATATTTATCTTTCTCACAGTCAGGTTGATTATCGAGCAAAACTTTGGGCCTGTAATTTCTGTTTTCAAAGAAATCAGGTATGTGAATTATTTTTAAAAAATGTTATATGTTTTATTTTAGTTGTATTATGAAAAAAATTAAGTTAGGTTGAATTTGTGTTTACACTGGCAGTGAGCAGTTTCTGCTGAACTCAGGGTGATAACTTTTGTTAAGCACAATATTGAATTTGAACATTTGTGGTTTATTCTGTTGAGTGGTTTTCTTGAGTCCTTGTCATTTGCTTGGGGCTGGGGAGGGGGTGTTCATTGAATTCCCTTTTCTTACACATTTTCTGTAGGCAGTGAATCTGTGACCCAAAGAAAGCACCTGTTTTTCATATTTCTCTTGACTTCAGTATATTCTGATTGGATAGTGTATATTACTGAATTTTCATTTTCTGATCTTTCTAACTTTTAGAGTCCAGGTATCAGTGTTGAGCTTCTTTTGATTTAAAAATTTTAAAAGTACCAAACTAGAAGGAGCTCACAAATCACAAGAGAGACTTCTCTATAAAAGTAACTGTGCGGCCAGGCCTAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATGAGGTCAAGAAATCGAGACCATTCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGGCCGGGCGCGGTGACTTA
Task1_train_27778
A change on Chromosome 20 affects gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCAAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
Task1_train_27779
An alteration has been detected in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Cowden syndrome 7
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
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Task1_train_27780
This gene mutation involves SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCAAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
Task1_train_27781
A variant on Chromosome 20 in gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; See cases
TTGATGACTGACCATAGGTTCGGAAACTATAAGCAGATGTCATTTAAAATATATCTTCATGAGAGATTCAGAAGTATATAGAAATCTTAAAAGCATTTCTGCTCCCTATTACATTTAGGATTAATGTCTTTGTTTAATATAATTTATTATAGTAATTCTAAGGCAGGGTAGCATAGTGGCTAAAGAGCCAGAGATCTGTAGCCAGACTGCCTGGGTTTGGCTCTCAGATCTACCACTTATTTCCTGTGTAACTTTGGGTAGGTCACTTAACTGCCTGTGCCTCAACTTCCTTGTCTTTAAAATTAGGATGATAGTATAGTATACCTATAGTCACTTCATGAGATTATTGTGAGAATTAAACTGAGTTAATGAGTATAAAGGACTTAGAACAGTGCTTGACACATGGTAAGTGCCATATAAGTATTTGGTATTATTATGCTTACCTAAGATTGTCACCTGCCAATTTATAAGTATGATCTGCAAGTCTATGTGTCCTAAGTGGAAATAATCTTTTGTAACCTTCCTAGCTGGACAGTGTGGGGGTTTTCTAGCTCTAAATGAATGTAGAGCTGGAAGACGGAGGGATCAGGGTGATCTCCGTCTCCTTTGCTCCCTTCTGTGCAGCTGGCTGACTGCGTGGGTGAACAGGGCCTCTCCAGGTTGCTGGGAGGTGGCTGGTGTGTCTGTAGTCATAGATCGAGCTTATCCCTGCTGGGAGCTGCAGTCAGTGGGCAGTCATGGCCAGGATGGGGCTAGAGTCTTCTGCTGGCTCTGACTGAGATTCTTGCTGGGGCTCGCAAGCTCAGTTGTACCCTTCTCTCCCAACCAGAGGCCCCTAAAGCTGCCTGTCAGCTCCTCAGCAGCACTTGCATTTGGTCACTCTGAGGTCACTGGCCTGGAGTGATCATCTGCTCACTTTGGGGAGATGCACCTCAACTTGTATTTTTAATGTAAAGCTAAAGACTATTTGGATTATAAGCCAACCCACAAGCTGTGAATTTAAAACATTTGCAGAGAGTTTTAAAAACAAAAGAAAATGCCTGTGGCATTATGTTGACTGGAAAAAACAAGTTCCACATTGTATATATGGGATGTTCTCAACTGTGCTTAAGTCTGGAAGGAAATCTGCCAGGAGGTTGACAGTAGCTGCTTCTAGGTGATAGGATTTTGGGGGGCTTTTCCTCCTTTGTTTGCTTCTATTTTCCTGGACTTGCCAATTTTTCTACATTCCGTATGTATTACTTTATTGATAATAGCCAAAATAATAAACCTAAATAAAGTCTTTGGCTTTATTTAGACTATTAACTATTGATGAGATAGGTGAAATCTCAGCCTTTAATTTGCAGGGCAAAACTTAAGAAATGGTTTTCATTTGTGTGTTTTTGGCTAGGCATGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACTGAGGGGAGAAAATCACTTGAAACCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATAAAGTGTGCTTTTAAACATTTAGAAGTTACAATAGCTTAAAACTGCTCTAAAAAATATTTTTTAAGAGGACAGAAATGATATAAATATAAGGCAGGGTTAGAAGTTTTAAATGCTGATTTTTATGTTTTTTAACGTGTCCTGTATTTTGTGCTTTCAGAATAAATACATGGTCATTACCATTTTTTTTCTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTTCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCATGGCTCACTGCAGCCTTAACCTCCTGGGTTCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCCTTCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAACTAATGTTTTTACTTCTTGTATACAGACAGGGTCTCACAGTGTTGCCCAAGCTAGTCTGGAGCTCCTGAGCTCAAGTGTTCCTCTCGTCTTGGCATCATTATCATTTTTACACATGGAAAATAAAAAGTGTAATATAGTTATGCCAACCCTAATAAAACTGTTTCCTTCTTTTCAGTTTCCTCCAGCTTATGGAGGCATATCTGAGGTGAATCAACCTGCCGAATTGATGCCCCAGTTTTCTACAATTGAGTACGTGATACAGGTAATTTCTTTGTTGTGCATTTAATGAGCAATGTTAAATACTGAATTTCTCTTGAAATCCTTTGTCTTCCATGTCTCTTACCTGGGCAGGGGACTTAAAGCTGTGAGGGCAGCAGGATCCTAACCTTTAGGTTTGATGTGTGTGCATCTACTGGCATTGTTTTCAAGTCCTGACATTATAGAAGGCTACTAAAAAGGTAGAACTGATTAAATTCCAAACCTGTTCTCTGTAGCCTTCTTCATCTCAGTTGATGGTACTCCATCATCTAGTTGTTTAGCTTCAGAACCTTAGACTTATCCTTGACCTCTCTCTTTCATGTTCCATATCTAATTCACTGGAAAATCCCATTGGCTCTATATTTGAAATTTATCCAGAATCCACCCACTTCCCCCTCCCTACTACCAGCTGCCCTGGGCCAGCCACTCCTTCTTACTTGAATCTTCTAATTGTTCTCCCTGATGTTACCATTGCCTATTTATACATTATTCTTCACCCAGCAGCCACAGTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTGTATTTATTCATTTATTCAGTGAGGAAAGTTTGTTTTGCTTTCAAATATTGGCCTTTGTGAATAATGCTTCAATGAATATAGCTGTTCAAATAACTGTTTACCCATATGTTGGAGGTTTGCATTTCTGCTACATTGTGTTTTATTGGAAAACTTGTCTGTCTTTATGCCAGAACTAAACTGTTTTTATTACTGTAGCTTTGTAATGTGCTTTGAAATTAGAAAAGGTGACATTGTTTCTTTTTTTTAAACATTTTTGGGCTCTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTCTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCTCGGGTTCACGCCATTCTCCTACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTAATATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGTTCTCCTGACCTTGTGATCCACCCACCTCGGCTTCCGAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCACATTTTTAGGCTCTTTATTGTCCTTTGAGATTCCGTATAATTTGTTGGTTACTTTTTCTATTTCTAAAAAAAAAAAATTGTTAATTGAAAAGGGATTGCATTGAATCTGTAGTTCACTAGGCAGCATGAACATCTTCACAATATTAAGTCTTACAACCCTTGAACATGAGCATGCTCAAAAGTGAGTTTAATTTCCATATATATGTTGATATTTTTGCTTTCTTCTGTTATTGATTTCTAGTTTTATTCCATTTTTATCGGAAATAATTATCTCATGTGTCCGTGTGAAGAGACCACCAAACAGGCTTTGTGTGAGCAACAAGGCTCTTGATTTCACCTGGGTGCAGGCAGGCTGAGTCCGAAAAAGGAGTCAGCAAAGGGTGGTGGATTATCATTAGTTCTTATAGGTTTTGGGATAGGCAGTGGAGTTACGAGCAATGTTTTGTGGGCAGGAGGTGGATCTCACAAAGTACGTTCTCAAGGGTGGGGAGAATTACAAAGACCCTTCTTAAGGGTGGGGGAGATTACAAAGTACATTGATCAGTTAGGGTGGGGCAGAAACAAATCACAGGTGGAATGTCATCAGTTAAGGCTATTTTCACTTCTTTTGTGAATTTTCAGTTGCTTCAGGCCATCTGGATGTATACGTGCAGGTCATAGGGGATATGATGGCTTGGCTTGGGTTCAGAGGCCTGACATTCCTGTGTTGTTATATTAATAAGAAAAGCAAAACAAAATAGTGAAGTGTTGGAGCAGTGAAAAAATTTTGGGGGTGATATGGAGAGATTAATGGGCGATGTTTCTCAGGACTGCTTCTAGCGGGATTAGGGGCAGCGTGGGAACCTACAGTGGGAGAGATTCAACTGAAGAAAGATTTTGGCGTAAGGGG
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Task1_train_27782
With a mutation on Chromosome 20 in gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Cowden syndrome 7
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Task1_train_27783
The gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) is located on Chromosome 20, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
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Task1_train_27784
A variant has been detected on Chromosome 20 in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
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Task1_train_27785
The gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
GATCTTAGCTAATCTGAATAACTTGCAGCAGTTTCTACATCAGCACATGCTGCTTCACCTTGTGCCATTATGTTATGGAGATGGCTTCTTTCCCTAAACCTCAGGAACCAACCTCTGCCAGCTTCCAGCTTTCTCCTGCAGCTTCCTTACCTCTCTCCACCTTCATAAATTGAAGAGAGTTGGGACCTTGCTCTGGATTAGGCCCTGGCTTAAGGGAATGTTGTATCTGGTTTGATTTTCTATTCAGACTACTAAAACATTCTCCACATCAGCAATAAGGCTGTTTCACTTTCTTATCATTCACGTGTTCACTTTTAATTTCCTTCAAGAACTTTTTCTTTGCATTCACAGCTTGGCAGTTTTGGGGCAAAAGGCCTAGCTTTCAGCTATCTTGGCTTTCAACATACCTTCCCTACTAAGATTAATGAGTTTTAGCTTTTGATTTAAAATGAGAGATGTGTGACTCTTCCTTTCACTTGAACACTTAGAGGGCATTGTAGGGTTATTAACTGGCCTCATTTCAATATTGTTGTATCTCAGGAAATAGGGGAGGCCCAAGGAGGAGGAGAGAGATGAGGGAAAGGTCAGTCAGTGGAGCAACAGAATATACACAACATTTATCAGTTAAGTTTGCCATCTTATATCAGTGCAGTTTGTAGCACCCCAAAACAATTAAAATGGTAACATCAAAGATCACTGATCACAGATCACCATAGCAGATATATAATAATAATGAAAAAGTTGGAAATATTGTGAGAATTACTGAACTGTGACACAGAGACATGAAGTGAGCACATGATGTTAGAAAACTTGCGCCAATAGTCTTGCTTGATGTACGATTGCCACAAATCTTCAATTTGTTAAAAAATCTGCAAATAAATGAGGCATGTCTGTGTTTGTTTAATGATTAACAATCCGTCACAAACTGGATAATTCATCAGCAATAACTCATCCAGTTTGTGATTCATCAATCCATCTTCGTTTTGCTGCATTTCAAAACAAGCCTCAGTCATCCATGTATTTCATGCCTAAACACTTCAGTAGGTGTATCATTAACTTAAGTTCAGTATTGAACGTAGTTCTTCAACTTTTTTGGAGATAAGGTTATATGCAGTGAAATGTGCAAATCCTAAGTGTGCCCTTCAAAATGTGTCAAGAACCTTCCTGTCATTGCTGTGTCAGTCATTTTAGAAGAGTACAGTGGGCTCTGTGACCGTGTTTGAGTTGCGCCTATAACAGACAAGGTTATGGCCTCTCATCCTACAGCACAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGAGACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAAGTAAGCAGCCCCAGTTTCCTTTCTGTTGAGGAACTGACTGACATTTTTCCCTTGAAGAGATACTTTAACATTTGTTAGTTTGTCTTTTTGATTCCATTGAATGGTTCTCACCAGACCTCATTAGCTTATTTGATCAGAGGAGGAGGCATTTTTGGCTAACCCAGTTGGGCCTATGAACACTTGCCTAGAGGAATCATCTTTCTGTAGGAAATATAGTTCATTAAAAGTATTAATTATTATTATTATCATCTGGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGCACAATCACAGCTCACCACAGCCTCAACCTCCCATGCTCAAGTGATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACCACAGGCACCTGCCACCAAAACTAGCTAATCTTTTTACTTTTATGCAGAGAGATGGTGATCTCACATTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTAGGCTCAAGCAGTCCTGCCACCTTGCCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGAATGAGCCACTGCACCTAGCCTGTGTTTCTTTTTCTGAATGGATGTCTGGCTTTCTGATCTCTCCTAAACATAAGCATGGCACTAACTCTGGAATTGTCAGTTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCATTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGATGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGGTAAATTGGGGACAGTGGCATTAGGTTCAGTCTTGGTTTCTGCTTTACTTTCGAGAAGAAAATTGTCACTTAATTATTATTATATAGTGAATCAGCAAGAATTTATCAGTTGCCTACCTTATGCTGCACGCTGGACATTCTGTTAAAGACGTGTTAAATGTGCATTTTCCCCTCAGAGATTTACATTATAGTTGGGAAGAAACAACACGCATGGAGCATTTGGAGAGTGATACAAATCTGTGTGGGTTGAGTTGACTTAGATGAGTCATTTTGTGAATGCTCTGGTCTTGTATTTTTCTTCTAAATCTGGAAAGTGGTTTTGGAAATAGGGATCCAGCCTGGTAAGTTTAGGGAGATGCCTTTTATCAGTCTGGATTTAATGAGATGAGAGAAGTCACACTGTAATTTAAATGGGGAAAGTCTTTTATAAAGAATACAACAAGAGAGTAGAACAGTGAGGGACTGGCTAGAAGGAAGTATAGAGAAGTGGGCAGCCACTACTTGTGGGGCTGAGATAGAGCACCAAAGGAAGTGCCCTTCTCCCCAGGGCTGATCCAGACCTAGTTGGGAGGGCATGGCCATGGCTTGGTGAGTCTTTTGCAGAGAAGTTACCGTGGTGCTGTGCCAGGGGAACTTACTAGAAATTCACTTTCTAGAATTTGAAGAAAATCCACCCTCCAGGGTGCCAGGGAAAGCTGTGTATAGGAAAATGTCTCACTGGAGACATGCAGGGATGCTGCTTAGCTGCTGGCTGCCATGTTCTCCAGGAGCTCAGCACTGGGGAGCCACGGTGCAGCAGGACCTGGCACCCGGGAAGCTGCTGAATGAGCACTCGGGCGCCCAAAGCTGACGCTCACCTCCAGCACTCTCTACTGACAACGCTTGATATCGTGCCAGCTGGCAAAGGAGAGGTAGTGAAAGGGCCCATGTCCATTTCACAGCAGGCAAAGGGGGTGAGTTTGGAGCCAGCACAAGGCAATAAATCAATAATTGGCACATGATAATCTTACCTTCCTGGAGAGTCACAGCATGTGTTTGTGATCAAAGCCACCATGGAAAGGCCCAGTAGGGAAACCTGTTTCATTTTGTTCAGCCCTCTATTTGCCCTTGCCATCTCATGGAACCATTTTTCAGGAAGTGTCAACATTTCAAACATAATTTGAAAATTGCTTCTTTAGGATTTCAGAGGGAGGATAGATAAGCAGAGGGCCCAGGTGGCTAACAAAGACTTCCTGTGGAAATGAGCCTTGAGTCAGGTTTTTATTACAGAATTAATTGGAGAAGGGAAGGCAAGGCTTGCTGAGTGGAGGGCTAGCAGGAATGAGCCTGCAGGAGCTAGCTGGGTCTTTTAGCTTATGCTGAGGACTTTGGAGAAACCAGTGTCACAGGAGGCTAGGTTGTGCAGTGGGGAACAGAGTCAGGGAAGGTACACCTTGATTGGGGAGCTCCTTAACTTTAGGGAGCAAGGGAGACGTGGCTGTGATTGTTAAGCGGGGGTTTGATGTCAGCATGATGCTTGTGTTTACATTTAATATCACCATGTGAGGCACATTGCAGAGAGAAAAGGCTATTGTTGTGAATGGAGGATTTTTCAGGCTCAATGGCACTGAGACCAGCATAGTGGCAGGAGAGATGGAGGAAGCAGAAGGTTTGAAATCAGGATGTAAACTGAAAGAATTGATAAAACTTGATGAAATGATTCTGTGTAAAGTCAAAAACCAAAAAGTCAGCACTGAATGACATTTCACACATGGGTAACTGCATGAGTGGTGTTGAGGTAGAAGATGGGAAAGGAGAGCAACTTTAGGGTGGGAGAAAGTTTTTTCTCTTTTTTTAATGTAATAGTTTATTTTTGATAATTTTTGATAATTGAATGTGAACTTGCAAAAGTGTGTCTCACGAAAACTCCCATATTTGGGTGGATGTCCTGACTGGGGCTCAGGCTATAGGTCA
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Task1_train_27786
This mutation is located in gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Cowden syndrome 7
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Task1_train_27787
Here is a mutation in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
GATCTTAGCTAATCTGAATAACTTGCAGCAGTTTCTACATCAGCACATGCTGCTTCACCTTGTGCCATTATGTTATGGAGATGGCTTCTTTCCCTAAACCTCAGGAACCAACCTCTGCCAGCTTCCAGCTTTCTCCTGCAGCTTCCTTACCTCTCTCCACCTTCATAAATTGAAGAGAGTTGGGACCTTGCTCTGGATTAGGCCCTGGCTTAAGGGAATGTTGTATCTGGTTTGATTTTCTATTCAGACTACTAAAACATTCTCCACATCAGCAATAAGGCTGTTTCACTTTCTTATCATTCACGTGTTCACTTTTAATTTCCTTCAAGAACTTTTTCTTTGCATTCACAGCTTGGCAGTTTTGGGGCAAAAGGCCTAGCTTTCAGCTATCTTGGCTTTCAACATACCTTCCCTACTAAGATTAATGAGTTTTAGCTTTTGATTTAAAATGAGAGATGTGTGACTCTTCCTTTCACTTGAACACTTAGAGGGCATTGTAGGGTTATTAACTGGCCTCATTTCAATATTGTTGTATCTCAGGAAATAGGGGAGGCCCAAGGAGGAGGAGAGAGATGAGGGAAAGGTCAGTCAGTGGAGCAACAGAATATACACAACATTTATCAGTTAAGTTTGCCATCTTATATCAGTGCAGTTTGTAGCACCCCAAAACAATTAAAATGGTAACATCAAAGATCACTGATCACAGATCACCATAGCAGATATATAATAATAATGAAAAAGTTGGAAATATTGTGAGAATTACTGAACTGTGACACAGAGACATGAAGTGAGCACATGATGTTAGAAAACTTGCGCCAATAGTCTTGCTTGATGTACGATTGCCACAAATCTTCAATTTGTTAAAAAATCTGCAAATAAATGAGGCATGTCTGTGTTTGTTTAATGATTAACAATCCGTCACAAACTGGATAATTCATCAGCAATAACTCATCCAGTTTGTGATTCATCAATCCATCTTCGTTTTGCTGCATTTCAAAACAAGCCTCAGTCATCCATGTATTTCATGCCTAAACACTTCAGTAGGTGTATCATTAACTTAAGTTCAGTATTGAACGTAGTTCTTCAACTTTTTTGGAGATAAGGTTATATGCAGTGAAATGTGCAAATCCTAAGTGTGCCCTTCAAAATGTGTCAAGAACCTTCCTGTCATTGCTGTGTCAGTCATTTTAGAAGAGTACAGTGGGCTCTGTGACCGTGTTTGAGTTGCGCCTATAACAGACAAGGTTATGGCCTCTCATCCTACAGCACAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGAGACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAAGTAAGCAGCCCCAGTTTCCTTTCTGTTGAGGAACTGACTGACATTTTTCCCTTGAAGAGATACTTTAACATTTGTTAGTTTGTCTTTTTGATTCCATTGAATGGTTCTCACCAGACCTCATTAGCTTATTTGATCAGAGGAGGAGGCATTTTTGGCTAACCCAGTTGGGCCTATGAACACTTGCCTAGAGGAATCATCTTTCTGTAGGAAATATAGTTCATTAAAAGTATTAATTATTATTATTATCATCTGGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGCACAATCACAGCTCACCACAGCCTCAACCTCCCATGCTCAAGTGATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACCACAGGCACCTGCCACCAAAACTAGCTAATCTTTTTACTTTTATGCAGAGAGATGGTGATCTCACATTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTAGGCTCAAGCAGTCCTGCCACCTTGCCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGAATGAGCCACTGCACCTAGCCTGTGTTTCTTTTTCTGAATGGATGTCTGGCTTTCTGATCTCTCCTAAACATAAGCATGGCACTAACTCTGGAATTGTCAGTTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCATTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGATGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGGTAAATTGGGGACAGTGGCATTAGGTTCAGTCTTGGTTTCTGCTTTACTTTCGAGAAGAAAATTGTCACTTAATTATTATTATATAGTGAATCAGCAAGAATTTATCAGTTGCCTACCTTATGCTGCACGCTGGACATTCTGTTAAAGACGTGTTAAATGTGCATTTTCCCCTCAGAGATTTACATTATAGTTGGGAAGAAACAACACGCATGGAGCATTTGGAGAGTGATACAAATCTGTGTGGGTTGAGTTGACTTAGATGAGTCATTTTGTGAATGCTCTGGTCTTGTATTTTTCTTCTAAATCTGGAAAGTGGTTTTGGAAATAGGGATCCAGCCTGGTAAGTTTAGGGAGATGCCTTTTATCAGTCTGGATTTAATGAGATGAGAGAAGTCACACTGTAATTTAAATGGGGAAAGTCTTTTATAAAGAATACAACAAGAGAGTAGAACAGTGAGGGACTGGCTAGAAGGAAGTATAGAGAAGTGGGCAGCCACTACTTGTGGGGCTGAGATAGAGCACCAAAGGAAGTGCCCTTCTCCCCAGGGCTGATCCAGACCTAGTTGGGAGGGCATGGCCATGGCTTGGTGAGTCTTTTGCAGAGAAGTTACCGTGGTGCTGTGCCAGGGGAACTTACTAGAAATTCACTTTCTAGAATTTGAAGAAAATCCACCCTCCAGGGTGCCAGGGAAAGCTGTGTATAGGAAAATGTCTCACTGGAGACATGCAGGGATGCTGCTTAGCTGCTGGCTGCCATGTTCTCCAGGAGCTCAGCACTGGGGAGCCACGGTGCAGCAGGACCTGGCACCCGGGAAGCTGCTGAATGAGCACTCGGGCGCCCAAAGCTGACGCTCACCTCCAGCACTCTCTACTGACAACGCTTGATATCGTGCCAGCTGGCAAAGGAGAGGTAGTGAAAGGGCCCATGTCCATTTCACAGCAGGCAAAGGGGGTGAGTTTGGAGCCAGCACAAGGCAATAAATCAATAATTGGCACATGATAATCTTACCTTCCTGGAGAGTCACAGCATGTGTTTGTGATCAAAGCCACCATGGAAAGGCCCAGTAGGGAAACCTGTTTCATTTTGTTCAGCCCTCTATTTGCCCTTGCCATCTCATGGAACCATTTTTCAGGAAGTGTCAACATTTCAAACATAATTTGAAAATTGCTTCTTTAGGATTTCAGAGGGAGGATAGATAAGCAGAGGGCCCAGGTGGCTAACAAAGACTTCCTGTGGAAATGAGCCTTGAGTCAGGTTTTTATTACAGAATTAATTGGAGAAGGGAAGGCAAGGCTTGCTGAGTGGAGGGCTAGCAGGAATGAGCCTGCAGGAGCTAGCTGGGTCTTTTAGCTTATGCTGAGGACTTTGGAGAAACCAGTGTCACAGGAGGCTAGGTTGTGCAGTGGGGAACAGAGTCAGGGAAGGTACACCTTGATTGGGGAGCTCCTTAACTTTAGGGAGCAAGGGAGACGTGGCTGTGATTGTTAAGCGGGGGTTTGATGTCAGCATGATGCTTGTGTTTACATTTAATATCACCATGTGAGGCACATTGCAGAGAGAAAAGGCTATTGTTGTGAATGGAGGATTTTTCAGGCTCAATGGCACTGAGACCAGCATAGTGGCAGGAGAGATGGAGGAAGCAGAAGGTTTGAAATCAGGATGTAAACTGAAAGAATTGATAAAACTTGATGAAATGATTCTGTGTAAAGTCAAAAACCAAAAAGTCAGCACTGAATGACATTTCACACATGGGTAACTGCATGAGTGGTGTTGAGGTAGAAGATGGGAAAGGAGAGCAACTTTAGGGTGGGAGAAAGTTTTTTCTCTTTTTTTAATGTAATAGTTTATTTTTGATAATTTTTGATAATTGAATGTGAACTTGCAAAAGTGTGTCTCACGAAAACTCCCATATTTGGGTGGATGTCCTGACTGGGGCTCAGGCTATAGGTCA
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Task1_train_27788
A variant has been detected on Chromosome 20 in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
ATAACTTGCAGCAGTTTCTACATCAGCACATGCTGCTTCACCTTGTGCCATTATGTTATGGAGATGGCTTCTTTCCCTAAACCTCAGGAACCAACCTCTGCCAGCTTCCAGCTTTCTCCTGCAGCTTCCTTACCTCTCTCCACCTTCATAAATTGAAGAGAGTTGGGACCTTGCTCTGGATTAGGCCCTGGCTTAAGGGAATGTTGTATCTGGTTTGATTTTCTATTCAGACTACTAAAACATTCTCCACATCAGCAATAAGGCTGTTTCACTTTCTTATCATTCACGTGTTCACTTTTAATTTCCTTCAAGAACTTTTTCTTTGCATTCACAGCTTGGCAGTTTTGGGGCAAAAGGCCTAGCTTTCAGCTATCTTGGCTTTCAACATACCTTCCCTACTAAGATTAATGAGTTTTAGCTTTTGATTTAAAATGAGAGATGTGTGACTCTTCCTTTCACTTGAACACTTAGAGGGCATTGTAGGGTTATTAACTGGCCTCATTTCAATATTGTTGTATCTCAGGAAATAGGGGAGGCCCAAGGAGGAGGAGAGAGATGAGGGAAAGGTCAGTCAGTGGAGCAACAGAATATACACAACATTTATCAGTTAAGTTTGCCATCTTATATCAGTGCAGTTTGTAGCACCCCAAAACAATTAAAATGGTAACATCAAAGATCACTGATCACAGATCACCATAGCAGATATATAATAATAATGAAAAAGTTGGAAATATTGTGAGAATTACTGAACTGTGACACAGAGACATGAAGTGAGCACATGATGTTAGAAAACTTGCGCCAATAGTCTTGCTTGATGTACGATTGCCACAAATCTTCAATTTGTTAAAAAATCTGCAAATAAATGAGGCATGTCTGTGTTTGTTTAATGATTAACAATCCGTCACAAACTGGATAATTCATCAGCAATAACTCATCCAGTTTGTGATTCATCAATCCATCTTCGTTTTGCTGCATTTCAAAACAAGCCTCAGTCATCCATGTATTTCATGCCTAAACACTTCAGTAGGTGTATCATTAACTTAAGTTCAGTATTGAACGTAGTTCTTCAACTTTTTTGGAGATAAGGTTATATGCAGTGAAATGTGCAAATCCTAAGTGTGCCCTTCAAAATGTGTCAAGAACCTTCCTGTCATTGCTGTGTCAGTCATTTTAGAAGAGTACAGTGGGCTCTGTGACCGTGTTTGAGTTGCGCCTATAACAGACAAGGTTATGGCCTCTCATCCTACAGCACAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGAGACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAAGTAAGCAGCCCCAGTTTCCTTTCTGTTGAGGAACTGACTGACATTTTTCCCTTGAAGAGATACTTTAACATTTGTTAGTTTGTCTTTTTGATTCCATTGAATGGTTCTCACCAGACCTCATTAGCTTATTTGATCAGAGGAGGAGGCATTTTTGGCTAACCCAGTTGGGCCTATGAACACTTGCCTAGAGGAATCATCTTTCTGTAGGAAATATAGTTCATTAAAAGTATTAATTATTATTATTATCATCTGGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGCACAATCACAGCTCACCACAGCCTCAACCTCCCATGCTCAAGTGATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACCACAGGCACCTGCCACCAAAACTAGCTAATCTTTTTACTTTTATGCAGAGAGATGGTGATCTCACATTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTAGGCTCAAGCAGTCCTGCCACCTTGCCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGAATGAGCCACTGCACCTAGCCTGTGTTTCTTTTTCTGAATGGATGTCTGGCTTTCTGATCTCTCCTAAACATAAGCATGGCACTAACTCTGGAATTGTCAGTTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCATTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGATGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGGTAAATTGGGGACAGTGGCATTAGGTTCAGTCTTGGTTTCTGCTTTACTTTCGAGAAGAAAATTGTCACTTAATTATTATTATATAGTGAATCAGCAAGAATTTATCAGTTGCCTACCTTATGCTGCACGCTGGACATTCTGTTAAAGACGTGTTAAATGTGCATTTTCCCCTCAGAGATTTACATTATAGTTGGGAAGAAACAACACGCATGGAGCATTTGGAGAGTGATACAAATCTGTGTGGGTTGAGTTGACTTAGATGAGTCATTTTGTGAATGCTCTGGTCTTGTATTTTTCTTCTAAATCTGGAAAGTGGTTTTGGAAATAGGGATCCAGCCTGGTAAGTTTAGGGAGATGCCTTTTATCAGTCTGGATTTAATGAGATGAGAGAAGTCACACTGTAATTTAAATGGGGAAAGTCTTTTATAAAGAATACAACAAGAGAGTAGAACAGTGAGGGACTGGCTAGAAGGAAGTATAGAGAAGTGGGCAGCCACTACTTGTGGGGCTGAGATAGAGCACCAAAGGAAGTGCCCTTCTCCCCAGGGCTGATCCAGACCTAGTTGGGAGGGCATGGCCATGGCTTGGTGAGTCTTTTGCAGAGAAGTTACCGTGGTGCTGTGCCAGGGGAACTTACTAGAAATTCACTTTCTAGAATTTGAAGAAAATCCACCCTCCAGGGTGCCAGGGAAAGCTGTGTATAGGAAAATGTCTCACTGGAGACATGCAGGGATGCTGCTTAGCTGCTGGCTGCCATGTTCTCCAGGAGCTCAGCACTGGGGAGCCACGGTGCAGCAGGACCTGGCACCCGGGAAGCTGCTGAATGAGCACTCGGGCGCCCAAAGCTGACGCTCACCTCCAGCACTCTCTACTGACAACGCTTGATATCGTGCCAGCTGGCAAAGGAGAGGTAGTGAAAGGGCCCATGTCCATTTCACAGCAGGCAAAGGGGGTGAGTTTGGAGCCAGCACAAGGCAATAAATCAATAATTGGCACATGATAATCTTACCTTCCTGGAGAGTCACAGCATGTGTTTGTGATCAAAGCCACCATGGAAAGGCCCAGTAGGGAAACCTGTTTCATTTTGTTCAGCCCTCTATTTGCCCTTGCCATCTCATGGAACCATTTTTCAGGAAGTGTCAACATTTCAAACATAATTTGAAAATTGCTTCTTTAGGATTTCAGAGGGAGGATAGATAAGCAGAGGGCCCAGGTGGCTAACAAAGACTTCCTGTGGAAATGAGCCTTGAGTCAGGTTTTTATTACAGAATTAATTGGAGAAGGGAAGGCAAGGCTTGCTGAGTGGAGGGCTAGCAGGAATGAGCCTGCAGGAGCTAGCTGGGTCTTTTAGCTTATGCTGAGGACTTTGGAGAAACCAGTGTCACAGGAGGCTAGGTTGTGCAGTGGGGAACAGAGTCAGGGAAGGTACACCTTGATTGGGGAGCTCCTTAACTTTAGGGAGCAAGGGAGACGTGGCTGTGATTGTTAAGCGGGGGTTTGATGTCAGCATGATGCTTGTGTTTACATTTAATATCACCATGTGAGGCACATTGCAGAGAGAAAAGGCTATTGTTGTGAATGGAGGATTTTTCAGGCTCAATGGCACTGAGACCAGCATAGTGGCAGGAGAGATGGAGGAAGCAGAAGGTTTGAAATCAGGATGTAAACTGAAAGAATTGATAAAACTTGATGAAATGATTCTGTGTAAAGTCAAAAACCAAAAAGTCAGCACTGAATGACATTTCACACATGGGTAACTGCATGAGTGGTGTTGAGGTAGAAGATGGGAAAGGAGAGCAACTTTAGGGTGGGAGAAAGTTTTTTCTCTTTTTTTAATGTAATAGTTTATTTTTGATAATTTTTGATAATTGAATGTGAACTTGCAAAAGTGTGTCTCACGAAAACTCCCATATTTGGGTGGATGTCCTGACTGGGGCTCAGGCTATAGGTCAGCACTGGACACTGGAGG
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Task1_train_27789
The gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) is located on Chromosome 20, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Congenital dyserythropoietic anemia, type II
ATAACTTGCAGCAGTTTCTACATCAGCACATGCTGCTTCACCTTGTGCCATTATGTTATGGAGATGGCTTCTTTCCCTAAACCTCAGGAACCAACCTCTGCCAGCTTCCAGCTTTCTCCTGCAGCTTCCTTACCTCTCTCCACCTTCATAAATTGAAGAGAGTTGGGACCTTGCTCTGGATTAGGCCCTGGCTTAAGGGAATGTTGTATCTGGTTTGATTTTCTATTCAGACTACTAAAACATTCTCCACATCAGCAATAAGGCTGTTTCACTTTCTTATCATTCACGTGTTCACTTTTAATTTCCTTCAAGAACTTTTTCTTTGCATTCACAGCTTGGCAGTTTTGGGGCAAAAGGCCTAGCTTTCAGCTATCTTGGCTTTCAACATACCTTCCCTACTAAGATTAATGAGTTTTAGCTTTTGATTTAAAATGAGAGATGTGTGACTCTTCCTTTCACTTGAACACTTAGAGGGCATTGTAGGGTTATTAACTGGCCTCATTTCAATATTGTTGTATCTCAGGAAATAGGGGAGGCCCAAGGAGGAGGAGAGAGATGAGGGAAAGGTCAGTCAGTGGAGCAACAGAATATACACAACATTTATCAGTTAAGTTTGCCATCTTATATCAGTGCAGTTTGTAGCACCCCAAAACAATTAAAATGGTAACATCAAAGATCACTGATCACAGATCACCATAGCAGATATATAATAATAATGAAAAAGTTGGAAATATTGTGAGAATTACTGAACTGTGACACAGAGACATGAAGTGAGCACATGATGTTAGAAAACTTGCGCCAATAGTCTTGCTTGATGTACGATTGCCACAAATCTTCAATTTGTTAAAAAATCTGCAAATAAATGAGGCATGTCTGTGTTTGTTTAATGATTAACAATCCGTCACAAACTGGATAATTCATCAGCAATAACTCATCCAGTTTGTGATTCATCAATCCATCTTCGTTTTGCTGCATTTCAAAACAAGCCTCAGTCATCCATGTATTTCATGCCTAAACACTTCAGTAGGTGTATCATTAACTTAAGTTCAGTATTGAACGTAGTTCTTCAACTTTTTTGGAGATAAGGTTATATGCAGTGAAATGTGCAAATCCTAAGTGTGCCCTTCAAAATGTGTCAAGAACCTTCCTGTCATTGCTGTGTCAGTCATTTTAGAAGAGTACAGTGGGCTCTGTGACCGTGTTTGAGTTGCGCCTATAACAGACAAGGTTATGGCCTCTCATCCTACAGCACAACACCCCGATCCCCCAAGGAGGCAGAGGAGCCATCCAGTTTGTCACGCATTATCAGCACTCCAGCACCCAGAGACGCATCCGCGTGACCACCATCGCCCGAAAGTAAGCAGCCCCAGTTTCCTTTCTGTTGAGGAACTGACTGACATTTTTCCCTTGAAGAGATACTTTAACATTTGTTAGTTTGTCTTTTTGATTCCATTGAATGGTTCTCACCAGACCTCATTAGCTTATTTGATCAGAGGAGGAGGCATTTTTGGCTAACCCAGTTGGGCCTATGAACACTTGCCTAGAGGAATCATCTTTCTGTAGGAAATATAGTTCATTAAAAGTATTAATTATTATTATTATCATCTGGAGACAGTCTCGCTCTGTTGCCCAAGCTGGAGTACAGTGGCACAATCACAGCTCACCACAGCCTCAACCTCCCATGCTCAAGTGATCCTCCCACTTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACCACAGGCACCTGCCACCAAAACTAGCTAATCTTTTTACTTTTATGCAGAGAGATGGTGATCTCACATTGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTTCTAGGCTCAAGCAGTCCTGCCACCTTGCCCTCCCAAAGTGTTGGGATTTCAGGAATGAGCCACTGCACCTAGCCTGTGTTTCTTTTTCTGAATGGATGTCTGGCTTTCTGATCTCTCCTAAACATAAGCATGGCACTAACTCTGGAATTGTCAGTTGGGCAGATGTACAGAGTCAGCTCAGGCACATAGAAGCAGCATTTGACCAGGAGGCTGCGGCAGTGTTGATGGCACGGCTTGGGGTGTTCCGAGCGGAGTCAGAGGAGGGGCCCGATGTGCTCCGGTGGCTGGACCGACAACTCATCCGACTGGTAAATTGGGGACAGTGGCATTAGGTTCAGTCTTGGTTTCTGCTTTACTTTCGAGAAGAAAATTGTCACTTAATTATTATTATATAGTGAATCAGCAAGAATTTATCAGTTGCCTACCTTATGCTGCACGCTGGACATTCTGTTAAAGACGTGTTAAATGTGCATTTTCCCCTCAGAGATTTACATTATAGTTGGGAAGAAACAACACGCATGGAGCATTTGGAGAGTGATACAAATCTGTGTGGGTTGAGTTGACTTAGATGAGTCATTTTGTGAATGCTCTGGTCTTGTATTTTTCTTCTAAATCTGGAAAGTGGTTTTGGAAATAGGGATCCAGCCTGGTAAGTTTAGGGAGATGCCTTTTATCAGTCTGGATTTAATGAGATGAGAGAAGTCACACTGTAATTTAAATGGGGAAAGTCTTTTATAAAGAATACAACAAGAGAGTAGAACAGTGAGGGACTGGCTAGAAGGAAGTATAGAGAAGTGGGCAGCCACTACTTGTGGGGCTGAGATAGAGCACCAAAGGAAGTGCCCTTCTCCCCAGGGCTGATCCAGACCTAGTTGGGAGGGCATGGCCATGGCTTGGTGAGTCTTTTGCAGAGAAGTTACCGTGGTGCTGTGCCAGGGGAACTTACTAGAAATTCACTTTCTAGAATTTGAAGAAAATCCACCCTCCAGGGTGCCAGGGAAAGCTGTGTATAGGAAAATGTCTCACTGGAGACATGCAGGGATGCTGCTTAGCTGCTGGCTGCCATGTTCTCCAGGAGCTCAGCACTGGGGAGCCACGGTGCAGCAGGACCTGGCACCCGGGAAGCTGCTGAATGAGCACTCGGGCGCCCAAAGCTGACGCTCACCTCCAGCACTCTCTACTGACAACGCTTGATATCGTGCCAGCTGGCAAAGGAGAGGTAGTGAAAGGGCCCATGTCCATTTCACAGCAGGCAAAGGGGGTGAGTTTGGAGCCAGCACAAGGCAATAAATCAATAATTGGCACATGATAATCTTACCTTCCTGGAGAGTCACAGCATGTGTTTGTGATCAAAGCCACCATGGAAAGGCCCAGTAGGGAAACCTGTTTCATTTTGTTCAGCCCTCTATTTGCCCTTGCCATCTCATGGAACCATTTTTCAGGAAGTGTCAACATTTCAAACATAATTTGAAAATTGCTTCTTTAGGATTTCAGAGGGAGGATAGATAAGCAGAGGGCCCAGGTGGCTAACAAAGACTTCCTGTGGAAATGAGCCTTGAGTCAGGTTTTTATTACAGAATTAATTGGAGAAGGGAAGGCAAGGCTTGCTGAGTGGAGGGCTAGCAGGAATGAGCCTGCAGGAGCTAGCTGGGTCTTTTAGCTTATGCTGAGGACTTTGGAGAAACCAGTGTCACAGGAGGCTAGGTTGTGCAGTGGGGAACAGAGTCAGGGAAGGTACACCTTGATTGGGGAGCTCCTTAACTTTAGGGAGCAAGGGAGACGTGGCTGTGATTGTTAAGCGGGGGTTTGATGTCAGCATGATGCTTGTGTTTACATTTAATATCACCATGTGAGGCACATTGCAGAGAGAAAAGGCTATTGTTGTGAATGGAGGATTTTTCAGGCTCAATGGCACTGAGACCAGCATAGTGGCAGGAGAGATGGAGGAAGCAGAAGGTTTGAAATCAGGATGTAAACTGAAAGAATTGATAAAACTTGATGAAATGATTCTGTGTAAAGTCAAAAACCAAAAAGTCAGCACTGAATGACATTTCACACATGGGTAACTGCATGAGTGGTGTTGAGGTAGAAGATGGGAAAGGAGAGCAACTTTAGGGTGGGAGAAAGTTTTTTCTCTTTTTTTAATGTAATAGTTTATTTTTGATAATTTTTGATAATTGAATGTGAACTTGCAAAAGTGTGTCTCACGAAAACTCCCATATTTGGGTGGATGTCCTGACTGGGGCTCAGGCTATAGGTCAGCACTGGACACTGGAGG
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Task1_train_27790
This is a variant in SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component), located on Chromosome 20. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Cowden syndrome 7
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Task1_train_27791
The gene SEC23B (SEC23 homolog B, COPII coat complex component) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_27792
A mutation in NAA20 (N-alpha-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit), located on Chromosome 20, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Intellectual developmental disorder, autosomal recessive 73
AAGAGTTCAGTCTCATCAGTCAAAAGACATGTAAACTAAAACCAAAATGAGATGCCATATTTTATGTATCAGCCAAGATTTTAAAAAATGATAAACCTCAGTGCTGATGATGGTGAGGTGAGAGGAACATTCTCATAAATTGCTAGTGACAATATAAATTGCTATTATCTTTCCAGAAGGCACTTTGGAAATAGTAATTCCATTTCCTGAAAGCTGAAAATAAGAAGAAATAGAGGCAGTTTGTCAGTGGTTGACAAAATAAGGCCCATAGGCCAAATCTGGCCCACTGCCTGTTTTTGTAAATAAAATGTTATTGGGACACCACGCTGATTAATTTATATTTTTTTCTGTGGCTTTTGCAGTTTGAGTAGTTCAGCAGGGACTGTATGGCCCACAAAGCCTAGGATGTTAACTATTTGGCCTTTTACAGAAAAAGTTTGCTAACCCCTGAGTTATACCATTACAAACATTATTTATTGCAGGAGAGTTACTAAGCATTTGGAATAAGATTCACACACAACAATCAGGAGATGGTTAAGTAAATTAAGCTGTACTGAAGAAGGATTTCAAACATTTTTTTGAGAAACAGGAAATGACCCAGGTGTCCATTGTCAGGATACAGGCTATTTAAGGTGTCTCTTCACATAAAGAAATACTATACAGCAGTAAAAATTAACTTACAGGTGCAGGCAGCAACAGGACTACATATCAGAAACAAAACTGAATGGGAAAAGCAAAAAATCTCTGCAGGTTCATCTGGATTTTTTAAATTACGACTAATGATATCACCACTTTTAAGATTTTTGAAGAATTTTGAATGACAAAAGTTTCACTATATAGGAAGGAAGGATTTTAGGATGCAAATCCGTTTATATGGTGTGCTTCCAGTGACATTTAAAATTTGCAGTGAAAGTCCCATAATCCAGGTGAGCCTATATTTGAAAGTAACCTGTTAGGTCCTAGAGGTCGATGGGAGGGAGGGGTGTCTGGGACTCCTCTGTTAGCCACAGAAGAGATGGTTGTGGTATATGTCAGTGGCTGGCTGGCAGGAAGACTGGCTGTCCTGCCATGTTAAGGGTTGTATTTGAGGGGTATTCAAAATAATGATGGTCCTTCAGAGGAGATTTTGAAGAATTTCGCACGGAACAGGTTTTCCAGGAACTTAAAAAATATATTTATGTGTGATTGATGGTGTCCTCTGATAAATTGCATCAGAAAGTTTATACTAACAAGAAATATATTTTCATCCATTAAAGTACAGAGTAAAAAGAAGAAGAGAAATGTAGGAATGATTACATGTCAGTAAGGATATCCCAAGGTTGAAGAGTGAAGTCATGAGCAAATTATTCAGGCATTTACTGTTAACATAGTTGATTCCTTAAGTCAGCTTTTATCTGCATTACTAGAAATGCAGGATTTGAATCAGTGGAGAGGAAAAACTGGGTAATTAAGTTGGCTCTGGAAGGACTTAGGTTGTAAAGTTATTTTCACAGTCTCATAGCTGAAGTCAAAGTAGGAACTACCCATTAATTTTTCAGTGCAATTATGTAAGCATCAGTGTATTAAGCATCTACTGTGTACCAGGCACCAGGGACAGAGGGAACATGATATTCATAGACTAAGAGGAGGCAGACCGCAAACAAACAATATCAGGTGATAAATGGAGAGACTTAGATATGGTATGGTCAGTAGGGAAGTAGACTGTAGAACTTTGGGGTCCTGATTCTCTGCTTTCTATTAGACAGTGCTATCACCATTCCACACTTGAGGCTATATGTCCAGGCAATTTTGTTAAAAATCAGTGATAACCTAAATATTTCATGTAATGGTATGTATGATTATAGGACTCATACAGAGCTGGGGATAAAGTAACAGTATACTTTTTAAAGGAAACTTTTTTTACAATATCCCTTAATGAAGAACTTTTTACTGTCCATTACTTTTCACACTCCTTAACAGGACTCTAGTATGGGATTCCTTTCTACCTACAATACCTCGCCCACTGGCCAGAGTATTTCATTGTTGCAGAGGCACCTGGTGGAGAATTAATGGGTTATAGTAAGTATAATACCACTAGTATTTTGTGGAGTAGGTAAAGATTTTAATATAGATTTCAACTGATTGCTTTAGACTGCAGAATTGGAATATAATGATGCTTGTAATTTTATTTCCTCTTCAACAATTCAAGAACTTACTGATCTCTGTTTTGGGCACTGTGCTAGGCCCAGGCGATAACGGCAGTGAACCAGACAGACATGGTCTTAGTCTTCTTAAATCTTTCATTCTAAAAAAAAAAAAAATCTTTCATTCTAAGGCCAGGTACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCAAGGCAGGCAGATCCTTTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCGGCCTGGCCAAATGGTGAAAGCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTATCGCGTGCCTATAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGGGAGAATCACTTGAACCCCGGAGGCAGAACTTGCAGTGGGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATCTTTCATTCTATACTTTTGTTAAATTTCTACATGGTTTATTTAGTACATAATGCAGGCATCATAGCATCCTCATTGAATTAGCATTACTAACAGAACCTTTAGCTCTGAACTATATGTGTACATCCACATGTACCCACATATACCCACACCCATATGAAATGCAGATATTTGAAAAAATACATACTCTGGTTTTTTTTTTTTCAAAATTAGTTGTGTTTTAAGTATATCGTTCTTTTTTGTTCTAATTCTGATTTTAGAACTATTCTAAATGTAACAGATAGTGTTACATTTACAAGTGAATTTCAAATAAAAGCACTAACTGTTAGCTGGATGACCTCAGGTGGTACTTAAAAACTTCTTTATTAGTTTCCTTTGTAATAAAAACATACTGAACAGTAATTCTATATTTATGTGTAAATCAATGTCTAGTTACTGAATGTGATTTTTGTTGTTGTTGGCAGTTATGGGTAAAGCAGAAGGCTCAGTAGCTAGGGAAGAATGGCACGGGCACGTCACAGCTCTGTCTGTTGCCCCAGAATTTCGACGCCTTGGTTTGGCTGCTAAACTTATGGAGTTACTAGAGGAGATTTCAGAAAGGTGAGATTCAGTTTTTCAAATACACTTAGTGATTTGTGGACCCCTAACCATTTTCTTCCCCTTCAGGCTGAATAACTGTCATGCTTTACAGTTCACAGGAATTTCATCTTCCATCTCCAGTAGTCCTTAGAACAATTCTATCACATAGTCAAAGTGATATTGTTTCTATTTTGCCATTGAGGAAATTAAGGCAAAGTGTTGTAGTGACCCGCTATAGGCCTATAAGCTGAGGAATTGGTGCAATTCAGTTCCAAAGGCTAGCTCTCGAGGTTTCTCTTAGTGTTCCTGCCACAGTGGCACACATTCCTAAAATCTGTTACCATTGCTTTGGCATCTGAATAAATTTTTAGCAGTGCTCCTCGGCCAAAAGAAAATAGTTCAGTCTTAAGCAGTTATATTCTAACTGTTTAATAAGTATTTATAGCCTAACAGCTAATAGCCATTTAGAAAAAAAATAAATTGAAAGAAGAAATATTTTCATTTCATTCTTAAATAACTGTGGCTAGCTACCAATGAGAGGTGTGCACCTGTTGGACATTAAATGACTTGGCAGAACCACTTGCATTCCTGTTTCATATTGATTTTCATCTAGTATTTTTTTTTAATCACAGCAACTGCCAGAAACTCAGCTTCATAGAAATATTATGTCATTAAGAGGAATGTAGCATGATCTTACGTTGAATTTGTGAACTACTTCAAACTAGTTTGCCAATATCTGACATGTAAGGTTTTGCTGTTTTCCCTGAACATTCGAAATATCCTTTGGTGGCTGTATGAGTTTGGGACACCTTAGGGCACCTGAGTGCACAGTTTGCGAACTGCCAGCATGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGGACGTGTTGTATATATCAAACCTCTTCATTACT
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Task1_train_27793
Gene NAA20 (N-alpha-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit), found on Chromosome 20, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Intellectual developmental disorder, autosomal recessive 73
TCAAAATAATGATGGTCCTTCAGAGGAGATTTTGAAGAATTTCGCACGGAACAGGTTTTCCAGGAACTTAAAAAATATATTTATGTGTGATTGATGGTGTCCTCTGATAAATTGCATCAGAAAGTTTATACTAACAAGAAATATATTTTCATCCATTAAAGTACAGAGTAAAAAGAAGAAGAGAAATGTAGGAATGATTACATGTCAGTAAGGATATCCCAAGGTTGAAGAGTGAAGTCATGAGCAAATTATTCAGGCATTTACTGTTAACATAGTTGATTCCTTAAGTCAGCTTTTATCTGCATTACTAGAAATGCAGGATTTGAATCAGTGGAGAGGAAAAACTGGGTAATTAAGTTGGCTCTGGAAGGACTTAGGTTGTAAAGTTATTTTCACAGTCTCATAGCTGAAGTCAAAGTAGGAACTACCCATTAATTTTTCAGTGCAATTATGTAAGCATCAGTGTATTAAGCATCTACTGTGTACCAGGCACCAGGGACAGAGGGAACATGATATTCATAGACTAAGAGGAGGCAGACCGCAAACAAACAATATCAGGTGATAAATGGAGAGACTTAGATATGGTATGGTCAGTAGGGAAGTAGACTGTAGAACTTTGGGGTCCTGATTCTCTGCTTTCTATTAGACAGTGCTATCACCATTCCACACTTGAGGCTATATGTCCAGGCAATTTTGTTAAAAATCAGTGATAACCTAAATATTTCATGTAATGGTATGTATGATTATAGGACTCATACAGAGCTGGGGATAAAGTAACAGTATACTTTTTAAAGGAAACTTTTTTTACAATATCCCTTAATGAAGAACTTTTTACTGTCCATTACTTTTCACACTCCTTAACAGGACTCTAGTATGGGATTCCTTTCTACCTACAATACCTCGCCCACTGGCCAGAGTATTTCATTGTTGCAGAGGCACCTGGTGGAGAATTAATGGGTTATAGTAAGTATAATACCACTAGTATTTTGTGGAGTAGGTAAAGATTTTAATATAGATTTCAACTGATTGCTTTAGACTGCAGAATTGGAATATAATGATGCTTGTAATTTTATTTCCTCTTCAACAATTCAAGAACTTACTGATCTCTGTTTTGGGCACTGTGCTAGGCCCAGGCGATAACGGCAGTGAACCAGACAGACATGGTCTTAGTCTTCTTAAATCTTTCATTCTAAAAAAAAAAAAAATCTTTCATTCTAAGGCCAGGTACAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCAAGGCAGGCAGATCCTTTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCGGCCTGGCCAAATGGTGAAAGCCTGCCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTATCGCGTGCCTATAATCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGGCGGGAGAATCACTTGAACCCCGGAGGCAGAACTTGCAGTGGGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATCTTTCATTCTATACTTTTGTTAAATTTCTACATGGTTTATTTAGTACATAATGCAGGCATCATAGCATCCTCATTGAATTAGCATTACTAACAGAACCTTTAGCTCTGAACTATATGTGTACATCCACATGTACCCACATATACCCACACCCATATGAAATGCAGATATTTGAAAAAATACATACTCTGGTTTTTTTTTTTTCAAAATTAGTTGTGTTTTAAGTATATCGTTCTTTTTTGTTCTAATTCTGATTTTAGAACTATTCTAAATGTAACAGATAGTGTTACATTTACAAGTGAATTTCAAATAAAAGCACTAACTGTTAGCTGGATGACCTCAGGTGGTACTTAAAAACTTCTTTATTAGTTTCCTTTGTAATAAAAACATACTGAACAGTAATTCTATATTTATGTGTAAATCAATGTCTAGTTACTGAATGTGATTTTTGTTGTTGTTGGCAGTTATGGGTAAAGCAGAAGGCTCAGTAGCTAGGGAAGAATGGCACGGGCACGTCACAGCTCTGTCTGTTGCCCCAGAATTTCGACGCCTTGGTTTGGCTGCTAAACTTATGGAGTTACTAGAGGAGATTTCAGAAAGGTGAGATTCAGTTTTTCAAATACACTTAGTGATTTGTGGACCCCTAACCATTTTCTTCCCCTTCAGGCTGAATAACTGTCATGCTTTACAGTTCACAGGAATTTCATCTTCCATCTCCAGTAGTCCTTAGAACAATTCTATCACATAGTCAAAGTGATATTGTTTCTATTTTGCCATTGAGGAAATTAAGGCAAAGTGTTGTAGTGACCCGCTATAGGCCTATAAGCTGAGGAATTGGTGCAATTCAGTTCCAAAGGCTAGCTCTCGAGGTTTCTCTTAGTGTTCCTGCCACAGTGGCACACATTCCTAAAATCTGTTACCATTGCTTTGGCATCTGAATAAATTTTTAGCAGTGCTCCTCGGCCAAAAGAAAATAGTTCAGTCTTAAGCAGTTATATTCTAACTGTTTAATAAGTATTTATAGCCTAACAGCTAATAGCCATTTAGAAAAAAAATAAATTGAAAGAAGAAATATTTTCATTTCATTCTTAAATAACTGTGGCTAGCTACCAATGAGAGGTGTGCACCTGTTGGACATTAAATGACTTGGCAGAACCACTTGCATTCCTGTTTCATATTGATTTTCATCTAGTATTTTTTTTTAATCACAGCAACTGCCAGAAACTCAGCTTCATAGAAATATTATGTCATTAAGAGGAATGTAGCATGATCTTACGTTGAATTTGTGAACTACTTCAAACTAGTTTGCCAATATCTGACATGTAAGGTTTTGCTGTTTTCCCTGAACATTCGAAATATCCTTTGGTGGCTGTATGAGTTTGGGACACCTTAGGGCACCTGAGTGCACAGTTTGCGAACTGCCAGCATGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGGACGTGTTGTATATATCAAACCTCTTCATTACTGGAGATAAAAGAAATACAATAAATAGAAGAGAAGGCCCCTCCTCGTATCTTCATTCTAGAAGAGAGATGTTTGTAGTAGCTTCACCTGTTGTCAAGCTGCCATTTCTTTCTCCACTGTAATTTCCTAAAAGTGTGGTAGGAAAGAGAATAGTTGCTGAGAAGGGTTCTTGAGCTTAATTTCTACTTAATTATTAGATTTAATAAAGGCAAGTTTTAAAGAAGTATCTGTGGCCTGACAAAGACTTCAAGCCAAATTAGAGGCAAAGGAGCTCAAACTCATTCAGAGAAGAAATTGTGTTAGCTGAAAAAGAAGTCGGTGCTAATCTTTAAGATTTTTTAAAGTTCTCTCTAGACCAAACAAAGAAGGGAAGAAAATTTTAGCATGATTATAGTTTACACACATTTATTAATGGCATTATGTTGAAAAAAAGTATTTGGCATTATTGTATAGTGAACAGGGAGTTAGAAAGTGGGTTGTTCAATGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAACATCACACACCAGGGCCTGTCGGGGGTGGGGGTCTAAGGGAGGGATAGAATTAGGATAAATACCTAATGTAGATGACGAGTTGATGGGTGCAGCAAACCACCATGGCACGCGTATACCTATGTAACAAACCTGCACGTTCTGCACATGTATCCCAGAACTTAAAGTATAATAATAATAAAAAAAAGCAGGTCGTAACTAGCTATGACCTTGCACATATAATTTAGGGTATTTGTATGATAGATTCTCCCTCTGAGTAGAAGACCACTAAGCTCTCTTCCCTTCCAGTTTCTAAGCCTTCATTATTTTAGACTAGTTGCTAAGATTTAAGTAATCTTCATTTGTAGGCATATATATACATATACACATACATGATACATATACATATGCTTATATACACTATATACATGTATACATAGTGCATACAATGTATACATTAAAAATAGAAACCAAACAAGTAGAGGAGAAGAAAAATTGAATGATAGAAGTCAACTCCAAAGAAGAGAAAAAGGAAATTAAACCAGCAAAACAAAATGCATGAAATAAAATGGTAGCCCAGAATCCAAATATTGTCAGTAATTACAACA
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Task1_train_27794
The gene CFAP61 (cilia and flagella associated protein 61) on Chromosome 20 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Spermatogenic failure 84
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Task1_train_27795
This variant affects gene CFAP61 (cilia and flagella associated protein 61) located on Chromosome 20. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Spermatogenic failure 84
TTAAATGATCAATTTGGGTGGCTGGCATGGGTATCCTTGACAGTTGTGCTTGTATGTTTCTCCATGGCATCTCCCCTGTCACTGGTAATGCCACCGCCCCTCTTTTTGATTGGGAGGGATGGCAGTATCTGGCTTCCCCTTGTGTGCTTGAATGGAGTACCAGCCGGCAGGCAGGGACTCCAGGTGACCCAAGGTAAGAAGGTTTCACCTAGTGGTAGGGTTTCCTTCCAGTGTAAAACTGCCTTACTTTTTTGTCCTCCATTATGCTCTCATTACACCAAAAATAATTTTTGTTGTTGTTATTTTAAGGGATTTGGGATGGGAAGAAAATTAGATGCACATGGCCCATCTGCTGTTTTGAGCTAATAACCTCTGTTGGCTCTTTGCTTTTTGTTTTTCAGTGATTTCTCAGCCCTATACTTATCACTCATTTTATTTTATAATGAGAGATGCCTCCTTGGTAATTAAAGAAAAGTCTTATAGTATAAAGGCCATTACAGGGTCAATGCAGATTGAAAGGTTGCCAGAACTGCCCTAGGGTTCCGCCACTGGCCCGGTTACCCTGAGCTCTGTTTCCTCTGTGCTTTGTGACAGAAGCTGGAAAGGCAGGGGACCTCGAGGAGCTTGGCCACAGATGCCACAGTTTTCATGGATTTGCTGGTGCCAGCCTTGCTGATCACAGAACACATCAGGGGCCTTGCATTCTCCAATTTCTGTTCTTGAAAGTAGGCTTTTAAAACAATTTTACTGTGGAAAACAAGGAGAAATATAAGTTGGTGTTTTGCAACCTGCATATATGATTTGATTTTTCCTGCATTTTGGGTGCGTTTACTGCTGCTGTCATCAGAGAGTCACACTCACCTTGGAGTGCTCCCCTCCCCCCACGCTCCTGACAGCATACACTGCTGGGAGGTGACACAGGACAGGCTGGCCCAGGGCACAGTTAGCATGGAGACCTGGGATCCCAGTGCAGTGTGGGGACAGAGGGGGGACCAGAACTGGGCCTGTGGAAACGAGCAGTGTGCCTGATATTTCCTTTACATGGGAAGACACTCATCAGTCCTTTAAATTACCTTCCTCTGTAAAAATATTACACATCAAGGGGGATAGAAGGTTTAAGAAGTGCACAGGGATAAGGCCCAATTACGCAGTTTTATAGCAGGCCAGCCAGCCATACATGTAATCAAAATGTATGATATGGGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATTCCATCATTTGGGAGGCCGAGACAGGCAGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCTGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTATCTCTACTAGAATTACAAAAAAATTAGCCAGGCGTGATGGTGGGCGCCTGAAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATCTCTTGAACCCAGGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCGAAGATCGCGCCAGTGTATTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGATACTGTCTCAAACTAAACAAAACAAAACAAAGTGTGTAACTTGGGGGTGACACATTTCCACACTAACAGGTGAATAGTAATGCATCAGAGAACACCAGTGGCTCTGTTTGCCCGACTCCTGAATTTCCCACAGGCTCCGTCTCTTGTGCTGACTGGCTTGTGCTCACATCGCCTGGCAGTGTCACGGAGCTGCTGTCCTGCCGCTTGGCCAATGGCACAGACTCGGGGCTCTCTGAGTTGATAGCAGCCATGGGTATGGAAGGAGCACATTACAAGCTGTGCTGCCATCCCCCAAAGACAATCCATCAGAACAACTAGCACTCAGGAAACGTAATTTCTAATTTAAAGAATTTACCATGGAGATGAGGTGGCAAATATGGAAGAGAAAAATACGTTTCTTACTATCATACCTAAAGTAATTTTTAAAAGATATTTATCACAAAATGCATGCCGTTTGTTTAAAATGCTTGTAGAAACCATCCCTTCTGTCTCTTCTGTAGGACATTGAGTACATACGGTCCCATTACAACATTGAAGATTTCATCTACTTCAGTCACCACCAGCGCGAAGAACACGGGCACATGCATCACTTTGCCCTCAACCCCATTTTCCGGCACTACACCAAGTTCTTTCTGAAGGAGATCCTGCGTTTAGGCTTTAAATCCTGTCTCTACTACCGTGTTTACCCAAAATCCAGAGAAGGCAAGGTAAGAGAATGGTGCAATTCACTTTCCCAGCAGGTCAACGTTCACAGTGTTGTTGGTGTTGTACGCCGCATTCTATTCATTCCTCTCATGATGGGTTTTGATGATAACATGGGTCTGAATTTCCAATGGCCATATTTAGTTTGGCCTTTTTCATAAACTACAGTGACATTCTGTAGGCTTCGAATTTCTGACACAATCACAACTAATATAATTGGTAGTACAATATGTTGGCTTTTCTATATTGACAAAATAGAGACTGAAAACTGTGCAGAAATGCTCTAAGAGCATGAAGATCTAATAATTTCTTATGATACGTGAGTACAATGCCAACATGATCCTATTCTGTTCCTTCAAGCCAAGAACATTTCAGTGATGAATCCATAGAATAAATTAATTCTATTTTAGAAGACTGGCATGCTATCCCAGCATTCCAAATAAGCACTATACACACCCCTACTAGGTGATGGAGAGAAAGTGCGGAGATGCCTGATGCCGATGTAACCCCATGTAACACTTGCCACATTTGCATGGAGTAATACTGTGGTAATAGACGCGAATCTGATGTGTATACATGGTGTGTATGTGCATGCACAGATAGCAAGTCCTCCATCTTACTTGCATACCTCCCATCCCACTTTAGTGTTCCTCATAGCACTCACCACCAACTGAAGTTATCTATTTTACCATGAACGCAGCCATGCTTTTATCTGTCTTGTTCAAAGCTGTATCCCCATTGCCTAGAAGAGTCACAAACACACACACACACAGAGACACCCCACACACTCTCATGCATTCATGCACATATACCACACTCTCACACACACTCATGAGTTCACACATATACTCACCCCCCTCCCCCACACGCACACACTCACACACTCATATAAGGTGTCTGGTTGTTCCACAGGAAAAGGCCTATTCAAGATAGATTCCCAAGGGTTTTTTTTCCTGAAAATTGGTCTCTCAGTCACTGACAACATTGGTCCTCAACTTGATGTAGACTTGGGGGTGAAGGGATTCAACCACTAGAACAGGTAGAAGTTGTCCCGTAAGATTCCACTCATGAACTCAAACTTTCCCATGTTCTGCCTAGAGTCTTTGACATTGTCTCATCAGCACAAGGGAGCTAAGGGATCTTAAAATGCCTTATTATTAATATGTCTATTTATTAAACAATCTAAAGTGTGTTAGTACATATACACATAACAATAATTTTGCCAGTGTATTTTATTTAACGAAAACCTTTTGGAGAAGTCCAGAAAACCTTTTGGAGAAGTCCAGAGGGAATGGGGAAGAAAGAAGAAAAACAGAAAAGGTTTTGAGTGAGATGTAGACTCTGCTCTAGTTTTTTTTAGTTTTTGTTTTTTCCTGTCAAAATGCAGCACCATGGCAATGAAATGGCCCAGCTTTGAACTCACTGAGATGGGAAGGTAACAGTTCTGCTGGAAAATCCTGGTCCTGCACAGTTTTCTTTTACTTTGCACTTGGCCAAATGCCAGTTTTGTGACCTTCAGGATGTGATATTAAATTCTTGTTTTTATTCATGAAGTTGCCTGGATGTTCTGGGTTAGAGAAAGTCCATTTGCATCCATAATAAAAATAATACCTTGGGCATTTCATTAAATGTTTATACATTTACCTCAATAGTATGAAATTAGGAATATGTTCCACACTGTTGTATGTAGCCTCTAAAAACATGCTTGGAAACAGATTTCTTCTCAGTCTGCCCTTCCAGTTGATTTCACATATTCATTTAAAACAAGTGTATGAAGCAGTTCCAAATAATTTGGGTAAGAATTCCCAAATTCTGCTATAAATCTCCAGTTGACTACAGTAAAGTTGAGCTTTTTGGCTCACATTATGGGGATGGTTTTCTCTGTATCCCTCTGGTCAGGGCATGTATTAAGAGCTCTTCC
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Task1_train_27796
With a mutation on Chromosome 20 in gene CFAP61 (cilia and flagella associated protein 61), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Spermatogenic failure 84
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Task1_train_27797
A variant was discovered on Chromosome 20, affecting KIZ, LOC130065507 (kizuna centrosomal protein| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12713). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Retinitis pigmentosa 69
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Task1_train_27798
A variant affecting Chromosome 20, within the gene KIZ, LOC130065507 (kizuna centrosomal protein| ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 12713), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_27799
Here is a genetic alteration in PAX1 (paired box 1) on Chromosome 20. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Otofaciocervical syndrome 2
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