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With a mutation on Chromosome X in gene DOCK11 (dedicator of cytokinesis 11), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; DOCK11 deficiency
CCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGCTGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTCCTAACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCTGGCCGCTTTTAATTTTTTTCGAGACAGGGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCACGATCACAGCTCACGGCAGCCTTGACCTCCTGTGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTTATTTTTGTTTCTTGTGGGGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGGAGACGGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGTTCAAGCAATCCTCCTGTCTTAGCCTCCTGAATAGGTGGGACTACAGGTGTGTTACCACCATACCCCAGCTAATTTTTTTATGTTTCTTAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAATCTCCTGCGCTCAAGCAATCCTCCTGTCTTGGCCTCCCAAGCCCTCAGATTACAGGCATGAACCACTGCAACTGGCCCCATGTAAATCTTTTAACTAAGCAATTTCTTTTCTAGGAATTTATCCTAAGGAAAAAATCAGAAAAAAAATGCACACAGTTTTAAATACAAGGATGTTCATCAGAACATTATTTACAACAGCAAAAAGTTGGAAAACAGCCTGTCTCCACTAATGAGAGAATGGTCCAATAAGTCATGTTTATCCATACAGCCATTAAAAGTAATGTCAGTGACTATAGTATAAACTATTGGCCAGACATGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAACACTAGGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGTGCCCAGGAGTTCCAAGCTAGCCTCAGCAACACAGGGAGACCTCATTTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCCAGGTATGGTAGTGCATGTCTATGGTCCCAGCTACACGGGAAGCTGAAGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCTGAGGCTGCAGTGAGACATGATCACACCACTGCACTTGAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAATAAATAAATAAACTATGATACCTGTGTTTTTATTGAGGTGTAATTCACATAATGCACAATCAAAACTGTTTAGTCTGACCTCAATTTTCTGAATACATAGGCATAGAAGAAAGATGAGAAGGAAATATATAAAAATGTGAATAATGATCATTGCTGGGTAGTAGGATTACAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTTTCACTTTGTCGCCCAGACTGGAGTTCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCTCATGCCACCCCGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCTTAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCAATTACAGTAATTTTTAATTTCTTCGTATGTTTCTGTAGTCTCCAAATAGATTTCTGTAACTTCTTTATAATCAGAAGTAAGTGATTTTTAAAAAGAAGAATGAAGACGCCCTTTATTGGAAACACAATTATAATGGCAATGTTCCTCACTTGGTCTCAAAGAAGTTAGTAGGTTACCTTATCTCCTTTTCCCTTCCACTGAATAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAATAAATAAAAACTTTCTTATTTTATAGGTAAATGCCAAAGAGCTTGATCCAAAATATGCTCATATACAAGTTACTTATGTGAAGCCTTACTTTGATGACAAAGAACTCACAGAAAGGAAGACCGAGTTTGAAAGAAATCATAATATCAGCAGATTTGTTTTTGAGGCCCCTTACACTTTATCAGGCAAAAAACAGGGCTGTATAGAAGAACAGTGCAAACGCCGTACAATCTTGACAAGTAAGTACAATTTTACATATTAACTTCTTATTTGTCTTGGTCTTTTTCAGCATACACGAGTAGCAGCTGGCCAGCTGGAACATACAACTGAAATTTTAATTATTATTTGTTCTGCTGTTCAGTTACAAGTTTGCACAAGCACGTCCATGTGATAAACCATCATTTTCCCATATGTCATCCATGATTGCCCAGAGGTGTCTCATAAAGAGAATTTCTCTCTGAATCCTGAAGTACTATATGGGACCCTAAGTCATCTTCTAGATAAAGGATGGGGAGAGTTAAGCACAATAGAGTTTTTTCTTTAATTTGGCTGTTTGAACAAATGATTTTCTAAAGTCAGTAAATCAATCTTAACATTTTAATAGCTTCAAACTCGTTTCCTTACGTGAAGAAGAGGATTCCTATTAACTGTGAACAGCAGATTAATTTAAAACCAATTGATGTTGCCACTGATGAAATAAAAGATAAAACTGCAGAGCTGCAAAAGCTTTGCTCCTCTACTGACGTGGACATGATTCAGCTCCAACTTAAATTGCAGGGCTGTGTTTCTGTGCAGGTACGTTGGTCATCCAACATGTATTGAATGTTTCTTGATGTTTCTTTTGGTTTTATAAGGGCACAGAGCAAGCATTAATTGTAATTATGTGTTGGGCACTTACTGAGTGCAAAAACCTGTGCATTATTTTTTGTTCATTTAATGAAGATATTACATTGAATTTTTTAAAGTTTTGTGTTATGTCAGAGGACTTTAACATAAGTCCGATGACTGTAGCGAAGCCCTGTATGTACATATCAGAAATCACTAACTTACTAGAATATCATCTTTGTAGATTATTTTCTTTAGTTAATGGTTTTTTGAAATAAACTTGAAATAAGCATATATTTCTCAGATATGGATTTCTTGTATATTTTGGGATTTTTAATAAAAAAGAGAAATGCCAAAACTTCTTTTGATTATTGCATTCTGGAAACACTCTCATTTTTCTTCTATTGTGATATAGGTCAATGCTGGTCCATTAGCATATGCAAGAGCTTTCTTAAATGACAGCCAAGCTAGCAAGTATCCACCTAAGAAAGTGAGTGAGTTGAAAGACATGTTTAGGTAAGTGTTTTATAGTTTTCAGGTTAGACCCGTGTTCGTTTTCTCTATTTTCTTCTTTTAAAAAACAACAAAGTATTGACCAAATAATACCCTTCCAAAAAGGGACATTCTCTGTGGTCTTTTACAATATCTAAGTGACCTCCTAATGGCACTTTGAGCAAATGTGAGATCAGTTTCATCCTGCAGGACATTAACAATACCCTAGTGACCCAAGAGATTAAATATGCCAGTTTACTATATTGCTTTGAATATTTTAAGTGACACAAACACAAGCCTATGTTCCTTATGTGCTTTCCTTCTTCACCCAATTGACCTCCTGTTACAGCATTTCAGACCATTTGGGGTAGGAATAGAAGTGGGGCAGGAAAGATTGCATAGGCTCACTCCAGTCCCCTGTCCTTACTTCTACTTGGACTCTGCCAAACTAGGGCATGCAACATCTTGTCTTCAGTGAGCGGCTCTGTAAGCTTAGGCATGTATGAATGCTCCTACATTAGAGAAATATCTTTAATATATAAAAGTCTTCATTCAGAAGAAGAGAAACAGTTGAGTAATATGGACTAAGGAGAAAGATGATAATCTATCCACTCATTTGCTCCCGACTTATTTTGTTTACTTTTCCTGTCTATGTTTTATCAGCTGTTCCAGAGTGCAGAGTAACCAGTAGTCATTCATTCACCAGTATTAATGCCTGGTACATGCAAAAGACTATTTGTTGCTATGACAGGGATATAAAACAAATGGACAATGAAGTACTTTGTCCCCTAAGACCTACACTCTAATTGTGGACATTAAACATAAACACATGAAATAATGGAAAAAGACTTTTATGATAGGTCATCAACTTTCTGTTCTCCTTCCTAGCAGCCCAGGGAAGATCCTTCATACCTGTACCACCCAGCACTGTACTAGCCACATAGTAAGCTC
CCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGCTGGGGTTCCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCGAACTCCTAACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACCACGCCTGGCCGCTTTTAATTTTTTTCGAGACAGGGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCTGTGGCACGATCACAGCTCACGGCAGCCTTGACCTCCTGTGCTCAAGCGATCCTCCCACCTCAGCCTCTTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGTGCACCACCACACCTGGCTTATTTTTGTTTCTTGTGGGGTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGGAGACGGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGTTCAAGCAATCCTCCTGTCTTAGCCTCCTGAATAGGTGGGACTACAGGTGTGTTACCACCATACCCCAGCTAATTTTTTTATGTTTCTTAGAGACAGGGTCTTGCTATGTTGCCCAAGCTGGTCTCAATCTCCTGCGCTCAAGCAATCCTCCTGTCTTGGCCTCCCAAGCCCTCAGATTACAGGCATGAACCACTGCAACTGGCCCCATGTAAATCTTTTAACTAAGCAATTTCTTTTCTAGGAATTTATCCTAAGGAAAAAATCAGAAAAAAAATGCACACAGTTTTAAATACAAGGATGTTCATCAGAACATTATTTACAACAGCAAAAAGTTGGAAAACAGCCTGTCTCCACTAATGAGAGAATGGTCCAATAAGTCATGTTTATCCATACAGCCATTAAAAGTAATGTCAGTGACTATAGTATAAACTATTGGCCAGACATGGTGGCTCATGCCTATAATCCCAACACTAGGGGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGTGCCCAGGAGTTCCAAGCTAGCCTCAGCAACACAGGGAGACCTCATTTCTACAAAAAAATTTAAAAATTAGCCAGGTATGGTAGTGCATGTCTATGGTCCCAGCTACACGGGAAGCTGAAGTGGGAGGATCACTTGAGCCCAGGAGGCTGAGGCTGCAGTGAGACATGATCACACCACTGCACTTGAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAATAAATAAATAAACTATGATACCTGTGTTTTTATTGAGGTGTAATTCACATAATGCACAATCAAAACTGTTTAGTCTGACCTCAATTTTCTGAATACATAGGCATAGAAGAAAGATGAGAAGGAAATATATAAAAATGTGAATAATGATCATTGCTGGGTAGTAGGATTACAGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTTTCACTTTGTCGCCCAGACTGGAGTTCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCAAGCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCTCATGCCACCCCGCCTGGCTAATTTTTGTGTTTTTAGTAGAGACAAGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACCCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCTTAAAATGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCTGGCCAATTACAGTAATTTTTAATTTCTTCGTATGTTTCTGTAGTCTCCAAATAGATTTCTGTAACTTCTTTATAATCAGAAGTAAGTGATTTTTAAAAAGAAGAATGAAGACGCCCTTTATTGGAAACACAATTATAATGGCAATGTTCCTCACTTGGTCTCAAAGAAGTTAGTAGGTTACCTTATCTCCTTTTCCCTTCCACTGAATAAAATAAAAAATAAAATAAAATAAATAAATAAAAACTTTCTTATTTTATAGGTAAATGCCAAAGAGCTTGATCCAAAATATGCTCATATACAAGTTACTTATGTGAAGCCTTACTTTGATGACAAAGAACTCACAGAAAGGAAGACCGAGTTTGAAAGAAATCATAATATCAGCAGATTTGTTTTTGAGGCCCCTTACACTTTATCAGGCAAAAAACAGGGCTGTATAGAAGAACAGTGCAAATGCCGTACAATCTTGACAAGTAAGTACAATTTTACATATTAACTTCTTATTTGTCTTGGTCTTTTTCAGCATACACGAGTAGCAGCTGGCCAGCTGGAACATACAACTGAAATTTTAATTATTATTTGTTCTGCTGTTCAGTTACAAGTTTGCACAAGCACGTCCATGTGATAAACCATCATTTTCCCATATGTCATCCATGATTGCCCAGAGGTGTCTCATAAAGAGAATTTCTCTCTGAATCCTGAAGTACTATATGGGACCCTAAGTCATCTTCTAGATAAAGGATGGGGAGAGTTAAGCACAATAGAGTTTTTTCTTTAATTTGGCTGTTTGAACAAATGATTTTCTAAAGTCAGTAAATCAATCTTAACATTTTAATAGCTTCAAACTCGTTTCCTTACGTGAAGAAGAGGATTCCTATTAACTGTGAACAGCAGATTAATTTAAAACCAATTGATGTTGCCACTGATGAAATAAAAGATAAAACTGCAGAGCTGCAAAAGCTTTGCTCCTCTACTGACGTGGACATGATTCAGCTCCAACTTAAATTGCAGGGCTGTGTTTCTGTGCAGGTACGTTGGTCATCCAACATGTATTGAATGTTTCTTGATGTTTCTTTTGGTTTTATAAGGGCACAGAGCAAGCATTAATTGTAATTATGTGTTGGGCACTTACTGAGTGCAAAAACCTGTGCATTATTTTTTGTTCATTTAATGAAGATATTACATTGAATTTTTTAAAGTTTTGTGTTATGTCAGAGGACTTTAACATAAGTCCGATGACTGTAGCGAAGCCCTGTATGTACATATCAGAAATCACTAACTTACTAGAATATCATCTTTGTAGATTATTTTCTTTAGTTAATGGTTTTTTGAAATAAACTTGAAATAAGCATATATTTCTCAGATATGGATTTCTTGTATATTTTGGGATTTTTAATAAAAAAGAGAAATGCCAAAACTTCTTTTGATTATTGCATTCTGGAAACACTCTCATTTTTCTTCTATTGTGATATAGGTCAATGCTGGTCCATTAGCATATGCAAGAGCTTTCTTAAATGACAGCCAAGCTAGCAAGTATCCACCTAAGAAAGTGAGTGAGTTGAAAGACATGTTTAGGTAAGTGTTTTATAGTTTTCAGGTTAGACCCGTGTTCGTTTTCTCTATTTTCTTCTTTTAAAAAACAACAAAGTATTGACCAAATAATACCCTTCCAAAAAGGGACATTCTCTGTGGTCTTTTACAATATCTAAGTGACCTCCTAATGGCACTTTGAGCAAATGTGAGATCAGTTTCATCCTGCAGGACATTAACAATACCCTAGTGACCCAAGAGATTAAATATGCCAGTTTACTATATTGCTTTGAATATTTTAAGTGACACAAACACAAGCCTATGTTCCTTATGTGCTTTCCTTCTTCACCCAATTGACCTCCTGTTACAGCATTTCAGACCATTTGGGGTAGGAATAGAAGTGGGGCAGGAAAGATTGCATAGGCTCACTCCAGTCCCCTGTCCTTACTTCTACTTGGACTCTGCCAAACTAGGGCATGCAACATCTTGTCTTCAGTGAGCGGCTCTGTAAGCTTAGGCATGTATGAATGCTCCTACATTAGAGAAATATCTTTAATATATAAAAGTCTTCATTCAGAAGAAGAGAAACAGTTGAGTAATATGGACTAAGGAGAAAGATGATAATCTATCCACTCATTTGCTCCCGACTTATTTTGTTTACTTTTCCTGTCTATGTTTTATCAGCTGTTCCAGAGTGCAGAGTAACCAGTAGTCATTCATTCACCAGTATTAATGCCTGGTACATGCAAAAGACTATTTGTTGCTATGACAGGGATATAAAACAAATGGACAATGAAGTACTTTGTCCCCTAAGACCTACACTCTAATTGTGGACATTAAACATAAACACATGAAATAATGGAAAAAGACTTTTATGATAGGTCATCAACTTTCTGTTCTCCTTCCTAGCAGCCCAGGGAAGATCCTTCATACCTGTACCACCCAGCACTGTACTAGCCACATAGTAAGCTC
Task1_train_31001
Given this variant in gene UBE2A (ubiquitin conjugating enzyme E2 A) on Chromosome X, classify it as benign or pathogenic. Include the disorder it may cause if applicable.
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability Nascimento type
TAGGAGCTGAGAGTAGTTCCCAGGTGGCAGCTAGTAAGGAAATAGGGACCAAAGTCCTACAACTGCAATGAACTGGGCTTGGCCAACAACTTGTAATTTGTTAAGCAGTGATGAAAACGAATATACTTGCTTTTGTAGATCTTGCTTTTGTTGATTTCATATGTGTGTATGTGTGTGTTAGTAGACTGCAAGTTCTTAGATGAGAGGAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTAATTTTTGTACCCCCTTCCTACTACAGCCATAATGTGATGCTATTAGGGAGACTTGCCTTAACTGATATGTTGGAGTTAATGGGAGATAGAAATCCTTGACCATGAAAGTACCTGTTGTTAAGCAGCAGCTAGAATCACTACCATTGTCAAGTGCCTCCTGCTTCTCATGTTAGAAACAAATTCCTGCACATCTGATATCTTCTGGACATCTTCACGGGGATGTCTCACCAGTCCCATGAACTCAGTAAGTCCCACCCAAAATTTCCTTTTCCAAACTTGTCCCTCTCTCTCTATTCTGTAATTCTGTTAATGGCACCTTCAAAACCCCAGTTATCTCGGGGCTTAGAGTTTCAGCCACTGTTGACTCCTTCCTCTCTCTTGCCCCATATTCAGCCTGTTGCCAAGTCCTCCCCATTCATTCATATCCTCGCCTTTATTGTCACTGCCTGCTTCAGTATCTCGCACCTAGATACTGCAAGAGTCTCCTGCCTGCTCTCTTGAGACCAATCTCTGATAAGGACAGCTCTAATGATGTCACTTCCCTGCTCAATGGACTTCCAAGGAATCCATTAGCTTGGCATTCAAAACTCTTGATGACTTAACCCAAATCTACCTTTCTCCTATTTTCAATAATTTTTAAATGTGTATTATGCCTATCTTCTAAGTTATTTTGGGTTGACCTTTAAAAATTATCCTTTAAAACTGTTATTGCTTTTGCAGGTCCACGGACTGTGACTCTTCCTGCAACCTGCAGCTTTTCCACGTTCCTTTTACTTCAGACCCACTGTCCTTGCAACTCCCTGCAGTCGGATAGTCTCATATCTTGGACTCTTCTGAACATAAATAGCCGCTTGGCTTGTTGAACTACCAAGGGGAAATGTGGTTCCAGAGCCAAATTGTGAGTGCCCAAAACAAAACAGAACAAAACAAAACCCTACTCCGCCTGCCTTAAGCTCCCATTCCCTCCCACAGGACATACAACACTATTTCATTCTGCCCTGGGGTGATCATTGGCCTAAACGTTGAGCGCCCAATCCTGCATTCAATCCCACAGCCCCGCCCCGCCCCCCCGTCATAGTCAAGGCCGATTTATTCTTTTGATTTTCCGTGATTTTAACCAATCACTCCTCTCCCCACCCCTCCGACCCCAGTCTCCGGTGTCCGAAGGGGTTGTGCACCCTAGAGTTGCCGCTTTTTGAGAACCGGTTTTACCTCCGCCCACTCCTTCGTCCTCTAGTTTGGGACTTCCAAACTTCTCCCCTCTCCTCCCCGGGCATAGTGCGCGCTTTCATGAATGATCTGGTCACAAAACAAACAAAAACGAATAGAAAAAGAAAAAAAGAGAAAAAGAAAAAAAGCCGAAAACTTCCCAGGGTTTGCCTTAGAATTAGCAGGTGGGGATGGACCCCGTTCCACCACGAGCTCCTCCAGCGCCCGGGGCTCCGGCGTACCCTACGCCTCTGCGCTCGCGGCCCCGCCCCGGGCCTCCCGTGGGGCTTTAATGACATAAGCAACTTTCCTCGCGCACCCCCCGCCCCGTCTTGGTACGGCCTGTCCGGCGCTCGACGTTCCACCCCCCTCTCTCTGCTCTCAGGTTGGTTCAGCCCCCGTCTACACTGGGGTGGTGCTTAGCCGGCGCCAGACCGACCCTCGACTTCGGAGAGGCAGCGCGGTTCCTCTGGGTGCTTCCGCCTCCCCTTCTCCTGCTTCTCCAGCCTCTTCGGCCTCCTCGCCCGCCGCGGGAACCCGAGACCCCAGTGTATGCCCCACCCCTGACCCCGCTCGCGACATGTCCACCCCGGCTCGGCGGCGCCTCATGCGGGACTTCAAGAGGTAAACCGAGGGGACGGCCGAGGCCGGGGGTTGCGAGCTGGGGCACAGGGCGGGTCCCGAGGCGCGCCGGGCGGGGAGGGCTGGGGAGCGGCCGGGAGCGGGCGCCAGTGCCGGCCTAGGGGGACCCCTGTCTGTCTTCCCGAAGGTTGCAGGAGGATCCTCCAGCCGGAGTCAGCGGGGCTCCGTCCGAGAACAACATAATGGTGTGGAACGCGGTCATTTTCGGGTGAGTCTGCGTTCGTGGCGGTGGCGAGAAAACTGGGGACGCGAGCAGCTTCGGTCTGCGCTCCGGGGCGGGCCCCCCGCGGAGGCCGAGCGGGTAGGGGAAAATGTTTGGGTCTGGCTGGGCCTAGGCGCCTCCCCGGAGCCTGTGCCTCGATTAGCTCAGTTCCCGCTGCCAGGGGGAACCGCTTGGGGTTCTAGGGGGGCGGGGCGGGGAGTGGTGGCGGTTAGGCGCGGCGGCTTGCCCTGTGTCTCTGAGCCCGGGACATCCATTTGTAGTGGCTTCCGACCCCGGTAGCGGTGCTGGAGATGGCAGAGCTCGGGATAGCCATCTCAGATGAAGCAGGGAGAAGGGGGCCCCTTAAGTGGGAACTGACCATTTTTCTCTGTGTTGCAGGCCTGAAGGGACCCCGTTTGAGGATGGTAAGAGAGAGTTTCTTTACCCACTTTTCAGGAGCCTGGTCATCTGGGGAAAGGGTTCCCAGTCATCCTGGAAGTGTCTCCTGCTTAGGAACCTGCCTCTGCCTAGCCTCTGTCTGCTAAAGGCTTGAGTGGAATGCAGTGTGTGGCTGGTGGTTCTGGATATTGTATGCTTGACTAGAACTGCACCTTTCTTCTTGCTTTCTTAAAAAAAAAATCTGTGTAAGGCAGTCACTTTTTAAAAGGAGCAATCATAGCACTGGTATTAAGGATTTTTGAGGCTTGGGCTGTAATTCTGCTAAATTCAGCCCTCCATCACTGAATTAGTATAAACCCAACCAGTTGCTGATAGGCAGCAGAGACCCCAGAGACCATCTGGTTCAGAATTCTACCCCAAGGGCAGGAGTTGTGTTCAGCAGGTGCTTGGTAGATGTGTGTTGGATGTTGAGTGGATGCGAGAATCCCTTGCGTACAACTGTCTGGTTTCTACAATCTGACATTGAATGCCTGTCAGCCTCACTGCTCTAAGATGGTCTTAAATGCCTCATTTGAGTACAGTATTCTTTCTTATTTTTAAGTGAATTTGCAGTGTGTGCTTTCATCAAGACGTTATGATGAGTAATTTCAAAGCAGCTTCACAATTGAAGTTAGCCTTAATGTACCCTTTTGATCAGTGTCCTGCCTACCTGAAAGTACTACATGTACCAGTAGGTACATAATTTTTAATTGATTTAGGTTTAACTTTTAAAAACACGTGTAAATTGCTTTTTAAAAACTTTCTGATTTTAGATAATTATAGATTCATATGCAGTTGCAAGAAATAATAGAGACACCCTTTATACCCTTAACCCAGTCCTCTACCCAAACCCTCCCATTTGGTAACATCTTGAATGACTAGACCCTATCACAACCGGAAAAATGACACTGATAGTTCTACACTCAGTTGTGTGTGTGTGTGGTTGTTTTTTGAAAGTTTAATACATTTAAAGGATGATTAAAGTATTTGAACTCATGAAATTCTTTAATATTTGAGGTTTTAAAAAAAAGGAAAAGGATCTTTCTGTTATTTTTTTCCTCAATGATTTCCTTCGGTCACATAGCATTTATACACACACACACACACACACACACTTCAGTTTGAAGGTGGGAACAAAAACATTTCTGCAAACTACTTAATACATACTTATGTTGCTGAGCCGGATTGCTTTTTGATGCTACCAGTCCACAAAATGTTGTGAGGTAAGTCAATTTCAACTAAGTCTGTAATTCATCTCAAGTACTTAGATTTCCCCAGGAAACTGTGGACAGTCACCTGAATATTTTTAGCTTCCTCTTTACCTTTACCCCCTGGGTAAATATCATTACTCTTCAGGGCTGCAAAGAAAAGAAATGA
TAGGAGCTGAGAGTAGTTCCCAGGTGGCAGCTAGTAAGGAAATAGGGACCAAAGTCCTACAACTGCAATGAACTGGGCTTGGCCAACAACTTGTAATTTGTTAAGCAGTGATGAAAACGAATATACTTGCTTTTGTAGATCTTGCTTTTGTTGATTTCATATGTGTGTATGTGTGTGTTAGTAGACTGCAAGTTCTTAGATGAGAGGAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTAATTTTTGTACCCCCTTCCTACTACAGCCATAATGTGATGCTATTAGGGAGACTTGCCTTAACTGATATGTTGGAGTTAATGGGAGATAGAAATCCTTGACCATGAAAGTACCTGTTGTTAAGCAGCAGCTAGAATCACTACCATTGTCAAGTGCCTCCTGCTTCTCATGTTAGAAACAAATTCCTGCACATCTGATATCTTCTGGACATCTTCACGGGGATGTCTCACCAGTCCCATGAACTCAGTAAGTCCCACCCAAAATTTCCTTTTCCAAACTTGTCCCTCTCTCTCTATTCTGTAATTCTGTTAATGGCACCTTCAAAACCCCAGTTATCTCGGGGCTTAGAGTTTCAGCCACTGTTGACTCCTTCCTCTCTCTTGCCCCATATTCAGCCTGTTGCCAAGTCCTCCCCATTCATTCATATCCTCGCCTTTATTGTCACTGCCTGCTTCAGTATCTCGCACCTAGATACTGCAAGAGTCTCCTGCCTGCTCTCTTGAGACCAATCTCTGATAAGGACAGCTCTAATGATGTCACTTCCCTGCTCAATGGACTTCCAAGGAATCCATTAGCTTGGCATTCAAAACTCTTGATGACTTAACCCAAATCTACCTTTCTCCTATTTTCAATAATTTTTAAATGTGTATTATGCCTATCTTCTAAGTTATTTTGGGTTGACCTTTAAAAATTATCCTTTAAAACTGTTATTGCTTTTGCAGGTCCACGGACTGTGACTCTTCCTGCAACCTGCAGCTTTTCCACGTTCCTTTTACTTCAGACCCACTGTCCTTGCAACTCCCTGCAGTCGGATAGTCTCATATCTTGGACTCTTCTGAACATAAATAGCCGCTTGGCTTGTTGAACTACCAAGGGGAAATGTGGTTCCAGAGCCAAATTGTGAGTGCCCAAAACAAAACAGAACAAAACAAAACCCTACTCCGCCTGCCTTAAGCTCCCATTCCCTCCCACAGGACATACAACACTATTTCATTCTGCCCTGGGGTGATCATTGGCCTAAACGTTGAGCGCCCAATCCTGCATTCAATCCCACAGCCCCGCCCCGCCCCCCCGTCATAGTCAAGGCCGATTTATTCTTTTGATTTTCCGTGATTTTAACCAATCACTCCTCTCCCCACCCCTCCGACCCCAGTCTCCGGTGTCCGAAGGGGTTGTGCACCCTAGAGTTGCCGCTTTTTGAGAACCGGTTTTACCTCCGCCCACTCCTTCGTCCTCTAGTTTGGGACTTCCAAACTTCTCCCCTCTCCTCCCCGGGCATAGTGCGCGCTTTCATGAATGATCTGGTCACAAAACAAACAAAAACGAATAGAAAAAGAAAAAAAGAGAAAAAGAAAAAAAGCCGAAAACTTCCCAGGGTTTGCCTTAGAATTAGCAGGTGGGGATGGACCCCGTTCCACCACGAGCTCCTCCAGCGCCCGGGGCTCCGGCGTACCCTACGCCTCTGCGCTCGCGGCCCCGCCCCGGGCCTCCCGTGGGGCTTTAATGACATAAGCAACTTTCCTCGCGCACCCCCCGCCCCGTCTTGGTACGGCCTGTCCGGCGCTCGACGTTCCACCCCCCTCTCTCTGCTCTCAGGTTGGTTCAGCCCCCGTCTACACTGGGGTGGTGCTTAGCCGGCGCCAGACCGACCCTCGACTTCGGAGAGGCAGCGCGGTTCCTCTGGGTGCTTCCGCCTCCCCTTCTCCTGCTTCTCCAGCCTCTTCGGCCTCCTCGCCCGCCGCGGGAACCCGAGACCCCAGTGTATGCCCCACCCCTGACCCCGCTCGCGACATGTCCACCCCGGCTCGGCGGCGCCTCATGCAGGACTTCAAGAGGTAAACCGAGGGGACGGCCGAGGCCGGGGGTTGCGAGCTGGGGCACAGGGCGGGTCCCGAGGCGCGCCGGGCGGGGAGGGCTGGGGAGCGGCCGGGAGCGGGCGCCAGTGCCGGCCTAGGGGGACCCCTGTCTGTCTTCCCGAAGGTTGCAGGAGGATCCTCCAGCCGGAGTCAGCGGGGCTCCGTCCGAGAACAACATAATGGTGTGGAACGCGGTCATTTTCGGGTGAGTCTGCGTTCGTGGCGGTGGCGAGAAAACTGGGGACGCGAGCAGCTTCGGTCTGCGCTCCGGGGCGGGCCCCCCGCGGAGGCCGAGCGGGTAGGGGAAAATGTTTGGGTCTGGCTGGGCCTAGGCGCCTCCCCGGAGCCTGTGCCTCGATTAGCTCAGTTCCCGCTGCCAGGGGGAACCGCTTGGGGTTCTAGGGGGGCGGGGCGGGGAGTGGTGGCGGTTAGGCGCGGCGGCTTGCCCTGTGTCTCTGAGCCCGGGACATCCATTTGTAGTGGCTTCCGACCCCGGTAGCGGTGCTGGAGATGGCAGAGCTCGGGATAGCCATCTCAGATGAAGCAGGGAGAAGGGGGCCCCTTAAGTGGGAACTGACCATTTTTCTCTGTGTTGCAGGCCTGAAGGGACCCCGTTTGAGGATGGTAAGAGAGAGTTTCTTTACCCACTTTTCAGGAGCCTGGTCATCTGGGGAAAGGGTTCCCAGTCATCCTGGAAGTGTCTCCTGCTTAGGAACCTGCCTCTGCCTAGCCTCTGTCTGCTAAAGGCTTGAGTGGAATGCAGTGTGTGGCTGGTGGTTCTGGATATTGTATGCTTGACTAGAACTGCACCTTTCTTCTTGCTTTCTTAAAAAAAAAATCTGTGTAAGGCAGTCACTTTTTAAAAGGAGCAATCATAGCACTGGTATTAAGGATTTTTGAGGCTTGGGCTGTAATTCTGCTAAATTCAGCCCTCCATCACTGAATTAGTATAAACCCAACCAGTTGCTGATAGGCAGCAGAGACCCCAGAGACCATCTGGTTCAGAATTCTACCCCAAGGGCAGGAGTTGTGTTCAGCAGGTGCTTGGTAGATGTGTGTTGGATGTTGAGTGGATGCGAGAATCCCTTGCGTACAACTGTCTGGTTTCTACAATCTGACATTGAATGCCTGTCAGCCTCACTGCTCTAAGATGGTCTTAAATGCCTCATTTGAGTACAGTATTCTTTCTTATTTTTAAGTGAATTTGCAGTGTGTGCTTTCATCAAGACGTTATGATGAGTAATTTCAAAGCAGCTTCACAATTGAAGTTAGCCTTAATGTACCCTTTTGATCAGTGTCCTGCCTACCTGAAAGTACTACATGTACCAGTAGGTACATAATTTTTAATTGATTTAGGTTTAACTTTTAAAAACACGTGTAAATTGCTTTTTAAAAACTTTCTGATTTTAGATAATTATAGATTCATATGCAGTTGCAAGAAATAATAGAGACACCCTTTATACCCTTAACCCAGTCCTCTACCCAAACCCTCCCATTTGGTAACATCTTGAATGACTAGACCCTATCACAACCGGAAAAATGACACTGATAGTTCTACACTCAGTTGTGTGTGTGTGTGGTTGTTTTTTGAAAGTTTAATACATTTAAAGGATGATTAAAGTATTTGAACTCATGAAATTCTTTAATATTTGAGGTTTTAAAAAAAAGGAAAAGGATCTTTCTGTTATTTTTTTCCTCAATGATTTCCTTCGGTCACATAGCATTTATACACACACACACACACACACACACTTCAGTTTGAAGGTGGGAACAAAAACATTTCTGCAAACTACTTAATACATACTTATGTTGCTGAGCCGGATTGCTTTTTGATGCTACCAGTCCACAAAATGTTGTGAGGTAAGTCAATTTCAACTAAGTCTGTAATTCATCTCAAGTACTTAGATTTCCCCAGGAAACTGTGGACAGTCACCTGAATATTTTTAGCTTCCTCTTTACCTTTACCCCCTGGGTAAATATCATTACTCTTCAGGGCTGCAAAGAAAAGAAATGA
Task1_train_31002
A mutation in UBE2A (ubiquitin conjugating enzyme E2 A), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability Nascimento type
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GTAGACTGCAAGTTCTTAGATGAGAGGAAAAAAAGTTTTTTTTTTTTAATTTTTGTACCCCCTTCCTACTACAGCCATAATGTGATGCTATTAGGGAGACTTGCCTTAACTGATATGTTGGAGTTAATGGGAGATAGAAATCCTTGACCATGAAAGTACCTGTTGTTAAGCAGCAGCTAGAATCACTACCATTGTCAAGTGCCTCCTGCTTCTCATGTTAGAAACAAATTCCTGCACATCTGATATCTTCTGGACATCTTCACGGGGATGTCTCACCAGTCCCATGAACTCAGTAAGTCCCACCCAAAATTTCCTTTTCCAAACTTGTCCCTCTCTCTCTATTCTGTAATTCTGTTAATGGCACCTTCAAAACCCCAGTTATCTCGGGGCTTAGAGTTTCAGCCACTGTTGACTCCTTCCTCTCTCTTGCCCCATATTCAGCCTGTTGCCAAGTCCTCCCCATTCATTCATATCCTCGCCTTTATTGTCACTGCCTGCTTCAGTATCTCGCACCTAGATACTGCAAGAGTCTCCTGCCTGCTCTCTTGAGACCAATCTCTGATAAGGACAGCTCTAATGATGTCACTTCCCTGCTCAATGGACTTCCAAGGAATCCATTAGCTTGGCATTCAAAACTCTTGATGACTTAACCCAAATCTACCTTTCTCCTATTTTCAATAATTTTTAAATGTGTATTATGCCTATCTTCTAAGTTATTTTGGGTTGACCTTTAAAAATTATCCTTTAAAACTGTTATTGCTTTTGCAGGTCCACGGACTGTGACTCTTCCTGCAACCTGCAGCTTTTCCACGTTCCTTTTACTTCAGACCCACTGTCCTTGCAACTCCCTGCAGTCGGATAGTCTCATATCTTGGACTCTTCTGAACATAAATAGCCGCTTGGCTTGTTGAACTACCAAGGGGAAATGTGGTTCCAGAGCCAAATTGTGAGTGCCCAAAACAAAACAGAACAAAACAAAACCCTACTCCGCCTGCCTTAAGCTCCCATTCCCTCCCACAGGACATACAACACTATTTCATTCTGCCCTGGGGTGATCATTGGCCTAAACGTTGAGCGCCCAATCCTGCATTCAATCCCACAGCCCCGCCCCGCCCCCCCGTCATAGTCAAGGCCGATTTATTCTTTTGATTTTCCGTGATTTTAACCAATCACTCCTCTCCCCACCCCTCCGACCCCAGTCTCCGGTGTCCGAAGGGGTTGTGCACCCTAGAGTTGCCGCTTTTTGAGAACCGGTTTTACCTCCGCCCACTCCTTCGTCCTCTAGTTTGGGACTTCCAAACTTCTCCCCTCTCCTCCCCGGGCATAGTGCGCGCTTTCATGAATGATCTGGTCACAAAACAAACAAAAACGAATAGAAAAAGAAAAAAAGAGAAAAAGAAAAAAAGCCGAAAACTTCCCAGGGTTTGCCTTAGAATTAGCAGGTGGGGATGGACCCCGTTCCACCACGAGCTCCTCCAGCGCCCGGGGCTCCGGCGTACCCTACGCCTCTGCGCTCGCGGCCCCGCCCCGGGCCTCCCGTGGGGCTTTAATGACATAAGCAACTTTCCTCGCGCACCCCCCGCCCCGTCTTGGTACGGCCTGTCCGGCGCTCGACGTTCCACCCCCCTCTCTCTGCTCTCAGGTTGGTTCAGCCCCCGTCTACACTGGGGTGGTGCTTAGCCGGCGCCAGACCGACCCTCGACTTCGGAGAGGCAGCGCGGTTCCTCTGGGTGCTTCCGCCTCCCCTTCTCCTGCTTCTCCAGCCTCTTCGGCCTCCTCGCCCGCCGCGGGAACCCGAGACCCCAGTGTATGCCCCACCCCTGACCCCGCTCGCGACATGTCCACCCCGGCTCGGCGGCGCCTCATGCGGGACTTCAAGAGGTAAACCGAGGGGACGGCCGAGGCCGGGGGTTGCGAGCTGGGGCACAGGGCGGGTCCCGAGGCGCGCCGGGCGGGGAGGGCTGGGGAGCGGCCGGGAGCGGGCGCCAGTGCCGGCCTAGGGGGACCCCTGTCTGTCTTCCCGAAGGTTGCAGGAGGATCCTCCAGCCAGAGTCAGCGGGGCTCCGTCCGAGAACAACATAATGGTGTGGAACGCGGTCATTTTCGGGTGAGTCTGCGTTCGTGGCGGTGGCGAGAAAACTGGGGACGCGAGCAGCTTCGGTCTGCGCTCCGGGGCGGGCCCCCCGCGGAGGCCGAGCGGGTAGGGGAAAATGTTTGGGTCTGGCTGGGCCTAGGCGCCTCCCCGGAGCCTGTGCCTCGATTAGCTCAGTTCCCGCTGCCAGGGGGAACCGCTTGGGGTTCTAGGGGGGCGGGGCGGGGAGTGGTGGCGGTTAGGCGCGGCGGCTTGCCCTGTGTCTCTGAGCCCGGGACATCCATTTGTAGTGGCTTCCGACCCCGGTAGCGGTGCTGGAGATGGCAGAGCTCGGGATAGCCATCTCAGATGAAGCAGGGAGAAGGGGGCCCCTTAAGTGGGAACTGACCATTTTTCTCTGTGTTGCAGGCCTGAAGGGACCCCGTTTGAGGATGGTAAGAGAGAGTTTCTTTACCCACTTTTCAGGAGCCTGGTCATCTGGGGAAAGGGTTCCCAGTCATCCTGGAAGTGTCTCCTGCTTAGGAACCTGCCTCTGCCTAGCCTCTGTCTGCTAAAGGCTTGAGTGGAATGCAGTGTGTGGCTGGTGGTTCTGGATATTGTATGCTTGACTAGAACTGCACCTTTCTTCTTGCTTTCTTAAAAAAAAAATCTGTGTAAGGCAGTCACTTTTTAAAAGGAGCAATCATAGCACTGGTATTAAGGATTTTTGAGGCTTGGGCTGTAATTCTGCTAAATTCAGCCCTCCATCACTGAATTAGTATAAACCCAACCAGTTGCTGATAGGCAGCAGAGACCCCAGAGACCATCTGGTTCAGAATTCTACCCCAAGGGCAGGAGTTGTGTTCAGCAGGTGCTTGGTAGATGTGTGTTGGATGTTGAGTGGATGCGAGAATCCCTTGCGTACAACTGTCTGGTTTCTACAATCTGACATTGAATGCCTGTCAGCCTCACTGCTCTAAGATGGTCTTAAATGCCTCATTTGAGTACAGTATTCTTTCTTATTTTTAAGTGAATTTGCAGTGTGTGCTTTCATCAAGACGTTATGATGAGTAATTTCAAAGCAGCTTCACAATTGAAGTTAGCCTTAATGTACCCTTTTGATCAGTGTCCTGCCTACCTGAAAGTACTACATGTACCAGTAGGTACATAATTTTTAATTGATTTAGGTTTAACTTTTAAAAACACGTGTAAATTGCTTTTTAAAAACTTTCTGATTTTAGATAATTATAGATTCATATGCAGTTGCAAGAAATAATAGAGACACCCTTTATACCCTTAACCCAGTCCTCTACCCAAACCCTCCCATTTGGTAACATCTTGAATGACTAGACCCTATCACAACCGGAAAAATGACACTGATAGTTCTACACTCAGTTGTGTGTGTGTGTGGTTGTTTTTTGAAAGTTTAATACATTTAAAGGATGATTAAAGTATTTGAACTCATGAAATTCTTTAATATTTGAGGTTTTAAAAAAAAGGAAAAGGATCTTTCTGTTATTTTTTTCCTCAATGATTTCCTTCGGTCACATAGCATTTATACACACACACACACACACACACACTTCAGTTTGAAGGTGGGAACAAAAACATTTCTGCAAACTACTTAATACATACTTATGTTGCTGAGCCGGATTGCTTTTTGATGCTACCAGTCCACAAAATGTTGTGAGGTAAGTCAATTTCAACTAAGTCTGTAATTCATCTCAAGTACTTAGATTTCCCCAGGAAACTGTGGACAGTCACCTGAATATTTTTAGCTTCCTCTTTACCTTTACCCCCTGGGTAAATATCATTACTCTTCAGGGCTGCAAAGAAAAGAAATGACAGCAGGAAACAGTGATTGTAAGGGCATACTACTTTGGCGCAGTTAATCATTTGAACTGATTTGTAGCAAAAAACTATAGCTAGACTTAATTTTCTTCTACCAGATTGGCACTAGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGACGGAGTTGCGCCCTGTCACCCAGGC
Task1_train_31003
A mutation in UBE2A (ubiquitin conjugating enzyme E2 A), located on Chromosome X, is being studied. Determine whether it’s pathogenic or benign, and specify the linked disease.
Pathogenic; not provided
ATCTCTTCATATCACATCTTAACAATTCTTGAATGAGATCCAGTTTGTCCATGCCTTGTAAGTAAGTTTATAACCTACTATGCTTTAGGGCCTCCTGCTACCTTAGGTTGACATATATTTAAGAAAAATAATTTCATTTCAATAGTAGCATAAACATTAGAAAAATAAATTTGCTGGAAACATGAATGCAATCTAAACCAAATGTGATTTTAAAATTATTTCTGCCATTAATTCCCTCCATATGTGTGAATAATTGAGTTGATTTTATAGTGAAGTACCTTATGAGCCATACTTAAGGGTTTCTGAGAGGGACTATGAAGTTTTTCCTGGCTTAAATTCAATTAAGTTTTCATTATAGGGTCACTATGACATGAAAAGGAACCAGTATGAACACTTTTATACTTATTCCCTTCTATTTTAAAAATAACTTGATTATGGATTTGTATTCTGGCATTGGTTTTTGAACCATTGTGCTTTCATTCTTTCTAGTCTGTCTAAAAATCACTGGAGCGTTTAAGATGGCAGCTGACTAACATAGGCCTTTGAGGTCTTTTGGTCTTCTAAAGGAAGAAGGCCAAATTTTGGGCCCAGTTTCTTAAGGATGTTTTCAAAATGTACAGTGGCTAAAATCTTGTAAGCAGTAATTTTGTGTTTATGATGGCTGTCTCCAAGTTTGGGGGAAAATAATGGCAAAACAAAAAATCACATTTGAGTAGTTCTTAGAGCAATTCCTAGAGATGTATTTCTTACCTGGCCTTTCCTCTCTACCCTGTATCTTTGCATTATTTAATACTTGGAAAAACCCACATAGCATTAAAAACAAAGTACTACTGAACAAAGTGATAAATACATTTTCTTAAATCTTTCTTTTCTAACCACAGGAACATTTAAACTTACAATAGAATTCACTGAAGAATATCCAAATAAACCACCTACAGTTAGATTTGTCTCTAAGATGTTCCATCCAAATGGCAAGTATCACTTTTAGTACAGTGTTTTAAACTACTATAGTGTTTATTATGGAGTATTCCACATTTCCTGTGTATTTTGTGGTGCCTGAGTATTTGTTTAGGCAGCTTGCTGCTTCTTGAAAGCTGAACTTGTTCTTGGTTGTCTGTGGCTGTCTTGTCCTAGAACTGAAGCAGTGGAGGTATTTTCCCTTTGCTTGGAGTCTGGGAGCCTCCTGATTTTGATGACCTTTGTCATTTACTTATTAAACAAAATGAAGGATGCTCTTGAGGTTTCCTTTTAATGCTAGGCCAGATTGGGATAGTCTTGTGTTGTAATTATTTTCACTAGCGTTTAGAAAAGTAGTTTTCATTGGACGCATATCAGAATTACTGTGGAACATTTTAAAAACACAGATGCCTTCGCCCCACTCCAAACCTAATGAATAGGATTCTGTTGTTGAAGGCCAGGCATACGGTATTGTCAGAAAAGCACCACAGGTGATTCTAACTTAACCACTTTGCACTTTTTAAAATAGTAGTAAGCCTAGAACAGCTTGCCTTTTATTTAGGTTAATGAAGTATTTTTCAGGGTATCAGATATGTTTATCTTTATGCCAAAATGAAATCTTGTGAACTCTGAGTGATCTTTTGTTATTTCAGATAGGGGATACAGCCTACAAATTTGGTGGAATGAATTTCCCACATGTCTGTGGATAGCTAGGGACCCTGTTCAAAAATGTTTCTGATTTCCTGGATAATAGGGCAGCCTTTTCCAAAGGATGAACACTAAATATCTTCCAGTTTTATACTGATCACATCTGACATTCTCTGATCATCCTGATTATTTCACTAGTGGTGGTTATGACTTATCTTTTTAGGCAGTTAACTGGGAAGCAACATAGGAATCTTTAAACTTCAAAAGCAAAGTATTCTTGACTATTTTTGTTTTGTCTATAATGTTAAAACCTTAGTGGTCTTGTTACGTTTAATGTACCTACTTCTTTGTTCTTAGTCTATGCAGATGGTAGTATATGTCTGGACATACTTCAGAACCGTTGGAGTCCAACCTATGATGTGTCTTCCATTCTAACATCCATACAGGTGAATTTTTCCTTAATGTGACGAACTATAACTTTTAATATGTTTATATTAGCAATTGAATTGTTTTTGAAAGTCATAATGTAATAGATCTTTTTATTTTTGGTCAAAGCTTGTTTGTTTTATAGATGAAAAGTAGACCATTAAGACCCAAGTCAGCTGGGTACAGTCGCTCACACCTGTAACCTCAGCACTTTGGCAGGCCAAGGTGGGAGGATTGCTTGAGTTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCTTCTCCCTTAAAAAAAAAAAAAGCCGCATATATTTTCCTAGCTACTAGCAGATTCACATAACTCTGGGTTTGTATGCTAAAGACAAGAAATGTAGCTGTACTTAGGACAATTCAATTGAGTGTCACTACCTTATAAAATAGTTGTTTTGCATTAAGGAACTGACATTTTAAAAATTGTCTCTTTAGTCTCTGTTGGATGAACCCAATCCCAATAGTCCAGCAAACAGCCAGGCTGCTCAGCTGTACCAGGAGAACAAACGGGAATATGAAAAGCGTGTTTCTGCAATAGTAGAACAAAGCTGGCGTGATTGTTGACCCCGGGTACAGTTTAAAGAAGCTGGCCATAAGAAAAATATATATTGATGTGTTTGTCACCTCCCTACTCCTGTCATTACATTTACTTTATTAAAAGCAAAATAACTGTTGTGCTGTTTCCATCTTCCTTGCCAAGTTTTCCTACCCCTTCTACCCTCTCCTTAAACATCAGAAAACACCCTCTATGAAATCAAATGTACTGTACCTGGGTTACTTGCAAAAATTACTAATGCTTCAGTTTTTCTGTTGTATTTCATTTCCAGTTTTCAGGCAGTTATTTTTATTATTGTACTTTAAGCTTTTAAGATGAATTGTTATACAAGAGGTGCTTATGCTTAGCTTGATGACCAGGATGTTATTTTTAACAAAATGATTGCTGAAGTGTTTCATCCTGGCTGGTCCTTCACTTGTGTTGGATTTAGAAGTGAATGTGTTTGGAATATGGCCTACAGAGAATAGAAACAAATCCATGTAAACAATTTTGAAGGAGGCATGGGAGCTAAAAATCCTGTGATACTAAGATCTCAGTCATATGAATTACAACGTAGTATTTACTGGCAAGAAGGAGAAAGTTGAAGGACTCAGCTAAAGGAGTACAGCAATTGTAGTAACTGACACATCCTCTCTTTGCAAGCTGCTGACTGGGCACACTCATGCCAAGTTTCAGAATTATTGGTCTTCTGGGTTTTTGCTTTTTAAAAGAGGTGTGGGAGCAGAGGAATGGAAACAATCGTGAGTTTTTGAGCTAGGGAAAGTTGGAGCTCCTTTAATCTTTTTAAAGGATCAGTGCTGCCCTAAGTGAATAAACTCAATTGTCCATCTTTATTTTAGAGTTTTAATGAATTCAAGGAAGGGAGCATAGCATATCTGTGGCAAACTATTTTCCACTCAAATCCTGAGTTATTGCTGCATGCTTTAATTTCTTCCCTTTCAGCATCTGAGAACCTTAAAGCCAATGTCTGCGATCTTTTTTTGGATATTTATACTTTTAGATATATAGTACCTTTAAGTAGCAGTATGGGACAAGGCTTGTAAATGTTTTGTCTAATGTTCTATTGTCACCTTTTATGCATTTATCACTTCCAAATCTAACTTTGCACAAGTAACCCATGTAAAAAAAAATGTACATTTTTCAAAAGTTGTAAATAAAAATAACCTTAAAATTTCATAGTCAAGGTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCTCAGTATAAACTTTTTGTATTGGTTTCTTATTGGGATCTCATATGTACTCATTTCCCCCCTCAAACATTAAGGTAAAAGCAAAAATACTCATTCTGGGAGGGGAAAAGACAAGACAGATACTTCTGGAGAGAACTTTTTTTTTCTTTCCAGTCATAAGTGGTAATGCTTTTTAAATATATTAACAGAATATGTTGCCGGGCACAGTGGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAGGGCGGGCAGATCACGAGGTCAG
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Task1_train_31004
This variant lies on Chromosome X and affects the gene UPF3B (UPF3B regulator of nonsense mediated mRNA decay). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 14
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Task1_train_31005
The gene LOC130068621, NDUFA1 (ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 29902| NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; Mitochondrial complex 1 deficiency, nuclear type 12
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Task1_train_31006
This alteration in NDUFA1 (NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A1) on Chromosome X may affect gene function. Does it lead to a disease or is it benign?
Pathogenic; Mitochondrial complex 1 deficiency, nuclear type 12
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Task1_train_31007
Gene NKAP (NFKB activating protein) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; not provided
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Task1_train_31008
A genetic alteration is present in NKAP (NFKB activating protein) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Intellectual developmental disorder, X-linked, syndromic, Hackmann-Di Donato type
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Task1_train_31009
A variant has been detected on Chromosome X in NKAP (NFKB activating protein). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Intellectual developmental disorder, X-linked, syndromic, Hackmann-Di Donato type
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Task1_train_31010
Given this context: Chromosome X, gene LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Danon disease
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Task1_train_31011
Gene LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Hypertrophic cardiomyopathy
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACCGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
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Task1_train_31012
Gene LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Danon disease
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACCGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACTGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
Task1_train_31013
The following genetic variant occurs in LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Danon disease
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACCGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
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Task1_train_31014
This variant lies on Chromosome X and affects the gene LAMP2 (lysosomal associated membrane protein 2). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Cardiovascular phenotype
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACCGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
AAACCAAAGTTTCAAAGTAAGAGAAAGAGCACAGCTCATCTCTATTACAGGTGACTAGATAAACAGTCTTGAAGTGATGATACTAATACTGCAAACGATTTTAAACTGTAAACACAAATCTGGACTTAAAATTAGGGGAATAATGAAGGGGAGCCAGATAAAAAGTCCAAAAATAAAGCTACTAAAGGATCAAAATAATTGAAGTACATAAGCAAAACAGACAAAAGGGAAAATGAATTCTTGAAAATATTTTTAAAGTGTAACTAACGTCTTTAATCGCAAGAATGGTAGGGTGGAGAGCCCAATTTATTGTGGCCTAACCAAGTCAGACTAGGTATTCAACACCACTGCAAAAGTAGTCGAATGGCTCACAGTATATTCGCTTTTAAACACAGCTTCCACATTTCCTTCCAAACCATAGAATTAATGGTTGAAAAGGATGTGGATGCCTGGAATAGCTAGCTCTGCTCAACAGAGTTGTGATCCACAAACCCCCAATTTTAGGTAATAGGCTTAAAAGGACAAGTCAATTAAGGAATTTTATGTGCTTTTTTTCTTCATGCAAATTTTAATCTTGTAATGCCAAATATGTCTTTCATATTCGTATGAACACATTATAATGAGCCCTTCAAAAGGTTTCATTAAAAATCTAATAAATACCACCATTATCCCTGAGTGATCTTCAAAAAGCGTCATTCACACTGGCACATGCTTTGAAAACTCTCCAGATCGTTTTGGCTGGTAAAAACATAGTTCATGATATTTGAGGCTTTGCTACCGCTCTTTATCTTTTGTCTTAACAAAATCAGACCAAACTGCTTTCATTCAGGTATGAAAATGTTTCCAGTGAGAAGACGGCCTCAGGAAGCAGATGCAAGATGCTCAAAGCTGCTGCTCCCAAGTGCCATCTTCCCTACAAACTAAAACCCATACCTCAAATAAAGCTCACTTAAAGCTTCTATCAGTTTTAGCTTTAAGAACTTTTTTTGCAAATGATTTTAAGATCACAAAAACATCTCGGTTGAGCAAAATGATGAGCCAAATATAGAGTTGCACAATTTGGTCAAGGCTATGAATTCATATTCCTCTATTTCAACGTTTAAATGTCTATGATTCAAAGGAAAAGCCACCTGTCAACATAAGAACATAAATTATTAATGAAGTTTGCTTGATTCTTACCTGTAGAATACTTTCCTTGTGTCACATTGAAAGGCTGAACCCTTAGATCAAAGGTATTTATCTGAAATGCTCCAGACACTGAAACAGTCTGCTCTTTGTTGCACATATAAGAACTTCCCAGGGGGGCATCCCAGTAGCTGAGATTGTTATTTGCAATGCTGAAAACTTCAAAGAAAAGAAACAGGTTAGTAACTTCTTATCCTATCAACATCAAAAATGGGAAAGTTGGCCAGGCACAGTGGCTCACGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGTGGGCAGATCACGTGAGCCCAGGAGATCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACAAAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGGCATGATGGTGCACACCTGTAGTCCCAGCTACCTAGGAGGCTGAGGTGGGTAGTTGGCTTGAACCTGGGATTGAGCTGTGGTCACACCCCTGCAATCTGGCCTGGGCATAGAGCGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAACAGTCCTCAGGGTTTTTCAGTGAAGGCCTGGGGGACAAGATCAACCCACAAAAAGCAATTCTTACCATAACTAGGTTCCCTTATCTTTCTATAGATGTTTCTATAGTCTAAAAATCAGTCATATCCTTAATTATTATCTACTCTACTTTGAAAAAATGGGATACAGAAAAAGACAGAACATCATAGTTCTAAGTTACTGATTTTAAGGTATGATCAAGGTACACTTTTTACATAGCATCTTCTGTTTCATTAAATAAGGCACTATTTGGTAATAAGACCATTGTAATTTCTAATCCTTCAGGGTAATCCACAGTCTTTTTCCCCAGGCCAGTGCTTTGCTTACTGGAGCCATTAACCAAATACATGCTGATGTTCACTTCCTTCAGATAAAATCGGTTTTCATTTTTCTGTTTGAAAAAGAGCTTCCAGTTAATTAACATTTCACAACTGTCTACAGATAACAGATACGGTTAATACCCACAGAAGAAAAGCAATCTAACACTATTACACAGAAGAAGAAATCATGCGGTAGAATAAACTGCAACTAAGTAAAAGAGAACTCATAATCTGACAGAAATCCCTTTCCTCTGTATTTTGTTTCCAACTTTTGGAGCACAGGTGTAGTCATGTGGATCTCAGACACTTGAAGATTTATGGCCTCAATTTTATTCCTCCTGTCACTTGCTGAGCCCTCACCACCTCTAGCCTGGATCACAGCAGCCTCTTAAGTGGGCTCCCTGCCTTTCAGCCCCTCCAGTCCTAATCTTTCCTTTTCACTGCTATTATCTTTCTGAAGTACTCATCTGATCAGCCAGTCATTCTAATAATTTCAGAGTGCAAGTACTCCAGGAGCTACCAAAATGAACCACACTTCAATCCTGCCTTCACCCTGTTTGCAATCTGCCAGGGAAGGTAAGATAAACACATAAACAACCATATTACAAAAAAGAAAGTGAGAAGTCATGAAAATAGGAGAGAAATCACTTCCAAATAAGGGAGGAGAAAAAGTAATGCCAGCTTAGGGATGGGGCATTTTGAACCGGGCAGGATTCTCTTAGGAAACAAGTGGGAAAAGGGGTATTTGAGAGAGCAAGAGTATAAATAACGGTAGTTAGAAAATAAGCATAATCTCAAATTTTTATGCTAGCATTTGAGCACTTACTAAGTGCCCAGCACTGTTCTTAAAACTTTACATATGATGCTTCGCTGAGTAAGTACAACACTCCTATGCAATAGGTGCTGTTATCATCCCCATTTTGGGAGTATGGCTGCGGAGTCTATGTAATTATTATTACTATGTTCTCCTACCTCACAAGAAGTGCACAGAGGACAGGATGAGGGAAGCACCCTGAAGGAACTAAAGGAAACATAAGGTTCATAAAGAGGGAGTGAAGGCTGAAAATGCAGGCTGCATTGCATGGGAGAAAAGAAGGCTTGAACTACCCAGCCATGGACTTTAGATGTTACCTTGTTGGCAAAAGAGAAACATTGTGAGGCAGGCAGACCATGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAATCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAGTTCCAGCTATTTGGGCAGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCTGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGGTCTCGCTACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAAAGCGAGACTCTGTCAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAGGAAAAGAAGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAGAGAAACACTGATGGAGAGATGTGCTTTAGGAAGGTTAAGTTGATGTAGAACAATGGAGAAGGTGAGGAAGAGGAGCAATCAGGCAGGAGCTGTTTGAATGGTCCAGGCAAGAGGTAATGTGGACTGGACCCAGAGCAAAGGCAATGGGGAGTAAAAGCTAGGAGACAGACTTCAGAGAAATTTCAGGAAGAAGCATAATGGAGGACTTCACACCTTCATCACATCCCTCCTCGACTTAGGCTACATCTTGGCTTTGCATTCAAGACTCCACAATTTGTCCCAATGACTTTTCCACATTTTCACTAAACATATAACACTCCTCATTCTCCCAGCTGGTCTTGATTATGCCCTTTATCCAGGGATAACCTGCACTTTCCCACTTACTCTCCTTATCTCCCTACCAATACAAATCAGACCCATCCTTGAAGGCCCAGCTCAAATGCCATCTCTGCCATTAAACCTTCCTGACTCTCCTCCAGCCGGAATTAACCTCTCCCTCCTCCATTCTCCTGCAGCACTTTGTACTATTCTCTGGTCTGGCACTCATCCCATTTCATATACACCT
Task1_train_31015
The gene CUL4B (cullin 4B), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; not provided
GCTGGGCCGTTATAGGATCTCTTCTCCATTCTTTTCCCCAATACCACCTGCAGTCCCCACCTTTGAATACCCCTATGTGGCTTAAACACCTTGCAGCAACCCCCATTCCTCACCCCCCAGCCAGCCCAAGTCTCCAGTTTTTCACTTGCTCCACTGCCTGTCTGCAGGGAGTGACCTGGAGTAGGGAAGGAAAAAGAGGGGAAAAGGGCAAAGCAGATAAGCCCTATTCTGTAGCTACTATAGAATCCATAATCTTACTGACCCTGATTTTTTCTTAATTCTTTCACTTCCACTTCCCACCTTAGCAACACTGTGGGGTAAAGAAGTCACTACTAAAACCCAAAAGAGGAAAATCTAATTTGCCATCATTATCACCTATGATCTTAAACATTTCAAAACTACTTTCTACCTACATCTTCAAAACTGTGGATCTAGCTTTCTATCCCCAATGTCCCCAAAGGCTTTTATACAGCTGCATTATCACTTCTCCTCTCTCCCCATTGCAAGCTCTGAACATGCAAATTACCAAACGATAAGATGCTGAGGAAAGCCCTTTTCCCACTATAGCTCTTCTTGTACTGACTTCAGTTCAATACATTTTATTTTTATTTTTGTGTTATTCTGGGTGTTTGTCAAAAATAAATCCTAAAGTAGGTCAAATATACTTATATTTCACCAATTTTTTTTTCTACTGTGAATATCACCTCAGTTGCCATGAATTACAACAAACACGTTTCTATTTATCCTCTTTAGTACAAATCATAGCAAGCAGATAACTAAATACAACTAAGTTTGAGGAATTAAGAGTTTAACTCACTTTTACCTGTTTGAACTGAATCATGATGTCTTTAGAAAGTTCCATGTCTTTAAACATTCCTTCAAGTTTGCTGGTGAAAGCAGCTCCGCATTCTATTAAAGATGTTTGTACATGTATAATATTTTAAAGTGGTAAAAACAAAAGAGGTTTAAAAGTGGGAAACACGAAATACAAAACTTTAGTATGAAGTATGATCTGTAACTTTCATAAGAATAAAAAGAAATCCTTACCCCAAAGTGTATGCCCCATTAATTCAGAGTCAAACTCTTTAATCCTGTAGTAACCTTATCTACTATTTAGGTATAAAATAAATGGGAAATTTTTATACAAATAATAAAACCAAGAACAATGCTTTATCTTAAAAAAAACAACTCTGGATATTATGTACAATAAGTTGGAAACCTCAGGAGCTTGCTCAATTTATGTTTTCATCATATATACATAGACATGAGTGACAAAAGAGGAAATCGATTGAAAGGGTAAAAAGCTAACATTCTCCTTCAGGAATCAAAGAAAAGGAACAGAAAGAATGAGAAACCTACCATGTTTAAGTTTGGACAGCATTGATTTTTCAGCATCTACAGATGCACTCTTTCCGACTAACAGGCGCTTGGCTAAATCTTTCTTATAGAAGGCCTCAAAAACATCCTTGCCTATGTAAAAAGAAATGCAAAATTTATAATATTCCAATAAAAAGTACTGACAAAACTGCTTTAAAGTGCTTTAATAAAGCACACCATTATTCCAAGTTATTTTACTTTACACATTTTATTTAAGTTTGTTAAATGCAAGAAACAGTAGAGATCCATTTTTGTGCCAGACATTTCGAAGTCTTTATTGTAAAACTTTTTTGCATGTAACTGTCTTGATTGCATTAACTTTTCTTCAGAAAAGCTTTTGTGGACTGGTAGCTTTGGTGCCAATATTTAAGAGATTAAGCCAAGTAGCAAAAATCAAGGCACTTAATACTAGAAGAGCCAAAGCATAGGACAATCAGGTAACATTCCTCACGTATCCCCCCAATGAATTAAACACAATTTTAAATCTGTAATTTCCAAATAAATATTCCCTCCAGTTTGAATATACTTGCTAGCTTCTCTGTTGAGTGCTATTTTAAAAGAAAAATATTAAAACATTAGTAAATACTTACCATAGATAAATCTAAATATGATCATAATTTTATCCAACATTTTCTCAAGTTCTTCATCTGTAGCTTCTTTGTTGCCTGCACGAAGTTTTGAATCTACATACTTAGCTAAAATGGGGGAAAAGTTTGTTGTTTAATAACCGGGGAATACACGAGGTACTGGGCACTATATATACCCAAAGAGGAGTATGATACACTGAGTTTTTCAATACTTCAGAAATTTATATGCATTTTTAAAAGTCTCCAAAGTCAGGAAGATCAACTGACTTGTTCAGTGCCATAGAGCTAATAACATCAGGGCCTGAACACAAACCCAAGTGTTCTGACTCCAGATCAAATGTACTTCCCACTATACTGATGTTTATGAAAATAGGATACGGATATCCTGTGGGGGAGGTCTCATGTAGCCCTGTGAGGGCATCATGTAATCCAAGCCACGAAAAGACATGAGGAATCTTCTGGAGTATCCATTTTATAGGAATAGTAAGCAATCTTAAACATTACTTTTCTATTAAAATAAACCAGATACATCGTAGAGTAGAAGGTAAAATTTGCTACATGTTTACGGATACATAGTAGATAGGTTGCAACAAAATTTCATCCTTTTGGCAGAGGACCCTAGACCTTCTCAGGTTACCTCCTCCTCTGACACTAAGGGTACTTGGGTGGAAAAACCTGAGAAGCACTGTAGTGTATATCACATCCTTATGCTAAATGGGCCCAGATTATTAGGTTTATTTTTGCCCTGGACTTTTTTCTTTTTCACTGACAACTGTAATTTCATGCTGCCCTTTTTTGTAGCTTGAAATAACACCCTGCCTCATTTTTAAATCATTAGGCTAGGAAAACAGATTAGCTTATTATCAATAAAGGTAAATAGTGTCCAACGTACTGTCTTTGAAAGAAAGCACATTATGTTTGACATGTGGGCTTTCAGTACTTACATCCAGGTTTTTAGAAACACTCTTCAAACTTGATATACCAGCTAAGCAACCTCAAACAAATCAGGAATTAGTAATACTACAACCTGGTAAAAATTTCAGATTGAGATTTTATGACTCAAAGAACATCATTAAACAACTGGAAAAAGGACTGGAAAACATACCTATAAGTTCAGCTGGTTTATTTGGTCTTTTGTTAATGAACGTTTCAAATGCTTCTTTCATGGCATTGATAAATTTCTCATTCTTCAGAAAGCAGATATCAATTATATGGTCAACCTTATCTTTAAAATCCAGCAATTCTTGAACCATGGTTTTATCTTTTTCAGGATTAATTACAATAGTGCTGCCAAATGCCTAAAACAAAAAATTACCACTTTTTACTGTAATCGAATTGTCTACAATGAAAACAATCCCCAAATCATATTTTAAGTGGCATATATATTTAAAGATCTTTAAAAAGTAAGATAAAGCTATTTTTAAGATGGAATCTTGCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTGAAACTCCTAGGCTGAAAGGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAGTTACAGGCATGTACCACTGCACCTGGCAAAATAAAGCTGATAGTGAAATGAGGACAAAAAAATAAAGTGCTAAATATCCACACTGTTAACCACTCATCTATAATCACAAAAATAGTAAGCAATGATCACTGGGCATATGATATCATAACAGGGTATTATTAGAAGCCTCTGGGATCTTTTCCTTATTTTTAAAGAAGTCAGCTTTCAACTTCCTTAAAATGGCAATCTGGCTTTAGTGTAAGATTGAAGAAAGGAAAGAAATTTGGGGTTCAAAGTCTTTTTCTACATTTACTGCTTTAAGTGGTAGAGACAGAAATTATGTCAGCCATCAATCAGGTTTTATAGCTGATATGCCACACAGCTACCATTCTCAGGTTGACTGTTCTCAAAATTCCCATTACTTTTTAAACAAATTTAAAATTCCCTTAAAAGAACTGGATCAAGTCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCAAGGCCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCTAGCTACTTGGGAG
GCTGGGCCGTTATAGGATCTCTTCTCCATTCTTTTCCCCAATACCACCTGCAGTCCCCACCTTTGAATACCCCTATGTGGCTTAAACACCTTGCAGCAACCCCCATTCCTCACCCCCCAGCCAGCCCAAGTCTCCAGTTTTTCACTTGCTCCACTGCCTGTCTGCAGGGAGTGACCTGGAGTAGGGAAGGAAAAAGAGGGGAAAAGGGCAAAGCAGATAAGCCCTATTCTGTAGCTACTATAGAATCCATAATCTTACTGACCCTGATTTTTTCTTAATTCTTTCACTTCCACTTCCCACCTTAGCAACACTGTGGGGTAAAGAAGTCACTACTAAAACCCAAAAGAGGAAAATCTAATTTGCCATCATTATCACCTATGATCTTAAACATTTCAAAACTACTTTCTACCTACATCTTCAAAACTGTGGATCTAGCTTTCTATCCCCAATGTCCCCAAAGGCTTTTATACAGCTGCATTATCACTTCTCCTCTCTCCCCATTGCAAGCTCTGAACATGCAAATTACCAAACGATAAGATGCTGAGGAAAGCCCTTTTCCCACTATAGCTCTTCTTGTACTGACTTCAGTTCAATACATTTTATTTTTATTTTTGTGTTATTCTGGGTGTTTGTCAAAAATAAATCCTAAAGTAGGTCAAATATACTTATATTTCACCAATTTTTTTTTCTACTGTGAATATCACCTCAGTTGCCATGAATTACAACAAACACGTTTCTATTTATCCTCTTTAGTACAAATCATAGCAAGCAGATAACTAAATACAACTAAGTTTGAGGAATTAAGAGTTTAACTCACTTTTACCTGTTTGAACTGAATCATGATGTCTTTAGAAAGTTCCATGTCTTTAAACATTCCTTCAAGTTTGCTGGTGAAAGCAGCTCCGCATTCTATTAAAGATGTTTGTACATGTATAATATTTTAAAGTGGTAAAAACAAAAGAGGTTTAAAAGTGGGAAACACGAAATACAAAACTTTAGTATGAAGTATGATCTGTAACTTTCATAAGAATAAAAAGAAATCCTTACCCCAAAGTGTATGCCCCATTAATTCAGAGTCAAACTCTTTAATCCTGTAGTAACCTTATCTACTATTTAGGTATAAAATAAATGGGAAATTTTTATACAAATAATAAAACCAAGAACAATGCTTTATCTTAAAAAAAACAACTCTGGATATTATGTACAATAAGTTGGAAACCTCAGGAGCTTGCTCAATTTATGTTTTCATCATATATACATAGACATGAGTGACAAAAGAGGAAATCGATTGAAAGGGTAAAAAGCTAACATTCTCCTTCAGGAATCAAAGAAAAGGAACAGAAAGAATGAGAAACCTACCATGTTTAAGTTTGGACAGCATTGATTTTTCAGCATCTACAGATGCACTCTTTCCGACTAACAGGCGCTTGGCTAAATCTTTCTTATAGAAGGCCTCAAAAACATCCTTGCCTATGTAAAAAGAAATGCAAAATTTATAATATTCCAATAAAAAGTACTGACAAAACTGCTTTAAAGTGCTTTAATAAAGCACACCATTATTCCAAGTTATTTTACTTTACACATTTTATTTAAGTTTGTTAAATGCAAGAAACAGTAGAGATCCATTTTTGTGCCAGACATTTCGAAGTCTTTATTGTAAAACTTTTTTGCATGTAACTGTCTTGATTGCATTAACTTTTCTTCAGAAAAGCTTTTGTGGACTGGTAGCTTTGGTGCCAATATTTAAGAGATTAAGCCAAGTAGCAAAAATCAAGGCACTTAATACTAGAAGAGCCAAAGCATAGGACAATCAGGTAACATTCCTCACGTATCCCCCCAATGAATTAAACACAATTTTAAATCTGTAATTTCCAAATAAATATTCCCTCCAGTTTGAATATACTTGCTAGCTTCTCTGTTGAGTGCTATTTTAAAAGAAAAATATTAAAACATTAGTAAATACTTACCATAGATAAATCTAAATATGATCATAATTTTATCCAACATTTTCTCAAGTTCTTCATCTGTAGCTTCTTTGTTGCCTGCACAAAGTTTTGAATCTACATACTTAGCTAAAATGGGGGAAAAGTTTGTTGTTTAATAACCGGGGAATACACGAGGTACTGGGCACTATATATACCCAAAGAGGAGTATGATACACTGAGTTTTTCAATACTTCAGAAATTTATATGCATTTTTAAAAGTCTCCAAAGTCAGGAAGATCAACTGACTTGTTCAGTGCCATAGAGCTAATAACATCAGGGCCTGAACACAAACCCAAGTGTTCTGACTCCAGATCAAATGTACTTCCCACTATACTGATGTTTATGAAAATAGGATACGGATATCCTGTGGGGGAGGTCTCATGTAGCCCTGTGAGGGCATCATGTAATCCAAGCCACGAAAAGACATGAGGAATCTTCTGGAGTATCCATTTTATAGGAATAGTAAGCAATCTTAAACATTACTTTTCTATTAAAATAAACCAGATACATCGTAGAGTAGAAGGTAAAATTTGCTACATGTTTACGGATACATAGTAGATAGGTTGCAACAAAATTTCATCCTTTTGGCAGAGGACCCTAGACCTTCTCAGGTTACCTCCTCCTCTGACACTAAGGGTACTTGGGTGGAAAAACCTGAGAAGCACTGTAGTGTATATCACATCCTTATGCTAAATGGGCCCAGATTATTAGGTTTATTTTTGCCCTGGACTTTTTTCTTTTTCACTGACAACTGTAATTTCATGCTGCCCTTTTTTGTAGCTTGAAATAACACCCTGCCTCATTTTTAAATCATTAGGCTAGGAAAACAGATTAGCTTATTATCAATAAAGGTAAATAGTGTCCAACGTACTGTCTTTGAAAGAAAGCACATTATGTTTGACATGTGGGCTTTCAGTACTTACATCCAGGTTTTTAGAAACACTCTTCAAACTTGATATACCAGCTAAGCAACCTCAAACAAATCAGGAATTAGTAATACTACAACCTGGTAAAAATTTCAGATTGAGATTTTATGACTCAAAGAACATCATTAAACAACTGGAAAAAGGACTGGAAAACATACCTATAAGTTCAGCTGGTTTATTTGGTCTTTTGTTAATGAACGTTTCAAATGCTTCTTTCATGGCATTGATAAATTTCTCATTCTTCAGAAAGCAGATATCAATTATATGGTCAACCTTATCTTTAAAATCCAGCAATTCTTGAACCATGGTTTTATCTTTTTCAGGATTAATTACAATAGTGCTGCCAAATGCCTAAAACAAAAAATTACCACTTTTTACTGTAATCGAATTGTCTACAATGAAAACAATCCCCAAATCATATTTTAAGTGGCATATATATTTAAAGATCTTTAAAAAGTAAGATAAAGCTATTTTTAAGATGGAATCTTGCTATGTTGCCCAGGCTAGTCTGAAACTCCTAGGCTGAAAGGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGAGTTACAGGCATGTACCACTGCACCTGGCAAAATAAAGCTGATAGTGAAATGAGGACAAAAAAATAAAGTGCTAAATATCCACACTGTTAACCACTCATCTATAATCACAAAAATAGTAAGCAATGATCACTGGGCATATGATATCATAACAGGGTATTATTAGAAGCCTCTGGGATCTTTTCCTTATTTTTAAAGAAGTCAGCTTTCAACTTCCTTAAAATGGCAATCTGGCTTTAGTGTAAGATTGAAGAAAGGAAAGAAATTTGGGGTTCAAAGTCTTTTTCTACATTTACTGCTTTAAGTGGTAGAGACAGAAATTATGTCAGCCATCAATCAGGTTTTATAGCTGATATGCCACACAGCTACCATTCTCAGGTTGACTGTTCTCAAAATTCCCATTACTTTTTAAACAAATTTAAAATTCCCTTAAAAGAACTGGATCAAGTCCGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATTTGAGTTCAGGAGTTCAAGGCCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATCCTAGCTACTTGGGAG
Task1_train_31016
Here is a variant affecting CUL4B (cullin 4B) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; X-linked intellectual disability Cabezas type
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Task1_train_31017
Given this context: Chromosome X, gene CUL4B, LOC113845788 (cullin 4B| H3K27ac hESC enhancers GRCh37_chrX:119693886-119694771 and GRCh37_chrX:119694772-119695656) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; CUL4B-related disorder
CTCATTTAGTAAGCTTGCCCAAGGTCATCATAGCTAGTCAATGGCAAAGCTGGGATTCTAATTCAGGTCTGTTTGACCCCCACATTTATGCAGCATCTATAGAAATGGAAACATCTTAACTCAGGTTTTAAACTACATTTACGAGCAGAGTGAAATTTTTAAAGACTGAAAGAAATGACTCCAGAAACCATGTTGCATTTTCAGAATAGAAAGAAACATCTTACTCTAGGCTTTAAACTTCACTGACTAGCAATGAGTGTGGGGAAAAAAGTTTTAATTAGAATATCCAAATGCCTTAATAATATGCTTTTATTTTAGGAGGGAGAGAAAAAAATCTCTGAAACCAATTTGAAAATGCAACCAGGATCATAACTCATTTAAAAATCTTTAGCTACAAAATCCATATATTTTTAAGTGAAATAATGAAAACGTTACTCAATTACAATTCATATTGACTTCAGAAAGCTCTACTATTAAATCAGAAACTGAGAGCCTGGGTATGGGAAGGTAGTGATATAAAAAAGAAAGGGTTAAAAATAGACAACACCATAGCCCTCTGCTTGAGACAAAATAGAGCATACTCCTGATTTCCACACAATGTTAAAAACACAAGCATAGAGAACCTAATCTTCTCAATACTAATATTCAGCCACAAAGCACTTATCTCATAAATATTACTTAAGTTCATTCATTTACTTCTCTATTTAATAAACACTGTAGCACTGATTACCTGGCAGTTACGGGTGTTGAAAAAGTAAGTCAGAAAAACAGAAACACATTCAACAAATAAAAATTAATTCAGCTCAAATACATTTTTAAAAATTGCTGATTTTATATTTGCCTCAATGTATTCATAATACTCTCCTCACATATCTCAAACACGGTCTGAACAAATTTTCCTAAAAGCTGCAGGTCGATACTTTAAAATCCATTTTAGTGATGGAAAAAATAGATGTAGTAATTGTTCCTATCTTTAGACTAGTGGTACACAGAGTTACTACTTCTGTGTATACACAATGTTTTTCACTTTCAAACCCTACCTTTGGAAAGAAATGCAGAGAACATAAATTTTTCTTCAAATATTCCTTCCAAATGAGTTTCATGAATACAGTATAAATCTAATTATAAATCTTATTTGAGCATAAAAAGATCACTATTGCTACCTGCATTTCTAGGCATTGGATAATGTGGCCTACTGAAGCATAAAAATAAAAATCCCAGCAATGCCAAGGCTCGCTATGCACCTGAAATAAATAAACCTCTTTAGAATACAAATTTCTCACCTGCAAAATCCGGATCAATCATACCGATTGTCAGTGTTATAAGGAATAACAGATTAAATACAATAGGTTGAAAAAGACCTCAAAATACTGCACAGAAACACCCGGTGTATGCTTCAGCACAAGGATCCTAACCACCCCCGGAAAATGAACCCTCCACCAAAAAAGGACCTCCCCTCCACCTCATTGATTATGCATAAAACATTAGGCCACCTCCAAACTGTTTAATATATTAACATAAATAGAGCACGTGACCCCTCGAGTGTCAAATCCTTATTAGGTGATTATGGATTTTGGCCTTGGTTACCTTTAAAGTTCTTGATCACTAACTTCTTAGCAGAGCCAGGTTTGCTGTTAGCAAAGCTAGAGACGGTGGTAGAAGATTTGGCTAGGCCGTTTGCATGATGCACCGAAGCCACAGAAGAGATTAATATACTCTTATTTTTAAGTTGCTGCTGCTGAGATGTTGCAGCAGTTGGTGAAGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATTCCTCAGCCATCTTCGCATCAAACCCTACAAACTCCAGGGTGTCTTCAAAACGCAGCTTCTTCTGTATCGGTACGTGGCTGGAAGCAGCCACTGAAACCCCCAGGCAGAAGGACGAGGTTGAAGGGGATGCCGAATCCCTGGGTTGTAAAGGAGGAGTGGAAGAGGAGGAAGAGGTGGAATCAAAGTCTTCTCTCTCGTTACTACTGTTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTTAACTTTCTCTTCTTGGCAGAGGTGGGCGGAGTGGTGCTGGTATTACCATCAGTGGCAGATCTGACCTCCTGAGCAGCAGCAGCAGCTGAGGGACTGGGGGAAGAAAAACCTGTTGGAAACATGAAAATAGCGGGGTCAACAGGCAGAGGAGCATCAAAAACCTACGTTTATATGCCTGCGTGCGTGTAGGAGAGAAGGTAGCAATGCTAGAGGGGGAAGGGAAGAAAGAAGAGAGGAGAAACACAGAGGACGAGAAGGAAAGTGAAGGGGGGGGCTACACCGGGGGAATGGGAGGGTTTGGGAAGGCGGATAGGCTGACACCAGGAGTGAGCAGAACGAGGGGGGAGAGCGAATGAGGAGGCAGACAGGTAAACGGCCGTGCCGTCCCCCTCCCCTGCTTTTCGATCTCTCTCCCCCCCTTTCTGCAGGAGCGACTCAGCGAGTCTGTGAGGCTGCAGCTCCTCCTCCTTTTCTCCCTCTCCCTGGGAGGGGAGAGGCTGTGGTTGGGGGAAAGGGGGAGGGGGAAAGAACCAGGGCTTGTTATTGTCAATAGCACAAGAGGCTAAAGATGGCGCCATTTCCGGTCACGCGGCGCCGAGGGAGGGGCGGTGTCAACCTCAGGGAGTGGGGGTGAGGGAAGCGCTGCAGCCGCCCGGGGGGCGGGGGAGCTCGCGCGTGAGGGGGCGGCTGGAAAGGGGCGGCTAAAGTGCCCCAGACGCTCGCGCTAGTTCGCTCCTGCTCCCGCTCCCCTTCGCGATCCCCTTTCCTGGCAGCGCCTTCCTTCCCTGGCCCACCGGGAACTCCCACTCCCTCCTTAACGGTCCCGCGGGAAGCTTCGCGCCGCAGCGCCCTTACCGGAAGTGACTGGGCAGACACTTTTCATAGCGCCCAGATCCCGAAGCCCCCAGGTCCGCAGGACTTGAGTGGGGGGGGGAAGGGGGGAGGGAGAAATTGGGGGGAAGAAAAGTGGATAGGAGGAGGGGGCGGGCCTTCGAGACACCTTCGGAGCTCCTGATTGGAGCTTTCTGAAGGCGAGGGGGTGGGGGGGGTGGCGGGAGGAGCGGGAAGGAGCCTCGGGGGAGGGAAGGTAGTGACGGCGAGGGGCGGAGTGAGCTAGCTGGGAAAACGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGAGAGGGAGGGACGGAATAAAACGTAAGGGTCCGGGAGAATAGAAACTTTGAAAGAGATGAAAGAATAAGGAGTGGTTGCAAGGCTAGGGGAGTAACCCTAAATAGAGGAAAACATAATCATGCCATTATGCCCGCTGCTGGAGAGGAATGTCCCTATGTTAAGATAGGAAAGGAGAAGAAAACGAGCTAAGATAGGAAGAAAAGGACTTTTTAATTCGGTGCCGGTATAAATTGTTTCTCTTTTATCTCAAGGCACCACAGACCCAAGGCTGAATAAGGCCTGAATTTTGATGCCTTTCTCTTTCATGTAGCTGTAAATCCTTTTATCTTACTACCAGGAGCATTTTCTAAGCTGGCTGGCCAAATTAAGTGTGTATTCTAAGGCGAAGAAATGGAAAGGTAACTAACCCCTCACCCACCCAGCACTATGCCCAGGATCGTCCTAACCCCCACTCTATCAGTCCTTAACTCAGTAATTTATAGACCCAACAAAGCTAAGACCCACTTCCTTCTTTTGCCAAATCTCAGTTTACACGCTGTCCCAAAGGAGACATTTTAGAACCATATCGGCAAAAGTCAGTGTTTTCTACTAATGTGTTTCATGACCCCATGCTTTACAATTGATTATTGATTTAAAAAATCTTTAAGTTTGGTTAAATTAGCAACAATAAACCTTGTAAATTCCCTGTTGGGAGTTTTTACTTAACCTTGGGGCATTCTCAGAGGGAGGTAACACAATATCAAAAACTAAATTTGCCAACCTGTTGATCATTCTAACTGCAAAAGCATTCAGTTAGCATGTATGGTAAGACTATGCAAGGTCTCTGCCCTTGAGAAGCCAGTAGGGGAAGATAGTTTCAAAACTAATTTCCATAACAATAATATGACATATATACAAAGTGCTGTCAGAAGAGGCAAAACAAGAA
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Task1_train_31018
A genomic change on Chromosome X affects CUL4B, LOC113845788 (cullin 4B| H3K27ac hESC enhancers GRCh37_chrX:119693886-119694771 and GRCh37_chrX:119694772-119695656). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked intellectual disability Cabezas type
CTCATTTAGTAAGCTTGCCCAAGGTCATCATAGCTAGTCAATGGCAAAGCTGGGATTCTAATTCAGGTCTGTTTGACCCCCACATTTATGCAGCATCTATAGAAATGGAAACATCTTAACTCAGGTTTTAAACTACATTTACGAGCAGAGTGAAATTTTTAAAGACTGAAAGAAATGACTCCAGAAACCATGTTGCATTTTCAGAATAGAAAGAAACATCTTACTCTAGGCTTTAAACTTCACTGACTAGCAATGAGTGTGGGGAAAAAAGTTTTAATTAGAATATCCAAATGCCTTAATAATATGCTTTTATTTTAGGAGGGAGAGAAAAAAATCTCTGAAACCAATTTGAAAATGCAACCAGGATCATAACTCATTTAAAAATCTTTAGCTACAAAATCCATATATTTTTAAGTGAAATAATGAAAACGTTACTCAATTACAATTCATATTGACTTCAGAAAGCTCTACTATTAAATCAGAAACTGAGAGCCTGGGTATGGGAAGGTAGTGATATAAAAAAGAAAGGGTTAAAAATAGACAACACCATAGCCCTCTGCTTGAGACAAAATAGAGCATACTCCTGATTTCCACACAATGTTAAAAACACAAGCATAGAGAACCTAATCTTCTCAATACTAATATTCAGCCACAAAGCACTTATCTCATAAATATTACTTAAGTTCATTCATTTACTTCTCTATTTAATAAACACTGTAGCACTGATTACCTGGCAGTTACGGGTGTTGAAAAAGTAAGTCAGAAAAACAGAAACACATTCAACAAATAAAAATTAATTCAGCTCAAATACATTTTTAAAAATTGCTGATTTTATATTTGCCTCAATGTATTCATAATACTCTCCTCACATATCTCAAACACGGTCTGAACAAATTTTCCTAAAAGCTGCAGGTCGATACTTTAAAATCCATTTTAGTGATGGAAAAAATAGATGTAGTAATTGTTCCTATCTTTAGACTAGTGGTACACAGAGTTACTACTTCTGTGTATACACAATGTTTTTCACTTTCAAACCCTACCTTTGGAAAGAAATGCAGAGAACATAAATTTTTCTTCAAATATTCCTTCCAAATGAGTTTCATGAATACAGTATAAATCTAATTATAAATCTTATTTGAGCATAAAAAGATCACTATTGCTACCTGCATTTCTAGGCATTGGATAATGTGGCCTACTGAAGCATAAAAATAAAAATCCCAGCAATGCCAAGGCTCGCTATGCACCTGAAATAAATAAACCTCTTTAGAATACAAATTTCTCACCTGCAAAATCCGGATCAATCATACCGATTGTCAGTGTTATAAGGAATAACAGATTAAATACAATAGGTTGAAAAAGACCTCAAAATACTGCACAGAAACACCCGGTGTATGCTTCAGCACAAGGATCCTAACCACCCCCGGAAAATGAACCCTCCACCAAAAAAGGACCTCCCCTCCACCTCATTGATTATGCATAAAACATTAGGCCACCTCCAAACTGTTTAATATATTAACATAAATAGAGCACGTGACCCCTCGAGTGTCAAATCCTTATTAGGTGATTATGGATTTTGGCCTTGGTTACCTTTAAAGTTCTTGATCACTAACTTCTTAGCAGAGCCAGGTTTGCTGTTAGCAAAGCTAGAGACGGTGGTAGAAGATTTGGCTAGGCCGTTTGCATGATGCACCGAAGCCACAGAAGAGATTAATATACTCTTATTTTTAAGTTGCTGCTGCTGAGATGTTGCAGCAGTTGGTGAAGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATTCCTCAGCCATCTTCGCATCAAACCCTACAAACTCCAGGGTGTCTTCAAAACGCAGCTTCTTCTGTATCGGTACGTGGCTGGAAGCAGCCACTGAAACCCCCAGGCAGAAGGACGAGGTTGAAGGGGATGCCGAATCCCTGGGTTGTAAAGGAGGAGTGGAAGAGGAGGAAGAGGTGGAATCAAAGTCTTCTCTCTCGTTACTACTGTTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTTAACTTTCTCTTCTTGGCAGAGGTGGGCGGAGTGGTGCTGGTATTACCATCAGTGGCAGATCTGACCTCCTGAGCAGCAGCAGCAGCTGAGGGACTGGGGGAAGAAAAACCTGTTGGAAACATGAAAATAGCGGGGTCAACAGGCAGAGGAGCATCAAAAACCTACGTTTATATGCCTGCGTGCGTGTAGGAGAGAAGGTAGCAATGCTAGAGGGGGAAGGGAAGAAAGAAGAGAGGAGAAACACAGAGGACGAGAAGGAAAGTGAAGGGGGGGGCTACACCGGGGGAATGGGAGGGTTTGGGAAGGCGGATAGGCTGACACCAGGAGTGAGCAGAACGAGGGGGGAGAGCGAATGAGGAGGCAGACAGGTAAACGGCCGTGCCGTCCCCCTCCCCTGCTTTTCGATCTCTCTCCCCCCCTTTCTGCAGGAGCGACTCAGCGAGTCTGTGAGGCTGCAGCTCCTCCTCCTTTTCTCCCTCTCCCTGGGAGGGGAGAGGCTGTGGTTGGGGGAAAGGGGGAGGGGGAAAGAACCAGGGCTTGTTATTGTCAATAGCACAAGAGGCTAAAGATGGCGCCATTTCCGGTCACGCGGCGCCGAGGGAGGGGCGGTGTCAACCTCAGGGAGTGGGGGTGAGGGAAGCGCTGCAGCCGCCCGGGGGGCGGGGGAGCTCGCGCGTGAGGGGGCGGCTGGAAAGGGGCGGCTAAAGTGCCCCAGACGCTCGCGCTAGTTCGCTCCTGCTCCCGCTCCCCTTCGCGATCCCCTTTCCTGGCAGCGCCTTCCTTCCCTGGCCCACCGGGAACTCCCACTCCCTCCTTAACGGTCCCGCGGGAAGCTTCGCGCCGCAGCGCCCTTACCGGAAGTGACTGGGCAGACACTTTTCATAGCGCCCAGATCCCGAAGCCCCCAGGTCCGCAGGACTTGAGTGGGGGGGGGAAGGGGGGAGGGAGAAATTGGGGGGAAGAAAAGTGGATAGGAGGAGGGGGCGGGCCTTCGAGACACCTTCGGAGCTCCTGATTGGAGCTTTCTGAAGGCGAGGGGGTGGGGGGGGTGGCGGGAGGAGCGGGAAGGAGCCTCGGGGGAGGGAAGGTAGTGACGGCGAGGGGCGGAGTGAGCTAGCTGGGAAAACGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGAGAGGGAGGGACGGAATAAAACGTAAGGGTCCGGGAGAATAGAAACTTTGAAAGAGATGAAAGAATAAGGAGTGGTTGCAAGGCTAGGGGAGTAACCCTAAATAGAGGAAAACATAATCATGCCATTATGCCCGCTGCTGGAGAGGAATGTCCCTATGTTAAGATAGGAAAGGAGAAGAAAACGAGCTAAGATAGGAAGAAAAGGACTTTTTAATTCGGTGCCGGTATAAATTGTTTCTCTTTTATCTCAAGGCACCACAGACCCAAGGCTGAATAAGGCCTGAATTTTGATGCCTTTCTCTTTCATGTAGCTGTAAATCCTTTTATCTTACTACCAGGAGCATTTTCTAAGCTGGCTGGCCAAATTAAGTGTGTATTCTAAGGCGAAGAAATGGAAAGGTAACTAACCCCTCACCCACCCAGCACTATGCCCAGGATCGTCCTAACCCCCACTCTATCAGTCCTTAACTCAGTAATTTATAGACCCAACAAAGCTAAGACCCACTTCCTTCTTTTGCCAAATCTCAGTTTACACGCTGTCCCAAAGGAGACATTTTAGAACCATATCGGCAAAAGTCAGTGTTTTCTACTAATGTGTTTCATGACCCCATGCTTTACAATTGATTATTGATTTAAAAAATCTTTAAGTTTGGTTAAATTAGCAACAATAAACCTTGTAAATTCCCTGTTGGGAGTTTTTACTTAACCTTGGGGCATTCTCAGAGGGAGGTAACACAATATCAAAAACTAAATTTGCCAACCTGTTGATCATTCTAACTGCAAAAGCATTCAGTTAGCATGTATGGTAAGACTATGCAAGGTCTCTGCCCTTGAGAAGCCAGTAGGGGAAGATAGTTTCAAAACTAATTTCCATAACAATAATATGACATATATACAAAGTGCTGTCAGAAGAGGCAAAACAAGAA
CTCATTTAGTAAGCTTGCCCAAGGTCATCATAGCTAGTCAATGGCAAAGCTGGGATTCTAATTCAGGTCTGTTTGACCCCCACATTTATGCAGCATCTATAGAAATGGAAACATCTTAACTCAGGTTTTAAACTACATTTACGAGCAGAGTGAAATTTTTAAAGACTGAAAGAAATGACTCCAGAAACCATGTTGCATTTTCAGAATAGAAAGAAACATCTTACTCTAGGCTTTAAACTTCACTGACTAGCAATGAGTGTGGGGAAAAAAGTTTTAATTAGAATATCCAAATGCCTTAATAATATGCTTTTATTTTAGGAGGGAGAGAAAAAAATCTCTGAAACCAATTTGAAAATGCAACCAGGATCATAACTCATTTAAAAATCTTTAGCTACAAAATCCATATATTTTTAAGTGAAATAATGAAAACGTTACTCAATTACAATTCATATTGACTTCAGAAAGCTCTACTATTAAATCAGAAACTGAGAGCCTGGGTATGGGAAGGTAGTGATATAAAAAAGAAAGGGTTAAAAATAGACAACACCATAGCCCTCTGCTTGAGACAAAATAGAGCATACTCCTGATTTCCACACAATGTTAAAAACACAAGCATAGAGAACCTAATCTTCTCAATACTAATATTCAGCCACAAAGCACTTATCTCATAAATATTACTTAAGTTCATTCATTTACTTCTCTATTTAATAAACACTGTAGCACTGATTACCTGGCAGTTACGGGTGTTGAAAAAGTAAGTCAGAAAAACAGAAACACATTCAACAAATAAAAATTAATTCAGCTCAAATACATTTTTAAAAATTGCTGATTTTATATTTGCCTCAATGTATTCATAATACTCTCCTCACATATCTCAAACACGGTCTGAACAAATTTTCCTAAAAGCTGCAGGTCGATACTTTAAAATCCATTTTAGTGATGGAAAAAATAGATGTAGTAATTGTTCCTATCTTTAGACTAGTGGTACACAGAGTTACTACTTCTGTGTATACACAATGTTTTTCACTTTCAAACCCTACCTTTGGAAAGAAATGCAGAGAACATAAATTTTTCTTCAAATATTCCTTCCAAATGAGTTTCATGAATACAGTATAAATCTAATTATAAATCTTATTTGAGCATAAAAAGATCACTATTGCTACCTGCATTTCTAGGCATTGGATAATGTGGCCTACTGAAGCATAAAAATAAAAATCCCAGCAATGCCAAGGCTCGCTATGCACCTGAAATAAATAAACCTCTTTAGAATACAAATTTCTCACCTGCAAAATCCGGATCAATCATACCGATTGTCAGTGTTATAAGGAATAACAGATTAAATACAATAGGTTGAAAAAGACCTCAAAATACTGCACAGAAACACCCGGTGTATGCTTCAGCACAAGGATCCTAACCACCCCCGGAAAATGAACCCTCCACCAAAAAAGGACCTCCCCTCCACCTCATTGATTATGCATAAAACATTAGGCCACCTCCAAACTGTTTAATATATTAACATAAATAGAGCACGTGACCCCTCGAGTGTCAAATCCTTATTAGGTGATTATGGATTTTGGCCTTGGTTACCTTTAAAGTTCTTGATCACTAACTTCTTAGCAGAGCCAGGTTTGCTGTTAGCAAAGCTAGAGACGGTGGTAGAAGATTTGGCTAGGCCGTTTGCATGATGCACCGAAGCCACAGAAGAGATTAATATACTCTTATTTTTAAGTTGCTGCTGCTGAGATGTTGCAGCAGTTGGTGAAGATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATTCCTCAGCCATCTTCGCATCAAACCCTACAAACTCCAGGGTGTCTTCAAAACGCAGCTTCTTCTGTATCGGTACGTGGCTGGAAGCAGCCACTGAAACCCCCAGGCAGAAGGACGAGGTTGAAGGGGATGCCGAATCCCTGGGTTGTAAAGGAGGAGTGGAAGAGGAGGAAGAGGTGGAATCAAAGTCTTCTCTCTCGTTACTACTGTTACTGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTTAACTTTCTCTTCTTGGCAGAGGTGGGCAGAGTGGTGCTGGTATTACCATCAGTGGCAGATCTGACCTCCTGAGCAGCAGCAGCAGCTGAGGGACTGGGGGAAGAAAAACCTGTTGGAAACATGAAAATAGCGGGGTCAACAGGCAGAGGAGCATCAAAAACCTACGTTTATATGCCTGCGTGCGTGTAGGAGAGAAGGTAGCAATGCTAGAGGGGGAAGGGAAGAAAGAAGAGAGGAGAAACACAGAGGACGAGAAGGAAAGTGAAGGGGGGGGCTACACCGGGGGAATGGGAGGGTTTGGGAAGGCGGATAGGCTGACACCAGGAGTGAGCAGAACGAGGGGGGAGAGCGAATGAGGAGGCAGACAGGTAAACGGCCGTGCCGTCCCCCTCCCCTGCTTTTCGATCTCTCTCCCCCCCTTTCTGCAGGAGCGACTCAGCGAGTCTGTGAGGCTGCAGCTCCTCCTCCTTTTCTCCCTCTCCCTGGGAGGGGAGAGGCTGTGGTTGGGGGAAAGGGGGAGGGGGAAAGAACCAGGGCTTGTTATTGTCAATAGCACAAGAGGCTAAAGATGGCGCCATTTCCGGTCACGCGGCGCCGAGGGAGGGGCGGTGTCAACCTCAGGGAGTGGGGGTGAGGGAAGCGCTGCAGCCGCCCGGGGGGCGGGGGAGCTCGCGCGTGAGGGGGCGGCTGGAAAGGGGCGGCTAAAGTGCCCCAGACGCTCGCGCTAGTTCGCTCCTGCTCCCGCTCCCCTTCGCGATCCCCTTTCCTGGCAGCGCCTTCCTTCCCTGGCCCACCGGGAACTCCCACTCCCTCCTTAACGGTCCCGCGGGAAGCTTCGCGCCGCAGCGCCCTTACCGGAAGTGACTGGGCAGACACTTTTCATAGCGCCCAGATCCCGAAGCCCCCAGGTCCGCAGGACTTGAGTGGGGGGGGGAAGGGGGGAGGGAGAAATTGGGGGGAAGAAAAGTGGATAGGAGGAGGGGGCGGGCCTTCGAGACACCTTCGGAGCTCCTGATTGGAGCTTTCTGAAGGCGAGGGGGTGGGGGGGGTGGCGGGAGGAGCGGGAAGGAGCCTCGGGGGAGGGAAGGTAGTGACGGCGAGGGGCGGAGTGAGCTAGCTGGGAAAACGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGAGAGGGAGGGACGGAATAAAACGTAAGGGTCCGGGAGAATAGAAACTTTGAAAGAGATGAAAGAATAAGGAGTGGTTGCAAGGCTAGGGGAGTAACCCTAAATAGAGGAAAACATAATCATGCCATTATGCCCGCTGCTGGAGAGGAATGTCCCTATGTTAAGATAGGAAAGGAGAAGAAAACGAGCTAAGATAGGAAGAAAAGGACTTTTTAATTCGGTGCCGGTATAAATTGTTTCTCTTTTATCTCAAGGCACCACAGACCCAAGGCTGAATAAGGCCTGAATTTTGATGCCTTTCTCTTTCATGTAGCTGTAAATCCTTTTATCTTACTACCAGGAGCATTTTCTAAGCTGGCTGGCCAAATTAAGTGTGTATTCTAAGGCGAAGAAATGGAAAGGTAACTAACCCCTCACCCACCCAGCACTATGCCCAGGATCGTCCTAACCCCCACTCTATCAGTCCTTAACTCAGTAATTTATAGACCCAACAAAGCTAAGACCCACTTCCTTCTTTTGCCAAATCTCAGTTTACACGCTGTCCCAAAGGAGACATTTTAGAACCATATCGGCAAAAGTCAGTGTTTTCTACTAATGTGTTTCATGACCCCATGCTTTACAATTGATTATTGATTTAAAAAATCTTTAAGTTTGGTTAAATTAGCAACAATAAACCTTGTAAATTCCCTGTTGGGAGTTTTTACTTAACCTTGGGGCATTCTCAGAGGGAGGTAACACAATATCAAAAACTAAATTTGCCAACCTGTTGATCATTCTAACTGCAAAAGCATTCAGTTAGCATGTATGGTAAGACTATGCAAGGTCTCTGCCCTTGAGAAGCCAGTAGGGGAAGATAGTTTCAAAACTAATTTCCATAACAATAATATGACATATATACAAAGTGCTGTCAGAAGAGGCAAAACAAGAA
Task1_train_31019
Located on Chromosome X, this mutation impacts C1GALT1C1 (C1GALT1 specific chaperone 1). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Polyagglutinable erythrocyte syndrome
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Task1_train_31020
Assess the clinical impact of this variant on gene C1GALT1C1 (C1GALT1 specific chaperone 1), found on Chromosome X. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Polyagglutinable erythrocyte syndrome
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Task1_train_31021
A variant was discovered in gene C1GALT1C1 (C1GALT1 specific chaperone 1), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Atypical hemolytic-uremic syndrome
TAAGTATTTCACACATTTATCAGTACAGGAGCTATTGCATTTACCACTGGATTAAGTTTCTGAGTAGCCATTGAAATTTGGGAAAAGGTATGGTAATGCAAAGTAGATAGGTTAGGACCTCCACACTGAAAACAGATATGGTACAGCTGTGAACATGGGAAAATTCCCTGAACTTGTACAAGGAAACAAAATCCAGAACAGGCTGGGCGCAGGGACTCATGCCTGTAATCTCAGAACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCAAGGGAACTGCTTGAAACCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTCCAGTCTGGGCGACAGAGCAAAACTCTGTGTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAATACAGAACAGATTCAACTCAGGTAAGTGAAACTGCCAGATGGCCAAAACAAGTTCTTCAAATTTCCACAGAACTCATTGACCCAGCAGGACTACATTTTTATCCAAATTGCAGCTGGGAGCTTGATTAACTGAGAAACAACACAATTAAATGACATGACATTCTTCATAGGCACCAATCCAATGTCAGTATCTGCAGGCTGAAGTACAGACAGTTACACTGAAATTGCGTATGCTCTGAGGAATGACACTAAATTCGCTTCCAGGAAAATTACTCAATTTTGTAAGTAATTTTCAGTTTTTTTTCTCAGGGATATTTTTCAACTTTCACTTTAATTTTCTTTAGTTGCTTAGTTGTACATTTTGAGAAGGCAAATCCATTGGAACTTGGGGAGGCTTAGAACATAAATCAGTATTAGAAGTAAAGGGAACACACAGCTAAAAGTTTTACTTTAATCACAAATTCACAACTAGAGATATCATTTGCATATCTTAGAACGCTAAAGACCTGTTAAAATTTTTTAACCAATCAGCAAAAATATGTGCCCCACAGATTTCTAATGTTCATAATTTAGAATTTATCACATATAATATTTATTAATAGTTTATTTGCAAAATTATTATTCTTAAAACACTTCTTTCCAACACATTTACAATGTTCATGTGTTTTAAAGAAAAAAACCACCCTCATTTAAAAATGTACTACTGACTTTAATGTGTGGTTATACCAGTGCCACCAAATTAGAAAAGAAAAAGAAACATACAGCTGTATTGGATATGTAGTTACTACTACAAATAATGACAACACACGTCCTATACAAAGATCATATTCACGCTTTTCTACCACTTCTCAGTCATTGTCAGAACCATTTGGAGGTAAGAAAACCAATGCATCATTGAAAATATGCCCAAATGCCCTAAGGCGGTATACCCCATACATCATCACATGCATCTGATTTGGAGTCAGTCCATTAAAAGTAACAGCCATATCTGAACAACAGCCTTCTACTACCTGGTTGGGGTGATAAGTCATTGCCTCTTTAATAGAAAGCCCAACAGATTTGGTATTAAATACATCTTTTCCATCAGCATCTTCTGCATTTTCTGCAAATACTCCAGCATATTTCAGGCAAACTGCTAGCTGTTTATCTTCAGATATCTTCCAAATCATCCCTCCCTGTTCAGGACACTTTTCTGGGATATTGAGAAGGCTGTTAAGTCTTTTCATTGATTCTACACTTAAGACAATTCCTCCTTCCATACCCACATATTCAAGGTCTCCAGATTTTATAGTGTGGCCTAGATAGAAAGGCTGTGATGGATCCTTTTTTAACAAAAAATACTTTAGGTTTTCAATGATAGCAAACGTAGTGGGGCGTGCAAGGAAGAACCAGTTGTATTGGTCTCTATACTTATCAAAGGCGTATTTGTAAGCTTTTCTCATCATTAACCACATGTCATTTGTGTCCATATTAATTGACTCAAACACTTTAACATTTTCAGAACTGAAGAACTCTGCTTTGTCACAGTGTTTGGTCCAAGTCTCCTTTACTGCAGCCCAAAGACTCACATCTTTGGGTTTTACAAGGATAATACAGTATACTCGAAAGCTCTTACTGAGCTCCATGCGCTCATCCTCTGAAATTTTCAAGATATCTTCTTTGTTAGGAGCTTGTAGGTGATGATGCTCATGGTGGTGCATTCTATTTCCATGACCAATCCTAATGTGTCCTAGCATAGTGATCAAAGCACAGAAAATGCTTCCAAGCATCACACCCTTCAAAAAGGAGCTGCTTTCAGAAAGCATTTTTCCTATAAAGAAGAAAAAGACTCTTAAAATACTTAATAGAAAAAGATTAGTCTATAAATTTGATTTGGTATTCCTTATATACTTACATTTTGCTTTTAATGTTTTTTTTAAAAGGTTCCCAAGCTTGAAATCAAGTTAGTTGCATATAGTACAAAAGGCTCTCAAAATCTTTAGCTTCCAATGGAATCTGATTACTGTTTGGTATAAACTGGAACTTTGCAACAACTCCTCTATGGAGAAGTTTGTTTTGCACTTCATCTATGGGGATTTAATAAACCCTTGAAACCAGTGTTACAGAGGTTATCCATCCACCATTCTCTTTAAAGAATTTCACATCACAAGCTTGCATTATTTAAATACCTCTAAAAATATAGTGAACTTTTACACCAAAACCTTGGGTTGAACAGATAAAACCACCTATAAATGGCAAATCACCAATGGTATTGTGCTGACATTTCTGTTCTCAACATAGTGCTTTCTTTAACTGATGGCTGCTGTCCTTAAGTGTTTTGAGTAAATCTAAACCAAGTTTCTTGAGAATAACACCATATAGGTTAATATTTACCCTTTTGTTCCTAAAACTAAATGGTTTCCAATACAGTATCCCAACTATTGATGTAATAGAAGCCCATAATAAAAAGTTACATCTTTTGGATCAAAAAGGAATATTGATAGATATATCTGGGGCCCATTAATAAACATTTTCATTTCCTCAAAAGGAATTTTCTTCTTCTTTGGGGAAGTAAAAATGGAAAAATTTACACTTTTATTTCAATTAGAAATTAAGAGGCAGGTGCAGTGGCTCATGGCTGTTATCTCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCCCTTGAGTTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCTTGTCTCTACCCAAAATCCAAAAAATTAGCCAGACGTGGTGGTGGGTGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCACAAGAGTCTCTTGAACTTGGGAAGCGGAGGCTGTAGTGAGCTGTGATCTCACCACGGCACTCCAGCCAGGGCATCAGAGTGAGACTCTGTCTCAGAAAAAATAAATAAATAAAAGAAATTAAAAGCTGACATTAAATAAACTTGTTGAAAAAAATTGTATGTTAACCATTTATTCTAGTAAAGGCTGAATTTTCCAATCTTCCCTCCATCTTCAGAAAAAAGCAATCTATTGAGCTACTTAGACTTCCCAGTTTTCTCTTATGGTTGAAAGGAGCCTTAGAAAACTACCCAATGTCAGTCACTTCTCTCATTTTACAGAGAGGAAATGGAAGTCCACAGAGGTTAAATAACTGACTCAGTCACACAGTTAGACAGTGGTATAAGTGGACTAGAAACCACATTTCTCAATATCAGTTTAATGGTTTTTTTCCATTACAGAAGAATAATTGCCATAGTGCTTCTACCACATTAGAGTTTAATAAATGGGTTACTGAATATCCTTGTTTTCATACAAATGGGAAAAAAGTGGGATCTGTTGACCATAACTGATATTTTGCACCCAACAGCACCATATTGCTACAAGGAAACCACTCCTGTGGTTTTCTGCTAGAGGAAATGGAATTTTGACTTCTACCAGAAAGACAAGGTGTGGAATAGCTTGGCAGATGTAATTTCTGAGCGGTGGGTGGGGCAAGAGGCAGGAAGACTTTCCTGTGTCACTCACAGAACTTGGTCAATAAACACAGTTCCAAGAAGAGAAGTGACAGAAAACAAGCTCGGCATAATATTAGAATTGTCGGCT
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Task1_train_31022
With a mutation on Chromosome X in gene C1GALT1C1 (C1GALT1 specific chaperone 1), classify this variant as benign or pathogenic. Include the disease if it's pathogenic.
Pathogenic; Polyagglutinable erythrocyte syndrome
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Task1_train_31023
A variant has been detected on Chromosome X in GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
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Task1_train_31024
A genetic alteration is present in GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Intellectual disability
ATTCAGAGTGTAGCATCTAAAACAACTGAGTTTTCCAGAGGCCAGAAAAAGGTTACCTTGGGACACAGGAATTTAAATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTG
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Task1_train_31025
Gene GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) on Chromosome X is altered by this variant. Does this mutation result in a disease or is it benign?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
ATTCAGAGTGTAGCATCTAAAACAACTGAGTTTTCCAGAGGCCAGAAAAAGGTTACCTTGGGACACAGGAATTTAAATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTG
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Task1_train_31026
Located on Chromosome X, this mutation impacts GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
CAGAGTGTAGCATCTAAAACAACTGAGTTTTCCAGAGGCCAGAAAAAGGTTACCTTGGGACACAGGAATTTAAATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGA
CAGAGTGTAGCATCTAAAACAACTGAGTTTTCCAGAGGCCAGAAAAAGGTTACCTTGGGACACAGGAATTTAAATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGAGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGA
Task1_train_31027
This genomic variant is located on Chromosome X, within the GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
AATTTAAATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGACCAAATATTCATTGCCCTCATGCCCAGACCCCATCTCCCACTTATTCTGTGTCTTTCTCAAAAACT
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Task1_train_31028
This is a variant in GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
ATTTGCTTTAAAGTGGTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGACCAAATATTCATTGCCCTCATGCCCAGACCCCATCTCCCACTTATTCTGTGTCTTTCTCAAAAACTAGGAAAG
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Task1_train_31029
Here is a variant affecting GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; GRIA3-related complex neurodevelopmental disorder
GTGAAATGCTGGTACAGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGACCAAATATTCATTGCCCTCATGCCCAGACCCCATCTCCCACTTATTCTGTGTCTTTCTCAAAAACTAGGAAAGCATCTACTAAATCAT
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Task1_train_31030
The gene GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) on Chromosome X carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; not provided
AGACAGAGAAGAGCTTGATTTGCCGGCTCTCAGCCCAGAACTACCCTCTTCCCACAGAGCCTGGAGATATGCCAGGCTCCTACGCCTATTCTTGACTTTATGACAGAGTGGGTTCTCTTCCTGTGAGTTTTTCTGGGCATGGGAGAACATAGCGTAACTAGGATGGAGCTCTGCCACACAGCAGAATTATCCTAAGGATGATGTGGCAATGTTTTATAAAACCTAGGGAGCAGATTTTCATTTCTGCAGACAGAGCCAGCCTTCAGCAACACTGTGAAGGAGATGAAGTTTCCTGAGTACAAGCCATTACCCATCACTGAGCATTCAATTCCCTCACACTGTCCAATAACTTCTTATGGTCCCTGTCTCTGAGGAACACTCATGATGCAGGACCAAACTTGCAACCCTGTCTGCACCTTGAGAGTTTTATAAAGTGCTGCTGCTTAGTCCCAACCCCCAGGGTTATGATTTAATTGGTCTTGAAGCCTAGGCAAGGTTTTTTGTCTTTTTGTGTTGACGTGTTTTGACTGAAGCTCCCTAGATGATATTGATATGCAGGCAGAACTGAGAATCACTGATGTAGAAGAACAATGTTTCTCAGTTTGGTCTGCAGACCACTTGCAGCAGAATCACCTGTGATGCTTAAGAAGTGCAGATTCTTGGGCATTCAGCTATTCTGAATCTGCATTTTAACAAACACCTCAGGTAATGCTGATGCACAGTAACATTTAAGAACAAAAATTTCCCCTTATTAAAACTTACCCATCTTCTTTCCCATTCCCTACTAACTGAATAAACAGTGGGTGCTGTTGAAGTAATGTGTTACATTTTGATCAAGCCTCCTGAAAACAACACAGAGCGTGATTCCAATAGAATTTCTCCATCAGACCAGGAGGATGATTTTGTTTTCGTTTTCTGTGTGTGGGGGTGGAAGGGGGTGTGGAGGAAGCAAGCCTTTTGATGCCTCTAATCCCACTATACAGGTAGTTTCCTACTTCACTTGGAGTCTGCCCTGAGTGGTTAAGGCTTAGTTGTCAAAGGAGAAAGTTTCTAATCTCCTGGGCCCCAAAAGCTATTTATATGAAGATGATGAGAAATATTATCATCTAGCTCCTTGCCTTATGGATGACCAACTCCACAAAATAGCAATGTCTTTGTTAAATTTATTAAACTCAAAGTGAATAGTGCTCATTTTCCAGCACCTACCCATTTATCTTCAAGTGAGAAGAGGTTTTTGACTATGTTTCTCTCATGACATTACCTTGTAGCAGTGGTTTTCAACCTTGGTTGCACTTTGTAATCACCTGGTGAGCTTTAAAAAATTTAAATGTCTGTGTCCTACCTCCCAAGTTCTGATTTAATTGGTGGGCCTGGGCATGAGTTTTTTTTTAAGATCCTAGGTGATTTTAATGTGGAGCCAAGGCTGAAAACCATTTGCTTCTACAGGTGTGCCCAGCAAACTTCACAGGAAGAGAACTCAATAAGTTAAATTATTACCTGTGGAAGCAGGAGATGGTAAAAAAAATATATATTTTTTCCTGTAATTAAAAGGAAAAATCCTGCTAGGAGTGCACTTGTAGTCCCAGCTATTCAGGAGGCTGAAGCTGGAAGATAGCTAGAGCCCAGGAGTTCAAGTCCAGTCTGGGCAACATAGAGAGACCTGACCTCATTTTTTAAAAAGAAAATCCTGCTTTGAAACGTGTATAGGCCTGACAAGTATTATGCATGCACCATCATAGTATGCCATCATGACATGGGGTATTGTTGTTAACATGTGACCTTTGTTTAATGTTTTAATTCCCTCACATCATCTATTTCCCTCCTTCATCAGCTATACTGAAACCACTCCTCTTTCCAGAAATAAAGAAAAGGATTTCTTAAACTTAGATCTGGCCCCTCTGGGTCTGGATTTGTTTTTGTTTTGTTTTATAGATCACTCTCCGGGCGCATTGTTGGAGGGGTTTGGTGGTTCTTCACCCTGATCATAATTTCTTCCTATACTGCCAATCTCGCTGCTTTCCTGACTGTGGAGAGGATGGTTTCTCCCATAGAGAGTGCTGAAGACTTAGCTAAACAGACTGAAATTGCATATGGGACCCTGGACTCCGGTTCAACAAAAGAATTTTTCAGAGTAAGTGCTCTGCAGTTAATTGAGCCTGCTGATATTTATTTTATCATCTTCTCACAAAGGCAAGTTCACAGTGCTTTTAAGGGAGAGTTGGGAAAGAGTGGGAATGTTATCAAAGGAGAGCATCTTAAATACTGGGCTGCTTGGTTGGTGATCTACTCCATTGTCGTTTAGAACCAAGACTTGAGTAAGACATAACAAGCTGCATGTCAAGGGCACTGAGTTTGGACTCCCAGGTTTGAATCCCAACCCTGCCACAAAGTGATTGTTTGTCCTTGGGCAAGCCATTTAACTTCTACCAGCTTCAGTCCCCTCACTTGAATAATGAGGGGATTGAACTAAATAATATATATTCTGCTTTCTAGCTTTTACAAAAGCAGTGCTTTTATGTCTCAGAGGTTCACAGAAGTTAGGCAATTGACTCTAAGACTGATGAGTAATGGACTATAAGAAATTACATATTCTATTTTAAATGTTAGTTGTCTATTGAGATGTATTACAATTGTATCAAGTATTTGTGTACATGGTGATAATTTCATTTTCAGGACAGCTGATAATTGTTTTAATTTCTTGGGTAGACGTATTCCCTCAGCTCCTCATAGGCAAAATCTTATTGAGGAAACAGTAAATTGTTCATTAGCAAAAGTTAATAAAGCTATGTAAAGTCTGTCAAGAGGAAAGATGAAAGGAGATTGAAGCAGGAAATGATAGAAGGATAATATGAGGGACAAACCACTTTCACATAAACCATCAAGATCTTTATTCTGTGGTAACTGGACTATTAAGGAAGAATACTAGTAGAGTTTTTAAGAACTAAAATGTTTTTTCAGTTACCCCAACAAGAAAAATATGCTAATTTAGATTAGAAAATGGACACATTCTATAATATTACTACTGCCTGCTACTGTAACCACAGTAACTAGTTGTAGCAATGATCCAGAAGCCACTTGGGTAGTAGGTGGAGTAGTTAGTCACTCTCTCCAACCAATAATCAAGTTATTGGATGACAGATATAATTGCTGATTTTTCCTCAAAGGCCCAGAGTAAACAGATGGTGGTTCTAAACCTCCTTTTTAAATAATCAATAAGAAATACATTTCTACATGTATTATCATGAGATTTGTCCAATTACTTCACAGTAAACCAGGAAGAGTACATTTCTTGACATTACAGCAATTAACTACAAACAGTTTTCACTCCCTGAAAGAGAATGTATTAGTCCTGGGACCCTTTCAAGAATTCTCATTGATTCAAGATATCCATATCTCACCTATACCACCTGTTTACTGACCAGATCATAATCCCCAACTGGGAGGAGGGGTCCAATGTTGGTCCAATGAAGACCCTCTGGAACTAATCTGGCCTTGACCCTCACTACTATGGCAGTCCCAGAAGCTTATTTAGAAACAATTTTCTGCCCCCATGAAATCACTCACATTTATCGGGGCTAGAAGCCAGGGATTTCCATCTGATGAGTAGTCAACACATAACCAGCTCCATGGAAATCTGGTTTGATATCAACCTTCAACAGAGCTTATGATAACCATCCCAATAGGCATGAAGTTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGAAGCTTCTATATGAAGTAATTAACCACTTAGGATATCAAGACACCAGACTTGAACCCTCAGATAAGAGATACTTGTTCCACTGGAAAGCATTTTTCTTTCAAAAACAATTAGAGGTTAGAAAGTTGTGCTTTAAATGGTAATCAATAAACGGCATCAATTCCCATTAGGCTTTCAAAGGCCATTCATCCATATTGCAGGCAAAAGGAGGCTCTCTGGAAAGATGAAGAGATTTATTAGCCCAGAGGCAGAAAGTGTGACCAAATATTCATTGCCCTCATGCCCAGACCCCATCTCCCACTTATTCTGTGTCTTTCTCAAAAACTAGGAAAGCATCTACTAAATCATTCAATCATGATTTCA
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Task1_train_31031
The gene GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3) on Chromosome X carries this variant. Does this mutation lead to a specific disease, or is it non-pathogenic?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability 94
CAAGTATCACCTTAGAATTTTTTTCTAGGATTTTCATTCCTAAGGACCTAGCTCCCAAGTCAATTGGAAGTTTTTGAGTCATTGAGTCTACAATTCTTTTATAGTCTCCAGAATGACTAACATAGGGCTAGAGGCACAGTAAGCATTTAATATATGTTCTAGGGACCACCTGAATTGAAATGAAATTTAATGGGATTATATGCAAAATTCAAAAAGGTAAAGATGAAGGAGACTTGACTTGGCAGAAAGAACTAAGTTTTGGTTTGACCTCAACCTGAGTTGATGGAAAGACTCTATTGACTCTATTATATTCTTCCAGTGCTTCTCAATAAAAAAAAATTTTGTTGAAAGGATAGAGGAATGACTAAATATATTAATGCAAATTCAAACAGCATTGGTAGAAAATAATGCTCCAGGTCAGGTGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGAGGGAGATTCACTTGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTAGGAAACATAGTGAGACCTCGTCTCTACAAAAAAATAAACAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGTGCACACTTGTAGTCCCAGGTATTCAGGAGGCTGATGCAGGAGGATCACTTGAGCCTGGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAACTAAGATCACAGCACTGCACTCCAGTCTGGGTGACAGAGTGAGACGAAAGAAGCGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAGAAAGAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAAGAGAGAGAAAGAAAGAAAAAGAGAGAAAGAAAGAAGAGAAAGAAAGAAAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAGAAAGAGAGAGAAAGAAAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAGAAACCAAACAGAAAAGAATGCTCTAAAATAAGAAGCAAAAGTTTGTTGTTGTTGTTTTTTCATTCTGTTCTGGTCATTTATTTGGGGTACCGTGTCTATTTCTATACACTCTAAATAGAGACAGACATTACCAACTACAATGTGCCTACGAGTGGAAAACCAAAGTTGTGAGAGTTCTGGAAACAATATCAGTCAGAGTTTCACCTGATGAAGAGATGAGAAGGGGACATAATAAAGGCCTTTCAATAATTAAAGAACCGTTGTACATTAAAAAAAAGAACCGTTGTAAAAAGGGACAGAATTATTTTACATAGCTCTAGGGGATAGTACCGGGGGTGGGGGTGTGGATTAAAATACTACCTATTGAATACAATATTCACAAACTAGGTGGCAGGATCCGTACTCCATACCTTAGCATCACACAATATTCCTATGTAACACATCTGCAAATGTACCCCCTGTGTCTAAAATAAAAGTTGAAATTGTAAAAAGGAATGGGAGTTATAGAAAAACAAAGATCATCTCAGAATAAGGAGGTACTTTCTTACAATAATTGATATCTCATGCTGGACTGGGCTGACTAAAATAGCTGTACACTACCTTATAATGGTCTTTGATTAGGCATATCCTGCTACGATTAGATAAACATAGCAGGATATTGTAGAGGAGATTTTTTCATTGAGAGGAAGGTTGAACTAACAAAGTGTTTTTCAAATAAGATTGCAACCAATTAGTGGGGCCATGAAATCCATTTAGTGGGTCCTGAGCAACATTATTTAAAATGAATTAGAATAGAATAGAAAATATCAGAGAGCATCACACATAGCAAGGATGAGTGTGGTTTTGAGAACTTGTTTTGGAAACAATGTTTACGTATGTATGAACGTGCCTACTAGGTTGCAGTGTAACGTGTTTTTTATTACTGTGGATTGCAATTAAAAAAAAAAAACTACTGCACTAACCCTCCTCCAGACTGAATATCTGGCAGCTCTAAGAATTCTTATCTCTTTGGTGCAGAGATCCAAAATTGCTGTGTACGAGAAAATGTGGTCTTACATGAAATCAGCGGAGCCATCTGTGTTTACCAAAACAACAGCAGACGGAGTGGCCCGAGTGCGAAAGTCCAAGGGAAAGTTCGCCTTCCTGCTGGAGTCAACCATGAATGAGTACATTGAGCAGAGAAAACCATGTGATACGATGAAAGTTGGTGGAAATCTGGATTCCAAAGGCTATGGTGTGGCAACCCCTAAAGGCTCAGCATTAAGGTGGGTGGAATAATATAACAATATCCGTGTTGTTATAGTATTCCACCTACCCTGATGCATTTTGTTGTCATTTTCTTTCTTGTGGATTTTGAGGTAACTTTTAAAAGTTTAAAATCTACAATATTCCATGGAGTTAAATAAGACGGTAAATTATGGTTTCATCTATTTAATGCATCCATTTTTTTTAATGTTCTCTCTCTGTGTTGTCCTCTCTGACTGTTTGTTGCTGTTTTAATTTTACAGTTCAACGGCTTTTTCAATTTAAATGGTAAAAGCCAAGTTATGGTGCCATATGTGACGAATGTTAATTGCATGGATGTGGTGTTCTTGTTACTTTTTTTCTCAAAGACAATTTCCCCATCCCGCACACTTCAGTTTTGAGCAAATGTTATCCTCCATGCCACCTTCCAATATTTAACCCTGTATTTGCTGTACAGACATTTTTATAGCTCCACGTTCTGTGAAATTTAGCCAATTTGTCCTCTTGTGCTCCTTTTTATACGTTAACGATTTCCTAAGCATTTGTGCATTTTCTTACAAGTTATGTTTTATCGTTTCAAGAAATGCTGTTAACCTGGCAGTATTAAAACTGAATGAGCAAGGCCTCTTGGACAAATTGAAAAACAAATGGTGGTACGACAAAGGAGAGTGCGGCAGCGGGGGCGGTGACTCCAAGGTCAGCCTCAATGTCACCACAACCGGGTACCCTTAGTGACGAGTAATCGGCAAGACTGTTATCTTATTATTGAGGAGAGAGCACAAGACTCACACATAAAGTGGAATGACCAGGTTATTCCCCTGCCTGGCAGCTTTGGGAACCAAAAAGACTTTAGGGCACTGCCCACATTTTTGATCTAACTTGGGTCCCTTCTTCAACTCCCAGACAGAGGCTCCAACCACACCCTTTCCCTTCCTTTACCCACCAGTTTGGTTGCCTTATGAAAGCCATGATGTGGGTTTCAATGCCCTAGGCTTTCAAGAGTCCAAGGCTTTCCTGTGAGACTGTCCCCGCCTGCCTCAGTTGAGTGGTATGAAAAATCAGATCCATCTACTGAAAAATCAGGGCATAGCCTTTTGTTTTCTAGGTTGTGATGGTTGCTCACAGAGGTTGGTTGGTTGAGTAAGGGTGGCTTCTTCAATTATGTGTCTGAGTGATGAGATGTTGTTCTCTATATGTGATAGCCCATTTAAGCAGGCCCCACTTAACTTGAAAGCCAAATAACAAGCTCGGTTTCAAGTTAAATGGGGTCTTTCTTCAATAGGCCACCCCATATAGAGACTTTGCAGAGACATTTTGTGTATTTAAGCAAGTGCGTCGCCTAACTGTGATACTATATGTGTGTATGAATCCCTGATTTAGCTTCTCCTTAGCCATGTTCTTGGTTCAGGTAGGTCTAATTGTTATCCAGGCTGCCATCATGAGAAAACCCATCTTACTTGGCATTCCTTTGACTTCTAATGCTCTTTGGAGCTAGAATGAATGAATAGCCATCATCCAAGCAACAAGAAATAGGGGCAAGCTCAGAAGCCGCGATACAAAGTCATGGAAACACACTTCGGGTAAGTACAGGAGAGGACCTGAAAATAGAATCCTCCTTGGCCCAAGGGGCATGAGAATTATATTGAAGCATGTAAACTCACCTCTTGTACGACCAAGATCCCATGGGCATCTTAAGGTGAAGAACAGTGTTTCCCAACCACAGACCAACAGACAGGCAAGCCAAAACTTTTCTTCTTCAGAGACAATGGTTGCACTTCTGCTCCTCTCTTTCCCTCTCTATCCCTCAGGATCCTGATGGAAAAGTTAGTTTGCCAGTCTGCAAATATAATATGGGTTTGG
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Task1_train_31032
This variant lies on Chromosome X and affects the gene GRIA3 (glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 3). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; not provided
TTAAAATTTAGTCGCATGCTCCTTAAAGGTATACATCGTTAGGATAACATCACATTGATAAGCATGAAACACTCTTCCCCGCCTCCTTCCTGCCCCCCTTCGCTCCCCTAAGAAAGTTCTTTTTTAGTTTCAATTTTTGCCTTTCCTTTTTTTGGACTAATATCGTGGTATCAGTTAATTCATTTCATGAAATGCCACTCATTTTCCCCGTGCAATGAACCATTTTGCTACTGGTTTTCTACATCCCACATCAGGGAATTCTATAACTCTTGTGAAACTTAAATAATACATGGAACTTGAAACTGTTCTTCTTGTCACAGCTTACATGGGTTATGTCAAAGGACCTCTCCCCCCATTAAATATCATATACATATAAAAGTCTAATGGCAGAGGAAGGGTTACCAGAAATTGGTCTATTTCCCAATGGACTGTGGAACATCCTTGCAGATAGCCTCACCAGTCTCCTTAAAGAGATAATCCAATATTTCATATGTGACAGAAATTATTACTACTTGTCTAGCTGTCATTCATCCTAAAAGAGTGACTATTTGCAAGGTTGTTGTGAATATGAGGCATTCCCACACCCCGTTTCTGAATGCAATTCAATTTCAATTGGACCTTTTATTAAAGTAAACAAGTATAGGACTGGCTTCTATGAAAATGGGATAAGAAGGACACGGCCATATTGTCTTTACTTTTAATTATTTAAATGATACCAAGACCAGCTGAACTAGAGTGTTAAGTGTCAGCAATGGCCATCATCTGTCACTGTGTTGTCACTTAAATAAGATGCTCAAAATTCACTGGCTTAACAATTTGGGTATTCCATTCAATTACATTCAGCAGCAAAATGGTTACATACCCTCTAAAAAGACTACAAAATGCTATTTTATTTTATTTCTTTTTCAAAGAAAGACTCCTGGCCCTTGGTGTGTCCTACCTCAAGGTAGGGCTCAAGACACCAACTTTTTTCTTTCCATTGTTCAGCAGTTCAGATTTTGCTTTTTCATACAGGCAGATAGCTTAGTCAGATTTGCACAGTTTGACCTGAAAGTCACTGACCGGCTTCCTCAATTTTTCCCCCTTGTTACAAAGAAAGCAAATAAGTGTAATTTTTAAAAATTATTCTCTACATTCCCTGGAGTAAAAGTTAAAAATGAGCTGGATTTTTAAAAAAATCATCAGCCTCCTGGAAAAGCTTTCTGATTTGTATGGAGCCAATCTAGGACCCGATGGATCCTCTGACACTCTCCTTAAACTCTCAGGAAAATGGAACGGAGCCAATTCTTTGTGCTGTGCCCTTGTTCCAGCAACACAAAGACTTGCTGCCCTGATTTTAACTAGGATGAAGATTTAGCAGCCAATCTCCAAAGGGAGCATTTTCTCAGCCACTAGGGGAAAGAGGAGAGTTAACCCTTTTTAAGCAAACCCTTGCAAAATAACTCCTCAGAGAAAAATAGCAGGAACCTCTAATATTATCATGTCGTATCTTAAAGACTAGTCGTTCACAAAGTTTGTCACAGGGAGAGCAAGGGAGAAAGGGGTGTTGCGGGGCAGAGAGGGGAAAGAGTGCTTCAAGTTCCCAAATGAAAAGAGTGTTACATTTATAGAGATTATGTCACCGCTCAACTCTGGCAAATGGTGTTTATCAAGGCTGGCAGAGGAATAAATTATGCTTGTGTTTACTCTTTTGTTCCCATGGCCAAGTGCTGTTTTATTAATTGTTGAACACCATTTTGAGGCACTAAGGAACGTAAGGAGTCAAGATGAAAGGACATTTAGGTGAGGATCAAGACTGTTAACAGAGGCACAATCTACCGTCTTGCTGGTCATTGCAAAACATTAGCCAGTTGCCAGAATTGAGTCATAACACTTACATCAATGTTTAGTTATTTTACAATTTAGAACTCCCCTGTACTGTTGTAATATATTATAATGTTCCATTGCCTTTGTTTTCCCCAAGATCTAATCACGTTGTTCATTTCTCTTAGGACAAGACCAGCGCTCTGAGCCTGAGCAATGTGGCAGGCGTTTTCTATATACTTGTCGGAGGTCTGGGGCTGGCCATGATGGTGGCTTTGATAGAATTCTGTTACAAATCACGGGCAGAGTCCAAACGCATGAAACTCACAAAGAACACCCAAAACTTTAAGCCTGCTCCTGCCACCAACACTCAGAATTATGCTACATACAGAGAAGGCTACAACGTGTATGGAACAGAGAGTGTTAAGATCTAGGGGTACGGTTAAGGTCTAGTAAACTAATCAGCTTTACTTTACTGTATGTCAATCTCTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTGGTTTATTGTTCAAAGCATTGTCTCTTTGCAACCATTTGATTCTTTGAAAACAATGGTTGTGCTTTCTTGTCAGGCAGTGGTGCTTTTCTAATAGAATGGTTGTAATTAAATTGTGGTCTGTGACCCAAAAGGAAATACAATTCTCCAGAACATCATTGTTCAATAGAAAATATATGCAAGCCACATACATGAGCCACGTGTGCAATTTTAAATGTTCTAGTAGTCATATGTTAAAAAGTAAAACAAGTGAAATTAATTTTAATGATACATTTTATTTAACCCAATATATCCAAAATATGATCCTTTCAACATGTTATCAATACAAAAAAAAGAATGACAAATTTTACATTCTTCACGCTAATCTTGCAAATCTGGGGTATATTTTATGCTTATGGTACATCTTGACTCATACTAGTTACATATCAAATGTTCAGTAGTCACACATGGCCAGTGGTTATTGTATTGGACAATGCATCTCTAGAGAAAGCAGCTGCTCTGGAACAGATATTAAAATTAGGGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGCAGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGGGCATAGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAATTAGGTACACAGGTGAAACACTGCCACCTCAAGTAATACAGCACTTCCATAGGGAGAGGTGGTTCTTTTAAGTAAACAGTGTATAAGTCTGAGATAATTCACTTAAGCTTTGAGTTCTTTTGTTGTCCCTTCCTTGGAACTGGTGCACAGGTAAGTGTCTATCAAAGGATAGTCTAGGCTCCCAGCTGCTAGCCAAGCCCTAATTCATACTTCAGTGAACCTGAGTGTTGCCACCTTGACTCTGGCAACTACAAACACCACCAATAATTCAGAATGTTCAAATGCAAGCTCGAATTAGAATAATGTCTCCATTCTGGACGTGTTTAAAAGAATATAGTCTTGTTACTTTAAAGTGCATCTGTCATCACTAAAATGCCTATCTGAAGTGGAACAGAACAATAAGCAACTTCATACCCCTTATTTTAGGCAATTTTGACCTCATGAGTAAATGTCAATATGCTGGGATTTCTACAAGTGCATTTGTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTGGGGTTTTTTTGGGGGGTGTTCTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGGCGGAATTTCACTCTATCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGCGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACATCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCCGCCTCACCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTCTATTTTTAGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTCTTGACTTCAAGTGATCCGCCTGCGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCTGCATTTGTGTTTTGGCCTTCTTATAGTTCACACTGTGGATTTACATTTAGCCAATTTTTAAATAATATTTCATTCAAATAAATCATTTGTCTTGGTCATGGAAAACATAATTTTGTCCAGT
TTAAAATTTAGTCGCATGCTCCTTAAAGGTATACATCGTTAGGATAACATCACATTGATAAGCATGAAACACTCTTCCCCGCCTCCTTCCTGCCCCCCTTCGCTCCCCTAAGAAAGTTCTTTTTTAGTTTCAATTTTTGCCTTTCCTTTTTTTGGACTAATATCGTGGTATCAGTTAATTCATTTCATGAAATGCCACTCATTTTCCCCGTGCAATGAACCATTTTGCTACTGGTTTTCTACATCCCACATCAGGGAATTCTATAACTCTTGTGAAACTTAAATAATACATGGAACTTGAAACTGTTCTTCTTGTCACAGCTTACATGGGTTATGTCAAAGGACCTCTCCCCCCATTAAATATCATATACATATAAAAGTCTAATGGCAGAGGAAGGGTTACCAGAAATTGGTCTATTTCCCAATGGACTGTGGAACATCCTTGCAGATAGCCTCACCAGTCTCCTTAAAGAGATAATCCAATATTTCATATGTGACAGAAATTATTACTACTTGTCTAGCTGTCATTCATCCTAAAAGAGTGACTATTTGCAAGGTTGTTGTGAATATGAGGCATTCCCACACCCCGTTTCTGAATGCAATTCAATTTCAATTGGACCTTTTATTAAAGTAAACAAGTATAGGACTGGCTTCTATGAAAATGGGATAAGAAGGACACGGCCATATTGTCTTTACTTTTAATTATTTAAATGATACCAAGACCAGCTGAACTAGAGTGTTAAGTGTCAGCAATGGCCATCATCTGTCACTGTGTTGTCACTTAAATAAGATGCTCAAAATTCACTGGCTTAACAATTTGGGTATTCCATTCAATTACATTCAGCAGCAAAATGGTTACATACCCTCTAAAAAGACTACAAAATGCTATTTTATTTTATTTCTTTTTCAAAGAAAGACTCCTGGCCCTTGGTGTGTCCTACCTCAAGGTAGGGCTCAAGACACCAACTTTTTTCTTTCCATTGTTCAGCAGTTCAGATTTTGCTTTTTCATACAGGCAGATAGCTTAGTCAGATTTGCACAGTTTGACCTGAAAGTCACTGACCGGCTTCCTCAATTTTTCCCCCTTGTTACAAAGAAAGCAAATAAGTGTAATTTTTAAAAATTATTCTCTACATTCCCTGGAGTAAAAGTTAAAAATGAGCTGGATTTTTAAAAAAATCATCAGCCTCCTGGAAAAGCTTTCTGATTTGTATGGAGCCAATCTAGGACCCGATGGATCCTCTGACACTCTCCTTAAACTCTCAGGAAAATGGAACGGAGCCAATTCTTTGTGCTGTGCCCTTGTTCCAGCAACACAAAGACTTGCTGCCCTGATTTTAACTAGGATGAAGATTTAGCAGCCAATCTCCAAAGGGAGCATTTTCTCAGCCACTAGGGGAAAGAGGAGAGTTAACCCTTTTTAAGCAAACCCTTGCAAAATAACTCCTCAGAGAAAAATAGCAGGAACCTCTAATATTATCATGTCGTATCTTAAAGACTAGTCGTTCACAAAGTTTGTCACAGGGAGAGCAAGGGAGAAAGGGGTGTTGCGGGGCAGAGAGGGGAAAGAGTGCTTCAAGTTCCCAAATGAAAAGAGTGTTACATTTATAGAGATTATGTCACCGCTCAACTCTGGCAAATGGTGTTTATCAAGGCTGGCAGAGGAATAAATTATGCTTGTGTTTACTCTTTTGTTCCCATGGCCAAGTGCTGTTTTATTAATTGTTGAACACCATTTTGAGGCACTAAGGAACGTAAGGAGTCAAGATGAAAGGACATTTAGGTGAGGATCAAGACTGTTAACAGAGGCACAATCTACCGTCTTGCTGGTCATTGCAAAACATTAGCCAGTTGCCAGAATTGAGTCATAACACTTACATCAATGTTTAGTTATTTTACAATTTAGAACTCCCCTGTACTGTTGTAATATATTATAATGTTCCATTGCCTTTGTTTTCCCCAAGATCTAATCACGTTGTTCATTTCTCTTAGGACAAGACCAGCGCTCTGAGCCTGAGCAATGTGGCAGGCGTTTTCTATATACTTGTCAGAGGTCTGGGGCTGGCCATGATGGTGGCTTTGATAGAATTCTGTTACAAATCACGGGCAGAGTCCAAACGCATGAAACTCACAAAGAACACCCAAAACTTTAAGCCTGCTCCTGCCACCAACACTCAGAATTATGCTACATACAGAGAAGGCTACAACGTGTATGGAACAGAGAGTGTTAAGATCTAGGGGTACGGTTAAGGTCTAGTAAACTAATCAGCTTTACTTTACTGTATGTCAATCTCTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGTTTGGTTTATTGTTCAAAGCATTGTCTCTTTGCAACCATTTGATTCTTTGAAAACAATGGTTGTGCTTTCTTGTCAGGCAGTGGTGCTTTTCTAATAGAATGGTTGTAATTAAATTGTGGTCTGTGACCCAAAAGGAAATACAATTCTCCAGAACATCATTGTTCAATAGAAAATATATGCAAGCCACATACATGAGCCACGTGTGCAATTTTAAATGTTCTAGTAGTCATATGTTAAAAAGTAAAACAAGTGAAATTAATTTTAATGATACATTTTATTTAACCCAATATATCCAAAATATGATCCTTTCAACATGTTATCAATACAAAAAAAAGAATGACAAATTTTACATTCTTCACGCTAATCTTGCAAATCTGGGGTATATTTTATGCTTATGGTACATCTTGACTCATACTAGTTACATATCAAATGTTCAGTAGTCACACATGGCCAGTGGTTATTGTATTGGACAATGCATCTCTAGAGAAAGCAGCTGCTCTGGAACAGATATTAAAATTAGGGGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCACGCAGTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCTAACACGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGGGCATAGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCTGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATAGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGTGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAATTAGGTACACAGGTGAAACACTGCCACCTCAAGTAATACAGCACTTCCATAGGGAGAGGTGGTTCTTTTAAGTAAACAGTGTATAAGTCTGAGATAATTCACTTAAGCTTTGAGTTCTTTTGTTGTCCCTTCCTTGGAACTGGTGCACAGGTAAGTGTCTATCAAAGGATAGTCTAGGCTCCCAGCTGCTAGCCAAGCCCTAATTCATACTTCAGTGAACCTGAGTGTTGCCACCTTGACTCTGGCAACTACAAACACCACCAATAATTCAGAATGTTCAAATGCAAGCTCGAATTAGAATAATGTCTCCATTCTGGACGTGTTTAAAAGAATATAGTCTTGTTACTTTAAAGTGCATCTGTCATCACTAAAATGCCTATCTGAAGTGGAACAGAACAATAAGCAACTTCATACCCCTTATTTTAGGCAATTTTGACCTCATGAGTAAATGTCAATATGCTGGGATTTCTACAAGTGCATTTGTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTGGGGTTTTTTTGGGGGGTGTTCTGTTTTGTTTTGTTTTTGAGGCGGAATTTCACTCTATCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGACGCGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACATCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCCGCCTCACCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACTTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTCTATTTTTAGTAGAGACAGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTCTTGACTTCAAGTGATCCGCCTGCGTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCGGCTGCATTTGTGTTTTGGCCTTCTTATAGTTCACACTGTGGATTTACATTTAGCCAATTTTTAAATAATATTTCATTCAAATAAATCATTTGTCTTGGTCATGGAAAACATAATTTTGTCCAGT
Task1_train_31033
Consider a variant on Chromosome X in gene THOC2 (THO complex subunit 2). Determine its clinical classification and disease relevance.
Pathogenic; X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome
GGTACCAAGGAAGTATTTTTGTTAGCACAATCAAGATATTCCTGATGTGAGTATATTCGCCTGTTTCAAGGCAATGTACCGATGCCTACAACAAACATTTTCAGATCCATTATTATAAAAGCACAAGTATACAGAGAAAAATTTGCCTTTGAAAAATCCAATTTTTTTTTTACCTTGGTTAGTTTGTAATGCCATTTATGTACAACATGTCGAAAATTTTCATAGTCTAATTGATCAGCCTTATTTCCACCATCAAATCCAGTTGCCCGTAATATGGTAAGGAATCCTGGATAGTTTCCACATTCCTAAGGAAACAATGTTTGTCACTTTTAAAGAAAAATTATGATCCACAAAATAGCAGAAATTGAAACTTAAGTAGACTAGATCAATGTTTCCGTGTAAAAACATCATGCGTATTTGGATAGGTAGTCACAAAAAGTTCAACTTATACAAAGATACTAATTTGGAATGTCAGTTTGAGATAGAATAAAAAAGTACATAGCACATTTTAATAACAAATTAATTGTGCTTATAAACACAGTTTTACAACTGAATCTTAAACTCAGCTTCTCTTTTAAAACTCAACTATCTAGATATTAATGGATGTGGTCATTATATACATGGGTAAAATATAAGGGTTTTTATTAGTCATACCTTTTCATATGTGGCTCTATCACTATGCCACCTGGTCACAGTCTCTAACATGCAGCAAAGAAACCTTCCGTATCGACTGGCTTCATTTTCAGTACAGCTTGCAACTGTGTAAATTATGTCAGAGAAAACCTACAGGAGAAAAATGTTTAAAAAATATAAACAAATCAAGGTCAAAATCAGTTAAAAATATTAGAAGATTCTCTTACAGCAAGTCATAATAAACAGGTAAGCCTAGTCAAAATGTATATTCCCTTTATATAATGACACTGCAGAGAACTTTGGAGATTTTGGCTTTTGTGGGGAAATAATGCATTCATAAAACAACCACCCAAAACAAGAACTTTTATAAAGAAAGCTGATTTACAGTGACAAGGAAAAAAAAATTTATCATTATTATTACATAATAAGTTGTTTTTTTTTTATTACATAATAGTTTCTTAACCACTTAGCCATACATATTACTGGGTTTACGGGGAGAGTAAGCAGAGGAAATGCTGATAGAAATTAAAAATATGCAGCTGACATACTGGAACATACATTATGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGAGACTGAGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGGGCCGTGGTGTGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCCGCGTCTCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCACCACCACACCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCGAAGTACTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCCGGCCACATTATGTTTTTAAACCACAAAATGTAGTAATAAGAAAAAAGCTAAATGCAAAATGTGCATATGACCATACTGAAAAGCTTCCCTGCTTTTATATGTGTGTGAAGGTGTAAACTTTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGTGAAGGTTAAGAATGGAGAAGAGAGTTCTACCTATTATGATACAACACGTAAACTCAAATACTTAGTTAATAGTTTAACCTTGAGTGCCTATTACATATCAGGTACTTTTTATGTGTAGTGATTCATTTAATCCTCACAACAATCTTATGAAGCAGGTACTTATGCTTTACAGATAAGAAAACAGGCACAGAGAGGTTAAATAACTTGCCAAAGATCATACAGCTAGAAAGTAGTAGAGCTAGGATTCAAGTTCAGACACTTGGTTCTTGAGTTCATGCTTTTTAACTAAACACACAATAATACCTCTATAAATTATAATGTTAGCTATCTTTGTGTGAGAACTTTTTAAAGGTTGCAATAAAAACTTACTCGATCATAGCAAAGAAGTGTGGAAAAATTTGGAGTTTTCTGTTGATGTACCAATTCAACAAAACGAGCACAGTAAACAGCATCAATTGCTGAAAAAATACATCGAGGAAATATACACAGCTGTAGAAATTTTGTGATGGTCTCATTTTTGGTAGATTCTAAAAATAAAGGAAGAATATATTAAGTGGTAAACTTCTTCCCCAAGTGCCTCAAAGCCACTAAACATGACAACATATTACCTTTAGTGAAGAGAATACTATAAACCACAAACTATTTATAGTTTGTAACCAAATGTCATGCCTGGTCATGATTATCATTTTTACTATGTGGACCTTTTTTTCTATGATTTCTCCAGAAATATGTTTTATACAGAAAAGCTGAATGACAAGCTGCCAATATGTAGTTAAAAGTTAATTAACTTCACCAGCAAACTATATCAGTTCCTCCAGTGAACATGAAGTTGATTCTGCATTAACAAATAACCAAAGAATGGGATAGGGAACACTGAGTTGAAATACAAACATAATACACTTTAACACCTCTAAAGTTATAATGTTTTGTTTTCTGTAATTTACCAGCATCAGGAACCTAACAATTCCAACAACTTACTTGCTAAAAGCCAGTTGTCCTTTTCCAGTTTCAATCTCTGTAGAACTCTCTGTACATGTTCCATCTGTTTCTTTTCTTCTTCAAGAAGCTTGTCCTGAAGGGCAGTACAGCGCTCCTTCTCTTTTTTCTTTTTATTTGGGGGCTACAAAGAATTCAATTAGACACTTTTCTAACTATATGCACATTACCTTTCTTCTTTTAATTGAAAAGTTTAAAGAGATAAAGGCTGATAGTTTATAACTACTTTAACATGAATATAGGTCCACTTGAACGTGCTACTTTTATCTCCATTCAACACACTCATAACACTGTCATGGCATCTTCATACACCATCAGAACAGGCTACATTTGCAACACTGACACTATTAGTCTCAGGCATGGTGTCATCTTTGACTCTTCCCTCTCCTTTATATCAAGACTGGTTTACAAGCCTTGTACACTGCCACTACCTCCATCAGTCTATGCTCTCACAATAGACTGCCCAAAAAGCCACCTAGCTGGTCTTTAGCCTAATGCTAGTCAAAAAGCATCTTTCATACTGCTGTCATGAGTAATCTTTTTTAAGTACCATTTTTTACATTACTATCCTGCTCAGGAATCTAAAATAGCTCTCAATTTTACCAAGTCTACTTTTCTCCCTGACTTCCAATGCCTACATAATCTGGCCCCATCATAACTATTCATATGAATCACTAAGTACATTCACTACATGAAAGTGAATCAGTAAAAGTGGTCTCCCTAAACCTCAATCTACTTCCTGTCTTTGCTGGAACCCTATGGTGACCTCCCTATCTGCTTCCATATTTCCAAACCTAATCTACCTTCAAGGCCTGTCCATTTCAAGACTCGGCTTCTCAATAGTCTTCTCCTAAAGAACTCTCCTCTTGAGAACTACTGCTCTTGCTATTAGAGTCACATGAATCACTTTAAGTTACTAGCATAGTCGTCAGTAGAAAAGGACACTCAAATAATTTTTGATTAATCATAACCTCCACCTAGTCACCAAACTCCTGGCCCCCCACTCAGAAGTAACTATTAAACCCCATTTAAGAAAATATTATATAGCAACAAGATCACTGTTTTAAGGAACCAGAGCTAAAACAATTTCAAAATATAGGTAACATTGAATACCATAAAGTTATTGCACTTGAACTACTAGAACAAAAACCTACCATTTCCTGATTGTCATCAATTGCTTTCATCTGGACTTTAAGTTTATTGACTTCTCGTTCATAGCTGGTGTGTGGAACTGCAAGGTCATACATTGTCAATGACCAGAATGTAGCATAGAATTGAGGGCTGATGTCATCCCAGACTTTGGAAACATGTAAGGAGACCACTGCTTCATGGACAGGCGCCATCACCATCTCACATGATGTAATGTACTTATGAACTTTATGTTGCTGTTTACTTCCCTTTTCTGATTTTTTAAGTTCATCATACTTTGACTGTAGATAAAAAG
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Task1_train_31034
A genomic change on Chromosome X affects THOC2 (THO complex subunit 2). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome
AATAGCAGTTGGGAAAACAGAGAGTGTTTTTTAATTTAGAGGACAGGTCTTATTGAAGGTAACTAATATGAATCTAGATGAGCAGAATGACTTCTGCTAAGGTTCTAACAAAACGGGATAAAATAGGGCTGACATTATCTGCATAAAAGACAGCCTAATTACCTGTTCTGGGCAAGATCTAGAATATGAACTAGGTTAAAAGCCTATCTTTCAGACCTGTGTCTCAAGGTGGACCACAACCTCAACAATTAAAACTAAAAATTAGTTTATAGGTATGAGAGGGTTACATGATAGCTCCAATCTCCCCAGTCCTCTGGGTCTGAATCTGTGATTTCTATTGCTAGGAACCCCATAGTCACTATCTAGTTAGAAAAATAGGCTTGGTCAGAAAAGAAGGCTATACTTCGTATTTACCCAAGATGAATATGTCCTTGTCTAAAGTCAGTTTAACTCCCACTTCAAGTTCACACCTTCAGTCAAATGAAGAGACATAACAGTTCTACATTTCAAATTGCCTGGGGAACTAGACTTATGGAATAGAACTGATATCCACAATTATTGCTGTACTTCTCACTATTGTTCAAAAATCTCGTCTCAAGAATCTGAGCAGGCCAGGCACAGTGGCTCATGCCTATAATGCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCTCATCTCTTCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGCCTGGGATAGGAGTATCGCTTGAACCCGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGAAGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGGCAGCGTTTGGCTGAATTATCCTCAAGAGAGCCTGCTGATAGTTTATAGAGGGGACATAGCAATCACCTAATATACATTTTCACTCTCTCAACGAAGGCTCTTCAACAGAGGCTTTCACTCAAGAAGCAAAAGCAAGGATCCCCAGGACAGCTTGGATGCCCATCCAGCACAACCACAAGATTGCTGGGAAACACCTTTTCCAGAGAGTGGCATGCTGCCTACAGATAAAAGACTTATATCTGACTTGGCTATACAGCCACTTTCATTTAGTTTTCTGTTTTCTTCCAAGCCTGAGAGGGAAATGCCATTTCTTTGTTTAGGTTTTTGTATCTCTTAAAAGACAAAGGTAATATTTTACACAAGTAAGAGAGAAAAAGTAGCTTGAATGACCTGCTCCATTTTCTGAGCTGGAAAAGTTCAGCCAACCACAGACAACCAGGTGTTCCTGTTTGCTAGGATTCCATATTGCTGATTAGTGTGTTCACTTAGCACAGGGCAGGTCAGAATTCCTAAGATGAAGAAATTCTCCCACCTCTGTCTGTCAAGAAATCAGGTACCCTCTTGCACAGCTGAGACTGATCTACCATGGGGTGTGACAACAGTAAGACGTTACACAAAGACGGCAAACAATTCTCTGGATTGAGAGGATCTAAAGGGGAAGAAGCAGCCTAACACCACTCCCTTATTGTCTTTTTCCCTTCAGAGTGTATACATAACACAGGAATTTCTGCATAGTGCTAACAAAGTGATAATTAAATCAAGTAGCAGTTAGTTAGGAAAGAAGTGGGAGACTGTAGCAGTTGATATGTAAACACTAACAGCAGATGTTTGATTAAATGATCAATTAGACTCCAAATTTCTCATCACCTTTTTTGTATACCTCTACCACACAGCTTCGTACCCCTATTGGAAACAAAGAAGGGATCCTAGTTTAGGGCCAAGACCTTCCCCCAAAATCTGTAGTGATATGTACTTACAGATAAAACCGTTAAGAAATAATTTGGATCGTTCTTGAGCGGCAGCAAAGACACTTGTACTTACCGAAATATGATGGGCATACATTGGCCTAGACAGGAAAAATGCTGCATCATGGGGTGTATGAAATTCATTACAGAGTACATCAATTGAAGGCACTCGCTTTATATAATCTTCTGTGCTCAGATTAGATGCTAAAAACCCACCAAACTGCACCAGGGTATCATGACACTAAATTTAAAAAATAAGACAAAATCAACATATTTTCCAAAGTGATTAAGAAGTCATTTTAGGAATATTTTAACAATTAAGAATCCAAATTTTATAACTTAAAAGGACTTTAGAGACTATCTACAAGTATAACCACATGACCATATTACAAAAAAAGATGCCAAGGCCCTGACAGGTTGACTAATCCAAGGTTTTACTAGCCAACTAGGTCTCTTAAATGTCAAGCTGTTGTTCATCACTTTTAGTAGAATATATTTACCTAAATCAAATAAAATAATAACCATAGGCAAACAGAAGTCAATTCCTTTGCCCTTAAAAGAAGAAAACTTTATTTACAGAATATATTTATAAATATTAAGTACCAAAACCTAAGATTAGCCCACAAAATGTGTTTAACTATCATCAACTATAACACAAAGAAAAAGAGAGACAGCAACCCAGCCTGGGCAACACGGCAGAGGCCCGACTCTACAAAAAAAATCTAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGACTGATCACTTGAGCCAGGGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTGAGATCATGCACTGCACTCTAGCCTGGGTAACAGAGTGAGGCTTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAGAGTGAGCATGCACAAGTGGGCAAGCAAGCATCTATTCTGTTATGACTGAGATTTCCAGAGATCGGGAAAGATATAAATGCAAACAACTTGAAGTTGCAGGAATTTAATGATGTAATATTTAATTAATTGACAGCCTTACATATAACATCTCTTGGAGCTATCTCTTATATATCACAATTTACATAGAAATAGGCCCTATTTCCAGAATGTCTTTCACATTAGGATGTCTCATATTCAAATGATGTGCAAAAATGACATTTTTCAAATTATAACACATTATCCTCCTTTAACAGGATTAAAAACATGTACATAAACATAAAAGCCACTTTAACTTGCCTGGTCATAGAGCTTTCCCACAAGTTTCAAATGTTTCTCTCCACCTTCCTGAAAGATTACCCCATTTCTCTGCTGAGCCATAAGCAGACAGAGAGGAAGGGCAAGATCATGGTCCAATAGAGCATCCTTTAATCTCTGAGAGGATTTTTTAGTGTTTCTGATCTGACCAAAATAACCACCCTGCACAAGGGAAGACACAAATTTACCAGTGTACAGTACATAACCCATGCTAATTTGAAAAAGACACAGAAAAAAGTTGAGTTAAAATGCTTAATATAAAAAACTCCTACATTCCACATTCCTTCCCTTACACAAATTTATTTCAGTGACTATTACTGACTACAGTCACTGGCTTAAAGACAAATGTCAACTGAATTTAAATTTCTGCATATTTTCCATTTTCCACCTTGCAGTCCCCTCATAAAGGATTATTCATTATTCAGTATGGCACAGATTCAACAGAGCAACTAAGACTTAAGGGAGTGAGGATATCAAGGATCATAGAAGATATAGTAATTATTTGGTGATTATTTTATTTATTTATTTATTATTTATTTTTTGAGACAGCATCTCACTGTCTTGCCCAGAATGGAGTACGATGGCGAGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACTACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAATGTTGGGATTATAAGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCTTATTTGGTAATTATTTTCCTTACGGATGCATTACTTACTGCCTTTTATACTTTGTTTCAGCTTTTTTAAAAAGTTAAAGTAATTACTGTATCTCAATTTCAAAAGGGGGGCAG
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Task1_train_31035
A variant was discovered on Chromosome X, affecting THOC2 (THO complex subunit 2). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome
AGGTAATATTTTACACAAGTAAGAGAGAAAAAGTAGCTTGAATGACCTGCTCCATTTTCTGAGCTGGAAAAGTTCAGCCAACCACAGACAACCAGGTGTTCCTGTTTGCTAGGATTCCATATTGCTGATTAGTGTGTTCACTTAGCACAGGGCAGGTCAGAATTCCTAAGATGAAGAAATTCTCCCACCTCTGTCTGTCAAGAAATCAGGTACCCTCTTGCACAGCTGAGACTGATCTACCATGGGGTGTGACAACAGTAAGACGTTACACAAAGACGGCAAACAATTCTCTGGATTGAGAGGATCTAAAGGGGAAGAAGCAGCCTAACACCACTCCCTTATTGTCTTTTTCCCTTCAGAGTGTATACATAACACAGGAATTTCTGCATAGTGCTAACAAAGTGATAATTAAATCAAGTAGCAGTTAGTTAGGAAAGAAGTGGGAGACTGTAGCAGTTGATATGTAAACACTAACAGCAGATGTTTGATTAAATGATCAATTAGACTCCAAATTTCTCATCACCTTTTTTGTATACCTCTACCACACAGCTTCGTACCCCTATTGGAAACAAAGAAGGGATCCTAGTTTAGGGCCAAGACCTTCCCCCAAAATCTGTAGTGATATGTACTTACAGATAAAACCGTTAAGAAATAATTTGGATCGTTCTTGAGCGGCAGCAAAGACACTTGTACTTACCGAAATATGATGGGCATACATTGGCCTAGACAGGAAAAATGCTGCATCATGGGGTGTATGAAATTCATTACAGAGTACATCAATTGAAGGCACTCGCTTTATATAATCTTCTGTGCTCAGATTAGATGCTAAAAACCCACCAAACTGCACCAGGGTATCATGACACTAAATTTAAAAAATAAGACAAAATCAACATATTTTCCAAAGTGATTAAGAAGTCATTTTAGGAATATTTTAACAATTAAGAATCCAAATTTTATAACTTAAAAGGACTTTAGAGACTATCTACAAGTATAACCACATGACCATATTACAAAAAAAGATGCCAAGGCCCTGACAGGTTGACTAATCCAAGGTTTTACTAGCCAACTAGGTCTCTTAAATGTCAAGCTGTTGTTCATCACTTTTAGTAGAATATATTTACCTAAATCAAATAAAATAATAACCATAGGCAAACAGAAGTCAATTCCTTTGCCCTTAAAAGAAGAAAACTTTATTTACAGAATATATTTATAAATATTAAGTACCAAAACCTAAGATTAGCCCACAAAATGTGTTTAACTATCATCAACTATAACACAAAGAAAAAGAGAGACAGCAACCCAGCCTGGGCAACACGGCAGAGGCCCGACTCTACAAAAAAAATCTAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTATAATCCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGACTGATCACTTGAGCCAGGGAGGTCAAGGCTACAGTGAGCTGAGATCATGCACTGCACTCTAGCCTGGGTAACAGAGTGAGGCTTTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAAAGAGAGTGAGCATGCACAAGTGGGCAAGCAAGCATCTATTCTGTTATGACTGAGATTTCCAGAGATCGGGAAAGATATAAATGCAAACAACTTGAAGTTGCAGGAATTTAATGATGTAATATTTAATTAATTGACAGCCTTACATATAACATCTCTTGGAGCTATCTCTTATATATCACAATTTACATAGAAATAGGCCCTATTTCCAGAATGTCTTTCACATTAGGATGTCTCATATTCAAATGATGTGCAAAAATGACATTTTTCAAATTATAACACATTATCCTCCTTTAACAGGATTAAAAACATGTACATAAACATAAAAGCCACTTTAACTTGCCTGGTCATAGAGCTTTCCCACAAGTTTCAAATGTTTCTCTCCACCTTCCTGAAAGATTACCCCATTTCTCTGCTGAGCCATAAGCAGACAGAGAGGAAGGGCAAGATCATGGTCCAATAGAGCATCCTTTAATCTCTGAGAGGATTTTTTAGTGTTTCTGATCTGACCAAAATAACCACCCTGCACAAGGGAAGACACAAATTTACCAGTGTACAGTACATAACCCATGCTAATTTGAAAAAGACACAGAAAAAAGTTGAGTTAAAATGCTTAATATAAAAAACTCCTACATTCCACATTCCTTCCCTTACACAAATTTATTTCAGTGACTATTACTGACTACAGTCACTGGCTTAAAGACAAATGTCAACTGAATTTAAATTTCTGCATATTTTCCATTTTCCACCTTGCAGTCCCCTCATAAAGGATTATTCATTATTCAGTATGGCACAGATTCAACAGAGCAACTAAGACTTAAGGGAGTGAGGATATCAAGGATCATAGAAGATATAGTAATTATTTGGTGATTATTTTATTTATTTATTTATTATTTATTTTTTGAGACAGCATCTCACTGTCTTGCCCAGAATGGAGTACGATGGCGAGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACTACACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGGCAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGTTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAATGTTGGGATTATAAGCGTGAGCCACCACGCCCGGCCTTATTTGGTAATTATTTTCCTTACGGATGCATTACTTACTGCCTTTTATACTTTGTTTCAGCTTTTTTAAAAAGTTAAAGTAATTACTGTATCTCAATTTCAAAAGGGGGGCAGGGGTGGTTGTGAAAGGAAGGTATGTATGGCTTTGACATTTGGTTTTATAAACTTACATATTGTTTGGATTCTTTACTATGACCGTGCATACATTATGAATTTTAAAAGTTGATGAACAAAAATAGCAATTCTTACCTCAGCTTTTAGCTGCTCTCCACCAGTCATAGCCTCTAGTTGCTCCATTGTCATTTCCTCTGTAATTTCTATTCCTGCCATTTTTTGTACCACTTCTTTCAATATAAGCAGGTCAAAACTATTCAAAAAGAAAAAAGAAACAGTCTATAGTTAGAACTTCAAATATAAAAGTAACAATGTATTGTAATTAATATACTGAGAAACCCTTAATTATTTGTATATAAATATGGGGGAAGGGGCTGAAGCAGTTTTTAACTGCATTCCTAGAACTATATTGACAAATACTTGGTGCGTAAGTTTATTTTAACTTTTACTTGGAAATAATTGCAAATTTACAGATAGGATGGAAAAATAACAATAGTACAAAGCTCACCCATATATCCTTTACCTCAACTTCACCTGGTAACATTTTTACTCCTGCTTGATTATTTGCATTTTCTCTCCCTCTCTGGAGCCCCTCTCTACATACATAGTCACACACTCAATTTTTTAATCATTTGAGGGAAAATTATTTACATCATGGCCTTCTACCCCTAAAATTTCTAAGACTGAATTTCCTAAGAGAGCTATTCTCTTAAATAACCACAGCACAGTTATCAATTTTAGTACATGTAACGCTGATACAATACTTTAATCTACCATTCATATTTCATTTTATCAGTTGACCCAATAAAGTCCTTCATAGCATTTTTTCTCCTCCAATACAGGATGGCCAAAATGTTTTTGATGGTATAGAGCCATTTCTAAATAATCCATTTACTAAACAGGGACAAAGATGTAGCATGGTCACATACACTTGGAAGCGAGGCAGGGAAGGAAGGAAAAAAAGAAGTTCTAAGTTGTGGTATCTGAGCCAAAGATGACAATTTAGTGGCCAGCCCAGAGCACATTTCAGTAATGTGCCAACAGTTATGCTTTTTAATCTGCAAAGTTTAGGACTACCAATGGAAATAATACCTTATGTCCTCTAAGATCTTCTTTAATTAATCTAAACAAAGTAAAAACATTCTTTCCTAAAACATACAGATGTTTTTCCAAACATAAAGTCAGACATACCCAAGACACAAGCTAATAGACGAAAGAACCATTTTCTAAGATTCTTATTAAATGTTTGTTCTCTCAACTTGCCTTGCT
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Task1_train_31036
The following genetic variant occurs in THOC2 (THO complex subunit 2) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome
ATGTGCAGGTTGGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTAGTCATTTACATTAGGTATATTTCCTGATGCTATCCCTCCCCTCTCCCCACACCCCACAACAGGCCCCGGTGTGTGAAGTTCCCCTTCCTGTGTCCAAGTGTTCTCCTTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGTGAGTTTGCTGAGAGTGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTGCAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGACTGCATAGTATTCCATGGTATATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTAAATAGTGCCGCAGTAAACAAACATGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATTCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTGCTGGATCAAATGGTATTTCTTGTTCTAGATCCTTGAGGAATCGCCACACTGTCTTCCACAAAGATGGATTAAAGACTTAAATGTTAGTCCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACAAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAACTAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACTGGCAACCTACAGAATGGTAGAAAATTTTTGCAATCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTCAAACAAATTTAGAAGAAAAAACAAACAACCCCATCAACAAGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCAACACTGGCCATCAGAGAAACGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGAAAACAACAGGTGCTGGAGAGGAGGTGGAGAAATAGGAACACTTTCACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTATTTGAGTTGGGTAGTGGACATATGGGTGCTTAGTTTAGGGAAAGTCACTGAGCTGTATTTTTCCGTATGTATGTTTTATTTCAATAAAAATCTTAGTAAAAGAATAAATAAATAAAAGAATGGGTCCTTAACAGTCTGAGGCTGAAAAGACTTCTTACACATAGCAGCAATGATTGAAAACTACACTCAAGAAAATGACTAGAAGGAAAAGAATGCTAAGTAACCACTAATCATAAGGGAATTAAAAAAGCAGCCACTTGTCTGAAGTATATTTTCCCATGTGAGGGACTTGACTAATAATCTCGCTAGATTTGGGTTTATATTAATATATACAGTTATGCACCATTTAACAATGTTTCGGTTGATGGACCACATATATGACCAGGGTCATATAACATTATATTAGAGCTAAAAAATTCCTATTGCCTAGTGATATCATGGCTGTCCTAACATCTTAGTGCAAGGTATTACCTTTTAAATGTTTAGATATGTTCAGATACACAAATATTTAACAGTGTATTACAACTCCCCACAGTATTCAGTACGGGAACATTCTGTACAGGTTTGTAGCCTAGGAGTAACGGGCCATACCATATAGTCTAGGTATGTAGTAGGTCATACCATCTAGGCTTGTATAAGTACACTCTCTGATGTTTGCACAATGACGAATCACCTAATGATGCATTTCTCACCTGTCATTAAGCAACACTTGACTGCATATGGTTAGGACACACTGGAATTTTCCACAAACCTCACTCAACATAACCCTTTATTAAATGAGGTTCATATTTTTATTTCTAAAGATACTCATAACACAAGTATACTCAGAATATTTTCATTTCAAAATTTAGGTTTGTAAGAAAAATCTTACTTACCTCCTTCATAAATGACTTGCCTATGCGCACCACTTTTGCAAATAAAATGGGATCGTGAGAAAGGTGAGGACCAAGGTAACAGAACATATTGAACACGTCTCTCCTCAAATCTTCAAAGCTCTCAGCTTGTTTTGGTGCTCTCTTGTTTTGCAAAGCATTAACAGGTGAGCCTTTAGCACCTTTAGGAACTCCAACTCTATTTTAAAAAGTAAAATAAATAAATAAACAAATAAATAAGTATATAATAAATATAACTATATACACACACACTACAATATCTACCATTTTAACAAAGTTATCTTAATCAGTGAAATTTTTTCTTGCTCATATTTGCTTTCTACATTTCAATTGTGCCTAACTTTATTACACCAGATAATTCTCAACTGGTAGAAACACATAAAAACAACAGTCATTAGAAAAAAAAAATCAGAGCTCAGAGGAGAATGTTCCAAATTAACTGCTTAATCAGAGAAGTGTGGATTTCAAGGAACATTTAACACACACCATCTGAATCTGTTTTTAAACTTGGCCGGTATCGGGAACTTGGATATGGGAATGGGCAACAAGGGATGGACCTAAGATGCACTGGAAGATGAAACAGAAAAATATGGATATAACAACACTGATTCAAGTCAACTGACATTTCTCAATCTGGATTCCACAACCTAGGGTATGTAGAATGTGGTCGTAGGGAAAGTGAGCCATGTAATAAAAGAAGGTCACTTTAGGACACCATACCCAGAGTTCTCACCTGCTCAGCAGGTGCCCCACTGTGGAGTCACAGGGGTCACTCTCTAAGAAGCCTGCATGGTCCACGGCCCATGAAGTGACACTGACGGCAGCAACCAGCAGCTACACAAAAGTCACAAGGCTGAGGCTTTTGAGGCAGGCTCTGATCTATGGGGCTGTAGCCACAGCTGCTATCAATACTGCTCCTAAGTATCCTGCAAGTAGGCAGAAAGCTAAAGGACTAGATGACATAGTAACTGGGGATGATAAGAGAGGCTAAACTACTAATTTCCAGAACAGCAGCCTATATGCCAGGAAAGGTAAGGGAATCAGAGAGGCAATGTCCTCACTCAGAGCCACTCAGCCAGGATGGAGAAAAATTACACTAAGAAAAAACCTCAGGAATTCTTTGCCCCTCCCACCCACTGAAAGGAGGGAAAGTCAAAACCAGAAGAATGGAGTTTCAACTCTCAATGGAACAAACCCAACCTAGAAGTCTAACTTGTAGTTTTCAGACTACACTGCAGCACACATTCTAGAACCCCTGGTCTAGACGTTAGAAGACAAGTCACTGATTAATATATATCAGACTGATACACTCTGTGAATAGTTCTTATCTTTTGATAAAAGGTACTAAAATATATGCTTGGTTTGAGGAGATAAGATAAATATACATTTTGTTGTAGTCCTAAGCTATTTCTACCTCAATGATTAATAAAGTATAAAGTTACATACCTTCGGTAGAGAGGCTCAATAGTTATATGAATGAGCTTGCAAATAGCAAGGGCTATTAGCTTGTGTGAAGCTGCATAGTATGGAGGCATCTGATCCATAATGTTCTGTGCATGTTGCCAATCACCAATCTTTAATAAGGCTTCCAACAAGCCAAGTTTTTGGTTATCAGGTGGCTAAAAATGAATAGTCAAAACTAAGATACTCAGGATACAGACATCAAGAAATCTTAATACTTTGTCACTTAAAAAACTGACCTAAGCAACACATCAAAAATATTTGCTATTCATGGGAAATTAAACAATATATTCCTGCAAGTACAATCAAAATTTTTAGCTATTGAAAAAACATCAGGGCCAGGCGCAGCGGCTCACACCTATAGTCCAGGAACATGGGAGGCTGAGGTAGGCAGATCACTTGAGCTCAGAAGTTTGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCTGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTAGAAGGCTGCAATGAGCTGTAATCATGCCACTGCACTCCAGCCCGGGTGAAAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAATAATAATAAATTTATTAAA
ATGTGCAGGTTGGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTAGTCATTTACATTAGGTATATTTCCTGATGCTATCCCTCCCCTCTCCCCACACCCCACAACAGGCCCCGGTGTGTGAAGTTCCCCTTCCTGTGTCCAAGTGTTCTCCTTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGTGAGTTTGCTGAGAGTGATGGTTTCCAGCTTCATCCATGTCCCTGCAAAGGACATGAACTCATCCTTTTTTATGACTGCATAGTATTCCATGGTATATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGATGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTAAATAGTGCCGCAGTAAACAAACATGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATAATTCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTGCTGGATCAAATGGTATTTCTTGTTCTAGATCCTTGAGGAATCGCCACACTGTCTTCCACAAAGATGGATTAAAGACTTAAATGTTAGTCCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACAAAAAGCAATGGCAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAACTAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACTACCATCAGAGTGAACTGGCAACCTACAGAATGGTAGAAAATTTTTGCAATCTACTCATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTCAAACAAATTTAGAAGAAAAAACAAACAACCCCATCAACAAGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCAAAAGAAGACATTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCAACACTGGCCATCAGAGAAACGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGCGATCATTAAAAAGTCAGAAAACAACAGGTGCTGGAGAGGAGGTGGAGAAATAGGAACACTTTCACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTATTTGAGTTGGGTAGTGGACATATGGGTGCTTAGTTTAGGGAAAGTCACTGAGCTGTATTTTTCCGTATGTATGTTTTATTTCAATAAAAATCTTAGTAAAAGAATAAATAAATAAAAGAATGGGTCCTTAACAGTCTGAGGCTGAAAAGACTTCTTACACATAGCAGCAATGATTGAAAACTACACTCAAGAAAATGACTAGAAGGAAAAGAATGCTAAGTAACCACTAATCATAAGGGAATTAAAAAAGCAGCCACTTGTCTGAAGTATATTTTCCCATGTGAGGGACTTGACTAATAATCTCGCTAGATTTGGGTTTATATTAATATATACAGTTATGCACCATTTAACAATGTTTCGGTTGATGGACCACATATATGACCAGGGTCATATAACATTATATTAGAGCTAAAAAATTCCTATTGCCTAGTGATATCATGGCTGTCCTAACATCTTAGTGCAAGGTATTACCTTTTAAATGTTTAGATATGTTCAGATACACAAATATTTAACAGTGTATTACAACTCCCCACAGTATTCAGTACGGGAACATTCTGTACAGGTTTGTAGCCTAGGAGTAACGGGCCATACCATATAGTCTAGGTATGTAGTAGGTCATACCATCTAGGCTTGTATAAGTACACTCTCTGATGTTTGCACAATGACGAATCACCTAATGATGCATTTCTCACCTGTCATTAAGCAACACTTGACTGCATATGGTTAGGACACACTGGAATTTTCCACAAACCTCACTCAACATAACCCTTTATTAAATGAGGTTCATATTTTTATTTCTAAAGATACTCATAACACAAGTATACTCAGAATATTTTCATTTCAAAATTTAGGTTTGTAAGAAAAATCTTACTTACCTCCTTCATAAATGACTTGCCTATGCGCACCACTTTTGCAAATAAAATGGGATCGTGAGAAAGGTGAGGACCAGGGTAACAGAACATATTGAACACGTCTCTCCTCAAATCTTCAAAGCTCTCAGCTTGTTTTGGTGCTCTCTTGTTTTGCAAAGCATTAACAGGTGAGCCTTTAGCACCTTTAGGAACTCCAACTCTATTTTAAAAAGTAAAATAAATAAATAAACAAATAAATAAGTATATAATAAATATAACTATATACACACACACTACAATATCTACCATTTTAACAAAGTTATCTTAATCAGTGAAATTTTTTCTTGCTCATATTTGCTTTCTACATTTCAATTGTGCCTAACTTTATTACACCAGATAATTCTCAACTGGTAGAAACACATAAAAACAACAGTCATTAGAAAAAAAAAATCAGAGCTCAGAGGAGAATGTTCCAAATTAACTGCTTAATCAGAGAAGTGTGGATTTCAAGGAACATTTAACACACACCATCTGAATCTGTTTTTAAACTTGGCCGGTATCGGGAACTTGGATATGGGAATGGGCAACAAGGGATGGACCTAAGATGCACTGGAAGATGAAACAGAAAAATATGGATATAACAACACTGATTCAAGTCAACTGACATTTCTCAATCTGGATTCCACAACCTAGGGTATGTAGAATGTGGTCGTAGGGAAAGTGAGCCATGTAATAAAAGAAGGTCACTTTAGGACACCATACCCAGAGTTCTCACCTGCTCAGCAGGTGCCCCACTGTGGAGTCACAGGGGTCACTCTCTAAGAAGCCTGCATGGTCCACGGCCCATGAAGTGACACTGACGGCAGCAACCAGCAGCTACACAAAAGTCACAAGGCTGAGGCTTTTGAGGCAGGCTCTGATCTATGGGGCTGTAGCCACAGCTGCTATCAATACTGCTCCTAAGTATCCTGCAAGTAGGCAGAAAGCTAAAGGACTAGATGACATAGTAACTGGGGATGATAAGAGAGGCTAAACTACTAATTTCCAGAACAGCAGCCTATATGCCAGGAAAGGTAAGGGAATCAGAGAGGCAATGTCCTCACTCAGAGCCACTCAGCCAGGATGGAGAAAAATTACACTAAGAAAAAACCTCAGGAATTCTTTGCCCCTCCCACCCACTGAAAGGAGGGAAAGTCAAAACCAGAAGAATGGAGTTTCAACTCTCAATGGAACAAACCCAACCTAGAAGTCTAACTTGTAGTTTTCAGACTACACTGCAGCACACATTCTAGAACCCCTGGTCTAGACGTTAGAAGACAAGTCACTGATTAATATATATCAGACTGATACACTCTGTGAATAGTTCTTATCTTTTGATAAAAGGTACTAAAATATATGCTTGGTTTGAGGAGATAAGATAAATATACATTTTGTTGTAGTCCTAAGCTATTTCTACCTCAATGATTAATAAAGTATAAAGTTACATACCTTCGGTAGAGAGGCTCAATAGTTATATGAATGAGCTTGCAAATAGCAAGGGCTATTAGCTTGTGTGAAGCTGCATAGTATGGAGGCATCTGATCCATAATGTTCTGTGCATGTTGCCAATCACCAATCTTTAATAAGGCTTCCAACAAGCCAAGTTTTTGGTTATCAGGTGGCTAAAAATGAATAGTCAAAACTAAGATACTCAGGATACAGACATCAAGAAATCTTAATACTTTGTCACTTAAAAAACTGACCTAAGCAACACATCAAAAATATTTGCTATTCATGGGAAATTAAACAATATATTCCTGCAAGTACAATCAAAATTTTTAGCTATTGAAAAAACATCAGGGCCAGGCGCAGCGGCTCACACCTATAGTCCAGGAACATGGGAGGCTGAGGTAGGCAGATCACTTGAGCTCAGAAGTTTGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCTGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTAGAAGGCTGCAATGAGCTGTAATCATGCCACTGCACTCCAGCCCGGGTGAAAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAATAATAATAAATTTATTAAA
Task1_train_31037
The gene THOC2 (THO complex subunit 2) on Chromosome X contains a mutation. Based on this information, is the variant pathogenic or benign? Provide the disease if relevant.
Pathogenic; X-linked intellectual disability-short stature-overweight syndrome
ATGGGAATGGGCAACAAGGGATGGACCTAAGATGCACTGGAAGATGAAACAGAAAAATATGGATATAACAACACTGATTCAAGTCAACTGACATTTCTCAATCTGGATTCCACAACCTAGGGTATGTAGAATGTGGTCGTAGGGAAAGTGAGCCATGTAATAAAAGAAGGTCACTTTAGGACACCATACCCAGAGTTCTCACCTGCTCAGCAGGTGCCCCACTGTGGAGTCACAGGGGTCACTCTCTAAGAAGCCTGCATGGTCCACGGCCCATGAAGTGACACTGACGGCAGCAACCAGCAGCTACACAAAAGTCACAAGGCTGAGGCTTTTGAGGCAGGCTCTGATCTATGGGGCTGTAGCCACAGCTGCTATCAATACTGCTCCTAAGTATCCTGCAAGTAGGCAGAAAGCTAAAGGACTAGATGACATAGTAACTGGGGATGATAAGAGAGGCTAAACTACTAATTTCCAGAACAGCAGCCTATATGCCAGGAAAGGTAAGGGAATCAGAGAGGCAATGTCCTCACTCAGAGCCACTCAGCCAGGATGGAGAAAAATTACACTAAGAAAAAACCTCAGGAATTCTTTGCCCCTCCCACCCACTGAAAGGAGGGAAAGTCAAAACCAGAAGAATGGAGTTTCAACTCTCAATGGAACAAACCCAACCTAGAAGTCTAACTTGTAGTTTTCAGACTACACTGCAGCACACATTCTAGAACCCCTGGTCTAGACGTTAGAAGACAAGTCACTGATTAATATATATCAGACTGATACACTCTGTGAATAGTTCTTATCTTTTGATAAAAGGTACTAAAATATATGCTTGGTTTGAGGAGATAAGATAAATATACATTTTGTTGTAGTCCTAAGCTATTTCTACCTCAATGATTAATAAAGTATAAAGTTACATACCTTCGGTAGAGAGGCTCAATAGTTATATGAATGAGCTTGCAAATAGCAAGGGCTATTAGCTTGTGTGAAGCTGCATAGTATGGAGGCATCTGATCCATAATGTTCTGTGCATGTTGCCAATCACCAATCTTTAATAAGGCTTCCAACAAGCCAAGTTTTTGGTTATCAGGTGGCTAAAAATGAATAGTCAAAACTAAGATACTCAGGATACAGACATCAAGAAATCTTAATACTTTGTCACTTAAAAAACTGACCTAAGCAACACATCAAAAATATTTGCTATTCATGGGAAATTAAACAATATATTCCTGCAAGTACAATCAAAATTTTTAGCTATTGAAAAAACATCAGGGCCAGGCGCAGCGGCTCACACCTATAGTCCAGGAACATGGGAGGCTGAGGTAGGCAGATCACTTGAGCTCAGAAGTTTGAGACAAGCCTGGGCAACATGGCGAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCCAAGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTAAGGCTGGAGAATTACTTGAGCCCAGGAGGTAGAAGGCTGCAATGAGCTGTAATCATGCCACTGCACTCCAGCCCGGGTGAAAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAATAATAATAAATTTATTAAAAAAAAAAACAGACACAGGCATTACAGTTTATAGACTTGGAATTAAGTTCTACTTCATGTTATGTCGTGCCACAGGAAACCAGAATTCATCATCTCTGAGAATCTCTTTAGGATTTGAGGGCCACTAATACACAGAGGACAATTAAAGTCAATACAACTTGTGATTTTACTTAGAAAACATTTTGAAATTTATACAAGAAAAAAAATATGACAGCTTCTCTTAAAAAGGAGCCATTCAGATTAAAAATAAAACCACTGTAGCAAATGATCCAGAAAATGAGGTTTCAGCAAAATGAAAACTAAGAAATTATTCTTCCATAAATGACTATTTAGAAGTTAAATTTCATAATTCAAAATCCAGAAGATAGTGTTAATTTTACTAGAATGAATTACATACTTTCTCTACTTTCTCCTCTTCTTTTTCCTTTTCTTTCTCTCGCTCATCCATTTTTTCAGAAGACAACACAACCATCGTAAGCTTTCTAACAATTTGCTTAGCTTCCGCAATTTCTCGTTTGTGTTCATCCATAATGCAATTATCAGCCGGAAGAAGCTAAAAATGGTACATTAAAATTTCATAAAATAGCTAATACCAACTACTTGTTCATATAAAAAGGAAACACTATTCTCAATTGATAAAACTATAAATAAGAAGTCTAACTTATTCGTGACCATTTGCCTTCTAAGTAAATTTCAGTTATTTTCTTATAATTTGACAGAATGAAGTACCTGAATTCTGTACCCCTTTTAAAATCAAGTCGCAGCTCAAAGTTTCACATCTTCTGTCTGACAGAGTCCCTAAAGTAATGTAATACCACAACAGTGATGTTTTCCGTTGAATTTATTAGTTTACCCAAGAAAATATATAGCAGTTCCATTAAAAACATTACAAATTTCCCCATTAAAGGCTAAACTCCAAATTAAATAAAGCATTGCAATATGGATCCAATTTGGGAAAGGTGAACTACTGAATAACACAAAGGGATAAATTTAAATCATCTAAATGAAAAATTTCAAGTAGAAAAATTATTAGTAACTTGACATCTCACTTTTTCTAGGAGCTTATTTAAGTCACAAGCTAGTTACTAATTTATTGCAAAAGAAAAAGTACTATGTGCATAGTCAACCCTCCATTATGAAAAAGGCTCAAGTATCTCAAACAGTCACCTTGTATGAGTGGAAGATGATTAATGAAGACATTTATAAAATAACCCTAACACAAAGAAAACTTTAGGCAACAAATTACTCAGTAGTTTCTGCTAGTCACTATGATAAGCTATAAAAGGAGTGTTCCTGACCCCTAGAAATGCATAATCTATTCCATTAACTAGGTTTAATGTAAACAGTAAATGAAAATAATAATGAACTATTAAACATTATAGATTTCATTCCATTTATCAAAAAAAAAAAAAGGAGGGAGGGAGAGAGAAAAGTCACTATGGACTGGTGCAAGGAAGTAAGCAAGACTTTTTCTCATTCTGTATGTTCTCCCCTGGCAATCAAACACATTTGTATTGCTGTACTTATACACCTGGCACAGGTCCTCTTGTTTTATTTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTTTTGCTCTCGTTGCCCAGGCTGGAGTGAAATGGCACGATCTCGGCCCACCGCAATCTCTGCCTCCCGGCTTCAAGCAATTCTGCCTCAGCCTCTCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACCCCAGGGTGATTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGATTTCAGCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGATGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAAGTGTGAGCCACTGCGCCCGGCCATAGGTCCTTATCTTTTACCCAGACAATTACAACTCCCTCTAATGGCCAAACTGTTTCTTCTTATAGTTCTCTCAACTTTTATTTCTGTGTATTTTGAGAATATGTCATTAGATACATGTAAAGTTAGAACTGTTTTATCTTCCTAGTGAGCACAATCTTGTTATTATGAAGTAGCCCGCTTTATCTCCTTCTGCCAAAAAGTCTATTTTGTCCAACAGTAAGTTTGCTGATCTATTTTCTCATCCTTTTACTATCAACATTTCATTATCCTTAAGTTTAAGCTGTTTCTCATATAAATAATAAACTCATTTTTAATTCCACTTGACAATCTTTGTCATATTAACAGGACCACTCAGTCTGCTTACATTTACTGCTAAATGCAATCATAATGAGTAATAAATCTATCATCAATTTGTACTTTCCACATATGCCGGTCTATACTTCCCTCTAAAGTCATACCTGTGTTTTTAAATTTTCCCTTTTCTGTCCACTTTTCCATATTCTCAGTTTCTACATCACATCTCTCCTTTAAATACTAATATGGCTCTCCACTCCCAAGAGAAAAATCCAGATTCCTTACTATGTCACTTAAGCCGTTAACAGTTTAGCTTTCTCTATTCCATCCTCATTCCCCCTATATACCACCCTAGGCTCCAACCACTCTGAGCTT
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Task1_train_31038
Chromosome X houses a mutation in gene XIAP (X-linked inhibitor of apoptosis). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to XIAP deficiency
TCTTCTCAAGAAATCAATTAATGGCAGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACCTGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTCGCATGAACCAGTATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATCAATTAATGCACGCATAATATAGAGACAGAGTCATTGTTACCATTCTCTTATTTTGCCTTTGACAAGTTTATATTGAGCATGTTATCAGGCAATGTGGGAGATTCTGGAGAACCAGGTTTGCCTCATAACTAGGGTTACCATATACTCTAGTTTGCCTGGGGCAACCCTGATTTATGCCTGTTGTCCCAGTGTGATTATTACTAGTGTAATTTTTCACTTTGAGAAGTGTCCAGGTTTGGAGGATAAATTATCTTTCTAATAATTGATACCCTTCTCATAACCTAACGGGTTCCTTTTAGTATTTTATCTGGGTTAAAATTACCAGCTGTAATTTGGCAGCTCTAATAAGACTGCAGCAATACTTATCTTCCATTTGAACAGATTGTTACTTGACCAAGGGAAGTTAATAGCAAAAGTAACTGCAGGGCACATGTATGTCATGGGCAAAAAAAAAAAAGTAACAGCAATTAAGGTTTGCAGGTACTTAGAATTTTTCCTGAGCCACCCTCTAGAGGGCAGTGTTACATATATATCTGTAATTATCCAGTTACAACAAAAAAAGGGCTCTCATTCATGCATGAAAATCAGAAATATTTCATACTCTTAAAGAACACATTGGAACCAATATTATGATTAAAACATATTTTGCTAAGCAAAGAGATATTAAAAATTAATTCATTAACATTCTGAACATTTTTTAACTTGTAAAAACAACTTTGATGCCTTGAATATATAATGATTCATTATAACAATTATGCATAGATTTTAATAATCTGCATATTTTATGCTTTCATGTTTTTCCTAATTAATGATTTGACATGGTTAATAATTATAATATATTCTGCATCACAGTTTACATATTTATGTAAAATAAGCATTTAAAAATTATTAGTTTTATTCTGCCTGCTTAAATATTACTTTCCTCAAAAAGAGAAAACAAAAATGCTAGATTTTACTTTATGACTTGAATGATGTGGTAATGTCGAACTCTAGTATTTAGAATTAGAATGTTTCTTAGCGGTCGTGTAGTTATTTTTATGTCATAAGTGGATAATTTGTTAGCTCCTATAACAAAAGTCTGTTGCTTGTGTTTCACATTTTGGATTTCCTAATATAATGTTCTCTTTTTAGAAAAGGTGGACAAGTCCTATTTTCAAGAGAAGATGACTTTTAACAGTTTTGAAGGATCTAAAACTTGTGTACCTGCAGACATCAATAAGGAAGAAGAATTTGTAGAAGAGTTTAATAGATTAAAAACTTTTGCTAATTTTCCAAGTGGTAGTCCTGTTTCAGCATCAACACTGGCACGAGCAGGGTTTCTTTATACTGGTGAAGGAGATACCGTGCGGTGCTTTAGTTGTCATGCAGCTGTAGATAGATGGCAATATGGAGACTCAGCAGTTGGAAGACACAGGAAAGTATCCCCAAATTGCAGATTTATCAACGGCTTTTATCTTGAAAATAGTGCCACGCAGTCTACAAATTCTGGTATCCAGAATGGTCAGTACAAAGTTGAAAACTATCTGGGAAGCAGAGATCATTTTGCCTTAGACAGGCCATCTGAGACACATGCAGACTATCTTTTGAGAACTGGGCAGGTTGTAGATATATCAGACACCATATACCCGAGGAACCCTGCCATGTATAGTGAAGAAGCTAGATTAAAGTCCTTTCAGAACTGGCCAGACTATGCTCACCTAACCCCAAGAGAGTTAGCAAGTGCTGGACTCTACTACACAGGTATTGGTGACCAAGTGCAGTGCTTTTGTTGTGGTGGAAAACTGAAAAATTGGGAACCTTGTGATCGTGCCTGGTCAGAACACAGGCGACACTTTCCTAATTGCTTCTTTGTTTTGGGCCGGAATCTTAATATTCGAAGTGAATCTGATGCTGTGAGTTCTGATAGGAATTTCCCAAATTCAACAAATCTTCCAAGAAATCCATCCATGGCAGATTATGAAGCACGGATCTTTACTTTTGGGACATGGATATACTCAGTTAACAAGGAGCAGCTTGCAAGAGCTGGATTTTATGCTTTAGGTAAACTTTATTATAAAACCAATAAATAGCTTCCCAAGTATGCCAGGGCTCATAAAAAGTAAATAGATGCCCTTAGCCCCCTGAACTGGTAAATATTTAGGTATAACTTGGCATGATTATATATATATCTGTATTATTCCGTGAACTCTTATGTTGAACCTGTAATGTAACTACTGAATTTATGTGAAAAAGACTACCATATTATGAGTCATGCTTCTCTTCATGTAATTGTTTTTAGGAAGTAGATAACTTGCAAAAGATGGTAGACATCCCCAATAGCAAAATGGGTCTAATAGTAATATTAACCATCATTTATTGAGCACTTACTATAAGTGCTCAATACATATACTTCATGCATTTTCTCTAAGCTTCACAATAGCTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTATCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATTTAGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGACACAGGGTCTCTCCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCATGCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCGGCCATATGAGTACTTTCAAATGGACTGTGGTAGACATTTCAGGAAGGGCCATTGGAGTGATTGCTTCTAAAGATATTTTAAAAAGTTATACCATTATATATTTGACCCATTTATTTTAAGATTGAATAATGCCTATAAAATATTGGTTATTTCGAAAGATTTTATTTATGTACCATCATATAGTAATCTTGAAGGTTTGTTTAGTGTCATGTAGCTATAAACTTAGAGAAACTTACAATTTCATTATGTAGAACTTTAATGTTACTAATACTTGAAACATAACTTGTTTTAAAATTTCACAGTTTGAAACAGTAAGGACAATATTGGTGGCCCAAATAACATACTAAAAAGAAAGTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGATGGCATGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGTGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTAAAACTCCATCTCAGAAAAAAATAATAATAATTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAAAATAAAGTATGCCAGGTACAGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAGATATAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCAAAGGTTGC
TCTTCTCAAGAAATCAATTAATGGCAGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACCTGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTCGCATGAACCAGTATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATCAATTAATGCACGCATAATATAGAGACAGAGTCATTGTTACCATTCTCTTATTTTGCCTTTGACAAGTTTATATTGAGCATGTTATCAGGCAATGTGGGAGATTCTGGAGAACCAGGTTTGCCTCATAACTAGGGTTACCATATACTCTAGTTTGCCTGGGGCAACCCTGATTTATGCCTGTTGTCCCAGTGTGATTATTACTAGTGTAATTTTTCACTTTGAGAAGTGTCCAGGTTTGGAGGATAAATTATCTTTCTAATAATTGATACCCTTCTCATAACCTAACGGGTTCCTTTTAGTATTTTATCTGGGTTAAAATTACCAGCTGTAATTTGGCAGCTCTAATAAGACTGCAGCAATACTTATCTTCCATTTGAACAGATTGTTACTTGACCAAGGGAAGTTAATAGCAAAAGTAACTGCAGGGCACATGTATGTCATGGGCAAAAAAAAAAAAGTAACAGCAATTAAGGTTTGCAGGTACTTAGAATTTTTCCTGAGCCACCCTCTAGAGGGCAGTGTTACATATATATCTGTAATTATCCAGTTACAACAAAAAAAGGGCTCTCATTCATGCATGAAAATCAGAAATATTTCATACTCTTAAAGAACACATTGGAACCAATATTATGATTAAAACATATTTTGCTAAGCAAAGAGATATTAAAAATTAATTCATTAACATTCTGAACATTTTTTAACTTGTAAAAACAACTTTGATGCCTTGAATATATAATGATTCATTATAACAATTATGCATAGATTTTAATAATCTGCATATTTTATGCTTTCATGTTTTTCCTAATTAATGATTTGACATGGTTAATAATTATAATATATTCTGCATCACAGTTTACATATTTATGTAAAATAAGCATTTAAAAATTATTAGTTTTATTCTGCCTGCTTAAATATTACTTTCCTCAAAAAGAGAAAACAAAAATGCTAGATTTTACTTTATGACTTGAATGATGTGGTAATGTCGAACTCTAGTATTTAGAATTAGAATGTTTCTTAGCGGTCGTGTAGTTATTTTTATGTCATAAGTGGATAATTTGTTAGCTCCTATAACAAAAGTCTGTTGCTTGTGTTTCACATTTTGGATTTCCTAATATAATGTTCTCTTTTTAGAAAAGGTGGACAAGTCCTATTTTCAAGAGAAGATGACTTTTAACAGTTTTGAAGGATCTAAAACTTGTGTACCTGCAGACATCAATAAGGAAGAAGAATTTGTAGAAGAGTTTAATAGATTAAAAACTTTTGCTAATTTTCCAAGTGGTAGTCCTGTTTCAGCATCAACACTGGCACGAGCAGGGTTTCTTTATACTGGTGAAGGAGATACCGTGCGGTGCTTTAGTTGTCATGCAGCTGTAGATAGATGGCAATATGGAGACTCAGCAGTTGGAAGACACAGGAAAGTATCCCCAAATTGCAGATTTATCAACGGCTTTTATCTTGAAAATAGTGCCACGCAGTCTACAAATTCTGGTATCCAGAATGGTCAGTACAAAGTTGAAAACTATCTGGGAAGCAGAGATCATTTTGCCTTAGACAGGCCATCTGAGACACATGCAGACTATCTTTTGAGAACTGGGCAGGTTGTAGATATATCAGACACCATATACCCGAGGAACCCTGCCATGTATAGTGAAGAAGCTAGATTAAAGTCCTTTCAGAACTGGCCAGACTATGCTCACCTAACCCCAAGAGAGTTAGCAAGTGCTGGACCCTACTACACAGGTATTGGTGACCAAGTGCAGTGCTTTTGTTGTGGTGGAAAACTGAAAAATTGGGAACCTTGTGATCGTGCCTGGTCAGAACACAGGCGACACTTTCCTAATTGCTTCTTTGTTTTGGGCCGGAATCTTAATATTCGAAGTGAATCTGATGCTGTGAGTTCTGATAGGAATTTCCCAAATTCAACAAATCTTCCAAGAAATCCATCCATGGCAGATTATGAAGCACGGATCTTTACTTTTGGGACATGGATATACTCAGTTAACAAGGAGCAGCTTGCAAGAGCTGGATTTTATGCTTTAGGTAAACTTTATTATAAAACCAATAAATAGCTTCCCAAGTATGCCAGGGCTCATAAAAAGTAAATAGATGCCCTTAGCCCCCTGAACTGGTAAATATTTAGGTATAACTTGGCATGATTATATATATATCTGTATTATTCCGTGAACTCTTATGTTGAACCTGTAATGTAACTACTGAATTTATGTGAAAAAGACTACCATATTATGAGTCATGCTTCTCTTCATGTAATTGTTTTTAGGAAGTAGATAACTTGCAAAAGATGGTAGACATCCCCAATAGCAAAATGGGTCTAATAGTAATATTAACCATCATTTATTGAGCACTTACTATAAGTGCTCAATACATATACTTCATGCATTTTCTCTAAGCTTCACAATAGCTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTATCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATTTAGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGACACAGGGTCTCTCCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCATGCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCGGCCATATGAGTACTTTCAAATGGACTGTGGTAGACATTTCAGGAAGGGCCATTGGAGTGATTGCTTCTAAAGATATTTTAAAAAGTTATACCATTATATATTTGACCCATTTATTTTAAGATTGAATAATGCCTATAAAATATTGGTTATTTCGAAAGATTTTATTTATGTACCATCATATAGTAATCTTGAAGGTTTGTTTAGTGTCATGTAGCTATAAACTTAGAGAAACTTACAATTTCATTATGTAGAACTTTAATGTTACTAATACTTGAAACATAACTTGTTTTAAAATTTCACAGTTTGAAACAGTAAGGACAATATTGGTGGCCCAAATAACATACTAAAAAGAAAGTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGATGGCATGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGTGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTAAAACTCCATCTCAGAAAAAAATAATAATAATTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAAAATAAAGTATGCCAGGTACAGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAGATATAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCAAAGGTTGC
Task1_train_31039
A variant on Chromosome X in gene XIAP (X-linked inhibitor of apoptosis) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to XIAP deficiency
GCCTGTAATCCCAGCATTTTGGAAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACCTGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGATAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTCGCATGAACCAGTATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAGCAAGAGCAAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATCAATTAATGCACGCATAATATAGAGACAGAGTCATTGTTACCATTCTCTTATTTTGCCTTTGACAAGTTTATATTGAGCATGTTATCAGGCAATGTGGGAGATTCTGGAGAACCAGGTTTGCCTCATAACTAGGGTTACCATATACTCTAGTTTGCCTGGGGCAACCCTGATTTATGCCTGTTGTCCCAGTGTGATTATTACTAGTGTAATTTTTCACTTTGAGAAGTGTCCAGGTTTGGAGGATAAATTATCTTTCTAATAATTGATACCCTTCTCATAACCTAACGGGTTCCTTTTAGTATTTTATCTGGGTTAAAATTACCAGCTGTAATTTGGCAGCTCTAATAAGACTGCAGCAATACTTATCTTCCATTTGAACAGATTGTTACTTGACCAAGGGAAGTTAATAGCAAAAGTAACTGCAGGGCACATGTATGTCATGGGCAAAAAAAAAAAAGTAACAGCAATTAAGGTTTGCAGGTACTTAGAATTTTTCCTGAGCCACCCTCTAGAGGGCAGTGTTACATATATATCTGTAATTATCCAGTTACAACAAAAAAAGGGCTCTCATTCATGCATGAAAATCAGAAATATTTCATACTCTTAAAGAACACATTGGAACCAATATTATGATTAAAACATATTTTGCTAAGCAAAGAGATATTAAAAATTAATTCATTAACATTCTGAACATTTTTTAACTTGTAAAAACAACTTTGATGCCTTGAATATATAATGATTCATTATAACAATTATGCATAGATTTTAATAATCTGCATATTTTATGCTTTCATGTTTTTCCTAATTAATGATTTGACATGGTTAATAATTATAATATATTCTGCATCACAGTTTACATATTTATGTAAAATAAGCATTTAAAAATTATTAGTTTTATTCTGCCTGCTTAAATATTACTTTCCTCAAAAAGAGAAAACAAAAATGCTAGATTTTACTTTATGACTTGAATGATGTGGTAATGTCGAACTCTAGTATTTAGAATTAGAATGTTTCTTAGCGGTCGTGTAGTTATTTTTATGTCATAAGTGGATAATTTGTTAGCTCCTATAACAAAAGTCTGTTGCTTGTGTTTCACATTTTGGATTTCCTAATATAATGTTCTCTTTTTAGAAAAGGTGGACAAGTCCTATTTTCAAGAGAAGATGACTTTTAACAGTTTTGAAGGATCTAAAACTTGTGTACCTGCAGACATCAATAAGGAAGAAGAATTTGTAGAAGAGTTTAATAGATTAAAAACTTTTGCTAATTTTCCAAGTGGTAGTCCTGTTTCAGCATCAACACTGGCACGAGCAGGGTTTCTTTATACTGGTGAAGGAGATACCGTGCGGTGCTTTAGTTGTCATGCAGCTGTAGATAGATGGCAATATGGAGACTCAGCAGTTGGAAGACACAGGAAAGTATCCCCAAATTGCAGATTTATCAACGGCTTTTATCTTGAAAATAGTGCCACGCAGTCTACAAATTCTGGTATCCAGAATGGTCAGTACAAAGTTGAAAACTATCTGGGAAGCAGAGATCATTTTGCCTTAGACAGGCCATCTGAGACACATGCAGACTATCTTTTGAGAACTGGGCAGGTTGTAGATATATCAGACACCATATACCCGAGGAACCCTGCCATGTATAGTGAAGAAGCTAGATTAAAGTCCTTTCAGAACTGGCCAGACTATGCTCACCTAACCCCAAGAGAGTTAGCAAGTGCTGGACTCTACTACACAGGTATTGGTGACCAAGTGCAGTGCTTTTGTTGTGGTGGAAAACTGAAAAATTGGGAACCTTGTGATCGTGCCTGGTCAGAACACAGGCGACACTTTCCTAATTGCTTCTTTGTTTTGGGCCGGAATCTTAATATTCGAAGTGAATCTGATGCTGTGAGTTCTGATAGGAATTTCCCAAATTCAACAAATCTTCCAAGAAATCCATCCATGGCAGATTATGAAGCACGGATCTTTACTTTTGGGACATGGATATACTCAGTTAACAAGGAGCAGCTTGCAAGAGCTGGATTTTATGCTTTAGGTAAACTTTATTATAAAACCAATAAATAGCTTCCCAAGTATGCCAGGGCTCATAAAAAGTAAATAGATGCCCTTAGCCCCCTGAACTGGTAAATATTTAGGTATAACTTGGCATGATTATATATATATCTGTATTATTCCGTGAACTCTTATGTTGAACCTGTAATGTAACTACTGAATTTATGTGAAAAAGACTACCATATTATGAGTCATGCTTCTCTTCATGTAATTGTTTTTAGGAAGTAGATAACTTGCAAAAGATGGTAGACATCCCCAATAGCAAAATGGGTCTAATAGTAATATTAACCATCATTTATTGAGCACTTACTATAAGTGCTCAATACATATACTTCATGCATTTTCTCTAAGCTTCACAATAGCTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTATCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGTGATTTAGGCTCACCACAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGACACAGGGTCTCTCCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGCATGCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCGGCCATATGAGTACTTTCAAATGGACTGTGGTAGACATTTCAGGAAGGGCCATTGGAGTGATTGCTTCTAAAGATATTTTAAAAAGTTATACCATTATATATTTGACCCATTTATTTTAAGATTGAATAATGCCTATAAAATATTGGTTATTTCGAAAGATTTTATTTATGTACCATCATATAGTAATCTTGAAGGTTTGTTTAGTGTCATGTAGCTATAAACTTAGAGAAACTTACAATTTCATTATGTAGAACTTTAATGTTACTAATACTTGAAACATAACTTGTTTTAAAATTTCACAGTTTGAAACAGTAAGGACAATATTGGTGGCCCAAATAACATACTAAAAAGAAAGTATGGCCGGGCGCGGTGGCTCCCGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGATGGCATGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGACTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGAAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGTGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTAAAACTCCATCTCAGAAAAAAATAATAATAATTAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATGAAAATAAAGTATGCCAGGTACAGTGGCTTACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGAAGGCCGAGGCGGGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGGCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACCAAAGATATAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAACCAAGACTGCGCCATTGCACTCCGGTCTGGGGAACA
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Task1_train_31040
This sequence change occurs on Chromosome X, altering STAG2 (STAG2 cohesin complex component). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Mullegama-Klein-Martinez syndrome
TTAAATTGGTTATTTCTGAAATAGTTAATAACTTTAAAACATATCCAGACTCAAGAATTGACTAAGAAAAATCCTGATCATATTTCACCCATGTCTAAATTCCTCATATTTTTCATATAATTTGAAATAAAGTGTTGATACTTTTTCCCTTTAATTTATGTATATGCTATATAGTAAGTGATATGTAGTAGCAAACTACATTACAGATTTCTTTACAGTGTTTTTTTTGGAGGCAGAATCTCACTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACTATCTCAGCTGACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCTCCTGCCTCAGCCTCCTCAGTAGCTGGAATTATAGGCTTGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGTCGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGTCTGTCTTGGCCTCCCCGAGTGCTGAGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGGCCTTCTTTACAGTTCTTTAGTGGAAATTTATGAGCATTAGAAAAAAAATCTACTAGCTAAATATTAAAATCCCAATCAAATATTTCAGGTATTAAGGGACTTTATCTACCTGGTAATATAACTGTTAATTTTTCTATATGGTTACTGTTGTCTAGTATAATTCAAAATTCCCCAAAATACTGGGGAATTCTGCTTTTTTTGTGCTTGTAACAACTTACAGGTGTTCATTTGGTTGTCTTCCTTTACAATTGAAAAGAAATGATGTGTTTTTTTACAGCTTCAGGAAAATCAAGATGAAATAGAAAATATGATGAATGCAATATTTAAAGGAGTGTTTGTACATAGATACCGGTAAGTTGTGACAGTTTTTTTCATAAATAGCATTATGTAATTTCTACTCAGCAAGTTTGCATATTTCGTGGTGTAGGGAATCTAAATTAGCAGGAAGAATGTTATAGTAAAATCAATGTTAGACTCCATTAGTGCCACTGAGTCACTCTGGGCAAGTTATTTAACTCATGTGAGTTTGGTGTTTCCCATCTGAAAAATGGGATAATGCTGTGCTTGACTTGCAGCCAGTAGAAGTTACTGCTATTTGGAGTTGGGCTACACAATACTTAATTGCCTTTGGATGCACTATGTTAGTAGAGCCTGCACGTGCTGACTCCTGACTCTCTTCCCTTCCATTGAATATCAGTGGGAACAATTGGATAGGTTAAAGTGAGATATTTTCTTTTGCTGTTTTGAATGAACAGAGGAAAGAAATAGTAATCTTATAAATTTATGCTGTAACCTATTCTTAAATTTTGGTAGTATTTTTATTCAGCTTCCACATATCCTCAACTTGGCAGTTACTGAATCAGGTTAATGCTTACTTTTTGTAATGTCTCCATGTCCATTCTTACCTTTTCACTTCTATTGTCACCATTACCTTAGTCTGTTTCCTCATTCTCATGCCTAGAGATTATTGCAGTTTTGCCAAAATATCCTTTTATTGTGTTATTCCTCTGCCTTCAATGACTCACCAGTACTTACAAGATGAATTTAAAATCATTTATTCTAACATTCAAATCCCAGTTGAGCTTGACCTCAGTGTAATGTATAAATAATACTTACCTGGAAATTACGCTCTAGCCAGACAAGTGTGCCTGCTGTCTTCTGAACACACCATGCCCAGCAGGTGTGAGCAAAGGCTGGGATATGGTATGGTATAAAAGGTGGGGATGGGATTTTGTTTGTAGTTTTATATAATTTTAAATGTTTATGTGTTGATAATTATGCTTTGCCACCTAAGCTTTTGGCATTCAGGCCCATGCTTCATTTCTATTTTTTAATCCCTAGTAATAAGATAATGTCATATTCATAGTAGATCTGAAGTACTTGGCATCTCTTGAATAAACCATAAGTTTTGTGGTATATTGGCACTAATTATGCATCGTTTTTCCTTCCCCCATTCAGTGATGCGATAGCTGAAATTCGAGCTATTTGCATTGAAGAGATTGGCATTTGGATGAAGATGTATAGTGATGCCTTTCTTAATGACAGTTATTTAAAATATGTTGGTTGGACTATGCATGATAAGGTAAGATGTGCCCTTCAGACTGCTTCTTTCTACACATCGGCGTGGCTGTCTGCACCTCTCATTCATGAGTTATCTCCCAGTATGTATACCTGGTGACACATTTCTGGAAGCCTCCCCTTTATTCTTTTCTATCTTCTCTGTAAAAACTTATTTTCTATCACATAAAGTCTGCTAGATATTTTTGAATCCTGGCCACTGATTTAACCATTAATGGTGAATCATTTTTTTGCTGAAATATTACAGTCATGAAGGTAGTAGGAGTGAGGCATTTCTTAGGGCACGAAGAAGAACCATTACGCTGTTGTTATCTGAGAGCTATATACTTAAAAAAAAAATTATTCAATTTTGATCCTCTCTTTTGACAAACCTGTATCTTAGCCAGATTATACCTTACTACTTGGTTTCTGACCTTTTTAATATGTTTTCATTAAACTACCATTCTCTTAGGCTGCCTCTTCACTTGCCTTGAAGAAATTGATTGTATATAATTCTTTCCAAACATTACTTCCCATAGTGGAAAATATACTGTGACACATGCTTCTATTGTTTTTCACAATAGATTTGTTCTGAACAAATTTTCAAAAATTATCCTTTGAACTACAGAAATAGTAACCCCATAGGTATTTAGTCATAAATGTATGTACTGATTACTATTTTTGCATTATCAAACATGATAGTTTCTGAAGGAATGCTATGGTATGAAACATTTAAAATTTTAAAGTAGAAAATATTGTGTACATCTTGAATATTGAAGTTGAAAATACATAGAGTTTTAATGCATTGTCTCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCAAGGTGAAGTAAGACTCAAATGTCTTACTGCTCTACAAGGGCTTTATTATAACAAAGAGCTTAATTCCAAACTGGAACTTTTTACCAGTCGGTTCAAGGTTAGTATTACTTAAGAATTTACAAATAACTTGTCATTTGCAAACACTTTTCTCTTGCTTTCCTTTTAAAAATATTTTAATTTTTTTGTCCTTAGGATAGAATTGTGTCTATGACCCTTGACAAAGAATATGATGTTGCAGTACAAGCAATAAAATTACTCACTCTTGTTTTACAGTAAGTATGTATTTGTTGCATATTTGCACTAATGTTCAGATATCTAAATAATATATTAGAGTATTTGGTTCAGACTCATCTAGGTCTAAATTTTAGTAGCTTACGTCATGGAGGTTTACAGCTAGAAGTTGAATTTCTTCATGTATAGTTGAGAAAACACAGGAAGAAGGAACCATAGAATATGGAAATTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTACGATCTCAGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACGACGCCTGGCTTATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCTGACCGAATATGGAAATTCTAACTGAGCTAGGAATTCATGTGTTCCCATTCTCTTGGCAGATTGATTTCCTTCCTGTTTTTCTGTTTTTGATGCTCTTGAAATAAGCACATCAGTGTATTAAAAAACATGCTTATTGTATTTTGTTACACTTTTAGAGTATGAGCATTTATAAGAATGTCTGTTATACTTCTCATAGCACCTTTAAACAATCTGAATTTAAGACCTATTCTGTGTTAATATCTGATAGTGATGTTATTCATATTTTTCCTTTTTAAAAAATGGTAGTAAAATATAGATTATGTAAAATTCACCATTTTAACCATTTTAAAGTATGGTTTACTGTCATTACCTATATTTACGTTGTTGTACAACTGCCACCACTATCCATTGTCAGAACCTTTTCATCACTTTATTCTGGAGCTCTGTACCCATTA
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Task1_train_31041
This mutation occurs in STAG2 (STAG2 cohesin complex component) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Mullegama-Klein-Martinez syndrome
AACTTTTGGACTTGATCAGTTGAAAACAAGAGAAGCCATTGCCATGCTACACAAGTAATCTCCAGATATTTTATTCAGCTCTCATATTTTTTAGTCATGAAACTTTATTTTTAAATCTAGCCCTTTCATTTGGAATAACTAAATTAAATTTATGCTTTATTATTAGCTTATAAATCTCTACCCTATCTCCTTTCTTAATTTTAAAGAACCAGTTACAGTGCTATCTCAATTAACAAATGAGTTGGGCCAGGCTTGGTGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGTAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAAATTAGCTGGGAGTGGGGGTGTGCACCTCTAGTCCCAGCAACTCAGGTATGAGAATGGCTCGAACCTTGGAGGCAGAGGGTGCAGTGAGCTGAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGGGACAGAGCGAGGCTCTGTCTCAACAACAACAACAATAAAATGAGTTAGGATTAAAACTCCGTTTATAAGCCTTTGTTTAAATTTAAACCATACAAAGTCTATAAATTATGTGAATCAAAGCAGCATAAATTCAAGCATTACACATCTTTTTTATCAACTTTTGTCATGATCTCATTGTCAGATAGAGAAATCTTTGAGGTTTGATTCCTTTGTCTCAAGTTTTTTCTTTGGTTCTGCACTCTTACTTTGTAGTGACCTTTTCCCATGTTTTGATCCACACCCTTCTTTCCATCTGCATATTTTGTTGCCCTTATCAAAATTGGAAGTCGTTTTATTTTATACTGGGCATGTAATTTAGTGATCAATTGCACTTTTAAAGTATGGGTACATTTTAGACCTTTAACATAACCAACATTTGTGTATTAAAACCCTTTATCTGTTACCTGTGGGTTAAAGAACCTTGCTTTTAGATTCTCGGACTCTCCTTCATCCTCTTGCTCATTTAGTTATAAAAGTGCTAACTGTCTCTCTGAGGAAAATATGCTGCTCTTGTTTAAGTTTTGCTTCTACTCCCTCAACTTAATTATTATTATTATTTTGTTTTTTGTAGAGACAGGGTCTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACCCCTGGCCTCAAGAGATCCTCCCACTTAGGCCACCAAAAGCACTAGGATTATAGGTGTGAACCACCACACCCAGCTTCCTCCCTCAACTTTAATTAACTCTCTCCTTTCACTTTCTTCTAAAACTGAAGTTTATTTTTATGCATCCATTAGATGGTAATTTTACATAATATTTAAGGACTACCTGTATATTATTTTCAGAAATAATATCTTTTTTTCATGTAATATCCTTTTTTCCTTCTTGATTCCATCTGGATTGTTTTTTACTCAGTTACATATTTGATAGAGTTATAATGTTGGGTTGTTATTTTGATGAATAGAGGTATTTATCGTCACATAAATATAGTTAAAATGGGCCTTAGATGGGGTTTAATTTTACTCTTGAATTGTTTATTACAAATGTTTGTGAATTATTTTTTAACGTTCTATATGTTAGAGTAGGTCTCCTTTATGTCTTGAAAAATACAGATAATGTATTGATCATTATGTGAGAGAATTTACATTATTTTCTATGGAAAAAAGTACTGATTAAAGAATGTAGATATACCAGACCATATTCAGACTGAAAGCTAAGTGGCGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGTTTTAAAGAAAGTAACAGTGACATAAAATGTCAGTATATCTGCACATTCTCACACTTTACAACCTGCTTATTTTCTATTCCTCAAATTAAAAGCTTGGCAAAGGAAGTAGTGAGTGAAATTTCCTAAGTTATTGACTTTTTTATTATAGTCCCTCAAATATTTATTTCAATTATTTTTTGTTTTCCTTTGCAGAGATGGCATAGAATTTGCTTTTAAAGAGCCTAATCCGCAAGGGGAGAGCCATCCACCTTTAAATTTGGCATTTCTTGATATTCTGAGTGAATTTTCTTCTAAACTACTTCGACAAGACAAAAGAACAGTGTATGTATTTGCTGGAAATGTCCTATTTAATTTCATTTTGGGATTCTTAAGGGCAATTTTTATACTTGGTTTCTCTCCTTTCTACTCACACAGAATTGTAGGATTGCATTAATACACAAAAAAGTTTATACTTCAGCAACTTTATAATTTAAGGATTATAACTGTGTTTTATGCATAATACTCTATTTTAATATTGTGAGTTTTCCTCCAGTATAATTTTGGCTTTTGACACGTAATTTGAATACTTTATGTATTATTTAAGAGACTGGACTCACTATGTTGCCCAGACTGGCTTTGAACTCCTGGGCTCCAGTGATTTTCCTGCCTTAATCTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCAGGAACCACTGCCTGGCTGCTTTTTGTGTTATTATCTGCATTTGTGCCTTAACCCAACTAAGGAGGGAGCATTTGAAAAAGAATAATAAAGGCAATCCATCAGGAACATCCTTTAATTCTCAAACAGGGCACTTTTCTGGTTTAGTCTCCAATAATAGTGACTTATAAAAGAGCCCCCAAAATGGATTTAAATTCTCAAAAATCTTCTACCTTTCGCCATGGCTTTGAGGTGTAAAAGGGCAGAAGCGTATGGATACCTCATATTGTAAATAATCTTGTCTGAAAACTCACTAGTATTTTGCATTTAAAGACTATAGATTTTATATGAAATTCTAAAGCAGGCAAAACTAATGTATGGTGATAAAAATTACAGTAACGGTTACTTCTAGTGTTGGAGAGTTTGAATGGGAACACTAGGGTACTAGAGTTCTGTATCTTTTTTTTTTTTTGAAATGAAGTTAGGTCTGTCCTTCAGGCACCATCTCGGCCCACTGCAAACTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCGTAGGTGGGATTACAGGCGTGCACCACCATGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCAAACTCGTGACCTCAGGTGATCTGTCCACCTTGGCCTCGCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAACCACTGTGCCCTGCCAAGTTCTGTATCTTGTTAGGTATGTGGGTCACACAGGTCTATGTTCAGTTATAAAACTGATACAACTGTGCTCTTAGTTTTGTGTGTTCTATTGTATATAAATTTATCCCAGTTAAAATTGCATAAGCAGTATTAATCAGAGAAATAAAAATTAAAACAAATACCATTTCTCACCTAGCACATTAGGAAAAATTAAGAAGTCTGATAGTGTCAAGTATTGCCAAGGATGTGAGGCAGCAGAGCCTTTTATACATTGTTGGTGACAGTACAAGACCATTTTGTGGAGCTCTTTGGCAATGCCTAGTAAAGTTTAAGATTCTCTCTACCTCATGATCCAGTAATTTCATTCATAAGTAGATACCCCACAGAAACTCCTGAATACATGCACAAGGAGACCGATAAAAGAATGATGGCTGTTTGATTGTTTGAAATAGTGGAAAAACTCAAAATAACCTAAACATCCATCAACTGAAAATGGATCAATAGATTGATATATAATGGAATACCATACAACAGTAAAAATAGCTGGATTTCATTGAGTACAAACAGCAAAGTACAAAACTGTACTATGATGTTTACAGACAACTATGTATTGAATGTACAAAATGTGCATGGGGGTGATAAGTAGTGGTAACCTCTGGGCACGAGGAGGAAGCAAAATGGGGATAGCTTTAGTGCGGGCTACTTATCTGTAATGTCCTATTTAGGTATGTGGTGGGTACATAATTGTAAATCTCTCTGCCAGTGAGTATATTTTGGCTCAAGTTTTGTATCTTGTTGCAGACTTAACAGTTTTTGGAGTGGTAGCCAGTTCACAGGCCACACTTGGAGGAGTACTGTACTACTATATATGACTGAAGTGTATTGTAATACAGAAAGACATACTGGGAGTCGGGTGCCGCGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGTCAAGGCGGGCAGAGAGT
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Task1_train_31042
This alteration occurs within gene SH2D1A (SH2 domain containing 1A) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
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Task1_train_31043
The gene SH2D1A (SH2 domain containing 1A), on Chromosome X, contains a mutation. Does this mutation cause a disorder, or is it a benign change?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
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Task1_train_31044
An alteration has been detected in SH2D1A (SH2 domain containing 1A) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative syndrome
AACATGGAACAAAACAGAGAAAGAAAAAAAGAGTGCATGGTACGCTTGTGCTGTCAGATCCAGGTTGCTCTGTTCCTAAGTTTATGGATGATTTGTTCAGAGTTGTTAAGAGACAAAAAAAGGTTAGGTTTTGTTTTCACTTATGTGACACTGAATGTTCTCACAGTTCACCTCACAGGTCAGCTGTTGCTCATATGGACTGATATAAAGGGATCCCTTTCCCTGTCTCCTTTCTATTTGAAATTCCACCATTTTGATTAATTCCTCTGGGCTAACCATTTGCCTGCTCAATATATGGAGAGCCCAAGGTGGACAACCTTTCAAATCCTTAATGTTGGAGTATGCATTCATATATCAGATTAATTTCTTCCTTGATCCAAAGCATGAAAAGGGGTAAGAGGTGGAGTTGGTCAAAAACATGTGAGGAAGGAAGATGATAAAATAATATTGGTCCCATTCCCCAGAGCCATCCCCAAATGTCACCTTGAATGCTTTAAAAAAAAATTCTTAATGCTGAAAATGACTAGTAGGAGACTTATGTTTATACTTTGCATACTAAGGCTGGACACTCTTCAATCAAGAAGAAAAGTTGCTACCAGCTACCACTGAAATCTTAGAGGATTGTTCTTAATCCTAGTAGATGAAGAGCAAATATCTGCCTTTGGTGCAAGTCAGCTCTGTACATCCAATCCATTGGTAAGACATGTGAGGAATTAAGTGTCGTTCTCGCTATTGAGTTCCCAGCCTTGCCATATTCTCAAAGAACTACACACTGAAGTTGCAGAAAGCATATAATAGACGACATAGCTTCAGTTATTTAAATTCAAATTTTAAAAGTACTTTACATAATCTAAAGGTACATGTACAAGACCATTCAGCTTCAGCAATAAATAAAGTCTTACTCTAGTGAAAATGCAGGAAGCTTTGCGGAAATATTACCTAGCACATTTTGAAATAGAAGCAATGTTTTATTTCAGAGAAGAAAATGAAGGTTGAAAGGTTTTAAAATATTAAAGACAGTTTAGCCTCAATCGAAGAAATAACATTTTCTAGAAACAACAGAGAATAAAAGTTACAACAAAATTATCAACAACTTGCAAATGATTCAAAACAGATTTTATGGACAAAATGCTGAAAGGTGGGCCCTGTACACCAAAGGGCACATACAAATCCACATAAAGGCAAAGCACCAGTTAAATGATTCACAGTCTCATCTAAAGCCCATCAAATAGATACATCTGGAACATCTTTGGATGTACATTGTGACTTTTGTATCTCAACTAGCACTTTGGGACCTTGGACAAGGTGTTAGGAAAGAAATCAATATTTGCTCAGGATCAAGACTTCTCAAGATGACTGCGTGAGGTAGAAGGAAGAGGGAGAAGAAGAACTTGCCCAGAGTTCACTGTTCATCTACTATGTCTGATTCTGTAGGAGTCTTCATGGCCATGTTCAGTAATGATTGCATACTGACAGTACTGATAAAACTATCAGTGTTTTGTTCTCAGAGCTCTTGGTCCTTTCATTTTGTCAGTGTGTTTTTGCCCTACGTAGTGGGTCCACATACCAACAGAGACATGTACAACTTGCCTCTATCATCAACTCCTTATGGGCTAGTTGAGCTAAGTTATTCCTGGTGGCCTCTGAGTAAACCGCAAGAACAGAAGCATTACTAAGCATCCCCGTCTGAGTGCAAGGGTGTGTGTTGGCAGTACAGCCCCAATCTTGCAAAATCCTTCTTCCAATGTTCCTCCCCTCTCTGTATGAACCCTGTGTTGGGGGGCAGAAGATGGAAGCCCTTGGCAAGCTCGATCGAACCAAGCTACTAAATTGCTGAGCTCGTTTTAACTGAAGTGTGAGAAGGAGGTTTAAGGCAAGTAGACAACATCCTGTTGTTGGGGTGCTTCTCTCTTTTTTGCACATCTGGCTGAACTGGGAGTCAGGTGGTTGACTTGTGCCTGGCTGCAGTAGCAGCGGCATCTCCCTTGCACAGTTCTCCTCCTCGGCCTGCCCAAGAGTCCACCAGGCCATGGACGCAGTGGCTGTGTATCATGGCAAAATCAGCAGGGAAACCGGCGAGAAGCTCCTGCTTGCCACTGGGCTGGATGGCAGCTATTTGCTGAGGGACAGCGAGAGCGTGCCAGGCGTGTACTGCCTATGTGTGCTGTGAGTATGATACGGTGGACATGGGCCTGCTGAGGGTGTGGGCGGTGGGCAACAGCAGCTGGGGCCAGGGTGGAGGCCGAGGCAGGCAGGGGCGCCGGCGTTAGCAGCTCGCCGACGCCTCCTCCGTGGCCCACCCTCAAGTCCAGCCCAGGGCCGTGGTGGAACACACTTTCGCCTCAATCCCTCGCTGGGGATTTCATTCCCTGGGCCTCCTGCTCTCCAGAAGGCCCTCACCAGAGCCTTTTGGGGCAGCTGCAGAGAATGCCATTTCGGGTGGTGAAATGTGGTCCACAGTTTACCTTCGCTCCGGGAAAGACCCAGGCTCCCCACTTCCATTTTGACCCCTATCGGGTGGCGCCCTGCGAGCCTTACTCTAGCTCTCTTTAAACGACTTTTGAAGTGTCATCCCAAAGGAAGAGCATGACATTCAGAGAGAGGAGGCACATTAAGAAACAGAGTCAATTACTTTAAGAATGCAATGCCAGTTAGGTCGAGATGCTGAGAGAGGAGGGGGATGTGTGTCAGTAAAATCACCTCTCTGGATCTGCTGATGTAGCATCCTTTAGAAAAGTAGTGGGGGGTGGGGAGGGGCAGGGGATTTCAGAAATAGGACCCTTCTTGATAAACGTTAGGACTCACAATAGTCTTAAAGGGAATGGAGGGAAAACACCCTTGTTATGATTCAGCTTTGCCATTTGCCTAGGCATGTCTCATTCTAAGGCTTCATTTTGAATCAAATTCATCTGCGTCTTTGCTCCAGGGCTCCGGAGTCAGGCAGATCTGAGACTTTGTCCTGTGCTCGTCAGATGTTAGGTTTGTGACTTGGGCAAATTAACCTCTCAGTTCCCCAGTTTTCTTATCCATTGAATAGGTATCATATTACTGCCTACCTCATAGGATTGTAAGATTAAGTGCCATAATGCAGTAAAAAAATTAGCACTGGGGCCTGACACCTAGTAAATGTTCAATAAATGTAAGCTATTGGTATTATTATTATACCAAAGATATATTATTATTTTATCTTCTCTTTTCAGTTGATTTCTTTTAGGAATCATGGGGGCATTTCTAAGGAAGGACCTAGCTCAGGCATTATTGTCAGCAGGATAAAAAAAAAAATCCATGAAAACAGCAGCCCTGCATTGTAGGTTCTAGACAGAAACCAAATGAGGTTAAATGCTTGGTAGTAAGTTCAGCATCTGATAATACCCCACAAGAGTTTGAAATACCTTATGGGTCAGTGAAGAAAGATTATCCTGATGCTGGTGCTAGAAGATTTTTCACTGTATATTGTTTTTTAAAAACGGTCAAGCCTTGTTTGTGGCAGCTCTCAGGTCATGCTAAATACATTTTTCACAAAGGCTTCAAGGGAAATACGTGGAAGCTATTGAATGTCTTGGGCTTGAATCTTTATGTTTTGCTTATATAATTATTGTTCCCGTGTGGAACCTAGGGAAGGGCAATGAAAACCAGCTAGGATTCTTAGGCTCTTTTCTCATTGAAAGAAGGTGGAGTGAGTGGGTGGGTGAAAGGCGCTGCTTTAGGGAAGCTGACAAAGGAGATAACATGCTCCTTAACCCAAAGGTGAAAAAGAATGTACAAAACAAGTCTGGGCAGGGGAGGGACAACAGGGTATAGTGAGAGGCAAGATATACCTAAGGCTTCAGCCTCACGGGGCTCCTGGCCGTTTCTCAAGCTCCTCAAAAATGCCCCCACTTAGGATTTCTGCGCTTATTGTTCCTTCTGCCCAAAATACCTTCAGTTCACATGTTTGTTCAACTGTCTCCTCCCTCAGAGAGGACTTGCTTGACCACCTATCTAGAACAAGTGCCCTCTCCCTGTCCCTGATACACTCACTCCATCTCTTTATTTTTCTTCAAAGAGCTTTAAACTATCTGATAATTTGCTTGTTTACCTACTTATTGCTGGGCTG
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Task1_train_31045
A sequence alteration has been identified in SH2D1A (SH2 domain containing 1A) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
ATGGAACAAAACAGAGAAAGAAAAAAAGAGTGCATGGTACGCTTGTGCTGTCAGATCCAGGTTGCTCTGTTCCTAAGTTTATGGATGATTTGTTCAGAGTTGTTAAGAGACAAAAAAAGGTTAGGTTTTGTTTTCACTTATGTGACACTGAATGTTCTCACAGTTCACCTCACAGGTCAGCTGTTGCTCATATGGACTGATATAAAGGGATCCCTTTCCCTGTCTCCTTTCTATTTGAAATTCCACCATTTTGATTAATTCCTCTGGGCTAACCATTTGCCTGCTCAATATATGGAGAGCCCAAGGTGGACAACCTTTCAAATCCTTAATGTTGGAGTATGCATTCATATATCAGATTAATTTCTTCCTTGATCCAAAGCATGAAAAGGGGTAAGAGGTGGAGTTGGTCAAAAACATGTGAGGAAGGAAGATGATAAAATAATATTGGTCCCATTCCCCAGAGCCATCCCCAAATGTCACCTTGAATGCTTTAAAAAAAAATTCTTAATGCTGAAAATGACTAGTAGGAGACTTATGTTTATACTTTGCATACTAAGGCTGGACACTCTTCAATCAAGAAGAAAAGTTGCTACCAGCTACCACTGAAATCTTAGAGGATTGTTCTTAATCCTAGTAGATGAAGAGCAAATATCTGCCTTTGGTGCAAGTCAGCTCTGTACATCCAATCCATTGGTAAGACATGTGAGGAATTAAGTGTCGTTCTCGCTATTGAGTTCCCAGCCTTGCCATATTCTCAAAGAACTACACACTGAAGTTGCAGAAAGCATATAATAGACGACATAGCTTCAGTTATTTAAATTCAAATTTTAAAAGTACTTTACATAATCTAAAGGTACATGTACAAGACCATTCAGCTTCAGCAATAAATAAAGTCTTACTCTAGTGAAAATGCAGGAAGCTTTGCGGAAATATTACCTAGCACATTTTGAAATAGAAGCAATGTTTTATTTCAGAGAAGAAAATGAAGGTTGAAAGGTTTTAAAATATTAAAGACAGTTTAGCCTCAATCGAAGAAATAACATTTTCTAGAAACAACAGAGAATAAAAGTTACAACAAAATTATCAACAACTTGCAAATGATTCAAAACAGATTTTATGGACAAAATGCTGAAAGGTGGGCCCTGTACACCAAAGGGCACATACAAATCCACATAAAGGCAAAGCACCAGTTAAATGATTCACAGTCTCATCTAAAGCCCATCAAATAGATACATCTGGAACATCTTTGGATGTACATTGTGACTTTTGTATCTCAACTAGCACTTTGGGACCTTGGACAAGGTGTTAGGAAAGAAATCAATATTTGCTCAGGATCAAGACTTCTCAAGATGACTGCGTGAGGTAGAAGGAAGAGGGAGAAGAAGAACTTGCCCAGAGTTCACTGTTCATCTACTATGTCTGATTCTGTAGGAGTCTTCATGGCCATGTTCAGTAATGATTGCATACTGACAGTACTGATAAAACTATCAGTGTTTTGTTCTCAGAGCTCTTGGTCCTTTCATTTTGTCAGTGTGTTTTTGCCCTACGTAGTGGGTCCACATACCAACAGAGACATGTACAACTTGCCTCTATCATCAACTCCTTATGGGCTAGTTGAGCTAAGTTATTCCTGGTGGCCTCTGAGTAAACCGCAAGAACAGAAGCATTACTAAGCATCCCCGTCTGAGTGCAAGGGTGTGTGTTGGCAGTACAGCCCCAATCTTGCAAAATCCTTCTTCCAATGTTCCTCCCCTCTCTGTATGAACCCTGTGTTGGGGGGCAGAAGATGGAAGCCCTTGGCAAGCTCGATCGAACCAAGCTACTAAATTGCTGAGCTCGTTTTAACTGAAGTGTGAGAAGGAGGTTTAAGGCAAGTAGACAACATCCTGTTGTTGGGGTGCTTCTCTCTTTTTTGCACATCTGGCTGAACTGGGAGTCAGGTGGTTGACTTGTGCCTGGCTGCAGTAGCAGCGGCATCTCCCTTGCACAGTTCTCCTCCTCGGCCTGCCCAAGAGTCCACCAGGCCATGGACGCAGTGGCTGTGTATCATGGCAAAATCAGCAGGGAAACCGGCGAGAAGCTCCTGCTTGCCACTGGGCTGGATGGCAGCTATTTGCTGAGGGACAGCGAGAGCGTGCCAGGCGTGTACTGCCTATGTGTGCTGTGAGTATGATACGGTGGACATGGGCCTGCTGAGGGTGTGGGCGGTGGGCAACAGCAGCTGGGGCCAGGGTGGAGGCCGAGGCAGGCAGGGGCGCCGGCGTTAGCAGCTCGCCGACGCCTCCTCCGTGGCCCACCCTCAAGTCCAGCCCAGGGCCGTGGTGGAACACACTTTCGCCTCAATCCCTCGCTGGGGATTTCATTCCCTGGGCCTCCTGCTCTCCAGAAGGCCCTCACCAGAGCCTTTTGGGGCAGCTGCAGAGAATGCCATTTCGGGTGGTGAAATGTGGTCCACAGTTTACCTTCGCTCCGGGAAAGACCCAGGCTCCCCACTTCCATTTTGACCCCTATCGGGTGGCGCCCTGCGAGCCTTACTCTAGCTCTCTTTAAACGACTTTTGAAGTGTCATCCCAAAGGAAGAGCATGACATTCAGAGAGAGGAGGCACATTAAGAAACAGAGTCAATTACTTTAAGAATGCAATGCCAGTTAGGTCGAGATGCTGAGAGAGGAGGGGGATGTGTGTCAGTAAAATCACCTCTCTGGATCTGCTGATGTAGCATCCTTTAGAAAAGTAGTGGGGGGTGGGGAGGGGCAGGGGATTTCAGAAATAGGACCCTTCTTGATAAACGTTAGGACTCACAATAGTCTTAAAGGGAATGGAGGGAAAACACCCTTGTTATGATTCAGCTTTGCCATTTGCCTAGGCATGTCTCATTCTAAGGCTTCATTTTGAATCAAATTCATCTGCGTCTTTGCTCCAGGGCTCCGGAGTCAGGCAGATCTGAGACTTTGTCCTGTGCTCGTCAGATGTTAGGTTTGTGACTTGGGCAAATTAACCTCTCAGTTCCCCAGTTTTCTTATCCATTGAATAGGTATCATATTACTGCCTACCTCATAGGATTGTAAGATTAAGTGCCATAATGCAGTAAAAAAATTAGCACTGGGGCCTGACACCTAGTAAATGTTCAATAAATGTAAGCTATTGGTATTATTATTATACCAAAGATATATTATTATTTTATCTTCTCTTTTCAGTTGATTTCTTTTAGGAATCATGGGGGCATTTCTAAGGAAGGACCTAGCTCAGGCATTATTGTCAGCAGGATAAAAAAAAAAATCCATGAAAACAGCAGCCCTGCATTGTAGGTTCTAGACAGAAACCAAATGAGGTTAAATGCTTGGTAGTAAGTTCAGCATCTGATAATACCCCACAAGAGTTTGAAATACCTTATGGGTCAGTGAAGAAAGATTATCCTGATGCTGGTGCTAGAAGATTTTTCACTGTATATTGTTTTTTAAAAACGGTCAAGCCTTGTTTGTGGCAGCTCTCAGGTCATGCTAAATACATTTTTCACAAAGGCTTCAAGGGAAATACGTGGAAGCTATTGAATGTCTTGGGCTTGAATCTTTATGTTTTGCTTATATAATTATTGTTCCCGTGTGGAACCTAGGGAAGGGCAATGAAAACCAGCTAGGATTCTTAGGCTCTTTTCTCATTGAAAGAAGGTGGAGTGAGTGGGTGGGTGAAAGGCGCTGCTTTAGGGAAGCTGACAAAGGAGATAACATGCTCCTTAACCCAAAGGTGAAAAAGAATGTACAAAACAAGTCTGGGCAGGGGAGGGACAACAGGGTATAGTGAGAGGCAAGATATACCTAAGGCTTCAGCCTCACGGGGCTCCTGGCCGTTTCTCAAGCTCCTCAAAAATGCCCCCACTTAGGATTTCTGCGCTTATTGTTCCTTCTGCCCAAAATACCTTCAGTTCACATGTTTGTTCAACTGTCTCCTCCCTCAGAGAGGACTTGCTTGACCACCTATCTAGAACAAGTGCCCTCTCCCTGTCCCTGATACACTCACTCCATCTCTTTATTTTTCTTCAAAGAGCTTTAAACTATCTGATAATTTGCTTGTTTACCTACTTATTGCTGGGCTGTCC
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Task1_train_31046
The following genetic variant occurs in SH2D1A (SH2 domain containing 1A) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
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Task1_train_31047
This variant affects gene SH2D1A (SH2 domain containing 1A) located on Chromosome X. Evaluate its biological effect and specify any disease association.
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
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The variant affects gene SH2D1A (SH2 domain containing 1A), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
CAAAAATTAGCCAGCCATGGTGGCATGCACCTGTAGCCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAAACAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAATGTATAGCACAGACAATTACATACAGTACACAATACTTGATAATGATAACAAATTACTGTGTTACTGGTTTATGTATTTACTGTACTATACATTTTATCATTATTTTAAAATCTACTCCTACTTATATAAAAAAAAGTTAGCTGTAAAACAGCCTCGGGCAGGTCCCTCAGGAGGTATTCCAGAAGGCATTCTGGAATATGAATATCATAGGAGATGACAGCTCCGTGTGTGTGACTGCACCTGAAGATCCTGCAGTGGGATAAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATACTGATGATCCTGACCCTCTCTGTAGGCCTAGGCTAATGTGCGTATTTGTGTTTTAGTTTTTAACAAAAAAGTTTAAATAGCAAAGAATACATAAAATAAAAATTTTGAAACAGAGAAAAGCTTATGGAATAAGGATATAAAGAAAAACAGTTTTGTACAGCTGTACAATGTGTTTGTGTTTTAAGCGAAGTGTTATAAAAGAGTCAAAAAGTTTAAAAAAATTTACAAGTTTATAAAGTAAAAGAGTTGAAGCTAAGATTAATTTATTATTGAAGCGATACAGTTTTTTTTTTTTGAGACAATCTCGCTCCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGAGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGTGCCACCATGCCTGGCTAAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGTTGTGTTAACCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGGGAAATATAAATATTTTAAAATAAATTTAGTGTAGCCTAAGTTTACAGTGTTCATAACATTCTAGTAGTGTAATGTCCTAGGCCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTGACTCACCCAGAGCAATTTCCAGTCCTGCAAGCTCCATTCATGGTAAGTACTCTCAACAGGTATAGCATTCTTTATCTTTTATACTATATTTTACTGTGCCTTTTCTATGTTTAGATAGGTTTAGATACACAAATACCATTATGTTACAATTGCATACAGTATTCTGTACAGTAACATGCTGTACAGGTTTGTAGCCTGGAGTAATAGGCTATACCACATAGCCTAGGTGGTATACCATATAGGTTTGTGTAAGTACAGTCTATGATGTTTGCACAACAACGAAATCACCTAATGATGCACTTCTCATAATGTATCCCCCTTGGTAAGTGATGCATGACTGTGGCAATATTATATTGCTATACATTATAATAGTAATTTTATAAAAATATAGTTATATTCAATTTATAGTATTATATCCTTATACTATTGCCATTATATTTATAACAAATATTATTAATATTAATAATTATTTATGTGGGCCTGATAGTGTATTATCCCAGTGAAATGTTTTCACCTTAAGTTTCGATATGTACTTAAAAATAAGTCTATTGTTTGTTAAAACTATCTAATAATTCATGGTTTTATCAATTACAACAGGTCCCTGTTGTAGTTTCTTTCTGTCCAAATGGTCTCTCAACTTGACAAATCTTTAGGAGCATGAATTTCCATATTTCAAAAAATGAAAAGATAAAGAAATCTCACTGGAAACTGTGGTTGGGCAGATACAATATGGAGACAAGTTAGATTCACTATGCTTTACTTCCTATGAATGCAATGACACCATATACGTGTGTCCTAGTATATGTGACATTTATATGTAATATTAAGCTCAAATTTAAAGTATCCATTGTTCTTTTGGAATCTTTCAGTAATGGAAGTTTATTCTTTCACAGGTATCACGGTTACATTTATACATACCGAGTGTCCCAGACAGAAACAGGTTCTTGGAGTGCTGAGGTATAGTTGTATTTATTTTTGCTTCTGGGGGTGTCAAGGAGGTATTTGAAATTTAGGCTGGTTTTATAAAAGAGCAAATTATACATTATTAAGTATTCATAAGGTTTAAATCTCTAAAGCTCCAATCCAAAATTGTTCATGGATCATTAAGAAAGCTTTAGAGAATTTTGGTCCCAGTCCTGTTTAGCCATCATTTTGCAGAGTTGTATGACTTTGGGAGAAAGATAAAAAAGTTGAAGAATTATGTCAAACTTTTAGTGACTATGTGAAATCTTAGCATATCAAAAGTAGGTAAAATAATTAAATGAACAATTATTTACCAAATGATACCAATATGAGTATTGGTATCGTGGGAGATTAAAAAACATGATGCTTATTTTCTAAGAGACTACAATATACTTGGGAAGTTATAACTTGAAATTAAACAGTTATGAGTGGAAGAAACTAGGCTTTGTCAACAGGTGAATCTGGGTTCCAGGTCTGGTCTCCCCTCCTCTCTGATAGGTCTATGATCTTGGGCAGGTTACTTGACTTTTCTGTGAGCCAGTTTCTTCATTTGTAAACGGAGCCTAAGAATCCTCCCTTATGCACAAGGCTCAATTTGAAAAGTAAATAAGATAACACACATAAAGAAGCTGTTTGCCACAAGGCCTGGCACACAGTGAGCCCTCAAAAAAGTGAACTCCTGAAAATTGCCACAACTCCTATTAATAACTCAATCTGTGCATTTAAAATTTTCTGAAGTCTAGACTTCAAGAAGTTAAAATAGCTCTCACGTTTACTGATTTATCAGTAAGTTGGAAAGTATAAATTACAGACCACAAATGTTTTGAACCACTGAGATGAATTAGGCCAAGTTTTCAAACACACTTTTGCTGTATTATGTAAGGATCATTAAAACTATAATACTAACTAAAGATAAAGTTATACCATTTCTAATTGAAACTATTTATACCTGTTTATTTAAAAAATTCTCTGTATCACTGCAGAGATGATTGAATAAGAAATTAAACTTTATTATGAAGAAAGTTATGTGTAAAATATACTGACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTTTGTATATTATTTCGCCAGAAATAGCTCTTCTCCCCAGAGAAATACCCTTCAGCTGCTGAAGAATATTATGTAAGGAAAGGATCTTAAATGCTTAGGGTTTAACAACTTTGTTTTTCAACTTGTTTTCCTGCATTTTGAGTATAACATCATATGAGATTGTTACATGCTTGTGATCATGTTAAAGAAGAGAGGGCTTATTGAACACAAATGCCCCCTCATCCTGTTGTCTGATCTGACGTTGTTTATGTAATAATATTGTAATTTTCTGCACCAAGAGAGCAGAAGATTGGCATGACATCCGCAAATAGAAAATAGTTTAAAAAATTCTTTAATTTTTGAAATGCATATTGCATTTTTTTCTATCTACTAAATTTACCTTCTTAGCAGTGCTTTTCTAAGGTGAAAATTAAACTAGTGTATATTCTCAGAGCTCATACCACCTGACTGGAAAAAATTTCTCTAGAGCATATTGAAGACCAGCTGTGATCTAATACATGTTTCCATGGATAACTAAGAGGTGACAGTATGGGAGATTTGCAAATTTGAAGAATAGCTGAGTTCAGTGACAGGATGAGAGTTGTCAGTGGTACAATTCTTGTGATAAATGTATTTTCGAAACTGGGTAAATGATAGATATTAATACTGATTTTTGGAACAATGTTTTAGTTTGCCATGCTGCAGGAAAAATCAAGGCAGTAGCATGCCACCATCTGTGCATATATTATGCTAGAAATCTAGGTAAGTGAGATTTGTTTTAAAGAGTGTAATGAAATCAAACCCTGGCCCCACTGAATTATGAAAGACAGATATCATGTGTTTTTCTAGTTTTAGAGAGACTTTTAGGTTAAATCTTTGCCTAGTGTATTATCTTATATGACTCAGACTAAAAGTTTGTTACATTGTTAATTTAG
CAAAAATTAGCCAGCCATGGTGGCATGCACCTGTAGCCTCAGCTACTCGGGAGGCTGAAACAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAATGTATAGCACAGACAATTACATACAGTACACAATACTTGATAATGATAACAAATTACTGTGTTACTGGTTTATGTATTTACTGTACTATACATTTTATCATTATTTTAAAATCTACTCCTACTTATATAAAAAAAAGTTAGCTGTAAAACAGCCTCGGGCAGGTCCCTCAGGAGGTATTCCAGAAGGCATTCTGGAATATGAATATCATAGGAGATGACAGCTCCGTGTGTGTGACTGCACCTGAAGATCCTGCAGTGGGATAAGATGTGGAGGTGGAAGACAGTGATACTGATGATCCTGACCCTCTCTGTAGGCCTAGGCTAATGTGCGTATTTGTGTTTTAGTTTTTAACAAAAAAGTTTAAATAGCAAAGAATACATAAAATAAAAATTTTGAAACAGAGAAAAGCTTATGGAATAAGGATATAAAGAAAAACAGTTTTGTACAGCTGTACAATGTGTTTGTGTTTTAAGCGAAGTGTTATAAAAGAGTCAAAAAGTTTAAAAAAATTTACAAGTTTATAAAGTAAAAGAGTTGAAGCTAAGATTAATTTATTATTGAAGCGATACAGTTTTTTTTTTTTGAGACAATCTCGCTCCGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGTCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGAGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGTGCGTGCCACCATGCCTGGCTAAGTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCGTTGTGTTAACCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCTGGGAAATATAAATATTTTAAAATAAATTTAGTGTAGCCTAAGTTTACAGTGTTCATAACATTCTAGTAGTGTAATGTCCTAGGCCTTCACATTCACTCACCACTCACTCATTGACTCACCCAGAGCAATTTCCAGTCCTGCAAGCTCCATTCATGGTAAGTACTCTCAACAGGTATAGCATTCTTTATCTTTTATACTATATTTTACTGTGCCTTTTCTATGTTTAGATAGGTTTAGATACACAAATACCATTATGTTACAATTGCATACAGTATTCTGTACAGTAACATGCTGTACAGGTTTGTAGCCTGGAGTAATAGGCTATACCACATAGCCTAGGTGGTATACCATATAGGTTTGTGTAAGTACAGTCTATGATGTTTGCACAACAACGAAATCACCTAATGATGCACTTCTCATAATGTATCCCCCTTGGTAAGTGATGCATGACTGTGGCAATATTATATTGCTATACATTATAATAGTAATTTTATAAAAATATAGTTATATTCAATTTATAGTATTATATCCTTATACTATTGCCATTATATTTATAACAAATATTATTAATATTAATAATTATTTATGTGGGCCTGATAGTGTATTATCCCAGTGAAATGTTTTCACCTTAAGTTTCGATATGTACTTAAAAATAAGTCTATTGTTTGTTAAAACTATCTAATAATTCATGGTTTTATCAATTACAACAGGTCCCTGTTGTAGTTTCTTTCTGTCCAAATGGTCTCTCAACTTGACAAATCTTTAGGAGCATGAATTTCCATATTTCAAAAAATGAAAAGATAAAGAAATCTCACTGGAAACTGTGGTTGGGCAGATACAATATGGAGACAAGTTAGATTCACTATGCTTTACTTCCTATGAATGCAATGACACCATATACGTGTGTCCTAGTATATGTGACATTTATATGTAATATTAAGCTCAAATTTAAAGTATCCATTGTTCTTTTGGAATCTTTCAGTAATGGAAGTTTATTCTTTCACAGGTATCACGGTTACATTTATACATACCTAGTGTCCCAGACAGAAACAGGTTCTTGGAGTGCTGAGGTATAGTTGTATTTATTTTTGCTTCTGGGGGTGTCAAGGAGGTATTTGAAATTTAGGCTGGTTTTATAAAAGAGCAAATTATACATTATTAAGTATTCATAAGGTTTAAATCTCTAAAGCTCCAATCCAAAATTGTTCATGGATCATTAAGAAAGCTTTAGAGAATTTTGGTCCCAGTCCTGTTTAGCCATCATTTTGCAGAGTTGTATGACTTTGGGAGAAAGATAAAAAAGTTGAAGAATTATGTCAAACTTTTAGTGACTATGTGAAATCTTAGCATATCAAAAGTAGGTAAAATAATTAAATGAACAATTATTTACCAAATGATACCAATATGAGTATTGGTATCGTGGGAGATTAAAAAACATGATGCTTATTTTCTAAGAGACTACAATATACTTGGGAAGTTATAACTTGAAATTAAACAGTTATGAGTGGAAGAAACTAGGCTTTGTCAACAGGTGAATCTGGGTTCCAGGTCTGGTCTCCCCTCCTCTCTGATAGGTCTATGATCTTGGGCAGGTTACTTGACTTTTCTGTGAGCCAGTTTCTTCATTTGTAAACGGAGCCTAAGAATCCTCCCTTATGCACAAGGCTCAATTTGAAAAGTAAATAAGATAACACACATAAAGAAGCTGTTTGCCACAAGGCCTGGCACACAGTGAGCCCTCAAAAAAGTGAACTCCTGAAAATTGCCACAACTCCTATTAATAACTCAATCTGTGCATTTAAAATTTTCTGAAGTCTAGACTTCAAGAAGTTAAAATAGCTCTCACGTTTACTGATTTATCAGTAAGTTGGAAAGTATAAATTACAGACCACAAATGTTTTGAACCACTGAGATGAATTAGGCCAAGTTTTCAAACACACTTTTGCTGTATTATGTAAGGATCATTAAAACTATAATACTAACTAAAGATAAAGTTATACCATTTCTAATTGAAACTATTTATACCTGTTTATTTAAAAAATTCTCTGTATCACTGCAGAGATGATTGAATAAGAAATTAAACTTTATTATGAAGAAAGTTATGTGTAAAATATACTGACAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGTTTGTATATTATTTCGCCAGAAATAGCTCTTCTCCCCAGAGAAATACCCTTCAGCTGCTGAAGAATATTATGTAAGGAAAGGATCTTAAATGCTTAGGGTTTAACAACTTTGTTTTTCAACTTGTTTTCCTGCATTTTGAGTATAACATCATATGAGATTGTTACATGCTTGTGATCATGTTAAAGAAGAGAGGGCTTATTGAACACAAATGCCCCCTCATCCTGTTGTCTGATCTGACGTTGTTTATGTAATAATATTGTAATTTTCTGCACCAAGAGAGCAGAAGATTGGCATGACATCCGCAAATAGAAAATAGTTTAAAAAATTCTTTAATTTTTGAAATGCATATTGCATTTTTTTCTATCTACTAAATTTACCTTCTTAGCAGTGCTTTTCTAAGGTGAAAATTAAACTAGTGTATATTCTCAGAGCTCATACCACCTGACTGGAAAAAATTTCTCTAGAGCATATTGAAGACCAGCTGTGATCTAATACATGTTTCCATGGATAACTAAGAGGTGACAGTATGGGAGATTTGCAAATTTGAAGAATAGCTGAGTTCAGTGACAGGATGAGAGTTGTCAGTGGTACAATTCTTGTGATAAATGTATTTTCGAAACTGGGTAAATGATAGATATTAATACTGATTTTTGGAACAATGTTTTAGTTTGCCATGCTGCAGGAAAAATCAAGGCAGTAGCATGCCACCATCTGTGCATATATTATGCTAGAAATCTAGGTAAGTGAGATTTGTTTTAAAGAGTGTAATGAAATCAAACCCTGGCCCCACTGAATTATGAAAGACAGATATCATGTGTTTTTCTAGTTTTAGAGAGACTTTTAGGTTAAATCTTTGCCTAGTGTATTATCTTATATGACTCAGACTAAAAGTTTGTTACATTGTTAATTTAG
Task1_train_31049
A variant was discovered on Chromosome X, affecting SH2D1A (SH2 domain containing 1A). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
TCACTCTGTCGCTCAGGCTGGAGTGGTGGAATGGCCCGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCCTGTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCCGGGATTGCCACCACACCTGGCTAATTTTCATATTTTTAGTAAAGCCAGGCTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCAGGTGGTCCGCCGGTCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCTATGCTTCTGTTGATAAATGACTTTACAAGCCACAAGAAGCTAAAAAGATGTGTGGTTTGAAATCTTTCCACACTTTAGGTGTGTATAGTTTTTCTTCTGTTTGATGACCCTAGCTTCGCTAGATCCTGTTTGGCCCAGTTCTAATCTGAAAGGCAAGAGACTGGGTCCTGGGATTCTGAGCCAGTTCTGCCTCTGGTTGTCTGTGTGACTTTGGGCAAGCTGATTAATTTCTTTGCATTCATATTTTCTTATCTGTCAAATGGGAATAACTGAATCAGCCAATAACTGCCATTTTGTGAGGAAATAGTGAAGGCAAGAGATAGGAATGTGCTTTGAAAATGAAAAAGTGCACTGAGGAAAGTATAAGGAGGCAATTTGTGCCTATGACCTGCATTTGCAATTTGGAGACTCTATCTTGGAACCAACGAACTGTTTGGACTTCTGCAAGAATGGCCATGTTATTTTGGATGAGTTCTCAATCGAGCTTTAGGAAGGTGGAGGGTAGGTGAGAGAGTGGGGTGGAGCTGGGTGAGAGAGTGTTCTACATCTACTGTGAACATATGGGGGAACACTAATATAGAGCTAAAAAGAATTTTTGTCATGTTTTCAATGAAAAATTACCCCAACATAAGGAAATGACTGAGAGTTACTATGGATAGTGTAGTATGCTATCTTCAGCATACCACTATCTAGCTGACAGAAGTCTTCATGCTCGCCTTCATGTTTTCTCATTAAATGCTAAAAAAACAAACAGCTCCCACCTCAAAAATCTACCAGATGGAATAGCTGAAAAACAACTTAAAAAAAAAACTAGTCATTGTTCAATTGCTCATAGCAATACTATTTTATTTTACGTAAAATGACAGGTTTGAGCTGATGCCTGAAGCTTGGCTCATAAGCTTTTGCAGGAAATTGTTGTTGATTTCAGGCAGTGTCTTTGCAAGACAACTGATGTCAGGAAAGGAACACATTTTAATAGTCACCTGCAAATAACTGTCTCTTTAAAAACACACAAATAAATAAATAAAGGTGACCTTATATAGTCTTTCATTTTCATGTCATAGAGAAAACCTTGTTACAGTGACGTGCTGATGGAGAGAACAATTTTGGGAGTATAGGGAAGTTTCCCAAGGAGGAAAAAATTTAATGTGAAGAATGGCGCAGGAAATATTGTGAGGTGAAAGAGTATGAGGACTGAACTAGCCGTGCACTGTGTGCATCATAACAGCCAATTTTTAATTTCCTGTGTAGCATTTTATATTGTGGGATGATGGCAGGGAGGATGGGTTGTTGGTTTTTCTTTTGTTGTTGTTCCTCAGGCTTTTTATTAATGACCTGTAGGATCTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCCTGTTTAACTGCATCCCCTCTGTTGGTGAATTCATTGTGGGTAATGGCCTGTATACCCTTAGAGGTTTGAGATGTCTGATGGGGAGCAGGCAGGAAGGGCAGGGCAATGAGCAAGAGCTTGTACAAACTAATACCACCTTTGGGAGAACTGAAATGACAGCTCATTAGCTCCTCTTGCAGGGAAATTCAGCCAACCAAAGTAAGCTCTTCTGGAATGTTGTTTTTCCTTCTTCCTTATGTTTTCAAATATTTCAACAAGTTACACAAATGTTACTTCTCTTAGCATCCCTAGCACATTTTGTAGGTCTTTTTGTATCATTATGAGATAGGTAAATAATTTGCTTGGCCTTTTATTTTCCAGACAGCACCTGGGGTACATAAAAGATATTTCCGGAAAATAAAAAATCTCATTTCAGCATTTCAGAAGCCAGATCAAGGCATTGTAATACCTCTGCAGTATCCAGTTGAGAAGAAGTCCTCAGCTAGAAGTACACAAGGTACTACAGGTATGATTTCCTCTTAATTTTTGACAGGGTTTGGAAGCTCAGAGTTATGAGTCAACCTGTTCATAACCATATAATCAATTAGAAGTTATGTAAGAAAAATGCAGTGAGAAAGTAGATGTAGCCAGCAAGTCAAATGAGAGGTGACAATTTATGTGCTATAATTTTCATCTATTATTCTAATAACTTTTAATAAATCTCTGTAAAAACATCAAAAATTCTATAAGCCCATAACATTTTAACTGCTCTTGTCTGTCTCATCTTGTTCTTTCCTGTCCCTTTAATAGGTAGCTAAGTATGATTTCACTTCACTAATTCAGACACAAATAATGTGAAAGATGGTATAATTCAGAGAACACCTGGGCTGTCCTTTATCTTTGCTTAGTAAACTGTTTTTTCCTTCAGGGACATGAAAGCTAACGTTAGCCTGGCACACATGATTCTGATTTCTGAATTGGTGGTGCTTGAATTAATGACATTTTTCTGAAGCAAAGGAAATTAAATAGTGCACTTTATTGTTCCACTGGCACATATTGTTACATATCCTGAGCAAACCTATTTTAGTGTATGTGTCGTGCTAAAGACTGAATACCAGCCAATGTCTGTAGCTATCTGATACGTGACTGTTTACTCCTCTATTGAATGGGGTTTATCATTTGTTTGGAGTAAGAGGATAGGCCTTGATTGAAACAATAAATATTTATGATAAAAGAAAACGAGTCCCTTTTTGACAGGGACCTAGGCTCAGGCATAAACTGACAATTAGACTCAAGTGGTGAATTAAATTAATGAATAGTTAGCCTTTATAATACAAATGCAAATAGAGCTCTAATTTCCAAGTTGGCTAGTTGTTTTTTTCTGCCTAATATTCCATTCTTTATAACTCAGTTTTAAATAATAGTTGCTTGAGGTATATTACTGTGTTGTGTCATTGTGAGTTTTATGCAGTTGGAAATTTTATAAGTTTGAGTTAATCTGTAATTTTAATAGTTTGTAAGTTTATTTTTTCTTGATTTTTGTTATTTTTCTTTAGGGATAAGAGAAGATCCTGATGTCTGCCTGAAAGCCCCATGAAGAAAAATAAAACACCTTGTACTTTATTTTCTATAATTTAAATATATGCTAAGTCTTATATATTGTAGATAATACAGTTCGGTGAGCTACAAATGCATTTCTAAAGCCATTGTAGTCCTGTAATGGAAGCATCTAGCATGTCGTCAAAGCTGAAATGGACTTTTGTACATAGTGAGGAGCTTTGAAACGAGGATTGGGAAAAAGTAATTCCGTAGGTTATTTTCAGTTATTATATTTACAAATGGGAAACAAAAGGATAATGAATACTTTATAAAGGATTAATGTCAATTCTTGCCAAATATAAATAAAAATAATCCTCAGTTTTTGTGAAAAGCTCCATTTTTAGTGAAATATTATTTTATAGCTACTAATTTTAAAATGTCTTGCTTGATTGTATGGTGGGAAGTTGGCTGGTGTCCCTTGTCTTTGCCAAGTTCTCCACTAGCTATGGTGTCATAGGCTCTTTTGGGATTTTTGAAGCTGTATACTGTGTGCTAAAACAAGCACTAAACAAAGAGTGAAGGATTTATGTTTAATTCTGAAAGCAACCTTCTTGCCTAGTGTTCTGATATTGGACAGTAAAATCCACAGACCAACCTGGAGTTGAAAATCTTATAATTTAAAATATGCTCTAAACATGTTTATCGTATTTGATGCTACAGGATTTGAAATTGTATTACAAATCCAATGAAATGAGTTTTTCTTTTCATTTACCTCTGCCCCAGTTGTTTCTACTACATGGAAGACCTCATTTTGAAGGGAAATTTCAGCAGCTGCAGCTCATGAGTAACTGATTTGTAACAAGCCTCCTTTTAAAGTAACCCTACAAAACCACTGGAAAGTTTATGGTTGTATTATTTTTTAAAAAAATTCCAAGTGAT
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Task1_train_31050
This is a variant in SH2D1A (SH2 domain containing 1A), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; X-linked lymphoproliferative disease due to SH2D1A deficiency
GTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCCTGTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCCGGGATTGCCACCACACCTGGCTAATTTTCATATTTTTAGTAAAGCCAGGCTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCAGGTGGTCCGCCGGTCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCTATGCTTCTGTTGATAAATGACTTTACAAGCCACAAGAAGCTAAAAAGATGTGTGGTTTGAAATCTTTCCACACTTTAGGTGTGTATAGTTTTTCTTCTGTTTGATGACCCTAGCTTCGCTAGATCCTGTTTGGCCCAGTTCTAATCTGAAAGGCAAGAGACTGGGTCCTGGGATTCTGAGCCAGTTCTGCCTCTGGTTGTCTGTGTGACTTTGGGCAAGCTGATTAATTTCTTTGCATTCATATTTTCTTATCTGTCAAATGGGAATAACTGAATCAGCCAATAACTGCCATTTTGTGAGGAAATAGTGAAGGCAAGAGATAGGAATGTGCTTTGAAAATGAAAAAGTGCACTGAGGAAAGTATAAGGAGGCAATTTGTGCCTATGACCTGCATTTGCAATTTGGAGACTCTATCTTGGAACCAACGAACTGTTTGGACTTCTGCAAGAATGGCCATGTTATTTTGGATGAGTTCTCAATCGAGCTTTAGGAAGGTGGAGGGTAGGTGAGAGAGTGGGGTGGAGCTGGGTGAGAGAGTGTTCTACATCTACTGTGAACATATGGGGGAACACTAATATAGAGCTAAAAAGAATTTTTGTCATGTTTTCAATGAAAAATTACCCCAACATAAGGAAATGACTGAGAGTTACTATGGATAGTGTAGTATGCTATCTTCAGCATACCACTATCTAGCTGACAGAAGTCTTCATGCTCGCCTTCATGTTTTCTCATTAAATGCTAAAAAAACAAACAGCTCCCACCTCAAAAATCTACCAGATGGAATAGCTGAAAAACAACTTAAAAAAAAAACTAGTCATTGTTCAATTGCTCATAGCAATACTATTTTATTTTACGTAAAATGACAGGTTTGAGCTGATGCCTGAAGCTTGGCTCATAAGCTTTTGCAGGAAATTGTTGTTGATTTCAGGCAGTGTCTTTGCAAGACAACTGATGTCAGGAAAGGAACACATTTTAATAGTCACCTGCAAATAACTGTCTCTTTAAAAACACACAAATAAATAAATAAAGGTGACCTTATATAGTCTTTCATTTTCATGTCATAGAGAAAACCTTGTTACAGTGACGTGCTGATGGAGAGAACAATTTTGGGAGTATAGGGAAGTTTCCCAAGGAGGAAAAAATTTAATGTGAAGAATGGCGCAGGAAATATTGTGAGGTGAAAGAGTATGAGGACTGAACTAGCCGTGCACTGTGTGCATCATAACAGCCAATTTTTAATTTCCTGTGTAGCATTTTATATTGTGGGATGATGGCAGGGAGGATGGGTTGTTGGTTTTTCTTTTGTTGTTGTTCCTCAGGCTTTTTATTAATGACCTGTAGGATCTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCCTGTTTAACTGCATCCCCTCTGTTGGTGAATTCATTGTGGGTAATGGCCTGTATACCCTTAGAGGTTTGAGATGTCTGATGGGGAGCAGGCAGGAAGGGCAGGGCAATGAGCAAGAGCTTGTACAAACTAATACCACCTTTGGGAGAACTGAAATGACAGCTCATTAGCTCCTCTTGCAGGGAAATTCAGCCAACCAAAGTAAGCTCTTCTGGAATGTTGTTTTTCCTTCTTCCTTATGTTTTCAAATATTTCAACAAGTTACACAAATGTTACTTCTCTTAGCATCCCTAGCACATTTTGTAGGTCTTTTTGTATCATTATGAGATAGGTAAATAATTTGCTTGGCCTTTTATTTTCCAGACAGCACCTGGGGTACATAAAAGATATTTCCGGAAAATAAAAAATCTCATTTCAGCATTTCAGAAGCCAGATCAAGGCATTGTAATACCTCTGCAGTATCCAGTTGAGAAGAAGTCCTCAGCTAGAAGTACACAAGGTACTACAGGTATGATTTCCTCTTAATTTTTGACAGGGTTTGGAAGCTCAGAGTTATGAGTCAACCTGTTCATAACCATATAATCAATTAGAAGTTATGTAAGAAAAATGCAGTGAGAAAGTAGATGTAGCCAGCAAGTCAAATGAGAGGTGACAATTTATGTGCTATAATTTTCATCTATTATTCTAATAACTTTTAATAAATCTCTGTAAAAACATCAAAAATTCTATAAGCCCATAACATTTTAACTGCTCTTGTCTGTCTCATCTTGTTCTTTCCTGTCCCTTTAATAGGTAGCTAAGTATGATTTCACTTCACTAATTCAGACACAAATAATGTGAAAGATGGTATAATTCAGAGAACACCTGGGCTGTCCTTTATCTTTGCTTAGTAAACTGTTTTTTCCTTCAGGGACATGAAAGCTAACGTTAGCCTGGCACACATGATTCTGATTTCTGAATTGGTGGTGCTTGAATTAATGACATTTTTCTGAAGCAAAGGAAATTAAATAGTGCACTTTATTGTTCCACTGGCACATATTGTTACATATCCTGAGCAAACCTATTTTAGTGTATGTGTCGTGCTAAAGACTGAATACCAGCCAATGTCTGTAGCTATCTGATACGTGACTGTTTACTCCTCTATTGAATGGGGTTTATCATTTGTTTGGAGTAAGAGGATAGGCCTTGATTGAAACAATAAATATTTATGATAAAAGAAAACGAGTCCCTTTTTGACAGGGACCTAGGCTCAGGCATAAACTGACAATTAGACTCAAGTGGTGAATTAAATTAATGAATAGTTAGCCTTTATAATACAAATGCAAATAGAGCTCTAATTTCCAAGTTGGCTAGTTGTTTTTTTCTGCCTAATATTCCATTCTTTATAACTCAGTTTTAAATAATAGTTGCTTGAGGTATATTACTGTGTTGTGTCATTGTGAGTTTTATGCAGTTGGAAATTTTATAAGTTTGAGTTAATCTGTAATTTTAATAGTTTGTAAGTTTATTTTTTCTTGATTTTTGTTATTTTTCTTTAGGGATAAGAGAAGATCCTGATGTCTGCCTGAAAGCCCCATGAAGAAAAATAAAACACCTTGTACTTTATTTTCTATAATTTAAATATATGCTAAGTCTTATATATTGTAGATAATACAGTTCGGTGAGCTACAAATGCATTTCTAAAGCCATTGTAGTCCTGTAATGGAAGCATCTAGCATGTCGTCAAAGCTGAAATGGACTTTTGTACATAGTGAGGAGCTTTGAAACGAGGATTGGGAAAAAGTAATTCCGTAGGTTATTTTCAGTTATTATATTTACAAATGGGAAACAAAAGGATAATGAATACTTTATAAAGGATTAATGTCAATTCTTGCCAAATATAAATAAAAATAATCCTCAGTTTTTGTGAAAAGCTCCATTTTTAGTGAAATATTATTTTATAGCTACTAATTTTAAAATGTCTTGCTTGATTGTATGGTGGGAAGTTGGCTGGTGTCCCTTGTCTTTGCCAAGTTCTCCACTAGCTATGGTGTCATAGGCTCTTTTGGGATTTTTGAAGCTGTATACTGTGTGCTAAAACAAGCACTAAACAAAGAGTGAAGGATTTATGTTTAATTCTGAAAGCAACCTTCTTGCCTAGTGTTCTGATATTGGACAGTAAAATCCACAGACCAACCTGGAGTTGAAAATCTTATAATTTAAAATATGCTCTAAACATGTTTATCGTATTTGATGCTACAGGATTTGAAATTGTATTACAAATCCAATGAAATGAGTTTTTCTTTTCATTTACCTCTGCCCCAGTTGTTTCTACTACATGGAAGACCTCATTTTGAAGGGAAATTTCAGCAGCTGCAGCTCATGAGTAACTGATTTGTAACAAGCCTCCTTTTAAAGTAACCCTACAAAACCACTGGAAAGTTTATGGTTGTATTATTTTTTAAAAAAATTCCAAGTGATTGAAACCTACACGAGATACAGAATTTTATGCGGCATTTTCTTCTCACATTT
GTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGAGTCCTGTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCCGGGATTGCCACCACACCTGGCTAATTTTCATATTTTTAGTAAAGCCAGGCTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACTTCAGGTGGTCCGCCGGTCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCCGGCTATGCTTCTGTTGATAAATGACTTTACAAGCCACAAGAAGCTAAAAAGATGTGTGGTTTGAAATCTTTCCACACTTTAGGTGTGTATAGTTTTTCTTCTGTTTGATGACCCTAGCTTCGCTAGATCCTGTTTGGCCCAGTTCTAATCTGAAAGGCAAGAGACTGGGTCCTGGGATTCTGAGCCAGTTCTGCCTCTGGTTGTCTGTGTGACTTTGGGCAAGCTGATTAATTTCTTTGCATTCATATTTTCTTATCTGTCAAATGGGAATAACTGAATCAGCCAATAACTGCCATTTTGTGAGGAAATAGTGAAGGCAAGAGATAGGAATGTGCTTTGAAAATGAAAAAGTGCACTGAGGAAAGTATAAGGAGGCAATTTGTGCCTATGACCTGCATTTGCAATTTGGAGACTCTATCTTGGAACCAACGAACTGTTTGGACTTCTGCAAGAATGGCCATGTTATTTTGGATGAGTTCTCAATCGAGCTTTAGGAAGGTGGAGGGTAGGTGAGAGAGTGGGGTGGAGCTGGGTGAGAGAGTGTTCTACATCTACTGTGAACATATGGGGGAACACTAATATAGAGCTAAAAAGAATTTTTGTCATGTTTTCAATGAAAAATTACCCCAACATAAGGAAATGACTGAGAGTTACTATGGATAGTGTAGTATGCTATCTTCAGCATACCACTATCTAGCTGACAGAAGTCTTCATGCTCGCCTTCATGTTTTCTCATTAAATGCTAAAAAAACAAACAGCTCCCACCTCAAAAATCTACCAGATGGAATAGCTGAAAAACAACTTAAAAAAAAAACTAGTCATTGTTCAATTGCTCATAGCAATACTATTTTATTTTACGTAAAATGACAGGTTTGAGCTGATGCCTGAAGCTTGGCTCATAAGCTTTTGCAGGAAATTGTTGTTGATTTCAGGCAGTGTCTTTGCAAGACAACTGATGTCAGGAAAGGAACACATTTTAATAGTCACCTGCAAATAACTGTCTCTTTAAAAACACACAAATAAATAAATAAAGGTGACCTTATATAGTCTTTCATTTTCATGTCATAGAGAAAACCTTGTTACAGTGACGTGCTGATGGAGAGAACAATTTTGGGAGTATAGGGAAGTTTCCCAAGGAGGAAAAAATTTAATGTGAAGAATGGCGCAGGAAATATTGTGAGGTGAAAGAGTATGAGGACTGAACTAGCCGTGCACTGTGTGCATCATAACAGCCAATTTTTAATTTCCTGTGTAGCATTTTATATTGTGGGATGATGGCAGGGAGGATGGGTTGTTGGTTTTTCTTTTGTTGTTGTTCCTCAGGCTTTTTATTAATGACCTGTAGGATCTGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTCCTGTTTAACTGCATCCCCTCTGTTGGTGAATTCATTGTGGGTAATGGCCTGTATACCCTTAGAGGTTTGAGATGTCTGATGGGGAGCAGGCAGGAAGGGCAGGGCAATGAGCAAGAGCTTGTACAAACTAATACCACCTTTGGGAGAACTGAAATGACAGCTCATTAGCTCCTCTTGCAGGGAAATTCAGCCAACCAAAGTAAGCTCTTCTGGAATGTTGTTTTTCCTTCTTCCTTATGTTTTCAAATATTTCAACAAGTTACACAAATGTTACTTCTCTTAGCATCCCTAGCACATTTTGTAGGTCTTTTTGTATCATTATGAGATAGGTAAATAATTTGCTTGGCCTTTTATTTTCCAGACAGCACCTGGGGTACATAAAAGATATTTCCGGAAAATAAAAAATCTCATTTCAGCATTTCAGAAGCCAGATCAAGGCATTGTAATACCTCTGCAGTATCTAGTTGAGAAGAAGTCCTCAGCTAGAAGTACACAAGGTACTACAGGTATGATTTCCTCTTAATTTTTGACAGGGTTTGGAAGCTCAGAGTTATGAGTCAACCTGTTCATAACCATATAATCAATTAGAAGTTATGTAAGAAAAATGCAGTGAGAAAGTAGATGTAGCCAGCAAGTCAAATGAGAGGTGACAATTTATGTGCTATAATTTTCATCTATTATTCTAATAACTTTTAATAAATCTCTGTAAAAACATCAAAAATTCTATAAGCCCATAACATTTTAACTGCTCTTGTCTGTCTCATCTTGTTCTTTCCTGTCCCTTTAATAGGTAGCTAAGTATGATTTCACTTCACTAATTCAGACACAAATAATGTGAAAGATGGTATAATTCAGAGAACACCTGGGCTGTCCTTTATCTTTGCTTAGTAAACTGTTTTTTCCTTCAGGGACATGAAAGCTAACGTTAGCCTGGCACACATGATTCTGATTTCTGAATTGGTGGTGCTTGAATTAATGACATTTTTCTGAAGCAAAGGAAATTAAATAGTGCACTTTATTGTTCCACTGGCACATATTGTTACATATCCTGAGCAAACCTATTTTAGTGTATGTGTCGTGCTAAAGACTGAATACCAGCCAATGTCTGTAGCTATCTGATACGTGACTGTTTACTCCTCTATTGAATGGGGTTTATCATTTGTTTGGAGTAAGAGGATAGGCCTTGATTGAAACAATAAATATTTATGATAAAAGAAAACGAGTCCCTTTTTGACAGGGACCTAGGCTCAGGCATAAACTGACAATTAGACTCAAGTGGTGAATTAAATTAATGAATAGTTAGCCTTTATAATACAAATGCAAATAGAGCTCTAATTTCCAAGTTGGCTAGTTGTTTTTTTCTGCCTAATATTCCATTCTTTATAACTCAGTTTTAAATAATAGTTGCTTGAGGTATATTACTGTGTTGTGTCATTGTGAGTTTTATGCAGTTGGAAATTTTATAAGTTTGAGTTAATCTGTAATTTTAATAGTTTGTAAGTTTATTTTTTCTTGATTTTTGTTATTTTTCTTTAGGGATAAGAGAAGATCCTGATGTCTGCCTGAAAGCCCCATGAAGAAAAATAAAACACCTTGTACTTTATTTTCTATAATTTAAATATATGCTAAGTCTTATATATTGTAGATAATACAGTTCGGTGAGCTACAAATGCATTTCTAAAGCCATTGTAGTCCTGTAATGGAAGCATCTAGCATGTCGTCAAAGCTGAAATGGACTTTTGTACATAGTGAGGAGCTTTGAAACGAGGATTGGGAAAAAGTAATTCCGTAGGTTATTTTCAGTTATTATATTTACAAATGGGAAACAAAAGGATAATGAATACTTTATAAAGGATTAATGTCAATTCTTGCCAAATATAAATAAAAATAATCCTCAGTTTTTGTGAAAAGCTCCATTTTTAGTGAAATATTATTTTATAGCTACTAATTTTAAAATGTCTTGCTTGATTGTATGGTGGGAAGTTGGCTGGTGTCCCTTGTCTTTGCCAAGTTCTCCACTAGCTATGGTGTCATAGGCTCTTTTGGGATTTTTGAAGCTGTATACTGTGTGCTAAAACAAGCACTAAACAAAGAGTGAAGGATTTATGTTTAATTCTGAAAGCAACCTTCTTGCCTAGTGTTCTGATATTGGACAGTAAAATCCACAGACCAACCTGGAGTTGAAAATCTTATAATTTAAAATATGCTCTAAACATGTTTATCGTATTTGATGCTACAGGATTTGAAATTGTATTACAAATCCAATGAAATGAGTTTTTCTTTTCATTTACCTCTGCCCCAGTTGTTTCTACTACATGGAAGACCTCATTTTGAAGGGAAATTTCAGCAGCTGCAGCTCATGAGTAACTGATTTGTAACAAGCCTCCTTTTAAAGTAACCCTACAAAACCACTGGAAAGTTTATGGTTGTATTATTTTTTAAAAAAATTCCAAGTGATTGAAACCTACACGAGATACAGAATTTTATGCGGCATTTTCTTCTCACATTT
Task1_train_31051
Gene OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) on Chromosome X is impacted by this variant. Evaluate whether it is clinically benign or pathogenic and name the disorder if relevant.
Pathogenic; Dent disease type 2
AGGCTTCACTAGAGAGCCCTGGACCTACTTTTCTTAGTGGGTCCTGCCTCGGAGAGCTGTCACTCAGACCATGCAGACTTCAGTGGAGAACCTGCAGGACTTCAGGACTCTGAGAGGCAGAAAACGTTCAGATTCTCTTCCCCTAAAGACCTGGCTAGCAGCCAGGCAAAATTTTGAAGCTTGTCCAGCAAATAAACTGCATGCTTCTCAGTCCATTAACTCCTTGGCTTCTAAATCCCATACGTAATATTTCCCAGTTTCATTCTTCATGTACAGAGTCCTCTTCTCCTACCTATTTTGTAATCCATTGTCTCTCTCAGGTGTTGATAGTAGTTGCCCTCAAAGGATTAGTTACAACTTTAAACCCCTTGTGAGATAGTGGTGAGTGAGCCCTTATCAATAATCTACCCATTTTTCTTCTCTCCATCCTTCTCTGTTTTTTTTATGCTAATCGCTACTTCTGTTCATACATTTTTTTGATCCTTAGGGTTGTCATTTGGTTGGGAGATTTGAATTATAGACTTTGCATGCCTGATGCCAATGAGGTGAAAAGTCTTATTAATAAGAAAGACCTTCAGAGACTCTTGAAATTCGACCAGGTAAGTAAAGTTTCATTTTATAGGAACTTTCCTAGATGGGAGATGAGATTGTTAGAGTTATGGGAGGTATATCTTACTCTAGGGAGTGATGGAAACGTCTTACTGTCTTGTGAAAACAGTGTGACTAGTGATGCATTGACTACATACAAGATTTGTAGTACTTTTATTAAGTGCTTGGATGGGAGGAGGGAAGATAACATTAGTGATAAAAAGTAAATACAACATTTATTCAAAACGTCTTTATCATTAAGAGATTTCAGAGATTTGTCTAAATGAGTTGGTGAATGGGTGGGGTTAATTGGGGAACACTTCCTGGAGGAAGTGGGCCTTCAGCTATGTTGATGTGGTTTGGCAGATGGAACAGTGAAAACTGTTCTATGATTACTTGGCAAGCTGAGGAACAGCTTGGAGGTAAAAGAGGGAGGCCCTGTGAGGGGAACTGGGAAGTACAGAAAAGAAGTTTGTCTGGGATCAACAGCATAGGCTATGGGCTCATGGGAACTAGATGATAAGTTGAAGCTAGCTGGTATTTAAAACCTGCAGGAAAAGCATTGAGTTGGTAACATTTACATAAAACCTGATATTCAAGAACCTGGTTTCCATATATTTGAAGCAGTAAATTTGCCTCAGAACCTGGCATGTGACTTGAATTTTTACTTCAACATATGGATACTGGCTGCTAAAAGTGAATGCTTCTTATTGAGGGAGGAAAATGTTTTGACTTCATTCGAATAATCTTTAAATCGTTATGAGAGCCTTTTCAACCTTCAGACGTAGCCAACATTCAGGTGATTTGCAGCAGAATGGTTTTTGTAGTGAGCCATTCTTGTCTATGTCTACCTTCACGTTGTGGTTGGCTGACAAATTTCTTTGCTTTTTCTTTATTCTGCCTCCAAAAGGGGTACATTTAGGATAAATTCTGAGTCTTATATAACTCTGGTAAAATATTTCAGTGAGGATCTTTCAAAACAATTTGAAACTATTCGCTGAATTTGGTTTGCAGAATTATTCATTCAACATTTGTGTGCTTTTTCTTTAAATTAAAATTGTGCTGGGTGGTTTCTGCCCAGCTCCAAGGAACTTACAATTATTCAGATTTCATTTTTCCATTTTACCCTCTGCCACTATTAGCAATAAAAGAATAGTGATGTGCTAATAACAAGCATCCTATCTGAGGGTGAGTTTAGATGCTGTGGGAATGCTGAGATTTAATTCATAAGGTATAGAAATTTCATTTATGTACTCTCACTACAGTTGTAAAGGTTGTGGAACTAGATACTTTGAAATAGGAACAGTGGCTTATCAACCTGATTATCTCTTATATTAAGATAGTGTTATCCTGCTTATTTGATGCTTCTTTCTATCTGTAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGGGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAG
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Task1_train_31052
A variant found in Chromosome X affects OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Dent disease type 2
CTTATTTGATGCTTCTTTCTATCTGTAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGGGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAA
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Task1_train_31053
Chromosome X houses a mutation in gene OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). Classify its clinical impact — is it pathogenic or benign, and what disease does it lead to if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
TTTCTATCTGTAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGGGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTT
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Task1_train_31054
This is a variant in OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Lowe syndrome
CTGTAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGGGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGT
CTGTAGCTAAATATTCAGCGCACACAGAAAAAAGCTTTTGTTGACTTCAATGAAGGGGAAATCAAGTTCATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCAAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGT
Task1_train_31055
Located on Chromosome X, this mutation impacts OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
CATCCCCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGT
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Task1_train_31056
This sequence variant lies in OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
CCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGTTGGAG
CCACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCAGAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGTTGGAG
Task1_train_31057
An alteration has been detected in OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) on Chromosome X. Is it pathogenic, and if so, what disease is involved?
Pathogenic; not provided
CACTTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGT
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Task1_train_31058
Located on Chromosome X, this mutation impacts OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
TTATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCA
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Task1_train_31059
This alteration occurs within gene OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) located on Chromosome X. Is it associated with a disease or is it a benign variant?
Pathogenic; Lowe syndrome
TATAAGTATGACTCTAAAACAGACCGGTGGGATTCCAGGTAAAGTAATAAGAACCTTCTCACAGAGAAGGTTAAGGCTTGATCTTATTTCTGACCCTCCATATTGGTAAGGGGCTAGGAATTTTTTAGGCCATGCCATAAGCAGATATATAAACCTAATGGCTCAGTGCCTCAGTGCTATTATAGAACAATAAGAGTGTTTCATTTATCTATACTCAAAGGTGAGCCTATCTTAGGGAAGTTATTACTTATATGTCAAGATTGTTGAAGTTTTATGGGCTACCTACAGTGCCTTATTTCTCTCACCTCAGCAAACTTGCTTAAATTTTTGCCTTCCTGATTTTGCCTTTGTTTCTTACCTATTACCTGTTCTGGCTATTTTTTTTCCCAAACTACCCAGCTATTTAATTCAGGATACCAGAAGGCAAAAACGAAGCCATGAAGGGTTCTTCTAGCACCAGTAGCTCTCAATCCTTAAAAGACTTTAGAATCCCTTAGAGAACTTCAAAAAATACTGATGCTTGGACCTAATATCTGCCACAGCTGGAGAACACTGAGAACCACTGTTTAGTAGACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCGCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTAGACCCTTTTGATTTCCTAATCATCCTAGTAAAGTGCCCCCAGTAAGTTCTTAGTGAGTATTTGTCCTCTACCTACTATCTCTTTCTTTTCTTTTCCTTTCCTTTTTTCTTTTTCTTTTCTTCTTTTTCTTTCTGTTTCTCCTAGCTGGCTGAGCACAGAAACTTGAAAGAGAAAGAATCCCCACGCATGTTCAGCTGTTTTGAACTCTGAGAGTACTGGCATGGGTGGGGAGTCGATATTCCTATGCTCCTAGGTAACTGGCCAGCAAATGAAGTGACACTGTTAGATCTTGTACACTTTGCCATGTTTGTTTCACTCACCTGACTTTAGAGTCAGCTGCAGAGCTACTGATGAGAAATATCTGTGTCACCTTCTGGATCAGGGTACAAGGTGTTGCTTCTTTTAATAGAATGATGAATAGGTTCTTTTTCCCTACCCTTGGTATTCTGTGGACTGACATTTGCTCAGACTTGCATGGTTTGATTTTATTTCGTCTCTATTAGAAGAAGCTAGACTTGTCCATAAATGTCTGGTTTAAAGGAGAAATCAATACTGTTATTCCTCTCCAAAAATTAAGCCCAGTCTAGGAAGAGAAGATTGGAGTTTTAGACTTGATTAGTTATCTATCTGTTGTGAAGTGTTGTTGATGCTCATAGAGTAAAGGAAAAGGAAGTGTTCAAAATATAATCCAAATCTTCTGAGGATATTTTAAGAACGTGCTATTTTCTCCTGTGGTGACATTGTTGAAGATGTACTCCCAATCTTAACAGAACCATTCATTCATTAGATAACTATTCGTTGAGCACCTACTTTGCACCAGATACCATGCTAGGTTCTAGGAGTTCAGTGGCAAACAAGCAAATACAGTCCCTTCACAGAGCTTGCAAAATAGTAGGGAGGATGACAGGGGTTGTTAGGGAAGGAGAAGTACACGGTTCTTTGGGAGCATGTAACAAGAGAGCCTAACCCTGATCTAAACCAGTGTGGTAGGTATTATGTTCTTGTGTGATATGTTCTCTTTATAACTCGTTTCTTTACTTACAGTGGGAAATGCCGGGTTCCAGCCTGGTGTGACCGAATTCTTTGGAGAGGAACAAATGTTAATCAGCTTAATTATCGGAGTCACATGGAACTGAAAACCAGCGACCACAAGCCTGTTAGCGCCCTCTTCCATATTGGGGTAAACACTTGTTTGTACATTCATTTATTTGTGTGTTAAGTATCAATTACTAGAGGATTATTTAGACTCAGAACAGATCAGTAATTCAGCAAGCCATAAATGTTCCATAACCAAATAACCATTTGCAGCATTGAGAGGTTAGTGCCCCCAACCCTCCCAAATGCTGTCCGTATAGCTCTTAATGCTCCAGGCCTTTTAGTGACACAGATGTTTCTCATGCTACATAGTGGTTAGGTGGTAACTTGAGCTTCCTAAAGTAGGTATGCATAATGAAGAGTTAAAAGCTAAGTTTTATCAGATAGTAAAGAAGGGAAACACCAGGAGGGAGATTCTGGGTGGAAGGGTAGAGACAGCAGGAGCAAAGGCACAGACTGATCAGAATACAGCCAACTCTGTATATTGTCTTAAGGGATATAGTGTCATCCCTACACTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCCCTATCCTCCGGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCTCTTCCCGGGTTCAAGCGATGCCCCTGCCTCAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCGAATTTTTTTTTAACTCTGTTCTATCCTGGGCTGCATTAATGGCCAGTTATTTAATTTTCTGTCTGTATTGTGAGTAAAGTTTTTTTCCCATTGTATTTTTAAACTGTGTGTTATTGGTATGTAGGTCATATCTTGTAATCATGCTGATTTAATTTGTTACAGCCAGTACATTTAGGTTATTTCTTGTGGATTTTTCAGATCTACAGCCCTATAATCTGTCAGAATGTATATAGTGCAGTGCTTAGTAGAATGGACTTTGTAGTAGACTTCTGGGATTTGCATCCGAGTTCAACCACTTTCTAACTGTGTAACCATGGACAATTTATGTAACATATTTATGCCTCAGTTTCCTCCTCTATTAAGCGTGGGTAATATTGGTACATACTCATGAAGATTAATGAGTTCGGACATGTGAAGAGCATAATGGGATAGGTTTCTTTCCTCTGTGTGTGTGTTGATTTAGGGGGCTTCTGAGATAGATATCACCAACCTGTTTTATCCTGCTCCTGTTTTAAGGAAGAAAGACTTTGGGGCTTTTCATTTAAGATCAGAATTATTTATTGGTCTTAGAATAGATTTTAAATTTTATCAAGACAATCATGACTTTACTTTTGTCCATTTTGAAATTTTAAAATAATAATCATTAATAATAGTAACTGTTCCTCAGATAGCAGCTAGTGGCTGTGTGGCAGGGACTATGTGAGGCAATTTGCACACATCTCATTTACTCCTCACAACAACGCTTTGAGTTAAATACAGTTGATCCTTCAACAACATGGGTTTGAACTACACAGATCCACTTATATCCAGATATTTTCAACCAAATGCAGATGGAAAATACAGTATTCACAGGATGTGAAACCCACGTATAAGGAGGGCCAACTGTGGGACTTGAGTATGCGTGAATTTGATTATACACAGGCCATGCCAGAATCAATCCCCCACAGATCTCAAGGGACAACTGTATTTCCCATTTAACAGATGAGCAGATGGAGAACAGCAAGTTGAAATAACTTATTTAAGAGCATTCAACTAGGAGGAGAGCTGAGATTCCAATCTTAAGTTGGCTTAACTCCCAACTCTGTGCTCTTTCTACTACCCCACAATACCTCTATAATTCTATAGAACTTGATGAAATATACCTTTAGATAACTTCTTTTAGCCCATCTAATTTCTAGTTTGTACTTGCAGGCTGCCCCTTTTTCTTCATTTGAATTCTCTTAATCCATTTTGAGAGGGTATCTTTCCTCAAACACTAACCTCTTTGGTTAGATCAGGTATGCCTGGCTTTTTTGTTTACATTTCTTTTCAAAACCTTCAGATTTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGTTGGAGTGCAG
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Task1_train_31060
A genomic change on Chromosome X affects OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). Classify this variant as benign or pathogenic, and name the disease if relevant.
Pathogenic; Dent disease type 2
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Task1_train_31061
Located on Chromosome X, this mutation impacts OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase). What is its biological consequence — is it benign or pathogenic, and which disease is associated if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
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Task1_train_31062
Assess the clinical impact of this variant on gene OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase), found on Chromosome X. State whether it’s pathogenic or benign, and the disease if applicable.
Pathogenic; Lowe syndrome
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Task1_train_31063
This genomic variant is located on Chromosome X, within the OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Dent disease type 2
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Task1_train_31064
A genetic alteration is present in OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Lowe syndrome
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Task1_train_31065
This sequence variant lies in OCRL (OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase) on Chromosome X. Is it clinically significant, and what condition might it cause if any?
Pathogenic; Lowe syndrome
CTGGTTTCCTGCTCTAGCCATCTAGTCCCCTGCCTTATTAGGTACAGGCTAAAACCTTTGAAAAGATCATTTTCCTATTTGAAATAACATTTCACATGGATTAGAGAAATGCTAAAGGAAAAATGTGTTATTTTCACACCTCCATTTGTAATTATTAACACACATACCACCCTTCCCTTTTGCTTCCTGCTGCTCTTCTGATCCTTGGGTAATCATCATAACCTCAGGAGTGATTATCTTGCCTGTCCCTTCATTCTGACTTCTTTGGTAGGAGGACCTGTTCCAGACCCCTGGAATGCAGGAAGAGCTCCAGCAGATCATTGATTGTCTGGATACCAGCATTCCTGAGACAATCCGTATCCTTTGCGACCAAAGCTTAAGAAGCTGGATGAGTACTTGATCAAACTCTTCTTCGCACCTATATTTGATTTTTGTGGTTCTATATTTATTTTCTTTGTAATATCTTTTATTATAAGATAACCACTGACTATCCACTTGTTTCTCATTTCCTTTCAGGAACTTTTGACCTCTTTCCATATCCAGCTCTTACTAAAAGGAAGCAAGGGGTAGATAACAATGACTTAAAAGCATGGGACATAGAAGCCACAGCACTGGTACTATTCTCCTTCAGGTGATCAGTCACTCCTGCCACCACACGTACTGTTGACAGGGCAGGGAGAAGGATGGGAAACATGGGCACCTGGTTTATAGGACTGCTCCAGTGTCAACTGTCACTCTGCAGGCTATATTCCCCTGACCCTGAAGCTGGGCCAAAGCTGCCAAGAGTCTTTGACCAATTCTGTAACAACTCACCTGCAGGGCACTTGAATCAATAAAATATCAAACCCCCATTAGGATCAATGTGCCCTGAATAAGAGGAGGGAAACAGTCCCTGTAGGAGCTTGAGGAAAGGAGCTCGTCGGGGCTCTGTGTGGCCTTTCTCCTGGAGCTCCTTTCCCTTGACTTAAGTTGATTCAGCTGGCAGCAACCACTCTGTGGCTGAAGCACTGCTCATTTTCTTGGAAGCCCTGCCAGAGCCAGTCATCTGTTACGAGCTGTATCAGCGATGTCTTGACTCTGCTTATGATCCCCGGATCTGCCGACAGGTGGGTTCTACTGACCTGGGGATGTGTTTGACGCAGATTGCCCCATAGAGAAGTCGTCAGTTTTACAGAGCCAGATAGGCAGCCAGCTGTCTGGTAGGATGGGTCTGCATCTGTTATTAATGGCAGGACACCAACATTGAGAGTTGCTACCCTTAAATTTTAGGTTGTGTTGTTTCCTACGATATTTGCCACCTTTTTCCCATTGGCCTATTTCTGTTTACAGAAAACATAGTGGGGTGGATCCCTCTACTCTGGGGTAAATTGGTGAAGCTGATTGTACGTGGAATTCTGGCTGACATTACCAGGAAGGATGGGTGACACTTGGGAGCCTTTCTTCTTTTTCTCTTCTTGGTGTGTGTTTTTAATCCTGAAATGATTTTAATGCACAGTAGCTGACAGTACCTGTGAATTGGACTAGTGAGTATTGAGAGGAGTCCCCATCCATGCTAAGTGACATTGTAAAGAAAACCATTCAAACAAAAAAGAACAGAAAACCATTCAGCTTGGTAGGTGCCGTGGCTACATGCCTACGGAAATGGGAAAAGAACAGATGAACACTGACCTATTGTGAGGCAGGGTGTGCGTATGAATGTGTGATGACCACGTGGCCTGGTCATTGAGTGGACAGGGACCAAACAGCACGGCCACTCTTACTTTGAAGTTATAATTTGGAAGGTATTGTGTTGGCCATGAGGAGATAATAGAAGTTAGACAGATGAAATGGGTCCTGCAAGGGTTGGATTATAGACTACTATTACAGCAGCTGTAAGTTCCTCTTACTTTCATCTTCCACCTGTTTTTCTCACTGCCTGCCCCTATTTTTAAAAACAGGTGATCTCCCAGCTTCCGAGATGCCATAGAAATGTTTTCCGTTACTTGATGGCATTCCTTCGAGAACTCTTAAAATTCTCTGAATACAATAGCGTCAATGCCAACATGATCGGTAAGAGTGCTTCATGCAACACGGGGCGTTTGTTGAGAATACTCTTAGTGCATTGTATCCAGTATATACCTTACTGCATATGCAGGCACATGGCAGTCAATAGTCCTTGTCCCCAGGCCCTCCAGCCCTGAGGTTTTGCTTAGGTTATGTCTGACAGAAGTTTCCGCTTGTCTTTCTCTCGTCTTGTAGCTACTCTCTTCACTAGTCTTCTCCTGAGGCCTCCACCCAACCTTATGGCAAGACAGACTCCAAGTGACCGCCAGCGTGCTATTCAGTTCCTTCTGGGCTTTCTGCTTGGGAGCGAAGAAGACTAAGGCTTTTACTGTTCTCTGATATTCTAGAAGCAGACGATCTCGGGCTCCAAGTATTTCAGAATGATTTAAAAAGTCATGCCACAGGAAGGGTCTATTGCAGAATTTCAAGTTCTGTTTATAGTAAAAAGGAAGAGCGTTTCCTAATCCCTCCTTTACCATATCCTACACAGAAAAATACTTTTAGACTTATATTGCCAAGCCAAAGTTACCATATTTTGGTGTTTTTGTGTTTTCTCTTTATAAGGCAAAAAGATCTGTATTTACACTCCTTCACCTAGGGATGTGTTTGTTGCCCTCCTACCCAATTGTCATGATTGTCCTTAGTACCCTAGGCCTAGATTCTGAGATCTTCCCATTCTAGGCCTACAAGCACTACTTGCTGTAGCTGAGACTTGTCTAGAGTCCTTTGTTTTGCACTTTTGACCCACCCCTTCCTGGATCACTCCTTTGCACTCCACTCCCCTCGTTCTGTCACTTTGAACGAAGTCTGAGTGAGGCTAGTGACTCCTTGGGTGTCCTCAACAGTGAATTCACTGTCTGCGTGCAGTTATTACATGCATTTGTGCATTTCTACTACAATGGCATCTTTATGTCTCTGTAACATTGGCCTTTTCATGGCTCCACACTGGGTGGAACCATATTCTCTTAGATCACATTTAGTAGCATAACTGTAGGGACTATTAGAGATGGCATCTCATCGATGAGAGAGAATCACAATCAGAATGGAAGCACTTTGAGTATCTGAAGAGTGAGAGCATTCATGTTTGACAGGTCCTGCTTCCCACTATCCTTTTCCTGTTATTATTCAAATTTTACACAAGGACTAATCCTGGGTGTCTCTGAGACCCATCTCCTGCCTAGACATCCACCTCCAGAGCAACACTGGCCCCACAGTAAAAGAGGAAGTCTTGTACCTCAGGCAGGCCCATCTAGAGCTATTGCTCCTTCCCACAGCAAAGGTATTGTGGATGACCCTTAGAATCCATTCTCTGGTCTTCTGAAATACCAAGGGCAGATGTCACCTCCTTCCTCAGCAGGACTGACTCTGGGCTCTACAACCAGCTCCTTCACATAAAGGGTTTAGAGACTCCCCTTGGCTCCCAGTCACCATATCCAGTGTTGTGTAAAGAGACTGGCCAACAGGACCAACCAAGCACCTTACCTCTCCCATACAAGATGACCCTCTGAGCTTTTCATTTATTCAAGCTCTGTGGTACAGCCTTTTTTTAAAATAAATTAATCTATATTGGTTGACAAACAAGCCACCAACCACTGACTGCAAAACTGCCTGATGCAGTTGGGTTCCTCCTGGTTTTCTTTTGTTACAACCACCCTTGCCTGTTTACATTAATTGCAAGGAGCATAACGTACAGGCTGTATGTACAATCCTGGGCATTGACTCTGTGACATTTCTAGCATATCCAAGGCACCACCAGTGATTTCTCCTGTTTCTTGGTGGGGGTGGGGGGGAAGGTACGTATTCTGCAATATGGCTAAACCCTTTCCTGATTGAGAGTTAAAGCAATAGGAGTCAAGTTACTGGTGCCACAGATCTGGAGGTATGATAGGTCAGGGGCTAGGTGTTGAACTTAGTTAATGGAAGACTGAGAGCAGAACAGGTTTGTCATCTCCGCAAGGCCAGAAAGTGATCACAAAAAGAGGCAGATGATAGACACTGGGGTAGGGTCATACCACAGGGAAATACCTTTCCTGGGCTTGTTTTCTAGCATATC
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Task1_train_31066
This variant lies on Chromosome X and affects the gene SASH3 (SAM and SH3 domain containing 3). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Immunodeficiency 102
TTCTTGCCCCTCAAGTCCACTCCAAGTTTCCTGCTTTCTCTGCCTCCACAGACACTTCCCTGCCCCCGACTGAAAATCATTCAAAATGCCCACTACTCTGTACTTCCCAGGGAGAAGGAGCCCAACTGAGTTTCTATGTGACATTGTAACTACACATTGAGTTAAGCAGGGAAAGTCAAATATGAATGCAGGGCATAGCTTCCTGGGTGGAGGGAGCGTTGGAGTGGGTATCAGGGAACATGGAGTCTAATGGACTGACTCAGTGCTGCCAGTTATAAAATGAGAAGCCTTGAGCAGTTCACTTGGTCTGTGTGACCTCAGATTTCCGCATCTGTTCATTGGAGTGTTGGCCCAGTTGTTCTCTAGAGGCCCTCCTAATTTGCCCATTCTTTGGTCAGTGAGCCATTTCTCCTCCCATTGCCAACTCTTTTCATGTCCAAGGGCCCAGAGGTGAAGCCGTGCTCCTGGTCGGTAGCCAAGGGGGTGGTTCAGAATCCCTTCTGCAGTGTAAAGCTTGCCAGAGCCCAGCTGCCTTCCCGGTGTATACCCTTGGGATTTCTAGGCAGGTCCCCTGGAAGGCACCTGCTAGGCACTGTCTCAGCTGTTCTAGGACAAAGGTGAGCCTCCTCCCTGCCCCATCTCCTGCAGGCAGTGAGCTCTGCAGCCCCAGCCCAGGTTCTGGCAGCTTCGGGGAGGAACCACCTGCCCCCCAGTACACAGGGCCTTTCTGTGGCCGGGCACGAGTCCACACCGACTTCACTCCCAGCCCCTATGACCACGACTCGCTGAAACTGCAGGTAAGATCAGCATCCGGGCTTCTCTGGAGCCTGGCAGGCTGTGCCCAAAAAGGAAGCTGGACTGAACCAGGCTATGACAGTGTCAGTGGAGGCCAAGGCCCCCCATATCCTCTCTCCCTTGCTCCCTTCTCCTCTCCTCTCCCCCAACAGAAAGGAGATGTGATCCAGATCATTGAAAAGCCACCTGTGGGCACGTGGCTGGGCCTACTCAATGGCAAGGTGGGCTCTTTCAAATTCATCTATGTGGATGTGCTGCCCGAGGAGGCCGTGGGGCATGCCCGCCCCAGCCGCCGACAGAGCAAGGGCAAGAGGCCCAAGCCTAAGACCCTGCATGAGCTGCTGGAGCGCATCGGCCTGGAGGTTTGAGCTTGGTCCTCACTAGTATCTAGTATCAGGGAGGCACAACTGCCCCAGGGATGGGGACCAGGAAATGACAGCTATGCGTAGTTGGGGAGGACCTAGGCAGGGGTGGCTGGTAAGCAGCTGTGCCGATGGCCTGCCTCTGCCTACAGGAGCACACATCCACCCTCCTGCTCAATGGCTACCAGACACTGGAAGACTTCAAAGAGCTGCGAGAAACACACCTCAATGAGCTGAACATCATGGATCCACAGCACCGGGCCAAGCTGCTCACGGCCGCCGAGCTGCTGCTGGACTATGACAGTGAGTGGCTTTAGGAGCGGCCTGGTGAGGGTGTGTGCCCACCGGCATTCCAGGGAGGGGAGGCTTGCCCTGGCCTTGCCTTCTGTCCACGCTCTGCCCTAGGACTGCTCTGCAGTGGAAAGGTACTTTCCACTTGAATTAGAATTTCAGGGAAAGTGTACGGGAGAAAGGAGTTGTAGGGATGATTGGGCCCAACCTCCTTTGGATCAAAGGGGACCCTTAAGGCCAAAGAAGGCAAAGCCTTACTTGAGGCCTCAAAGCTGAGTAATAACAGAGCCAGGATTCAAGCCCACTGCCTGGCTCCAGCTTAGTGCTAAAGAAGTGTGAGCTCCTGGACTGCAGAGCTGGCCTGGAAACAACTCCTACCAGCTTCTAAGCTGGAAGCAGTGAGGAGAGGGGCAGGGCGGTGGCAGGTGCCCAGAAGGAGAGACTGCCTATGGTGTATTTCCCAAGGTCCCTACCTCCACCCCCATATTCTGTCTCCCTCTCTCGTCCCTGGCAGCTGGCAGTGAGGAGGCTGAAGAGGGCGCCGAGAGCAGCCAGGAGCCAGTGGCACACACAGTGTCGGAACCCAAGGTGGACATCCCGCGCGACTCAGGCTGCTTTGAGGGCTCGGAGAGCGGGCGCGATGACGCAGAGCTGGCAGGCACTGAGGAGCAGCTGCAAGGCCTCTCCCTGGCCGGGGCACCTTGAGGTGGCGGTGGCAATAGGCCAAGGCTGGGACCCAGCTGCAAAGGCTGTAGGAGTGGGCCCAGCCTCCCGTGGTGGCCCAGGTCCTGAGGACTGGCACTGAGCCTGGCCCTGCTTCCCCAGGGACACTTAGGGCCACAGAGGCCAGGCCAGGGCCCTACAGGTTCCAGGCTCAGCTGGAGTGGTTGGGGAGTCGCCCAAGGGCACATCCCACCTGCCTGAGCCCCGCCCTCCACCAGCGACTGACAGCGCAGCCCCTCCTGGCACCAACTGCTCCCCTGCCATGGCCACGGCCACAGCAAGTGGGGCACTGGGAAACCCTGCCCATGTCCCTCACCAACAAGGCCTCCAAATCCTCCTCACCCCCACACCACCTACCCCTGTCGCACTGCTCCTGAAAAGGGGGCCAAGTCAATGTTTCAGGTCAGTCTAAAAACCCTAGGGAAGCTGGCCATTTAAAAGAACCCAAACTGACCATGGGTAAATCCAGTTCCCCTAAATAAGGCCTGAAGAAATCCACAGGTACCATTCCCACTTTCCTTCTCCCTAGCTTTCTTAGAGGTTTGGCCACTAAATCTTATGAGACTTGAACCAAGTGGCTTCCTCTTTCTAGGCTTAGGACGGGTTGGGGTTAGAAAGGGTGATCACTGAAGGCCTTGCCTGCTCTGACATTCTGTGACATTAAATGTCTATTCTCCTGTTACCTGTGGCCTGGGACACCAGTGGGGTTTATCGAGGGGACCAGAGGGGCCTCAGGCTTTCAGATGAAATGGCTCCTCCTACTCACCCACTTTATTCCTCTCCATGTAATTCAGGACAAGCTGCAACTTCCCCCAGCTTAACACAATGCCCATACCTCATACGATATGCGCCCTCCCGTTCCATCCCTGGCCCCCTCAAACGAGACTTCTCACAAGGCTGATTACAGATGGTCAAACCTGGCTTCCAAGGACAGAATTGCCTCTCGGAAGCCAGCTGTGGATCTGAGTCCAGAGTTGGCCACTTGTGTGGGTCCTCACAAGCAAAGAGAGCACTAAACTTGACATTGGGGGTCCACCACTCCAACTTTGCTTTCTGAAGGTTTTGGTGTACATTGAGCCCCAGAAGGAAAGGAGAGTATCTGTGAGTGGGGGCCTCCCTTGACCCCAGTACGAAGTCTATGCCCTGAATCCCCAGAGTAGCCCTTCCTGGTGCCCAACTGGCCTGGGGACAAACAGCGTCCACTACATCTAGGACTGCCGGCTAAGTGGACACACTTCTTGACCTCCTACCAGGAACTTTGGTAAAAGCTAGCTTTGGGGAAGGGGTTGGGTGTAAATATGAGAGGGTGGAGGGAGACCAGCTGGTAGCAATAAACATGGGTAGAACTAAATTACCGTCTCCAGTTATCTTTTCTATGGAGAGAGTGTTGTGGGGAGGGGCAGACCGGTCTCCTTCAAAGCTGGCCTCAGCAAAGTGTCCCTCACTGTCCTTTCAGGTCCATCTTTCCCTTCCCTTAAATGTTCAGTGCCCTTGACTCTGCTGACCTAAAGCTCCAGTCTGAAGCCCTAGCTGGCTCTGCCCTCCCCTCTAACCAGCCCTCCTCAGAACAAGGCTCAAGCTCCCATGACCACGGGCTTTGCTGGGGTCCAAGAGGTGTAGGGGGGAATGGCTATTTCCCTCATCCAATAACTGTTCATTTTAACAGGGCCCTTAAAGACCTTCACCCGTGTGAAGAAAGGCCTGCACTGAGGAGCTGTCCAGGATCTAAGAGGGGGAGATTTGGGGTCAGCATGGCCTTTCCTCTGAAGTCACCTTTTCCTGGCCCCCACCCTGTACCCACTAAAGCAGTGCCATCTCCTGGGAGGTAGGATGGAGATGAAGACCTCTAGCTTCCTTTCTGTTTCTGCCAGAATTAACTGCATTGGGCATTGGGAAGGGGGTTACTGGAGAGAGAGCTGCCACCA
TTCTTGCCCCTCAAGTCCACTCCAAGTTTCCTGCTTTCTCTGCCTCCACAGACACTTCCCTGCCCCCGACTGAAAATCATTCAAAATGCCCACTACTCTGTACTTCCCAGGGAGAAGGAGCCCAACTGAGTTTCTATGTGACATTGTAACTACACATTGAGTTAAGCAGGGAAAGTCAAATATGAATGCAGGGCATAGCTTCCTGGGTGGAGGGAGCGTTGGAGTGGGTATCAGGGAACATGGAGTCTAATGGACTGACTCAGTGCTGCCAGTTATAAAATGAGAAGCCTTGAGCAGTTCACTTGGTCTGTGTGACCTCAGATTTCCGCATCTGTTCATTGGAGTGTTGGCCCAGTTGTTCTCTAGAGGCCCTCCTAATTTGCCCATTCTTTGGTCAGTGAGCCATTTCTCCTCCCATTGCCAACTCTTTTCATGTCCAAGGGCCCAGAGGTGAAGCCGTGCTCCTGGTCGGTAGCCAAGGGGGTGGTTCAGAATCCCTTCTGCAGTGTAAAGCTTGCCAGAGCCCAGCTGCCTTCCCGGTGTATACCCTTGGGATTTCTAGGCAGGTCCCCTGGAAGGCACCTGCTAGGCACTGTCTCAGCTGTTCTAGGACAAAGGTGAGCCTCCTCCCTGCCCCATCTCCTGCAGGCAGTGAGCTCTGCAGCCCCAGCCCAGGTTCTGGCAGCTTCGGGGAGGAACCACCTGCCCCCCAGTACACAGGGCCTTTCTGTGGCCGGGCACGAGTCCACACCGACTTCACTCCCAGCCCCTATGACCACGACTCGCTGAAACTGCAGGTAAGATCAGCATCCGGGCTTCTCTGGAGCCTGGCAGGCTGTGCCCAAAAAGGAAGCTGGACTGAACCAGGCTATGACAGTGTCAGTGGAGGCCAAGGCCCCCCATATCCTCTCTCCCTTGCTCCCTTCTCCTCTCCTCTCCCCCAACAGAAAGGAGATGTGATCCAGATCATTGAAAAGCCACCTGTGGGCACGTGGCTGGGCCTACTCAATGGCAAGGTGGGCTCTTTCAAATTCATCTATGTGGATGTGCTGCCCGAGGAGGCCGTGGGGCATGCCCGCCCCAGCCGCCGACAGAGCAAGGGCAAGAGGCCCAAGCCTAAGACCCTGCATGAGCTGCTGGAGCGCATCGGCCTGGAGGTTTGAGCTTGGTCCTCACTAGTATCTAGTATCAGGGAGGCACAACTGCCCCAGGGATGGGGACCAGGAAATGACAGCTATGCGTAGTTGGGGAGGACCTAGGCAGGGGTGGCTGGTAAGCAGCTGTGCCGATGGCCTGCCTCTGCCTACAGGAGCACACATCCACCCTCCTGCTCAATGGCTACCAGACACTGGAAGACTTCAAAGAGCTGCGAGAAACACACCTCAATGAGCTGAACATCATGGATCCACAGCACCGGGCCAAGCTGCTCACGGCCGCCGAGCTGCTGCTGGACTATGACAGTGAGTGGCTTTAGGAGCGGCCTGGTGAGGGTGTGTGCCCACCGGCATTCCAGGGAGGGGAGGCTTGCCCTGGCCTTGCCTTCTGTCCACGCTCTGCCCTAGGACTGCTCTGCAGTGGAAAGGTACTTTCCACTTGAATTAGAATTTCAGGGAAAGTGTACGGGAGAAAGGAGTTGTAGGGATGATTGGGCCCAACCTCCTTTGGATCAAAGGGGACCCTTAAGGCCAAAGAAGGCAAAGCCTTACTTGAGGCCTCAAAGCTGAGTAATAACAGAGCCAGGATTCAAGCCCACTGCCTGGCTCCAGCTTAGTGCTAAAGAAGTGTGAGCTCCTGGACTGCAGAGCTGGCCTGGAAACAACTCCTACCAGCTTCTAAGCTGGAAGCAGTGAGGAGAGGGGCAGGGCGGTGGCAGGTGCCCAGAAGGAGAGACTGCCTATGGTGTATTTCCCAAGGTCCCTACCTCCACCCCCATATTCTGTCTCCCTCTCTCGTCCCTGGCAGCTGGCAGTGAGGAGGCTGAAGAGGGCGCCGAGAGCAGCCAGGAGCCAGTGGCACACACAGTGTCGGAACCCAAGGTGGACATCCCGTGCGACTCAGGCTGCTTTGAGGGCTCGGAGAGCGGGCGCGATGACGCAGAGCTGGCAGGCACTGAGGAGCAGCTGCAAGGCCTCTCCCTGGCCGGGGCACCTTGAGGTGGCGGTGGCAATAGGCCAAGGCTGGGACCCAGCTGCAAAGGCTGTAGGAGTGGGCCCAGCCTCCCGTGGTGGCCCAGGTCCTGAGGACTGGCACTGAGCCTGGCCCTGCTTCCCCAGGGACACTTAGGGCCACAGAGGCCAGGCCAGGGCCCTACAGGTTCCAGGCTCAGCTGGAGTGGTTGGGGAGTCGCCCAAGGGCACATCCCACCTGCCTGAGCCCCGCCCTCCACCAGCGACTGACAGCGCAGCCCCTCCTGGCACCAACTGCTCCCCTGCCATGGCCACGGCCACAGCAAGTGGGGCACTGGGAAACCCTGCCCATGTCCCTCACCAACAAGGCCTCCAAATCCTCCTCACCCCCACACCACCTACCCCTGTCGCACTGCTCCTGAAAAGGGGGCCAAGTCAATGTTTCAGGTCAGTCTAAAAACCCTAGGGAAGCTGGCCATTTAAAAGAACCCAAACTGACCATGGGTAAATCCAGTTCCCCTAAATAAGGCCTGAAGAAATCCACAGGTACCATTCCCACTTTCCTTCTCCCTAGCTTTCTTAGAGGTTTGGCCACTAAATCTTATGAGACTTGAACCAAGTGGCTTCCTCTTTCTAGGCTTAGGACGGGTTGGGGTTAGAAAGGGTGATCACTGAAGGCCTTGCCTGCTCTGACATTCTGTGACATTAAATGTCTATTCTCCTGTTACCTGTGGCCTGGGACACCAGTGGGGTTTATCGAGGGGACCAGAGGGGCCTCAGGCTTTCAGATGAAATGGCTCCTCCTACTCACCCACTTTATTCCTCTCCATGTAATTCAGGACAAGCTGCAACTTCCCCCAGCTTAACACAATGCCCATACCTCATACGATATGCGCCCTCCCGTTCCATCCCTGGCCCCCTCAAACGAGACTTCTCACAAGGCTGATTACAGATGGTCAAACCTGGCTTCCAAGGACAGAATTGCCTCTCGGAAGCCAGCTGTGGATCTGAGTCCAGAGTTGGCCACTTGTGTGGGTCCTCACAAGCAAAGAGAGCACTAAACTTGACATTGGGGGTCCACCACTCCAACTTTGCTTTCTGAAGGTTTTGGTGTACATTGAGCCCCAGAAGGAAAGGAGAGTATCTGTGAGTGGGGGCCTCCCTTGACCCCAGTACGAAGTCTATGCCCTGAATCCCCAGAGTAGCCCTTCCTGGTGCCCAACTGGCCTGGGGACAAACAGCGTCCACTACATCTAGGACTGCCGGCTAAGTGGACACACTTCTTGACCTCCTACCAGGAACTTTGGTAAAAGCTAGCTTTGGGGAAGGGGTTGGGTGTAAATATGAGAGGGTGGAGGGAGACCAGCTGGTAGCAATAAACATGGGTAGAACTAAATTACCGTCTCCAGTTATCTTTTCTATGGAGAGAGTGTTGTGGGGAGGGGCAGACCGGTCTCCTTCAAAGCTGGCCTCAGCAAAGTGTCCCTCACTGTCCTTTCAGGTCCATCTTTCCCTTCCCTTAAATGTTCAGTGCCCTTGACTCTGCTGACCTAAAGCTCCAGTCTGAAGCCCTAGCTGGCTCTGCCCTCCCCTCTAACCAGCCCTCCTCAGAACAAGGCTCAAGCTCCCATGACCACGGGCTTTGCTGGGGTCCAAGAGGTGTAGGGGGGAATGGCTATTTCCCTCATCCAATAACTGTTCATTTTAACAGGGCCCTTAAAGACCTTCACCCGTGTGAAGAAAGGCCTGCACTGAGGAGCTGTCCAGGATCTAAGAGGGGGAGATTTGGGGTCAGCATGGCCTTTCCTCTGAAGTCACCTTTTCCTGGCCCCCACCCTGTACCCACTAAAGCAGTGCCATCTCCTGGGAGGTAGGATGGAGATGAAGACCTCTAGCTTCCTTTCTGTTTCTGCCAGAATTAACTGCATTGGGCATTGGGAAGGGGGTTACTGGAGAGAGAGCTGCCACCA
Task1_train_31067
A variant found in Chromosome X affects ZDHHC9 (zDHHC palmitoyltransferase 9). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Syndromic X-linked intellectual disability Raymond type
TCTCAGCACTTTGGGAGGCCTAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCCAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACTCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTGTGCACCTGTAATACCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACACAGTGAGACTCCATCTCAAAAAATAAATAAATAAAATGGGCTTTGACAATAGATGCTGATGAGGCTGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGAGTGTAAATTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGTGGCGATTCCTCAAGGATCCAGTACCAGAAATACCATTTGACCCAGCAATCCCATTACTGGGTATATACCCAAAGCATTATAAATCATTCTACCATAAAGACACATGCACACATATGTTTATTGCAGCACTATTTACAATACCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGCTCACCAATGATAGACCGGATAAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCACCCATAAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAGCTGGAAGCCATCATTCTCAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTCATAAGTGGGAGTTGAACAATGAGAACACATGGACACAGGGAGGGGAACAACACATACTGGGGTCTGTCGGGGGGTGGGGTGAGGAGGGAGGGCATTAGGACAAATACCTAATGCATGCAGGGCTTAAAACGTAGATGACAGGTTGATAGGTGCAGCAAACCACCATGGCACATGTATACCTATGTAACAAACCTGCACATTCTGCACACGTATCCCAGAACTTAAAGTAAAATAAAAAATAATAATAATAATAAAATGGGTTTTGATTTATAAAAATCTTATATACATATAGTAGCTTTTTAGTATACACGCTGCCGAAGAGAGCACCATATAGCTTTTACCATATAAAGCAATATATATCTCCCAACCTTTGCCTAAAGAAATGGCTAGTAAGAGGAAAGCAATGCCCTCAGGATGCCACATGGTATACAGAAAAAACATTATCCAATCATGGGAACTCAAGAAAAAGTAATTTTAAAAAGAACATTAGAAGTATGCCTAGTGATGATATAAGCAATTTCACATATAGGCCTATCAACAGGAATCTTTATGGCCCATTTCTCATCTTGGCCAGGGTTTAGCACACAGTAGGCAGTGATTACAACAAAGCCACATATATGTGGATGGAAGTACAGACCACTGTATTAGACACACATATACCTGACCCTCTTGCAGCAGCAGCAAAGAGAAGAAATAAGCAGTTTGGAATCAGACCTGCTCTAGCTTAATCTCATACTAATTATGTGAACTTACATACTGGTGCTTCACCTATTTCCTCATCCGTAAAATGGGGATAATACCAATCTCATGGGGCTGTTACAAGTCTTAAATGAGAGAAAGGTAAATCACTTAGCACAGTGCCCAATATGTAGTAGAAACTCAATAAATGCTAGCAACTTTCCTCTTCTTGGGTTGCGTCTTAGACAGACCTTCCTTCCTCAATGCTGCCCTCCAGTGGACTAGGTGTCTCCTCCCACTATGTAAGGTGGGTCCCACATGAAAATCCAGTACAGGAAAATCTAAATTTCAAAAATAGGTAAAGTTTATTTTTCTCATTTACTAAAGAGGTTTTTGTAAAGTTTAGGCTAGAGGATATTTAAATTTTGATTTGATCTACACAAGTACAGCTGATTTGCAGTTTTTCAGGAGCTTGTTGCCTATCTAAATTTCCCTATCTAAATCTAGTTCATTTCTCATCTAAATCTATCTTCCCTCCTCCCAAAATTGGTGACCACCCTGACTTTCTAGTTCAACTCAGCCTTTTCCCTAGGCAATGTCCCTGTAGTTTTACTCACCCACACAGTTGTCACAGATGCTGCAATGGGAGGCCCGGGGAGGCCGGAAGATCTTGCATGTGTAACAGTATTTCAGTTTCACAATCTGGTTGTTTATCTGGAAATTCTTGATACGAGGCGGTGGTCGCTGGCCCTGGGGCACCGCACCATTGGTAGCTTCTGTAAATCAATAAAGACAGTTAATATCACAGCTAGCCATCACTTGAGCCCAAAAGTCTCACCACCTCTCCAAAACCAATGGGGGCATTCAAAGGTTCCCCAAGCCCCCTGTCTTTTATAGACTAGACACTCAACATCACAGAATATGCCCATAAAACTCCACTAAGTGCATGCAGTTCTGTTGTATACATAAGAAAAAGTGTTTCTTCGAGGCTTTTTTTTCTGATTACAAAGAAAAACATTCATTTAAAAAAATAGCTAAAAATACATTAAATGAAAACATCCAATTTCACTAATAATCAGAGAAATAAAAATTAAAGCACAAAGATACCATTTTTACCTATCATATTAAAAAACATTACAAACAATAAAAATACCCCATGTTAGCAAGGGTGGGGAAAGGTCATTCTTAGATCTTATCAGTGAGCAATATGGCAGCTGCTACTAAACTTTTTTTTTCTTTTAAGATGAAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGGGATCTCAGTCTTGGCTCACTGCAATTTCTGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGGGCCCACCACCATGCCTGGCTGATTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTTATCATGTTTGTCAGGCTGGTCTCAGACTCCAGACCTCAAGTGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGTGCCCAGCCAGCTACCAAAGTTTTAAACGTGTATATTCATTTACTGATCAAGTCTACTTCTAGAAACTTATCAAAATTATAATGAGATATACGAAAGATGTTTATATAAGGATATTTGTCACAGAGTTCCTTTTAATAGTGAAAAACTAAAAATAACTTCAATGTCACAATAGAAGGGTGGTTAAGTAAATTATGTTATGTGCATAGAATGGAATATTATGCAGCCGTTAAAAATGACATAGACGAAAGAATGGTGAAAACAGGAAAATACAATATATGGCAAAATGAAAATGTATGTTAAAAAGCAATACGCATAAAACAATACTATCTTGCAAACAAAATATATGCATGTGAAAAGAAAAGACTGGTAACACAGAAACAGTTACTGAAATAAAAGTAATGCTTGCTTATTGTAAAAATTTTGGAAAAAAACAGAATAGGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCGGGGCACCTGAGATCAGGAGTTTGAGACCAGTCTGGCCAACATGGCAAAACCCCGTGTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAAGCATGGTGGCACGCATCTGTAATCCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGCAAGACTCCAACTCAAAAAAAAAATTTTTTTTGGAAAAAAACAAAGTATAAATAAGAAAACATAAAAATCACTGACAGTCAGTCTCTCAGCTCAGAGATATTTATATTTTTTGGCGTATTTCCTTCTAATCTTCTATTAACAGGTAAACATTCATAATTTTTAAAAAATTGAGATCATATTATAAATGCAGATTTGTACCATGAAGTATTTACTTAATATTATATGCTGTGAACATTTTCTCATTGTTAATTTTTTTTCTAAAACATAACTACTGGCAATATTCCATCATATACGTGTACTATGATTTATTTAAATATTCCATATTGTTGGGATTTTTTACTATTTAGGTGATGTTTCATGTAAAAATTTAAAACATTACAGAGAAAAGCTTAAATCTCCTTCGATCACCACCTCAATCCTAGTCCCCTCCTCCCTTCCAAGAACATACTCATGTGTTAAAATTAATTTCTAAAACAGAAAGAATAAAGAAAAGAATGGTGAAGTATAAGC
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Task1_train_31068
A variant found in Chromosome X affects ELF4 (E74 like ETS transcription factor 4). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; Autoinflammatory syndrome, familial, X-linked, Behcet-like 2
CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCGAGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCAGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACTGAACCCCAACATGATGTACTATGTGAAGACTCATGCTGACCTGGGTGCCCTTACCTCACAGCTTTGGTGAGCTTGACCTGGCCCTCTGCTGGAGAGACGAGCATGGTGGAGGTAGTGGGGATCTCCTCGTCTAGCGACGGTCCCAATTCCAGACTCGCAGATGGCTGGAGACCGACATGCTGAATTTTTGGCTTCTCCCAAGAAGAGCTGCCCTTGCCCTGGGGGGCAGATCTGGATGAGACCCTGGAGCTGGTTCGCCGGGTGGTACTGGCAGAGGCCACAGAGGCCGTGGAGGCCTGAGGTGGGGCTGCTGTGGCTTCGCTGCTCTCATCCTCATCTTCAATGACCACCAGGTCCTTGGGCATCTCCTTAAACTGGTACACCAGCCTCTGCCCTTCCACTTTGGCCAGTATGCCTCTTTGGTAGTAGTATCTAGAGGAAGAGGGGCAGGGAGTTGGGAGTTAGCCGGGAGCTGGGTGGGAGACCTTCTACCTCCATCTCCCCAGTGCTCCTCCCCGAGGGCTAGGCAAGCATGAGGCTGAGTGAGGCTGGCTGGGGAGCCAGCTGAGGGCCCAAGGGCAAGGGAAAGGATATGTCAACACCTGGACTTGGAAGGCTTTTATGACATTCCTGAGATTTCCCCCTGAGAACTCAAAGGATCACAAAAGGTTTTCAGATGTCACCCCACTCCAACCCCCTGCTTTGGGGCAGAGGACAGGGAATGACTGAAGGAGAGAACTGAGAGTGAGGGGATGGATGGCGGGAACAGCAATCCCCCAGCCTGAGAGACCACCTCTAGGACAACTCAAGCCCACCTCCCCGGGTCTCTGGCTTGCAGATGTGAAGAAAGCCCTTCTTGGGGAAGAGGGGGTGCTGAACTGCTCTTCCATTATAAAAAGCAAAAAGGAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTACTTGAGGCCAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATGAGGCCAGGCGCCGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGCAGATTGAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCCAGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGACACAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATAAAAAAAAAACATACAAAAAATTAGCTGAGCGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCAGGCAGTGCAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCATTCAAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAAGGCCAGGTCAGATACAAGAGGAGGGGGGCTCTTCCTGCCAGAGGGGGCCTGGGGAACAGACATAGGAGCAAGCTAAGAGGAAAGTTACGAGACTCGTTTCCTTAGGATCAATCAGGTCTCCATGAAAGCGAGGAGGACTCCTTGGACTTAAGGAAGGATTGGTGATCCCCAGGGCAGGGGTTCTGCATCATCCCAACAGCTCCTACCTTAGTGCCCGCCCCATTGTCTCATAGTTCATGTCAGGCTTGTTTTTCTGCTTCCCCCACAGCTTGGACACAGCTTTGGAGTCCACCAGTTTGAAGATGCCTTTCTCTCGCTGGGTCCACTTGATGTACTTGGGACAGGTGTTTCTGTCTTGCAGAAGAGCCAGGAGGAACTCCCACAGATAGATGGTGCTGCCTGCAGAGGGGCAGGCCGTGAGGGGCAGCCTGGGCAGCTGGGGCACCCTGGCAGCAGGGAAGGGGCTCCCTCCCCACCTCACCTGAGTCCCAGCTGTCCATACCTTTGCCATCCTTTGATTTCTTCCTAATGGGGATGCTGGGGTCAGTGACAGGTGAGGTACTTCGGTTGCCCTTGGTCTTCCGGACTATGAGGGAAAGGTGAGTAGGATGAGGAGCAGCTCCCAAGAGAGGGCCCGGGAGCTGGCCAAGTTGGCTGTGACAAAGCCAACAAGGAGGAGGCAGGTCACCAGGGCTGGAGGCCCCAGATCGCTCTCCACAGCCACAGCCCTCAGGCCTTTGCACCCTCATTTTCAGGCCCCCAGGGTAGCACTGCAACATGGCTACAATGTGGAGAAACCGGGTGCTTGCAAATAAGTCACCTTTGTGAGAACAGAATCTGCCTAGCCTAACTTCTGATACGGAAAGGCAGCCTAAAGGCACCAGTGTTGTGCAGGTAAGTGCGGTGCTGAGGTTCGGTTGCCATGCTGACAAGGCAGTATCAAGCAGCCATCGCCTGAGTAAATCAATAACACCGGGGCTTGGGAAAGCCCAAAGTCCTCTCTCATATATGGCCTCGGCTTTATAAGCTCTGCAGAAGGGAGATAAGCACCCGGCATGACTGGTCTTTTATAGGCTGAGGCCCCAGAGGTCCGGGGACTGGCCAGGGGGCCGAGCCTGGTGTCCAAACTCCCAGCCTAGGATTCAACCCATCGAGATCATTAATGTTTCTGAAAGAGTTTATGCAGATCCCAGGCAGACAGGGGCAGCATGGGAAATGTCAGGCTACAGGCAGACTAACGGATGAGGCCAGGTTTTACAGAAGGGAGGCCTTTTGGTCCATCTCTGTCACACCAGAGAGCTGGCCTCTTAACACATCCATGAGCCCTGACCGCCCCCCCACGCCCCGCCCATCCCCTCGGAGACACACATACACTCACTCTCCCCCACTTACTTCTCTTCTTTGATTTCCCAGTCTTCTTGGCACTTTCCTCTCTGGAGGCCTTCTCCTCCAGAGAATGCCCCTCCTGGTCACTAGTGTCACCCGCCCTGTTCAGGGCATCGGGCTCAGAGGCAGGAAACAGGTAGTTGGGCAGAGTGACAGCTGGTGCAGGGTCCGAGTCTGGAAGCATTTCGGAGGTACTGACTGCAAGAAGAAAGACCTGAGGTGGGCGGGGCCCAGGCAGGGCTGGAGCGGGGTCTCCCAGCGCTGGAGAGACGGGTAGGTTCCAAGGGAGGGCGGGGGGCTCATCCCCCCAGCCCCAGACACAGGATACACCTGAAAATGCCTCATGTGGCTTGTACCACGAGGAGAGGAAACATCTGCAGAGCTGTGGGCACAAGCTGGCCCCAATTACAGCTGCCACATTTATAGCCCACTGTTGGTGGTAGGGAAGTTCTAGGCGGCACCCCAGGTAAAGGGCCACCTTGATTTAGTCCTTGGCTCATTTTACGACTCAAAGGGGCCTTAGAGATCATGTAGCCCCATTCCTGTGTTTTCCTGATGAGGAAACTGAGACAGACCCAGAGAGGGGAAGTCATGTGCCCAAGGTCACACAGCAAGTTGGTGCCCGGTACAAATAGGCACCCATTATTGGATCCTGGATGAATACTGGTGAGAGTCAGGACTAGAAATCTCTCAGATTTCAGCTTTATGGCTTGCCTTCCCTCACTGTACCACACCACCCCTTGGGAGAAGGCAATCTGGGGGAACCCTCCTGTGCATCTGCCTGAGGGGTCATTGGGAAGAGCCTGCCTTGGGGGCCCTCTGGGGAGTTAGGAGCCTGGTAGGATGGGCAAGGATCACTTATTTCTTTATTTTATTTATTTATTTATTTAGACAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA
CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGTAGCTGGGTGTGGTGGTGGGTACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCGAGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCAGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACTGAACCCCAACATGATGTACTATGTGAAGACTCATGCTGACCTGGGTGCCCTTACCTCACAGCTTTGGTGAGCTTGACCTGGCCCTCTGCTGGAGAGACGAGCATGGTGGAGGTAGTGGGGATCTCCTCGTCTAGCGACGGTCCCAATTCCAGACTCGCAGATGGCTGGAGACCGACATGCTGAATTTTTGGCTTCTCCCAAGAAGAGCTGCCCTTGCCCTGGGGGGCAGATCTGGATGAGACCCTGGAGCTGGTTCGCCGGGTGGTACTGGCAGAGGCCACAGAGGCCGTGGAGGCCTGAGGTGGGGCTGCTGTGGCTTCGCTGCTCTCATCCTCATCTTCAATGACCACCAGGTCCTTGGGCATCTCCTTAAACTGGTACACCAGCCTCTGCCCTTCCACTTTGGCCAGTATGCCTCTTTGGTAGTAGTATCTAGAGGAAGAGGGGCAGGGAGTTGGGAGTTAGCCGGGAGCTGGGTGGGAGACCTTCTACCTCCATCTCCCCAGTGCTCCTCCCCGAGGGCTAGGCAAGCATGAGGCTGAGTGAGGCTGGCTGGGGAGCCAGCTGAGGGCCCAAGGGCAAGGGAAAGGATATGTCAACACCTGGACTTGGAAGGCTTTTATGACATTCCTGAGATTTCCCCCTGAGAACTCAAAGGATCACAAAAGGTTTTCAGATGTCACCCCACTCCAACCCCCTGCTTTGGGGCAGAGGACAGGGAATGACTGAAGGAGAGAACTGAGAGTGAGGGGATGGATGGCGGGAACAGCAATCCCCCAGCCTGAGAGACCACCTCTAGGACAACTCAAGCCCACCTCCCCGGGTCTCTGGCTTGCAGATGTGAAGAAAGCCCTTCTTGGGGAAGAGGGGGTGCTGAACTGCTCTTCCATTATAAAAAGCAAAAAGGAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTACTTGAGGCCAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATGAGGCCAGGCGCCGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGCAGATTGAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCCAGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGACACAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATAAAAAAAAAACATACAAAAAATTAGCTGAGCGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCAGGCAGTGCAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCATTCAAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAAGGCCAGGTCAGATACAAGAGGAGGGGGGCTCTTCCTGCCAGAGGGGGCCTGGGGAACAGACATAGGAGCAAGCTAAGAGGAAAGTTACGAGACTCGTTTCCTTAGGATCAATCAGGTCTCCATGAAAGCGAGGAGGACTCCTTGGACTTAAGGAAGGATTGGTGATCCCCAGGGCAGGGGTTCTGCATCATCCCAACAGCTCCTACCTTAGTGCCCGCCCCATTGTCTCATAGTTCATGTCAGGCTTGTTTTTCTGCTTCCCCGACAGCTTGGACACAGCTTTGGAGTCCACCAGTTTGAAGATGCCTTTCTCTCGCTGGGTCCACTTGATGTACTTGGGACAGGTGTTTCTGTCTTGCAGAAGAGCCAGGAGGAACTCCCACAGATAGATGGTGCTGCCTGCAGAGGGGCAGGCCGTGAGGGGCAGCCTGGGCAGCTGGGGCACCCTGGCAGCAGGGAAGGGGCTCCCTCCCCACCTCACCTGAGTCCCAGCTGTCCATACCTTTGCCATCCTTTGATTTCTTCCTAATGGGGATGCTGGGGTCAGTGACAGGTGAGGTACTTCGGTTGCCCTTGGTCTTCCGGACTATGAGGGAAAGGTGAGTAGGATGAGGAGCAGCTCCCAAGAGAGGGCCCGGGAGCTGGCCAAGTTGGCTGTGACAAAGCCAACAAGGAGGAGGCAGGTCACCAGGGCTGGAGGCCCCAGATCGCTCTCCACAGCCACAGCCCTCAGGCCTTTGCACCCTCATTTTCAGGCCCCCAGGGTAGCACTGCAACATGGCTACAATGTGGAGAAACCGGGTGCTTGCAAATAAGTCACCTTTGTGAGAACAGAATCTGCCTAGCCTAACTTCTGATACGGAAAGGCAGCCTAAAGGCACCAGTGTTGTGCAGGTAAGTGCGGTGCTGAGGTTCGGTTGCCATGCTGACAAGGCAGTATCAAGCAGCCATCGCCTGAGTAAATCAATAACACCGGGGCTTGGGAAAGCCCAAAGTCCTCTCTCATATATGGCCTCGGCTTTATAAGCTCTGCAGAAGGGAGATAAGCACCCGGCATGACTGGTCTTTTATAGGCTGAGGCCCCAGAGGTCCGGGGACTGGCCAGGGGGCCGAGCCTGGTGTCCAAACTCCCAGCCTAGGATTCAACCCATCGAGATCATTAATGTTTCTGAAAGAGTTTATGCAGATCCCAGGCAGACAGGGGCAGCATGGGAAATGTCAGGCTACAGGCAGACTAACGGATGAGGCCAGGTTTTACAGAAGGGAGGCCTTTTGGTCCATCTCTGTCACACCAGAGAGCTGGCCTCTTAACACATCCATGAGCCCTGACCGCCCCCCCACGCCCCGCCCATCCCCTCGGAGACACACATACACTCACTCTCCCCCACTTACTTCTCTTCTTTGATTTCCCAGTCTTCTTGGCACTTTCCTCTCTGGAGGCCTTCTCCTCCAGAGAATGCCCCTCCTGGTCACTAGTGTCACCCGCCCTGTTCAGGGCATCGGGCTCAGAGGCAGGAAACAGGTAGTTGGGCAGAGTGACAGCTGGTGCAGGGTCCGAGTCTGGAAGCATTTCGGAGGTACTGACTGCAAGAAGAAAGACCTGAGGTGGGCGGGGCCCAGGCAGGGCTGGAGCGGGGTCTCCCAGCGCTGGAGAGACGGGTAGGTTCCAAGGGAGGGCGGGGGGCTCATCCCCCCAGCCCCAGACACAGGATACACCTGAAAATGCCTCATGTGGCTTGTACCACGAGGAGAGGAAACATCTGCAGAGCTGTGGGCACAAGCTGGCCCCAATTACAGCTGCCACATTTATAGCCCACTGTTGGTGGTAGGGAAGTTCTAGGCGGCACCCCAGGTAAAGGGCCACCTTGATTTAGTCCTTGGCTCATTTTACGACTCAAAGGGGCCTTAGAGATCATGTAGCCCCATTCCTGTGTTTTCCTGATGAGGAAACTGAGACAGACCCAGAGAGGGGAAGTCATGTGCCCAAGGTCACACAGCAAGTTGGTGCCCGGTACAAATAGGCACCCATTATTGGATCCTGGATGAATACTGGTGAGAGTCAGGACTAGAAATCTCTCAGATTTCAGCTTTATGGCTTGCCTTCCCTCACTGTACCACACCACCCCTTGGGAGAAGGCAATCTGGGGGAACCCTCCTGTGCATCTGCCTGAGGGGTCATTGGGAAGAGCCTGCCTTGGGGGCCCTCTGGGGAGTTAGGAGCCTGGTAGGATGGGCAAGGATCACTTATTTCTTTATTTTATTTATTTATTTATTTAGACAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA
Task1_train_31069
Given a variant located on Chromosome X and affecting ELF4 (E74 like ETS transcription factor 4), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; Autoinflammatory syndrome, familial, X-linked, Behcet-like 2
GCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAATCCGAGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCAGACATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACTGAACCCCAACATGATGTACTATGTGAAGACTCATGCTGACCTGGGTGCCCTTACCTCACAGCTTTGGTGAGCTTGACCTGGCCCTCTGCTGGAGAGACGAGCATGGTGGAGGTAGTGGGGATCTCCTCGTCTAGCGACGGTCCCAATTCCAGACTCGCAGATGGCTGGAGACCGACATGCTGAATTTTTGGCTTCTCCCAAGAAGAGCTGCCCTTGCCCTGGGGGGCAGATCTGGATGAGACCCTGGAGCTGGTTCGCCGGGTGGTACTGGCAGAGGCCACAGAGGCCGTGGAGGCCTGAGGTGGGGCTGCTGTGGCTTCGCTGCTCTCATCCTCATCTTCAATGACCACCAGGTCCTTGGGCATCTCCTTAAACTGGTACACCAGCCTCTGCCCTTCCACTTTGGCCAGTATGCCTCTTTGGTAGTAGTATCTAGAGGAAGAGGGGCAGGGAGTTGGGAGTTAGCCGGGAGCTGGGTGGGAGACCTTCTACCTCCATCTCCCCAGTGCTCCTCCCCGAGGGCTAGGCAAGCATGAGGCTGAGTGAGGCTGGCTGGGGAGCCAGCTGAGGGCCCAAGGGCAAGGGAAAGGATATGTCAACACCTGGACTTGGAAGGCTTTTATGACATTCCTGAGATTTCCCCCTGAGAACTCAAAGGATCACAAAAGGTTTTCAGATGTCACCCCACTCCAACCCCCTGCTTTGGGGCAGAGGACAGGGAATGACTGAAGGAGAGAACTGAGAGTGAGGGGATGGATGGCGGGAACAGCAATCCCCCAGCCTGAGAGACCACCTCTAGGACAACTCAAGCCCACCTCCCCGGGTCTCTGGCTTGCAGATGTGAAGAAAGCCCTTCTTGGGGAAGAGGGGGTGCTGAACTGCTCTTCCATTATAAAAAGCAAAAAGGAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATTACTTGAGGCCAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTATTAAAAATACAAAAAATGAGGCCAGGCGCCGTGACTCACGCCTGTAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCAGATCACGAGGTCAGCAGATTGAAACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCCAGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGACACAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGTAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATAAAAAAAAAACATACAAAAAATTAGCTGAGCGTGGTGGCATGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCATGAGAATCGCTTGAACCCAGGCAGTGCAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCATTCAAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAAAGGCCAGGTCAGATACAAGAGGAGGGGGGCTCTTCCTGCCAGAGGGGGCCTGGGGAACAGACATAGGAGCAAGCTAAGAGGAAAGTTACGAGACTCGTTTCCTTAGGATCAATCAGGTCTCCATGAAAGCGAGGAGGACTCCTTGGACTTAAGGAAGGATTGGTGATCCCCAGGGCAGGGGTTCTGCATCATCCCAACAGCTCCTACCTTAGTGCCCGCCCCATTGTCTCATAGTTCATGTCAGGCTTGTTTTTCTGCTTCCCCCACAGCTTGGACACAGCTTTGGAGTCCACCAGTTTGAAGATGCCTTTCTCTCGCTGGGTCCACTTGATGTACTTGGGACAGGTGTTTCTGTCTTGCAGAAGAGCCAGGAGGAACTCCCACAGATAGATGGTGCTGCCTGCAGAGGGGCAGGCCGTGAGGGGCAGCCTGGGCAGCTGGGGCACCCTGGCAGCAGGGAAGGGGCTCCCTCCCCACCTCACCTGAGTCCCAGCTGTCCATACCTTTGCCATCCTTTGATTTCTTCCTAATGGGGATGCTGGGGTCAGTGACAGGTGAGGTACTTCGGTTGCCCTTGGTCTTCCGGACTATGAGGGAAAGGTGAGTAGGATGAGGAGCAGCTCCCAAGAGAGGGCCCGGGAGCTGGCCAAGTTGGCTGTGACAAAGCCAACAAGGAGGAGGCAGGTCACCAGGGCTGGAGGCCCCAGATCGCTCTCCACAGCCACAGCCCTCAGGCCTTTGCACCCTCATTTTCAGGCCCCCAGGGTAGCACTGCAACATGGCTACAATGTGGAGAAACCGGGTGCTTGCAAATAAGTCACCTTTGTGAGAACAGAATCTGCCTAGCCTAACTTCTGATACGGAAAGGCAGCCTAAAGGCACCAGTGTTGTGCAGGTAAGTGCGGTGCTGAGGTTCGGTTGCCATGCTGACAAGGCAGTATCAAGCAGCCATCGCCTGAGTAAATCAATAACACCGGGGCTTGGGAAAGCCCAAAGTCCTCTCTCATATATGGCCTCGGCTTTATAAGCTCTGCAGAAGGGAGATAAGCACCCGGCATGACTGGTCTTTTATAGGCTGAGGCCCCAGAGGTCCGGGGACTGGCCAGGGGGCCGAGCCTGGTGTCCAAACTCCCAGCCTAGGATTCAACCCATCGAGATCATTAATGTTTCTGAAAGAGTTTATGCAGATCCCAGGCAGACAGGGGCAGCATGGGAAATGTCAGGCTACAGGCAGACTAACGGATGAGGCCAGGTTTTACAGAAGGGAGGCCTTTTGGTCCATCTCTGTCACACCAGAGAGCTGGCCTCTTAACACATCCATGAGCCCTGACCGCCCCCCCACGCCCCGCCCATCCCCTCGGAGACACACATACACTCACTCTCCCCCACTTACTTCTCTTCTTTGATTTCCCAGTCTTCTTGGCACTTTCCTCTCTGGAGGCCTTCTCCTCCAGAGAATGCCCCTCCTGGTCACTAGTGTCACCCGCCCTGTTCAGGGCATCGGGCTCAGAGGCAGGAAACAGGTAGTTGGGCAGAGTGACAGCTGGTGCAGGGTCCGAGTCTGGAAGCATTTCGGAGGTACTGACTGCAAGAAGAAAGACCTGAGGTGGGCGGGGCCCAGGCAGGGCTGGAGCGGGGTCTCCCAGCGCTGGAGAGACGGGTAGGTTCCAAGGGAGGGCGGGGGGCTCATCCCCCCAGCCCCAGACACAGGATACACCTGAAAATGCCTCATGTGGCTTGTACCACGAGGAGAGGAAACATCTGCAGAGCTGTGGGCACAAGCTGGCCCCAATTACAGCTGCCACATTTATAGCCCACTGTTGGTGGTAGGGAAGTTCTAGGCGGCACCCCAGGTAAAGGGCCACCTTGATTTAGTCCTTGGCTCATTTTACGACTCAAAGGGGCCTTAGAGATCATGTAGCCCCATTCCTGTGTTTTCCTGATGAGGAAACTGAGACAGACCCAGAGAGGGGAAGTCATGTGCCCAAGGTCACACAGCAAGTTGGTGCCCGGTACAAATAGGCACCCATTATTGGATCCTGGATGAATACTGGTGAGAGTCAGGACTAGAAATCTCTCAGATTTCAGCTTTATGGCTTGCCTTCCCTCACTGTACCACACCACCCCTTGGGAGAAGGCAATCTGGGGGAACCCTCCTGTGCATCTGCCTGAGGGGTCATTGGGAAGAGCCTGCCTTGGGGGCCCTCTGGGGAGTTAGGAGCCTGGTAGGATGGGCAAGGATCACTTATTTCTTTATTTTATTTATTTATTTATTTAGACAGTCTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGTGTGATCTCGGCTCATTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC
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Task1_train_31070
A variant was discovered in gene ELF4 (E74 like ETS transcription factor 4), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; See cases
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Task1_train_31071
This genomic variant is located on Chromosome X, within the AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Severe X-linked mitochondrial encephalomyopathy
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Task1_train_31072
This sequence change occurs on Chromosome X, altering AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family). What is the medical significance of this variant — is it benign or linked to a disease?
Pathogenic; Severe X-linked mitochondrial encephalomyopathy
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Task1_train_31073
This mutation occurs in AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth Neuropathy X
ACAAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGTGTGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGAACTCCAGACTGGGAAACAGAGCGAGACACCGCCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATCTATTCTGCTTCCATAAAGCTAACCTAAATCTTCTATAGTTTTGTTTACTTATGTCTACTTCCTGTTCTTTCCTTAACAGACAGGATATTTAATAACCATGATTTGCAGAATATTCTTTTCTATATGTAGAAACCAGTTTTTGGATGTGACTGCCTCTCACCTAGAAATGTTTTCTTAGATTTCTTTTTGTCACTCAGTATTCATTCATTCGACAAATATTTATGGAGTACTTATTATATACAAAAGTATTATGTTGTCCGGGTTGCTGAGACAAAACTGACATGGACCTTGACTATGAGGAGCATACAACCTAGTACAGAAAGATACAGCCTTGCTCACAACTACAGAGCAATGTAAACAGTAGTGTGCCATATGAGAGGTACAGATTAAAGGAGTCAAGTATTTCAAGCAGAGGGCGAGAACCTCCAGCCGGGGGTGAACTGGACCAGCTTCATGAAGGATGTGGCATTTGAGCTCTCTAACCCTTTGTTCATCTTTGTGGCTATTTAGACTCCCCCAAAGCAACCTAAAAATCCAACGAGTGAGCAACCGTAAACTGTGAAATTCGCTTAATGGAATATATAGTCATTAAACTGTTTACAAAGTCTGAAGCAACATAGAAAATGCTTACATTTATGGTGTTAAGTGGAAAAGAGCAGAATATTATATATAGTATGCTTGCCACGAATAAAACAAACCAACAATAAAACCTACATGCAAGGAAACACAGGGAAGGAAATACACCAAAATATTAATGGTTGCTGCAGGTGACTTTCCTCTCCTCTCTCCTTCTTGTCTGTCTTCTACATTGACCACATATTACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCATGATCTCCACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTTAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCCTGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTTCTCCTGGCCCACGTATTACTTTTATAACAGGTTAAAAAGATCCAGTACATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTTGGAGGGGGAAAAAAATTCCTCCAAGGTACCTACGTCCTTAGTTGCAGAGTCCATAAACAAACACAATACACTTGTAACTAGCAATGGGGAAATTACCTCATGGTTCCTACATACTATAGTCTTGTTTATGTCATAATAGATTGTAAAAAACAGCTAAAAATAGTACTCAAGGAAAATGAAAACAGAGTAATTTTCCTTTCTAGGGAACAGGTTATAACATTGCTTCATCCTCCATCCTCCGGATTCAAGTTTGAGCAAAGGGAACAGCAGATCCATCTGAAGGCTTATGTGCATGCCCACCAGGGGTTATGCCAGTAGCTGCTGCCAATAAGTAGAACCGGAAGAGCTCTACCCCTGCAGGCATGCACACTGTTCATTTCATCTGCCACTAGCTTGCAGATGAGGCCATACCTGGTCTTCTGAATCAAGCAGTTCACACATTTCTATTCTGTACCCTCAGCCTCCAAACACTCTGACCCTATTTGGTTAGGCTGTTGATGAGCTTTAGCACACCACCGGGCAGACTTGTTCACAGGCTAGGGAGAATGAATTATGCCTGGTCATGCTGTAGCACACTTACCACCCAGATGTTAGAGCGTGCTTGTAGCTCTGCATTTACCCGGAAGCCACCAAAATCTGAGTCTATTTCCAGGCCACCAGTCTTGGCCAACTCAACATTGGGCTCCAGGCCCACAGCTGCCACTATGTGGTCAGTTTCTACCTGAGGCAAAAAAGAAATAATTCAGTCAATTACCACAGTTTCCATTTATGCCTACAGGCGTAACAATGGCCCTTCATGCCATTAAGAATTGGGACTTTAAAAAATCATGGGTTAACTTACCTCTGATAAATGGATTTTAAGTTCTATTTCATAAGCCTCCACCACCCCATCCCATGCACATCCCCCATGTCATTCGAACAGAAATCTGCCACCCTAGCCAGGACTCAAAACTCTGTGAGACAGATAGAATGGGGCTAAGGGAAAGTGGTTCACAGGAGCCTACTCTGGCTCTCATCATTCTGTTTTAATGGAGGGATGGTTAATTCGGAAAATTATATCAGGTTAATGGCAACTGCCAGGAAAACTAATCTACTGGTGTCAAATGAAGGAGTAAAAATGAGGCAAGGGGAGTGGAGAACTGGAAGGCCTCTTGGCAGACTATCTTTTCCTTCCTTACCTTCCTGCCGTCTTTCAGCTTGATAAGTAACTTGCCACTGCTGACTCCAACGGATTGCACAATAGCATTGGGCATCACCTTAACCCCCTCTGTAAAGGCAAACAAGACCTGAGAGTGAGCCTACAAGGCTATCACTTTCATGGGAAGTAGGAAAGCTGACCAGCGGTCTCCTCCACGGTAAAACCAATTATCAGTACACAGGCAGTTTTGGAGAGCTGCAAGAACCTACACCCATGGTTCATTTTCAGCACTTCCAGGAATTTGGGGCATCTGATTCAGAACACCTAGATGAACTTAGCTGACTGGAGAATGGTGGAAACATTTTACAGGCCAGGTGATAGGGCTTATGTCAAGGGGGTTCCTATAGAAGCGAAGTTTGCCTTAGGTCACACTCAAAGGAAATAGAGTGGCAGCATATAGAAACAGTCTCTCTACCTCGTCTGACTTTTTCCATGGTCCAGTTGCTGAGGTATTCGGGGAGGATCTTTCCCATATTTCCTTTCTCGGGGAAGAGTTGAATCACTTCTGTGCCCAAGGCTCGAGCTGGGAAGAAGAAACAGAGTAGTTACAGCAGGAAGCAAAAGTCAATCCTAGGAATACAGGAAGAGAAGTAAAGGAGCAGCAGGCAGCCCTCACTACAGACAGGGCAGAGCTGCAATCCAGGCCGAGCGCCCACTTACAGGACAGTGGGCATGAGGGCCTCGGTGCTCAAGTTCATTTGTAACGCAAATACAACAGGTATCAGAACTGCTGGCCCCAGATTAAGCTTCAGATGGTGAACTCTGTGCACTTCCACCCATGCAGTCACCTAAGGCTTACATAAGTGCTTTGCAACCTCTGAATAGGAAGCATCCTCCTGAAAAGATGCCCTGATTTCATATATCTGAAAAAGAACATTAAGAAAACTAGTTGCCATGAAACATTCCAACTGGAGCTCACAGATCTCTCAAGCTGGGAACCATCATGTGCCCAAAGAAGTTTTTGGCATTTTACAGGAAGCAGCAGTTCAAAGACACCCATAATTCTGTAGTCTGCATTGCCCTTATCATCTTCATAACTCACTTTCCTTAATATTTTATTTCTAAGGAGTCCTGGCATAGAGGGTAGAGGAAAAGAAAGGAAAGAAAGTATTGCTGTTGGCCAGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCC
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Task1_train_31074
Gene AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Combined oxidative phosphorylation deficiency
ACAAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGTGTGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGAACTCCAGACTGGGAAACAGAGCGAGACACCGCCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATCTATTCTGCTTCCATAAAGCTAACCTAAATCTTCTATAGTTTTGTTTACTTATGTCTACTTCCTGTTCTTTCCTTAACAGACAGGATATTTAATAACCATGATTTGCAGAATATTCTTTTCTATATGTAGAAACCAGTTTTTGGATGTGACTGCCTCTCACCTAGAAATGTTTTCTTAGATTTCTTTTTGTCACTCAGTATTCATTCATTCGACAAATATTTATGGAGTACTTATTATATACAAAAGTATTATGTTGTCCGGGTTGCTGAGACAAAACTGACATGGACCTTGACTATGAGGAGCATACAACCTAGTACAGAAAGATACAGCCTTGCTCACAACTACAGAGCAATGTAAACAGTAGTGTGCCATATGAGAGGTACAGATTAAAGGAGTCAAGTATTTCAAGCAGAGGGCGAGAACCTCCAGCCGGGGGTGAACTGGACCAGCTTCATGAAGGATGTGGCATTTGAGCTCTCTAACCCTTTGTTCATCTTTGTGGCTATTTAGACTCCCCCAAAGCAACCTAAAAATCCAACGAGTGAGCAACCGTAAACTGTGAAATTCGCTTAATGGAATATATAGTCATTAAACTGTTTACAAAGTCTGAAGCAACATAGAAAATGCTTACATTTATGGTGTTAAGTGGAAAAGAGCAGAATATTATATATAGTATGCTTGCCACGAATAAAACAAACCAACAATAAAACCTACATGCAAGGAAACACAGGGAAGGAAATACACCAAAATATTAATGGTTGCTGCAGGTGACTTTCCTCTCCTCTCTCCTTCTTGTCTGTCTTCTACATTGACCACATATTACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCATGATCTCCACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTTAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCCTGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTTCTCCTGGCCCACGTATTACTTTTATAACAGGTTAAAAAGATCCAGTACATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTTGGAGGGGGAAAAAAATTCCTCCAAGGTACCTACGTCCTTAGTTGCAGAGTCCATAAACAAACACAATACACTTGTAACTAGCAATGGGGAAATTACCTCATGGTTCCTACATACTATAGTCTTGTTTATGTCATAATAGATTGTAAAAAACAGCTAAAAATAGTACTCAAGGAAAATGAAAACAGAGTAATTTTCCTTTCTAGGGAACAGGTTATAACATTGCTTCATCCTCCATCCTCCGGATTCAAGTTTGAGCAAAGGGAACAGCAGATCCATCTGAAGGCTTATGTGCATGCCCACCAGGGGTTATGCCAGTAGCTGCTGCCAATAAGTAGAACCGGAAGAGCTCTACCCCTGCAGGCATGCACACTGTTCATTTCATCTGCCACTAGCTTGCAGATGAGGCCATACCTGGTCTTCTGAATCAAGCAGTTCACACATTTCTATTCTGTACCCTCAGCCTCCAAACACTCTGACCCTATTTGGTTAGGCTGTTGATGAGCTTTAGCACACCACCGGGCAGACTTGTTCACAGGCTAGGGAGAATGAATTATGCCTGGTCATGCTGTAGCACACTTACCACCCAGATGTTAGAGCGTGCTTGTAGCTCTGCATTTACCCGGAAGCCACCAAAATCTGAGTCTATTTCCAGGCCACCAGTCTTGGCCAACTCAACATTGGGCTCCAGGCCCACAGCTGCCACTATGTGGTCAGTTTCTACCTGAGGCAAAAAAGAAATAATTCAGTCAATTACCACAGTTTCCATTTATGCCTACAGGCGTAACAATGGCCCTTCATGCCATTAAGAATTGGGACTTTAAAAAATCATGGGTTAACTTACCTCTGATAAATGGATTTTAAGTTCTATTTCATAAGCCTCCACCACCCCATCCCATGCACATCCCCCATGTCATTCGAACAGAAATCTGCCACCCTAGCCAGGACTCAAAACTCTGTGAGACAGATAGAATGGGGCTAAGGGAAAGTGGTTCACAGGAGCCTACTCTGGCTCTCATCATTCTGTTTTAATGGAGGGATGGTTAATTCGGAAAATTATATCAGGTTAATGGCAACTGCCAGGAAAACTAATCTACTGGTGTCAAATGAAGGAGTAAAAATGAGGCAAGGGGAGTGGAGAACTGGAAGGCCTCTTGGCAGACTATCTTTTCCTTCCTTACCTTCCTGCCGTCTTTCAGCTTGATAAGTAACTTGCCACTGCTGACTCCAACGGATTGCACAATAGCATTGGGCATCACCTTAACCCCCTCTGTAAAGGCAAACAAGACCTGAGAGTGAGCCTACAAGGCTATCACTTTCATGGGAAGTAGGAAAGCTGACCAGCGGTCTCCTCCACGGTAAAACCAATTATCAGTACACAGGCAGTTTTGGAGAGCTGCAAGAACCTACACCCATGGTTCATTTTCAGCACTTCCAGGAATTTGGGGCATCTGATTCAGAACACCTAGATGAACTTAGCTGACTGGAGAATGGTGGAAACATTTTACAGGCCAGGTGATAGGGCTTATGTCAAGGGGGTTCCTATAGAAGCGAAGTTTGCCTTAGGTCACACTCAAAGGAAATAGAGTGGCAGCATATAGAAACAGTCTCTCTACCTCGTCTGACTTTTTCCATGGTCCAGTTGCTGAGGTATTCGGGGAGGATCTTTCCCATATTTCCTTTCTCGGGGAAGAGTTGAATCACTTCTGTGCCCAAGGCTCGAGCTGGGAAGAAGAAACAGAGTAGTTACAGCAGGAAGCAAAAGTCAATCCTAGGAATACAGGAAGAGAAGTAAAGGAGCAGCAGGCAGCCCTCACTACAGACAGGGCAGAGCTGCAATCCAGGCCGAGCGCCCACTTACAGGACAGTGGGCATGAGGGCCTCGGTGCTCAAGTTCATTTGTAACGCAAATACAACAGGTATCAGAACTGCTGGCCCCAGATTAAGCTTCAGATGGTGAACTCTGTGCACTTCCACCCATGCAGTCACCTAAGGCTTACATAAGTGCTTTGCAACCTCTGAATAGGAAGCATCCTCCTGAAAAGATGCCCTGATTTCATATATCTGAAAAAGAACATTAAGAAAACTAGTTGCCATGAAACATTCCAACTGGAGCTCACAGATCTCTCAAGCTGGGAACCATCATGTGCCCAAAGAAGTTTTTGGCATTTTACAGGAAGCAGCAGTTCAAAGACACCCATAATTCTGTAGTCTGCATTGCCCTTATCATCTTCATAACTCACTTTCCTTAATATTTTATTTCTAAGGAGTCCTGGCATAGAGGGTAGAGGAAAAGAAAGGAAAGAAAGTATTGCTGTTGGCCAGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCC
ACAAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGTGTGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGAACTCCAGACTGGGAAACAGAGCGAGACACCGCCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATCTATTCTGCTTCCATAAAGCTAACCTAAATCTTCTATAGTTTTGTTTACTTATGTCTACTTCCTGTTCTTTCCTTAACAGACAGGATATTTAATAACCATGATTTGCAGAATATTCTTTTCTATATGTAGAAACCAGTTTTTGGATGTGACTGCCTCTCACCTAGAAATGTTTTCTTAGATTTCTTTTTGTCACTCAGTATTCATTCATTCGACAAATATTTATGGAGTACTTATTATATACAAAAGTATTATGTTGTCCGGGTTGCTGAGACAAAACTGACATGGACCTTGACTATGAGGAGCATACAACCTAGTACAGAAAGATACAGCCTTGCTCACAACTACAGAGCAATGTAAACAGTAGTGTGCCATATGAGAGGTACAGATTAAAGGAGTCAAGTATTTCAAGCAGAGGGCGAGAACCTCCAGCCGGGGGTGAACTGGACCAGCTTCATGAAGGATGTGGCATTTGAGCTCTCTAACCCTTTGTTCATCTTTGTGGCTATTTAGACTCCCCCAAAGCAACCTAAAAATCCAACGAGTGAGCAACCGTAAACTGTGAAATTCGCTTAATGGAATATATAGTCATTAAACTGTTTACAAAGTCTGAAGCAACATAGAAAATGCTTACATTTATGGTGTTAAGTGGAAAAGAGCAGAATATTATATATAGTATGCTTGCCACGAATAAAACAAACCAACAATAAAACCTACATGCAAGGAAACACAGGGAAGGAAATACACCAAAATATTAATGGTTGCTGCAGGTGACTTTCCTCTCCTCTCTCCTTCTTGTCTGTCTTCTACATTGACCACATATTACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCATGATCTCCACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTTAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCCTGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTTCTCCTGGCCCACGTATTACTTTTATAACAGGTTAAAAAGATCCAGTACATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTTGGAGGGGGAAAAAAATTCCTCCAAGGTACCTACGTCCTTAGTTGCAGAGTCCATAAACAAACACAATACACTTGTAACTAGCAATGGGGAAATTACCTCATGGTTCCTACATACTATAGTCTTGTTTATGTCATAATAGATTGTAAAAAACAGCTAAAAATAGTACTCAAGGAAAATGAAAACAGAGTAATTTTCCTTTCTAGGGAACAGGTTATAACATTGCTTCATCCTCCATCCTCCGGATTCAAGTTTGAGCAAAGGGAACAGCAGATCCATCTGAAGGCTTATGTGCATGCCCACCAGGGGTTATGCCAGTAGCTGCTGCCAATAAGTAGAACCGGAAGAGCTCTACCCCTGCAGGCATGCACACTGTTCATTTCATCTGCCACTAGCTTGCAGATGAGGCCATACCTGGTCTTCTGAATCAAGCAGTTCACACATTTCTATTCTGTACCCTCAGCCTCCAAACACTCTGACCCTATTTGGTTAGGCTGTTGATGAGCTTTAGCACACCACCGGGCAGACTTGTTCACAGGCTAGGGAGAATGAATTATGCCTGGTCATGCTGTAGCACACTTACCACCCAGATGTTAGAGCGTGCTTGTAGCTCTGCATTTACCTGGAAGCCACCAAAATCTGAGTCTATTTCCAGGCCACCAGTCTTGGCCAACTCAACATTGGGCTCCAGGCCCACAGCTGCCACTATGTGGTCAGTTTCTACCTGAGGCAAAAAAGAAATAATTCAGTCAATTACCACAGTTTCCATTTATGCCTACAGGCGTAACAATGGCCCTTCATGCCATTAAGAATTGGGACTTTAAAAAATCATGGGTTAACTTACCTCTGATAAATGGATTTTAAGTTCTATTTCATAAGCCTCCACCACCCCATCCCATGCACATCCCCCATGTCATTCGAACAGAAATCTGCCACCCTAGCCAGGACTCAAAACTCTGTGAGACAGATAGAATGGGGCTAAGGGAAAGTGGTTCACAGGAGCCTACTCTGGCTCTCATCATTCTGTTTTAATGGAGGGATGGTTAATTCGGAAAATTATATCAGGTTAATGGCAACTGCCAGGAAAACTAATCTACTGGTGTCAAATGAAGGAGTAAAAATGAGGCAAGGGGAGTGGAGAACTGGAAGGCCTCTTGGCAGACTATCTTTTCCTTCCTTACCTTCCTGCCGTCTTTCAGCTTGATAAGTAACTTGCCACTGCTGACTCCAACGGATTGCACAATAGCATTGGGCATCACCTTAACCCCCTCTGTAAAGGCAAACAAGACCTGAGAGTGAGCCTACAAGGCTATCACTTTCATGGGAAGTAGGAAAGCTGACCAGCGGTCTCCTCCACGGTAAAACCAATTATCAGTACACAGGCAGTTTTGGAGAGCTGCAAGAACCTACACCCATGGTTCATTTTCAGCACTTCCAGGAATTTGGGGCATCTGATTCAGAACACCTAGATGAACTTAGCTGACTGGAGAATGGTGGAAACATTTTACAGGCCAGGTGATAGGGCTTATGTCAAGGGGGTTCCTATAGAAGCGAAGTTTGCCTTAGGTCACACTCAAAGGAAATAGAGTGGCAGCATATAGAAACAGTCTCTCTACCTCGTCTGACTTTTTCCATGGTCCAGTTGCTGAGGTATTCGGGGAGGATCTTTCCCATATTTCCTTTCTCGGGGAAGAGTTGAATCACTTCTGTGCCCAAGGCTCGAGCTGGGAAGAAGAAACAGAGTAGTTACAGCAGGAAGCAAAAGTCAATCCTAGGAATACAGGAAGAGAAGTAAAGGAGCAGCAGGCAGCCCTCACTACAGACAGGGCAGAGCTGCAATCCAGGCCGAGCGCCCACTTACAGGACAGTGGGCATGAGGGCCTCGGTGCTCAAGTTCATTTGTAACGCAAATACAACAGGTATCAGAACTGCTGGCCCCAGATTAAGCTTCAGATGGTGAACTCTGTGCACTTCCACCCATGCAGTCACCTAAGGCTTACATAAGTGCTTTGCAACCTCTGAATAGGAAGCATCCTCCTGAAAAGATGCCCTGATTTCATATATCTGAAAAAGAACATTAAGAAAACTAGTTGCCATGAAACATTCCAACTGGAGCTCACAGATCTCTCAAGCTGGGAACCATCATGTGCCCAAAGAAGTTTTTGGCATTTTACAGGAAGCAGCAGTTCAAAGACACCCATAATTCTGTAGTCTGCATTGCCCTTATCATCTTCATAACTCACTTTCCTTAATATTTTATTTCTAAGGAGTCCTGGCATAGAGGGTAGAGGAAAAGAAAGGAAAGAAAGTATTGCTGTTGGCCAGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCC
Task1_train_31075
A variant was discovered in gene AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family), Chromosome X. Please indicate if this mutation results in a known disease or if it's non-harmful.
Pathogenic; Deafness, X-linked 5
ACAAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGGCGTGTGTGGTGGCAAGCGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGACAGGAGAATGGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGAACTCCAGACTGGGAAACAGAGCGAGACACCGCCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATCTATTCTGCTTCCATAAAGCTAACCTAAATCTTCTATAGTTTTGTTTACTTATGTCTACTTCCTGTTCTTTCCTTAACAGACAGGATATTTAATAACCATGATTTGCAGAATATTCTTTTCTATATGTAGAAACCAGTTTTTGGATGTGACTGCCTCTCACCTAGAAATGTTTTCTTAGATTTCTTTTTGTCACTCAGTATTCATTCATTCGACAAATATTTATGGAGTACTTATTATATACAAAAGTATTATGTTGTCCGGGTTGCTGAGACAAAACTGACATGGACCTTGACTATGAGGAGCATACAACCTAGTACAGAAAGATACAGCCTTGCTCACAACTACAGAGCAATGTAAACAGTAGTGTGCCATATGAGAGGTACAGATTAAAGGAGTCAAGTATTTCAAGCAGAGGGCGAGAACCTCCAGCCGGGGGTGAACTGGACCAGCTTCATGAAGGATGTGGCATTTGAGCTCTCTAACCCTTTGTTCATCTTTGTGGCTATTTAGACTCCCCCAAAGCAACCTAAAAATCCAACGAGTGAGCAACCGTAAACTGTGAAATTCGCTTAATGGAATATATAGTCATTAAACTGTTTACAAAGTCTGAAGCAACATAGAAAATGCTTACATTTATGGTGTTAAGTGGAAAAGAGCAGAATATTATATATAGTATGCTTGCCACGAATAAAACAAACCAACAATAAAACCTACATGCAAGGAAACACAGGGAAGGAAATACACCAAAATATTAATGGTTGCTGCAGGTGACTTTCCTCTCCTCTCTCCTTCTTGTCTGTCTTCTACATTGACCACATATTACTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCATGATCTCCACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTTAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCCTGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTTCTCCTGGCCCACGTATTACTTTTATAACAGGTTAAAAAGATCCAGTACATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTTGGAGGGGGAAAAAAATTCCTCCAAGGTACCTACGTCCTTAGTTGCAGAGTCCATAAACAAACACAATACACTTGTAACTAGCAATGGGGAAATTACCTCATGGTTCCTACATACTATAGTCTTGTTTATGTCATAATAGATTGTAAAAAACAGCTAAAAATAGTACTCAAGGAAAATGAAAACAGAGTAATTTTCCTTTCTAGGGAACAGGTTATAACATTGCTTCATCCTCCATCCTCCGGATTCAAGTTTGAGCAAAGGGAACAGCAGATCCATCTGAAGGCTTATGTGCATGCCCACCAGGGGTTATGCCAGTAGCTGCTGCCAATAAGTAGAACCGGAAGAGCTCTACCCCTGCAGGCATGCACACTGTTCATTTCATCTGCCACTAGCTTGCAGATGAGGCCATACCTGGTCTTCTGAATCAAGCAGTTCACACATTTCTATTCTGTACCCTCAGCCTCCAAACACTCTGACCCTATTTGGTTAGGCTGTTGATGAGCTTTAGCACACCACCGGGCAGACTTGTTCACAGGCTAGGGAGAATGAATTATGCCTGGTCATGCTGTAGCACACTTACCACCCAGATGTTAGAGCGTGCTTGTAGCTCTGCATTTACCCGGAAGCCACCAAAATCTGAGTCTATTTCCAGGCCACCAGTCTTGGCCAACTCAACATTGGGCTCCAGGCCCACAGCTGCCACTATGTGGTCAGTTTCTACCTGAGGCAAAAAAGAAATAATTCAGTCAATTACCACAGTTTCCATTTATGCCTACAGGCGTAACAATGGCCCTTCATGCCATTAAGAATTGGGACTTTAAAAAATCATGGGTTAACTTACCTCTGATAAATGGATTTTAAGTTCTATTTCATAAGCCTCCACCACCCCATCCCATGCACATCCCCCATGTCATTCGAACAGAAATCTGCCACCCTAGCCAGGACTCAAAACTCTGTGAGACAGATAGAATGGGGCTAAGGGAAAGTGGTTCACAGGAGCCTACTCTGGCTCTCATCATTCTGTTTTAATGGAGGGATGGTTAATTCGGAAAATTATATCAGGTTAATGGCAACTGCCAGGAAAACTAATCTACTGGTGTCAAATGAAGGAGTAAAAATGAGGCAAGGGGAGTGGAGAACTGGAAGGCCTCTTGGCAGACTATCTTTTCCTTCCTTACCTTCCTGCCGTCTTTCAGCTTGATAAGTAACTTGCCACTGCTGACTCCAACGGATTGCACAATAGCATTGGGCATCACCTTAACCCCCTCTGTAAAGGCAAACAAGACCTGAGAGTGAGCCTACAAGGCTATCACTTTCATGGGAAGTAGGAAAGCTGACCAGCGGTCTCCTCCACGGTAAAACCAATTATCAGTACACAGGCAGTTTTGGAGAGCTGCAAGAACCTACACCCATGGTTCATTTTCAGCACTTCCAGGAATTTGGGGCATCTGATTCAGAACACCTAGATGAACTTAGCTGACTGGAGAATGGTGGAAACATTTTACAGGCCAGGTGATAGGGCTTATGTCAAGGGGGTTCCTATAGAAGCGAAGTTTGCCTTAGGTCACACTCAAAGGAAATAGAGTGGCAGCATATAGAAACAGTCTCTCTACCTCGTCTGACTTTTTCCATGGTCCAGTTGCTGAGGTATTCGGGGAGGATCTTTCCCATATTTCCTTTCTCGGGGAAGAGTTGAATCACTTCTGTGCCCAAGGCTCGAGCTGGGAAGAAGAAACAGAGTAGTTACAGCAGGAAGCAAAAGTCAATCCTAGGAATACAGGAAGAGAAGTAAAGGAGCAGCAGGCAGCCCTCACTACAGACAGGGCAGAGCTGCAATCCAGGCCGAGCGCCCACTTACAGGACAGTGGGCATGAGGGCCTCGGTGCTCAAGTTCATTTGTAACGCAAATACAACAGGTATCAGAACTGCTGGCCCCAGATTAAGCTTCAGATGGTGAACTCTGTGCACTTCCACCCATGCAGTCACCTAAGGCTTACATAAGTGCTTTGCAACCTCTGAATAGGAAGCATCCTCCTGAAAAGATGCCCTGATTTCATATATCTGAAAAAGAACATTAAGAAAACTAGTTGCCATGAAACATTCCAACTGGAGCTCACAGATCTCTCAAGCTGGGAACCATCATGTGCCCAAAGAAGTTTTTGGCATTTTACAGGAAGCAGCAGTTCAAAGACACCCATAATTCTGTAGTCTGCATTGCCCTTATCATCTTCATAACTCACTTTCCTTAATATTTTATTTCTAAGGAGTCCTGGCATAGAGGGTAGAGGAAAAGAAAGGAAAGAAAGTATTGCTGTTGGCCAGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCC
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Task1_train_31076
Here’s a variant in RAB33A, AIFM1 (RAB33A, member RAS oncogene family| apoptosis inducing factor mitochondria associated 1) located on Chromosome X. What is the predicted biological effect — harmless or disease-causing?
Pathogenic; Severe X-linked mitochondrial encephalomyopathy
TTTTTTGAGACTGAGTCTTGCTCTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGGGCAGTGGCATGATCTCCACTCACTGCAGCCTCTGCCTCCTTAGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCACTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCCTGTGCCACCACACCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGGAGAGACAGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGATCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTAAGCCACTTCTCCTGGCCCACGTATTACTTTTATAACAGGTTAAAAAGATCCAGTACATCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTTGGAGGGGGAAAAAAATTCCTCCAAGGTACCTACGTCCTTAGTTGCAGAGTCCATAAACAAACACAATACACTTGTAACTAGCAATGGGGAAATTACCTCATGGTTCCTACATACTATAGTCTTGTTTATGTCATAATAGATTGTAAAAAACAGCTAAAAATAGTACTCAAGGAAAATGAAAACAGAGTAATTTTCCTTTCTAGGGAACAGGTTATAACATTGCTTCATCCTCCATCCTCCGGATTCAAGTTTGAGCAAAGGGAACAGCAGATCCATCTGAAGGCTTATGTGCATGCCCACCAGGGGTTATGCCAGTAGCTGCTGCCAATAAGTAGAACCGGAAGAGCTCTACCCCTGCAGGCATGCACACTGTTCATTTCATCTGCCACTAGCTTGCAGATGAGGCCATACCTGGTCTTCTGAATCAAGCAGTTCACACATTTCTATTCTGTACCCTCAGCCTCCAAACACTCTGACCCTATTTGGTTAGGCTGTTGATGAGCTTTAGCACACCACCGGGCAGACTTGTTCACAGGCTAGGGAGAATGAATTATGCCTGGTCATGCTGTAGCACACTTACCACCCAGATGTTAGAGCGTGCTTGTAGCTCTGCATTTACCCGGAAGCCACCAAAATCTGAGTCTATTTCCAGGCCACCAGTCTTGGCCAACTCAACATTGGGCTCCAGGCCCACAGCTGCCACTATGTGGTCAGTTTCTACCTGAGGCAAAAAAGAAATAATTCAGTCAATTACCACAGTTTCCATTTATGCCTACAGGCGTAACAATGGCCCTTCATGCCATTAAGAATTGGGACTTTAAAAAATCATGGGTTAACTTACCTCTGATAAATGGATTTTAAGTTCTATTTCATAAGCCTCCACCACCCCATCCCATGCACATCCCCCATGTCATTCGAACAGAAATCTGCCACCCTAGCCAGGACTCAAAACTCTGTGAGACAGATAGAATGGGGCTAAGGGAAAGTGGTTCACAGGAGCCTACTCTGGCTCTCATCATTCTGTTTTAATGGAGGGATGGTTAATTCGGAAAATTATATCAGGTTAATGGCAACTGCCAGGAAAACTAATCTACTGGTGTCAAATGAAGGAGTAAAAATGAGGCAAGGGGAGTGGAGAACTGGAAGGCCTCTTGGCAGACTATCTTTTCCTTCCTTACCTTCCTGCCGTCTTTCAGCTTGATAAGTAACTTGCCACTGCTGACTCCAACGGATTGCACAATAGCATTGGGCATCACCTTAACCCCCTCTGTAAAGGCAAACAAGACCTGAGAGTGAGCCTACAAGGCTATCACTTTCATGGGAAGTAGGAAAGCTGACCAGCGGTCTCCTCCACGGTAAAACCAATTATCAGTACACAGGCAGTTTTGGAGAGCTGCAAGAACCTACACCCATGGTTCATTTTCAGCACTTCCAGGAATTTGGGGCATCTGATTCAGAACACCTAGATGAACTTAGCTGACTGGAGAATGGTGGAAACATTTTACAGGCCAGGTGATAGGGCTTATGTCAAGGGGGTTCCTATAGAAGCGAAGTTTGCCTTAGGTCACACTCAAAGGAAATAGAGTGGCAGCATATAGAAACAGTCTCTCTACCTCGTCTGACTTTTTCCATGGTCCAGTTGCTGAGGTATTCGGGGAGGATCTTTCCCATATTTCCTTTCTCGGGGAAGAGTTGAATCACTTCTGTGCCCAAGGCTCGAGCTGGGAAGAAGAAACAGAGTAGTTACAGCAGGAAGCAAAAGTCAATCCTAGGAATACAGGAAGAGAAGTAAAGGAGCAGCAGGCAGCCCTCACTACAGACAGGGCAGAGCTGCAATCCAGGCCGAGCGCCCACTTACAGGACAGTGGGCATGAGGGCCTCGGTGCTCAAGTTCATTTGTAACGCAAATACAACAGGTATCAGAACTGCTGGCCCCAGATTAAGCTTCAGATGGTGAACTCTGTGCACTTCCACCCATGCAGTCACCTAAGGCTTACATAAGTGCTTTGCAACCTCTGAATAGGAAGCATCCTCCTGAAAAGATGCCCTGATTTCATATATCTGAAAAAGAACATTAAGAAAACTAGTTGCCATGAAACATTCCAACTGGAGCTCACAGATCTCTCAAGCTGGGAACCATCATGTGCCCAAAGAAGTTTTTGGCATTTTACAGGAAGCAGCAGTTCAAAGACACCCATAATTCTGTAGTCTGCATTGCCCTTATCATCTTCATAACTCACTTTCCTTAATATTTTATTTCTAAGGAGTCCTGGCATAGAGGGTAGAGGAAAAGAAAGGAAAGAAAGTATTGCTGTTGGCCAGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCCAGCACTTTGGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCCTCACCAGAACTAATCTCAGTGTTTAGCTTTTCACTATATAAACCTTAATTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCAGGTCAGGAGATCGAGACAGTCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTACAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCCTGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAATAAATAAATAAACCTTAATTAAACTCTTCCTACTGATCCTGCCAAACACATCTCTGGGATTCACAGAAAAGCTATATAAGACTAGAGAAAGAAAATCAAGGTCACTCCTCAATACTCACCCTTTCTGCCAAGAGCACAGGCCAGTTCGCTACCAAGGAAGCCCCCACCGATAATCGTAATTGATTTGACTTCCCGTGAAATCTTCTCCAAGCTTCTAAAGTCTCCAATCTGCAGGATCACATCAGTTTAGTCCATTAATTTCCAAAAGGGGCATAGGATAATAATACTAGAAAGTAGTTTCTTCTAAATCTTTGGCAAAAGTAAATTTTCTCCTTGTATAAAGTGACTCAATTATAACTTCTATGTTATTAATGCAAATTTATTTCTTCATGGTAAAATTCCTTCTATAAACAGTGGTTCTCAATTGGTGGCAGTTTTGTCCCTATCTTCCCCAGGAGGACATCTGGCAATATCTGAAGACATTTTTGGTTGTCAGGGCAAGTAGGTGCTCCCAGCATTTAGTGTGCAGAGGCCAGGATGCTGCTAACATACTACAATGGCATAAGACAGCCCCCACTACAATTATCCAGCTCAAAATGCCAATACTGCAGAGGCTGACAAGCCTTGTTCTAGGAAGAACTTAAAAGACAGTACACAGCCTGGCCAACAGGGTAAAACGTCCCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAATTAGC
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Task1_train_31077
This mutation occurs in AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 4
GGGTGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTTGGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTGTCTCTACCAAAAATACAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCTGAGACAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGTGGTGAGCAGAGATCACACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCATCGCTGTTAAGTTGCTCAGGTGACAGCTTTTTGGTCACCAAGGGATCCCTCACCAGAACTAATCTCAGTGTTTAGCTTTTCACTATATAAACCTTAATTAGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCACCAGGTCAGGAGATCGAGACAGTCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTTACAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCCTGAACCCGGGAAGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAATAAATAAATAAACCTTAATTAAACTCTTCCTACTGATCCTGCCAAACACATCTCTGGGATTCACAGAAAAGCTATATAAGACTAGAGAAAGAAAATCAAGGTCACTCCTCAATACTCACCCTTTCTGCCAAGAGCACAGGCCAGTTCGCTACCAAGGAAGCCCCCACCGATAATCGTAATTGATTTGACTTCCCGTGAAATCTTCTCCAAGCTTCTAAAGTCTCCAATCTGCAGGATCACATCAGTTTAGTCCATTAATTTCCAAAAGGGGCATAGGATAATAATACTAGAAAGTAGTTTCTTCTAAATCTTTGGCAAAAGTAAATTTTCTCCTTGTATAAAGTGACTCAATTATAACTTCTATGTTATTAATGCAAATTTATTTCTTCATGGTAAAATTCCTTCTATAAACAGTGGTTCTCAATTGGTGGCAGTTTTGTCCCTATCTTCCCCAGGAGGACATCTGGCAATATCTGAAGACATTTTTGGTTGTCAGGGCAAGTAGGTGCTCCCAGCATTTAGTGTGCAGAGGCCAGGATGCTGCTAACATACTACAATGGCATAAGACAGCCCCCACTACAATTATCCAGCTCAAAATGCCAATACTGCAGAGGCTGACAAGCCTTGTTCTAGGAAGAACTTAAAAGACAGTACACAGCCTGGCCAACAGGGTAAAACGTCCCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGTCGTGGTGGCACATGCCTGTAATTCTAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCACAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACCGCACTCCAGCCTGGGTGATAGAGCGAGATTCAGTCTCGAAAAAAAAAAAAAGACAGGACAAATCTTATCCCTGAAAAATGACAGCAGTTTTTATAAGCACAGTGTTAAGAAGCAGAACACCTCCTTGCTTTTTATTTAGGTACTCTTAACTTTTTTCTCAGAAGTCTCTACACAGCACTTGCAATGAAAAATGCCAAGAGGCTGTAAGGGGTTCCAATGAATCAAACACATCAGGAAAAAACAACTATGGAAGAGCAATCAGAAGGATCTATTGCAAGCAATACAAACACTCCATTTTTTCCCTAGGAGCTTAAAACCCTTGAGTGAGGTATCTGAGGTGCAGAGAGAGGAAGTGACTTGTTCAAGGCCAGATAACAAGTCTGGAGAAGAGCCATAAATAGAACTTGGATCTCCCAAGTCCCGGGTGGGCACTTGGGGACTGCAAGATTATACTACTTCTTCAAAAACAACACAAGGAAAACACTAAAGCAGACAATTACCTTTCTGAAAAGCGTTGTTCTACTCTTCACCTCTGCTCCAGCCCTATCAATGGCAGACAGACTTCTTGGAGTACCTCCTGGAAATAAGAGAAGGAAAACCCTTTAGCCCAACAAGCAGGAGCCAGCCCAAACAATACTCCCTCCACCACACAAAGGTGGAGCCCTCTTCACTTAGCACCATGGCGGCAACAACAGGATAGGATACCAAGGCTTTGTTTGCCTTCAGCTTGCCTCACAGCAGGCTTTCTGTCAGTTTCCTTTGAGAAGCAGATTTGAGAGTCTGTCTTCAAGGGGTACACCCTGCCCCTAGGTGGCCAAAAGGCCTTACTTTTGGCTTCCATGTTCTCTTCTAGTTTCTCATGAGGATTTGCCAGCTAGCATAGCTACATGGGTTTGATAAATTGCTTCTGTCTCCTCTCTTGGTTTCTGATTGCAACTGGCAATGAAGCCACAAACGACATCACTTTCAAGGCACAGGGCACAGGGTGAGGGTTAAGCAGGGAGAGAAAAAAGGGCAACTTCTTCATGCCTCTACCGGGAGAACAGCAAGGATCATCCAGAAGGGCTGGTGATCCAGGATGCTTTGACACAGCCAGCTTTTGTACCAAGAGAAGACACTCACTTCAGAGAGTCTGGGTTTCCATTTTCTTAAGTAGTAATGCCTTCCATAGAGAAGGCTGGACTCTAAAACTTGAATGAGCTGTATCAGGGAAGAAAGCCATCTCCAGAAATGCTCACCTGTTGCAATCAAGCACTTTTCATAGGTTATTTGAGAGCCATCATTAAGTTTCACCATGTTGTCTCTCACATCCAGCTGTACTACCTGGTACAGTCACACACATACACAAAAGAGGTAGAGATGAATTAGCATTGAAAAAGTTTTATTGAGATATAATTCACATCAAATTCACCATTTTAAAGTGTGGAATTCTGTGGATTTCAGTATATTCACAAGGTTGTGCCACCATCACCACTATCTGATTTCAGAACATTTCCATCACCACCCCAAAACTCCAGGTCAATAAGAAGTTGTCAGCCCAGGACAGGCACAGTGACTCATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACTGAGGCCACGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGTGGCGGCATATGCCTGTGGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCCCAAAACCACAACAACAAAAACAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAGTTGTCAGCCCAATAAGAAGAATGAGTTCTTGACCTAAAGCGATCCTTAAGAAACCATATCCAAGTAATCATGGGAACCACAGTTTCTGGTACCCAGTTTTTTTAGGCAGTCATATGTTGGAAATTGGCAATGAGAAGGCAGGCAACATTAGAGCAAGTCATGACAGTCCCAAAGCCCTGACCCATGTGTGGAAAAGGAGAATCGGAACAGCCTTTCTTATATGGCTGTTTGGAATTACTTATTATTACTTTATTAATAAGTCTCCTACATCTACAACATTTTTACAGAATGCTTTCTCCAACTTGTAGCCTTCACGGAAACTTGGCTCTCTCTTAAGGAGAGCTTACACATAGAGGCTGTTCGTTCCCCCACACTCCACATCACAAGGCCAGGAGGAGGTGTTGGCATTCTGCAAGCTTCTTGAGGTTACTGGTCTGCTGCTTCCAGATTCTTGTACTTTCATTCTCTTCTGAGGGACATCAGAGGAGTCCTATATTCCTACGAATCACTGTTTTGAGCCACCTCCTGGCTACTCCTCCTGATTCACTGAAGACCTTGGAACCTGGCTCATACTTTTCCTCATCTTGTTATCTCCTAAACCTCTCCTCCTACCTCAATTATTCTACTTGTTGGTCACAATTTTCCATCCCTTCAGCTTTCGCTCAGTCTGTCTCCTATGCTTGCTTTCAATTTTCTCTGTTTATTTGACTAGCTGCTCCATTCTAACTAA
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Task1_train_31078
This mutation occurs in AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Does this change lead to a known medical condition, or is it benign?
Pathogenic; Deafness, X-linked 5
TTAATTAAACTCTTCCTACTGATCCTGCCAAACACATCTCTGGGATTCACAGAAAAGCTATATAAGACTAGAGAAAGAAAATCAAGGTCACTCCTCAATACTCACCCTTTCTGCCAAGAGCACAGGCCAGTTCGCTACCAAGGAAGCCCCCACCGATAATCGTAATTGATTTGACTTCCCGTGAAATCTTCTCCAAGCTTCTAAAGTCTCCAATCTGCAGGATCACATCAGTTTAGTCCATTAATTTCCAAAAGGGGCATAGGATAATAATACTAGAAAGTAGTTTCTTCTAAATCTTTGGCAAAAGTAAATTTTCTCCTTGTATAAAGTGACTCAATTATAACTTCTATGTTATTAATGCAAATTTATTTCTTCATGGTAAAATTCCTTCTATAAACAGTGGTTCTCAATTGGTGGCAGTTTTGTCCCTATCTTCCCCAGGAGGACATCTGGCAATATCTGAAGACATTTTTGGTTGTCAGGGCAAGTAGGTGCTCCCAGCATTTAGTGTGCAGAGGCCAGGATGCTGCTAACATACTACAATGGCATAAGACAGCCCCCACTACAATTATCCAGCTCAAAATGCCAATACTGCAGAGGCTGACAAGCCTTGTTCTAGGAAGAACTTAAAAGACAGTACACAGCCTGGCCAACAGGGTAAAACGTCCCTACTAAAAATACAAAAAAAAAAAAAATTAGCCGGTCGTGGTGGCACATGCCTGTAATTCTAGCTACTTGGAAGGCTGAGGCACAAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGCACCACCGCACTCCAGCCTGGGTGATAGAGCGAGATTCAGTCTCGAAAAAAAAAAAAAGACAGGACAAATCTTATCCCTGAAAAATGACAGCAGTTTTTATAAGCACAGTGTTAAGAAGCAGAACACCTCCTTGCTTTTTATTTAGGTACTCTTAACTTTTTTCTCAGAAGTCTCTACACAGCACTTGCAATGAAAAATGCCAAGAGGCTGTAAGGGGTTCCAATGAATCAAACACATCAGGAAAAAACAACTATGGAAGAGCAATCAGAAGGATCTATTGCAAGCAATACAAACACTCCATTTTTTCCCTAGGAGCTTAAAACCCTTGAGTGAGGTATCTGAGGTGCAGAGAGAGGAAGTGACTTGTTCAAGGCCAGATAACAAGTCTGGAGAAGAGCCATAAATAGAACTTGGATCTCCCAAGTCCCGGGTGGGCACTTGGGGACTGCAAGATTATACTACTTCTTCAAAAACAACACAAGGAAAACACTAAAGCAGACAATTACCTTTCTGAAAAGCGTTGTTCTACTCTTCACCTCTGCTCCAGCCCTATCAATGGCAGACAGACTTCTTGGAGTACCTCCTGGAAATAAGAGAAGGAAAACCCTTTAGCCCAACAAGCAGGAGCCAGCCCAAACAATACTCCCTCCACCACACAAAGGTGGAGCCCTCTTCACTTAGCACCATGGCGGCAACAACAGGATAGGATACCAAGGCTTTGTTTGCCTTCAGCTTGCCTCACAGCAGGCTTTCTGTCAGTTTCCTTTGAGAAGCAGATTTGAGAGTCTGTCTTCAAGGGGTACACCCTGCCCCTAGGTGGCCAAAAGGCCTTACTTTTGGCTTCCATGTTCTCTTCTAGTTTCTCATGAGGATTTGCCAGCTAGCATAGCTACATGGGTTTGATAAATTGCTTCTGTCTCCTCTCTTGGTTTCTGATTGCAACTGGCAATGAAGCCACAAACGACATCACTTTCAAGGCACAGGGCACAGGGTGAGGGTTAAGCAGGGAGAGAAAAAAGGGCAACTTCTTCATGCCTCTACCGGGAGAACAGCAAGGATCATCCAGAAGGGCTGGTGATCCAGGATGCTTTGACACAGCCAGCTTTTGTACCAAGAGAAGACACTCACTTCAGAGAGTCTGGGTTTCCATTTTCTTAAGTAGTAATGCCTTCCATAGAGAAGGCTGGACTCTAAAACTTGAATGAGCTGTATCAGGGAAGAAAGCCATCTCCAGAAATGCTCACCTGTTGCAATCAAGCACTTTTCATAGGTTATTTGAGAGCCATCATTAAGTTTCACCATGTTGTCTCTCACATCCAGCTGTACTACCTGGTACAGTCACACACATACACAAAAGAGGTAGAGATGAATTAGCATTGAAAAAGTTTTATTGAGATATAATTCACATCAAATTCACCATTTTAAAGTGTGGAATTCTGTGGATTTCAGTATATTCACAAGGTTGTGCCACCATCACCACTATCTGATTTCAGAACATTTCCATCACCACCCCAAAACTCCAGGTCAATAAGAAGTTGTCAGCCCAGGACAGGCACAGTGACTCATGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACTGAGGCCACGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTGGCCAGGTGTGGCGGCATATGCCTGTGGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAACCCCAAAACCACAACAACAAAAACAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAGTTGTCAGCCCAATAAGAAGAATGAGTTCTTGACCTAAAGCGATCCTTAAGAAACCATATCCAAGTAATCATGGGAACCACAGTTTCTGGTACCCAGTTTTTTTAGGCAGTCATATGTTGGAAATTGGCAATGAGAAGGCAGGCAACATTAGAGCAAGTCATGACAGTCCCAAAGCCCTGACCCATGTGTGGAAAAGGAGAATCGGAACAGCCTTTCTTATATGGCTGTTTGGAATTACTTATTATTACTTTATTAATAAGTCTCCTACATCTACAACATTTTTACAGAATGCTTTCTCCAACTTGTAGCCTTCACGGAAACTTGGCTCTCTCTTAAGGAGAGCTTACACATAGAGGCTGTTCGTTCCCCCACACTCCACATCACAAGGCCAGGAGGAGGTGTTGGCATTCTGCAAGCTTCTTGAGGTTACTGGTCTGCTGCTTCCAGATTCTTGTACTTTCATTCTCTTCTGAGGGACATCAGAGGAGTCCTATATTCCTACGAATCACTGTTTTGAGCCACCTCCTGGCTACTCCTCCTGATTCACTGAAGACCTTGGAACCTGGCTCATACTTTTCCTCATCTTGTTATCTCCTAAACCTCTCCTCCTACCTCAATTATTCTACTTGTTGGTCACAATTTTCCATCCCTTCAGCTTTCGCTCAGTCTGTCTCCTATGCTTGCTTTCAATTTTCTCTGTTTATTTGACTAGCTGCTCCATTCTAACTAATTTGGGCCAATGGTAGAACACCCAAACTGTTCTTTTGCCAGTACCTTTAATTCCCTTGCACCCTACTCCTTCTTATGGTTAAGAGCTTGAGCTTTGGAGTCAGAGAGAATAGGGCCCCAGTCTTTGCACCACTCTTTACTAGCTGAGACCATTCAATTAAGCACCTACTATGTATCAAGTTGAGACAGTGATCCTTGCTGCTTTCAGAGTTTAGTGGCCAAGACAATTTAACAAGCACTAACAATAATCAAGAGTGACAAATGTGATGTAAGTGGTAAGAACAGTGCAGGTAGCGCTGGGAACATATGACATGTGCAATCTAGTCAGGTTGGGTTGGGTAAAGCTTTCTAGAGGCAATGACATGAACTGAGATCTGATGGATAAGCAGCTTCTTTAGCCTCCTTTGATTTGTCCTTGGTAAGCTCCCTCTTCAATCCAATCCCGCTACTCAACCCTCACGGTGTTCGCTCTCAGATAACCATCTTATGTTCTATTGTATTGCAAAAACAAATGAAGCCATTAGATGTGATCTTCCATAGCTTCCCATGAGGCATGAGGGCTCCCCACCACCCCCGTCCAGCCTATTAACATGCTTGTCCCATCCAATAGGTCCCACCTTTGATTCTATGTCCTCTTCACGCTTTTATCCGATTGCCATCTCTCTTTT
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Task1_train_31079
A sequence alteration has been identified in AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) on Chromosome X. Is it disease-inducing or harmless?
Pathogenic; Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Bieganski type
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Task1_train_31080
This variant lies on Chromosome X and affects the gene AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family). Based on this context, is the mutation pathogenic or benign? If pathogenic, what disease does it cause?
Pathogenic; Spondyloepimetaphyseal dysplasia, Bieganski type
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Task1_train_31081
Given this context: Chromosome X, gene AIFM1, RAB33A (apoptosis inducing factor mitochondria associated 1| RAB33A, member RAS oncogene family) — does this variant present pathogenic behavior, and if so, what disease does it relate to?
Pathogenic; Charcot-Marie-Tooth disease X-linked recessive 4
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Task1_train_31082
A variant was discovered on Chromosome X, affecting IGSF1 (immunoglobulin superfamily member 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; X-linked central congenital hypothyroidism with late-onset testicular enlargement
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Task1_train_31083
Here is a variant affecting IGSF1 (immunoglobulin superfamily member 1) on Chromosome X. Please identify whether it is a benign mutation or associated with a disorder.
Pathogenic; X-linked central congenital hypothyroidism with late-onset testicular enlargement
ATTAACACTCTATCTTTCTCCTCTTGGGCACGGTAGTTCCCCTCCGTGGCCTAGCCTAGCCTTCCAGGAGGAATTACTCTCCCTAACCCCTTCTCCAATGATCTCCATCCCAGTCCCATGTCCGGTCGGTCCTTACCAGTCACCCAGATCATAAGGGGCATACTGAGATATGACCCCCTGTTTGACATGGTTGTCTCATAGTAGATACAGCTATAGTTCCCAGAGTCCTCTGCTCCAACAGTGTGGAGAAGGAAGTCAGCTGAGTTCCCTGAGACACTCCGAAACTGTAAGGGAACATGGGCTCCCTCCTGCAAGAGGGCGAACCTCATGCCCTGGAAAGTCCCTTGGCAGCGCAGGATCACACTCTTCCCAGGAAACACCACAGGACCTGGCTGTGCCAGGAGAGTGGGTTTGGGGTAGAATTCTGAAATTAAAGAGACCACAGCATGAGATAAACCCAGCCCTCACATCCTGCAAATAGCCTTTTAAAGTGTTATTGTAAGACACAATATATGTTTGTTGTTAAAAATTAGAAAATATAGAAAAAAAAACTAATGAAGGAAACACAATTCTACCACTCAAAGATAAATATTTTTAATATTTAATTGCCATTTATTCTTTCCATATATTCCCATGTCCATGTAGCTATAACTGTTTACATAATTGGGACTCCACTTATGCACAGTTGTGTAGTTGTGTAGTATGCAGCTGACATTTCAAGGTCTTCTCCCTTTCTCTGAGAGCCATCCAGCCCACCGGTCTCTGACAGCCCAGCTAGAGAAAAAGTGGACATTGAGCCTAAAGCTCAATGCCAAGCCATAAAAATGTGCAGAAATAGGGCAAGTTGAACCGAGCTCTTGGGATTAGACACCCCCATCTACCTCATTTATTTCCCCAGAAGTGAATTGCTTGCCTCCCCACTGCCTTTGTTTCTTGTTCCTGTAATAATAACATGAGCAGCTGTGCATCATGGACTGGTCACTATGGGCCAGCCGCTGTCCTAAGCACGTTCTCAGTGTGTTTTAGAAGAAACATTTCTTCCTCTCCCACTGACAGCCTTCCACCCACCATCCCAGGGTTGGCACCACCTCTACCTGGAGTCCCCCCTCCTAACCTGTCACCACGAGCTCCACAGGGTCGCTGGGCTCAGACCAGATAGAAAAGTCATAATATCGGCAGCTGTAATTCCCTCCATCACCAATGCCCACCGAAATGATTAGAAAGTGAGCTGCACTGGCCCCCGGACTTGCCCAGGACCTGTCACTGGATGCTATTTCACTTCCATCTTTGTAAAGAATAAAGCTCATATGCTGGTGGGGGGTGGAGCAATTGAAAGTCACTCGGGCACCAGGGGTGACCACAGGGCTGGCCCATGTCTTGAAGAAGGGCTTAGGGTACATTTCTAGAAGGCAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAACAAAATACAACACAAAACCAAATTAAGAACAAGAAAGAGAGAAAGCAAATATAGCAAATATTGGTTCTCGGAGGCTTCTTTGCTTTTAAGTAAGTGCATTTAAAAAGTAAGGTAAATCCACTTTGCAGATGGACTTCTCACACAGGGACCCTTCAACCCCACCCCTCACTACCTCCAGATGAGTCCTCAGTGTGATCAGGGCAGGCAATGGAGGCTAGTAAAAAGGTAGAATTTTTCTTGGGGTTCTGCTGATTCTCTGAGCCTCAGTTTGCCCATTTGGACAAGGGGAAAATGGTACCTGCTTCACCCACCTTGAAGAGTTGCTCTATGGTGAAGTGAGATAATTGATGTGAAAATAATTAGAAAAATTAAATCACCCTCCACGAACCAAAGCTATTAATAACGATTATGGCTATTAATATCGTGCAGCCAGAGGCCCTGGCACTCCCAGCGCCACGCCTGCCTGGCTCTAAGATTGGACACAGGCTCTCAGGACCAGCAGCAAAGTTTGCTGCAGGGAGAGGAGTGTCTGACCCAGGGCTTTGCCTTTCCCTCCACCCTGCCCCCTTTCCTCCCACACCCTTTTCAGCTCTACCTTTTATGACAAGCTCCAGCGGCTCACTGGGCTCAGACCACTTGAAGGGGCGTTTTTCAGTGTGAGTGCGGCAGCTGTAATTGCCTTCGTCTTTATCCTCCATTCTCTGGATTGTAAAGAAGGCTTCTCTTCCAACAGCACCAAGTTGCTGGACAGGTTCTTGCTCTCCCTCCTTATACAGAGCAAACCCCATGCCTGCCAGCCATCCTTTGCACCGGAGTTGTAGTTCCTGGCCCCGGATTGTGGGGGAAGCAGAAATGACAGGTTTGGGGAGGATGTCTGGAAAACAGAATGGGGTGAAAAAGGAGTCAGAAGTTTGCAGTTGCCCAGATGGGATACTCAGGGTCACTTTGTCAGCAAATAAAGACATTCATTCTGGGCTGGCCCTAGGCTCTTCCAGTCAGTCTCCTCACACTCTCTTTCCCATTCCGCCCCTCCCCCTACCCCATAACCCCCTACCATTTCAGTGCCCCTCCTCTCCTACATGCAGCACGAGCCCCTTGGGCTCCAGGGTCCCTGTGAGTTCATTCCCTCACTCCCAGGAGCAGTGTTGGAGTCCCAGGGGCACTGGGGATAACTCCCGGAGACCCTCTACATTTTCTTACCTGTCCCCACCAGCTCAAGTGCCTCACTGGGCTCCGATACAGCCATCTCCTCCCATGAATGGCAGTGGTAGCTCCCGGTGTGGCTCTGGGTCAGGGCGCCAAGGGGGAAGGCAGCCCGGACCTGCTCTGAGGCCGGGCGAGTGGCGATCCACCCGGTCCCATCCTTCAGCAACACAAACTCCTTAGTTGAGCCAGAAGGGCTTCTGCACCAGAGGGTTAAGTTCTTCCACGGGGCCAGAGGAAAGTTGGTCTCTGCCCACAGCTCAGGCTTAGGGGTTGGCATGACTATTTCTAGAAACAGCAGAATTAATGAAGCCATCCTCCCGCCTCCCTTCCCCTCCCTCCTCCTTGCCCTTGAACCCTCTACCCAGATCACACTGCCCACCTCCCCTTGCAACCCAAATCCAAACCCTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTCAGGTGCTGGGGAAAGGGGAAGCTGGTGTCTTATAGCTGAGCCTCAGAAAAGTGCAGAAGCTTGGAGGAAATTTTGCAGGCAGAAAGGCAAAGTTGGAGGCTGAATTTTGCCAGCAGCTTTAGCAAGTGCCCCTTCCTGGCTGCCCTTCCCTCCCAACCAGCCACTCCCTGGCCAATGACACTGACGCTCTGTAGTTATTTCGGATCTCCAGGGAGGAATGTCCCAGTCTGGAGCAGGAAAAACTCACCAGTCTCTTCTATCAATACCCCATTGCACAGTCCTGCAAAAGAAATTGCTGCCAGGACTCGGCCCCCTCCCCCACCGGGACTTCACCCCGGCCTTCTGCCCGGGGCCCCTTCCCCCACTTGTACTCACCACAGCAGAGAAGGGCCGTGACTATGAAGAGCATGGTGACCCCTTGAGCTGTTCCCAGCAACCAGGCTTCTCTAGTGAGACCAGAAAAGAGATGAGAGGAGTTGCTGGGATGAGGGGGAGGGTGGAGGAAAGGGGGCGGCAATTTATGTCATTGGCTTACTCGCTACCCAATGGGGACTGGATATGGCCAAGATAATGGGATATAATCTTATTTGACATCAATGACTTTTCTTTTTGAGGGCCTTACCACCTACAAACCTCTTGCTCTTTCATGACCCACGTGTCCCCCCCGCCCCCTCCCCACTCCGCAGCCTATATCATATGTCAGCTCCCCATGGCCCCTGATTAGGTTGTTGCTGGAATTGAGATGTCAGATGGGAAAATGCTTTTATATTATTTGGAGCTCTCAGAACCCCTGGAGCTCATTGTGATCGGCAGCTCTGGGTGGTGTGTGTGGGGGTGGAGGGAGAAACTGTGAGTATTTCTCAGTCATCAAGTTTAAGTTCGGAAGCAGTTGTTGTGGCAGTATTGGTCCTCAGACCCACCTGCCTCACCTGCCTTTGTTATGGAAGGGTTGCCTAGGCAGCTGTGATGAATTACTAGAAGATTGGCAGTGCCGAGCCAAGCTTTTCAGAGAGTAGAAACTCTCC
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Task1_train_31084
A variant was discovered on Chromosome X, affecting IGSF1 (immunoglobulin superfamily member 1). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
TTGGGACTCCACTTATGCACAGTTGTGTAGTTGTGTAGTATGCAGCTGACATTTCAAGGTCTTCTCCCTTTCTCTGAGAGCCATCCAGCCCACCGGTCTCTGACAGCCCAGCTAGAGAAAAAGTGGACATTGAGCCTAAAGCTCAATGCCAAGCCATAAAAATGTGCAGAAATAGGGCAAGTTGAACCGAGCTCTTGGGATTAGACACCCCCATCTACCTCATTTATTTCCCCAGAAGTGAATTGCTTGCCTCCCCACTGCCTTTGTTTCTTGTTCCTGTAATAATAACATGAGCAGCTGTGCATCATGGACTGGTCACTATGGGCCAGCCGCTGTCCTAAGCACGTTCTCAGTGTGTTTTAGAAGAAACATTTCTTCCTCTCCCACTGACAGCCTTCCACCCACCATCCCAGGGTTGGCACCACCTCTACCTGGAGTCCCCCCTCCTAACCTGTCACCACGAGCTCCACAGGGTCGCTGGGCTCAGACCAGATAGAAAAGTCATAATATCGGCAGCTGTAATTCCCTCCATCACCAATGCCCACCGAAATGATTAGAAAGTGAGCTGCACTGGCCCCCGGACTTGCCCAGGACCTGTCACTGGATGCTATTTCACTTCCATCTTTGTAAAGAATAAAGCTCATATGCTGGTGGGGGGTGGAGCAATTGAAAGTCACTCGGGCACCAGGGGTGACCACAGGGCTGGCCCATGTCTTGAAGAAGGGCTTAGGGTACATTTCTAGAAGGCAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAACAAAATACAACACAAAACCAAATTAAGAACAAGAAAGAGAGAAAGCAAATATAGCAAATATTGGTTCTCGGAGGCTTCTTTGCTTTTAAGTAAGTGCATTTAAAAAGTAAGGTAAATCCACTTTGCAGATGGACTTCTCACACAGGGACCCTTCAACCCCACCCCTCACTACCTCCAGATGAGTCCTCAGTGTGATCAGGGCAGGCAATGGAGGCTAGTAAAAAGGTAGAATTTTTCTTGGGGTTCTGCTGATTCTCTGAGCCTCAGTTTGCCCATTTGGACAAGGGGAAAATGGTACCTGCTTCACCCACCTTGAAGAGTTGCTCTATGGTGAAGTGAGATAATTGATGTGAAAATAATTAGAAAAATTAAATCACCCTCCACGAACCAAAGCTATTAATAACGATTATGGCTATTAATATCGTGCAGCCAGAGGCCCTGGCACTCCCAGCGCCACGCCTGCCTGGCTCTAAGATTGGACACAGGCTCTCAGGACCAGCAGCAAAGTTTGCTGCAGGGAGAGGAGTGTCTGACCCAGGGCTTTGCCTTTCCCTCCACCCTGCCCCCTTTCCTCCCACACCCTTTTCAGCTCTACCTTTTATGACAAGCTCCAGCGGCTCACTGGGCTCAGACCACTTGAAGGGGCGTTTTTCAGTGTGAGTGCGGCAGCTGTAATTGCCTTCGTCTTTATCCTCCATTCTCTGGATTGTAAAGAAGGCTTCTCTTCCAACAGCACCAAGTTGCTGGACAGGTTCTTGCTCTCCCTCCTTATACAGAGCAAACCCCATGCCTGCCAGCCATCCTTTGCACCGGAGTTGTAGTTCCTGGCCCCGGATTGTGGGGGAAGCAGAAATGACAGGTTTGGGGAGGATGTCTGGAAAACAGAATGGGGTGAAAAAGGAGTCAGAAGTTTGCAGTTGCCCAGATGGGATACTCAGGGTCACTTTGTCAGCAAATAAAGACATTCATTCTGGGCTGGCCCTAGGCTCTTCCAGTCAGTCTCCTCACACTCTCTTTCCCATTCCGCCCCTCCCCCTACCCCATAACCCCCTACCATTTCAGTGCCCCTCCTCTCCTACATGCAGCACGAGCCCCTTGGGCTCCAGGGTCCCTGTGAGTTCATTCCCTCACTCCCAGGAGCAGTGTTGGAGTCCCAGGGGCACTGGGGATAACTCCCGGAGACCCTCTACATTTTCTTACCTGTCCCCACCAGCTCAAGTGCCTCACTGGGCTCCGATACAGCCATCTCCTCCCATGAATGGCAGTGGTAGCTCCCGGTGTGGCTCTGGGTCAGGGCGCCAAGGGGGAAGGCAGCCCGGACCTGCTCTGAGGCCGGGCGAGTGGCGATCCACCCGGTCCCATCCTTCAGCAACACAAACTCCTTAGTTGAGCCAGAAGGGCTTCTGCACCAGAGGGTTAAGTTCTTCCACGGGGCCAGAGGAAAGTTGGTCTCTGCCCACAGCTCAGGCTTAGGGGTTGGCATGACTATTTCTAGAAACAGCAGAATTAATGAAGCCATCCTCCCGCCTCCCTTCCCCTCCCTCCTCCTTGCCCTTGAACCCTCTACCCAGATCACACTGCCCACCTCCCCTTGCAACCCAAATCCAAACCCTTTCCTTCTTTCCTTCCTTCCTCAGGTGCTGGGGAAAGGGGAAGCTGGTGTCTTATAGCTGAGCCTCAGAAAAGTGCAGAAGCTTGGAGGAAATTTTGCAGGCAGAAAGGCAAAGTTGGAGGCTGAATTTTGCCAGCAGCTTTAGCAAGTGCCCCTTCCTGGCTGCCCTTCCCTCCCAACCAGCCACTCCCTGGCCAATGACACTGACGCTCTGTAGTTATTTCGGATCTCCAGGGAGGAATGTCCCAGTCTGGAGCAGGAAAAACTCACCAGTCTCTTCTATCAATACCCCATTGCACAGTCCTGCAAAAGAAATTGCTGCCAGGACTCGGCCCCCTCCCCCACCGGGACTTCACCCCGGCCTTCTGCCCGGGGCCCCTTCCCCCACTTGTACTCACCACAGCAGAGAAGGGCCGTGACTATGAAGAGCATGGTGACCCCTTGAGCTGTTCCCAGCAACCAGGCTTCTCTAGTGAGACCAGAAAAGAGATGAGAGGAGTTGCTGGGATGAGGGGGAGGGTGGAGGAAAGGGGGCGGCAATTTATGTCATTGGCTTACTCGCTACCCAATGGGGACTGGATATGGCCAAGATAATGGGATATAATCTTATTTGACATCAATGACTTTTCTTTTTGAGGGCCTTACCACCTACAAACCTCTTGCTCTTTCATGACCCACGTGTCCCCCCCGCCCCCTCCCCACTCCGCAGCCTATATCATATGTCAGCTCCCCATGGCCCCTGATTAGGTTGTTGCTGGAATTGAGATGTCAGATGGGAAAATGCTTTTATATTATTTGGAGCTCTCAGAACCCCTGGAGCTCATTGTGATCGGCAGCTCTGGGTGGTGTGTGTGGGGGTGGAGGGAGAAACTGTGAGTATTTCTCAGTCATCAAGTTTAAGTTCGGAAGCAGTTGTTGTGGCAGTATTGGTCCTCAGACCCACCTGCCTCACCTGCCTTTGTTATGGAAGGGTTGCCTAGGCAGCTGTGATGAATTACTAGAAGATTGGCAGTGCCGAGCCAAGCTTTTCAGAGAGTAGAAACTCTCCCCTCACCCAGATTATAACTAGAAATGTGCAGCAGCTTTGGGTCATGAGTCTTGTAGTATTAGATGATATTAACCCAAAATCCATCGGACAATTTTTACTTAGAAAACACTGACCATCCTTCCTGGTGAGGAAAACATGATTTTCAAGCTGCTTTCTCTGAAATCTGGTTCCTGATCTTATTCTTTGATGCAGTGTTGCTGGGCTGGGGTGGGGCACATAAAGCTACATTTTTTTTTTTTTCTAACCACTGGCTTGGAGATTACTCTAATGAGTACGGGACCCAGGTCAGGTTCCGGAAAGAAGTAGAACTTGACCCCTGCTGAAACTTTTTGAAAACTCAAAGGGTGGTGGTTTTTGCAGAAGGCTTAGGTGGCTCCCTTCTGATTGCCCAAGTATTCTGTCCCTCAGATTCCAGTGGAAAACACAGACACATGTAATCATAATCATAATCCATTGTGCATTGAATACTTCCAGACACACTGACCACAGTTGCAGGGCGGGGGGTACAGCCAGAAGCAGGGAGTAGGGGGAAGTAGACAAGGTATTCAGGAGCTAACATCCCTACTGGGTCAGAAGTGGTCATTTCTCTCCTTGTTCCCAGTAGAGTAGCCTGAGCACAAGCCATGGGGATGAGAGAGGCAGATGGCCCAGAGCACACCACAG
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Task1_train_31085
A variant found in Chromosome X affects FRMD7 (FERM domain containing 7). Please analyze its biological impact: is it benign or pathogenic, and what condition might it cause?
Pathogenic; not provided
CCTCGTTTATTGTTGAAATCAAAAGACTAGATGAATGACATATGTCATGAATCTTTGACCATCACAATGATAATACCCACTTATTCAAGGACCAGGCAGAGAACAACCTCAACTACTCAGAACGCAGGTAATTTTTAAAGGCCTCTGAACAGGGTTACATAACAGCTAAAAATTGTGGGCTTTAAAAATAATATACCTGGTCTGGGCATGGTGGCTCACACCTTAATCCCAGCCCTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATGACTCGAGCCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTCATCTCTACAAAAATAATAAAAATTACCCGGCCATGGTAGTGCATGCCTGTAGTCCCTACCACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTGGGAGGCAAGGCTGCAGTGAGCGGAGATCATGTCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACACAGCGAGACCCTGTCTCAAATAATAATAACAATATATTTCCCTTTAAAGGCTTTTCCTCTACCTCCAAATCAGAGTCAACTGACTGATTTTCCATACTACTTTCAATGAGGTTACTTATCTGGTTTCCCAGTCCACAGCAGAAGAAAAGCAGCTAAATGAACAGTAGAAGAGGATTGTTCTAGTTAGGCATACACTAACAAAGAAAGTCAGATCACAGCCGGGAGAAACATAAAAATCAAAAAAAATCACAAGAATTAGCCAGGCACCATGGCTCACACCTGTAATTCGAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATTACAAGGTCAGGGGTCCAAGATCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCCGTCTCTACCAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGCCCGCGCCTGTAATTCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGCAGAGAATTGCTTGAACATGGGAGGCGGAGATTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCCATCTCAAAACAAAACAAAACAAAACAAACAACAACAACAAAAAAAAACACAAGAATAATAAAGTCTAAAGAGTCTGGATGATTTATCACCTAAGTACAGGGCCTTGACATGCATCCCCTGCCCTGAGGCCATTATTGCACTACAGCTGCCTGCAAAAGATCATATGTGATGTTTATAATAACTCAGGTCATTAAGAAAGGGGCAAAATATGCTCAGTATCATCTATTTAAGAAGGCAGGGATTCATAGAATACAGACTGGAAAGATTCAATCAGAAATATGTAAGTTTTAACAGATCTTAATTTTTACTGGGGTAGGATATCACTCTTTGGAAAAAATCCTGTATGGGGAAGCTTTTAATCAGAATTTTGTACCTAGCTAAAAGTTTTGAAAACTTCCTCCAACGGATTCCTAGGCTGACGTATTCAAGTAAAGACAAGATCTTTTTTTTTATTTTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAACGTGCAGGTTTGTTACATATGTATGCATGTACCATGTTGGTGTGCTGCAACCATTAACTCGAAAGACAAGATCTTAACCCAACCTTGCTTCAATTCCTCCAAAGTGTGACCTGTAGTGAGGATTCTCTAGTGGCATATTGTTCAATCTTCTAAATCTCTTATCCCCTCCAGTGCTTTCTCATGCTAGCTTTTACAACCCAAAGGATGCTGTTGAGCTTTTTCTTTCCATGGTTTGCATATAAGTTAAATATAGGAGAAACAATGGGTTTATAGAACATGTATTCTCAAACTGCACACATCCGCCCATCCTTGCTGAGACTCTGATCCTACCCCTTAGGTAAGGTGCCCCCATCTTCCTCCCTCCTAGTTAGAAAACATTGACTTAATGTGTCATACAGAGAATGAGCAGGAAAGGGTGCAATCTTTGATGTGATTGAAATGGATTCTTTGTTGCTTCTAGAATGTGAACTCCTCCTAAGCCTCCTGTGTTATTGAAAAGAAGCAGTGTGAGCAGTTTGCCTATGTGCATTGTTTAATTACCTATAGCGGAAACTGGAACCCTTGCTGCAGAGTAGGGTTTTGGGCTTTGATTTGGGCTCTTCCGAAAGCCTGAAGAAAGCATGGTATTCCACACAAGTCTTCCAGAAAGCCTTGCAGGCATCTCGGCTGGCCATGGTGAACTCCAAGGTATCCTTGCACAACACCTGTATAAACCAATTTCCATTAAGTAAAACATCCTTCAAGAATATCAAAGACCTTCAAATCCCAATGCCTTCCAAACTATTGCTCCGTTGGCCCATGCAGCTTCTGATTTTCCACTTGGCTCCCTGTAGGTTTCACACCTGCTGAAACCTAATGATTGGCAACCTTGCGAGGAATAGACAGGGCCACTGCTCACAAACAGAGCCTTCTCTAAGAAGCAAATATTGCTTTGCACACTCCCCTCACCTTAAATACCTTTTTTACTCACTCTTCTCTGCCAGAAACATTTTTATGAAGTAAATTAGATTAAAATCATGTCAAAGGGCATCTTTTCAAGGTGAGAAGTTATAAATGACCAACAGGAAACAGGAGGGAGGAGAAGATTTCCTTATAGATGGAAGGGTTTATAAGATGATTACATGTACATAAGTCTGTTGTTTTCTTGAGACAAGGTGTCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCATCACTCACTATAACCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCTTCCTGACTCAGCCTCCTGAATAGCTAGAACTACAGGCATGTGCCACCATACCCGCTTAATTTCTTTGTAGTTTTTTTTGTTGAGATGGGATCTTGCTATGTTGCCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAAGTGATCCTTCCACCTCAACCTCTTAAAGCACTGGGATTATGAACGCAAGCCACTACACTCAGTCCATGAGTCTTTTTAGTGTAACAGTTAGAAACACTTTTTCCTCTATAGGTTGTCTTGTACAATGCTCTATATTGCTCATCTAGCATATTCTAATCTTGGCTTTCCAGACCTAAAGTTCGAGTTTTCCCCATCTCCTGACACTATATGTACCCCTCACATGGCATGTTTGCAGCCCTGTTTTCAGCAGCCCCATCAACCCACTGCACTGACCCCACTTCTCTCATTCCTTTCCAGGTTCCTGCATGTAGCCTCTGGGGCTCTCCATGAGCTTCACACTAAGTCCAGTTTCTTGAACTGCTCAATGAACACTTTTCTATAAGGTCAAGATGCAGAGAATAAAATCCAAACTGCTGGATCTTCAGTAGGTCAAAAATTAGTTGATACACACTTTTTATTTTCTTTATGGTCATAAGAAAATTCCTTTCTAGACTAAGTGGCTCATGCCTGGTAACGTCAGCACTTTGGGAGGCCAGAGTAAGAGGATCATTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAATATGTTTTAAAAATTAGCGAAGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCTAGCTACTCAAAAGGCTGAGGCGGTAGGATCACTTGAGCCCAGGACGTTGAGGCTGCTCTGAGCTACATGTCACCACTCCACTTCAGTGTGGGCAACAGTGTGACCCTATCTCTAGAATAAAAAAAGAAGATCATTTCTAGCACCTTTGTCTCACCCTTTACTATGCAACCTTGCCCAAAAACTGTTTATTTTGCTTACGTGTATACCTGACTCCCACATCCTGCTTGTTTTTGGCATATACTAGGTGTTCAATAATTTTTGCTTAAGGAAAGTAATTGAAGATACTTTATAAAATGGAACAGATAACATCATATGAATGTATTCTTAGTCCTAGATCTGGTCACTCCCATTTGACTTATCAAATCCCTAAAAAGCAGTTTCCAGGGAGACTTGCCTTTCAGCCGAGCTGCCCCATTTTCCTATTACTTTGTTAACTCTAAACTGCCAATCAGATTTCTTAGTGTTTTGCCTTTAGTAAAAAATGATTAAAACTCTGGTTGATTTCTTCAAAGGCAAAAGAAAAGACACACCATCACTCAGGGCCAGCCGGCTTTTACAATTTACATTCAAACGATTTGCAGA
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Task1_train_31086
A variant has been detected on Chromosome X in FRMD7 (FERM domain containing 7). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Nystagmus 1, congenital, X-linked
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Task1_train_31087
This variant affects the gene FRMD7 (FERM domain containing 7) found on Chromosome X. What is the clinical effect of this variant — benign or pathogenic? State the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
GCCATGGTGAACTCCAAGGTATCCTTGCACAACACCTGTATAAACCAATTTCCATTAAGTAAAACATCCTTCAAGAATATCAAAGACCTTCAAATCCCAATGCCTTCCAAACTATTGCTCCGTTGGCCCATGCAGCTTCTGATTTTCCACTTGGCTCCCTGTAGGTTTCACACCTGCTGAAACCTAATGATTGGCAACCTTGCGAGGAATAGACAGGGCCACTGCTCACAAACAGAGCCTTCTCTAAGAAGCAAATATTGCTTTGCACACTCCCCTCACCTTAAATACCTTTTTTACTCACTCTTCTCTGCCAGAAACATTTTTATGAAGTAAATTAGATTAAAATCATGTCAAAGGGCATCTTTTCAAGGTGAGAAGTTATAAATGACCAACAGGAAACAGGAGGGAGGAGAAGATTTCCTTATAGATGGAAGGGTTTATAAGATGATTACATGTACATAAGTCTGTTGTTTTCTTGAGACAAGGTGTCACTCTGTTGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCATCACTCACTATAACCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCAGTCTTCCTGACTCAGCCTCCTGAATAGCTAGAACTACAGGCATGTGCCACCATACCCGCTTAATTTCTTTGTAGTTTTTTTTGTTGAGATGGGATCTTGCTATGTTGCCCAGGTTGGTCTCAAACTCCTGAACTCAAGTGATCCTTCCACCTCAACCTCTTAAAGCACTGGGATTATGAACGCAAGCCACTACACTCAGTCCATGAGTCTTTTTAGTGTAACAGTTAGAAACACTTTTTCCTCTATAGGTTGTCTTGTACAATGCTCTATATTGCTCATCTAGCATATTCTAATCTTGGCTTTCCAGACCTAAAGTTCGAGTTTTCCCCATCTCCTGACACTATATGTACCCCTCACATGGCATGTTTGCAGCCCTGTTTTCAGCAGCCCCATCAACCCACTGCACTGACCCCACTTCTCTCATTCCTTTCCAGGTTCCTGCATGTAGCCTCTGGGGCTCTCCATGAGCTTCACACTAAGTCCAGTTTCTTGAACTGCTCAATGAACACTTTTCTATAAGGTCAAGATGCAGAGAATAAAATCCAAACTGCTGGATCTTCAGTAGGTCAAAAATTAGTTGATACACACTTTTTATTTTCTTTATGGTCATAAGAAAATTCCTTTCTAGACTAAGTGGCTCATGCCTGGTAACGTCAGCACTTTGGGAGGCCAGAGTAAGAGGATCATTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAATATGTTTTAAAAATTAGCGAAGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCTAGCTACTCAAAAGGCTGAGGCGGTAGGATCACTTGAGCCCAGGACGTTGAGGCTGCTCTGAGCTACATGTCACCACTCCACTTCAGTGTGGGCAACAGTGTGACCCTATCTCTAGAATAAAAAAAGAAGATCATTTCTAGCACCTTTGTCTCACCCTTTACTATGCAACCTTGCCCAAAAACTGTTTATTTTGCTTACGTGTATACCTGACTCCCACATCCTGCTTGTTTTTGGCATATACTAGGTGTTCAATAATTTTTGCTTAAGGAAAGTAATTGAAGATACTTTATAAAATGGAACAGATAACATCATATGAATGTATTCTTAGTCCTAGATCTGGTCACTCCCATTTGACTTATCAAATCCCTAAAAAGCAGTTTCCAGGGAGACTTGCCTTTCAGCCGAGCTGCCCCATTTTCCTATTACTTTGTTAACTCTAAACTGCCAATCAGATTTCTTAGTGTTTTGCCTTTAGTAAAAAATGATTAAAACTCTGGTTGATTTCTTCAAAGGCAAAAGAAAAGACACACCATCACTCAGGGCCAGCCGGCTTTTACAATTTACATTCAAACGATTTGCAGAAACAACCAAAAAAATTCCCAGTGAACAGAAAGTAAACGAATTTATTAGAAAGCTACTTACCAAGATATTGGCATGAAGTTTGATGAGAAAATGCTTTCTCTTAAAACTCAACTTGCGGATTTTAGCCCAGTTAAAAGTATTGATCTTTGTATTTCCCTACAATGAAAAATGTGGCAGATTTCAGAATGTATTAACAAGAGTTGGCTTGTAAGACAGTGCAAACCTGATAGAAAATGCACTTAATGAGAGGGACCGCCCTTGACCCATCTCTTGCACAGATTGATCCTGCTGCACTGGGTAGGAGCTGTGGTCAAAGAAGGCATTTCAGGTGGGATACAAGGATGCTCTGGAATGCAAGCAAGAAGGGGTATGCCTAGGGAAGTTTTCTGGCCAGCACAGGGAGATCACAAGAGGAAAGGATTACTACAATAGCTTTTCTAATCTCGCCCCTTTCCCATGTTTCCCGATTCATCTGCTAAAAACAATGTCCTCTTTCTCCTGACACCCCAATAGCTCAAACACCTTCAATAGCTCCTCACTGCCCACATCACATCATGGCCATATCTTGCTGCCTCATCTATATTGAATATATAACCTTTGTTCCCACTAATTCCAAAACACCCTTTCATCTAACTCTATACCTCTCTCCTGCAGTCTCCTCATTTTCCTTGCCCACAATGCCTTCCACATAGTCAAGCCTTCTTGCCAGCTCTGACAGACCCTTCTCTAGGCTATTCTGTTTAATTACTGCAGCCTACACCCATTTCCAACTCCTCTAAACTCCCTTGGCTTTCCTGGTCGGTCCAACCAGCTTTGCTTTTTTGCTTATTTGTTGTTTGTTCAACAGGTAATCTATTCGCGTGGTCTGAAAATCAGAGGTATACAAAAAGATATATATAGAAAGAAGTCTCACTCCCACCACTGTCACCCCTATTTCTGTCCCCATCTATCCATTCCCTGCAGTTAACTATGTTTATTAGTTTGTCATGTATACTTTTCATGCAACTACAAGTAAATATGATTGACCATTTCCCTTTCTGGCTGGTGATAATACTGAGGGGTGAGATCACCTTGGGAAAGGACACCCAAGTTTGAGCCAAGATAACCACCCCTCACTAAAGCTGAAGGGCTTGAAAGGAAAGAGATTTTACCCGTAACACCAGTACTCCCATGTGAGCAACAGCCAGGTGAATCTGCATCCCTTCACCATCACTGGCGGGGTGAGGCCTGATGCCATACATATCCAGCTTCCTTGCTATGTCCAGTAGCAGAATGTCAGATTCAGCTGGGCTCCTGCCACTGAAAGGGGAAAGAATTTATGAGCCTAATAAATGCCTCAAGAATGACATTTCCACCCTGAGAGCTCCATGAGGATCTCAGCGTTTCATGGAGCCTGAAACTTCTCAGGTTTAAGGGCTTGCTCTTAAGAGTCTGTCCCCAATTTTAGTGTTCTCTACTGGGGGAAGCAGGTGCCAGCTGAAAGTACTTACATGTGCTTCTGATGAAAGTGCATGATCTTGCCCTCTAAACAGTCTTGGTTTGGTAAGTACCGAGTTTGTGCCAGATGCTTCCTATCTGTTTCTTCATGAAAGTCTCCAAGTTCTGCTGCATGACAGGAAAAAGACATTTTTCACATTACCTTTGAGGAACTTAGCAATGGAGCATCCAGCATACCCTTGTCCTCCATCAAACAGCCCCTTCTTTGTAGCCAATGCAGTCCAAAGCCTCCAACCCCACGCTTTATGTATATTTATGTTTCTATAGGGGTGTGTGTGTTTGGGGGGGGCAATTGGCTCTTTTTCAATTTGGAAGCATTTCAGCCTTAGTATAGAAAGTCACAGACCAAATATAGATCTTAGGGGCTCCAAGATCACAGTTGAACATTTTGTTAGATTTTTCTTCTACCATATTGTATATATGATCTCTCTTACTTTCAATCAGCCACTGGTATAGGTGGAACTATGTCCCCACCCTCTGCCAAGTTCATATGTTGGAGTCCTAATTCCAGTAGCAGAGAATGTGACTATATTTGGAGATAGAGCTTTTAGGAGGTGATTGAGGTGAAATGACTCCATCAAGGCAAGCCTTAAACCAATCTGACTGGTATCCTTATAAGAAGAAGAAATTTGGACACACAGAGAGACACCAGGGATGTGAG
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Task1_train_31088
This genomic variant is located on Chromosome X, within the FRMD7 (FERM domain containing 7) gene. Can you determine its pathogenicity and name any linked disease?
Pathogenic; Nystagmus 1, congenital, X-linked
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Task1_train_31089
This is a variant in FRMD7 (FERM domain containing 7), located on Chromosome X. Is this mutation a likely cause of disease or not?
Pathogenic; Nystagmus 1, congenital, X-linked
CAAAAATTAGTTGATACACACTTTTTATTTTCTTTATGGTCATAAGAAAATTCCTTTCTAGACTAAGTGGCTCATGCCTGGTAACGTCAGCACTTTGGGAGGCCAGAGTAAGAGGATCATTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCTTGTCTCTACAAAATATGTTTTAAAAATTAGCGAAGTGTGGTGGCACATGCCTGTAGTCCTAGCTACTCAAAAGGCTGAGGCGGTAGGATCACTTGAGCCCAGGACGTTGAGGCTGCTCTGAGCTACATGTCACCACTCCACTTCAGTGTGGGCAACAGTGTGACCCTATCTCTAGAATAAAAAAAGAAGATCATTTCTAGCACCTTTGTCTCACCCTTTACTATGCAACCTTGCCCAAAAACTGTTTATTTTGCTTACGTGTATACCTGACTCCCACATCCTGCTTGTTTTTGGCATATACTAGGTGTTCAATAATTTTTGCTTAAGGAAAGTAATTGAAGATACTTTATAAAATGGAACAGATAACATCATATGAATGTATTCTTAGTCCTAGATCTGGTCACTCCCATTTGACTTATCAAATCCCTAAAAAGCAGTTTCCAGGGAGACTTGCCTTTCAGCCGAGCTGCCCCATTTTCCTATTACTTTGTTAACTCTAAACTGCCAATCAGATTTCTTAGTGTTTTGCCTTTAGTAAAAAATGATTAAAACTCTGGTTGATTTCTTCAAAGGCAAAAGAAAAGACACACCATCACTCAGGGCCAGCCGGCTTTTACAATTTACATTCAAACGATTTGCAGAAACAACCAAAAAAATTCCCAGTGAACAGAAAGTAAACGAATTTATTAGAAAGCTACTTACCAAGATATTGGCATGAAGTTTGATGAGAAAATGCTTTCTCTTAAAACTCAACTTGCGGATTTTAGCCCAGTTAAAAGTATTGATCTTTGTATTTCCCTACAATGAAAAATGTGGCAGATTTCAGAATGTATTAACAAGAGTTGGCTTGTAAGACAGTGCAAACCTGATAGAAAATGCACTTAATGAGAGGGACCGCCCTTGACCCATCTCTTGCACAGATTGATCCTGCTGCACTGGGTAGGAGCTGTGGTCAAAGAAGGCATTTCAGGTGGGATACAAGGATGCTCTGGAATGCAAGCAAGAAGGGGTATGCCTAGGGAAGTTTTCTGGCCAGCACAGGGAGATCACAAGAGGAAAGGATTACTACAATAGCTTTTCTAATCTCGCCCCTTTCCCATGTTTCCCGATTCATCTGCTAAAAACAATGTCCTCTTTCTCCTGACACCCCAATAGCTCAAACACCTTCAATAGCTCCTCACTGCCCACATCACATCATGGCCATATCTTGCTGCCTCATCTATATTGAATATATAACCTTTGTTCCCACTAATTCCAAAACACCCTTTCATCTAACTCTATACCTCTCTCCTGCAGTCTCCTCATTTTCCTTGCCCACAATGCCTTCCACATAGTCAAGCCTTCTTGCCAGCTCTGACAGACCCTTCTCTAGGCTATTCTGTTTAATTACTGCAGCCTACACCCATTTCCAACTCCTCTAAACTCCCTTGGCTTTCCTGGTCGGTCCAACCAGCTTTGCTTTTTTGCTTATTTGTTGTTTGTTCAACAGGTAATCTATTCGCGTGGTCTGAAAATCAGAGGTATACAAAAAGATATATATAGAAAGAAGTCTCACTCCCACCACTGTCACCCCTATTTCTGTCCCCATCTATCCATTCCCTGCAGTTAACTATGTTTATTAGTTTGTCATGTATACTTTTCATGCAACTACAAGTAAATATGATTGACCATTTCCCTTTCTGGCTGGTGATAATACTGAGGGGTGAGATCACCTTGGGAAAGGACACCCAAGTTTGAGCCAAGATAACCACCCCTCACTAAAGCTGAAGGGCTTGAAAGGAAAGAGATTTTACCCGTAACACCAGTACTCCCATGTGAGCAACAGCCAGGTGAATCTGCATCCCTTCACCATCACTGGCGGGGTGAGGCCTGATGCCATACATATCCAGCTTCCTTGCTATGTCCAGTAGCAGAATGTCAGATTCAGCTGGGCTCCTGCCACTGAAAGGGGAAAGAATTTATGAGCCTAATAAATGCCTCAAGAATGACATTTCCACCCTGAGAGCTCCATGAGGATCTCAGCGTTTCATGGAGCCTGAAACTTCTCAGGTTTAAGGGCTTGCTCTTAAGAGTCTGTCCCCAATTTTAGTGTTCTCTACTGGGGGAAGCAGGTGCCAGCTGAAAGTACTTACATGTGCTTCTGATGAAAGTGCATGATCTTGCCCTCTAAACAGTCTTGGTTTGGTAAGTACCGAGTTTGTGCCAGATGCTTCCTATCTGTTTCTTCATGAAAGTCTCCAAGTTCTGCTGCATGACAGGAAAAAGACATTTTTCACATTACCTTTGAGGAACTTAGCAATGGAGCATCCAGCATACCCTTGTCCTCCATCAAACAGCCCCTTCTTTGTAGCCAATGCAGTCCAAAGCCTCCAACCCCACGCTTTATGTATATTTATGTTTCTATAGGGGTGTGTGTGTTTGGGGGGGGCAATTGGCTCTTTTTCAATTTGGAAGCATTTCAGCCTTAGTATAGAAAGTCACAGACCAAATATAGATCTTAGGGGCTCCAAGATCACAGTTGAACATTTTGTTAGATTTTTCTTCTACCATATTGTATATATGATCTCTCTTACTTTCAATCAGCCACTGGTATAGGTGGAACTATGTCCCCACCCTCTGCCAAGTTCATATGTTGGAGTCCTAATTCCAGTAGCAGAGAATGTGACTATATTTGGAGATAGAGCTTTTAGGAGGTGATTGAGGTGAAATGACTCCATCAAGGCAAGCCTTAAACCAATCTGACTGGTATCCTTATAAGAAGAAGAAATTTGGACACACAGAGAGACACCAGGGATGTGAGTACACAGAAAAAAAGACCAAGTGATAACACAACAAGAAGGCAGCCATCTGCTAGCCAAGGAGAAAGGCCTCAGGAAAAAAAAAAAAACAACTGCTGACAGCTTATCTTGGACACGAAGCCTCCAGAATTGTGGAACATACATTTCTGGCATTTAAGCCATTCAGTCTCTGGTATTTTGTTATGGCAGCCCTAGCAAACTAGTACAGCCATCCAACCCCACTCCATCCTGATCATATATTATCAAGAAAGAGGAATATAAATGCCAACGACATTGCAAGCCAATTCATCACTCTGTACATTGGGAGTCTAGTAAATCCCCAGCTATCTGAAATCCCCAATAGATGAATCATCCTGAAAATCATTCTGGCTTTTCCAAATAGCTAGCAGTTTATCTATGATCATAATTTGCTCTTTTCTAGATGCCTCCAGTTTATTTTTATGAAACATCTATTACAGCACTATGTCTACAAAGGCATTTAGGACTATGTGCCCTTAACCTTAATTGCCTCAGATTGTTTTGATTTTTGGATTCTTTTTTCTTCTTTATAATTTGTATGCCTTTTTCCTCTCTGTCAGATTTATATGAATCATTTCCTGGTCACTGACTTCCCCTGAAGTCAAACTTTAGAATACTTGGTTCTAAAGTGAGACTTCTAGTCTAACATAAAATGAGAAAGCAAATATCCAAACCTGTTAGCATTCTATATACTGTAAGAGTAAATAGACTCTCCATGGAATCCTATGGTGCTCTTCTATTGGATAAGATACATGGACAATAGGATACCTATTTTGAGTGCTGGAGGGCTGTTTTTTTTCTCTTCTTTCTTGGTTTTCCATTTGTGTTTTAGACAGGTGGGTGTATATCTGTATTTCAAAAATCACAATATAATAAAAATCTCCATATAATAAACATTTTTTAAAAGACCAAAGAAATGGCTCATTGATTAATTTTTTTTGCCAATACTGATAAATGTACAAATCACATTGAAACCCAATAAGGCTCTGATGGTTTCACTGACTAATTCTATCAAATATTCAAAGAAGAAATAAATACCAATTCTTCACAAACTCTCCCAGAAAATAGAGGAGTAGATACTTAGCAACATATTCTATGAGGTCAATATTACCCT
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Task1_train_31090
A variant on Chromosome X in gene FRMD7 (FERM domain containing 7) has been observed. Is this a neutral mutation, or does it result in a disease? If so, which one?
Pathogenic; Nystagmus 1, congenital, X-linked
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Task1_train_31091
A variant affecting Chromosome X, within the gene FRMD7 (FERM domain containing 7), has been observed. Determine if it's benign or associated with disease.
Pathogenic; Nystagmus 1, congenital, X-linked
TCCGCCTGCCTCAGAAACATCTGTGGAATTTTGTTTTCAATAGATTTCTTTGGGAGTAATGTAGATGATGGATGAGGGGAATCAATTTGGAAGCTGTTGGAATAATGTGACAGGTGATCCTTATGCAGTGGGAACAGACAGAACTTTGGGAAGCACTAACATGTAAAGAGCAGGTAGAGGAAGAGGAACCAGTAAAAGAGACATTAAAACAGTGCAAAGTCCTGATACAACTCCGCCTGCCTCAGAAACATCTGTGGAATTTTGTAAACATGCAGGTTATTGGCAACTCAGGAATAAGGCCCAGGAATCGGCATTTAACAAGAAACTCAGGCGATCCTAATGCACACTGAAATTTGAGAACCATCACACTAGATTGTAAAATATAGGGAGAAAATATTTCATACATATTAGGCACTTAAATATGAACTAAAGCGAGTGAATAATGCTTGTGACAGGATATAACTAAAGAATCTTCAGGCAGACAGTGAATGGCATTGCAGATTGACATCAAGGATGCTCGAAGATTTGCAGTGCCAGAAAATGAGATATATTCCTCAAACCAATCCAGAGTACTGTAATTACCAGAGTTCTTCAGATTTACTCAAAGATCCAGCAGCATGATTTCTTTCATCTCAGGCAAAATTAAAACAATTTTCTAAATTGCTGAATTTACTGGATGTATGAAGGGTTGAAATAATATCTCAAAGCCCTTTTCTCCCCTTATATTAAAATGAGAAATTGTGTGAGGTTGTTGAAACCTTTCTCAAGCTCTAACTGTGAACTCTCTTCCTTAAATGATTTTCCATACTTACTTTTTACCTGCTTTGTTATGGGCTTCAAAAGCTCCAGCCAAACCTGTAATAACATTAAGGAAAAAATTGGTAGAGCATGGCATTGAGCAGAGCTTTTTTTTTTTCGGTAATAGATAAAGATTAACATGAAATAAATGAGTACCAGGACTATTTAGACTTCTAAAGGTAGAAACAAACAGCAATGTCAAATAGGTGGCATACTACGTTTAATCTGCCCCCTTATATTTTCCCGATGACAGTGAACATTGTTGATCTATAAACTCTTTCTTGTTGACATTTGAATCACTGCTCCACTGCCTTAGTAGGATGACAGAGGTGTCACATACATGGCTCATTAGTTGCTACAAAGACTAATGAAGGCATTTGGCTCCACATTTGAACCCTCCAGTCCCCAAATGCCAGTCTAATAGACATAATGAGCCTTTCTGGGAAGATGCCAGATCACAGATATGCCAAGGCAGGACACAACAGAAGAATATCTGAACGTTAGGGTCTGAGAAAGGAGAAAGGAGATTCCTCTGAATATTCACTGGTGAGGTTAAAAGTCTTAATTCTGCAGGTTGAGGTCCAGGCTCTGGAAAGGCAAAATTGATAAAGCATGCATAGCTGCTCACAGAGTGACAAAACAGGAATGTGGGGTAAAAGAGTTTGTGTTTGGCAAATTGAGGTGACTTGTTGTTTTGAAACAGAGTCTCACTCTGTTGCTCAGGCTGGGATGCGGTGGTGCGATGCTGGCTCACAGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACACCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAAAGATGAGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCAAGGTGACTGTTAATAAACAAAGAGGGAGGACAAAAACTAGTTATTAAATCTAATCATGTTGCAAGGGTGCACATAGTTTTTCATTTTTCAATCAGGGAATTGAACCCTACATACCTAGCTGCAAACTGCATTTAGAAGCAATGCTAGACACAAAGAACCCTATAATGAAACCAACTTACATTATTTCCAGAATGGCTGCAGAATTCTAATCCAAAATATTCCTTTTCAGCAAGATTTAGATGGCTGCAACTCAGGTTAAACAATGCCTTCCCGGATGACTTTTGCTAAACAAAACAAAAAGATGATAGCACAATTTGCATTCCTAACCTGATACTGCAGCACGGAATAAAGGGTAGAAGCCACAAGACTCTCTGCAAGCCCTGTTTCCTTTAAGCACTGTTTAGAGGACCTGCATCCTTTTCAAAGATGTTGACCTTTACAGATAGATCCACTTATCTGTCTCTGTGTTGTTTTAGCGACATCCCTAAGAAAGCCTTATAACAAACCACCTTGGAAAAAGAAATACTTGCACTTAACTATGGCTACATCTGCAAATTTACCCTTTCAATGGAATTCTTGAATCAGTTCATCCCATGGGCAATTTGAATGATTTCTTCCAAATTGACAGATAGTTTAGTCAAGATGTAAATCCAACCCTATTACTCCCCTGCTTGAAATCCTTCAGTGGCACCCCCTCAGGATAAAGCCTGTACTCCTCAGCACAGGAGACCCAGTTCTCTCTCCCTCCTGTGGCCATGCCTGCGCCTCCAGCCTCTTGCCCACCTCCTCCTGATACTTTCCTCTCTAATAACGGCAGCCTGCTCTTAGTTCCCCATACCTGTCTAGTCATTGCGTGCCTGCATGCCTCTGCTCATGTCATCCTTCTCCACCTATCGCTCTTTCCACATTTCTTTGGTTTGGCTTACTCCTACTCAGCTCAGATGTCATCTCCCCAGAGAAGGTTTCTTCAATCCCTATCAGCCGCAGGCTGAGCCAAGGGCAAGCTCCCCTATGCCTCCAAACACCCTCACTTACCTCAAGCATAGCACTTCTTGCCCTGGATGTCTATCTTCCCCATTAGACTGAATTCCTCCATAGCAGGGACTTTGCTTTATTTTTCTTGTTACTCACCAGTTCTAATTCAGAGCCTGGCACATAGTACTGGGCTCCTGAATGTTTGTTGATCCAACATGAAATTGACCATATGATTATATGAGCCCCTTGAGTAGATTTCATTTTGTAGCTTTGCCCACCAAATCTGCATACAGCATACTCTGTTCACATAAGGCCACAAATTTTTTTCTTCATAAAGCCCACACACACTGTGAGCACAAAACAGTCCCTTTCTTATGCTTCTCTGAGAACAGGAGCTTTGAAGAGCTCTCTGTGAAAAATTTCTTTGAGCTGAGTATGGCTGGGACTGATTTTCAGCCTGCCTCCACTATTGCTGAACCCAGGGATTGCTGTTGCAGGGAGGACCGTGATGGGAAAATTGAGCCCTGGCTGATAGGCACAAAGACTGGCTGCTGAAAACCCCTAGTTAAAGGCGAGTCACGCGGTGCCTACAGTGCTGCAAAGGAAGCCAGGCGCGGGGAAATGTAGTTGGAAATCACCGACCCATAGAATTAACAGCAACCTTGAGAGGTCAGAGAGTCCATCCACCACCAATTCCCCCCTCCCTCAAGGCAGCACCACACTGAACAGAGCCCACATCTGGGATTTAATAGTTTTCAGGAAGGCGGCCTACCTCACCCGCTTCCCCCACCGTCCAAAAATACACCCCTCTCCCCATGGACTTCTCTCTACTTGGTTTTACTGCCCAGAGCTCCACCGACTCAAGATTCATTTGGGTTAACCCCAGTCCGATTTTTAAATGAAAATAGGCTGCAAAGGGTGAAACTTATTTCATCCCTTGCACCTGGAGACAGAGCTGCTCTACCAAGGGAAAGGGGGTTTGATTTGATGTGGGAGATCACAATGGAGCTGTAGTCCAAGAAAAGGGGGTCAGTTCCCCTGGGGGGGGTGGCACCAAGGGAATGGGGTTGCCAGGGAGGGCCTGTTTATAGGGGAGAGGGGTACATTTTTGCCTGTGTGGCAACCTTGCCTAGGGCAAGTGCTGACACAGACCATTGCAGACACATGAAATTGCTCCTATTTTTAAAATCCTTCATAGACAAGGAGCTGCCATGGGATTTTTATTATGAAAAAAAAAAAGAATTTCTAAAGAGAGAGAGATGACAGCAATACTTTTTCCAACACCAAAGAAACACTTCAGTCATGAGGACCAAATTCCATCATACACTCCAGTTTTTTTTTGCA
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Task1_train_31092
The following genetic variant occurs in FRMD7 (FERM domain containing 7) on Chromosome X. Classify its clinical effect — pathogenic or benign — and list any associated condition.
Pathogenic; Inborn genetic diseases
GCTACTGACAGATGAGTCTACTGTTTACAATTGTATATGAAGGAGAGGGGAGAGTTCTGGATTGGAAGTCCAGCTCTGCAATTATATGCTGTGTGATTGTGCACACGTCACTTAAGTTCCCTGAGCCTCCATCTTTTAACTTACAAAATGGGAAAAGATCTTTTCCCTACCTTCACTCACAAGGCTGAATGGAAGATCAAATGAACTAATGGATGTGAAAGTGCTTTGTAAATTTTAAAGTGCTATCCACAGATGACTCACTACTGCTATCATCATCATCACCACCATTATCATCATCATCACTATCATCATCATCATCATCATCATCAATCTATTATTGTTAAGCAGAGAAGGTACTATTGGATGATTGAATGCTAACTTAAGCTTCTAACTCCTCTGGACAAAGCCACTCACAGTACTGCAGCCAATGCTATTGCCTCTCTGGGTAACACCATGGTTGCTACTTACAAAGCATTCTTCCACAGAGCAAAAGGGATCACATGCTTTGACACCTGAATTGCTGGGTATCAAATCTCTCCCATTATCTTTCCAAGGAACACAATGTGTTGCAGCTGGAAAGAGACAGTTTGACTTGAAGCCAAATCAAGTCTTCTAGTTGCTGGAAGTGGCTCTTCCGTAGGTGAATTTTGTGAAGATATGGTACTGTGTTCCTTACCCACCCTCCACCCCATTTAAATGGATCTGAATTAGACTGCACATTCAACAAACTCTTCTGTCACTTTTTGTCAAAGATTTCTCTTTGAGTTCCTTGAAATATCTATTAAAAACTTAGCCTAAAGCAATATCTTTTGAATACCCAGCTCACTAATTCAGGTACTGCAGCACTGTGAGCATACACCACCAGTCTGCAAATGGATAAACTACTCAAAAGATATTTTCCACCCCTTAAATATAGTTCCAAGAAAGAATAGGAAATGCCTCATACCTCTAATGGAAGCTATTTGCTACAAAAACAAATCATTCAGGTCCGTGGAACTAGAAATGCCTTTTGCGCATAAAACTGAAAGGAAGAGACAGCAAAACAGCAGATGAAGACATGAAGTCATCACTCACAAAGCACATGATTCAAATAAAAATAAAATACTCATTGGAAAAATGGGCTACCCACACACACAACATCATGGCTGAGCCACAGCAGTTGTCAGTTTATGTATAAAAGAAAAAAACCAACATTTTGTATGAATTTCAGAGAAAATAAACTATTTGTCTCTTGTTAGTGGCTAATGTAAATATCAGAGCAAATAGCATTTTTGGTTCCAATAAAAATGTAGAACTTTTCAAAATGCTCATACATAAATCCTGACATCAAAATGTACATATCTTAAGATGTTGGAACATGAGCACCAAATGATGTGCTTAATACATTTGTTCTTTCTTGAAGAGATGAGGTATAATTGTATGCAATCATCTTGTAGCTAGGAATTTATTAAGAACTCTGAACTATAAGTACTAAATCAAACTAAATAGTCTCTTATCCTATTTTTCTCTCTCATACTTGTCATTCCTTCCTGAAGTTCTCATTACAACTACATAATTCTACCCCTTATAACCCATAGGTTTTCTTCAGAAAAGGAGGATAGCTTCCCCCACTCCTTTCCCTCAGAACAACAGTTTTCTCCCCACAAATGCTCATGGGGTGAGACCCACAGACATAATTTCAATGAACAACAATACCTTATTGGGTAAAAGAACTAGTTTATTGCTGCTTTACTTTTTGCAAATAGTTATCCTGTCTTTAAAATTTGCTATTGTTGTCCCTTGAGAAAAGACAACTTGTTCTAAGAGAAAGGTTAATGGAAAAATATGAACTACATTGTGATGTTAAATACAGATTATTTTTCCAAAGCTAAAAATCACAGTCCTCCTTCATTCAGTCCTAAAGAAGACATAACATTGCTCTCTAATGGGCTGTTCACAAATGACAATTATTGAATGAATAATAAAGGAATAATAGCAATGTGATTTCCACTTACATCAACCACAAAAATCTTCTGGGAATCATCCAAAAACTGCACTTTTAAATGTAGCATTCTCAGCGAGGCCGTTGGGCTGCAAGCAGGCTCAGAGTGCTGTGGGTGCTTTCTCCAGGAATTTCACTCCCAGCTGGATGTGGTGCACTCGGGCCCCCCCACCCCCAGCCAGGCATTCCCACTGTCAGCGGGGCACACTTCCGTTTGCTTGAAGTAATGCACACCCAAGGGCATTTGTGCTGCCAAGTGCAGGGGATCAATAGCATCTGGGCAGTCTCCTGTTTGGTCAATATCAAATCTAACTGGACTTCCTCTAGCCTTCTTAAACTCAGCTCCTTTCTTCAAAGAAAAATATAAAGAAAGCAAGCATTTGTGGTCCCTGGGGATTTTCTTTATTTCACAAGGGCACAATTTGAAAACCCTAGATCAAGCTTTAATAAACTGAGAATAGCCATTCTCAAAAGTAAAAAGATTCAAGTTAATCTCAAATTGTACTAGAAATTTCATGGCCAAGCTAGGAAGCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGCTTATATATATCTATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATAATTGCTATTATATAGAAACATATATAATATAAAATTATGCATAATTTTAATTATCTGAATTCACATGATTTAGAAATAAAAACTATATAAAAAGGTATATAGAAAACTTCACTTCCACTCCTGTTCCCTCTTTTCTGTGTTCCCAATACACCCCTATTGGTAACCAATTTTTTTTCTTTCTATTCCCATAGAATTTATGTGCTTACATCTATAAAGAAATGAAACAAGGAATACAACTAAGGTCGAACCCCATCTCAGCTGTAAATAACATTCATGTATTCTTGGATAAATGAACTAATTAGGATAAAGAACGTTCTAATAAAACAGTCATCAAAGAATTACATTAATATCATTTTCATTATATAACAATAATTACGATGACATTTATTCTGGACTGAGATAACACTTAAGGCAAGAACTAAGAAAACTTACCTCCATTTGTATTTTTTGTTGACAAGAAGATAATGGGTGAATGATTAAAAGATGCCAAGCACAGTAGATTACATTACGATAGGATTCTTGGCTGAAAGTGGTATGAAAATATAGAAGAAGAAAAGCCAATTTAAAATGTTCAACTACTAAAGAACTAGCTCGTTTATTTTTATAAATGAATAAAGGGTGTCAAATTGTTGTGATATTTAAATTGTACCGGATATGTTTAAAATAGTGATGTAACAGTTTTTATTTTAAAATACCAATATTTATATGACACCAGCAAACACATACTTTGTCAAGTATTTAACTTCCCATGAAAAATTTTAGATGTCAACTTAGATGGGTGAGGGGACACATGATTTTTCAAAATACTTTTGGGGGTCACATGAGCAGAATACTTTGTGGACCACTGCTTTAAAACACTATTTCTCTAAGTACGGTTGAGGGACCAACTTACAGAATCACCTGGGAAGGGTGGCTGACTTTTTAAAAATGCCGATACCTGAACCCCATCCCCAAATTGGGTTGTTAGGTTTGGGGTGGACCCCAAATAGATCAATTTTCAACATGCACTCCAAGTGGCTCTCATGCAAACCATTTAAGAAGCACTACTTAAAAAATAAAAACTAGCATTTTACAGTATTATAGCCATGGCTGAAGAGGGAAACAACCTCACATACATACCTGGACTGAGGATAGAATTGAAATAAAAGCTAAACAAGAGCCGGAGCTCTCAAAATAGCAGCACCCGTGGAGGAGGCTAGAAATAGGAAAAGGTCACCAGGGAAGGAAGGCACTTTTCCTGGAATTCCTAGTACAATCAAAGAATAGAATGGGAATGGAAGGGCTTAGGCAGGCTAAGCCCACTGTGGGCTTTCCACTGTGGTTGCACTTTGGGAGAAAACAGAAGAAAGTCCTTTCCCATCTTGAACCAGCCTGAGGAAAGCCCGTGTTTAGGAGGGTCGACCGTCACACCAAAACAAAACATGCC
GCTACTGACAGATGAGTCTACTGTTTACAATTGTATATGAAGGAGAGGGGAGAGTTCTGGATTGGAAGTCCAGCTCTGCAATTATATGCTGTGTGATTGTGCACACGTCACTTAAGTTCCCTGAGCCTCCATCTTTTAACTTACAAAATGGGAAAAGATCTTTTCCCTACCTTCACTCACAAGGCTGAATGGAAGATCAAATGAACTAATGGATGTGAAAGTGCTTTGTAAATTTTAAAGTGCTATCCACAGATGACTCACTACTGCTATCATCATCATCACCACCATTATCATCATCATCACTATCATCATCATCATCATCATCATCAATCTATTATTGTTAAGCAGAGAAGGTACTATTGGATGATTGAATGCTAACTTAAGCTTCTAACTCCTCTGGACAAAGCCACTCACAGTACTGCAGCCAATGCTATTGCCTCTCTGGGTAACACCATGGTTGCTACTTACAAAGCATTCTTCCACAGAGCAAAAGGGATCACATGCTTTGACACCTGAATTGCTGGGTATCAAATCTCTCCCATTATCTTTCCAAGGAACACAATGTGTTGCAGCTGGAAAGAGACAGTTTGACTTGAAGCCAAATCAAGTCTTCTAGTTGCTGGAAGTGGCTCTTCCGTAGGTGAATTTTGTGAAGATATGGTACTGTGTTCCTTACCCACCCTCCACCCCATTTAAATGGATCTGAATTAGACTGCACATTCAACAAACTCTTCTGTCACTTTTTGTCAAAGATTTCTCTTTGAGTTCCTTGAAATATCTATTAAAAACTTAGCCTAAAGCAATATCTTTTGAATACCCAGCTCACTAATTCAGGTACTGCAGCACTGTGAGCATACACCACCAGTCTGCAAATGGATAAACTACTCAAAAGATATTTTCCACCCCTTAAATATAGTTCCAAGAAAGAATAGGAAATGCCTCATACCTCTAATGGAAGCTATTTGCTACAAAAACAAATCATTCAGGTCCGTGGAACTAGAAATGCCTTTTGCGCATAAAACTGAAAGGAAGAGACAGCAAAACAGCAGATGAAGACATGAAGTCATCACTCACAAAGCACATGATTCAAATAAAAATAAAATACTCATTGGAAAAATGGGCTACCCACACACACAACATCATGGCTGAGCCACAGCAGTTGTCAGTTTATGTATAAAAGAAAAAAACCAACATTTTGTATGAATTTCAGAGAAAATAAACTATTTGTCTCTTGTTAGTGGCTAATGTAAATATCAGAGCAAATAGCATTTTTGGTTCCAATAAAAATGTAGAACTTTTCAAAATGCTCATACATAAATCCTGACATCAAAATGTACATATCTTAAGATGTTGGAACATGAGCACCAAATGATGTGCTTAATACATTTGTTCTTTCTTGAAGAGATGAGGTATAATTGTATGCAATCATCTTGTAGCTAGGAATTTATTAAGAACTCTGAACTATAAGTACTAAATCAAACTAAATAGTCTCTTATCCTATTTTTCTCTCTCATACTTGTCATTCCTTCCTGAAGTTCTCATTACAACTACATAATTCTACCCCTTATAACCCATAGGTTTTCTTCAGAAAAGGAGGATAGCTTCCCCCACTCCTTTCCCTCAGAACAACAGTTTTCTCCCCACAAATGCTCATGGGGTGAGACCCACAGACATAATTTCAATGAACAACAATACCTTATTGGGTAAAAGAACTAGTTTATTGCTGCTTTACTTTTTGCAAATAGTTATCCTGTCTTTAAAATTTGCTATTGTTGTCCCTTGAGAAAAGACAACTTGTTCTAAGAGAAAGGTTAATGGAAAAATATGAACTACATTGTGATGTTAAATACAGATTATTTTTCCAAAGCTAAAAATCACAGTCCTCCTTCATTCAGTCCTAAAGAAGACATAACATTGCTCTCTAATGGGCTGTTCACAAATGACAATTATTGAATGAATAATAAAGGAATAATAGCAATGTGATTTCCACTTACATCAACCACAAAAATCTTCTGGGAATCATCCAAAAACTGCACTTTTAAATGTAGTATTCTCAGCGAGGCCGTTGGGCTGCAAGCAGGCTCAGAGTGCTGTGGGTGCTTTCTCCAGGAATTTCACTCCCAGCTGGATGTGGTGCACTCGGGCCCCCCCACCCCCAGCCAGGCATTCCCACTGTCAGCGGGGCACACTTCCGTTTGCTTGAAGTAATGCACACCCAAGGGCATTTGTGCTGCCAAGTGCAGGGGATCAATAGCATCTGGGCAGTCTCCTGTTTGGTCAATATCAAATCTAACTGGACTTCCTCTAGCCTTCTTAAACTCAGCTCCTTTCTTCAAAGAAAAATATAAAGAAAGCAAGCATTTGTGGTCCCTGGGGATTTTCTTTATTTCACAAGGGCACAATTTGAAAACCCTAGATCAAGCTTTAATAAACTGAGAATAGCCATTCTCAAAAGTAAAAAGATTCAAGTTAATCTCAAATTGTACTAGAAATTTCATGGCCAAGCTAGGAAGCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGCTTATATATATCTATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATAATTGCTATTATATAGAAACATATATAATATAAAATTATGCATAATTTTAATTATCTGAATTCACATGATTTAGAAATAAAAACTATATAAAAAGGTATATAGAAAACTTCACTTCCACTCCTGTTCCCTCTTTTCTGTGTTCCCAATACACCCCTATTGGTAACCAATTTTTTTTCTTTCTATTCCCATAGAATTTATGTGCTTACATCTATAAAGAAATGAAACAAGGAATACAACTAAGGTCGAACCCCATCTCAGCTGTAAATAACATTCATGTATTCTTGGATAAATGAACTAATTAGGATAAAGAACGTTCTAATAAAACAGTCATCAAAGAATTACATTAATATCATTTTCATTATATAACAATAATTACGATGACATTTATTCTGGACTGAGATAACACTTAAGGCAAGAACTAAGAAAACTTACCTCCATTTGTATTTTTTGTTGACAAGAAGATAATGGGTGAATGATTAAAAGATGCCAAGCACAGTAGATTACATTACGATAGGATTCTTGGCTGAAAGTGGTATGAAAATATAGAAGAAGAAAAGCCAATTTAAAATGTTCAACTACTAAAGAACTAGCTCGTTTATTTTTATAAATGAATAAAGGGTGTCAAATTGTTGTGATATTTAAATTGTACCGGATATGTTTAAAATAGTGATGTAACAGTTTTTATTTTAAAATACCAATATTTATATGACACCAGCAAACACATACTTTGTCAAGTATTTAACTTCCCATGAAAAATTTTAGATGTCAACTTAGATGGGTGAGGGGACACATGATTTTTCAAAATACTTTTGGGGGTCACATGAGCAGAATACTTTGTGGACCACTGCTTTAAAACACTATTTCTCTAAGTACGGTTGAGGGACCAACTTACAGAATCACCTGGGAAGGGTGGCTGACTTTTTAAAAATGCCGATACCTGAACCCCATCCCCAAATTGGGTTGTTAGGTTTGGGGTGGACCCCAAATAGATCAATTTTCAACATGCACTCCAAGTGGCTCTCATGCAAACCATTTAAGAAGCACTACTTAAAAAATAAAAACTAGCATTTTACAGTATTATAGCCATGGCTGAAGAGGGAAACAACCTCACATACATACCTGGACTGAGGATAGAATTGAAATAAAAGCTAAACAAGAGCCGGAGCTCTCAAAATAGCAGCACCCGTGGAGGAGGCTAGAAATAGGAAAAGGTCACCAGGGAAGGAAGGCACTTTTCCTGGAATTCCTAGTACAATCAAAGAATAGAATGGGAATGGAAGGGCTTAGGCAGGCTAAGCCCACTGTGGGCTTTCCACTGTGGTTGCACTTTGGGAGAAAACAGAAGAAAGTCCTTTCCCATCTTGAACCAGCCTGAGGAAAGCCCGTGTTTAGGAGGGTCGACCGTCACACCAAAACAAAACATGCC
Task1_train_31093
Given a variant located on Chromosome X and affecting FRMD7 (FERM domain containing 7), assess whether it is benign or pathogenic. Indicate the associated disease if pathogenic.
Pathogenic; not provided
CTACTGACAGATGAGTCTACTGTTTACAATTGTATATGAAGGAGAGGGGAGAGTTCTGGATTGGAAGTCCAGCTCTGCAATTATATGCTGTGTGATTGTGCACACGTCACTTAAGTTCCCTGAGCCTCCATCTTTTAACTTACAAAATGGGAAAAGATCTTTTCCCTACCTTCACTCACAAGGCTGAATGGAAGATCAAATGAACTAATGGATGTGAAAGTGCTTTGTAAATTTTAAAGTGCTATCCACAGATGACTCACTACTGCTATCATCATCATCACCACCATTATCATCATCATCACTATCATCATCATCATCATCATCATCAATCTATTATTGTTAAGCAGAGAAGGTACTATTGGATGATTGAATGCTAACTTAAGCTTCTAACTCCTCTGGACAAAGCCACTCACAGTACTGCAGCCAATGCTATTGCCTCTCTGGGTAACACCATGGTTGCTACTTACAAAGCATTCTTCCACAGAGCAAAAGGGATCACATGCTTTGACACCTGAATTGCTGGGTATCAAATCTCTCCCATTATCTTTCCAAGGAACACAATGTGTTGCAGCTGGAAAGAGACAGTTTGACTTGAAGCCAAATCAAGTCTTCTAGTTGCTGGAAGTGGCTCTTCCGTAGGTGAATTTTGTGAAGATATGGTACTGTGTTCCTTACCCACCCTCCACCCCATTTAAATGGATCTGAATTAGACTGCACATTCAACAAACTCTTCTGTCACTTTTTGTCAAAGATTTCTCTTTGAGTTCCTTGAAATATCTATTAAAAACTTAGCCTAAAGCAATATCTTTTGAATACCCAGCTCACTAATTCAGGTACTGCAGCACTGTGAGCATACACCACCAGTCTGCAAATGGATAAACTACTCAAAAGATATTTTCCACCCCTTAAATATAGTTCCAAGAAAGAATAGGAAATGCCTCATACCTCTAATGGAAGCTATTTGCTACAAAAACAAATCATTCAGGTCCGTGGAACTAGAAATGCCTTTTGCGCATAAAACTGAAAGGAAGAGACAGCAAAACAGCAGATGAAGACATGAAGTCATCACTCACAAAGCACATGATTCAAATAAAAATAAAATACTCATTGGAAAAATGGGCTACCCACACACACAACATCATGGCTGAGCCACAGCAGTTGTCAGTTTATGTATAAAAGAAAAAAACCAACATTTTGTATGAATTTCAGAGAAAATAAACTATTTGTCTCTTGTTAGTGGCTAATGTAAATATCAGAGCAAATAGCATTTTTGGTTCCAATAAAAATGTAGAACTTTTCAAAATGCTCATACATAAATCCTGACATCAAAATGTACATATCTTAAGATGTTGGAACATGAGCACCAAATGATGTGCTTAATACATTTGTTCTTTCTTGAAGAGATGAGGTATAATTGTATGCAATCATCTTGTAGCTAGGAATTTATTAAGAACTCTGAACTATAAGTACTAAATCAAACTAAATAGTCTCTTATCCTATTTTTCTCTCTCATACTTGTCATTCCTTCCTGAAGTTCTCATTACAACTACATAATTCTACCCCTTATAACCCATAGGTTTTCTTCAGAAAAGGAGGATAGCTTCCCCCACTCCTTTCCCTCAGAACAACAGTTTTCTCCCCACAAATGCTCATGGGGTGAGACCCACAGACATAATTTCAATGAACAACAATACCTTATTGGGTAAAAGAACTAGTTTATTGCTGCTTTACTTTTTGCAAATAGTTATCCTGTCTTTAAAATTTGCTATTGTTGTCCCTTGAGAAAAGACAACTTGTTCTAAGAGAAAGGTTAATGGAAAAATATGAACTACATTGTGATGTTAAATACAGATTATTTTTCCAAAGCTAAAAATCACAGTCCTCCTTCATTCAGTCCTAAAGAAGACATAACATTGCTCTCTAATGGGCTGTTCACAAATGACAATTATTGAATGAATAATAAAGGAATAATAGCAATGTGATTTCCACTTACATCAACCACAAAAATCTTCTGGGAATCATCCAAAAACTGCACTTTTAAATGTAGCATTCTCAGCGAGGCCGTTGGGCTGCAAGCAGGCTCAGAGTGCTGTGGGTGCTTTCTCCAGGAATTTCACTCCCAGCTGGATGTGGTGCACTCGGGCCCCCCCACCCCCAGCCAGGCATTCCCACTGTCAGCGGGGCACACTTCCGTTTGCTTGAAGTAATGCACACCCAAGGGCATTTGTGCTGCCAAGTGCAGGGGATCAATAGCATCTGGGCAGTCTCCTGTTTGGTCAATATCAAATCTAACTGGACTTCCTCTAGCCTTCTTAAACTCAGCTCCTTTCTTCAAAGAAAAATATAAAGAAAGCAAGCATTTGTGGTCCCTGGGGATTTTCTTTATTTCACAAGGGCACAATTTGAAAACCCTAGATCAAGCTTTAATAAACTGAGAATAGCCATTCTCAAAAGTAAAAAGATTCAAGTTAATCTCAAATTGTACTAGAAATTTCATGGCCAAGCTAGGAAGCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGCTTATATATATCTATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATAATTGCTATTATATAGAAACATATATAATATAAAATTATGCATAATTTTAATTATCTGAATTCACATGATTTAGAAATAAAAACTATATAAAAAGGTATATAGAAAACTTCACTTCCACTCCTGTTCCCTCTTTTCTGTGTTCCCAATACACCCCTATTGGTAACCAATTTTTTTTCTTTCTATTCCCATAGAATTTATGTGCTTACATCTATAAAGAAATGAAACAAGGAATACAACTAAGGTCGAACCCCATCTCAGCTGTAAATAACATTCATGTATTCTTGGATAAATGAACTAATTAGGATAAAGAACGTTCTAATAAAACAGTCATCAAAGAATTACATTAATATCATTTTCATTATATAACAATAATTACGATGACATTTATTCTGGACTGAGATAACACTTAAGGCAAGAACTAAGAAAACTTACCTCCATTTGTATTTTTTGTTGACAAGAAGATAATGGGTGAATGATTAAAAGATGCCAAGCACAGTAGATTACATTACGATAGGATTCTTGGCTGAAAGTGGTATGAAAATATAGAAGAAGAAAAGCCAATTTAAAATGTTCAACTACTAAAGAACTAGCTCGTTTATTTTTATAAATGAATAAAGGGTGTCAAATTGTTGTGATATTTAAATTGTACCGGATATGTTTAAAATAGTGATGTAACAGTTTTTATTTTAAAATACCAATATTTATATGACACCAGCAAACACATACTTTGTCAAGTATTTAACTTCCCATGAAAAATTTTAGATGTCAACTTAGATGGGTGAGGGGACACATGATTTTTCAAAATACTTTTGGGGGTCACATGAGCAGAATACTTTGTGGACCACTGCTTTAAAACACTATTTCTCTAAGTACGGTTGAGGGACCAACTTACAGAATCACCTGGGAAGGGTGGCTGACTTTTTAAAAATGCCGATACCTGAACCCCATCCCCAAATTGGGTTGTTAGGTTTGGGGTGGACCCCAAATAGATCAATTTTCAACATGCACTCCAAGTGGCTCTCATGCAAACCATTTAAGAAGCACTACTTAAAAAATAAAAACTAGCATTTTACAGTATTATAGCCATGGCTGAAGAGGGAAACAACCTCACATACATACCTGGACTGAGGATAGAATTGAAATAAAAGCTAAACAAGAGCCGGAGCTCTCAAAATAGCAGCACCCGTGGAGGAGGCTAGAAATAGGAAAAGGTCACCAGGGAAGGAAGGCACTTTTCCTGGAATTCCTAGTACAATCAAAGAATAGAATGGGAATGGAAGGGCTTAGGCAGGCTAAGCCCACTGTGGGCTTTCCACTGTGGTTGCACTTTGGGAGAAAACAGAAGAAAGTCCTTTCCCATCTTGAACCAGCCTGAGGAAAGCCCGTGTTTAGGAGGGTCGACCGTCACACCAAAACAAAACATGCCC
CTACTGACAGATGAGTCTACTGTTTACAATTGTATATGAAGGAGAGGGGAGAGTTCTGGATTGGAAGTCCAGCTCTGCAATTATATGCTGTGTGATTGTGCACACGTCACTTAAGTTCCCTGAGCCTCCATCTTTTAACTTACAAAATGGGAAAAGATCTTTTCCCTACCTTCACTCACAAGGCTGAATGGAAGATCAAATGAACTAATGGATGTGAAAGTGCTTTGTAAATTTTAAAGTGCTATCCACAGATGACTCACTACTGCTATCATCATCATCACCACCATTATCATCATCATCACTATCATCATCATCATCATCATCATCAATCTATTATTGTTAAGCAGAGAAGGTACTATTGGATGATTGAATGCTAACTTAAGCTTCTAACTCCTCTGGACAAAGCCACTCACAGTACTGCAGCCAATGCTATTGCCTCTCTGGGTAACACCATGGTTGCTACTTACAAAGCATTCTTCCACAGAGCAAAAGGGATCACATGCTTTGACACCTGAATTGCTGGGTATCAAATCTCTCCCATTATCTTTCCAAGGAACACAATGTGTTGCAGCTGGAAAGAGACAGTTTGACTTGAAGCCAAATCAAGTCTTCTAGTTGCTGGAAGTGGCTCTTCCGTAGGTGAATTTTGTGAAGATATGGTACTGTGTTCCTTACCCACCCTCCACCCCATTTAAATGGATCTGAATTAGACTGCACATTCAACAAACTCTTCTGTCACTTTTTGTCAAAGATTTCTCTTTGAGTTCCTTGAAATATCTATTAAAAACTTAGCCTAAAGCAATATCTTTTGAATACCCAGCTCACTAATTCAGGTACTGCAGCACTGTGAGCATACACCACCAGTCTGCAAATGGATAAACTACTCAAAAGATATTTTCCACCCCTTAAATATAGTTCCAAGAAAGAATAGGAAATGCCTCATACCTCTAATGGAAGCTATTTGCTACAAAAACAAATCATTCAGGTCCGTGGAACTAGAAATGCCTTTTGCGCATAAAACTGAAAGGAAGAGACAGCAAAACAGCAGATGAAGACATGAAGTCATCACTCACAAAGCACATGATTCAAATAAAAATAAAATACTCATTGGAAAAATGGGCTACCCACACACACAACATCATGGCTGAGCCACAGCAGTTGTCAGTTTATGTATAAAAGAAAAAAACCAACATTTTGTATGAATTTCAGAGAAAATAAACTATTTGTCTCTTGTTAGTGGCTAATGTAAATATCAGAGCAAATAGCATTTTTGGTTCCAATAAAAATGTAGAACTTTTCAAAATGCTCATACATAAATCCTGACATCAAAATGTACATATCTTAAGATGTTGGAACATGAGCACCAAATGATGTGCTTAATACATTTGTTCTTTCTTGAAGAGATGAGGTATAATTGTATGCAATCATCTTGTAGCTAGGAATTTATTAAGAACTCTGAACTATAAGTACTAAATCAAACTAAATAGTCTCTTATCCTATTTTTCTCTCTCATACTTGTCATTCCTTCCTGAAGTTCTCATTACAACTACATAATTCTACCCCTTATAACCCATAGGTTTTCTTCAGAAAAGGAGGATAGCTTCCCCCACTCCTTTCCCTCAGAACAACAGTTTTCTCCCCACAAATGCTCATGGGGTGAGACCCACAGACATAATTTCAATGAACAACAATACCTTATTGGGTAAAAGAACTAGTTTATTGCTGCTTTACTTTTTGCAAATAGTTATCCTGTCTTTAAAATTTGCTATTGTTGTCCCTTGAGAAAAGACAACTTGTTCTAAGAGAAAGGTTAATGGAAAAATATGAACTACATTGTGATGTTAAATACAGATTATTTTTCCAAAGCTAAAAATCACAGTCCTCCTTCATTCAGTCCTAAAGAAGACATAACATTGCTCTCTAATGGGCTGTTCACAAATGACAATTATTGAATGAATAATAAAGGAATAATAGCAATGTGATTTCCACTTACATCAACCACAAAAATCTTCTGGGAATCATCCAAAAACTGCACTTTTAAATGTAGCGTTCTCAGCGAGGCCGTTGGGCTGCAAGCAGGCTCAGAGTGCTGTGGGTGCTTTCTCCAGGAATTTCACTCCCAGCTGGATGTGGTGCACTCGGGCCCCCCCACCCCCAGCCAGGCATTCCCACTGTCAGCGGGGCACACTTCCGTTTGCTTGAAGTAATGCACACCCAAGGGCATTTGTGCTGCCAAGTGCAGGGGATCAATAGCATCTGGGCAGTCTCCTGTTTGGTCAATATCAAATCTAACTGGACTTCCTCTAGCCTTCTTAAACTCAGCTCCTTTCTTCAAAGAAAAATATAAAGAAAGCAAGCATTTGTGGTCCCTGGGGATTTTCTTTATTTCACAAGGGCACAATTTGAAAACCCTAGATCAAGCTTTAATAAACTGAGAATAGCCATTCTCAAAAGTAAAAAGATTCAAGTTAATCTCAAATTGTACTAGAAATTTCATGGCCAAGCTAGGAAGCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGCTTATATATATCTATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATAATTGCTATTATATAGAAACATATATAATATAAAATTATGCATAATTTTAATTATCTGAATTCACATGATTTAGAAATAAAAACTATATAAAAAGGTATATAGAAAACTTCACTTCCACTCCTGTTCCCTCTTTTCTGTGTTCCCAATACACCCCTATTGGTAACCAATTTTTTTTCTTTCTATTCCCATAGAATTTATGTGCTTACATCTATAAAGAAATGAAACAAGGAATACAACTAAGGTCGAACCCCATCTCAGCTGTAAATAACATTCATGTATTCTTGGATAAATGAACTAATTAGGATAAAGAACGTTCTAATAAAACAGTCATCAAAGAATTACATTAATATCATTTTCATTATATAACAATAATTACGATGACATTTATTCTGGACTGAGATAACACTTAAGGCAAGAACTAAGAAAACTTACCTCCATTTGTATTTTTTGTTGACAAGAAGATAATGGGTGAATGATTAAAAGATGCCAAGCACAGTAGATTACATTACGATAGGATTCTTGGCTGAAAGTGGTATGAAAATATAGAAGAAGAAAAGCCAATTTAAAATGTTCAACTACTAAAGAACTAGCTCGTTTATTTTTATAAATGAATAAAGGGTGTCAAATTGTTGTGATATTTAAATTGTACCGGATATGTTTAAAATAGTGATGTAACAGTTTTTATTTTAAAATACCAATATTTATATGACACCAGCAAACACATACTTTGTCAAGTATTTAACTTCCCATGAAAAATTTTAGATGTCAACTTAGATGGGTGAGGGGACACATGATTTTTCAAAATACTTTTGGGGGTCACATGAGCAGAATACTTTGTGGACCACTGCTTTAAAACACTATTTCTCTAAGTACGGTTGAGGGACCAACTTACAGAATCACCTGGGAAGGGTGGCTGACTTTTTAAAAATGCCGATACCTGAACCCCATCCCCAAATTGGGTTGTTAGGTTTGGGGTGGACCCCAAATAGATCAATTTTCAACATGCACTCCAAGTGGCTCTCATGCAAACCATTTAAGAAGCACTACTTAAAAAATAAAAACTAGCATTTTACAGTATTATAGCCATGGCTGAAGAGGGAAACAACCTCACATACATACCTGGACTGAGGATAGAATTGAAATAAAAGCTAAACAAGAGCCGGAGCTCTCAAAATAGCAGCACCCGTGGAGGAGGCTAGAAATAGGAAAAGGTCACCAGGGAAGGAAGGCACTTTTCCTGGAATTCCTAGTACAATCAAAGAATAGAATGGGAATGGAAGGGCTTAGGCAGGCTAAGCCCACTGTGGGCTTTCCACTGTGGTTGCACTTTGGGAGAAAACAGAAGAAAGTCCTTTCCCATCTTGAACCAGCCTGAGGAAAGCCCGTGTTTAGGAGGGTCGACCGTCACACCAAAACAAAACATGCCC
Task1_train_31094
Mutation context: Chromosome X, Gene FRMD7 (FERM domain containing 7). Determine if this variant is likely to be benign or pathogenic. Mention the disease if applicable.
Pathogenic; not provided
TACTGACAGATGAGTCTACTGTTTACAATTGTATATGAAGGAGAGGGGAGAGTTCTGGATTGGAAGTCCAGCTCTGCAATTATATGCTGTGTGATTGTGCACACGTCACTTAAGTTCCCTGAGCCTCCATCTTTTAACTTACAAAATGGGAAAAGATCTTTTCCCTACCTTCACTCACAAGGCTGAATGGAAGATCAAATGAACTAATGGATGTGAAAGTGCTTTGTAAATTTTAAAGTGCTATCCACAGATGACTCACTACTGCTATCATCATCATCACCACCATTATCATCATCATCACTATCATCATCATCATCATCATCATCAATCTATTATTGTTAAGCAGAGAAGGTACTATTGGATGATTGAATGCTAACTTAAGCTTCTAACTCCTCTGGACAAAGCCACTCACAGTACTGCAGCCAATGCTATTGCCTCTCTGGGTAACACCATGGTTGCTACTTACAAAGCATTCTTCCACAGAGCAAAAGGGATCACATGCTTTGACACCTGAATTGCTGGGTATCAAATCTCTCCCATTATCTTTCCAAGGAACACAATGTGTTGCAGCTGGAAAGAGACAGTTTGACTTGAAGCCAAATCAAGTCTTCTAGTTGCTGGAAGTGGCTCTTCCGTAGGTGAATTTTGTGAAGATATGGTACTGTGTTCCTTACCCACCCTCCACCCCATTTAAATGGATCTGAATTAGACTGCACATTCAACAAACTCTTCTGTCACTTTTTGTCAAAGATTTCTCTTTGAGTTCCTTGAAATATCTATTAAAAACTTAGCCTAAAGCAATATCTTTTGAATACCCAGCTCACTAATTCAGGTACTGCAGCACTGTGAGCATACACCACCAGTCTGCAAATGGATAAACTACTCAAAAGATATTTTCCACCCCTTAAATATAGTTCCAAGAAAGAATAGGAAATGCCTCATACCTCTAATGGAAGCTATTTGCTACAAAAACAAATCATTCAGGTCCGTGGAACTAGAAATGCCTTTTGCGCATAAAACTGAAAGGAAGAGACAGCAAAACAGCAGATGAAGACATGAAGTCATCACTCACAAAGCACATGATTCAAATAAAAATAAAATACTCATTGGAAAAATGGGCTACCCACACACACAACATCATGGCTGAGCCACAGCAGTTGTCAGTTTATGTATAAAAGAAAAAAACCAACATTTTGTATGAATTTCAGAGAAAATAAACTATTTGTCTCTTGTTAGTGGCTAATGTAAATATCAGAGCAAATAGCATTTTTGGTTCCAATAAAAATGTAGAACTTTTCAAAATGCTCATACATAAATCCTGACATCAAAATGTACATATCTTAAGATGTTGGAACATGAGCACCAAATGATGTGCTTAATACATTTGTTCTTTCTTGAAGAGATGAGGTATAATTGTATGCAATCATCTTGTAGCTAGGAATTTATTAAGAACTCTGAACTATAAGTACTAAATCAAACTAAATAGTCTCTTATCCTATTTTTCTCTCTCATACTTGTCATTCCTTCCTGAAGTTCTCATTACAACTACATAATTCTACCCCTTATAACCCATAGGTTTTCTTCAGAAAAGGAGGATAGCTTCCCCCACTCCTTTCCCTCAGAACAACAGTTTTCTCCCCACAAATGCTCATGGGGTGAGACCCACAGACATAATTTCAATGAACAACAATACCTTATTGGGTAAAAGAACTAGTTTATTGCTGCTTTACTTTTTGCAAATAGTTATCCTGTCTTTAAAATTTGCTATTGTTGTCCCTTGAGAAAAGACAACTTGTTCTAAGAGAAAGGTTAATGGAAAAATATGAACTACATTGTGATGTTAAATACAGATTATTTTTCCAAAGCTAAAAATCACAGTCCTCCTTCATTCAGTCCTAAAGAAGACATAACATTGCTCTCTAATGGGCTGTTCACAAATGACAATTATTGAATGAATAATAAAGGAATAATAGCAATGTGATTTCCACTTACATCAACCACAAAAATCTTCTGGGAATCATCCAAAAACTGCACTTTTAAATGTAGCATTCTCAGCGAGGCCGTTGGGCTGCAAGCAGGCTCAGAGTGCTGTGGGTGCTTTCTCCAGGAATTTCACTCCCAGCTGGATGTGGTGCACTCGGGCCCCCCCACCCCCAGCCAGGCATTCCCACTGTCAGCGGGGCACACTTCCGTTTGCTTGAAGTAATGCACACCCAAGGGCATTTGTGCTGCCAAGTGCAGGGGATCAATAGCATCTGGGCAGTCTCCTGTTTGGTCAATATCAAATCTAACTGGACTTCCTCTAGCCTTCTTAAACTCAGCTCCTTTCTTCAAAGAAAAATATAAAGAAAGCAAGCATTTGTGGTCCCTGGGGATTTTCTTTATTTCACAAGGGCACAATTTGAAAACCCTAGATCAAGCTTTAATAAACTGAGAATAGCCATTCTCAAAAGTAAAAAGATTCAAGTTAATCTCAAATTGTACTAGAAATTTCATGGCCAAGCTAGGAAGCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGCTTATATATATCTATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATATAATTATATAGATATAATATATCCATATAATTGCTATTATATAGAAACATATATAATATAAAATTATGCATAATTTTAATTATCTGAATTCACATGATTTAGAAATAAAAACTATATAAAAAGGTATATAGAAAACTTCACTTCCACTCCTGTTCCCTCTTTTCTGTGTTCCCAATACACCCCTATTGGTAACCAATTTTTTTTCTTTCTATTCCCATAGAATTTATGTGCTTACATCTATAAAGAAATGAAACAAGGAATACAACTAAGGTCGAACCCCATCTCAGCTGTAAATAACATTCATGTATTCTTGGATAAATGAACTAATTAGGATAAAGAACGTTCTAATAAAACAGTCATCAAAGAATTACATTAATATCATTTTCATTATATAACAATAATTACGATGACATTTATTCTGGACTGAGATAACACTTAAGGCAAGAACTAAGAAAACTTACCTCCATTTGTATTTTTTGTTGACAAGAAGATAATGGGTGAATGATTAAAAGATGCCAAGCACAGTAGATTACATTACGATAGGATTCTTGGCTGAAAGTGGTATGAAAATATAGAAGAAGAAAAGCCAATTTAAAATGTTCAACTACTAAAGAACTAGCTCGTTTATTTTTATAAATGAATAAAGGGTGTCAAATTGTTGTGATATTTAAATTGTACCGGATATGTTTAAAATAGTGATGTAACAGTTTTTATTTTAAAATACCAATATTTATATGACACCAGCAAACACATACTTTGTCAAGTATTTAACTTCCCATGAAAAATTTTAGATGTCAACTTAGATGGGTGAGGGGACACATGATTTTTCAAAATACTTTTGGGGGTCACATGAGCAGAATACTTTGTGGACCACTGCTTTAAAACACTATTTCTCTAAGTACGGTTGAGGGACCAACTTACAGAATCACCTGGGAAGGGTGGCTGACTTTTTAAAAATGCCGATACCTGAACCCCATCCCCAAATTGGGTTGTTAGGTTTGGGGTGGACCCCAAATAGATCAATTTTCAACATGCACTCCAAGTGGCTCTCATGCAAACCATTTAAGAAGCACTACTTAAAAAATAAAAACTAGCATTTTACAGTATTATAGCCATGGCTGAAGAGGGAAACAACCTCACATACATACCTGGACTGAGGATAGAATTGAAATAAAAGCTAAACAAGAGCCGGAGCTCTCAAAATAGCAGCACCCGTGGAGGAGGCTAGAAATAGGAAAAGGTCACCAGGGAAGGAAGGCACTTTTCCTGGAATTCCTAGTACAATCAAAGAATAGAATGGGAATGGAAGGGCTTAGGCAGGCTAAGCCCACTGTGGGCTTTCCACTGTGGTTGCACTTTGGGAGAAAACAGAAGAAAGTCCTTTCCCATCTTGAACCAGCCTGAGGAAAGCCCGTGTTTAGGAGGGTCGACCGTCACACCAAAACAAAACATGCCCT
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Task1_train_31095
A variant was discovered on Chromosome X, affecting HS6ST2 (heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 2). What is its functional impact — neutral or pathogenic? State the disease if pathogenic.
Pathogenic; Paganini-Miozzo syndrome
TAACCAAGAAAATCCTATGTCATTTCAAATAATTTTGCTTCAATTTGGGACAATCCAAGAGGCTTTGAGGGGTTCTGGTTATCTTCTGGAGAATGCGGGAAGGAATCTGCCAGAGGACAGTAGCCACCAAACAGATAATCTAGACCACATTAATAATGTGTGTTTATAGACATCATACTCTGACCTACATGTTCAAAAGGATCAGTAAAGGCACATGTGCCCCATGGAACTCCAGACAAGGCCATGGCTTTCATGGTGACCAAGACCTTGTTTTCACTTCTCTGCTATAGTCATGGCTGTGGAATTCTACTTTTGCCCAGAAGAGCTTTTTAAATATTACCACCTCTCAATACACCTACAAGGTCTGTCAGTATGAGAAATTCTTTTCAATATTGCCAAATTGTTTGGGAACTTATTAAACACCAGAATATTGTTGTGACAATGACTTACACAATTGTACCAATGGATTGAGGTCCTGGGGCTAAGGTTTTCTTGGGGTGGAAGAAAAAATTTGTTAGTATTGGAAAGGAAATACAAGTTTGGCAGATTCTGACACAATTCCAGCATTTGAGAAAGGACAGTGTAAACTGAGAGAAGAGAGAGTGAAGAGGAGAGCCAGGGGGTGATGTTCCCCTTAAATCTCAATGGTAATCTGAAAGTCAGAGGGCTCTAGGGCTCTATTTGCTGCAGTTGGACAGAAAAATCCACACTGGTTGTTGCGTTCTAACAGTCACCTGCAAAGCATCCCCTTGTCCAGGGTACCAAGTGCACCCGGGGGATGGGGATGGGACACAGACATGTCCTTGCCGGCCCAGAGACCCCATCCAGAGGCCTCCAGGCCATGAAACTCACCTTGTGCACCCCCTGGACTCCCTGCTTCAGCCCAGATTTGTTTTAAGGAGACTTGCGAAACAGTAGCCCTGGCTGGACTAACTGCACCCCATAGCACTCACTTCCCCCACCCCACCACCACCCACTTTACAGTACTGCATGACCTCTAGCAACTGGACATCGCGTCTGGAGGGAGGAAAATACCCTTGCTTCTGGCTACAGACTATTAATAAATCAGCTTTTACCGCATCAGCCCAGGCTCACAGAACATGGGCTGGCAGCGCCCCATGCTGGGGCTCAAGCTTTTTAAATATTTTTTGTAAATCAGGAGAGGCTCCTGGTGACTGAACCCCACATGGGGTCCAGGGCACCATCCCAGCCCGCCCTTCGGTCCGCGGGGTGCCCCCCGCCACTCCCAAAGAGCCACGGATGCCTCTCATGCAGCCAGTAGTGATAAGCAAGCCTGGGAACCATGAGCTCTCCTTGGATGTCGGAAAATAGCGACAGAGGGACACCCAGTCGCCCGGGAAGACCAGAGCCAGAGCGGGGAAGGAGCGAGGTGATAAAAGTCCGGCAAGAAGAGAAAAACAGAAAGGGTAAGAGAGAAAAAGAATAAAAGCGAGAGAGGGGAATGGAAAGAAGGAAACAGCGAGCAAACAGGAGCAGACAACATCTAGGACACAAGAGAGAAAGAGGGAGAACAAGGCAAATAGACGAAATAGGGGGGAAAGCGGGGGGAGGGAAGAATGCGGGCGCCGAAAGGAGGAAGAGAGCGCTGAAAGGAGACTTCGGAACCCGGGTGCAGAGTAGAAGAAAGCAGGGATCCAGAGACGCTGCACGGAGAGCGCGGCTCTTTAGGGCTCTCCAGTGCGGAGACTGAGTACGATGCCCCGTCCCAGCGGCCCCGTTCCGGCCGCTCGGCCGCCTCCCCCGCACGCTCTGCCAACCATCACGCAGGCCACCCTGCGGACAGACAGACGGTCAGTCCGGGGCCGGAGCGGAAAGCCTTTCTGTGGCCGCCACAGCGCGGCGAACGTGCGCTACTGGGCGCCCAGCACCTGCCCAGCCGGGGTGCAAACGCCCGGGCGTCAGGGTGCGCGCTAGGTCCCCGGCTTGGGCCAGCCGCGCCTCCCAGCCCTCCGCCCGCCTAGGCCCGGGTCCCGCTCGACTACCGGCGCGCACTCACCTGGACGGTCTCAGCCTGGCGTCGCGCTTGCCGTCCACCACGGAGGGCACACAGCTGGTGAGCTCGGTCCAGTCGGCGTGCAACCCGCAGCTCCAGCCCGTGGAGAACCTGGAGAAGAGCCAGGTTTCCCGCTTACCCGGCCGGTGGCAAGTGCATTTCTTCTGACCCACGCGGCACTCGCACGGCTGCTCCAGCTGGATGTTACGCACCAAGTGGCGGCCGAAAGTGGTGCCCCCGGTCTTCTGGATGTGCAGGAACACGATCAGGTCATCGCCCTTGATGTCGAAGTCTACCTTGCGCAGGAGGTCGCCGCGGGTGAAATTGTAGCGGGGCACGAACCTGGCGGAGCTCTCATCCTCCGAGCGGTACGGGTCCGGCACCGGGGAGCTGAACGCCTGCAGGCGGAGGAGCTGGCATTCTGTGCCGGGGCACACGTATTGGAGGACGATCACGGCAAATAGGAAGAGCATCACCAAAGCTAGCAGCAGCTTGTTGGATTTCTCATCCATGTTCCCGACGCTGGGGGAAACCCAAGCTCGTTACGTCAATCCCGCAGCTCAGCCCGCGCTCGTCGTGCCCCCGCACCGCCCCCTTCCCCTGGAGCCGCTGCTGCGCCCCTCTCCCCCTCCCCTCCGCACCGAGTACTCCACGGCGGCGGCGGCTGCGGCGGCGGCTCCCTTCCCCGCTTCCTTCCTTCCCGGCAGGCTCAGCGCTGTGGCTTCTGCGGCACACACACACCCCCACCCCGACTCCTTCCCGCGGGCCGTTCGCCCCCTCCCCCCGCCAGAGCTCTCCGGAGCTCCCCGGAGCCCCTCCACGGGGTTTAGCCCCAGTGGGACCCCTCCGGGCCCAGTCGCCCCACTCCTCAACTCACGCCCCCAGTCCGGGCCCCCGCGTGTCTCGCTCCACTCTCGGTGGCTCCCGCTCCCATCCCCATCCCGCTTCGTCCGCCGGACTCTCCGGGCTCTTCTGCCCCTATCCTCTTTGGAGCGCACACCTCTGTCCGGGTTTCTCCCCGCATGCCCCGAAGCCCTCCTTTTGCCGGCGCCCGCGCCCGCTTGCCCACCCGGTAGGCGGCCTCGAGGGAGCTCGGAGCCGGGGGCTCAGAGTTACCCTGGGGGAATGAGCCGGCCGGCAGCCCGACTTGCTATCGGAGACGCTGCGCTGCCGGTGCCCGCGGAACAGTAGCGACGGAGCCGCGGCGTGGGCAAATGCGCGCCGCACCCCTCCGGAGACCCTAGCCGGGCCACCAATGGCCAGCTGGAACTTTACGCCCTTCTCTACCCCCCGCGGCTGCCTTCCCTCCCCGTACAGCACCTTCGCGCCCTGGCCTGGGAGCGCGAACCCCGCTTTCACCTAGAACGTACCTGGCCATGGGGCCGAAAATCTTGGAGAAGATCGCACCGAGCACGTGCTTCAGCGAGTGGCCCAGGGCGGCCAGGCCCCGAGTGAGCAGGGCCCGGCAGAGGGAGCCCAGGTCCCAGCGTCGCCTGAGGACGTGCATCCGCCTGCGGCGGCCCCGGGACAGCAGCGCGAAAAGCGGGGCGCACGCGGCTCCCGCCAGGGAAGAAGACGCCTTTCGGGGCTTGTCCAGGAGCGGCCGGGTGTGGAATCCGTGAGACACACCCCTAGGAGGGCCCGCGCGAACTGAGGCGGCGACCGACCCGGGCCGGCTCGCTGCCAATTCGGCCTCTACTCTGGAATGCCGGCGGGGACAGGTGGTGCGGACGGGCGCTCCTCGCTCCGGTTGCCGCGGCGGCTCGAACTCCCGGACTGCACACGCAGGCAGTGCCATTCCCCCCTTCAGGCAACTCAGGGTACTAAGGATCACGAGCGAGCTTGAATTTATATAATAATGCCTCACGCCTAAGAGCTCGAGCCACTTCACAAGCAGAGAACCTGGGTTTTCTCTTTTCTTGGAGTACGGAGGTCACTCCGCTTAGCGCATCACTCCACTTTGGCTCGTAATTTCAACCTCTCCTAAAATAGCAAAGGCGCAAATTGGAGCTTTTCCGTCTCTCTTTGCCAATTTCCATTCTCCAGCGGAAGCGGGGGCATTTTCTGAAAAGGTAAGTCAGC
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Task1_train_31096
A genetic alteration is present in USP26 (ubiquitin specific peptidase 26) on Chromosome X. Is this variant benign or disease-causing, and if the latter, which condition is involved?
Pathogenic; Spermatogenic failure, X-linked, 6
TCCTTCTAGATAAACTGTGTTCTGAATACAATCTCCAAACTTTGGAATCTGGTTTTCCTCTTACAGGGTATTACCTACTAATAACTTCCCCACATCACTAAAATCCAACTCACCTATTTTAAAGGACCCTAGGCTTAAGAGCATCAACAAGCTCTTGGATTAATACAACTATACTGAAGCCATACCCCATATACAAGGGGGCATATTCCTATTGGTAAAGGTGTGACTGAAAATTCAATCCTATGTTATGTGAGAAAACCTCTTAGTACAAGTCATTTGTTCACAGCAAAGGCACAAAGTACAACAGATTCACTGCCTCAAAGGCAGGAAAAGGTTATGATAATAGTGGTGGCACATGCTTGATGGCAAAATTATTAAATCCCCTGGATTTTAATGAAATATGACCACCCTAGGATCCATGCATCTTTCCCCAGAAGCAGAACATCTTCATATGGAGTTTCTGATGTTGTGTCAAATAAGTAACAAGTAATACTTTCAAATTCTACAAGTCCACTTTAAAGCATATATTGCTTACTCATTGAAGAAACAAGACCACCACACTATAAGGTACAGAGATGTAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAATTAGTCATGTAATGTTGAATGCAGAGGATTGTTCAAGGTTTCGCAGATGAAGTCCAGGTAAACAAAGTTCCTCTGAGGCAATGAAAGTGCCCCTCTAAGAAAACTAACATGGCAAGGTGGGCTCAGACCACCAAGGGCCAAGAGCTTGCTAGCAGACACACAGGAAATGTGGGCCAATTTCTTAAAAGCAAATCAATCTGGAGATTTGACTTGGCGTTTAGCCTCATCTATATATGCCCAAGAGGATTCAAAAGTTATCAGCCTCATTTTTTATTGCCAGGATCCCAGCAACTATTTTTTTCCACCAAATTGCAGAGTATGATCAGAAGTGATTTTTGTGAGTTTGGCTTTTAATAAGTTCACAAAGGCAAGGCATACATTAATATGAAAAACACAAAAATGTAATCAAAACCTTTTACAAAATAAGCAATTTAAATATACAACCAAGGTAGTGTATGTAGTACAGTAGTGGTTCTCAAACTGTATCAAGCATCACGGTCTCCATCAGATTGCTATCCCTTACCCCAAGTTTCTGAATCAGTAGGTCTACAGTGGAACCCAAGATTTTGCATTTCAAATGACTACCCCCATGCTCCTGGTGCTGCTAGTTTAAGGAGCATACTTTTTAAACCACTGTATTAGAACATGGAAAGAGGCAGGAAGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAGTCCAACCTGGGCAGCATAGTGAGACCCTGTCTCTGCAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCTAGGCCTGGTGGCACACATCTATAGTCCCATCTCAAGCAAGAAGATAAGTCCCTCTCTTTTCAGGAGGCTGAGAGAGAATCGCTTGATGCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGTTATTATTGAAGGACTGCACTCTAGCCAGGATGACAGAGCAAGACCCTGACTATATTAAAATGAAGAAGAACATGAAAAACACAATTTCAGTCTTGTAGGAGAGAAGGATGCTCATCAGCCAGAGCTATGGGATTGAGGTGTCTGTGTCAGGATTAGAATGCAGATCTCCCCATTAAGTGTTTCTGTTTGACCTTTGGTCCTAGACTAATTGCATTTTCATCTCTGGATAAAGTTCACAGTTTTCCTTCCATGGAGGAAGTGGTATCGAGTGAGACAGTCAGGCAGATCTGTACAAGGAGGAGTACGTTCCTCTTATTCCTTCTGAAGGGTCTCCTCTACCTCCTTGCTATTAAGCTGGGCATTCTCTTCTCTTTTCAACATCTCTTCAAAGATCTCATTATGCATGTAAAAGAAGATGTACCCAGTGCAACGCCTATCCTCCTGCATCTGGGCCTCCTGGATACCTAACACCCGCATATCATCGTAAGTGAACCAGATCTGTTTCTCAAAGTCATAGGCATCACAGATATAATGGCCTGACTTTAGAGTCTTCCCAAGATGGCTGACAACACTAATGAGCCGGTAGGTATGATCTCCCTTATCATCATTTCTTTTTGTTTCCTTGGCTTTAGATTTTATCTTATCTAAAATGTCTTTGTTTCTTGGATTCTTATTGGAACCCAGTGCAAGTAGGGAATTCCTGTTAGACTTCTGTAGATTTAATTTTGTAGGTCTTAGGAGGTTCTTTGTGTGCCCCTGGGTGCCTGGCTTTGGAAAGCTTTGAGGCAGTGCCTGCTGAGGGGCTTGTTCACAGATTCTCATACCGTCACACTGCTGAGTCTGTTCAGACACTTTTTGGAATCTTTCTGGAATTCTGATATTTTTATCTTCATACAAATCTTTAGTAGGATTGATAATCCTATCAAAAGCTACAAACTTACTGGTTTTCACATATTTCTTTCGTTTTGGATTTTCGGGCACTGTTTGAAAGTCAACTTTTGAGAGAGGTGTGCCTGGGCTGCTGGCAGGTTTACCTCCAGCTTTGTGGAACTGACAAAGTGAGGTATCTTCCAGATACGTCATTAAGTGAGCTAACGGTTCTTTTTCAATGAATGCTCGATCTCCTGAGTATACAGATTCTAGCTCATTTGGTTTAGAATTTTTTCCAAGGTACTTTTGCTGCTGTCTTCTGCTTGCCCCTTTAAAGACTGTCTGGCCTTTTTTTTGTTCAGACTCCTTATCTGATCCAATGTGTGGAGCCAGGATATCTTTGGATTCCTTTGTTGCAGGCCATGATACACTGATGTTTCCAGAAGTCATCTTTCGAATAACTTTTAATAATTGGAAATCTGTAATTTCTCCATCCTCACTCAAGGGAAGAGGTGGTCTGGTGCCTTCATTGCAATGAGAAGACACCTTTAAATATTTGGAAATGATGACTTCCTGGTCATTCTTCTTTAATGCACAAAACTCATTCAAGCTATAGCGTTTGAGGTGAACAATAAGGATTCTAGGTAGCCTACTGAATGAGTGCACTCCAACGGAAGTCTTGTGCTCACATTTTGCACATTTATACTCAAGCTCTTCTGCTCCAAAAAAAAGATCAAAAGTAGACTGAATAGATGAAGGATGTGCTTTTATTCTTTGGGGAAGGTTGATGGAGAGGTAATTATTCAGTTCTGTCTTGAGAATAACCTGACCACAAGCTTTACAAGCAATGGAGTGCAACAACTCTAACTCAAAATTAGTAATGACAGGGCAAGAAAACCCACTGGTGTCAGGATCATCAGCAAAAACCTGTTTAGGAAAATTATCTTCCCCAAATTCACTTTTAGGCTTCCAAATTGTGTTGAGTTTTTCCATGTTATCTTTCAGTTGATCTAAACAGTGAGCTAAAAACTCATGAGCATCGTTCTGTGCATTGCCATGGAATATCTCTGCAGCTGCTGAAATGGCCTTTTTAAGATTCAAGAGTAACATCTCCTTGATTTCTATATTATAGGTATCTTTAAAAAAAAGTAGCCGTGCCAAGCACATGGTAAGAGCATTAAGGGGAATTTTACCCCATGGGAAACTCTGATTAAGTAAATCATCAGCAAACGATGGGATTGAAAGTAGAGACTGTAACACTGCATTCATATAACAGGTGTTTCCCAAATTGGGGAGGCCGTGGCATATTTTCTCTGGAAATAATTCAAAAAATAGTTTTAATTTATCCCACTTTGTGTAACCGTCACTATACCCTTGTTGTAACAGAAATACCAAAACCATTTTCTCAGTGAGAGCTTGGAGAAGACCAATGTCATCTAGGTAAGGATTTCCAGTGGCGTTCATGATGCATGAAGATTCACATTCCAATTTCTTATTCTCTTCTAACTCTTTTAACTTCAATTGTTTCTCTCGATTATAGCTTACACACCTCGAACAATCTGCCTTGGATTTCTTGTATTCTACAGAATTATTTTCTTTCAAGAATTCCTCATTCATCTCTGAGCTAGATGAGAGCATTCTTTTCCTCTTCTTGTGCTGATTTTCTGATAACTCTCCGCAAGTAAGTGTCAATTTTGATGTAAGCAAAGGCATCCTCTGAAGGACACCTGTCCCACTTCCTTTTGCTATCTCAAAAGAT
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Task1_train_31097
Gene USP26 (ubiquitin specific peptidase 26), found on Chromosome X, is impacted by this variant. What is the biological outcome — benign or pathogenic?
Pathogenic; Spermatogenic failure, X-linked, 6
CTAATAACTTCCCCACATCACTAAAATCCAACTCACCTATTTTAAAGGACCCTAGGCTTAAGAGCATCAACAAGCTCTTGGATTAATACAACTATACTGAAGCCATACCCCATATACAAGGGGGCATATTCCTATTGGTAAAGGTGTGACTGAAAATTCAATCCTATGTTATGTGAGAAAACCTCTTAGTACAAGTCATTTGTTCACAGCAAAGGCACAAAGTACAACAGATTCACTGCCTCAAAGGCAGGAAAAGGTTATGATAATAGTGGTGGCACATGCTTGATGGCAAAATTATTAAATCCCCTGGATTTTAATGAAATATGACCACCCTAGGATCCATGCATCTTTCCCCAGAAGCAGAACATCTTCATATGGAGTTTCTGATGTTGTGTCAAATAAGTAACAAGTAATACTTTCAAATTCTACAAGTCCACTTTAAAGCATATATTGCTTACTCATTGAAGAAACAAGACCACCACACTATAAGGTACAGAGATGTAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAATTAGTCATGTAATGTTGAATGCAGAGGATTGTTCAAGGTTTCGCAGATGAAGTCCAGGTAAACAAAGTTCCTCTGAGGCAATGAAAGTGCCCCTCTAAGAAAACTAACATGGCAAGGTGGGCTCAGACCACCAAGGGCCAAGAGCTTGCTAGCAGACACACAGGAAATGTGGGCCAATTTCTTAAAAGCAAATCAATCTGGAGATTTGACTTGGCGTTTAGCCTCATCTATATATGCCCAAGAGGATTCAAAAGTTATCAGCCTCATTTTTTATTGCCAGGATCCCAGCAACTATTTTTTTCCACCAAATTGCAGAGTATGATCAGAAGTGATTTTTGTGAGTTTGGCTTTTAATAAGTTCACAAAGGCAAGGCATACATTAATATGAAAAACACAAAAATGTAATCAAAACCTTTTACAAAATAAGCAATTTAAATATACAACCAAGGTAGTGTATGTAGTACAGTAGTGGTTCTCAAACTGTATCAAGCATCACGGTCTCCATCAGATTGCTATCCCTTACCCCAAGTTTCTGAATCAGTAGGTCTACAGTGGAACCCAAGATTTTGCATTTCAAATGACTACCCCCATGCTCCTGGTGCTGCTAGTTTAAGGAGCATACTTTTTAAACCACTGTATTAGAACATGGAAAGAGGCAGGAAGATTGCTTGAGGCCAGGAGTTCAAGTCCAACCTGGGCAGCATAGTGAGACCCTGTCTCTGCAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAATAGCTAGGCCTGGTGGCACACATCTATAGTCCCATCTCAAGCAAGAAGATAAGTCCCTCTCTTTTCAGGAGGCTGAGAGAGAATCGCTTGATGCCAGGAGTTTGAGGCTGCAGTGAGTTATTATTGAAGGACTGCACTCTAGCCAGGATGACAGAGCAAGACCCTGACTATATTAAAATGAAGAAGAACATGAAAAACACAATTTCAGTCTTGTAGGAGAGAAGGATGCTCATCAGCCAGAGCTATGGGATTGAGGTGTCTGTGTCAGGATTAGAATGCAGATCTCCCCATTAAGTGTTTCTGTTTGACCTTTGGTCCTAGACTAATTGCATTTTCATCTCTGGATAAAGTTCACAGTTTTCCTTCCATGGAGGAAGTGGTATCGAGTGAGACAGTCAGGCAGATCTGTACAAGGAGGAGTACGTTCCTCTTATTCCTTCTGAAGGGTCTCCTCTACCTCCTTGCTATTAAGCTGGGCATTCTCTTCTCTTTTCAACATCTCTTCAAAGATCTCATTATGCATGTAAAAGAAGATGTACCCAGTGCAACGCCTATCCTCCTGCATCTGGGCCTCCTGGATACCTAACACCCGCATATCATCGTAAGTGAACCAGATCTGTTTCTCAAAGTCATAGGCATCACAGATATAATGGCCTGACTTTAGAGTCTTCCCAAGATGGCTGACAACACTAATGAGCCGGTAGGTATGATCTCCCTTATCATCATTTCTTTTTGTTTCCTTGGCTTTAGATTTTATCTTATCTAAAATGTCTTTGTTTCTTGGATTCTTATTGGAACCCAGTGCAAGTAGGGAATTCCTGTTAGACTTCTGTAGATTTAATTTTGTAGGTCTTAGGAGGTTCTTTGTGTGCCCCTGGGTGCCTGGCTTTGGAAAGCTTTGAGGCAGTGCCTGCTGAGGGGCTTGTTCACAGATTCTCATACCGTCACACTGCTGAGTCTGTTCAGACACTTTTTGGAATCTTTCTGGAATTCTGATATTTTTATCTTCATACAAATCTTTAGTAGGATTGATAATCCTATCAAAAGCTACAAACTTACTGGTTTTCACATATTTCTTTCGTTTTGGATTTTCGGGCACTGTTTGAAAGTCAACTTTTGAGAGAGGTGTGCCTGGGCTGCTGGCAGGTTTACCTCCAGCTTTGTGGAACTGACAAAGTGAGGTATCTTCCAGATACGTCATTAAGTGAGCTAACGGTTCTTTTTCAATGAATGCTCGATCTCCTGAGTATACAGATTCTAGCTCATTTGGTTTAGAATTTTTTCCAAGGTACTTTTGCTGCTGTCTTCTGCTTGCCCCTTTAAAGACTGTCTGGCCTTTTTTTTGTTCAGACTCCTTATCTGATCCAATGTGTGGAGCCAGGATATCTTTGGATTCCTTTGTTGCAGGCCATGATACACTGATGTTTCCAGAAGTCATCTTTCGAATAACTTTTAATAATTGGAAATCTGTAATTTCTCCATCCTCACTCAAGGGAAGAGGTGGTCTGGTGCCTTCATTGCAATGAGAAGACACCTTTAAATATTTGGAAATGATGACTTCCTGGTCATTCTTCTTTAATGCACAAAACTCATTCAAGCTATAGCGTTTGAGGTGAACAATAAGGATTCTAGGTAGCCTACTGAATGAGTGCACTCCAACGGAAGTCTTGTGCTCACATTTTGCACATTTATACTCAAGCTCTTCTGCTCCAAAAAAAAGATCAAAAGTAGACTGAATAGATGAAGGATGTGCTTTTATTCTTTGGGGAAGGTTGATGGAGAGGTAATTATTCAGTTCTGTCTTGAGAATAACCTGACCACAAGCTTTACAAGCAATGGAGTGCAACAACTCTAACTCAAAATTAGTAATGACAGGGCAAGAAAACCCACTGGTGTCAGGATCATCAGCAAAAACCTGTTTAGGAAAATTATCTTCCCCAAATTCACTTTTAGGCTTCCAAATTGTGTTGAGTTTTTCCATGTTATCTTTCAGTTGATCTAAACAGTGAGCTAAAAACTCATGAGCATCGTTCTGTGCATTGCCATGGAATATCTCTGCAGCTGCTGAAATGGCCTTTTTAAGATTCAAGAGTAACATCTCCTTGATTTCTATATTATAGGTATCTTTAAAAAAAAGTAGCCGTGCCAAGCACATGGTAAGAGCATTAAGGGGAATTTTACCCCATGGGAAACTCTGATTAAGTAAATCATCAGCAAACGATGGGATTGAAAGTAGAGACTGTAACACTGCATTCATATAACAGGTGTTTCCCAAATTGGGGAGGCCGTGGCATATTTTCTCTGGAAATAATTCAAAAAATAGTTTTAATTTATCCCACTTTGTGTAACCGTCACTATACCCTTGTTGTAACAGAAATACCAAAACCATTTTCTCAGTGAGAGCTTGGAGAAGACCAATGTCATCTAGGTAAGGATTTCCAGTGGCGTTCATGATGCATGAAGATTCACATTCCAATTTCTTATTCTCTTCTAACTCTTTTAACTTCAATTGTTTCTCTCGATTATAGCTTACACACCTCGAACAATCTGCCTTGGATTTCTTGTATTCTACAGAATTATTTTCTTTCAAGAATTCCTCATTCATCTCTGAGCTAGATGAGAGCATTCTTTTCCTCTTCTTGTGCTGATTTTCTGATAACTCTCCGCAAGTAAGTGTCAATTTTGATGTAAGCAAAGGCATCCTCTGAAGGACACCTGTCCCACTTCCTTTTGCTATCTCAAAAGATTTGCTACTTGATTTCTCATCAACTTTGTGGAATGAAGTTTTGTTGATTTCCTTCTGTGTTGTGCTAGAAAAGACACT
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Task1_train_31098
The variant affects gene GPC3 (glypican 3), which is on Chromosome X. Please evaluate whether this mutation is benign or pathogenic and specify the disease if necessary.
Pathogenic; Simpson-Golabi-Behmel syndrome type 1
GTCCTCTTTCCTAGTTTAATTCACCAAAGAAACTAATTACTCCTAGAGTTTAAAGACAAGCTGAAATAGCCTAATCCACCCTCCACATTTTGGATAAGCAATAGTTCAGAGTGCACAGCAGTTGCACTGTATAGATGCTAAGGGTGTCTATCAACCAAGCCAACAAAGTCTGGGTTTGAATCCCAGCTCCTCTGACTTAACTAGCTTTGAGGAAGAAATAAGACTCAGTGTTTGATAGATCAGTAGAGTGTCTACAGTGTATAGTAATCTATCATATATTTCTTTCTCTCTCTTGTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGAGGCAGGGTCTCACTCTTTCGCCCAGGCTGGGGTGCAGTCACGTGATCATGGCTCACTGCAGCGTTGATCCTCCCACTTCAGTCCCCCCAGTAGCATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTATTTATTTATTTATTGGTAGAGATGGGGTCTGTACGTTGCCCAGACTGGTCTTGAACTCCCAGCCTCAAACAACCCTCCCGCCTAGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCTTAAGCCACAGCACCTGGCCACATATATTTCAAAGTAGCTAGAAAAGAAGAATTTGAATGTTTCTAGCATAAAGACAAATATTTAGGTGATAGATACCCCAATTATATTGATTTGACCTTTACAAATTGTATGAATGTATTAAACTATCACATGTCCCCTGAAAATACGTACACATATTGTATATCAATGAAAAATAATTAGCAGAAAGCAGAAATAGAATATTTCTAAAACAGAAAAATAAAACAAAACCCAGCTTTTAGGTTTATTAAGACTGATTTCATGGGTTACTATGAAATGATATTATGTAAACTAGCCAGCATAGCACTTGAGATGTAGTGGAAGCTCAACAATGGTAGTGTAATATACTATTCTGCCACCTCCTTCTACAAAGCTGGCAGCATTCAGGAATCAGATACTACCTTAGGGAAACTGACTGGTAACTCTTGGCTACATGTTCTGCTATATATTGGAAGTTGGTATCTCCCGAGATTCCGTTACTAACAATATCTGACTGAAACCAAGGAAACTGCTGCCTCACTCACAGAACTTCCCTTCCTCCATCACGAATTTCATCAGACTTAGACTGATATAATCAAGGCTATAAACAAAACCATTGGAGAACATGGATTGTTTGCCTTGCTTATGTGCTTGTGAGGTTTAATTAGTGAACTCTAGCTGGGTCTTTTGTGTTTGAAGTCACTACTCAAAATGCTAATGTGATATACATGATTGAAAACACCAAGAGGAAATTAGAATCAGAAAAATTGGTGATAACCAAATTAAAGGGAGACCTGGTCAATTTCTGAAGCATGGCTCTTCCACTAACTTTACGTGGGTGCTCTTAGGCAAGTTGCAATTTCACTTAAGCTTCAGTTTCCTCATTTATAAAATGAAGATAATAGCTCCCACTTCACAGGCTTGTCATCTATTGTGTATCAATAATGAGGATTATGATAACTGACAATAATGCTAATAATAGCCAACATTTATCGAAGACTTACCACATACCAGACACGTGCTAAGTGCTTTAACAAATGTCATTCCCTATGAAGACGATATTCTTTTTATTTCTATTTCATGAATCAGAAAAATGAACTCATAAAGATAAAATGACTTCCCAACATCGCACAGTAAGGAAGTAGGTGGAGCCAGGCTTTACGATTGCATAGCCTGTGGTCTTAATATGCTGCCTAACTCTGTGAGGTCATTCAGTCCATCATCACCCCTTCCCCACCTTCCAATTTTGTTCTCATTTCTCTCCATCAGTACCTGCTACTGGCCACCTCACCCCAATAAGGCCCAAATCCTCTGACAACTGTAGACTGGTACTCACAGTGGTGGTCAGCTTTCCTGCATTCTTCTGGACATACTGGATAGAATCATGGATTGTTGAAAAGAGACCAAGCAGTACGTTCTCCATGTCATAGATTCTGTACATGCCATTCACAAGTTCTTCAAGGGACAGAATGTATTCTCTCCAGTACTTGTCAATCTCCACCACACCTGCCATACAGCCTTGCATGACCACATTGCAGTAACCGCCACAGGGTTTAACCATCATCAGTCCCTGGCAGTAAGAGCAGTACCACATTCTGGTGAGCATTCGGCCACAGTCCTTACTGAACTTCAGGTGATCAGTTGTGTTGATCACTTCAATTCCAAGATTCAGAGCCTGAAGGAAGATCCTAGTGACTTGCAGTGACTTGGAAACCTGGGTCATAATAAGCTTGGGGAAATTCCCAAATACTTTCAGGTCACGTCTTGCTCCTCGGAGGCACTCATTGATGTCCAAGGCTGAATCAGGCAGGCCTGGGTTCATTAGCTGGGTATAGATGACTGGAAACAGGCTGTCAAACAATTCATTGACCATGTCATCTACATTGATGTCAGAACCCAAGATGTAGAGAGACACATCTGTGAAAAATTCACCCACAAACTCAAAAGCTTGTGGAGTCAGGCTTGGGTAGTTGTTCTTGAACATGGCATTGGTGTAGTTCTTGGCATGGCGAACAACAATTTCAAAGGCCTCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGACACAAAAATGTGTACAAATTAAAGCATGAAAATCCAGTGTGAAAATGAATTTGAGACTTCTCTATTGCTGTGGTGATTAAGGTCCCATTTGCGTTAAATAATTGACTCTCATTCATTTCTGGCATTGCCTCTACTCTTGCAGTTGTTTGCTCCTATAAATCAATTTTCCTTTCTGAACATGAAGTCCAGATTCTGATGTGCACATAAATTCTTAAACACACAAATTATATTTCAAATGACAAAAGCCAAGATTCAGTTAACATTTCGGCCTTTCATGAAAATATTGATTAAAAATTGGCTAAATGAGAAGTTATTTCTCTTTCTCACACTGATTTATTCAGTTAAAAAGAAATTGTATTTCAGGACATTTCATTTTTAGACAGAGATAAATATTTGACAACAAACCATACATTGTATAAACTCACACAACAATTTAAGCCTGTTTAGCCCTGGAGGGGAGGCAAGTTCCTAGCCAAGAATAAAAGCTATCACGAATTTAATCATTTTGGTAGATTTTCTCCTGATAACTTTAAAGAGAGCTTTCTGACAGATTGCCAGACCTGGAAATGGAATCTATCCAATGCATTTGTATCTGGGTGGAAAAATAATCCATGTGCTTATCTATCATTTGGTATTGAAAACAACACCTCTGGTATTTGCAAGCTGAACATCCGGAGGGATAACTACTAAGCTTCCTTGCTAAGTTCAGCTTCCACATGGCTTGGAAGCCTTATCTGCTCTACAGAGACCACAAATTCATGATTACATCTGCTGCCCCAACCCCTTTGCATAAAGCCCAATCAGTGTCATTGGTTTGAAAGAGAAAGTAGTAATGTCACCATCTCATTTTCTCCAAACTGAAACATCCCAGACCCAAATTATTTCAAATAATCAGAGTCTACATTTACATGAGGGAAGGAAAAACAACCACAATAGGCTTTTGAAGAAATAAGACAGAGTTTAAAAACAAAAATAGCCAAGTTTCCTGAGACACTTAAAATTAACTTAGTCCTTCCTTCCATTTCCTTCCAAAGTGCAAAGGTCCATGACAGATGTACTCCAAATGATGCCAGTTCATGAGCCTTGAAAAATCGAATTATTACCACTTTTAGACTACTAGAGAGACCATACTCCAACAGTTCCTTGGGATCACTTAGTCCAACATTTCAGTCATCTGTGGCAGAAGTGAGCTCTAGGTTGTGCTACCACCATCTGCCCCAGATCCCTCCCAGAGTAGAACATGCTCCCTAGATTCTTCCCTTGGGCTTATGACATGCCCAGCAATGTTGAACAATTGCCAGTGTAGTTCTATTGGGTTTCCAAGCTCACTTGAGAAAATAATGAGTTTAAAACAAAACTTAACTTCCTACAAAAGGTTTTTGAGTATATGTGTACTGAGGGCAGTGAGAGTGTAACAGTCTCTGAGGGACACTAGCTTGCACTGATTACTTTGCAGCTGTGTGTCCCTGGGGAAA
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Task1_train_31099
A variant has been detected on Chromosome X in GPC3 (glypican 3). What is its effect — pathogenic or benign? If pathogenic, name the disease.
Pathogenic; Wilms tumor 1
CAACCCTCCCGCCTAGGCATCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCTTAAGCCACAGCACCTGGCCACATATATTTCAAAGTAGCTAGAAAAGAAGAATTTGAATGTTTCTAGCATAAAGACAAATATTTAGGTGATAGATACCCCAATTATATTGATTTGACCTTTACAAATTGTATGAATGTATTAAACTATCACATGTCCCCTGAAAATACGTACACATATTGTATATCAATGAAAAATAATTAGCAGAAAGCAGAAATAGAATATTTCTAAAACAGAAAAATAAAACAAAACCCAGCTTTTAGGTTTATTAAGACTGATTTCATGGGTTACTATGAAATGATATTATGTAAACTAGCCAGCATAGCACTTGAGATGTAGTGGAAGCTCAACAATGGTAGTGTAATATACTATTCTGCCACCTCCTTCTACAAAGCTGGCAGCATTCAGGAATCAGATACTACCTTAGGGAAACTGACTGGTAACTCTTGGCTACATGTTCTGCTATATATTGGAAGTTGGTATCTCCCGAGATTCCGTTACTAACAATATCTGACTGAAACCAAGGAAACTGCTGCCTCACTCACAGAACTTCCCTTCCTCCATCACGAATTTCATCAGACTTAGACTGATATAATCAAGGCTATAAACAAAACCATTGGAGAACATGGATTGTTTGCCTTGCTTATGTGCTTGTGAGGTTTAATTAGTGAACTCTAGCTGGGTCTTTTGTGTTTGAAGTCACTACTCAAAATGCTAATGTGATATACATGATTGAAAACACCAAGAGGAAATTAGAATCAGAAAAATTGGTGATAACCAAATTAAAGGGAGACCTGGTCAATTTCTGAAGCATGGCTCTTCCACTAACTTTACGTGGGTGCTCTTAGGCAAGTTGCAATTTCACTTAAGCTTCAGTTTCCTCATTTATAAAATGAAGATAATAGCTCCCACTTCACAGGCTTGTCATCTATTGTGTATCAATAATGAGGATTATGATAACTGACAATAATGCTAATAATAGCCAACATTTATCGAAGACTTACCACATACCAGACACGTGCTAAGTGCTTTAACAAATGTCATTCCCTATGAAGACGATATTCTTTTTATTTCTATTTCATGAATCAGAAAAATGAACTCATAAAGATAAAATGACTTCCCAACATCGCACAGTAAGGAAGTAGGTGGAGCCAGGCTTTACGATTGCATAGCCTGTGGTCTTAATATGCTGCCTAACTCTGTGAGGTCATTCAGTCCATCATCACCCCTTCCCCACCTTCCAATTTTGTTCTCATTTCTCTCCATCAGTACCTGCTACTGGCCACCTCACCCCAATAAGGCCCAAATCCTCTGACAACTGTAGACTGGTACTCACAGTGGTGGTCAGCTTTCCTGCATTCTTCTGGACATACTGGATAGAATCATGGATTGTTGAAAAGAGACCAAGCAGTACGTTCTCCATGTCATAGATTCTGTACATGCCATTCACAAGTTCTTCAAGGGACAGAATGTATTCTCTCCAGTACTTGTCAATCTCCACCACACCTGCCATACAGCCTTGCATGACCACATTGCAGTAACCGCCACAGGGTTTAACCATCATCAGTCCCTGGCAGTAAGAGCAGTACCACATTCTGGTGAGCATTCGGCCACAGTCCTTACTGAACTTCAGGTGATCAGTTGTGTTGATCACTTCAATTCCAAGATTCAGAGCCTGAAGGAAGATCCTAGTGACTTGCAGTGACTTGGAAACCTGGGTCATAATAAGCTTGGGGAAATTCCCAAATACTTTCAGGTCACGTCTTGCTCCTCGGAGGCACTCATTGATGTCCAAGGCTGAATCAGGCAGGCCTGGGTTCATTAGCTGGGTATAGATGACTGGAAACAGGCTGTCAAACAATTCATTGACCATGTCATCTACATTGATGTCAGAACCCAAGATGTAGAGAGACACATCTGTGAAAAATTCACCCACAAACTCAAAAGCTTGTGGAGTCAGGCTTGGGTAGTTGTTCTTGAACATGGCATTGGTGTAGTTCTTGGCATGGCGAACAACAATTTCAAAGGCCTCTGTAAAAAAAAAAAAAAAAGAGACACAAAAATGTGTACAAATTAAAGCATGAAAATCCAGTGTGAAAATGAATTTGAGACTTCTCTATTGCTGTGGTGATTAAGGTCCCATTTGCGTTAAATAATTGACTCTCATTCATTTCTGGCATTGCCTCTACTCTTGCAGTTGTTTGCTCCTATAAATCAATTTTCCTTTCTGAACATGAAGTCCAGATTCTGATGTGCACATAAATTCTTAAACACACAAATTATATTTCAAATGACAAAAGCCAAGATTCAGTTAACATTTCGGCCTTTCATGAAAATATTGATTAAAAATTGGCTAAATGAGAAGTTATTTCTCTTTCTCACACTGATTTATTCAGTTAAAAAGAAATTGTATTTCAGGACATTTCATTTTTAGACAGAGATAAATATTTGACAACAAACCATACATTGTATAAACTCACACAACAATTTAAGCCTGTTTAGCCCTGGAGGGGAGGCAAGTTCCTAGCCAAGAATAAAAGCTATCACGAATTTAATCATTTTGGTAGATTTTCTCCTGATAACTTTAAAGAGAGCTTTCTGACAGATTGCCAGACCTGGAAATGGAATCTATCCAATGCATTTGTATCTGGGTGGAAAAATAATCCATGTGCTTATCTATCATTTGGTATTGAAAACAACACCTCTGGTATTTGCAAGCTGAACATCCGGAGGGATAACTACTAAGCTTCCTTGCTAAGTTCAGCTTCCACATGGCTTGGAAGCCTTATCTGCTCTACAGAGACCACAAATTCATGATTACATCTGCTGCCCCAACCCCTTTGCATAAAGCCCAATCAGTGTCATTGGTTTGAAAGAGAAAGTAGTAATGTCACCATCTCATTTTCTCCAAACTGAAACATCCCAGACCCAAATTATTTCAAATAATCAGAGTCTACATTTACATGAGGGAAGGAAAAACAACCACAATAGGCTTTTGAAGAAATAAGACAGAGTTTAAAAACAAAAATAGCCAAGTTTCCTGAGACACTTAAAATTAACTTAGTCCTTCCTTCCATTTCCTTCCAAAGTGCAAAGGTCCATGACAGATGTACTCCAAATGATGCCAGTTCATGAGCCTTGAAAAATCGAATTATTACCACTTTTAGACTACTAGAGAGACCATACTCCAACAGTTCCTTGGGATCACTTAGTCCAACATTTCAGTCATCTGTGGCAGAAGTGAGCTCTAGGTTGTGCTACCACCATCTGCCCCAGATCCCTCCCAGAGTAGAACATGCTCCCTAGATTCTTCCCTTGGGCTTATGACATGCCCAGCAATGTTGAACAATTGCCAGTGTAGTTCTATTGGGTTTCCAAGCTCACTTGAGAAAATAATGAGTTTAAAACAAAACTTAACTTCCTACAAAAGGTTTTTGAGTATATGTGTACTGAGGGCAGTGAGAGTGTAACAGTCTCTGAGGGACACTAGCTTGCACTGATTACTTTGCAGCTGTGTGTCCCTGGGGAAAAAAAATCTGCCTTTCTGTAAGTTGTTGAATGTTCACTTGGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTAGAACATTAAGCAATTCCTAGAAAGTTGCTCTATCTTATAACAACTCTCCAAACTCCACATGCTACTTTAGTCTCAATCCTTGTTTTCTAAAAGCTGGATGAGGCCAAGAGATTATCTAGCCCAATACAGAGGACCAGTCAACAAATTCGTTAAAATCATCAGAAATTTGGAGATTTGAAACTATTCATTCATTTTAATTTCAGCTAGCAATCACTTGTTATATATCAGACTCTGTACTAGGTGCTAGAGGCACATAAATGCTGGGTAGATGGAGATAAATGATAAACCATCCTTGTTTCAGAAGTATTCACAAGCTATATGGTTTAGAGTTTACAAAATATTCTCAAGTATATTATGGCATCTACTTTTTACAACAATCTTTTAAGTTTGGTATTACAACTCCCATTTTATATGCGACAAAATTGAGGCTCAGTAGAGTTAAAGCATTTTCCC
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