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Gene DCC (DCC netrin 1 receptor) on Chromosome 18 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Carcinoma of colon
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ATACAGTATTTTAAGTCAATGCTGGAGTTGATTAAAGTCTTACTTTTCCCTTTAAATTCCAAGTCAGTTATGAGAAACAATGATAAAAAATGAGCTTTTATCCCCAGATTTATAGTCCTTGAACTAGATTTCATGTTCATTTATGTTGCTTCCTCAAAAAACCCATGTAAATTGGATGGGCTAGGTCAACAAGCTAGTGATCATCCTTCATTTGCTCCATGGAGTTAGACAGATGTTGGTGCAAAATTCTTACACCGCCTGCCCATTCCTAAATGTGCGAACTTAGGCAAGTTACTTATTTTGTCTTTATTTTGGCACCCCCATGTGTGAACTGAGAATAAGAATACTTAGCAGGATTGTTTTGAAAAATAGTAATATATAATATTATAATAAGATGATTAATATTAAAAATAGCCCTCATTTGGATAACTATTTTTGGCACCAACTCCCAGGCAACTTTTCACAGCGTGAATAGTTAGCCCTCTTTGAACAAGTTACTAAGTACCAGCCACTTTAAATACATAATCTCATTTAATCCTAACAAATTACTAGTATCATTCCTATTTTGCAGATGAAAAACAGGCCAAGACAGGTTCAGTTGACAAGAAATTGCACAGATCTAAATGCAGACTGGACTTACTGTGAATCCCAAATTTTCCCTCACCATGTTATTTTGTCCAAAATGAAACTAAAATGCTTGGCATAGATCTAGACTTTTGTAGGCACTCAGTAAATATTATTTCCACTCTGAAGAAAACGATTCATGTTTCATTTCGCTTCTCATCAGAGGTACCACGAACAGAATATCACCCTTTTATGATAAATCACTCAAATTGCAGACTTTTGATCCCTAAAGTTCAAGAGTGAAAAGGTATAAATATGAAGAAATTTCATGTTAGGTCACGGGATGGGAAAAGATGCTTATGTCAGGATTTACCATTTCTAGTGACCAGCACCTAGCAGATTGCTGGTTTATTAGATTTATTTATTATTTTCATTGTTTCCTTCAGATGACTCCTATTTATCTGATTGTAGAGTAACCTCTGAGCTTTATTAGCTAGAATTTTATTTTCCACAGTGTAGTCCAAACAACTTTTTCTTGGCAAAATATAGGACCCCATTAGAACCATTAGGACTAAAATGTCAGCTCTCGTGATAGAAGAGAACTGAGGCCACTGTCTTTTCATGGCTTTCTCTAATACCTTTTCTGCTGAAGTCTTGGTTACAATGCTAAGAATGACATAACCCCTTAGTTATGTGAGGTGTACTAGCTGATTCAATAAGCCTTTATGAAAGTTTTATTTTCAGCTATAAGGTCAAGGTTGTATTAGCGCTACAAGCTAAGCAGAATTTATAAGGCAAATTTCAGTTTCCTCCAAAAAGGCAGCCCTTATGTATAGGAAACAGAAATATCATCTATTTGATACTCAGCAGTGCCTCTTATGATTTTCATGAGCAGCAGAATGTCTTTTATTGACAAAAGCCATACAAAAAAAACCAGAATTACATCTTTTTTGTTCCAAAATAGAATTAAAAATGATAGTCTATCAAATTAGCCATGATGGATTTTATTTTATTCTAACGTCTTATGCTCATTTGTAGACCAGAGCAACCATCTCTTCTAACTCTGCAAATCTTCCTTGGTTCTGCTATGCAACTTAGGGCTCATTTAGGTGGTTTAGCACAGGGCTTTCTGGCCCTAAGCCGAGACTGGCACCAAATAAGCTTGCCTGACACTTTATAGGGTGTGATGAACAGTCCAGAGCTCCCAGGCAACTTTCCACAGCATGATTTGGAATCTACTTGCAATTACATATGGCTAGTGGAGCTGCATCTGGAGAAGCCTAATCAGAATTTGTCTTCCATTTAGTAGAAATAAAACGAGCCCACTCATTGTGTCAGAATTCATCTTTACACTACAGAATGAGCAATAACCTAAAATCAATGCCAATCTCCTGGATATGGTGTATATACTTGAGAAAGTGTTCTGCAGAATGTTTTCTACATTACTTTCATCACTGTGTTTTCTATTTCAGGGCCCACTCTTCATAAGACCCATGTGAAAACAGCCTCCCTTGGGTTGGCTGGAAAAGCAAGATCCCCTTTGCTTCCTGTGTCTGTGCCAACAGCCCCTGAAGTGTCTGAGGAGAGCCACAAACCAACAGAGGATTCAGCCAATGTAAGGGCATCTTTAAAATTCATGCTTCATCAAGGGACAGATTGACTGGCGCTGTGTAATAGCATCTAAACCAATGAGTACTGTCCATTCACCCCAGGCCACCCCAGGCCATTGTTGTTCTTATTGTTGTTTGTTCCTTTGTTTTCCTGCACTTAAATATGAAGAGGAAATAAAAGCTATGAAAAAAAATTATGTCAGAGACTTAGTTATGTAAAAAAGTTGATTCTTAAGGACAGTCTTAGAAATATGACCAGATAGCTACAGAACGTGTGGTTTTACACCCATATATGTACATAATATATACATATACACATGATATACACATGGATACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTTTTCAATAGGAAGAAATACCTTGGCATTCTTGGAAATAAATAAGACTATATAACTCTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTATTTTAAGAGACAGGGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGCTAGAGGGTAGTGGCTATTCACAGGCACAATCATAGTGCACTACAGCCCTGAACTTCTTAGCTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAATTTCCCAAGTAGCTAAGACTATAGGTGCACATTACTACACCAACTTATACAGTTATTCTCTAAAATTAAAAAAATATAGTGACAAAAAGCTATATTATGAGGGCTTTTTGAAGTTATTATATATGTTACTTCTGAAATCATAAAATACCAGAAATATAGATTTGTGAAGGAAAAAATATAAAATAAAAAAATTGAAGGAGTTTAAGTAATACAAAAAGGAAATGACGTAATTAAAAAATAAGAAGGGAAAGTTTATTTAAAGACAGAAAAAGTTTTACTAAGGAAATAAGCTAAAAAGGGTTCCAGTTAGAAAACTCAGAAGGAACATCAATAGAGAAGGGGAAAAAATCAGAATTTTAAGAAAAAAAAAACATTTATCCCGAAAATGCACTGTAAAGGAGATTCAAAAAGACATTGCCTAAAGGCAGCTATTTATAGTACACTTTAGTTGTTTCTGAATATAATTCAAGAGAAAACATTTAAAAGAAGCCTAAGGAATTAACATATCAGATATCTTGAAAAATCAGGGCACTAGAAGAGAAAAAAGATGAAAAGAGCAGATTAAAATTCTATTTTGTTATTACATTTGGATCTTTTTTAAGCATAAATTATGAAATGAAAATAATCTGCCACCCTTCCAACTAGCTTGTTTTCTTCATGCATAAATGAAGTCTTCTGCAAAATTTGCAAATAATGTATTGAAAAATAAATTTATAACAATATCAAGGAATAAGTAGGTAACATTTAATCAGTCCTCTGTAAGCAATGCAACTACCAGGTCTTTTATAAAAATTATACTTTCTTTTGATATCTGGTTGTTGTTAAAAACAAAGAATCATTTCATTTGAATGAAGAACAATACATTTTTCTTGACTTAATTTTTTTTCAATACTACAAACAATAAAATATTTTAACGACATAGAGATCAGGGAAGCTGAGTATGTGAGTGTGTCTGTAAATGTTTTGGCAGATGAGTGTTATCTACTTAACATGCTTTTCAAAGATTCAAATTTATAAGACTCTAATGCACTTTTGTGCGTTAGAATATAGCTGTTTATGTCAATATCTGTTTAGGATCAAGGTTTGTGGCCACATCTCAAATAAAATCAAACTTCTAAGTTTACATGAAGTATCTCATCTCATAAAGAATCATGTCAGGTAGGCCTATTTTTACATTAAAGGTTGACTCTAAAGAATGGCAGCCAAATTAAAATATTAAACTTTATTAATATTAAAAGCAGTAAGAAACACATATTAAAGGAAATAAAGAGGACAAATAGTGTAGACCAACATTTGCCTATGAAAACATAATGTGTAATTTTAAATTGACTAGAAGCTA
Task1_train_26101
This gene mutation involves TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
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GAAACGCCTCACTGCACACTACTTCGGCTACACAGGTAGGTAACACTTTAATCATTTTGTTAAATCACAGCCACTTTGATTATGTTATGTTTCCGATGATATAAACATTGGAAGGCACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGATGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGG
Task1_train_26102
The variant affects gene TCF4 (transcription factor 4), which is on Chromosome 18. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
TCACTGCACACTACTTCGGCTACACAGGTAGGTAACACTTTAATCATTTTGTTAAATCACAGCCACTTTGATTATGTTATGTTTCCGATGATATAAACATTGGAAGGCACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGG
TCACTGCACACTACTTCGGCTACACAGGTAGGTAACACTTTAATCATTTTGTTAAATCACAGCCACTTTGATTATGTTATGTTTCCGATGATATAAACATTGGAAGGCACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCACCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGG
Task1_train_26103
This gene mutation involves TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
ACTACTTCGGCTACACAGGTAGGTAACACTTTAATCATTTTGTTAAATCACAGCCACTTTGATTATGTTATGTTTCCGATGATATAAACATTGGAAGGCACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCA
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Task1_train_26104
With a mutation on Chromosome 18 in gene TCF4 (transcription factor 4), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_26105
Here’s a variant in TCF4 (transcription factor 4) located on Chromosome 18. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
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This variant impacts the gene TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
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Task1_train_26107
A variant affecting Chromosome 18, within the gene TCF4 (transcription factor 4), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
ACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCACAGAAGGATGCTGTAAGACCAGGCTCCTCTCTCTCCATAGCGTAAGCGCCTTTCCAGATGGCACTGTCTGCCACAGGTGTGTATGGTAAACATGGAAGT
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Task1_train_26108
This sequence variant lies in TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
ACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCACAGAAGGATGCTGTAAGACCAGGCTCCTCTCTCTCCATAGCGTAAGCGCCTTTCCAGATGGCACTGTCTGCCACAGGTGTGTATGGTAAACATGGAAGT
ACAGTGGTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGATGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCACAGAAGGATGCTGTAAGACCAGGCTCCTCTCTCTCCATAGCGTAAGCGCCTTTCCAGATGGCACTGTCTGCCACAGGTGTGTATGGTAAACATGGAAGT
Task1_train_26109
The variant affects gene TCF4 (transcription factor 4), which is on Chromosome 18. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
GTAACATTGTAGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTTGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCACAGAAGGATGCTGTAAGACCAGGCTCCTCTCTCTCCATAGCGTAAGCGCCTTTCCAGATGGCACTGTCTGCCACAGGTGTGTATGGTAAACATGGAAGTCAACTG
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Task1_train_26110
This alteration occurs within gene TCF4 (transcription factor 4) located on Chromosome 18. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Developmental disorder
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AGCATTCTAACCTTGTACCTCTGAAAATCCCAGAATAGGTTCACAAACGCAACATTACAATTCAGACAAACTCTTTTTGCCATGTCTTGGTAATGCTGCTTGTAATATCTACACATGATGTGACTTTTAAGTCCTGTGTTCCCAAAAGACTGGAGAAACAACTTTCTACTTATTTATGAATGAGAAGCAACATCAGGGTCAGCATTTCATCCTGCACTACCCCTCTGGAAGCAGAGTTGGCACTACAGGTTACGATAACAAACCAGGGAAAGGGACAGAAATAAGACCAAAAAAAAAAAAATCCATATTTACAGTAAAATCTTTCTTTTAAAAAAGTTAATCAGTACTATTTTTTTACAGGAGAAAAAAGTCTGAAACAAATGAACAAAAGCTTACCATAGTCACTAAATTTTTAATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTGTCATAGGTCTATAAGATCCATCTGTTCCTCCTACCCTAAGGAATGGCTAATGTCATCACTTCGTTGTCATCAGGACGTTTGCTGGTTTTGTTACTAGGGCAGCCGAGCTTCCCCTAATTCAATATCCAGTAATTATAAACACTAGCTGACTTGAATACCAACAAAAACGTTCATGTAGTTTTCTTCAGAAGTACACTTTTTCATTATTGCAAGTTTACAATTTTTTTTAAATTAAATATTTTTTTTTCAGACTTACAAATTAATTATATTTTTTTTTTCCAAAAGAAGTTTAGGCACAAATGCATTGTTCCACAGTGTGGAAAGATTGCCGTTCAGTCTCTGGGCTGTGTCTCAGCCTGTACATACTGCTTTGCACATTCTGAATGATATGTTAAAGAAAGTCGTCCCTCAAGTTGCACTTTTTTCTTTCTTTTTTTTGTTTTTCTGTTTTTTGATAATTGGGAATGCTGAAACCTCTTGCGTCTGCGATTCATAACTACTCAGACTTGTCTTATATTACAAAAATGGGGGTTAAGGAGAAGTGTTTATGTGGGTTTAAGATAATACAGCTGTTAAGGAAGTGGTCTCTTGTTTTAATGAAGCAATGTGGCAACTTGGACCTGAGAAAGGAAAAAAGAGAGAAAAAATTCATTAATATATTTGTAACAGAAAAAGTATGCTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTTCCATGAAAGAAAATATCTGTCAATTTGGGTGAAATTCACTTTTATGGCTGATACACTGATGAGAGTTTTGAATGATCGATCTCAGAAATGGCTGAAAACAAACTTGCCCTTTTACATCTGTCCCATGTGATTCGATGCGTCTCCCATTCCAGGGTGTGGGCCGGCCAAGGAGAGAGGGGGAGGCTCTGAGGACACCTTCTCTTCCTCCCTTCTTTTCAGACACGCAGCTTTCGGATTCAGATTCCTTTCTGTGGAGGATTAAAGCACAGAACCTTTGTTTAATGCTGAGGCTTCTGGCAGAGGGCAGCAATGCACTCTTCTTGCGTGTCTGACCTTTTTCTCAGTGTTTATATTACAGAACAAAAGGAACAGTTACTAAGTACTGTGGCAATCCATTTGGTCAGTCACTAGTAAAAGGTGAACTGCATGTGAGTGTGTACAGCCACTTTACAGTAAGCAAAGGTTGGTAAAGCAAATAAACTAAGCTCAAATTACTGAAAGGATATAGGGAAAGTTGCAATATAATCTTAGTTATAAGAGAATCCCACAACTTAATTACAGGAGAAAGGGATGCTGCCTTATGGATTTAGACACAGTCTGCAATGGAAACAATTCTTTGGAATGATGCTTGAAAGTCTACTGTCTGCCACTGCTCAAGACTGGCGTGCCCATCTCAGCTTGTGCCTGCCACAAGCTCCTCACGAGCTCTGCAAGGAGGCTGGCCTGCACTGACCTCGGACTTGCTGCTCCAGACTGAGGATGACGGCCACCGCCTGGTGGAGGATCAGGAGCTTGGTCTGGGGCTTGTCACTCTTGAGGTGGAGCTGCACCATGCGGCCGAGCTCTTTGAAAGCCTCGTTGATGTCACGGACCCGCAGACGCTCTCGGGCATTGTCGGCCATCCTCCGCTCCTTCTCACGCTCTGCCTTCTGCTCTGGTGTCAGGTCCTCATCGTCATTATTGCTGTGGGACAAAAGGGATGCAACATTTTCTAATGGTGTGGGGAAAAAGAAGGTGTCTACATTACTTTGTTTTCTTCCAGAGTTTTCAGGGAACTTTTCCATCTTATGCCATGTTTTTGGCAGAATTTTTATATCCACTTGACCTTGGGATTGGTTTAGATGGCTTTGACAGTTCACAATACACAAGATATTTGGTTTTCTCGCAGACATTAAACCCAAACCAAACAGGTGAGGGTGACGTAGATTAAAGTTAGAGTGCAGGGTGTGCCCATACTGATACAGGGGGGCAGAAAGGGAAAACAAAGCTTTTTTTATTCAATGGGGTTACACTCTGCAAAGCAGGCATTCACCAACTTACGCCTAGCATATGTTGCATAACCACGCTTCAAAAAGACTTTATGTTTATACTTTATTTTTTAAATATATATAAAACCTTTCATACCGTGACATCTGAAATCTAGGGGAAACAAGTAATTGAAAAATGATTTTGATAGGTCAAAAAAATACAAGGCAGCTTAACAGGAGTAAGAAGAAAGGCCTATATGTAAGACACCAGAGCAATGGGAGTGAAGACAGTGAGGCTTTTATTCAGGTGTCCCCATTACCTTGCTTTGAAGGCCTGGTCAACCCACTATGTGAGTCTCATTTTCTCTATGTATTAAACAAAAAGTTACAAAAACATGACTTCCATGGTCTTTAATCTTATAGATGTTTATGATCCACAGAACAAGTTTGGGAAACCTGAACTGATATCAGTCATGCAAAACGATTCAACAAACCAAACACCTGCAGCTTATGAATGACCATGACCTCATTGTGAGTCAAAAATGAAGCCAGAAAGCTGGGTGCAGTGGCTCATGCCTATAACCCCAGCCTGGACGATATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAATAAAAAAAAATTAGCTGGGCACAGTGATGCACACCTGCGGTCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGCTCACTTGAATCTAGGAGGTGGAGGCTACAGTGAGATGTGATCAGGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCCAGACTCTGTCTCTTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCAAAAGGTAATTTCTAATTGTGAAAACCAAAATATTCCATGATTCATAACAAATGCATGGCCGGGCCCAGAATAGTCTGAAAAGATAAGATCGGTTCTGTCCATTTCTGAGTGTTACAGTGACAAATTAGAAACTTTTGAATGGAAGGCAAAGAGGATGATGAGCCACCTGGAAAGCATATCATATGAGGAAGTCGTCACAGCAGCAGGGTTCAAATATTCCAAGGGCTGTCATGTAAAAAAGAGAAGTGTGCACGACGTCTTGTCTCAAGAAGGCAGAGCAGCACGTGCTATAAAGCTCTGAATGACTATTGTGAATAAACATGAGTGAGGACTTTTGGGGGGCTTATGAGAGACACAGAAAATGAAACAAACTTCACTGAACATCAGTAGACTCCCCATCACAAGAAACTCCATGGAAGTGACTAACAATTAACCTAAAGGGTAATTTCACACATTGGAAATGTTCACAGAATAAAGATGATTAATCACAACATTTCGGAGTTGGAAGATGTGGGAAATTATCTACTCAATTAAATGTATATTTAATGAATGCTGGTTTAAAATATATGACTCTGATGTTCCATTTTGGAGAATCTCTGGGTAACTTCCAAGTGGCAATAAGGACCAATTACACTTGAGAAGCTCCAATCAATCAAAAGTGGGAGTGGTATTCTTCGGTTGCAAGTATACGTTACACATAAAGATAATGCACGTAAGTCAAGAACACTTGGGTGAAGGAGAAAAGTTAGGGGCAAGGAGGATGACACCACAGAAGGATGCTGTAAGACCAGGCTCCTCTCTCTCCATAGCGTAAGCGCCTTTCCAGATGGCACTGTCTGCCACAGGTGTGTATGGTAAACATGGAAGTCAACTGAGTCCACTGG
Task1_train_26111
The following genetic variant occurs in TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
TACTGTTACCTAGATCTTGACCTAGTAATTGATTTGATATCCTTCTTGTCGTCATCTAATTTCTTGTCCTCCGAAGATTTCGTGTCTTGCAGGTTCTCATCACCCTCGTCATCGGATTTGATCTCAGAGCTGCCAGAGGAGACACTCTGCCCCTGTAGTCCTGGTGGCATGCCTGCCGAAAAAGAGAAATCAGGTGACATGTACACCACAATCTCACTGCCTGCACACCAGATTGCAAGGCTGCCAGCAGACAATTCATACTGCTGAACTGTGATCCTTCTGTCACTTTTTTTTCCCCCTGCTATCTGTTGAAGTTTCAAAAAATGCACCTGCAGAAACAAGTTTTCCCTGCATTGGCTCTAAGGTTAAATTCTATTTTGCAATCTTTTGGAGTAGATGGTAATTTCACTGTCTACAAAACATCAACTTAATTGCAATGAAAATCATAATCATGAAAATCACACAGCCAATGTTCTGATTAAGAACCCAAGTAAATATCAGCTATTATATTGAGTTTCTTCCATATGCAATGATTTAATAGAAAAATGTCCTTAAAATATAATTCCCAGGGAGTATGCTAAATATGTGCAGTCAAGACTTCAATAGGTACCCTAATGATATTCTGAAATTAGGCTTCTCTTATTCTCAAGAAGTAATCAGCATTTTAAAATGGTACATATGGAAGGCAGTTTGCTACTCATTTTAGAAATTTCTAGCTTTATCATTGCTCAACTTTCCAAGTCACACTGCATTTTAAAACACGACCCTAATGTAGTAATTTTTTTAAAGGTAGAAGCATATCTGTCAAGTATTCCTCTTTATTTGTAATCTGTGTATTCTAGAACCTTGCCACTCAAACTTTGGTCCATGCGGCCTCATCATCTGTGAGCCCATTAGAAATGGACAATCCCAGACCTACAGAAGTGGAATCTGCATTTTAACAAGATGCTCAGGTTGTGCTTATGTGCAGTTTGAGAAGCACAGGTTTAGGACAAAGAGGGCAAAATCCAAAGCCTCCTGATAAGAAAGGTCCTGGCCAGTTGTGGTGGTTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCGGGAGGCTGAGGCGGGTGCATCACTTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCTAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAAATAGCCAGGCATGGTGATGCATGTCTGTAATCCTAGCTACCCCCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGGCTCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCCATAAAATGATTATTATTCATAAAAAATGGGCAGACATACCCATACATATAATTGACACTCAGATCTGTACAATGTTGAACAGCTGAAAAAATGCCCACATGTATTCCTGTGGCAATGTTATCATTTTTATATTAAATGTGAAGGGACTGAGAAGATGTTATCTAAGCGACTCCTAGTCAGCTGGCCAGCAATAGCCCAACTTCCTGGGGTCATGAAAAGCCGCTCGTAATCACCGGTATGAGGCAATCATTAGAGGGCTAGATGACTCAAGAGCGAAAATCATGCAACCAAGCTCCATTTTTTAAATGCACCTATATTTCCTTCCATCTTAAACAACAAAAACAATTTCCTTCCTTCCTATTCATTTGGAAATATCATTTTCAGGCCACAACTAACCACATTAGAGGACCTGAATGAGAAAAATGTGGAAATAGCTAAAATAAAATTTCCTCTCATCAGTCTGTGGCCTCATTCCCTGCTGATATAGGACCAGGATTTCAGAGGATGTTTGAGGAAAACAGTCCCTGGAGAAACACAATTAGCGGGCGAAGTTCTAAATACTTTGCCATTTCCTTACCATTTTTGTGCCCAATTTGATTCCTGGGTTTCTGCCAGTGCTTCTTGAGGGATGAACACCAAGAGGCTGGGTATCAACACTGGTCCTATTGTGAAAGTGAGGTCAGAAGTGCCCTGGTGAGGCCAACCTACCTCTGTAAGGGTCCTGGGGTGGGTTCAGGTCAGGGGAAGTCGCAGACTGGACAGGAAGCTGTGGAACCGGAACCTGGTTTGGCAGAAGAGAATGGCTGCCTCTCAGGGCCACGCCATCTTCACGATGGGTCCCCACCTGAAAGGGCGAGAGGAACCAGAGAGGTGAGCAGGAACCGGAGGTGCGACAGCTATTTCCAGAGGCCAAGAGGACCTGATGAAGGCTGGCTTTTCAAAAACCATACTCCCAAACGCGTTTCACTAGAGGGCGCTGAAGGACCGCACATGCACCTATAGTTCCCGGCGAAAACACTTAACACTCAGTAAGATGCCGTGCTGTACATTCAGTGACAAATATGGCAGAGTAGCTCAGGCAGGTAAAACGTCAAATTGCCTCCCAGGGTGCTGCAGTGGAGCGCACTGATTCGTACCCATCTGTCTTCTATCATGTCCGCCAACAGATCTGACAATTATCTTAATGCCCATATGCTTAATTGTGAGCTTCTCAATTCCCCCATTGCTATCGGAAATCCTACAGGAATTTCAATTTGGCATTCGACTTTCATTTCAGGGGATAAGATTCTCAGGCCTGCCATTTTTTTTTTTCCATAATGCCAGCTAAGCCTCTGACAGCGGAAGCTACAGCAGTATGGGACACAGCCTCTGCTTGGTACAAATATAATAAAATGTCACCTGGCTTTCCAAAACTGGCAGCCCATTCCAAATTAATGTTTACTGTATTTCATCAGCTGCTGAGTTCCAAATCCAAAGGGGGATGGTTTCTGCCAATGCCACCACACCGGAAAATGTACCAATAAAGGTTTTATTAAACACACCAGTAATGCCATCATTGCCATGCAAGGAAGGATGTTTGGACATTTTTCCATTTTTTTCCTCACTATTCTGACCCTAGAAAGACACCATATTGTAAATACTCTTTATGCTTCCAAGAATAAAATTATAGAGTACAGCATGATTACTTCATTAAAAAAATACTGCTGAGCTTTTTATTAACTACTACTATCGACTCTGGGGTCCAGAGACATTGAACTTGTGGCACTGAGACAGCAACTGCCTACTTCATAGCACATGCCTTCAAGCGAAAACATGAAGCATTTGTCAACTAAGAGGACAATCAGTAGTTCACATTTTCTTTTCTATTTCCAAGTATTTTCTTAGCCTATGGTTAAGTGAGCATTTACACAGGACGGTGGGTCTAAAACACAAAAAATTAACCATACATTTATACTGCTATGAATCAGGTTTATTTTTTTTTCCAGTCAAAAATATGAAACCAGAAAGGAGAATCATCACTCTTGTGTTACCAATATATTTTAAAAGGGTATTTCCAAAGAATGCATCAACAATAAGTATCTGAACCAACAACAAATTCACAGGACCTAATAAGCACATGCTATTTAAAGGCAGCCATGTATTAAGTATCACCTATAATATTTTGCTTTTTACTGAAAATATATTTAAGTAATTGATCCTGAAGTATGCCATTTTTATATTCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCACTCCAACTTTTTTTTAAATTTTGGGTGGAGATGATCACATAAATCATATTAATTGTTTGGATTCAAAATACAGCAAGAATAAGACAACACTTGAGGCTTATGAGCCTCAGGAAGTATAAATGAATGTTTCAGCAGAGAGATGTAGGAAGTCCAGCACTGCTCCCCGGTGCCTGTGTCGCAACACAGAACTTTCTGAATGGTGGTTATTTGGCCTCTGTGGGGTGCTTCAAATGTACTGAGACTGATATCTCCCAAAGAAGCCCATTCCATTTTTACCACAAATTGGCCTCTTTGTAGATTTCACTCACTGATTCTAGTTTCAGCTTCTAGAGCTCTGTGGCGTTAAGTACAAACCTTTTTTTTTTTTTAAACATATTCAACCCTGTTGCCTGCCACACCACTCCTTTCCTCTGTGACTGAAGTCTGCTCTCTTATAGGCAGACCACGCCCACCTGCTCCAGCAACCATTTGTAACTCACTCTCTTATATATTTTAA
TACTGTTACCTAGATCTTGACCTAGTAATTGATTTGATATCCTTCTTGTCGTCATCTAATTTCTTGTCCTCCGAAGATTTCGTGTCTTGCAGGTTCTCATCACCCTCGTCATCGGATTTGATCTCAGAGCTGCCAGAGGAGACACTCTGCCCCTGTAGTCCTGGTGGCATGCCTGCCGAAAAAGAGAAATCAGGTGACATGTACACCACAATCTCACTGCCTGCACACCAGATTGCAAGGCTGCCAGCAGACAATTCATACTGCTGAACTGTGATCCTTCTGTCACTTTTTTTTCCCCCTGCTATCTGTTGAAGTTTCAAAAAATGCACCTGCAGAAACAAGTTTTCCCTGCATTGGCTCTAAGGTTAAATTCTATTTTGCAATCTTTTGGAGTAGATGGTAATTTCACTGTCTACAAAACATCAACTTAATTGCAATGAAAATCATAATCATGAAAATCACACAGCCAATGTTCTGATTAAGAACCCAAGTAAATATCAGCTATTATATTGAGTTTCTTCCATATGCAATGATTTAATAGAAAAATGTCCTTAAAATATAATTCCCAGGGAGTATGCTAAATATGTGCAGTCAAGACTTCAATAGGTACCCTAATGATATTCTGAAATTAGGCTTCTCTTATTCTCAAGAAGTAATCAGCATTTTAAAATGGTACATATGGAAGGCAGTTTGCTACTCATTTTAGAAATTTCTAGCTTTATCATTGCTCAACTTTCCAAGTCACACTGCATTTTAAAACACGACCCTAATGTAGTAATTTTTTTAAAGGTAGAAGCATATCTGTCAAGTATTCCTCTTTATTTGTAATCTGTGTATTCTAGAACCTTGCCACTCAAACTTTGGTCCATGCGGCCTCATCATCTGTGAGCCCATTAGAAATGGACAATCCCAGACCTACAGAAGTGGAATCTGCATTTTAACAAGATGCTCAGGTTGTGCTTATGTGCAGTTTGAGAAGCACAGGTTTAGGACAAAGAGGGCAAAATCCAAAGCCTCCTGATAAGAAAGGTCCTGGCCAGTTGTGGTGGTTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCGGGAGGCTGAGGCGGGTGCATCACTTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCCTGGCTAATGTGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACGAAAAATAGCCAGGCATGGTGATGCATGTCTGTAATCCTAGCTACCCCCTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGGCTCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCCATAAAATGATTATTATTCATAAAAAATGGGCAGACATACCCATACATATAATTGACACTCAGATCTGTACAATGTTGAACAGCTGAAAAAATGCCCACATGTATTCCTGTGGCAATGTTATCATTTTTATATTAAATGTGAAGGGACTGAGAAGATGTTATCTAAGCGACTCCTAGTCAGCTGGCCAGCAATAGCCCAACTTCCTGGGGTCATGAAAAGCCGCTCGTAATCACCGGTATGAGGCAATCATTAGAGGGCTAGATGACTCAAGAGCGAAAATCATGCAACCAAGCTCCATTTTTTAAATGCACCTATATTTCCTTCCATCTTAAACAACAAAAACAATTTCCTTCCTTCCTATTCATTTGGAAATATCATTTTCAGGCCACAACTAACCACATTAGAGGACCTGAATGAGAAAAATGTGGAAATAGCTAAAATAAAATTTCCTCTCATCAGTCTGTGGCCTCATTCCCTGCTGATATAGGACCAGGATTTCAGAGGATGTTTGAGGAAAACAGTCCCTGGAGAAACACAATTAGCGGGCGAAGTTCTAAATACTTTGCCATTTCCTTACCATTTTTGTGCCCAATTTGATTCCTGGGTTTCTGCCAGTGCTTCTTGAGGGATGAACACCAAGAGGCTGGGTATCAACACTGGTCCTATTGTGAAAGTGAGGTCAGAAGTGCCCTGGTGAGGCCAACCTACTTCTGTAAGGGTCCTGGGGTGGGTTCAGGTCAGGGGAAGTCGCAGACTGGACAGGAAGCTGTGGAACCGGAACCTGGTTTGGCAGAAGAGAATGGCTGCCTCTCAGGGCCACGCCATCTTCACGATGGGTCCCCACCTGAAAGGGCGAGAGGAACCAGAGAGGTGAGCAGGAACCGGAGGTGCGACAGCTATTTCCAGAGGCCAAGAGGACCTGATGAAGGCTGGCTTTTCAAAAACCATACTCCCAAACGCGTTTCACTAGAGGGCGCTGAAGGACCGCACATGCACCTATAGTTCCCGGCGAAAACACTTAACACTCAGTAAGATGCCGTGCTGTACATTCAGTGACAAATATGGCAGAGTAGCTCAGGCAGGTAAAACGTCAAATTGCCTCCCAGGGTGCTGCAGTGGAGCGCACTGATTCGTACCCATCTGTCTTCTATCATGTCCGCCAACAGATCTGACAATTATCTTAATGCCCATATGCTTAATTGTGAGCTTCTCAATTCCCCCATTGCTATCGGAAATCCTACAGGAATTTCAATTTGGCATTCGACTTTCATTTCAGGGGATAAGATTCTCAGGCCTGCCATTTTTTTTTTTCCATAATGCCAGCTAAGCCTCTGACAGCGGAAGCTACAGCAGTATGGGACACAGCCTCTGCTTGGTACAAATATAATAAAATGTCACCTGGCTTTCCAAAACTGGCAGCCCATTCCAAATTAATGTTTACTGTATTTCATCAGCTGCTGAGTTCCAAATCCAAAGGGGGATGGTTTCTGCCAATGCCACCACACCGGAAAATGTACCAATAAAGGTTTTATTAAACACACCAGTAATGCCATCATTGCCATGCAAGGAAGGATGTTTGGACATTTTTCCATTTTTTTCCTCACTATTCTGACCCTAGAAAGACACCATATTGTAAATACTCTTTATGCTTCCAAGAATAAAATTATAGAGTACAGCATGATTACTTCATTAAAAAAATACTGCTGAGCTTTTTATTAACTACTACTATCGACTCTGGGGTCCAGAGACATTGAACTTGTGGCACTGAGACAGCAACTGCCTACTTCATAGCACATGCCTTCAAGCGAAAACATGAAGCATTTGTCAACTAAGAGGACAATCAGTAGTTCACATTTTCTTTTCTATTTCCAAGTATTTTCTTAGCCTATGGTTAAGTGAGCATTTACACAGGACGGTGGGTCTAAAACACAAAAAATTAACCATACATTTATACTGCTATGAATCAGGTTTATTTTTTTTTCCAGTCAAAAATATGAAACCAGAAAGGAGAATCATCACTCTTGTGTTACCAATATATTTTAAAAGGGTATTTCCAAAGAATGCATCAACAATAAGTATCTGAACCAACAACAAATTCACAGGACCTAATAAGCACATGCTATTTAAAGGCAGCCATGTATTAAGTATCACCTATAATATTTTGCTTTTTACTGAAAATATATTTAAGTAATTGATCCTGAAGTATGCCATTTTTATATTCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCACTCCAACTTTTTTTTAAATTTTGGGTGGAGATGATCACATAAATCATATTAATTGTTTGGATTCAAAATACAGCAAGAATAAGACAACACTTGAGGCTTATGAGCCTCAGGAAGTATAAATGAATGTTTCAGCAGAGAGATGTAGGAAGTCCAGCACTGCTCCCCGGTGCCTGTGTCGCAACACAGAACTTTCTGAATGGTGGTTATTTGGCCTCTGTGGGGTGCTTCAAATGTACTGAGACTGATATCTCCCAAAGAAGCCCATTCCATTTTTACCACAAATTGGCCTCTTTGTAGATTTCACTCACTGATTCTAGTTTCAGCTTCTAGAGCTCTGTGGCGTTAAGTACAAACCTTTTTTTTTTTTTAAACATATTCAACCCTGTTGCCTGCCACACCACTCCTTTCCTCTGTGACTGAAGTCTGCTCTCTTATAGGCAGACCACGCCCACCTGCTCCAGCAACCATTTGTAACTCACTCTCTTATATATTTTAA
Task1_train_26112
Here is a genetic alteration in TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
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Task1_train_26113
Gene TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
GTCAATATACAGCAATGACTAAAAGTTTCTTCTGAAGAAAATAATTTTTTTATGATTCATTAAACTTGAAGGTAAAAAAAGATTGCTGTTAGAATACATATTACATGTCTAACCTACAAAATAAAAAACACTTTAAATGTAAAATAATACACATTCAGTGTAGAAAACTTGGAAAATACATAATTCAAAAAAGGAAAAAATAATAGCTATGATCTCACTGAAATCTCATGCCCCGACACTGTTAGCACTTTTAAAATCCACTCTTCCTGTCTTTTCTGGGTGTGCATGTATATTTTTATGCTAAATAAAAATAGAATATTTTGTTCAATTACTTTTCTTGACAGAATTTGGACAGAGCCGTCGGTGTGAAAATAGCAATCTGTCCCCATATTTGCATCTTCATAAAAGTTCTTTCTTCCTAACATGTGGTCTTCCATGATGCATTACCAAGACCCAAAAAGTGGCATCTCTAGCCTTGTTTCTGTGCCTTTCACTGAGATCATGCTACTCAGGTCGAGGGAATTTGTGATGTTTTCTAGAATGACTGTGCATCCTAATTTTTCTTTCCCACCATTAATCTAGAAATGGATGGCAGAACTGTGAGCACCAGATTTTTGTCCAAGCTCTGCTATTACCACTGGTAATAAACTCAACAACTCAACTCCCTTTTTGGGACTCAGTATTCTCATCTGTAAAATCAGGGTATCAGACTACATTAGTCGTTCTCAAACATTATGATACCATAGAACATTTCTTTTTCTAAATTAGAAAATGAATAAAATGAAAGCTACTTTGTTTGAAATGTGGAAACTGGAGTTCCACCTGCTCAGATTCCTCTATCCCTTGTTGTATCTCTTGTTGTCTCGAAAGGGGGTTACTGACAATTGAAATCATTTTTCAGAGTGTAAGAATCTGGTACAGAACCCGAGGAGTACAACAATACTGAACTCTAGTTTCTATTTCCACCAGGGGGAACGTTTGATTATCCTCTTAAAATCACCTCAATCGCTTCCCAGTTTCAACGCGGTCTCTCTGGACATAGAGACTTCAGAATCCCACTGCCCTCTCTATTCTGTGATCTTCTCATACCACGGAGGCTTGGAAGAGGTTGACATTAAATCCCAGCTAAGCCATGGCCATCATTTCTGAAAGTTTTGTGGCAATGTGAAACCTCCTGTCCTCGACCAAGGAGCTGAGTTTACACTGGGCCATGAGAGCTGCATGCAGGAAATAACAAACGCAAGTAACTCCACTATAAATTACAGTAAGGTAAGGTTTCCATCAGGTACAGATGTGATTTAGGTTTTGTTGCTGTTGTTTTGTTTTTTTAATAAGCCACCTGTCTCCTTACCAAAGAGCAGAGACATGAACCAAGGAAGGCTTTCTGGAAGCATTTATATTGGAAAGACAATGAGTCTCTTAAACGGACCCCTGAAAAGTGAAATTATTTACTGACATAATTCTACAAATTATAGTTATTCAATTTGAAGCCACAGGTCATACGAATGTATTATACTTTGAAGTCAAACATCCCTTCTACCCCACACAATTATTTCACAATTTATTTACAAAATTATAGTTTTCTCTAAACATCCCAATGGCATGTACTTTAAAGAGGGAATTTGGAAAGCCTGAAATTCCTGCAGGAAATGATCCATTTAAATAGTCTATATTTGATGACTATCTAGTCTATATTCATATTCATGACTATATTAACTGAGTTTTTTTCATCTGAGACGTTTTATTGGAATACATTATTCTGCCGTTGGGTGTCTTCTGCAGAGCTAAGAAAAGTGTAAGAAATACATTTTCCATATGCCTGTATATTTTAAAAAGATAATCTAATTTTTAAGAAAAGGTTTGGATGTAAACGACTATACTGTTATCTGGTAATTTGTCTCTCCCACCCTTTGTATTTGTCTGTTATAGGAATGTTAAAGCTTTGGGATTTGGGGGGAAGTGAGTTTCCACCTACAAAATCAGGAAGTACAAGGGGGGAATCATTCTTATAAACTGTTATATGATGAAATGGGATTTGAAATACACTACCTGAGAGAGATGGAGGAGAGCCAACAGGAGTTGAAGGGTTTGATGAAAAGCTGTTGTTAGTGTGATCTGGAGAATAGATCTTAAAACAATAAGGAGAAAAAAAAAACACCCTCATTCATTAAAATAATTCACACTTTTCTAAACTACGAAGTTGTCAACGCAATTCATTTAGAACTTACAAGTTACAGCATACATGTAATAATCAACTACAGTACCAAAATTGTCAAATGAAGAACTTAACAATTATTTTAATTTTTCAAAACAAGAATTACTGATGTGGTATGGGATGGTGGGAAAAGAGCCAGGCTGGGGTCAGCAGACTTCAAACCAACTCTTCGTTCCTACTGGCTGTGTGGCTATGGGCAAGCCAAGCAGATACTTTGAACTTTCCTTTCCTCATCTACACAATGAGAGGTTGAACAGGATCATTCCTAAGATATTTTGCCACTCTTTTGCCAGATCTAGGCGTTTGATTGCATAGCATCAGAAGGCCCAGATGAAACAAAAACTTTTACTTAGGGCACAATGCTAATACAGTGTGAACTTTTTTAATGCTCTCAATGGTAAAAGCCAACTGAAGAGACAAAATCTTAGAGAAAGAAATCTCCACTTACATTTATTTATTTATTTGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAAGTTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCCATGCCTAGTTAATTTTCATGTTTTTAGTAGTGACAGGGCTTCACCGTGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACCAGTGTGAGCCACACTACCTGGCCCTCCACTTACATTTCTAAATGACCATGTTTAGCTTTTGACTAAAATACCAGATATACTCTCTGAGACAATGAAGGTATGCCATTTTGTCATCAGGGAACATGCAAGAAATGTTCAATTTTAGCTTTCTGGCAGTAGGTGGGCAAAGCAGAGAAGCTGAGTCCCCCAGGTGCCAATTATGTGACAGTTCTTCATGGACCTCAGTTATTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAATGCCTCTTTCAAAGTGTTTTAGAACTATTCCTTGCTAAGACAGTCTTAGCTGGTCAATGTGCACCCATATTACTTTAGAGAAAAATAAGACATCAGTATAAAAAACCTATAAACCCAAAGACCAGGAGAATATTCCCACATCCATAATTGAGTGCAGCTTAGTACCATTTTGAGGATGAGAGAAAGAGACTATATACTGGAAGCTTCAGAGCCTTCTCAAATTTTCCAGTGACTGTTATGCAAGAAAGCTAGCATTTTCCAAAAATCAAAGCTATTTGCCATTCATTTTCTAAAATTCCAAATGTCCACTTCTGATTAAAGTTCACCCTTTACAATGGTACATATGGAGTCCAAAGTCAATATTTCCTCACCGAAGCAAGTGCTTTCCCCAGAGCATCTCCAGTCTGGGAGCTGCCGGCTGCCCCGCTTCCTCTATTTGCTGCAAAAACAAAAGGCAGAATATGAAAACCAGGCAGTGAGACGTCTAACAATTTTCTATTCCTGGTCCATTTACTCACAATTTAATTGCATTTTTAATGCTAATTACAACACATTAATCTTTAATTAGCATTAATTTGTTTGCTGAGGTAGATGTCAAATATATTCATGTTACTTTTTTACAGATAAAATATAAACCTGACACCTTGGTTTAAAGATAAAGTGGTTTCCTTGCTATGACTTTCCCCTTGCTGTTGATGAGCTGGTGAATGTAGCAAGCTATGTGACGGTCATTGCTGACAAGTATAGACTACTTTCAGGTCTCTGGAGTCCTCAGAGTCTGGCTTTTCTTTATATTATTTTATAGTAAATGGAATTATCTTCACAAATAACTTCCATCTGTTTTCAAATAAATAGAAATTTGATACATAGCAAAACGGGGTATTCGTCTCACAGTCCTACA
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Task1_train_26114
This gene mutation involves TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_26115
This gene mutation involves TCF4 (transcription factor 4) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Pitt-Hopkins syndrome
CCCACACAATTATTTCACAATTTATTTACAAAATTATAGTTTTCTCTAAACATCCCAATGGCATGTACTTTAAAGAGGGAATTTGGAAAGCCTGAAATTCCTGCAGGAAATGATCCATTTAAATAGTCTATATTTGATGACTATCTAGTCTATATTCATATTCATGACTATATTAACTGAGTTTTTTTCATCTGAGACGTTTTATTGGAATACATTATTCTGCCGTTGGGTGTCTTCTGCAGAGCTAAGAAAAGTGTAAGAAATACATTTTCCATATGCCTGTATATTTTAAAAAGATAATCTAATTTTTAAGAAAAGGTTTGGATGTAAACGACTATACTGTTATCTGGTAATTTGTCTCTCCCACCCTTTGTATTTGTCTGTTATAGGAATGTTAAAGCTTTGGGATTTGGGGGGAAGTGAGTTTCCACCTACAAAATCAGGAAGTACAAGGGGGGAATCATTCTTATAAACTGTTATATGATGAAATGGGATTTGAAATACACTACCTGAGAGAGATGGAGGAGAGCCAACAGGAGTTGAAGGGTTTGATGAAAAGCTGTTGTTAGTGTGATCTGGAGAATAGATCTTAAAACAATAAGGAGAAAAAAAAAACACCCTCATTCATTAAAATAATTCACACTTTTCTAAACTACGAAGTTGTCAACGCAATTCATTTAGAACTTACAAGTTACAGCATACATGTAATAATCAACTACAGTACCAAAATTGTCAAATGAAGAACTTAACAATTATTTTAATTTTTCAAAACAAGAATTACTGATGTGGTATGGGATGGTGGGAAAAGAGCCAGGCTGGGGTCAGCAGACTTCAAACCAACTCTTCGTTCCTACTGGCTGTGTGGCTATGGGCAAGCCAAGCAGATACTTTGAACTTTCCTTTCCTCATCTACACAATGAGAGGTTGAACAGGATCATTCCTAAGATATTTTGCCACTCTTTTGCCAGATCTAGGCGTTTGATTGCATAGCATCAGAAGGCCCAGATGAAACAAAAACTTTTACTTAGGGCACAATGCTAATACAGTGTGAACTTTTTTAATGCTCTCAATGGTAAAAGCCAACTGAAGAGACAAAATCTTAGAGAAAGAAATCTCCACTTACATTTATTTATTTATTTGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAAGTTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCGGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCCATGCCTAGTTAATTTTCATGTTTTTAGTAGTGACAGGGCTTCACCGTGTTGGCCAGGCTAGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACCAGTGTGAGCCACACTACCTGGCCCTCCACTTACATTTCTAAATGACCATGTTTAGCTTTTGACTAAAATACCAGATATACTCTCTGAGACAATGAAGGTATGCCATTTTGTCATCAGGGAACATGCAAGAAATGTTCAATTTTAGCTTTCTGGCAGTAGGTGGGCAAAGCAGAGAAGCTGAGTCCCCCAGGTGCCAATTATGTGACAGTTCTTCATGGACCTCAGTTATTGTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAATGCCTCTTTCAAAGTGTTTTAGAACTATTCCTTGCTAAGACAGTCTTAGCTGGTCAATGTGCACCCATATTACTTTAGAGAAAAATAAGACATCAGTATAAAAAACCTATAAACCCAAAGACCAGGAGAATATTCCCACATCCATAATTGAGTGCAGCTTAGTACCATTTTGAGGATGAGAGAAAGAGACTATATACTGGAAGCTTCAGAGCCTTCTCAAATTTTCCAGTGACTGTTATGCAAGAAAGCTAGCATTTTCCAAAAATCAAAGCTATTTGCCATTCATTTTCTAAAATTCCAAATGTCCACTTCTGATTAAAGTTCACCCTTTACAATGGTACATATGGAGTCCAAAGTCAATATTTCCTCACCGAAGCAAGTGCTTTCCCCAGAGCATCTCCAGTCTGGGAGCTGCCGGCTGCCCCGCTTCCTCTATTTGCTGCAAAAACAAAAGGCAGAATATGAAAACCAGGCAGTGAGACGTCTAACAATTTTCTATTCCTGGTCCATTTACTCACAATTTAATTGCATTTTTAATGCTAATTACAACACATTAATCTTTAATTAGCATTAATTTGTTTGCTGAGGTAGATGTCAAATATATTCATGTTACTTTTTTACAGATAAAATATAAACCTGACACCTTGGTTTAAAGATAAAGTGGTTTCCTTGCTATGACTTTCCCCTTGCTGTTGATGAGCTGGTGAATGTAGCAAGCTATGTGACGGTCATTGCTGACAAGTATAGACTACTTTCAGGTCTCTGGAGTCCTCAGAGTCTGGCTTTTCTTTATATTATTTTATAGTAAATGGAATTATCTTCACAAATAACTTCCATCTGTTTTCAAATAAATAGAAATTTGATACATAGCAAAACGGGGTATTCGTCTCACAGTCCTACAGTACACCAAACAAACAAACAAAAATTTCCACAACAGGTCTGGCTAACAAGGAGAGAAAATATTTTTAATGTTTTAAATAACATATATTCTCCACATATTTAAAAGTCTGTGTTCACACTAAAAAAAGTGAACTGGTATGCTACTAAAAGTCAATATGGCCTCGAATTCCAGAGATAAAGTAAGTCTACATATTCATGAAGCTTATCTCTACTGCCTTAAACACTGGTATTTTTATCTACAAAAGAGAAGAACAAAGAGTATTGTGAATAATAAAAGACATATATTACAGTATACAATTCAAAGCCAGCTTTCTTTAACATGTATCATTGGAAGGTATCTTGCCTTTAGAACTAAGTGATAAAATGGGATTTCCAGGATTCTTGTGGTCTTCAGTATTAACAGAATGCCTAGCACTTGGGGTATGTTGTATTTACTAAAGCCTCAACATTAGCAAATAGACATAGTATCTAAATAAAACCTATTAAAGTTCTGAGGGAAGATTGTTTTTCACTATTTTGTGAAATAAGAAAAGGAAAGGTTAAATCACCCAATGAATCCAAGCAAAACTTCATTAAACAGGTATATAATTTCAAAGACTTTCCAGCCCCATTCTTGAACTAAGAGAGCCTTCTTTCTTACAAATGTGTTGTCATCACCTTCCACACTTGTAAAATGCAGTAGTGGGGTCGGATCTTCAGTGGTCCAATTCTATGGCTTTTCCAGGTCATAATTTAATTCTCCTGACCTCTGCTTAGCATAGCTAATTTATGCTTGTTATTTTCATATATTTATATGTTGAGTTTGTCAGATGAGTTTTCTTTTTTGTTTTGAGATGGAGTCTTGTTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTTCCGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGCACACGCCACCACGCCAAGTAATTTTCGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCATGAACCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGACTGAGTCACGGTGCCCAGCCGATAATGTTTTGATATATACTTTATTTGGTTTACAAAACCCACACCCATATTTATTTGTTAATTGCTAAAATACTGAAAGAAATCTGGCACATGATAAGAAGAACACAATTATCTCGTGACAAAATAAACTTCCATATCACAAAGTTATGATATTAAAATACATGAGTCATTAGTACTCATGATAGGTATTGTATAAGCAAGTTCTTTGAAATGAGGGTCTGACATCATACAATTGGACCACTGGGAGCAGCTCAGATATCAAGAGTATTAAAAATATTTAATATAAGATAAAATACAACAAATTATATCTAGTGTGAAAATGAGAAGAATTTCTGCATTAAGGAGTCCTTTAAAAACTAAAAACATGGATTGCAGGCATGCACCACTATGCCTGGCTAAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGA
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Task1_train_26116
A mutation in TCF4 (transcription factor 4), located on Chromosome 18, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_26117
This is a variant in TCF4 (transcription factor 4), located on Chromosome 18. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; not provided
TTTTTTTTTTTGCTTTTCGGGTATGCATATGCAGATAAACAAATTTGTTCCCCATATTTTGTGTGGTCTGCTAGGGAAAGGAGCCTACTGATATAATCTACCTGGCCTCTCCTGCAATGTGCACCCTTCCAGAAAGCCACTTTCCTGGGCAGATAGAAAAAATATATCCTTCCGTCAATGTTTTCAATCGAAATCTGTTTTGAGTGATGGATCCTTGAGTTGCCAATCTCTGTAAGCTCCTGTAGGACAATATCTCCCACTGCTCACAAAACAGGGGACTGATGCTGAGGTAGCTACTGTTTATAACTGAAGGTGATTAGCTTTTTGTCACGGCACAAAACGCACCCAGGTGACATAGCCTGCTGTGTCCCTTTGAGTTACACCTAGGACGGGTCACAAAGTTAAAGGACTTCTGACACACGGGCTCTATTATGCGTGGAACAAATTCTCTCTATTCCTAACAGAGCCATTCCATCCAATTTTATAGATTTCCATGGAATTTCACACGTGAACTAACAAACTAAAAGAGCTAACACACTGAAGGGAAGGAAGATTAGTATCTTTTAATGAGAATGATTTTGAGTGTGTCCACTATATCAGGCTGCTTCCCTGGTACTCTTTGCCCCAAATGTGCTCCCCTTCCTGTGACATGGCCCTTCCTAGAGATGCATAAAGAAGGAAACCCCATGGCCCGTAGACAAGGCTTATACAAATAAGGTTTTCACACCTGGGCAAAAAGAGTTAACATTTTGCACACAGGGGTTCTTGGTAAATTCCACATCTAAATTCAGGGCATTAACTTGGTAACAAGATAATTACATTAGAAAATAAGTGCCACACACATATCAGGATGGAGCCCTTAGGGGCATCCTCCAAGTGGTTCATTCTTGAAGTAGCTGCTATCATTTCAAACATCTTGGTCTTTTTAAAAAATTCATTTATTTATTTGTTTGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTCAGCTCACTGTAAGCTCTGCCTCCCAGGTTCATGCCATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTACAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTTGATATCCTGACCTTGTGATTTGCCTGCCTTGGCCTCCCAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACTCGGCCACATCTTGGTCTTTTTTGAGCAGCAGAAAGGTATACGCTATCAGTAGCAAGACTACAAGCTCAGGGTGGGGGCACACATCCATGTATTTAAACATACTGGACAATTCCATAATTTCCTATATTTGTCTTCTCCCCCAAAAGTTGGGCCTTTTATCCTAAACCAGTTACTATGTTGGGACAGAGCTTTCACCATGTAATATTCCAGTCTGTGGTAGGTTACTTCATCTTGGACCCTTGTTCTTACCTACAAATTAGTAAGTGGGTGAAAATTTTACATAAGGTTATACATTAGGCCAACTTGTTCCCAGTTGGCTAAATCCAGGATGTTCAAAACATACATGGAGCTGAACCACTTCTAAACAAACAGCTACATCGTCTTGGGGATGGTGAAGATGCTGAAATGGTTGGTCATGAGTGGAAGACCATCATAAGCATCGGCTCTAAGTGAAGCAGATCAATCTAATCTTAACCCATTACTGCTTAAAGGGGTTTAATTGTAAAGAAAGACTTAGTACAGTTTTAATTAATACATCAATTTTTAAGGAATTCAATTCCTAAGAAGAGCATGACTTCAAAAATTCTACACTTGCCTACTATTCCATTTCTTCTGCCCCATCTGTGACATTAAGTGACCCAGGAAAATGCTATCCAGTGGCCTTTCCCTCAGAAGCAGCAGCATCTTACCTTGCATGAAGAAGGAGCTAGGGAAAGTGCTGGTTGCTGGTTTGGAGGAAGGATAGCCTGGCGAGTCCCTATTGTAGTCGGCAGTGCTTGCTGATGGAGCATAGACCTGAGGAGAAAGAACCAACTGAGTTTTGCTTTTTGCATTGACCACAGCAGCCCAAGCTCCATTCTTATATAAGAAGTAGGCAGAAAGTGCTACATTTCTACCCTTTCCAGTTTAAATCTGAACAAACCCTAGAAACAGTGCCCTTTCCGAACACACTAAAACAAACACAACAAAACGAAACAAAAGCTCGGTGTATTTGTGCGAACAGAAAATAACCAGGTGTGTTATATTCCAGTTGATGTAAACCATGTCTAGTTGTAAATACACTGTATAATGCCCATAGGGTAATCCTGTGAGTCTAAGCACTTCTTTCTTTTTCTTCTAAACACAGATGGCCCATAAGCATGTGAAAATGGTAAAAACAGAAAGACATGCATCAAACCTCTTTCAAATGGTAGAGTAAAAACTCTACCTTTCAATTAAAATTTTCACTTTTACAGAGAGGAGGTAGGGAGGGGGGAGACAGAGAGAACACAAATGAACTATCCAAACCACAGAAAGTGATAAATATATCTTAGAATATTAAATTCCCATAGTGTCAGCTTTTTGCAGAGATGCATGAAAAAGGCCATTAAAAGCCTGGATCTACATAAGACCACCAACAATCAGTGTGTGCATAGGAAGCGGGAGGAGGGAGCCCTCCTTTTTCATGCTTATTATATTTGTGTGTACAATAAACTTAAAAAGTGTGCCAAAAACCTAATTTACTTACATTCATTTACTAATACTCATGAGACTTGGGAAACCAATTCTTTATACAAATAGCCTGTGTATTTTCTTGTTTATGTTTTTTTTAAACAGGACAGCATAGTAGAAAAGCACAAATTCATAAGGTATAGTTTAACTTTAATTGGTTTTCCCCCTTGCCTTTTCTGCTAAATATAATTTTTTTTAATCCCCATTTTCTTTTGCTCTCAAAGTTCCTCTCTCCAGATGGTCAGAAAGACTGAAACACTGTCATCCTCTTGATGAAAATGGATACCTTCCTGCCTCCATTTTGAAGCAGGCAGCGGCTCACAAAATTGGCAGTGAGCCTACAGTGATATTCACAGGTCACAGTAAAAGGAAAAGAAATTCACCAATAAAAAGGCAAGTGCAGGGTTACCAAAAAATAACTCTCATTTTTTTTTACAGTGCACATCGAATAAACACCCCAGAAAAATTATATAATTGCTCTCAGAACACCATGAATCATAAACTAAGCATTAATACAAGGTTTAGGATTTCACAAAGGATAGGTCCACAGAGACAGATGTGGGAAAATATGCATCTACATCCATACATCAAATAAATGCTACACATGCCCCAAAGTGCCCTTGAAAATTGGGAGGTCCTGGAGCTTTAACAAAACAAAAACAAACCAGAAAAGCCCACTCGCACTTCAGAAAACAGGGATTTTTCTTAAGGCACTAATGGATACAAGCCCTATATTTCACTGGACTTTATTTTGTAATTTTCATCACATTTTAAATGTATAAACAGTGATTTGCTTCTATTTCCAGAGGGCTTACAATAAGGAAAAAAAACTTTTTTGAGTATTTTTAAGAAACAAAGAATAAAACTTTGGCTAGGAATCCAAAAACAAACCAATGATCTAAGTTCTGTCAACCACATCTCAGAATTTTCTTGAGAACTATTAACTAACAAAGAGTTTGTGAATTACTACTGAAGGTATTTAGAGAAGGTCTTGAGAATAATCTAACAAGATGAAAGAAACATCACAGGAAAAAGGGAAACTGAAAACTGACGGAATGATTGTAGTGTGACTATAATATATCTACACGCTATTAGCCTGACAGCAATCTGGCCTCAGTATTAACATAAGCTAAGTGTACTATGGAATATACCCAAATTTCAGAAATCAATATATTTATTATAAAACTAAAAAGAATCTCCGACCCATATTATTAAATCATCTTATGTTTTAAAACAATTAAAATCAATTCTTTTCATATATACTTTAATTTTAATTACATATTCTATTACATTATCCTTAAACATATATATCATTATGTCAACACCATTTGATGACACCTAATAAGGTTTATC
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Task1_train_26118
A variant was discovered on Chromosome 18, affecting FECH (ferrochelatase). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Protoporphyria, erythropoietic, 1
AGCAACAAATGCCATGAGCAGTGATCTCAATAAATTCCTCTTTGCCTGTCACTATAAAAGCCAGTCTGGTCCCAACTCAGTATCAAGGACATTATTCCAGACAGCACAGTACTGCTATCAATTCAGGTTTCCTTAGCAAATAAGTGCTTCAGATATACTCGCAAGGGCTCCTGAATTGGAGTTTTCTGCATCATCTCCATAAAAATATTTTTTCACCTCTAAAGTCATCAAAGAATTGAAGCAGGCCCTTGGGAAATATCCTTAAGGGGAGAGAGTGGCTCCAAAAATAACCTTCCTTCCAGCACCACACCACCAGCTCAGAGAATTCACTTCACGGTGGGACGGTCACTCAAAGTCTACTGTGAACCTCATCCCCAAAAAGGTAATGGCAAAGGCTAGAGGAAAATCCTAAACAATCACCTATGCCTTGTATCTTTCTCTAGAAACACAATCTACTAGTAGAAAAACCAATTTGAAATTTTAAAAATGTGGATGCTACTCATGAGGGCTGTCATCAACGTAGGAAAACTATTAACTCAAGTGGATGACATGTTTCTTTTCCTGTATTAAAAAAGCTCCTCACATTTAATAATTCTGATTTAGATCAGTTTTGATTTAACAGACAGCATGAATCAAACTTAGCTAAAACCTTAATGATGTTGTAATATTTATTAACATAGCCAATTCTCAATATAGAAGATTTATGAATCTCCTAATACTTCCACTTTATAAACTGGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGCTCTTTTGAAGAACAAAGTTTCAGGGCTTGGAGGAAAGAGAAAGTGATCTTTACAAATTCTTCATGGAACCACCGGGGATCTTTTAATCCATTTAAATACAAACATAGAAGATCAGACTCTGATCTGACATTATTTCTATATTTTTAGAAACACTTTTCACTCATAAATCCAAGGTGACAATGGCATTAAATGGCATTAAAAATATCTACAGGAAAGGACTACCACGAAATACAATATTATGATAACAGTTATTGCATTAAAGTGGTTACTTTTCTGTATTCTTCACATGTCCCATTGTATCACTATACATTTTTATAATAAAAAATCGTAAATTAAGAAAGAATTCAAGCAAAGTATTGTTGACTTTATAAAATAATTCTTAAAACAAATGTTCAGAAAGAAGGCATTCAACTAAGATAGAGAAGATGCTGGATGGAGAGGCTTGCAAGGTCCCGGGAGGAGCTCCAGGGTGAAGCTCATCACTAGCCTTTCCAGCAGCACTGTCCCTGGAGACCAGAAGCAGTGGGAGCCCCTTCCCTGTGGCACCACGGACTCCCACCAAGGCACGTATCATGAACACTGTACTTGTACACGTTTATTACCCTTGGGTGTATGGGGAATCTAAGAGCACCTCTGAAATCCATACTTGATTCCTTTTTACATTGAGGAAAGTGAGATTCACACACAAATACCAAGATGACCAATGAATGGTGGCCTCGCTGGCAAAAGCAGCCATTGCAGGTAACCAAATTGCCTCCCTAGCATTCTGTAACCCATGGGCTTAGGGAAAGATTAAGTAACATTTCTTTTTCAAATTCACTTCAAATACTCAACTGTGTTCATTTAAAAAACAGCAACTATATGCACGAGACTAAACAGATCTCATTCACACTGCCAGCCCACAGAGGGGACTCTCCGTACCCTTTCAGGAGGGTTTTGGGCAATAAAGCCAAAATCTGTACTTAAATAGGTGTGTCTCATAAGACAAATTTTTAACTCATTTATTAAAGGTCCTGATGGACATTCCAAACTAGTAACTTATACCTAGAGAGAGAAAATACAAATGCTTACTGTATAGTTATATAAAAATAGAAATCCATCAAGAGTCCAATCCTCAAGAAACCACACAATTTGTACCCAAAGGCTGTATATATATCAAGGAAGGATGACTTCCTTCCTTGATCTCTAAATAACACCCTCTCCACATCGGAGGTATCTGGAGGTTGGGCATTTGCCTAACGCCACGGGGTCCACCGGCGGGGGTCACAGCTGCTGGCTGGTGAAGAAGGATTTAGTCTCCCTGCAGACAGGATTGACACAGAGCGGACAGCTCAGGGTCAGCTGCTTGGAACACAGCTCGTTTGACTGGATGTGTGAATGCACCAAGTCGGCCAGGGCCTGGAAGATAGACAAGAGGCAAAGACGCATGAGAAGCACAGGGTCTGCTCGTCTGCCATGCCCCCTCCTCCAGCTGCCCAGGTCAGCGCTCTGGCTTGGGGTTTCTTTTCATCCGAGTGGTGAGCCCTTTGAACCAAATTCTACAGCATCTTCCTTTCCTGAGAATCCTCAGCTTACAGAAAGTTAAAACAGAGATTTCAGGAGATGAAAACCTCTTACCCTACCCACTAGGCCTTTTCTCTGGAAAGCAGGTTTTAAATCAGACATAGTTATAGGTGGGTAGAAATCAGAAAATTGGGGCTATCTGAAGGAAAAAAGACTGAGCAGATAAGGAATTCGATTTTATTTTTGTAATTAATTGGAACTCCAAATGTTCTAATATGTGAGAAAAACCAATATTCTGCAAGAGTTTCTCAGAGGATTACTCTCTGGTATGTTCTACTAAAACGATTGTAACACTGTAGATACCTTAGAGAACAATGGATTTCCATTAAGAGACTCAGCTCTTCTGATGTTTTCAACTCCACACTGAATCAAATGAGAAAAGGGAGGAAAAACACAGATATATTTTATTTTCCTTTTTTTTTCAAAGAAACTGCTACAAAAAAATAAATACACACAGATACACACACACAATTCAAAGTCTGACTTCAACTGTTCGCAGACTGCTCATTAATGAAAAATACTCATGGGGCAGGGCTGTATGTTGATTCTGTTATCATAAATTATTCCTCAATTCTTATGTCCTTCCCCTTCCCCATTACCTTCCTAAAGGTGGTTTGTTTGCAAATCCTTTTTGTGGTTACACTTGATGAAATTCTCAAGCAATTTAAATCTGTTTACCATTCTTTTTTTATTCTCTTTTGCTAGTGCATAATTTTACAGACTCTTCCTAAGTAGAATGTTACTGTAAATATAGTTTCATACTTGTTTTGATCCCAAGTGCCAAAATGAGGTAAATTAACTTATCGACTATAAAATATGTATTGGACCTACACTGGAACCAATTCAGAGTTGGGTTTTAAAATATATTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCGTCCCGGGTTCAAGGGATCATCCTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGTGGCAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAACGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCAAGTCTGGCCTGAAATATATTCTTATGGAGAAAAATCTAAAGGAAAACAATGGGAGGATTGTTTCTGTACCATCCCTGCTCCCGGCTCCAAAAATATCCACTGCCTAATAACTGAAAATGGTCTAATTATGATTTACTCAGGTAGTTAGGATTCTTCTCTTTCCCTTTTCTTTTGATAGCTTTTCAATTACTTGATCTTTTATTTTTTATTTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGAGGCAGTCTCAGTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTAGTGCGATCTCAACTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGATTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTACCACCACGCTTAGCTAAGTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGATTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCACCACACCTGGCCTCAGCTACTTGATCTTTTAGATTAGCATTAACATCAGGAGACTGGCATGGGAAAAACGTTGAGATTCAGCAAACACATGGAT
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Task1_train_26119
Gene FECH (ferrochelatase) on Chromosome 18 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Protoporphyria, erythropoietic, 1
CAAACTTAGCTAAAACCTTAATGATGTTGTAATATTTATTAACATAGCCAATTCTCAATATAGAAGATTTATGAATCTCCTAATACTTCCACTTTATAAACTGGCTAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACGCTCTTTTGAAGAACAAAGTTTCAGGGCTTGGAGGAAAGAGAAAGTGATCTTTACAAATTCTTCATGGAACCACCGGGGATCTTTTAATCCATTTAAATACAAACATAGAAGATCAGACTCTGATCTGACATTATTTCTATATTTTTAGAAACACTTTTCACTCATAAATCCAAGGTGACAATGGCATTAAATGGCATTAAAAATATCTACAGGAAAGGACTACCACGAAATACAATATTATGATAACAGTTATTGCATTAAAGTGGTTACTTTTCTGTATTCTTCACATGTCCCATTGTATCACTATACATTTTTATAATAAAAAATCGTAAATTAAGAAAGAATTCAAGCAAAGTATTGTTGACTTTATAAAATAATTCTTAAAACAAATGTTCAGAAAGAAGGCATTCAACTAAGATAGAGAAGATGCTGGATGGAGAGGCTTGCAAGGTCCCGGGAGGAGCTCCAGGGTGAAGCTCATCACTAGCCTTTCCAGCAGCACTGTCCCTGGAGACCAGAAGCAGTGGGAGCCCCTTCCCTGTGGCACCACGGACTCCCACCAAGGCACGTATCATGAACACTGTACTTGTACACGTTTATTACCCTTGGGTGTATGGGGAATCTAAGAGCACCTCTGAAATCCATACTTGATTCCTTTTTACATTGAGGAAAGTGAGATTCACACACAAATACCAAGATGACCAATGAATGGTGGCCTCGCTGGCAAAAGCAGCCATTGCAGGTAACCAAATTGCCTCCCTAGCATTCTGTAACCCATGGGCTTAGGGAAAGATTAAGTAACATTTCTTTTTCAAATTCACTTCAAATACTCAACTGTGTTCATTTAAAAAACAGCAACTATATGCACGAGACTAAACAGATCTCATTCACACTGCCAGCCCACAGAGGGGACTCTCCGTACCCTTTCAGGAGGGTTTTGGGCAATAAAGCCAAAATCTGTACTTAAATAGGTGTGTCTCATAAGACAAATTTTTAACTCATTTATTAAAGGTCCTGATGGACATTCCAAACTAGTAACTTATACCTAGAGAGAGAAAATACAAATGCTTACTGTATAGTTATATAAAAATAGAAATCCATCAAGAGTCCAATCCTCAAGAAACCACACAATTTGTACCCAAAGGCTGTATATATATCAAGGAAGGATGACTTCCTTCCTTGATCTCTAAATAACACCCTCTCCACATCGGAGGTATCTGGAGGTTGGGCATTTGCCTAACGCCACGGGGTCCACCGGCGGGGGTCACAGCTGCTGGCTGGTGAAGAAGGATTTAGTCTCCCTGCAGACAGGATTGACACAGAGCGGACAGCTCAGGGTCAGCTGCTTGGAACACAGCTCGTTTGACTGGATGTGTGAATGCACCAAGTCGGCCAGGGCCTGGAAGATAGACAAGAGGCAAAGACGCATGAGAAGCACAGGGTCTGCTCGTCTGCCATGCCCCCTCCTCCAGCTGCCCAGGTCAGCGCTCTGGCTTGGGGTTTCTTTTCATCCGAGTGGTGAGCCCTTTGAACCAAATTCTACAGCATCTTCCTTTCCTGAGAATCCTCAGCTTACAGAAAGTTAAAACAGAGATTTCAGGAGATGAAAACCTCTTACCCTACCCACTAGGCCTTTTCTCTGGAAAGCAGGTTTTAAATCAGACATAGTTATAGGTGGGTAGAAATCAGAAAATTGGGGCTATCTGAAGGAAAAAAGACTGAGCAGATAAGGAATTCGATTTTATTTTTGTAATTAATTGGAACTCCAAATGTTCTAATATGTGAGAAAAACCAATATTCTGCAAGAGTTTCTCAGAGGATTACTCTCTGGTATGTTCTACTAAAACGATTGTAACACTGTAGATACCTTAGAGAACAATGGATTTCCATTAAGAGACTCAGCTCTTCTGATGTTTTCAACTCCACACTGAATCAAATGAGAAAAGGGAGGAAAAACACAGATATATTTTATTTTCCTTTTTTTTTCAAAGAAACTGCTACAAAAAAATAAATACACACAGATACACACACACAATTCAAAGTCTGACTTCAACTGTTCGCAGACTGCTCATTAATGAAAAATACTCATGGGGCAGGGCTGTATGTTGATTCTGTTATCATAAATTATTCCTCAATTCTTATGTCCTTCCCCTTCCCCATTACCTTCCTAAAGGTGGTTTGTTTGCAAATCCTTTTTGTGGTTACACTTGATGAAATTCTCAAGCAATTTAAATCTGTTTACCATTCTTTTTTTATTCTCTTTTGCTAGTGCATAATTTTACAGACTCTTCCTAAGTAGAATGTTACTGTAAATATAGTTTCATACTTGTTTTGATCCCAAGTGCCAAAATGAGGTAAATTAACTTATCGACTATAAAATATGTATTGGACCTACACTGGAACCAATTCAGAGTTGGGTTTTAAAATATATTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCGTCCCGGGTTCAAGGGATCATCCTGCCTCAGCCTCTCAAGTAGCTGAGATTACAGGCATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGTGGCAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAACGATCCACCCGCCTCAGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCAAGTCTGGCCTGAAATATATTCTTATGGAGAAAAATCTAAAGGAAAACAATGGGAGGATTGTTTCTGTACCATCCCTGCTCCCGGCTCCAAAAATATCCACTGCCTAATAACTGAAAATGGTCTAATTATGATTTACTCAGGTAGTTAGGATTCTTCTCTTTCCCTTTTCTTTTGATAGCTTTTCAATTACTTGATCTTTTATTTTTTATTTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTTGAGAGGCAGTCTCAGTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTAGTGCGATCTCAACTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGATTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGGCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTACCACCACGCTTAGCTAAGTTTTGTATTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGACTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGATTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAACCACCACACCTGGCCTCAGCTACTTGATCTTTTAGATTAGCATTAACATCAGGAGACTGGCATGGGAAAAACGTTGAGATTCAGCAAACACATGGATCTCAACTGAAGAGGCTGTATTCTCAAACTTCATATAAAAGTCAGTTACAACAGAATAACCAGCGTTGGTAAAGGGCATTCTCCAACAATGTTGATGGGAGAGTCAGCGATACACTGACTAGAAAAATATATACCAACACTGAAATTCCATGTGCACCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGTAGCTGAGGAGAGGATCACCTGAGCCTGGGATTTTGAGGCTAAAGGGAGCTATGATTGTGCCACTGCACCCCAGCCTGGTTGACAGAGCCAGATTTCATCTCTAAGCAAATTTATAAAATCATAATAAATTTAAAATAAAAAAATTGATTTCCAAACATATTGGTATAAACTATATTTTCACTGAAGTTTTAGCAAGTTCACAATTAGCCAAGCTCATAGTGAGATACAGAAGGCATCTTTAAACAAAATCCATAGACAATGCTGCAACCATTTCTTAGCCAATTACAACTTGCCTGCAAATCCTGTGTCAGAACCACTGACAAGAAACTTAGGTGCTCCCTAACTTCACCCATGTCTGATTGATGTCCAGCATGGAAATTCAAATTCCACGGGGATCAGGTGTTGGCTCAAGTTCTGCCCCCACCCACTCTCTACCCTGCCCTACACCTGCTGCC
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Task1_train_26120
Chromosome 18 houses a mutation in gene FECH (ferrochelatase). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Protoporphyria, erythropoietic, 1
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Task1_train_26121
This alteration in FECH (ferrochelatase) on Chromosome 18 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Protoporphyria, erythropoietic, 1
CTCTTCCTCAGTCTTAACATAGGGCAAGTCCCAAAACATTTCCATGCTTTCCATCACCGATCCACTGGGCTCTCTAACTATAAGAACTATTAGTTAGGTTTCCAGTTGAAAATGGTAGTCAGGAGAGAGCATATCTTAAATCACATATACTCTCAGACTAAGACTCAACTTCCAAAAAGATAAACAGGTTCAATTTTGGTGAGTAGAATACAGTGAATCAGAAGAATTCAAAGGGACTCCATTCAAGGTTCAGAAACAATCTCTCCAGAAATCAAAAAGTTGTCACGACCATATTCACGTTACAGACCGCACTTCACAGGTGGATATCATTTTCATATGTGCAAGGGGGCATCTGGAAGCTACATTAGCTCTTTCAGGTTGTGTGGAAACATTCAACAAACAACCCAAAGAAGTCATTAAGGAGAAAATGTGACTGAGAAATGTGTTTGTGATAAAGACACACACTGGCTCTGCCACAATAGTGCCAGTCTAAAAGATACAACAGATAAACAGCATTTGAGTGGCCTCGAAGAATTAACGTACTTCGCAAAGCCTTCCACAACTTGGATAGACGGATGTACCTGTCCTTACATGAGATACATTCAAGAAAAACTAAGCATACAGTGAAGTTTTGCATACACTGTCACTTGGTAGAGCCAGCCCTGAAATAAAAACCATAGTCAATCTTCTGTCATGTAAATAACAATCTTCTTAATTTATCTAATTGTGAGAGCAGCCATTTACATATTGAGGTATATTTCTTAAAACAAGGCAAAAGTAGAGCTTAAAAATTCATAAAATCTGACTCCTTCTCCAGTAACATATGACCAGACATTTTGAAGTTGTAGTGGTGCATTTCCAAAAGAAAAATAATAATTCAGGCTGAGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGTGCTTTAGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCATTTGCGGCCAGGATTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAAATACACAAATTAGCCGAGCGTGGTGGCACATGCCTGCAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGATGGAGGTTGCAATGACAGAGCAAGATACCATCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAATGATAATTCAAACTCTTGAGGGTATCTTAGAACTCAGGCATTTTAATGGGTTCTCTGAACAAATATTTAAGGCACATAACAAGCTTTGACTTTTTCCAATAGCCTTTTGATTCTCCTTATGGTTATAGAAGTGATAAACATTAATATCCAAAAGCAATTTGGGACTAAGAATGTGCTGACTTCAATCCTTGCAATGGAATGCAAACAAATGTGTCTGTGGGTGACAGTAGCAGCTTTGCCTACAATGAATGATACAGAGATTGCCAAACACCAATTATTCCCCAGCTCCAGTTAAATATACAGAAAACGACAAGCAGTAACATTTTCCAAAATCAAGAAAACAGAAAATTCTGCAAAGGGAACCCCAAACTGGGCTTTAGTTTTACCAGCAACCAACTCATAACTGAAGCAAAACAACGACAACAGCAACAAAATATCAGTATTTCCCATGTTGTATGGGCATCTTTGCTTTCAAAATGAGAACAGTTACAATCTTTGCTACATCAGTAAGAAAATCTGGGTAGCCATAAAAAGGTTTATCACACAAACCCAGAAAGAGCCTTAAGGTTCATTACTGATCCATTACACAATGGCATTAAAGCACTGAACACTGACAGCCACTGCCTACCACCCACACCATTTGTAATTACCAGCCAAGTGGCCAATAATTCAAGGGACAGATGGACCATGAGATTTCAAATGGACTGACCTGAACTCTCGTGTTTAAAGAAGACAGGTTGAATTTGCCATTCAAATTGCAAATAATTCATCCTTCCCTTCAGTACTTAGACTCCTTGGTTATTTTTGCCAGCACCGTATCTACCTTTCCACTGTCAGAGAGATGCCCTTACCTGTGGTGGAGCAGCTGTACTGTGGATACTGTGTGAAAGCAATAGCCCTTTCTAGGCCATCTCTCTCCATCTCTTCAATTGCTTCTTCTGTTAAAGGATGGACGTACCGAAATCCAATATAGTATTTGTGAGGGGCTATTAGGAAGCACATGTGGAAAGGAGAAAGTGTTAATCCTTATATAGATTCCTCAGAGTCAACAAACATAATGCAATGCCCAGAACAAAGAACAGTTCATGTAATTTCCTATGGCACTGACGGTGAAGGCAAGTTTAGCATATTCCTTGGATCTTATCCACTCTTCAGCTGGTATGTGAACTTTTAATGATGACTTTCTAGGATCAGTACCCCACCCACACACCTTTACTGCACAGTGGTTTTTAAAACTCAAACTTCTCTTCCTAATTCTCTGTTCTTGGCTGGCATAAGAGAGCCTCAAGAGAAAGGAGGAAAAAACAACACTTATTCTAAAATATAACTTCCTCTTGCATACCAGATACTATGGTAGCCACTGGGCATTATTTTTTTAATCATTTAAACCTGATTTTCCAGATAAGGAAACAGAGACTCTGAAGGTTAACTGAACTACCCAAAGTCATACCTTGCAGGTGGTCGAGCTGGAATTAGAGCCTGGGTCTCCCAACCCATGCTTCTCACTCCTCCCAGGCCCCCCACCTCACCCTGCTCCTATTACCCAGTTCCCCGAACCCCCAGGCCACCTCGTTTATATAAAAAAATGCAAGAGCTCTTGCATACGTAAAAAAATTCATTGATAACAAATGATTAAAATGATTCTCCTCATTACACATATAAAACAGTGCTTACTTTGGAGGTGCCACATGGGATTGAAAGCCATTGTTCTTGGTACCTAAATGGCCCATGCCTGCTGTATATCCTCATGTTCTTTCCCTGTCCCTTCCCTGTCCTTTCACGAATACCCTCTTCTATCTTCTTTATCCTCCCGCATCTTCCTTTCTTGTAGTTCAAAAACATCCACACCACATAATTGTTTAAGCATGTATAAAGTCATAAAACTACAAGTTTCCTAAACTTACTTAGTCTTGTTTCCTTGCCTTTTCATAGGATTACACATAACTTACACTCAGGGATGATAGTGAGAATCACTACATGAGTGTCAGGTAATAAATAATAAGACCATGATAATGTTACTGTCCAAAGCATTAGCAGGGGCTGCAACTATGAATGTGACATAAATTGCCACAAGAAACATTTAGGTTAAAGTGAAGGAAAAGACGGGAGTTTATCTCATTTATACCTAGATATATACAAGGACGACATTCCTCCTAACTTGACCCAGAGAGCTAAGAGCCAGGGGAACACATTCCCAAGGGAGAAGCAGAATGCCATTAGGCGAGAGAAGCACATGTGTGCACAGAAAGGCTGGTCGGACTCAGTATTCTCTGGTTGGGTACTGCAAAAAAGAAGAAGGAAGTAAAACTAGATCATTTTTAGCGCTCTGTCCATTTTCCGGCCACCAATTTCGTGCTGCCTTGCATAAAATGGTCACTAGCAGTTAAAACATATCACAGGACATGATCCCATAAGCAAACTCCAAATGACTGATTGTTCAAAGATTATGTGCTTTGTGCTAAAAACCGCCAACTATTACAATACCATCAAATCCCTTGAAGCAACTCTTGGTGATTTGAGCTGAGGTTTAGCAAGCAAGTAGAAACTGCTTTCGATTCTACTTTGAAACAATACGATGATCAGAATGACATCCCCAGTGCTGCAGGTCAACCGGCTTCTCGCATTTTCTTTTCACCTGTCCAGTATCTGAAGGTTACGGTCTAAATGCCTAGGGTCTGGGAGTTCCTCAAATCATGCATACTAAGAGGTAGAAAGGCTGCCCTTGCAGATAAAGACAAGGGCAGGTGGCCACATTTTAAAGTGAGACAGAGTAAAATACCCTGGAAAGAACTGATAATGTTTTCTAAATGCTTTCTAAAGACAACCTGTAAACACATATTGGAGAAAAAGCAGCAAGGTACTCTCCAACTGGGCATATCCTGAGGAACCAACAAACAGTGTTCATGAAGGACCCGTGTCCATCAGGGTGGGTTTCACAATGCAG
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Task1_train_26122
Consider this mutation in FECH (ferrochelatase) on Chromosome 18. Is this a benign change or a disease-causing variant?
Pathogenic; Protoporphyria, erythropoietic, 1
ATGATCTAAAGTTACTTAGTAGAATTTAAAGACTTTCATTTAATTTTAATAATATTAAGCCTACTTATATTAATGAGTTGCTGCTAGAAAAACACACAAATGAAATAATTTTTCTTCTAGGATTCCAAACTGAATCAGTTCTTCAGTTTCTATCAAATCCCAACCCTCAGTGCATATGGCTGAGGTGGGGAGAGGGGCTGGGAGGGGCAAGGAGAAATGGAATGGGCCCTGCTTGGCAGGCTGCCAGATGAAGAAGGTATCTAATGCCCATCCCCAACTAACCTCAGGTTACACAGCACTCAGTCATCATACCCATGATCATATAGCAAAAAACAATAAACACACAATAAGAAAATTTTGGTTCTGGCCAGGCACGGTGGCTCGTGGCTCATGGCTCATGCCTGTAATACCAGCACTTTGGGAAGCCATGGCAGAACTGCTGGAAGCCAAGAGTTCAAAACCAGCCTCGGCAGCAAAATGAGACCCCCATCTTTACAAGAAAAAAAATTTGTTTTAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGGATCACTTAAGCCCAGGAGTTCAAGGATGCAGTGAGCCATGATCACACCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCTACACTCCTCAAAATAAAAACGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATGCAAAATCAGCTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTTGGGAGGTGTAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCAAGTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAAAGAGCAAGACTCCCTCTCAAAAAAAAAATAAAATTACAGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCTAACATAGTGAATTCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACCACACTCCAGCCTGAGAGACAGAGTGAGACTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAGATATATATATATATGTGTGTGTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATTCATACCTGTATAATTTTCATCAAACAATGTGTGATCTAGCAGAAAGGTCATGGAGTTAAATAGGTCCCAGCTACTTTCTCTCACTCTGCCTGATGTTAAAGGGTGCTGTTTCTATGTACTCATCTCGATAACTTCCCTTTATAGAGTCTTCTGTTGCCTCTGTACAGAGGAAGACTTGGGAGCGGTTGTGACTCCTGTTACTAAAGAGGACCCTTGCAACAATGCCATGCCTGCTGCCAGCCACCAGCAACAGAAGAGGTGAGGTATGAAACGTGTACTTCACTTCTTTAATAGATGATAAATCCTGTTACTTCTTTTATAATTACGTTCACTGTGTTAAGGGATGAAAAACAATACTCTAGCTTCCTATAGAAATTCTTGGTAGACCAGTTATTCGTTATCCTGTACAGAACATACATTTCATAGGCATAATTATGTTAGGTTCGTAAATACATTTCCAGCATATATAATTTGTGTTATGTGACATATTCCAGAACCAAATTCTTAACACAATTTGCAGACTGTTTGTACTCAACTCTGTGTCTTTTAACAATAGCCCTGTTGCAGGGAAGGATCCAGTGGGGAAGGAGGGTGTAAAATCTATGGTTTAACAGCTATTGAAAGGAAGCCAAGAAAATAGCTCCTTCCACACTGGCTTTTCCCAGCACCTTTCCTCCCAGGCAGCTTGTGTCTATTGGTGTCTGCATCGATAAAGAGAAATTCTTATTTGTACCTGATGTTAGACTCATACCTCTTCTGCGGTTGAACTTGAGGTTTTGCACCCTGGGCATGCTGGGCTGTTTCTGTGGTGACGGCCGCTGCAGCTGCACCTGACTTCCACCTCCATGGCTGACAGACCCTCCAGCTGCTGGATGCCACTGTGACAAAATTAAAGTGCTCGCATGAAATCTAGCTAGAAAGTAATTTCTTCTGAAGAGGTCCTCAGAGCATAATTCCTGACTTTAAAATTTAAAGAGATCCCATGGCAGAAATGATTTTCCTAGCATTTCTCTGCAGGCAGGTAAAGGAACTTAAGCCCTCTCCAAGGGGATGGGGTGGAGGATCGCTCCCCTAGGATGGCCGATGAGAGCCTGCAGAGAAGCATTTTAGAAACTACACACACCTCCTCTCCCCACCTCGGCTGCAGATTTTGATACAATCCCTCACAAGAACCCCTGCACGAGACCAACATGACTGACAGTAGCGTGCTGCTCCTGTGGAAGGAGAAGGGGCTGCAGAAAAGTGAAAAGCCGCCGATTTCGGGAGTGGCGAGTGGGCCAGTTTCCAAATAGCTGCAGTTCTCCTTTCTGCCTCCAAGCCTTCTTCGGAAAGCACTCGTGCTGAGAACCCAGTACTGCCCTTGAACCTTGACAAGGGGCCTCTGCTTCCCAGGGCCTGTTCTGGCCCTCCTCCCACTGCACCCCACCCCACGGGGTATGCAGTCTCTACCACCAAGGAGACATGCCACCCCAGGAGTCCACATCCCACGTGCCAGACCAGGCTCCCAGCGCCCCAGGATTCCCTGTCCCCCAAGCTCCACACCCACTCCCAGGGTCTGTGCAGGCATTTTTTCAGATCCATCCTCCTGAGGGAGGTTGTGCCATCAGTGGATCAAGTCTTGACCTGAATGGTGGCCAAGGGATAGATAGCTGTTTGCAGGGGCAAGAGTGGAACTGGGCATGAAGACCAGAGAGTCCATCCAGGCTGTCTGTGAGGCTCCCCACAAGGCCAGAAAGAGCCAGCGGCAAGAAGAGAAGCAGGAAAGCATGTCAGTCAGAGGCAACTCTCCAAAGGCCTCTACACTTCTGCAGGAACTCAGAGAGTTCAAGAGCTCATCCTTCCAGGTTGTGATCAAGGTCTATTTGTCAACATAGGAGGACAGAACATATTTCCCAGTTTGTTAGCTTGCTATATCCCACATACCATATATGTGCCTTCAAGTATACCCTTGTCCTGGGCCCCACAGGAGGTGGCAGTGGGTCTGAAGAACCCACCTGAATTGAGGAGATCATGTGCCATACTCAGCTGTCATATGAAGAGTACTGGTCCTTAAACAGCCAGTGAAATGAAACTGAAGCCATATAGGAAGTACTGAAGATGGCCATGTGAGACGGTGGTTACTGTGGTGCCTGGTGCTATGCACATGACCTCTTCCCCATTCTCAAACCAGCCGGTTAGAAACCAGCTTGCGATCAGTCTCCTTCTGCCCTCCTCCTCCTAAGAGGCAAAGGTGCCCTGAGGAGGAATTCAGGCTGTGGGTTAAGCAGCTCTGACTCTGAATTCAGCTCTGCCACTTACTAGCAATGTGACCTGGGGCCAGGTCTTCCTGAGCCTGAGTTTCCCCACCTGTAAAATGACACCTTGCTACAGGGATTCTTGAAAGGAGTAGAGCAGAGGAGTGAAGCGTTCTGCAGTGTCCACCATGTGATTAGTACTGGTGTTAGTTTCAATTGTCAGTTTCTAGAGGACGGGAACTATACCTGCTCTGATTTTATCACCTAGCATGTCTGTAAAATATAAGAGAATTATATCTCCAGGCCATTAGATTTCCAACCACCCAGATTGTACACATTCCTAGCACAGCCAATCATGTCAGCTTATGCTGAATAATCTTTACCAACTCAAAGTGGAAGTGCAAAGATTCCATAAAGAAGTTCAATTCCATCTGGTTTGAGTTGGTGTTTTAAAAAAAAAAAAATTCAATTCCAAGGCTCAAACCAACTCACATCTCCTTTTTTACTAAGTTTAATTCTGAACTTCATCGTGGGATTTAACCAGGTTCCTAATC
ATGATCTAAAGTTACTTAGTAGAATTTAAAGACTTTCATTTAATTTTAATAATATTAAGCCTACTTATATTAATGAGTTGCTGCTAGAAAAACACACAAATGAAATAATTTTTCTTCTAGGATTCCAAACTGAATCAGTTCTTCAGTTTCTATCAAATCCCAACCCTCAGTGCATATGGCTGAGGTGGGGAGAGGGGCTGGGAGGGGCAAGGAGAAATGGAATGGGCCCTGCTTGGCAGGCTGCCAGATGAAGAAGGTATCTAATGCCCATCCCCAACTAACCTCAGGTTACACAGCACTCAGTCATCATACCCATGATCATATAGCAAAAAACAATAAACACACAATAAGAAAATTTTGGTTCTGGCCAGGCACGGTGGCTCGTGGCTCATGGCTCATGCCTGTAATACCAGCACTTTGGGAAGCCATGGCAGAACTGCTGGAAGCCAAGAGTTCAAAACCAGCCTCGGCAGCAAAATGAGACCCCCATCTTTACAAGAAAAAAAATTTGTTTTAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGGATCACTTAAGCCCAGGAGTTCAAGGATGCAGTGAGCCATGATCACACCACCGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCTACACTCCTCAAAATAAAAACGGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATGCAAAATCAGCTGGGTGTGGTGGCATGCACCTGTAATCCCAGTTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACTTGGGAGGTGTAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCAAGTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAAAGAGCAAGACTCCCTCTCAAAAAAAAAATAAAATTACAGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGAAGGCCAAGGCGGGCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCTAACATAGTGAATTCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTATGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACATGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAGGCTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACCACACTCCAGCCTGAGAGACAGAGTGAGACTCTCTCAAAAAAAAAAAAAAGATATATATATATATGTGTGTGTGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATTCATACCTGTATAATTTTCATCAAACAATGTGTGATCTAGCAGAAAGGTCATGGAGTTAAATAGGTCCCAGCTACTTTCTCTCACTCTGCCTGATGTTAAAGGGTGCTGTTTCTATGTACTCATCTCGATAACTTCCCTTTATAGAGTCTTCTGTTGCCTCTGTACAGAGGAAGACTTGGGAGCGGTTGTGACTCCTGTTACTAAAGAGGACCCTTGCAACAATGCCATGCCTGCTGCCAGCCACCAGCAACAGAAGAGGTGAGGTATGAAACGTGTACTTCACTTCTTTAATAGATGATAAATCCTGTTACTTCTTTTATAATTACGTTCACTGTGTTAAGGGATGAAAAACAATACTCTAGCTTCCTATAGAAATTCTTGGTAGACCAGTTATTCGTTATCCTGTACAGAACATACATTTCATAGGCATAATTATGTTAGGTTCGTAAATACATTTCCAGCATATATAATTTGTGTTATGTGACATATTCCAGAACCAAATTCTTAACACAATTTGCAGACTGTTTGTACTCAACTCTGTGTCTTTTAACAATAGCCCTGTTGCAGGGAAGGATCCAGTGGGGAAGGAGGGTGTAAAATCTATGGTTTAACAGCTATTGAAAGGAAGCCAAGAAAATAGCTCCTTCCACACTGGCTTTTCCCAGCACCTTTCCTCCCAGGCAGCTTGTGTCTATTGGTGTCTGCATCGATAAAGAGAAATTCTTATTTGTACCTGATGTCAGACTCATACCTCTTCTGCGGTTGAACTTGAGGTTTTGCACCCTGGGCATGCTGGGCTGTTTCTGTGGTGACGGCCGCTGCAGCTGCACCTGACTTCCACCTCCATGGCTGACAGACCCTCCAGCTGCTGGATGCCACTGTGACAAAATTAAAGTGCTCGCATGAAATCTAGCTAGAAAGTAATTTCTTCTGAAGAGGTCCTCAGAGCATAATTCCTGACTTTAAAATTTAAAGAGATCCCATGGCAGAAATGATTTTCCTAGCATTTCTCTGCAGGCAGGTAAAGGAACTTAAGCCCTCTCCAAGGGGATGGGGTGGAGGATCGCTCCCCTAGGATGGCCGATGAGAGCCTGCAGAGAAGCATTTTAGAAACTACACACACCTCCTCTCCCCACCTCGGCTGCAGATTTTGATACAATCCCTCACAAGAACCCCTGCACGAGACCAACATGACTGACAGTAGCGTGCTGCTCCTGTGGAAGGAGAAGGGGCTGCAGAAAAGTGAAAAGCCGCCGATTTCGGGAGTGGCGAGTGGGCCAGTTTCCAAATAGCTGCAGTTCTCCTTTCTGCCTCCAAGCCTTCTTCGGAAAGCACTCGTGCTGAGAACCCAGTACTGCCCTTGAACCTTGACAAGGGGCCTCTGCTTCCCAGGGCCTGTTCTGGCCCTCCTCCCACTGCACCCCACCCCACGGGGTATGCAGTCTCTACCACCAAGGAGACATGCCACCCCAGGAGTCCACATCCCACGTGCCAGACCAGGCTCCCAGCGCCCCAGGATTCCCTGTCCCCCAAGCTCCACACCCACTCCCAGGGTCTGTGCAGGCATTTTTTCAGATCCATCCTCCTGAGGGAGGTTGTGCCATCAGTGGATCAAGTCTTGACCTGAATGGTGGCCAAGGGATAGATAGCTGTTTGCAGGGGCAAGAGTGGAACTGGGCATGAAGACCAGAGAGTCCATCCAGGCTGTCTGTGAGGCTCCCCACAAGGCCAGAAAGAGCCAGCGGCAAGAAGAGAAGCAGGAAAGCATGTCAGTCAGAGGCAACTCTCCAAAGGCCTCTACACTTCTGCAGGAACTCAGAGAGTTCAAGAGCTCATCCTTCCAGGTTGTGATCAAGGTCTATTTGTCAACATAGGAGGACAGAACATATTTCCCAGTTTGTTAGCTTGCTATATCCCACATACCATATATGTGCCTTCAAGTATACCCTTGTCCTGGGCCCCACAGGAGGTGGCAGTGGGTCTGAAGAACCCACCTGAATTGAGGAGATCATGTGCCATACTCAGCTGTCATATGAAGAGTACTGGTCCTTAAACAGCCAGTGAAATGAAACTGAAGCCATATAGGAAGTACTGAAGATGGCCATGTGAGACGGTGGTTACTGTGGTGCCTGGTGCTATGCACATGACCTCTTCCCCATTCTCAAACCAGCCGGTTAGAAACCAGCTTGCGATCAGTCTCCTTCTGCCCTCCTCCTCCTAAGAGGCAAAGGTGCCCTGAGGAGGAATTCAGGCTGTGGGTTAAGCAGCTCTGACTCTGAATTCAGCTCTGCCACTTACTAGCAATGTGACCTGGGGCCAGGTCTTCCTGAGCCTGAGTTTCCCCACCTGTAAAATGACACCTTGCTACAGGGATTCTTGAAAGGAGTAGAGCAGAGGAGTGAAGCGTTCTGCAGTGTCCACCATGTGATTAGTACTGGTGTTAGTTTCAATTGTCAGTTTCTAGAGGACGGGAACTATACCTGCTCTGATTTTATCACCTAGCATGTCTGTAAAATATAAGAGAATTATATCTCCAGGCCATTAGATTTCCAACCACCCAGATTGTACACATTCCTAGCACAGCCAATCATGTCAGCTTATGCTGAATAATCTTTACCAACTCAAAGTGGAAGTGCAAAGATTCCATAAAGAAGTTCAATTCCATCTGGTTTGAGTTGGTGTTTTAAAAAAAAAAAAATTCAATTCCAAGGCTCAAACCAACTCACATCTCCTTTTTTACTAAGTTTAATTCTGAACTTCATCGTGGGATTTAACCAGGTTCCTAATC
Task1_train_26123
This alteration in ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) on Chromosome 18 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Benign recurrent intrahepatic cholestasis type 1
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Task1_train_26124
The following genetic variant occurs in ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) on Chromosome 18. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy, 1
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCTGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
Task1_train_26125
A mutation found in ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) on Chromosome 18 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCTGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
Task1_train_26126
Mutation context: Chromosome 18, Gene ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCTGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
Task1_train_26127
This genomic variant is located on Chromosome 18, within the ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Benign recurrent intrahepatic cholestasis type 1
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCTGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
Task1_train_26128
A mutation found in ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) on Chromosome 18 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
CCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGTTTGAGGCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTAAGCCAAGGTCATGCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCTGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATAT
Task1_train_26129
This variant affects gene ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) located on Chromosome 18. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
GCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATATGTCATAATTTCCTTCCTTTTTAAAGTTGAATATATTCCATTATGTGGAAGCACCACATTCTGTTTATCCATTCA
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Task1_train_26130
This sequence variant lies in ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1) on Chromosome 18. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; not specified
GCCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATATGTCATAATTTCCTTCCTTTTTAAAGTTGAATATATTCCATTATGTGGAAGCACCACATTCTGTTTATCCATTCA
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Task1_train_26131
Located on Chromosome 18, this mutation impacts ATP8B1, ATP8B1-AS1 (ATPase phospholipid transporting 8B1| ATP8B1 antisense RNA 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Cholestasis, intrahepatic, of pregnancy, 1
CCACTGCACCCCAGCCTGGGCCACAGAGGGAGACCTTGTTTTTTTTTTAAATGCACCTGGCATATAACAGTGCTTAATAAAAATTTTAAGACAACTTAAGAAAAACAAGCCCCTCTAAGATTATCTACATTGACTTTGTGCAATCCCTCTCATTATGTATTGGTGAACTCAGAGGAACAAAATGTTTCAAGTCTAAGTCACATAATCAGTTGATAAATCTCCAAAGCAAACCCGTCCCCTCCCATTATCTAGAAGGCTACTTTATAACTGAATAAAAATCATGTTTGACTTGTCCTTTTGGCACGGCTAGTTACGTTAAAGGTACGTAATGGAAAATAAACTAGAGCTGGCTGGCTATGGAGGAAAGAGATAGATCTAACTCCGAGCAAGCAATACCATTCGCATGGTAGGGCAAGCACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAACAGTGTGGATGAATTAAACTGCTAGTGACCACAGACATACGCACTGATAAAGAAGGCAAGATGACATACGTCATACAGCTGACTCCTGTTGAGGAAGATAAAGTTGGAATATTCTTAGTATACATCAAGGAGGAGGAGGAGACTAAGAAAAGAAAGAGACAGACTCATGAGTCACAAAATAGACTGAAAAGTCTAGTTATATATAATGCATTTAAGCAACCCAGCATCACAGGAACATGCAATTACCTATGTACAGTCAGGTAATACTTCAGCTCAGTGATAATAATACGACAGAGCTGGAGGTGACATTAGGGATTATTTTCTTTTCCGATGAGAAAACTGAAACCTGAGCATAAGCCCAAGGTGACACCGGATTTTGGCAATAGGATGAGGATGAATATCCAGGTCATTAGTTTGAGTATTTTTAATACAAGATACTCCCTTATAGTGACAGAGGGAGGAAAAAGGAACAGAATTCAGACATAGAGATGAGGGCTGTGGGTGTGCTTCTGCAGGCTTTAATACCAGCACAACTGTATTTCTGCATGGCAGGACTCAATATTTTAATTGTGTGGACTTAAATTCTAGCATCCAGAAAAAGGCAGCCTTCTAGGGAGGTGAGGAGGATGATGAGAGCACGTGGAAGCTTTTCTTCAGTGCTAAACATGTTACTCTAAACTCACACCAGGTGACCCAATGATGAAGTTCCCACAGATTTACCAAAGGTAGGAAGAAAGTCCCAGAAAGAAATGCTTAGATGAAGGAGAATGATATTGTCAAAGCAAGCACCAGCCAGAGTTCAATAATTTATGTCTTACAAAACTTATTAAATATCAGGGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGTAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTTCAGCATCTTGATCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCACCTGCCTCGGCTTCCCAAAATGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCACTGTGCCCAGCCAATATCAGGGCTTTTAATAAACCCAAAATATGGGAAGAGAACCAGTAAGAGAGAAAAAAATACACAACATCTATATAAAAGAATAAAAATATAAGGATAAATTTCCCCCCATAGACCTTATTTTCCTCTTCGCATCCTTCAGAAGCCCTGTCAGTGATACTCTTTCCTCCTGATGGGCTGTGGGCTTTCTGGGGGTAGGGTCACAGGCGTTGTCATGGTTAAGTGACTTTATGAAACATCTGCTCTATGAAAACCTAAGCTGTAAAATCTAAAAAAAGAAAATCCACCCCCTACACATTCCAGCCATTTCTCCTCTCTAGCACGTTGGGCCTCACTGGCCGTGGGTGCATGACTCACTTTTGATCATGTTCACGTCATTGGCCCCATCTCCGATGGCCAGCGTGATGGCTTTCTTGTACCTCTTCACCAGGTCCACCACCATGGCCTTCTGCTTGGGGGTGACGCGGCAGCAGATGACTGCGCTGCACTCGCAGGCCAGGTCCACAAAGTTTTTCTGCCGCTGCTCTTTCTTAGCTTCTAGCCTCCTTTTACTTTGGGTCCGCATCCGTCTTTCTTCTTCTGTTCTTGGGAACTTCAGCTTCAGAATCTTATTTCTCTTGGTCTTTTTCTCGAGAAGAATTTCATTCTGTGAAATCAGAGAGGGAAAAGGTTACATTCACTTTAGTTTTACCCCAGGAGTACCATTCCCAAGATTTAAATTATGTGAAGGATAATTTTTGGATTATGTCACTGATTATATTTGACAAATAAATTTGATTTTATAACCAAAACATGTATATATATGTGTGCGTGTGTATGTATATACACACGCACACATATATGTATGTGTGTATGTATATACACACACACACACACACACATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTTGCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTTCCAGGTTCAAGCAATTTCCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCCGGGACTACAGGTGTGCACCACCACGCCTGGCTAATTATTTTTTTTGTATTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGCACAGGCGTGAGCCACTGTGCTCAGCTATATATATATTTTTCAATGGAGATGGGGTCTTGCTGTATAGCCTGGGTTGAAGTGCAGTGGCTATTCATTCACAAGTGTGATCATTGCATGCTGCAGCCTCGAACACCTAAGCTCAAACCACCCTCCTGCTTCAACCTCCAGAGGAGCTGGGACTACAGGCGCATGCCACCACATCCAGCTTATAAAATATATATGCAACAAAAATTTAGAAAATCTAACAATCTATAAAGAAGAAAATGAAAAAACCCATTAATTAGTAAACCAAGATAACCACTTTTACCTCTTTGGTATACATCCTTTCATATATCATATATTATTAAGTCTCAAACTTGGAAAAACCACACTTTCATGTATAGGCTAAGAGACTTTTAGGTTGGCAGTTAACATGTGAAAGCATCTAAAAGTGGCTCCAAATGAACTTCTTTCTTTTGAGTTAAAGGCACAGATACACTAATGATACGTACCAACCAAGAACCAGTGATGATTAAGGCACGGTTTCCACCGGGTGGAAAAAAAGATTCCTGCACAGGAGGTGCAAACTTTGCGTAGACGCCACCTCTATTCCTCTGGTTTTCCATCCTTGCATGAAGAAGAGAACTAGGGGAAACCAAATTTCAGTGTTTAAAGTGTAAGACCCTAAATAGGCCCTTGACTCTGAGATAACTTTGACTTAAAAAAAATTGTGACAAAAAAACAAAGTTTACCATCTTACCTATTTTTGTTTCTTTATTTTATTTTCATTATAATTTTTTTGAGAGAGGGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGAGCAGTGGCATGATCATGGATCACTGCAGCCTTGACCTCCCAGCCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTTGCTGGGACTATAGGCACACGCTATCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGCAATAGGGTTTTGCCATATCCCGGGCTTTGACCATTTTTAAGTGTACAACTTAGTAGTGTTAACTATAGTCACATTGTTATCCAACCAATCTCTAGAACTTTTTCATCTTGCAAAACGGAAACTCTATACCTATTAAACAATAACACCTCACCTCACTCGCCCTCCAGTCCCTGGTAACTTCCAGTTAACTTTCTGTTTGAATGAATTTGAGCACTCTAGATACCTCATATATGTGAAATCAAACAGTATTTGTCTTTCTGTGACTGGTTTATTTCACTTAGCTTAATGTCTTCAAGGTTCATCTATATAATATATGTCATAATTTCCTTCCTTTTTAAAGTTGAATATATTCCATTATGTGGAAGCACCACATTCTGTTTATCCATTCAC
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Task1_train_26132
An alteration has been detected in ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) on Chromosome 18. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; ATP8B1-related disorder
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCCGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCTGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
Task1_train_26133
Here is a genetic alteration in ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) on Chromosome 18. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCCGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCTGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
Task1_train_26134
This sequence variant lies in ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) on Chromosome 18. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Benign recurrent intrahepatic cholestasis type 1
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCCGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
CAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTTCAGCCTGGGCAGCAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACATGTATATACACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCTGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTA
Task1_train_26135
Here is a variant affecting ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) on Chromosome 18. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; not provided
ACATATATACATACATATATCTACATATATACACACATATATAAATACATGTATATATAAATATACATATATAAATATATGTATATATATATAAATATAAATGTGTGTGTGTGTATACACCTTCTGATGTGATACTTAAAGAAAAGCACAGCATCACTTACGGACTCTTCCTGCCAACAATGTGTAACCTAGCTCTAATCATGAGGGAACATCAGACAAACGCAAATGGAGGGATAGCCTATAAAATAACCAGCCTGTGCTTTTTAAAAATATCAATGGATGAAAGATCAAAAAGAGATTGAACCGTCCTTGACTCAGAGTCATGATCACCTAATATAACCTGTGATCTTAGATTGGATCCTGGACCAGAAAAACAAAGAATGAACCTCCCTGGTAAAATCTGATAAAGTCTATTGATTAGATAATATTGTACTGTGTTAAATTTTCTGGTTCTGAACATTGCACTGTATATATAAGTGAGTGCTTCTGTTCTTAGGAAATACCTACTATGGTATATAGTACAGTATTTAGGGGAAAGGGACATTAGGCCTGCAATTTATTCTCTTTTTTATATTTTTATTTTCTTTTTTTATCATGTAATCTTGCTCCTTCTAACGCAATTTACTCTCAAATGGTTCAGAAAACAATAACCTGTATGTATGTGTGTGTACATATATATGTGTGTATATATATAGGTATATATAATGAAATTACATATATATAATTAGATATATATTAGATCTATATATAGAGATATGTAAATGAAATTTCATTATGTTAACAATTGGTGGATATGGAAGAGTATGAGGGCTCTTTAAACCATTCTTGTAACTTTTCTATAAGTTTGAGATTATTTCAAATTACGAATTTAAAGCAGTTCAGTGGTAGGAAGTGATTTTCATCTTCACTTGGTGGTCTGTTATGTGCCTGCATTGCAGATATGATTTTGATTCATAAGCATAGCTTTGCTTTTCTCAGAAATCTTTTCCTGCTGAGTCCTCCCTTCCCTGCCATCAAGTACAGAAGAGAGCACTCAGAGGTGCTCAAAAAATAAAAGAGCATGTGTTGTTTAAAATAAAAGACTGCTACAAATGTCTACCTGCTGCTTCAGAAATGTTCCACCTGCTGCCCCAGATTCAGCATCTGGCAGCCCACGTGGTTAAAGAATGTCAGCAGCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGACTCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCGCACCACTGCACTCCTGGGTGACGGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAGAGAGGGATTAAAAAAGAACGTCAGCAGCATTTGCAAGATTCAGAGATACTGTGGCTACCCCTTTGAGTAGGGAACACAGTGAAGAATGAAGAAAACAATACCAGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTATCGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCGCGATGTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTGGCTGGGACTACAGGTGCCAGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCAACAATACCAGTTTCAGTAAAGCTGCAGAAATCTCCCAGGAGCCAAGTAGCTCTTTCACTGGCTGCTTTATCCTGATGCCACTCAATACAATGGGCACAAGCAACATCTAAATGAGCGATTCATAGACAGACTCTGAGGGGGACTTACCAATGATAGACATTCGCTTCCGGTCACTGTTGAAGTCCAAAATGGCAAGAACATTGTAAGTCCTTTCAGTGCCCAGTTCACTGATGGTGATGGTGTTCTGGGTCCTGGCGAGGAAGGCAAAGCCAAAGTTCCTGGCAGCGTTTACCAGGGCACCTTCATCGGGAGAGGCTGCCTGGTAGTTGAGCTGACCTAACAAGGAAGCGAGAGAAATCCCAGAAAAGCTGTAAAAACAAATGCAGAGCTCATTGTTGAGGCCTCTGCTGAGGCTCCTGTGGGGGTCAGATGGGCTGCAAAGCCCAAAACATCCCCAGGAAAACGAGTCATTGACTTGGAAGGGTTATGCCAAGATTAAAACTTCTTTGTTTTATCTTGACTTATAAACAGTAATATAAACTAAAAAAGAAACATTGGTGGAGAATGAGGGAAAATTCCCATAATCCCACCATCCACAGGAGAAACAACAGGTGTTGACATTTTATCATTCCCTCCAGTGCCTTTTAAAATGTCTGTATCTGAAATTGTTTCTATCAAGCTGAATATACATTTACATCCTGATTATTTTAATGCTGTATCTGAGCATATTGCCATCCCTTTTTAAATTCTTTATAAACATTTGAACAAATGTAAATATGTTATCATTTTCCCATTACAGACACTTAATTTCCAAATTTTTTTACTCTCAAAAAGTCACACTTTAATAACCCTTTTGTATGTGTGTAAAGATTTTTCTGTTTCTTTTTTCTTTTTAGAGACAGAGGTCTCCCTATGTTGTCCAGGCTGCTCTTGATCTCCGGGGCCCAAGTGATCCTTCTGCCTCAGCCTAATGAGTCGCTAGGGCTACAGGCTCATGTCACCTCACCTGGCTTATTCTCTTTCTTTCTTGTTTTTCTGAAACAGGGTCTCACCGTGTTGCCCAGGTTGCAGTGCAGTGGCACGATCATGGCTCACTGAAGCCTCAATCTCCCCAGGCTCAGTGATCCTCCTACCTCATCTTCCCATGTAGCTGGGATTACTGGTACACGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTTGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGCTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAGTGATTCGCCTGCCTCAGTCCCTAAAGTGTTCGGATTACAGGCATGAGCCACTGCCCCTGGGCCCCTGGCTTATTTTCTAAGAGCAGATTCCTATTAGGAAAATACTGAGCCAGAGAACACTGATAATTTTAAAACTCATTGGTATACAATACTAATTTGTTTTCCAAGAAGGTTGTACCAGTTTATCTTCCCTCTAAAAAAGTATGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTGTTTTTTTGAGACAGTCTTACTCTGGCACCAAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTCAGCTCACTGCAGCCTTGATCGCTTCAGGCGCAAGTGATCCTCCCACCTCAGCTTCCTGAGTAGTTGGGACTATAGGCGCACATCACCACGCCCAGCTAATGTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGATCTCACCATGTTGCCCAGGCTATTTTTTCTTTACCATAGCTATATTCTCCTTATTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCACACAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAATTTGGGAGGCTGAGGCAGGTAGATCATGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCTGTCTCTACTAAAAACACAGAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCACGTGCCTATAGTTCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCACCCTGGTGACAGACCGAGACTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAGTTGAAACAAACCAACCAACCTTAGTTTGATCACTATCCGATATCTTAATGTTTAAAAGTTAAATAATGGAAAATTGTCTTCTATTCACAACTACATTTCAACAATAAGAATAAGCTAGGTTCAGTGGCACGTGCCTATAATTGCAACTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGTGTGAGGTTACAGTGAGCTTTGATATTCCACTGCACTCCAGCCTGGCTGACAGAGCAAGATGCAGTCTCTTTTAGGAAAAAAGAAAAAACCAATAAGAA
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Task1_train_26136
This is a variant in ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1), located on Chromosome 18. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
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Task1_train_26137
This variant impacts the gene ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) on Chromosome 18. Is the change likely to result in a pathogenic outcome?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis
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A mutation on Chromosome 18 affecting ATP8B1 (ATPase phospholipid transporting 8B1) has been found. Is it harmful or harmless? What disease, if any, does it cause?
Pathogenic; Progressive familial intrahepatic cholestasis type 1
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The gene NEDD4L (NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase) on Chromosome 18 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Periventricular nodular heterotopia 7
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Task1_train_26140
A genomic change on Chromosome 18 affects NEDD4L (NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Periventricular nodular heterotopia with syndactyly, cleft palate and developmental delay
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AGAAGTGAGAATTTACGGTTTATGACTCATGAAATTCTCTTGAATGTTGCCTCAGTATACATAAAATTTCAGGTGTATTGTTTGCATTATCTATATTTATAAATTTATCTTCCAGGCTGTCCCTTACTCCAGAGAATTTAAGCAGAAATATGACTACTTCAGGAAGAAATTAAAGAAACCTGTGAGTAATCATGCCTTCCAAAAATGCTTTGTGTTAGTCATTTGTAAGTTACCACAGTCACTTCAGTGAGAACAACTTGGTTGTTACTTTTATATGAATGCTAAAAATATTACCTTCCTTTTCTCTCTGCACTTTGATCCTCCTGGTTCTAAAATCTGAATTTTCTTTTTAACAGAAATGGTAAGTGAAAATTAACTCAGTGTTACATATCAAATCACCTGAAGGGTAATTTCCTATGTAATACATAAAAAGACAGGAATGATTTTTATGGGATATAAAATAATTCAGAACCCTAGTCACAAAATCTGTGGAAGCCTATTCAATTATGCGCAGTTATCATATTTAATTAACCTGGATCCCGGTAAGAAAAATGTTCAAGTCCTTCCTTGTAAATGCAAAAGCTTAGTTTCAACTACAGTATTTATAATATAGTGTTATATTTAATTATAATAATTGGCAGTATTACGTCCAAATGTAATTTTCTACTTATAATTATCCCTGGCAGTTTAAAACCTAGAAACTCTAAAAATTTTTATGGGCAACATTTTAAATTATAACATTGCATTTTCTAATGACACACCATCCCCAAATTGTTCAACATTGCATCCTCTGTTTTACTTTCCGATTCCTCCTTAGCAGTTTTCTCTTCAATTTTCTCCATCACTATGGTTACACCTCTAGGGAGGGGAGAGAAGCGGCTGCAGCTCAGACCCCCTCTGGTGGCCTGGGCTCCATTGCCATCTCTCCCTGCCTCCTCCCCTCAGCTGGTTCCTCCTGCCCGGGAACATCTCTGGATGGGGCACAATGTCTGCTCTCATTTAGGGGTTTTGGTCTCTGTTCCAAAGTCCTGATTCAAGAGCTTGCGGGTAACTGCTATTGAAATGATTCTTTGCCTTCAAAACTCAAATGATCACTGAAAATTCCACAGTTTTCTTTGTGAGTCATGTCCCCTGGTAATGATGATGACTGTGGTCATCACCCAGTCTCACTCTATGGCTCTCACATAGCAGTGTCTGCTACCCGGAAACCATCTCTGCACATTCATTCTTACAGCCAGACCAAGCCTGGACCGCCTCTTTGCAGGAGGCAGTTGCCACAACCTTGGTCAAGTGTTTTGTTATTTTCATGTCAGCGAACCATGCTTTGGGCTGCTTTCCCCACACTTGGCATAATCAGGATCCCACTCCCCATGGCAACAAAATGGACTTGAGGCAGCGTGGATTATATCTACCACCTGGCGGCCCTGCCACAGTTGAGCATGGATAGGCCCAACCTGGCCAGGTGGGGATTATTACAGGTTTTGACTACCTGGGCTAAAGTCTCTTGAGTGAAGCAACAGATACAGTCGACTGCCTTTCGGTTGCCCTATGCTGGAGAAGTGCCCACAGTTGTTTATTAAAGGGGGCAAGGAGGATGTTCTCCTTCGCAGCAGAGTTCTAACTTTCCTGAGCATCGCTAGTGGATGCCGTGTGTCCCATCGTGACACAGCAAGGCTTTCTGTCTGCAAGGGAAAACCCCTAAAGGAGAGAATCTCAGTTGGAACCATTTGTCACTGCCTGTTTCTTTGAGGACTGCCAACTTTTCTACCATTTGCTGTTGTTTTTATTAGAAAACAAAGTGTGTATTTACTGTATGATTATGTGTTTTCTTTTGTCTTTTGTGTAGGCTGATATCCCCAATAGGTTTGAAATGAAACTTCACAGAAATAACATATTTGAAGAGTCCTATCGGAGAATTATGTCCGTGAAAAGACCAGATGTCCTAAAAGCTAGACTGTGGATTGAGTTTGAATCAGAGAAAGGTCTTGACTATGGGGGTGTGGCCAGAGAATGGTTCTTCTTACTGTCCAAAGAGATGTTCAACCCCTGCTACGGCCTCTTTGAGTACTCTGCCACGTAAGTATATGGCCACACCCAGTGTGTGTCCCCCACTGAGACAGTTGTATGAATTTAAACAGAATGAAAGGATAAGCAGCTCATGAGTTCGAGATGCATTAACTCTGCTGAGTTTGTTCTCTCCTCACCCCACAGCCCCTTGCAAGTCTAGAACAGGTTCTGACTCTACGTGGTGAAATAGTGTACTCTGCGAACATCTAACATTGATTTTTTTTCTTGTCTATTGGGTTCATGGAGTTGAAATTGAAAACGTGGATAATTATGATAAGGAACAGGAGGCGATTTTCATTTGCAGTGTTCAAGAGGAGGACTTGTCAGTGTTAGAATTCAAAAACAAAGGAGGTGTTTTTTGAACAAGAGTCGTTTCTGAGGTCTCCTGTGTAAAGGCAAATTGTAAGGACTTTGAGGACCTAGGACCATGCCCTGCTCCTGTAAGGAAAGAACCAGGTTTCCCCTTGCATTAGGATTTCATCATTGCCAGGCTTGGAAACTGAGGCAGACTAAATTGCTTTCTGAGCAATTAAACATCAGCTACTTCCAGGCCAGCCATTCCTCCTTCAGACTCTGAATCCTCCAAGGGTTGGGCAGTACCCAAGCCCCCAGTAGAATAGTCATTGACCTTGCTGAAGGGCATTTGTCATCACTCCAGCCCTGGGCTCTAAGGGGACGTGGGTTCCCCCACATCTCCCACCTGGTACCAGTCTCCTGGGGGCTCATTTGGAAGGCCGCCTCAGTACATTCTTCCTGGTTGCTCTAGCCAAGAATTGCCCAATTGATTTGTTGTTACTGAGTCCCATGAGAAAGCCCACTATGTACAATGTATCCAACTATTGAAGGTGGAGGGCAGGGTGGAGAGAGACAAGATCTTTACCTCTTCTCCACATTTTCAAAGATACCCCCACCCCGGAGGAATCAGTCTGTGATCCCAGTTTGAAAACTACTGATCCACATGATTGTGAACCAAGCAAGATCATTTGGACAAATCTAAAAATTTGCAGGTTTGCATCATTGAGAGAGCCATATCCTGTTCCTAATCCCCTCGAGGCCTTTTCAGAGCAGAGTAGTGGTCAGAAGACAGACCAAGGGTTGGGCCCATAGCAAACATCTTATGGCCAAGCCAAAAGCCTCTGGAAGGAATTAAACTTCCTTCATCACAGAGACGACCTAAAGTACTCACATCTTTGGGAATCCCTGCACAGCCCCTTTATTATGTGGCGTTTCTCATCTCCCCAAGATATTTGGCTGAACCATATGAAATAGACACTTCGTAGGTCAAAAACAGTCAAACATCAGCGTCTCTTATGGTTTAATTGACTTTAGAGGGCACATGCGTCAGCCTCCATGGTGGGTCACGGTTGAGCATGTGGTAAGTCAGGTCCTCTAGCCCACACATTTTCCCACTAGGTACAGAATGCTCGCAGGGACACTGTAAAAGTTGAGTGACAGGTGGCAAACAAATATGCAAAATCTTGCATTTGAAAGTGTGATTGGGCTTTTCTTCTCTTTCTCCTCAAAAGGGACAACTACACCCTTCAGATCAACCCTAATTCAGGCCTCTGTAATGAGGATCATTTGTCCTACTTCACTTTTATTGGAAGAGTTGCTGGTCTGGCCGTATTTCATGGGAAGCTCTTAGATGGTAAGTCTTGAAGTAATAAAAATAGGTCAGTGCTGCTTGCGGTTTGCTAGTAGGTGTCTTATCTTTCGCATCATGGGTTTTTAAGCAAAAGCTTCACTGGTTTACTCATAAAGTATTTTTATGTTTTGCCCATAATGGATGTCCTTTTCTCTGGTAGCTTATTTTGGGCACTGAAGACATAGTGTCTACACACAGTTAAAAACAAAAGTTTTTTTTTAACTTCAGTGTAAAACACAGAACATTATGTATTTATACATTTGTATGTTTTCTGGAATAACTTTAGTGAAAGCAAGATTTGATAACAGATGGAAAAACTAATTGAAAAGTTAATTAAAATGATCTCATCTATCTAATATCCTGTGATTATTGCGTTTGTCCCCA
Task1_train_26141
A sequence alteration has been identified in NEDD4L (NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase) on Chromosome 18. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Periventricular nodular heterotopia 7
CCACAGTTGTTTATTAAAGGGGGCAAGGAGGATGTTCTCCTTCGCAGCAGAGTTCTAACTTTCCTGAGCATCGCTAGTGGATGCCGTGTGTCCCATCGTGACACAGCAAGGCTTTCTGTCTGCAAGGGAAAACCCCTAAAGGAGAGAATCTCAGTTGGAACCATTTGTCACTGCCTGTTTCTTTGAGGACTGCCAACTTTTCTACCATTTGCTGTTGTTTTTATTAGAAAACAAAGTGTGTATTTACTGTATGATTATGTGTTTTCTTTTGTCTTTTGTGTAGGCTGATATCCCCAATAGGTTTGAAATGAAACTTCACAGAAATAACATATTTGAAGAGTCCTATCGGAGAATTATGTCCGTGAAAAGACCAGATGTCCTAAAAGCTAGACTGTGGATTGAGTTTGAATCAGAGAAAGGTCTTGACTATGGGGGTGTGGCCAGAGAATGGTTCTTCTTACTGTCCAAAGAGATGTTCAACCCCTACTACGGCCTCTTTGAGTACTCTGCCACGTAAGTATATGGCCACACCCAGTGTGTGTCCCCCACTGAGACAGTTGTATGAATTTAAACAGAATGAAAGGATAAGCAGCTCATGAGTTCGAGATGCATTAACTCTGCTGAGTTTGTTCTCTCCTCACCCCACAGCCCCTTGCAAGTCTAGAACAGGTTCTGACTCTACGTGGTGAAATAGTGTACTCTGCGAACATCTAACATTGATTTTTTTTCTTGTCTATTGGGTTCATGGAGTTGAAATTGAAAACGTGGATAATTATGATAAGGAACAGGAGGCGATTTTCATTTGCAGTGTTCAAGAGGAGGACTTGTCAGTGTTAGAATTCAAAAACAAAGGAGGTGTTTTTTGAACAAGAGTCGTTTCTGAGGTCTCCTGTGTAAAGGCAAATTGTAAGGACTTTGAGGACCTAGGACCATGCCCTGCTCCTGTAAGGAAAGAACCAGGTTTCCCCTTGCATTAGGATTTCATCATTGCCAGGCTTGGAAACTGAGGCAGACTAAATTGCTTTCTGAGCAATTAAACATCAGCTACTTCCAGGCCAGCCATTCCTCCTTCAGACTCTGAATCCTCCAAGGGTTGGGCAGTACCCAAGCCCCCAGTAGAATAGTCATTGACCTTGCTGAAGGGCATTTGTCATCACTCCAGCCCTGGGCTCTAAGGGGACGTGGGTTCCCCCACATCTCCCACCTGGTACCAGTCTCCTGGGGGCTCATTTGGAAGGCCGCCTCAGTACATTCTTCCTGGTTGCTCTAGCCAAGAATTGCCCAATTGATTTGTTGTTACTGAGTCCCATGAGAAAGCCCACTATGTACAATGTATCCAACTATTGAAGGTGGAGGGCAGGGTGGAGAGAGACAAGATCTTTACCTCTTCTCCACATTTTCAAAGATACCCCCACCCCGGAGGAATCAGTCTGTGATCCCAGTTTGAAAACTACTGATCCACATGATTGTGAACCAAGCAAGATCATTTGGACAAATCTAAAAATTTGCAGGTTTGCATCATTGAGAGAGCCATATCCTGTTCCTAATCCCCTCGAGGCCTTTTCAGAGCAGAGTAGTGGTCAGAAGACAGACCAAGGGTTGGGCCCATAGCAAACATCTTATGGCCAAGCCAAAAGCCTCTGGAAGGAATTAAACTTCCTTCATCACAGAGACGACCTAAAGTACTCACATCTTTGGGAATCCCTGCACAGCCCCTTTATTATGTGGCGTTTCTCATCTCCCCAAGATATTTGGCTGAACCATATGAAATAGACACTTCGTAGGTCAAAAACAGTCAAACATCAGCGTCTCTTATGGTTTAATTGACTTTAGAGGGCACATGCGTCAGCCTCCATGGTGGGTCACGGTTGAGCATGTGGTAAGTCAGGTCCTCTAGCCCACACATTTTCCCACTAGGTACAGAATGCTCGCAGGGACACTGTAAAAGTTGAGTGACAGGTGGCAAACAAATATGCAAAATCTTGCATTTGAAAGTGTGATTGGGCTTTTCTTCTCTTTCTCCTCAAAAGGGACAACTACACCCTTCAGATCAACCCTAATTCAGGCCTCTGTAATGAGGATCATTTGTCCTACTTCACTTTTATTGGAAGAGTTGCTGGTCTGGCCGTATTTCATGGGAAGCTCTTAGATGGTAAGTCTTGAAGTAATAAAAATAGGTCAGTGCTGCTTGCGGTTTGCTAGTAGGTGTCTTATCTTTCGCATCATGGGTTTTTAAGCAAAAGCTTCACTGGTTTACTCATAAAGTATTTTTATGTTTTGCCCATAATGGATGTCCTTTTCTCTGGTAGCTTATTTTGGGCACTGAAGACATAGTGTCTACACACAGTTAAAAACAAAAGTTTTTTTTTAACTTCAGTGTAAAACACAGAACATTATGTATTTATACATTTGTATGTTTTCTGGAATAACTTTAGTGAAAGCAAGATTTGATAACAGATGGAAAAACTAATTGAAAAGTTAATTAAAATGATCTCATCTATCTAATATCCTGTGATTATTGCGTTTGTCCCCAAATTATTTTTTAATTTGAAGGGACTAAATAATTTCAAAATAATGTTACTGCTTAGCTAAGACATTAACCCTGAAACAAATAACACAAAATAATTTCATTCTTATTTAAAGCATATAGATCATGGAAGAATTTCAAGGTACCTTGAAAGTTAGAAGTCAAACCCTCTACCTGGCGGTATCTATAGGCTTAGAGACTTCTAAAAGATTTGGCCAATTCAAAATAGTGTCCTTAAGAAAACACTACAGAAATCATCAGTGAGAAAAAAGCATCAGAAATACTTTTTAAGAGCCTGGAGGTAGAGTGGTTGAGGATGGGAAGAGGGAGAGTAGGATTTGAGATTGACATTGCAGTAACTTATAAGAAAGATATTTCCAAGGGAACTGTGTTCATTGCATTTATAGAGCCTTAGCTATTCTAATAAATAATTTGTATACCCTCTGTACTTTTCCCATGAATATGTTTTTACTGTTAATTGGTAGCTGATATTGATGCTCTGATTTTGTTGCTTTATTTGGTAGCAGGGCGACAGTAAACACTTTTTTTCCTCTAGAAGGAAACTAAACCACACACTCTTTCCATGTATGTATAGTGTGAATATATTTTAATTTCCAGCTTTGGAGTCATGCCATAGATTGTTTCAGCCTGCTCCAATTCACTCCAACTTTCTCAGAAGGTCAGTTTAGTCACCGTATGCAAGTGAGAAGATGCTGTTAGTTGCTACAGTGTCTTTAATACCCTCTCTAACAGGGGGTAATAGAGAAGCATAAGATATGATCCTGACCTTAGTCAGCTTATATTTTAGCGGGGGGAAAAGAGATGAGAACAAAACCAGAAGAATCACAGTGATAGTGTCTGAGCAGAAGGGAGTGCATTGAGTCCTCAGAGGAGAAAGTGACTTGGCTGGAGGCTCAGGGAATCTTTCCCAGGATGAGCTGCACCTCGGAGGTGGGGTAGCATTTGAGCGTTCAAAGGCTGGGGTCATTTCAGATGAGTGAGGACCAGCCCAGAGTCAAGGCCTTGTGGAAGAAGATGGGCGGAAGCAGGAACCACTCAGGGTCTCAAGGAGCTGGCTAAAGTGACCCCGACAAGAGTGATCACGATATAAACCTGGAATTGCACATTTAAGAGTCCAAGTGCACATAGATGGGCCTAGTCAGCAGTGTCTTCAAATTTCCCACAGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGCTGCTCCCCCTGGTCGGCTTCATGCTTTTACTTCCCCAGACACTGGAGTCTATTGGAGCCTGCATAGGGCCACGCTGAGCCGGGGAGAATTGGCCTGTACTGCAGAGGGTGGGTGCCTGGTGGGGGGATGAAGGAGCAGAAGCAGGAGCCTGGGGTGCCAGGTCTGGTGGGGTCAGGACCCCCTGTGAGGAGGTGCGTGATGCCTTTGGATCAGGTGAAATGGAGGCACCTGCAGGACGCCTGAATGGTGGGAGGCCGACCTCGCTGCTGTTGCCTCCCTGAGGCCTCTGCCG
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Task1_train_26142
Given this variant in gene NEDD4L (NEDD4 like E3 ubiquitin protein ligase) on Chromosome 18, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Periventricular nodular heterotopia with syndactyly, cleft palate and developmental delay
CCACAGTTGTTTATTAAAGGGGGCAAGGAGGATGTTCTCCTTCGCAGCAGAGTTCTAACTTTCCTGAGCATCGCTAGTGGATGCCGTGTGTCCCATCGTGACACAGCAAGGCTTTCTGTCTGCAAGGGAAAACCCCTAAAGGAGAGAATCTCAGTTGGAACCATTTGTCACTGCCTGTTTCTTTGAGGACTGCCAACTTTTCTACCATTTGCTGTTGTTTTTATTAGAAAACAAAGTGTGTATTTACTGTATGATTATGTGTTTTCTTTTGTCTTTTGTGTAGGCTGATATCCCCAATAGGTTTGAAATGAAACTTCACAGAAATAACATATTTGAAGAGTCCTATCGGAGAATTATGTCCGTGAAAAGACCAGATGTCCTAAAAGCTAGACTGTGGATTGAGTTTGAATCAGAGAAAGGTCTTGACTATGGGGGTGTGGCCAGAGAATGGTTCTTCTTACTGTCCAAAGAGATGTTCAACCCCTACTACGGCCTCTTTGAGTACTCTGCCACGTAAGTATATGGCCACACCCAGTGTGTGTCCCCCACTGAGACAGTTGTATGAATTTAAACAGAATGAAAGGATAAGCAGCTCATGAGTTCGAGATGCATTAACTCTGCTGAGTTTGTTCTCTCCTCACCCCACAGCCCCTTGCAAGTCTAGAACAGGTTCTGACTCTACGTGGTGAAATAGTGTACTCTGCGAACATCTAACATTGATTTTTTTTCTTGTCTATTGGGTTCATGGAGTTGAAATTGAAAACGTGGATAATTATGATAAGGAACAGGAGGCGATTTTCATTTGCAGTGTTCAAGAGGAGGACTTGTCAGTGTTAGAATTCAAAAACAAAGGAGGTGTTTTTTGAACAAGAGTCGTTTCTGAGGTCTCCTGTGTAAAGGCAAATTGTAAGGACTTTGAGGACCTAGGACCATGCCCTGCTCCTGTAAGGAAAGAACCAGGTTTCCCCTTGCATTAGGATTTCATCATTGCCAGGCTTGGAAACTGAGGCAGACTAAATTGCTTTCTGAGCAATTAAACATCAGCTACTTCCAGGCCAGCCATTCCTCCTTCAGACTCTGAATCCTCCAAGGGTTGGGCAGTACCCAAGCCCCCAGTAGAATAGTCATTGACCTTGCTGAAGGGCATTTGTCATCACTCCAGCCCTGGGCTCTAAGGGGACGTGGGTTCCCCCACATCTCCCACCTGGTACCAGTCTCCTGGGGGCTCATTTGGAAGGCCGCCTCAGTACATTCTTCCTGGTTGCTCTAGCCAAGAATTGCCCAATTGATTTGTTGTTACTGAGTCCCATGAGAAAGCCCACTATGTACAATGTATCCAACTATTGAAGGTGGAGGGCAGGGTGGAGAGAGACAAGATCTTTACCTCTTCTCCACATTTTCAAAGATACCCCCACCCCGGAGGAATCAGTCTGTGATCCCAGTTTGAAAACTACTGATCCACATGATTGTGAACCAAGCAAGATCATTTGGACAAATCTAAAAATTTGCAGGTTTGCATCATTGAGAGAGCCATATCCTGTTCCTAATCCCCTCGAGGCCTTTTCAGAGCAGAGTAGTGGTCAGAAGACAGACCAAGGGTTGGGCCCATAGCAAACATCTTATGGCCAAGCCAAAAGCCTCTGGAAGGAATTAAACTTCCTTCATCACAGAGACGACCTAAAGTACTCACATCTTTGGGAATCCCTGCACAGCCCCTTTATTATGTGGCGTTTCTCATCTCCCCAAGATATTTGGCTGAACCATATGAAATAGACACTTCGTAGGTCAAAAACAGTCAAACATCAGCGTCTCTTATGGTTTAATTGACTTTAGAGGGCACATGCGTCAGCCTCCATGGTGGGTCACGGTTGAGCATGTGGTAAGTCAGGTCCTCTAGCCCACACATTTTCCCACTAGGTACAGAATGCTCGCAGGGACACTGTAAAAGTTGAGTGACAGGTGGCAAACAAATATGCAAAATCTTGCATTTGAAAGTGTGATTGGGCTTTTCTTCTCTTTCTCCTCAAAAGGGACAACTACACCCTTCAGATCAACCCTAATTCAGGCCTCTGTAATGAGGATCATTTGTCCTACTTCACTTTTATTGGAAGAGTTGCTGGTCTGGCCGTATTTCATGGGAAGCTCTTAGATGGTAAGTCTTGAAGTAATAAAAATAGGTCAGTGCTGCTTGCGGTTTGCTAGTAGGTGTCTTATCTTTCGCATCATGGGTTTTTAAGCAAAAGCTTCACTGGTTTACTCATAAAGTATTTTTATGTTTTGCCCATAATGGATGTCCTTTTCTCTGGTAGCTTATTTTGGGCACTGAAGACATAGTGTCTACACACAGTTAAAAACAAAAGTTTTTTTTTAACTTCAGTGTAAAACACAGAACATTATGTATTTATACATTTGTATGTTTTCTGGAATAACTTTAGTGAAAGCAAGATTTGATAACAGATGGAAAAACTAATTGAAAAGTTAATTAAAATGATCTCATCTATCTAATATCCTGTGATTATTGCGTTTGTCCCCAAATTATTTTTTAATTTGAAGGGACTAAATAATTTCAAAATAATGTTACTGCTTAGCTAAGACATTAACCCTGAAACAAATAACACAAAATAATTTCATTCTTATTTAAAGCATATAGATCATGGAAGAATTTCAAGGTACCTTGAAAGTTAGAAGTCAAACCCTCTACCTGGCGGTATCTATAGGCTTAGAGACTTCTAAAAGATTTGGCCAATTCAAAATAGTGTCCTTAAGAAAACACTACAGAAATCATCAGTGAGAAAAAAGCATCAGAAATACTTTTTAAGAGCCTGGAGGTAGAGTGGTTGAGGATGGGAAGAGGGAGAGTAGGATTTGAGATTGACATTGCAGTAACTTATAAGAAAGATATTTCCAAGGGAACTGTGTTCATTGCATTTATAGAGCCTTAGCTATTCTAATAAATAATTTGTATACCCTCTGTACTTTTCCCATGAATATGTTTTTACTGTTAATTGGTAGCTGATATTGATGCTCTGATTTTGTTGCTTTATTTGGTAGCAGGGCGACAGTAAACACTTTTTTTCCTCTAGAAGGAAACTAAACCACACACTCTTTCCATGTATGTATAGTGTGAATATATTTTAATTTCCAGCTTTGGAGTCATGCCATAGATTGTTTCAGCCTGCTCCAATTCACTCCAACTTTCTCAGAAGGTCAGTTTAGTCACCGTATGCAAGTGAGAAGATGCTGTTAGTTGCTACAGTGTCTTTAATACCCTCTCTAACAGGGGGTAATAGAGAAGCATAAGATATGATCCTGACCTTAGTCAGCTTATATTTTAGCGGGGGGAAAAGAGATGAGAACAAAACCAGAAGAATCACAGTGATAGTGTCTGAGCAGAAGGGAGTGCATTGAGTCCTCAGAGGAGAAAGTGACTTGGCTGGAGGCTCAGGGAATCTTTCCCAGGATGAGCTGCACCTCGGAGGTGGGGTAGCATTTGAGCGTTCAAAGGCTGGGGTCATTTCAGATGAGTGAGGACCAGCCCAGAGTCAAGGCCTTGTGGAAGAAGATGGGCGGAAGCAGGAACCACTCAGGGTCTCAAGGAGCTGGCTAAAGTGACCCCGACAAGAGTGATCACGATATAAACCTGGAATTGCACATTTAAGAGTCCAAGTGCACATAGATGGGCCTAGTCAGCAGTGTCTTCAAATTTCCCACAGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGCTGCTCCCCCTGGTCGGCTTCATGCTTTTACTTCCCCAGACACTGGAGTCTATTGGAGCCTGCATAGGGCCACGCTGAGCCGGGGAGAATTGGCCTGTACTGCAGAGGGTGGGTGCCTGGTGGGGGGATGAAGGAGCAGAAGCAGGAGCCTGGGGTGCCAGGTCTGGTGGGGTCAGGACCCCCTGTGAGGAGGTGCGTGATGCCTTTGGATCAGGTGAAATGGAGGCACCTGCAGGACGCCTGAATGGTGGGAGGCCGACCTCGCTGCTGTTGCCTCCCTGAGGCCTCTGCCG
CCACAGTTGTTTATTAAAGGGGGCAAGGAGGATGTTCTCCTTCGCAGCAGAGTTCTAACTTTCCTGAGCATCGCTAGTGGATGCCGTGTGTCCCATCGTGACACAGCAAGGCTTTCTGTCTGCAAGGGAAAACCCCTAAAGGAGAGAATCTCAGTTGGAACCATTTGTCACTGCCTGTTTCTTTGAGGACTGCCAACTTTTCTACCATTTGCTGTTGTTTTTATTAGAAAACAAAGTGTGTATTTACTGTATGATTATGTGTTTTCTTTTGTCTTTTGTGTAGGCTGATATCCCCAATAGGTTTGAAATGAAACTTCACAGAAATAACATATTTGAAGAGTCCTATCGGAGAATTATGTCCGTGAAAAGACCAGATGTCCTAAAAGCTAGACTGTGGATTGAGTTTGAATCAGAGAAAGGTCTTGACTATGGGGGTGTGGCCAGAGAATGGTTCTTCTTACTGTCCAAAGAGATGTTCAACCCCTACTACGGCCTCTTTGAGTACTCTGCCACGTAAGTATATGGCCACACCCAGTGTGTGTCCCCCACTGAGACAGTTGTATGAATTTAAACAGAATGAAAGGATAAGCAGCTCATGAGTTCGAGATGCATTAACTCTGCTGAGTTTGTTCTCTCCTCACCCCACAGCCCCTTGCAAGTCTAGAACAGGTTCTGACTCTACGTGGTGAAATAGTGTACTCTGCGAACATCTAACATTGATTTTTTTTCTTGTCTATTGGGTTCATGGAGTTGAAATTGAAAACGTGGATAATTATGATAAGGAACAGGAGGCGATTTTCATTTGCAGTGTTCAAGAGGAGGACTTGTCAGTGTTAGAATTCAAAAACAAAGGAGGTGTTTTTTGAACAAGAGTCGTTTCTGAGGTCTCCTGTGTAAAGGCAAATTGTAAGGACTTTGAGGACCTAGGACCATGCCCTGCTCCTGTAAGGAAAGAACCAGGTTTCCCCTTGCATTAGGATTTCATCATTGCCAGGCTTGGAAACTGAGGCAGACTAAATTGCTTTCTGAGCAATTAAACATCAGCTACTTCCAGGCCAGCCATTCCTCCTTCAGACTCTGAATCCTCCAAGGGTTGGGCAGTACCCAAGCCCCCAGTAGAATAGTCATTGACCTTGCTGAAGGGCATTTGTCATCACTCCAGCCCTGGGCTCTAAGGGGACGTGGGTTCCCCCACATCTCCCACCTGGTACCAGTCTCCTGGGGGCTCATTTGGAAGGCCGCCTCAGTACATTCTTCCTGGTTGCTCTAGCCAAGAATTGCCCAATTGATTTGTTGTTACTGAGTCCCATGAGAAAGCCCACTATGTACAATGTATCCAACTATTGAAGGTGGAGGGCAGGGTGGAGAGAGACAAGATCTTTACCTCTTCTCCACATTTTCAAAGATACCCCCACCCCGGAGGAATCAGTCTGTGATCCCAGTTTGAAAACTACTGATCCACATGATTGTGAACCAAGCAAGATCATTTGGACAAATCTAAAAATTTGCAGGTTTGCATCATTGAGAGAGCCATATCCTGTTCCTAATCCCCTCGAGGCCTTTTCAGAGCAGAGTAGTGGTCAGAAGACAGACCAAGGGTTGGGCCCATAGCAAACATCTTATGGCCAAGCCAAAAGCCTCTGGAAGGAATTAAACTTCCTTCATCACAGAGACGACCTAAAGTACTCACATCTTTGGGAATCCCTGCACAGCCCCTTTATTATGTGGCGTTTCTCATCTCCCCAAGATATTTGGCTGAACCATATGAAATAGACACTTCGTAGGTCAAAAACAGTCAAACATCAGCGTCTCTTATGGTTTAATTGACTTTAGAGGGCACATGCGTCAGCCTCCATGGTGGGTCACGGTTGAGCATGTGGTAAGTCAGGTCCTCTAGCCCACACATTTTCCCACTAGGTACAGAATGCTCGCAGGGACACTGTAAAAGTTGAGTGACAGGTGGCAAACAAATATGCAAAATCTTGCATTTGAAAGTGTGATTGGGCTTTTCTTCTCTTTCTCCTCAAAAGGGACAACTACACCCTTCATATCAACCCTAATTCAGGCCTCTGTAATGAGGATCATTTGTCCTACTTCACTTTTATTGGAAGAGTTGCTGGTCTGGCCGTATTTCATGGGAAGCTCTTAGATGGTAAGTCTTGAAGTAATAAAAATAGGTCAGTGCTGCTTGCGGTTTGCTAGTAGGTGTCTTATCTTTCGCATCATGGGTTTTTAAGCAAAAGCTTCACTGGTTTACTCATAAAGTATTTTTATGTTTTGCCCATAATGGATGTCCTTTTCTCTGGTAGCTTATTTTGGGCACTGAAGACATAGTGTCTACACACAGTTAAAAACAAAAGTTTTTTTTTAACTTCAGTGTAAAACACAGAACATTATGTATTTATACATTTGTATGTTTTCTGGAATAACTTTAGTGAAAGCAAGATTTGATAACAGATGGAAAAACTAATTGAAAAGTTAATTAAAATGATCTCATCTATCTAATATCCTGTGATTATTGCGTTTGTCCCCAAATTATTTTTTAATTTGAAGGGACTAAATAATTTCAAAATAATGTTACTGCTTAGCTAAGACATTAACCCTGAAACAAATAACACAAAATAATTTCATTCTTATTTAAAGCATATAGATCATGGAAGAATTTCAAGGTACCTTGAAAGTTAGAAGTCAAACCCTCTACCTGGCGGTATCTATAGGCTTAGAGACTTCTAAAAGATTTGGCCAATTCAAAATAGTGTCCTTAAGAAAACACTACAGAAATCATCAGTGAGAAAAAAGCATCAGAAATACTTTTTAAGAGCCTGGAGGTAGAGTGGTTGAGGATGGGAAGAGGGAGAGTAGGATTTGAGATTGACATTGCAGTAACTTATAAGAAAGATATTTCCAAGGGAACTGTGTTCATTGCATTTATAGAGCCTTAGCTATTCTAATAAATAATTTGTATACCCTCTGTACTTTTCCCATGAATATGTTTTTACTGTTAATTGGTAGCTGATATTGATGCTCTGATTTTGTTGCTTTATTTGGTAGCAGGGCGACAGTAAACACTTTTTTTCCTCTAGAAGGAAACTAAACCACACACTCTTTCCATGTATGTATAGTGTGAATATATTTTAATTTCCAGCTTTGGAGTCATGCCATAGATTGTTTCAGCCTGCTCCAATTCACTCCAACTTTCTCAGAAGGTCAGTTTAGTCACCGTATGCAAGTGAGAAGATGCTGTTAGTTGCTACAGTGTCTTTAATACCCTCTCTAACAGGGGGTAATAGAGAAGCATAAGATATGATCCTGACCTTAGTCAGCTTATATTTTAGCGGGGGGAAAAGAGATGAGAACAAAACCAGAAGAATCACAGTGATAGTGTCTGAGCAGAAGGGAGTGCATTGAGTCCTCAGAGGAGAAAGTGACTTGGCTGGAGGCTCAGGGAATCTTTCCCAGGATGAGCTGCACCTCGGAGGTGGGGTAGCATTTGAGCGTTCAAAGGCTGGGGTCATTTCAGATGAGTGAGGACCAGCCCAGAGTCAAGGCCTTGTGGAAGAAGATGGGCGGAAGCAGGAACCACTCAGGGTCTCAAGGAGCTGGCTAAAGTGACCCCGACAAGAGTGATCACGATATAAACCTGGAATTGCACATTTAAGAGTCCAAGTGCACATAGATGGGCCTAGTCAGCAGTGTCTTCAAATTTCCCACAGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGATGGGAATGTCCCTGTCGGCAGGGCTCATTCTGCACATCTGTCCGCTGCTCCCCCTGGTCGGCTTCATGCTTTTACTTCCCCAGACACTGGAGTCTATTGGAGCCTGCATAGGGCCACGCTGAGCCGGGGAGAATTGGCCTGTACTGCAGAGGGTGGGTGCCTGGTGGGGGGATGAAGGAGCAGAAGCAGGAGCCTGGGGTGCCAGGTCTGGTGGGGTCAGGACCCCCTGTGAGGAGGTGCGTGATGCCTTTGGATCAGGTGAAATGGAGGCACCTGCAGGACGCCTGAATGGTGGGAGGCCGACCTCGCTGCTGTTGCCTCCCTGAGGCCTCTGCCG
Task1_train_26143
This variant affects gene MALT1 (MALT1 paracaspase) located on Chromosome 18. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; Combined immunodeficiency due to MALT1 deficiency
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Task1_train_26144
With a mutation on Chromosome 18 in gene MALT1 (MALT1 paracaspase), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Combined immunodeficiency due to MALT1 deficiency
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Task1_train_26145
This mutation is located in gene RAX (retina and anterior neural fold homeobox) on Chromosome 18. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Isolated microphthalmia 3
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Task1_train_26146
The gene RAX (retina and anterior neural fold homeobox) on Chromosome 18 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Isolated microphthalmia 3
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Task1_train_26147
Here is a genetic alteration in LMAN1 (lectin, mannose binding 1) on Chromosome 18. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Factor V and factor VIII, combined deficiency of, type 1
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Task1_train_26148
This sequence variant lies in CCBE1 (collagen and calcium binding EGF domains 1) on Chromosome 18. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 1
TGCAGCTCAGTGATGTCATTGCGGATGTCAGCCAGCATAAGTAGCAGGAAGTCGAAAGAACCAGGGGGTCCCTGTGTACATGGGAGGAATCAAAGCTAGAATACGACAGACAGCAATGGCCTCCGGGGCTCCATGACTTGACCTGCTGCTTGCTGGCAACTACTTTCTCAATAACTCTGTGCCCCAAATGGAGCCAATGTGAGGACTGCTACAGGAGCCTGGGGGTCCTCCATATTGTTTTCTAATTCTGTCACTTCTCAGCTGAGCTTTGGTGATGTATTCACCTTTCCTCCCTCCTAACGCTTTATCAAATCCAGTAGAGGAAAGGATATAAGAATAACTCTCCTAGGTTACTTTCCAAAGCAGTCTGGAAGATGCTTATGAAGGCAGCAGAGCAGTGGTTAAGAGACTGGGGTTCTGTTGGATTTGAATCTCATCTCTGCCGCTTACTAGCTGTGTCATCTTAATTTCTTGTGGTTCAGTTTCCCCATCTGTAAAACGGGGATAATAATAGTCCCAACTTCATAGGGTTTTGTAGGATTCATAAGTGAGGATTTAAGCAAGTAAATACGTGTAAAGGGCTTTGAGCATAATACGTATTCAAAAATGTTATCTGGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGATGGATAGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGAAAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAATTTAACAAAAATTTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTGGACCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAAGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAACAATGCTGTTATTTTTTAAAAGCAAAATTATTAAAATGTTTATAAGATGGCTGACTATAAGCACAAACTAAATGAAGTTGAGAGGATGTTGTAAAGACGTCAACTCCTCGTTGACTAGGAAAGGTCCAAACAAAATCTTCCTAATTTTTCTATGTATTGAGTATCCTTTATCATCATATAGTATTTACTAAGCCTTAATTTCATATAGCGCTGTGTGGGGCATGGTAAAAAAGAAATGCACAAACACGCATGTTCTGGGCTTGTCAGAAGCTTGTAGTAAAATCGTTATCATCTCCCGCAACTGCTGCTACAGCAGCGGGCACCGTGGAAGCAGAGCTTACACCGTAAAGCACTAAGAGAGGCACAGTATTTTCATATCATTTGACCCTCACAGTAGCCACTTCAGGGATGGCAGGTCAGATTCCACTATCGCCACTGCACAGTGGGGGGCAAGAATGCCCAGAGACCCTCAGTGAAGTGCCCGTGGTCAGAAAGCCAGCAGGTAGAAGAGTTGAGATGGGAACCCACGACTCCTACCTCTGTGGCCACAGCCGCTGGATTTCAGAAATGATACTTCTTCAGAAGCAGTGACGTGGTTTGAATTTTCTATGCTTTTGAATACTACTATTTCTCATTTTTAATCTCCCAGATACTATGCTTATATGCAGCTAATTTCTTCTCAGGTCCTAAACAGCCCTGCGTGGTTTTGCACTTTTTAAGAGGAGATGGCCATCTGGCCTGCTAGGGTTGCAGCAGTGGCTAAATTCTCAAGTACGCAGAGTTATGATTTAAACCCATAGATTTCCTTCCTAGACCTTTCAAATGTTTTATGATAATACTTGGAAACAGACTCATGGCATAGCAGGGTTTTGAGCTTTAGGAAAGACATTTCAAATAAAGATTAGCCATGATAAAAGAGAAAACAGCAACAGAAAACAAATTTGAAAAATAAATCCAAACTAGCAGCTAAGGGCTTCTATGACTCTCTTCCTAACCACAGAGTTCTGTTCAGGTGGGCTGAGTGGCATCAGGAAGGGGCGGGCTTTTGCTACTAGACCAACCTATAGGCTCATCAGAGCTGCATCCCTGAGAACGTTCCCCTGGGGAAGCAGGACACAGAGTGCTACTTACTGGAGACCCTCTGGGCCCAGGCGCTCCTCTCTCCCCCTAAAAACAGAAAGGCCAGGGTTAGCTTTCTAGAGCACATGGATATCACAAGAATAGTCTCTATTTATACACCCACCATAACCACTTCCCTGCACAAAACAATAAACATTTTCTATAGAAAACATATGTAAAACTGAGCTGGACTCACGGGACCACTTATTTGAACAGGACTGCTTGGGTCAAGTGTCTCTCATTCTGATTTCCCTCAAGCCCATCTATTTTCAAACCTTCTTGGCAAGAGGAATGTTCATATTTCCCAACAGCATGTGGAGTAACAAACTTTCTGAAGTAACTCACACTGACTTCTTTGTGAGGCAAAAAAGAGCAGGCAGCTCTCAGAGGGGAACCACCCTGCTTGCAAAAAGAATGGAGCATCTCCTGTTCCTGAGAAATCTCACAGAAATGGAAACACACAAAAAGCTATCCCGTAAAGCAACACTGGTTAAAGAGAAAAACACATGTGAGAATCACAACACAGAGGCTCATTTAAAATTTACAGGGGTCACTTTTCCTATGAGTGGTTGTGGTGGTTGTTTTTGTCTTTGGGGTTGGTTTTGGAATTGAAGACAATGGCTTTTCAGATTTTGTTCCCAGCTTTGGGGAAAAAGTTCTATCTGGTATCTGTGTCTCACTTCTGCTGCATGCAAAATGGGGTTGGTAAACAGTGTCTGGTGAGCTTTCCTGGATGTCAGTGCAAGAGGTAGAAAGTGAGAGACCTTCAGGCCGGGAGCGGTGCCTCACACCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACCTGGGGTCAGGAGTTTAAGGCCAGCCTGGGTAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAATCCAAAAATTAGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAAGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGTCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACTCGGGAGGTGGAGCTTGCCGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAATCCAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGTGCACACCTGTGGTCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGGGCTTGAGCCAGAGAGGCAGAGGCTGTAATGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATCTCAAAAAACAAAAACAAAACAAAACAAAAAAATCGAAAGTGAGAGACCTTTAGCTTGTGAGGACCACTCATAAGGCTTACCTTAGAACCATCTCTTCCTGGTGCCCCTGGTGGACCCTGTAATACAAAAGGATCTGGTTTAACCACAGGCAAAAGCATGGGACAAAAACACATTTTCCCCCAAAAAGGAAGTGGATCTCTGATAAGATACTGACCACAGGGCCCCTCCGGCCTTGCTTAATGTGGGACAGATCAGGAGATGGTCCCATGGGTCCCATTGAGCCCCGTGGGCCGGGCTGCCCAGGAGGGCCTGGCATACCGGGGAAGCCTGGGCTTCCCTTTGGTCCTGGTGAGCCTGTAATCAAAGAACACCTCATTAGCTCACAGCACATGAGAAGGACAAAGGGCCCTGGCTAACAAGAGTCCAGGACCCCTGCAGCCATTTCTCTTTGTACTCTCTCTGCCTTTGCCTTCTGACATCTCCATCAGGCTGTCCCACAGGCATTTTAAACTTGATACGATCAAAAGCGGCTTCCCCATCTTCCTCTCTTTTCGCGGACTGCCAGTCATACATCCACTCAAGCCAAAAACTGGAGAGTCTTCCTCTATATTTCCCTGTTTCTGCAACCTCCTTTTTGAATCAGTGGCCAGCTCCTGTGCATTTTACCTCTTTAACATCTCACAGCTGTCTGCTCCCTTCTATCC
TGCAGCTCAGTGATGTCATTGCGGATGTCAGCCAGCATAAGTAGCAGGAAGTCGAAAGAACCAGGGGGTCCCTGTGTACATGGGAGGAATCAAAGCTAGAATACGACAGACAGCAATGGCCTCCGGGGCTCCATGACTTGACCTGCTGCTTGCTGGCAACTACTTTCTCAATAACTCTGTGCCCCAAATGGAGCCAATGTGAGGACTGCTACAGGAGCCTGGGGGTCCTCCATATTGTTTTCTAATTCTGTCACTTCTCAGCTGAGCTTTGGTGATGTATTCACCTTTCCTCCCTCCTAACGCTTTATCAAATCCAGTAGAGGAAAGGATATAAGAATAACTCTCCTAGGTTACTTTCCAAAGCAGTCTGGAAGATGCTTATGAAGGCAGCAGAGCAGTGGTTAAGAGACTGGGGTTCTGTTGGATTTGAATCTCATCTCTGCCGCTTACTAGCTGTGTCATCTTAATTTCTTGTGGTTCAGTTTCCCCATCTGTAAAACGGGGATAATAATAGTCCCAACTTCATAGGGTTTTGTAGGATTCATAAGTGAGGATTTAAGCAAGTAAATACGTGTAAAGGGCTTTGAGCATAATACGTATTCAAAAATGTTATCTGGGCCAGGTGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGATGGATAGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGAAAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAATTTAACAAAAATTTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTGGACCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAAGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCCAAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAACAATGCTGTTATTTTTTAAAAGCAAAATTATTAAAATGTTTATAAGATGGCTGACTATAAGCACAAACTAAATGAAGTTGAGAGGATGTTGTAAAGACGTCAACTCCTCGTTGACTAGGAAAGGTCCAAACAAAATCTTCCTAATTTTTCTATGTATTGAGTATCCTTTATCATCATATAGTATTTACTAAGCCTTAATTTCATATAGCGCTGTGTGGGGCATGGTAAAAAAGAAATGCACAAACACGCATGTTCTGGGCTTGTCAGAAGCTTGTAGTAAAATCGTTATCATCTCCCGCAACTGCTGCTACAGCAGCGGGCACCGTGGAAGCAGAGCTTACACCGTAAAGCACTAAGAGAGGCACAGTATTTTCATATCATTTGACCCTCACAGTAGCCACTTCAGGGATGGCAGGTCAGATTCCACTATCGCCACTGCACAGTGGGGGGCAAGAATGCCCAGAGACCCTCAGTGAAGTGCCCGTGGTCAGAAAGCCAGCAGGTAGAAGAGTTGAGATGGGAACCCACGACTCCTACCTCTGTGGCCACAGCCGCTGGATTTCAGAAATGATACTTCTTCAGAAGCAGTGACGTGGTTTGAATTTTCTATGCTTTTGAATACTACTATTTCTCATTTTTAATCTCCCAGATACTATGCTTATATGCAGCTAATTTCTTCTCAGGTCCTAAACAGCCCTGCGTGGTTTTGCACTTTTTAAGAGGAGATGGCCATCTGGCCTGCTAGGGTTGCAGCAGTGGCTAAATTCTCAAGTACGCAGAGTTATGATTTAAACCCATAGATTTCCTTCCTAGACCTTTCAAATGTTTTATGATAATACTTGGAAACAGACTCATGGCATAGCAGGGTTTTGAGCTTTAGGAAAGACATTTCAAATAAAGATTAGCCATGATAAAAGAGAAAACAGCAACAGAAAACAAATTTGAAAAATAAATCCAAACTAGCAGCTAAGGGCTTCTATGACTCTCTTCCTAACCACAGAGTTCTGTTCAGGTGGGCTGAGTGGCATCAGGAAGGGGCGGGCTTTTGCTACTAGACCAACCTATAGGCTCATCAGAGCTGCATCCCTGAGAACGTTCCCCTGGGGAAGCAGGACACAGAGTGCTACTTACTGGAGACCGTCTGGGCCCAGGCGCTCCTCTCTCCCCCTAAAAACAGAAAGGCCAGGGTTAGCTTTCTAGAGCACATGGATATCACAAGAATAGTCTCTATTTATACACCCACCATAACCACTTCCCTGCACAAAACAATAAACATTTTCTATAGAAAACATATGTAAAACTGAGCTGGACTCACGGGACCACTTATTTGAACAGGACTGCTTGGGTCAAGTGTCTCTCATTCTGATTTCCCTCAAGCCCATCTATTTTCAAACCTTCTTGGCAAGAGGAATGTTCATATTTCCCAACAGCATGTGGAGTAACAAACTTTCTGAAGTAACTCACACTGACTTCTTTGTGAGGCAAAAAAGAGCAGGCAGCTCTCAGAGGGGAACCACCCTGCTTGCAAAAAGAATGGAGCATCTCCTGTTCCTGAGAAATCTCACAGAAATGGAAACACACAAAAAGCTATCCCGTAAAGCAACACTGGTTAAAGAGAAAAACACATGTGAGAATCACAACACAGAGGCTCATTTAAAATTTACAGGGGTCACTTTTCCTATGAGTGGTTGTGGTGGTTGTTTTTGTCTTTGGGGTTGGTTTTGGAATTGAAGACAATGGCTTTTCAGATTTTGTTCCCAGCTTTGGGGAAAAAGTTCTATCTGGTATCTGTGTCTCACTTCTGCTGCATGCAAAATGGGGTTGGTAAACAGTGTCTGGTGAGCTTTCCTGGATGTCAGTGCAAGAGGTAGAAAGTGAGAGACCTTCAGGCCGGGAGCGGTGCCTCACACCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGGCTGAGACGGGCAGATCACCTGGGGTCAGGAGTTTAAGGCCAGCCTGGGTAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAATCCAAAAATTAGGCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAAGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCTGTCTCTACTGAAAATACAAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCGGTCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACTCGGGAGGTGGAGCTTGCCGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAATCCAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGTGCACACCTGTGGTCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCGGGAGAATTGGGCTTGAGCCAGAGAGGCAGAGGCTGTAATGAGCCAAGATTGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACCATCTCAAAAAACAAAAACAAAACAAAACAAAAAAATCGAAAGTGAGAGACCTTTAGCTTGTGAGGACCACTCATAAGGCTTACCTTAGAACCATCTCTTCCTGGTGCCCCTGGTGGACCCTGTAATACAAAAGGATCTGGTTTAACCACAGGCAAAAGCATGGGACAAAAACACATTTTCCCCCAAAAAGGAAGTGGATCTCTGATAAGATACTGACCACAGGGCCCCTCCGGCCTTGCTTAATGTGGGACAGATCAGGAGATGGTCCCATGGGTCCCATTGAGCCCCGTGGGCCGGGCTGCCCAGGAGGGCCTGGCATACCGGGGAAGCCTGGGCTTCCCTTTGGTCCTGGTGAGCCTGTAATCAAAGAACACCTCATTAGCTCACAGCACATGAGAAGGACAAAGGGCCCTGGCTAACAAGAGTCCAGGACCCCTGCAGCCATTTCTCTTTGTACTCTCTCTGCCTTTGCCTTCTGACATCTCCATCAGGCTGTCCCACAGGCATTTTAAACTTGATACGATCAAAAGCGGCTTCCCCATCTTCCTCTCTTTTCGCGGACTGCCAGTCATACATCCACTCAAGCCAAAAACTGGAGAGTCTTCCTCTATATTTCCCTGTTTCTGCAACCTCCTTTTTGAATCAGTGGCCAGCTCCTGTGCATTTTACCTCTTTAACATCTCACAGCTGTCTGCTCCCTTCTATCC
Task1_train_26149
This sequence variant lies in CCBE1 (collagen and calcium binding EGF domains 1) on Chromosome 18. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Hennekam lymphangiectasia-lymphedema syndrome 1
CCCCTCATGAGCTGTGGAAATGAGCCATGGGACCATCAAACAAGTCCCCATGAAGAGCCCATGTTAACTATGCACATCATGGACTTGCTCCCCTGCCGCATGGTGGAAACAAAAACGTTTCCCACCACGAGGACAGTGGGAGGCCCAATTCCATTTCCTGTTCACTGGTTGAAGACAGTGGGTAGCAGTGGGTGGGAGCCGTGGCATGCAGCCCCAGACTGTGCACATGTGCTGCGTAGACACAGGCCAGCCCTGAACTTGAGGATGGCAACAACTTCCCAGCCACTCCCTGCACAAGCTGCCAGTGACTCAGTCCCTGTGTACGCTGAGGGGAGGGTGGTCATCTGGACGCTCCCCGGCAGTACCAACTATGTCACCTGTAGACCGGATGTTGCAGCTGCATCCTCCTCTGCAATTCCTCAGGCTCACTGCCTTTCCCCAGGTGTCCCTGCCCTAAACCTACATGTGATGCTGCCTGTACTGCCCAGAGAGAGAGGAGATGAAGTTGAAATCAGAGATAGAAATAGAACTCTTAGTAGAAGCCAAGTTCTGCTGGTCCCCAAACCCCCAAACAAAAAGAACAGGGGGCTGGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCGCTTTGGGGGGGCCAAGACAGGAAGCTGAGCCCAGGAGTTCCAGGCCAGACTGAGCAACATAGTAAAATCCCATCTCTATAAAATACGAACAAAATTAGCTGGGTGTAGTGGCGCATGCCTGTAGCTCCAGCTACTCAGGAGGCTCAGGTGGGAGGATCACAGGAGCACGGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGTGTGACCCTGTCTCAAAAATAAATGCATAAAGAATAGGGTACAGTAGCTGCTATAAAGTGAAGTAAGAGCCTTGTGCCTGGGACCTGAGCCTCATGGAATGGCCTGTACCTTTCTCTGCAGGAGAGGCCAGAGATCCCTGCCCCATTCACTTGGGAGTCACAATCCCATTGTCTGGCATTGTGGGGCACCATTCCCAAATGCCGACAGGGAGCAACCAGAGGACCTACGGTTAGAACTTCTCAGAAATGGTGCTCCCTAGAGCCCCTGCTAGGATAGAGAAAGAGGGATGCTCATGACAGCTGGTTTATCTTCCATGTAGGTCTACCTGCTAGTCTCTGGCAGTTCATCCTCCAGTTGATTCTTAAATCTCACCATGCCTAGGAATCATTAGAGGCATTGGTGTAAATATGCACGTCTGGACCCACTCTCAGAGTTGTGATTCATTAGGTGTGGAGAAAAGGCCAGGTTTTTTTTTTTTTTCCCCAAACGAGGACCCCAGATGTTTCTTGGGTTAGTTATGAACTGACCACACTTTCAGACACATGGTTCCAATGGAAAATGAGCCATAAAGCTGCCTTAGAACCTCAAGGAGTGCACGGCTGGGATAGCCAGTTCATGAGGGTGGCAGTAAACAGGCTGGTGCCGTGGATGGTGCAGGCTCTGCTCAGCTGCAGCCCAGGTGGCTGGCTTCAGCTCCCTCTGACTTCCTCCCAACCTGTCTGCCATATGGCTACTTCCTTTTTTCCCCAACCATCTTCTAAGAGAATGTTTATTCTTGTTTTGTTCTGTCTGCGTTTTTACTTTTCTGACCACTTATACTCTGTTTTACATTATTCTAGTTTATATTTGGGCATGTTCCCCTTCTCCTGCTCTTATGTCTCATTGCCAATTAGGACCTTGCTGGTACCAAATCCCGGAAGAATTCCTTGGGCCTAATTGGTTTTAGTAATTGTGATGAAGGGCAGTGATAAGCTATCCCTAGGATAATATCAAACACAACTCCATCCAACAAGTATGAGAACTGAAGGGTCCAACCAAGGACAGAACCATCTGAACAAGGCACATGTTCAGAAGCTGGAAACAAGCACATTCCCAACACACCCAGACAGTATGGCTTCTCCCGCTTCCGGTGTCTCTCCCGGTCATATCGGTATCCCGGATAACAAGTACACAGCACTCGGCCAAAGTTGTCCGTGCACTGCTGTTCACAGGGAGCCTCGGCACAAACGTCGTAATCTGAAAAAGCAAAGTGAGAGCTCACATCAACTACAGGAGGAGGCGGAGTAACCTGGCCCTGGCCTGGAAAGGACTTTCTGGGCTGGGCTCTGCTCAAGGGCACGTGTGAAGTGTGGACAGATATACTTGGAGGGACAGGAACTCTTTAGGGCTGTGGGTCACCTTCTAAGAGTACTGCAATGGGTAACTTACATGGCATCACATCACTCGTGATTTTTCCCCTAGGTCACCTTGTCATCCTTTGGTCTTTGTCACTATCCAGAGAGAAAAGACTCTTAAGAGGGCCAGCCTCTGCGGATTCCCTCGGGGTTGGGGGTGCTGTTTTGTCTTGTTCATCAACTGCTGTAGAGGCAGGTGACTCCACCCAGCAGAATACTAAACAAAGGCCAGCTGGGGTGACAGGCACTGGTGTCATCATGTGGGAGGAAGGGCTGGAAGTCAGGCAGGCTCAGAGAGGTAGGAAGGGGGCTTTGTGTATACATGTCTAGTCTTATGCTGCTGATACAGACATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAACTGGCTCACAGTTCCACATAGCTGGGGAGGCATCACAATCATGGCTGAAGGTGAATGAGGAGCAAAGCTGCTTCTTACATGGTATCAGGCAAGAGTGTGTGTGCAAGGGAACTCCCCATCAGATCTCGTGAGACTTATTCACTGTCATGAGAACACCATGGGAAAGACCCACCCCATGATTCAATTACATCCCACCAGGTCCCTCCCATGACACGAGGGAATTAAGGGAGCTACAATTCAAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGCCAAACCATATCACTTTGTAATAGAAATGTGCATGACTTATAAGAGGGCCGATGCTTATGTGTGTATACTGTATAAGTGTGCATCCTGGGGGGTTGATCTCTCATGCTGAGAAGGGGTTGGGTGAGTTTGAATGGCTAGAGGTCTCTTTCCAGCTCTCAGCCTGTACAAACTGAGGTGGATACACTGCTACTCATAAAGAATTAGGGCATCTGCTCCTCTCAGTTCCTATGAACTGATATGTAATGAGCCTCTGAAGGGACTTTGGCTCTAATTCAGTAGCTCAGGCACAACACTGACTCCCGGACCGGAGCCAGCACCTCATTAATCCTTGCACTATCTCTTCCAGGTGCTGACAGATAAACTATACTTGGACACAGAGCGAGTCTGGCTTTGCTCCACCACATATGAAGGTGAACGGGTGGGCTGTCAGCTCCTGATGCAGGGAGGGTTTGTGTGACAAGTATTGTGCCACTCTCACGATGACCTGGAAAGCTGCCCTTGTAAAATACTCCTTCCCATGATTGTGATTTCAGGCCTGCTTTGCCTGCATGGTGTTCTGACCAACCCTGCAAACTGTCTCTGGCTACACGTTTCCCCCACTTGGCATCGCCTCTAGGCAGCCAAGGTTCTGTGCTCTTTTTGTTGGAGAGCGTGATCCTGGCATGACTGGCTCTGAGCTTCCCTGTTGGCTGTTGCCACCATTCCGCAGCAGCTGGGAAGGGGAAGAAGGAGGCAGAGAGGCTGTCGAAGTGTTTGAGTTGATCATGGTGCCTAACAAGGCAGTTCCCTGTCTCTCCTACCATTTCTGCTTCCCTGAGGAACCGCTCTCAACTCTTCTGATTCTTTCTATACTCACTTCTGCATCTCTAAATAGCTGACTTGCATTGCTTTATTTTTATTTTAAATCCTCTCTATTGACTTCCAGTAACAGAAGAGATGCATTTAACTTTTTCACGGCCTCCTGTGCCCTGCAGTCACACCCATAACTTCATATTCCCTCCATCTGGCCAATACAGTTATGATGATATTTTGGTGCGGTAATTGTTAGTATTTGCACCATAATGACAACATAAAAGCTATTCTTTGCTGAGCCTGGAAGTATGCTTGAATTACTTGTACCTTCTTGAAGACCTTTTTGTCTTCTTTGGAATTAAAAGAATTACCTTGTATATTTTTGGGGTGCCAGTTACTGA
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Task1_train_26150
This variant affects gene CCBE1 (collagen and calcium binding EGF domains 1) located on Chromosome 18. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; not provided
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Task1_train_26151
This variant lies on Chromosome 18 and affects the gene MC4R (melanocortin 4 receptor). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Obesity
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Task1_train_26152
Here is a genetic alteration in MC4R (melanocortin 4 receptor) on Chromosome 18. Based on the data, is it a benign variant or a cause of disease?
Pathogenic; Obesity due to melanocortin 4 receptor deficiency
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Task1_train_26153
This variant affects the gene MC4R (melanocortin 4 receptor) found on Chromosome 18. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; Obesity
CTGTTATATGGCTCGTTCATGAATTATACACACCCTAACACTGTAAACCACTCCAGGAGAAGGTATGAACCTGAAGAAGGAGGAGCCAGGATCTGAGATGGCACTTGGAGGAGAAATAGGATAAACTGGGAAGGGCAGCCACCACAGAAGATGGGGTGTGCTCATAGCTCTCTTTTTCATATCTCTAGTCCCTGGGATTTTTCAGATTCATGAAATGAAAGAATGGACAGGAAACGTAGCAATGAAAAAAACATAACTGTGTCCCTCTACTGCTATAGACTATGATTGTTAGATTAGTGTATATTTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACT
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A variant was discovered in gene MC4R (melanocortin 4 receptor), Chromosome 18. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; MC4R-related disorder
TGTGCTCATAGCTCTCTTTTTCATATCTCTAGTCCCTGGGATTTTTCAGATTCATGAAATGAAAGAATGGACAGGAAACGTAGCAATGAAAAAAACATAACTGTGTCCCTCTACTGCTATAGACTATGATTGTTAGATTAGTGTATATTTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTAT
TGTGCTCATAGCTCTCTTTTTCATATCTCTAGTCCCTGGGATTTTTCAGATTCATGAAATGAAAGAATGGACAGGAAACGTAGCAATGAAAAAAACATAACTGTGTCCCTCTACTGCTATAGACTATGATTGTTAGATTAGTGTATATTTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGACCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTAT
Task1_train_26155
A variant found in Chromosome 18 affects MC4R (melanocortin 4 receptor). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
TGTGCTCATAGCTCTCTTTTTCATATCTCTAGTCCCTGGGATTTTTCAGATTCATGAAATGAAAGAATGGACAGGAAACGTAGCAATGAAAAAAACATAACTGTGTCCCTCTACTGCTATAGACTATGATTGTTAGATTAGTGTATATTTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTAT
TGTGCTCATAGCTCTCTTTTTCATATCTCTAGTCCCTGGGATTTTTCAGATTCATGAAATGAAAGAATGGACAGGAAACGTAGCAATGAAAAAAACATAACTGTGTCCCTCTACTGCTATAGACTATGATTGTTAGATTAGTGTATATTTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGACCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTAT
Task1_train_26156
A genetic alteration is present in MC4R (melanocortin 4 receptor) on Chromosome 18. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
TTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTC
TTAAATCCTCACATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTACGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTC
Task1_train_26157
This variant lies on Chromosome 18 and affects the gene MC4R (melanocortin 4 receptor). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
ATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCT
ATTCACTTTTGCTTCAAAATAGAGGAATTGCAGTGGAATTAAAATTTCAGCTTTAGTACCACTTCTTATGTGTAAACTTTAACTTCACTATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAATCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCT
Task1_train_26158
A change on Chromosome 18 affects gene MC4R (melanocortin 4 receptor). Identify whether the variant is neutral or disease-linked. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
ATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACA
ATTATCCTTTAAGGTAGTGTTTTCAGATGAATGTTGAAAGTGTTTCTTGGGTCTTATAATCAGTGTAAAACATTTAGATTTGAGTTAAGGAGTACCTTTGCATATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGAATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACA
Task1_train_26159
Here is a mutation in MC4R (melanocortin 4 receptor) on Chromosome 18. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
TATGACTTCTGCCCATGAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACAC
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Task1_train_26160
Here’s a variant in MC4R (melanocortin 4 receptor) located on Chromosome 18. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
GAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCC
GAGCATTTGAAGACCCTGTAAATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATCTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCC
Task1_train_26161
The variant affects gene MC4R (melanocortin 4 receptor), which is on Chromosome 18. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
ATCCTAAGATAGTTTACTGGTAATCCTCAACCTAATATATTCTTTTGCTTTATTTTAAATTACACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAAT
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Task1_train_26162
The following genetic variant occurs in MC4R (melanocortin 4 receptor) on Chromosome 18. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Obesity, autosomal dominant
CACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCT
CACACAGATTAGAAAGTACAGTACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTCTTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCT
Task1_train_26163
With a mutation on Chromosome 18 in gene MC4R (melanocortin 4 receptor), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Obesity due to melanocortin 4 receptor deficiency
TACAAATTTTATTGCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCTTACCTTCCTCTTGCCTTATTT
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Task1_train_26164
A variant affecting Chromosome 18, within the gene MC4R (melanocortin 4 receptor), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; BODY MASS INDEX QUANTITATIVE TRAIT LOCUS 20
GCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCTTACCTTCCTCTTGCCTTATTTTTTCTCTTTTTAA
GCTCAGTGGCCAAATCTGTAGGATTATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCAGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCTTACCTTCCTCTTGCCTTATTTTTTCTCTTTTTAA
Task1_train_26165
Gene MC4R (melanocortin 4 receptor), found on Chromosome 18, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; not provided
TATTTTGGAGCAAAACATTTTACTCTTCAAGAAGTGGCTGTGGAAGGCTAGTTTATTGCATGACATCCTCTGGGGTTTGGTAGGTGCCTCCCTTCCTGCTTAAAATGTACCAGCATCACAGATACCTTTATTTTAGTTATTTACAAATATTGCCAGAAAACACTTCTGCTATGAATTTGGTTTTGAAGTTTAAAATCCTTGATAATCAACATTTGTACTCCAGTTCAAAAAATCAGCAATAAGTAAACAGCAAGTCATTTTCATGTGAAATGAGAAAGAATTCGATGTCAGTCCTGTACTTCTCTAGAAACAGGAAGCTAAATCTCTCAGTACAATATTACCTTTTCTGGACACTTCAGCAGACCCTGAATCCTTGTTTAAAGGGGGCATAAATCCCCATTCTCTGTTTTATTAATATTGTTTAGGGATAATTTGGTAACAGGAAATTTAGCTTGACATGGCAACTTAGGTTTTCCAGGACACTTTCATCCCTATAGCTGCCTTTTCCCACCCACCCCAAACCGAATTGCCTGTGTGAAATATCAGGCTGTTTGCTAAGGGAGATGAATCTTTCTGTGTCTGAGAAGTACACATAGTTTTCTAACTCAGCATCTCTCTTTTTTCAGCACCTGTTTTTCTCTCTAGAGGAGCTTCATTTCTACTTCTGCACAGGGAGGATGAACAAACCTTTAATTAAATTACTTGAAATTTCAGTGATGATATTTTTAAAAATGATTATACATCTATTCTTTAAATATTTTCCCTTAACTGCTAGAATGAACTCTCTACATTTCAATGGTGGATAATATAATATAATAAAGCATTTATTAGAATATGTTTAATGAGGCTCTGATTTCTATGTTACGAAAGCACGCAAAGTGTCCAATGCTTATGAATAACACGAAGGAGACATTGTTAAGCTTTTAATAAGGACTTTTCTTTTTGTAAATCCACAGTGCCTACAACCTATAACATAGATTCATATTTTATGGCCAAAAAAGTAGCATGACATTGGAAATAATACAGAGACTGGGCATTTTTTCTCATTAAAAATCATAGGCTTAAATTTACACAATGGATATTCTCAACCAGTACCCTACACGGAAGAGAAAGCTGTTGCAGAAGTACAATATTCAGGTAGGGTAAGAGTGAAAAAGTCTCTTATGCATGTTCCTATATTGCGTGCTCTGTCCCCATTTAATATCTGCTAGACAAGTCACAAAGGCCTCCCAGGGGATAGCAACAGATGATCTCTTTGAAGGTTTTCCTCAGTTCTTGACTCCGGAGTGCATAAATCAGAGGATCGATGATTGAATTACACATGATCAGTATGAGATACAAGTTAAAGTGAGACATGAAGCACACACAATATGGATTCTGAGGACAAGAGATGTAGAATATTAAGTGGAGGAAGAATGGGGCCCAGCAGACAACAAAGACGCCAATCAGGATGGTCAAGGTAATCGCTCCCTTCATATTGGCACCTTGGCGGATGGCACCAGTGCCGGGGAGGACAGCAATCCTCTTAATGTGAAGCCTGGCCATCAGGAACATGTGGACATAGAGAGAAGCCATGAGAGCCAGCATGGTGAAGAACATGGTGATGAGGCAGATGATGACAGCACTACTATCTGAGTAAATGATGAACAAAATGCCTGAAACCGTGCAAGCTGCCCAGATACAACTTATGATGATCCCAACCCGCTTAACTGTCATAATGTTATGGTACTGGAGAGCATAGAAGATAGTAAAGTACCTGTCCACTGCAATTGAAAGCAGGCTGCAAATGGATGCAAGCAAGGAGCTACAGATCACCGAGTCAATGACATTATCAATATTCACTGTGAAACTCTGTGCATCCGTATCTGTACTGTTTAATAGGGTGATGACAATGGTTTCTGATCCATTTGAAACGCTCACCAGCATATCAGCCACAGCCAAGCTGCAGATGAAAAAGTACATGGGTGAATGCAGATTCTTGTTCTTGGCTATTGCCACAATCACTAAGATATTCTCCAACAAGCTGATGACACCCAGAGTCACAAACACCTCAGGAGAGACAAAAAGTTGCTCGTAGCACCCTCCATCAGAGTAGCCTTTTCCAAGGGACTCACTGGCATTGCTGTGCAGTCTGTAACTGCTGCGGTTCCAGAGGTGCAGAGAAGTGTGCATCCCACGGTGGGTGGAGTTCACCATGCTGGCAGGAGAATTCCAGTGTCCCCCTGAATTGATTTAACCTCCTGGGTCAGGGAGTCGTCTCAGTTATTTCCTCCAAGTCTTTATCTGTCTGAAAGTTGTGAGGCTAAAATTGCCATGCCTGCTGTGAGTAAATGTCACAAGTCCAGAGCTTGACATGGAGTTTTTAGTCTCTTTTAGGTACGACTCTAATCATCATCACTTTAAAATCTTGGGCTTCAAAATATTCATTCTCAGTTGAAAGAGTCTGCTCTTTGCTTTCTTGTTCTCACTTCTGCTTTAACTTTAATCTTATGCATTCAAGTCTGTTCAAAATAATTTTCCTTGAAGCTGCCATGCCATTGGGAGACGAATCTGTGCGCACATGCTCACATCGGCTGCCTCTCGGAAGCTTCTGTTTCCAGCCTGAGCGTTGCTTTGAGTGTTAGGGGCTGTAGGCGCCAGCTGCTGATTTTTATGATGTGTGGAGAGAAAAAAAACATGTTCACGGTGGCTCCTCCTCTGCTTCCTTCTGACCAATCCCAATGCAATGGGAGTCTGTGAGACAGGATTATGTTTCAGAGACACAAATTGCAGGGTGACACAGATTCAGATGCAGAAGCTCCTGAAGTCTGAAGTCGAGAAGCAAGCCGGATAAGAGACTGAATTTCCCTTTTTAAGTTTTCAAGGGAAACAACTTGATCCCTAGAGGCCATTCTGTGATATCAAAACAAGCTATCTTCAGGCAGCCAGGTTCATTCTTATGTAAAAGACATCATGTGTGTGTGTAAAATGAAATGGAAAGTATACTGTCTTATGTTCCTGAAACAGATACTCTGCTTTTTGGCTAGGATACTGAATTTATTTACCTTCTTAATTTTTTGTTTTTATTAAGAACCCAGCCAGTAGTGGTTCAGTTAAAATACCTGAAAAACAGAGAGGATATTTAATGATACAGATAGACATGGTATGGCTGGAAGAACTATGTAGGTAGCTATAAATTATGAATGGGTTCAAAAGGGGTTGATTTTAATGCACTAATATCCCATATTTCTCTATTGAGGAGTTTGTGTTATAGCTGAAAAAAGGTGCTTTTTATTTACAATATTTTAAACTCATACGGCATTAATGTAACTATGCTTACACTGAACTCAGGAAAATAATAAGCTGCATTCTGTTTTTTTTTTTTAAGCAACTTTTTTTTAAACCTCCAGAGTTTAACGTATCGTAAGTTGAACCGACAAATACCTAGTAACTTTACTTATCAAGCCAAGACTGGTGATACTAGTTAGTTATTGAAGTTTCTGAATATTTTGCTTAAGGTGGTTTGAAAGATGGCAGCAAAGTTACTTTCCAAATTAACTGAACAACAGATTATACAAAATTTTGTATATTCTTTTCTTCTATGATTATTTTTGGTTTTAGTGCTCTATAGTTTGTAGCTGCTTATTTCAGGGTTAATTCTGAATCTCAGTTACTTAGGTTGGGAATGTATCCTCTTTCCTTTTGTGACAGAGACAATACTAAGTATTGTTCCTGAGCATTGAGATAAATTAACGTCTTCCATCCACCTTTGGAATTGGGTAGGACCTTATGACTAAATTCTAGCTAATGGCATGTTGACAGTGGGGCTCATCGCATTAGCTCTTTCATAATTTTACACAAGTTTTCTCTCCTGTCTTTGAAATCTCATGTTACAGGTGGCAGGACCATATCATGAAAGGAGCCTGTCTCTTGAATGATTGCACAGAGCAGAACTCACACCTCCAACTCCCTTCCCCTGTATTTCTGAATGCCTAATCATCTGTATATTGTAAAATGCTGGAATGGGCTTTCCTGAACATCATGAGCTGGAAATAATCTTACCTTCCTCTTGCCTTATTTTTTCTCTTTTTAAAAATTGACATATAATTCACATACC
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Task1_train_26166
The gene PIGN (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N) on Chromosome 18 contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 1
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Task1_train_26167
Gene PIGN (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N), found on Chromosome 18, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 1
TATTTAGGTCTATTGAAGAGAAATAAATATAGCAGCACAGTAAGGAATTTAGGTAAGATATGCAGAAGAATTTTCAAACAATTTGAGTGGTTAAACATGGGAAAGCTGGCAAGGTGAATAGAGTTTCCTCCCATGGAGATCTTTACATTCAATTTAGAATAGCAGAAAATTTAATTTTTACATGACATTTTAGTGTGGACATGATTAAAGCAAAGAGGGCTAACACAGTAGCTTTGAGACATTTTTGTTTTGGCAACAGAATGTTTTTTCACATGAAACTAAAACTTTTACTGATTCCTCCAAGCATAAAAGAAAGAAAACCTTCTAGACTTAAACAAAAAAAAATGGGCGGGATTTTAAGTTATCAGTGGCACAATTTCATTATGAAAGCCCGAAAGCACCTACTAGGAGGTTTAATGACTCTTAGAACCTAGGCCAAAATCATGACTAATGGTTTGATATTGGTATTTTAAATTCCCGTTAGTTCACATGATTTTATATTCTTGACCAAGATTAGGTTCAAATTTTACAGTGTTAATTGAGGAAAAAAAAGTGTATTGAAAATAGAATAAAATACAATATTATTCATACACTAGAGAGATGTCTGGCTTTCGACCTACAACCGGCATCAGTGGGAACACTGCCAGGAGCAAAGAGAAGAAAGTCCAACTCAGTGAGGTCATCTAAAATCAAGAAAAAAGTTATCTTTAGACAAATATGGTATAGAAAACTATCATTAGTGTTTCACAGACTATATGACTGTGAAGGTAAAAGGAAAATGCAAAGCCTTACAGCTGTTTATTATTTTATTTTTCAAATACTTTCTAGCAGAATCAACAGCTAACTACTTTAAAAAGTAATAGTTACTATTTGTGAAGGACCTGTTGCATAGCAGGTATAGTATTAGGTATAATATGAGCACTTTCTCATTTAATTCTCACAATAACCTCAAGAGGCAGGTATTATCATTCCCAATACATCAGATGATGAAACAGAGCTCAGAGAAGTTAAAATATAAGTAGTACCAGGTCCATGACAAGTAAATAAAATAACCAGTATTTAAACCTGCATAAAGTGCTTCATTCAATTTAGGTTAGACCATATATTGATGAAGACATCTATAAAAAAGGTGGCCTACAATAATCACCAAACAACTGAGCCCAGAAGGAAAATAAGTAAAACTACTTTTGTAATTAGATTAAGATCCCTCACAAATTAAAAGATCGATAATCCCATTCATTGAAGATTTTTTAATAAATTCTCAGAGTAGAAAGAAGATATCTTCCTGCTACTTCTATCAAAAAGTATCAAAGTGGAAATATAAGTGCATTCTTTGTAGAAGCACATTGTAATTCCCTATGTAGCTGAAGGAAGAAAATCAAGACTGACTATATTTTTAATAATCTATAATAAATACATACTTATCCAGAAAAAAAAAAAACTGAGTGGCTCAGGGTAACGAGGGAGGTGTTTCCTGTGACTCACAGAGTGCAGACCCCTAAGCCACTGGGCTGTGCTGCTCTGGACGACTCCTTGCCTGGTCCATTATCAAGATATTTGAAGCTAAACAAATCCAGGAAATGCTTCAGAGATGGACATATCAGTACAACTTATATAGCATTTCAATTACCACATAACTGGCCCATTTTGATGTGAAAGTCTAAGTGAATTACTGAAACCTTACAGGTAATGTCAGTCCTCCTATCAATATGACTAGGCTCTTTTATGTAAGAACACATTCTACCCTTTTCTTTAAAAATAAACAGTTCCTTGAGTTACACATGTGTCAAAACAAAGTAGTTACTAATCTGTCCTATGTCAAAATGAGTACTCATACCTTTGCTCGAGTCCACAGCCGAGTGAGAAATGGCCAAGCTGCAAAGGCAGTAAGTCCAGCGGTAAGCATATAGCGGTAGAAAAAACTGAGAACCTAGTAATGCATTCCAAAGAAGGAATGAAAAATAAGGTCATTTAATACTAGTTACAAATATATAAAAGAAATTTGCAAATGTTGTAATCTGGTAAGTTACTTACTAATACTTCAATTCCCAGGGTAAAGGCTAACAGGTACCCAACAAAATGGCTCAGAGGATAGGTCAACACTGATACAACAAGGTCCTGAATAACTTGAAATCTGTTTCAAATAAAAAGACTGATTGAATTTTAAAGTTAGGTCATACATAGTATAACAATACAAACTTTGCACAAAGCTAAAACACTACATAATTTTCCATTTATAGATTATTCAAAAACTAAAATAAGCTCTAACGGATTTGTTTCAAGGGCTTTATTTACCTATTTTTTTTTAATCTAGAAGTATTTTAGGGAAAATGTAATTTCTGAATTAATTTGAAAACGATCAGCCAGGTGCAGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAAGAGGGCGGATCACCTGAGGTCACAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTCAGCTGAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCCGGACAACAAGAGCGAAACGCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAATGATCACAAAAGTTTGCTTGGTTTTTATAAGCATTAATGACAATAAATGAATCTTGTTTGATCTTAGTTTAAACACGGATTCATACAATTACAGATACAACATCAATATAAAACACAATGAATCCAAATGCATATAAACTGAAAAATTTTTTAAAATTCACCCAAGTAATCCTATATTTAAATCTTAATGAAATAAAGGTAGGGTTTCCTAATCTAGTTAGAGAAAAATCTTAATTACATTTTCTAACTGAGCTAAATAACCTTTTCCAAACCCAATTTAAGATGTCACTAATTGTACACTAACGGTAATCAAGTGAACTCATAACCATCAAAAATGTATTACATACTTGAGTACTTTTTACATTTCATCACTAGGAAAAAAAGTTAACATTTGTAGTGCATTATTAAGTAGGTAATTTTAGAAGGTCAGTATCATTTGGTTTATGACCTTTCTCTGACTGAAAGCAACAGCTGCAGAATTTCATCAAAATGAGGAAGGTGCCATGTAGGAAAGAAAAGCTAACACCAGTCAAAAGGGGAATGTTTCTTTTATTCTTAACAATGAATAAGCACAGAGGATCAACAGATGATTTTGTAAAATCATTTAGAAGACTGTGAATTTTTATGTCTTTTTCCTATACAATCTATCAAAAAGATAAAGATAGGACACAACATACTTTCAAAATCATGTTTTCCCTTAAAATTTAAATATATATGTTTTCTTCATAATTAGGACATTTAATAATTCAGGAGGGGTTCTGTACTAGATACAATTTTCTGCAAAGACAAAACCTTTTGTTCTAAAAGTTTAAAAACCAGACTAAATGACATTTTTAAAAATCTGAGTTAAATATGCGTATGCAACAACCCTATTCCTTTCAAATGGAGAGGTAACAATATGTTATTTGATCAGTGTCTTTTTGCCTTATAGTTAATATTTTAAGCATTTTAATATTAATATTAATTTTTGATATTTTTAAGTTAATTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGTGCATACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAAACATTTTGCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCCTTGCACCCAGCCAACTCCGAAATATTTTTAATACATCATGTTTTAAAAGAAGGAAGAAGCAGTCAAAGCTAAAGTTAAGAAAAATTAGAATAAAATTATGCATAGTGTCACGATGCACATGTTAAGCCAACCTTGGGGATACCCTTATTATAATAGGCTCTCATTCTTTCAT
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Task1_train_26168
Here is a mutation in PIGN (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N) on Chromosome 18. Determine whether it’s benign or pathogenic. If the latter, what disease does it cause?
Pathogenic; Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 1
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Task1_train_26169
This gene mutation involves PIGN (phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 1
GAGACACGGCAAGAACCTGTCTCTAAGGAAACTGGCGGGGGGGGGGGGGCAGGGTGGAGAAAGGAGCCCAGTCCTACCTCCTCTTTTATCATATCACCCTAATTTTCTTCATAAAATTATCATAATGTGTAAGTTTTGTTTATAGTTGCTTTAATTCTCCTACTAGAATGTTAAGTTCTGAGAAAGCAGGGGCTATCTCAAAGATATGTAGTAGATGAAAAAAAGAGTCCACTAGCTTCTTTTTCTTTCATGCTTAAATAAATCTGGAAATAATCATGGCAGTGTACTGGTTACACTGTTCTGGCCTTTTGTCAATGTCTCCCCTGTGGACCTATGATGTGGCATGATGCTCTCCATTAGCACTTACAAATATATAAGAAATCGCCCTCTGAAAAATGCACCATTACTTACTGAAGACATGCTGTTGAGTGCATTATTCACTGTGCTCTTCTGTCTTCATTAGGGCCTGGGGTTGAAATAGCTCAGTACTACCTCTTGCTTTTTATCTAATAGAAATATCTTGTAGGTAGGGTGATTTTATAACTGACAGCATGTACTTTGTTTGGGTTGAAAAATCTCAAAAACTGATTATTTACCTCTATGAAACCTTAAATTTCCTCTTTTTTAATTTTTATTTACTCTACCTCACATTCAAATTAATAAATTAATAAAAGAACATCAAAAGTTCAGTTTATCAGTTTAGACATTCAGAAAGTCTAGTTATTAGCAGTGGTGTGCTGGGAAGGGTTCAACAAATGGCTCTGTGAGAAGAGAGAAGCCAACAACCCCTTGTAGTGTTTGTATAGAAATAGTAATGGCACAAATGTCAAAATGAGGGATTTACAACTAAAATTTGAAGAGTGATTTCTTAAAAATTTAAACTTTGTTCTTATTTTAAGAGGTTGTATTTATAAACCAGTAAAGAAATGCTTGTACCTTTCAAAAATGCATCATCAAATTGCTGAGCTGATACTCTTTGGGGATACTTGATTCCAGCTCCCCAAGTGACTAAAGGAGTTAAAGTCTCTGAAGGATGACCAGCCCCATGGGAACCTACAAATAAGATATAAAGAATAATAAGACAAATATAGAAGAACTAACTTACAACTAAATATTTTTTAAAATAGTTTGTTTTAAAGAGTTGATCCATATATAGTTAATTCTAGTGACTACATTACCAAATGGTTACAACCTTTTATGGCAATTAGTTTGACAATATTCCTATAAAGCAAGTTAGAGAAACAACAACAAACAGGCATAAAGTAAAACAAAAAACCAGACTGCCTGCTGAGTAACTATGGTTGAAAGAATAGAAATAATAACAATAAGACATGGAAGAAATGTTGCTGCTGCCAGAGCAGCACTGCAGACAGAAAGAACAGAGAGCTCCCTTGGGCAGTAACCACCCAAGCTTGGGGCAAGCAGTAGAGACTAAGTCTTTCTGGAGAAGATGGCAAGGTCTCTGGGTCCTTTTCTTCCAGGCCACTCTGGCAGGTAGAGCCAAAAGAAGTCCTTTATAAAGTGGAACTCAAATCACTAGAAATCCATATTGTGATTTGGGGACAAATCTCATCTTTGCTTTATTTTGTTCTCTGTGCACACATTGCATTTGCCTTGGGAATCTCACAGGGCGCACAGGCTTACCCGGGACAGAATTTCAGCAGCCCTCGGTCCCTCAGTAACACCATCTTAACGTCACTCCCTTTGCCATCATATACAGTTAATTCTCTGTAGATAAATAATAGCTACTTTTTATTTTCTTCTCCACTTTTCTCTAGTTTGTCATTTGTAAATGAGAATATATTCGTTTTTTAGTTAGAGAAAATATTTTTTTATAAGATCAGTTGTTTTTTAGGCTAACATTTTAAGCACAGAATTATGTGCTAGACATTTTGTATACAGCAAGACATCTAATCCTCTCAACATCATAAAATATTTACCAGCTACATTTATCACTACTTTAATTGTAAGGTACATATCAATTAAAGACACACTAACCCCAGTCTGTCATTCCATGGTCAGAGGTAAAGATAAATGTTGTTTTCCCATCATTTCCATAGAAGTGGTTAAACATAGACACGATTTCTTTAACTCCATCATCAACTTTTTTAATATTGTGCTTGTAGTCTCTATTTGTAAAGAAACAGAGGAACAAATTAAATTAATTTGGAGAAATCAAATTTATTCAACGTGGATTCATTACATTCAAAATCAGTAACTTCTGAAATGCTTTTAGATTTCATCTTTAATATTTTAAAATCAGAGTACTCTAGATTGTTAAAATAATTTTTTCTCCTTTTAATGAAGCTAAATAACCTGAAATAGTTTTCAAAGATGGCTTAAAAGGAGGGGAATGATTAACAAATATATTTTAATAAACCCTTTTTAGGTCCTAAATGAGATAGATGACGTTCATGTCTCTCACTCTTACTACATAAACTAAACTGTTTGGCCACATTACAAGTATCATTTCAAGTATAGAATATTTTCATTCCCTAAAGTGCTTTTGATATAAAATATAATATCATGTTTTGAACACATTATATTTAAGACTGCCACACAACTGAACAAGGTTCATTCGATATGAATATTCCATCAATTACAGCAGTGCATCACGTTTAAGAAGGGGATTGTGAGGTATTCATCACTGGCAGCTAACCCAATAGGCTTTACAGCCACTGTTAGGCTAATTTAAACCAAATGCAAAGTCAGAAATAAGAGTATAACATGGTATCTTCCTTTTACTTATGGTCCTCAAAAGTGAGAAAAATACTTGCTGTCATATATAAGGAGTGTTATTGAATTATGGTATACAAAAATGTATACAATTTATTTGCTAGATACAATACTAATTAAAGGGAATACACAAGGAATAAATAATTACATCTTTTGGTGATATAAAAGTTAATACCATAAAATGCTTTATATTTTCAAGATTCACTGAAAATATTTCTAAAATATATAGATATTTTAGATAATTTTTTTCTCTGCTTCAGTAAATGAAGATTATGTAATATGTACAGGATATATTTTACTTATATTAATGTGCCATCTGGATACAGCACATATGATTTAAACGACTATATTGGAAATCTCATATAATTGAGAACTTAATAAACATTACAGTAGTTGTTTAAAATATTAGCTCTGTTGTTATAATTCCAAAGAAAACTTTATAATAAAAAGTTCAATAGAATAGCTGTTGCCCTAAAAAATACAATTAAACACAATATTAAATTACCTCGAGGATGGTCGATGAGCATGTCCGTTTGTATCTATTCCTAATAAATGTAAGAAAAAAACTATTTTCTCTTCATTTATTTTAGAAAACAAAGACTGGTTGTTTCTGGCATGATGAAAGAAGTCCTACATATAACAAATGAGTTAAAAATATTTAGTTCATTTGTTTTATTTTAAAAATAATACTGATGAAAACATTTAAATTTATGCATAAGTACAAAATTAAATTATCTCACGTTGTTTAAATCTGTGCTCAAGACCTACCAACACAACGTCTTTGCTATCAGTTCAGACATCTATGTTCAAATAATGAGTTAGCTGTTTTCTCTGTTATAATAAGGCCAAAAAAAGATGTTAGAAAGGGGATCATAATTTCATAGAGATCTCATAATGTTGTTAATCCCACATCTAACTTAATAAAATACAGCAGATTGAAGACATATTTTGGCAAGAGTCAAAAATAATATAGTAATACTGTTACCAGTTTAAGAATAATTTATTTTTTTAAATATTTCAGAACTGGACCACTTTTCATTGTCCTGTGTACTATCAACCTAGTCCAACCGTAATCTCTAATGTAGAACATTGCAAATAGCCTCCTAATTACTTCCTTTGCCCCAGCTAGAATGTGTTCTTCAAATCATGTAACAGAAAAGCAACCAATTAATAAAATATTACTTGGCAGGGTGAGGCTGGGAATAATTAATTAAAATAAAATTTGAAGATTATTATGCTAATTAAATAATGATAAACTAGATTCATAAACCCTTCTAAGGCAAATGATTCACCCTGTATTCACATATGCATGAACATGGGTGCAAAACTATGAAGACTACTTTTAAATTATTTTAAATAA
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A mutation in TNFRSF11A (TNF receptor superfamily member 11a), located on Chromosome 18, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Autosomal recessive osteopetrosis 7
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Task1_train_26171
Here is a variant affecting TNFRSF11A (TNF receptor superfamily member 11a) on Chromosome 18. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; Autosomal recessive osteopetrosis 7
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This gene mutation involves TNFRSF11A (TNF receptor superfamily member 11a) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Autosomal recessive osteopetrosis 7
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Task1_train_26173
A mutation found in TNFRSF11A (TNF receptor superfamily member 11a) on Chromosome 18 may be clinically relevant. Is it pathogenic or benign, and if the former, which disease is implicated?
Pathogenic; Autosomal recessive osteopetrosis 7
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Task1_train_26174
The gene KDSR (3-ketodihydrosphingosine reductase), on Chromosome 18, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Erythrokeratodermia variabilis et progressiva 4
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This mutation occurs in SERPINB8 (serpin family B member 8) on Chromosome 18. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Peeling skin syndrome 5
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Given this context: Chromosome 18, gene RTTN (rotatin) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_26177
This alteration occurs within gene RTTN (rotatin) located on Chromosome 18. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; MICROCEPHALY, SHORT STATURE, AND POLYMICROGYRIA WITH SEIZURES
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This gene mutation involves ZNF407 (zinc finger protein 407) on Chromosome 18. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; Short stature, impaired intellectual development, microcephaly, hypotonia, and ocular anomalies
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Task1_train_26179
Gene HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2) on Chromosome 19 is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Febrile seizures, familial, 2
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This alteration in HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2) on Chromosome 19 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
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Task1_train_26181
This gene mutation involves HCN2, LOC129391015 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2| MPRA-validated peak3211 silencer) on Chromosome 19. Is it associated with any clinical condition, or is it benign?
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
CGCAGGCCCTGAACCGACAGGACCTTTTCTGCCAGAGCTTCCCAGGGAGAGTTTTGGGATCCACCTTGGGGACTTGGACTCTGGCCGGGTGTATCTGGGAGTGGAAACGCCCTCTGGTCTCTTGTCCACGGGTATTTATCATACGGAACGTCCGAATGGTGCCAAGTCCGGCTCGGCCGTTCCTCCCACCCTCTCGGCCTCCCCTGTGGCGCCAGCCCCGTCTCTGCTTGGCTTCCCTCCCTCCTGTGTGGACGCCCCACTTCCTCCCCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTTCCTCCTCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTTCCTCCTCTCCTGCGTGGACGCCCCACTCCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTTCCTCCTCTCTCCTCCTGCGTGGACGCCCCACTTCCTCTGGAAATGCAGCCGGTGCTGCCCTGGTTCAGTCTTCCTGTGGCCCCTGTGGAGGCTCCCGCTTCTCAGTAAGGCATCTGGGGCCCTCACCTCCCGGCGTGAGCTGAGCACGGTTCATTTCCCACCCTGGCTTCCCGCCTTCGCTCTCCCTGTGCGCGCCGCCCTGCCTCGCCCTGCTGCTTCCCAGTGCCCCTCTGCACCCCGGCTCCTCTCTGCTCCTCTGCTGTCCTGTCCTGTCTATTTTTTTAACGCCAACCTTGTGCCAGGCACATTGTCCCTCTCTGGTCATGTGAAGCACTTAATCTATTTTGAGCCACCTCTTGGGCCTTGTGAGGTCTCCTGCATCTTCAAGGACACGGGGTCAAAGTTGGGCCTGAGGAAGGGACCTGGGCTAGGGCAGCGCAGTGGGCGTTGGGCTCCCTCGGGGCTGGGTGGCCTTCCTGGGGTGGGAGCCTGGTCCCGAGGGAGGAGTGCCCAGGGCTTGTCCTGCAGGCGCCTGGGGGGAAGGCACCGGCCTGAGCTGTGGGCACCCTCGTCCCCCAGGGAGGAATGCCCGGGGCTGGTCCTGCAGGCGCCTGGGGGGAAGGCACCGGCCTGAGGTGTGGGCACCCTCGCCCCCCAGGGAGGAATGCCCGGGGCTGGTCCCATAGGTGCCTGGGGGAAGGCACCAGCTTGAGGTGTGGGTGCCCCTCGTCCCACAGGGAAGAGGGCCCGGGGCTGGTCCCATAGGTGCCTGGGGGAATGCACCAGCCTGAGCTGTGGGCACCCTCGCCCCCCAGGGAGGAATGCCCGGGGCTGGTCCCATAGGTGCCTGGGGGGAAGGCACCAGCCTGAGGTGTGGGCACCCTCGCCCCCCAGGGAGGAATGCCCGGGGCTGGTCCCATAGGTGCCTGGGGGAAGGCACCAGCCTGAGGTGTGGGTGCCCCTCGTCCCACAGGGAAGAGGGCCCGGGGCTGGTCCCGCAGGCTCCTCGGAGGAGGCACTGGCTCGAGGTGTGGGCGCCCCTCGTCCCCCAAGGAAGAGTGCCCGGGGCTGGTCCCGCAGGTGCCCCGGGGAGGCACCGGCCTGAGGTGTGGGCACCCTCGCCCCCAGGTTCTACTGGGACTTCACCATGCTGCTGTTCATGGTGGGAAACCTCATCATCATCCCAGTGGGCATCACCTTCTTCAAGGATGAGACCACTGCCCCGTGGATCGTGTTCAACGTGGTCTCGGACACCTTCTTCCTCATGGACCTGGTGTTGAACTTCCGCACCGGCATTGTGATCGAGGACAACACGGAGATCATCCTGGACCCCGAGAAGATCAAGAAGAAGTATCTGCGCACGTGGTTCGTGGTGGACTTCGTGTCCTCCATCCCCGTGGACTACATCTTCCTTATCGTGGAGAAGGGCATTGACTCCGAGGTCTACAAGACGGCACGCGCCCTGCGCATCGTGCGCTTCACCAAGATCCTCAGCCTCCTGCGGCTGCTGCGCCTCTCACGCCTGATCCGCTACATCCATCAGTGGGAGGAGGTGAGGTGGGGCGGGGGCGGGGCCAAGGCAGCAGGGGCGGGGCTATAATGGTGCATGGGCGGGGCCAAGGCAGCAGGGGCGGGGCTATAATGGTGCATGGGTGGGGCCAAGGCAGCAGGGGTGGGGCTATGAGAGATCTGGGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGGTGGGGCTATGGGAGATCTGGGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGATGGGGCTATGAGAGATCTGAGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGATGGGGCTATGAGAGATCTGGGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGGTGGGGCTATGGGAGATCTGGGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGATGGGGCTATGAGAGATCTGGGTGGGGTCAAGGCCCCAGGGGTGGGGCTATGAGGGTGCAGGGGTGGAGCTACAATGGTGCAGTGGTAGAGCCAAGACAGCAGGGGTGGGGCTATCAGGTTGCTGAGCAGGGTCGAGGCAGCAGGGGCAGGGCTATGATGCTGCTGGGGTGGAGTCAAGCAGCAGGGGTGGGGCCGTGATATCTGGGTGGGGTCAAGGAGCAGGGGCAGGGCTGTGAGGGTGCTGGGCGGGGTCAAGGCATCAGGGGCGGGGCTATGAGGGTTGTGCTGAGCGGGGTCAGACATCCGAGTGGAGATATGAGGGTTGTGCTGGGCGGGGTCAGGCAGCAAGGGCGGGACTATGAGGGTTGTGCTGGGCGGGGTCAGGCAGCAGGGGCGGGGCAATGCGGGTTTTGCTGGGGCAGGGCCAGACATCAGGGGTGGGGATATGAGGGTTGTGCTGGGGCGGTGTCAGACATCAGGGGTGGGGAGCTGTGGATTTGGGGGGTGTCCTAGGGCGGGGGCTGTGGATTTGGGGGGGTCCTGCAGTGAAGGCTGTAGAGGTGGGCGGGGTCCTGGGGTGGGGGCTGTGGGTTTGGAGGGCGGGGGTCCCGGGGCAGGGCTGCAGGGTGGGGCGGGGGTCCTGTGCGGGGCCTTGGATTTGGGGGAGGGGGCCAGGAGCTCCCGCAGTGGGGGCGCACGGGGCTGGGGCTCTGAAGGTGGGGGCCGGGGGTCAGCGGGTAGGGTGGGCTCACGGCGCCTTCCTGCAGATCTTCCACATGACCTATGACCTGGCCAGCGCGGTGATGAGGATCTGCAATCTCATCAGCATGATGCTGCTGCTCTGCCACTGGGACGGCTGCCTGCAGTTCCTGGTGCCTATGCTGCAGGACTTCCCGCGCAACTGCTGGGTGTCCATCAATGGCATGGTGGTGAGCGCCGCGGGCCCTGACGGAGGGGGAGACGCAGGCTCCCATACAGAGGGGGGACCCAGGCCCCCTTATCCCGCTTACAGAGGGTTGAACCCAAGCCTTTCAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTTCAGAGGCGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTTCAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTTCAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGGAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGTGGGGACCCAGGCGCCCCCTTATGGAGGGAAGGACTCGGGCCCTTACAGAGGCGGGGACCCAGGCCGCCTTACAGAGGGAGAGACACAGGCCCTTCAGGGGTGGGGACAAGACCCCCTTACACGGGAGGACTCAGGCCTCTTTACAGAGGGGGACCCAGGACTGCAGCCCCGGCACTGGCCC
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Task1_train_26182
Given this context: Chromosome 19, gene HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
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Task1_train_26183
An alteration has been detected in HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2) on Chromosome 19. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
CTGGCCCCTTAATGTCCCTGGGGGTCTGAAACAGCCACTTGGAACCTTTCAGGCCTGGGATCATCCGTGGAGAGAAGCTGAGTGTGGTTATGATGAGTCCTGTCACCCAGACATCTGCTTAGCGCGTTTTCCAATGGATTTCCCTTTTAATTAACCCACATTAATTATTATTATTTTATTTACTTATTTTTTTTTGAGACTGAGTTTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTTACCACAAACCCCACCTCCCAGGGTTCAAGGGATTCTCTCGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACACCTGGATAATTTTCGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTCTCGCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTGGTTGGATCCCTTGAGCCCAGAAGTTGAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCACAGAGCAAGACCTGATCTCTAACAACTAAAGAAAAATTTACAACATGGCCCTGAATTGGGAAAGTGGTATCACCATGCCAAAGAAATAATAAATGGGCCAGGCATGGCTGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGCTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGCGCACCTGTAATTCCAGCTACTGTAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGCAGAGGTTGCAGCGAGCTGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCCAGACTTTGTCTCAAAAAAAATAAATAAAAATAAGTAAAAGCAAAAGGAAGAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGGCTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAACTAGCTTGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCCAAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGCGGAGGCTGCCGTGAGCCAAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAGAGCGAAACTCCGTCAAAAAAGAAGGAATAATAAATGAAGTTAGGTCCCAGATACTCCTTGCTTCCTAGCTGAGATGTGCTGACTGTTAAGAAGGGTTAGTTATGGGAGCCCTCGGCCGCTACAGTCAGGTTAGTGGCCAGTGAGCCTTTGTCCCTGCCTGGGGAGTGCTGTGCCCCAGCGTCCAGCCACATATGGGACTTGGGATGTGTTTGGTTTGGACACAGAGCAGGTGGGCATTGATGGGGTCAGGAGCTACAGAGGGAAGACCCGCCAGTGCCCCTCCCCAGAGCCTGGCACAGCTGCCCAGGCTGAGGCAGCCCATTGTCTGGCTGCCACCCGCACATGCGGTCCCATTTCCTGAACAGAGCCCCGCGGCTCCCCTTTCCCGGCCGGGTCAGCTGAGGACTTGGTGCGGCAGGACCTCCTGGGCCGGCCTGGTGTCTCTGCCCGCCCTGCCCCTCTGCTCTGGCCCAGATGCTCCCTGGAACTTTTGCCCCCTCTTGACCTCACAGATGCTCTGATCTCAGAGGCTGCAAAAGGCGGGACCCAGACTCTCGCCCTTGGGGTCTCAGTTTCCCCAGGAGTGAAGCGGGCAGGTAGAATCAGCCCTGGCCCTCCTGCCAACTCACTGTGACAAGTGTGCAAACCATGTCATCTACCTGGGTCTCCATTTCTCTTGGTTACCTCTGAACATGGGGAGCTCACCACCTCCAGTGCTTGGCAGAGGGTGGGCGCTGGGCCCTTGAGGACCGAGGGCTCCTGGGGCGTGAGCACCTGCCCACCACCGCCCCTCCTGCTGGCCTTGCAGAACCACTCGTGGAGTGAACTGTACTCCTTCGCACTCTTCAAGGCCATGAGCCACATGCTGTGCATCGGGTACGGCCGGCAGGCGCCCGAGAGCATGACGGACATCTGGCTGACCATGCTCAGCATGATTGTGGGTGCCACCTGCTACGCCATGTTCATCGGCCACGCCACTGCCCTCATCCAGTCGCTGGACTCCTCGCGGCGCCAGTACCAGGAGAAGGTCTGAGGGAGGCGGGCCCCGGCCTGGGTTCTGATGGGGGAGGCGGGCCTGGATCTGGGGTCTGAGAGAGAGTCAGGCCAGGCCCTGGGGTCTGATGGAGGGAGGCAGGCCCGGTCCTGGGGTCTGAGGCTGGAGGGAGGCCTTGCCCTGGGGTCTGAGGGCGGAGGTAGTCCTTGTCCCGGGGTCTGAGGGGAGGGGCGGGCCCGGCCCCGGGGTCTGAGGGGAGAGGCAGTCTCAGCCCTTCACTCAGCTTCAAGTGGCGCGCTCAGGGCAGAGACCGCGTGATGGGGAGCAGGGGACCCTGGGGGTCTGTGGCTGTGATTAGGAGGAGAAACGGCCGGTGGTGAGAGGTTCTCTGACCCTGTGACAGGGAGGGAGGTCCAGAGCCTGGAGATGGACGTGGGGCGGGGGCTGGGGAGGGGATGCAGGCTGGGCAGGAAGGGGTGAGTTGGGATCAGGGCAGGACAGGGTCAGTCTTTGGACATCGGGAAGCCCCCGGGCTGAAGGGGCATTGCCAGGAGGCTGGGCCCACCTGGGGGTCTCTAGGCCGGCTCAGGATGGGGCTGGGTTAGGGAAGGGCCTGGCGGGGTCTGAGAGGCCTGGGGTTGCTTCAGGACACGCCGGTGGCCGGCAGTCAGGGCCAGGCTTCAGGGAGAGCAAGGCTGCCCCACTGCTCAGATGCGGCCTCTGGCCTGCAGCGTCCATTGGGTTAATCCTAGGCTTGGCAGTGGAGGGGACACGGGGGAGCTGGGAGGGGTGGAGGGAGATTAGGATTGGCCCCATTGGCAGCCCCTGGAGTTGGGCCTCATGCACCACTCTGTGCCTCAGTTTCCCCATGTTAGGCGGCTGGCTGGTCCTGGCTGGGAGCCAAGTGCCCCCCTCTCCCGCGCCCCGAGCAGTGGCTGGCTGGGTCAGCTGGGCCCCGTGCCAGGCGCCCTGCTGTCCGGAAGCCACGGGCCTCACACCCAAACATAAGCTGGTGCCACCACCCGCCCGCCGTCACGGGTTCCGCTGAGCTCAGGGCAGCTGCGGCCGGGCGGGGCTGGGGCGGAAGTGAGGCTGGAGCTGCCGGGGGGCACCGTCCTGGGGACAGCAGGGCCTGGCACCCCCGCCCAGCACCCACGCTCCCTTCCCTGCTCAGGAGGGGCTGACCCGATGGTTTCTGGAAAGATCATCAGGGAAGGGCCAGAGCCCCCGGGAAGGGGGTCCTGTGTGTCAGGGTACCTGGGGCCTCTCCTCGTAGAGTCAGGTGCCCACCCATTCCTCAGGGATAGGGTTGCTAGATAAAGTTCAGGGCACCCGGCCTGGTGCAGTGGCTCCTGCCTGTAATCCCGGCACTCTGGGAGGCCGAGACAGGCCGATCGCCTGAGGTCAGGAGTTTAAGACCAGCCTGAGCAACACGGCGAGACCTCATCGCTACAAAAAATTAAAAAATTAGCAGGGCAGGGTGGTGCACACCTGTAATCCCCACTACTCAGGAGGCCGAGGTGGGAGGATCCCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGTGCAATATGGCGAGACCTCATCTCCACAAAAAATAAAAGAATCAGCCAGGCGTGGTGGCGCACACCTGCAGTCCCTGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCATAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCTGTGATTGCACCACTGCACTCCAGCGTGGGCCACAGAGCGAGACAGTGTCTCAGAAAAAAAAAATGGAATTTATCATTGAAACGAATTCAACTTTGATTTAAATAGAAGCATGTTTATTTGCTCTTGTTGAATCTGGCCGCCCCTGTGTGTGGCGGAGGCCTGTCTCCCCG
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Task1_train_26184
This variant affects gene HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2) located on Chromosome 19. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
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Task1_train_26185
Assess the clinical impact of this variant on gene HCN2 (hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2), found on Chromosome 19. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; HCN2 related developmental and epileptic encephalopathy
ACATCAGCAAGGCCGTGTGTGAGCCAGGCAGGGTGTCCCCGGTGTAGCACCTGGCTCGGGCAGAGGCCCCGAGGAGGGGCTGGAGGAGCTGGGCGAGGAGGCGGGCAGGACGGGCCTGACACTAGGGACCTCGGGCCCCGGGAATGCCTCTGGGGGGGCGTGTACACCCGTTGCTCCCAGGAGGCACACACTGCGGTTCGCTTCGCCAAGAATGTTTAATTGCATTTGATGACTACGGTTTCCATTCATTCATTTGTAGAGATATAACACTCAGACCACAAAATGCATAAAATGCGGTGGCTTTTAGTATTAACAGAGTGCTGCACCCGATACCACAGCCTCACTCCAGAACATTCTCATGGGCCCAAAAGGAGACCTGGGGTGTTAGTCACCAGCTCACTCCCCGTCCCCAGCCCCTGGCAACCCACGCTACTTAGTCATTATTTAGGTGTTTAGGAGTTGCAAAGTCAAATCTTTAAACCCACATATGGCCAGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTCAGAGGCCGAGACGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAGCCCCGTCTCCACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGCGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGACAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAGTACCAAAAAGTGCCCCAGGTCATAAGGGCACAGCTCGATAGCTGGTCCCTAAAGGGAACGTGGTGTAACCACCACACAGAACGAAGCTGGAACGTTCCTGCCGTCCTTAGAAGCTGCCTTTGCTAAGGGGAATTGCCCTGACTTCCCACACCATTGATTCATCTCCAGACCCTTGGTTTTCATGTTGATTTTTCAAAAATCACCTGATAGTCTGACCGAATGTAGCTTTCCACTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCGGGCTCCAGTGCAGTTGTGTGATCTTGGTTCACTGTAACCTCCTCCTCCCGGGTTCAAGAGACTCGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACATCAGGCGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCGGCCTTATTTTTCCCCCATTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGTCAGGGTCTTGTTCTGCGCTCAGGCTGGAGGGCAGTGGTGTGGGGATCACGGCTCACTGCAGCCTCGACTTCCTGCACCACCACGCCTGGCTGTTTTTTTTTTTTCCGGTAGAGACGGGGGTCTTACCGTGTTGCCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCCGCCTCGGCCTCCGCAAATGCTGAGATCACACGCGTGAGCCCCCGCACCCGGCCTCCTTTCCACCGCTCTTGTCTACAGCCGCCCCTCCTGGTCCGATTGTATTGGCAGATGTCGCCAATACGGTGTCAAACGGCGAAGGGGCACTGAGCGTTTTTTCTTTCTCCCGTCCTTGGCGGCAGCAGCTCGGTTCCGGCTACGGGGCTGAGCCCGTCTCTCAGACGAGGAAACTGGGGTCCGAGAGGTGAGCCGGTCCCAGAGGCAGGGCGAGGGGGAAGCGGGAGTGGGGTCCGCAGCGGACCCAGCCCTGCCTCCCCCCTGCAGGAGATCGTCAACTTCAACTGCCGGAAGCTGGTGGCCTCCATGCCGCTGTTCGCCAACGCCGACCCCAACTTCGTCACGGCCATGCTGACCAAGCTCAAGTTCGAGGTCTTCCAGCCGGGTGACTACATCATCCGCGAAGGCACCATCGGGAAGAAGATGTACTTCATCCAGCACGGCGTGGTCAGCGTGCTCACTAAGGGCAACAAGGAGATGAAGCTGTCCGATGGCTCCTACTTCGGGGGTGAGCTTGAGGGGGGCGCGCCTGGAGGGGGAGGGGGCACGCGACCCCCGCGGTGTGCAGAGCCAGGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGATGGGGATGGGGATGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGATGGGGATGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGATGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGCACCAGGGAGAGCCTGGGTGGGAAGCGCCCACGCTGGCCAAGGTGCAGAGGCCGGGCCGTGTGCCTGGGCGGGGAGGGCCGCGGCGCCCGCCTCGTCCAGCAACCCCCCCCTGCGCGCCACGTGCAGAGATCTGCCTGCTCACCCGGGGCCGCCGCACGGCGAGCGTGCGGGCTGACACCTACTGCCGCCTCTATTCGCTGAGCGTGGACAACTTCAACGAGGTGCTGGAGGAGTACCCCATGATGCGGCGCGCCTTCGAGACGGTGGCCATCGACCGCCTGGACCGCATCGGTGAGCGGGCCGGGGGCGTGGCCGGGGCGGGTGCCCTGGCGGGGGAGGGGCGTGGCCAAGGCATCAGGAGAGTGGCTTGGACAGTGGCAGGGGGAAGGGCGTGGCTGTGGCATCAGGGGCACGGTTGGGGCAGAGACGTGGCCAAGGCATCAGGAGTGTGGCCATGGCAGCAGGGGCGTGGCTGGGGCAGGGGCAGCGGCTGGCCGCTCCTAGGACCCCTTTGGGTCTAGAGGCTGATTTTCTGACCTATTGTCCTACTTCAGCCAGAGGCAGCCTGTTTCCCAAGGGAGGGAATGCACAGGGTGTTTGCGGTTGTGCCGAATGCTCGGTGAGCACCTGCTGTGTGCTGGGGGTGCAGGGGACAGACCCGGGGGCCCACTCAGACTCCCAGGGAGGCTTATGGACTGGTGATGAAATCACACACGACTGGGCTGTGTGCCAGCAGGGCAGGTGGGGCCGGTGGGCTTCCCTGAGTTGGGAATGCAGAGTGGAGACCAGGGTAAGGGATGCCATGTGGAAACGGGGAGGAAGATGTGTTCGTGGAGTGGACACAGCACATCCCAAGGCCCTGAGGTGGAAAAGAGGCCTAGAGTCCAGAGAGCCAGGGAGGCCTGGAGGAGGTTGGGGAAGAAGGGGAGGCCAGACACACAGGGCCCAGTGGGCGGCAGGGAGAGTTTAGACTAAATCAGGAGCATCAGGGAGCCATGGAGGGTTCTAGGTGGGCGGAGGACCTGGTCAGATTGTATCCGCCAAGGCGGGCCGTGTCCAGGAGGGAGACGGTGACCTGGCCTCTCAGGGGGGCAGTCTCTGGGGCAGGGAGGGGCAGAGCCCTGATGACTGGATGTAGGCGCCAGAGAGATGGCGGCTCATGCTGCTGTTCGTGGGAATGGGAATGAAGACCATGGCTGAAACGCAGGACAGGTGCGACGGAGTGGTGTCAGGGAGCTCCCTGGTGTACAGTAGGAAGCTCTCCACAACTTGCTCTATACAGTGAGTATGCAACCCGTTCCTGAGTATCAGGTGCTTAGGTTATAACTTCTGTATACAGCAGGTGCTCAGCACAGGCTGTGTACAGGCAGGTGTTTTCGGTATGCCTGTGGCACACTGGAGGCAGTCATTACATAATCAGCGTATACAGGTGGTACACATGCATACTTGGTGCACAGTGATACCTGCTCCATGTACACAGCAGGCATTAAATACCTGTTTACTGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAGTCCCAGCACTTTCGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGATGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCCGGGAGGTGGACCTTGCAGTGGGCCGAGATCGC
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Task1_train_26186
This sequence variant lies in POLRMT (RNA polymerase mitochondrial) on Chromosome 19. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
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Task1_train_26187
A genetic alteration is present in POLRMT (RNA polymerase mitochondrial) on Chromosome 19. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
CAGGGGTGTGACCCACTCCACCACAGAGCCCATGTGGGAGATGAGGCGGGCACTCTCGGTCAGCCAGTGCTGTGGGACACAGGCCGTCTCAGGGCAGGGGGCTCAGGCCGGGGATCCCGTCCACTTGCTTAGGGAGTCCTGGCCGAGCGGGGACAGGACAGGACGTACCTGGATGGCCCGGGTCCCCGAGAACATCTCCTGTAGACTCTTGAAGACCTGGCGTACGAGATAGTGAGAGGCCTCCCACACGAACTCCTGCAGAGGGCGGGCAGCAGGTGCAGGTCCTCAGGGGCTGGCCCGTTCACGCCCTACTCCCCCCTATTTCAGAGCCACTGAGGCCCAAGGCCTAGGGCCTAGCAGGGGGGCAGGGGAATGGGGCCTGGCGCCCACGCAGTCAGCAAGAAACGCCCAAGCCCTAACAGGCAGCCAGTGGTCTGGGGGAGCAGCCAGGGCTCCTGCTGGGAGGCTGGGTCGGGGGCACACCCGTCTGAGTTTTAAATGGCAGTGAAACCAACGTGTTCGCAGCGCGACATGCCTGGCGCACCTGGGGAAAGTCGCTCAGCTCCCGGAGGCGCTTCTCAATCTGCAGGCGCCCGCCATAGCGCGTGACCCCGTACACCACCGTCATCACCGTCTGCTTCACCACCTTGCGGGTGATGAAACCTTCCAGCACCTGTGCCACCCGCATGCCCCGCTGGGCGTCCTGCCTACGGAACACCTCCACCTGCACGGCGGGTGGGCCGGGGGCGCGGGTCAGCCCCGCTAGCAGCCCAGGGGCCACCAAGCACCCATGAAGCCCCCGCCCCAGCCCCACCACATCCTCAGGACAGGCCAAGGTGAGGGCACCTGGGGCCGAGACTCAGGGCTCACATTGCCCCCACGCCGAGATGCCCCCGGGCAGCAGGGCACACCCTACCTGCGCGGCCACGCCGCTGTACACGTCCTGCGGCACATCCGAGGGCTCCAGGTTGACGGAGGCGGCGCCCACGCTGTCGCGGCCCAGAGCAGCATAATGCTGCAGGCCGTTGCAAGAGCCGTCCTGAGGAAGGGGCGGCAAACGGGAGATGGAAGCTAGAGAGGCAGAGACGTGTGGGACCCCAAACCACCCCCCAGGTCGAGCCGTTCCTAGGGCCGTGCACCCCCCAGCCAAGTGCACCGGAGCCCCCGCACGCTCCCGGGAGAGACCAGGAGCCATGGCTCCCGCACACTCTAGGACCACCTCCAGAGAATACCACGAGCGAAGGTGAAATCTCACACCCTCAAGTCGAGCCCCAGGCCCAGTGCACACTGCACGGCCTCGGGGGCCAGACCCAGCTGGCTCACCTGATGGACGGGGAGGTGGGAGACATAGGCGGCAGGGTCGGAGGCGCGCACAGCGTTCGCCACCTCCATACAGCAGGCCAGCGTCTGCCAGGGTTCCTCCGCGCCCATCCACCACTTTCGGCCCTGCGGGGACAGCGGATGGGGGGCAGTGAGGCCCGGGCCCGATCCCTGAGCCCGCTGGGAGGCTGTGTTGCGGGGAGGTGGGAAATGGGGAGGAGACGCACACCCGTGATAGTGAACACGGGACGCATGTGGGCGAGAGACGGGGCGGTGGCTGGATGAGTTCTCCATAGCCACGGATGGAGGATGGGAGCTGCGGGTGGACCGGGCTGAAACAAGCGTGTCCGGAGCTGCCGGGGGAGGAGGGTGGACAGAGGACCTGGGGGCGCCGGGGGAGGAAGCAGCTCGGCGGATGCAGGGGAGGGGGGAACGTGGGGAACGCGGGGGCCCTGGGGCAGGGGAGAAGGGAGAAGCAGGACGGGCAGGGGGCGCGGGGGAGGAGAGCGGGCGGGGGACGTGGGGGCGCCAGGGGAGGGGGAGGGGAGGAGGAAGACGGGCAGGGGGCGCCAGGGGAGGGGGAGGGGAGGAGGAAGACGGGCAGGGGGCGCGGGGGCGCCGGGGGAGGGCGCGGGGGCGCCGGGGGAGGGCGCGGGGGTGCCGGGAGGGCGGGGAATGCGGGGGCCCCGCCCCTACCGTCAAGGGTTGGTCCGCGGAGTCCAGGATGTCATCCATCACCTCCTCCGCAAAGGCCAGGCGCTTCCGCAGCGGCTCCCGCTTCTTCAACCCCGTGAGATTGACCAGGTGGATCTTGAGCCAATCCAGGCCGTGCGGGCCGAGCGGGCGGCCCTGGGCGAACTCCAGCAGGGCCCGCGCCACGTCGCTGCCCAGGTGGTTGAAGTGCGGCGGGCAGGGGTAGGTGCGGCCGCGGAAGTCCATGTTGTGCGGCAGCCAGAAGACGCGGTCCCGCAGGTGCTGCGCCAGCGAGAGGCGGTACAGCGCCTCCGCCCGCAGGCTGTGCATCTCCCGGGCCACCTTCTGGCAGTGCGCCAGCTCACGGCGCAGCTCGGCCTTGCGGGCGGGCGCGGCGCTGTGCGGCAGGTGGGCCTCGGGCGGCTGGGGCGCCTCGGAGGGCGGGGCCGGCACGCCTAGCTGGGGGCAGCCCTTGGCCTGGAAGAGCTGCAGCACCAGGTCCAGCACGCGCCCGTTGACGCGCCAGGCGCAGTTGCCCAGTTGGGTGAGGGCGTCCAGTGCGCCATGCAGCGCGGTGGGCGGGCAGGTTTCCAGCAGCTCCTGGTGCTGCGTGGCGCCTTCCACCGTGCGCATCAGCTTGGTGGGGCTGAGCAGGAAAGCACCAGAGTGCGGCGATGTCCAGGGCAGCGGGGGGCAAAGCATGGGTACATCCACCGCCTCGAAGGTCAGCGTGGGCTCCGCGGCCTTCTCCAGCAGCTGCACGTAGGCCGGGTGCGGCTTCAGGATGCCGATCTGGGGTGCGACAGGCAGACGGGTCAGGGCCCCGGTGCTGGGGCTTTCCTGTTCCCACCCCTTAAACTTGGGTGAGAGGGGCCGGCTCCCCGGCCAACAAGAAACCAGTGTGGCCTCCCACGAACAGAAGCCACCTCCAGAAACGGCCGGACACCTGCATGGACACCCATGGTGTGTCCCGAGTCCTGGGAGGTACTGACGGCTGCGCTGAGATCAAGGCTCCGCCCAAAGGCGCCAACCCCATGGGGTCCCTGGTCCTCCCAGCGGGATGCCCCCCAGCTCAGGAGGGCACTGCCTGGCACCTGCTGGACGTTGCGGAAGGAATACACGTGGTAGAGCACGGGGACAAGCCGAGAGGAACGATGCGGCTTGTCCAGGCTGCATGGCATCTGCGTAGCCTGCACCAGCATCTCCGCCAGCAGCTTGCCCAGCTCCATCTGCACTGGCAGGGGCCAGGGCTGCTCCCGCAGGGCCTCGGGCGCCCCCAGCTCCTCCCAGTACTGCCGCGGCAGGCAGGGCTCGGGCACCTGTAGGACAGGGCGGTCAGGGCGCTGGGCACCGGGGCCCCTGAGCTAGATGCCCCACCGCCCGTGCCTGACGCCCGGTGGGGCATCTGTCAGCCCAAGCATACAGATGAACAGACTGAAGCTTGGGTGCAAACCCGGCTGCTCCAGGGAGGGAGAGCGCCCACCCACCACTGGCCCCAGCCAGGAGGAGAGGGGGTGCGAGCCTCACCTCGGCGTCGGAGGCCAGCAAGCAGAGGTACTTCCTGTAGTGGTTCTGCAGCGCCTGCACCTGGCCACTGACCCGCTGCCTCTGCACCACGTGCCGGCTGAAAGTGCGCGCACTCAGCTCCCGGGCCAGGGTGGTGAAGGACTCACCTTGGGCGGGCAGCGCCTGCAGGACCTGCGGAAGGCAGCCGTGAGTGCCTGCCCGCCCCGCCCGGGGACCCGGCCGCGCGGAGGAAGACGCACCTGCAGGAGCATCCGCACCACCTCGCGCTCGTCCAGCAGGCACAGGAAGGGGTAAAGTGAGAACCGGCCCTCGTACACCTCGCGCTCTAGGCGGTTCTTGGTCTCCCGCAGCGCCCGGCACAGTGCTTTCTCCCATTGGTCCCGCAGGGTCTTCAGGGTCTTCCGCTGCGGGGGATGAACGGGCCCGGTGAGCCCCGTGGCAGCTGGTGGGACCCAGGCTCACAGGACGGGGGTCACCGCAGCTCCCTGCAGAGACCTCATGGCCCTCAAGGTCCCTGCTGTGTGTTCCGGGTAGCTCCTCACCCCGGCCTGCCCTC
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A variant was discovered on Chromosome 19, affecting POLRMT (RNA polymerase mitochondrial). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
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Task1_train_26189
The gene POLRMT (RNA polymerase mitochondrial) is located on Chromosome 19, where a mutation has occurred. What is the medical relevance of this mutation?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
CATGCCCCGCTGGGCGTCCTGCCTACGGAACACCTCCACCTGCACGGCGGGTGGGCCGGGGGCGCGGGTCAGCCCCGCTAGCAGCCCAGGGGCCACCAAGCACCCATGAAGCCCCCGCCCCAGCCCCACCACATCCTCAGGACAGGCCAAGGTGAGGGCACCTGGGGCCGAGACTCAGGGCTCACATTGCCCCCACGCCGAGATGCCCCCGGGCAGCAGGGCACACCCTACCTGCGCGGCCACGCCGCTGTACACGTCCTGCGGCACATCCGAGGGCTCCAGGTTGACGGAGGCGGCGCCCACGCTGTCGCGGCCCAGAGCAGCATAATGCTGCAGGCCGTTGCAAGAGCCGTCCTGAGGAAGGGGCGGCAAACGGGAGATGGAAGCTAGAGAGGCAGAGACGTGTGGGACCCCAAACCACCCCCCAGGTCGAGCCGTTCCTAGGGCCGTGCACCCCCCAGCCAAGTGCACCGGAGCCCCCGCACGCTCCCGGGAGAGACCAGGAGCCATGGCTCCCGCACACTCTAGGACCACCTCCAGAGAATACCACGAGCGAAGGTGAAATCTCACACCCTCAAGTCGAGCCCCAGGCCCAGTGCACACTGCACGGCCTCGGGGGCCAGACCCAGCTGGCTCACCTGATGGACGGGGAGGTGGGAGACATAGGCGGCAGGGTCGGAGGCGCGCACAGCGTTCGCCACCTCCATACAGCAGGCCAGCGTCTGCCAGGGTTCCTCCGCGCCCATCCACCACTTTCGGCCCTGCGGGGACAGCGGATGGGGGGCAGTGAGGCCCGGGCCCGATCCCTGAGCCCGCTGGGAGGCTGTGTTGCGGGGAGGTGGGAAATGGGGAGGAGACGCACACCCGTGATAGTGAACACGGGACGCATGTGGGCGAGAGACGGGGCGGTGGCTGGATGAGTTCTCCATAGCCACGGATGGAGGATGGGAGCTGCGGGTGGACCGGGCTGAAACAAGCGTGTCCGGAGCTGCCGGGGGAGGAGGGTGGACAGAGGACCTGGGGGCGCCGGGGGAGGAAGCAGCTCGGCGGATGCAGGGGAGGGGGGAACGTGGGGAACGCGGGGGCCCTGGGGCAGGGGAGAAGGGAGAAGCAGGACGGGCAGGGGGCGCGGGGGAGGAGAGCGGGCGGGGGACGTGGGGGCGCCAGGGGAGGGGGAGGGGAGGAGGAAGACGGGCAGGGGGCGCCAGGGGAGGGGGAGGGGAGGAGGAAGACGGGCAGGGGGCGCGGGGGCGCCGGGGGAGGGCGCGGGGGCGCCGGGGGAGGGCGCGGGGGTGCCGGGAGGGCGGGGAATGCGGGGGCCCCGCCCCTACCGTCAAGGGTTGGTCCGCGGAGTCCAGGATGTCATCCATCACCTCCTCCGCAAAGGCCAGGCGCTTCCGCAGCGGCTCCCGCTTCTTCAACCCCGTGAGATTGACCAGGTGGATCTTGAGCCAATCCAGGCCGTGCGGGCCGAGCGGGCGGCCCTGGGCGAACTCCAGCAGGGCCCGCGCCACGTCGCTGCCCAGGTGGTTGAAGTGCGGCGGGCAGGGGTAGGTGCGGCCGCGGAAGTCCATGTTGTGCGGCAGCCAGAAGACGCGGTCCCGCAGGTGCTGCGCCAGCGAGAGGCGGTACAGCGCCTCCGCCCGCAGGCTGTGCATCTCCCGGGCCACCTTCTGGCAGTGCGCCAGCTCACGGCGCAGCTCGGCCTTGCGGGCGGGCGCGGCGCTGTGCGGCAGGTGGGCCTCGGGCGGCTGGGGCGCCTCGGAGGGCGGGGCCGGCACGCCTAGCTGGGGGCAGCCCTTGGCCTGGAAGAGCTGCAGCACCAGGTCCAGCACGCGCCCGTTGACGCGCCAGGCGCAGTTGCCCAGTTGGGTGAGGGCGTCCAGTGCGCCATGCAGCGCGGTGGGCGGGCAGGTTTCCAGCAGCTCCTGGTGCTGCGTGGCGCCTTCCACCGTGCGCATCAGCTTGGTGGGGCTGAGCAGGAAAGCACCAGAGTGCGGCGATGTCCAGGGCAGCGGGGGGCAAAGCATGGGTACATCCACCGCCTCGAAGGTCAGCGTGGGCTCCGCGGCCTTCTCCAGCAGCTGCACGTAGGCCGGGTGCGGCTTCAGGATGCCGATCTGGGGTGCGACAGGCAGACGGGTCAGGGCCCCGGTGCTGGGGCTTTCCTGTTCCCACCCCTTAAACTTGGGTGAGAGGGGCCGGCTCCCCGGCCAACAAGAAACCAGTGTGGCCTCCCACGAACAGAAGCCACCTCCAGAAACGGCCGGACACCTGCATGGACACCCATGGTGTGTCCCGAGTCCTGGGAGGTACTGACGGCTGCGCTGAGATCAAGGCTCCGCCCAAAGGCGCCAACCCCATGGGGTCCCTGGTCCTCCCAGCGGGATGCCCCCCAGCTCAGGAGGGCACTGCCTGGCACCTGCTGGACGTTGCGGAAGGAATACACGTGGTAGAGCACGGGGACAAGCCGAGAGGAACGATGCGGCTTGTCCAGGCTGCATGGCATCTGCGTAGCCTGCACCAGCATCTCCGCCAGCAGCTTGCCCAGCTCCATCTGCACTGGCAGGGGCCAGGGCTGCTCCCGCAGGGCCTCGGGCGCCCCCAGCTCCTCCCAGTACTGCCGCGGCAGGCAGGGCTCGGGCACCTGTAGGACAGGGCGGTCAGGGCGCTGGGCACCGGGGCCCCTGAGCTAGATGCCCCACCGCCCGTGCCTGACGCCCGGTGGGGCATCTGTCAGCCCAAGCATACAGATGAACAGACTGAAGCTTGGGTGCAAACCCGGCTGCTCCAGGGAGGGAGAGCGCCCACCCACCACTGGCCCCAGCCAGGAGGAGAGGGGGTGCGAGCCTCACCTCGGCGTCGGAGGCCAGCAAGCAGAGGTACTTCCTGTAGTGGTTCTGCAGCGCCTGCACCTGGCCACTGACCCGCTGCCTCTGCACCACGTGCCGGCTGAAAGTGCGCGCACTCAGCTCCCGGGCCAGGGTGGTGAAGGACTCACCTTGGGCGGGCAGCGCCTGCAGGACCTGCGGAAGGCAGCCGTGAGTGCCTGCCCGCCCCGCCCGGGGACCCGGCCGCGCGGAGGAAGACGCACCTGCAGGAGCATCCGCACCACCTCGCGCTCGTCCAGCAGGCACAGGAAGGGGTAAAGTGAGAACCGGCCCTCGTACACCTCGCGCTCTAGGCGGTTCTTGGTCTCCCGCAGCGCCCGGCACAGTGCTTTCTCCCATTGGTCCCGCAGGGTCTTCAGGGTCTTCCGCTGCGGGGGATGAACGGGCCCGGTGAGCCCCGTGGCAGCTGGTGGGACCCAGGCTCACAGGACGGGGGTCACCGCAGCTCCCTGCAGAGACCTCATGGCCCTCAAGGTCCCTGCTGTGTGTTCCGGGTAGCTCCTCACCCCGGCCTGCCCTCTGCCGGCTTCAGCGTGCCTGACGCAGCCAAGAGCAAAAGCCCAGCTGCAGTGTGCGCAGAAGCACAGGCCAAGACCCAACCTCGGGACCCCACAAGTTTTCCCTGAGCGGCAGCCAGGCTGAGTTCCTAGGCCCTGCATGACCAGACCAGGGCATGAGCAATTCAACCGCATACACGGAGCTCAGCCCCTGCGGCGGACACGCGACCCCGGCTCAGCCCCTGCGGCGGACACGGGACCCCGGCTCAGCCCGTGCGGTGGACACGCGACCCCGGCTCAGCCCCTGCGGCGGACACGGGACCCCGGCTCAGCCCCTACCGCGTGCTTGACCTCCTTGCTTGGCAACGTGGGCTTCTCCACGGACACCACGCACACCCTGCTGGCCAGCTCCATGTGGAGCTGCTTCTCAAAGAGGCACTGCAGGGTCTTCAAGGGCAGGTGCAGCTTCGGGTAGGACACACGCCCATCCTGCAGGGATGGGGGTAGTGAGGTTGGGGGCTTGCCAGAGGGCGACCTGCCCTCCCAGGACCCCGAGACAGCATGGGTGCACGCGTTTCTGCGTCTCCTGCAAGTTGCTGGTGGCTATCGCTGACGCGGGGAAAGGCGGGCTGCGGGTAAAGTCAGTGCCAGCAGTGCAAACCAAAGGCCTTGACCCTCCTGGCCTCGACCCCTCTAGAAGGGACACTG
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An alteration has been detected in POLRMT (RNA polymerase mitochondrial) on Chromosome 19. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
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Task1_train_26191
This mutation is located in gene POLRMT (RNA polymerase mitochondrial) on Chromosome 19. Is it associated with a disease or is it a benign polymorphism?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency 55
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Task1_train_26192
This alteration in ELANE (elastase, neutrophil expressed) on Chromosome 19 may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Cyclical neutropenia
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Task1_train_26193
A variant was discovered on Chromosome 19, affecting ELANE (elastase, neutrophil expressed). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Neutropenia, severe congenital, 1, autosomal dominant
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Task1_train_26194
A variant on Chromosome 19 in gene ELANE (elastase, neutrophil expressed) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; not provided
GCCCCTTCCAAAGATACGGCGTCCCCCACCCCTGAAATCCCCCCACCCCCGACTTGAAACAGGGCTGTGTAGACAGTAGGCGCTTACTAAGTGCACTGTGGTGATGTTAAGGCAGCAAGGTGGGAACCCTGCCAAAAGGGGAGGGGAGAAGGCAGGGTAGTGTGTGTCTGATTAAGCTGAGGACAGGGCAGACATGGACTGAGCGCCTGCTGTGTGCCAGGCTCTGGGAGGGCAGGGCCATTGTCTCCCTAACCCGAGAGCCATGGGGGTCCACTTGCCTGTGGTCACGTCAGGACTCCAGCCTGGCCCAGGCTCTGCGTGTCCCCGGGTGCCCTCGCCCCGCCTATTCCTGGAGACAGGCCCGTTGGTTCCCTTCCCCTCCCCTTGTCCTGGAGCCAGGAGGACGTTGGTTCTTGCGACAGCCTTGGCCCGGCCGTTGCAGCTGGAACATCGTGGGGGAGATGGGAAGAGGAACGGGGCCCGGAGCCCGGGGCTGGGTCCTGGGAATCCCTTTCCCGCAGCTGGGACTCCAGCTCCCCTGCCAGTTCCTCCAGGCGGAAGCCCTCAGGCTTGGTCCTCACTCCAGCCTCCCGGCCTGGACAGGAATTCTCTCTCCAGCAGCCCTGCCAGATGCCCGCCCAGCCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAG
GCCCCTTCCAAAGATACGGCGTCCCCCACCCCTGAAATCCCCCCACCCCCGACTTGAAACAGGGCTGTGTAGACAGTAGGCGCTTACTAAGTGCACTGTGGTGATGTTAAGGCAGCAAGGTGGGAACCCTGCCAAAAGGGGAGGGGAGAAGGCAGGGTAGTGTGTGTCTGATTAAGCTGAGGACAGGGCAGACATGGACTGAGCGCCTGCTGTGTGCCAGGCTCTGGGAGGGCAGGGCCATTGTCTCCCTAACCCGAGAGCCATGGGGGTCCACTTGCCTGTGGTCACGTCAGGACTCCAGCCTGGCCCAGGCTCTGCGTGTCCCCGGGTGCCCTCGCCCCGCCTATTCCTGGAGACAGGCCCGTTGGTTCCCTTCCCCTCCCCTTGTCCTGGAGCCAGGAGGACGTTGGTTCTTGCGACAGCCTTGGCCCGGCCGTTGCAGCTGGAACATCGTGGGGGAGATGGGAAGAGGAACGGGGCCCGGAGCCCGGGGCTGGGTCCTGGGAATCCCTTTCCCGCAGCTGGGACTCCAGCTCCCCTGCCAGTTCCTCCAGGCGGAAGCCCTCAGGCTTGGTCCTCACTCCAGCCTCCCGGCCTGGACAGGAATTCTCTCTCCAGCAGCCCTGCCAGATGCCCGCCCAGCCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCACGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAG
Task1_train_26195
The following genetic variant occurs in ELANE (elastase, neutrophil expressed) on Chromosome 19. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Cyclical neutropenia
CAGCAGCCCTGCCAGATGCCCGCCCAGCCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCTCCCTGGGAAGGGTTAGAGGGAGAGTTTCCTTGTCACTAAGTTTTCTCATAGCTCTCACCCAGTGCAGTGGCGCGATCGCAGCTCACTACAGCCTCCATCTCCTGGGCTCAAGCCACCCTCTCAGCTTGGAATGGGGGGTAGCTGGAACCACAGGTGCCACCACGTGGGTCCACCACGTCTGGCTAATATATATATATACACACACACATACATATATTATAAATAATAAATATATATTTTATTTAAATAAAATATATAATATTTATAATTATTTTATAATTATAATAATATTTATATAATTATAAATATCATTTATAATTATAATATTTATTATTTTATAAAATAATAAATATAAAATATATAAAAATATTTTTATAAAATAATAAAAATATATATATACACACATATATATATATTTTTTGAGACAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACT
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Task1_train_26196
Given a variant located on Chromosome 19 and affecting ELANE (elastase, neutrophil expressed), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Neutropenia, severe congenital, 1, autosomal dominant
CAGCAGCCCTGCCAGATGCCCGCCCAGCCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCTCCCTGGGAAGGGTTAGAGGGAGAGTTTCCTTGTCACTAAGTTTTCTCATAGCTCTCACCCAGTGCAGTGGCGCGATCGCAGCTCACTACAGCCTCCATCTCCTGGGCTCAAGCCACCCTCTCAGCTTGGAATGGGGGGTAGCTGGAACCACAGGTGCCACCACGTGGGTCCACCACGTCTGGCTAATATATATATATACACACACACATACATATATTATAAATAATAAATATATATTTTATTTAAATAAAATATATAATATTTATAATTATTTTATAATTATAATAATATTTATATAATTATAAATATCATTTATAATTATAATATTTATTATTTTATAAAATAATAAATATAAAATATATAAAAATATTTTTATAAAATAATAAAAATATATATATACACACATATATATATATTTTTTGAGACAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACT
CAGCAGCCCTGCCAGATGCCCGCCCAGCCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTTCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCTCCCTGGGAAGGGTTAGAGGGAGAGTTTCCTTGTCACTAAGTTTTCTCATAGCTCTCACCCAGTGCAGTGGCGCGATCGCAGCTCACTACAGCCTCCATCTCCTGGGCTCAAGCCACCCTCTCAGCTTGGAATGGGGGGTAGCTGGAACCACAGGTGCCACCACGTGGGTCCACCACGTCTGGCTAATATATATATATACACACACACATACATATATTATAAATAATAAATATATATTTTATTTAAATAAAATATATAATATTTATAATTATTTTATAATTATAATAATATTTATATAATTATAAATATCATTTATAATTATAATATTTATTATTTTATAAAATAATAAATATAAAATATATAAAAATATTTTTATAAAATAATAAAAATATATATATACACACATATATATATATTTTTTGAGACAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACT
Task1_train_26197
The gene ELANE (elastase, neutrophil expressed) on Chromosome 19 carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; not provided
CCCCTGCCTCAGGCGGGGAGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCTCCCTGGGAAGGGTTAGAGGGAGAGTTTCCTTGTCACTAAGTTTTCTCATAGCTCTCACCCAGTGCAGTGGCGCGATCGCAGCTCACTACAGCCTCCATCTCCTGGGCTCAAGCCACCCTCTCAGCTTGGAATGGGGGGTAGCTGGAACCACAGGTGCCACCACGTGGGTCCACCACGTCTGGCTAATATATATATATACACACACACATACATATATTATAAATAATAAATATATATTTTATTTAAATAAAATATATAATATTTATAATTATTTTATAATTATAATAATATTTATATAATTATAAATATCATTTATAATTATAATATTTATTATTTTATAAAATAATAAATATAAAATATATAAAAATATTTTTATAAAATAATAAAAATATATATATACACACATATATATATATTTTTTGAGACAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTA
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Task1_train_26198
The gene ELANE (elastase, neutrophil expressed), on Chromosome 19, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; Cyclical neutropenia
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Task1_train_26199
A variant was discovered in gene ELANE (elastase, neutrophil expressed), Chromosome 19. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Neutropenia, severe congenital, 1, autosomal dominant
AGGGCTTCAGGGAAGCTCACCAAGGCAGAAGGGCGGGAGAGATTGTCAGAGCCCCAGCTGGTGTCCAGGGACTGACCGTGAGCCTGGGTGAAAGTGAGTTCCCCGTTGGAGGCAACAGACGAGGAGAGGATGGAAGGCCTGGCCCCCAAGAATGAGCCCTGAGGTTCAGGGAGCGGCTGGAGTGAGCCGGCCCCAGATCTCCGTCCAGCTGCGGGTCCCAGAGGCCTGGGTTACACTCGCAGCTCCTGGGGGAGGCCCTTGACGTGCCTCAGTTCCCAAACAGGAACCCTGGGAAGGACCAGAGAAGTGCCTATTGCGCAGTGAGTGCCCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGTATCACAGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGTGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGATAAACAGAGGCAGGCGACACAGCTGCATGTGGCCGGTATCACGGGGCCCTGGGTAAACTGAGGCAGGCGAGGCCACCCCCATCAAGTCCCTCAGGTCTAGGTTTGGCAGGTTTGGCAAAAACACAGCAACGCTCGGTTAAATCTGAATTTCGGGTAAGTATATCCTGGGCCTCATTTGGAAGAGACTTAGATTAAAAAAAAAACGTCGAGACCAGCCCGGCCAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTGATCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGATCACCCGAGGTCAGATGTTCAAGACCAGCCTGGCCGACAGGGCGAAACACTGTCTCTACTACAAATACAAAAATTAGCCGGGAGTGGTGGCAGGTGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCCGTGAGCCGGGATCACGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCGATAGAGCAAGACTCTGTCTCCAAAAAAATAAATTAAAAAACCCACATTGATTATCTGACATTTGAATGCGATTGTGCATCCTGAATTTTGTCTGGAGGCCCCACCCGAGCCAATCCAGCGTCTTGTCCCCCTTCTCCCCCTTTTCATCAACGCCCTGTGCCAGGGGAGAGGAAGTGGAGGGCGCTGGCCGGCCGTGGGGCAATGCAACGGCCTCCCAGCACAGGGCTATAAGAGGAGCCGGGCGGGCACGGAGGGGCAGAGACCCCGGAGCCCCAGCCCCACCATGACCCTCGGCCGCCGACTCGCGTGTCTTTTCCTCGCCTGTGTCCTGCCGGCCTTGCTGCTGGGGGGTGAGTTTTTGAGTCCAACCTCCCGCTGCTCCCTCTGTCCCGGGTTCTGTTCCCACCTCTCCATAGAGGGCCCCACCAGTGTGGGTCCCTCATCCTCACAGGGGAGGTGCCAGCTGGGACAAGGAGACCAGAAGAGACTGAGGTTCTGAGCGGTGAAGCCACCACCAGGAGCCCAGAGTTGGGGTTTGAAAACCGGGGAGGGGGGGGGGGTCGCAGGTCGCCCTCTGGGTTCAAGTCCAGGTCTGTCTGTGCCTTGGAGGGGCACCGTGGGGAGGTCCCTTTGCCTCTCCGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGAACAACAGGGGTGCGAACGGCCCCGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCCGGTGGGGGATCCCGTGGGTTCCTGGTGGGGGATCCAGAGGCCCCGTGGCCGGGAGGGGACAGGCTCCTTGGCAGGCACTCAGCACCCGCACCCGGTGTGTCCCCAGGCACCGCGCTGGCCTCGGAGATTGTGGGGGGCCGGCGAGCGCGGCCCCACGCGTGGCCCTTCATGGTGTCCCTGCAGCTGCGCGGAGGCCACTTCTGCGGCGCCACCCTGATTGCGCCCAACTTCGTCATGTCGGCCGCGCACTGCGTGGCGAATGTGTGAGTAGCCGGGAGTGTGCGCGCCCGGCTCGGACCCCGCGTCCCGGTCTGTGAGGTGGGTGGGGGGAGGCCGGGGCCGGGGCTGCTGGCGGGGGGGGGTCCGTCCAGGGCCCGCGGGGCCCCTCGAGCACCTTCGCCCTCAGGCCCGTCGCCGGATGGGGACGACAAGGCGCGGCTGAGCCCCGACCCCCGGGGCCGCCCCTGAGCCCCGCCTCTCCCTCCCCGGCAGAAACGTCCGCGCGGTGCGGGTGGTCCTGGGAGCCCATAACCTCTCGCGGCGGGAGCCCACCCGGCAGGTGTTCGCCGTGCAGCGCATCTTCGAAAACGGCTACGACCCCGTAAACTTGCTCAACGACATCGTGATTCTCCAGGTGCCGCCGGGCGGGGCGGGGGGCGCAGGGGCGGAGGCCAGAGGCCTGGGGAGGGTGGAGGCTGCGACGGAGGGGCGCGTCGGGGCCGCTCGTGGGGACCTGGGGTGGCATCGTGGGCTGGGTGGTCCCCTCTCCGCGCCTCGGTCTGCACCTCTGTGAAACGGGAAAATACCCGCCATGGGCCGTTGAGGGGTTAAATGAGATCCTGCAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGTTGTCAATCAACAAACTTACTGAGAAGGGAGGCCCCGATCTGCTGTCAATCAACAAACTTACTGAGATTCTTTGTGTCTCTCCATTCACCAGTCCTGTGGCCCAGGGCAGGGGCCGCCTCTGTCTTTGGGAAAAGGGGCAAAAGTCCCCACCTTTCCACCCCTGTCCGCGGCTTGCAGTTCTGGTTATTTCCTGGGCGCCGGGCCCCGTGGCTCAGGCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCTGAGCAACATAGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATACAAAAAAAAAAAATTAGCCGAGTGTGGTTGTGGGTGCCTGTAATGCCAACTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGAGAATCGCTTGAACCCCGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGATTCCTCCCTGGGAAGGGTTAGAGGGAGAGTTTCCTTGTCACTAAGTTTTCTCATAGCTCTCACCCAGTGCAGTGGCGCGATCGCAGCTCACTACAGCCTCCATCTCCTGGGCTCAAGCCACCCTCTCAGCTTGGAATGGGGGGTAGCTGGAACCACAGGTGCCACCACGTGGGTCCACCACGTCTGGCTAATATATATATATACACACACACATACATATATTATAAATAATAAATATATATTTTATTTAAATAAAATATATAATATTTATAATTATTTTATAATTATAATAATATTTATATAATTATAAATATCATTTATAATTATAATATTTATTATTTTATAAAATAATAAATATAAAATATATAAAAATATTTTTATAAAATAATAAAAATATATATATACACACATATATATATATTTTTTGAGACAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGGTATTGTTAGT
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